Basic Info |
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Transcripts
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_07G0330100 | OsMH63_07T0330100-mRNA-7 | Chr07 | 21158888 | 21163667 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGAGGTATTGTGTGCGTATGGGATGCGGAGTCGAATTTGGAAGGAGTCCAAATTTGGCACGATTGAGAGAATCAATAAAGTCATCATCCACTTTAAGAGTTCTTCGATTTATGTTTCACCGGGTTTCGGCGGTCTTACCGGCAACTCACCGGCGGTCAGACCGGCGGCATTGCAGCGGTCAGACCGGCGGGAGCACGGCGGTCAGACCGGTGGCGGCAACAGGCGCGGCAGGCGACATCGGCGGTCAGACCGGGTGATCTATACCGGTCAGACCGGCAGCATCCACTCGGTCAGACCAGCAGATCAATCTCGGTCAGACCGCAATCCATCGATTCCGAGGGAGTACATTAAATTTGAGTTGAAACCTGGAGAAGTTTTGGATGACTATCTTTCTAGGTTTAATAAAATTTTGAGTGATCTTAGATCTGTCGATTCTTCTTATGATACTAATTATCCACAATCTAAGATTTCTCGTCACTTTTTGAATGGTCTTGATATGTCTATTTGGGAGATGAAAGTTACATCTATTCAGGAGTCTGTTAACATGTCTACTTTGACTTTGGATTCGCTTTACACAAAATTAAAAACACATGAGATGAATGTTCTTTCTCGTAAAGTTGATACTAAGTCGAGTGCTTTGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTTGGATGTTGATGCTTCTTCATCAAAGTCTTCTTTTCTTGCTGTTTTTAATGCCACGTCCGATGATCAACTCGAACAGATTGAGGAGGAGGATTTGGCTTTGGTTGCTAATAGAATTGCTCGAGCTATGAATAATGCCAGGAACAGGAAAAGAGGTGGTCCAAATCGTTGCTTTGAATGTGGTTCAATTGATCATCTTCGTTCGCATTGTCCTAAGCTTGGGAGAGGTAAAAGAGAAGACAAAGATGGTGAGAAGACCAACAACAACAACAACAAGCCGAAGGGTTCATCCCGAGGGAGGAAGCTGGACAATCTCAGGAAGATTTTTCAACAAGTTTGCGCCGCCTTCGAGCCACTAAGTGATATAGATGGTGAAAGTGGAGATGATGATAAGGGAAAGAACATCTCCGATGTTTGTTTCATGGCACGTGGTGAATCTGACATAGAGTATGAAGATAATGAGGTAAGTGCTTTTGAGGAAGCTATTAATATTTTGAGTGAAAAGAATAAGAAGTGTGAGAAGATGTATAGAAAACAGGAATTTATCATTGAATCTCTTAAATCTGAAGTTGCTAGTTTAAAATCTCTTATTCCTAATGATGATGATTACTCAAATTGTGAGGTTCTAATGAATGAGATTTCAAAAATTAGAGATGTTAATGCTGCACATGATTTGAAAAATAGATCTTCTCTTGCTTGTAGTCGTGTTGAGTACATGGAAGATGTTGTGAAAAACAATGAATGCTTTCTTGCCCTAAATGTCGTAAAAGCAAAGGCTTTGTTGGCAAGGAAGGAGAACGTGTGGATCGTGGATTCCGGTTGTTCGCGGCACATGACCGGTGATAAAAATTGGTTCTCCTCCCTCAAGAAGGCATCTAAGACTGAATCGATTATCTTTAGTGATGCTTCTACAAGTGTTGTTCTTGCTACAGGTTTGGTAAATGAAAAATTTGAATTGAAGAATGTAGCTTTGGTTGAGGACTTAAAGTACAATTTGCTTTCGGTTTCACAAATTGTTGATGAAACTTTTGAGGTTCACATTAAGAAAACTGGAAGTAAAGTTTTTGATTCTTGTGGTGATTCTGTGTTGAATATTTCTCGCTATGGAAGAGTGTTTAAAGCTGATTTTGAAAATCCTGTTTCACCTATGATAACATGTTTGGTTGCTAAGTTTAATAAAGATGTGATGTTTTGGCATCATAGACTTGGACATGTTGGTTTTGATCATCTCACTAGGTTAAGTGGTTTGGATCTTGTTCGTGGTTTGCCTAAACTTAAGAATGATCTTGATTTGGTTTGTACACCGTGTCGTCATGCTAAGATGGTTTCTTCTTCACATGCTCCTATTGTTTCTGTGATGACGGATGCACCGGGACAGCTATTACATATGGACACTGTTGGTCCAGCTAGAGTGCAATCTGTTGGAGGAAAGTGGTATGTGTTGTGCTTTGTCTTGAAATCTAGAAATTTGGATAAGTTTGAGGCACGTTCTACTGATGGATTGTTTCTTGGTTACCCCGCACATACTCGTGGCTATCGTGTACTTATTTTGGAGACTAACAAAATCGTGGAGACTTGCGAAATTTCTTTTGACGAGGCTAGTCTAGGTACTAGACCTGATATTGCAGGTACACTGTCACAGGTTCAGGGGGAGGATGGTCTTATTTTTAAAGACGAGAGCGACAACGACAACGACGACGATGAGGTCAGCCCGGCCGGTCAGACCGGGCGCCAGGCCGGTCAGACCGCTGGCACACCTCCGGTCAGACCGGCTCAAGAGGAGCGGTCAGACCGGCCAGGGTCGTCGGCTGAGGGTTCTGTTGATGCTGTTCGAGATGGTCCTCCAGAAATTACTACTTCGACCAGTACTGATACAGAACGTGGATCAACTTCAGAAGTTGCTGCTCCTTTGCACATTCAATGA
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| Protein seq | MEVLCAYGMRSRIWKESKFGTIERINKVIIHFKSSSIYVSPGFGGLTGNSPAVRPAALQRSDRREHGGQTGGGNRRGRRHRRSDRVIYTGQTGSIHSVRPADQSRSDRNPSIPREYIKFELKPGEVLDDYLSRFNKILSDLRSVDSSYDTNYPQSKISRHFLNGLDMSIWEMKVTSIQESVNMSTLTLDSLYTKLKTHEMNVLSRKVDTKSSALVSSSSSLDVDASSSKSSFLAVFNATSDDQLEQIEEEDLALVANRIARAMNNARNRKRGGPNRCFECGSIDHLRSHCPKLGRGKREDKDGEKTNNNNNKPKGSSRGRKLDNLRKIFQQVCAAFEPLSDIDGESGDDDKGKNISDVCFMARGESDIEYEDNEVSAFEEAINILSEKNKKCEKMYRKQEFIIESLKSEVASLKSLIPNDDDYSNCEVLMNEISKIRDVNAAHDLKNRSSLACSRVEYMEDVVKNNECFLALNVVKAKALLARKENVWIVDSGCSRHMTGDKNWFSSLKKASKTESIIFSDASTSVVLATGLVNEKFELKNVALVEDLKYNLLSVSQIVDETFEVHIKKTGSKVFDSCGDSVLNISRYGRVFKADFENPVSPMITCLVAKFNKDVMFWHHRLGHVGFDHLTRLSGLDLVRGLPKLKNDLDLVCTPCRHAKMVSSSHAPIVSVMTDAPGQLLHMDTVGPARVQSVGGKWYVLCFVLKSRNLDKFEARSTDGLFLGYPAHTRGYRVLILETNKIVETCEISFDEASLGTRPDIAGTLSQVQGEDGLIFKDESDNDNDDDEVSPAGQTGRQAGQTAGTPPVRPAQEERSDRPGSSAEGSVDAVRDGPPEITTSTSTDTERGSTSEVAAPLHIQ
