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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	82507	82932	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0101700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0101700-00;protein_id=OsNip_01t0101700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	83724	84095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0101700-00;Name=OsNip_01t0101700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0101700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	83865	84095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0101700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	134912	135439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102300-01;Name=OsNip_01t0102300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0102300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	146028	146082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102600-01;Name=OsNip_01t0102600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0102600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	147576	147805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	148085	148146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	148085	148313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102700-01;Name=OsNip_01t0102700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0102700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	169751	169909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102900-01;Name=OsNip_01t0102900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0102900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	169751	169909	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0102900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0102900-01;protein_id=OsNip_01t0102900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	170091	170260	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0102900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0102900-01;protein_id=OsNip_01t0102900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	170091	170316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102900-01;Name=OsNip_01t0102900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0102900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	170261	170316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	169360	169909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102900-02;Tag=IsoSeq:G17.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G9.6;prot_id "UniRef90_I1HC57";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	169010	169171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0102900-02;Tag=IsoSeq:G17.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G9.6;prot_id "UniRef90_I1HC57";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	170798	173144	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0103000-01;Parent=gene:OsNip_01g0103000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0103000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	171406	171554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103000-01;Name=OsNip_01t0103000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0103000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	171406	171554	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0103000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0103000-01;protein_id=OsNip_01t0103000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	171764	171875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103000-01;Name=OsNip_01t0103000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0103000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	172770	172921	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0103000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0103000-01;protein_id=OsNip_01t0103000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	172587	175073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103050-01;Name=OsNip_01t0103050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0103050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	178607	178641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	180463	180548	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	178652	178677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	178652	180575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103100-02;Name=OsNip_01t0103100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0103100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	178678	180462	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0103100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0103100-02;protein_id=OsNip_01t0103100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	180463	180575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0103100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	178815	180433	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0103075;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	178815	180433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0103075-00;Parent=gene:OsNip_01g0103075;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0103075-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	227179	227181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	227179	227634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104400-03;Name=OsNip_01t0104400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0104400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	274958	275084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	270250	270355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	270250	271333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;Name=OsNip_01t0104900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0104900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	270356	271309	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0104900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;protein_id=OsNip_01t0104900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	271310	271333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	271457	271518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;Name=OsNip_01t0104900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0104900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	271457	271518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	274135	274929	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0104900-03;Parent=gene:OsNip_01g0104900;transcript_id=OsNip_01t0104900-03;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7
Chr01	TAMA	exon	274529	274929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-03;Name=OsNip_01t0104900-03;exon_id=OsNip_01t0104900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7;prot_id "UniRef90_A0A6A4LL02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	exon	274135	274333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-03;Name=OsNip_01t0104900-03;exon_id=OsNip_01t0104900-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7;prot_id "UniRef90_A0A6A4LL02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	274929	274929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-03;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7;prot_id "UniRef90_A0A6A4LL02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	274529	274710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-03;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7;prot_id "UniRef90_A0A6A4LL02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	274135	274333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0104900-03;Tag=IsoSeq:G29.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G17.7;prot_id "UniRef90_A0A6A4LL02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	284762	291892	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0105300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	284762	291892	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0105300-01;Parent=gene:OsNip_01g0105300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0105300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	323054	323923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0106300-01;Name=OsNip_01t0106300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0106300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	327128	328450	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0106400-01;Parent=gene:OsNip_01g0106400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0106400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	327128	327336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0106400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	374728	374979	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0106900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	552333	552574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0110400-01;Name=OsNip_01t0110400-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0110400-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	552367	552574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0110400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	772470	773829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0114300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	770374	771213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0114300-02;Name=OsNip_01t0114300-02;exon_id=OsNip_01t0114300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G64.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G34.1;prot_id "UniRef90_A0A287DWS7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	770918	771213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0114300-02;Tag=IsoSeq:G64.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G34.1;prot_id "UniRef90_A0A287DWS7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	772470	773835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0114300-02;Tag=IsoSeq:G64.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G34.1;prot_id "UniRef90_A0A287DWS7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	774848	779158	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0114402-00;Parent=gene:OsNip_01g0114402;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0114402-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	774848	774857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0114402-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	921078	921270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0116400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	924801	925950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0116900-01;Tag=IsoSeq:G65.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G35.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3EIW8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	mRNA	961333	965992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0117050-02;Parent=gene:OsNip_01g0117050;transcript_id=OsNip_01t0117050-02;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1
Chr01	TAMA	exon	965578	965992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117050-02;Name=OsNip_01t0117050-02;exon_id=OsNip_01t0117050-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8YQL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	965682	965990	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0117050-02;Parent=transcript:OsNip_01t0117050-02;protein_id=OsNip_01t0117050-02;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8YQL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	961333	965448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117050-02;Name=OsNip_01t0117050-02;exon_id=OsNip_01t0117050-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8YQL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	965991	965992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117050-02;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8YQL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	965578	965679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117050-02;Tag=IsoSeq:G66.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G58.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8YQL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	962505	962569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	969340	973327	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0117200;Name=OsNip_RLCK16;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	969340	973327	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0117200-01;Parent=gene:OsNip_01g0117200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0117200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	969340	969486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	969340	970664	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117200-01;Name=OsNip_01t0117200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0117200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	999898	1000997	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0117700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0117700-00;protein_id=OsNip_01t0117700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1010259	1011841	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0117900-01;Parent=gene:OsNip_01g0117900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0117900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1010259	1010361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1010259	1010567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0117900-01;Name=OsNip_01t0117900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0117900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1017440	1017709	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;protein_id=OsNip_01t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1017807	1017916	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;protein_id=OsNip_01t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1018591	1018860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;Name=OsNip_01t0118000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0118000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1018591	1018860	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;protein_id=OsNip_01t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1018968	1019246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;protein_id=OsNip_01t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1018968	1019435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;Name=OsNip_01t0118000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0118000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1019247	1019435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1016196	1017917	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0118033;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1125645	1126732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0119800-01;Name=OsNip_01t0119800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0119800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1127045	1127402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0119800-01;Name=OsNip_01t0119800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0119800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1145920	1153828	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0120300-00;Parent=gene:OsNip_01g0120300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0120300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1251035	1251421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1250500	1251487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122000-02;Tag=IsoSeq:G89.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G74.3;prot_id "UniRef90_C7IWQ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1254028	1254083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Name=OsNip_01t0122200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0122200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1254028	1254083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1254208	1254255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1254208	1254534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Name=OsNip_01t0122200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0122200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1254256	1254534	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0122200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;protein_id=OsNip_01t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1254625	1255359	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0122200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;protein_id=OsNip_01t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1254625	1255635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Name=OsNip_01t0122200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0122200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1255360	1255635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1254331	1255339	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0122367-00;Parent=gene:OsNip_01g0122367;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0122367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1254331	1254558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0122367-00;Parent=transcript:OsNip_01t0122367-00;protein_id=OsNip_01t0122367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1254331	1255339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122367-00;Name=OsNip_01t0122367-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0122367-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1254559	1255339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1264331	1265206	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0122534;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1264331	1265206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0122534-00;Parent=gene:OsNip_01g0122534;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0122534-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1264331	1264789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122534-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1264331	1265206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122534-00;Name=OsNip_01t0122534-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0122534-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1264790	1265134	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0122534-00;Parent=transcript:OsNip_01t0122534-00;protein_id=OsNip_01t0122534-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1265135	1265206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0122534-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1395980	1396825	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125500-00;Name=OsNip_01t0125500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0125500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1401419	1402373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1401419	1402460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;Name=OsNip_01t0125550-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0125550-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1402374	1402460	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0125550-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;protein_id=OsNip_01t0125550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1403082	1403387	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0125550-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;protein_id=OsNip_01t0125550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1403082	1403419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;Name=OsNip_01t0125550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1403388	1403419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1404816	1406889	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0125600-01;Parent=gene:OsNip_01g0125600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0125600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1404816	1404960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1404961	1404999	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0125600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125600-01;protein_id=OsNip_01t0125600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1405103	1405178	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0125600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125600-01;protein_id=OsNip_01t0125600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1415534	1415720	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0125800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125800-01;protein_id=OsNip_01t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1417361	1417768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-01;Name=OsNip_01t0125800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0125800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1418397	1418654	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0125800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0125800-01;protein_id=OsNip_01t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1418397	1418982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-01;Name=OsNip_01t0125800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0125800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1418655	1418982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	1413872	1414309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Name=OsNip_01t0125800-02;exon_id=OsNip_01t0125800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	1413874	1414309	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0125800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;protein_id=OsNip_01t0125800-02;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	1414845	1415006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Name=OsNip_01t0125800-02;exon_id=OsNip_01t0125800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	exon	1417361	1417768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Name=OsNip_01t0125800-02;exon_id=OsNip_01t0125800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1415534	1416646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1417361	1417768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1418397	1418982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125800-02;Tag=IsoSeq:G95.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G79.1;prot_id "UniRef90_A0A1R3GR34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1413847	1418662	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0125850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1413847	1418662	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0125850-00;Parent=gene:OsNip_01g0125850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1413847	1414174	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1413847	1414307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1414175	1414307	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0125850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;protein_id=OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1414843	1414934	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0125850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;protein_id=OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1414843	1415004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1414935	1415004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1415532	1415720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1415532	1415720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1416221	1416619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1416221	1416619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1417337	1417783	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1417337	1417783	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1418412	1418662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Name=OsNip_01t0125850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1418412	1418662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1421693	1427682	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0125900;Name=OsNip_UBC34;biotype=protein_coding;description=Ubiquitin-conjugating;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1421693	1427650	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0125900-01;Parent=gene:OsNip_01g0125900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1421693	1421897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125900-01;Name=OsNip_01t0125900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1421693	1421897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1423289	1423343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1423289	1425260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0125900-01;Name=OsNip_01t0125900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0125900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1491024	1492684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127000-01;Name=OsNip_01t0127000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0127000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1492575	1492684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	1493275	1493412	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127000-02;Tag=IsoSeq:G99.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G53.1;prot_id "UniRef90_J3KW05";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1490490	1490851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127000-02;Tag=IsoSeq:G99.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G53.1;prot_id "UniRef90_J3KW05";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1490993	1492680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127100-01;Name=OsNip_01t0127100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0127100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1491076	1491417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0127100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0127100-01;protein_id=OsNip_01t0127100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1491418	1492680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1497241	1500606	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0127200-01;Parent=gene:OsNip_01g0127200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0127200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1518835	1520946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0127700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1573450	1573450	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0128400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1572525	1572656	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0128400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0128400-01;protein_id=OsNip_01t0128400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1673607	1673836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1675247	1675362	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0130000-01;Name=OsNip_01t0130000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0130000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1675247	1675362	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0130000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0130000-01;protein_id=OsNip_01t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1676735	1677066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0130000-01;Name=OsNip_01t0130000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0130000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1771497	1772410	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0132200-01;Parent=gene:OsNip_01g0132200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1771497	1771621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1771497	1772410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0132200-01;Name=OsNip_01t0132200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0132200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1772348	1772410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1855158	1855410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133500-02;Name=OsNip_01t0133500-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0133500-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1857805	1858452	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0133650-00;Parent=transcript:OsNip_01t0133650-00;protein_id=OsNip_01t0133650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1865459	1866109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133700-00;Name=OsNip_01t0133700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0133700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1865459	1866109	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0133700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0133700-00;protein_id=OsNip_01t0133700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1865235	1865307	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0133766;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1865235	1865307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133766-00;Name=OsNip_01t0133766-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0133766-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1865455	1866126	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0133799;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1865455	1866126	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0133799-00;Parent=gene:OsNip_01g0133799;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0133799-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1865455	1865530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133799-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1865531	1866124	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0133799-00;Parent=transcript:OsNip_01t0133799-00;protein_id=OsNip_01t0133799-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1866125	1866126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133799-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1868093	1868762	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0133832;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1868093	1868762	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0133832-00;Parent=gene:OsNip_01g0133832;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0133832-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1868093	1868150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133832-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1868093	1868762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0133832-00;Name=OsNip_01t0133832-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0133832-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1868151	1868762	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0133832-00;Parent=transcript:OsNip_01t0133832-00;protein_id=OsNip_01t0133832-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	1869486	1870071	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0133866;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1904234	1904531	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0134700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0134700-01;protein_id=OsNip_01t0134700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	1904619	1904902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134700-01;Name=OsNip_01t0134700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0134700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1904774	1904902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1906717	1908131	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0134800-01;Parent=gene:OsNip_01g0134800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0134800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1906717	1906977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1906717	1908131	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134800-01;Name=OsNip_01t0134800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0134800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1906978	1908084	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0134800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0134800-01;protein_id=OsNip_01t0134800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1908085	1908131	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	1906717	1909774	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0134800-02;Parent=gene:OsNip_01g0134800;transcript_id=OsNip_01t0134800-02;Tag=IsoSeq:G127.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G104.1
Chr01	TAMA	exon	1909653	1909774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134800-02;Name=OsNip_01t0134800-02;exon_id=OsNip_01t0134800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G127.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G104.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9WF35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	1906717	1908084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0134800-02;Tag=IsoSeq:G127.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G104.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9WF35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1928220	1928591	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0135600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0135600-01;protein_id=OsNip_01t0135600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1928592	1929735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1929907	1930288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135600-01;Name=OsNip_01t0135600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0135600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1934117	1934246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1934247	1934699	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0135800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0135800-01;protein_id=OsNip_01t0135800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1941012	1941148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1941650	1941845	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1941012	1941148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	1941012	1941370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135900-01;Name=OsNip_01t0135900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0135900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	1941149	1941370	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0135900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0135900-01;protein_id=OsNip_01t0135900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1941384	1941851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0135900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	1944276	1944948	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0136000-00;Parent=gene:OsNip_01g0136000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0136000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2001786	2002851	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0137400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0137400-00;protein_id=OsNip_01t0137400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2002940	2003083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0137400-00;Name=OsNip_01t0137400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0137400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2063615	2064696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2064697	2064735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0138600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0138600-01;protein_id=OsNip_01t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2065306	2065367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0138600-01;Name=OsNip_01t0138600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0138600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2065500	2065557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0138600-01;Name=OsNip_01t0138600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0138600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2122034	2122320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	2120969	2122320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140100-02;Name=OsNip_01t0140100-02;exon_id=OsNip_01t0140100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G142.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G113.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7BC84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	2120969	2121468	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0140100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0140100-02;protein_id=OsNip_01t0140100-02;Tag=IsoSeq:G142.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G113.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7BC84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	2120495	2120496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140100-02;Tag=IsoSeq:G142.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G113.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7BC84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	2121472	2122320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140100-02;Tag=IsoSeq:G142.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G113.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7BC84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2131487	2131574	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0140400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0140400-01;protein_id=OsNip_01t0140400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2131674	2132744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140400-01;Name=OsNip_01t0140400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0140400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2132847	2132991	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0140400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0140400-01;protein_id=OsNip_01t0140400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2135322	2135399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2136108	2137291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2131674	2132744	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0140400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0140400-02;protein_id=OsNip_01t0140400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2132847	2132991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0140400-02;Name=OsNip_01t0140400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0140400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2215662	2216048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-01;Name=OsNip_01t0141100-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0141100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2222121	2222812	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-01;Name=OsNip_01t0141100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0141100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2222589	2222812	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2215676	2215922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2215676	2216048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;Name=OsNip_01t0141100-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141100-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2215923	2216048	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0141100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;protein_id=OsNip_01t0141100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2216131	2216286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;Name=OsNip_01t0141100-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141100-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2216131	2216286	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0141100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;protein_id=OsNip_01t0141100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2216371	2216469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;Name=OsNip_01t0141100-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141100-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2216371	2216469	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0141100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;protein_id=OsNip_01t0141100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2216557	2216631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141100-02;Name=OsNip_01t0141100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2253149	2253271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141700-01;Name=OsNip_01t0141700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2253379	2253506	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141700-01;Name=OsNip_01t0141700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0141700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2254057	2254147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141700-01;Name=OsNip_01t0141700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2254701	2255000	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0141700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0141700-01;protein_id=OsNip_01t0141700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2265483	2265725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0141900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0141900-01;protein_id=OsNip_01t0141900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2265483	2266230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141900-01;Name=OsNip_01t0141900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0141900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2265726	2266230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0141900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2266281	2271051	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0142100;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2266281	2271051	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0142100-01;Parent=gene:OsNip_01g0142100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2266281	2266649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2266281	2266904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142100-01;Name=OsNip_01t0142100-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0142100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2266650	2266904	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0142100-01;protein_id=OsNip_01t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2267381	2267588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142100-01;Name=OsNip_01t0142100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0142100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2267959	2268112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142100-01;Name=OsNip_01t0142100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0142100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2295940	2296042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2297971	2298108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2296049	2297950	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0142875;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2296049	2296152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Name=OsNip_01t0142875-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0142875-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2296049	2296152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2296256	2296487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Name=OsNip_01t0142875-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0142875-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2296256	2296487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2296575	2296787	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2296575	2297950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Name=OsNip_01t0142875-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0142875-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2296788	2297543	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0142875-00;Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;protein_id=OsNip_01t0142875-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2297544	2297950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142875-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2338166	2342048	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0142950;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2338166	2342048	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0142950-01;Parent=gene:OsNip_01g0142950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0142950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2338166	2339518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0142950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2434793	2434841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2434842	2435173	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0145200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0145200-01;protein_id=OsNip_01t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2438034	2438127	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0145200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0145200-01;protein_id=OsNip_01t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2488413	2491357	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0146101-01;Parent=gene:OsNip_01g0146101;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0146101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2488413	2488707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146101-01;Name=OsNip_01t0146101-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0146101-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2491108	2491357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146101-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2500280	2500349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2500280	2501248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146200-01;Name=OsNip_01t0146200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0146200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2500350	2500682	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0146200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0146200-01;protein_id=OsNip_01t0146200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2500683	2501248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	mRNA	2501911	2502504	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t014659A-01;Parent=gene:OsNip_01g014659A;transcript_id=OsNip_01t014659A-01;Tag=IsoSeq:G162.1;Source=Nipponbare.root_G96.1
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	2501911	2501912	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t014659A-01;Tag=IsoSeq:G162.1;Source=Nipponbare.root_G96.1;prot_id "UniRef90_C7IXM3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	2502054	2502504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t014659A-01;Tag=IsoSeq:G162.1;Source=Nipponbare.root_G96.1;prot_id "UniRef90_C7IXM3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2530890	2531390	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0146600-01;Parent=gene:OsNip_01g0146600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0146600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2530890	2530967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2530890	2531390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146600-01;Name=OsNip_01t0146600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0146600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2530968	2531390	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0146600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0146600-01;protein_id=OsNip_01t0146600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2541950	2542484	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0146801;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2541950	2542484	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0146801-00;Parent=gene:OsNip_01g0146801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0146801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2541950	2542107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2541950	2542293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146801-00;Name=OsNip_01t0146801-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0146801-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2542315	2542401	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0146801-00;Parent=transcript:OsNip_01t0146801-00;protein_id=OsNip_01t0146801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2542420	2542484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146801-00;Name=OsNip_01t0146801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0146801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2542429	2542484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0146801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2550946	2551461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0147001-00;Name=OsNip_01t0147001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0147001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2560897	2560989	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2560897	2561000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;Name=OsNip_01t0147200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0147200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2560990	2561000	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;protein_id=OsNip_01t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2561102	2561675	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;protein_id=OsNip_01t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2562630	2562749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;Name=OsNip_01t0147200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0147200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2562630	2562749	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0147200-01;protein_id=OsNip_01t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	2693206	2695074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0149800-02;Name=OsNip_01t0149800-02;exon_id=OsNip_01t0149800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G173.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G137.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	2694054	2695074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0149800-02;Tag=IsoSeq:G173.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G137.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	2693206	2693814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0149800-02;Tag=IsoSeq:G173.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G137.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2699128	2703491	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0149900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2699128	2703491	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0149900-01;Parent=gene:OsNip_01g0149900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2699128	2699346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2699128	2700020	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0149900-01;Name=OsNip_01t0149900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0149900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2747134	2747204	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0150800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0150800-01;protein_id=OsNip_01t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	2771088	2771192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0151200-04;Name=OsNip_01t0151200-04;exon_id=OsNip_01t0151200-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G179.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G90.5;prot_id "UniRef90_F6GV27";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	2771284	2771358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0151200-04;Name=OsNip_01t0151200-04;exon_id=OsNip_01t0151200-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G179.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G90.5;prot_id "UniRef90_F6GV27";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2835598	2835883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152687-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2837892	2838045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2837892	2838171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152700-01;Name=OsNip_01t0152700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0152700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	2839934	2843512	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0152800;Name=OsNip_RLCK25;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2839934	2839978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2839934	2842745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;Name=OsNip_01t0152800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0152800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2839979	2842745	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0152800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;protein_id=OsNip_01t0152800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2842897	2843285	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0152800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;protein_id=OsNip_01t0152800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2842897	2843512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;Name=OsNip_01t0152800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0152800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2843286	2843512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2840037	2843293	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0152850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2840037	2843293	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0152850-00;Parent=gene:OsNip_01g0152850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0152850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2840037	2840469	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0152850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0152850-00;protein_id=OsNip_01t0152850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2840037	2842740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152850-00;Name=OsNip_01t0152850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0152850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2840470	2842740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2842892	2843293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152850-00;Name=OsNip_01t0152850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0152850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2842892	2843293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2844503	2845212	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0152900;Name=OsNip_Fbox002;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2844503	2845212	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0152900-00;Parent=gene:OsNip_01g0152900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0152900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2844503	2844658	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2844503	2845212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152900-00;Name=OsNip_01t0152900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0152900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2844659	2845120	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0152900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0152900-00;protein_id=OsNip_01t0152900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2845121	2845212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2847554	2848849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152950-00;Name=OsNip_01t0152950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0152950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2847554	2848849	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0152950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0152950-00;protein_id=OsNip_01t0152950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2849160	2849246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0152951-00;Name=OsNip_01t0152951-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0152951-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2849824	2849974	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0152951-00;Parent=transcript:OsNip_01t0152951-00;protein_id=OsNip_01t0152951-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2851445	2851689	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0152951-00;Parent=transcript:OsNip_01t0152951-00;protein_id=OsNip_01t0152951-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2851954	2855225	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0153000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2851954	2854675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153000-00;Name=OsNip_01t0153000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0153000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2851954	2854675	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0153000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0153000-00;protein_id=OsNip_01t0153000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2854819	2855225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153000-00;Name=OsNip_01t0153000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0153000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2854819	2855225	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0153000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0153000-00;protein_id=OsNip_01t0153000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2851988	2855214	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0153050-00;Parent=gene:OsNip_01g0153050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0153050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2851988	2852372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2851988	2854673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;Name=OsNip_01t0153050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0153050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2852373	2852909	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0153050-00;Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;protein_id=OsNip_01t0153050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2852910	2854673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2854817	2855214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;Name=OsNip_01t0153050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0153050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2854817	2855214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0153050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2857382	2858128	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0153100;Name=OsNip_Fbox002;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2930802	2930921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0154600-01;Name=OsNip_01t0154600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0154600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	2932646	2932886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0154600-01;Name=OsNip_01t0154600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0154600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2954510	2954510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0154950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2954510	2956849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0154950-01;Name=OsNip_01t0154950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0154950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2954511	2955398	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0154950-01;Parent=transcript:OsNip_01t0154950-01;protein_id=OsNip_01t0154950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2955399	2956849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0154950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2957166	2958439	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0155000;Name=Hsr203j;biotype=protein_coding;description=Alpha/beta;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2957166	2958439	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0155000-02;Parent=gene:OsNip_01g0155000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0155000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2957166	2957395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2957396	2958409	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0155000-02;protein_id=OsNip_01t0155000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2958410	2958439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2962422	2964972	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0155200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2962422	2964972	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0155200-00;Parent=gene:OsNip_01g0155200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0155200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2962422	2964917	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0155200-00;protein_id=OsNip_01t0155200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2962422	2964972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155200-00;Name=OsNip_01t0155200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0155200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2964918	2964972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2966314	2967346	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0155300-00;Parent=gene:OsNip_01g0155300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0155300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2966314	2966323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2966314	2967346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155300-00;Name=OsNip_01t0155300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0155300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2966324	2967346	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0155300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0155300-00;protein_id=OsNip_01t0155300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	2971130	2980491	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0155400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	2971130	2977009	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0155400-01;Parent=gene:OsNip_01g0155400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2971130	2971368	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2971130	2971726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2971369	2971726	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2971812	2971882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2971812	2971882	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2973308	2973401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2973308	2973401	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2973502	2973569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2973502	2973569	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2973681	2973747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2973681	2973747	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2973830	2973960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2973830	2973960	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2974093	2974200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2974093	2974200	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2974577	2974642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2974577	2974642	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2974990	2975056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2974990	2975056	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2975741	2975816	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	2975741	2975816	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0155400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;protein_id=OsNip_01t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	2976399	2976510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0155400-01;Name=OsNip_01t0155400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0155400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3044488	3044633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0157900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3046202	3046402	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0157900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0157900-01;protein_id=OsNip_01t0157900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3046608	3046849	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0157900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0157900-01;protein_id=OsNip_01t0157900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3046608	3047128	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0157900-01;Name=OsNip_01t0157900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0157900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3046850	3047128	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0157900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	3044527	3047093	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0157900-02;Parent=gene:OsNip_01g0157900;transcript_id=OsNip_01t0157900-02;Tag=IsoSeq:G198.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G157.1
Chr01	TAMA	exon	3044527	3044898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0157900-02;Name=OsNip_01t0157900-02;exon_id=OsNip_01t0157900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G198.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G157.1;prot_id "UniRef90_A0A540NQ61";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	3102683	3102799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0159300-01;Name=OsNip_01t0159300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0159300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3346176	3346318	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0164800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0164800-01;protein_id=OsNip_01t0164800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	3346587	3346705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0164800-01;Name=OsNip_01t0164800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0164800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3346704	3346705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0164800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3517006	3517144	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0168800-01;protein_id=OsNip_01t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3517243	3517310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0168800-01;Name=OsNip_01t0168800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0168800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3517243	3517310	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0168800-01;protein_id=OsNip_01t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3621523	3624403	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0170300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0170300-01;protein_id=OsNip_01t0170300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3639023	3639159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0170500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3663504	3663757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0170800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	3665042	3666044	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0170900-01;Parent=gene:OsNip_01g0170900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3665042	3665348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3665042	3666044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0170900-01;Name=OsNip_01t0170900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0170900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3665349	3665687	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0170900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0170900-01;protein_id=OsNip_01t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3665688	3666044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	3667476	3673008	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0171000-01;Parent=gene:OsNip_01g0171000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0171000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	3921301	3922653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176100-01;Tag=IsoSeq:G263.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G208.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9UXF6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	3922852	3923563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176100-01;Tag=IsoSeq:G263.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G208.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9UXF6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3921411	3921820	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0176150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0176150-00;protein_id=OsNip_01t0176150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3921411	3921821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176150-00;Name=OsNip_01t0176150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0176150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	3924401	3926257	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0176200-01;Parent=gene:OsNip_01g0176200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3924401	3924432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3925105	3926098	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0176200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0176200-01;protein_id=OsNip_01t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3925105	3926257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176200-01;Name=OsNip_01t0176200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0176200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3954932	3955442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	3953070	3954170	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0176751-00;Parent=gene:OsNip_01g0176751;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0176751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3953070	3953238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176751-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	3953239	3953766	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0176751-00;Parent=transcript:OsNip_01t0176751-00;protein_id=OsNip_01t0176751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3953767	3953994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	3954110	3954170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0176751-00;Name=OsNip_01t0176751-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0176751-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	4081623	4082803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178600-01;Tag=IsoSeq:G273.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G215.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6GSA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4092287	4092383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4094021	4094251	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0178700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0178700-01;protein_id=OsNip_01t0178700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4094021	4094814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178700-01;Name=OsNip_01t0178700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0178700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4092625	4093040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178775-00;Name=OsNip_01t0178775-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0178775-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4093415	4093507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178775-00;Name=OsNip_01t0178775-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0178775-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4093582	4093875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178775-00;Name=OsNip_01t0178775-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0178775-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4093996	4094164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178775-00;Name=OsNip_01t0178775-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0178775-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4099317	4099593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178850-00;Name=OsNip_01t0178850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0178850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4106828	4106828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4106828	4108508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0178900-01;Name=OsNip_01t0178900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0178900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	4110402	4112126	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0179000-01;Parent=gene:OsNip_01g0179000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0179000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4110402	4110689	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4110402	4112126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179000-01;Name=OsNip_01t0179000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0179000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4110690	4112003	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0179000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0179000-01;protein_id=OsNip_01t0179000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4112004	4112126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	4118041	4122224	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0179200;biotype=protein_coding;description=Syntaxin%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	4118041	4122224	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0179200-01;Parent=gene:OsNip_01g0179200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4118041	4118202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4118041	4118458	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179200-01;Name=OsNip_01t0179200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0179200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4118203	4118458	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0179200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0179200-01;protein_id=OsNip_01t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4120359	4120609	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0179200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0179200-01;protein_id=OsNip_01t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4129826	4129884	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179400-01;Name=OsNip_01t0179400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0179400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4131924	4132152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179400-01;Name=OsNip_01t0179400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0179400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4132250	4132331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179400-01;Name=OsNip_01t0179400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0179400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4133252	4133777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0179400-01;Name=OsNip_01t0179400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0179400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4180208	4180789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0180050-00;Parent=transcript:OsNip_01t0180050-00;protein_id=OsNip_01t0180050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4258978	4259194	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0180800-03;Parent=transcript:OsNip_01t0180800-03;protein_id=OsNip_01t0180800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4269535	4269643	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0180900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0180900-01;protein_id=OsNip_01t0180900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4270087	4270134	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0180900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0180900-01;protein_id=OsNip_01t0180900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4270087	4270356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0180900-01;Name=OsNip_01t0180900-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0180900-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4398030	4398035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4400713	4401942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183100-01;Name=OsNip_01t0183100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0183100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4401733	4401942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	4402668	4407292	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0183300-01;Parent=gene:OsNip_01g0183300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4402668	4402846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4402668	4403063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4402847	4403063	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0183300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;protein_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4403860	4404002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4403860	4404002	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0183300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;protein_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4404339	4404447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4404339	4404447	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0183300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;protein_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4404546	4405707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4404546	4405707	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0183300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;protein_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4406558	4406614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4406558	4406614	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0183300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;protein_id=OsNip_01t0183300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4406754	4406865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183300-01;Name=OsNip_01t0183300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0183300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4426544	4426863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	4426685	4426686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-02;Tag=IsoSeq:G294.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G181.1;prot_id "UniRef90_A0A287EZP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	4425511	4425609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-02;Tag=IsoSeq:G294.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G181.1;prot_id "UniRef90_A0A287EZP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	4425002	4425134	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-02;Tag=IsoSeq:G294.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G181.1;prot_id "UniRef90_A0A287EZP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	4424793	4424910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-02;Tag=IsoSeq:G294.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G181.1;prot_id "UniRef90_A0A287EZP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	4423980	4424259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183633-02;Tag=IsoSeq:G294.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G181.1;prot_id "UniRef90_A0A287EZP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4434129	4434386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;Name=OsNip_01t0183800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0183800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4434129	4434386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4435913	4436047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;Name=OsNip_01t0183800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0183800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4436028	4436047	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0183800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;protein_id=OsNip_01t0183800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4436618	4437695	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0183800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;protein_id=OsNip_01t0183800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4436618	4437827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;Name=OsNip_01t0183800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0183800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4437696	4437827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0183800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	4434094	4437902	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0183800-02;Parent=gene:OsNip_01g0183800;transcript_id=OsNip_01t0183800-02;Tag=IsoSeq:G295.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G233.2
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4514356	4514701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;Name=OsNip_01t0185200-03-E22;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0185200-03-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4514604	4514701	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0185200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;protein_id=OsNip_01t0185200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4514790	4514919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;Name=OsNip_01t0185200-03-E21;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0185200-03-E21;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4514790	4514919	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0185200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;protein_id=OsNip_01t0185200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4515027	4515116	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;Name=OsNip_01t0185200-03-E20;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0185200-03-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4515027	4515116	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0185200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185200-03;protein_id=OsNip_01t0185200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4531773	4532859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185300-02;Name=OsNip_01t0185300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0185300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4532604	4532859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	4528240	4528488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;Name=OsNip_01t0185300-03;exon_id=OsNip_01t0185300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	4528240	4528488	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0185300-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;protein_id=OsNip_01t0185300-03;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	4528581	4528740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;Name=OsNip_01t0185300-03;exon_id=OsNip_01t0185300-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	4528581	4528740	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0185300-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;protein_id=OsNip_01t0185300-03;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	4531776	4532851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;Name=OsNip_01t0185300-03;exon_id=OsNip_01t0185300-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	4531776	4532602	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0185300-03;Parent=transcript:OsNip_01t0185300-03;protein_id=OsNip_01t0185300-03;Tag=IsoSeq:G302.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G187.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4531622	4532654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185350-01;Name=OsNip_01t0185350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0185350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4536009	4536009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4538762	4539217	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0185400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0185400-01;protein_id=OsNip_01t0185400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4539376	4540065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-01;Name=OsNip_01t0185400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0185400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4539419	4540065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	4534028	4534310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-02;Name=OsNip_01t0185400-02;exon_id=OsNip_01t0185400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G303.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G239.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZWC2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	4535889	4536075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-02;Name=OsNip_01t0185400-02;exon_id=OsNip_01t0185400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G303.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G239.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZWC2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	exon	4538049	4538091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-02;Name=OsNip_01t0185400-02;exon_id=OsNip_01t0185400-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G303.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G239.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZWC2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	4538413	4538672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0185400-02;Name=OsNip_01t0185400-02;exon_id=OsNip_01t0185400-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G303.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G239.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZWC2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	4668595	4668700	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0187300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0187300-01;protein_id=OsNip_01t0187300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	4668595	4669037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0187300-01;Name=OsNip_01t0187300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0187300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	4884026	4885331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0191300-02;Name=OsNip_01t0191300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0191300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	5014697	5015197	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0193250-00;Name=OsNip_01t0193250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0193250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5373712	5373778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0198900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5373712	5374663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0198900-02;Name=OsNip_01t0198900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0198900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5374430	5374663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0198900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	5384196	5385088	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0199300-00;Parent=gene:OsNip_01g0199300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0199300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5384196	5384238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5384196	5385088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199300-00;Name=OsNip_01t0199300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0199300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5384818	5385088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	5389837	5394412	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0199400-01;Parent=gene:OsNip_01g0199400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5389837	5390070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5390071	5390487	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5390973	5391065	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0199400-02-E5;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5390973	5391065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5391301	5391390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0199400-02-E4;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5391301	5391390	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5391472	5391536	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0199400-02-E3;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5391472	5391536	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5392106	5392176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0199400-02-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5392106	5392176	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5392297	5392335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0199400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5392297	5392335	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5393938	5394350	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0199400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;protein_id=OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5393938	5394412	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Name=OsNip_01t0199400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0199400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5394351	5394412	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	5389841	5393868	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0199400-02;Parent=gene:OsNip_01g0199400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0199400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5389841	5390070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5389841	5390487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0199400-02;Name=OsNip_01t0199400-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0199400-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5428989	5429174	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0200300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0200300-01;protein_id=OsNip_01t0200300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5429266	5429388	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0200300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0200300-01;protein_id=OsNip_01t0200300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5429266	5429390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0200300-01;Name=OsNip_01t0200300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0200300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	5479359	5479749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0200700-01;Name=OsNip_01t0200700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0200700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5479450	5479749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0200700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5530497	5531111	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0201275-00;Parent=transcript:OsNip_01t0201275-00;protein_id=OsNip_01t0201275-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	5543398	5544219	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0201500-01;Tag=IsoSeq:G354.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G281.1,Nipponbare.panicle_G281.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5UK57";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	5652524	5655707	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0202700;Name=FT-L;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	5770252	5770393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205550-00;Name=OsNip_01t0205550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0205550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5770917	5771163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205550-00;Name=OsNip_01t0205550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0205550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5771861	5772046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205550-00;Name=OsNip_01t0205550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0205550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	5773300	5774176	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0205600;biotype=protein_coding;description=Crotonase%2C;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5773300	5773339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	5773300	5774176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205600-01;Name=OsNip_01t0205600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0205600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5773340	5774083	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0205600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0205600-01;protein_id=OsNip_01t0205600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5774084	5774176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	5774293	5778476	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0205700;Name=GSK1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	5774293	5776922	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0205700-01;Parent=gene:OsNip_01g0205700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0205700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5774293	5774770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0205700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	5907241	5908632	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0208700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0208700-01;protein_id=OsNip_01t0208700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	5908973	5909560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0208700-01;Name=OsNip_01t0208700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0208700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5909270	5909560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0208700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	5904982	5909565	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0208700-02;Parent=gene:OsNip_01g0208700;transcript_id=OsNip_01t0208700-02;Tag=IsoSeq:G369.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G294.5
Chr01	TAMA	exon	5904982	5905256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0208700-02;Name=OsNip_01t0208700-02;exon_id=OsNip_01t0208700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G369.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G294.5;prot_id "UniRef90_A8ASG2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	5904984	5905256	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0208700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0208700-02;protein_id=OsNip_01t0208700-02;Tag=IsoSeq:G369.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G294.5;prot_id "UniRef90_A8ASG2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	CDS	5906914	5906964	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0208700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0208700-02;protein_id=OsNip_01t0208700-02;Tag=IsoSeq:G369.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G294.5;prot_id "UniRef90_A8ASG2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	exon	5938963	5939508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0209400-02;Name=OsNip_01t0209400-02;exon_id=OsNip_01t0209400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G371.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G227.2;prot_id "UniRef90_K3YTT1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6027570	6027763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6031025	6032833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0210900-01;Name=OsNip_01t0210900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0210900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6032781	6032833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0210900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6037454	6039022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0211000-00;Name=OsNip_01t0211000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0211000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6037454	6039022	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0211000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0211000-00;protein_id=OsNip_01t0211000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	6057440	6058954	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0211200;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6057440	6058954	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0211200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0211200-00;protein_id=OsNip_01t0211200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	6063140	6063607	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0211400;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	6063140	6063607	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0211400-00;Parent=gene:OsNip_01g0211400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0211400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6063140	6063607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0211400-00;Name=OsNip_01t0211400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0211400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	6076731	6078239	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0211600;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6381594	6381819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0216951-00;Name=OsNip_01t0216951-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0216951-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6387860	6387999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0217000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6455325	6456068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218032-01;Name=OsNip_01t0218032-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0218032-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6494938	6495100	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0218500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-01;protein_id=OsNip_01t0218500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6495195	6497781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-01;Name=OsNip_01t0218500-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0218500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6495261	6497781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6494516	6494596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6494516	6495100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Name=OsNip_01t0218500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0218500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6494597	6495100	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0218500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;protein_id=OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6495195	6495256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Name=OsNip_01t0218500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0218500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6495195	6495256	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0218500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;protein_id=OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6499047	6499087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Name=OsNip_01t0218500-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0218500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6499047	6499087	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0218500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;protein_id=OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6499218	6499441	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0218500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;protein_id=OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6499218	6499766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Name=OsNip_01t0218500-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0218500-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6499442	6499766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6494583	6494596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6494583	6495100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;Name=OsNip_01t0218500-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0218500-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6494597	6495100	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0218500-03;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;protein_id=OsNip_01t0218500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6495195	6495260	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0218500-03;Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;protein_id=OsNip_01t0218500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6495195	6495668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;Name=OsNip_01t0218500-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0218500-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6495261	6495668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	6495257	6497781	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0218500-04;Parent=gene:OsNip_01g0218500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0218500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6495257	6497781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218500-04;Name=OsNip_01t0218500-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0218500-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	6500709	6507086	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0218700;Name=OsNip_ABCD1;biotype=protein_coding;description=ABC;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	6500709	6502533	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0218700-02;Parent=gene:OsNip_01g0218700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0218700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6500709	6501138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6500709	6501333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;Name=OsNip_01t0218700-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0218700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6501139	6501333	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0218700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;protein_id=OsNip_01t0218700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6501610	6501875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;Name=OsNip_01t0218700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0218700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6501610	6501875	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0218700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;protein_id=OsNip_01t0218700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6502494	6502533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;Name=OsNip_01t0218700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0218700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6502494	6502533	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0218700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0218700-02;protein_id=OsNip_01t0218700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6587345	6587507	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0220400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0220400-01;protein_id=OsNip_01t0220400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6587816	6587940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220400-01;Name=OsNip_01t0220400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0220400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6587816	6587940	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0220400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0220400-01;protein_id=OsNip_01t0220400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	6587146	6587898	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0220400-02;Parent=gene:OsNip_01g0220400;transcript_id=OsNip_01t0220400-02;Tag=IsoSeq:G404.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G188.1,Nipponbare.root_G243.1,Nipponbare.panicle_G320.1
Chr01	TAMA	exon	6587146	6587898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220400-02;Name=OsNip_01t0220400-02;exon_id=OsNip_01t0220400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G404.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G188.1,Nipponbare.root_G243.1,Nipponbare.panicle_G320.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0II66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	6587898	6587898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220400-02;Tag=IsoSeq:G404.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G188.1,Nipponbare.root_G243.1,Nipponbare.panicle_G320.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0II66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	6587146	6587721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220400-02;Tag=IsoSeq:G404.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G188.1,Nipponbare.root_G243.1,Nipponbare.panicle_G320.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0II66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	6590983	6592142	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0220500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	6590983	6592142	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0220500-00;Parent=gene:OsNip_01g0220500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0220500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6590983	6591330	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	6590983	6591440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0220500-00;Name=OsNip_01t0220500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0220500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6653629	6655290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	6654666	6654796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221500-02;Name=OsNip_01t0221500-02;exon_id=OsNip_01t0221500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G408.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G190.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	6653209	6653210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221500-02;Tag=IsoSeq:G408.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G190.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	6654669	6654796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221500-02;Tag=IsoSeq:G408.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G190.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6659237	6659531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221600-01;Name=OsNip_01t0221600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0221600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6659683	6659823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0221600-01;Name=OsNip_01t0221600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0221600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6659683	6659823	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0221600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0221600-01;protein_id=OsNip_01t0221600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6665082	6665133	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0221700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0221700-00;protein_id=OsNip_01t0221700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	6787136	6789577	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0223900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0223900-01;protein_id=OsNip_01t0223900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6789578	6789730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0223900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6840743	6841165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0224400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	6967620	6967979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0226300-02;Name=OsNip_01t0226300-02;exon_id=OsNip_01t0226300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G426.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G253.3,Nipponbare.panicle_G335.3;prot_id "UniRef90_A0A2P2L1W7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6993432	6994006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	6989015	6989205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0226600-02;Name=OsNip_01t0226600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0226600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6989015	6989205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0226600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	7186356	7186820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0229800-00;Name=OsNip_01t0229800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0229800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7245622	7246003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0230800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	7270624	7270815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-01;Name=OsNip_01t0231500-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0231500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7266339	7266408	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0231500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;protein_id=OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7268777	7268903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7269016	7269796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7269927	7270066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7270624	7270815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Name=OsNip_01t0231500-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0231500-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7270624	7270815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7270910	7271620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Name=OsNip_01t0231500-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0231500-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7270910	7271620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7272337	7273208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Name=OsNip_01t0231500-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0231500-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7272337	7273208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	7275696	7278124	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0231600;biotype=protein_coding;description=Pleckstrin;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7277271	7277972	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0231600-00;Parent=gene:OsNip_01g0231600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0231600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7277271	7277346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0231600-00;Name=OsNip_01t0231600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0231600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7345138	7345302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7460350	7460538	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0235200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7473855	7474043	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0235350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0235350-00;protein_id=OsNip_01t0235350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7590433	7592743	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0237100-01;Parent=gene:OsNip_01g0237100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7590433	7590658	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7590659	7590784	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0237100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0237100-01;protein_id=OsNip_01t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7590951	7591031	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0237100-01;Name=OsNip_01t0237100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0237100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	7667608	7668076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238500-02;Name=OsNip_01t0238500-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0238500-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7667700	7668076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	7666758	7666934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238500-03;Tag=IsoSeq:G482.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G223.2;prot_id "UniRef90_A0A059BMH2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	7667055	7667510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238500-03;Tag=IsoSeq:G482.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G223.2;prot_id "UniRef90_A0A059BMH2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	7667608	7668097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238500-03;Tag=IsoSeq:G482.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G223.2;prot_id "UniRef90_A0A059BMH2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	7670071	7672734	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0238600;biotype=protein_coding;description=Nucleic;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7670071	7672734	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0238600-01;Parent=gene:OsNip_01g0238600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0238600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7670071	7670208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7670071	7670446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0238600-01;Name=OsNip_01t0238600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0238600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7804166	7804280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7804166	7804910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;Name=OsNip_01t0241000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0241000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7804281	7804910	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0241000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;protein_id=OsNip_01t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7804989	7805510	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0241000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;protein_id=OsNip_01t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7804989	7805788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;Name=OsNip_01t0241000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0241000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7805511	7805788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	7804143	7805788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-02;Name=OsNip_01t0241000-02;exon_id=OsNip_01t0241000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G492.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G287.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9UHG9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	7805360	7805599	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0241000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0241000-02;protein_id=OsNip_01t0241000-02;Tag=IsoSeq:G492.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G287.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9UHG9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	7804143	7805359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-02;Tag=IsoSeq:G492.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G287.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9UHG9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	7805603	7805788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241000-02;Tag=IsoSeq:G492.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G287.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9UHG9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7806682	7810887	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0241100-01;Parent=gene:OsNip_01g0241100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7806682	7807112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7806682	7807193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Name=OsNip_01t0241100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0241100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7807113	7807193	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;protein_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7807275	7807499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Name=OsNip_01t0241100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0241100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7807275	7807499	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;protein_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7807589	7807709	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Name=OsNip_01t0241100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0241100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7807589	7807709	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;protein_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7808065	7808256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Name=OsNip_01t0241100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0241100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7808065	7808256	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;protein_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7808884	7808947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;Name=OsNip_01t0241100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0241100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7808884	7808947	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0241100-01;protein_id=OsNip_01t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	7852782	7853064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242333-00;Name=OsNip_01t0242333-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0242333-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7853591	7853972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242333-00;Name=OsNip_01t0242333-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0242333-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7854044	7854147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242333-00;Name=OsNip_01t0242333-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0242333-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	7856491	7857240	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0242400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0242400-01;protein_id=OsNip_01t0242400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7857241	7857611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7856518	7857344	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0242450-00;Parent=gene:OsNip_01g0242450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0242450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7856518	7856909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242450-00;Name=OsNip_01t0242450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0242450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	7857022	7857344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242450-00;Name=OsNip_01t0242450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0242450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	7857827	7860061	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0242500;biotype=protein_coding;description=D-tyrosyl-tRNA(Tyr);Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	7857828	7860061	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0242500-01;Parent=gene:OsNip_01g0242500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0242500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7857828	7858107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0242500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8130258	8130932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247600-01;Name=OsNip_01t0247600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0247600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8130889	8130932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8132699	8135454	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0247700;Name=SLAC;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8132699	8135454	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0247700-01;Parent=gene:OsNip_01g0247700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0247700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8132699	8134377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8132699	8135454	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-01;Name=OsNip_01t0247700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0247700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8134378	8135421	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0247700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0247700-01;protein_id=OsNip_01t0247700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8135422	8135454	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	8132699	8135453	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0247700-02;Parent=gene:OsNip_01g0247700;transcript_id=OsNip_01t0247700-02;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2
