Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_07g0026100 | OGI:07075810 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:28467083-28477052 | ||||||||
| Gene Symbol | OsWD40-148 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MACIKSAQRAALTALAPEAPYLAAGTMSGAVDMLFSASANIEIFRLDFQSDSPDLPLLASAPSPDRFNRLSWSRPSAADGDSFSLGLLAGGLSDGSVAVWNPLSMINSEGKAEDALVARLEKHTGPVCGLEFSELTPNRLASGAEQGELCIWDLKNPSEPVVFPPLKSVGSSAQAEISYLTWNPKFQHILATASSNGMTVVWDLRNQKPLTSFSDSNRTKCSVLQWNPDMSTQLIVASDDDNSPSLRVWDVRKTISPVREFVGHSKGVIAMSWCPYDSSYLLTCSKDNRTICWDTVSGEIMSELPASSNGNFDIHWYRKIPGVVAAASSFDVKIGIYNLEFSGLYAAGDSAIGAPARPRAPAPKWLKCPTGASFGFGGKLVSFHQAAPTQGAQVTTSEASLLCHFPVHVHNLVIEQSLVSRSTEFEAAIQNGDKSSLRALCDKKAQESLSDEERETWGFLRVMFEDGDAARTKLLAHLGFNPPQEQTSSSTDELNRTLADTLNLDHGAPTDTSDSQFMVDNGEDFFNNPQPSEASLAEESISTNGQQIEQEMPVNVEPSDPSVDKSIQHALVVGDYKGAVNLCLAANRMADALVIAHAGGSALWESTRNQYLKNTVSPYLKVVSAMVGNDLMSFVSTWPLNAWKETLALLCTFARKEEWNVLCDTLASRLLGVGDTLAATLCYICAGNIDKAVEIWSRDLKSEDGGKTYVDLLQDLMEKTITLALATGHKSFSASLSKLVENYAELLASQGLLKTAMEYLKLLGSDEHSHELAILRDRIAFSTEENHAASTSVHAGSINSSAYPTIQPSYSTPDPSQNLYQGTSQYAVPSNQYQDYQQQSNTAYGTYNSTYSQQPTQMFVPSNTTPVISQPNATPAPVPQQPVKAFTPTNLPGLKNPEQYQQPTLGSQLYAGANPPYTSGQSTPYQGVPPTTYHQPRPPTQFQTVPTAPPAVSSATVPGTTPSQMFPGPVANNPTSRFMPSNNPGFVQRPGLSPVQPSSPTQAQGQPQPVVAPPATPATVQTADTSKVSAELKPVIATLTRLFDETSKAMGGSQVKKREIEDNSRKIGTLFAKLNSGDISPNVSSKLIQLCSALDSGDFATAMHLQVLLTTSDWDECNFWLAALKRMIKTRQNFRM |
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| Function | Protein transport protein SEC31 homolog B [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8L611] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_07g0026100 | OsPr106_07g0026100.02 | Chr07 | 28467158 | 28477052 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcgtgcatcaagagcgcgcagagggcggcgctgacggcgctggcgccggaggcgccctacctcgccgccggcaccatgagcggcgccgtcgacatgctcttctccgcgtcggccaacatcgagatcttccgcctcgacttccagtccgactcgcccgacctccccctcctcgcctccgccccttcccccgaccgcttcaaccgcctctcctggtcccgccccagcgccgctgacggcgactccttctccctcggcctcctcgccggtggcctcagcgacggctccgtcgccgtgtggaatccgctgagcatgatcaactccgaggggaaagcggaggatgccttggttgcgaggctcgagaagcacaccgggccggtttgcggactggagtttagcgagctcacaccgaatcggctcgcctcaggggctgaacagggggagctttgcatctgggatctcaagaacccctccgagccagtcgtgtttccgccactcaagagtgttggctccagtgctcaagctgaaatatcttatttaacctggaacccgaagtttcagcatattctagcaaccgcttccagtaatgggatgacagttgtttgggatttaagaaaccaaaaaccgttgactagcttttcagattcaaacagaacgaaatgctctgttcttcaatggaaccctgacatgtccacccagctaattgttgcatcagatgatgataactctccatctttgagagtttgggatgtgaggaaaaccatttcaccagtaagagaatttgtgggacactcaaaaggtgtaattgctatgtcgtggtgCccctatgatagttcatacttgcttacctgttctaaagataatagaacaatatgctgggatactgttagtggagagattatgagtgagctaccagcaagctcaaacggtaacttcgacattcactggtatcgaaaaataccaggtgttgttGCAgcaGCATCCTCATTTGATGTGAAAATCGGCATATACAACTTAGAGttctctggcctttatgcagctggtgatagtgctattggtgccccagcacgcccaagagctccagctccaaaatggttgaaatgccccactggcgcatctttcggctttgggggcaaacttgtttctttccaccaagcagcgcccacccaaggtgcacaagtgactacttcagaggcaagtctactctgccacttccctgtgcatgtacataatttggtgattgagcaaagtctggtaagccggtcgactgaatttgaagctgctatacagaatggggacaaaagttcactgcgtgctctgtgcgataaaaaagcacaagaatctctatctgatgaggagagagaaacatggggcttcctaagggtaatgtttgaggatggggatgctgccaggacaaagctgcttgctcatcttggctttaaccctcctcaagaacagacttctagttcaacagatgaactgaacagaacattggcagatactcttaaccttgatcatggcgcgccaactgatacatcagattctcaatttatggttgataatggggaagattttttcaacaatcctcaaccttcggaggctagtttggcagaagaatcaatttctacaaatggtcaacagatcgagcaggaaatgcctgtaaatgttgaaccatcagatccatcagttgacaaaagtattcaacatgcactggtagttggtgattataaaggagcagtcaatctgtgccttgctgccaatcgaatggctgatgctctggttattgcccatgctggtggttctgctctatgggaaagcacaagaaaccagtatcttaagaatactgtatcaccctatctaaaggttgtttctgctatggttggcaatgatttgatgagttttgtgagtacatggccattgaatgcttggaaggaaacacttgcgctactgtgcacatttgccaggaaagaggaatggaatgttctatgcgatacccttgcatctagactgttgggagttggagatacactagctgcaactctctgttatatttgtgctggaaatatcgacaaagctgtggaaatatggtctcgcgacttgaagtctgaagatggtGGgaagacttatgttgatcttctccaggatttgatggagaagaccattactcttgcccttgctacagggcataagagctttagtgcgtcactgtctaagcttgtggaaaactatgcagaacttttggccagtcaaggccttcttaaaactgcaatggaatacttAaaattgttgggatcagatgaacattcacacgagctggcaatattGAgagaccggattgcattttctacagaagagaatcatgctgccagtacttcagttcatgcgggcagtattaacagttccgcgtaccctacaattcaaccgagctatagcaccccagacccttctcagaacctttaccaggggacttcacaatatgctgtgccaagtaaccagtatcaagattaccagcaacaatctaatacagcatatggaacatacaacagtacatattctcaacaaccaacccagatgtttgttccatcaaacaccactccagtgatctcccagccaaatgcaactccagcaccagttccacaacaaccagtgaaggcatttactcctaccaacttgccaggtctaaaaaatcctgagcaataccagcaaccaactttgggctcccagctttatgcgggtgctaatccaccatatacttctggacaatcgactccatatcaaggtgtacctcccaccacataccatcagcctagaccacctacacaattccaaacagttcccacagcacctccagctgtttctagtgccactgtaccaggaacgaccccaagtcagatgttccctggtccagttgctaataacccgacttccaggtttatgccatcaaacaatccaggttttgttcaaaggccaggtttgagtcctgtacagccctcaagtccaacacaggcacaaggacaaccgcagcctgttgttgcacctcctgcaactcccgcaactgtgcagacagctgacacatcgaaggtgtctgctgagctgaaaccagttattgctacattgactagactatttgatgaaacatctaaagctatgggtggatcacaagttaaaaaacgtgaaatcgaagacaactcaagaaagatcggaacactatttgcaaaactcaattctggggatatatctccaaacgtttcatcaaaactcattcagctttgcagtgcacttgatagcggtgattttgccactgcgatgcaccttcaggtacttctgacaacgagcgactgggacgagtgcaacttctggcttgccgcattgaagcgtatgatcaagacgaggcagaatttcagaatgtaa