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_07G0330100 | OsMH63_07T0330100-mRNA-8 | Chr07 | 21159610 | 21165309 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGCATGAAGAACTTGAAAATTTTGAGAGAAACAAAGTTTGGACTTTAGTTGAACCACCTTCTGGACATAATATTATTGGAACCAAGTGGGTTTTCAAAAATAAACAAAATGAGGATGGTTTAATTGTGAGAAATAAAGCTAGACTTGTTGCTCAAGGTTTTACTCAAGTTAAGGGTTTAGATTTTGATGAAACTTTTGCTCCTGTTGCTAGAATTGAGGCAATTAGACTTTTGTTGGCTTTTTCTGCTTCAAAAGGTTTTAAATTGTATCAAATATATGTGAAAAGTGCTTTTCTAAATGGTTTTATACAGGAGAAAGTTTATGTCAAACAACCACCAAGTTTTGAAAATCCTGATTTTCCCAACCATGTTTTTAAATTGTCTAAAGCTTTGTATGGTTTGAAACAAGCTCCTAGGACATGGTATGATAGGCTTAAGAACTTTTTACTTGCAAAAGGTTTTACAATGGGAAAGGTTGACAAAACGCTTTTTGTTCTTAAGCATGATTTTGCTGAGACTATGCGCAGGGAATTTGAGATGAGTATGATGGGTGAGTTATCGTACTTTTTGGGATTGCAAATTAAGCAAACACCTCAAGGTACTTTTGTGCATCAAACGAAGTATATGAAGGATCTTTTGAGACGGTTCAAAATGGAGAATTGCAAGCCAATTTCAACACCAATTAGTTCTACAGCTGTGTTGGATCCTGATGAAGATGGTGAAGCTGTTGATCAAAAGGAATATAGAAGTATGATTGGATCTTTGTTGTATCTAACTGCTTCTAGGCCAGACATACAGTTTGCTGTGTGTTTGTGTGCACGCTTTCAAGCTTCTCCTCGTGCTTCACATCGTCAAGCGGTCAAGCGAATAATGAGATTCTTTGGCTTTTATCTACTTTCAAAAGATTATGGTCTTACTTTTGAGAAAGTACCTCTCTTTTGTGATAATACTAGTGCTATCAATATTGGTAAGAATCCTGTTCAACACTCACGCACAAAGCACATTGATATTCGTTTTCACTTTTTGACGGATCATGTTGAGAAGGGAGATGTGGAATTGCAGTTTTTGGACACAAAGTTGCAAATTGCTGATATTTTCACTAAACCTTTGGATTCTAATCACTTTGCTTTTCTTCGTGTTGAATTGGGCATAATTCATCCTTTTGGCATGGTTTGA
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| Protein seq | MHEELENFERNKVWTLVEPPSGHNIIGTKWVFKNKQNEDGLIVRNKARLVAQGFTQVKGLDFDETFAPVARIEAIRLLLAFSASKGFKLYQIYVKSAFLNGFIQEKVYVKQPPSFENPDFPNHVFKLSKALYGLKQAPRTWYDRLKNFLLAKGFTMGKVDKTLFVLKHDFAETMRREFEMSMMGELSYFLGLQIKQTPQGTFVHQTKYMKDLLRRFKMENCKPISTPISSTAVLDPDEDGEAVDQKEYRSMIGSLLYLTASRPDIQFAVCLCARFQASPRASHRQAVKRIMRFFGFYLLSKDYGLTFEKVPLFCDNTSAINIGKNPVQHSRTKHIDIRFHFLTDHVEKGDVELQFLDTKLQIADIFTKPLDSNHFAFLRVELGIIHPFGMV
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.0032035 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g29490 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0246700 | SBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0298500 | RBH | 0 | 0 | 0.000833 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