Chr01	TAMA	exon	8134534	8135453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-02;Name=OsNip_01t0247700-02;exon_id=OsNip_01t0247700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2;prot_id "UniRef90_A0A287KQ29";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	8135289	8135453	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0247700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0247700-02;protein_id=OsNip_01t0247700-02;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2;prot_id "UniRef90_A0A287KQ29";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	8132699	8133344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-02;Name=OsNip_01t0247700-02;exon_id=OsNip_01t0247700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2;prot_id "UniRef90_A0A287KQ29";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	8134534	8135286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-02;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2;prot_id "UniRef90_A0A287KQ29";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	8132699	8133344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247700-02;Tag=IsoSeq:G504.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G406.1,Nipponbare.root_G292.2;prot_id "UniRef90_A0A287KQ29";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8146442	8148059	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0247900;biotype=protein_coding;description=AWPM-19-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8146442	8148059	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0247900-01;Parent=gene:OsNip_01g0247900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8146442	8146715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8146442	8146841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Name=OsNip_01t0247900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0247900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8146716	8146841	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0247900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;protein_id=OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8146943	8146988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Name=OsNip_01t0247900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0247900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8146943	8146988	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0247900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;protein_id=OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8147329	8147548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Name=OsNip_01t0247900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0247900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8147329	8147548	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0247900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;protein_id=OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8147832	8147955	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0247900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;protein_id=OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8147832	8148059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Name=OsNip_01t0247900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0247900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8147956	8148059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0247900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8152795	8153685	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0248000;biotype=protein_coding;description=Stigma-specific;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8152795	8153685	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0248000-01;Parent=gene:OsNip_01g0248000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0248000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8152795	8153181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8152795	8153685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248000-01;Name=OsNip_01t0248000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0248000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8153182	8153589	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0248000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0248000-01;protein_id=OsNip_01t0248000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8153590	8153685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8159901	8161287	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0248300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8159901	8161287	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0248300-00;Parent=gene:OsNip_01g0248300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0248300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8159901	8160050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248300-00;Name=OsNip_01t0248300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0248300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8161147	8161287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0248300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0248300-00;protein_id=OsNip_01t0248300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8159918	8160693	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0248350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8159918	8160693	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0248350-00;Parent=gene:OsNip_01g0248350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8159918	8160281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;Name=OsNip_01t0248350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0248350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8159918	8160281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8160402	8160405	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8160402	8160693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;Name=OsNip_01t0248350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0248350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8160406	8160669	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0248350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;protein_id=OsNip_01t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8160670	8160693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8170309	8175903	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0248400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8170309	8175903	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0248400-01;Parent=gene:OsNip_01g0248400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0248400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8170309	8170504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8170309	8170553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0248400-01;Name=OsNip_01t0248400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0248400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8170505	8170553	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0248400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0248400-01;protein_id=OsNip_01t0248400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8300818	8302401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251200-01;Name=OsNip_01t0251200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0251200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8300599	8300710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251200-02;Name=OsNip_01t0251200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0251200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8300623	8300710	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0251200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0251200-02;protein_id=OsNip_01t0251200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8300818	8301367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251200-02;Name=OsNip_01t0251200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0251200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8300818	8301367	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0251200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0251200-02;protein_id=OsNip_01t0251200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8305748	8306555	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0251400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8305749	8306555	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0251400-01;Parent=gene:OsNip_01g0251400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0251400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8305749	8305965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8305749	8306136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;Name=OsNip_01t0251400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0251400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8305966	8306136	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0251400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;protein_id=OsNip_01t0251400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8306387	8306476	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0251400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;protein_id=OsNip_01t0251400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8306387	8306555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;Name=OsNip_01t0251400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0251400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8306477	8306555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	8305748	8306554	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0251400-02;Parent=gene:OsNip_01g0251400;transcript_id=OsNip_01t0251400-02;Tag=IsoSeq:G516.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G414.3
Chr01	TAMA	exon	8305748	8306554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-02;Name=OsNip_01t0251400-02;exon_id=OsNip_01t0251400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G516.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G414.3;prot_id "UniRef90_A0A446NBP0";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	CDS	8305866	8305952	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0251400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0251400-02;protein_id=OsNip_01t0251400-02;Tag=IsoSeq:G516.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G414.3;prot_id "UniRef90_A0A446NBP0";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	8305953	8306554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-02;Tag=IsoSeq:G516.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G414.3;prot_id "UniRef90_A0A446NBP0";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	8305748	8305863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0251400-02;Tag=IsoSeq:G516.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G414.3;prot_id "UniRef90_A0A446NBP0";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8329791	8333933	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0252100;Name=OsNip_SKgamma;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8329791	8333933	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0252100-01;Parent=gene:OsNip_01g0252100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8329791	8329914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Name=OsNip_01t0252100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0252100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8329791	8329914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8330952	8331026	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8330952	8331137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Name=OsNip_01t0252100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0252100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8331027	8331137	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;protein_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8331229	8331321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Name=OsNip_01t0252100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0252100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8331229	8331321	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;protein_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8331445	8331504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Name=OsNip_01t0252100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0252100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8331445	8331504	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;protein_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8331703	8331975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;Name=OsNip_01t0252100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0252100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8331703	8331975	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;protein_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8332107	8332181	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252100-01;protein_id=OsNip_01t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8337325	8338574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252200-01;Name=OsNip_01t0252200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0252200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8339050	8339181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8339050	8339456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252300-01;Name=OsNip_01t0252300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0252300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8339182	8339424	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0252300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252300-01;protein_id=OsNip_01t0252300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8339425	8339456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8339174	8339709	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0252400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8339174	8339709	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0252400-01;Parent=gene:OsNip_01g0252400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0252400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8339174	8339304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8339174	8339709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252400-01;Name=OsNip_01t0252400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0252400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8339305	8339529	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0252400-01;protein_id=OsNip_01t0252400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8339530	8339709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	8344471	8346041	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0252600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8344471	8346041	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0252600-00;Parent=gene:OsNip_01g0252600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8344471	8344479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8344471	8344791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;Name=OsNip_01t0252600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0252600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8344480	8344791	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;protein_id=OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8344898	8345037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;Name=OsNip_01t0252600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0252600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8344898	8345037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0252600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;protein_id=OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8345136	8345324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;Name=OsNip_01t0252600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0252600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8345136	8345324	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0252600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;protein_id=OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8345458	8345509	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0252600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0252600-00;protein_id=OsNip_01t0252600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8386102	8386229	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0253300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0253300-01;protein_id=OsNip_01t0253300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8386348	8386717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0253300-01;Name=OsNip_01t0253300-02-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0253300-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8382155	8382280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0253300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8383353	8383449	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0253300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0253300-02;protein_id=OsNip_01t0253300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8397773	8398030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0253600-01;Name=OsNip_01t0253600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0253600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8407576	8408348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0253900-01;Name=OsNip_01t0253900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0253900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8546452	8546772	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0256500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0256500-02;protein_id=OsNip_01t0256500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8546773	8546869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	8555263	8555300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256600-02;Tag=IsoSeq:G533.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G427.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8560625	8569629	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0256800-01;Parent=gene:OsNip_01g0256800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0256800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8562967	8563111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8563411	8563530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8565434	8565580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8566186	8566497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8567303	8567450	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8568385	8568571	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0256800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;protein_id=OsNip_01t0256800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8569402	8569537	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0256800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;protein_id=OsNip_01t0256800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8569402	8569629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-01;Name=OsNip_01t0256800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8560807	8561007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8560807	8561220	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-02;Name=OsNip_01t0256800-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8561008	8561220	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0256800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0256800-02;protein_id=OsNip_01t0256800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8561456	8561977	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0256800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0256800-02;protein_id=OsNip_01t0256800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8562095	8562283	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0256800-02;Name=OsNip_01t0256800-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0256800-01-E12;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8626746	8628659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0257900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8628660	8628980	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0257900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0257900-01;protein_id=OsNip_01t0257900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8628981	8630032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0257900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8627878	8629136	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0258000-01;Parent=gene:OsNip_01g0258000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0258000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8627878	8628725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0258000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8659466	8659946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0258700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8660041	8660090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0258700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8660041	8660459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0258700-03;Name=OsNip_01t0258700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0258700-01-E7;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8689258	8689797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0259300-01;Name=OsNip_01t0259300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0259300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8691829	8699628	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0259400-01;Parent=gene:OsNip_01g0259400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0259400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8691829	8692311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0259400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8695522	8697105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0259400-01;Name=OsNip_01t0259400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0259400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8884789	8884884	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0262500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0262500-01;protein_id=OsNip_01t0262500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	8885076	8885388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0262500-01;Name=OsNip_01t0262500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0262500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8885190	8885388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0262500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	8885632	8892462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0262600-01;Parent=gene:OsNip_01g0262600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0262600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8885632	8885759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0262600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8885632	8886017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0262600-01;Name=OsNip_01t0262600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0262600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8885760	8886017	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0262600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0262600-01;protein_id=OsNip_01t0262600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	8887088	8887150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0262600-01;Name=OsNip_01t0262600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0262600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	8887088	8887150	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0262600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0262600-01;protein_id=OsNip_01t0262600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9070264	9070343	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0265900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0265900-00;protein_id=OsNip_01t0265900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9070972	9071250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0265900-00;Name=OsNip_01t0265900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0265900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9071071	9071250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0265900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	9071195	9071395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0265900-01;Name=OsNip_01t0265900-01;exon_id=OsNip_01t0265900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G562.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G451.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0ASF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	9071195	9071394	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0265900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0265900-01;protein_id=OsNip_01t0265900-01;Tag=IsoSeq:G562.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G451.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0ASF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9278171	9279031	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0269100-01;Name=OsNip_01t0269100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0269100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9319575	9319637	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0269900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0269900-01;protein_id=OsNip_01t0269900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9340193	9340420	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0270300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0270300-02;protein_id=OsNip_01t0270300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9341232	9342240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0270300-02;Name=OsNip_01t0270300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0270300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9341979	9342240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0270300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	9341177	9342166	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0270300-03;Parent=gene:OsNip_01g0270300;transcript_id=OsNip_01t0270300-03;Tag=IsoSeq:G581.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G347.6
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	9394231	9394477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0271700-02;Tag=IsoSeq:G585.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G269.2;prot_id "UniRef90_UPI00053C3698";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9432814	9432953	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0272800-01;protein_id=OsNip_01t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9433935	9434045	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0272800-01;protein_id=OsNip_01t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9433935	9434046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0272800-01;Name=OsNip_01t0272800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0272800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9434046	9434046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	9431796	9435911	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0272800-02;Parent=gene:OsNip_01g0272800;transcript_id=OsNip_01t0272800-02;Tag=IsoSeq:G587.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G270.4
Chr01	TAMA	exon	9435338	9435911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0272800-02;Name=OsNip_01t0272800-02;exon_id=OsNip_01t0272800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G587.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G270.4;prot_id "UniRef90_UPI0011D2A153";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	9435338	9435911	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0272800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0272800-02;protein_id=OsNip_01t0272800-02;Tag=IsoSeq:G587.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G270.4;prot_id "UniRef90_UPI0011D2A153";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	9626665	9626665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t027549A-01;Tag=IsoSeq:G592.1;Source=Nipponbare.panicle_G477.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CXK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	9626083	9626497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t027549A-01;Tag=IsoSeq:G592.1;Source=Nipponbare.panicle_G477.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CXK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9626942	9630057	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0275500-00;Parent=gene:OsNip_01g0275500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9626942	9627178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9627179	9627410	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0275500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;protein_id=OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9627733	9627941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;Name=OsNip_01t0275500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0275500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9627733	9627941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0275500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;protein_id=OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9628065	9628232	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0275500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;protein_id=OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9628065	9630057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;Name=OsNip_01t0275500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0275500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9628233	9630057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0275500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9631334	9638881	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0275600;Name=OsNip_AGO4a;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9631334	9633056	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0275600-02;Parent=gene:OsNip_01g0275600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0275600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9631334	9631529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0275600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	9655417	9655980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t027599A-02;Tag=IsoSeq:G595.2;Source=Nipponbare.leaf_G274.2,Nipponbare.panicle_G480.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9658174	9661275	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0276000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9658174	9661275	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0276000-01;Parent=gene:OsNip_01g0276000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0276000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9659330	9659922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276066-00;Name=OsNip_01t0276066-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0276066-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	9660815	9660816	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t027609A-01;Tag=IsoSeq:G597.1;Source=Nipponbare.root_G353.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9665820	9665851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9668981	9669090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;Name=OsNip_01t0276100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	9669169	9669241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;Name=OsNip_01t0276100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0276100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9669169	9669241	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0276100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;protein_id=OsNip_01t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9669627	9669818	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0276100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;protein_id=OsNip_01t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9669627	9670111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;Name=OsNip_01t0276100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9669819	9670111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	9669947	9670122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-02;Name=OsNip_01t0276100-02;exon_id=OsNip_01t0276100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G598.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G354.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	9669947	9670033	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0276100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0276100-02;protein_id=OsNip_01t0276100-02;Tag=IsoSeq:G598.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G354.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	9670037	9670122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276100-02;Tag=IsoSeq:G598.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G354.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9671077	9676036	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0276200;Name=OSVDAC7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9671077	9676036	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0276200-00;Parent=gene:OsNip_01g0276200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9671077	9671132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9671077	9671189	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Name=OsNip_01t0276200-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276200-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9671133	9671189	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0276200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;protein_id=OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9671593	9671688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Name=OsNip_01t0276200-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276200-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9671593	9671688	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0276200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;protein_id=OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9671910	9671993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Name=OsNip_01t0276200-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276200-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9671910	9671993	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0276200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;protein_id=OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9672074	9672142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Name=OsNip_01t0276200-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276200-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9672074	9672142	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0276200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;protein_id=OsNip_01t0276200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9672916	9673017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276200-00;Name=OsNip_01t0276200-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0276200-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9691036	9691721	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0276650-00;Parent=gene:OsNip_01g0276650;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0276650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9691036	9691333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276650-00;Name=OsNip_01t0276650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0276650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9691416	9691721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0276650-00;Name=OsNip_01t0276650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0276650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9694027	9699817	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0276700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9770018	9771047	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0278000-00;Parent=gene:OsNip_01g0278000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0278000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9770018	9770291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9770388	9770999	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0278000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0278000-00;protein_id=OsNip_01t0278000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9770388	9771047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278000-00;Name=OsNip_01t0278000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9771000	9771047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9787093	9787094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9787095	9787342	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0278050-00;Parent=transcript:OsNip_01t0278050-00;protein_id=OsNip_01t0278050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9787450	9787690	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0278050-00;Parent=transcript:OsNip_01t0278050-00;protein_id=OsNip_01t0278050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9787450	9787848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278050-00;Name=OsNip_01t0278050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0278050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9787691	9787848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9788633	9789771	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0278100-01;Parent=gene:OsNip_01g0278100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0278100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9788633	9788887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9788633	9789771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278100-01;Name=OsNip_01t0278100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9788888	9789085	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0278100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278100-01;protein_id=OsNip_01t0278100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9789086	9789771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9793959	9796177	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0278200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9793959	9796133	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0278200-01;Parent=gene:OsNip_01g0278200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9793959	9794232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Name=OsNip_01t0278200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9793959	9794232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9794312	9794418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Name=OsNip_01t0278200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9794312	9794418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9794847	9794877	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9794847	9796133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Name=OsNip_01t0278200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9794878	9795045	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0278200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;protein_id=OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9795046	9796133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	9795133	9796177	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0278200-02;Parent=gene:OsNip_01g0278200;transcript_id=OsNip_01t0278200-02;Tag=IsoSeq:G609.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G363.1
Chr01	TAMA	exon	9795133	9796177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-02;Name=OsNip_01t0278200-02;exon_id=OsNip_01t0278200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G609.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	9795342	9795989	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0278200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0278200-02;protein_id=OsNip_01t0278200-02;Tag=IsoSeq:G609.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	9795990	9796177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-02;Tag=IsoSeq:G609.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	9795133	9795339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278200-02;Tag=IsoSeq:G609.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9809349	9809555	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0278466;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9809349	9809555	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0278466-00;Parent=gene:OsNip_01g0278466;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0278466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9809349	9809555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278466-00;Name=OsNip_01t0278466-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278466-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	9816821	9822750	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0278600;Name=OsNip_Degp1;biotype=protein_coding;description=PDZ/DHR/GLGF;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	9816821	9822750	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0278600-01;Parent=gene:OsNip_01g0278600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9816821	9816941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9816821	9817242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;Name=OsNip_01t0278600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0278600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9816942	9817242	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0278600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;protein_id=OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9817796	9817936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;Name=OsNip_01t0278600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0278600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9817796	9817936	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0278600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;protein_id=OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	9818012	9818130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;Name=OsNip_01t0278600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0278600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9818012	9818130	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0278600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;protein_id=OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	9818946	9819215	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0278600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0278600-01;protein_id=OsNip_01t0278600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10100899	10101164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0282866-00;Name=OsNip_01t0282866-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0282866-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10101036	10101164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0282866-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10101878	10102286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0282866-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10113431	10119022	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0283000-01;Parent=gene:OsNip_01g0283000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0283000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10113431	10114580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0283000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10168806	10168926	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0284500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0284500-01;protein_id=OsNip_01t0284500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10168806	10168997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-01;Name=OsNip_01t0284500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0284500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10168927	10168997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	10167945	10168918	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0284500-02;Parent=gene:OsNip_01g0284500;transcript_id=OsNip_01t0284500-02;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1
Chr01	TAMA	exon	10168854	10168918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;Name=OsNip_01t0284500-02;exon_id=OsNip_01t0284500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	10168854	10168916	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0284500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;protein_id=OsNip_01t0284500-02;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	10167945	10168600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;Name=OsNip_01t0284500-02;exon_id=OsNip_01t0284500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	10168574	10168600	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0284500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;protein_id=OsNip_01t0284500-02;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	10168917	10168918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	10167945	10168571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284500-02;Tag=IsoSeq:G630.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G377.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9UF75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	10193639	10196696	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0284700;Name=OsNip_CYP20-3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10193658	10196611	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0284700-01;Parent=gene:OsNip_01g0284700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0284700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10193658	10193716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10193658	10193900	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284700-01;Name=OsNip_01t0284700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0284700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10193717	10193900	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0284700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0284700-01;protein_id=OsNip_01t0284700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10194007	10194153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0284700-01;Name=OsNip_01t0284700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0284700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10194007	10194153	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0284700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0284700-01;protein_id=OsNip_01t0284700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10291818	10292251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0286550-00;Name=OsNip_01t0286550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0286550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10292244	10292251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0286550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10291889	10295449	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0286600-01;Parent=gene:OsNip_01g0286600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	10478045	10479019	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289600-01;Tag=IsoSeq:G635.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G381.1;prot_id "UniRef90_K3XHW3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	10477926	10478798	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0289732;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10477926	10478798	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0289732-01;Parent=gene:OsNip_01g0289732;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0289732-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10477926	10478017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289732-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10477926	10478798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289732-01;Name=OsNip_01t0289732-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0289732-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10478018	10478620	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0289732-01;Parent=transcript:OsNip_01t0289732-01;protein_id=OsNip_01t0289732-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10478621	10478798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289732-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	10487870	10488107	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0289750;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10487870	10488107	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0289750-00;Parent=gene:OsNip_01g0289750;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0289750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10487870	10488107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289750-00;Name=OsNip_01t0289750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0289750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	10488741	10490994	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0289900;biotype=protein_coding;description=Transferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	10488943	10490994	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0289900-00;Parent=gene:OsNip_01g0289900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0289900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10488943	10488947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10488943	10489584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289900-00;Name=OsNip_01t0289900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0289900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10488948	10489584	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0289900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0289900-00;protein_id=OsNip_01t0289900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10490243	10490994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0289900-00;Name=OsNip_01t0289900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0289900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10490243	10490994	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0289900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0289900-00;protein_id=OsNip_01t0289900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	10488741	10490985	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0289900-01;Parent=gene:OsNip_01g0289900;transcript_id=OsNip_01t0289900-01;Tag=IsoSeq:G636.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G382.1
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10625275	10625360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0292250-00;Name=OsNip_01t0292250-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0292250-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10626522	10626765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0292250-00;Name=OsNip_01t0292250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0292250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10643287	10643487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;Name=OsNip_01t0292700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0292700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10643287	10643487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0292700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;protein_id=OsNip_01t0292700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10643564	10643674	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;Name=OsNip_01t0292700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0292700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10643564	10643674	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0292700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;protein_id=OsNip_01t0292700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10643817	10644047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;Name=OsNip_01t0292700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0292700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10643817	10644047	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0292700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0292700-01;protein_id=OsNip_01t0292700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10806411	10806646	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0295700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;protein_id=OsNip_01t0295700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10806732	10806902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;Name=OsNip_01t0295700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0295700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10806732	10806902	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0295700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;protein_id=OsNip_01t0295700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10807633	10807791	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0295700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;protein_id=OsNip_01t0295700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10807633	10808077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;Name=OsNip_01t0295700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0295700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10807792	10808077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0295700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	10805549	10808038	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0295700-02;Parent=gene:OsNip_01g0295700;transcript_id=OsNip_01t0295700-02;Tag=IsoSeq:G645.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G391.3
Chr01	TAMA	exon	10805549	10808038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0295700-02;Name=OsNip_01t0295700-02;exon_id=OsNip_01t0295700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G645.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G391.3;prot_id "UniRef90_A0A1U8Q812";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	10807643	10808038	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0295700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0295700-02;protein_id=OsNip_01t0295700-02;Tag=IsoSeq:G645.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G391.3;prot_id "UniRef90_A0A1U8Q812";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10826254	10826356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0296100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10826442	10827151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0296100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	10824769	10826165	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0296133;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	10824769	10825067	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0296133-00;Name=OsNip_01t0296133-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0296133-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10825174	10825259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0296133-00;Name=OsNip_01t0296133-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0296133-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10891886	10892529	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0297200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0297200-01;protein_id=OsNip_01t0297200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	10892604	10893543	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0297200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0297200-01;protein_id=OsNip_01t0297200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	10892604	10893684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0297200-01;Name=OsNip_01t0297200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0297200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10893544	10893684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0297200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	gene	10896502	10897632	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g029769A;Tag=IsoSeq:G650
Chr01	TAMA	mRNA	10896502	10897632	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t029769A-01;Parent=gene:OsNip_01g029769A;transcript_id=OsNip_01t029769A-01;Tag=IsoSeq:G650.1;Source=Nipponbare.root_G395.1
Chr01	TAMA	exon	10896502	10897632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t029769A-01;Name=OsNip_01t029769A-01-E1;exon_id=OsNip_01t029769A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G650.1;Source=Nipponbare.root_G395.1;prot_id "UniRef90_Q5QMR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	10896850	10897632	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t029769A-01;Parent=transcript:OsNip_01t029769A-01;protein_id=OsNip_01t029769A-01;Tag=IsoSeq:G650.1;Source=Nipponbare.root_G395.1;prot_id "UniRef90_Q5QMR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	10896502	10896847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t029769A-01;Tag=IsoSeq:G650.1;Source=Nipponbare.root_G395.1;prot_id "UniRef90_Q5QMR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11070897	11070931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11071316	11071375	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0301100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0301100-01;protein_id=OsNip_01t0301100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11071316	11071960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301100-01;Name=OsNip_01t0301100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0301100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11071376	11071960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11075123	11077640	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0301300-01;Parent=gene:OsNip_01g0301300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0301300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11075123	11075195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11075196	11075372	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0301300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0301300-01;protein_id=OsNip_01t0301300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11076498	11076737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0301300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0301300-01;protein_id=OsNip_01t0301300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11076498	11077640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301300-01;Name=OsNip_01t0301300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0301300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11076738	11077640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	11078206	11083482	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0301500;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11078206	11083482	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0301500-01;Parent=gene:OsNip_01g0301500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0301500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11078206	11078416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11078206	11079568	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0301500-01;Name=OsNip_01t0301500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0301500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11078417	11079568	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0301500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0301500-01;protein_id=OsNip_01t0301500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11083159	11083461	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0301500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0301500-01;protein_id=OsNip_01t0301500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11220093	11220586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0303200-01;Name=OsNip_01t0303200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0303200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11221053	11221413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0303200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11221847	11223469	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0303300-01;Parent=gene:OsNip_01g0303300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0303300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11246486	11246737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0303800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11245276	11245456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0303800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11283941	11284127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11299784	11307932	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0304500-00;Parent=gene:OsNip_01g0304500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11299784	11299815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11299784	11299924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304500-00;Name=OsNip_01t0304500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0304500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11307154	11307187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304500-00;Name=OsNip_01t0304500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0304500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11307757	11307932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304500-00;Name=OsNip_01t0304500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0304500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11307815	11307932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11316720	11320061	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0305200-01;Parent=gene:OsNip_01g0305200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11316720	11316883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11316720	11316931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11318850	11318906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11318850	11318906	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0305200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;protein_id=OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11319040	11319087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11319040	11319087	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0305200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;protein_id=OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11319217	11319273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11319217	11319273	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0305200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;protein_id=OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11319711	11319773	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0305200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;protein_id=OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11319711	11319814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11319774	11319814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11319928	11320061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Name=OsNip_01t0305200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0305200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11319928	11320061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	11316723	11320061	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0305200-02;Parent=gene:OsNip_01g0305200;transcript_id=OsNip_01t0305200-02;Tag=IsoSeq:G672.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G410.3
Chr01	TAMA	exon	11316723	11318906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-02;Name=OsNip_01t0305200-02;exon_id=OsNip_01t0305200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G672.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G410.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	exon	11319040	11320061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-02;Name=OsNip_01t0305200-02;exon_id=OsNip_01t0305200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G672.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G410.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	11319040	11320061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305200-02;Tag=IsoSeq:G672.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G410.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11317192	11317678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305300-01;Name=OsNip_01t0305300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0305300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11350507	11350609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0305900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11355933	11356623	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0305900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0305900-01;protein_id=OsNip_01t0305900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11364355	11364533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11364534	11364963	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0306100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306100-01;protein_id=OsNip_01t0306100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11365034	11365335	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0306100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306100-01;protein_id=OsNip_01t0306100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11365034	11365344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306100-01;Name=OsNip_01t0306100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0306100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11365336	11365344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	11366633	11367460	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0306200;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11366633	11367015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11366633	11367460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306200-01;Name=OsNip_01t0306200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0306200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11367016	11367264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0306200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306200-01;protein_id=OsNip_01t0306200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11367265	11367460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11378620	11380071	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0306400-01;Parent=gene:OsNip_01g0306400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11378620	11378936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11378620	11380071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306400-01;Name=OsNip_01t0306400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0306400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11378937	11379725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0306400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306400-01;protein_id=OsNip_01t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11379726	11380071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	11409697	11410418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-01;Name=OsNip_01t030679A-01-E1;exon_id=OsNip_01t030679A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G674.1;Source=Nipponbare.root_G411.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	11409960	11410088	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t030679A-01;Parent=transcript:OsNip_01t030679A-01;protein_id=OsNip_01t030679A-01;Tag=IsoSeq:G674.1;Source=Nipponbare.root_G411.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	11409697	11409959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-01;Tag=IsoSeq:G674.1;Source=Nipponbare.root_G411.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	11410092	11410418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-01;Tag=IsoSeq:G674.1;Source=Nipponbare.root_G411.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	exon	11409697	11410451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-02;Name=OsNip_01t030679A-02-E1;exon_id=OsNip_01t030679A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G674.2;Source=Nipponbare.root_G411.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	11409960	11410088	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t030679A-02;Parent=transcript:OsNip_01t030679A-02;protein_id=OsNip_01t030679A-02;Tag=IsoSeq:G674.2;Source=Nipponbare.root_G411.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	11409697	11409959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-02;Tag=IsoSeq:G674.2;Source=Nipponbare.root_G411.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	11410092	11410451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t030679A-02;Tag=IsoSeq:G674.2;Source=Nipponbare.root_G411.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9V055";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11412154	11421047	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0306800-01;Parent=gene:OsNip_01g0306800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11412154	11412268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11412154	11412411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11412269	11412411	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11412832	11412938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11412832	11412938	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11416436	11416710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11416938	11417103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11416938	11417103	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11417605	11417846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11417605	11417846	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11419498	11419685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11419498	11419685	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11420497	11420713	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0306800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;protein_id=OsNip_01t0306800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11420497	11421047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0306800-01;Name=OsNip_01t0306800-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0306800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11494771	11496222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307562-00;Name=OsNip_01t0307562-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0307562-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11494771	11496222	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0307562-00;Parent=transcript:OsNip_01t0307562-00;protein_id=OsNip_01t0307562-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	11502003	11504425	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0307624;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11502003	11503278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307624-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11502003	11504425	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307624-01;Name=OsNip_01t0307624-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0307624-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11503279	11503434	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0307624-01;Parent=transcript:OsNip_01t0307624-01;protein_id=OsNip_01t0307624-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11503435	11504425	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307624-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	11504902	11506234	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0307686;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11505079	11506118	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0307686-00;Parent=gene:OsNip_01g0307686;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0307686-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11505079	11505129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11505079	11505822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;Name=OsNip_01t0307686-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0307686-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11505130	11505822	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0307686-00;Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;protein_id=OsNip_01t0307686-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11505930	11506103	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0307686-00;Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;protein_id=OsNip_01t0307686-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11505930	11506118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;Name=OsNip_01t0307686-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0307686-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11506104	11506118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0307686-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	11504902	11506234	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0307686-01;Parent=gene:OsNip_01g0307686;transcript_id=OsNip_01t0307686-01;Tag=IsoSeq:G678.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G414.5
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11680202	11680449	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0310800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0310800-01;protein_id=OsNip_01t0310800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	11698118	11698190	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0311500-02;Name=OsNip_01t0311500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0311500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11698984	11699141	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0311500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0311500-02;protein_id=OsNip_01t0311500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11699245	11699614	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0311500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0311500-02;protein_id=OsNip_01t0311500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11699245	11699832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0311500-02;Name=OsNip_01t0311500-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0311500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11699615	11699832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0311500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	11703247	11704653	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0311600;biotype=protein_coding;description=Sulfotransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	11703247	11704653	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0311600-01;Parent=gene:OsNip_01g0311600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0311600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11703247	11703540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0311600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	11703247	11704653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0311600-01;Name=OsNip_01t0311600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0311600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	11703541	11704581	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0311600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0311600-01;protein_id=OsNip_01t0311600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11804161	11804400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0314100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12352736	12353063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12363841	12364285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12363841	12365483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;Name=OsNip_01t0323600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0323600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12364286	12365470	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0323600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;protein_id=OsNip_01t0323600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12365471	12365483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12366195	12366314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;Name=OsNip_01t0323600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0323600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12366195	12366314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	12363884	12366310	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0323600-02;Parent=gene:OsNip_01g0323600;transcript_id=OsNip_01t0323600-02;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2
Chr01	TAMA	exon	12366158	12366310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;Name=OsNip_01t0323600-02;exon_id=OsNip_01t0323600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	12363884	12365483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;Name=OsNip_01t0323600-02;exon_id=OsNip_01t0323600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	12364102	12364305	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0323600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;protein_id=OsNip_01t0323600-02;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	12366158	12366310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	12364306	12365483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	12363884	12364099	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323600-02;Tag=IsoSeq:G706.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G427.5,Nipponbare.panicle_G566.3,Nipponbare.leaf_G323.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6FHX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	12363862	12365491	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0323775;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	12363862	12365491	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0323775-00;Parent=gene:OsNip_01g0323775;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0323775-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12363862	12364225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323775-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12363862	12365491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0323775-00;Name=OsNip_01t0323775-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0323775-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12364226	12365491	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0323775-00;Parent=transcript:OsNip_01t0323775-00;protein_id=OsNip_01t0323775-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	12371544	12376437	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0323950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	12371544	12376437	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0323950-00;Parent=gene:OsNip_01g0323950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0323950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12371544	12371963	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0323950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0323950-00;protein_id=OsNip_01t0323950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12551682	12557268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	12556073	12556476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327000-02;Tag=IsoSeq:G710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G429.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7DMW1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	12556591	12557275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327000-02;Tag=IsoSeq:G710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G429.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7DMW1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12564283	12564355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12569678	12570030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12568431	12568431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12568432	12568833	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0327100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0327100-02;protein_id=OsNip_01t0327100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12569255	12569677	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0327100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0327100-02;protein_id=OsNip_01t0327100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12569255	12569866	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327100-02;Name=OsNip_01t0327100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0327100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12569678	12569866	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	12564382	12569579	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0327250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	12564382	12569579	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0327250-00;Parent=gene:OsNip_01g0327250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0327250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12564382	12564579	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327250-00;Name=OsNip_01t0327250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0327250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12564382	12564579	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12568419	12568431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0327250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12745078	12745509	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	12745559	12747074	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0330200;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	12745559	12747074	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0330200-00;Parent=gene:OsNip_01g0330200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0330200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12746457	12746919	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0330200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0330200-00;protein_id=OsNip_01t0330200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12746457	12747074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330200-00;Name=OsNip_01t0330200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0330200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12746920	12747074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	12752570	12753322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t033064A-02;Tag=IsoSeq:G720.2;Source=Nipponbare.root_G437.2;prot_id "UniRef90_A0A287KJ90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12762695	12765028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12762695	12765301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330650-01;Name=OsNip_01t0330650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0330650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12765029	12765295	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0330650-01;Parent=transcript:OsNip_01t0330650-01;protein_id=OsNip_01t0330650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12765296	12765301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0330650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	12804579	12810251	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0331100;Name=OsNip_GELP16;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	12804579	12810204	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0331100-01;Parent=gene:OsNip_01g0331100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0331100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12804579	12804730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0331100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12804731	12805028	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0331100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0331100-01;protein_id=OsNip_01t0331100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12808482	12808834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0331100-01;Name=OsNip_01t0331100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0331100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	12808482	12808834	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0331100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0331100-01;protein_id=OsNip_01t0331100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	12809324	12809594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0331100-01;Name=OsNip_01t0331100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0331100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13170797	13171230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0336300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13170797	13171578	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0336300-00;Name=OsNip_01t0336300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0336300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13171231	13171578	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0336300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0336300-00;protein_id=OsNip_01t0336300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13171584	13171928	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0336300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0336300-00;protein_id=OsNip_01t0336300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13294785	13294921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0338150-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13374082	13374471	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0340400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13396264	13397109	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0340600-00;Name=OsNip_01t0340600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0340600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13396264	13397109	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0340600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0340600-00;protein_id=OsNip_01t0340600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13422910	13424625	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0341000-00;Parent=gene:OsNip_01g0341000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0341000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13422910	13423147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341000-00;Name=OsNip_01t0341000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0341000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13422910	13423147	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0341000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0341000-00;protein_id=OsNip_01t0341000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13423529	13424625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341000-00;Name=OsNip_01t0341000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0341000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13423529	13424625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0341000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0341000-00;protein_id=OsNip_01t0341000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	13422745	13424756	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0341000-01;Parent=gene:OsNip_01g0341000;transcript_id=OsNip_01t0341000-01;Tag=IsoSeq:G734.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G446.1,Nipponbare.panicle_G586.1
Chr01	TAMA	exon	13422745	13424756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341000-01;Name=OsNip_01t0341000-01;exon_id=OsNip_01t0341000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G734.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G446.1,Nipponbare.panicle_G586.1;prot_id "UniRef90_A0A287SR44";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	13423257	13424288	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0341000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0341000-01;protein_id=OsNip_01t0341000-01;Tag=IsoSeq:G734.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G446.1,Nipponbare.panicle_G586.1;prot_id "UniRef90_A0A287SR44";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	13424289	13424756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341000-01;Tag=IsoSeq:G734.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G446.1,Nipponbare.panicle_G586.1;prot_id "UniRef90_A0A287SR44";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13422745	13423254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341000-01;Tag=IsoSeq:G734.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G446.1,Nipponbare.panicle_G586.1;prot_id "UniRef90_A0A287SR44";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13437009	13438567	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0341200;biotype=protein_coding;description=Tubulin%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13437009	13438567	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0341200-01;Parent=gene:OsNip_01g0341200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0341200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13437009	13437064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13437009	13438567	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341200-01;Name=OsNip_01t0341200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0341200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13437065	13438483	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0341200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0341200-01;protein_id=OsNip_01t0341200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13438484	13438567	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0341200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13442503	13443528	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0341300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13565906	13566342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0343200-01;Name=OsNip_01t0343200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0343200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13566433	13566461	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0343200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0343200-02;protein_id=OsNip_01t0343200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13570702	13570825	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13570826	13570846	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0343300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;protein_id=OsNip_01t0343300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13570977	13571075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;Name=OsNip_01t0343300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0343300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13570977	13571075	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0343300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;protein_id=OsNip_01t0343300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13572381	13572656	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0343300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;protein_id=OsNip_01t0343300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13572381	13573119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;Name=OsNip_01t0343300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0343300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13572657	13573119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0343300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13572351	13572654	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0343350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13572351	13572654	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0343350-00;Parent=gene:OsNip_01g0343350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0343350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13572351	13572652	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0343350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0343350-00;protein_id=OsNip_01t0343350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13798928	13799906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347000-01;Name=OsNip_01t0347000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0347000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13809346	13809459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347200-02;Tag=IsoSeq:G746.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G592.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13815928	13817056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347300-01;Name=OsNip_01t0347300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0347300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	13837950	13839351	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0347500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13838790	13839085	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0347500-00;Parent=gene:OsNip_01g0347500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0347500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13838790	13839083	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0347500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0347500-00;protein_id=OsNip_01t0347500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13838790	13839085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-00;Name=OsNip_01t0347500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0347500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13839084	13839085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	13837950	13839351	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0347500-01;Parent=gene:OsNip_01g0347500;transcript_id=OsNip_01t0347500-01;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3
Chr01	TAMA	exon	13838786	13839351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;Name=OsNip_01t0347500-01;exon_id=OsNip_01t0347500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	13839294	13839350	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0347500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;protein_id=OsNip_01t0347500-01;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	13837950	13838693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;Name=OsNip_01t0347500-01;exon_id=OsNip_01t0347500-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	13839351	13839351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13838786	13839291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13837950	13838693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347500-01;Tag=IsoSeq:G747.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G454.3;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13842272	13843744	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0347600;biotype=protein_coding;description=Ervatamin;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13842272	13843744	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0347600-01;Parent=gene:OsNip_01g0347600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0347600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13842272	13842389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13842272	13842828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347600-01;Name=OsNip_01t0347600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0347600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13842390	13842828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0347600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0347600-01;protein_id=OsNip_01t0347600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13842915	13843507	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0347600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0347600-01;protein_id=OsNip_01t0347600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13842915	13843744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0347600-01;Name=OsNip_01t0347600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0347600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	13848670	13849223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t034799A-01;Name=OsNip_01t034799A-01-E1;exon_id=OsNip_01t034799A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G749.1;Source=Nipponbare.root_G456.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5F4F2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	13849223	13849223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t034799A-01;Tag=IsoSeq:G749.1;Source=Nipponbare.root_G456.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5F4F2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13848670	13849130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t034799A-01;Tag=IsoSeq:G749.1;Source=Nipponbare.root_G456.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5F4F2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13847798	13848584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t034799A-01;Tag=IsoSeq:G749.1;Source=Nipponbare.root_G456.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5F4F2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13859190	13860614	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0348000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13859456	13859751	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0348000-00;Parent=gene:OsNip_01g0348000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0348000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13859456	13859457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13859456	13859751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-00;Name=OsNip_01t0348000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0348000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13859458	13859751	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0348000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0348000-00;protein_id=OsNip_01t0348000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	13859190	13860614	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0348000-01;Parent=gene:OsNip_01g0348000;transcript_id=OsNip_01t0348000-01;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1
Chr01	TAMA	exon	13859190	13859755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;Name=OsNip_01t0348000-01;exon_id=OsNip_01t0348000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	13859191	13859247	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0348000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;protein_id=OsNip_01t0348000-01;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	13859848	13860614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;Name=OsNip_01t0348000-01;exon_id=OsNip_01t0348000-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	13859190	13859190	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13859251	13859755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	13859848	13860614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348000-01;Tag=IsoSeq:G750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G457.1;prot_id "UniRef90_B8A7J6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	13887272	13893184	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0348600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	13887272	13893148	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0348600-01;Parent=gene:OsNip_01g0348600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13887272	13887484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13887272	13887593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13887485	13887593	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0348600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;protein_id=OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13888527	13888598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13888527	13888598	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0348600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;protein_id=OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13888724	13888789	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13888724	13888789	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0348600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;protein_id=OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13888888	13888944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13889038	13889105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	13889189	13889270	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;Name=OsNip_01t0348600-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0348600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13892232	13892380	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0348600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348600-01;protein_id=OsNip_01t0348600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13903285	13903474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13903475	13903714	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0348900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348900-01;protein_id=OsNip_01t0348900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	13903812	13904009	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0348900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0348900-01;protein_id=OsNip_01t0348900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	13903812	13904012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0348900-01;Name=OsNip_01t0348900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0348900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14059669	14062071	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0351300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0351300-01;protein_id=OsNip_01t0351300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14062072	14062094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14063653	14064199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-01;Name=OsNip_01t0351300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0351300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14063653	14064199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	14061496	14062255	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0351300-02;Parent=gene:OsNip_01g0351300;transcript_id=OsNip_01t0351300-02;Tag=IsoSeq:G759.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G462.1
Chr01	TAMA	exon	14061496	14062255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-02;Name=OsNip_01t0351300-02;exon_id=OsNip_01t0351300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G759.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G462.1;prot_id "UniRef90_F6HZ59";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	14061497	14061679	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0351300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0351300-02;protein_id=OsNip_01t0351300-02;Tag=IsoSeq:G759.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G462.1;prot_id "UniRef90_F6HZ59";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	14061496	14061496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-02;Tag=IsoSeq:G759.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G462.1;prot_id "UniRef90_F6HZ59";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	14061683	14062255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351300-02;Tag=IsoSeq:G759.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G462.1;prot_id "UniRef90_F6HZ59";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14068832	14069563	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0351500;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14068832	14069563	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0351500-00;Parent=gene:OsNip_01g0351500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0351500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14068832	14069033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351500-00;Name=OsNip_01t0351500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0351500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14068832	14069033	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0351500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0351500-00;protein_id=OsNip_01t0351500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14069248	14069504	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0351500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0351500-00;protein_id=OsNip_01t0351500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14069248	14069563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351500-00;Name=OsNip_01t0351500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0351500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14069505	14069563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0351500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14167663	14168485	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0353501-00;Parent=gene:OsNip_01g0353501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0353501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14167663	14167806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14167663	14167815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;Name=OsNip_01t0353501-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0353501-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14167807	14167815	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0353501-00;Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;protein_id=OsNip_01t0353501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14168040	14168483	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0353501-00;Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;protein_id=OsNip_01t0353501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14168040	14168485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;Name=OsNip_01t0353501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0353501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14168484	14168485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0353501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14264078	14264413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14264414	14267047	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0355100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0355100-01;protein_id=OsNip_01t0355100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14267048	14267208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14264762	14267043	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0355175;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14264762	14267043	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0355175-00;Parent=gene:OsNip_01g0355175;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0355175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14264762	14265340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;Name=OsNip_01t0355175-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0355175-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14264762	14265340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14265948	14266059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14265948	14267043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;Name=OsNip_01t0355175-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0355175-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14266060	14266326	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0355175-00;Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;protein_id=OsNip_01t0355175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14266327	14267043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	gene	14279472	14279945	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g035524A;Tag=IsoSeq:G762
Chr01	TAMA	mRNA	14279472	14279945	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t035524A-01;Parent=gene:OsNip_01g035524A;transcript_id=OsNip_01t035524A-01;Tag=IsoSeq:G762.1;Source=Nipponbare.panicle_G602.1
Chr01	TAMA	exon	14279472	14279945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t035524A-01;Name=OsNip_01t035524A-01-E1;exon_id=OsNip_01t035524A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G762.1;Source=Nipponbare.panicle_G602.1;prot_id "UniRef90_C7J6Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	14279629	14279943	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t035524A-01;Parent=transcript:OsNip_01t035524A-01;protein_id=OsNip_01t035524A-01;Tag=IsoSeq:G762.1;Source=Nipponbare.panicle_G602.1;prot_id "UniRef90_C7J6Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	14279944	14279945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t035524A-01;Tag=IsoSeq:G762.1;Source=Nipponbare.panicle_G602.1;prot_id "UniRef90_C7J6Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	14279472	14279626	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t035524A-01;Tag=IsoSeq:G762.1;Source=Nipponbare.panicle_G602.1;prot_id "UniRef90_C7J6Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14280966	14282033	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0355250;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14280966	14282033	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0355250-00;Parent=gene:OsNip_01g0355250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0355250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14280966	14281163	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0355250-00;Name=OsNip_01t0355250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0355250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	14447365	14447365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357100-03;Tag=IsoSeq:G769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G468.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	14453255	14453454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357100-03;Tag=IsoSeq:G769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G468.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14447341	14453462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0357150-00;Parent=gene:OsNip_01g0357150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14447341	14447699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14447341	14447835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;Name=OsNip_01t0357150-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0357150-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14447700	14447835	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0357150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;protein_id=OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14451681	14452035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;Name=OsNip_01t0357150-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0357150-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14451681	14452035	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0357150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;protein_id=OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14452138	14452422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;Name=OsNip_01t0357150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0357150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14452138	14452422	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0357150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;protein_id=OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14452516	14453338	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0357150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;protein_id=OsNip_01t0357150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14452516	14453462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357150-00;Name=OsNip_01t0357150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0357150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14453690	14453751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14453752	14453877	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0357200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0357200-01;protein_id=OsNip_01t0357200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14453987	14454050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357200-01;Name=OsNip_01t0357200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0357200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14453987	14454050	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0357200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0357200-01;protein_id=OsNip_01t0357200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14459951	14459952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14460201	14460337	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0357400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0357400-01;protein_id=OsNip_01t0357400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14460503	14461084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14461150	14461166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14462311	14462787	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0357500-00;Parent=gene:OsNip_01g0357500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0357500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14462311	14462610	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0357500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0357500-00;protein_id=OsNip_01t0357500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14462311	14462787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357500-00;Name=OsNip_01t0357500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0357500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14462611	14462787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14471243	14476738	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0357800-01;Parent=gene:OsNip_01g0357800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0357800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14471243	14471348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357800-01;Name=OsNip_01t0357800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0357800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14471243	14471348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0357800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	14826336	14826485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364100-00;Name=OsNip_01t0364100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0364100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	14827084	14828267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364100-00;Name=OsNip_01t0364100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0364100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	gene	14828520	14829189	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g036439A;Tag=IsoSeq:G785
Chr01	TAMA	mRNA	14828520	14829189	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t036439A-01;Parent=gene:OsNip_01g036439A;transcript_id=OsNip_01t036439A-01;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1
