Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: XL628S_117425_DEL1153440

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

DEL

Os XI-adm: Xiangling628S | XL628S

Os cB: ARC 10497 | Os117425RS1

Chr11

22934135

22946722

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

12587 bp

27881261

27893847

10 There is no gene in this region.

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XL628S_117425_DEL1153440	Chr11	22934135	22946722	27881261	27893847	12587
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XL628S_YX1_DEL1133620	Chr11	22934135	22946724	12783428	12800447	17020
XL628S_MH63RS3_DEL1144210	Chr11	22934135	22946724	13292253	13309280	17028

>XL628S_117425_DEL1153440
GTGTCACACCCCGAAGTTCTCCTCCCAAGCCTAAAATTTATTTTTTTAAAACGACCCCAAGAAAATGCAGGTGAAATCAAGAGAAAACCCTAAGAAAGTAATGCAAATAATAATCGGATTTGACATGTGGAATTTTTCTTGAGTTCTACATGTCGAAATTCATTAACAGGATTTTTAGTGGAATTTTCAGAGCTCTAGAAATAATTTTAACCAATTAAAATTGAGCAAGTAATATTTTAATTCCAGGGAAAATCCTTTTTCCTTTTTCTTTTTCCTTTTTCCTCCCTTTTTCCTCCTTTTTGTCAAATGGGCCGTCGGCCCATTTCTCCTTTCCTCCCCCTCCTCCTTGCTGGGCCGGCCGCAGGCCGAGGCCCAGCGAGGCCGTCCCGCCGCCTCCTCTCTCGGGGTCGCCGACAGGTGGGGCCCACCTGTCGGGTCCTTCCCCCACCTCCCGCCTATCTCGCTCGCGCCGCCGCGCCCGCAACCGCCGCCGCGCCCACGTCTCCGCCTTCTCCGGGCCACGTCGACCACGCCCGCGCGTGCGCCGCGTCTCCCGCGCCCACTCCCCTCTCTCCCGCTCGCGCCCGCGCCCGAGATGGCCGGGATTCGATTTTCGAATCCCGCCTCTCTCTCCTCCCCCACTCCCCCACGTCGGCCGGCGATTCCCGCCTCTCCCGGCCACGTCCGGTCCCCTCTCCCCCTATTTAAGCATCGCCGTCGTCCCCTCTCACTTTTTCCCCATTTCGCCGCACTCTCTCGAGCCTCCCATCGCTCCCGCGCCGTGCAACCCCTTGCCGCCGCCTTTTCCGCTACTCCGGCCGCCGCTAGCCGCCGCTAGGCTCGTCGCCGTCTTGCACCGTCGCCGCCGTTAGATTCGCGAGGCCGAGGTCCACCTCGTCCACCCCTCCTCCGTCGAGGTTCGCCGCCGGAGTCCCATCCCCGTCGTGCGCCGGTGAGTGACGCCATGGCCGCCGCCTTCGGCCGGCGCCCTCGCTCTCTCGCACTCTTCTCTCTCCCTCTAACCCCTCTCCTTTTGTTCGTTAGGAGGCTTCGGAGCTCGTCCCGCCGTCGCCATCGTCCTCCGTCGCCCGCCGTCGTCGACCGTTGTCGGTGAGGCCTCTCCTCCTCTTTCTCTCTCTCTCCCGCACCGTTTAGCCGTCGCGCCGCCGCTTAGCCGCGTAGCTGCCGCTTCATCTCTAGCCGCCGCTCTCCGCCGCCGGTCGGTCGCCGTCGGCCGTCGTCTTGCGCCGCTGCTGCATGTGCGCCGCCGCCGCATGTGCGCCGCGCCGTCGGCGCCATGGTCGCCGGGCCGGTTTGCGCCGTGCCCGCGCGCACCGGCCGCGAGCTCCCGCCGCCGTCCGATCTACCCTTGGGTAGATCGGGGCCATCGGTTCGGCCGCCGCGTGGCGCGCCGCTCCTCCCCGGTCCGTGGACCCGATCCGCCGTGGACCGCCCTCCCCGAGCCGCTGACCAGTGGGCCCGCGTGCCAGCGCCCTTCCTCCCTCCCCGAGCCGCTGACCGGTGGGCCCCGCATGTCGGCGCCGCCTCCTCCTGTGCTGACGTCAGCCCTGGATAATATTGCGCAATAAATTATTTAAGGATTTTTGCTATAGTAATAAACACAGTGAATCTTCTAAAATTCATAACTAATTCATCCGAGCTCCGTTTAAGCCCATTCAAGTCTCAGTAAATCAAGAAAAATGTGTAGAATCCATTAAAAATGGTTTTGTTCCCTGTTTCAGTAGTCTTATAGCCTGTTTGCAATGTTTGCCTTGTATGTCGCTAGATTCCGGCTCTTCCGACGCTCCGGTGTACTTTGAGATAGTCGCCGAGGTTCCTCCAGCAGCAGAGCAAGGCAAATCATGCTTGTCACTTGAACATGTTGATCCTAAATTGCAAATGCTCTATTGTTTTCTTTCAAATATTGCATTGTTTTATAATATTACTTTGGAATGGTTACCTATTGTTACAGCCATGCTTTTTGGATACCTTGCTCCTTTGTTAGCTTGGGTTATAACATGATTAGACTTTGGATTAGGAATTGCTTAGCCATGCTTAGTTCAACTAGCACACAATGGGGAAATTTCATTTAAAACCTAGACTATAGGTTTATATGATAATGTTGGATTAGTACCACCGCTCTGGTGTTGGTTAAATAAAATGAATCACATAGTGGGCTGTGGGTGCATGGTTTTGCTGGTCGCACCCATGGCAGTTAAGGACCGGTTCGCGGGATGCCCTGGAAGAACTTATCGTACTTACCACAAGCCAGCGTGGGCAACGGTTGGGCTTGTAGTGTAGTTTTCCTCTAGTCGACGCATCCAGGCAAGGGTGGGCGTGATGGAGCGGGGCGGGCCCTGCGACGGCCTCTGTCGCTTCCGGATTTACCTAGGCACGAGAGGGGACTGCCCGTTGCCCGCTGGGGACGGGGGTGAAACCTGAGGTGTGGTGTGCTTGGCTAGAGGGGGCTATGCGAAGGGTCCTGTCACGGCCTCTTTCCGGTATGTCGTGGTGGCATGTCGGCGCACGGAAACGTGTCGTGGGGCTGTGTCTTGTGGGTACAGTTGTACACCTCTGATCAGAGTAAAACTATTCGAATAGCCGTGCCCGCGGTTATGGGCGGTCAACCAGATTCACCGTGATTAGTCTCACCCTAGTGTAATCTTTTGAATTTGGATGGTATAGGTGGAAGGTTGGGCCTGTCGCAACGTGGGTTAGCGTTGGACAACGGATGATTAATATTAATTAATTATTACAACTGTTTTCGCATTCAATTCTTGTTTATAAATGCTAGTATTTATGCAAATGAACCTGTTTAGCTATCCCTTGTTGAATCCCTGCATCATACCCCCATTCCGGTATGACTTGCTGAGTACAGTGGGTAGTACTCAGCCTTGCTCTATTTTCTCCCCCAATCCCAGAGTTCGAGTATGTGTCCGATGGCGGGTTCTCCGAGGAGTAGGCTTCGTCCGTGCCGTCGAGGATGCCTGTGGAGTGGTGTTCCCGCTGCAGTTCAAGTCAAGGATTAGCTCCAGTTATCTTTTGTTTTCCGCTGCATTTTTTTGTAAGACTTTTATGATGTTTGTAAGACGTGGATCTGAATGTCAACATTGTCGTTTGTGTACCCCGGCCGGTCCTGGACGGGGATTTTAATGCACATTCTGCTTGAAATTCTATTCGGGAATTTCTGGGCGTGACAAGTTGGTATCAGAGCCGACCTTGACCGTAGGACAAGCCAAATGGAAAAAAACCTAAGAGCCCTCTGAATCCTTTTCATTGCACATGTTCTTTGCAACTGGATTTGTTCCGGGAAAATTGGGATCTGTTCTTGTGGTTCAGGGGAAAAATCTTGTCGCTCATTTAAGTGGGATTTGCCAAAACAAGTCAGTCTAGGGTTTTAGTAAAATTATTGAGATTTATTCGTCAGTCAGTTGGGGTTTTATGGGTGAAATGCATTAGGTCCTAGCTCAGTAACATGGGTTGCAAGGTATTTATGCTTTGTTTGTTATTATTAGTATGTATCTAATTTCTCATTATTTTATCGTTATGTGAGTCTGTCTTATTTATTCGCTCTCATGCAAAATGATCTATGCATAAAATTTCGCTCTTATTCGATTCCCTTATTTGAGTCTTTTATTGCTTTATTTCAATTTGGATTTGAGCATGCATTGATCCTACTCCTTTGTCTTCTCTAGATGGCCGGTCACCCACCCAACCACCGCGGAGAAGGCATGATCGACTTTGTGGCAGAGTTGGCACGCATGACACTGGTGGTAGGCTACCCCAACGCGCCGGAGTACACGACTATTCCACCGCTCAGTGGCGAGCTTCCTCACCGTGTCCGCTTGGAGGTCCATGGCTACGTGGGGACTTGCCTCGCTAACATGGCGGTTGAGGCGTCAGGAGGCACAGCAGATCACGCCTGTCAGGAGGCAGCCTACTTGATGATGGCCAGACTACGGGAGCGCCACAACTACATCGTCCATGACACGGCGTACCGCTTCCACCCCCGTCGAGCCAACGGTGATGGTGTCAGTTCCTTCCGTCCGACAGCTGGCAAGAACGACACCACCTTTGGTCACATGTGTGCTGTGATGAGGGGATTGGACAGGATGCACTCAGACCTGCACAAGGCGACCAAGGCCTTGAACGATGGGAAGCTCATGAGGATCGTCGCTCTGAAGGACGAGATAGCGCGCCTGAAGAGGGAGAACGCTCAGCTAAAGGGTCTTCCAGCGCCAGGGGGAGTCCGGATCCGCACTACGCCCTGCAAGACGACGACGGCACCCGTGCACATCCAGCTTGCGCCCAGGAACCCACCTCCAGCAGCAGCTCCCGCAGCACCTCCAGTTCCGCCCGCAGTTCCTGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCCGCGTCCGCTCTCTCCTTCGCTCCAGCATCAGCCGCCAGAGGTCCAGCCAGTGGCACCGGAGGTTGGTTGTCTGCTACTCCCAGTGGCAGCCGCGATCCCAGCAGCAGCAGTTCCAGTCGCTTAGAGGGACCGGGTGACGAGCAGGAGGACGCCTTTGACTCCACCGACCGCAGGAGCCGTTCCGAGCATTAGGCTCGTTTTTCCCATTAGTTTATCGACTGTCTAGCTTCTGCTTGTTAGTTTGTGTGTTTAGGTTGCTTGTTTGGGGTCAGTCGACGGTCGATATCATGTGCCTATGATATGGCTGTCTTAATAAGGATTTTTGCTTGCTCTTTTAAGTGTTTTAATTCAGATCAGAACAATTGCAGTCTAAATTCCTTTGTAATAAAGCTTAGTTCCTGAGCATCTGTTTTTCTCCTTTTCCCCCGTCTGCTTTTCCCTCCAGATGGTCTACACCAGGACTGGCAACCGCACGACAGGTGAGGGCAGCAACGGCGAAGAACGCGCTGAGGGCGTGCACCCCAGCAGTGATTCCGGCAATGGTCCGCCACCACTTCCCGAGAATCCGACCCTTGCCCAAGTTATGGCACATCAGACTCAGATGATGGCAGC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