Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: 127652_R527_OTH0120990

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

OTH

Os cA2: NATEL BORO | Os127652RS1

Os XI-1B: R527 | R527

Chr01

14758502

14758571

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

4812 bp

15022584

15027395

10 There is no gene in this region.

SV_id	Chromosome	ref_start	ref_end	query_start	query_end	length
127652_127518_OTH0120380	Chr01	14758502	14758571	15033237	15038045	4809
127652_127742_OTH0120190	Chr01	14758502	14758571	14844970	14849780	4811
127652_132424_OTH0119270	Chr01	14758502	14758571	14883871	14888681	4811
127652_D62_OTH0118470	Chr01	14758502	14758571	14842123	14846933	4811
127652_FH838_OTH0120990	Chr01	14758502	14758571	15293303	15298113	4811
127652_G630_OTH0120700	Chr01	14758502	14758571	15014195	15019005	4811
127652_R498_OTH0120190	Chr01	14758502	14758571	14869342	14874152	4811
127652_R527_OTH0120990	Chr01	14758502	14758571	15022584	15027395	4812
127652_Y3551_OTH0120650	Chr01	14758502	14758571	15017743	15022550	4808
127652_MH63RS3_OTH0120880	Chr01	14758502	14758571	15025555	15030365	4811

>127652_R527_OTH0120990
GTGACTGCAACATAAGCAGTAGCAGTGTGCATTATCGCTTATATACAAACCTGCCGAGATTTGCGGCTCCTGGAGATTTTTGAGCTGGCGTGGCCACCTGCGCGAGCCGACGCGTCATCGGCGCTGGGTCTGGTGGGATTTAACGAGCGCAGGGTAGGCTGCTGGCCATTTTGCAAAGACACCCTTGATTTATCTGATAATTTGCTATACGTCCCTAGGCCTTAGTTCTAATGCTTTGCGTTCTTACTAGGAGGACCTCTAAAGAAAAGAATATTCTATATGAAGAAGCGAAAAATCGAACTGCAGTCTAAAAACTAGAAGAGTAGGGGCTTTTTTGCAAAACAGAAACAACCCTAACTCCCTTCCCCAAACCCTAGCCGCCACCGTTCCTCCGCCTCCTCTCCTCCTCTCGCTCCGCTCTCTCCCTGCCCAAGCGACGGCCGTCGCCGCGTGCCGCTCCCCTCATCCTCTTCTTCCCACAGGTGACGACCTCCCCCGCGCGCTCTCTGCTGCCGTGCCCGCCACCGCCCGACACGCGGGCCGCTGCCGTCGCCATCCTCTCGCTCCTGCCGCCGCATCCGCCAACAAGGAGGCCGGGACCGCCGGATCCGGTGACTCCGGCCTCCTCGCCGGCAGATCCGGCCGTTGTGAGGGGAGGGGAAGCCGGCAGCTGCCCTCTACGCCCGGCACCGCCCCTCTCTCCCTCTCCATCCTCTTCGTTTCTGGATCGGCGGACGCCTGCGATTAGGCGGCCTAGGGCTCATGGTCAACAGGGACACACCGCTGTATAGAAGTCCAGCTGCTCCGAAAGATTATCTTCACCCGCAGCCCCCTGTTGTTGCCTTGAGCTACTTGGTCAGTTGAGTGCCTTCTTCTTTAATGTTTGTTTCTCTAATTTTTGAAGAATGGTGATGGATAGAAATAGGAAATGAAAGAATGCACTTTTGACAGGTTATTGGTTATTCAAGTACACCAGAAATGACCCTATTTAGCACAAAGTTGATTGAATGATTGAGATGTATTTCTTGCTTTGTCACAGCTGTTTCACTCTCTTCGGTCATAACAAGGGAGGTGGACTTCATCATTAATTTTTTGCTTAATAATGTATTAGTAGACTTCTCCCCCTATTTTGTAAGTAATAGCTGTTGCTTAAGGCTATTGTGTAATGCTATATACAGATAGCAAGTTTGTACTTTACAAAATCCTTCCTGTAGATGGTGATTAATATCTGCTCTAGAATTTAAATAGCAGCTTTCGTTTTTCCTGCCTTGCATTCATGGTAGAGATCGCATGGACAAAGAGTTGTAACCTTTTAAGTAAACCTTTCTATTTCTGATTTACTCACCTTTTTTTTTCCCTTAGGTATATAGCTGGCCCCAAAACATATATGCTTTTCTCCAATAACAACAAATTAAGATGCATTTCATCCGTTCTTGCGCAGTTCCAGTAGAGCTAAATGAACACTGGGTTTAATTATTTTGTGCGGAACTCAACTGCAACTTAATATTTACATAAATTCAGTAACCGTTGCTTCTCCGCACACACACAACAATAAGCGTTCTTTTTGGCACAAATCTGATGATGCTTCTACAGCTTACTGCCTCTGCAGCGAAGTCTAGCCAATCTGGAAGATTGACAAAATTGATTGCTTGCAGAACAAATGAGTAAGCAGTGCAATACACCCATTCTCACTTTATCTTTACACATGGGTCTTAGTGGTGTTGTATCGGATGTTTCAGTGTATGTAATTCTAGCTGATGCCATTTTCTCTCTATTTTCTCTCTTTGTTGCAATTAGCAATGACCTGATTGGGAGAAGTAGGTAAATCTGAGCTGGCTTTGACATGTAGTAGTGTGGCTTTTGCTTCATCAAACAAGTGCATCATCATAATATGGATGTCCTGAGAGGACTGCTGGACAGGCAATGCTGCTGTGGTGGTGAAAGTATTATGCATAACATTCCTTATTTTTGCTTTCAAAATGTTAATCAGGTACATCACGATGTTTTTTCCTGTACATTTCCGATATGTGCTCTGATTACTGCCGGTAAATGCTTTTTTCCTCAATGTACAAATCATGTTGCCTCACTGTGATGCTCTGCTCATCCATTACATTGGTTATATGCCAATTGCTTTACTTCTTTATAACTCCATTGATGCGGTAGCTAATGTCATATGCTCGCAATATCTTACTTTTTACCTTCTTTGATCTAATAAATAAAGTATAACCTTGGTCTTTTTATAAAACAATCCTTTTCCAATGAGCACTTATGATAACTATGTACCTCCATGCTTGAAATAGAAGATCATGCCTTTATTAACAGTATATGCTTATGAGAACTGACATTAATTTTCCCTTAGGAATAGCTGGCTTCAAAACCCATGCCTTTTTTCCCCATAACGACAAGTTTAGATGCATTTTTCATCCTTTCTTGCACAGTTCTACTGGATCTGAACGTACCACTGGGTATTTTGTACATAATTCAAATGCGACTTAATGTTTGCATAAAATCAGTCTCCATTGAAGTGAGGTTTAATATTTATGAAATATATTATAGATGCTTGGGCATGATGTGCTGTAAATTTAGAGGGGTTAGTTTGTGCTATCTGGACGAAATGTTATATATTAGCAACAGAAAACAGCAGCCGAAATATTTTTCGTTTCAAATACTCGAGCTATATGTACTTTTTATAATATGAACATGCTGATGAGTGTTTTTGACATTGTGGCCATCTCTCCTGTGATTTTGCTCCAAATTCTATAAATGGAGAACTTTTCCTTTACTTGAATTTCTCTGTTCCAAACTTGAATACTTAATTTAATTGTTTTTTTTTCTTTTCTACCATATATCTTGTATTTTCTTTTTGGTCAGATCTATATCATAGATTACACCATTTACGATATAATTCATGTGCCTCATTCTTGGTTTCAGATTGCTCAAACTAACAGTACTACATTTGAGAGCCTCAATTTTTATTGCCATCACCTGGGTGGATGTGTGCGGTAGTTTGTGGTAAGTCCAATGAATTTGCAGTGGGAATGGACTGCTCCTGGTACATAACTTCTTCCCGAGATTGGTTTTATACCTTATATCCCTTCTTAATAAAGTGATAGTGAATACAGTTATGATTGGCCACTCCTTTGTTTTAATTTGTAAGGTCCCTGGTGGTTGCTTTTTATTTCATTTCAATAAATGATTACAGAAAAAAAATATATTGATAAAGTATATGCCATTTGTTGATTCCATTTTATTGTATAGCTTTAGAACGAGGTGGCTGAACTGACCTTCTGATTGCTTCCTACAAATGAAGACGGTTTTACAGTGTTGCTCCTCTCCCAGCCTCCCACCTTCATCACTGACCTTTCCCTGATATGCAATCTCATTTGTTTGCCATTGCCCCTGTGTTTCATAAATATATTTAATCCCTGTGATTCAGGGCTTCCTGATTTGAATTTTCAAGGAAAGCATTGACATTAGGTGGTTAATACTATCCAGCTTAACTCTCTAATCAGTCACGCGCAGTCTGGATTTAGAGTGTGTTTGGTTACTGCCCTGAGAATCACGCCTGACTCAGGCATCGATCTCAGCGTTCGACGTCGTTCGCCTTCGGCTGGATCGACCTGCTTGAGAGCACTCAGGTGAGGGCAACAACCAAACAGCCTCTTAGAAATTTATGCTTCGTATGTTCTTAGTTCAATCTATGTTTTTACTTTGTCTTGCGATTTTACAAAATGTTGTGTATAAGTTTTTAGTTCAGAATAATTAAACGAACATGGCTACTTCTATTGTTACTGACAAAATTCAGTGGCGCCCTATGTTGATTGTTTATTCTTTTGACAAGGTCGGGAGAAGTGATGGACGGAGAATATCCAGTGTCAATGTTTTTCAATTGCACTTACAAAACTTATAAAAAATGTTTGCTCACAGGCCGGCAATAGCACACGCAAATTCAACAATGTCTGCTTTTGCTGAAGGATACAAAAGTGACACCTGACATCAAGAACTACACCGACATTATTGGACAGTTCCTCCTTCAAACAAGTTCTACATTGTGACTATGAACAATACATTCATGAAGCAAGATAGAATAGTAAGCTCACTTACACTAGACAACCATTGCTCTCTTCATGCCTTTGACAAAGAAATAACATGAAATTCAAATTACAGTACTTTGCTAAGGAATATCAAAGACCTACATTCAGCCACTCATGGGAGGTCGAAAAACCATGGACATTCAAGTTGAAGCAGCAGACAGAATTTCAGTCACCCTGACTCTACATGTTTCAACACATGGTCGTTGCAACTTAAAAAAAAGGATGGGCAACTTTTGCAGCGAACAATGGCATACATCTTCGGTCCGTTTACATCTTTCACTTCCACAAGGCACCTCAACTCCAAACGACAATAGATGTCTGCTAAATGCCATGTATATCGCCTATGCTATAGTGAAATCGTCCTTTTGTTAGCACTAAATTATCCCATTCATTTTAGTGCAGCAAAACTGCAAGCCTCCTCTACCACCGTTATGCTATGCTAATTAGCTTTGCACCTTAAGCACTAATGATCAGCACTCAACTCTATTGTAAATATGCAATGCCACCTACTACTACCCGCTAATATACTTGTATATGATCTATTTATCAATGCCTGCTTCCTTTCCCTTAATTTATTTCTCATATGCTTCTTTCAATATGCTCTCCTTTATCTTCAATCTTTAATATACAAACCTGCTGGGATTACTATACATATGTCCACTCTGTTTCTAACCTACTTGATTGCAGGCCGCGCGCCAACGGCGCGCTCCCCCTCTAG