Chr01	TAMA	exon	14828838	14829189	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t036439A-01;Name=OsNip_01t036439A-01-E1;exon_id=OsNip_01t036439A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	exon	14828520	14828736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t036439A-01;Name=OsNip_01t036439A-01-E2;exon_id=OsNip_01t036439A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	14829188	14829189	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t036439A-01;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	14828838	14828921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t036439A-01;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	14828520	14828736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t036439A-01;Tag=IsoSeq:G785.1;Source=Nipponbare.root_G474.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14856256	14878542	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0364400;Name=OsNip_RLCK35;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14856256	14878542	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0364400-00;Parent=gene:OsNip_01g0364400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0364400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14856256	14857496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;Name=OsNip_01t0364400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0364400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14856256	14857496	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0364400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;protein_id=OsNip_01t0364400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14857581	14857730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;Name=OsNip_01t0364400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0364400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14857581	14857730	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0364400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;protein_id=OsNip_01t0364400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14857814	14858320	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;Name=OsNip_01t0364400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0364400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14857814	14858320	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0364400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;protein_id=OsNip_01t0364400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14877588	14878542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;Name=OsNip_01t0364400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0364400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14877588	14878542	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0364400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364400-00;protein_id=OsNip_01t0364400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14856428	14858011	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0364412;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14856428	14858011	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0364412-00;Parent=gene:OsNip_01g0364412;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0364412-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14856428	14856921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364412-00;Name=OsNip_01t0364412-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364412-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14857761	14858011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364412-00;Name=OsNip_01t0364412-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364412-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14879651	14880271	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0364450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14879651	14880271	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0364450-00;Parent=gene:OsNip_01g0364450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0364450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14879651	14880029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14879651	14880271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364450-00;Name=OsNip_01t0364450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14880030	14880269	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0364450-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364450-00;protein_id=OsNip_01t0364450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14880270	14880271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14892931	14898978	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0364800;Name=OsNip_WAK7/8;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14892931	14898978	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0364800-00;Parent=gene:OsNip_01g0364800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0364800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14892931	14893845	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364800-00;Name=OsNip_01t0364800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14892931	14893845	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14897706	14897721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14897706	14898978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364800-00;Name=OsNip_01t0364800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14897722	14898978	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0364800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0364800-00;protein_id=OsNip_01t0364800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14900942	14902670	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0364900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14900942	14902670	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0364900-01;Parent=gene:OsNip_01g0364900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0364900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14900942	14901119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14900942	14901349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;Name=OsNip_01t0364900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0364900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14901120	14901349	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0364900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;protein_id=OsNip_01t0364900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14902434	14902437	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0364900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;protein_id=OsNip_01t0364900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14902434	14902670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;Name=OsNip_01t0364900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0364900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14902438	14902670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0364900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14903885	14915751	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0365000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14903885	14915751	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0365000-00;Parent=gene:OsNip_01g0365000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0365000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14903885	14905125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;Name=OsNip_01t0365000-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0365000-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14903885	14905125	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0365000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;protein_id=OsNip_01t0365000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14908983	14909144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;Name=OsNip_01t0365000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0365000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14908983	14909144	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0365000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;protein_id=OsNip_01t0365000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14909288	14909736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;Name=OsNip_01t0365000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0365000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14909288	14909736	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0365000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;protein_id=OsNip_01t0365000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	14914820	14915751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;Name=OsNip_01t0365000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0365000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14914820	14915751	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0365000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0365000-00;protein_id=OsNip_01t0365000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	14924924	14927978	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0365300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	14924924	14927978	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0365300-01;Parent=gene:OsNip_01g0365300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0365300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14924924	14924955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	14926301	14926477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0365300-01;Name=OsNip_01t0365300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0365300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14926301	14926477	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0365300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0365300-01;protein_id=OsNip_01t0365300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14964599	14964917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0366400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	14964918	14965268	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0366400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0366400-00;protein_id=OsNip_01t0366400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14965269	14965363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0366400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15332445	15332889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372100-01;Name=OsNip_01t0372100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0372100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15338118	15338469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15339849	15340013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15340237	15341480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372350-01;Name=OsNip_01t0372350-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0372350-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15344380	15344465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15344466	15344615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0372400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;protein_id=OsNip_01t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15344728	15344776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;Name=OsNip_01t0372400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0372400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15344728	15344776	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0372400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;protein_id=OsNip_01t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15344874	15345340	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0372400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;protein_id=OsNip_01t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15344874	15345409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;Name=OsNip_01t0372400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0372400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15345341	15345409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	15344449	15345323	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0372450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15455781	15456276	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0374900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0374900-01;protein_id=OsNip_01t0374900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15457192	15457657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0374900-01;Name=OsNip_01t0374900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0374900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15457342	15457657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0374900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	15462065	15465895	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0375000-01;Parent=gene:OsNip_01g0375000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0375000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15462065	15462441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0375000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15462065	15462768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0375000-01;Name=OsNip_01t0375000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0375000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15462442	15462768	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0375000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0375000-01;protein_id=OsNip_01t0375000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15462926	15463137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0375000-01;Name=OsNip_01t0375000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0375000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15462926	15463137	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0375000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0375000-01;protein_id=OsNip_01t0375000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	15542003	15542526	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0376200;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15542003	15542526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0376200-01;Name=OsNip_01t0376200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0376200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	15562767	15563289	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0376600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	15562767	15563289	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0376600-00;Parent=gene:OsNip_01g0376600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0376600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15562767	15562790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0376600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15562767	15563289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0376600-00;Name=OsNip_01t0376600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0376600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15562791	15563147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0376600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0376600-00;protein_id=OsNip_01t0376600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15563148	15563289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0376600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	15568888	15573355	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0376700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	15568888	15573347	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0376700-01;Parent=gene:OsNip_01g0376700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0376700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15568888	15569106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0376700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15779837	15780024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0379400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15778688	15779575	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0379400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0379400-02;protein_id=OsNip_01t0379400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	15777387	15780996	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0379400-03;Parent=gene:OsNip_01g0379400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0379400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15777387	15777530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0379400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15777387	15777671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0379400-03;Name=OsNip_01t0379400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0379400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15777531	15777671	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0379400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0379400-03;protein_id=OsNip_01t0379400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15778676	15779836	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0379400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0379400-03;protein_id=OsNip_01t0379400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15951926	15953007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0382200-01;Name=OsNip_01t0382200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0382200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	15961648	15962152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0382450-01;Name=OsNip_01t0382450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0382450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15966105	15966212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0382500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	15966105	15967644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0382500-01;Name=OsNip_01t0382500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0382500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	15997945	15998841	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0383001-00;Parent=transcript:OsNip_01t0383001-00;protein_id=OsNip_01t0383001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16000688	16000964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0383100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16002317	16002970	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0383100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0383100-01;protein_id=OsNip_01t0383100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16003058	16003326	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0383100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0383100-01;protein_id=OsNip_01t0383100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16003058	16003329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0383100-01;Name=OsNip_01t0383100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0383100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16003327	16003329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0383100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	16104255	16104347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0384450-01;Name=OsNip_01t0384450-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0384450-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16104327	16104347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0384450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16104422	16104680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0384450-01;Name=OsNip_01t0384450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0384450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16104422	16104680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0384450-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16130956	16131331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0384800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	16135873	16141845	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0384901-01;Parent=gene:OsNip_01g0384901;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0384901-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16387430	16387574	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0388500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0388500-00;protein_id=OsNip_01t0388500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16389372	16389507	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0388500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0388500-00;protein_id=OsNip_01t0388500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16389372	16389527	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0388500-00;Name=OsNip_01t0388500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0388500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16389508	16389527	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0388500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	16364890	16389811	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0388500-01;Parent=gene:OsNip_01g0388500;transcript_id=OsNip_01t0388500-01;Tag=IsoSeq:G823.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G646.2
Chr01	TAMA	exon	16364890	16365127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0388500-01;Name=OsNip_01t0388500-01;exon_id=OsNip_01t0388500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G823.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G646.2;prot_id "UniRef90_A0A1Q3CJS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	16364892	16365127	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0388500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0388500-01;protein_id=OsNip_01t0388500-01;Tag=IsoSeq:G823.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G646.2;prot_id "UniRef90_A0A1Q3CJS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	16366710	16366790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0388500-01;Name=OsNip_01t0388500-01;exon_id=OsNip_01t0388500-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G823.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G646.2;prot_id "UniRef90_A0A1Q3CJS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16495359	16495522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	16498330	16498448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390600-01;Name=OsNip_01t0390600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0390600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16502929	16503329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	16511620	16518660	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0390900;Name=OsNip_DsPTP1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	16511620	16515893	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0390900-02;Parent=gene:OsNip_01g0390900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0390900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16511620	16511818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16511620	16511859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;Name=OsNip_01t0390900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0390900-01-E5;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16511819	16511859	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0390900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;protein_id=OsNip_01t0390900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16512697	16512850	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0390900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;protein_id=OsNip_01t0390900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16512697	16515893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;Name=OsNip_01t0390900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0390900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16512851	16515893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	16511620	16518660	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0390900-01;Parent=gene:OsNip_01g0390900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0390900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16511620	16511818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	16511620	16511859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0390900-01;Name=OsNip_01t0390900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0390900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	16511819	16511859	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0390900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0390900-01;protein_id=OsNip_01t0390900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	17070289	17070795	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0496900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0496900-01;protein_id=OsNip_01t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17070796	17070813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	17067179	17070759	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0496900-02;Parent=gene:OsNip_01g0496900;transcript_id=OsNip_01t0496900-02;Tag=IsoSeq:G833.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G654.2
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	17420867	17421121	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0502700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0502700-00;protein_id=OsNip_01t0502700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	17420867	17421266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-00;Name=OsNip_01t0502700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0502700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17421122	17421266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	17420434	17420755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-01;Name=OsNip_01t0502700-01;exon_id=OsNip_01t0502700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G845.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G664.1,Nipponbare.root_G502.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C54A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	exon	17420867	17421278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-01;Name=OsNip_01t0502700-01;exon_id=OsNip_01t0502700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G845.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G664.1,Nipponbare.root_G502.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C54A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	17420521	17420755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-01;Tag=IsoSeq:G845.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G664.1,Nipponbare.root_G502.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C54A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	17420867	17421278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502700-01;Tag=IsoSeq:G845.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G664.1,Nipponbare.root_G502.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C54A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	17422915	17427640	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0502800-01;Parent=gene:OsNip_01g0502800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0502800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17422915	17423219	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	17422915	17423264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502800-01;Name=OsNip_01t0502800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0502800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	17423220	17423264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0502800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0502800-01;protein_id=OsNip_01t0502800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	17424287	17424398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0502800-01;Name=OsNip_01t0502800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0502800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17586054	17586287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0505700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	17756330	17756575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0508050-00;Name=OsNip_01t0508050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0508050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	17760811	17761039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0508050-00;Name=OsNip_01t0508050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0508050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	17767883	17768453	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0508100;Name=RH3;biotype=protein_coding;description=Ferritin/ribonucleotide;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	17767883	17768453	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0508100-01;Parent=gene:OsNip_01g0508100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0508100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	17767883	17768371	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0508100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0508100-01;protein_id=OsNip_01t0508100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	17767883	17768453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0508100-01;Name=OsNip_01t0508100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0508100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	17905649	17905736	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0510100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0510100-01;protein_id=OsNip_01t0510100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	17975929	17976987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0511000-02;Tag=IsoSeq:G865.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G681.3,Nipponbare.root_G520.2;prot_id "UniRef90_A0A426XCX0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	17993313	17993750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0511100-01;Name=OsNip_01t0511100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0511100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17993509	17993750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0511100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17995641	17995673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0511200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18027023	18027084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0511800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18043256	18043379	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512100-01;Name=OsNip_01t0512100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0512100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18044292	18044403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512100-01;Name=OsNip_01t0512100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0512100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18044475	18044579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512100-01;Name=OsNip_01t0512100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0512100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18049702	18050083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512100-01;Name=OsNip_01t0512100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0512100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18049906	18050083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18051553	18051612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18051553	18054687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512200-01;Name=OsNip_01t0512200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0512200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18051613	18054450	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0512200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0512200-01;protein_id=OsNip_01t0512200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18054451	18054687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18051797	18054679	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0512200-02;Parent=gene:OsNip_01g0512200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0512200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18062860	18062861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18077807	18078185	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0512800-00;Name=OsNip_01t0512800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0512800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18077807	18078185	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0512800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0512800-00;protein_id=OsNip_01t0512800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18087603	18092828	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0513100;Name=OsNip_PP2C03;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18087603	18092828	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0513100-01;Parent=gene:OsNip_01g0513100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0513100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18087603	18087948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18092594	18092826	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0513100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513100-01;protein_id=OsNip_01t0513100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18092594	18092828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513100-01;Name=OsNip_01t0513100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0513100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18092827	18092828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18101569	18111530	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0513200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18101569	18111530	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0513200-01;Parent=gene:OsNip_01g0513200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18101569	18103042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Name=OsNip_01t0513200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0513200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18101569	18103042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18103149	18103243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18105303	18105415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Name=OsNip_01t0513200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0513200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18105303	18105415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18108028	18109321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18110783	18110881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Name=OsNip_01t0513200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0513200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18110783	18110881	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0513200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;protein_id=OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18111013	18111094	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0513200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;protein_id=OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18111013	18111530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Name=OsNip_01t0513200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0513200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18111095	18111530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18124934	18128862	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0513400-01;Parent=gene:OsNip_01g0513400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18124934	18125145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18124934	18125406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Name=OsNip_01t0513400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0513400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18125146	18125406	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;protein_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18125509	18125744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Name=OsNip_01t0513400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0513400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18125509	18125744	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;protein_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18126857	18127056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Name=OsNip_01t0513400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0513400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18127129	18127216	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;protein_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18127307	18127401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Name=OsNip_01t0513400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0513400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18127307	18127401	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;protein_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18128045	18128274	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;protein_id=OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18128045	18128862	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Name=OsNip_01t0513400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0513400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18128275	18128862	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18130245	18132521	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0513500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18130245	18131759	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0513500-01;Parent=gene:OsNip_01g0513500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0513500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18156852	18156942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0513950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18158750	18159025	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18158750	18159188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Name=OsNip_01t0514000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0514000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18159026	18159188	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0514000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;protein_id=OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18159270	18159406	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0514000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;protein_id=OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18159512	18159625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Name=OsNip_01t0514000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0514000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18159512	18159625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0514000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;protein_id=OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18163236	18163316	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0514000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;protein_id=OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18163236	18163373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Name=OsNip_01t0514000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0514000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18163317	18163373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18163467	18163519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Name=OsNip_01t0514000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0514000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18163467	18163519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18163750	18173557	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0514300;biotype=protein_coding;description=Armadillo-type;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18163750	18173557	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0514300-01;Parent=gene:OsNip_01g0514300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0514300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18163750	18163908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18188875	18188913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0514600-01;Name=OsNip_01t0514600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0514600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18286806	18286998	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0516600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0516600-02;protein_id=OsNip_01t0516600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18286806	18287130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0516600-02;Name=OsNip_01t0516600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0516600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18394008	18394126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0518400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18394242	18394495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0518500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18447510	18447630	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0519400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0519400-01;protein_id=OsNip_01t0519400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18447510	18448858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-01;Name=OsNip_01t0519400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0519400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	18446966	18447418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Name=OsNip_01t0519400-02;exon_id=OsNip_01t0519400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	18446966	18447238	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0519400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;protein_id=OsNip_01t0519400-02;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	18447510	18447706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Name=OsNip_01t0519400-02;exon_id=OsNip_01t0519400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	18448539	18448886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Name=OsNip_01t0519400-02;exon_id=OsNip_01t0519400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18447242	18447418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18447510	18447706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18448539	18448886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519400-02;Tag=IsoSeq:G886.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G403.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MXA2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18459992	18463680	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0519700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18460124	18460861	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0519700-00;Parent=gene:OsNip_01g0519700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0519700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18460124	18460861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519700-00;Name=OsNip_01t0519700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0519700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18460124	18460861	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0519700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0519700-00;protein_id=OsNip_01t0519700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	18459992	18463680	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0519700-01;Parent=gene:OsNip_01g0519700;transcript_id=OsNip_01t0519700-01;Tag=IsoSeq:G887.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G529.8
Chr01	TAMA	exon	18463244	18463680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0519700-01;Name=OsNip_01t0519700-01;exon_id=OsNip_01t0519700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G887.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G529.8;prot_id "UniRef90_UPI000989A99C";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	18463244	18463679	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0519700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0519700-01;protein_id=OsNip_01t0519700-01;Tag=IsoSeq:G887.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G529.8;prot_id "UniRef90_UPI000989A99C";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18530898	18530992	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0520500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0520500-01;protein_id=OsNip_01t0520500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18537376	18539551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;Name=OsNip_01t0520600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0520600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18537376	18539551	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0520600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;protein_id=OsNip_01t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18539881	18540249	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0520600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;protein_id=OsNip_01t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18539881	18540574	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;Name=OsNip_01t0520600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0520600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18540250	18540574	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18540678	18540738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;Name=OsNip_01t0520600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0520600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18540678	18540738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	18539613	18540835	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0520600-02;Parent=gene:OsNip_01g0520600;transcript_id=OsNip_01t0520600-02;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1
Chr01	TAMA	exon	18540678	18540835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;Name=OsNip_01t0520600-02;exon_id=OsNip_01t0520600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	18539613	18540591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;Name=OsNip_01t0520600-02;exon_id=OsNip_01t0520600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	18539832	18540083	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0520600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;protein_id=OsNip_01t0520600-02;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	18540678	18540835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	18540084	18540591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18539613	18539829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520600-02;Tag=IsoSeq:G889.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G404.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YXR9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18555703	18556813	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0520800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18555703	18556076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18555703	18556406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;Name=OsNip_01t0520800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0520800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18556077	18556406	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0520800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;protein_id=OsNip_01t0520800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18556545	18556625	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0520800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;protein_id=OsNip_01t0520800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18556545	18556813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;Name=OsNip_01t0520800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0520800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18556626	18556813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0520800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18584847	18587837	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0521200-01;Parent=gene:OsNip_01g0521200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0521200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18584847	18585611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Name=OsNip_01t0521200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18584847	18585611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18585729	18585922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18585729	18586550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Name=OsNip_01t0521200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18585923	18586090	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0521200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;protein_id=OsNip_01t0521200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18586091	18586550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18587307	18587397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521200-01;Name=OsNip_01t0521200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18596303	18596378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-01;Name=OsNip_01t0521400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0521400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18596509	18597589	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0521400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0521400-01;protein_id=OsNip_01t0521400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18596509	18597834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-01;Name=OsNip_01t0521400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0521400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18597590	18597834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	18589978	18597868	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0521400-02;Parent=gene:OsNip_01g0521400;transcript_id=OsNip_01t0521400-02;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1
Chr01	TAMA	exon	18589978	18590155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Name=OsNip_01t0521400-02;exon_id=OsNip_01t0521400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	exon	18591408	18591581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Name=OsNip_01t0521400-02;exon_id=OsNip_01t0521400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	18591408	18591425	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0521400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;protein_id=OsNip_01t0521400-02;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	18592530	18592935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Name=OsNip_01t0521400-02;exon_id=OsNip_01t0521400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	18593092	18593348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Name=OsNip_01t0521400-02;exon_id=OsNip_01t0521400-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18592530	18592935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18593871	18593939	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	18596509	18597868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521400-02;Tag=IsoSeq:G890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G703.1;prot_id "UniRef90_F6GTJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18601026	18601084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18601085	18601534	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0521500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;protein_id=OsNip_01t0521500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18602238	18602572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;Name=OsNip_01t0521500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0521500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18602238	18602572	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0521500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;protein_id=OsNip_01t0521500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18603964	18604038	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0521500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;protein_id=OsNip_01t0521500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18605445	18605533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521500-01;Name=OsNip_01t0521500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0521500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18601082	18601531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Name=OsNip_01t0521550-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0521550-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18601082	18601531	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0521550-00;Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;protein_id=OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18602235	18602298	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0521550-00;Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;protein_id=OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18602235	18602547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Name=OsNip_01t0521550-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521550-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18602299	18602547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18603943	18604037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Name=OsNip_01t0521550-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521550-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18604215	18604316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18605443	18605531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Name=OsNip_01t0521550-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521550-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18607982	18608082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Name=OsNip_01t0521550-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0521550-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18607982	18608082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18609543	18609670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18626121	18626171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18626172	18626489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0522100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0522100-01;protein_id=OsNip_01t0522100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18626490	18627135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18639233	18641762	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0522400-00;Parent=gene:OsNip_01g0522400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0522400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18639233	18640843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;Name=OsNip_01t0522400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0522400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18639233	18640843	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0522400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;protein_id=OsNip_01t0522400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18641153	18641224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;Name=OsNip_01t0522400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0522400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18641153	18641224	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0522400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;protein_id=OsNip_01t0522400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18641339	18641537	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0522400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;protein_id=OsNip_01t0522400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18641581	18641762	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0522400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0522400-00;protein_id=OsNip_01t0522400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18659094	18662684	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0522800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18659094	18662684	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0522800-00;Parent=gene:OsNip_01g0522800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0522800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18659094	18659284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522800-00;Name=OsNip_01t0522800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0522800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18659094	18659284	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0522800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0522800-00;protein_id=OsNip_01t0522800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18661709	18662684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0522800-00;Name=OsNip_01t0522800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0522800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	18663624	18665275	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0522950;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18674124	18674473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523100-00;Name=OsNip_01t0523100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0523100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18674124	18674473	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0523100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523100-00;protein_id=OsNip_01t0523100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18671367	18674451	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0523250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18671367	18672280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18672281	18672553	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0523250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523250-00;protein_id=OsNip_01t0523250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18672554	18673901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18674027	18674451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18687833	18688211	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0523401-00;Parent=gene:OsNip_01g0523401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0523401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18687833	18688198	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0523401-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523401-00;protein_id=OsNip_01t0523401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18687833	18688211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523401-00;Name=OsNip_01t0523401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0523401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18688199	18688211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18703975	18705050	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0523600-00;Parent=gene:OsNip_01g0523600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18703975	18704069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Name=OsNip_01t0523600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0523600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18703975	18704069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18704156	18704416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Name=OsNip_01t0523600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0523600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18704156	18704416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18704513	18704544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18704513	18704612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Name=OsNip_01t0523600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0523600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18704545	18704612	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0523600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;protein_id=OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18704707	18704965	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0523600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;protein_id=OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18704707	18705050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Name=OsNip_01t0523600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0523600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18704966	18705050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18704760	18706173	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0523800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18704760	18706173	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0523800-00;Parent=gene:OsNip_01g0523800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0523800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18704760	18704867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18704760	18705098	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523800-00;Name=OsNip_01t0523800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0523800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18704868	18705098	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0523800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523800-00;protein_id=OsNip_01t0523800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18705388	18706173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0523800-00;Name=OsNip_01t0523800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0523800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18705388	18706173	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0523800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0523800-00;protein_id=OsNip_01t0523800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18720539	18721863	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0524251;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18720539	18721863	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0524251-01;Parent=gene:OsNip_01g0524251;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0524251-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18720539	18721318	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524251-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18720539	18721863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524251-01;Name=OsNip_01t0524251-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0524251-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18721319	18721849	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0524251-01;Parent=transcript:OsNip_01t0524251-01;protein_id=OsNip_01t0524251-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18721850	18721863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524251-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18749285	18750480	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0524400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18749285	18750480	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0524400-01;Parent=gene:OsNip_01g0524400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18749285	18749512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18749285	18750480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524400-01;Name=OsNip_01t0524400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0524400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18749513	18750091	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0524400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0524400-01;protein_id=OsNip_01t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18750092	18750480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18755303	18756817	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0524500;Name=OsNip_MYBS1;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18755303	18756817	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0524500-01;Parent=gene:OsNip_01g0524500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0524500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18771827	18772531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0524700-01;Name=OsNip_01t0524700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0524700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18781121	18781392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18818271	18819071	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0525350-00;Parent=gene:OsNip_01g0525350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0525350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18818271	18818572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18818271	18819071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525350-00;Name=OsNip_01t0525350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18818693	18819071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18823738	18834467	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0525500-01;Parent=gene:OsNip_01g0525500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0525500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18823738	18823808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525500-01;Name=OsNip_01t0525500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18824061	18824169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525500-01;Name=OsNip_01t0525500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18825686	18825852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525500-01;Name=OsNip_01t0525500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18833883	18834467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525500-01;Name=OsNip_01t0525500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18833287	18833812	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0525700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	18833287	18833812	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0525700-01;Parent=gene:OsNip_01g0525700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0525700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18833287	18833378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18833287	18833812	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525700-01;Name=OsNip_01t0525700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0525700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18833379	18833504	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0525700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0525700-01;protein_id=OsNip_01t0525700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18833505	18833812	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	18835667	18836039	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0525701;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18835667	18835777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0525701-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18856855	18857307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0526200-01;Name=OsNip_01t0526200-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0526200-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18856979	18857307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18923609	18923648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0527400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18924271	18924333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0527400-01;Name=OsNip_01t0527400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0527400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18924271	18924333	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0527400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0527400-01;protein_id=OsNip_01t0527400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18924950	18925651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0527400-01;Name=OsNip_01t0527400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0527400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18926824	18926958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0527400-01;Name=OsNip_01t0527400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0527400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	18977977	18978319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0528000-01;Name=OsNip_01t0528000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0528000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18992785	18992929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	18992785	18993402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0528300-01;Name=OsNip_01t0528300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0528300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	18992930	18993358	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0528300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0528300-01;protein_id=OsNip_01t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18993359	18993402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19073048	19073382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19073569	19073890	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19081149	19081450	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530300-01;Name=OsNip_01t0530300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0530300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19085856	19085991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530366-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19086461	19086553	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0530366-01;Parent=transcript:OsNip_01t0530366-01;protein_id=OsNip_01t0530366-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19088032	19088186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530366-01;Name=OsNip_01t0530366-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0530366-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19089919	19090041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;Name=OsNip_01t0530400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0530400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19089919	19090041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19090164	19090165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19090164	19090234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;Name=OsNip_01t0530400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0530400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19090166	19090234	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0530400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;protein_id=OsNip_01t0530400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19091133	19091309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;Name=OsNip_01t0530400-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0530400-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19091133	19091309	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0530400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0530400-01;protein_id=OsNip_01t0530400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19093989	19094105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19095631	19097491	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0530500-01;Parent=gene:OsNip_01g0530500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19095631	19095880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19325780	19325937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0533800-00;Name=OsNip_01t0533800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0533800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19507874	19508342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0536433-00;Name=OsNip_01t0536433-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0536433-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19507881	19508096	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0536433-00;Parent=transcript:OsNip_01t0536433-00;protein_id=OsNip_01t0536433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19508097	19508342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0536433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19509834	19510988	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0536466;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19509834	19510988	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0536466-00;Parent=gene:OsNip_01g0536466;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0536466-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19684600	19684887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0538000-04;Name=OsNip_01t0538000-03-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0538000-03-E5;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19685989	19686310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0538000-04;Name=OsNip_01t0538000-04-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0538000-04-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19685989	19686310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0538000-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	19805233	19805407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0538650-00;Name=OsNip_01t0538650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0538650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19824231	19826621	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0539400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19824231	19826595	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0539400-01;Parent=gene:OsNip_01g0539400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19824231	19824807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19824231	19825116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Name=OsNip_01t0539400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19824808	19825104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0539400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;protein_id=OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19825105	19825116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19825524	19825713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Name=OsNip_01t0539400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19825524	19825713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19826407	19826595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Name=OsNip_01t0539400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19826407	19826595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19824805	19826621	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0539400-02;Parent=gene:OsNip_01g0539400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0539400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19824805	19824807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19824805	19825116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;Name=OsNip_01t0539400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19824808	19825104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0539400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;protein_id=OsNip_01t0539400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19825105	19825116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19825524	19826621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;Name=OsNip_01t0539400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19825524	19826621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19845620	19848402	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0539900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19845620	19848402	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0539900-01;Parent=gene:OsNip_01g0539900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0539900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19845620	19846417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19845620	19848402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539900-01;Name=OsNip_01t0539900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0539900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19846418	19846987	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0539900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0539900-01;protein_id=OsNip_01t0539900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19846988	19848402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0539900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19849324	19850690	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0540000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19849324	19850690	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0540000-00;Parent=gene:OsNip_01g0540000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19849324	19849607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19849324	19849661	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;Name=OsNip_01t0540000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0540000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19849608	19849661	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0540000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;protein_id=OsNip_01t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19850569	19850604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0540000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;protein_id=OsNip_01t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19850569	19850690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;Name=OsNip_01t0540000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0540000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19850605	19850690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19853580	19854168	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0540300;biotype=protein_coding;description=Rac-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19853580	19854168	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0540300-00;Parent=gene:OsNip_01g0540300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0540300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19853580	19853674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;Name=OsNip_01t0540300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0540300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19853580	19853674	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0540300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;protein_id=OsNip_01t0540300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19853786	19853873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;Name=OsNip_01t0540300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0540300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19853786	19853873	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0540300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;protein_id=OsNip_01t0540300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19854082	19854168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;Name=OsNip_01t0540300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0540300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19854082	19854168	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0540300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540300-00;protein_id=OsNip_01t0540300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	19855213	19856657	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0540400;biotype=protein_coding;description=Transposase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19855213	19856657	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0540400-00;Parent=gene:OsNip_01g0540400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0540400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19855213	19855259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;Name=OsNip_01t0540400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0540400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19855213	19855259	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0540400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;protein_id=OsNip_01t0540400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19855405	19856341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;Name=OsNip_01t0540400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0540400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19855405	19856341	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0540400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;protein_id=OsNip_01t0540400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19856424	19856657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;Name=OsNip_01t0540400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0540400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19856424	19856657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0540400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0540400-00;protein_id=OsNip_01t0540400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19911224	19911406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0541600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	19913890	19914158	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0541600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0541600-01;protein_id=OsNip_01t0541600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	19913890	19914280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0541600-01;Name=OsNip_01t0541600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0541600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19914159	19914280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0541600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	19959667	19961939	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0541800-01;Parent=gene:OsNip_01g0541800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0541800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19959667	19959816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0541800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20102142	20102301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543400-00;Name=OsNip_01t0543400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0543400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20126121	20126848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20124383	20126778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0543800-00;Parent=gene:OsNip_01g0543800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20124383	20124777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Name=OsNip_01t0543800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0543800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20124383	20124777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20125595	20125985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Name=OsNip_01t0543800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0543800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20125595	20125985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20126076	20126340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20126076	20126778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Name=OsNip_01t0543800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0543800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20126635	20126778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	20153482	20156277	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0544200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20153482	20156262	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0544200-01;Parent=gene:OsNip_01g0544200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20153482	20153499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20154946	20155386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;Name=OsNip_01t0544200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0544200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20154946	20155386	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0544200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;protein_id=OsNip_01t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20155479	20155604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0544200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;protein_id=OsNip_01t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20155479	20156262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;Name=OsNip_01t0544200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0544200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20155605	20156262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20153482	20156277	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0544200-02;Parent=gene:OsNip_01g0544200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20153482	20153499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20153482	20155386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;Name=OsNip_01t0544200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0544200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20153500	20154102	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0544200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;protein_id=OsNip_01t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20154103	20155386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20155479	20156277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;Name=OsNip_01t0544200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0544200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20155479	20156277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20153485	20156262	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0544200-03;Parent=gene:OsNip_01g0544200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20153485	20153499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20153485	20154015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Name=OsNip_01t0544200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0544200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20153500	20154015	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0544200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;protein_id=OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20154946	20155081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Name=OsNip_01t0544200-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0544200-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20154946	20155081	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0544200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;protein_id=OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20155207	20155235	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0544200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;protein_id=OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20155207	20155386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Name=OsNip_01t0544200-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0544200-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20155236	20155386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20155479	20156262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Name=OsNip_01t0544200-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0544200-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20155479	20156262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20302457	20302467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0546400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	20302284	20302462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0546400-02;Name=OsNip_01t0546400-02;exon_id=OsNip_01t0546400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G919.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G545.1;prot_id "UniRef90_A0A287SSW9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20501295	20501694	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0549200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0549200-01;protein_id=OsNip_01t0549200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20501295	20501757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0549200-01;Name=OsNip_01t0549200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0549200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20598327	20598592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550250-00;Name=OsNip_01t0550250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20600001	20600111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-01;Name=OsNip_01t0550300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20601474	20601932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-01;Name=OsNip_01t0550300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20601474	20601932	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0550300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-01;protein_id=OsNip_01t0550300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20602005	20602191	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0550300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-01;protein_id=OsNip_01t0550300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20602005	20602258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-01;Name=OsNip_01t0550300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20599446	20599853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Name=OsNip_01t0550300-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20599809	20599853	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0550300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;protein_id=OsNip_01t0550300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20600001	20600111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Name=OsNip_01t0550300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E5;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20600791	20600874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Name=OsNip_01t0550300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20600791	20600874	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0550300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;protein_id=OsNip_01t0550300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20601240	20601340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Name=OsNip_01t0550300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0550300-01-E3;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20601240	20601340	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0550300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;protein_id=OsNip_01t0550300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20601474	20602191	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0550300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;protein_id=OsNip_01t0550300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20601474	20602258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Name=OsNip_01t0550300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20602192	20602258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	20602221	20602506	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-03;Name=OsNip_01t0550300-03;exon_id=OsNip_01t0550300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G931.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G421.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	20602495	20602506	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0550300-03;Parent=transcript:OsNip_01t0550300-03;protein_id=OsNip_01t0550300-03;Tag=IsoSeq:G931.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G421.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	20602221	20602492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550300-03;Tag=IsoSeq:G931.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G421.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20628587	20631077	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0550600-00;Parent=gene:OsNip_01g0550600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0550600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20628587	20629808	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0550600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550600-00;protein_id=OsNip_01t0550600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20629990	20631077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550600-00;Name=OsNip_01t0550600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0550600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20643216	20643879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550800-01;Name=OsNip_01t0550800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20643597	20643879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20641271	20641392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550850-00;Name=OsNip_01t0550850-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550850-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20641506	20641739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550850-00;Name=OsNip_01t0550850-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550850-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20641924	20642110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550850-00;Name=OsNip_01t0550850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20642898	20643062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550850-00;Name=OsNip_01t0550850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20643214	20643562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550850-00;Name=OsNip_01t0550850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	20651659	20654948	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0550900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20651659	20654948	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0550900-00;Parent=gene:OsNip_01g0550900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20651659	20651720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20651659	20651720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20651871	20651957	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20651893	20651957	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0550900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;protein_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20652028	20652286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20652028	20652286	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0550900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;protein_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20652439	20652609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20652439	20652609	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0550900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;protein_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20653267	20653320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20653267	20653320	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0550900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;protein_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20653451	20653594	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0550900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;protein_id=OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20653451	20653597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20653595	20653597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20654504	20654948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Name=OsNip_01t0550900-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550900-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20654504	20654948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	20651869	20654847	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0550950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20651869	20654847	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0550950-00;Parent=gene:OsNip_01g0550950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20651869	20651987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Name=OsNip_01t0550950-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550950-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20651869	20651987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20652072	20652299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Name=OsNip_01t0550950-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550950-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20652072	20652299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20652437	20652673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Name=OsNip_01t0550950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20652437	20652673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20653466	20653585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20653466	20653593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Name=OsNip_01t0550950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0550950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20653586	20653593	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0550950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;protein_id=OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20654500	20654734	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0550950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;protein_id=OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20654500	20654847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Name=OsNip_01t0550950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0550950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20654735	20654847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0550950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	20662988	20665060	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0551000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20662993	20665013	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0551000-01;Parent=gene:OsNip_01g0551000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0551000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20662993	20663085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0551000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20662993	20663916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0551000-01;Name=OsNip_01t0551000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0551000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20664623	20664667	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0551000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0551000-01;protein_id=OsNip_01t0551000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20700553	20700664	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0551400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20716388	20716704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0551800-01;Name=OsNip_01t0551800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0551800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20716562	20716704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0551800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20742111	20742427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0552300-01;Name=OsNip_01t0552300-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0552300-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20742238	20742427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0552300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	20738640	20738967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0552300-02;Name=OsNip_01t0552300-02;exon_id=OsNip_01t0552300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G936.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G424.3;prot_id "UniRef90_UPI000E6F6E82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	20875595	20875861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0554400-01;Name=OsNip_01t0554400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0554400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20937157	20937436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0555100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	20938340	20941280	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0555200-01;Parent=gene:OsNip_01g0555200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0555200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20938340	20939436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0555200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20938340	20939718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0555200-01;Name=OsNip_01t0555200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0555200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	20939437	20939718	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0555200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0555200-01;protein_id=OsNip_01t0555200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	20940293	20940977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0555200-01;Name=OsNip_01t0555200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0555200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	21040851	21041073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0556700-01;Tag=IsoSeq:G942.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G743.2,Nipponbare.leaf_G428.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21043249	21043288	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0556800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0556800-00;protein_id=OsNip_01t0556800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21114757	21114937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21115691	21115731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21128145	21128151	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0558300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0558300-01;protein_id=OsNip_01t0558300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21128145	21128357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558300-01;Name=OsNip_01t0558300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0558300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21155114	21155639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558800-01;Name=OsNip_01t0558800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0558800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21161913	21161982	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0558850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0558850-00;protein_id=OsNip_01t0558850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21162157	21162420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558850-00;Name=OsNip_01t0558850-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0558850-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21166877	21166954	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0558900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0558900-01;protein_id=OsNip_01t0558900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21166877	21167414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558900-01;Name=OsNip_01t0558900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0558900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21166955	21167414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21167379	21167476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0558900-02;Name=OsNip_01t0558900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0558900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	21167873	21172622	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0559000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21167873	21172622	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0559000-01;Parent=gene:OsNip_01g0559000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21167873	21168030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21167873	21168114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21168031	21168114	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21168385	21168465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21168385	21168465	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21169561	21169610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21169561	21169610	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21170583	21170660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21170583	21170660	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21170769	21170826	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21170769	21170826	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21170913	21170962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21170913	21170962	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21171364	21171472	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21171556	21171617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21171556	21171617	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21172211	21172253	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0559000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;protein_id=OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21172211	21172262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21172254	21172262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21172371	21172622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Name=OsNip_01t0559000-02-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559000-02-E9;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21172371	21172622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21167915	21172622	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0559000-02;Parent=gene:OsNip_01g0559000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0559000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21167915	21168030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21167915	21168114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559000-02;Name=OsNip_01t0559000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21179610	21179905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21179035	21179283	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0559100-02;protein_id=OsNip_01t0559100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21186733	21186859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559300-01;Name=OsNip_01t0559300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0559300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21187019	21187069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559300-01;Name=OsNip_01t0559300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21187165	21187424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559300-01;Name=OsNip_01t0559300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21187265	21187424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21195400	21201154	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0559500-01;Parent=gene:OsNip_01g0559500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21195400	21195431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21195432	21195673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21195878	21195962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21195878	21195962	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21196049	21196312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21196049	21196312	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21196408	21196710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21197585	21197689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21197585	21197689	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21197806	21197905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21197806	21197905	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21199504	21199823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21199504	21199823	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21200073	21200249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21200073	21200249	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21200322	21200450	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21200322	21200450	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21200741	21200968	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0559500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;protein_id=OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21200741	21201154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Name=OsNip_01t0559500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0559500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21200969	21201154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	21195401	21201532	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0559525;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21195401	21201532	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0559525-00;Parent=gene:OsNip_01g0559525;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0559525-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21195401	21195665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21195862	21195957	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21196039	21196302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21196402	21196715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21197592	21197703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21197815	21197904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21199503	21199821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21200071	21200252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21200737	21201204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21201256	21201532	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0559525-00;Name=OsNip_01t0559525-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0559525-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	21201971	21203280	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0559550;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21266795	21266923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0560000-02;Name=OsNip_01t0560000-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0560000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21266795	21266923	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0560000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0560000-02;protein_id=OsNip_01t0560000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21267574	21267888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0560000-02;Name=OsNip_01t0560000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0560000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21267574	21267888	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0560000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0560000-02;protein_id=OsNip_01t0560000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21441282	21441440	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0563000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21441282	21441439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0563000-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21632407	21632649	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0565900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0565900-01;protein_id=OsNip_01t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21632650	21633086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21632670	21633045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0565900-02;Name=OsNip_01t0565900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0565900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	21632393	21632788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0565900-03;Name=OsNip_01t0565900-03;exon_id=OsNip_01t0565900-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G961.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G759.1;prot_id "UniRef90_A0A5C7HZG6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	21632417	21632575	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0565900-03;Parent=transcript:OsNip_01t0565900-03;protein_id=OsNip_01t0565900-03;Tag=IsoSeq:G961.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G759.1;prot_id "UniRef90_A0A5C7HZG6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	21631180	21631274	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0565900-03;Tag=IsoSeq:G961.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G759.1;prot_id "UniRef90_A0A5C7HZG6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21831969	21832151	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0569800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0569800-01;protein_id=OsNip_01t0569800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21881600	21881726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-01;Name=OsNip_01t0570500-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0570500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21879080	21879265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21880753	21881157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-03;Name=OsNip_01t0570500-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0570500-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21881437	21881521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;Name=OsNip_01t0570500-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0570500-01-E9;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	21881600	21881726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;Name=OsNip_01t0570500-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0570500-01-E10;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21882895	21883034	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0570500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;protein_id=OsNip_01t0570500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21883156	21883449	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0570500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;protein_id=OsNip_01t0570500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21883156	21883943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;Name=OsNip_01t0570500-04-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0570500-04-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21883450	21883943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	21886899	21887840	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0570601;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21886899	21887840	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0570601-00;Parent=gene:OsNip_01g0570601;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0570601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21886899	21887840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570601-00;Name=OsNip_01t0570601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0570601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21886899	21887840	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0570601-00;Parent=transcript:OsNip_01t0570601-00;protein_id=OsNip_01t0570601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	21892646	21897926	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0570700;biotype=protein_coding;description=Carbamoyl-phosphate;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	21896614	21897709	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0570700-01;Parent=gene:OsNip_01g0570700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21896614	21896614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	21896614	21897709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570700-01;Name=OsNip_01t0570700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0570700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	21896615	21897595	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0570700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0570700-01;protein_id=OsNip_01t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21897596	21897709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21956855	21957643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0571700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22078545	22079459	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0574400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0574400-01;protein_id=OsNip_01t0574400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22078545	22079795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574400-01;Name=OsNip_01t0574400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0574400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22079460	22079795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22079460	22079852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22077185	22079275	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0574451-00;Parent=gene:OsNip_01g0574451;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22077185	22077263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;Name=OsNip_01t0574451-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0574451-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22077185	22077263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22077981	22078347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22078348	22078460	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0574451-00;Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;protein_id=OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22078549	22079059	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0574451-00;Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;protein_id=OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22078549	22079275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;Name=OsNip_01t0574451-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0574451-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22079060	22079275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574451-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22082298	22088239	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0574500-01;Parent=gene:OsNip_01g0574500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0574500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22082298	22082540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22083159	22083246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0574500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0574500-01;protein_id=OsNip_01t0574500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22084583	22084840	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0574500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0574500-01;protein_id=OsNip_01t0574500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22084926	22085050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574500-01;Name=OsNip_01t0574500-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0574500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22086265	22086741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574500-01;Name=OsNip_01t0574500-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0574500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22089702	22089757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574600-01;Name=OsNip_01t0574600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0574600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22090436	22090501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574600-01;Name=OsNip_01t0574600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0574600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22090436	22090501	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0574600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0574600-01;protein_id=OsNip_01t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22090733	22091018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574600-01;Name=OsNip_01t0574600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0574600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22090951	22091018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22098634	22098673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22098674	22099549	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0574800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0574800-01;protein_id=OsNip_01t0574800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22099550	22099659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0574800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	22120320	22128715	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0575000;biotype=protein_coding;description=Root;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22120320	22128679	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0575000-01;Parent=gene:OsNip_01g0575000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22120320	22120481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;Name=OsNip_01t0575000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0575000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22120320	22120481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22121500	22121501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22121500	22121646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;Name=OsNip_01t0575000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0575000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22121502	22121646	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0575000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;protein_id=OsNip_01t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22121756	22121820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0575000-01;Name=OsNip_01t0575000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0575000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22353427	22353722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0578000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22355630	22355696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0578000-01;Name=OsNip_01t0578000-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0578000-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22471873	22472572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0580200-01;Name=OsNip_01t0580200-01-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0580200-01-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22471984	22472572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0580200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22554467	22554531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22557515	22561678	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0581900-01;Parent=gene:OsNip_01g0581900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22557515	22559122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22559123	22559128	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;protein_id=OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22559285	22559932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;Name=OsNip_01t0581900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0581900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22559285	22559932	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;protein_id=OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22560850	22561200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;Name=OsNip_01t0581900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0581900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22561165	22561200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22561465	22561678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22591434	22596164	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0582400-01;Parent=gene:OsNip_01g0582400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0582400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22754546	22754682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22754546	22755126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;Name=OsNip_01t0585300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0585300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22754683	22755126	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0585300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;protein_id=OsNip_01t0585300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22755226	22755345	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0585300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;protein_id=OsNip_01t0585300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22755226	22755398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;Name=OsNip_01t0585300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0585300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22755346	22755398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	22754569	22755390	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0585300-02;Parent=gene:OsNip_01g0585300;transcript_id=OsNip_01t0585300-02;Tag=IsoSeq:G1001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G792.3
