Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os05g37620 OGI:05059760 | 2/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr05:22016009-22021001
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q94HW2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0380700 SBH 0.000000 0.0 0.286608
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g61490 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0380700 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0257900 SBH 0 0.002273 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0348400 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
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