Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os09g17329 OGI:09031540 | 12/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr09:10604980-10622218
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Protein ACCELERATED CELL DEATH 6 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8LPS2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os09g17329 LOC_Os09g17329.1 Chr09 10604980 10622218 - MSU_osa1r7
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Protein seq

MMAASNGEEPPSTSMATSSSPLPMVAQLMVTTDRAVSQQLKDLVNKENSTTMVAALSLSREAYEVAMALKNGEEHRQGRCSGKGDAAAMLMMMASKKEDAAKPSTASMNPLLLSLASQGRLNDYDAESGMDLDGVTTEGNTALHVVATCGDGPGYLRSAGVIYSRSQHLMLVQNNNGDTPLHCAVRAGHSKMVDHLIDLVETKDNSPSSARLEELLRKENCRKETAFHDAVCIGNKDIITNLLKYYSELAGFLMDATGTSPLYLAVLHQQVDIAKLLHQMTDGNLSYSGPNRQNALHAAVLQDQVMTKMLLNWNNGLTEQSDENGSTPLHFAASLLRRGIYNTVIPVLRANPVQLYKQDSEGLYPIHVAASSGANLTVKSFIRERPEIAGLRDSKGRTFLHVAVERERWNVVVYACHTQSLARILNMQDNDGNTALHIAVKHGNKAIFCSLLMNKEVNLNISNNKGQTALDISQSKILAGYFYGWNPNKLILRALTFCNARGGCRRVDHLQEQYIIHQKQVDEVRESDKMTNSTQTLGIASVLIVTVTFGVMFAIPGGYKADDHNNGGTPTLAGSYIFDAFIMANTIAFICSSLAIINLMYSGMPMVSLPLRRRHFNISLLLAFSSVTSLGTAFALGMYLVLAPVTRCTAIAICAMMMIASLCLYTEPLNGVRFAIALYVRRGNRVLLVIAQILLIRTLITYWPCVIIFGWAAISTKDGHTRHG

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
LOC_Os09g17329 LOC_Os09g17329.2 Chr09 10605006 10619471 - MSU_osa1r7
CDS seq