Chr01	TAMA	exon	22754569	22755390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-02;Name=OsNip_01t0585300-02;exon_id=OsNip_01t0585300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G792.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	22754660	22755388	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0585300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0585300-02;protein_id=OsNip_01t0585300-02;Tag=IsoSeq:G1001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G792.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	22755389	22755390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-02;Tag=IsoSeq:G1001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G792.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	22754569	22754657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585300-02;Tag=IsoSeq:G1001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G792.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	22755984	22757293	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0585400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	22755984	22757293	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0585400-01;Parent=gene:OsNip_01g0585400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0585400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22755984	22756078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22755984	22756218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0585400-01;Name=OsNip_01t0585400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0585400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22756079	22756218	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0585400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0585400-01;protein_id=OsNip_01t0585400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22756869	22756965	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0585400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0585400-01;protein_id=OsNip_01t0585400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	22820253	22823138	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0586600;Name=OsNip_CBSX7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22820894	22821066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22821230	22821776	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22821230	22822282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;Name=OsNip_01t0586600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0586600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22821777	22822282	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0586600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;protein_id=OsNip_01t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	22822363	22822522	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0586600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;protein_id=OsNip_01t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	22822363	22823095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;Name=OsNip_01t0586600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0586600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22822523	22823095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	22820260	22823138	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0586600-02;Parent=gene:OsNip_01g0586600;transcript_id=OsNip_01t0586600-02;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1
Chr01	TAMA	exon	22822935	22823138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-02;Name=OsNip_01t0586600-02;exon_id=OsNip_01t0586600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1;prot_id "UniRef90_M0TK79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	22822935	22823138	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0586600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0586600-02;protein_id=OsNip_01t0586600-02;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1;prot_id "UniRef90_M0TK79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	22822363	22822524	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-02;Name=OsNip_01t0586600-02;exon_id=OsNip_01t0586600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1;prot_id "UniRef90_M0TK79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	22822504	22822524	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0586600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0586600-02;protein_id=OsNip_01t0586600-02;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1;prot_id "UniRef90_M0TK79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	22821840	22822282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0586600-02;Name=OsNip_01t0586600-02;exon_id=OsNip_01t0586600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1004.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G601.1;prot_id "UniRef90_M0TK79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	22951320	22952187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0588800-01;Name=OsNip_01t0588800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0588800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22951586	22952187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0588800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22980027	22980515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0589000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23001983	23002368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0589700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23004127	23004931	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0589800-01;Parent=gene:OsNip_01g0589800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0589800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23004127	23004127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0589800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23004724	23004838	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0589800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0589800-01;protein_id=OsNip_01t0589800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	23106164	23106221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0591000-03;Tag=IsoSeq:G1020.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G612.3;prot_id "UniRef90_UPI00109F4BE9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23105376	23106077	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0591250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23105376	23106077	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0591250-00;Parent=gene:OsNip_01g0591250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0591250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23105376	23105552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0591250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23105376	23106077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0591250-00;Name=OsNip_01t0591250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0591250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23105553	23105873	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0591250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0591250-00;protein_id=OsNip_01t0591250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23105874	23106077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0591250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23112461	23120563	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0591500;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23112461	23120522	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0591500-00;Parent=gene:OsNip_01g0591500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0591500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23112461	23112881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0591500-00;Name=OsNip_01t0591500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0591500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23301874	23306377	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0594800-00;Parent=gene:OsNip_01g0594800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0594800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23305942	23306377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594800-00;Name=OsNip_01t0594800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0594800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	23311205	23312581	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0594900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23311205	23311414	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23311205	23311764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;Name=OsNip_01t0594900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0594900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23312038	23312341	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;Name=OsNip_01t0594900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0594900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23312038	23312341	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0594900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;protein_id=OsNip_01t0594900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23312432	23312581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;Name=OsNip_01t0594900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0594900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23312537	23312581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0594900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23313213	23313445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23313213	23313928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595001-00;Name=OsNip_01t0595001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23313446	23313868	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0595001-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595001-00;protein_id=OsNip_01t0595001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23313869	23313928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23316218	23316307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23316308	23316876	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;protein_id=OsNip_01t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23318541	23318640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;Name=OsNip_01t0595100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0595100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23318541	23318640	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0595100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;protein_id=OsNip_01t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23318721	23318944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;Name=OsNip_01t0595100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23318721	23318944	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595100-01;protein_id=OsNip_01t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23333577	23333583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23336896	23337221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-01;Name=OsNip_01t0595400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23336896	23337221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	23336896	23337114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-02;Name=OsNip_01t0595400-02;exon_id=OsNip_01t0595400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1031.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G816.2;prot_id "UniRef90_A0A6A4LXG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	23336896	23336910	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0595400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0595400-02;protein_id=OsNip_01t0595400-02;Tag=IsoSeq:G1031.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G816.2;prot_id "UniRef90_A0A6A4LXG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	23333051	23333052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-02;Tag=IsoSeq:G1031.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G816.2;prot_id "UniRef90_A0A6A4LXG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	23336914	23337114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595400-02;Tag=IsoSeq:G1031.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G816.2;prot_id "UniRef90_A0A6A4LXG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23343306	23345362	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0595600;biotype=protein_coding;description=Alpha/beta;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23343306	23343364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23343306	23343487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;Name=OsNip_01t0595600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23343365	23343487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;protein_id=OsNip_01t0595600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23343575	23343816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;Name=OsNip_01t0595600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23343575	23343816	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;protein_id=OsNip_01t0595600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23344654	23345197	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0595600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;protein_id=OsNip_01t0595600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23344654	23345362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;Name=OsNip_01t0595600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0595600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23345198	23345362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23347762	23353061	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0595725;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23347762	23353061	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0595725-00;Parent=gene:OsNip_01g0595725;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0595725-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23347762	23348079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;Name=OsNip_01t0595725-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595725-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23347762	23348079	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0595725-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;protein_id=OsNip_01t0595725-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23352164	23352835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;Name=OsNip_01t0595725-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595725-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23352164	23352835	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0595725-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;protein_id=OsNip_01t0595725-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23352935	23352955	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0595725-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;protein_id=OsNip_01t0595725-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23352935	23353061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;Name=OsNip_01t0595725-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595725-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23352956	23353061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595725-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23353537	23353963	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0595800-00;Parent=gene:OsNip_01g0595800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0595800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23353537	23353792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595800-00;Name=OsNip_01t0595800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23353537	23353792	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595800-00;protein_id=OsNip_01t0595800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23353821	23353963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595800-00;Name=OsNip_01t0595800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0595800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23353821	23353963	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0595800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0595800-00;protein_id=OsNip_01t0595800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23353985	23354232	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0595850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23353985	23354232	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0595850-01;Parent=gene:OsNip_01g0595850;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0595850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23353985	23354232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595850-01;Name=OsNip_01t0595850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23357007	23359952	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0595900;Name=OsNip_Fbox023;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23357007	23359952	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0595900-01;Parent=gene:OsNip_01g0595900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23357007	23357063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23357007	23358182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;Name=OsNip_01t0595900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0595900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23357064	23358182	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;protein_id=OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23358320	23358463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;Name=OsNip_01t0595900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23358320	23358463	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;protein_id=OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23358573	23358941	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0595900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;protein_id=OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23358573	23359952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;Name=OsNip_01t0595900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0595900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23358942	23359952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23502093	23502375	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0598200-01;Name=OsNip_01t0598200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0598200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23502163	23502375	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0598200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23510098	23512343	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0598400;Name=OsNip_Fbox028;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23510098	23512343	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0598400-01;Parent=gene:OsNip_01g0598400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0598400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23510098	23510311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0598400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23542391	23542705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0599550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23544345	23544345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0599550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23585868	23585981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23584039	23585690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0600500-01;Parent=gene:OsNip_01g0600500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0600500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23584039	23584795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23584039	23585063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;Name=OsNip_01t0600500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0600500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23585175	23585296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;Name=OsNip_01t0600500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0600500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23585175	23585296	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0600500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;protein_id=OsNip_01t0600500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23585382	23585564	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0600500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;protein_id=OsNip_01t0600500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23585382	23585690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;Name=OsNip_01t0600500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0600500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23585565	23585690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	23584026	23585690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0600500-02;Parent=gene:OsNip_01g0600500;transcript_id=OsNip_01t0600500-02;Tag=IsoSeq:G1039.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G621.1
Chr01	TAMA	exon	23585382	23585690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0600500-02;Name=OsNip_01t0600500-02;exon_id=OsNip_01t0600500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1039.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G621.1;prot_id "UniRef90_A0A2C9UBG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	23585382	23585689	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0600500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0600500-02;protein_id=OsNip_01t0600500-02;Tag=IsoSeq:G1039.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G621.1;prot_id "UniRef90_A0A2C9UBG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23663180	23663697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0602075-00;Name=OsNip_01t0602075-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0602075-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23663805	23664198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0602075-00;Name=OsNip_01t0602075-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0602075-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23663813	23664196	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0602200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0602200-01;protein_id=OsNip_01t0602200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23673178	23675960	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0602400;Name=OsNip_CYP72A32;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23673178	23675960	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0602400-01;Parent=gene:OsNip_01g0602400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23673292	23673717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0602400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0602400-01;protein_id=OsNip_01t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23760661	23760964	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0603300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0603300-02;protein_id=OsNip_01t0603300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23762029	23762293	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0603300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23770115	23771515	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0603500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23770115	23771515	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0603500-00;Parent=gene:OsNip_01g0603500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0603500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23770115	23771515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0603500-00;Name=OsNip_01t0603500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0603500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23770115	23771515	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0603500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0603500-00;protein_id=OsNip_01t0603500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	23776275	23780692	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0603700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23776275	23780692	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0603700-01;Parent=gene:OsNip_01g0603700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0603700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23840093	23840725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0605100-01;Name=OsNip_01t0605100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0605100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23887760	23888225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0606166-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23890258	23890668	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0606200-00;Parent=gene:OsNip_01g0606200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0606200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23896932	23897435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0606400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	23896788	23897016	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t060689A-01;Tag=IsoSeq:G1055.1;Source=Nipponbare.panicle_G835.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V2Q5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23912171	23912253	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0606900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0606900-01;protein_id=OsNip_01t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23912376	23912432	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0606900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0606900-01;protein_id=OsNip_01t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23912583	23913239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0606900-01;Name=OsNip_01t0606900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0606900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23914150	23914185	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23914150	23914856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607000-01;Name=OsNip_01t0607000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0607000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23914186	23914689	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0607000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0607000-01;protein_id=OsNip_01t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23914690	23914856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23920443	23920508	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0607100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0607100-00;protein_id=OsNip_01t0607100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23921130	23921302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23923718	23923798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23923799	23923944	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0607200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0607200-01;protein_id=OsNip_01t0607200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23924927	23925190	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0607200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0607200-01;protein_id=OsNip_01t0607200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	23932510	23932639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607200-01;Name=OsNip_01t0607200-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0607200-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23936865	23937209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	23938395	23943781	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0607400-02;Parent=gene:OsNip_01g0607400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0607400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23938395	23938635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23938395	23938782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607400-02;Name=OsNip_01t0607400-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0607400-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	23938636	23938782	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0607400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0607400-02;protein_id=OsNip_01t0607400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	23938871	23939077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0607400-02;Name=OsNip_01t0607400-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0607400-01-E17;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24104354	24104421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0609700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24108990	24109073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0609900-02;Name=OsNip_01t0609900-02-E16;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0609900-02-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24148411	24148846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0610400-01;Name=OsNip_01t0610400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0610400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24148629	24148846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0610400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24151040	24151300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0610500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24151040	24151507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0610500-02;Name=OsNip_01t0610500-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0610500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24151301	24151507	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0610500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0610500-02;protein_id=OsNip_01t0610500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24151908	24152175	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0610500-02;Name=OsNip_01t0610500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0610500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24151908	24152175	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0610500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0610500-02;protein_id=OsNip_01t0610500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	24285116	24285306	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612600-02;Tag=IsoSeq:G1077.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G496.2,Nipponbare.panicle_G851.2;prot_id "UniRef90_A0A162AG67";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	24284235	24284418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612600-02;Tag=IsoSeq:G1077.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G496.2,Nipponbare.panicle_G851.2;prot_id "UniRef90_A0A162AG67";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	24282953	24283938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612600-02;Tag=IsoSeq:G1077.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G496.2,Nipponbare.panicle_G851.2;prot_id "UniRef90_A0A162AG67";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24294290	24294291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24294290	24296635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;Name=OsNip_01t0612700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0612700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24294292	24296635	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0612700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;protein_id=OsNip_01t0612700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24297626	24297733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;Name=OsNip_01t0612700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0612700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24297626	24297733	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0612700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;protein_id=OsNip_01t0612700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24298222	24298331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;Name=OsNip_01t0612700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0612700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24299097	24299171	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0612700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612700-01;protein_id=OsNip_01t0612700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24300463	24300611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612800-01;Name=OsNip_01t0612800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0612800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24300463	24300611	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0612800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612800-01;protein_id=OsNip_01t0612800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24313953	24314162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;Name=OsNip_01t0612900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0612900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24313953	24314162	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0612900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;protein_id=OsNip_01t0612900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24315011	24315159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;Name=OsNip_01t0612900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0612900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24315240	24315516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;Name=OsNip_01t0612900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0612900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24315240	24315516	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0612900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;protein_id=OsNip_01t0612900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24316612	24317113	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;Name=OsNip_01t0612900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0612900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24316917	24317113	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0612900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24334363	24334379	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24334363	24336159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613100-00;Name=OsNip_01t0613100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0613100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24334380	24336158	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0613100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0613100-00;protein_id=OsNip_01t0613100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24336159	24336159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	24341214	24343585	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0613300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	24341214	24343585	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0613300-01;Parent=gene:OsNip_01g0613300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0613300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24341214	24341598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;Name=OsNip_01t0613300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0613300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24341214	24341598	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0613300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;protein_id=OsNip_01t0613300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24341731	24341842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;Name=OsNip_01t0613300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0613300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24341731	24341842	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0613300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;protein_id=OsNip_01t0613300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24343329	24343458	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0613300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;protein_id=OsNip_01t0613300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24343329	24343585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;Name=OsNip_01t0613300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0613300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24343459	24343585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	24341881	24342143	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0613400;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	24341881	24342143	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0613400-01;Parent=gene:OsNip_01g0613400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0613400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24341881	24342143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0613400-01;Name=OsNip_01t0613400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0613400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24576771	24576859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24604903	24605484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618500-01;Name=OsNip_01t0618500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0618500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24604342	24604529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618601-00;Name=OsNip_01t0618601-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0618601-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24604607	24604778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618601-00;Name=OsNip_01t0618601-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0618601-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24604916	24605096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618601-00;Name=OsNip_01t0618601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0618601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	24611455	24615465	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0618700;biotype=protein_coding;description=Lipase%2C;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24614231	24614232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24614231	24614586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;Name=OsNip_01t0618700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0618700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24614233	24614586	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0618700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;protein_id=OsNip_01t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24614693	24615133	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0618700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;protein_id=OsNip_01t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24614693	24615465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;Name=OsNip_01t0618700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0618700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24615134	24615465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	24611455	24615455	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0618700-02;Parent=gene:OsNip_01g0618700;transcript_id=OsNip_01t0618700-02;Tag=IsoSeq:G1101.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G870.1
Chr01	TAMA	exon	24611455	24612246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-02;Name=OsNip_01t0618700-02;exon_id=OsNip_01t0618700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1101.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G870.1;prot_id "UniRef90_A0A200PUQ8";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	24613505	24614047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0618700-02;Name=OsNip_01t0618700-02;exon_id=OsNip_01t0618700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1101.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G870.1;prot_id "UniRef90_A0A200PUQ8";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24814511	24814589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24817040	24817249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24817352	24817676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24817352	24817840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;Name=OsNip_01t0622033-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0622033-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24817951	24818151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;Name=OsNip_01t0622033-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0622033-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24817951	24818151	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0622033-01;Parent=transcript:OsNip_01t0622033-01;protein_id=OsNip_01t0622033-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24842499	24842626	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0622600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0622600-01;protein_id=OsNip_01t0622600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24842716	24842815	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0622600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0622600-01;protein_id=OsNip_01t0622600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24843008	24843094	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0622600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0622600-01;protein_id=OsNip_01t0622600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24843008	24843459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622600-01;Name=OsNip_01t0622600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0622600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24843095	24843459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0622600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24941445	24941505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0624500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0624500-01;protein_id=OsNip_01t0624500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24942065	24942147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0624500-01;Name=OsNip_01t0624500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0624500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24942065	24942147	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0624500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0624500-01;protein_id=OsNip_01t0624500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	24986982	24988791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626032-01;Name=OsNip_01t0626032-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0626032-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24994804	24994859	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0626100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0626100-01;protein_id=OsNip_01t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	24994965	24995529	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0626100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0626100-01;protein_id=OsNip_01t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	24994965	24997782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626100-01;Name=OsNip_01t0626100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0626100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25002856	25003291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25004123	25004701	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0626300-01;Parent=gene:OsNip_01g0626300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0626300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25004123	25004370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25004614	25004701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25004212	25004702	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0626350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25009514	25012233	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0626400-01;Parent=gene:OsNip_01g0626400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0626400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25009514	25009545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25009514	25010075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Name=OsNip_01t0626400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0626400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25011303	25011916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Name=OsNip_01t0626400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0626400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25011769	25011916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25012062	25012233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Name=OsNip_01t0626400-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0626400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25012062	25012233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25009546	25011602	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0626400-02;Parent=gene:OsNip_01g0626400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0626400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25009546	25010075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;Name=OsNip_01t0626400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0626400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25009546	25010075	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0626400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;protein_id=OsNip_01t0626400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25010996	25011139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;Name=OsNip_01t0626400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0626400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25010996	25011139	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0626400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;protein_id=OsNip_01t0626400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25011303	25011427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;Name=OsNip_01t0626400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0626400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25011303	25011427	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0626400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;protein_id=OsNip_01t0626400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25011589	25011602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;Name=OsNip_01t0626400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0626400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25011589	25011602	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0626400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0626400-02;protein_id=OsNip_01t0626400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25019149	25021608	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0626500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25019149	25021608	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0626500-01;Parent=gene:OsNip_01g0626500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0626500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	25071785	25072149	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0627933-01;Tag=IsoSeq:G1131.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G530.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0JKV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	25072280	25072839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0627933-01;Tag=IsoSeq:G1131.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G530.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0JKV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25076430	25078374	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0627967-00;Parent=gene:OsNip_01g0627967;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0627967-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25076430	25076459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0627967-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25076430	25076967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0627967-00;Name=OsNip_01t0627967-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0627967-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25076460	25076967	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0627967-00;Parent=transcript:OsNip_01t0627967-00;protein_id=OsNip_01t0627967-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25077061	25077265	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0627967-00;Name=OsNip_01t0627967-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0627967-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25221104	25221448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0630900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25226874	25227261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25228733	25230793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631100-02;Name=OsNip_01t0631100-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0631100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25232057	25232113	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25236632	25236701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;Name=OsNip_01t0631200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0631200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25236632	25236701	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;protein_id=OsNip_01t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25237151	25237358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;Name=OsNip_01t0631200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0631200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25237151	25237358	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;protein_id=OsNip_01t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25237435	25237605	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;protein_id=OsNip_01t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25237435	25238165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;Name=OsNip_01t0631200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0631200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25237606	25238165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25257001	25263993	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0631400;Name=GPAT;biotype=protein_coding;description=Six-hairpin;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25257001	25263141	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0631400-01;Parent=gene:OsNip_01g0631400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0631400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25257001	25257251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0631400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25302482	25302926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	25350655	25350711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633000-02;Tag=IsoSeq:G1145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G537.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25370961	25371006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25410908	25410969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;Name=OsNip_01t0633900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0633900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25410908	25410969	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0633900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;protein_id=OsNip_01t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25411068	25411118	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0633900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;protein_id=OsNip_01t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25411921	25411930	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0633900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;protein_id=OsNip_01t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25411921	25412119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;Name=OsNip_01t0633900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0633900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25411931	25412119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25413436	25413922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;Name=OsNip_01t0633900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0633900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25413436	25413922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25420384	25425896	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0634300;Name=OsNip_DjC11;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25420384	25425723	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0634300-00;Parent=gene:OsNip_01g0634300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0634300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25420384	25423987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634300-00;Name=OsNip_01t0634300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0634300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25420384	25423987	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0634300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634300-00;protein_id=OsNip_01t0634300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25425314	25425723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634300-00;Name=OsNip_01t0634300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0634300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25425314	25425723	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0634300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634300-00;protein_id=OsNip_01t0634300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	25420875	25425896	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0634300-01;Parent=gene:OsNip_01g0634300;transcript_id=OsNip_01t0634300-01;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2
Chr01	TAMA	exon	25425353	25425896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634300-01;Name=OsNip_01t0634300-01;exon_id=OsNip_01t0634300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	25425353	25425896	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0634300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0634300-01;protein_id=OsNip_01t0634300-01;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	25420875	25423987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634300-01;Name=OsNip_01t0634300-01;exon_id=OsNip_01t0634300-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	25423962	25423987	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0634300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0634300-01;protein_id=OsNip_01t0634300-01;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	25420875	25423959	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634300-01;Tag=IsoSeq:G1149.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G906.2,Nipponbare.root_G691.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25439082	25440898	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0634500;Name=OsNip_LAC2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25439082	25440898	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0634500-00;Parent=gene:OsNip_01g0634500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25439082	25439212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;Name=OsNip_01t0634500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0634500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25439082	25439212	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;protein_id=OsNip_01t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25439323	25440249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;Name=OsNip_01t0634500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0634500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25439323	25440249	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;protein_id=OsNip_01t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25440348	25440876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;protein_id=OsNip_01t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25440348	25440898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;Name=OsNip_01t0634500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0634500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25440877	25440898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25442124	25444228	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0634600;Name=OsNip_PME4;biotype=protein_coding;description=Pectin;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25442602	25444219	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0634600-00;Parent=gene:OsNip_01g0634600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0634600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25442602	25442746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0634600-00;Name=OsNip_01t0634600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0634600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25442602	25442746	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0634600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0634600-00;protein_id=OsNip_01t0634600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25463434	25463635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635200-01;Name=OsNip_01t0635200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0635200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25468391	25468591	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0635400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0635400-02;protein_id=OsNip_01t0635400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25468592	25468608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25476388	25477555	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0635550;Name=OsNip_ZHD5;biotype=protein_coding;description=ZF-HD;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25476388	25477555	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0635550-00;Parent=gene:OsNip_01g0635550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0635550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25476388	25477555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635550-00;Name=OsNip_01t0635550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0635550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25476744	25477442	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0635550-00;Parent=transcript:OsNip_01t0635550-00;protein_id=OsNip_01t0635550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25477443	25477555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25478689	25483004	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0635600;Name=OsNip_ZHD5;biotype=protein_coding;description=Trimeric;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25478689	25483004	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0635600-00;Parent=gene:OsNip_01g0635600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0635600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25478689	25481033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635600-00;Name=OsNip_01t0635600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0635600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25478689	25481033	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0635600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0635600-00;protein_id=OsNip_01t0635600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25482824	25482863	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0635600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0635600-00;protein_id=OsNip_01t0635600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25482824	25483004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635600-00;Name=OsNip_01t0635600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0635600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25482864	25483004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25481887	25483035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25481887	25484008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635800-01;Name=OsNip_01t0635800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0635800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25483036	25483260	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0635800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0635800-01;protein_id=OsNip_01t0635800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25483261	25484008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0635800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25490150	25490661	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0636100;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25490150	25490661	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0636100-01;Parent=gene:OsNip_01g0636100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0636100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25490150	25490661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636100-01;Name=OsNip_01t0636100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0636100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25492188	25492237	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0636200;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25492188	25492237	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0636200-00;Parent=gene:OsNip_01g0636200;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0636200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25492188	25492237	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636200-00;Name=OsNip_01t0636200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0636200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	25501902	25504409	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0636400;biotype=protein_coding;description=Alpha/beta;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25501902	25504409	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0636400-01;Parent=gene:OsNip_01g0636400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25501902	25502103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25501902	25502245	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;Name=OsNip_01t0636400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0636400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25502104	25502245	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0636400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;protein_id=OsNip_01t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25502354	25502421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;Name=OsNip_01t0636400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0636400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25502354	25502421	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0636400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;protein_id=OsNip_01t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25503253	25503342	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;Name=OsNip_01t0636400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0636400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25503253	25503342	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0636400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;protein_id=OsNip_01t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25503493	25503903	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0636400-01;Name=OsNip_01t0636400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0636400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	25748192	25748602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0640700-01;Tag=IsoSeq:G1164.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G545.1,Nipponbare.panicle_G915.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9E986";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	25766047	25766525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641100-01;Name=OsNip_01t0641100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0641100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25766130	25766525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	25777616	25781934	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0641700-01;Parent=gene:OsNip_01g0641700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0641700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25777616	25777873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25777616	25778026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;Name=OsNip_01t0641700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0641700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25777874	25778026	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0641700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;protein_id=OsNip_01t0641700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25778618	25778657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;Name=OsNip_01t0641700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0641700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25778618	25778657	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0641700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;protein_id=OsNip_01t0641700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25778749	25778862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;Name=OsNip_01t0641700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0641700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25778749	25778862	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0641700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0641700-01;protein_id=OsNip_01t0641700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25842244	25842344	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0642900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0642900-01;protein_id=OsNip_01t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25842863	25843089	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0642900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0642900-01;protein_id=OsNip_01t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25843189	25843461	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0642900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0642900-01;protein_id=OsNip_01t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25843189	25843494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0642900-01;Name=OsNip_01t0642900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0642900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25843462	25843494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25882035	25882114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0643600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0643600-00;protein_id=OsNip_01t0643600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	25883577	25883649	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0643600-00;Parent=transcript:OsNip_01t0643600-00;protein_id=OsNip_01t0643600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	25883577	25883718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0643600-00;Name=OsNip_01t0643600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0643600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25883650	25883718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0643600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26037119	26039015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0646000-02;Tag=IsoSeq:G1177.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G552.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YNN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26044168	26045843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0646300-01;Name=OsNip_01t0646300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0646300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26051925	26052112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0646400-01;Name=OsNip_01t0646400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0646400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26052213	26052291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0646400-01;Name=OsNip_01t0646400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0646400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26111955	26112136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26112494	26112496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26115235	26117702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;Name=OsNip_01t0647850-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0647850-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26115235	26117702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26118337	26118418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;Name=OsNip_01t0647850-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0647850-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26118809	26119288	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0647850-01;Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;protein_id=OsNip_01t0647850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26118809	26119289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;Name=OsNip_01t0647850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0647850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26119289	26119289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0647850-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26119741	26126165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0648000-01;Parent=gene:OsNip_01g0648000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0648000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26119741	26120052	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0648000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26121496	26121693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0648000-01;Name=OsNip_01t0648000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0648000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26200975	26201321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0649200-01;Name=OsNip_01t0649200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0649200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26201256	26201321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0649200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26272066	26272320	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0650200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0650200-03;protein_id=OsNip_01t0650200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	26249831	26250049	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0650200-04;Parent=transcript:OsNip_01t0650200-04;protein_id=OsNip_01t0650200-04;Tag=IsoSeq:G1188.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G556.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	26249399	26249400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0650200-04;Tag=IsoSeq:G1188.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G556.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26264400	26264597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0650200-04;Tag=IsoSeq:G1188.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G556.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26267753	26268020	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0650501;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26267753	26268020	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0650501-00;Parent=gene:OsNip_01g0650501;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0650501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26267753	26268020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0650501-00;Name=OsNip_01t0650501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0650501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26278076	26280346	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0650700;biotype=protein_coding;description=Transposase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26278076	26280346	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0650700-01;Parent=gene:OsNip_01g0650700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0650700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26278076	26278465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0650700-01;Name=OsNip_01t0650700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0650700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26374016	26374047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26383595	26387037	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0652300-01;Parent=gene:OsNip_01g0652300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0652300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26383595	26383895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26383595	26383947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;Name=OsNip_01t0652300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0652300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26383896	26383947	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0652300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;protein_id=OsNip_01t0652300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26386684	26386910	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0652300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;protein_id=OsNip_01t0652300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26386684	26387037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;Name=OsNip_01t0652300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0652300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26386911	26387037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	26383604	26386939	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0652300-02;Parent=gene:OsNip_01g0652300;transcript_id=OsNip_01t0652300-02;Tag=IsoSeq:G1194.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G717.3
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Chr01	TAMA	CDS	26386658	26386939	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0652300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0652300-02;protein_id=OsNip_01t0652300-02;Tag=IsoSeq:G1194.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G717.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9VHZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26386323	26386655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-02;Tag=IsoSeq:G1194.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G717.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9VHZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26383604	26384355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652300-02;Tag=IsoSeq:G1194.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G717.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9VHZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26383821	26387010	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0652375;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26383821	26387010	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0652375-00;Parent=gene:OsNip_01g0652375;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0652375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26402782	26403477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652800-01;Name=OsNip_01t0652800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0652800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26401702	26402017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652800-04;Name=OsNip_01t0652800-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0652800-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26402017	26402017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0652800-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26414917	26414973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26414917	26415679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;Name=OsNip_01t0653100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0653100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26414974	26415679	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0653100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;protein_id=OsNip_01t0653100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26415761	26416026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;Name=OsNip_01t0653100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0653100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26415761	26416026	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0653100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;protein_id=OsNip_01t0653100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26418472	26418855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;Name=OsNip_01t0653100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0653100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26418472	26418855	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0653100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0653100-00;protein_id=OsNip_01t0653100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	26414713	26416235	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0653100-01;Parent=gene:OsNip_01g0653100;transcript_id=OsNip_01t0653100-01;Tag=IsoSeq:G1197.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G720.1
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Chr01	TAMA	CDS	26415632	26415653	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0653100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0653100-01;protein_id=OsNip_01t0653100-01;Tag=IsoSeq:G1197.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G720.1;prot_id "UniRef90_I1GZ37";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	26415927	26416235	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-01;Tag=IsoSeq:G1197.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G720.1;prot_id "UniRef90_I1GZ37";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26414713	26415629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653100-01;Tag=IsoSeq:G1197.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G720.1;prot_id "UniRef90_I1GZ37";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26420263	26420331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26420263	26421981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653200-01;Name=OsNip_01t0653200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0653200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26420332	26421843	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0653200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0653200-01;protein_id=OsNip_01t0653200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26421844	26421981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26423510	26423740	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0653300;Name=OsNip_VQ2;biotype=protein_coding;description=VQ;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26423510	26423740	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0653300-00;Parent=gene:OsNip_01g0653300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0653300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26423510	26423740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653300-00;Name=OsNip_01t0653300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0653300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26423510	26423740	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0653300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0653300-00;protein_id=OsNip_01t0653300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26428183	26429329	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0653350;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26428183	26429329	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0653350-00;Parent=gene:OsNip_01g0653350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0653350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26428183	26428423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653350-00;Name=OsNip_01t0653350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0653350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26428183	26428423	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0653350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0653350-00;protein_id=OsNip_01t0653350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26428881	26429329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0653350-00;Name=OsNip_01t0653350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0653350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26520599	26520699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0654150-00;Name=OsNip_01t0654150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0654150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26522784	26527301	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0654200;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26522784	26527301	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0654200-01;Parent=gene:OsNip_01g0654200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0654200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26522784	26523127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0654200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26522784	26523304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0654200-01;Name=OsNip_01t0654200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0654200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26523128	26523304	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0654200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0654200-01;protein_id=OsNip_01t0654200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26573702	26573815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0654900-00;Name=OsNip_01t0654900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0654900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	26591284	26591461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t065524A-01;Name=OsNip_01t065524A-01-E1;exon_id=OsNip_01t065524A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1204.1;Source=Nipponbare.panicle_G945.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	26591286	26591438	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t065524A-01;Parent=transcript:OsNip_01t065524A-01;protein_id=OsNip_01t065524A-01;Tag=IsoSeq:G1204.1;Source=Nipponbare.panicle_G945.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	26591284	26591285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t065524A-01;Tag=IsoSeq:G1204.1;Source=Nipponbare.panicle_G945.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26591442	26591461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t065524A-01;Tag=IsoSeq:G1204.1;Source=Nipponbare.panicle_G945.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26592688	26593702	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0655250;biotype=protein_coding;description=PWWP;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26592688	26593702	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0655250-00;Parent=gene:OsNip_01g0655250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0655250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26592688	26593143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655250-00;Name=OsNip_01t0655250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0655250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26593243	26593298	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655250-00;Name=OsNip_01t0655250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0655250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26593243	26593298	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0655250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0655250-00;protein_id=OsNip_01t0655250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26593489	26593702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655250-00;Name=OsNip_01t0655250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0655250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26593489	26593702	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0655250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0655250-00;protein_id=OsNip_01t0655250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26599136	26599632	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0655300;Name=OsNip_SET2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26599136	26599632	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0655300-01;Parent=gene:OsNip_01g0655300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26599136	26599137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26599307	26599397	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0655300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0655300-01;protein_id=OsNip_01t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26599307	26599632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655300-01;Name=OsNip_01t0655300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0655300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26599398	26599632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26601979	26608476	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0655400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26601979	26604359	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0655400-03;Parent=gene:OsNip_01g0655400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26601979	26602311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26601979	26602703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;Name=OsNip_01t0655400-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0655400-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26602312	26602703	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0655400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;protein_id=OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26602782	26603349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;Name=OsNip_01t0655400-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0655400-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26602782	26603349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0655400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;protein_id=OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26603527	26603619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;Name=OsNip_01t0655400-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0655400-01-E4;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26603527	26603619	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0655400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;protein_id=OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26603706	26604359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;Name=OsNip_01t0655400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0655400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26603706	26604359	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0655400-03;Parent=transcript:OsNip_01t0655400-03;protein_id=OsNip_01t0655400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26602273	26608476	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0655400-01;Parent=gene:OsNip_01g0655400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0655400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26602273	26602311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0655400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26704255	26704430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0656600-02;Tag=IsoSeq:G1210.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G730.2,Nipponbare.panicle_G949.1,Nipponbare.root_G730.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3Y0F0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	26699280	26703788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0656600-02;Tag=IsoSeq:G1210.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G730.2,Nipponbare.panicle_G949.1,Nipponbare.root_G730.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3Y0F0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26722728	26722874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0657000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26722875	26722977	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0657000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0657000-01;protein_id=OsNip_01t0657000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26724409	26724515	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0657000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0657000-01;protein_id=OsNip_01t0657000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26724409	26724906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0657000-01;Name=OsNip_01t0657000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0657000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	26822203	26823850	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0659400;Name=OsNip_miR319a;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26822203	26823850	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0659400-01;Parent=gene:OsNip_01g0659400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0659400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26822203	26823564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0659400-01;Name=OsNip_01t0659400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0659400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26823672	26823850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0659400-01;Name=OsNip_01t0659400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0659400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26862081	26863434	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0659800;biotype=protein_coding;description=C2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26862081	26862209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0659800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	26862081	26863434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0659800-01;Name=OsNip_01t0659800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0659800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	26862210	26863100	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0659800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0659800-01;protein_id=OsNip_01t0659800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26863101	26863434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0659800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	26872217	26875031	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0659900;Name=OsNip_FBK1;biotype=protein_coding;description=Kelch-domain-containing;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	26872217	26875031	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0659900-01;Parent=gene:OsNip_01g0659900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0659900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	26895768	26895926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0660300-01;Name=OsNip_01t0660300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0660300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27042297	27042432	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0662300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0662300-01;protein_id=OsNip_01t0662300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27042433	27042644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	27041849	27041849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662300-02;Tag=IsoSeq:G1226.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G963.2;prot_id "UniRef90_A0A103YHG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	27042471	27042589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662300-02;Tag=IsoSeq:G1226.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G963.2;prot_id "UniRef90_A0A103YHG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	27047365	27050478	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0662600;Name=OsNip_ISC6;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	27047365	27050417	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0662600-04;Parent=gene:OsNip_01g0662600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0662600-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27047365	27050003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662600-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27047365	27050417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662600-04;Name=OsNip_01t0662600-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0662600-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27050004	27050375	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0662600-04;Parent=transcript:OsNip_01t0662600-04;protein_id=OsNip_01t0662600-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27050376	27050417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0662600-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	27047492	27050427	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0662600-02;Parent=gene:OsNip_01g0662600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0662600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	27177093	27177172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-01;Name=OsNip_01t0665200-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0665200-03-E4;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27177093	27177172	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0665200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0665200-01;protein_id=OsNip_01t0665200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27177257	27177681	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0665200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0665200-01;protein_id=OsNip_01t0665200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27177257	27178237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-01;Name=OsNip_01t0665200-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0665200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27177682	27178237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27171711	27172064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27171711	27172115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;Name=OsNip_01t0665200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0665200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27172065	27172115	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0665200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;protein_id=OsNip_01t0665200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27173401	27173809	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;Name=OsNip_01t0665200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0665200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27173401	27173809	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0665200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;protein_id=OsNip_01t0665200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27174394	27174431	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0665200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;protein_id=OsNip_01t0665200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27174394	27176017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;Name=OsNip_01t0665200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0665200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27174432	27176017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0665200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	27265994	27266432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0666800-01;Name=OsNip_01t0666800-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0666800-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	27302367	27302710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0667550-00;Name=OsNip_01t0667550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0667550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27302710	27302710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0667550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27303264	27303575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0667700-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27337691	27337739	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0668000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0668000-02;protein_id=OsNip_01t0668000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27338309	27338451	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0668000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0668000-02;protein_id=OsNip_01t0668000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27338934	27339020	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0668000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0668000-02;protein_id=OsNip_01t0668000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27338934	27339335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668000-02;Name=OsNip_01t0668000-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0668000-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27339021	27339335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	27336218	27336459	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0668000-03;Parent=gene:OsNip_01g0668000;transcript_id=OsNip_01t0668000-03;Tag=IsoSeq:G1251.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G581.1
Chr01	TAMA	exon	27336218	27336459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668000-03;Name=OsNip_01t0668000-03;exon_id=OsNip_01t0668000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1251.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G581.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	27336220	27336429	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0668000-03;Parent=transcript:OsNip_01t0668000-03;protein_id=OsNip_01t0668000-03;Tag=IsoSeq:G1251.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G581.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	27336218	27336219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668000-03;Tag=IsoSeq:G1251.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G581.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	27336433	27336459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668000-03;Tag=IsoSeq:G1251.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G581.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	27340911	27341950	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0668100;Name=OsNip_FLA7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	27340911	27341950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0668100-01;Parent=gene:OsNip_01g0668100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0668100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27340911	27341153	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27340911	27341950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668100-01;Name=OsNip_01t0668100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0668100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27341154	27341897	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0668100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0668100-01;protein_id=OsNip_01t0668100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27341898	27341950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0668100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	27340911	27341950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0668100-02;Parent=gene:OsNip_01g0668100;transcript_id=OsNip_01t0668100-02;Tag=IsoSeq:G1252.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G755.3
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27598509	27598806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27608639	27608639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	27623546	27623897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672600-01;Name=OsNip_01t0672600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0672600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	27624620	27630340	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0672700-01;Parent=gene:OsNip_01g0672700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0672700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27629931	27630111	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0672700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0672700-01;protein_id=OsNip_01t0672700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27629931	27630340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672700-01;Name=OsNip_01t0672700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0672700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27630112	27630340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	27624723	27630339	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0672700-02;Parent=gene:OsNip_01g0672700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0672700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27624723	27624857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	27624723	27625290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;Name=OsNip_01t0672700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0672700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27624858	27625290	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0672700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;protein_id=OsNip_01t0672700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27625702	27625812	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0672700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;protein_id=OsNip_01t0672700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	27626519	27626614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;Name=OsNip_01t0672700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0672700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27626519	27626614	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0672700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0672700-02;protein_id=OsNip_01t0672700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27860530	27860799	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0677500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0677500-00;protein_id=OsNip_01t0677500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	27860880	27860943	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0677500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0677500-00;protein_id=OsNip_01t0677500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28102050	28102079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0682001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28130510	28132559	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0682700-01;Parent=gene:OsNip_01g0682700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0682700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28130510	28132559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0682700-01;Name=OsNip_01t0682700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0682700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28131994	28132559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0682700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28136367	28143339	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0683100-01;Parent=gene:OsNip_01g0683100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0683100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28137419	28137887	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0683100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0683100-01;protein_id=OsNip_01t0683100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28142725	28143339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683100-01;Name=OsNip_01t0683100-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0683100-02-E6;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28143007	28143339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28137679	28137680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28137679	28137887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683100-02;Name=OsNip_01t0683100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0683100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28140347	28140544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683100-02;Name=OsNip_01t0683100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0683100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28140347	28140544	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0683100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0683100-02;protein_id=OsNip_01t0683100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28177038	28177756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0683700-02;Tag=IsoSeq:G1302.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G791.1;prot_id "UniRef90_UPI0007721A63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28231704	28231958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28233352	28233420	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0684800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;protein_id=OsNip_01t0684800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28233610	28233687	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0684800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;protein_id=OsNip_01t0684800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28233833	28234495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;Name=OsNip_01t0684800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0684800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28234115	28234495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28234591	28234854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0684800-01;Name=OsNip_01t0684800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0684800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28246063	28246259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28246607	28247165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28247166	28247597	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0685300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0685300-01;protein_id=OsNip_01t0685300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28247598	28248021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28250506	28251508	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0685400-01;Parent=gene:OsNip_01g0685400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0685400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28250506	28250587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28250506	28251508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-01;Name=OsNip_01t0685400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0685400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28250588	28251292	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0685400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0685400-01;protein_id=OsNip_01t0685400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28251293	28251508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	28249922	28251613	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0685400-02;Parent=gene:OsNip_01g0685400;transcript_id=OsNip_01t0685400-02;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2
Chr01	TAMA	exon	28249922	28250285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;Name=OsNip_01t0685400-02;exon_id=OsNip_01t0685400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	28249923	28250075	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0685400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;protein_id=OsNip_01t0685400-02;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	28250373	28250465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;Name=OsNip_01t0685400-02;exon_id=OsNip_01t0685400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	28250607	28250607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;Name=OsNip_01t0685400-02;exon_id=OsNip_01t0685400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	28250622	28251613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;Name=OsNip_01t0685400-02;exon_id=OsNip_01t0685400-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	28249922	28249922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0685400-02;Tag=IsoSeq:G1306.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G794.2;prot_id "UniRef90_F2D2Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28295136	28299994	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0686100-01;Parent=gene:OsNip_01g0686100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28295136	28295656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Name=OsNip_01t0686100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0686100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28295136	28295656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28295751	28295828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28296789	28296892	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28297372	28297465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28297564	28299994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Name=OsNip_01t0686100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0686100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28299602	28299802	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0686100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;protein_id=OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28299803	28299994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28295763	28299924	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0686100-02;Parent=gene:OsNip_01g0686100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0686100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28295763	28295828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-02;Name=OsNip_01t0686100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0686100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28295763	28295828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28322583	28322660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28342915	28343649	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0687150-00;Parent=gene:OsNip_01g0687150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0687150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28346887	28347003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28350010	28350882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687300-01;Name=OsNip_01t0687300-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0687300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28350742	28350882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28346074	28346412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687300-02;Name=OsNip_01t0687300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0687300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28346074	28346412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28363993	28364628	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0687450-00;Parent=gene:OsNip_01g0687450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0687450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28363993	28364628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687450-00;Name=OsNip_01t0687450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0687450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28364351	28364628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28364038	28364062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28367231	28367428	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0687500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0687500-01;protein_id=OsNip_01t0687500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28367511	28367603	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0687500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0687500-01;protein_id=OsNip_01t0687500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28367511	28368033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687500-01;Name=OsNip_01t0687500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0687500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28367604	28368033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28378929	28379546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0687850-00;Name=OsNip_01t0687850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0687850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28378929	28379546	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0687850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0687850-00;protein_id=OsNip_01t0687850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28425816	28427634	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0688900-00;Parent=gene:OsNip_01g0688900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0688900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28448373	28448444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0689451-02;Name=OsNip_01t0689451-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0689451-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28451981	28452152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0689451-02;Name=OsNip_01t0689451-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0689451-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28452967	28454211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0689451-02;Name=OsNip_01t0689451-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0689451-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28457398	28457607	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0689451-02;Parent=transcript:OsNip_01t0689451-02;protein_id=OsNip_01t0689451-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28458472	28458977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0689451-02;Name=OsNip_01t0689451-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0689451-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28538984	28539322	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0691300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0691300-01;protein_id=OsNip_01t0691300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28539955	28541359	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0691400-00;Parent=gene:OsNip_01g0691400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0691400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28575815	28576169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28576599	28576674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28578164	28582752	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0692500-00;Parent=gene:OsNip_01g0692500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0692500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28578164	28578557	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0692500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0692500-00;protein_id=OsNip_01t0692500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28578647	28578716	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0692500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0692500-00;protein_id=OsNip_01t0692500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28579773	28580473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692500-00;Name=OsNip_01t0692500-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0692500-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28579778	28580473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28580570	28580655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692500-00;Name=OsNip_01t0692500-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0692500-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28585578	28585781	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0692700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0692700-01;protein_id=OsNip_01t0692700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28586376	28586498	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0692700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0692700-01;protein_id=OsNip_01t0692700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28586376	28586500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692700-01;Name=OsNip_01t0692700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0692700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	28586376	28586985	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0692700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;protein_id=OsNip_01t0692700-02;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	CDS	28585605	28585781	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0692700-02;Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;protein_id=OsNip_01t0692700-02;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	exon	28583193	28583442	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;Name=OsNip_01t0692700-02;exon_id=OsNip_01t0692700-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28583779	28583828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28583552	28583704	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28583193	28583442	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0692700-02;Tag=IsoSeq:G1330.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1038.2;prot_id "UniRef90_UPI000C875D45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28599291	28599294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0693100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28599291	28599516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0693100-00;Name=OsNip_01t0693100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0693100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28835283	28835294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0696800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28835295	28835339	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0696800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0696800-02;protein_id=OsNip_01t0696800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28835697	28836853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0696800-02;Name=OsNip_01t0696800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0696800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28849660	28849719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28854747	28855282	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0697250;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28854747	28855282	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0697250-00;Parent=gene:OsNip_01g0697250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0697250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28854747	28854748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28854747	28855093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697250-00;Name=OsNip_01t0697250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0697250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28854749	28855093	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0697250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0697250-00;protein_id=OsNip_01t0697250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28855178	28855282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697250-00;Name=OsNip_01t0697250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0697250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28855178	28855282	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0697250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0697250-00;protein_id=OsNip_01t0697250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28870424	28872647	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0697400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28870424	28872556	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0697400-00;Parent=gene:OsNip_01g0697400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0697400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28870424	28870747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697400-00;Name=OsNip_01t0697400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0697400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28870424	28870747	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0697400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0697400-00;protein_id=OsNip_01t0697400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28872319	28872555	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0697400-00;Parent=transcript:OsNip_01t0697400-00;protein_id=OsNip_01t0697400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28872319	28872556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697400-00;Name=OsNip_01t0697400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0697400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28872556	28872556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	28871845	28872647	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0697400-01;Parent=gene:OsNip_01g0697400;transcript_id=OsNip_01t0697400-01;Tag=IsoSeq:G1348.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1052.1