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| Protein seq | MACIKSAQRAALTALAPEAPYLAAGTMSGAVDMLFSASANIEIFRLDFQSDSPDLPLLASAPSPDRFNRLSWSRPSAADGDSFSLGLLAGGLSDGSVAVWNPLSMINSEGKAEDALVARLEKHTGPVCGLEFSELTPNRLASGAEQGELCIWDLKNPSEPVVFPPLKSVGSSAQAEISYLTWNPKFQHILATASSNGMTVVWDLRNQKPLTSFSDSNRTKCSVLQWNPDMSTQLIVASDDDNSPSLRVWDVRKTISPVREFVGHSKGVIAMSWCPYDSSYLLTCSKDNRTICWDTVSGEIMSELPASSNGNFDIHWYRKIPGVVAAASSFDVKIGIYNLEFSGLYAAGDSAIGAPARPRAPAPKWLKCPTGASFGFGGKLVSFHQAAPTQGAQVTTSEASLLCHFPVHVHNLVIEQSLVSRSTEFEAAIQNGDKSSLRALCDKKAQESLSDEERETWGFLRVMFEDGDAARTKLLAHLGFNPPQEQTSSSTDELNRTLADTLNLDHGAPTDTSDSQFMVDNGEDFFNNPQPSEASLAEESISTNGQQIEQEMPVNVEPSDPSVDKSIQHALVVGDYKGAVNLCLAANRMADALVIAHAGGSALWESTRNQYLKNTVSPYLKVVSAMVGNDLMSFVSTWPLNAWKETLALLCTFARKEEWNVLCDTLASRLLGVGDTLAATLCYICAGNIDKAVEIWSRDLKSEDGGKTYVDLLQDLMEKTITLALATGHKSFSASLSKLVENYAELLASQGLLKTAMEYLKLLGSDEHSHELAILRDRIAFSTEENHAASTSVHAGSINSSAYPTIQPSYSTPDPSQNLYQGTSQYAVPSNQYQDYQQQSNTAYGTYNSTYSQQPTQMFVPSNTTPVISQPNATPAPVPQQPVKAFTPTNLPGLKNPEQYQQPTLGSQLYAGANPPYTSGQSTPYQGVPPTTYHQPRPPTQFQTVPTAPPAVSSATVPGTTPSQMFPGPVANNPTSRFMPSNNPGFVQRPGLSPVQPSSPTQAQGQPQPVVAPPATPATVQTADTSKVSAELKPVIATLTRLFDETSKAMGGSQVKKREIEDNSRKIGTLFAKLNSGDISPNVSSKLIQLCSALDSGDFATAMHLQVLLTTSDWDECNFWLAALKRMIKTRQNFRM
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_07g0026100 | OsPr106_07g0026100.01 | Chr07 | 28467083 | 28477047 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcgtgcatcaagagcgcgcagagggcggcgctgacggcgctggcgccggaggcgccctacctcgccgccggcaccatgagcggcgccgtcgacatgctcttctccgcgtcggccaacatcgagatcttccgcctcgacttccagtccgactcgcccgacctccccctcctcgcctccgccccttcccccgaccgcttcaaccgcctctcctggtcccgccccagcgccgctgacggcgactccttctccctcggcctcctcgccggtggcctcagcgacggctccgtcgccgtgtggaatccgctgagcatgatcaactccgaggggaaagcggaggatgccttggttgcgaggctcgagaagcacaccgggccggtttgcggactggagtttagcgagctcacaccgaatcggctcgcctcaggggctgaacagggggagctttgcatctgggatctcaagaacccctccgagccagtcgtgtttccgccactcaagagtgttggctccagtgctcaagctgaaatatcttatttaacctggaacccgaagtttcagcatattctagcaaccgcttccagtaatgggatgacagttgtttgggatttaagaaaccaaaaaccgttgactagcttttcagattcaaacagaacgaaatgctctgttcttcaatggaaccctgacatgtccacccagctaattgttgcatcagatgatgataactctccatctttgagagtttgggatgtgaggaaaaccatttcaccagtaagagaatttgtgggacactcaaaaggtgtaattgctatgtcgtggtgCccctatgatagttcatacttgcttacctgttctaaagataatagaacaatatgctgggatactgttagtggagagattatgagtgagctaccagcaagctcaaacggtaacttcgacattcactggtatcgaaaaataccaggtgttgttGCAgcaGCATCCTCATTTGATGTGAAAATCGGCATATACAACTTAGAGttctctggcctttatgcagctggtgatagtgctattggtgccccagcacgcccaagagctccagctccaaaatggttgaaatgccccactggcgcatctttcggctttgggggcaaacttgtttctttccaccaagcagcgcccacccaaggtgcacaagtgactacttcagaggtgcatgtacataatttggtgattgagcaaagtctggtaagccggtcgactgaatttgaagctgctatacagaatggggacaaaagttcactgcgtgctctgtgcgataaaaaagcacaagaatctctatctgatgaggagagagaaacatggggcttcctaagggtaatgtttgaggatggggatgctgccaggacaaagctgcttgctcatcttggctttaaccctcctcaagaacagacttctagttcaacagatgaactgaacagaacattggcagatactcttaaccttgatcatggcgcgccaactgatacatcagattctcaatttatggttgataatggggaagattttttcaacaatcctcaaccttcggaggctagtttggcagaagaatcaatttctacaaatggtcaacagatcgagcaggaaatgcctgtaaatgttgaaccatcagatccatcagttgacaaaagtattcaacatgcactggtagttggtgattataaaggagcagtcaatctgtgccttgctgccaatcgaatggctgatgctctggttattgcccatgctggtggttctgctctatgggaaagcacaagaaaccagtatcttaagaatactgtatcaccctatctaaaggttgtttctgctatggttggcaatgatttgatgagttttgtgagtacatggccattgaatgcttggaaggaaacacttgcgctactgtgcacatttgccaggaaagaggaatggaatgttctatgcgatacccttgcatctagactgttgggagttggagatacactagctgcaactctctgttatatttgtgctggaaatatcgacaaagctgtggaaatatggtctcgcgacttgaagtctgaagatggtGGgaagacttatgttgatcttctccaggatttgatggagaagaccattactcttgcccttgctacagggcataagagctttagtgcgtcactgtctaagcttgtggaaaactatgcagaacttttggccagtcaaggccttcttaaaactgcaatggaatacttAaaattgttgggatcagatgaacattcacacgagctggcaatattGAgagaccggattgcattttctacagaagagaatcatgctgccagtacttcagttcatgcgggcagtattaacagttccgcgtaccctacaattcaaccgagctatagcaccccagacccttctcagaacctttaccaggggacttcacaatatgctgtgccaagtaaccagtatcaagattaccagcaacaatctaatacagcatatggaacatacaacagtacatattctcaacaaccaacccagatgtttgttccatcaaacaccactccagtgatctcccagccaaatgcaactccagcaccagttccacaacaaccagtgaaggcatttactcctaccaacttgccaggtctaaaaaatcctgagcaataccagcaaccaactttgggctcccagctttatgcgggtgctaatccaccatatacttctggacaatcgactccatatcaaggtgtacctcccaccacataccatcagcctagaccacctacacaattccaaacagttcccacagcacctccagctgtttctagtgccactgtaccaggaacgaccccaagtcagatgttccctggtccagttgctaataacccgacttccaggtttatgccatcaaacaatccaggttttgttcaaaggccaggtttgagtcctgtacagccctcaagtccaacacaggcacaaggacaaccgcagcctgttgttgcacctcctgcaactcccgcaactgtgcagacagctgacacatcgaaggtgtctgctgagctgaaaccagttattgctacattgactagactatttgatgaaacatctaaagctatgggtggatcacaagttaaaaaacgtgaaatcgaagacaactcaagaaagatcggaacactatttgcaaaactcaattctggggatatatctccaaacgtttcatcaaaactcattcagctttgcagtgcacttgatagcggtgattttgccactgcgatgcaccttcaggtacttctgacaacgagcgactgggacgagtgcaacttctggcttgccgcattgaagcgtatgatcaagacgaggcagaatttcagaatgtaa
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| Protein seq | MACIKSAQRAALTALAPEAPYLAAGTMSGAVDMLFSASANIEIFRLDFQSDSPDLPLLASAPSPDRFNRLSWSRPSAADGDSFSLGLLAGGLSDGSVAVWNPLSMINSEGKAEDALVARLEKHTGPVCGLEFSELTPNRLASGAEQGELCIWDLKNPSEPVVFPPLKSVGSSAQAEISYLTWNPKFQHILATASSNGMTVVWDLRNQKPLTSFSDSNRTKCSVLQWNPDMSTQLIVASDDDNSPSLRVWDVRKTISPVREFVGHSKGVIAMSWCPYDSSYLLTCSKDNRTICWDTVSGEIMSELPASSNGNFDIHWYRKIPGVVAAASSFDVKIGIYNLEFSGLYAAGDSAIGAPARPRAPAPKWLKCPTGASFGFGGKLVSFHQAAPTQGAQVTTSEVHVHNLVIEQSLVSRSTEFEAAIQNGDKSSLRALCDKKAQESLSDEERETWGFLRVMFEDGDAARTKLLAHLGFNPPQEQTSSSTDELNRTLADTLNLDHGAPTDTSDSQFMVDNGEDFFNNPQPSEASLAEESISTNGQQIEQEMPVNVEPSDPSVDKSIQHALVVGDYKGAVNLCLAANRMADALVIAHAGGSALWESTRNQYLKNTVSPYLKVVSAMVGNDLMSFVSTWPLNAWKETLALLCTFARKEEWNVLCDTLASRLLGVGDTLAATLCYICAGNIDKAVEIWSRDLKSEDGGKTYVDLLQDLMEKTITLALATGHKSFSASLSKLVENYAELLASQGLLKTAMEYLKLLGSDEHSHELAILRDRIAFSTEENHAASTSVHAGSINSSAYPTIQPSYSTPDPSQNLYQGTSQYAVPSNQYQDYQQQSNTAYGTYNSTYSQQPTQMFVPSNTTPVISQPNATPAPVPQQPVKAFTPTNLPGLKNPEQYQQPTLGSQLYAGANPPYTSGQSTPYQGVPPTTYHQPRPPTQFQTVPTAPPAVSSATVPGTTPSQMFPGPVANNPTSRFMPSNNPGFVQRPGLSPVQPSSPTQAQGQPQPVVAPPATPATVQTADTSKVSAELKPVIATLTRLFDETSKAMGGSQVKKREIEDNSRKIGTLFAKLNSGDISPNVSSKLIQLCSALDSGDFATAMHLQVLLTTSDWDECNFWLAALKRMIKTRQNFRM
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A5 | Chr07 | 28471211 | 28471290 | + | OsPr106_07g0026100.02 | OsPr106_07g0026100.02,OsPr106_07g0026100.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 42.136925 | 148.372879 | 86.458969 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0657200 | RBH | 11.396201 | 10.557129 | 30.719021 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g46370 | RBH | 6.912460 | 6.799846 | 7.724886 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0657200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0026210 | RBH | 3.256567 | 48.659435 | 39.958897 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0026270 | RBH | 1.343518 | 17.754545 | 22.436298 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0026090 | RBH | 7.323834 | 66.152481 | 63.185875 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0025850 | RBH | 0.925757 | 2.918562 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_03g0017660 | RBH | 0.000000 | 10.042198 | 10.069296 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0450200 | RBH | 28.970851 | 72.724194 | 45.8484975 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0026580 | RBH | 1.629491 | 5.759631 | 9.458450 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0462600 | RBH | 33.0564025 | 74.9381905 | 54.2438505 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0025860 | RBH | 1.473058 | 1.089129 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0026300 | RBH | 2.805039 | 73.478729 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0025940 | RBH | 30.720228 | 108.159424 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0026360 | RBH | 1.183860 | 4.549997 | 1.494474 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0025890 | RBH | 0.890477 | 42.183975 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G026000 | RBH | 1.869149 | 43.078709 | 21.773958 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0025790 | RBH | 7.556453 | 83.703270 | 40.847870 |
