Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os11g10760 OGI:11017670 | 5/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr11:5907950-5911943
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Disease resistance protein RPV1 [UniProtKB/Swiss-Prot:V9M2S5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os11g10760 LOC_Os11g10760.1 Chr11 5907950 5911943 - MSU_osa1r7
CDS seq

ATGCACGACCTGGTGCATGATTTTGCAAGATCAATCTTATTTGATGCAGTTCTGGATTCTGGAAAAAAAATCAATATTGGGGTAAGCAGTTGTCGCTATGGAATGCTCAGAGATTGCAGCAAACCACTAGAGTTGGTTACACCTTCACCTGCAAAGATAAGAGCACTGCATTTTCTGGGTTGTGGCAAAATTGAGCTTCATGGTGTTGCATTCTCATCCGCTTCATGCTTGCGAGTTTTAGATTTAAGTGGCTGTTCCATCCTGAGGTTACCTGCTTCTATCGGTCAATTAAAGCAATTGAGGTACCTTAATGCTCCGGGTATGAAAAATCGAATGATTCCCAAGTGTATCACCAAGCTCTCAAAATTAAATTTCCTCAGCCTTTGTAGGTCTCGTGCTATCTCAGCACTACCAGAGTCAATTGGTGAAATTGAAGGTCTCATGCATCTTGATTTATCAGGTTGTTCACGATTAAAAGAGCTCCCAAAGTCATTTGGGAAGCTCAGAAGGTTGGTGCACCTAAATTTGTCGAATTGCTCTCGTGTTAAAGATGTATCAGAATACATTTGTGGCCTTACCAACCTTGAATATTTGAACCTATCAGTGTGCCGTAAAATTGGATTTCTACCGAGAACATTGGGCAGCCTCACAGAACTTAAGTATTTGAACCTATCAGGTTGTTTTGGGATAAAAGAATTACCGAAATCATTTCAGCAGCTAAAAAATTTGGTGCATCTGGATCTGTCATGCTGTAATTGTGTTAAAGATTTGTCAGAAGCTTTAGATGGCCTTGCAAAACTGCAGTACTTGAACTTATCATATTGTCACCATTATGGAAACCAGTTTCGTCTGAGAGGGCTGCCAGAAGTCATTGGCAATCTCACCAGTCTCCGGCATTTGCATTTATCGGGGTTCCTAGACAATATATTTGGCAACCAATCTGGAGTCATGGACAAGCTCCTGGAAATAGGGTATTTAAATTTATCAACATTCCAGGGTAATATTTTTCAGCAACTACCACCAGGTCAAAGTCACAGTTTCATTGAGTGCATCGGTGCCCTTTCAAATCTGGAGCATCTAAATTTGTCTAATAATGTCAGCCTTTATAGTGTACCTGAAAGTCTGGGTAACCTTAGGAAGCTACACACATTAGACCTCACAGGTTGCATTGGACTATTGTGGCTACCAGAAAGTATAAGTAAAATTCAAAGCTTGAAATATGTACTTATGAAGGATTTGTTGAGACTTAAGTCCACACTATCTTGTTTCAACAATGGCCCAATCTTGTTGCCAAACTTTGTGGTCCAAGCTGTTGACAAGAAATCCAGCAATCTTGGTCAGCTTCTTGATGCAAACCCTGCTGAGTTGGACATAAGTAGTCTTGAAAATGTGAAGTCCACAAAAGAAGCAAAGGGAATAAAATTGTCAGGAAAGAGAAATATTGTCAAACTGAAATTTGATTGGACCATAGGAACCAAGCGATACGTGGAGGACATGGAAGTGTTGAGAGAACTAGTGCCGCCAAGCACTGTGAAGTACTTTGAACTGCGAGGTTATCACAGTACAAGCTTTCCTACCTGGTTAATGGGCATTGCACACTGTCTCCCTAATCTTGTCAAAATTAAGATAGTGGATTTGTCGAAATGCAGCATACTACCACTTGGTCAGTTACCAAACCTTAAACAACTGGTTCTCGGTAGAATGAAGAGCATAACAAAGATCGATGCGGACTTCTGTGGTGGTGCGAGAGCATTTCCTCAGCTGAAGACATTTGACATATACAGCATGGAAAGGTTGCAAGAGTGGAATACAACATACTCTTGTGGTGAGGATGGTGTGACTGAGTTCATGTTCCCCAACCTTCAGTGGTTAAGCATAAGTGACTGCCCCAATTTGGTTGTGAAACCACTCCCGCCTAGAGTTACGTGGTGGAAAATAGAGGGCGGTGAAAGTGTCATATCATCATGGGGAGGGAGTGTGCACACTGGTACATCTTCATCCTCTTGTTCAGTAACTAATCTGGTCGTCAAATTCTGTACGTTGCCGTTGAGTCAGTGGAGTCTGCTTCACCACCTTCCTGCCCTCCGTCACTTAACCATCCACTGGTGCGCTGATCTGACTAGCTCACCAGAGATCATTCAAGACCTCCACTCACTCAAATCACTATCCCTAGATGGAAACGAACAGGCAGAGCTTCCAGATTGGCTGGGTGACCTCCCTTCTCTTCAAGAACTAAAGATAACCATGTATCCAGCGCTGACTGAGCTGCAAGAGAAAATTAGGCAGCTCATGTCACTACAGTCATTGACATTGTCTTCTTGTCAGATGCTGACATCATTAGGTGAATGGTTTGGGAGTCTCACCTCTCTCCAAGAATTGCACATCTCACACTGCCAAAGGCTGAACAGTTTCCCAGAGGGCATGCAGTATCTCACCTCCCTCTTGTCACTGCATCTGAGTTACTGTGAGAGCATTTCAGCACTGCCTGAATGGTTAGGAAACCTCACATCCCTCAAGACACTCCAGATATGGGAATGCAGAGGCATCAAGTCTTTGCCGGAGAGCATCGAACAACTCACTATGCTTGAACATCTAGAAATTTCTGGCTGTCCTGAACTAAAGCAATGGTGTGAATTAGAGGATAGCAAAACGAAGCTTGCTCACATAAAAAATAAATGTTTTTGGTAG

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.364117 0.563477 0.341354

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0213700 RBH 0.523300 0.590417 1.194303
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g10550 SBH 0.289328 0.288145 0.233684
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0213700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0007230 SBH 0.184482 4.528352 1.957189
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0007310 SBH 0.212823 0.445578 1.015957
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0007120 SBH 0.342441 1.518315 3.846814
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0007140 SBH 0.064182 0.059509 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0007120 SBH 5.265685 12.773895 6.666517
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0093800 RBH 0.9760985 15.4786595 5.625932
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0007110 SBH 0.170104 0.251311 0.873241
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0100900 RBH 0.945748 3.856083 1.5163025
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0007260 SBH 0.212022 0.070946 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0007130 RBH 0.560330 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0007150 SBH 1.603995 13.509791 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0007240 SBH 0.430545 0.0 0.392089
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0007230 SBH 0.106816 2.635762 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G007270 RBH 0.290100 1.266545 1.528052
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0007110 SBH 0.269171 3.348744 4.076067
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