Chr01	TAMA	exon	28871845	28872647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697400-01;Name=OsNip_01t0697400-01;exon_id=OsNip_01t0697400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1348.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1052.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4K2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	28872252	28872647	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0697400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0697400-01;protein_id=OsNip_01t0697400-01;Tag=IsoSeq:G1348.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1052.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4K2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28871845	28872249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697400-01;Tag=IsoSeq:G1348.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1052.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4K2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28874539	28875033	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0697700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28874539	28875033	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0697700-00;Parent=gene:OsNip_01g0697700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0697700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28874539	28875033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0697700-00;Name=OsNip_01t0697700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0697700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28874539	28875033	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0697700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0697700-00;protein_id=OsNip_01t0697700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28881515	28882954	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0698000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28881515	28882954	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0698000-02;Parent=gene:OsNip_01g0698000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0698000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28881515	28881815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28881515	28882954	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698000-02;Name=OsNip_01t0698000-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28881816	28882859	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0698000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0698000-02;protein_id=OsNip_01t0698000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28882860	28882954	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28885430	28890828	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0698100;biotype=protein_coding;description=SWAP/Surp;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28885452	28890777	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0698100-01;Parent=gene:OsNip_01g0698100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0698100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28885452	28885553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28885452	28885863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698100-01;Name=OsNip_01t0698100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	28889311	28890828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698100-03;Tag=IsoSeq:G1350.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1054.3;prot_id "UniRef90_A0A287LEG7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28891193	28892278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698200-00;Name=OsNip_01t0698200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0698200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28891406	28892278	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0698200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0698200-00;protein_id=OsNip_01t0698200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28892894	28893019	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698300-01;Name=OsNip_01t0698300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28894264	28895749	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0698300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0698300-02;protein_id=OsNip_01t0698300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28895837	28895907	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0698300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0698300-02;protein_id=OsNip_01t0698300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28896901	28897172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698300-02;Name=OsNip_01t0698300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28896901	28897172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28900223	28903951	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0698500;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28900223	28903951	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0698500-01;Parent=gene:OsNip_01g0698500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0698500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28900223	28900488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698500-01;Name=OsNip_01t0698500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28903781	28903951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698500-01;Name=OsNip_01t0698500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	28910198	28911081	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0698800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28910215	28911081	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0698800-01;Parent=gene:OsNip_01g0698800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0698800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28910215	28910362	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28910215	28911081	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698800-01;Name=OsNip_01t0698800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0698800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28910363	28910998	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0698800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0698800-01;protein_id=OsNip_01t0698800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28910999	28911081	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0698800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	28964966	28965232	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0699950-01;Parent=transcript:OsNip_01t0699950-01;protein_id=OsNip_01t0699950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	28964966	28968109	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0699950-01;Name=OsNip_01t0699950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0699950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28965233	28968109	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0699950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	28970632	28974258	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0700000-01;Parent=gene:OsNip_01g0700000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0700000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28970632	28970748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0700000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	28971239	28971720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0700000-01;Name=OsNip_01t0700000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0700000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29036414	29036601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0701350-00;Name=OsNip_01t0701350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0701350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29040686	29040724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0701350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29040843	29040948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0701350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29041034	29041387	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0701350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29046232	29047039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0701500-01;Name=OsNip_01t0701500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0701500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29161253	29161304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703400-01;Name=OsNip_01t0703400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0703400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29161907	29161978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703400-01;Name=OsNip_01t0703400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0703400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29161907	29161978	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0703400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0703400-01;protein_id=OsNip_01t0703400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29162233	29162547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703400-01;Name=OsNip_01t0703400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0703400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29162362	29162547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29166421	29170361	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0703600-01;Parent=gene:OsNip_01g0703600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29166421	29166660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29166661	29166789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0703600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;protein_id=OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29166891	29167040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;Name=OsNip_01t0703600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0703600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29166891	29167040	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0703600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;protein_id=OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29168885	29168992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;Name=OsNip_01t0703600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0703600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29168885	29168992	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0703600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;protein_id=OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29169079	29169175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;Name=OsNip_01t0703600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0703600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29169079	29169175	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0703600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;protein_id=OsNip_01t0703600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29169283	29169380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0703600-01;Name=OsNip_01t0703600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0703600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29202204	29202408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29203674	29203750	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0704300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0704300-01;protein_id=OsNip_01t0704300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29203674	29203802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-01;Name=OsNip_01t0704300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0704300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29203751	29203802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	29202288	29203805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-02;Name=OsNip_01t0704300-02;exon_id=OsNip_01t0704300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1373.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1067.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1FGG9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	29203221	29203634	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0704300-02;protein_id=OsNip_01t0704300-02;Tag=IsoSeq:G1373.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1067.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1FGG9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	29203635	29203805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-02;Tag=IsoSeq:G1373.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1067.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1FGG9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	29202288	29203218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704300-02;Tag=IsoSeq:G1373.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1067.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1FGG9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	29206326	29209606	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0704400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29206326	29209606	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0704400-01;Parent=gene:OsNip_01g0704400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0704400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29206326	29207379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;Name=OsNip_01t0704400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0704400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29206326	29207379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29208101	29208408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29208101	29208557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;Name=OsNip_01t0704400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0704400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29208409	29208557	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0704400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;protein_id=OsNip_01t0704400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29208685	29208753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0704400-01;Name=OsNip_01t0704400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0704400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29249803	29250112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0705500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	29247032	29247147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0705500-02;Name=OsNip_01t0705500-02;exon_id=OsNip_01t0705500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1378.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1071.3;prot_id "UniRef90_B4FKL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	29247032	29247147	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0705500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0705500-02;protein_id=OsNip_01t0705500-02;Tag=IsoSeq:G1378.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1071.3;prot_id "UniRef90_B4FKL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29271457	29272285	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0705700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0705700-01;protein_id=OsNip_01t0705700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29272325	29272878	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0705700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0705700-01;protein_id=OsNip_01t0705700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29272325	29273175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0705700-01;Name=OsNip_01t0705700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0705700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29272879	29273175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0705700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29298120	29298339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706332-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29315368	29315377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29315625	29315791	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0706500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0706500-00;protein_id=OsNip_01t0706500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29317540	29318156	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706600-00;Name=OsNip_01t0706600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0706600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29317817	29318156	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	29318195	29322563	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0706700;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29318195	29322559	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0706700-01;Parent=gene:OsNip_01g0706700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0706700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29318195	29318491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29318195	29318602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706700-01;Name=OsNip_01t0706700-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0706700-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29318492	29318602	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0706700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0706700-01;protein_id=OsNip_01t0706700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29318951	29319058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0706700-01;Name=OsNip_01t0706700-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0706700-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29427418	29427479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708300-02;Name=OsNip_01t0708300-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0708300-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	29431941	29434694	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0708350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29431941	29432009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29432793	29432909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29432994	29433148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29433403	29433507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29433608	29434281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29434357	29434480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29434559	29434694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708350-00;Name=OsNip_01t0708350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	29431658	29436450	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0708400;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29436121	29436450	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0708400-01;Parent=gene:OsNip_01g0708400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0708400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29436121	29436450	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708400-01;Name=OsNip_01t0708400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0708400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	29431658	29436438	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0708400-02;Parent=gene:OsNip_01g0708400;transcript_id=OsNip_01t0708400-02;Tag=IsoSeq:G1390.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G849.5,Nipponbare.panicle_G1083.1,Nipponbare.panicle_G1083.2,Nipponbare.root_G849.1,Nipponbare.root_G849.3,Nipponbare.root_G849.4,Nipponbare.leaf_G645.2
Chr01	TAMA	exon	29431658	29432017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0708400-02;Name=OsNip_01t0708400-02;exon_id=OsNip_01t0708400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1390.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G849.5,Nipponbare.panicle_G1083.1,Nipponbare.panicle_G1083.2,Nipponbare.root_G849.1,Nipponbare.root_G849.3,Nipponbare.root_G849.4,Nipponbare.leaf_G645.2;prot_id "UniRef90_A0A287LFN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	29431660	29431848	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0708400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0708400-02;protein_id=OsNip_01t0708400-02;Tag=IsoSeq:G1390.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G849.5,Nipponbare.panicle_G1083.1,Nipponbare.panicle_G1083.2,Nipponbare.root_G849.1,Nipponbare.root_G849.3,Nipponbare.root_G849.4,Nipponbare.leaf_G645.2;prot_id "UniRef90_A0A287LFN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29482107	29482865	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709400-01;Name=OsNip_01t0709400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0709400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29483251	29483634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29483251	29484259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Name=OsNip_01t0709500-04-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0709500-04-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29483635	29484259	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0709500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;protein_id=OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29484343	29484586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Name=OsNip_01t0709500-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0709500-03-E7;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29484343	29484586	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0709500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;protein_id=OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29485056	29485457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Name=OsNip_01t0709500-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0709500-03-E6;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29485056	29485457	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0709500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;protein_id=OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29486109	29486223	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0709500-04;Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;protein_id=OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29486109	29486225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Name=OsNip_01t0709500-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0709500-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29486224	29486225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29483262	29484259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-02;Name=OsNip_01t0709500-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0709500-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29483262	29484259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29484343	29484586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-02;Name=OsNip_01t0709500-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0709500-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29484343	29484586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0709500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29575159	29575578	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0711600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0711600-01;protein_id=OsNip_01t0711600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29575159	29575622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711600-01;Name=OsNip_01t0711600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0711600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581112	29581360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711700-00;Name=OsNip_01t0711700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0711700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581467	29581747	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711700-00;Name=OsNip_01t0711700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0711700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29582208	29582353	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711700-00;Name=OsNip_01t0711700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0711700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29582793	29582886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711700-00;Name=OsNip_01t0711700-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0711700-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29580715	29580853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29580715	29580853	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0711800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;protein_id=OsNip_01t0711800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581043	29581086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29581043	29581086	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0711800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;protein_id=OsNip_01t0711800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581177	29581345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581450	29581637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29581824	29581888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29582245	29582337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29582245	29582337	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0711800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;protein_id=OsNip_01t0711800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29583002	29583046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711800-00;Name=OsNip_01t0711800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0711800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	29584058	29584603	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0711900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29584058	29584603	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0711900-01;Parent=gene:OsNip_01g0711900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0711900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29584058	29584058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29584058	29584603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711900-01;Name=OsNip_01t0711900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0711900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29584059	29584490	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0711900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0711900-01;protein_id=OsNip_01t0711900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29584491	29584603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0711900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	29597417	29598085	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0712500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29597417	29598085	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0712500-00;Parent=gene:OsNip_01g0712500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0712500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29597417	29598085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0712500-00;Name=OsNip_01t0712500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0712500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29597417	29598085	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0712500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0712500-00;protein_id=OsNip_01t0712500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29648730	29648810	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0713800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0713800-00;protein_id=OsNip_01t0713800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29648909	29649037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0713800-00;Name=OsNip_01t0713800-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0713800-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29648909	29649037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0713800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0713800-00;protein_id=OsNip_01t0713800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	gene	29652601	29657347	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g071389A;Tag=IsoSeq:G1407
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Chr01	TAMA	CDS	29657196	29657347	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t071389A-01;Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;protein_id=OsNip_01t071389A-01;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	CDS	29656887	29657054	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t071389A-01;Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;protein_id=OsNip_01t071389A-01;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	CDS	29656641	29656808	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t071389A-01;Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;protein_id=OsNip_01t071389A-01;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	exon	29655530	29655622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;Name=OsNip_01t071389A-01-E7;exon_id=OsNip_01t071389A-01-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	29655530	29655622	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t071389A-01;Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;protein_id=OsNip_01t071389A-01;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	29655355	29655435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;Name=OsNip_01t071389A-01-E8;exon_id=OsNip_01t071389A-01-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	29655355	29655435	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t071389A-01;Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;protein_id=OsNip_01t071389A-01;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	29655075	29655269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t071389A-01;Name=OsNip_01t071389A-01-E9;exon_id=OsNip_01t071389A-01-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G1407.1;Source=Nipponbare.root_G862.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29670703	29670733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0713900-01;Name=OsNip_01t0713900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0713900-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29679124	29679462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0714100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29680684	29680736	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0714100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0714100-01;protein_id=OsNip_01t0714100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29680684	29680754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0714100-01;Name=OsNip_01t0714100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0714100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29680737	29680754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0714100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	29688208	29688640	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0714225-00;Parent=gene:OsNip_01g0714225;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0714225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29688208	29688595	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0714225-00;Parent=transcript:OsNip_01t0714225-00;protein_id=OsNip_01t0714225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29688208	29688640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0714225-00;Name=OsNip_01t0714225-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0714225-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29688596	29688640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0714225-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29830265	29830497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29830321	29830497	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;protein_id=OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29830625	29830745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29830625	29830745	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;protein_id=OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29831846	29831917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832312	29832399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832630	29832737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832846	29833648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29833956	29834142	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29834670	29834778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29834670	29834778	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;protein_id=OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29834869	29835011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29834869	29835011	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;protein_id=OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29835559	29835781	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;protein_id=OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29835559	29836090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Name=OsNip_01t0716800-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29835782	29836090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29830302	29830320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29830302	29830497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0716800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29830321	29830497	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29830625	29830745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29830625	29830745	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29831846	29831917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29831846	29831917	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832312	29832399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29832312	29832399	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832630	29832737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29832630	29832737	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29832846	29833648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0716800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29832846	29833648	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	29833956	29834045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;Name=OsNip_01t0716800-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0716800-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	29833956	29834045	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0716800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-02;protein_id=OsNip_01t0716800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	29830266	29830793	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0716800-03;Parent=gene:OsNip_01g0716800;transcript_id=OsNip_01t0716800-03;Tag=IsoSeq:G1416.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G658.2
Chr01	TAMA	exon	29830266	29830793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-03;Name=OsNip_01t0716800-03;exon_id=OsNip_01t0716800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1416.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G658.2;prot_id "UniRef90_B9EZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	29830266	29830511	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0716800-03;Parent=transcript:OsNip_01t0716800-03;protein_id=OsNip_01t0716800-03;Tag=IsoSeq:G1416.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G658.2;prot_id "UniRef90_B9EZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	29830515	29830793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0716800-03;Tag=IsoSeq:G1416.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G658.2;prot_id "UniRef90_B9EZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29993472	29994075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719300-01;Name=OsNip_01t0719300-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0719300-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	29988269	29988668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719350-00;Name=OsNip_01t0719350-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0719350-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29988269	29988668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29988765	29988960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30015207	30015371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30011021	30011287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0719700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0719700-00;protein_id=OsNip_01t0719700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30011772	30011903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0719700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30020954	30021230	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0720200-01;Parent=gene:OsNip_01g0720200;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0720200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30020954	30021230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0720200-01;Name=OsNip_01t0720200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0720200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30021240	30023716	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0720300-00;Parent=gene:OsNip_01g0720300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0720300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30060594	30060870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0721000-02;Tag=IsoSeq:G1433.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G881.1,Nipponbare.panicle_G1115.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9IQ18";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30083992	30085482	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0721500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0721500-01;protein_id=OsNip_01t0721500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30088521	30088871	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0721700-00;Parent=gene:OsNip_01g0721700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0721700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30088521	30088871	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0721700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0721700-00;protein_id=OsNip_01t0721700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30091365	30091440	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0721800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30091441	30092964	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0721800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0721800-01;protein_id=OsNip_01t0721800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30092965	30093186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0721800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30095422	30098794	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0721900-01;Parent=gene:OsNip_01g0721900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0721900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30095422	30095652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0721900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30117870	30118492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0722425-00;Name=OsNip_01t0722425-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0722425-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30117870	30118492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0722425-00;Parent=transcript:OsNip_01t0722425-00;protein_id=OsNip_01t0722425-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30125573	30128993	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0722550;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30125573	30128993	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0722550-00;Parent=gene:OsNip_01g0722550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0722550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30125573	30125861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0722550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30146000	30146432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723025-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30156435	30156575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723100-01;Name=OsNip_01t0723100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0723100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30171025	30171153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723400-02;Name=OsNip_01t0723400-05-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0723400-05-E19;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30171025	30171153	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0723400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0723400-02;protein_id=OsNip_01t0723400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30171244	30171332	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0723400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0723400-02;protein_id=OsNip_01t0723400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30171244	30171626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723400-02;Name=OsNip_01t0723400-02-E18;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0723400-02-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30171333	30171626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30166607	30171070	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0723450-00;Parent=gene:OsNip_01g0723450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0723450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30166607	30166686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0723450-00;Name=OsNip_01t0723450-00-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0723450-00-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30236326	30236538	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725000-01;protein_id=OsNip_01t0725000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30236539	30236776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30236508	30236782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725000-02;Tag=IsoSeq:G1440.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G673.1,Nipponbare.root_G888.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0QXG8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30242065	30242327	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725400-01;protein_id=OsNip_01t0725400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30242422	30242557	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0725400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725400-01;protein_id=OsNip_01t0725400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30250917	30251103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30251471	30254956	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0725600-01;Parent=gene:OsNip_01g0725600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30251471	30251556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30251471	30251614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Name=OsNip_01t0725600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0725600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30251557	30251614	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;protein_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30251722	30251883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Name=OsNip_01t0725600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0725600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30251722	30251883	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0725600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;protein_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30253101	30253136	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Name=OsNip_01t0725600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0725600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30253101	30253136	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0725600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;protein_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30253240	30253367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Name=OsNip_01t0725600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0725600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30253240	30253367	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0725600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;protein_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30253478	30254767	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;protein_id=OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30253478	30254956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Name=OsNip_01t0725600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0725600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30254768	30254956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30257752	30263390	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0725800;Name=OsNip_WD40-24;biotype=protein_coding;description=WD40/YVTN;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30257752	30263365	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0725800-01;Parent=gene:OsNip_01g0725800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30257752	30258289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30257752	30258889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;Name=OsNip_01t0725800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0725800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30258290	30258889	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;protein_id=OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30258991	30259148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;Name=OsNip_01t0725800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0725800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30258991	30259148	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;protein_id=OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30259993	30260935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;Name=OsNip_01t0725800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0725800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30259993	30260935	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0725800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;protein_id=OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30261014	30261199	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0725800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;protein_id=OsNip_01t0725800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30261014	30261600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-01;Name=OsNip_01t0725800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0725800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	30263108	30263108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-02;Tag=IsoSeq:G1442.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1120.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30263364	30263390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725800-02;Tag=IsoSeq:G1442.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1120.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30263383	30264381	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0725900-01;Parent=gene:OsNip_01g0725900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0725900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30263383	30263709	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30263383	30264014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725900-01;Name=OsNip_01t0725900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0725900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30264119	30264332	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0725900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0725900-01;protein_id=OsNip_01t0725900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30264119	30264381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725900-01;Name=OsNip_01t0725900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0725900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30264333	30264381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0725900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30270960	30272787	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0726001-00;Parent=gene:OsNip_01g0726001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0726001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30270960	30270960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30270960	30271367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;Name=OsNip_01t0726001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0726001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30270961	30271353	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0726001-00;Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;protein_id=OsNip_01t0726001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30271354	30271367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30272517	30272787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;Name=OsNip_01t0726001-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0726001-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30272517	30272787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30272986	30274078	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0726100-01;Parent=gene:OsNip_01g0726100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0726100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30272986	30273275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30272986	30273589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726100-01;Name=OsNip_01t0726100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0726100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30273276	30273589	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0726100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726100-01;protein_id=OsNip_01t0726100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30273678	30274078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726100-01;Name=OsNip_01t0726100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0726100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30274018	30274078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30278399	30280577	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0726400;Name=MADS32;biotype=protein_coding;description=MADS;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30278399	30280577	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0726400-01;Parent=gene:OsNip_01g0726400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30278399	30278491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30278399	30278502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;Name=OsNip_01t0726400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0726400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30278492	30278502	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0726400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;protein_id=OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30278590	30278665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;Name=OsNip_01t0726400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0726400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30278590	30278665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0726400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;protein_id=OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30280203	30280269	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0726400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;protein_id=OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30280387	30280577	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0726400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726400-01;protein_id=OsNip_01t0726400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30293943	30293986	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30293943	30294155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;Name=OsNip_01t0726700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0726700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30293987	30294155	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0726700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;protein_id=OsNip_01t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30294265	30295753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;Name=OsNip_01t0726700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0726700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30294265	30295753	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0726700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;protein_id=OsNip_01t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30295876	30296540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;Name=OsNip_01t0726700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0726700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30296207	30296540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30348601	30348695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0727840-00;Name=OsNip_01t0727840-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0727840-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30348601	30348695	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0727840-00;Parent=transcript:OsNip_01t0727840-00;protein_id=OsNip_01t0727840-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30348820	30348912	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0727840-00;Parent=transcript:OsNip_01t0727840-00;protein_id=OsNip_01t0727840-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30348820	30349017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0727840-00;Name=OsNip_01t0727840-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0727840-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30348913	30349017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0727840-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30386907	30387001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0728700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30386907	30387462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0728700-01;Name=OsNip_01t0728700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0728700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30387558	30387849	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0728700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0728700-01;protein_id=OsNip_01t0728700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30401226	30401330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0729100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0729100-02;protein_id=OsNip_01t0729100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30405175	30405267	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0729100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0729100-02;protein_id=OsNip_01t0729100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30405175	30405429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729100-02;Name=OsNip_01t0729100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0729100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30405268	30405429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	30398989	30399264	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0729100-03;Parent=transcript:OsNip_01t0729100-03;protein_id=OsNip_01t0729100-03;Tag=IsoSeq:G1453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1129.1;prot_id "UniRef90_A0A2P5FL75";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30427732	30428090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30429051	30429137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30429510	30429674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30430185	30430303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30430711	30430826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30430903	30431384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Name=OsNip_01t0729950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0729950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30430903	30431384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0729950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30447427	30449206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0730100-01;Parent=gene:OsNip_01g0730100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0730100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30447427	30447558	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30489765	30489852	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0730800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0730800-01;protein_id=OsNip_01t0730800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30489853	30489872	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30489766	30489852	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0730800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0730800-02;protein_id=OsNip_01t0730800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30489853	30489872	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30490038	30490382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730800-02;Name=OsNip_01t0730800-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0730800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30490038	30490382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30490746	30497183	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0730900;biotype=protein_coding;description=DNA;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30494842	30497106	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0730900-01;Parent=gene:OsNip_01g0730900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0730900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30494842	30494853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30494842	30497106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-01;Name=OsNip_01t0730900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0730900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30494854	30496722	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0730900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0730900-01;protein_id=OsNip_01t0730900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30496723	30497106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	30490746	30497183	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0730900-02;Parent=gene:OsNip_01g0730900;transcript_id=OsNip_01t0730900-02;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1
Chr01	TAMA	exon	30494971	30497183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-02;Name=OsNip_01t0730900-02;exon_id=OsNip_01t0730900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1;prot_id "UniRef90_J3M943";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	CDS	30496481	30497182	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0730900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0730900-02;protein_id=OsNip_01t0730900-02;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1;prot_id "UniRef90_J3M943";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	exon	30494081	30494300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-02;Name=OsNip_01t0730900-02;exon_id=OsNip_01t0730900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1;prot_id "UniRef90_J3M943";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	exon	30493463	30493921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-02;Name=OsNip_01t0730900-02;exon_id=OsNip_01t0730900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1;prot_id "UniRef90_J3M943";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	TAMA	exon	30491816	30491876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0730900-02;Name=OsNip_01t0730900-02;exon_id=OsNip_01t0730900-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1460.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1136.1;prot_id "UniRef90_J3M943";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30717302	30717667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30714016	30714354	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736450-00;Name=OsNip_01t0736450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0736450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30727331	30728062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736551-01;Name=OsNip_01t0736551-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0736551-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30727331	30728062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736551-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30728174	30730635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736551-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30730636	30731127	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0736551-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736551-01;protein_id=OsNip_01t0736551-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30731128	30731409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736551-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30730320	30731337	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0736600-01;Parent=gene:OsNip_01g0736600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0736600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30730320	30730644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30730320	30731337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736600-01;Name=OsNip_01t0736600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0736600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30730645	30731238	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0736600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736600-01;protein_id=OsNip_01t0736600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30731239	30731337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30735203	30735270	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0736750;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30735203	30735270	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0736750-00;Parent=gene:OsNip_01g0736750;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0736750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30735203	30735270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736750-00;Name=OsNip_01t0736750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0736750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30738700	30740720	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0736900;biotype=protein_coding;description=Reticulon;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30738700	30740720	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0736900-01;Parent=gene:OsNip_01g0736900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30738700	30738832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30738700	30739034	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Name=OsNip_01t0736900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0736900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30738833	30739034	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0736900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;protein_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30739432	30739612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Name=OsNip_01t0736900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0736900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30739432	30739612	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0736900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;protein_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30739736	30739877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Name=OsNip_01t0736900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0736900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30739736	30739877	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0736900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;protein_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30739970	30740039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Name=OsNip_01t0736900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0736900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30739970	30740039	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0736900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;protein_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30740125	30740291	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0736900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;protein_id=OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30740125	30740720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Name=OsNip_01t0736900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0736900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30740292	30740720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0736900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30761668	30762594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t073749A-01;Tag=IsoSeq:G1480.1;Source=Nipponbare.panicle_G1151.1,Nipponbare.root_G902.1,Nipponbare.leaf_G686.1;prot_id "UniRef90_Q6Z724";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30765493	30765851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737500-01;Name=OsNip_01t0737500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0737500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30768424	30769146	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0737550-00;Parent=gene:OsNip_01g0737550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0737550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30768424	30769146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737550-00;Name=OsNip_01t0737550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0737550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30768424	30769146	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0737550-00;Parent=transcript:OsNip_01t0737550-00;protein_id=OsNip_01t0737550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30772299	30773134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737700-00;Name=OsNip_01t0737700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0737700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30773004	30773134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30775140	30779238	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0737800-02;Parent=gene:OsNip_01g0737800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0737800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30775140	30775287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30782601	30782966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0737900-02;Tag=IsoSeq:G1482.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1153.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9CVN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30786449	30786570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738000-01;Name=OsNip_01t0738000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0738000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30835595	30837960	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0738600-03;Parent=gene:OsNip_01g0738600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0738600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30835595	30837960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738600-03;Name=OsNip_01t0738600-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0738600-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30835964	30837960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30840199	30840478	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0738800-01;Parent=gene:OsNip_01g0738800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0738800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30840199	30840373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30840199	30840478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-01;Name=OsNip_01t0738800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0738800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30840374	30840478	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0738800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-01;protein_id=OsNip_01t0738800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	30840199	30845206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0738800-02;Parent=gene:OsNip_01g0738800;transcript_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4
Chr01	TAMA	exon	30844804	30845206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30844804	30845205	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30844111	30844157	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30844111	30844157	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30843967	30844006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30843967	30844006	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30843821	30843883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30843821	30843883	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30843596	30843733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30843596	30843733	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30843131	30843289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30843131	30843289	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30842996	30843049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30842996	30843049	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30842693	30842761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30842693	30842761	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30842447	30842576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30842447	30842576	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30842116	30842156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30842116	30842156	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30841734	30841958	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E11;rank=11;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30841734	30841958	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30841000	30841045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E12;rank=12;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30841000	30841045	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30840717	30840868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E13;rank=13;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30840717	30840868	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	30840199	30840580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Name=OsNip_01t0738800-02;exon_id=OsNip_01t0738800-02-E14;rank=14;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	30840380	30840580	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0738800-02;Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;protein_id=OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	30845206	30845206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30840199	30840377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738800-02;Tag=IsoSeq:G1486.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1156.3,Nipponbare.root_G905.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30848500	30849925	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0738900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30848500	30849925	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0738900-01;Parent=gene:OsNip_01g0738900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0738900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30848500	30849133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;Name=OsNip_01t0738900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0738900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30848500	30849133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30849214	30849431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30849214	30849925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;Name=OsNip_01t0738900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0738900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30849432	30849923	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0738900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;protein_id=OsNip_01t0738900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30849924	30849925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0738900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30850664	30856206	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0739000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30850664	30856206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0739000-01;Parent=gene:OsNip_01g0739000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30850664	30851030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30850664	30851083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30851031	30851083	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30851278	30851390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30851278	30851390	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30852177	30852226	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30852177	30852226	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30852314	30852384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30852314	30852384	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30852467	30852539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30852467	30852539	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30853486	30853583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30853486	30853583	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30853678	30853744	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30853678	30853744	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30853892	30853972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30853892	30853972	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30854054	30854221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30854054	30854221	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30854305	30854472	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30854305	30854472	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30854555	30854851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30854555	30854851	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30854947	30855168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30854947	30855168	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30856029	30856067	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0739000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;protein_id=OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30856029	30856206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Name=OsNip_01t0739000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0739000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30856068	30856206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	30868528	30871602	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0739200;Name=OsNip_PP14;biotype=protein_coding;description=Protein-tyrosine;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	30868528	30871602	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0739200-01;Parent=gene:OsNip_01g0739200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0739200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30868528	30868687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30868528	30868921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739200-01;Name=OsNip_01t0739200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0739200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30868688	30868921	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0739200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0739200-01;protein_id=OsNip_01t0739200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30869444	30869566	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0739200-01;Name=OsNip_01t0739200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0739200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30915830	30916147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0740300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0740300-01;protein_id=OsNip_01t0740300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30916148	30916476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0740300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	30909425	30909523	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0740300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0740300-02;protein_id=OsNip_01t0740300-02;Tag=IsoSeq:G1493.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G910.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	30909527	30909655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0740300-02;Tag=IsoSeq:G1493.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G910.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30993892	30994037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742250-00;Name=OsNip_01t0742250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0742250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30994583	30997017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742250-00;Name=OsNip_01t0742250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0742250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	30997998	30999138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742300-01;Name=OsNip_01t0742300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0742300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30998119	30998345	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	30998119	30999454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742350-01;Name=OsNip_01t0742350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0742350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	30998346	30998942	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0742350-01;Parent=transcript:OsNip_01t0742350-01;protein_id=OsNip_01t0742350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30998943	30999454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0742350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31157393	31157902	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0745000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0745000-00;protein_id=OsNip_01t0745000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31166222	31166285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0745300-00;Name=OsNip_01t0745300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0745300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	31324400	31324605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0748300-01;Tag=IsoSeq:G1518.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G928.2;prot_id "UniRef90_B4FTS9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31371388	31372729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749300-02;Name=OsNip_01t0749300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0749300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31370593	31370805	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0749300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0749300-01;protein_id=OsNip_01t0749300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31371388	31372497	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0749300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0749300-01;protein_id=OsNip_01t0749300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31371388	31372631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749300-01;Name=OsNip_01t0749300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0749300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31372498	31372631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31373447	31377544	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0749400-02;Parent=gene:OsNip_01g0749400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31373447	31373893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31373447	31374274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;Name=OsNip_01t0749400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0749400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31373894	31374274	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0749400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;protein_id=OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31374504	31374777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;Name=OsNip_01t0749400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0749400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31374504	31374777	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0749400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;protein_id=OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31375216	31377302	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0749400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;protein_id=OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31375216	31377544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;Name=OsNip_01t0749400-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0749400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31377303	31377544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31394913	31400069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0749900-01;Parent=gene:OsNip_01g0749900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0749900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31394913	31395110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0749900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31410268	31410736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0750100-01;Name=OsNip_01t0750100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0750100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31410471	31410736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0750100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31409175	31409275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0750100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31526968	31527114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0751600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31550662	31550746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0752100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31608398	31608975	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0753200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0753200-01;protein_id=OsNip_01t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31609503	31609696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0753200-01;Name=OsNip_01t0753200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0753200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31609684	31609696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31648188	31648756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0754300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	31651616	31656497	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0754500;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31670016	31670159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0754800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31795752	31796097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757200-01;Name=OsNip_01t0757200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0757200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31795752	31796097	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0757200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0757200-01;protein_id=OsNip_01t0757200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31796784	31797026	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0757200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0757200-01;protein_id=OsNip_01t0757200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31796784	31797640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757200-01;Name=OsNip_01t0757200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0757200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31797027	31797640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	31795255	31796095	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0757301;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31795255	31796095	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0757301-00;Parent=gene:OsNip_01g0757301;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0757301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31795255	31796095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757301-00;Name=OsNip_01t0757301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0757301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	31806962	31811863	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0757400;Name=SKD1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31806962	31811179	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0757400-01;Parent=gene:OsNip_01g0757400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0757400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31806962	31807297	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31806962	31807299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757400-01;Name=OsNip_01t0757400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0757400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31807298	31807299	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0757400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0757400-01;protein_id=OsNip_01t0757400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31807400	31807544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757400-01;Name=OsNip_01t0757400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0757400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31807400	31807544	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0757400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0757400-01;protein_id=OsNip_01t0757400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	31811352	31811657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0757500-03;Tag=IsoSeq:G1559.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G961.1;prot_id "UniRef90_A0A251S906";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31875590	31875713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758450-00;Name=OsNip_01t0758450-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0758450-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31875590	31875713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31876569	31876667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31877361	31877567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758450-00;Name=OsNip_01t0758450-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0758450-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31877361	31877567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	31889711	31891221	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0758500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31889711	31891221	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0758500-01;Parent=gene:OsNip_01g0758500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0758500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31889711	31890366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31889711	31891221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-01;Name=OsNip_01t0758500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0758500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31890367	31890954	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0758500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0758500-01;protein_id=OsNip_01t0758500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31890955	31891221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31890232	31890577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31890578	31890729	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0758500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0758500-02;protein_id=OsNip_01t0758500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31890810	31890954	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0758500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0758500-02;protein_id=OsNip_01t0758500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31890810	31891198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-02;Name=OsNip_01t0758500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0758500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31890955	31891198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	gene	31907247	31911654	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g075889A;Tag=IsoSeq:G1567
Chr01	TAMA	mRNA	31907247	31911654	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t075889A-01;Parent=gene:OsNip_01g075889A;transcript_id=OsNip_01t075889A-01;Tag=IsoSeq:G1567.1;Source=Nipponbare.panicle_G1216.1,Nipponbare.root_G965.1
Chr01	TAMA	exon	31907247	31911654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t075889A-01;Name=OsNip_01t075889A-01-E1;exon_id=OsNip_01t075889A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1567.1;Source=Nipponbare.panicle_G1216.1,Nipponbare.root_G965.1;prot_id "UniRef90_Q8W150";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	31907247	31907504	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t075889A-01;Parent=transcript:OsNip_01t075889A-01;protein_id=OsNip_01t075889A-01;Tag=IsoSeq:G1567.1;Source=Nipponbare.panicle_G1216.1,Nipponbare.root_G965.1;prot_id "UniRef90_Q8W150";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	31907508	31911654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t075889A-01;Tag=IsoSeq:G1567.1;Source=Nipponbare.panicle_G1216.1,Nipponbare.root_G965.1;prot_id "UniRef90_Q8W150";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	31919396	31922335	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0758900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	31919494	31922325	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0758900-01;Parent=gene:OsNip_01g0758900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31919494	31919694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31919494	31920828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;Name=OsNip_01t0758900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0758900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31919695	31920828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0758900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;protein_id=OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31920940	31921815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;Name=OsNip_01t0758900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0758900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31920940	31921815	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0758900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;protein_id=OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	31921902	31921940	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0758900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;protein_id=OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	31921902	31922325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;Name=OsNip_01t0758900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0758900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31921941	31922325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	31919396	31922335	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0758900-02;Parent=gene:OsNip_01g0758900;transcript_id=OsNip_01t0758900-02;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1
Chr01	TAMA	exon	31919396	31920828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-02;Name=OsNip_01t0758900-02;exon_id=OsNip_01t0758900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1;prot_id "UniRef90_A0A199VL42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	31919396	31919707	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0758900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0758900-02;protein_id=OsNip_01t0758900-02;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1;prot_id "UniRef90_A0A199VL42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	31920937	31921815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-02;Name=OsNip_01t0758900-02;exon_id=OsNip_01t0758900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1;prot_id "UniRef90_A0A199VL42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	31921902	31922335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-02;Name=OsNip_01t0758900-02;exon_id=OsNip_01t0758900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1;prot_id "UniRef90_A0A199VL42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	31919711	31920828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0758900-02;Tag=IsoSeq:G1568.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G966.1,Nipponbare.panicle_G1217.1;prot_id "UniRef90_A0A199VL42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	31988600	31989198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0760300-01;Name=OsNip_01t0760300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0760300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31989014	31989198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0760300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	31986500	31987079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;Name=OsNip_01t0760300-02;exon_id=OsNip_01t0760300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	31986500	31987079	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0760300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;protein_id=OsNip_01t0760300-02;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	31987170	31987286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;Name=OsNip_01t0760300-02;exon_id=OsNip_01t0760300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	CDS	31987652	31987726	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0760300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;protein_id=OsNip_01t0760300-02;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	exon	31987822	31988088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;Name=OsNip_01t0760300-02;exon_id=OsNip_01t0760300-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	31987822	31988088	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0760300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0760300-02;protein_id=OsNip_01t0760300-02;Tag=IsoSeq:G1574.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1222.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32143763	32144456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0763800-02;Tag=IsoSeq:G1590.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1237.2;prot_id "UniRef90_A0A200Q237";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32165440	32165796	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0764200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0764200-00;protein_id=OsNip_01t0764200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32167881	32171339	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0764300-01;Parent=gene:OsNip_01g0764300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0764300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32167881	32167959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0764300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	32228341	32228576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0764900-01;Name=OsNip_01t0764900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0764900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32229072	32229309	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0764900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0764900-01;protein_id=OsNip_01t0764900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32229414	32229632	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0764900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0764900-01;protein_id=OsNip_01t0764900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32229414	32229661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0764900-01;Name=OsNip_01t0764900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0764900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32229633	32229661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0764900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32370394	32370627	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0767966-00;Parent=transcript:OsNip_01t0767966-00;protein_id=OsNip_01t0767966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	32371115	32371318	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0767966-00;Name=OsNip_01t0767966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0767966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32379784	32380046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0768100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32379784	32380582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0768100-01;Name=OsNip_01t0768100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0768100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32380047	32380532	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0768100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0768100-01;protein_id=OsNip_01t0768100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32380533	32380582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0768100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32381348	32385675	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0768200;biotype=protein_coding;description=TRAM%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32381348	32385675	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0768200-01;Parent=gene:OsNip_01g0768200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0768200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32381348	32381571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0768200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32433292	32433355	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0769000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0769000-01;protein_id=OsNip_01t0769000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32435212	32435268	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0769000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0769000-01;protein_id=OsNip_01t0769000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	32436693	32439546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769000-01;Name=OsNip_01t0769000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0769000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32436952	32436952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32436952	32439421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769000-02;Name=OsNip_01t0769000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0769000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	32442999	32443312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-01;Name=OsNip_01t0769100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0769100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32440320	32440485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32440582	32440763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32440977	32441067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32441155	32441312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32442309	32442480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32442559	32442669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32442939	32443329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0769100-02;Tag=IsoSeq:G1612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1252.2,Nipponbare.root_G991.3,Nipponbare.leaf_G741.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6V4T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32450917	32456504	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0769200;Name=OsNip_Sub4;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32622130	32622189	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0772600-03;Parent=transcript:OsNip_01t0772600-03;protein_id=OsNip_01t0772600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32622130	32622721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0772600-03;Name=OsNip_01t0772600-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0772600-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	32902194	32902222	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0777400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0777400-02;protein_id=OsNip_01t0777400-02;Tag=IsoSeq:G1649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1282.1;prot_id "UniRef90_V7CJD0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32902226	32902606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777400-02;Tag=IsoSeq:G1649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1282.1;prot_id "UniRef90_V7CJD0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32903356	32904172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32903356	32905028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777450-01;Name=OsNip_01t0777450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32904455	32905028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32904020	32905293	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0777500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32904020	32905293	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0777500-00;Parent=gene:OsNip_01g0777500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32904020	32904148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32904020	32904192	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Name=OsNip_01t0777500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0777500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	32904285	32904363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Name=OsNip_01t0777500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32904285	32904363	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;protein_id=OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32904458	32904625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Name=OsNip_01t0777500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32904458	32904625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;protein_id=OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32904898	32904955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Name=OsNip_01t0777500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0777500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32904898	32904955	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0777500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;protein_id=OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32905028	32905293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;Name=OsNip_01t0777500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32905028	32905293	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777500-00;protein_id=OsNip_01t0777500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32907633	32908968	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0777600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32907633	32908968	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0777600-01;Parent=gene:OsNip_01g0777600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0777600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32907633	32908362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32907633	32908968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777600-01;Name=OsNip_01t0777600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32908363	32908737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0777600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0777600-01;protein_id=OsNip_01t0777600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32908738	32908968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32909708	32911380	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0777650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32909708	32911380	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0777650-01;Parent=gene:OsNip_01g0777650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0777650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32909708	32910524	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32909708	32911380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777650-01;Name=OsNip_01t0777650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32910525	32910806	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0777650-01;Parent=transcript:OsNip_01t0777650-01;protein_id=OsNip_01t0777650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32910807	32911380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32910354	32925646	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0777700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32910354	32925363	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0777700-00;Parent=gene:OsNip_01g0777700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32910354	32910546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E30;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E30;rank=30;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32910354	32910546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32910641	32910715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E29;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E29;rank=29;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32910641	32910715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32910810	32910977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E28;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E28;rank=28;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32910810	32910977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32911250	32911307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E27;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E27;rank=27;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32911250	32911307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32911380	32911621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E26;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E26;rank=26;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32911380	32911621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32911887	32911951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E25;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E25;rank=25;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32911887	32911951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32912594	32912597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32912594	32912673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E24;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E24;rank=24;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32912598	32912673	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0777700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;protein_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32913337	32913381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E23;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E23;rank=23;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32913337	32913381	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0777700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;protein_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32913476	32913714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E22;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32913476	32913714	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;protein_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32913879	32913998	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E21;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E21;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32913879	32913998	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;protein_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	32914097	32914171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;Name=OsNip_01t0777700-00-E20;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0777700-00-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	32914097	32914171	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0777700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0777700-00;protein_id=OsNip_01t0777700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	32945017	32945018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t077839A-01;Tag=IsoSeq:G1653.1;Source=Nipponbare.root_G1016.1,Nipponbare.panicle_G1285.1;prot_id "UniRef90_Q0JIT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	32945103	32945551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t077839A-01;Tag=IsoSeq:G1653.1;Source=Nipponbare.root_G1016.1,Nipponbare.panicle_G1285.1;prot_id "UniRef90_Q0JIT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	32946648	32946942	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0778400;Name=OsNip_AGP19;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	32946648	32946942	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0778400-00;Parent=gene:OsNip_01g0778400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33082705	33083394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0780900-01;Name=OsNip_01t0780900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0780900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33083361	33083394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0780900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33141127	33144999	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0782100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0782100-01;protein_id=OsNip_01t0782100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33145146	33145541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782100-01;Name=OsNip_01t0782100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0782100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33145146	33145541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33155934	33156559	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0782500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0782500-01;protein_id=OsNip_01t0782500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	33155934	33156647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-01;Name=OsNip_01t0782500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0782500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33156560	33156647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	33158116	33158317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-01;Name=OsNip_01t0782500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0782500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33158116	33158317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	33155557	33155687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-02;Tag=IsoSeq:G1668.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1297.3,Nipponbare.leaf_G763.1;prot_id "UniRef90_UPI0009BF86CB";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	33154325	33154345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782500-02;Tag=IsoSeq:G1668.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1297.3,Nipponbare.leaf_G763.1;prot_id "UniRef90_UPI0009BF86CB";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33169011	33169121	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782850-00;Name=OsNip_01t0782850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0782850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33170140	33170349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0782800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0782800-00;protein_id=OsNip_01t0782800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33172122	33172664	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0782800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0782800-00;protein_id=OsNip_01t0782800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	33172122	33172680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782800-00;Name=OsNip_01t0782800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0782800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33172665	33172680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33177222	33177457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0782901-01;Name=OsNip_01t0782901-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0782901-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33240727	33240742	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0784500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0784500-01;protein_id=OsNip_01t0784500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	33241765	33242102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0784500-01;Name=OsNip_01t0784500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0784500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33241765	33242102	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0784500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0784500-01;protein_id=OsNip_01t0784500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33321383	33321777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0785700-02;Name=OsNip_01t0785700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0785700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33321383	33321777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0785700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	33318036	33319436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0785700-03;Name=OsNip_01t0785700-03;exon_id=OsNip_01t0785700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1677.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G769.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9VFF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	33359500	33359570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0786700-01;Tag=IsoSeq:G1680.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1033.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	33364391	33367253	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0786800-01;Parent=gene:OsNip_01g0786800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0786800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33364391	33364430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0786800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	33364391	33364739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0786800-01;Name=OsNip_01t0786800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0786800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33364431	33364739	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0786800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0786800-01;protein_id=OsNip_01t0786800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33601018	33602193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-01;Name=OsNip_01t0793300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0793300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33603612	33605323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-01;Name=OsNip_01t0793300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0793300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33605261	33605323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	33604397	33605325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-02;Tag=IsoSeq:G1725.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G805.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7QVP6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	33602082	33602193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-02;Tag=IsoSeq:G1725.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G805.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7QVP6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	33601002	33601767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793300-02;Tag=IsoSeq:G1725.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G805.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7QVP6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33609385	33609889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0793701-00;Name=OsNip_01t0793701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0793701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33615896	33616216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0793701-00;Parent=transcript:OsNip_01t0793701-00;protein_id=OsNip_01t0793701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	33641946	33642431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0794400-02;Name=OsNip_01t0794400-02;exon_id=OsNip_01t0794400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1730.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1331.1;prot_id "UniRef90_Q0JIL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	33641946	33641946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0794400-02;Tag=IsoSeq:G1730.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1331.1;prot_id "UniRef90_Q0JIL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	33642016	33642431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0794400-02;Tag=IsoSeq:G1730.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1331.1;prot_id "UniRef90_Q0JIL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33731531	33731643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0796400-01;Name=OsNip_01t0796400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0796400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	33733124	33735548	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0796500-01;Parent=gene:OsNip_01g0796500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0796500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33735462	33735548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0796500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33741398	33741505	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0796700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0796700-01;protein_id=OsNip_01t0796700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33778293	33778403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0797800-01;Name=OsNip_01t0797800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0797800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	33782551	33782910	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0797900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0797900-02;protein_id=OsNip_01t0797900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33782911	33783108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0797900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33784694	33784759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0797900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33784885	33787644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0797900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	33870705	33871835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0799900-01;Name=OsNip_01t0799900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0799900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33871610	33871835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0799900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34017557	34018832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0802900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34019130	34019231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0802900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34133382	34133448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0804900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34135611	34135636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34135816	34135882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805100-01;Name=OsNip_01t0805100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0805100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34135816	34135882	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0805100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0805100-01;protein_id=OsNip_01t0805100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34136277	34137582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805100-01;Name=OsNip_01t0805100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0805100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34137233	34137582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	34135804	34137582	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0805100-02;Parent=gene:OsNip_01g0805100;transcript_id=OsNip_01t0805100-02;Tag=IsoSeq:G1764.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1068.1,Nipponbare.panicle_G1353.1
