Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: 128077_G630_TRA1123180

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

TRA

Os GJ-trop2: KETAN NANGKA | Os128077RS1

Os XI-adm: G630 | G630

Chr11

12439183

12453290

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

14140 bp

13325939

13340078

16

Gene_id	Chromosome	Start	End
OsG630G1117326700.01	Chr11	13331991	13333945

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>128077_G630_TRA1123180
TGATGAACCCTGAGTTCCTCTCGACACTCAAGGCTGTTGTTGGCCCGATCTTTCGGTGAGTTGTGATAACTACGATTTGGGAGAAACGTTGACAATCCGACTACAACCGTACGAGATGTTGTGTTGCGCCTTACCGATCGATACACCTCTCCATGGGTTGTTGATCTTGCCGGTACAGATCAACCCTATTCCTGCAAGCAAATCGAAGAAACAAGCAAGAACAAGATAAAAGCAATCTGATATTGCAAATAGGAATTTAATACAAATGATAAGTTGGGGTTCCGAAGAACAAGCAGACGGACGGTCTAGCCGACACGCGCGCTGCAAGCAAGTAGCAATGGCTAAACTTTAATCTATCAAAACCCCAGAAACCCTGAAGGGGTAACTAGCTATATATAGGGGTGGGAGGACGACCTAGGGGTGCCTAGGGTCGTGCTCCACCAGCTTGGGGCGCACCCCACATGGGCCCCACCTGGGCCGGGGTCCCAAATGAAGTTACAAGCCCATAGGCCCATTATAGGTGACGCAGCACCTTGTTCCTGTGATTCCGGCCACACGATATGGAATTCAGAGAAGAGGCTAGATCCGTTAGAAAGAGGGCTCCGAGAGCTTTCCATCAAGTACTCGCGGGCCGAAAACGAAAGTCGTATGCAGATTCGGTGGCCGTTTGAAGTCAACAGTGTAGTAGGTGGCCGAATCGGATTCCAACACTTGGAGTACTTGATCTCGATATCTTCTTGTTCATCCATGATGTGAGCAATGGTTGCATCCGTGGTAGCCATGGTCACATCAGTTTTACTCTAGCCTGAGATATACCACTGTACCCACAAGACACAACCCACCGGCTTGTTACCGTGCCCGGCCAGACACGTCACCATGTGGAGTTGTTGTGACAAGACCCCTCACATAACTCAACTCAAAGCAGCGCACCGTTCCTAGATCGTCCCTCAAAAGCCAGAGGCATGGACTCCCCAGCGACCCCATTGACTTCTCACCGCTTCACAGTCTGGCACACCACAATGAGCCATGCTATACAAAGTGTCCAGCATTGCCCATGCTGGCTTGTGGTTGGCACGGTTAATGTTTCACAACAATAGCTCGCGAACCGGTCCTTAATTGTCATGAGCACGACCATCAAAACCATGTGCTCACAACCCACCTTTAATCAAGTTTTAGTTCACAACTAATTAATAACCAATCACGACTGACCATCGTGAGCTACCATTAAATATCCGCTCGTCAGTTGGGCTGGCTACATGGTTCTGGAGGGAGGGCTGTTAGACCAGTAGGCGACGACAGTAGCGAGGTGGCGTTGAAGCCTATGATGAGCTTCCTTCCAGGCATTTAGAAGACCCATTTCTTAGGGGTGTTGTGTGCTTGTTCTGTTTTAATCGGTAGGATCAAACGTAGACGCGTGGTTTTGTTGTATATTTTCCTTTTTTCTGACTATAGTCTCCCAAGACTATAGAATTATATTTTACTAGAAAAAATACCACTCGAATGCTATTTTAATCTTATTATTGTTATACGGTTTAGCTAGGATGAAATTCACTATGGGAATTCACTTGGAATTTTTTTAGAAAATCATGAGCTTCAATTCGGAGTCCGACATTCATCTCAAGTTAGCATGTATGTTTTTTAAAGAAATTTCTTATACGACTTCTTTTGTATTTTCAAAAGCAAATGAACTTAAAATCCGACTCATATGCGGATCTCTATTTTCAAAAGCGAATGAACTTCAGAACCGACTCAAATACGGATGATGTACCAAAATACCAGCAAAAACATTTTCAATTTTTATAATTAGTTGGGTGACCCGCGCAATTGCGCGGCTAGCACCCAGATAAAATTATCTATTTTTTAATTTGGCATTACTTAAAATTTGTTAAATAGCCATTATGTTGTCTTATAACCTTAAAAGATTGAACCTTATCCTCCTCAATTTTTTATAGTTTTTATTTAAAGGCACACCAGTCATTAGCTCTTACTCTTTTATGACCCCTTTATTTTTTTTACGAATTACATAGTACAACACAGACACTCACAACGTGCACACACACACCCCTATAAATGCACGCACGCAAACCCTACCCCTATGAGCATCTTCGTAGACTGGGTCGGCAAATCCTGGAGATTGACGAAGTTATCACAGGCGCCTTGCTGTCGAGAGGTACGTCGCCTACCAATGAAAGCACAATGCCGTTAAATCCTGGAAAATTCGCTCCCATAGGGAGTCGAACCTAGGACCTAAGTTGCTACTGAGGCTCTTGTAACCATTAGGCTACATGCCCTTTCGCTATCACCCGTTTATTTGTTTATCCAGTCTATCACGGCTTTTATTTAACTGCCTTTAAACCTTTAAAAAATACACCTTCTAGTTTTTAGAGTCCATTGTCTCGACAGGTTCCGTTACTATAATTTTTAGGAGAGTTGTCAAACGTCAATATTGTATTTCTCTATGATCCGCCTGTTGTCTCCCATATTTATTGTTGTTGGTATTTTAAAAATTGAACATAACTATCGTTGGGGTTCATCTTTTACTTTCTAGAAATCCACCCAACCGTCGCCGGCTTCGCCATACTATACGCATGTATTTTTATTATCATTGAGATTTTAAAAATCGAACATGATTATCACTGTGATTTACTTTTTACTTTCTAGAAGTCCCGCCAACTGTCGTGATCGTGACTTGTCTATCGTCCCTCCTCTTAATCATCATTGAGATTCTGCCACCAACATACTCCTTTACGGTCCTAATATCCTCTCCTCTTGATTGTTATATGTCATCATTAAGTTTTAGATGGACTATTTTTTAAAAAAAATCGATATTTTTCATTCCAATATATTCTTATTTTCCTACTTGAACTCTTAGAATTATTTCTCTATTTTCAATTTTTTTATTTTTTATTTTGAATTTTAAGGATTCATTTCTCTACCTGCCAACCGCCATCGGTTCCACACCACTATACTCCTGTATGGCATGCTGGTTGTCTGCCTTATTTATTACCATTGAGATTTTTAAAACAAAACAAGATTGCAATTTTTTAATCCAAAAAACATGATTGTTATTGCGATTTACTTTTTTACTTTATAGAAGTCCCGCCAACCGTCATGACTATGCTGCTCATCGTACTATCCATCGTTCCACCTCTTAATCGTTCTTGGGGGTTCTATTTGTGGTTTTATTTATAATTTTTAGACGTCTCATCAACTGTTCAGCACCTTACTGTTTTACAGGCATATTACTTGTCCTTTTTTTATTGTTGTTTGTAATCGTTGATTATTTTTTGAAAAATCCATATTTTTTATTCTGATATTTTTTTATTTATAAAGTATATTTCTACTTGAAATCTTATAGTTATTTTTCTATTTTCGGAATTTATTTTATTTTTTATTTCGAATTTTAATTATTCTGGTATTTAGTTCTATAATTATTCTGGTATTTAGTTCTATAAGGACTCTTCTTGATATTAATTATTTTTAATTCCGAATTTCAATTATTTCTAAATTTACTTTAACTCTCTTTTTCTCTTTTCTAATTTTAGAATTTATTCTATTTTTAATTTCGAATTTCATATATTTCTAAATTGTATTATAATTGAATTCTTCTTTTCTTTTTCTCCGATTACTATGGGAATTTCTAGCCTCTACAGCTAAGGTGGTGCCTTTTTTCAAGGCTGTTTCAATAATCTTATCTTAACTAATTAAAAGATTCGTATTTTTTCTTTTGTCACTTTTTTTCATCCGTAATTCCGACCAAACGGCGCCCTCCGTCTCCGTCTCCGTCTCCGCACGTAATACGACCAAAGCAATGCAAAAAAAAAATCAGAGATCAGAGATTCATACTAAATCCTAATCGTGCACAGGGGACAAATCACAACATCAAATATCGATTAAAACCCCATTGAGCAATTAGAAATCTTACATGCATTGGAAAAAAGAAAAATAAAATAAAAATCATACAAACCATTGATGGTGCTGCTGCTCATAGTCCATACCATCAGCTTGAGTCCCCAAGCATTGGCCAGCGTGGCATGGCAACTAGGAGGAGACAACCATCGGTGGCTCGGACGGCGGGGCAATAGGGAGGAGGAGGCCTTGGCGGCTCGGTGAATGGCCATTGGCGGCAGCAGCGGCAGCGCTACATGAGGACGGTGGAGGAGGGGGCCATGAGGAGACGGTGTATGCTCGGAGGAGGAGGTGGAGGAGTCGATGAGGAAGAAGAGGCGGCGGCGGCGGCGCCGACACACGGCGTGCTACGCAGAGCGGAAGAGAAGGAGTGATGCTAAGTAGGGAAAAACGGCGGCGCACGATACGGAGTGGGAGAAGGCGGCGCACGATGCGGAGTGGGAGAGAGCCGGAGTTTTAGGGTTAGTTATTGGGTTGCTTTAGCTTGGTGGGCCAATTGGGCCAAATTTAGTCTGGTTGGTCTTTTTTTTATGTAATAAGTCCACTCTAACTCCCTCAATATCGCTTCAATTTAATTTATATCTCGAACCACAATAACGAATATTTTGACCCCTCACAATTAAAACCGGTTTAATTTAACTTTCTTAGTGGTTTTAAAGGACGGTTTAGCTGACATGACGCTTTAACTTAGTCTAACCTACCGAGTCATCCTACAGGACCCACCCATCAATGGCCCTTATATTTATTCTCTTCCTTTCCTTTCCCCTCCATCAGATCGGTGTTGCCCCATCTCTCCCCTTCCTCTCCACGTCGAGCCGCCGTTGGAGAGAAGCTCGGACGTCAAAGGGAGTATAGCTTTCAATGGAAGTGGTTATAGTAATTTTTTTTCATAGCTTTACCAATCTGTCATGTATGTATTGATTTCTTTGTTAGTGATTAGTTTTAACGGTGTATTTTTTTAAAATATTATTCTTTTAAAGTGCTCATATAGCAAAAAATAATTATCTAATAAAATTTGAGTGAAATTTGTGTGGTCCCGATGCAACGCACGGACACTTTGCTATGCTAGACAGATTCAGATAGATGGAGAT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