Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: IR64_FH838_DEL1206700

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

DEL

Chr12

7628983

7639191

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

10603 bp

5540962

5551564

5 There is no gene in this region.

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IR64_FH838_DEL1206700	Chr12	7628983	7639191	5540962	5551564	10603
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IR64_Y3551_DEL1206690	Chr12	7628983	7637142	5543545	5551887	8343
IR64_MH63RS3_DEL1206720	Chr12	7628983	7637142	5546787	5555129	8343

>IR64_FH838_DEL1206700
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAAAGCTATAGCTACGACTTCGACGCTGGCGTTACGTCAGAAGAGGAAGGACCGACGTTATGAATTGTCGATCCGTCGTAGTAGAATTCACCATCGGGATTAAGGACTTCTTCGTTGATGAACCCCATCAGTTGTTCTTGAACAGCCGTGATAAAATCCTTGTGTGGGAGATTTTCCCTCATGTGAATACGCTATCATTCGAAAAATAATGACATATCAATATATGAAATTAATAAACAACTTAACAAATCGATACGCAATGAAATTTTGAATGGTTTATGTATACGTACATCGAGCTCTCGTATGGTGTATATTTGGTTTGATAGGCAGTGGTCATACTCGCATACGTAGTAGCCGCATAAGTTAGTTCCCTGGTCCTGCTTTGCAAACTACATGAGAAACGATGAGAGATTTAATATACTCTTTATATTAACTGTAATTAGAGATTCAATTCAATATAATTTTGGATCATGCATGTACTCACTGGAAAATGAAACCTCCATCCAAGTTTTTCTTTCCAAGTCCCGCGGACCAATTGACGGAACCAATCCCAAGCCCTACATGTGCAGTTGCTAGCTATGATTAATTAATTATTACCCGAGATCAACATAATAGCAACAGAGTCCCGTGACTTTGGAATAGATGGTATTATATTACCTGTCTATCAGTTGGAAGACCTTGTCAAAAACCTTCTCCTCTTTATTCATTGAGTCGTACACAGTGACTCTGCATGCGTCCAAGTCGAAAAAGAACAGGACCTGGTGGAATCTGGAATATGCGTGAGATGAGATAAATATCAGAATGTATATGTTATATGTATGGGAATGAAATTTGTTCGAATGACAATAAAAACTCACTCTGTGTTGTACGGCAATAGTATGAACGTCTTGAAATGCTGCTGCGTTAGGAGATGGACGAGATTGTCCTCTGTGTCTTTCTCGTACTTGTCAATCATTTCAGTGTTGATTTTCCGAGGGTCGATGAACCCAGTATCGTAAACCCCCCGCCGTCGGGCCCTTTGAATCTCCATTCTACAACAATAAAAGGAAATTATTATTGCTTACATATATGCCAGGAGCTAATTATTGAACGAAACAAATCGAACTCAAAGATACTTACAAAATCCATGCGCCCAGAAGAGAGACGTCGAGGGCGTCCAGATGGTACAGATCGAAGACATCCTTGAAATGGATCCATAGAACATCTTCTCCTTGCAAGAAATCAGGGTTTCTGATCCTCGCTCTGAACATCTCTCTACCCTTGGCACTCATTTCCATGTACCGTTCATGGAATTTGTATATTTTTGTCGGTAGGGACTGCAACTGCTCAGGCCTAACAAGTGGTTTACCGAGTTCAAACTTGTATGCCACTTCCGCCTTCGGGATTGGTGCGCCTCCAACCAACTGAGCCACAGTTAAACCGGTGTCCGAAATAAAATCCGTTATGCCAAAGTCTTCGCCGGTTACCAATGGCTCGACCACTTGGTTTGGTTGTTTTCCAAGCTGAGGAATTGGTTTGGACTTCTTGTAATAGGCTTTCCTAAGTGTTCGGTCATAGTCCGATAGCTTTAAGGCCTCCTTGTTTGTGGTGGACATTCCCTTGAAGAAATTCTTCATGCTCGGGTCAATAGGTATCTTCTTTTTAGGACTCCGAGGCTTGAGTTGCCTCTTCACTTCTCCTGCCACATAAGCGTCAAGCTCCTCTTGACTGCAATCGTACGGCGGCTCCTTGTTTTGGGTGGTGTCAACTTTGGCCTTCTTCGTTGTCCTTGTGCTGGCAGAAGGTGGAGCTTGGCGAGACCTTGTCTTGGGAGGTGCAGGCGGACACGGTGGAGGCGGAGGCGGAGGAGGCGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGCAGGAGGAGGTGGTGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGTAGGAGGACGTGGCAGAGGAACCGTTGGAGATGGTGCAGGAGGAGACGGCGGAGCCGGAGGAGATGGTGCACGAGACGCCGCTTGTCGCCCAGGGAGGATGATGTACCGCTTGCGCCATAGTATAATGGCGTGGCTTGTGTCTCGTAGATGCGTCTCACCGTCTCCTCCTGGGTAGTCCAACTCGAGGTCCTCGCACACGGCTTCCACCAGCTCAACTTCGACCCTCGAGTATCCTGCTGGAATCGGCCTGTAGTGGTAAGTCCCTGAAATGTCCGTTGGGATGGCCATTCCCGACGCCACCTTCACGTGATGAGAGGTTATCTATTAGTAATCAACCTAAGCAGCAACCTGCGGAACGTACAAGTAAAAAATCATATATTACATCGAGCATACCTTGATTGATAAGTTCTTGAAGGGAATATGCAGCACAAATGGTGTCCGTTGCATGATCTCATCAACAGGGCAGGTGGTTTTGTCCTGGGTTTGCATGGCGTCCATGCTCTGTGATCCTACCTGCCCCGTTGAGGCGCAGATACTACGATTGCCTGATGGGCTGACCATTGGAGGAGGTATGTACAGCTGGGGATCGTGTGACCGATGTGCTGCCATGCGTTCATCCACCTTCCGGGCCACCTCCTCTTGCATGCTGAGCTCGTAGCTCGATACCCTGTACTCAAGATATGCAATCTTCGCCTCGGTATCTCTCTTGCTCCTCATCCGACTCTTGTACGTGTGGATGTCCTCCTTGAATCCAATCTTCCAGGGAATCACGCCTTTCCCTCGTGTTCGTCCTGGATGCTCGGGAGTTTGTAGGGCGAGTGACAGCTCGTCCTTCTCTCTGTCGGGTCGGAACGTGCCCTGAGAAGAGGCTTTCACTGCGTCCGTTAGTCGACTGGCAGCCTTGCGTATATGATTGCTGAAGACCAGGGAGCCATCAACTGGGTTAAGCATTCCACCGTGAGCATAGTACCAGAACTTCGATCGATCCGGCCATTTAGCGGTGGCCGGTTCGATACCCCTCTCAATCATTCTTGCCTCCATCTCCTCCCACTTCGGTATTGCGACGCTATAGCCACCTGACCCCAAGTGGTGATGATACTTCTTCTTGGCAGCGTTTTCCTTGTTTTTACCATCATCGCTTGCCCTTGTTGCCCTGTCTTGTAAGCAACGAACTCGTCCCAATGATCCCTTAGCTTTGAGAATACGTCGAAGTTCGGTGTTAGTCCCTTCAGGATGTATTTCTTGTACAGATCTCCCTTGAAGCTCTGGAACTGTTCTGCCATTTTCTTAAGAGTCCACTATTTCACTATGTTCTCCATACCCATAGGGAGCGTGAACATCTCGAGCATTGTGGTCCACAGTATCTCTTTCTCTGATTCCGGGACAAAGCTATCATTATCCCCGCGTGCTCTTGTTCTACGCCAGTACACCTTGCTGACAGGCACGTTATCTCTCACAACCCAACCGCTGTGGCGTACAAAATTCTTGGCTACTTCTACCGGGGCACTAGGTCAGCCGTCTGCGTCCACCTCAGTTATGATGTGCCGACCCTCTATCTTCTTCACGGCACCTCGTTGTCCGCGTGCCCTCTTCTGTCCAGTGGAGGGACGACTTCCACTAGCCTCCTCCTCGTTCCCTTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCTGCATCCCTCTCCATGTTCCCCTCCTCGTTCAAGTACTGGTTTGTATCCTCGTTCCCCTCTTCTTTGTTCCAGTACTGGCTGCTTCCCTCTACGATTGTATCGTACAGTATCTGTTCATCATCGTGATCAGCCATCTGTTCATAGAAGAAATATTTGCTAAGCGTAATATTAAAACTCTACTAATCTTGTATTAAAACTCAAATAATCATATATGCTAAGTCTAAGTGTCGTGTGTTATAACCCTAGATAATCATATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGAATATTACATTTCTAATAATCTTATATTAAATCTCAAACAATCTCTAACAATCAAATATGCTAAGTCTAATTAAGTTCCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATTTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACTCACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTTTAACACTCAAATATGCTAAGTCTAATAATCTAATAATCTCTAACACTCACATATGCTAACTCTAATAATCTAATAATCTTATATTAGAAATCTAACAATCTTATATTATATCCCTAACAATCACATCTTTACATCACTTGCCTGCGCGAATTCCTTCGAGGGCTAGCTACCACTTCGGCTTGGGGGACGACGACGACGACGTCTTCTCTGCAACATGCAAAAAAAATGTATTAGTCTAAATGCAAAGGAACATATAATGTATTTCACGTTTCCAAGTATATATAATCATATATATATGCTAAGTTCAACAATAGTTTAATTATATCGTTCATACACATTTCGCTCGCGTTCGTTCTCACACTTTTAGTTCAAGTGCATTCACGTTCGTTAACGTTTCAATCACGTTCGTTCGCGTTTCATTCACGTTCGTTTGAGTTCGTTCACTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTCATGTTTGTTCACGTTTCGTTCGCGTTCGGTCGCGTTTCTTTAACGTTTCGTTCGCGTTCGTTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTAAGCGTTCGTTCGCGTTCGTTCACCTTAGTTCGCGTTCGTTCGCTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTGCTCGCGTTCGTTCACATTCGTTCACG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