Chr01	TAMA	exon	34135804	34137582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805100-02;Name=OsNip_01t0805100-02;exon_id=OsNip_01t0805100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1764.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1068.1,Nipponbare.panicle_G1353.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7DIJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	34136470	34137582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805100-02;Tag=IsoSeq:G1764.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1068.1,Nipponbare.panicle_G1353.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7DIJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	34138399	34139709	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0805200-01;Parent=gene:OsNip_01g0805200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0805200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34138399	34138555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34138399	34138696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;Name=OsNip_01t0805200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0805200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34138556	34138696	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0805200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;protein_id=OsNip_01t0805200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34138785	34138943	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;Name=OsNip_01t0805200-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0805200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34138785	34138943	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0805200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;protein_id=OsNip_01t0805200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34139079	34139165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;Name=OsNip_01t0805200-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0805200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34139079	34139165	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0805200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;protein_id=OsNip_01t0805200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34139250	34139365	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0805200-01;Name=OsNip_01t0805200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0805200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	34203180	34203267	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t080659A-01;Tag=IsoSeq:G1773.1;Source=Nipponbare.leaf_G832.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34217036	34217393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0806600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34217394	34217720	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0806600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0806600-01;protein_id=OsNip_01t0806600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34261113	34261452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0807532-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	34265588	34266179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t080779A-02;Tag=IsoSeq:G1774.2;Source=Nipponbare.panicle_G1362.2,Nipponbare.leaf_G833.1;prot_id "UniRef90_Q5VR60";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34295448	34295574	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0807800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0807800-01;protein_id=OsNip_01t0807800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34301177	34301304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0807900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34307524	34307772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0808100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34308275	34309521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0808100-01;Name=OsNip_01t0808100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0808100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34442138	34442422	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0810700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34509399	34509408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34509399	34509777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-02;Name=OsNip_01t0812000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0812000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34512129	34512738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-02;Name=OsNip_01t0812000-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0812000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34512398	34512738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34508455	34508745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-03;Name=OsNip_01t0812000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0812000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34511035	34512090	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0812000-03;Parent=transcript:OsNip_01t0812000-03;protein_id=OsNip_01t0812000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34511035	34512776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-03;Name=OsNip_01t0812000-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0812000-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34512091	34512776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812000-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	34509409	34512763	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0812025-00;Parent=gene:OsNip_01g0812025;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0812025-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34509409	34509772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812025-00;Name=OsNip_01t0812025-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0812025-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34511025	34512064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0812025-00;Name=OsNip_01t0812025-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0812025-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	34584515	34584599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0813500-02;Tag=IsoSeq:G1795.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1087.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	34583947	34584321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0813500-02;Tag=IsoSeq:G1795.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1087.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34628726	34628820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34628821	34629163	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0814150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0814150-00;protein_id=OsNip_01t0814150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34629512	34629564	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0814150-00;Parent=transcript:OsNip_01t0814150-00;protein_id=OsNip_01t0814150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34629512	34629879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814150-00;Name=OsNip_01t0814150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0814150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34629565	34629879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	34629568	34635205	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0814200;biotype=protein_coding;description=Endonuclease/exonuclease/phosphatase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	34629568	34635205	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0814200-01;Parent=gene:OsNip_01g0814200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34629568	34630870	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Name=OsNip_01t0814200-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0814200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34629568	34630870	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34631330	34631478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Name=OsNip_01t0814200-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0814200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34631330	34631478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34631758	34631813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Name=OsNip_01t0814200-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0814200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34631758	34631813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34631956	34632203	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34631956	34632852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;Name=OsNip_01t0814200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0814200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34632204	34632852	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0814200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0814200-01;protein_id=OsNip_01t0814200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34642296	34642794	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34639847	34640771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814400-02;Name=OsNip_01t0814400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0814400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34641175	34641391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814400-02;Name=OsNip_01t0814400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0814400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34641171	34641617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0814550-00;Name=OsNip_01t0814550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0814550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34682524	34682573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0815800-01;Name=OsNip_01t0815800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0815800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34682524	34682573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0815800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34843075	34843673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34843075	34845610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818200-01;Name=OsNip_01t0818200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0818200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34845513	34845610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34841964	34842286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34843502	34843583	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0818200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0818200-02;protein_id=OsNip_01t0818200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34845414	34845601	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0818200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0818200-02;protein_id=OsNip_01t0818200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34845602	34845603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34842171	34842624	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0818100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0818100-00;protein_id=OsNip_01t0818100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34843118	34843596	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0818100-00;Parent=transcript:OsNip_01t0818100-00;protein_id=OsNip_01t0818100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34843118	34843713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818100-00;Name=OsNip_01t0818100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0818100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34843597	34843713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	34883941	34884432	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818800-01;Name=OsNip_01t0818800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0818800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34885514	34885623	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0818900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0818900-01;protein_id=OsNip_01t0818900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	34888493	34888646	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0818900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0818900-01;protein_id=OsNip_01t0818900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	34888493	34888692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818900-01;Name=OsNip_01t0818900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0818900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34888647	34888692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0818900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35002644	35003226	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0820700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0820700-00;protein_id=OsNip_01t0820700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	34996867	34999374	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0820750;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	35096193	35097077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822200-02;Name=OsNip_01t0822200-02;exon_id=OsNip_01t0822200-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1827.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1109.1,Nipponbare.panicle_G1405.1,Nipponbare.leaf_G857.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1XFP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	35097592	35097849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822200-02;Tag=IsoSeq:G1827.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1109.1,Nipponbare.panicle_G1405.1,Nipponbare.leaf_G857.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1XFP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	35096193	35097077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822200-02;Tag=IsoSeq:G1827.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1109.1,Nipponbare.panicle_G1405.1,Nipponbare.leaf_G857.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1XFP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	exon	35111107	35111313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t082250A-01;Name=OsNip_01t082250A-01-E1;exon_id=OsNip_01t082250A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1828.1;Source=Nipponbare.panicle_G1406.1;prot_id "UniRef90_I1HHN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	35111107	35111312	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t082250A-01;Parent=transcript:OsNip_01t082250A-01;protein_id=OsNip_01t082250A-01;Tag=IsoSeq:G1828.1;Source=Nipponbare.panicle_G1406.1;prot_id "UniRef90_I1HHN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	CDS	35111012	35111015	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t082250A-01;Parent=transcript:OsNip_01t082250A-01;protein_id=OsNip_01t082250A-01;Tag=IsoSeq:G1828.1;Source=Nipponbare.panicle_G1406.1;prot_id "UniRef90_I1HHN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	35111313	35111313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t082250A-01;Tag=IsoSeq:G1828.1;Source=Nipponbare.panicle_G1406.1;prot_id "UniRef90_I1HHN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	35110845	35111009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t082250A-01;Tag=IsoSeq:G1828.1;Source=Nipponbare.panicle_G1406.1;prot_id "UniRef90_I1HHN7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35115261	35115959	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0822501-01;Parent=gene:OsNip_01g0822501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0822501-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35115261	35115381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822501-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35115261	35115959	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822501-01;Name=OsNip_01t0822501-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0822501-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35115382	35115594	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0822501-01;Parent=transcript:OsNip_01t0822501-01;protein_id=OsNip_01t0822501-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35115595	35115959	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822501-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	35121625	35122986	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0822800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35121625	35122986	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0822800-01;Parent=gene:OsNip_01g0822800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0822800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35121625	35121988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35121625	35122652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;Name=OsNip_01t0822800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0822800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35121989	35122615	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0822800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;protein_id=OsNip_01t0822800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35122616	35122652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35122722	35122986	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;Name=OsNip_01t0822800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0822800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35122722	35122986	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	35130013	35130913	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0822900;Name=OsNip_LTP1.2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35130013	35130913	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0822900-03;Parent=gene:OsNip_01g0822900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0822900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35130013	35130366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35130013	35130376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822900-03;Name=OsNip_01t0822900-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0822900-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35130367	35130376	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0822900-03;Parent=transcript:OsNip_01t0822900-03;protein_id=OsNip_01t0822900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35130463	35130815	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0822900-03;Parent=transcript:OsNip_01t0822900-03;protein_id=OsNip_01t0822900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35130463	35130913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0822900-03;Name=OsNip_01t0822900-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0822900-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35244024	35244059	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0824800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0824800-01;protein_id=OsNip_01t0824800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35247995	35248669	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0824900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0824900-01;protein_id=OsNip_01t0824900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35248670	35248925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0824900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35257561	35259062	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0825000-01;Parent=gene:OsNip_01g0825000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35257561	35257729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35257561	35257743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;Name=OsNip_01t0825000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0825000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35257730	35257743	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0825000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;protein_id=OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35258029	35258329	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0825000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;protein_id=OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35258421	35258861	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0825000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;protein_id=OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35258421	35259062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;Name=OsNip_01t0825000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0825000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35258862	35259062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0825000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	35278373	35279026	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0825166;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35278373	35279026	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0825166-00;Parent=gene:OsNip_01g0825166;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0825166-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35278373	35279026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0825166-00;Name=OsNip_01t0825166-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0825166-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35278373	35279026	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0825166-00;Parent=transcript:OsNip_01t0825166-00;protein_id=OsNip_01t0825166-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	35287290	35287943	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0825332;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35287290	35287943	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0825332-00;Parent=gene:OsNip_01g0825332;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0825332-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	35432102	35432264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0828100-01;Tag=IsoSeq:G1847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1419.1,Nipponbare.root_G1124.1,Nipponbare.leaf_G865.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9Q5C3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	35432616	35432880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0828100-01;Tag=IsoSeq:G1847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1419.1,Nipponbare.root_G1124.1,Nipponbare.leaf_G865.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9Q5C3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35433722	35435429	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0828200-00;Parent=gene:OsNip_01g0828200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0828200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35433722	35433789	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0828200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35433722	35434059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0828200-00;Name=OsNip_01t0828200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0828200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35433790	35434059	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0828200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0828200-00;protein_id=OsNip_01t0828200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35434177	35434242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0828200-00;Name=OsNip_01t0828200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0828200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35473695	35474333	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0828900-00;Parent=transcript:OsNip_01t0828900-00;protein_id=OsNip_01t0828900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35478358	35478442	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0829000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0829000-01;protein_id=OsNip_01t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35478536	35478647	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0829000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0829000-01;protein_id=OsNip_01t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35478827	35478930	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0829000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0829000-01;protein_id=OsNip_01t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35478827	35478985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0829000-01;Name=OsNip_01t0829000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0829000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35478931	35478985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	35597093	35599018	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0831900;Name=OsNip_AMT2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35597093	35598956	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0831900-02;Parent=gene:OsNip_01g0831900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0831900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	35597927	35598212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-02;Name=OsNip_01t0831900-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0831900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35597927	35598212	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0831900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0831900-02;protein_id=OsNip_01t0831900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35598306	35598956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-02;Name=OsNip_01t0831900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0831900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35597122	35597284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35597122	35597841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-01;Name=OsNip_01t0831900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0831900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	35597927	35598212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-01;Name=OsNip_01t0831900-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0831900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	35598306	35599018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831900-01;Name=OsNip_01t0831900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0831900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35597399	35599031	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0831950-00;Parent=gene:OsNip_01g0831950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0831950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35597399	35597940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35597399	35598214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;Name=OsNip_01t0831950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0831950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35597941	35598214	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0831950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;protein_id=OsNip_01t0831950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35598310	35598962	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0831950-00;Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;protein_id=OsNip_01t0831950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35598310	35599031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;Name=OsNip_01t0831950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0831950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35598963	35599031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0831950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35601142	35604029	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0832000-01;Parent=gene:OsNip_01g0832000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35601142	35601250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35601142	35601428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;Name=OsNip_01t0832000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0832000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35601251	35601428	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0832000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;protein_id=OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35601506	35601620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;Name=OsNip_01t0832000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0832000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35601506	35601620	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0832000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;protein_id=OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35601726	35601841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;Name=OsNip_01t0832000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0832000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35601726	35601841	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0832000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;protein_id=OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	35602073	35602204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;Name=OsNip_01t0832000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0832000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35602073	35602204	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0832000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0832000-01;protein_id=OsNip_01t0832000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	35749209	35749594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0834250-01;Name=OsNip_01t0834250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0834250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	35749322	35749594	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0834250-01;Parent=transcript:OsNip_01t0834250-01;protein_id=OsNip_01t0834250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	35756352	35758678	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0834400;Name=HAP3A;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35776008	35776069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0834800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	35888339	35888562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0837000-01;Name=OsNip_01t0837000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0837000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35966847	35966946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0838600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	35981651	35984194	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0838800-01;Parent=gene:OsNip_01g0838800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0838800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36059256	36059450	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0840300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0840300-00;protein_id=OsNip_01t0840300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36083073	36085662	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0840700;Name=OsNip_RPL36.2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36083073	36083264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36083073	36083295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-00;Name=OsNip_01t0840700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0840700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36083265	36083295	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0840700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0840700-00;protein_id=OsNip_01t0840700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36084104	36084198	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0840700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0840700-00;protein_id=OsNip_01t0840700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	36083119	36085662	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0840700-01;Parent=gene:OsNip_01g0840700;transcript_id=OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2
Chr01	TAMA	exon	36085617	36085662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Name=OsNip_01t0840700-01;exon_id=OsNip_01t0840700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	36085639	36085662	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0840700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;protein_id=OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	36085355	36085483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Name=OsNip_01t0840700-01;exon_id=OsNip_01t0840700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	36084104	36084303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Name=OsNip_01t0840700-01;exon_id=OsNip_01t0840700-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	36083119	36083295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Name=OsNip_01t0840700-01;exon_id=OsNip_01t0840700-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36085617	36085636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36085355	36085483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36084104	36084303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36083119	36083295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840700-01;Tag=IsoSeq:G1905.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G895.2,Nipponbare.root_G1158.2,Nipponbare.panicle_G1469.2;prot_id "UniRef90_A0A7J6HCE5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36091051	36091822	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0840900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36091051	36091822	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0840900-01;Parent=gene:OsNip_01g0840900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0840900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36091051	36091433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36091051	36091822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0840900-01;Name=OsNip_01t0840900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0840900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36091434	36091820	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0840900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0840900-01;protein_id=OsNip_01t0840900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36120000	36120301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0841450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36146198	36146280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0841800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36280966	36281521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844850-00;Name=OsNip_01t0844850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0844850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36283052	36283198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844850-00;Name=OsNip_01t0844850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0844850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36287167	36289644	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0844900;biotype=protein_coding;description=Homeodomain-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36287282	36287350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36287282	36289641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-01;Name=OsNip_01t0844900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0844900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36287351	36288010	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0844900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0844900-01;protein_id=OsNip_01t0844900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36288011	36289641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	36287167	36289644	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0844900-02;Parent=gene:OsNip_01g0844900;transcript_id=OsNip_01t0844900-02;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1
Chr01	TAMA	exon	36287167	36288006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-02;Name=OsNip_01t0844900-02;exon_id=OsNip_01t0844900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1;prot_id "UniRef90_A0A2U1MJA7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	36287167	36287580	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0844900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0844900-02;protein_id=OsNip_01t0844900-02;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1;prot_id "UniRef90_A0A2U1MJA7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	36289176	36289644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-02;Name=OsNip_01t0844900-02;exon_id=OsNip_01t0844900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1;prot_id "UniRef90_A0A2U1MJA7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36287584	36288006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-02;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1;prot_id "UniRef90_A0A2U1MJA7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36289176	36289644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0844900-02;Tag=IsoSeq:G1918.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1480.1;prot_id "UniRef90_A0A2U1MJA7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36296563	36298686	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0845100;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36296586	36298621	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0845100-01;Parent=gene:OsNip_01g0845100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0845100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36296586	36297015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36296586	36297879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;Name=OsNip_01t0845100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0845100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36297016	36297879	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0845100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;protein_id=OsNip_01t0845100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36298408	36298446	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0845100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;protein_id=OsNip_01t0845100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36298408	36298621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;Name=OsNip_01t0845100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0845100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36298447	36298621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	36296563	36298686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0845100-02;Parent=gene:OsNip_01g0845100;transcript_id=OsNip_01t0845100-02;Tag=IsoSeq:G1919.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1481.1,Nipponbare.root_G1168.1,Nipponbare.root_G1168.2
Chr01	TAMA	exon	36296563	36298686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-02;Name=OsNip_01t0845100-02;exon_id=OsNip_01t0845100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1919.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1481.1,Nipponbare.root_G1168.1,Nipponbare.root_G1168.2;prot_id "UniRef90_A0A426X4X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	36298575	36298685	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0845100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0845100-02;protein_id=OsNip_01t0845100-02;Tag=IsoSeq:G1919.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1481.1,Nipponbare.root_G1168.1,Nipponbare.root_G1168.2;prot_id "UniRef90_A0A426X4X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	36298686	36298686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-02;Tag=IsoSeq:G1919.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1481.1,Nipponbare.root_G1168.1,Nipponbare.root_G1168.2;prot_id "UniRef90_A0A426X4X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	36296563	36298572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845100-02;Tag=IsoSeq:G1919.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1481.1,Nipponbare.root_G1168.1,Nipponbare.root_G1168.2;prot_id "UniRef90_A0A426X4X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36297008	36298858	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0845000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36297008	36298858	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0845000-01;Parent=gene:OsNip_01g0845000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0845000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36297008	36297009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36297008	36298858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845000-01;Name=OsNip_01t0845000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0845000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36297010	36298563	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0845000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0845000-01;protein_id=OsNip_01t0845000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36298564	36298858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36323780	36325014	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0845950;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36323780	36325014	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0845950-01;Parent=gene:OsNip_01g0845950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0845950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36323780	36323867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0845950-01;Name=OsNip_01t0845950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0845950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36323780	36323867	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0845950-01;Parent=transcript:OsNip_01t0845950-01;protein_id=OsNip_01t0845950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36324192	36324532	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0845950-01;Parent=transcript:OsNip_01t0845950-01;protein_id=OsNip_01t0845950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36359740	36359903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0846500-02;Name=OsNip_01t0846500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0846500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36392413	36392685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36395486	36398031	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0847200;Name=OsNip_MPG1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36395486	36397969	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0847200-01;Parent=gene:OsNip_01g0847200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0847200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36395486	36395713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36395840	36395919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36395920	36396030	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;protein_id=OsNip_01t0847200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396518	36396580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;Name=OsNip_01t0847200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36396986	36397657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;protein_id=OsNip_01t0847200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396986	36397969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-01;Name=OsNip_01t0847200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36395599	36395713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Name=OsNip_01t0847200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36395599	36395713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36395840	36395919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36395840	36396030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Name=OsNip_01t0847200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36395920	36396030	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;protein_id=OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396518	36396580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Name=OsNip_01t0847200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36396518	36396580	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;protein_id=OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396671	36396910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Name=OsNip_01t0847200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36396671	36396910	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;protein_id=OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36396986	36397657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0847200-02;Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;protein_id=OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396986	36398031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Name=OsNip_01t0847200-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36397658	36398031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36395917	36397667	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0847250;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36395917	36397667	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0847250-00;Parent=gene:OsNip_01g0847250;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0847250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36395917	36396074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847250-00;Name=OsNip_01t0847250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396638	36396917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847250-00;Name=OsNip_01t0847250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36396992	36397667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847250-00;Name=OsNip_01t0847250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36398984	36401707	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0847300;biotype=protein_coding;description=Uncharacterised;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36398984	36401707	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0847300-01;Parent=gene:OsNip_01g0847300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36398984	36399140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36398984	36399338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;Name=OsNip_01t0847300-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36399141	36399338	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0847300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;protein_id=OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36400180	36400312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;Name=OsNip_01t0847300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0847300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36400180	36400312	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0847300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;protein_id=OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36401434	36401564	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0847300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;protein_id=OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36401434	36401707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;Name=OsNip_01t0847300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0847300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36401565	36401707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36399037	36401679	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0847300-02;Parent=gene:OsNip_01g0847300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0847300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36399037	36399140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36399037	36399338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-02;Name=OsNip_01t0847300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0847300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36399141	36399338	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0847300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0847300-02;protein_id=OsNip_01t0847300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36400180	36400312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0847300-02;Name=OsNip_01t0847300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0847300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36482508	36482540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0848900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36483575	36483990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0848900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36544135	36544181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0850100-01;Name=OsNip_01t0850100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0850100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36544264	36544424	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0850100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0850100-01;protein_id=OsNip_01t0850100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36544662	36544742	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0850100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0850100-01;protein_id=OsNip_01t0850100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36544662	36545196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0850100-01;Name=OsNip_01t0850100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0850100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36544743	36545196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0850100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	36540208	36540568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0850100-02;Name=OsNip_01t0850100-02;exon_id=OsNip_01t0850100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1936.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1178.1;prot_id "UniRef90_A0A678TQC3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	36540209	36540478	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0850100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0850100-02;protein_id=OsNip_01t0850100-02;Tag=IsoSeq:G1936.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1178.1;prot_id "UniRef90_A0A678TQC3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36642959	36643202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0851000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36808170	36808213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36808170	36808790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854400-01;Name=OsNip_01t0854400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0854400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36808214	36808630	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0854400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0854400-01;protein_id=OsNip_01t0854400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36808631	36808790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36813736	36815023	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0854500;Name=OsNip_WOX9;biotype=protein_coding;description=Homeobox;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36813736	36815023	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0854500-01;Parent=gene:OsNip_01g0854500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0854500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36813736	36814079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36813736	36814303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854500-01;Name=OsNip_01t0854500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0854500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36814080	36814303	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0854500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0854500-01;protein_id=OsNip_01t0854500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	36814413	36815023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854500-01;Name=OsNip_01t0854500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0854500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36814792	36815023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36838524	36839070	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0854651;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36838524	36839070	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0854651-00;Parent=gene:OsNip_01g0854651;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0854651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36838524	36838829	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0854651-00;Parent=transcript:OsNip_01t0854651-00;protein_id=OsNip_01t0854651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36838524	36839070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854651-00;Name=OsNip_01t0854651-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0854651-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36838830	36839070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36840077	36842114	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0854800;Name=CYP86A7-2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36840077	36842114	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0854800-01;Parent=gene:OsNip_01g0854800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0854800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36840077	36840196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36840077	36842114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854800-01;Name=OsNip_01t0854800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0854800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36840197	36841834	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0854800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0854800-01;protein_id=OsNip_01t0854800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36841835	36842114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0854800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	36863177	36871094	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0855000;Name=GPAT;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	36863177	36871094	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0855000-01;Parent=gene:OsNip_01g0855000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0855000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36863177	36863346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0855000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	36863177	36864225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0855000-01;Name=OsNip_01t0855000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0855000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36863347	36864225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0855000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0855000-01;protein_id=OsNip_01t0855000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	36865673	36866287	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0855000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0855000-01;protein_id=OsNip_01t0855000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37031230	37031230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37046946	37047176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857400-01;Name=OsNip_01t0857400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0857400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37046946	37047176	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0857400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0857400-01;protein_id=OsNip_01t0857400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37049569	37049677	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0857400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0857400-01;protein_id=OsNip_01t0857400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37049569	37049889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857400-01;Name=OsNip_01t0857400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0857400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37049678	37049889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37049101	37049752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857400-02;Tag=IsoSeq:G1960.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1514.3,Nipponbare.root_G1193.5;prot_id "UniRef90_K3XHJ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37079876	37079986	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0857975-00;Name=OsNip_01t0857975-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0857975-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37080266	37080532	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0858000-00;Name=OsNip_01t0858000-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0858000-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37276623	37277138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0860900-01;Name=OsNip_01t0860900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0860900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37279687	37280051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	37308265	37310312	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0861900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37308289	37308437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37309041	37309212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-01;Name=OsNip_01t0861900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0861900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37309041	37309212	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0861900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0861900-01;protein_id=OsNip_01t0861900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37309311	37310312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-01;Name=OsNip_01t0861900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0861900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37310133	37310312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	37309311	37310155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;Name=OsNip_01t0861900-02;exon_id=OsNip_01t0861900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	exon	37309043	37309212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;Name=OsNip_01t0861900-02;exon_id=OsNip_01t0861900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	37309058	37309212	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0861900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;protein_id=OsNip_01t0861900-02;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37310155	37310155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37309043	37309055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37308265	37308916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0861900-02;Tag=IsoSeq:G1978.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1525.1;prot_id "UniRef90_M0SGX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37310842	37311314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Name=OsNip_01t0862000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0862000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37311506	37311646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Name=OsNip_01t0862000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0862000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37311506	37311646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37312364	37312442	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37312364	37312481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Name=OsNip_01t0862000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0862000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37312443	37312481	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0862000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;protein_id=OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37313983	37314221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Name=OsNip_01t0862000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0862000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37313983	37314221	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0862000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;protein_id=OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37314356	37314638	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0862000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;protein_id=OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37314356	37314676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Name=OsNip_01t0862000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0862000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37314639	37314676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	37310831	37314711	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0862000-02;Parent=gene:OsNip_01g0862000;transcript_id=OsNip_01t0862000-02;Tag=IsoSeq:G1979.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1526.1
Chr01	TAMA	exon	37314356	37314711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-02;Name=OsNip_01t0862000-02;exon_id=OsNip_01t0862000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1979.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1526.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8IXK7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	37314356	37314711	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0862000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0862000-02;protein_id=OsNip_01t0862000-02;Tag=IsoSeq:G1979.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1526.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8IXK7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	37313983	37314221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862000-02;Name=OsNip_01t0862000-02;exon_id=OsNip_01t0862000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1979.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1526.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8IXK7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37335584	37336207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862800-01;Name=OsNip_01t0862800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0862800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37335851	37336207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0862800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37359523	37359558	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0863300-02;Tag=IsoSeq:G1984.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1210.2,Nipponbare.panicle_G1530.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CAN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37365714	37366103	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0863500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0863500-01;protein_id=OsNip_01t0863500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37366104	37366446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0863500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	37366217	37366327	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0863500-02;Parent=transcript:OsNip_01t0863500-02;protein_id=OsNip_01t0863500-02;Tag=IsoSeq:G1986.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1532.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8J2V2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37365424	37365509	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0863500-02;Tag=IsoSeq:G1986.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1532.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8J2V2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37365681	37366216	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0863500-02;Tag=IsoSeq:G1986.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1532.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8J2V2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37366331	37366446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0863500-02;Tag=IsoSeq:G1986.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1532.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8J2V2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37403702	37403883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37410342	37410508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864401-00;Name=OsNip_01t0864401-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0864401-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37410492	37410508	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0864401-00;Parent=transcript:OsNip_01t0864401-00;protein_id=OsNip_01t0864401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37411159	37411461	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864401-00;Name=OsNip_01t0864401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0864401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37412047	37412223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37412047	37413011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864500-01;Name=OsNip_01t0864500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0864500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37412941	37413011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37415178	37415459	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0864566-00;Parent=gene:OsNip_01g0864566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0864566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37415178	37415405	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0864566-00;Parent=transcript:OsNip_01t0864566-00;protein_id=OsNip_01t0864566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37415178	37415459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864566-00;Name=OsNip_01t0864566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0864566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37415406	37415459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	37417036	37423374	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0864700;Name=OsNip_Nek5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37417036	37417649	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0864700-00;Parent=gene:OsNip_01g0864700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0864700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37417036	37417301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37417036	37417649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-00;Name=OsNip_01t0864700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0864700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37417302	37417649	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0864700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0864700-00;protein_id=OsNip_01t0864700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	37417074	37423374	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0864700-01;Parent=gene:OsNip_01g0864700;transcript_id=OsNip_01t0864700-01;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2
Chr01	TAMA	exon	37423068	37423374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;Name=OsNip_01t0864700-01;exon_id=OsNip_01t0864700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	37423068	37423373	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0864700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;protein_id=OsNip_01t0864700-01;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	37422502	37422732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;Name=OsNip_01t0864700-01;exon_id=OsNip_01t0864700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	37422706	37422732	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0864700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;protein_id=OsNip_01t0864700-01;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	37422353	37422419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;Name=OsNip_01t0864700-01;exon_id=OsNip_01t0864700-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	37422208	37422273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0864700-01;Name=OsNip_01t0864700-01;exon_id=OsNip_01t0864700-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G1988.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1534.2,Nipponbare.root_G1213.2;prot_id "UniRef90_J3L649";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37513224	37513263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	37509919	37510019	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Name=OsNip_01t0866100-02;exon_id=OsNip_01t0866100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	CDS	37510903	37510972	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0866100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;protein_id=OsNip_01t0866100-02;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	TAMA	exon	37511606	37512219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Name=OsNip_01t0866100-02;exon_id=OsNip_01t0866100-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	37512762	37513281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Name=OsNip_01t0866100-02;exon_id=OsNip_01t0866100-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37509919	37509919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37511147	37511491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37511606	37512219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37512762	37513281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866100-02;Tag=IsoSeq:G1993.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G927.1,Nipponbare.leaf_G927.2,Nipponbare.panicle_G1537.5,Nipponbare.panicle_G1537.4,Nipponbare.root_G1217.1,Nipponbare.panicle_G1537.6,Nipponbare.root_G1217.3,Nipponbare.root_G1217.5,Nipponbare.panicle_G1537.3;prot_id "UniRef90_M0TQW8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	37510909	37512831	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0866133;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37510909	37512831	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0866133-00;Parent=gene:OsNip_01g0866133;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0866133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37510909	37510970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866133-00;Name=OsNip_01t0866133-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0866133-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37510909	37510970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866133-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	37526584	37526728	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0866600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0866600-02;protein_id=OsNip_01t0866600-02;Tag=IsoSeq:G1997.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1220.1,Nipponbare.panicle_G1541.3,Nipponbare.panicle_G1541.2,Nipponbare.leaf_G930.2;prot_id "UniRef90_M5WJP3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	exon	37526465	37526487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866600-02;Name=OsNip_01t0866600-02;exon_id=OsNip_01t0866600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G1997.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1220.1,Nipponbare.panicle_G1541.3,Nipponbare.panicle_G1541.2,Nipponbare.leaf_G930.2;prot_id "UniRef90_M5WJP3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	TAMA	exon	37525930	37526332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866600-02;Name=OsNip_01t0866600-02;exon_id=OsNip_01t0866600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G1997.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1220.1,Nipponbare.panicle_G1541.3,Nipponbare.panicle_G1541.2,Nipponbare.leaf_G930.2;prot_id "UniRef90_M5WJP3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37526729	37526729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866600-02;Tag=IsoSeq:G1997.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1220.1,Nipponbare.panicle_G1541.3,Nipponbare.panicle_G1541.2,Nipponbare.leaf_G930.2;prot_id "UniRef90_M5WJP3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37525930	37526312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866600-02;Tag=IsoSeq:G1997.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1220.1,Nipponbare.panicle_G1541.3,Nipponbare.panicle_G1541.2,Nipponbare.leaf_G930.2;prot_id "UniRef90_M5WJP3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37527433	37529093	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0866700-01;Parent=gene:OsNip_01g0866700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37527433	37527625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37527433	37527706	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;Name=OsNip_01t0866700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0866700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37527626	37527706	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0866700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;protein_id=OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37528107	37528202	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0866700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;protein_id=OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37528901	37529038	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0866700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;protein_id=OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37528901	37529093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;Name=OsNip_01t0866700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0866700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37529039	37529093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37529968	37530437	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0866750-00;Parent=gene:OsNip_01g0866750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0866750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37529968	37530037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37530038	37530358	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0866750-00;Parent=transcript:OsNip_01t0866750-00;protein_id=OsNip_01t0866750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	37530359	37530437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0866750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37535953	37539344	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0866800-01;Parent=gene:OsNip_01g0866800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0866800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37714796	37714889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0869900-02;Tag=IsoSeq:G2015.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1231.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37714857	37715481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0870100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37714857	37715555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0870100-01;Name=OsNip_01t0870100-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0870100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37834236	37834350	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0872500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0872500-01;protein_id=OsNip_01t0872500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	37839529	37840372	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872600-01;Name=OsNip_01t0872600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0872600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	37838819	37838891	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872600-02;Tag=IsoSeq:G2023.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1238.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9RX44";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	37839336	37840313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872600-02;Tag=IsoSeq:G2023.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1238.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9RX44";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	37843352	37844058	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0872650;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37843352	37844058	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0872650-00;Parent=gene:OsNip_01g0872650;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0872650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37843352	37843620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872650-00;Name=OsNip_01t0872650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0872650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37843821	37844058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872650-00;Name=OsNip_01t0872650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0872650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	37844994	37852790	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0872700;Name=OsNip_Xrn3;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	37844994	37852790	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0872700-01;Parent=gene:OsNip_01g0872700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0872700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	37844994	37845385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	37844994	37846052	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0872700-01;Name=OsNip_01t0872700-01-E23;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0872700-01-E23;rank=23;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	37845386	37846052	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0872700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0872700-01;protein_id=OsNip_01t0872700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38099048	38099482	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0877900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0877900-01;protein_id=OsNip_01t0877900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38099483	38099628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0877900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38101549	38102991	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0878000-02;Parent=gene:OsNip_01g0878000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0878000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38101549	38101901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0878000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38118825	38119017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0878550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	38191821	38192525	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0880100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38191821	38191990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38191821	38192525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880100-01;Name=OsNip_01t0880100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0880100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38202161	38202371	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880200-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38199826	38200021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38200195	38200841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38201145	38201922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38201145	38202367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;Name=OsNip_01t0880250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0880250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38201923	38202213	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0880250-00;Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;protein_id=OsNip_01t0880250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38202214	38202367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	38206952	38211683	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0880300;Name=OsNip_PME7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38206952	38211683	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0880300-02;Parent=gene:OsNip_01g0880300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0880300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38206952	38207110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38207111	38207802	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0880300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0880300-02;protein_id=OsNip_01t0880300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38210708	38211638	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0880300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0880300-02;protein_id=OsNip_01t0880300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38210708	38211683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880300-02;Name=OsNip_01t0880300-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0880300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38211639	38211683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	38207129	38210880	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0880350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38207129	38210880	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0880350-00;Parent=gene:OsNip_01g0880350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0880350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38207129	38207824	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0880350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0880350-00;protein_id=OsNip_01t0880350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38207129	38207860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880350-00;Name=OsNip_01t0880350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0880350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38207825	38207860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38210683	38210880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880350-00;Name=OsNip_01t0880350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0880350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38210683	38210880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0880350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38290773	38290970	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0882100-00;Parent=gene:OsNip_01g0882100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0882100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38291672	38292452	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0882200-00;Parent=gene:OsNip_01g0882200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0882200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38291810	38292142	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0882200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882200-00;protein_id=OsNip_01t0882200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38292249	38292344	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0882200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882200-00;protein_id=OsNip_01t0882200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38292249	38292452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882200-00;Name=OsNip_01t0882200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0882200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38305134	38305258	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0882300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0882300-01;protein_id=OsNip_01t0882300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38304960	38305065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882300-02;Name=OsNip_01t0882300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0882300-01-E8;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38305134	38305258	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0882300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0882300-02;protein_id=OsNip_01t0882300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38305134	38305568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882300-02;Name=OsNip_01t0882300-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0882300-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38300260	38300540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882250-00;Name=OsNip_01t0882250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0882250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	38305824	38306726	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0882400;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38305824	38306726	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0882400-01;Parent=gene:OsNip_01g0882400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0882400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38305824	38306543	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0882400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0882400-01;protein_id=OsNip_01t0882400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38305824	38306726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882400-01;Name=OsNip_01t0882400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0882400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38306544	38306726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	38306570	38307754	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0882500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38306570	38307754	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0882500-00;Parent=gene:OsNip_01g0882500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38306570	38306755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38306570	38306825	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Name=OsNip_01t0882500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0882500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38306756	38306825	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0882500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;protein_id=OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38306910	38306995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Name=OsNip_01t0882500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0882500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38306910	38306995	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0882500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;protein_id=OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38307109	38307225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Name=OsNip_01t0882500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0882500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38307109	38307225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0882500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;protein_id=OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38307341	38307703	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0882500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;protein_id=OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38307341	38307754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Name=OsNip_01t0882500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0882500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38307704	38307754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	38310588	38313631	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0882800;Name=OsNip_AAP11E;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38310588	38313631	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0882800-01;Parent=gene:OsNip_01g0882800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0882800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38310588	38310817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38310588	38311614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0882800-01;Name=OsNip_01t0882800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0882800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38323063	38323124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0883100-02;Tag=IsoSeq:G2065.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1599.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38321342	38321830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0883100-02;Tag=IsoSeq:G2065.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1599.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38329445	38329535	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0883200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0883200-01;protein_id=OsNip_01t0883200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38414222	38414293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38415050	38415106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38415217	38415273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38415217	38415273	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0884500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;protein_id=OsNip_01t0884500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38415384	38415440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38415550	38415606	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38415550	38415606	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0884500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;protein_id=OsNip_01t0884500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38416112	38416165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884500-01;Name=OsNip_01t0884500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0884500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38432869	38433428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884700-01;Tag=IsoSeq:G2072.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1605.3,Nipponbare.root_G1265.1,Nipponbare.leaf_G965.1;prot_id "UniRef90_J3L6I1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38431343	38431773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884700-01;Tag=IsoSeq:G2072.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1605.3,Nipponbare.root_G1265.1,Nipponbare.leaf_G965.1;prot_id "UniRef90_J3L6I1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38436060	38437032	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0884850-00;Parent=transcript:OsNip_01t0884850-00;protein_id=OsNip_01t0884850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38436060	38437082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884850-00;Name=OsNip_01t0884850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0884850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	38437193	38440422	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0884900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38437193	38438811	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0884900-01;Parent=gene:OsNip_01g0884900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0884900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38437193	38437313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38437314	38437340	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0884900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0884900-01;protein_id=OsNip_01t0884900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38437491	38437598	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0884900-01;Name=OsNip_01t0884900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0884900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38437491	38437598	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0884900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0884900-01;protein_id=OsNip_01t0884900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38545397	38545487	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0887100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0887100-01;protein_id=OsNip_01t0887100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38545580	38545633	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0887100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0887100-01;protein_id=OsNip_01t0887100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38545580	38545821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0887100-01;Name=OsNip_01t0887100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0887100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38545634	38545821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0887100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	38542775	38542925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0887100-02;Name=OsNip_01t0887100-02;exon_id=OsNip_01t0887100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2082.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G970.1;prot_id "UniRef90_A0A140CWN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38618768	38619152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0888500-01;Name=OsNip_01t0888500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0888500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38685170	38685666	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0889800-02;Tag=IsoSeq:G2093.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G975.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9QH06";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38688239	38688469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0889900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38692318	38692619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0889900-01;Name=OsNip_01t0889900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0889900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38692538	38692619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0889900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38698163	38702593	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0890001-01;Parent=gene:OsNip_01g0890001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0890001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38698163	38698648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0890001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38698163	38698726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0890001-01;Name=OsNip_01t0890001-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0890001-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38698649	38698726	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0890001-01;Parent=transcript:OsNip_01t0890001-01;protein_id=OsNip_01t0890001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38702434	38702520	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0890001-01;Parent=transcript:OsNip_01t0890001-01;protein_id=OsNip_01t0890001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38754459	38754908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0891300-02;Name=OsNip_01t0891300-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0891300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38796678	38797375	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0892300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38841929	38842417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893300-01;Name=OsNip_01t0893300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0893300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	38840245	38842418	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0893300-02;Parent=gene:OsNip_01g0893300;transcript_id=OsNip_01t0893300-02;Tag=IsoSeq:G2099.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1621.2
Chr01	TAMA	exon	38840245	38840457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893300-02;Name=OsNip_01t0893300-02;exon_id=OsNip_01t0893300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2099.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1621.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9YII7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38846248	38846386	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0893400-02;Parent=transcript:OsNip_01t0893400-02;protein_id=OsNip_01t0893400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38846248	38846506	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893400-02;Name=OsNip_01t0893400-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0893400-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38859999	38860214	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0893700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0893700-00;protein_id=OsNip_01t0893700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	38852797	38854346	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0893700-01;Parent=gene:OsNip_01g0893700;transcript_id=OsNip_01t0893700-01;Tag=IsoSeq:G2100.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1279.1
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Chr01	TAMA	CDS	38852932	38853228	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0893700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0893700-01;protein_id=OsNip_01t0893700-01;Tag=IsoSeq:G2100.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1279.1;prot_id "UniRef90_B9EVB3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	38853541	38854006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893700-01;Tag=IsoSeq:G2100.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1279.1;prot_id "UniRef90_B9EVB3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	38853229	38853246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893700-01;Tag=IsoSeq:G2100.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1279.1;prot_id "UniRef90_B9EVB3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	38852797	38852929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0893700-01;Tag=IsoSeq:G2100.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1279.1;prot_id "UniRef90_B9EVB3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38864030	38867821	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0894000-01;Parent=gene:OsNip_01g0894000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0894000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38864030	38864066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0894000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	38864030	38864322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0894000-01;Name=OsNip_01t0894000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0894000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	38864067	38864322	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0894000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0894000-01;protein_id=OsNip_01t0894000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	38884960	38887597	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0894300-02;Parent=gene:OsNip_01g0894300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0894300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	38925243	38926377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0895300-01;Name=OsNip_01t0895300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0895300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	38926170	38926377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0895300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	38986663	38986821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0897100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	39177279	39178286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0900300-00;Name=OsNip_01t0900300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0900300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39178285	39178286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0900300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	39192083	39192770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t090069A-01;Name=OsNip_01t090069A-01-E1;exon_id=OsNip_01t090069A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2126.1;Source=Nipponbare.panicle_G1641.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39344943	39345206	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0904000-00;Parent=transcript:OsNip_01t0904000-00;protein_id=OsNip_01t0904000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39357530	39362871	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0904200-01;Parent=gene:OsNip_01g0904200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0904200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39357530	39357696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0904200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	39411898	39413226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905300-02;Tag=IsoSeq:G2141.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1312.4;prot_id "UniRef90_A2WY34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	39417954	39418617	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905400-01;Name=OsNip_01t0905400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0905400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39421336	39421382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39421845	39422280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39431871	39432081	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0905700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0905700-01;protein_id=OsNip_01t0905700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39431871	39432424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905700-01;Name=OsNip_01t0905700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0905700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39432082	39432424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39433408	39435696	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0905800-01;Parent=gene:OsNip_01g0905800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0905800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39433408	39433697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39433408	39434746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;Name=OsNip_01t0905800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0905800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39433698	39434746	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0905800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;protein_id=OsNip_01t0905800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39435553	39435580	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0905800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;protein_id=OsNip_01t0905800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39435553	39435696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;Name=OsNip_01t0905800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0905800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39435581	39435696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39433448	39435652	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0905800-03;Parent=gene:OsNip_01g0905800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0905800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39433448	39433697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39433448	39434746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0905800-03;Name=OsNip_01t0905800-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0905800-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39433698	39434746	.	-	2	ID=CDS:OsNip_01t0905800-03;Parent=transcript:OsNip_01t0905800-03;protein_id=OsNip_01t0905800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39435553	39435580	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0905800-03;Parent=transcript:OsNip_01t0905800-03;protein_id=OsNip_01t0905800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39670664	39670720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	39668420	39668476	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39668555	39668675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39668764	39668814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39669064	39669176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39669638	39669723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39670204	39670406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910450-00;Name=OsNip_01t0910450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	39670759	39672253	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0910500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39670759	39672253	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0910500-01;Parent=gene:OsNip_01g0910500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0910500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39670759	39670959	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39670759	39672253	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910500-01;Name=OsNip_01t0910500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39670960	39672186	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0910500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0910500-01;protein_id=OsNip_01t0910500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39672187	39672253	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39679510	39680136	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0910800-00;Parent=gene:OsNip_01g0910800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39679510	39679708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Name=OsNip_01t0910800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39679510	39679708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39679716	39679737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Name=OsNip_01t0910800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39679716	39679737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39679762	39679770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39679762	39680136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Name=OsNip_01t0910800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39679771	39680079	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0910800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;protein_id=OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39680080	39680136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	39679522	39680146	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0910800-01;Parent=gene:OsNip_01g0910800;transcript_id=OsNip_01t0910800-01;Tag=IsoSeq:G2160.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1667.1
Chr01	TAMA	exon	39679522	39680146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-01;Name=OsNip_01t0910800-01;exon_id=OsNip_01t0910800-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2160.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1667.1;prot_id "UniRef90_I1HUG1";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	CDS	39679716	39679883	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0910800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0910800-01;protein_id=OsNip_01t0910800-01;Tag=IsoSeq:G2160.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1667.1;prot_id "UniRef90_I1HUG1";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	39679884	39680146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-01;Tag=IsoSeq:G2160.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1667.1;prot_id "UniRef90_I1HUG1";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	39679522	39679713	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910800-01;Tag=IsoSeq:G2160.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1667.1;prot_id "UniRef90_I1HUG1";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	39682839	39683433	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0910900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	39682842	39683433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0910900-01;Parent=gene:OsNip_01g0910900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0910900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39682842	39683080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	39682842	39683433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-01;Name=OsNip_01t0910900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0910900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39683081	39683356	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0910900-01;Parent=transcript:OsNip_01t0910900-01;protein_id=OsNip_01t0910900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39683357	39683433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	39682839	39683433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0910900-02;Parent=gene:OsNip_01g0910900;transcript_id=OsNip_01t0910900-02;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2
Chr01	TAMA	exon	39683058	39683433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-02;Name=OsNip_01t0910900-02;exon_id=OsNip_01t0910900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2;prot_id "UniRef90_M8B3N4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	CDS	39683416	39683433	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0910900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0910900-02;protein_id=OsNip_01t0910900-02;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2;prot_id "UniRef90_M8B3N4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	exon	39682839	39682965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-02;Name=OsNip_01t0910900-02;exon_id=OsNip_01t0910900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2;prot_id "UniRef90_M8B3N4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	39683058	39683413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-02;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2;prot_id "UniRef90_M8B3N4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	39682839	39682965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0910900-02;Tag=IsoSeq:G2161.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1000.2;prot_id "UniRef90_M8B3N4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	39684584	39687171	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0911000;biotype=protein_coding;description=Sas10/Utp3/C1D;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	39692411	39692555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0911100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	gene	39878959	39879405	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0915401;biotype=protein_coding;description=Proteinase;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	39878959	39879405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0915401-00;Name=OsNip_01t0915401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0915401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39878959	39879405	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0915401-00;Parent=transcript:OsNip_01t0915401-00;protein_id=OsNip_01t0915401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	39881691	39890325	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0915350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	39881890	39882033	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0915350-00;Parent=transcript:OsNip_01t0915350-00;protein_id=OsNip_01t0915350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	39882122	39882251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0915350-00;Name=OsNip_01t0915350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0915350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	39882319	39882381	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0915350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40019693	40023577	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0917500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0917500-01;protein_id=OsNip_01t0917500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	40023578	40023853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0917500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40177910	40177993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0920300-01;Name=OsNip_01t0920300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0920300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40177910	40177993	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0920300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0920300-01;protein_id=OsNip_01t0920300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40232085	40232180	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0921300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0921300-01;protein_id=OsNip_01t0921300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40232336	40233212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0921300-01;Name=OsNip_01t0921300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0921300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	40235190	40238278	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0921400-01;Parent=gene:OsNip_01g0921400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0921400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	40235190	40235248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0921400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	40235190	40235587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0921400-01;Name=OsNip_01t0921400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0921400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40235249	40235587	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0921400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0921400-01;protein_id=OsNip_01t0921400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40235635	40235784	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0921400-01;Parent=transcript:OsNip_01t0921400-01;protein_id=OsNip_01t0921400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40553482	40553612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0925000-01;Name=OsNip_01t0925000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0925000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40785360	40785446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-01;Name=OsNip_01t0929100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0929100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40785360	40785446	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0929100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0929100-01;protein_id=OsNip_01t0929100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40786167	40786723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-01;Name=OsNip_01t0929100-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0929100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	40785129	40785164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	40785129	40785446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Name=OsNip_01t0929100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0929100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40785795	40785863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Name=OsNip_01t0929100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0929100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40785795	40785863	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0929100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;protein_id=OsNip_01t0929100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	40786006	40786064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Name=OsNip_01t0929100-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0929100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40786006	40786064	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0929100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;protein_id=OsNip_01t0929100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	40786167	40786742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Name=OsNip_01t0929100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0929100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	40786404	40786742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	40786287	40786541	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0929100-03;Parent=gene:OsNip_01g0929100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0929100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40786287	40786403	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0929100-03;Parent=transcript:OsNip_01t0929100-03;protein_id=OsNip_01t0929100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	40786287	40786541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0929100-03;Name=OsNip_01t0929100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0929100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	40829895	40830191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0930400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	40833605	40834861	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0930500-01;Parent=gene:OsNip_01g0930500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0930500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	40833605	40833927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0930500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	40833605	40834861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0930500-01;Name=OsNip_01t0930500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0930500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	40833928	40834626	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0930500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0930500-01;protein_id=OsNip_01t0930500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	40834627	40834861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0930500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	40842288	40842289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0930800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	40909710	40914137	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0932550-00;Parent=gene:OsNip_01g0932550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0932550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41139354	41139354	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937025-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41139354	41140530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937025-00;Name=OsNip_01t0937025-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0937025-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41139355	41140530	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0937025-00;Parent=transcript:OsNip_01t0937025-00;protein_id=OsNip_01t0937025-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41139355	41140629	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0937050;Name=OsNip_CLP;biotype=protein_coding;description=Homolog;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41139355	41140629	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0937050-01;Parent=gene:OsNip_01g0937050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0937050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41139355	41140629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937050-01;Name=OsNip_01t0937050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0937050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41139355	41140629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0937050-01;Parent=transcript:OsNip_01t0937050-01;protein_id=OsNip_01t0937050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41141999	41143462	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0937100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41142013	41143416	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0937100-01;Parent=gene:OsNip_01g0937100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0937100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41142013	41142144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41142013	41143416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-01;Name=OsNip_01t0937100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0937100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41142145	41143404	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0937100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0937100-01;protein_id=OsNip_01t0937100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41143405	41143416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	41141999	41143462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0937100-02;Parent=gene:OsNip_01g0937100;transcript_id=OsNip_01t0937100-02;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1
