Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: YX1_Y3551_DEL1207560

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

DEL

Chr12

8227023

8237233

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

10605 bp

5541283

5551887

4 There is no gene in this region.

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YX1_FH838_DEL1207670	Chr12	8227023	8237233	5540962	5551564	10603
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YX1_MH63RS3_DEL1207640	Chr12	8227023	8237233	5544523	5555129	10607

>YX1_Y3551_DEL1207560
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAAAGCTATAGCTACGACTTCGACGCTGGCGTTACGTCAGAAGAGGAAGGACCGACGTTATGAATTGTCGATCCGTCGTAGTAGAATTCACCATCGGGATTAAGGACTTCTTCGTTGATGAACCCCATCAGTTGTTCTTGAACAGCCGTGATAAAATCCTTGTGTGGGAGATTTTCCCTCATGTGAATACGCTATCATTCGAAAAATAATGACATATCAATATATGAAATTAATAAACAACTTAACAAATCGATACGCAATGAAATTTTGAATGGTTTATGTATACGTACATCGAGCTCTCGTATGGTGTATATTTGGTTTGATAGGCAGTGGTCATACTCGCATACGTAGTAGCCGCATAAGTTAGTTCCCTGGTCCTGCTTTGCAAACTACATGAGAAACGATGAGAGATTTAATATACTCTTTATATTAACTGTAATTAGAGATTCAATTCAATATAATTTTGGATCATGCATGTACTCACTGGAAAATGAAACCTCCATCCAAGTTTTTCTTTCCAAGTCCCGCGGACCAATTGACGGAACCAATCCCAAGCCCTACATGTGCAGTTGCTAGCTATGATTAATTAATTATTACCCGAGATCAACATAATAGCAACAGAGTCCCGTGACTTTGGAATAGATGGTATTATATTACCTGTCTATCAGTTGGAAGACCTTGTCAAAAACCTTCTCCTCTTTATTCATTGAGTCGTACACAGTGACTCTGCATGCGTCCAAGTCGAAAAAGAACAGGACCTGGTGGAATCTGGAATATGCGTGAGATGAGATAAATATCAGAATGTATATGTTATATGTATGGGAATGAAATTTGTTCGAATGACAATAAAAACTCACTCTGTGTTGTACGGCAATAGTATGAACGTCTTGAAATGCTGCTGCGTTAGGAGATGGACGAGATTGTCCTCTGTGTCTTTCTCGTACTTGTCAATCATTTCAGTGTTGATTTTCCGAGGGTCGATGAACCCAGTATCGTAAACCCCCCGCCGTCGGGCCCTTTGAATCTCCATTCTACAACAATAAAAGGAAATTATTATTGCTTACATATATGCCAGGAGCTAATTATTGAACGAAACAAATCGAACTCAAAGATACTTACAAAATCCATGCGCCCAGAAGAGAGACGTCGAGGGCGTCCAGATGGTACAGATCGAAGACATCCTTGAAATGGATCCATAGAACATCTTCTCCTTGCAAGAAATCAGGGTTTCTGATCCTCGCTCTGAACATCTCTCTACCCTTGGCACTCATTTCCATGTACCGTTCATGGAATTTGTATATTTTTGTCGGTAGGGACTGCAACTGCTCAGGCCTAACAAGTGGTTTACCGAGTTCAAACTTGTATGCCACTTCCGCCTTCGGGATTGGTGCGCCTCCAACCAACTGAGCCACAGTTAAACCGGTGTCCGAAATAAAATCCGTTATGCCAAAGTCTTCGCCGGTTACCAATGGCTCGACCACTTGGTTTGGTTGTTTTCCAAGCTGAGGAATTGGTTTGGACTTCTTGTAATAGGCTTTCCTAAGTGTTCGGTCATAGTCCGATAGCTTTAAGGCCTCCTTGTTTGTGGTGGACATTCCCTTGAAGAAATTCTTCATGCTCGGGTCAATAGGTATCTTCTTTTTAGGACTCCGAGGCTTGAGTTGCCTCTTCACTTCTCCTGCCACATAAGCGTCAAGCTCCTCTTGACTGCAATCGTACGGCGGCTCCTTGTTTTGGGTGGTGTCAACTTTGGCCTTCTTCGTTGTCCTTGTGCTGGCAGAAGGTGGAGCTTGGCGAGACCTTGTCTTGGGAGGTGCAGGCGGACACGGTGGAGGCGGAGGCGGAGGAGGCGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGCAGGAGGAGGTGGTGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGTAGGAGGACGTGGCAGAGGAACCGTTGGAGATGGTGCAGGAGGAGACGGCGGAGCCGGAGGAGATGGTGCACGAGACGCCGCTTGTCGCCCAGGGAGGATGATGTACCGCTTGCGCCATAGTATAATGGCGTGGCTTGTGTCTCGTAGATGCGTCTCACCGTCTCCTCCTGGGTAGTCCAACTCGAGGTCCTCGCACACGGCTTCCACCAGCTCAACTTCGACCCTCGAGTATCCTGCTGGAATCGGCCTGTAGTGGTAAGTCCCTGAAATGTCCGTTGGGATGGCCATTCCCGACGCCACCTTCACGTGATGAGAGGTTATCTATTAGTAATCAACCTAAGCAGCAACCTGCGGAACGTACAAGTAAAAAATCATATATTACATCGAGCATACCTTGATTGATAAGTTCTTGAAGGGAATATGCAGCACAAATGGTGTCCGTTGCATGATCTCATCAACAGGGCAGGTGGTTTTGTCCTGGGTTTGCATGGCGTCCATGCTCTGTGATCCTACCTGCCCCGTTGAGGCGCAGATACTACGATTGCCTGATGGGCTGACCATTGGAGGAGGTATGTACAGCTGGGGATCGTGTGACCGATGTGCTGCCATGCGTTCATCCACCTTCCGGGCCACCTCCTCTTGCATGCTGAGCTCGTAGCTCGATACCCTGTACTCAAGATATGCAATCTTCGCCTCGGTATCTCTCTTGCTCCTCATCCGACTCTTGTACGTGTGGATGTCCTCCTTGAATCCAATCTTCCAGGGAATCACGCCTTTCCCTCGTGTTCGTCCTGGATGCTCGGGAGTTTGTAGGGCGAGTGACAGCTCGTCCTTCTCTCTGTCGGGTCGGAACGTGCCCTGAGAAGAGGCTTTCACTGCGTCCGTTAGTCGACTGGCAGCCTTGCGTATATGATTGCTGAAGACCAGGGAGCCATCAACTGGGTTAAGCATTCCACCGTGAGCATAGTACCAGAACTTCGATCGATCCGGCCATTTAGCGGTGGCCGGTTCGATACCCCTCTCAATCATTCTTGCCTCCATCTCCTCCCACTTCGGTATTGCGACGCTATAGCCACCTGACCCCAAGTGGTGATGATACTTCTTCTTGGCAGCGTTTTCCTTGTTTTTACCATCATCGCTTGCCCTTGTTGCCCTGTCTTGTAAGCAACGAACTCGTCCCAATGATCCCTTAGCTTTGAGAATACGTCGAAGTTCGGTGTTAGTCCCTTCAGGATGTATTTCTTGTACAGATCTCCCTTGAAGCTCTGGAACTGTTCTGCCATTTTCTTAAGAGTCCACTATTTCACTATGTTCTCCATACCCATAGGGAGCGTGAACATCTCGAGCATTGTGGTCCACAGTATCTCTTTCTCTGATTCCGGGACAAAGCTATCATTATCCCCGCGTGCTCTTGTTCTACGCCAGTACACCTTGCTGACAGGCACGTTATCTCTCACAACCCAACCGCTGTGGCGTACAAAATTCTTGGCTACTTCTACCGGGGCACTAGGTCAGCCGTCTGCGTCCACCTCAGTTATGATGTGCCGACCCTCTATCTTCTTCACGGCACCTCGTTGTCCGCGTGCCCTCTTCTGTCCAGTGGAGGGACGACTTCCACTAGCCTCCTCCTCGTTCCCTTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCTGCATCCCTCTCCATGTTCCCCTCCTCGTTCAAGTACTGGTTTGTATCCTCGTTCCCCTCTTCTTTGTTCCAGTACTGGCTGCTTCCCTCTACGATTGTATCGTACAGTATCTGTTCATCATCGTGATCAGCCATCTGTTCATAGAAGAAATATTTGCTAAGCGTAATATTAAAACTCTACTAATCTTGTATTAAAACTCAAATAATCATATATGCTAAGTCTAAGTGTCGTGTGTTATAACCCTAGATAATCATATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGAATATTACATTTCTAATAATCTTATATTAAATCTCAAACAATCTCTAACAATCAAATATGCTAAGTCTAATTAAGTTCCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATTTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACTCACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTTTAACACTCAAATATGCTAAGTCTAATAATCTAATAATCTCTAACACTCACATATGCTAACTCTAATAATCTAATAATCTTATATTAGAAATCTAACAATCTTATATTATATCCCTAACAATCACATCTTTACATCACTTGCCTGCGCGAATTCCTTCGAGGGCTAGCTACCACTTCGGCTTGGGGGACGACGACGACGACGTCTTCTCTGCAACATGCAAAAAAAATGTATTAGTCTAAATGCAAAGGAACATATAATGTATTTCACGTTTCCAAGTATATATAATCATATATATATGCTAAGTTCAACAATAGTTTAATTATATCGTTCATACACATTTCGCTCGCGTTCGTTCTCACACTTTTAGTTCAAGTGCATTCACGTTCGTTAACGTTTCAATCACGTTCGTTCGCGTTTCATTCACGTTCGTTTGAGTTCGTTCACTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTCATGTTTGTTCACGTTTCGTTCGCGTTCGGTCGCGTTTCTTTAACGTTTCGTTCGCGTTCGTTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTAAGCGTTCGTTCGCGTTCGTTCACCTTAGTTCGCGTTCGTTCGCTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTGCTCGCGTTCGTTCACATTCGTTCA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