Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| Os12g0286300 | OGI:12029340 | 16/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Chr12:10904277-10909395 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | CGTGGTCTCGAAGCTAACAAACAGCAGCAAGAAAATCAAGTCCAAGGCGACATTTTCGCTCATTGCATGCTTCTCCTCCTTGAGCTCCTCGAGTAGAACATCGAAGAAGTCAATGCTTTCCTGGCGGCCTGTTGCTTTCTTCCTCTCGTCCATCATTTCTTTCAACATCTTCATGACATTCTTCCTTCCCTGCAGGGATCGATCGGATTGAATCCATCGTGCGCTAGTATAGCTAATACAATATTTCGATCTGTCTCCGGAATAAGTTATGTATGCTCATTTCTTTGTAAAAAGAGTGGAAGCTTTAATTTGCTGATATTACAAACTAATATTATAATATAGGATGATCATGCAACATATATACATCTGCACTTACTCTTGTCAACTTGAACCTAGAGCAGAGAAAAAAAATGCGTTGCAGGTTAAATTCATTCTCTCAGAGTACCCATGGATGTCATATCTCTGTAGACGGCTTAGTACAATAGGCTTGTCTGTTGAAATTTCCATTTTCTTTATAGCCTGAGTTGGTCTTCTTAATTTCTTTGGGTAGCTCAGAATTTATCCTATCACCCTATGTTCTTTTTATTTACTTTTTTCGTTTTAAATTACCTGTCAGCCTGGGTTAGTTCTAAGTCAAACGTGTCTATCATTGATCATTATTTTTTTAGAAATCCATATAGTTTAACAACGCACGAATTATATATCATAGAAGTATCTCTCATGGTAAATATAAAAGTATAAATCTTATGATGTCGAACTATATGAGTTTATAGAACTTGATAGTTGAACATAAAAATTTTTAAGATGATAAATCTAGAACAATAGTTATAGAACTTGATAGTCAAAGATTAATATTTTTAATTGATGATAAATCTAGAACAATAAGTAATTTGAAACGAAGGGAGTAGTTAAAAACCTATTGGTTGTGTATAAACCATTTCTTTTTTTTTAAAAAAATATATATGAATGCAAGTTGATCTATATTTGCACTAATTATGTAACTGCATATTCTTAGTTTCTCTTTTCAGTGAGGATATGTAGCTGAACTATATAACCGCACTGTACATCTAATTACTAGTTTATGGCGCATCAAATTCATATGCATTAATTTACCTGCATACATTTGTAGAATAAAGTGCCAGGAATGCATAGTGGAAATGATAGAAGGCCCTGAATGAAATCATCGTATTGTTTCCACATCTTTCCGTCTGAGGTCACGGAGTCATAGCTGATTAACTTCTAGGCTGTAATGCTGCATATCATCTGCAATATATTGTAGTGATCTAAAGAGTCAATTGTGTGTATACGTAAGTGTAGTGGATCCATCACTAAAGTAATTGCGAAATGGGTGAATCATTCTGTATTATAGCTACGTAGTTACTACATGTTTATTTGCTTTGTACATATAACACGTTTCTTCTTTTAACTTATTAACCGCGACAACCTCCCCTACGTAGTAAAAAAAAAGTCTCGTCATTGCTTTCTTTATAAATATATTTTTTAAAATTACTAACCTATGTCCCACTAAATAATGTTTCAAAACTAATATACTTTTAATTTCTCATATATTATAATACAAATTTGAATTTTAATTACATGATATTATTTTCATCAAATAAAATTTTTATATTGGAATAATATATAATTAGTCAAATATTTGAAGATTGAAATCTACAAATACACGCGTGTCTTATTCTGTGACACATAGGGAGTATTAAAACTATAAGAACGTATTATTGTGACAAATATAATATACATGTTTTACATATTAAATCCAAATATATTTAGTATATTAATGATTTAAGATTAGACATTTCACTTTAAGATCATTCATTCAAGAATTGTCTCTTCTGAAATATTTCATCAGAGCCCATAACACCTTAAACTTTTTTTCTCATTTTACAAGGTTCACTTCACTGCTTAATAACATTTCTCTTTGTTTCTCTTTACAAGATTCATATTTTAAGCTAACTCTTTCATGTTATAGATGACTCCATTGTCGAAGTTTCAAATTTTTTTTTAGAATTTTTATGATTACTTGCTTGAAATATAAAACCTCAATGTTTAAATCAGTCTTTGTACTTTCAAACCTATGTAAATATAGTGATAAAAATTCTAAAAAATATTGAGAAGTAAGTTATATATAACGTACCTATCAATGCTACCAAAATTTAGGGTAAAATACGACTTATATATAGATAGGGAAAAAAAGAAAAATTCCATTAGGGGGTAAAGTGAGTTGTTTCCAATAGTTCGTAAGTGTAAAATGGGCTTTTTAAAGGGGGTTTAAGTAATCTGATGAGATAGCTGGTGGGAATAAAATAAACTTGTTTTTTTTTTCTTTTTATGGTTGACCTATCAGACATACGCTTGAGGCTGCTTCCTTCAATTCGATGCTTGGGTGATGAAGCCATGACAAAAGACTGGCCTCCGCCGTTTTCTGCATATCCTTGATCATGTCTCGCCGGAGATTCTCAGGGCCAAATAGCCGGAACACCATGTTCTTGATGTACTTGTGCGACGACCCGAGCGTGGTGATGATGCTGTCAGCACCAATGATCCGCATGATCGAGTCCGGGTACCACATCCGGAAAGCCTCCCCTCTTGCTGGAACACGAAGTTGTTCACTTCCGGGTCAAGAGACACGATCAGATCTTCGCCGACAATGTTTGTTCTGAAGACCGGACCATACCTAAAACATGCACAATTGAGTGTTAGCATACATATTTTTATCGGTCACTATGTTGTGCTGTAGATTTTTGAGTTATATGTGATGACTTTCCTTAACCTCTCTTAGTATAATATATGTAGTATTAAATAAATAAATATAATTTATAAGGAACAAAAACACCTAGCATGTATGCTATGATAAGTGGAATAATCTATGTATACCTATTTAAGTGTAGTTTGAGTGAGTTATCACTTTAACTAGAAAGATCTAACCATTTATTATGTGGATCTTGAGTGAGCTCCTAGTGAATCTTTGACATAAAATTTATTTTCATATTTAATATTTTTTGTTGAAAACTTAATATAGAATTGTATCCATCTTAAATAGACTCTCAATTTAGTGTTTTAGTAATTCAATTTTATAATTTTGAAATTAAAGATTACCAAGTTGTAGTTTGCATGGACCTTCCTTTTTTTTTTTACCAAACTGCTATAGTTCATAATATAATCAACAGATTTAAGATATGCTTAAATTAAAATTTAGTACTTATATGGACCAACTTTTTTGGTCTACAAATACCATCGTATTTTCATTGTCACGTCATTCTCAGATAAAATGGTATTTTGCAAAACTCATGTATCTCTACAATGGTATTTTGTAAATTTTCTTTATTACAAAATCAACACTAATCCATGAAGAGAAAAAGGAGCATGTTGCTAATTTCTTCTACAACATCCAAGACGATTCTTTTTAAATTACTAGTTACATGCTGCCTGCCTGTACGTTGTAATGGATCTAGCTCATATAATTAGGGGGGCCAAACAAATATAACTAGGTAAAACCCCATGCATTGCTGTGGGAATTTAGTATGATAACAATAAAAAATAACGTGTAAAATAGCTAGATAATATCAGATTAAGTAAATTAATGTGGTTTATGATAATTTAAATTTAAATAGTATGTAGAATGGTGATTCAAACGTAAAAAGTAAGGTGGTATGACTTTATGGAAGAAGAAAAGTAGGGAGATAGTTTGGACCGTAGATTAATCATCTAAAGGCTAAAAATAATTGATGTGATATGACTTAATTAGAGGGAAAAATGAGAAAGATAATTTGGACCATAGATTAATCATTTAAGCACTAACTAAGTGAGGATGAACTATATAAGTATATAGGATATCATAAAACATAATAAAGATATACATTGAAACGTTACGTGAATTATGTTGGATGATAATTTAACATGTTTATATTTGAAATGCTCTTAAATTATAAAAACTATAAAGATATAGCATGTTTGCATGATGTTTAAATGGGATGATTGTTAGTGGATGATGATGTGGCATCTTGTTAATTAGTGAATGATGATGTGGCATCTTTGCATGTTAAGCTTAAAGAGTTAGTGGGGGATAACTTTACAGTAAGATAGGATTAGGGATGTATGGGAGAGTGATTGAGGATAAAACTTTGGATCCGGTAGTTACTTTTCATGTACAAACACACTAGGAAGGAGGGGATGAAAGGAAAAACACTCCACTTTAAAGATAGTAGAGATATAACGTTGTACTACCTTCGTATCAAAATATAGCAGTTTTTTTAAGTTCAAATTTGAATTAGAATATTTCTAGTTCATATTTAAACAAAAAGGTATCTCAATAGAAAGAGGTAAGAGGAAGTACGTGTTTAATCTAATAAAGAATATGTTTCATCTCATCTTCTATGTTTAACTGTACACTCGAGTATCTAGGTTCTACATATATATTAAGTTTACTGAAATATATTAGGTGTAAAAATTGGCACAACGTAAAATCCCCTATGTGAAAGGGAGAATGGATTGTTTCGGGGAGAGTTACTCACTTGCATGGTATCCCAGGGCTCAAATATTTTGCACTAAAATTTAGGGTTTAGCTCGACGGCTGTCTTGGAGGTATGTTTCTTTTTGGTAATGTTTTTTTGGAATTTTAATTTAACAAGCTAGTAGTATTAATGTTTCAATTATGAACTTCTCAATATTTCCGTAACTTTAAAAAATAATTCTCCAAATGTTATTCTTTCCAAAATATTAAACTATGTCCTATCCTATCCTACAATACAAATATCATTGTGTTAGAAAAATAACCCATGTTATCGTAGAATATGTATTTCCTTGTAATTAACACGGTATAACCATAAACATAAACATGTAGAATATGTTTATATTTTTACTTATCAAGACGACGTTTGAAGAAGCCGAGCAGCTCAAGGGAGGGGCTTTGGGAGAAGAAGTCGAGGGTCTCGCCCAGGATAGGGAGGCCCCTCGACCCTGGCGGCAGCTTCCCTTGTACTAAT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| CDS seq | ATGTACATTTCACAGGAAAATGGAATTCCTTATGGCTGGCTTTGGTCTCACTGCTACTGTGTTAGCTGCCTTGTTGATCCGTTTGTTGGTCATCAAACGGAACACCAGTATTCCAGTAAATTAGTACAAGGGAAGCTGCCGCCAGGGTCGAGGGGCCTCCCTATCCTGGGCGAGACCCTCGACTTCTTCTCCCAAAGCCCCTCCCTTGAGCTGCTCGGCTTCTTCAAACGTCGTCTTGATAAGTATGGTCCGGTCTTCAGAACAAACATTGTCGGCGAAGATCTGATCGTGTCTCTTGACCCGGAAGTGAACAACTTCGTGTTCCAGCAAGAGGGGAGGCTTTCCGGATGTGGTACCCGGACTCGATCATGCGGATCATTGGTGCTGACAGCATCATCACCACGCTCGGGTCGTCGCACAAGTACATCAAGAACATGGTGTTCCGGCTATTTGGCCCTGAGAATCTCCGGCGAGACATGA
