Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsJ4155_04g0278000 | OGI:04082720 | 45/50 | Os XI-adm: J4155S | J4155S | PKU | Chr04:27793213-27793362 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
Mutant | - | ||||||||||
Stuctural Variations | FH838_J4155S_DEL0435060,XL628S_J4155S_DEL0436000,LK638S_J4155S_DEL0432570,ZS97RS3_J4155S_DEL0435100,II32_J4155S_DEL0434890,117534_J4155S_DEL0434390,FS32_J4155S_DEL0433430,127652_J4155S_DEL0435130,G46_J4155S_DEL0434600,DG_J4155S_DEL0436130,132424_J4155S_DEL0440310,
More
|
||||||||||
DNA seq | ATGCAGGAACAACAGAGACCACAACAGCAGGAAGCGACGCCCGAGTATTCCGGCTGGATGCGACGGTGGATGCGGCAGGGTGGAGGCGGCGATTTTGATGCGCCTGGCGTCGTCGTGGATGAGTCGATGCGCCTGCGGATGGCTGGATGA |
||||||||||
CDS seq | MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG |
||||||||||
Protein seq | MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG |
||||||||||
Function | - |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsJ4155_04g0278000 | OsJ4155_04g0278000.10 | Chr04 | 27793213 | 27793362 | + | . | ||
CDS seq | ATGCAGGAACAACAGAGACCACAACAGCAGGAAGCGACGCCCGAGTATTCCGGCTGGATGCGACGGTGGATGCGGCAGGGTGGAGGCGGCGATTTTGATGCGCCTGGCGTCGTCGTGGATGAGTCGATGCGCCTGCGGATGGCTGGATGA |
|||||||
Protein seq | MQEQQRPQQQEATPEYSGWMRRWMRQGGGGDFDAPGVVVDESMRLRMAG |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | None | None | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0022670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0021500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0021920 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G021750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0021670 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Os XI: R9311 | R9311 | AGIS | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: HZ | HZ | PKU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: J4155S | J4155S | PKU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: LK638S | LK638S | PKU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: XL628S | XL628S | PKU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-temp: 02428 | 02428 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os cB: Basmati1 | Basmati1 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os O.glaberrima: Ogla | OglaRS2 | DIADE | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: CN1 | CN1 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: D62 | D62 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: DG | DG | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-temp: DHX2 | DHX2 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: FH838 | FH838 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: FS32 | FS32 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: G46 | G46 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: G630 | G630 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: G8 | G8 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1A: II32 | II32 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: J4155 | J4155 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-temp: Kosh | Kosh | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-temp: KY131 | KY131 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-trp: Lemont | Lemont | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-adm: LJ | LJ | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-sbtrp: NamRoo | NamRoo | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: R498 | R498 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: R527 | R527 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: S548 | S548 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-2: TM | TM | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-3: Tumba | Tumba | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: WSSM | WSSM | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: Y3551 | Y3551 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-1B: Y58S | Y58S | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os XI-adm: YX1 | YX1 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |
Os GJ-temp: ZH11 | ZH11 | SICAU | NA | NA | NA | NA | NA |