Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_09g0015750 OGI:09056850 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr09:21034113-21051309
Gene Symbol Os_F0710, OsFbox495, Os_F0522, Os_F0789
DNA seq

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Function -

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_09g0015750 OsPr106_09g0015750.01 Chr09 21034178 21051309 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_09g0015750 OsPr106_09g0015750.02 Chr09 21043438 21051309 - NAM
CDS seq

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MGITLEMNRVMPTRRRRQRRRRRRNRHRYRSIAKLGKRKFSPSQQDDDSQGAKRMKNSGMLLSKTDFISKVDHILKRHSGTCVKTFKLEVPYELDVCDHVDRWLQFAITPAIEELTLTLYGTAQKYNFPCSLLSDGMADSIRILDLGHCAFCPTIEPGSWRSLKRLCLSFVRITEDDLGCLLLNSLALEGMELRHCDEIVSLKIPCTLQQLSYITVSECSRVRVIENKAPNVSSFYFTGNKVKLSLGEWLQVKKLNMRSSRIVRYARATLPSMMPNVETLSIGSLREVFNTPMLPTKFPYLKYLSISLIGLTNSPAYDYLSLVSFLAASPLLETFFLAISQQQAEQESIFGSSSLMRQIPEHRYEYLKSVTINGFCSAKSMVELTCGLIAKSAKRKRSHCQQDDDDSQGGKRMRNSVPTLPEDIWCHIHSLMPMRDAARVACVSRAFLSSWRCHPNLTFNEHTLGLDEYVFETDFISKVDHILEKHSGIGVKTFNLQVPYELDVCDHLDHWLQFAITPRIEELNLMLYGTVQEYNFPCSLLSDGIANSIRFLDLGHCAFHPTVELGSWRSLKRLCLSFVHITGDELGCVLSNLFALEWLELIYCDKIASLKIPCTLQRLSYLKVSECSRMRVIESKAPKVSNFYFTGYKVKLSLGEWLRVKELCMLSSHLVCYACANLPSMMSNLETLSICSLDEVVNTPMLTTKFLYLKYLSISLSGLTVSPSYDYFSLVSFLDASPFLETFFLAISKEQMKRESKFRDSSHMRQIQEHRHEHLKSVTIIGFCSAKSLVELTCHILENAVSLECLTLNTTLGFASRSEHSPGTCFPMGKAVLMGVPKALSAIQTYIVGKVPSTVRLNVMEPCNLCNGIGH

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_09g0015750 OsPr106_09g0015750.04 Chr09 21047788 21051295 - IsoSeq
CDS seq

atgtctgtgaccatgttgatcgttggcttcaatttgctattacaccagcgatcgaagaactcactcttacgctgtatggaactgctcaaaagtacaatttcccatgctcacttctatctgatgggatggcagattctattcggattcttgatcttggccattgcgccttctgtcccacaatcgaacctggttcatggagaagccttaaaaggctatgtttgtcttttgtgcgtatcacggaggatg

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Protein seq

MSVTMLIVGFNLLLHQRSKNSLLRCMELLKSTISHAHFYLMGWQILFGFLILAIAPSVPQSNLVHGEALKGYVCLLCVSRRM

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr09 21049352 21050110 - OsPr106_09g0015750.04 OsPr106_09g0015750.04,OsPr106_09g0015750.02 All
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A5 Chr09 21043932 21044137 - OsPr106_09g0015750.02 OsPr106_09g0015750.03,OsPr106_09g0015750.02,OsPr106_09g0015750.01 All
A5 Chr09 21044180 21044377 - OsPr106_09g0015750.02 OsPr106_09g0015750.03,OsPr106_09g0015750.02,OsPr106_09g0015750.01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.578064 3.825436 14.007648

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0502900 RBH 0.000000 0.525712 2.021904
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g32600 RBH 0.320174 0.108494 0.352592
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0502800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0015620 RBH 0.462841 1.751757 2.570502
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0015630 RBH 0.143939 0.418935 0.368326
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0015850 RBH 0.444246 0.0 2.228222
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0015610 RBH 0.059847 0.106295 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0326200 RBH 5.3888455 3.126287 5.375338
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0015600 RBH 0.132849 0.072648 0.519741
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0315200 RBH 1.824517 0.802349 4.738747
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0015570 RBH 0.104130 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0015440 RBH 0.265119 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0015500 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0015360 RBH 0.143628 0.0 0.554072
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0015480 RBH 0.147261 0.690092 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G015880 RBH 0.122106 0.875533 1.501507
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0015670 RBH 0.489735 2.735040 3.352199
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