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| Protein seq | MYISQENGIPYGWLWSHCYCVSCLVDPFVGHQTEHQYSSKLVQGKLPPGSRGLPILGETLDFFSQSPSLELLGFFKRRLDKYGPVFRTNIVGEDLIVSLDPEVNNFVFQQEGRLSGCGTRTRSCGSLVLTASSPRSGRRTSTSRTWCSGYLALRISGET |
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| Function | Cytochrome P450 87A3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XU38] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| Os12g0286300 | Os12t0286300-00 | Chr12 | 10904277 | 10909395 | - | irgsp1_rep | ||
| CDS seq | ATGTACATTTCACAGGAAAATGGAATTCCTTATGGCTGGCTTTGGTCTCACTGCTACTGTGTTAGCTGCCTTGTTGATCCGTTTGTTGGTCATCAAACGGAACACCAGTATTCCAGTAAATTAGTACAAGGGAAGCTGCCGCCAGGGTCGAGGGGCCTCCCTATCCTGGGCGAGACCCTCGACTTCTTCTCCCAAAGCCCCTCCCTTGAGCTGCTCGGCTTCTTCAAACGTCGTCTTGATAAGTATGGTCCGGTCTTCAGAACAAACATTGTCGGCGAAGATCTGATCGTGTCTCTTGACCCGGAAGTGAACAACTTCGTGTTCCAGCAAGAGGGGAGGCTTTCCGGATGTGGTACCCGGACTCGATCATGCGGATCATTGGTGCTGACAGCATCATCACCACGCTCGGGTCGTCGCACAAGTACATCAAGAACATGGTGTTCCGGCTATTTGGCCCTGAGAATCTCCGGCGAGACATGA
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| Protein seq | MYISQENGIPYGWLWSHCYCVSCLVDPFVGHQTEHQYSSKLVQGKLPPGSRGLPILGETLDFFSQSPSLELLGFFKRRLDKYGPVFRTNIVGEDLIVSLDPEVNNFVFQQEGRLSGCGTRTRSCGSLVLTASSPRSGRRTSTSRTWCSGYLALRISGET |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | None | None | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_12g0286300 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_12g0002650 | SBH | 0.051591 | 0.000000 | 2.866550 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_12g0002880 | SBH | 0.129176 | 4.586803 | 1.691222 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_12g0002890 | SBH | 0.211036 | 5.912539 | 7.850230 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_12g0002680 | SBH | 0.087364 | 0.225610 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_12g0002920 | SBH | 2.024029 | 11.755780 | 2.752731 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_12G0151300 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_12g0002900 | SBH | 0.296119 | 0.160317 | 0.257169 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0166300 | RBH | 0.233352 | 0.731658 | 3.880301 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_12g0002680 | SBH | 0.297230 | 0.110961 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_12g0002900 | SBH | 0.091705 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_12g0002930 | SBH | 3.552785 | 9.533342 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_12g0002860 | SBH | 0.375868 | 0.0 | 0.438137 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_12g0002840 | SBH | 0.495588 | 5.051036 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_12G002740 | SBH | 0.330559 | 4.901138 | 1.338020 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_12g0002980 | SBH | 0.330237 | 2.981189 | 3.443192 |
