Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os11g28104 OGI:11047000 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr11:16144745-16161505
Gene Symbol -
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Function Cysteine-rich receptor-like protein kinase 42 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FNE1]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os11g28104 LOC_Os11g28104.1 Chr11 16144745 16161505 - MSU_osa1r7
CDS seq

ATGGATCGTCTCCTGCTCGCGCCGTCTGCGGTGGCGCTGCTGGTGGTTGCCTCGGCGTGGGTTCCGGCCGCCGCTGACCCGCAGATCACGCTGCTCAACCTGGGGTGCAGCCAGTACAACGCGACACCGGCCGCCGCCTTCCTCGCCGCCCTCAACGCCACCTTCGCCGTGCTCCGCGCCAACCTGTCGTCGGCTGGTGGCGGTGGTGGCTTCGCCACGGCGGCCGAGCCGCGCGCCGCCGCGCCGGCGTTCGCGATGGCGCAGTGCCGCCCGTACGTCGCGGGGGCGGGCAGCTGCGCCGCGTGCTTCGACGCCGCGGCGTCGCGCCTCCGCGCCAGGTGCGGCGCCGCCAACGGCGGGCGCGCCATCCTCGACGGCTGCGTCGTGAGGTACGAGAGCGCCGCCTTCTTCGACGGCCCGGCCACGCTTCCCGGGAACACGCAGGTATGCAACGGCACCGCCGTCGCCGACGGCTCTTTCGCTGGCGCGGCGCGTGGGCTCGTCGGTGACCTCGCGGCCGCCGCGCCCCGCGCACCGGGGCTCGCCGCGGCGGCCGCTCGCGGCGGCGTGTACGCGGCGGCGCAGTGCGTGGAGACGGTCGGGGAGGGCGGGTGCGCGCAGTGCCTGGCGGTGCCGGCGAGGAACATCGATGGGTGCCCGCCGGACTCCGACGGCCGCGCCGTGGACGCCGGCTGCTTCATGAGGTACTCCGACAAGCCGTTCTTCCCGGCGAACGCGACCATAGATCTGGCGCCATACTTGCGATCACCTGGGAAATCAAATCACAAAGGAGCCATCATAGGAGGAATTTTAGGAGGTGTGGCATTCCTGCTCCTTGGCCTATTGGCACTCTTCTGGACCAGGCAGTCTAAGAAGCCGTTGAAGCCTCGTAGAGGAGATATTCTTGGAGCAACAGAACTGCAGGGTCCAACAAGTTTTTACTATAAAGATCTAAAGGTTGCAACCAATAATTTCAGTGAGCAAAGCAAACTTGGAGAAGGGGGATTTGGAGATGTATTTAAGGCTTCGCTGAAAAATGGGAAAACTGTAGCTGTAAAACGGTTAACAGTTATGGAAACTAGCAGGGCCAAAGCAGATTTTGAAAGTGAAGTGAAGTTGATTAGCAATGTTCATCATCGGAATCTTGTCCGGCTTCTTGGTTGCGCAAGCAAGGGCTCAGAATGCCTGCTTGTTTATGAATACATGGCAAATGGAAGCCTTGATAAGTTCCTCTTTGGCGAGAAAAGTGTCGCCCTCAATTGGAAGCAGCGATTTAATATCATTATCGGCATGGCTCGTGGCCTTGCATATCTTCATGAAGAATTCCATGTGCGCATCATACACCGTGACATTAAATCTAGCAATGTTCTTCTTGATGACGAGTTTCAACCAAAGATTGCTGATTTCGGTTTAGCAAGGCTCATACCTGATGATCATAGTCATCTCAGCACTAATTTTGCAGGAACATTGGGTTACACAGCTCCTGAGTATGCCATCCATGGGCAACTCTCAGAGAAGGTTGACACATACGGCTTTGGTGTAGTCACTTTAGAAATAATAGGTGGTAGGAAGCTCAATGATGCAAGGCTGGAGCCTGATAGCCAGTACCTACTTGAATGGGCCTGGAAGCTTTATGAAGACAACAACTTGATTGAATTGGTGGACAGATCATTAGACCCAGAAGAATACAATCACGAGGAGGTGAAAAGAACAATGGAGATTGCCCTTCTGTGCACTCAATCGGCTGTCACATCACGTCCAATGATGTCGGAGGTAGTTGTGTTGTTGCTGACAAGAAATGCTCTAGAGTTCCAGCCCACGAGACCGACTTTTATCGATGCAACTCGTAGAGTGCCAGGTGAAACATCAACCTCCAGTTCATCTTCTGCATCCAAAGCTACTGTTTCGATATCACAACTTTCAGCCAGGTGA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.072868 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0470500 RBH 0.0 0.118605 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g34220 RBH 0.0 0.0 0.077973
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0470500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0013620 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0013550 RBH 0.338670 0.000000 1.718607
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0013520 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0013290 RBH 0.031450 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0013580 RBH 0.493559 0.0 8.945413
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0248700 RBH 3.559532 10.889134 0.3170075
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0013550 RBH 0.000000 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0264000 RBH 3.831233 18.659854 0.3127725
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0013660 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0013730 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0013360 RBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0013210 RBH 0.012564 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0013540 RBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G013350 RBH 0.240992 0.0 0.840026
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0013550 RBH 0.0 0.0 0.0
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