Chr01	TAMA	exon	41143389	41143462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-02;Name=OsNip_01t0937100-02;exon_id=OsNip_01t0937100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1;prot_id "UniRef90_I1HV10";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	41143389	41143462	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0937100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0937100-02;protein_id=OsNip_01t0937100-02;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1;prot_id "UniRef90_I1HV10";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	exon	41141999	41143082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-02;Name=OsNip_01t0937100-02;exon_id=OsNip_01t0937100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1;prot_id "UniRef90_I1HV10";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	CDS	41142638	41143082	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0937100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0937100-02;protein_id=OsNip_01t0937100-02;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1;prot_id "UniRef90_I1HV10";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41141999	41142635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0937100-02;Tag=IsoSeq:G2290.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1387.1;prot_id "UniRef90_I1HV10";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41145301	41146727	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0937200;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41145301	41146727	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0937200-01;Parent=gene:OsNip_01g0937200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0937200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41262734	41265391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0939800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41300203	41301041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;Name=OsNip_01t0940000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0940000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41301400	41301660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;Name=OsNip_01t0940000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41301400	41301660	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0940000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;protein_id=OsNip_01t0940000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41301795	41302057	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;Name=OsNip_01t0940000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41301795	41302057	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0940000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;protein_id=OsNip_01t0940000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41302148	41302472	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0940000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;protein_id=OsNip_01t0940000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41302148	41302983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;Name=OsNip_01t0940000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0940000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41302473	41302983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41305317	41311135	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0940100;Name=OsNip_HXK3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41305317	41307138	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0940100-02;Parent=gene:OsNip_01g0940100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0940100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41305317	41306420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41305317	41307138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-02;Name=OsNip_01t0940100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0940100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41306421	41306642	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-02;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-02;protein_id=OsNip_01t0940100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41306643	41307138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41305718	41311135	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0940100-01;Parent=gene:OsNip_01g0940100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41305718	41305824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41305718	41306199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41305825	41306199	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41306289	41306370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41306289	41306370	.	-	1	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41306491	41306618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41306491	41306618	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41306700	41306798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41306700	41306798	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41306920	41307075	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41306920	41307075	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41308350	41308424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41308350	41308424	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41310977	41311135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;Name=OsNip_01t0940100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41310977	41311135	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0940100-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940100-01;protein_id=OsNip_01t0940100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41343327	41344282	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0940600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41343327	41344264	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0940600-01;Parent=gene:OsNip_01g0940600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0940600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41343327	41343392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41343327	41343662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;Name=OsNip_01t0940600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0940600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41343393	41343662	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0940600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;protein_id=OsNip_01t0940600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41343764	41343931	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0940600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;protein_id=OsNip_01t0940600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41343764	41344264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;Name=OsNip_01t0940600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0940600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41343932	41344264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	41343334	41344282	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0940600-02;Parent=gene:OsNip_01g0940600;transcript_id=OsNip_01t0940600-02;Tag=IsoSeq:G2304.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1061.2
Chr01	TAMA	exon	41343334	41344282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-02;Name=OsNip_01t0940600-02;exon_id=OsNip_01t0940600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2304.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1061.2;prot_id "UniRef90_M7YH09";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	41343334	41343690	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0940600-02;Parent=transcript:OsNip_01t0940600-02;protein_id=OsNip_01t0940600-02;Tag=IsoSeq:G2304.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1061.2;prot_id "UniRef90_M7YH09";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41343694	41344282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940600-02;Tag=IsoSeq:G2304.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1061.2;prot_id "UniRef90_M7YH09";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41346647	41348373	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0940700;Name=OsNip_PR2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41346647	41348356	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0940700-01;Parent=gene:OsNip_01g0940700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0940700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41346647	41346748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0940700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41454397	41454542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0943100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41493483	41493586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0944000-03;Name=OsNip_01t0944000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0944000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41493653	41494443	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0944000-03;Name=OsNip_01t0944000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0944000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41539854	41540865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0944900-02;Tag=IsoSeq:G2315.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1069.9;prot_id "UniRef90_A0A5J9VL69";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41572819	41573073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0945650-00;Name=OsNip_01t0945650-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0945650-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41573194	41573344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0945650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41570750	41572049	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0945700-00;Parent=gene:OsNip_01g0945700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0945700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41570750	41571109	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0945700-00;Name=OsNip_01t0945700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0945700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41570750	41571109	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0945700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0945700-00;protein_id=OsNip_01t0945700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41571207	41572049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0945700-00;Name=OsNip_01t0945700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0945700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41571207	41572049	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0945700-00;Parent=transcript:OsNip_01t0945700-00;protein_id=OsNip_01t0945700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	41570553	41573396	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0945700-01;Parent=gene:OsNip_01g0945700;transcript_id=OsNip_01t0945700-01;Tag=IsoSeq:G2318.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1071.2
Chr01	TAMA	exon	41573204	41573396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0945700-01;Name=OsNip_01t0945700-01;exon_id=OsNip_01t0945700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2318.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1071.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9VFH9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41629533	41630468	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-01;Name=OsNip_01t0947000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0947000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41629533	41630468	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0947000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0947000-01;protein_id=OsNip_01t0947000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41630584	41631539	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0947000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0947000-01;protein_id=OsNip_01t0947000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41630584	41631696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-01;Name=OsNip_01t0947000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0947000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41631540	41631696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	41630782	41631703	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0947000-02;Parent=gene:OsNip_01g0947000;transcript_id=OsNip_01t0947000-02;Tag=IsoSeq:G2324.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1405.5
Chr01	TAMA	exon	41630782	41631703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-02;Name=OsNip_01t0947000-02;exon_id=OsNip_01t0947000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2324.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1405.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	CDS	41630784	41631533	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0947000-02;Parent=transcript:OsNip_01t0947000-02;protein_id=OsNip_01t0947000-02;Tag=IsoSeq:G2324.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1405.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	41630782	41630783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-02;Tag=IsoSeq:G2324.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1405.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41631537	41631703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947000-02;Tag=IsoSeq:G2324.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1405.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41657953	41658477	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0947500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41657953	41658477	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0947500-00;Parent=gene:OsNip_01g0947500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0947500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41657953	41657962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41657953	41658477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947500-00;Name=OsNip_01t0947500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41657963	41658247	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0947500-00;Parent=transcript:OsNip_01t0947500-00;protein_id=OsNip_01t0947500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41658248	41658477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41677883	41681803	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0947700;Name=OsNip_g1;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41677883	41681803	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0947700-01;Parent=gene:OsNip_01g0947700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0947700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41677883	41679275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;Name=OsNip_01t0947700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41677883	41679275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41679655	41680586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41679655	41681803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;Name=OsNip_01t0947700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41680587	41681246	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0947700-01;Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;protein_id=OsNip_01t0947700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41681247	41681803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41679818	41679905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41679818	41680517	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;Name=OsNip_01t0947767-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947767-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41679906	41680517	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0947767-00;Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;protein_id=OsNip_01t0947767-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41680580	41680627	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0947767-00;Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;protein_id=OsNip_01t0947767-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41680580	41681392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;Name=OsNip_01t0947767-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0947767-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41680628	41681392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947767-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41689146	41689565	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947800-00;Name=OsNip_01t0947800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0947800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41689146	41689565	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0947800-00;Parent=transcript:OsNip_01t0947800-00;protein_id=OsNip_01t0947800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41689620	41690158	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0947833;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41689620	41690158	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0947833-00;Parent=gene:OsNip_01g0947833;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0947833-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41689620	41689791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;Name=OsNip_01t0947833-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947833-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41689620	41689791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41689804	41689944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41689804	41690158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;Name=OsNip_01t0947833-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0947833-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41689945	41690157	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0947833-00;Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;protein_id=OsNip_01t0947833-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41690158	41690158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0947833-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41691190	41698689	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0948100;Name=OsNip_MUS81;biotype=protein_coding;description=Restriction;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41691190	41698689	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0948100-01;Parent=gene:OsNip_01g0948100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0948100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41691190	41691310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41691190	41691513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948100-01;Name=OsNip_01t0948100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41698353	41698689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41698428	41699108	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0948133;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41698428	41699108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948133-01;Name=OsNip_01t0948133-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948133-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41712152	41714118	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0948200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41712445	41714110	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0948200-00;Parent=gene:OsNip_01g0948200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0948200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41712445	41712482	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41712445	41713988	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;Name=OsNip_01t0948200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41712483	41713811	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0948200-00;Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;protein_id=OsNip_01t0948200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41713812	41713988	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41714044	41714110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;Name=OsNip_01t0948200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41714044	41714110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	41712152	41714118	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0948200-01;Parent=gene:OsNip_01g0948200;transcript_id=OsNip_01t0948200-01;Tag=IsoSeq:G2325.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1792.2
Chr01	TAMA	exon	41712152	41714118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-01;Name=OsNip_01t0948200-01;exon_id=OsNip_01t0948200-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2325.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1792.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0GNT8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	41712153	41712293	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0948200-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948200-01;protein_id=OsNip_01t0948200-01;Tag=IsoSeq:G2325.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1792.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0GNT8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	five_prime_UTR	41712152	41712152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-01;Tag=IsoSeq:G2325.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1792.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0GNT8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41712297	41714118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948200-01;Tag=IsoSeq:G2325.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1792.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0GNT8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41716035	41718600	.	+	.	ID=gene:OsNip_01g0948300;biotype=protein_coding;description=Cellular;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41716035	41718600	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0948300-01;Parent=gene:OsNip_01g0948300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41716035	41716103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41716035	41716350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;Name=OsNip_01t0948300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41716104	41716350	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0948300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;protein_id=OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41716983	41717247	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;Name=OsNip_01t0948300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0948300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41716983	41717247	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0948300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;protein_id=OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41718030	41718279	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0948300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;protein_id=OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41718030	41718600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;Name=OsNip_01t0948300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0948300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41718280	41718600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41718639	41721571	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0948400;Name=OsNip_P5CR;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41718639	41721571	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0948400-02;Parent=gene:OsNip_01g0948400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0948400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41722524	41722944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41724841	41725141	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;Name=OsNip_01t0948500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0948500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41724841	41725141	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0948500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;protein_id=OsNip_01t0948500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41725750	41726010	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0948500-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;protein_id=OsNip_01t0948500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41725750	41726196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;Name=OsNip_01t0948500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41726011	41726196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	exon	41722427	41723525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-02;Name=OsNip_01t0948500-02;exon_id=OsNip_01t0948500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2328.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1408.1;prot_id "UniRef90_UPI000C1CE781";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr01	TAMA	five_prime_UTR	41722842	41723525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-02;Tag=IsoSeq:G2328.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1408.1;prot_id "UniRef90_UPI000C1CE781";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41722427	41722737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948500-02;Tag=IsoSeq:G2328.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1408.1;prot_id "UniRef90_UPI000C1CE781";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41728692	41729581	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0948600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41728692	41729581	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0948600-01;Parent=gene:OsNip_01g0948600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0948600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41728692	41729174	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41728692	41729581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948600-01;Name=OsNip_01t0948600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0948600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41729175	41729312	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0948600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0948600-01;protein_id=OsNip_01t0948600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41729313	41729581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41742500	41743499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	three_prime_UTR	41741371	41742475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0948900-03;Tag=IsoSeq:G2330.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1797.2;prot_id "UniRef90_A0A251UND9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41788113	41788243	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0949140-00;Parent=transcript:OsNip_01t0949140-00;protein_id=OsNip_01t0949140-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	41814168	41814793	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0949220-00;Parent=gene:OsNip_01g0949220;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_01t0949220-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41814168	41814673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0949220-00;Name=OsNip_01t0949220-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0949220-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41814752	41814793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0949220-00;Name=OsNip_01t0949220-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0949220-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41848510	41849077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0950000-01;Name=OsNip_01t0950000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0950000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	41848891	41849077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0950000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	41848481	41848810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0950100-00;Name=OsNip_01t0950100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0950100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	gene	41853850	41854831	.	-	.	ID=gene:OsNip_01g0950200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41931148	41931234	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0952300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0952300-00;protein_id=OsNip_01t0952300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	41932464	41932532	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0952300-00;Parent=transcript:OsNip_01t0952300-00;protein_id=OsNip_01t0952300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	41932464	41932899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0952300-00;Name=OsNip_01t0952300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0952300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	41932533	41932899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0952300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	TAMA	CDS	41932464	41932887	.	-	.	ID=CDS:OsNip_01t0952300-01;Parent=transcript:OsNip_01t0952300-01;protein_id=OsNip_01t0952300-01;Tag=IsoSeq:G2343.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1808.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1XGZ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	42152701	42153070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0956600-01;Name=OsNip_01t0956600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0956600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42152701	42153070	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0956600-01;Parent=transcript:OsNip_01t0956600-01;protein_id=OsNip_01t0956600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	42153170	42153291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0956600-01;Name=OsNip_01t0956600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_01t0956600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	42470362	42470362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0963800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42470363	42470449	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0963800-01;Parent=transcript:OsNip_01t0963800-01;protein_id=OsNip_01t0963800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	42470909	42471259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0963800-01;Name=OsNip_01t0963800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_01t0963800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	42479692	42479950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0964000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	42482948	42483339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0964000-01;Name=OsNip_01t0964000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0964000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	42684942	42685393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0967800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	42692461	42692593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0967900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	42693148	42693260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0967900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42689978	42690224	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0967900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0967900-02;protein_id=OsNip_01t0967900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42690442	42690577	.	+	2	ID=CDS:OsNip_01t0967900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0967900-02;protein_id=OsNip_01t0967900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42691041	42691313	.	+	1	ID=CDS:OsNip_01t0967900-02;Parent=transcript:OsNip_01t0967900-02;protein_id=OsNip_01t0967900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	exon	42707053	42707981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0968300-01;Name=OsNip_01t0968300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_01t0968300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	42736008	42737917	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0969000-01;Parent=gene:OsNip_01g0969000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0969000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42736278	42736388	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0969000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0969000-01;protein_id=OsNip_01t0969000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	CDS	42737621	42737830	.	-	0	ID=CDS:OsNip_01t0969000-01;Parent=transcript:OsNip_01t0969000-01;protein_id=OsNip_01t0969000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	exon	42737621	42737917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0969000-01;Name=OsNip_01t0969000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_01t0969000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	42737831	42737917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0969000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	mRNA	42738765	42742174	.	-	.	ID=transcript:OsNip_01t0969100-01;Parent=gene:OsNip_01g0969100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_01t0969100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	42738765	42739222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0969100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	42852692	42852984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_01t0971200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	43047513	43047671	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0974200-03;Parent=transcript:OsNip_01t0974200-03;protein_id=OsNip_01t0974200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	43047672	43047861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0974200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	43047165	43047877	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0974200-04;Parent=gene:OsNip_01g0974200;transcript_id=OsNip_01t0974200-04;Tag=IsoSeq:G2439.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1882.3
Chr01	TAMA	exon	43047165	43047449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0974200-04;Name=OsNip_01t0974200-04;exon_id=OsNip_01t0974200-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2439.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1882.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr01	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	43096858	43096885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0975300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr01	RAP2018-11-26	CDS	43096886	43097518	.	+	0	ID=CDS:OsNip_01t0975300-02;Parent=transcript:OsNip_01t0975300-02;protein_id=OsNip_01t0975300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	43097519	43097940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0975300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr01	TAMA	mRNA	43096681	43097710	.	+	.	ID=transcript:OsNip_01t0975300-03;Parent=gene:OsNip_01g0975300;transcript_id=OsNip_01t0975300-03;Tag=IsoSeq:G2445.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1485.5
Chr01	TAMA	exon	43096681	43096734	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0975300-03;Name=OsNip_01t0975300-03;exon_id=OsNip_01t0975300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2445.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1485.5;prot_id "UniRef90_M1B9E2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	exon	43096953	43097710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_01t0975300-03;Name=OsNip_01t0975300-03;exon_id=OsNip_01t0975300-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2445.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1485.5;prot_id "UniRef90_M1B9E2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr01	TAMA	CDS	43097301	43097579	.	+	.	ID=CDS:OsNip_01t0975300-03;Parent=transcript:OsNip_01t0975300-03;protein_id=OsNip_01t0975300-03;Tag=IsoSeq:G2445.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1485.5;prot_id "UniRef90_M1B9E2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	257773	258070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103622-00;Name=OsNip_10t0103622-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0103622-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	257773	258070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103622-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	258697	258741	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0103622-00;Parent=transcript:OsNip_10t0103622-00;protein_id=OsNip_10t0103622-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	259782	260018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103622-00;Name=OsNip_10t0103622-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0103622-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	259974	260018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103622-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	263292	271996	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0103500-00;Parent=gene:OsNip_10g0103500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	263292	263972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	263292	265933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Name=OsNip_10t0103500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0103500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	263973	264698	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0103500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;protein_id=OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	264699	265933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	269601	271272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Name=OsNip_10t0103500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0103500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	269601	271272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	271283	271996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Name=OsNip_10t0103500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0103500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	271283	271996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	284700	286949	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0103700;Name=OsNip_hox15;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	284706	285771	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0103700-03;Parent=gene:OsNip_10g0103700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0103700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	284706	285271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	284706	285346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;Name=OsNip_10t0103700-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0103700-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	285272	285346	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0103700-03;Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;protein_id=OsNip_10t0103700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	285461	285610	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0103700-03;Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;protein_id=OsNip_10t0103700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	285461	285771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;Name=OsNip_10t0103700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0103700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	285611	285771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0103700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	284721	286945	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0103700-02;Parent=gene:OsNip_10g0103700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0103700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	655625	656001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0109300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	656514	656676	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0109300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0109300-01;protein_id=OsNip_10t0109300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	658808	658866	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0109300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	658751	658863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0109300-03;Name=OsNip_10t0109300-03;exon_id=OsNip_10t0109300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14579.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8697.1;prot_id "UniRef90_A0A453SQI7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	925710	925889	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0114300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0114300-01;protein_id=OsNip_10t0114300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	926079	926324	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0114300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0114300-01;protein_id=OsNip_10t0114300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	926079	926465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114300-01;Name=OsNip_10t0114300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0114300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	926325	926465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	926519	930299	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0114400;Name=OsNip_BRI1;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	926519	930299	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0114400-01;Parent=gene:OsNip_10g0114400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0114400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	926519	926687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	926519	930299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114400-01;Name=OsNip_10t0114400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	926688	930020	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0114400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0114400-01;protein_id=OsNip_10t0114400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	930021	930299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	939067	940863	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0114500;biotype=protein_coding;description=Barley;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	939084	940863	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0114500-01;Parent=gene:OsNip_10g0114500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0114500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	939084	939375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	939084	940511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;Name=OsNip_10t0114500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	939376	940401	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0114500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;protein_id=OsNip_10t0114500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	940402	940511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	940702	940863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;Name=OsNip_10t0114500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	940702	940863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	939067	940853	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0114500-02;Parent=gene:OsNip_10g0114500;transcript_id=OsNip_10t0114500-02;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2
Chr10	TAMA	exon	940702	940853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;Name=OsNip_10t0114500-02;exon_id=OsNip_10t0114500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	940702	940851	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0114500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;protein_id=OsNip_10t0114500-02;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	exon	939067	940477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;Name=OsNip_10t0114500-02;exon_id=OsNip_10t0114500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	940310	940477	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0114500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;protein_id=OsNip_10t0114500-02;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	940852	940853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	939067	940307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114500-02;Tag=IsoSeq:G14591.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11466.2;prot_id "UniRef90_Q7XH85";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	956079	997375	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0114850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	956079	997375	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0114850-00;Parent=gene:OsNip_10g0114850;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0114850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	956079	956290	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114850-00;Name=OsNip_10t0114850-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114850-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	991751	991921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114850-00;Name=OsNip_10t0114850-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114850-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	995243	995339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114850-00;Name=OsNip_10t0114850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	995822	995933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114850-00;Name=OsNip_10t0114850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	997236	997375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0114850-00;Name=OsNip_10t0114850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0114850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	1083978	1084105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;Name=OsNip_10t0116800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0116800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	1084420	1084487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;Name=OsNip_10t0116800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0116800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1084420	1084487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0116800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;protein_id=OsNip_10t0116800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1084567	1084804	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0116800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;protein_id=OsNip_10t0116800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1084567	1084984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;Name=OsNip_10t0116800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0116800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1084805	1084984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1085228	1088637	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0116900-02;Parent=gene:OsNip_10g0116900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0116900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1085228	1085641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1085228	1086371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;Name=OsNip_10t0116900-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0116900-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1085642	1086371	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0116900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;protein_id=OsNip_10t0116900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1086788	1086942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;Name=OsNip_10t0116900-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0116900-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1086788	1086942	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0116900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;protein_id=OsNip_10t0116900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1087021	1087133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;Name=OsNip_10t0116900-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0116900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1087021	1087133	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0116900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0116900-02;protein_id=OsNip_10t0116900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1129214	1129383	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0117800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0117800-02;protein_id=OsNip_10t0117800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1129500	1130076	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0117800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0117800-02;protein_id=OsNip_10t0117800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1129500	1131484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0117800-02;Name=OsNip_10t0117800-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0117800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1130077	1131484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0117800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1139924	1141436	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0118000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1139929	1141433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118000-01;Parent=gene:OsNip_10g0118000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1139929	1140494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Name=OsNip_10t0118000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1139929	1140494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1140604	1140950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1140604	1140991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Name=OsNip_10t0118000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0118000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1140951	1140991	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;protein_id=OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1141119	1141404	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0118000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;protein_id=OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1141119	1141433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Name=OsNip_10t0118000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1141405	1141433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	1139924	1141436	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118000-02;Parent=gene:OsNip_10g0118000;transcript_id=OsNip_10t0118000-02;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3
Chr10	TAMA	exon	1140604	1141436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;Name=OsNip_10t0118000-02;exon_id=OsNip_10t0118000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	1140604	1141434	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0118000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;protein_id=OsNip_10t0118000-02;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	1139924	1140512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;Name=OsNip_10t0118000-02;exon_id=OsNip_10t0118000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	1140507	1140512	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0118000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;protein_id=OsNip_10t0118000-02;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	1141435	1141436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	1139924	1140504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118000-02;Tag=IsoSeq:G14598.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11471.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1160415	1163436	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0118100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1160415	1163436	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0118100-01;Parent=gene:OsNip_10g0118100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0118100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1160415	1160490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1160415	1163436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118100-01;Name=OsNip_10t0118100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1160491	1160751	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0118100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0118100-01;protein_id=OsNip_10t0118100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1160752	1163436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1162917	1164483	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0118200;Name=ZRP4;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1162917	1164483	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118200-01;Parent=gene:OsNip_10g0118200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0118200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1162917	1163562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;Name=OsNip_10t0118200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1162917	1163562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1163650	1164068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1163650	1164483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;Name=OsNip_10t0118200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1164069	1164308	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0118200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;protein_id=OsNip_10t0118200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1164309	1164483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	1162917	1164483	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118200-02;Parent=gene:OsNip_10g0118200;transcript_id=OsNip_10t0118200-02;Tag=IsoSeq:G14599.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11472.2
Chr10	TAMA	exon	1162917	1164483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-02;Name=OsNip_10t0118200-02;exon_id=OsNip_10t0118200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14599.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11472.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	1163644	1164483	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0118200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0118200-02;protein_id=OsNip_10t0118200-02;Tag=IsoSeq:G14599.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11472.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	1162917	1163641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118200-02;Tag=IsoSeq:G14599.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11472.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1189829	1190703	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0118800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1189829	1190703	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118800-00;Parent=gene:OsNip_10g0118800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1189829	1189976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1189829	1190234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;Name=OsNip_10t0118800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0118800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1189977	1190234	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0118800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;protein_id=OsNip_10t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1190514	1190702	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0118800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;protein_id=OsNip_10t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1190514	1190703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;Name=OsNip_10t0118800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0118800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1190703	1190703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1193347	1194794	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0118900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1193347	1194794	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0118900-01;Parent=gene:OsNip_10g0118900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0118900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1193347	1193982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1193347	1194114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118900-01;Name=OsNip_10t0118900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0118900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1193983	1194114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0118900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0118900-01;protein_id=OsNip_10t0118900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1194241	1194372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0118900-01;Name=OsNip_10t0118900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0118900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1531684	1531815	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124000-01;protein_id=OsNip_10t0124000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1531927	1531953	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124000-01;protein_id=OsNip_10t0124000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	1532800	1536191	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0124100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1532800	1536184	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0124100-01;Parent=gene:OsNip_10g0124100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1532800	1532953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1532800	1533043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;Name=OsNip_10t0124100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1532954	1533043	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;protein_id=OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1534431	1534776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;Name=OsNip_10t0124100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0124100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1534431	1534776	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;protein_id=OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1534875	1536001	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0124100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;protein_id=OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1534875	1536184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;Name=OsNip_10t0124100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0124100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1536002	1536184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	1532802	1536191	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0124100-02;Parent=gene:OsNip_10g0124100;transcript_id=OsNip_10t0124100-02;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1
Chr10	TAMA	exon	1532802	1534776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-02;Name=OsNip_10t0124100-02;exon_id=OsNip_10t0124100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1;prot_id "UniRef90_A0A287PCL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	1532802	1533146	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0124100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0124100-02;protein_id=OsNip_10t0124100-02;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1;prot_id "UniRef90_A0A287PCL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	1534875	1536191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-02;Name=OsNip_10t0124100-02;exon_id=OsNip_10t0124100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1;prot_id "UniRef90_A0A287PCL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	1533150	1534776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-02;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1;prot_id "UniRef90_A0A287PCL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	1534875	1536191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124100-02;Tag=IsoSeq:G14603.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11474.1,Nipponbare.root_G8708.2,Nipponbare.root_G8708.1;prot_id "UniRef90_A0A287PCL5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1534242	1536004	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0124150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1534242	1536004	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0124150-00;Parent=gene:OsNip_10g0124150;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0124150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1534242	1534788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124150-00;Name=OsNip_10t0124150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1534902	1536004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124150-00;Name=OsNip_10t0124150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1539462	1540349	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0124200;Name=OsNip_CAF1-15;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1539462	1540349	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0124200-00;Parent=gene:OsNip_10g0124200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0124200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1539462	1540349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124200-00;Name=OsNip_10t0124200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0124200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1539462	1540349	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0124200-00;protein_id=OsNip_10t0124200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1545297	1548037	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0124400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1545297	1548037	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0124400-00;Parent=gene:OsNip_10g0124400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1545297	1545554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1545297	1546413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Name=OsNip_10t0124400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1545555	1546403	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0124400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;protein_id=OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1546404	1546413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1547741	1547851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Name=OsNip_10t0124400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1547741	1547851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1548006	1548037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Name=OsNip_10t0124400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1548006	1548037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1556778	1559803	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0124500;Name=OsNip_Fbox507;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1556778	1559803	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0124500-01;Parent=gene:OsNip_10g0124500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0124500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1556778	1556813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1556778	1558224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;Name=OsNip_10t0124500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1556814	1558187	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0124500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;protein_id=OsNip_10t0124500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1558188	1558224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1559625	1559803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;Name=OsNip_10t0124500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1559625	1559803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	1562608	1565335	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0124700;Name=OsNip_Fbox508;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1562608	1565335	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0124700-01;Parent=gene:OsNip_10g0124700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1562608	1562954	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1562608	1563152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Name=OsNip_10t0124700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0124700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1562955	1563152	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;protein_id=OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1563226	1563381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Name=OsNip_10t0124700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0124700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1563226	1563381	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;protein_id=OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1564037	1564861	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;protein_id=OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1564037	1564914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Name=OsNip_10t0124700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1564862	1564914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1565051	1565126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Name=OsNip_10t0124700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1565051	1565126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1565306	1565335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0124700-01;Name=OsNip_10t0124700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0124700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1774786	1775103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1893711	1893736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1897742	1902389	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0130900-00;Parent=gene:OsNip_10g0130900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0130900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1899951	1900548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0130900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1902262	1902389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0130900-00;Name=OsNip_10t0130900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0130900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1902262	1902389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0130900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1897769	1902437	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0131000-00;Parent=gene:OsNip_10g0131000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0131000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1897769	1897783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0131000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1952885	1953401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0131850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	1998837	1999759	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0132300-01;Parent=gene:OsNip_10g0132300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1998837	1999063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1999064	1999315	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0132300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;protein_id=OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1999416	1999625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0132300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;protein_id=OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	1999722	1999724	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0132300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;protein_id=OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	1999722	1999759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;Name=OsNip_10t0132300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0132300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1999725	1999759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0132300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2060774	2060817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0133100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2062346	2063920	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0133133-00;Name=OsNip_10t0133133-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0133133-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2062493	2064004	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0133166-00;Parent=transcript:OsNip_10t0133166-00;protein_id=OsNip_10t0133166-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2087427	2091932	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0133500-01;Parent=gene:OsNip_10g0133500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0133500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2087471	2087971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0133500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0133500-01;protein_id=OsNip_10t0133500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2090716	2091932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0133500-01;Name=OsNip_10t0133500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0133500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2091664	2091932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0133500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2099188	2099823	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0133600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2099188	2099823	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0133600-01;Parent=gene:OsNip_10g0133600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0133600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2099188	2099722	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0133600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0133600-01;protein_id=OsNip_10t0133600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2205595	2205693	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0135600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0135600-01;protein_id=OsNip_10t0135600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2206209	2206439	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0135600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0135600-01;protein_id=OsNip_10t0135600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2206209	2206735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0135600-01;Name=OsNip_10t0135600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0135600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2206440	2206735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0135600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2208448	2209029	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0135650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2260432	2260688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2261185	2261397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Name=OsNip_10t0136625-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0136625-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2261185	2261397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2261502	2261757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2261852	2261993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2262105	2262486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Name=OsNip_10t0136625-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0136625-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2262105	2262486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2283674	2294325	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0136800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2283674	2283675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2283674	2283946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;Name=OsNip_10t0136800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0136800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2283676	2283946	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0136800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;protein_id=OsNip_10t0136800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2294072	2294268	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0136800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;protein_id=OsNip_10t0136800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2294072	2294325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;Name=OsNip_10t0136800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0136800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2294269	2294325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2288954	2293083	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0136900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2291857	2292441	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0136900-00;Parent=gene:OsNip_10g0136900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0136900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2291857	2292441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-00;Name=OsNip_10t0136900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0136900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2291857	2292441	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0136900-00;Parent=transcript:OsNip_10t0136900-00;protein_id=OsNip_10t0136900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	2288954	2293083	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0136900-01;Parent=gene:OsNip_10g0136900;transcript_id=OsNip_10t0136900-01;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1
Chr10	TAMA	exon	2291883	2293083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;Name=OsNip_10t0136900-01;exon_id=OsNip_10t0136900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	2292359	2293081	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0136900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;protein_id=OsNip_10t0136900-01;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	2288954	2289238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;Name=OsNip_10t0136900-01;exon_id=OsNip_10t0136900-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	2293082	2293083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	2291883	2292356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	2288954	2289238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0136900-01;Tag=IsoSeq:G14618.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11484.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EXJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2364614	2364645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Name=OsNip_10t0138100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2366270	2366365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Name=OsNip_10t0138100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0138100-01-E7;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2366270	2366365	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0138100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;protein_id=OsNip_10t0138100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2366473	2366571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Name=OsNip_10t0138100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0138100-01-E8;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2366473	2366571	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0138100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;protein_id=OsNip_10t0138100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2366944	2367133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Name=OsNip_10t0138100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0138100-01-E9;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2366944	2367133	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0138100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;protein_id=OsNip_10t0138100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2367585	2367814	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0138100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;protein_id=OsNip_10t0138100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2367585	2368717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Name=OsNip_10t0138100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0138100-01-E10;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2367815	2368717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2362518	2363430	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0138150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2362518	2363430	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0138150-00;Parent=gene:OsNip_10g0138150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0138150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2362518	2362627	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2362518	2363195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;Name=OsNip_10t0138150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2362628	2363047	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0138150-00;Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;protein_id=OsNip_10t0138150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2363048	2363195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2363315	2363430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;Name=OsNip_10t0138150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2363315	2363430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2374615	2378634	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0138300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2374615	2378634	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0138300-01;Parent=gene:OsNip_10g0138300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2374615	2374658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2374615	2375931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Name=OsNip_10t0138300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2374659	2375931	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0138300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;protein_id=OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2377294	2377410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Name=OsNip_10t0138300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0138300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2377294	2377410	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0138300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;protein_id=OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2377511	2377551	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0138300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;protein_id=OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2377511	2377584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Name=OsNip_10t0138300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0138300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2377552	2377584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2378368	2378634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Name=OsNip_10t0138300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2378368	2378634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2386145	2387780	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0138600;Name=OsNip_Fbox529;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2386145	2387780	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0138600-01;Parent=gene:OsNip_10g0138600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2386145	2386227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2386145	2387780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138600-01;Name=OsNip_10t0138600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0138600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2386228	2387664	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0138600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0138600-01;protein_id=OsNip_10t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2387665	2387780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0138600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2422073	2426565	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0139300;Name=OsNip_FBX365;biotype=protein_coding;description=F-box;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2422073	2426565	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0139300-01;Parent=gene:OsNip_10g0139300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2422073	2422268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Name=OsNip_10t0139300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0139300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2422073	2422268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2424482	2424502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2424482	2424528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Name=OsNip_10t0139300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0139300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2424503	2424528	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0139300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;protein_id=OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2425244	2426495	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0139300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;protein_id=OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2425244	2426565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Name=OsNip_10t0139300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0139300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2426496	2426565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2438829	2440205	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0139500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2438829	2440205	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0139500-01;Parent=gene:OsNip_10g0139500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2438829	2439071	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0139500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0139500-01;protein_id=OsNip_10t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2438829	2439310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139500-01;Name=OsNip_10t0139500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0139500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2439072	2439310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2439891	2440205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139500-01;Name=OsNip_10t0139500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0139500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2439891	2440205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2445678	2447981	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0139600;biotype=protein_coding;description=F-box;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2445678	2447981	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0139600-01;Parent=gene:OsNip_10g0139600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0139600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	2507000	2508389	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0140700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2507002	2508368	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0140700-00;Parent=gene:OsNip_10g0140700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0140700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2507002	2507361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2507002	2507583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-00;Name=OsNip_10t0140700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0140700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2507362	2507583	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0140700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0140700-00;protein_id=OsNip_10t0140700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2507590	2508368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-00;Name=OsNip_10t0140700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0140700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2507944	2508368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	2507000	2508389	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0140700-01;Parent=gene:OsNip_10g0140700;transcript_id=OsNip_10t0140700-01;Tag=IsoSeq:G14623.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11488.1,Nipponbare.leaf_G6651.1
Chr10	TAMA	exon	2507000	2508389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-01;Name=OsNip_10t0140700-01;exon_id=OsNip_10t0140700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14623.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11488.1,Nipponbare.leaf_G6651.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1DLS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	2508026	2508166	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0140700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0140700-01;protein_id=OsNip_10t0140700-01;Tag=IsoSeq:G14623.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11488.1,Nipponbare.leaf_G6651.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1DLS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	2507000	2508025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-01;Tag=IsoSeq:G14623.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11488.1,Nipponbare.leaf_G6651.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1DLS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	2508170	2508389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0140700-01;Tag=IsoSeq:G14623.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11488.1,Nipponbare.leaf_G6651.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1DLS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2510775	2511357	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0140900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2510775	2511357	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0140900-00;Parent=gene:OsNip_10g0140900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0140900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2517938	2519418	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0141050-00;Parent=gene:OsNip_10g0141050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0141050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2518740	2518945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0141050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2519043	2519418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0141050-00;Name=OsNip_10t0141050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0141050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2519043	2519418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0141050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2517965	2518675	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0141200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0141200-00;protein_id=OsNip_10t0141200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2518729	2518971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0141200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0141200-00;protein_id=OsNip_10t0141200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2518998	2520206	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0141200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0141200-00;protein_id=OsNip_10t0141200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2523971	2524453	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0141300;Name=OsNip_WAK100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2523971	2524453	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0141300-00;Parent=gene:OsNip_10g0141300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0141300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2523971	2524453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0141300-00;Name=OsNip_10t0141300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0141300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2523971	2524453	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0141300-00;Parent=transcript:OsNip_10t0141300-00;protein_id=OsNip_10t0141300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2528896	2531384	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0141400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2567779	2567867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2567779	2567867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2569454	2569526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2569454	2569589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2569527	2569589	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;protein_id=OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2570196	2570325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2570196	2570325	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;protein_id=OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2570413	2570550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0142100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2570413	2570550	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;protein_id=OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2571087	2571196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0142100-02-E2;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2571087	2571196	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;protein_id=OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2571523	2571552	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;protein_id=OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2571523	2572053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Name=OsNip_10t0142100-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2571553	2572053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2570475	2571793	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142100-02;Parent=gene:OsNip_10g0142100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0142100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2570475	2570550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;Name=OsNip_10t0142100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2570475	2570550	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;protein_id=OsNip_10t0142100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2571087	2571196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;Name=OsNip_10t0142100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0142100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2571087	2571196	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0142100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;protein_id=OsNip_10t0142100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2571523	2571552	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;protein_id=OsNip_10t0142100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2571523	2571793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;Name=OsNip_10t0142100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2571553	2571793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2572703	2573795	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0142301;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2572703	2573795	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142301-00;Parent=gene:OsNip_10g0142301;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0142301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2572703	2573085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142301-00;Name=OsNip_10t0142301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2573726	2573795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142301-00;Name=OsNip_10t0142301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2587372	2588664	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0142500;Name=OsNip_Fbox533;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2587372	2588664	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142500-01;Parent=gene:OsNip_10g0142500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0142500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2587372	2587390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2587372	2588664	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142500-01;Name=OsNip_10t0142500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2587391	2588575	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142500-01;protein_id=OsNip_10t0142500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2588576	2588664	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2591402	2596571	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0142600;Name=OsNip_WAK101;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2594665	2596299	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142600-00;Parent=gene:OsNip_10g0142600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0142600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2594665	2596299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142600-00;Name=OsNip_10t0142600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2594665	2596299	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0142600-00;protein_id=OsNip_10t0142600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	2591402	2596571	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142600-01;Parent=gene:OsNip_10g0142600;transcript_id=OsNip_10t0142600-01;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1
Chr10	TAMA	exon	2591402	2591505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;Name=OsNip_10t0142600-01;exon_id=OsNip_10t0142600-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	2591404	2591505	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0142600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;protein_id=OsNip_10t0142600-01;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	2594301	2596571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;Name=OsNip_10t0142600-01;exon_id=OsNip_10t0142600-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	2594301	2594378	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0142600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;protein_id=OsNip_10t0142600-01;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	2591402	2591403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	2594382	2596571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142600-01;Tag=IsoSeq:G14626.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6653.1;prot_id "UniRef90_B9GB71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2594713	2596911	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0142700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2594713	2596911	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0142700-01;Parent=gene:OsNip_10g0142700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0142700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2594713	2595255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2594713	2595283	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;Name=OsNip_10t0142700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0142700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2595256	2595283	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0142700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;protein_id=OsNip_10t0142700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2596722	2596909	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0142700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;protein_id=OsNip_10t0142700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2596722	2596911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;Name=OsNip_10t0142700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2596910	2596911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2614802	2618660	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0142900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2614802	2618660	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0142900-01;Parent=gene:OsNip_10g0142900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2614802	2615873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Name=OsNip_10t0142900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2614802	2615873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2615987	2616093	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2615987	2616164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Name=OsNip_10t0142900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2616094	2616164	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;protein_id=OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2616241	2616442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Name=OsNip_10t0142900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0142900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2616241	2616442	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0142900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;protein_id=OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2616538	2616855	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0142900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;protein_id=OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2616538	2616864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Name=OsNip_10t0142900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0142900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2616856	2616864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2618436	2618660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Name=OsNip_10t0142900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0142900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2618436	2618660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0142900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2619498	2619929	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0143200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2619498	2619929	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0143200-00;Parent=gene:OsNip_10g0143200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0143200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2619498	2619929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143200-00;Name=OsNip_10t0143200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0143200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2619498	2619929	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0143200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0143200-00;protein_id=OsNip_10t0143200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2632829	2633427	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0143500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2632829	2633427	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0143500-00;Parent=gene:OsNip_10g0143500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0143500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2632829	2633158	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2632829	2633427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143500-00;Name=OsNip_10t0143500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0143500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2633159	2633410	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0143500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0143500-00;protein_id=OsNip_10t0143500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2633411	2633427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2652631	2659894	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0143800-01;Parent=gene:OsNip_10g0143800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0143800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2652631	2654657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2652631	2659894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143800-01;Name=OsNip_10t0143800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0143800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2654658	2654864	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0143800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0143800-01;protein_id=OsNip_10t0143800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2654865	2659894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2662311	2665288	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0143866;Name=OsNip_WAK102;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2662311	2665288	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0143866-00;Parent=gene:OsNip_10g0143866;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0143866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2662311	2664203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143866-00;Name=OsNip_10t0143866-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0143866-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2662311	2664203	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0143866-00;Parent=transcript:OsNip_10t0143866-00;protein_id=OsNip_10t0143866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2665163	2665288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143866-00;Name=OsNip_10t0143866-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0143866-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2665163	2665288	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0143866-00;Parent=transcript:OsNip_10t0143866-00;protein_id=OsNip_10t0143866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2662380	2664228	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0143932;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2662380	2664228	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0143932-00;Parent=gene:OsNip_10g0143932;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0143932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2662380	2663290	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143932-00;Name=OsNip_10t0143932-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0143932-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2663366	2664228	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0143932-00;Name=OsNip_10t0143932-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0143932-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2667065	2667466	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0144000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2667065	2667466	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0144000-00;Parent=gene:OsNip_10g0144000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0144000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2667065	2667466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0144000-00;Name=OsNip_10t0144000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0144000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2667065	2667466	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0144000-00;Parent=transcript:OsNip_10t0144000-00;protein_id=OsNip_10t0144000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2709163	2711992	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0144700;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2709163	2711992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0144700-00;Parent=gene:OsNip_10g0144700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0144700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2709163	2709777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0144700-00;Name=OsNip_10t0144700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0144700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2709163	2709777	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0144700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0144700-00;protein_id=OsNip_10t0144700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2710982	2711992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0144700-00;Name=OsNip_10t0144700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0144700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2710982	2711992	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0144700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0144700-00;protein_id=OsNip_10t0144700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2715875	2718897	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0144800;Name=OsNip_Fbox534;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2715875	2718897	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0144800-00;Parent=gene:OsNip_10g0144800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0144800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2715875	2715897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0144800-00;Name=OsNip_10t0144800-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0144800-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2715875	2715897	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0144800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0144800-00;protein_id=OsNip_10t0144800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2843303	2843304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2843303	2843797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-01;Name=OsNip_10t0147300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2843557	2843797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2844273	2844562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-01;Name=OsNip_10t0147300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2844273	2844562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2843429	2845284	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0147300-02;Parent=gene:OsNip_10g0147300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2843429	2843696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2843429	2844312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;Name=OsNip_10t0147300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2843697	2844026	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0147300-02;Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;protein_id=OsNip_10t0147300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2844027	2844312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2845020	2845284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;Name=OsNip_10t0147300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2845020	2845284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	2843300	2844535	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0147300-03;Parent=gene:OsNip_10g0147300;transcript_id=OsNip_10t0147300-03;Tag=IsoSeq:G14630.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11493.1
