Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_11g0019100 OGI:11066080 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:22421609-22428427
Gene Symbol OsWD40-189
DNA seq

CCCTAGTCGACCATCTCGCTTCCCCCTTCCCCGCCTCCTCTCGAGTTCACCTGCCACCCGCCCGCCGCCGCCGCCGAGCAGCTACTGGTGCCGGCTGCCGTCCTCCTGCTTCCGCCGCCGGTGAGCTTCCGCACGCACGCAGATCCTCTTCCTCATCTCACTCTCTCTCTCTCTGCCTTAACAAAATTTGGGGTTCAACTGACTGATCCCCATCCCGCTCCTTGCTAGGGATTTCAGATGGAGAACCAAGATCAGCAGGAGCCCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGAAGCGTGATGTGCCAGCTCGTCAGTCCCGAGGGAGACCACCTCGGCGCCGCCCTCTACCTGCCGCAGAACGTCGGCCCGCCGCAGCTTCAGGAGATCGTCAACCATCTTCTCCACAACGTATGCACGCTTGTGTTTTTTACACTGCTATTGTTACCATGCCGGCCGGAGGGCTAGCTCCCTTGGTTTAGCGACAATTTTAAAATTCATATTCATATCGGATTTGGGGAACCACTTGTCACATCGATTTATTTGTTGAGAAAACATTGTGAAACCACCTAACTAGAGTACTAGGCAACATCACAAGCTGTCTGGAGTTGTTTCCCTTAATTCTGTAATTTTTTTTGCATAATTCATTGGCGGGAGATGAAATTAATGCCTTTACAACAAGGACAAGTCTACTTTTAAGCTTTCACATAAAAAGAAAAAAAAAATCTGAATGGATGTATCATGGGAAATTTATGTTCAGCTATGTAATGTACTACTTGTGTGACCTCATTACTTTAAACATTTACTTTAGGAGGACAAGTTGCCCTATGCATTCTACATCGGAGATGAAGAGCTATCTGTCCAGCTTGGTGCTTACATGCAGCAAAAAAATGGTGGGACTCCAATCTGAAGTTCATCTATACTTTTTTTCATTGGGGAAGAAAAATAATATACGCTAGGTGTGGTGTATCGTTTCTGATTTGTATATTTTGGTTTAATGAATGAAGCAAATGTTGAGGTCACCCTGCGCATAGTATATCAACCACAAGCAGTTTTCCGCATCAGGCCAGTCAACCGATGCTCTGCTACAATTGCTGGTAAGTCGGATTATGTTCATTACACTTGTTTTCTTTTCTATTACAATTTTATGACTCTTTGTTTGGTAATTTCTCATAGAACTGTAATTATCATGGGAATATCATCGGACAGAAAGCTTTGCATTTGTTTTATCTGTTGTAGATGCCACTGTATGTATCCATGGTTCACAATACTAGTTTGTACAGGCCTACTATTCAATAGTAATGAATGTAGTTTTATGTAGATACTTTTTTTGTGTGTTTGGGGTGGGGAGGAGGTAGAAGAGTCTAGAGCAGGCATATTAAGATGCTTTTGGACATGTTTATCCTAGGTGATCATCAAATGTTTACCATATGCATGAAAAATCAAAACTACTTATTTATTTTGTGCTTAGATTACACTGCTGTGAAATGATTTGATTATCTTATCCATCTGCAGGCCATACAGAAGCCGTATTAGCTGTCTCTTTCAGCCCTGATGGAAGATGTTTGGCTAGTGGTTCAGGTGACACCACTGTTCGGTTTTGGGATCTGAACACGCAGACCCCATTGTTCACATGCAAAGGTGGTTTTTTGAATTCTTGCATATTGGTATTGGTAATTTGCAGTCATGTTTCTCATGTCTTAAACAACTGTAACATTTACAATGCATTGATGCTGGTTTTTATGCTTATGGCATGGCTATTCTTCTTGATGATAACTAAGTGCTTACCAACATTTGTGATTTACCATGAGAGATATCAAGCTAACTCACAACAAACATGTAAATTATTTTTAGCATTAATTAATCTTCATAGTCAGTGCTTAATGTTGTAGTAATTCATTGTTGTTCCTTTTAGATTAGTTCTGTTGGGCAAAGCTGTGAGTTAGTAGCCCTGGAACTTTAAAATACAGAATAATTTATTTCTTGTTAATAACTCATCACATAAACCGATTTTTGGTCAATATCCGATAGTTCCTTTTGCATACTTTGTATCCAATATCTTCTACCATTAGTATTTGAAAGTTAGTTGTTGCATACTTTGCATCTTCCAGGCCACAAAAATTGGGTGCTCTGCATTGCATGGTCACCTGATGGGAACCATCTTGTTAGTGGAAGCAAGTCAGGGGAGCTTATATTATGGGACCCAAAAACAGGCAAGCAATTGGGCACTCCACTTACGGTGAGATCATGAAATCCTTTTCAGTTAAGTACTTAAGTGGTAACCTGTAGGCTGTGTAGAAATATGAATTAAAAATTTATGCTAGCTATTGATCTGCATATTTCCAGATCTCACTGCCCTATGTGTGAATTTATGTGTATGTGGAAAATTAGTTTGTTGAAAAGAGCTGCTGCGATGTTTTTTCTTGGTATGATAGATTCACATGCACATAGTTTTGGACAGAATATATGGACACTGTACTTAGATACTGTGGATGTTTCATTTTTTCGTGCCATCCAGTACTCATTTGTTGTGGACTTATACAAATTAGGGGCATAGAAAATGGATTACTGCTGTATCTTGGGAGCCAGTTCATTTGCAAGCTCCCTGCCGCCGTTTTGTAAGTGCAAGTAAGGATGGTGACGCACGTATTTGGGATATTACCACAAGGAAGTGCGTTATTGCCCTTACAGGTCACACTAATTCTGTGACCTGTGTCAAGTGGGGTGGAGACGGTTTGATTTACACTGGGTAAGACTATTGTATACATAGGTCGTCCTTTCTTCCTTTTTAGACAAAGGATCATGGCTTTGTCCTTTATCTTTTATATCAATTATTAGTTTACTACCTTCAGAATATGAATTGGTTTGCTAAAACAGGTATGCCAATAAATGCAGTAATGCCATCTGTATTCAGGATTCTACCATGTACCAGTGTTGTCATACACATTAACATATTTTATAGTAAAATCGATATATTGACCTTGCAGATATATGATGTAAAACCTCTGTGTTTGTCAACTCTGCTACCTTTTGACAGATTAATTTATTGAGGCCACAAATGACTCGAAACAATTTTTTTATTTGTCATGGTAAATTCTGAATATGATAGGATAACGAACATATTTAATCTGTATTTTGAATGGAAATCAATATGCATACCAGTGCTTACTGTTTCTACTTTGGCAATCGTGAGCAAGAAACTACAAATATAGCTCTTAGCAACCCAGGCTACAACCCTCTCTTGGTGCCTCAGTATTCCCTGCATTTACCAAAATTTATTAAATCTATTTATAGTGAAATATCCAATACTTGATTTTTTTTTTAACACCATAATTTGGCTTCTGATGGTAGGCATAGACCTTTATCTGGCTAAGGCTTCCAGTTATTTTCTTTTTCCTCATGCACCCATTGCTATTTTGTTCACTCCTAATAGACAGCATAACTTTATGCAAAAATGGTTGAATTCTGCACTGTAGTTGGTTAATCTAAGTTCTTATTTTAACATTTACCATGAGTGTTTGTAGTAATGCCACACATGAATACATGATACTTGATGGTTGATGGCGCTATACGATTATCTGTACAAAGAGCTGTTTTTGAGAAGTACACTTTTAGAAACAATGATAGATGGATAAAATTCTAAAACCAATGTATGTGTACTGCAGTTCTGAAGATTGCTTAATCAAAGTCTGGGAAACTTCTCAGGGAAAGTTGGTCAAAACACTGCAGGTAATGTACCAGCATTTTCACTGGGCATTCTAAAGTTTATGGAAATGTTTATGCTCCCATGAGTCAGTGTCCACATTGTTATACAGATGTACTGGATCTGGAGATGAATTTCAATTCAAAACATTTGGTCCTGCTGAACTGTCAAGTTTGCATGGATCTGTAGTGAAACCATGTAGGAGGCTGATGCTAGCACACCATATTCTAATTTTCCTTCATCCTGATCGACAGAATAAGCTCATGTGAATGCATATTCTTTATGAACAACCAATCTGACTATTCATGTTTATTTCCTTCTGAAAATACTTCGATGGCTAGAATAATTCGGTCATTTAAGATACAGGTAGGCTATGAAAGGCCATATTTGCTTGGTTTGGGCTCAAAGACCAAGGAACAATTCATATTTACTAGGATGCCCATATACGAAATGCTAAGCCAAACCCTCCTGATACTAATTGCACCAGGCGCATGCTGACAGCCTGTGTGCAATAGCTAGCTGATACTGGTTGCTTTGTGAATAGAAAAATTCATTGCCAAATAGTTGAAGGTTTACTCTAAATGGGGGTTGGGGGTATGAAAATTTATTTTGGACAATATGTGCTTCCCACAATGATCAAACTAACCCCTCCATTTTTTTAATATTTTAAAGTTTTAACCAACGTCTTACAAAAGAAAATGGAGGAAGTAATATTGTATTCCTTAATTCATGAATCAAGAACCAAATACCAAGTATCCTTTCAATTGTGAATCATCAGTCGTATCCAAGAAACGATTTTGAGGATTATTTTTAATATTATTTTGTTGCTATTTTTGCACATTTACTGGACTTAATATTTTTGTAGCAGTGAATTATTTCCATACTTTCAAGTCAGCTATTCTATGCTAGTTGTCAGTGTCTGTCATCTTTTTAAAGTAGTTACTACGCATATGCAGGGTCATGGGCACTGGGTCAATTCACTTGCTTTGAGCACCGAGTATATTTTGCGCACTGGGGCTTATGACCATACTGGCAAAACATATTCAACTGCAGATGAAATGAAGGAGGTATGATGCAATCATAAATCAGTGCTAAAACTGTTTTTGTTGTTTCCATTTGTCGCTTGCTGAAATGATTTTTGTGACTTGAGAATTTTGAATATTCAGGCAGCGCTTGCAAGATACAAGAAGATGAGGGGCAATGCGCCTGAGAGACTAGTATCAGGTTCTGATGATTTTACTATGTTTCTCTGGGAACCAACAATTAGTAAACAGCCCAAAGCTCGCATGACTGGTCATCAAAAGGT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CDS seq

