Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsJ4155_04g0278000 OGI:04082720 | 45/50 Os XI-adm: J4155S | J4155S | PKU Chr04:27793213-27793362
Gene Symbol -
Mutant -
Stuctural Variations

FH838_J4155S_DEL0435060,XL628S_J4155S_DEL0436000,LK638S_J4155S_DEL0432570,ZS97RS3_J4155S_DEL0435100,II32_J4155S_DEL0434890,117534_J4155S_DEL0434390,FS32_J4155S_DEL0433430,127652_J4155S_DEL0435130,G46_J4155S_DEL0434600,DG_J4155S_DEL0436130,132424_J4155S_DEL0440310,

More
DNA seq

ATGCAGGAACAACAGAGACCACAACAGCAGGAAGCGACGCCCGAGTATTCCGGCTGGATGCGACGGTGGATGCGGCAGGGTGGAGGCGGCGATTTTGATGCGCCTGGCGTCGTCGTGGATGAGTCGATGCGCCTGCGGATGGCTGGATGA

CDS seq

MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG

Protein seq

MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG

Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsJ4155_04g0278000 OsJ4155_04g0278000.10 Chr04 27793213 27793362 + .
CDS seq

ATGCAGGAACAACAGAGACCACAACAGCAGGAAGCGACGCCCGAGTATTCCGGCTGGATGCGACGGTGGATGCGGCAGGGTGGAGGCGGCGATTTTGATGCGCCTGGCGTCGTCGTGGATGAGTCGATGCGCCTGCGGATGGCTGGATGA

Protein seq

MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM None None None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0022670 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0021500 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0021920 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G021750 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0021670 RBH 0.0 0.0 0.0
Os XI: R9311 | R9311 | AGIS NA NA NA NA NA
Os XI-adm: HZ | HZ | PKU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: J4155S | J4155S | PKU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: LK638S | LK638S | PKU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: XL628S | XL628S | PKU NA NA NA NA NA
Os GJ-temp: 02428 | 02428 | SICAU NA NA NA NA NA
Os cB: Basmati1 | Basmati1 | SICAU NA NA NA NA NA
Os O.glaberrima: Ogla | OglaRS2 | DIADE NA NA NA NA NA
Os XI-1A: CN1 | CN1 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1A: D62 | D62 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1A: DG | DG | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-temp: DHX2 | DHX2 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: FH838 | FH838 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1A: FS32 | FS32 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1A: G46 | G46 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: G630 | G630 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: G8 | G8 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1A: II32 | II32 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: J4155 | J4155 | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-temp: Kosh | Kosh | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-temp: KY131 | KY131 | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-trp: Lemont | Lemont | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-adm: LJ | LJ | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-sbtrp: NamRoo | NamRoo | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: R498 | R498 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: R527 | R527 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: S548 | S548 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-2: TM | TM | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-3: Tumba | Tumba | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: WSSM | WSSM | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: Y3551 | Y3551 | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-1B: Y58S | Y58S | SICAU NA NA NA NA NA
Os XI-adm: YX1 | YX1 | SICAU NA NA NA NA NA
Os GJ-temp: ZH11 | ZH11 | SICAU NA NA NA NA NA
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.