Rice Gene Index: a comprehensive database for homology, collinearity, and transcripts of genes in rice pangenome.

Variation ID: 117425_Y3551_TRA1210750

Variant Type:

Ref Genome:

Query Genome:

Chromosome:

Ref Start:

Ref End:

TRA

Os cB: ARC 10497 | Os117425RS1

Os XI-1B: Y3551 | Y3551

Chr12

7788692

7798896

SV Length:

Query Start:

Query End:

Allele sv Count:

10605 bp

5541283

5551887

5 There is no gene in this region.

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117425_FH838_TRA1210860	Chr12	7788692	7798888	5540962	5551564	10603
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117425_Y3551_TRA1210750	Chr12	7788692	7798896	5541283	5551887	10605
117425_MH63RS3_TRA1211060	Chr12	7788692	7798896	5544523	5555129	10607

>117425_Y3551_TRA1210750
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGCAAAGCTATAGCTACGACTTCGACGCTGGCGTTACGTCAGAAGAGGAAGGACCGACGTTATGAATTGTCGATCCGTCGTAGTAGAATTCACCATCGGGATTAAGGACTTCTTCGTTGATGAACCCCATCAGTTGTTCTTGAACAGCCGTGATAAAATCCTTGTGTGGGAGATTTTCCCTCATGTGAATACGCTATCATTCGAAAAATAATGACATATCAATATATGAAATTAATAAACAACTTAACAAATCGATACGCAATGAAATTTTGAATGGTTTATGTATACGTACATCGAGCTCTCGTATGGTGTATATTTGGTTTGATAGGCAGTGGTCATACTCGCATACGTAGTAGCCGCATAAGTTAGTTCCCTGGTCCTGCTTTGCAAACTACATGAGAAACGATGAGAGATTTAATATACTCTTTATATTAACTGTAATTAGAGATTCAATTCAATATAATTTTGGATCATGCATGTACTCACTGGAAAATGAAACCTCCATCCAAGTTTTTCTTTCCAAGTCCCGCGGACCAATTGACGGAACCAATCCCAAGCCCTACATGTGCAGTTGCTAGCTATGATTAATTAATTATTACCCGAGATCAACATAATAGCAACAGAGTCCCGTGACTTTGGAATAGATGGTATTATATTACCTGTCTATCAGTTGGAAGACCTTGTCAAAAACCTTCTCCTCTTTATTCATTGAGTCGTACACAGTGACTCTGCATGCGTCCAAGTCGAAAAAGAACAGGACCTGGTGGAATCTGGAATATGCGTGAGATGAGATAAATATCAGAATGTATATGTTATATGTATGGGAATGAAATTTGTTCGAATGACAATAAAAACTCACTCTGTGTTGTACGGCAATAGTATGAACGTCTTGAAATGCTGCTGCGTTAGGAGATGGACGAGATTGTCCTCTGTGTCTTTCTCGTACTTGTCAATCATTTCAGTGTTGATTTTCCGAGGGTCGATGAACCCAGTATCGTAAACCCCCCGCCGTCGGGCCCTTTGAATCTCCATTCTACAACAATAAAAGGAAATTATTATTGCTTACATATATGCCAGGAGCTAATTATTGAACGAAACAAATCGAACTCAAAGATACTTACAAAATCCATGCGCCCAGAAGAGAGACGTCGAGGGCGTCCAGATGGTACAGATCGAAGACATCCTTGAAATGGATCCATAGAACATCTTCTCCTTGCAAGAAATCAGGGTTTCTGATCCTCGCTCTGAACATCTCTCTACCCTTGGCACTCATTTCCATGTACCGTTCATGGAATTTGTATATTTTTGTCGGTAGGGACTGCAACTGCTCAGGCCTAACAAGTGGTTTACCGAGTTCAAACTTGTATGCCACTTCCGCCTTCGGGATTGGTGCGCCTCCAACCAACTGAGCCACAGTTAAACCGGTGTCCGAAATAAAATCCGTTATGCCAAAGTCTTCGCCGGTTACCAATGGCTCGACCACTTGGTTTGGTTGTTTTCCAAGCTGAGGAATTGGTTTGGACTTCTTGTAATAGGCTTTCCTAAGTGTTCGGTCATAGTCCGATAGCTTTAAGGCCTCCTTGTTTGTGGTGGACATTCCCTTGAAGAAATTCTTCATGCTCGGGTCAATAGGTATCTTCTTTTTAGGACTCCGAGGCTTGAGTTGCCTCTTCACTTCTCCTGCCACATAAGCGTCAAGCTCCTCTTGACTGCAATCGTACGGCGGCTCCTTGTTTTGGGTGGTGTCAACTTTGGCCTTCTTCGTTGTCCTTGTGCTGGCAGAAGGTGGAGCTTGGCGAGACCTTGTCTTGGGAGGTGCAGGCGGACACGGTGGAGGCGGAGGCGGAGGAGGCGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGCAGGAGGAGGTGGTGGAGGAGCCGGAGGAGATGGTGTAGGAGGACGTGGCAGAGGAACCGTTGGAGATGGTGCAGGAGGAGACGGCGGAGCCGGAGGAGATGGTGCACGAGACGCCGCTTGTCGCCCAGGGAGGATGATGTACCGCTTGCGCCATAGTATAATGGCGTGGCTTGTGTCTCGTAGATGCGTCTCACCGTCTCCTCCTGGGTAGTCCAACTCGAGGTCCTCGCACACGGCTTCCACCAGCTCAACTTCGACCCTCGAGTATCCTGCTGGAATCGGCCTGTAGTGGTAAGTCCCTGAAATGTCCGTTGGGATGGCCATTCCCGACGCCACCTTCACGTGATGAGAGGTTATCTATTAGTAATCAACCTAAGCAGCAACCTGCGGAACGTACAAGTAAAAAATCATATATTACATCGAGCATACCTTGATTGATAAGTTCTTGAAGGGAATATGCAGCACAAATGGTGTCCGTTGCATGATCTCATCAACAGGGCAGGTGGTTTTGTCCTGGGTTTGCATGGCGTCCATGCTCTGTGATCCTACCTGCCCCGTTGAGGCGCAGATACTACGATTGCCTGATGGGCTGACCATTGGAGGAGGTATGTACAGCTGGGGATCGTGTGACCGATGTGCTGCCATGCGTTCATCCACCTTCCGGGCCACCTCCTCTTGCATGCTGAGCTCGTAGCTCGATACCCTGTACTCAAGATATGCAATCTTCGCCTCGGTATCTCTCTTGCTCCTCATCCGACTCTTGTACGTGTGGATGTCCTCCTTGAATCCAATCTTCCAGGGAATCACGCCTTTCCCTCGTGTTCGTCCTGGATGCTCGGGAGTTTGTAGGGCGAGTGACAGCTCGTCCTTCTCTCTGTCGGGTCGGAACGTGCCCTGAGAAGAGGCTTTCACTGCGTCCGTTAGTCGACTGGCAGCCTTGCGTATATGATTGCTGAAGACCAGGGAGCCATCAACTGGGTTAAGCATTCCACCGTGAGCATAGTACCAGAACTTCGATCGATCCGGCCATTTAGCGGTGGCCGGTTCGATACCCCTCTCAATCATTCTTGCCTCCATCTCCTCCCACTTCGGTATTGCGACGCTATAGCCACCTGACCCCAAGTGGTGATGATACTTCTTCTTGGCAGCGTTTTCCTTGTTTTTACCATCATCGCTTGCCCTTGTTGCCCTGTCTTGTAAGCAACGAACTCGTCCCAATGATCCCTTAGCTTTGAGAATACGTCGAAGTTCGGTGTTAGTCCCTTCAGGATGTATTTCTTGTACAGATCTCCCTTGAAGCTCTGGAACTGTTCTGCCATTTTCTTAAGAGTCCACTATTTCACTATGTTCTCCATACCCATAGGGAGCGTGAACATCTCGAGCATTGTGGTCCACAGTATCTCTTTCTCTGATTCCGGGACAAAGCTATCATTATCCCCGCGTGCTCTTGTTCTACGCCAGTACACCTTGCTGACAGGCACGTTATCTCTCACAACCCAACCGCTGTGGCGTACAAAATTCTTGGCTACTTCTACCGGGGCACTAGGTCAGCCGTCTGCGTCCACCTCAGTTATGATGTGCCGACCCTCTATCTTCTTCACGGCACCTCGTTGTCCGCGTGCCCTCTTCTGTCCAGTGGAGGGACGACTTCCACTAGCCTCCTCCTCGTTCCCTTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCCGCATCCCTCTCCACGTTCCCCTCCTCGTTCCCCTCTGCATCCCTCTCCATGTTCCCCTCCTCGTTCAAGTACTGGTTTGTATCCTCGTTCCCCTCTTCTTTGTTCCAGTACTGGCTGCTTCCCTCTACGATTGTATCGTACAGTATCTGTTCATCATCGTGATCAGCCATCTGTTCATAGAAGAAATATTTGCTAAGCGTAATATTAAAACTCTACTAATCTTGTATTAAAACTCAAATAATCATATATGCTAAGTCTAAGTGTCGTGTGTTATAACCCTAGATAATCATATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGAATATTACATTTCTAATAATCTTATATTAAATCTCAAACAATCTCTAACAATCAAATATGCTAAGTCTAATTAAGTTCCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACACACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATTTTATATTAAATCTCTAACAATCTCTAACACTCACATATGCTAAGTCTAATTAAGTTTCGTATATTAAACCTCTAATAATCTTATATTAAATCTCTAACAATCTTTAACACTCAAATATGCTAAGTCTAATAATCTAATAATCTCTAACACTCACATATGCTAACTCTAATAATCTAATAATCTTATATTAGAAATCTAACAATCTTATATTATATCCCTAACAATCACATCTTTACATCACTTGCCTGCGCGAATTCCTTCGAGGGCTAGCTACCACTTCGGCTTGGGGGACGACGACGACGACGTCTTCTCTGCAACATGCAAAAAAAATGTATTAGTCTAAATGCAAAGGAACATATAATGTATTTCACGTTTCCAAGTATATATAATCATATATATATGCTAAGTTCAACAATAGTTTAATTATATCGTTCATACACATTTCGCTCGCGTTCGTTCTCACACTTTTAGTTCAAGTGCATTCACGTTCGTTAACGTTTCAATCACGTTCGTTCGCGTTTCATTCACGTTCGTTTGAGTTCGTTCACTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTCATGTTTGTTCACGTTTCGTTCGCGTTCGGTCGCGTTTCTTTAACGTTTCGTTCGCGTTCGTTCACGTTCGTTCGCGTTCGTTAAGCGTTCGTTCGCGTTCGTTCACCTTAGTTCGCGTTCGTTCGCTAACACTCACGTTCGTTCACGTTTCAGTCACGTTGCTCGCGTTCGTTCACATTCGTTCA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