Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_11g0017440 | OGI:11010520 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:20753458-20769518 | ||||||||
| Gene Symbol | XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0017440 | OsARC_11g0017440.01 | Chr11 | 20753458 | 20769444 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGTCTGGTTTATCTAGGCTCACATTAAGCTCTAACAATTTAACTGGGCTGATACCCAGTTCTATTTGGAACAACATGTCAGCACTAATGGCGTTCACTGTCCAGCAAAATTCGTTAAGTGGAACCATTCCTCCAAATGCATTCAGTAATTTTCCCAGTCTCCAGCTTATAGGAATGGACCACAACAAGTTTCATGGTAGTATCCCTACGTCGATTGCCAATGCTTCCCATCTGTGGTTGGTTCAGCTTGGTGCTAACTTCTTAAGCGGTATCGTTCCTCCAGAGATTGGAGGCTTAAGAAATCTCAAAATTCTACAGCTTTCAGAAACATTTCTTGAAGCTAGAAGCCCCAACGATTGGAAATTCATAACCGCATTAACAAATTGTTCCCAGTTTAGCGTGTTGTACTTGGCTAGTTGCAGCTTTGGAGGAGTTCTTCCTGATTCACTTTCCAATTTGTCCTCTCTGACAAATCTTTTCCTTGACACAAACAAAATTTCGGGAAGCATACCTGAAGATATTGATAACCTCATCAATCTGCAAGCATTTAATCTCGATAACAACAATTTCACAGGGCATCTTCCCTCCTCCATTGGTAGGCTTCAAAATCTGCATCTTCTCTCCATAGGGAACAACAAAATTGGTGGGCCAATTCCATTGACATTAGGAAACCTAACAGAACTATATATTTTACAACTCAGATCAAATGCTTTTAGCGGTAGCATACCAAGCATTTTTAGAAACCTTACAAACTTATTAGGACTAAGCCTAGACAGCAATAACTTTACTGGTCAAATCCCAACAGAGGTAGTCAGCATTGTCAGTCTCTCTGAAGGTTTGAACCTGTCGAATAACAACTTGGAGGGATCAATACCACAACAAATCGGGAATCTGAAAAATCTTGTAAACTTAGATGCCAGATCAAATAAATTATCAGGTGAAATCCCTACTACCCTTGGTGAATGCCAACTTCTCCAGAATATCTATCTCCAAAATAACATGTTAACTGGTAGTCTTCCATCACTCCTGAGTCAATTGAAAGGCCTACAAACTCTTGATCTTTCGAGTAACAATTTGTCTGGTCAAATACCCACATTCCTATCAAACCTTACCATGCTCGGTTATCTCAACCTTTCATTCAATGATTTTGTTGGAGAAGTACCTACACTTGGTGTCTTTTTGAATGCTTCTGCAATTTCAATTCAAGGGAATGGCAAACTTTGTGGTGGCGTGCCTGATCTACATTTGCCTAGATGTACATCACAAGCACCGCACAGAAGGCAGAAATTTCTGGTAATTCCTATTGTTGTGTCTCTTGTGGCAATATTACTCCTGCTTTTATTATTCTACAAGCTTCTGGCTCGGTACAAGAAAATAAAATCAAAGATACCATCAACCACATGCATGGAAGGCCATCCTTTGATCTCTTACTCTCAGCTGGCAAGGGCAACAGACAGTTTCTCAGCGACCAATTTGTTGGGATCAGGATCATTTGGTTCTGTGTATAAAGGAGAATTAGATAAACAATCTGGTCAAAGTAAAGATATTATTGCTGTCAAAGTGCTAAAACTCCAAACTCCTGGAGCGCTCAAGAGTTTCACAGCTGAATGTGAAGCACTGCGAAATCTACGACACCGGAATCTTGTCAAGATAATTACAGCTTGCTCAAGCATTGATAACAGCGGCAATGACTTCAAAGCAATTGTGTTTGACTTCATGCCTAGTGGTAATTTAGAAGGCTGGTTGCATCCTGCCACAAACAACCCAAAGTACTTAAATCTTCTTCAGAGAGTTGGCATACTACTTGATGTGGCTAATGCGCTGGATTATCTACATTGCCATGGACCAACACCTGTTGTACATTGTGATCTCAAACCGAGCAATGTGCTTTTAGATGCTGAGATGGTAGCACATGTTGGAGACTTTGGACTTGCTAAGATTCTTTTTGAAGGCAACTCATTGCTCCAACAGTCTACAAGCTCGATGGGACTTAGAGGGACAATCGGTTATGCTCCCCCAGAGTATGGTGCTGGAAATACGGTATCGACTCAAGGAGATATTTACAGCTATGGTATTCTTGTGCTAGAAACGGTAACTGGGAAGAGGCCCACAGATAAGAAATTCATACAAGGATTGAGCCTCCGTGAGTATGTTGAGCTGGGTCTACATGGTAAAATGATGGATGTTGTCGACACTCAGCTATCTTTGCACCTTGAGAATGAACTTCTTACCACGGATGAATACAAAGTCATGATTGATTGCCTGGTTTCATTGCTTAGGCTTGGATTGTATTGCTCTCAGGAAATACCGTCGAATAGAATGTCAACTGGAGATATTATTAAGGAATTGAATGCCATAAAACAAACCCTCTTATCACCAACGTCGGTCATGATCTCTTCTTTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGATCGGCCCAGCGAGCAGTGACGATGATGCTGCTGCTGCTGCTCGTACCAGTACAGGCGGCGTCGCCGGCGACGAACTCGCGCTGCTCTCTTTCAAGTCATCCCTGCTACACCAGGGGGGCTTGTCGCTGGCATCTTGGAACACGTCCGGCCACGGCCAGCACTGCACATGGGTGGGTGTTGTGTGCGGCCGCCGCCGCCGGCACCCACACAGGGTGGTGAAGCTGCTGCTGGGCTCGTCCAACCTGTCCGGGATCATCTCGCCGTCGCTGGGCAACCTGTCCTTCCTCAGGGAGCTGGACCTCAGCGACAACTACCTCTCCGGCGAGATACCACCGGAGCTCAGCCGTCTCAGCAGGCTTCAGCTGCTGGAGCTGAGCGATAACTCCCTCCAAGGGAGCATCCCCGCGGCCATTGGAGCATGCACCAAGTTGACAACGCTAGACCTCAGCAACAACCAACTGCGAGGTATGATCCCACGTGAGATTGGTGCCAGCTTGAAACATCTCTCGAATTTGTACCTTGACACCAATGGTTTGTCAGGAGAGATTCCATCTGCTTTGGGCAATCTCACTAGCCTTCAGTATTTTGATTTGAGCTACAACAGATTATCAGGAGCTATACCTTCATCGCTAGGGCAGCTCAGCAGCAGTCTATTGACTATGAGTTTGGGACAGAACAATCTAAGTGGGATGATCCCCAATTCTATCTGGAACCTTTCGTCTCTAAGAGAGTTTAGTGTCAGCGGAAACAAGCTAGGTGGTATGATCCCTACAAATGCATTCAAAACCCTTCACCTCCTCGAGGTGATAGATATGTACACTAACCGTTTCCATGGCAAAATCCCTGCCTCAGTTGCTAATGCTTCTCATCTGACACGGCTTCAGATTGATGGCAACTTGTTCAGTGGAATTATCACCTCGGGGTTTGGAAGGTTAAGAAATCTCACAACACTGTATCTCTGGAGAAATTTGTTTCAAACTAGAGAACAAGAAGATTGGGGGTTCATTTCTGACCTAACAAATTGCTCCAAATTACAAACATTGGACTTGGGAGAAAATAACCTGGGGGGAGTTCTTCCTAATTCGTTTTCCAATCTTTCCACTTCGCTTAGTTTTCTTGCACTTGATTTGAATAAGATCACAGGAAGCATTCCAAAGGATATTGGCAATCTTATTGGCTTACAACATCTCTATCTCTGCAACAACAATTTCAGAGGGTCTCTTCCATCATCGTTGGGCAGGCTTAGAAACTTAGGCATTCTAGTCGCCTACGAAAACAACTTGAGCGGTTCGATCCCATTGGCCATAGGAAATCTTACTGAACTTAATATCTTACTGCTCGGCACCAACAAATTCAGTGGTTGGATACCATACACACTCTCAAACCTCACAAACTTGTTGTCATTAGGCCTTTCAACTAATAACCTTAGTGGTCCAATACCCAGTGAATTATTCAATATTCAAACACTATCAATAATGATCAATGTATCAAAAAATAACTTGGAGGGATCAATACCACAAGAAATAGGGCATCTCAAAAATCTAGTAGAATTTCATGCAGAATCGAATAGATTATCAGGTAAAATCCCTAACACGCTTGGTGATTGCCAGCTCTTACGGTATCTTTATCTGCAAAATAATTTGTTATCTGGTAGCATCCCATCAGCCTTGGGTCAGCTGAAAGGTCTCGAAACTCTTGATCTCTCAAGCAACAATTTGTCAGGCCAGATACCCACATCCTTAGCAGATATTACTATGCTTCATTCCTTGAACCTTTCTTTCAACAGCTTTGTGGGGGAAGTGCCAACCATTGGTGCTTTCGCAGATGCATCCGGGATCTCAATCCAAGGCAATGCCAAACTCTGTGGTGGAATACCTGATCTACATCTGCCTCGATGTTGTCCATTACTAGAGAACAGAAAGCATTTCCCAGCTCTACCTATTTCTGTTTCTCTGGTCGCAGCACTGGCCATCCTCTCATCACTCTACTTGCTTATAACCTGGAACAAGAGAACTAAAAAGGGAGCCCCTTCAAGAACTTCCATGAAAGGCCACCCATTGGTCTCTTATTCGCAGTTGGTAAAAGCAACAGATGGTTTCGCGCCGACCAATTTGTTGGGTTCTGGATCATTTGGCTCAGTATACAAAGGAAAGCTTAATATCCAAGATCATGTTGCAGTGAAGGTACTAAAGCTTGAAAATCCTAAGGCACTCAAGAGTTTCACTGCCGAATGTGAAGCACTACGAAATATGCGACATCGAAATCTTGTCAAGATAGTTACAATTTGCTCGAGCATTGATAACAGAGGGAACGATTTCAAAGCAATTGTGTATGACTTCATGCCCAACGGCAGTCTGGAAGATTGGATACACCCTGAAACAAATGATCAAGCAGACCAGAGGCACTTGAATCTGCATCGAAGAGTGACCATACTACTTGATGTTGCCTGTGCATTGGACTATCTTCACCGCCATGGCCCTGAACCTGTTGTACACTGTGATGTTAAATCAAGAAATGTGCTGTTAGATTCTGATATGGTAGCGCATGTTGGAGATTTTGGGCTTGCAAGAATACTTGT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| Protein seq | MSGLSRLTLSSNNLTGLIPSSIWNNMSALMAFTVQQNSLSGTIPPNAFSNFPSLQLIGMDHNKFHGSIPTSIANASHLWLVQLGANFLSGIVPPEIGGLRNLKILQLSETFLEARSPNDWKFITALTNCSQFSVLYLASCSFGGVLPDSLSNLSSLTNLFLDTNKISGSIPEDIDNLINLQAFNLDNNNFTGHLPSSIGRLQNLHLLSIGNNKIGGPIPLTLGNLTELYILQLRSNAFSGSIPSIFRNLTNLLGLSLDSNNFTGQIPTEVVSIVSLSEGLNLSNNNLEGSIPQQIGNLKNLVNLDARSNKLSGEIPTTLGECQLLQNIYLQNNMLTGSLPSLLSQLKGLQTLDLSSNNLSGQIPTFLSNLTMLGYLNLSFNDFVGEVPTLGVFLNASAISIQGNGKLCGGVPDLHLPRCTSQAPHRRQKFLVIPIVVSLVAILLLLLLFYKLLARYKKIKSKIPSTTCMEGHPLISYSQLARATDSFSATNLLGSGSFGSVYKGELDKQSGQSKDIIAVKVLKLQTPGALKSFTAECEALRNLRHRNLVKIITACSSIDNSGNDFKAIVFDFMPSGNLEGWLHPATNNPKYLNLLQRVGILLDVANALDYLHCHGPTPVVHCDLKPSNVLLDAEMVAHVGDFGLAKILFEGNSLLQQSTSSMGLRGTIGYAPPEYGAGNTVSTQGDIYSYGILVLETVTGKRPTDKKFIQGLSLREYVELGLHGKMMDVVDTQLSLHLENELLTTDEYKVMIDCLVSLLRLGLYCSQEIPSNRMSTGDIIKELNAIKQTLLSPTSVMISSLLLLLLLIGPASSDDDAAAAARTSTGGVAGDELALLSFKSSLLHQGGLSLASWNTSGHGQHCTWVGVVCGRRRRHPHRVVKLLLGSSNLSGIISPSLGNLSFLRELDLSDNYLSGEIPPELSRLSRLQLLELSDNSLQGSIPAAIGACTKLTTLDLSNNQLRGMIPREIGASLKHLSNLYLDTNGLSGEIPSALGNLTSLQYFDLSYNRLSGAIPSSLGQLSSSLLTMSLGQNNLSGMIPNSIWNLSSLREFSVSGNKLGGMIPTNAFKTLHLLEVIDMYTNRFHGKIPASVANASHLTRLQIDGNLFSGIITSGFGRLRNLTTLYLWRNLFQTREQEDWGFISDLTNCSKLQTLDLGENNLGGVLPNSFSNLSTSLSFLALDLNKITGSIPKDIGNLIGLQHLYLCNNNFRGSLPSSLGRLRNLGILVAYENNLSGSIPLAIGNLTELNILLLGTNKFSGWIPYTLSNLTNLLSLGLSTNNLSGPIPSELFNIQTLSIMINVSKNNLEGSIPQEIGHLKNLVEFHAESNRLSGKIPNTLGDCQLLRYLYLQNNLLSGSIPSALGQLKGLETLDLSSNNLSGQIPTSLADITMLHSLNLSFNSFVGEVPTIGAFADASGISIQGNAKLCGGIPDLHLPRCCPLLENRKHFPALPISVSLVAALAILSSLYLLITWNKRTKKGAPSRTSMKGHPLVSYSQLVKATDGFAPTNLLGSGSFGSVYKGKLNIQDHVAVKVLKLENPKALKSFTAECEALRNMRHRNLVKIVTICSSIDNRGNDFKAIVYDFMPNGSLEDWIHPETNDQADQRHLNLHRRVTILLDVACALDYLHRHGPEPVVHCDVKSRNVLLDSDMVAHVGDFGLARILVDGTSLIQQSTSSMGFRGTIGYAAPEYGVRHIASTHGDIYSYGILVLEIVTGKRPTDSTFRPDLGLRQYVELGLHGRVTDVVDTKLILDSENWLNSTNNSPCRRITECIVSLLRLGLSCSQDLPLSRTPTGDIIDELNAIKQNLSGLFPVCEGASLEF