ATGACGACGCAGCAAGCTTCTGGTGCAGATGCAGAGTCGGGCATGGATCTGGACGGGGTCACCACTGAAGGGAACACTGCACTCCATGTTGTGGCCACCTGCGGTGATGGCCCGGGCTACTTGAGGAGTGCAGGCGTCATCTACAGCAGGTCCCAACATCTCATGTTAGTGCAGAACAACAACGGTGACACACCTCTGCACTGCGCTGTCCGGGCTGGCCATTCCAAAATGGTTGATCATCTAATTGATCTGGTTGAAACTAAGGACAACTCCCCTAGCAGCGCGAGACTGGAGGAACTCCTGAGAAAGGAAAACTGCCGTAAGGAGACGGCCTTTCATGATGCCGTCTGCATTGGAAATAAGGATATAATCACCAACCTTCTTAAATATTATTCAGAATTGGCCGGCTTCCTTATGGATGCAACAGGTACTTCACCGTTGTACCTAGCTGTCTTGCATCAACAGGTCGACATTGCAAAGTTATTGCATCAAATGACAGACGGGAATCTTTCGTACTCTGGCCCAAATAGACAAAATGCATTGCACGCAGCCGTTCTACAAGACCAAGTGATGACCAAAATGTTGTTGAACTGGAACAATGGCCTCACAGAGCAATCGGACGAAAATGGGAGCACGCCACTCCATTTCGCTGCATCACTTCTACGGAGAGGAATATACAATACGGTCATCCCTGTGCTGAGAGCCAACCCAGTTCAGTTGTATAAGCAAGACTCTGAAGGATTGTACCCCATACACGTCGCTGCCTCCTCCGGTGCCAATCTGACAGTCAAGTCCTTTATTAGAGAGCGACCTGAGATCGCTGGTTTACGCGATTCTAAGGGGAGGACTTTCCTTCATGTTGCCGTTGAAAGGGAAAGATGGAATGTAGTTGTGTATGCTTGCCATACTCAATCGTTGGCTAGGATTTTGAATATGCAAGACAACGATGGAAACACTGCATTGCACATAGCAGTGAAGCATGGGAATAAGGCTATCTTCTGTTCTCTACTGATGAATAAGGAGGTAAACTTAAATATATCAAATAATAAGGGGCAAACTGCTTTAGATATATCGCAGAGTAAGATTCTTGCAGGATATTTCTATGGATGGAACCCTAACAAACTGATATTGCGGGCACTAACGTTTTGCAATGCAAGAGGTGGTTGTCGTCGGGTAGATCACCTGCAGGAACAATATATTATTCATCAAAAACAAGTAGATGAAGTGAGGGAATCGGACAAAATGACAAATTCAACACAAACTTTGGGTATTGCCTCAGTGCTGATTGTTACTGTCACGTTTGGCGTAATGTTTGCCATACCAGGAGGTTACAAAGCAGACGATCACAATAATGGTGGCACACCAACACTTGCTGGAAGTTATATATTTGATGCATTCATCATGGCTAACACAATAGCATTCATTTGCTCGAGCTTGGCTATCATCAACCTCATGTACTCTGGAATGCCTATGGTTAGTCTACCACTTCGCCGTCGGCACTTTAACATATCTCTACTCCTGGCCTTCAGTTCAGTGACAAGTTTGGGTACTGCCTTTGCACTAGGTATGTATTTAGTGCTGGCCCCAGTGACTCGATGCACTGCAATTGCAATCTGTGCAATGATGATGATTGCATCACTGTGCTTATATACGGAGCCTTTAAATGGCGTTCGTTTTGCAATAGCACTATATGTTAGGAGGGGCAATCGGGTATTGCTAGTTATTGCACAGATTCTACTTATTCGAACGCTAATTACATATTGGCCCTGTGTGATAATCTTTGGCTGGGCAGCGATTTCAACAAAAGATGGGCACACAAGACATGGATGA

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MTTQQASGADAESGMDLDGVTTEGNTALHVVATCGDGPGYLRSAGVIYSRSQHLMLVQNNNGDTPLHCAVRAGHSKMVDHLIDLVETKDNSPSSARLEELLRKENCRKETAFHDAVCIGNKDIITNLLKYYSELAGFLMDATGTSPLYLAVLHQQVDIAKLLHQMTDGNLSYSGPNRQNALHAAVLQDQVMTKMLLNWNNGLTEQSDENGSTPLHFAASLLRRGIYNTVIPVLRANPVQLYKQDSEGLYPIHVAASSGANLTVKSFIRERPEIAGLRDSKGRTFLHVAVERERWNVVVYACHTQSLARILNMQDNDGNTALHIAVKHGNKAIFCSLLMNKEVNLNISNNKGQTALDISQSKILAGYFYGWNPNKLILRALTFCNARGGCRRVDHLQEQYIIHQKQVDEVRESDKMTNSTQTLGIASVLIVTVTFGVMFAIPGGYKADDHNNGGTPTLAGSYIFDAFIMANTIAFICSSLAIINLMYSGMPMVSLPLRRRHFNISLLLAFSSVTSLGTAFALGMYLVLAPVTRCTAIAICAMMMIASLCLYTEPLNGVRFAIALYVRRGNRVLLVIAQILLIRTLITYWPCVIIFGWAAISTKDGHTRHG

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.632617 4.769748 0.477652

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0343200 RBH 10.366726 9.794417 2.683925
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g15370 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0343200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0006450 SBH 0.090379 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0006460 SBH 0.0 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0006700 SBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0006550 SBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0006660 RBH 3.620526 23.517025 13.299588
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0185900 RBH 0 0.0048205 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0006670 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0161700 RBH 0 0 0.010459
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0006500 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0006400 RBH 0.310064 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0006340 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0006260 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0006330 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G006860 RBH 0.051388 13.900421 1.647125
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0006730 RBH 0.0 25.470318 2.086420
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