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Protein seq

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Function Notchless protein homolog [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FLX9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_11g0019100 OsCMeo_11g0019100.01 Chr11 22421651 22427909 + NAM
CDS seq

ATGGAGAACCAAGATCAGCAGGAGCCCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGAAGCGTGATGTGCCAGCTCGTCAGTCCCGAGGGAGACCACCTCGGCGCCGCCCTCTACCTGCCGCAGAACGTCGGCCCGCCGCAGCTTCAGGAGATCGTCAACCATCTTCTCCACAACGAGGACAAGTTGCCCTATGCATTCTACATCGGAGATGAAGAGCTATCTGTCCAGCTTGGTGCTTACATGCAGCAAAAAAATGCAAATGTTGAGGTCACCCTGCGCATAGTATATCAACCACAAGCAGTTTTCCGCATCAGGCCAGTCAACCGATGCTCTGCTACAATTGCTGGCCATACAGAAGCCGTATTAGCTGTCTCTTTCAGCCCTGATGGAAGATGTTTGGCTAGTGGTTCAGGTGACACCACTGTTCGGTTTTGGGATCTGAACACGCAGACCCCATTGTTCACATGCAAAGGCCACAAAAATTGGGTGCTCTGCATTGCATGGTCACCTGATGGGAACCATCTTGTTAGTGGAAGCAAGTCAGGGGAGCTTATATTATGGGACCCAAAAACAGGCAAGCAATTGGGCACTCCACTTACGGGGCATAGAAAATGGATTACTGCTGTATCTTGGGAGCCAGTTCATTTGCAAGCTCCCTGCCGCCGTTTTGTAAGTGCAAGTAAGGATGGTGACGCACGTATTTGGGATATTACCACAAGGAAGTGCGTTATTGCCCTTACAGGTCACACTAATTCTGTGACCTGTGTCAAGTGGGGTGGAGACGGTTTGATTTACACTGGTTCTGAAGATTGCTTAATCAAAGTCTGGGAAACTTCTCAGGGAAAGTTGGTCAAAACACTGCAGGGTCATGGGCACTGGGTCAATTCACTTGCTTTGAGCACCGAGTATATTTTGCGCACTGGGGCTTATGACCATACTGGCAAAACATATTCAACTGCAGATGAAATGAAGGAGGCAGCGCTTGCAAGATACAAGAAGATGAGGGGCAATGCGCCTGAGAGACTAGTATCAGGTTCTGATGATTTTACTATGTTTCTCTGGGAACCAACAATTAGTAAACAGCCCAAAGCTCGCATGACTGGTCATCAAAAGCTCGTAAACCATGTCTACTTCTCTCCTGATGGGCAGTGGTTGGCCAGTGCCTCCTTTGACAAATCTGTCAAGTTATGGAACGGTATTACAGGCAAATTCGTTGCAGCTTTCAGAGGACATGTTGCAGATGTCTACCAGATCAGCTGGTCTGCCGACAGTAGGCTTCTACTCAGTGGAAGCAAGGATTCCACCCTAAAGGTTTGGGATATTCGAACACACAAGTTGAAACAGGACTTGCCAGGCCACGCAGATGAGGTGTATGCTGTGGATTGGAGCCCTGACGGTGAGAAGGTTGCATCTGGTGGGAAAGACAGGGTCCTCAAGCTTTGGATGAACTAG