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0017440 | OsARC_11g0017440.03 | Chr11 | 20764832 | 20769518 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGTACATCACAAGCACCGCACAGAAGGCAGAAATTTCTGGTAATTCCTATTGTTGTGTCTCTTGTGGCAATATTACTCCTGCTTTTATTATTCTACAAGCTTCTGGCTCGGTACAAGAAAATAAAATCAAAGATACCATCAACCACATGCATGGAAGGCCATCCTTTGATCTCTTACTCTCAGCTGGCAAGGGCAACAGACAGTTTCTCAGCGACCAATTTGTTGGGATCAGGATCATTTGGTTCTGT
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| Protein seq | MYITSTAQKAEISGNSYCCVSCGNITPAFIILQASGSVQENKIKDTINHMHGRPSFDLLLSAGKGNRQFLSDQFVGIRIIWFC |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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| SE | Chr11 | 20768392 | 20769245 | - | OsARC_11g0017440.01 | OsARC_11g0017440.01,OsARC_11g0017440.02 | All |
| SE | Chr11 | 20768392 | 20769245 | - | OsARC_11g0017440.03 | OsARC_11g0017440.03,OsARC_11g0017440.02 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.021506 | 0.098889 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0569800 | RBH | 0.063795 | 0.587945 | 1.832365 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g36180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0569800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0017830 | SBH | 0.128877 | 6.788608 | 1.696541 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0017950 | SBH | 0.037384 | 0.707040 | 1.005031 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0017770 | SBH | 0.164332 | 9.540369 | 4.595458 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0017370 | RBH | 0.0 | 0.019391 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0017840 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0332200 | RBH | 0.009196 | 0.9433155 | 3.2579865 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0018330 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0344300 | RBH | 0.099182 | 0.4184825 | 0.0564465 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0018140 | RBH | 0.0 | 0.143210 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0018220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0017770 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0017590 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0017720 | RBH | 0.000000 | 1.564580 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G016140 | SBH | 0.0 | 0.588280 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0017620 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
