Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
Os12g0478400 OGI:12048240 | 13/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Chr12:17478005-17486364
Gene Symbol WAK125, OsWAK125, OsRLCK368, RLCK368, OsWAK-RLP
DNA seq

ATGAGAGGATTGCAGGCCGCCGTGCTGTTCACGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGCCGACGAACTGCACCACCCGCTGCGGCGACATCAGCTTCGAGTACCCGTTCGGCGTGGAGCCCGGCTGCTACCACCCAGGCTTCAACCTCACCTGCAGCAGCAACGACACCAGGCTGTTCATGGGCGACGGCACCGTGCAGGTGCTCGACATCTCCATCCCCAACTCCACCTTGCGCGTCAACGCCACCGCCATGGCGTTCGACCCCGCCGACGACGTGCAGCGCGGCGTCATCAACGCGACGACGACATGGCGCGCCGCCGCCGCCGCCGACGACGACGGGGGCCCGTTCGTCGTGTCGAGGCGCAACACGATCGCGCTGATGGGATGCAACGCCCGCGTCGACCTCCGCGGCGGAGACCGCCGCCACAGCGACAACCTGGTCAGCTCCTGCACCGCCGTCTGCCCACCGGTCGGCGGCGGCGACGACGCCGCGGCTCACGACGACGGCGACGGCGGCGACGGCCACACCATCGCGATCATCGACGCCTGGAACGGCAAGTGCTCCGGCGTCGGCTGCTGCCAGGCAAACATCATGCTGGGCTACCCTTCCTACACCATCCAGATCAAGCAGCTGCAGGAGAAGAACCTCCATAGCTTCGACTTCCAGTACATCGCCTACATCACGGACGAGACGCTGAATTTCACGGAAGAGATCGCCGGCCGCATCGCCACTCCGGCGGCGCTCCCGGCCACGCTAGACTTTGTGATCAGAAGCAACTCGTCGTGTTCGACGCCGGCGAACTCGACGGCCGGCGGCGAGTGCCGCAGCGAACACAGCTTTTGTGAGGATTACAAGGGTGGTGGTAATACCCTCCTTGGGTATAGCTGCGTCTGCTCGGAGGGTTACCGAGGAAATCCCTACGTTGCTGGTGGATGCCATGGTACGTGTGTGCTCGCTCGGATGATTAATGTTGGTCGTTTTAGGGCTCGTTTGGTTTAAATGATTTCTATATGAAACCTTAGGACATCTATCTTCTATCTTCTATCTATTATCTTCTATCTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTATATACTAAAAGTCCATTAATCTTCCTACAAACGCTCTTAAGCCGCCACTTGGCGCTCTAATAAATTAGAGAAATCAAAGAAATTCTGAGAAAAAAGAAAAGCATCTATCCGTTGATTTTAAAATAGTGGGTCCACTATTAGAAACCGTCAGATTAACTATATTGATCTTAAAACGTACAATTCCACACCATCCGTAGGTACGTACGTACGTACGGTTCCATCTCCCTCCCTCCTTTTTCTTTTCATATATATATAATCGAGATAACAGTTAATATAGTTAAATTTTATATAATCACTAGCAAAAGTGCCCGTGCGTTGCACCGGGTGATTACAGAGTGTGTATATTGACCAAAAGTGTTGTTTGGTTTAGCAAAAGTGCCCGTGCGTTGCACCGGGAAGTTTACAGATCAGAAAAATATGCAATTAATTAAAATACAAATTCGCTGAAATATTTGGTATTTTTAAGTAGGTATGTGTATAATTAAATAAATTTACAAGTAAAATTCTCCATTCTCCATGGTTAAATAAAATGACATGGTTAAATTTAATTTTATTAAATTCTCCATAATTAGTTACGCTCTTTGGAATTTTATTGGAATTTTCAGAGCTTAATTGCTAATTTTATTAATACAAACATCATTTAACAATTATTTAATTGGAAAAAGAAAGAAAATACTTTCTTATAGGTTTGCTTCGAAATAAACATATTCAATAGAACTATAATTGTAATGCTTCTGAAAAAATGAGCACTAAAAATGTACTTATTCTCTGTTTTTCGGCTCGAGGGACCAACAATAGACTTATTTCCGACCTATGCCGGTCGGCCCACGGCCTTTTGCGCATGCGCGGGCGCACTTTTCCTCCCCCAGGCCGCAACCTGGGCTTGGGCCGAAAAAGAGGCCTCACTCTCGATCCCTCTTGGGCCGATTTCGGCCCGGACGACACCGGCCGTCCGATCTCTAGGGTTTTGATCGGACGACCGAGCGTCAATAGTGGGGAAACAAAACCCACTCCCTCTCAGCCGCGGAACCCTAGCCCATTCCCCCCCTCCCATCTCACTTCGCCGCCCTCTCCTCCGCGCCCCCGAGCGGCGGCGGCGACGACGGCGCCCCTCCCCCACCACCGATGGCGGCGGCGGCGGCACCCCCACCACCCACGGCGGCGTCGGCGGCATCCTCCCCCACCACCGGCGGCGGATCTAGCGGGAGGGGAGGCGCCCCGCGAGCGGCGGCGACGGCGACGGCGCCCCTCCTCCCGCGAGCGGCGGCGGCAGCACCCTCCCCCACCACCGGCGGCGGATCTAGCGGGTGGGGAGGCGCCCCGCGAGCAGCGGCGACGGCGCCCCTCCTCCCGCGAGCGGCGGCGGCGGTGGAGTCCTCCCCCACCACCGACGGTGGCGGCGGCGCTCTCCCCCACCACCGGAGAGTGCCCTCTGCCGCCGCCGCCGGCGGATCTAGCGGGAGGGGAGGCGGCGGCGGCGGTGCTCTCCCCTCCACCGGATCCACAGCGACGGCGACGGCGGCGGTTCGGCAACGACGGCGACGGCGACGGCGGCAGCGGCGGCGACCCCCTTCGATCTAATTTTTTGTTTTTATTTGGATATATGTGTGCTAGCGGCGACCCCCTTCGATCTAATTTTTTGTTTTTTTGCAAAGTGCTATAAGGCTGCATGTGATTCTTTGTTATGTGCTATGATTTTTTATACTATGTATGTATATATGCACTTGTTCTCCTGGTGATGCTAACCGAATAGGACTTGGTATAATTCAAACCAAGTCCTATTCGCCCAAACAGAAACAAAGTCCTAATCAGCTCAAACGAAAACAGATGGGAGTTTGTTTCCTATTTTTGTGGAATCGGACATATTCTTTTACCGCGTTGATGAATCGGATTCGTTCCGGTTTTTTTTCACCCGGTTTTTTTGACGGACGATGGAAGCACCTCTTATTTTTTAAGTAGTAGTAGATAACTTATATGATTATATTATGATATATCTCTTTCCAAAATAAAGTTTACACCACTATATTTTTACCCATTAAATAAAGGTATACGTGAACCCTTTATGTGGAGCATTATTTTCAAATAATACACTATTTAAATAAAGTTTATAAAGTTTATATCGTTACATTCTGTACGCATTAAACTAACAAAGAAATATATTAACTAATTTATACTTAAACGTGCTATTTTAGACTTTTTAATAAAGGCCGGATTAATTTTACGAGTCTTTACAATTATTTGTACCATAAATTATATATCTATTTTTATTTTTCAAATAAATATATAATTTTAATATCTATATTAGATTTATTGCATTCTAGACCTACATCCATCTTGAGTGCTCCACTAAATAAAAGAAAATATTAAAATTTGTCATTGAAAATCAAAATATGCTAGCTTATTTTTTAATGAAACTGTTAAACCCATTAAAAGTACATTATTAGACATCTAATGACTTTCTACCAACTTAATTAATTTCTTCATAAAAAAACTTTATTAATTCCTCACAACATACACGTGGGGGCTATTTACATATACGAATTGATCTTGATGCTTTTGTAAATAAATGATATTTTAAATTTAAAAGATAAATAAACGATCTTAAAATGATCATAGCATCTAAATCATACATATGATTGCTCCTAGCACTCCTAAACACTTCTAAGTCGCTATGTGGCATTCTATTAATTACAAAAACACTCATATAATCGACCATCGGTTTCCACTTAAACCGATGGACCCAATTTTTATACCATCATATCTATCTTTTCGGAAAAAACAAATTCTATCAGAATCTCTGTCTGGCTCACTGCATAACATGCATGTGTGCGCTCCTGTACCTTTTAAACCGGTAGAACCATTGTTTGTAACAAGTGTTTATTCATGGTACATGACATTTTAAAAATATTACTGTGCAATGATATTTCGACGTTATTGTATTCTTGCTAGGTTGCGTGGAGCCTCTCATTCACTCTACATGAAATGTTCATAGGTAGATCGCCTCTCAAAATATATCAATCATATTAGGCTATATAAACCCGTGCATTTTTTGTGTAGATTAATGTCCCACCCAATTCATCCTTTAACATATTATGATAATATATTATACAATTAAAAAAATAAAAACACCTTAATTTTTATTTTACACTTACTTTTACTTTCGTTGACATGTTTTCTAAAAAAAATAAATCTACCTTTTTTTTAAATGATGAAGAATATTATAAATAATTACTTATAGATACTACTTATATTTGATATAATATAAATCTAATAGGTTAGAATATTATTAAAGAATTAATTAATGCTGACAAAAATAATGTATGGAGAAATCGTGGCAGATGTTCTCCTGTTAAATGTCGCTTTTATAAATACCTCAAACTTGGCGTACGACGCATGCCCGCGCGAATGCGCGGGCTACCTTCCTAGTTTTTTTAACAATTGTTGGAATTGAATCCTTAGGATTTTTTTCAACATATATCACTTGTTTCATAAGAATGGATCTTACCAAATTTCTAAGGATGGTAGTCTTACGAGCTTATTTTATACCCTCTCCGAGCTGATAATACTTGTATCGTTTTAGACAAGAGTAAGGTCAAACTTTAAAATCTTTGATTATGAATCATTTTAAAAATATTTGTCTTTCAAATATGGTGACTATATGCATAGATTAGTCTTAAAAAGTACTTTAATAAAATCATATATATTTTTAAAATATTTTTATACATATTATAATAAAAAATAATGGTCAAAGTTATTTTTAACTTTTTTGAAGACCGTGCCCTTGTCTTAAACGACAAGTATTTTCAATCCGGAAGGAGTACGGTTCTTAGGATGAGATGAAACCTTTTTTGGAAAAATTCCTAAGGAATTAAATAGATGTGATATTCTAATCCTTTACTTTACGTAATTTC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Function Wall-associated receptor kinase 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMP1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
Os12g0478400 Os12t0478400-00 Chr12 17478005 17486364 + irgsp1_rep
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM None None None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0478400 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g29430 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0013130 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0013270 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0013180 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0012930 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0012660 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0242800 RBH 0 6.289524 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0012850 RBH 0.0 0.136741 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0263100 RBH 0 0.2563965 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0012770 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0013120 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0012950 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0012910 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0013090 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G012790 RBH 0.0 0.393469 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0012460 RBH 0.0 0.0 0.0
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