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Protein seq

MENQDQQEPGSGSGSGSVMCQLVSPEGDHLGAALYLPQNVGPPQLQEIVNHLLHNEDKLPYAFYIGDEELSVQLGAYMQQKNANVEVTLRIVYQPQAVFRIRPVNRCSATIAGHTEAVLAVSFSPDGRCLASGSGDTTVRFWDLNTQTPLFTCKGHKNWVLCIAWSPDGNHLVSGSKSGELILWDPKTGKQLGTPLTGHRKWITAVSWEPVHLQAPCRRFVSASKDGDARIWDITTRKCVIALTGHTNSVTCVKWGGDGLIYTGSEDCLIKVWETSQGKLVKTLQGHGHWVNSLALSTEYILRTGAYDHTGKTYSTADEMKEAALARYKKMRGNAPERLVSGSDDFTMFLWEPTISKQPKARMTGHQKLVNHVYFSPDGQWLASASFDKSVKLWNGITGKFVAAFRGHVADVYQISWSADSRLLLSGSKDSTLKVWDIRTHKLKQDLPGHADEVYAVDWSPDGEKVASGGKDRVLKLWMN

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_11g0019100 OsCMeo_11g0019100.02 Chr11 22421609 22428427 + IsoSeq
CDS seq

CTAGTCGACCATCTCGCTTCCCCCTTCCCCGCCTCCTCTCGAGTTCACCTGCCACCCGCCCGCCGCCGCCGCCGAGCAGCTACTGGTGCCGGCTGCCGTCCTCCTGCTTCCGCCGCCGGGATTTCAGATGGAGAACCAAGATCAGCAGGAGCCCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGGAAGCGTGATGTGCCAGCTCGTCAGTCCCGAGGGAGACCACCTCGGCGCCGCCCTCTACCTGCCGCAGAACGTCGGCCCGCCGCAGCTTCAGGAGATCGTCAACCATCTTCTCCACAACGAGGACAAGTTGCCCTATGCATTCTACATCGG

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Protein seq

LVDHLASPFPASSRVHLPPARRRRRAATGAGCRPPASAAGISDGEPRSAGARQRQRQRKRDVPARQSRGRPPRRRPLPAAERRPAAASGDRQPSSPQRGQVALCILHR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr11 22421728 22421846 + OsCMeo_11g0019100.02 OsCMeo_11g0019100.01,OsCMeo_11g0019100.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.041299 11.861526 5.295037

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0594200 RBH 1.673088 1.318215 4.028183
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g38170 RBH 1.117154 0.877927 1.073239
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0594200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0019100 RBH 1.228075 4.986028 4.417761
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0019280 RBH 0.189479 2.956726 2.284397
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0000230 RBH 0.286992 3.930327 1.424014
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0018770 RBH 0.051661 0.224717 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0019050 RBH 2.943973 12.779589 12.920444
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0348700 RBH 2.7087335 10.17656 8.811277
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0019620 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0361400 RBH 2.6441715 7.917672 13.9191795
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0019390 RBH 0.108573 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0019550 RBH 0.972678 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0019050 RBH 0.000000 10.693826 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0018730 RBH 0.252674 0.0 0.369698
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0018870 RBH 0.000000 0.606924 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G019050 RBH 0.531295 3.310673 4.148380
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0019320 RBH 0.726930 10.342424 1.850067
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