Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_11g0024160 OGI:11010520 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:28136376-28151114
Gene Symbol RLCK355, OsRLCK355, RLCK354, OsRLCK354, RLCK356, OsRLCK356, XA3, Xa-3, Xa3 (Xa4b, Xa6, Xa9, Xa w), Xa3, Xaw, Xa4-b, XA26, Xa26(t), Xa26(t)*, Xa26, RKb, MRKb, MRKB, TRKb, Xa3/Xa26, EXS, OsEXS, MRKc, MRKc, RKc, TRKc
DNA seq

ggactaaatgttgaaacgataactttacattacttttttacatgtggaataatccttcctgatgctcttcagcttcacgaccacatcgtttatttccaacctttctgcaggtgagctgctgcaacacatcaagccaacctcgaatactgccacaagagggtcttcattggcccaagtagttgaacaaggcaaggaagtaacattgttctcaagaacaccttgttgtatcaatatttcaccttgcagaagaatatcatccgcaacatccgcaagcactggaaatgcttcagaaacccacttcctaaggctcatatcaccagcaaacatgggatcagtaggtctcttcccggtgaagacttcgagcatcatgatcccgaagctgaatacatcgctcttccgtgatgcttttcccataaatgcatactctgttcaacaaatgggatttttgacaaaaaaaaagaataaatgttgtcgattaaataaacaaaatgtacttagtaaaataaaattttctcatgaatagtttgtgcaagtacctggagccatgtatcctattgtccctggcatgctggctgaaactagagaattgtcatcacctaacagtaattttgcaatgccaaagtccgccacatgcgccgtcatctcctcatcaaacaacacattgctaggcttgaggtcacaatgcaaaataacctcagaatgatgatagtgaaggtgctccattgccattgacacgtcaagcataatgtcaagtctcttcagaaatcctagtggtgggtggtcttccttgtgcaagtatgtctccaagctgccattgggcatgtactgaagcaatagtgctttgaacctgacattcaatatcaaaacttctcatggcttgttccacctgcatgttgagaactttaattgcaaccaccattccatcgtcgagtcgacccttaaaaaccttgccaaaacttccacctcccagcatgttaccctcattgaaattctcagtggcacgaacaatctcatgatatgatactaatctatggctgattatatcatctccatcaacaggagctgttccctctccctgctttttaactttctttctgatcagttggcatatgcaaatggctataaccccaagtactaaagcaacacccgggagtataaattttagcaagtatctattagtcgaccgagaatttcccgggcacggagaaaatcctagacggggagcaccgcacaatccatcgttccctgtcaaagattgcatggtgatgtttctgaaaacaccttcatctggtactggaccatgtaattcattgaaggaaaggttcaaaatggttaggtaagtcaagtttgccaagaactttggaatggtaccagagaggttgttagaagagaggtccaaagcagctaagctaattgaattgcgcaaagtgtatggaactgaaccttcaaatgagttgtgagacaggtttaggtaagttagcattgtgagctgtccaaaagaatctgggatgctgccaaccaagctgttgtcagaaagatctattttatcaatctgcttcatgtggccaagatcagcaggcaatgcaccagtcagagagttgtgggacagatttaggtggacaagttcatcaagatgaaacaaaccagttggcaaaccagatgataaattattttgagataaagaaatgtactctaaattagtgagattaccaataccttcaggtattgatccggagaactcattgttgtagagatacaattgtacaagcctcccgagaaaaccaatttttgccgggatgggaccagcaaaattatttcttgcaatgtcaatcctctcaagactctccatggtcatgacagattctgggatctcctggcttagttgattgttcagaaggatcaacgagctgagactacttagatttgatattgtcgacggaattcctccggtcaacctgttgctatctacatcgaaaaccacgagattcctagagagattgccgacataatctggaagcctaccagtgaaagaattggtgtgcaagctcaagagctggagctccctgcaattggagagagcagcaaagaaaccgagatccccttggaggtggttctctccaacatcaaattgctcaagtgatatcatgttgcttccaaatgaagctggtactgatccaattaactggttggcacccagccctacggcagataattcagaaaaattaccaagaaaagcagggaaggaaccagataaccgattgactgaaagctccagaatggtgagattcttcagcttccctagctgcacagggatctctccatagagcttgcagaatgagaagtcaagcctactgagcatggtgaggttgccaagaacagctgggattgtcccgacaagctcatttccaccaaataaaattccagtaagaagaggcaactctgccagccatgtcggtataggaccagtaaacaaattctgcgacagagagatgatcctggcttgcttgctggacgcgaggcctatcggaatcgggccggtgaagttgttcagagagagtgatatcacctgcagcattgggaggttgaagctgatgttgttgtcaggtatagggccggtcaagttgttgttggccatgtagagcattcggaggccggacatgttgaagatggccggaggtatctcgccggagagatggttgatctgcatgttgaggaagtcgagcttgggcaaggatgcaatggcaggtggtatcgatcccgacaaggtgttgttggcgaagttgacatggctgagctcaggcgtggtgttgaaaagctgagctgggatctcgccggagagcgagttgatgctcaaatcaagaaactggatgctcgtgaggttggcaatggcggatgggatggagagagacagggagttgcggccgaggttgaggtacctgaggcgacgcagccggccgaggtcgggtgggattggaccggtgatgccggcgcctgtgaggttgaggacggcgaggaatgagaggttggcaaggtgaggcgagagctgtccgtgcagcggagtccccggcaacgccagcgaggtgacgcgctgccggcgacggccgcacgacacgccgacccagcgacagaaggagacgttggccggccagccgtcgcggaggacgccgagagggtcggagagctgcgccttgaacgccagcagcgcagcgaggtcggtgtcgttgctgctgctgctgctgctgctaacaccggtggccgtggcgatgatgacgactgctgctactgttagtatcaccgacaagtactgcgcaaccgccatgaccgcccctgcccggtgcaaagattttgctagctggagtaggagcttcgatgtgtacgtactacctaacaagggatggagatgagtatgtcgcaataaaacaagatgaatcctagctgcttacaattacacaggtcgcacacatactacgtacaaaatattacaaacaaatgacattacgtttttgaacagtaacacggtcatcagacactttattactgattacttaatataaaaaatatagtaaaattacaatgttttaaaacattgatatgataaatttacccataacatttcaaatgttgaatggaaatgtttaaatatatgtttacgataaaaatgcgtcacctatttgtagctgggtactactctcgtatatatacaggctatggaggatgcccaaggatttaattgttgataagtttgattagctggtagattcacttagacgctgacatctctgatgaattcgtcgcatgttcagacctgacactgacatgctttaactcatgttgcatcagcataagctaaggtatggtgactcctctccaatattactagccactcagtcacgcgaagcgcgactctaagcgtcagcataacctatatatatatgagtgaacgattgatcaagacaattatatgaccagtttcataagaatactcccttcctcctcaaatataagtaatttagcttgtttaacgaagattaaggttcagcaaaaaagatttatattacttatttagttagggatggttggagtggttgtagtttggagtaagataaaaataaaatttgaatgagaggtgagattgatggggcaaataatattttatgaatccttgataaatttcaaaaacttggtatcctataggtaatttgaaaacatatgaaattatacgtaaacgtagatatattttaaaatttaatgtccaattaatacatacgtaggacccggggcggatctacagggtggtccaggtggtctctagaccaccaaaaaaatagcaactaaccctactatatatacaagattttagaaaaaaaaactgatcgcaaggcaagtacttgaactagaaggaaaccgaagtgtcacgcacgcgggtggtcttcggtctcacctcgtttttcgccaccggttgtttttcgcaaatcgctcgcacaaagccaatgctgctgcccacgaccctagacgaggagaggaggaggcgaggagccctacctgtagcctgcgtgagcgcgacaccgacggccgatcgaccgatgggcgatggctttgacgcggtgacgccttgacatcggccttgagcccttgactccacaagagcaagacctccgtcgaccgccgtccctgcctgccgccagccaccagccactctgtgactctccacccgctgcagtgccactgcacgggcctgcacgggccgccactccgatgcatgacggctgacggtgcgtcggcggctcggcatgacttgccgacttcaagtcttcaactcactgtcggcgatcagtggctcagcgcccgaccggtgcacggcagctgtccgttccaacgaccgtcgaccgagcgaccctaactccctcagcgtcggcggtcgaccgagcgacactcgagtgatcgagtcgttgacgccggcttcatccttcagttttaggtcttgtaattatgtagcttaa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Function LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FL28]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_11g0024160 OsCMeo_11g0024160.01 Chr11 28137124 28151114 - NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_11g0024160 OsCMeo_11g0024160.02 Chr11 28136376 28138715 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 14.940664 4.490395

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0695800 RBH 0.068483 0.0 0.167381
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g47310 RBH 0.046286 0.0 0.043063
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0695800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0024590 RBH 0.0 5.368335 1.046873
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0024610 RBH 0.0 1.959447 0.097477
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0024060 RBH 0.000000 10.479267 4.550014
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0023840 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0024440 RBH 0.0 2.110048 0.689818
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0444900 RBH 0.0035985 16.211173 0.0034995
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024890 SBH 0.0 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0443000 RBH 0.232072 0.990518 0.0105465
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0024680 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0024760 SBH 0.027641 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0024230 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0023950 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0024350 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G024290 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0024490 SBH 0.0 2.211889 0.0
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National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

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