Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: 127564_G46_TRA1207240

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

TRA

Chr12

7523848

7530333

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

9344 bp

15838820

15848163

15 There is no gene in this region.

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127564_R9311_TRA1205050	Chr12	7523848	7535420	9048040	9059671	11632
127564_XL628S_TRA1206740	Chr12	7523848	7530333	15911536	15920880	9345
127564_YX1_TRA1204890	Chr12	7523848	7525167	6348594	6349916	1323
127564_ZS97RS3_TRA1207010	Chr12	7523848	7530333	15855797	15865141	9345

>127564_G46_TRA1207240
ACCACGTCACGGCCGAGGACGTGCTGACAACTCCAGACGTCATCGTTGGTACGTTCCTCATTCATTCCATCCCTGCTACCATTTTGTTCGACTCTGGAGCTTCCCACTCGTTTATATCTGTGCCATTCGTGGGGAGAAATCAGTTGGGGGTAGAAAGGCTTAGGAACCCTCTGCTCATCACCACCCCTGGAGGGGTTATGACAGCAAAGTATTATAGTCCTGCCGTCCCTATAGAAATTCAGGGGATTCCTTTTGCTTCGGATCTGATTCTTCTAGACACCAAGAACTTGGATGTGATCCTTGGGATGAATTGATTAGCTCAATTCCAAGGAGTAGTGGATTGTGCAAGACGCACTGTCACTCTGTACCGAGAGCCGGAACAATCGGTTGTTTTCTTTGCACCCCCAACCTCTGTCTGTAGTTCAGAACTTCATCAGATAGGACTGTCAGAAATCCCCATCGTCAGGGAGTTCGGAGACGTGTTTCCGGAAGAACTACCCGGTATGCCGCCCAAGCGAGAGATTGAGTTCCGGATAGATCTTGCTCCAGGAACCACTCCTCTGTATAAGCGACCCTACCGTATGGCAGCAAATGAACTGGCCGAAGTTAAGAAACAGTTGGAAGAGTTGAAAGAAAAGGGGTATATACGTCCGAGTACTTCCCCCTGGAGTGCTCCTGTGATTTTTGTGGAGAAGAAAGACAAGACGAAGAGGATGTGCGTTGACTACAGAGCTCTCAATAAAGTCACCATAAAAACAAGTACCCTCTTCCCCGGATCGATGATCTGTTCGATCAGCTTAAAGGTGCCACTGTATTCTCCAAGATTGATCTTCGTTCCGGATATCACCAATTACGTATTCGTGAAGAAGATATTCCTAAGACCGCATTCACCACGCGATACGGACTGTATGAATTCACGGTGATGACGTTCGGTTTAACCAATGCTCCTGCCATCTTCATGAACTTAATGAACAAAGTGTTCATGGAATACTTGGATAAGTTTGTTGTGGTGTTCATTGATGACATTCTGGTGTACTCACAATCAGAGGAAGACTATCAGCACCATCTCCGTCTGGTGTTGGGAAAGTTGCGGGAACATCAATTGTATGCCAAACTTAGCAAGTGTGAGTTCTGGTTGTCCGAAGTCAAATTCTTAGGGCACGTGATATATGCTAAAGGAGTTGCTGTGGACCCCGAAACAGTGACCGCCGTCACTGATTGGAAGCAACCCAAGACAGTCACTCAAATTCGCAGTTTCTTAGGTTTGGCTGGAGGTTTATCGAGAACTTCTCCAAAATCGCTCGACCCATGACACAGTTGTTGAAGAAAGAAGAGAAATTTGTGTGGAGCCCGCAATGCGAGAAGGCGTTCCAAACACTCAAAGAAAAGCTGGTTTCCTCGCCGGTGTTAATCTTGCCGGATACTCGCAAGGACTTCATGGTGTATTGTGACGCTTCGCGCCAAGGATTGGGGTGCGTGCTCATGCAGGACGGTCATGTGGTGGCCTATGCCTCACGCCAGCTATGGCCTCATGAAGGCAACTACCCTACCCATGATTTGGAGTTAGCCGCGGTGGTTCATGCTCTAAAAATCTGGCGGCACTATCTCATTGGGAATCGCTGTGAAATATATACTGATCATAAGAGTTTGAAATACATCTTCACCCAGTCGGATCTGAATCTTCGGCAGAGGAGATGGTTAGAACTCATCAAGGATTATGATGTGGGAATTCACTATCATCCTGGTAAGGCCAACGTGGTCGCCGACGCTCTAAGTCGAAAGAGCCATTGCAACACCCTTAACGTCCGTGGCATTCCACCCGAACTTAACAAACAGATGGAAGCCCTGAATCTAAGTATAGTGGGTCGTGGATTCTTGGCTGCGTTGGAAGCCAAGCCCACCTTGCTCGATCAAATCCGCGAGGCTCAGAAGAACGACCCGGACATGCATGGACTCCTCAAGAATATGAAACAGGGTAAAGCCGCTGGTTTCACAGAGGATGAACACGGAACCCTATGGAACGGAAATCGGGTATCCGTTCCAGATAACAAAGAACTTAAACAGCTGATACTTCAGGAAGCTCACGAAAGTCCTTATTCCATCCACCCTGGCAGTACGAAGATGTACTTAGACTTGAAGGAGAAATACTGGTGGGTTAGTATGAAGCGGGAAATTGCAGAGTTCGTGGCCCTTTGTGATGTGTGCCAGCGTGTCAAGGCAGAGCACCAACGACCGGCCGGACTTCTCCAACCTCTCCAAGTACCAGAATGGAAATGGGATGAAATTGGGATGGATTTCATCACCGGATCCAAAAACCCAAGGTGGATATGATTCTATATGGGTAGTTGTGGATCGATTAACCAAGGTAGCTCGATTTATTCCTGTGAAGACCACCTATGGAGGGAACAAACTAGCCGAGCTCTACTTCGCTAGGATCGTGAGTCTCCATGGCGTTCCCAAGAAAATCGTATCTGATAGGGGAAGCCAATTCACCTCTCACTTTTGGAAGAAGCTCCAAGAAGAGCTGGGTACCCGATTAAATTTCAGCACCGCGTATCACCCGCAGACAGATGGACAGACCGAGCGTCTAAATCAGATCCTAGAAGATATGCTTCGCGCATGTGTCCTAGATTTCGGGAAGACCTGGGATAAGAGTCTCCCCTATGCCGAGTTCTCCTACAATAACAGCTACCAAGCCAGTATACAAATGGCACCTTATGAAGCATTGTATGGGCGCAAATGCCGGACACCGCTCTTGTGGGACCAAGTTGGGGAAAGTCAAGTGTTCGGGACCGATATCCTGAGAGAAGCTGAAGCGAAGGTTAGAACCGTTCGGGATAATCTAAAGGTGGCACAGTCCCGGCAGAAAAGTTATGCAGATAACTGTCGCCGTGACCTGGAATTCGCAGTGGACGATTTTGTGTACCTTCGGGTCACACCATTGCGGGGTGTACACAGGTTTCAGACAAAAGGGAAGCTCGCACCTCGGTTCGTGGGTCCTTTCCGTATCATTGCTCGGCGCGGAGAAGTCGCTTACCAGTTGGAGCTGCCCGCCTCCTTGGGCAACGTGCATGATGTGTTCCATGTGTCGCAACTCAAGAAATGTCTTCGAGTGCCATCCGAGCAGGCCGACTCAGAACAAATGGAAGTTCGCGAAGACTTGACCTACGTGGAGAGGCCAGTGAAAATCCTGGACACCATGGAGCGCAGGACCAGGAACCGGGTAATCCGTTTTTGCAAGGTCCAATGGAGCAACCACGCCGAGGAAGAAGCTACCAGGGAGCGTGAAGACGAGCTGAAGGCAGCCCATCCCGATCTCTTCGCCAGTTCTTCCGAATCTCGGGGTCGAGATTCCGTTTAAGGGGGGTAGGTTTGTCGCGTCCCAAAACGACTCTAAAATACATCCTCTAAATTATGCATAGAATAAGTAAAATCCATGTGAAAGCCTCCAACAATTAAAATGTGCAAAGTTAAAAGTCAAATAAGGCTTGGAGGATTCTTGTATATTTCCTAAAAGCCTAAAATGCGTAAATAAATTTTAGTGGAATTTTCAGAGCACAAATAATAATTAAGAAGAAAAAAACAAAGTTAAAATGGTTTTATAAAAAGAAAAGCTCTAAAAAGTCTTTTCTCTCCCCCTCCCCCTCTTGGGCTGTCACGCCCGGAATTTCTATCCAAAATTCCAAACGCTTACATGTGTGTTAAACCCTCGTCCAGGAATCAACCGAGGCACACAATGACAATTTGATAATAGAGTACAAATAAATAACTATTTAATATTCGCAAATAATAAAAGATTACAGAGGTAGATAGTTCCTCTAAAAAAAATAACATTCTACGCAGTGGAAAAATAAAAACTATAACAAACTACGGAACAGCTATGGCGACTCCACTCCACAGGCATCTTAACCAAGAACAAGCCTAATCCTCCAGATCATCACCTTCACTGAGATACTCGTCTTCTGATGAATGAATATTGCAAGAATGAGCATATGACATACTCAACAAGCCACACAGCAAATATGCAAGTGCACAGGATAACAAAGGATGGCATAATAGAGCTCATTTGCAGAAACAGCATTTGACAAATACTTTAAGAGAATAGTAAAACAGTTAAATAATTAATCAATATTAAATAAACACCATACAACACACCCATGTTGCATAGGCCCAACCACATTTGAACAACCAACCCCAGTTGAACAAATTTAACCTCCAAACCAGGAATTATCCATCCCAAACCAGGAGTTAAATTAATTACCACATTATTACCATTAATGAGTAGTGTGAGACTAATCACGAAAAACATTGCTCAACTCACCCATAACCGCGGGTACGGCTATTCGAATAGATTAAACTCTGATCAGAGGTGTACCACTGTACCCACAAGACACAACCCCACATCATGTCACTATGTGCCTCAATACCACCACGATACCTCGGAAAGGAGTTGTGACAATACCCCTCGCATAACACAACTCACCACAGTGCAGCGTACCTGGATCATAATCACCCCCTCTACAACCAGAGGCATGGACTCCCCAGCGACCCCCACGGACTTCTCGCCGCTTCTCAGTCTGGCACCCCGTAATGAATCATGCTATACAAACGGTAAGCCGTTGCCCACGCTGGCTTGTGGTTGGCATGGTAAATGTTTCACAACAGTAGCTCGCGAACCGGTCCTTAATTGTCATGAACACAACCATCAAAACCATATGCTCACAACCCACCTTAACCAGGTTTTAATTATCAATTAATTAACATCACACGATTTACCATCGTGAGCTACCATTGAATATAACCCTAATTAATAATAATAATTATATAATTTAATTTATATTTAACCCCTTTAGTTAGCTAATGTTTCTAAGCATGGCTAAGCAAACATATATATAGCATTTAGCTGAACCAATCCAATATATAAGGTTCATGCTAATCAAATTATAACCCATAGAAAAATAAAGTCATCTTCGGCCATTAATTAATTGGGAAAGGTTCAC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