Chr10	TAMA	exon	2843300	2844535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-03;Name=OsNip_10t0147300-03;exon_id=OsNip_10t0147300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14630.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11493.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	2843300	2843878	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0147300-03;Parent=transcript:OsNip_10t0147300-03;protein_id=OsNip_10t0147300-03;Tag=IsoSeq:G14630.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11493.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	2843882	2844535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147300-03;Tag=IsoSeq:G14630.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11493.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2849620	2855809	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0147400;Name=OsNip_LAX4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2849620	2855809	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0147400-01;Parent=gene:OsNip_10g0147400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2849620	2849956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2849620	2850331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Name=OsNip_10t0147400-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0147400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2849957	2850331	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;protein_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2852155	2852620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Name=OsNip_10t0147400-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0147400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2852155	2852620	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0147400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;protein_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2854381	2854478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Name=OsNip_10t0147400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0147400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2854381	2854478	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;protein_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2854773	2855069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Name=OsNip_10t0147400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0147400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2854773	2855069	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;protein_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2855278	2855685	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;protein_id=OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2855278	2855809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Name=OsNip_10t0147400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2855686	2855809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2849633	2851034	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0147400-03;Parent=gene:OsNip_10g0147400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2849633	2849956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2849633	2851034	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-03;Name=OsNip_10t0147400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2849957	2850352	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147400-03;Parent=transcript:OsNip_10t0147400-03;protein_id=OsNip_10t0147400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2850353	2851034	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2850079	2855639	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0147566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2850079	2855639	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0147566-00;Parent=gene:OsNip_10g0147566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2850079	2850212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2850079	2850328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Name=OsNip_10t0147566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2850213	2850328	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0147566-00;Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;protein_id=OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2852151	2852607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Name=OsNip_10t0147566-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0147566-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2852151	2852607	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0147566-00;Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;protein_id=OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2854367	2854387	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0147566-00;Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;protein_id=OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2854367	2854460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Name=OsNip_10t0147566-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0147566-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2854388	2854460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2854761	2855072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Name=OsNip_10t0147566-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147566-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2854761	2855072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2855274	2855639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Name=OsNip_10t0147566-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147566-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2855274	2855639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2885294	2889781	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0147900;biotype=protein_coding;description=Armadillo-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2885294	2889777	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0147900-02;Parent=gene:OsNip_10g0147900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2885294	2885900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;Name=OsNip_10t0147900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2885294	2885900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2887587	2887613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2887587	2889777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;Name=OsNip_10t0147900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2887614	2889596	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;protein_id=OsNip_10t0147900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2889597	2889777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2887387	2889781	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0147900-01;Parent=gene:OsNip_10g0147900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0147900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2887387	2887613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2887387	2889781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0147900-01;Name=OsNip_10t0147900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0147900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2887614	2889596	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0147900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0147900-01;protein_id=OsNip_10t0147900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2950257	2951031	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0149100-00;Parent=gene:OsNip_10g0149100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0149100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2967532	2967640	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0149400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0149400-00;protein_id=OsNip_10t0149400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2978891	2978932	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;protein_id=OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2979087	2979137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Name=OsNip_10t0149700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0149700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2979087	2979137	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;protein_id=OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2980025	2980164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Name=OsNip_10t0149700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0149700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2980025	2980164	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;protein_id=OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2980279	2980345	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;protein_id=OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2980279	2980359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Name=OsNip_10t0149700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0149700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2980346	2980359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2981156	2981505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Name=OsNip_10t0149700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0149700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2981156	2981505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2981620	2982619	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0149800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2981620	2982619	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0149800-00;Parent=gene:OsNip_10g0149800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0149800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2981620	2981854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2981620	2982303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149800-00;Name=OsNip_10t0149800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0149800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2981855	2982303	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0149800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0149800-00;protein_id=OsNip_10t0149800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	2982400	2982619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149800-00;Name=OsNip_10t0149800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0149800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2982572	2982619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0149800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	2995427	2998062	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0150200;biotype=protein_coding;description=Sterile;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2995427	2998062	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0150200-01;Parent=gene:OsNip_10g0150200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2995427	2995452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2995453	2995534	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;protein_id=OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2995621	2995772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;Name=OsNip_10t0150200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0150200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2995621	2995772	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;protein_id=OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2997672	2997752	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;protein_id=OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2997672	2998062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;Name=OsNip_10t0150200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0150200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2997753	2998062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	2999345	3001254	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0150300;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	2999345	3001254	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0150300-01;Parent=gene:OsNip_10g0150300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2999345	2999620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	2999345	3000066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0150300-01;Name=OsNip_10t0150300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0150300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	2999621	3000066	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0150300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0150300-01;protein_id=OsNip_10t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3001041	3001185	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0150300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0150300-01;protein_id=OsNip_10t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3121649	3121654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152000-01;Tag=IsoSeq:G14641.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8723.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1EYK6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	3122025	3123021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152400-00;Name=OsNip_10t0152400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0152400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3126236	3126620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3126236	3127180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152400-00;Name=OsNip_10t0152400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0152400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3126621	3127166	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0152400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0152400-00;protein_id=OsNip_10t0152400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3127167	3127180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	3133335	3134728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0152801-01;Name=OsNip_10t0152801-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0152801-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3341675	3342916	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0153900;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3341675	3342916	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0153900-01;Parent=gene:OsNip_10g0153900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0153900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3341675	3341720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0153900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3341675	3342916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0153900-01;Name=OsNip_10t0153900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0153900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3341721	3342701	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0153900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0153900-01;protein_id=OsNip_10t0153900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3342702	3342916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0153900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3358062	3360552	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0154000;Name=OsNip_VAMP714;biotype=protein_coding;description=Membrane-trafficking;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3358062	3360518	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0154000-02;Parent=gene:OsNip_10g0154000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3358062	3358535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Name=OsNip_10t0154000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3358062	3358535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3359349	3359512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Name=OsNip_10t0154000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3359349	3359512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3359606	3360019	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3359606	3360518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Name=OsNip_10t0154000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3360020	3360313	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0154000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;protein_id=OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3360314	3360518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3358124	3360552	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0154000-01;Parent=gene:OsNip_10g0154000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3358124	3358444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3358124	3358535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Name=OsNip_10t0154000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0154000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3358445	3358535	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;protein_id=OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3359349	3359512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Name=OsNip_10t0154000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0154000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3359349	3359512	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;protein_id=OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3359606	3359796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Name=OsNip_10t0154000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0154000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3359606	3359796	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;protein_id=OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3360079	3360313	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;protein_id=OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3360079	3360552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Name=OsNip_10t0154000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3360314	3360552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3374000	3374881	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0154200-01;Parent=gene:OsNip_10g0154200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3374000	3374268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3374000	3374881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154200-01;Name=OsNip_10t0154200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3374269	3374490	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0154200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154200-01;protein_id=OsNip_10t0154200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3374491	3374881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3386285	3389784	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0154401;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3386285	3389784	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0154401-01;Parent=gene:OsNip_10g0154401;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0154401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3386285	3386553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154401-01;Name=OsNip_10t0154401-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154401-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3388229	3388295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154401-01;Name=OsNip_10t0154401-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154401-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3389016	3389784	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154401-01;Name=OsNip_10t0154401-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	3393943	3394920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154500-00;Name=OsNip_10t0154500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0154500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3393943	3394920	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0154500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0154500-00;protein_id=OsNip_10t0154500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3397799	3398404	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0154533;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3397799	3398404	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0154533-00;Parent=gene:OsNip_10g0154533;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154533-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3397799	3398404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154533-00;Name=OsNip_10t0154533-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0154533-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	3403423	3404719	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0154566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3428657	3430195	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0154600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154600-01;protein_id=OsNip_10t0154600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3431517	3431724	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0154600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154600-01;protein_id=OsNip_10t0154600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3431861	3431961	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0154600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154600-01;protein_id=OsNip_10t0154600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3431861	3432416	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154600-01;Name=OsNip_10t0154600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0154600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3431962	3432416	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3438474	3439397	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0154700;Name=OsNip_CYP18-4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3438474	3439397	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0154700-01;Parent=gene:OsNip_10g0154700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3438474	3438592	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3438474	3439397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154700-01;Name=OsNip_10t0154700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3438593	3439138	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0154700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0154700-01;protein_id=OsNip_10t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3439139	3439397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3446108	3446808	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0154900;Name=OsNip_CYP124;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3446108	3446808	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0154900-00;Parent=gene:OsNip_10g0154900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0154900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3446108	3446319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;Name=OsNip_10t0154900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3446108	3446319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3446453	3446495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3446453	3446808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;Name=OsNip_10t0154900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0154900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3446496	3446774	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0154900-00;Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;protein_id=OsNip_10t0154900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3446775	3446808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0154900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3462828	3464263	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0155100;biotype=protein_coding;description=Curculin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3462828	3464263	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0155100-01;Parent=gene:OsNip_10g0155100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0155100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3462828	3462901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3462828	3464263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155100-01;Name=OsNip_10t0155100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0155100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3462902	3464026	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0155100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0155100-01;protein_id=OsNip_10t0155100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3464027	3464263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3464548	3464901	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0155200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3464548	3464901	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0155200-00;Parent=gene:OsNip_10g0155200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0155200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3464548	3464901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155200-00;Name=OsNip_10t0155200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0155200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3464548	3464901	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0155200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0155200-00;protein_id=OsNip_10t0155200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3468006	3469312	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0155300;Name=OsNip_Fbox539;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3468006	3469312	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0155300-01;Parent=gene:OsNip_10g0155300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3468006	3468055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3468006	3469312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155300-01;Name=OsNip_10t0155300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0155300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3468056	3469195	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0155300-01;protein_id=OsNip_10t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3469196	3469312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3472050	3475176	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0155400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3472050	3475176	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0155400-00;Parent=gene:OsNip_10g0155400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3472050	3472706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Name=OsNip_10t0155400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0155400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3472050	3472706	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0155400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;protein_id=OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3472835	3473049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Name=OsNip_10t0155400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0155400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3472835	3473049	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0155400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;protein_id=OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3473581	3473826	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Name=OsNip_10t0155400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0155400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3473581	3473826	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0155400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;protein_id=OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3474545	3474738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Name=OsNip_10t0155400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0155400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3474545	3474738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3474822	3475176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Name=OsNip_10t0155400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0155400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3474822	3475176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3472145	3473747	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0155450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3472145	3473747	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0155450-00;Parent=gene:OsNip_10g0155450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0155450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3472145	3472315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3472145	3472726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0155450-00;Name=OsNip_10t0155450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0155450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3653108	3653501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3696797	3698817	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0158400-00;Parent=gene:OsNip_10g0158400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0158400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3696797	3696992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158400-00;Name=OsNip_10t0158400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0158400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	3697774	3698817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158400-00;Name=OsNip_10t0158400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0158400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3698775	3698817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3697742	3698655	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0158475;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3697742	3698655	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0158475-00;Parent=gene:OsNip_10g0158475;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0158475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3697742	3697987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3697742	3698655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158475-00;Name=OsNip_10t0158475-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0158475-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3697988	3698353	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0158475-00;Parent=transcript:OsNip_10t0158475-00;protein_id=OsNip_10t0158475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3698354	3698655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158475-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	3716418	3717249	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0158625;biotype=protein_coding;description=Putative;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	3716418	3716474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158625-00;Name=OsNip_10t0158625-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0158625-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3716418	3716474	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0158625-00;Parent=transcript:OsNip_10t0158625-00;protein_id=OsNip_10t0158625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3716555	3716936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158625-00;Name=OsNip_10t0158625-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0158625-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3716555	3716936	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0158625-00;Parent=transcript:OsNip_10t0158625-00;protein_id=OsNip_10t0158625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3717182	3717249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158625-00;Name=OsNip_10t0158625-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0158625-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	3727965	3730348	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0158700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3727965	3730348	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0158700-01;Parent=gene:OsNip_10g0158700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0158700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3727965	3729176	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0158700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0158700-01;protein_id=OsNip_10t0158700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3727965	3729177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158700-01;Name=OsNip_10t0158700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0158700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3729177	3729177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3729985	3730348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158700-01;Name=OsNip_10t0158700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0158700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3729985	3730348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0158700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3741004	3743910	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0159033;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3741004	3743910	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0159033-01;Parent=gene:OsNip_10g0159033;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3741004	3741276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3741004	3741290	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;Name=OsNip_10t0159033-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0159033-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3741277	3741290	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0159033-01;Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;protein_id=OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3742239	3742325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;Name=OsNip_10t0159033-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0159033-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3742239	3742325	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0159033-01;Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;protein_id=OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3743444	3743717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0159033-01;Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;protein_id=OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3743444	3743910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;Name=OsNip_10t0159033-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0159033-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3743718	3743910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159033-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3750178	3752622	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0159167;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3750178	3752622	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0159167-01;Parent=gene:OsNip_10g0159167;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0159167-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3750178	3751576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159167-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3750178	3751662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159167-01;Name=OsNip_10t0159167-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0159167-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3751577	3751662	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0159167-01;Parent=transcript:OsNip_10t0159167-01;protein_id=OsNip_10t0159167-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3752095	3752476	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0159167-01;Parent=transcript:OsNip_10t0159167-01;protein_id=OsNip_10t0159167-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3752095	3752622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0159167-01;Name=OsNip_10t0159167-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0159167-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3868506	3869006	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0160600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0160600-02;protein_id=OsNip_10t0160600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3869007	3871256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0160600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	3868565	3868876	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0160600-03;Parent=transcript:OsNip_10t0160600-03;protein_id=OsNip_10t0160600-03;Tag=IsoSeq:G14655.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11513.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0FSF7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	3868301	3868564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0160600-03;Tag=IsoSeq:G14655.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11513.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0FSF7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3870959	3871309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0160600-03;Tag=IsoSeq:G14655.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11513.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0FSF7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3891913	3892400	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0160700-00;Parent=gene:OsNip_10g0160700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0160700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3891913	3892264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0160700-00;Name=OsNip_10t0160700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0160700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3891913	3892264	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0160700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0160700-00;protein_id=OsNip_10t0160700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3892375	3892400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0160700-00;Name=OsNip_10t0160700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0160700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3897383	3900243	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0161100-01;Parent=gene:OsNip_10g0161100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0161100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3897383	3897979	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;Name=OsNip_10t0161100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3898284	3898345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3898346	3898384	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0161100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;protein_id=OsNip_10t0161100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3899678	3900241	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0161100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;protein_id=OsNip_10t0161100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3899678	3900243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;Name=OsNip_10t0161100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3900242	3900243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3908198	3912665	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0161400;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3908198	3912557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0161400-01;Parent=gene:OsNip_10g0161400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0161400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3908198	3908485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;Name=OsNip_10t0161400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3908198	3908485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3908662	3908781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3908662	3912557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;Name=OsNip_10t0161400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3908782	3911196	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0161400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;protein_id=OsNip_10t0161400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3911197	3912557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	3912049	3912665	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0161400-02;Parent=gene:OsNip_10g0161400;transcript_id=OsNip_10t0161400-02;Tag=IsoSeq:G14656.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11514.1
Chr10	TAMA	exon	3912049	3912665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-02;Name=OsNip_10t0161400-02;exon_id=OsNip_10t0161400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14656.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11514.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	3912408	3912665	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0161400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0161400-02;protein_id=OsNip_10t0161400-02;Tag=IsoSeq:G14656.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11514.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3912049	3912405	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161400-02;Tag=IsoSeq:G14656.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11514.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3930492	3932306	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0161550;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3930492	3932306	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0161550-01;Parent=gene:OsNip_10g0161550;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0161550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3930492	3930743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161550-01;Name=OsNip_10t0161550-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161550-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3931353	3931440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161550-01;Name=OsNip_10t0161550-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161550-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3931910	3932306	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161550-01;Name=OsNip_10t0161550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0161550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3931336	3932316	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0161625;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3931336	3932316	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0161625-00;Parent=gene:OsNip_10g0161625;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0161625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3931336	3931440	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161625-00;Name=OsNip_10t0161625-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0161625-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3931336	3931440	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0161625-00;Parent=transcript:OsNip_10t0161625-00;protein_id=OsNip_10t0161625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3931910	3932017	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0161625-00;Parent=transcript:OsNip_10t0161625-00;protein_id=OsNip_10t0161625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3931910	3932316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161625-00;Name=OsNip_10t0161625-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0161625-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3932018	3932316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161625-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3932962	3935843	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0161700;Name=OsNip__F0753;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3932962	3935843	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0161700-01;Parent=gene:OsNip_10g0161700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0161700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3932962	3933010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3933011	3934060	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0161700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0161700-01;protein_id=OsNip_10t0161700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	3941201	3941644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161800-01;Name=OsNip_10t0161800-01;exon_id=OsNip_10t0161800-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14657.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6662.1,Nipponbare.panicle_G11515.1,Nipponbare.panicle_G11515.2;prot_id "UniRef90_UPI00188F6BA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	3942066	3942067	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161800-01;Tag=IsoSeq:G14657.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6662.1,Nipponbare.panicle_G11515.1,Nipponbare.panicle_G11515.2;prot_id "UniRef90_UPI00188F6BA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3941731	3941895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161800-01;Tag=IsoSeq:G14657.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6662.1,Nipponbare.panicle_G11515.1,Nipponbare.panicle_G11515.2;prot_id "UniRef90_UPI00188F6BA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3941201	3941644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0161800-01;Tag=IsoSeq:G14657.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6662.1,Nipponbare.panicle_G11515.1,Nipponbare.panicle_G11515.2;prot_id "UniRef90_UPI00188F6BA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3949483	3950042	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0162100-01;Parent=gene:OsNip_10g0162100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0162100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3949483	3949637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3949483	3949747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;Name=OsNip_10t0162100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0162100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3949638	3949747	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0162100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;protein_id=OsNip_10t0162100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3949832	3949946	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0162100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;protein_id=OsNip_10t0162100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3949832	3950042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;Name=OsNip_10t0162100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0162100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3949947	3950042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	3949505	3950041	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0162100-02;Parent=gene:OsNip_10g0162100;transcript_id=OsNip_10t0162100-02;Tag=IsoSeq:G14658.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11516.4
Chr10	TAMA	exon	3949505	3950041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-02;Name=OsNip_10t0162100-02;exon_id=OsNip_10t0162100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14658.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11516.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0M5P4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	3949612	3949848	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0162100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0162100-02;protein_id=OsNip_10t0162100-02;Tag=IsoSeq:G14658.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11516.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0M5P4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	3949849	3950041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-02;Tag=IsoSeq:G14658.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11516.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0M5P4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3949505	3949609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162100-02;Tag=IsoSeq:G14658.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11516.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0M5P4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3967320	3968592	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0162300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3967320	3968105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3967320	3968592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162300-01;Name=OsNip_10t0162300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0162300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3968106	3968558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0162300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162300-01;protein_id=OsNip_10t0162300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3968559	3968592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3979229	3979230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3979229	3981437	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;Name=OsNip_10t0162400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0162400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3979231	3981437	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0162400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;protein_id=OsNip_10t0162400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3981580	3981640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;Name=OsNip_10t0162400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0162400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3981580	3981640	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0162400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;protein_id=OsNip_10t0162400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3982492	3982938	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0162400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;protein_id=OsNip_10t0162400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3982492	3983411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;Name=OsNip_10t0162400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0162400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3982939	3983411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	3982627	3983434	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0162400-02;Parent=gene:OsNip_10g0162400;transcript_id=OsNip_10t0162400-02;Tag=IsoSeq:G14659.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8733.1
Chr10	TAMA	exon	3982627	3983434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-02;Name=OsNip_10t0162400-02;exon_id=OsNip_10t0162400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14659.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8733.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KB86";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	3982628	3982744	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0162400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0162400-02;protein_id=OsNip_10t0162400-02;Tag=IsoSeq:G14659.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8733.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KB86";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	3982627	3982627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-02;Tag=IsoSeq:G14659.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8733.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KB86";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	3982748	3983434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162400-02;Tag=IsoSeq:G14659.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8733.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KB86";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3984181	3984588	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0162500;biotype=protein_coding;description=Chloramphenicol;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3984181	3984588	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0162500-00;Parent=gene:OsNip_10g0162500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0162500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	3984181	3984575	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0162500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0162500-00;protein_id=OsNip_10t0162500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3984181	3984588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162500-00;Name=OsNip_10t0162500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0162500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3984576	3984588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	3991788	3993428	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0162600;Name=OsNip_Crll2;biotype=protein_coding;description=Lateral;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	3991788	3993428	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0162600-00;Parent=gene:OsNip_10g0162600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0162600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	3991788	3992240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162600-00;Name=OsNip_10t0162600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0162600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4077764	4077884	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0162842-00;Parent=transcript:OsNip_10t0162842-00;protein_id=OsNip_10t0162842-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4080732	4081249	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0162842-00;Parent=transcript:OsNip_10t0162842-00;protein_id=OsNip_10t0162842-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	4080732	4081525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162842-00;Name=OsNip_10t0162842-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0162842-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4081250	4081525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162842-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	4080175	4081731	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0162844;biotype=protein_coding;description=Wall-associated;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	4080175	4081731	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0162844-00;Parent=gene:OsNip_10g0162844;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0162844-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4080175	4080535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162844-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	4080175	4081731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162844-00;Name=OsNip_10t0162844-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0162844-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4080536	4081648	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0162844-00;Parent=transcript:OsNip_10t0162844-00;protein_id=OsNip_10t0162844-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	4122866	4122900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162848-02;Tag=IsoSeq:G14662.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6664.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GTN9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	4121371	4122236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0162848-02;Tag=IsoSeq:G14662.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6664.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GTN9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4263295	4263440	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0163040-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4263441	4266212	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0163040-02;Parent=transcript:OsNip_10t0163040-02;protein_id=OsNip_10t0163040-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	4281031	4286574	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0163100-01;Parent=gene:OsNip_10g0163100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0163100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4281031	4281118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	4281031	4282136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;Name=OsNip_10t0163100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0163100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4281119	4282136	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0163100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;protein_id=OsNip_10t0163100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	4282558	4282668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;Name=OsNip_10t0163100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0163100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4282558	4282668	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0163100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;protein_id=OsNip_10t0163100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	4282758	4282828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0163100-01;Name=OsNip_10t0163100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0163100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	4914321	4915824	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0171300-01;Parent=gene:OsNip_10g0171300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0171300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4929261	4929722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0171500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	4930205	4931157	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0171500-01;Name=OsNip_10t0171500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0171500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	4930216	4931139	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0171500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0171500-01;protein_id=OsNip_10t0171500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4947082	4947727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0172000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	5278190	5278771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176300-00;Name=OsNip_10t0176300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0176300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5278190	5278771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0176300-00;Parent=transcript:OsNip_10t0176300-00;protein_id=OsNip_10t0176300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	5287364	5287771	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0176550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	5287364	5287771	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0176550-00;Parent=gene:OsNip_10g0176550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0176550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	5287364	5287771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176550-00;Name=OsNip_10t0176550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0176550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5287364	5287771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0176550-00;Parent=transcript:OsNip_10t0176550-00;protein_id=OsNip_10t0176550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	5288765	5290390	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0176700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	5288765	5289278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;Name=OsNip_10t0176700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0176700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5288765	5289278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5289894	5289955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	5289894	5290390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;Name=OsNip_10t0176700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0176700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5289956	5290207	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0176700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;protein_id=OsNip_10t0176700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5290208	5290390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	5290779	5290829	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0176800;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	5290779	5290829	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0176800-00;Parent=gene:OsNip_10g0176800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0176800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	5290779	5290829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0176800-00;Name=OsNip_10t0176800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0176800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5538557	5538706	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0180600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0180600-00;protein_id=OsNip_10t0180600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5541425	5544572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0180800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	5539743	5544578	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0180800-01;Parent=gene:OsNip_10g0180800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5539743	5539841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	5539743	5541100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0180800-01;Name=OsNip_10t0180800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0180800-02-E2;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5539842	5541100	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0180800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0180800-01;protein_id=OsNip_10t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5866542	5866649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0185400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	5866542	5867333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0185400-00;Name=OsNip_10t0185400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0185400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5866650	5867333	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0185400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0185400-00;protein_id=OsNip_10t0185400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	5907417	5908148	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0186200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0186200-00;protein_id=OsNip_10t0186200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6276052	6276222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6276468	6276597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6274283	6274702	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0190600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0190600-00;protein_id=OsNip_10t0190600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6274703	6275200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6275260	6275647	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6287535	6291740	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0190800-01;Parent=gene:OsNip_10g0190800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0190800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6287535	6287581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6287582	6289102	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0190800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0190800-01;protein_id=OsNip_10t0190800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6289361	6289550	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0190800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0190800-01;protein_id=OsNip_10t0190800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6290578	6290705	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0190800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0190800-01;protein_id=OsNip_10t0190800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6290578	6291740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0190800-01;Name=OsNip_10t0190800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0190800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	6385254	6386050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191600-00;Name=OsNip_10t0191600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0191600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	6404506	6405513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191900-00;Name=OsNip_10t0191900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0191900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6404506	6405513	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0191900-00;Parent=transcript:OsNip_10t0191900-00;protein_id=OsNip_10t0191900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	6404230	6405788	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0191900-01;Parent=gene:OsNip_10g0191900;transcript_id=OsNip_10t0191900-01;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1
Chr10	TAMA	exon	6404230	6404279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;Name=OsNip_10t0191900-01;exon_id=OsNip_10t0191900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	6404231	6404279	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0191900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;protein_id=OsNip_10t0191900-01;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	6404496	6405788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;Name=OsNip_10t0191900-01;exon_id=OsNip_10t0191900-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	6404496	6404611	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0191900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;protein_id=OsNip_10t0191900-01;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	6404230	6404230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	6404615	6405788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0191900-01;Tag=IsoSeq:G14710.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11552.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9WP00";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	6416709	6417205	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0192301;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	6416709	6416803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0192301-00;Name=OsNip_10t0192301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0192301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6416893	6417205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0192301-00;Name=OsNip_10t0192301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0192301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	6484463	6486741	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0193100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6484463	6486741	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0193100-00;Parent=gene:OsNip_10g0193100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0193100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6484463	6484970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;Name=OsNip_10t0193100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0193100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6484463	6484970	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0193100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;protein_id=OsNip_10t0193100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6486008	6486040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;Name=OsNip_10t0193100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0193100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6486008	6486040	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0193100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;protein_id=OsNip_10t0193100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6486647	6486741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;Name=OsNip_10t0193100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0193100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6486647	6486741	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0193100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0193100-00;protein_id=OsNip_10t0193100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	6497068	6510300	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0193500;Name=OsNip_STA239;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6497068	6510300	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0193500-01;Parent=gene:OsNip_10g0193500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6497068	6497108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6497068	6497526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;Name=OsNip_10t0193500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0193500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6497109	6497526	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0193500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;protein_id=OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6507489	6507530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;Name=OsNip_10t0193500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0193500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6507489	6507530	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0193500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;protein_id=OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6510091	6510185	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0193500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;protein_id=OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6510091	6510300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;Name=OsNip_10t0193500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0193500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6510186	6510300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	6503535	6506576	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0193601;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6503535	6506576	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0193601-01;Parent=gene:OsNip_10g0193601;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0193601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6503535	6506576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0193601-01;Name=OsNip_10t0193601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0193601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	6540786	6544142	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0194200;Name=OsNip_CAD1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6540786	6544129	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0194200-01;Parent=gene:OsNip_10g0194200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6540786	6540916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Name=OsNip_10t0194200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0194200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6540786	6540916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6541749	6541758	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6541749	6541847	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Name=OsNip_10t0194200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0194200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6541759	6541847	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0194200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;protein_id=OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6542230	6542343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Name=OsNip_10t0194200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0194200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6542230	6542343	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0194200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;protein_id=OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6542494	6542721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;Name=OsNip_10t0194200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0194200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6542494	6542721	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0194200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0194200-01;protein_id=OsNip_10t0194200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	6839741	6839794	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0198100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;protein_id=OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	6838024	6838236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;Name=OsNip_10t0198100-02;exon_id=OsNip_10t0198100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	6838024	6838236	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0198100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;protein_id=OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	TAMA	CDS	6837648	6837920	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0198100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;protein_id=OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	TAMA	CDS	6837416	6837576	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0198100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;protein_id=OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	6836253	6836553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;Name=OsNip_10t0198100-02;exon_id=OsNip_10t0198100-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	6836550	6836553	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0198100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;protein_id=OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	6839795	6839796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	6836253	6836547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198100-02;Tag=IsoSeq:G14716.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11557.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	6842035	6842533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198300-00;Name=OsNip_10t0198300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0198300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	6845043	6846735	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0198333-01;Parent=gene:OsNip_10g0198333;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0198333-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6845043	6845153	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198333-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	6845043	6846735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198333-01;Name=OsNip_10t0198333-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0198333-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6868486	6868644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0198600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	6868645	6869008	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0198600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0198600-01;protein_id=OsNip_10t0198600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6951819	6951970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0199500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7503234	7503453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0205300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	8503289	8504235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0317900-02;Name=OsNip_10t0317900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0317900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8503301	8503842	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0317950-00;Parent=gene:OsNip_10g0317950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0317950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8503301	8503545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0317950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8503301	8503842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0317950-00;Name=OsNip_10t0317950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0317950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8503546	8503767	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0317950-00;Parent=transcript:OsNip_10t0317950-00;protein_id=OsNip_10t0317950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8503768	8503842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0317950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	8506423	8507053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Name=OsNip_10t0318000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0318000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8506423	8507053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8507147	8507221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Name=OsNip_10t0318000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0318000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8507147	8507221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8507328	8507633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8507328	8509627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Name=OsNip_10t0318000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0318000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8507634	8507888	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0318000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;protein_id=OsNip_10t0318000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8507889	8509627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8559025	8566013	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0318700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8559025	8566013	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0318700-00;Parent=gene:OsNip_10g0318700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0318700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8559025	8559036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;Name=OsNip_10t0318700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0318700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8559025	8559036	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0318700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;protein_id=OsNip_10t0318700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8565552	8565635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;Name=OsNip_10t0318700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0318700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8565552	8565635	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0318700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;protein_id=OsNip_10t0318700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8565715	8565777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;Name=OsNip_10t0318700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0318700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8565715	8565777	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0318700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;protein_id=OsNip_10t0318700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8565954	8566013	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;Name=OsNip_10t0318700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0318700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8565954	8566013	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0318700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0318700-00;protein_id=OsNip_10t0318700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8570834	8572512	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0318900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8570834	8572512	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0318900-01;Parent=gene:OsNip_10g0318900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0318900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8570834	8570835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8570834	8572512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318900-01;Name=OsNip_10t0318900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0318900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8570836	8571465	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0318900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0318900-01;protein_id=OsNip_10t0318900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8571466	8572512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0318900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8660446	8662837	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0320001;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8660446	8662837	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0320001-00;Parent=gene:OsNip_10g0320001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8660446	8660446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8660446	8660778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Name=OsNip_10t0320001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8660447	8660683	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0320001-00;Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;protein_id=OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8660684	8660778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8661822	8661876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Name=OsNip_10t0320001-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320001-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8661822	8661876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8662506	8662837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Name=OsNip_10t0320001-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320001-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8662506	8662837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8679311	8681266	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0320100;Name=OsNip_F3'H;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8679311	8681266	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0320100-01;Parent=gene:OsNip_10g0320100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8679311	8679356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8679311	8680295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;Name=OsNip_10t0320100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8679357	8680295	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0320100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;protein_id=OsNip_10t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8680389	8681030	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0320100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;protein_id=OsNip_10t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8680389	8681266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;Name=OsNip_10t0320100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0320100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8681031	8681266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8680387	8681006	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0320201;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8680387	8681006	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0320201-00;Parent=gene:OsNip_10g0320201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0320201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8680387	8680645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8680387	8681006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320201-00;Name=OsNip_10t0320201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8680646	8680939	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0320201-00;Parent=transcript:OsNip_10t0320201-00;protein_id=OsNip_10t0320201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8680940	8681006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	8682868	8687984	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0320300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	8682868	8687984	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0320300-00;Parent=gene:OsNip_10g0320300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0320300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8682868	8683325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320300-00;Name=OsNip_10t0320300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8687670	8687984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0320300-00;Name=OsNip_10t0320300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0320300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8925033	8925064	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0323500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0323500-01;protein_id=OsNip_10t0323500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8925528	8925637	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0323500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0323500-01;protein_id=OsNip_10t0323500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	8925731	8925905	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0323500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0323500-01;protein_id=OsNip_10t0323500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	8925731	8926170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0323500-01;Name=OsNip_10t0323500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0323500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8925906	8926170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0323500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9062760	9062924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	9062760	9064406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326400-01;Name=OsNip_10t0326400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0326400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	9062925	9064355	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0326400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0326400-01;protein_id=OsNip_10t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9064356	9064406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	9078440	9080094	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0326800-01;Parent=gene:OsNip_10g0326800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0326800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9078440	9078652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	9078653	9078743	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0326800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0326800-01;protein_id=OsNip_10t0326800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	9078899	9079929	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0326800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0326800-01;protein_id=OsNip_10t0326800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	9078899	9080094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326800-01;Name=OsNip_10t0326800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0326800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9079930	9080094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0326800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9257298	9257349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0329300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9258022	9258162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0329300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9258731	9258827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0329300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	9268529	9268617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0329400-00;Name=OsNip_10t0329400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0329400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	9389135	9389326	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0331600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0331600-00;protein_id=OsNip_10t0331600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9861344	9861566	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0339290-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9976102	9976309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0340100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	9984427	9987827	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0340301-01;Parent=gene:OsNip_10g0340301;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0340301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9984427	9985283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0340301-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	10175170	10175302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0343200-01;Name=OsNip_10t0343200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0343200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	10180422	10182933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0343400-01;Name=OsNip_10t0343400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0343400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	10187423	10187639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0343400-01;Name=OsNip_10t0343400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0343400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10187602	10187639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0343400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	10189694	10195055	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0343500-00;Parent=gene:OsNip_10g0343500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0343500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	10387861	10388225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346200-01;Name=OsNip_10t0346200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0346200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	10390880	10396620	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0346300-01;Parent=gene:OsNip_10g0346300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10390880	10391313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10390880	10391435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Name=OsNip_10t0346300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0346300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	10392535	10393554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Name=OsNip_10t0346300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0346300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10392535	10393554	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0346300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;protein_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10394395	10394514	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Name=OsNip_10t0346300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0346300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10394395	10394514	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0346300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;protein_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10394718	10394965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Name=OsNip_10t0346300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0346300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10394718	10394965	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0346300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;protein_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10396157	10396308	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0346300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;protein_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10396428	10396565	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0346300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;protein_id=OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10396428	10396620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Name=OsNip_10t0346300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0346300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10396566	10396620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	10392539	10393534	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0346450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	10392539	10393534	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0346450-00;Parent=gene:OsNip_10g0346450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0346450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10392539	10393147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0346450-00;Name=OsNip_10t0346450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0346450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10952691	10953601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0358150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	10956338	10959148	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0358200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10992125	10992190	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0358600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0358600-01;protein_id=OsNip_10t0358600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	10992300	10992377	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0358600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0358600-01;protein_id=OsNip_10t0358600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10992300	10992663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0358600-01;Name=OsNip_10t0358600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0358600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10992378	10992663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0358600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	10991287	10997389	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0358700;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	10991287	10997385	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0358700-01;Parent=gene:OsNip_10g0358700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0358700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	10991287	10993096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0358700-01;Name=OsNip_10t0358700-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0358700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10991287	10993096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0358700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	11384733	11384797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;Name=OsNip_10t0364700-02;exon_id=OsNip_10t0364700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	11384733	11384756	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0364700-02;Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;protein_id=OsNip_10t0364700-02;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	11384760	11384797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	11384890	11384962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	11385044	11385097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	11387878	11388337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364700-02;Tag=IsoSeq:G14820.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6730.1,Nipponbare.panicle_G11624.1,Nipponbare.root_G8802.1;prot_id "UniRef90_A0A1U8AUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	11388674	11390191	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0364800-01;Parent=gene:OsNip_10g0364800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0364800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	11388674	11390191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0364800-01;Name=OsNip_10t0364800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0364800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11545618	11545704	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368400-01;Name=OsNip_10t0368400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0368400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	11545618	11545704	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0368400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0368400-01;protein_id=OsNip_10t0368400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	11545839	11545979	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0368400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0368400-01;protein_id=OsNip_10t0368400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	11545839	11546028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368400-01;Name=OsNip_10t0368400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0368400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11545980	11546028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11573766	11573853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368902-00;Name=OsNip_10t0368902-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0368902-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	11573766	11573853	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0368902-00;Parent=transcript:OsNip_10t0368902-00;protein_id=OsNip_10t0368902-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	11574516	11576077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368902-00;Name=OsNip_10t0368902-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0368902-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	11574516	11576077	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0368902-00;Parent=transcript:OsNip_10t0368902-00;protein_id=OsNip_10t0368902-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	11572574	11576610	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0368902-01;Parent=gene:OsNip_10g0368902;transcript_id=OsNip_10t0368902-01;Tag=IsoSeq:G14826.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11629.1
Chr10	TAMA	exon	11574376	11576610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0368902-01;Name=OsNip_10t0368902-01;exon_id=OsNip_10t0368902-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14826.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11629.1;prot_id "UniRef90_UPI0018AE2358";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11599729	11599845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	11598554	11598662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369500-02;Name=OsNip_10t0369500-02;exon_id=OsNip_10t0369500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14829.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11632.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YA89";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	11598645	11598662	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0369500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0369500-02;protein_id=OsNip_10t0369500-02;Tag=IsoSeq:G14829.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11632.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YA89";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	11599841	11599842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369500-02;Tag=IsoSeq:G14829.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11632.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YA89";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	11596534	11596949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369500-02;Tag=IsoSeq:G14829.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11632.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YA89";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11605737	11606326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369600-01;Name=OsNip_10t0369600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0369600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	11606796	11607117	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0369600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0369600-01;protein_id=OsNip_10t0369600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	11606796	11607118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369600-01;Name=OsNip_10t0369600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0369600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11607118	11607118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	11605175	11609036	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0369600-02;Parent=gene:OsNip_10g0369600;transcript_id=OsNip_10t0369600-02;Tag=IsoSeq:G14830.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11633.2,Nipponbare.leaf_G6736.1,Nipponbare.root_G8808.2
Chr10	TAMA	exon	11608855	11609036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369600-02;Name=OsNip_10t0369600-02;exon_id=OsNip_10t0369600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14830.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11633.2,Nipponbare.leaf_G6736.1,Nipponbare.root_G8808.2;prot_id "UniRef90_A0A7I8K8K8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	11608855	11609035	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0369600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0369600-02;protein_id=OsNip_10t0369600-02;Tag=IsoSeq:G14830.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11633.2,Nipponbare.leaf_G6736.1,Nipponbare.root_G8808.2;prot_id "UniRef90_A0A7I8K8K8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	11605737	11607475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0369600-02;Name=OsNip_10t0369600-02;exon_id=OsNip_10t0369600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14830.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11633.2,Nipponbare.leaf_G6736.1,Nipponbare.root_G8808.2;prot_id "UniRef90_A0A7I8K8K8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	11607420	11607475	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0369600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0369600-02;protein_id=OsNip_10t0369600-02;Tag=IsoSeq:G14830.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11633.2,Nipponbare.leaf_G6736.1,Nipponbare.root_G8808.2;prot_id "UniRef90_A0A7I8K8K8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11811221	11811275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0372800-01;Name=OsNip_10t0372800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0372800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11811677	11811757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0372800-01;Name=OsNip_10t0372800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0372800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	11811826	11811899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0372800-01;Name=OsNip_10t0372800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0372800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11985838	11986066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0376200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	12023736	12024088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377000-02;Tag=IsoSeq:G14845.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8817.3;prot_id "UniRef90_J3N274";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12024100	12024661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377150-00;Name=OsNip_10t0377150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0377150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12052521	12052733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0377400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0377400-01;protein_id=OsNip_10t0377400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12052521	12052937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-01;Name=OsNip_10t0377400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0377400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12048153	12048899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-02;Name=OsNip_10t0377400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0377400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12048462	12048899	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0377400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0377400-02;protein_id=OsNip_10t0377400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12052521	12052733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0377400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0377400-02;protein_id=OsNip_10t0377400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12052521	12052871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-02;Name=OsNip_10t0377400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0377400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12052734	12052871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	12048110	12052952	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0377400-04;Parent=gene:OsNip_10g0377400;transcript_id=OsNip_10t0377400-04;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1
Chr10	TAMA	exon	12052522	12052952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-04;Name=OsNip_10t0377400-04;exon_id=OsNip_10t0377400-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADE298";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	12052522	12052950	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0377400-04;Parent=transcript:OsNip_10t0377400-04;protein_id=OsNip_10t0377400-04;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADE298";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	12048110	12048900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-04;Name=OsNip_10t0377400-04;exon_id=OsNip_10t0377400-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADE298";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	12052951	12052952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-04;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADE298";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	12048110	12048898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377400-04;Tag=IsoSeq:G14847.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8818.1,Nipponbare.leaf_G6743.1,Nipponbare.panicle_G11647.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADE298";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12048474	12052756	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0377450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12048474	12052756	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0377450-00;Parent=gene:OsNip_10g0377450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0377450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12048474	12048862	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12048474	12048885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377450-00;Name=OsNip_10t0377450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0377450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12052514	12052756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377450-00;Name=OsNip_10t0377450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0377450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12052514	12052756	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0377450-00;Parent=transcript:OsNip_10t0377450-00;protein_id=OsNip_10t0377450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12060353	12063575	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0377500;biotype=protein_coding;description=Nucleic;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12060353	12063575	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0377500-00;Parent=gene:OsNip_10g0377500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12060353	12060479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12060353	12060486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Name=OsNip_10t0377500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0377500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12060480	12060486	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0377500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;protein_id=OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12060567	12060839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Name=OsNip_10t0377500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0377500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12060567	12060839	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0377500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;protein_id=OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12060933	12061418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Name=OsNip_10t0377500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0377500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12060962	12061418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12061505	12061586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12061673	12061793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12061878	12062040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12062120	12062642	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12062865	12062944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12063029	12063115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12063196	12063575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0377500-00;Name=OsNip_10t0377500-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0377500-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12115113	12115205	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0378400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0378400-01;protein_id=OsNip_10t0378400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12116070	12116366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378400-01;Name=OsNip_10t0378400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0378400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12116070	12116366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	12116070	12116368	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378400-02;Name=OsNip_10t0378400-02;exon_id=OsNip_10t0378400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14851.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6746.2,Nipponbare.panicle_G11651.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HMF9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	12116070	12116368	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0378400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0378400-02;protein_id=OsNip_10t0378400-02;Tag=IsoSeq:G14851.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6746.2,Nipponbare.panicle_G11651.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HMF9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	12113672	12115269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378400-02;Name=OsNip_10t0378400-02;exon_id=OsNip_10t0378400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14851.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6746.2,Nipponbare.panicle_G11651.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HMF9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	12115239	12115269	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0378400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0378400-02;protein_id=OsNip_10t0378400-02;Tag=IsoSeq:G14851.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6746.2,Nipponbare.panicle_G11651.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HMF9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	12113672	12115236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378400-02;Tag=IsoSeq:G14851.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6746.2,Nipponbare.panicle_G11651.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HMF9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12119384	12120231	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0378450-00;Parent=gene:OsNip_10g0378450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0378450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12119384	12119637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12119384	12120231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378450-00;Name=OsNip_10t0378450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0378450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12119638	12120225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0378450-00;Parent=transcript:OsNip_10t0378450-00;protein_id=OsNip_10t0378450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12120226	12120231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0378450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12181085	12183127	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0379100;Name=OsNip_-THT1;biotype=protein_coding;description=Transferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12181085	12183127	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0379100-01;Parent=gene:OsNip_10g0379100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0379100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12181085	12181338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12181085	12182268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;Name=OsNip_10t0379100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0379100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12181339	12182268	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0379100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;protein_id=OsNip_10t0379100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12182665	12183045	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0379100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;protein_id=OsNip_10t0379100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12182665	12183127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;Name=OsNip_10t0379100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0379100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12183046	12183127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12181406	12183056	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0379233-00;Parent=gene:OsNip_10g0379233;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0379233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12181406	12181407	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12181406	12182256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;Name=OsNip_10t0379233-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0379233-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12181408	12182256	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0379233-00;Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;protein_id=OsNip_10t0379233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12182651	12182683	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0379233-00;Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;protein_id=OsNip_10t0379233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12182651	12183056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;Name=OsNip_10t0379233-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0379233-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12182684	12183056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12215018	12216339	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0379854;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12215018	12216339	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0379854-00;Parent=gene:OsNip_10g0379854;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0379854-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12215018	12215347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379854-00;Name=OsNip_10t0379854-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0379854-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12215018	12215347	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0379854-00;Parent=transcript:OsNip_10t0379854-00;protein_id=OsNip_10t0379854-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12215456	12215586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0379854-00;Parent=transcript:OsNip_10t0379854-00;protein_id=OsNip_10t0379854-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12215456	12216339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379854-00;Name=OsNip_10t0379854-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0379854-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12215587	12216339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0379854-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12214895	12216736	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0380100;Name=OsNip_-THT2;biotype=protein_coding;description=Transferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12215500	12216409	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0380100-01;Parent=gene:OsNip_10g0380100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0380100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12215500	12215500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12215500	12216409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-01;Name=OsNip_10t0380100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0380100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12215501	12216406	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0380100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0380100-01;protein_id=OsNip_10t0380100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12216407	12216409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	12214895	12216736	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0380100-02;Parent=gene:OsNip_10g0380100;transcript_id=OsNip_10t0380100-02;Tag=IsoSeq:G14853.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8821.3
Chr10	TAMA	exon	12214895	12215382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-02;Name=OsNip_10t0380100-02;exon_id=OsNip_10t0380100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14853.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8821.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0EWQ3";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	exon	12215480	12216736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-02;Name=OsNip_10t0380100-02;exon_id=OsNip_10t0380100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14853.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8821.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0EWQ3";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	12216366	12216494	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0380100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0380100-02;protein_id=OsNip_10t0380100-02;Tag=IsoSeq:G14853.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8821.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0EWQ3";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	12214895	12215382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0380100-02;Tag=IsoSeq:G14853.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8821.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0EWQ3";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12345146	12345957	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0382400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12851354	12851502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;Name=OsNip_10t0388600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0388600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12851592	12851765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;Name=OsNip_10t0388600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12853366	12853622	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0388600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;protein_id=OsNip_10t0388600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12853706	12853781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;Name=OsNip_10t0388600-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0388600-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12853706	12853781	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0388600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;protein_id=OsNip_10t0388600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12853864	12854148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;Name=OsNip_10t0388600-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388600-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12853990	12854148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12855670	12856069	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0388701;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12855670	12856069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0388701-01;Parent=gene:OsNip_10g0388701;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0388701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12855670	12856069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388701-01;Name=OsNip_10t0388701-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0388701-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	12867952	12869919	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0388900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12867952	12869919	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0388900-01;Parent=gene:OsNip_10g0388900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12867952	12868264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12867952	12868282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12868265	12868282	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12868367	12868464	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12868367	12868464	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12868545	12868584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12868545	12868584	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12868707	12868946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12868707	12868946	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12869397	12869537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12869667	12869715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12869667	12869715	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12869827	12869906	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0388900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;protein_id=OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12869827	12869919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Name=OsNip_10t0388900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0388900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12869907	12869919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0388900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12870906	12874037	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0389000-01;Parent=gene:OsNip_10g0389000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0389000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12870906	12871162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12870906	12871236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;Name=OsNip_10t0389000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0389000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12871163	12871236	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0389000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;protein_id=OsNip_10t0389000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12872160	12872262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;Name=OsNip_10t0389000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0389000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12872160	12872262	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0389000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;protein_id=OsNip_10t0389000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12873160	12873337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;Name=OsNip_10t0389000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0389000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12873807	12874037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389000-01;Name=OsNip_10t0389000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0389000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12899339	12899738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Name=OsNip_10t0389500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0389500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12899339	12899738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12899819	12899842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12899819	12899952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Name=OsNip_10t0389500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0389500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12899843	12899952	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0389500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;protein_id=OsNip_10t0389500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12900629	12901055	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0389500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;protein_id=OsNip_10t0389500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12901644	12902125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Name=OsNip_10t0389500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0389500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12901695	12902125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0389500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12937984	12938622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390000-00;Name=OsNip_10t0390000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0390000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12938827	12939127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390000-00;Name=OsNip_10t0390000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0390000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12941575	12941757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12942936	12943115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12943207	12943326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12943837	12943980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	12944210	12944374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12944476	12944781	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0390100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;protein_id=OsNip_10t0390100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12944855	12945218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12944855	12945218	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0390100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;protein_id=OsNip_10t0390100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	12945343	12945671	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0390100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;protein_id=OsNip_10t0390100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12945343	12945695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12945672	12945695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12946496	12946746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Name=OsNip_10t0390100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0390100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12946496	12946746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	12946103	12946820	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0390100-01;Parent=gene:OsNip_10g0390100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0390100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	12946103	12946820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-01;Name=OsNip_10t0390100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0390100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	12940714	12946765	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0390100-03;Parent=gene:OsNip_10g0390100;transcript_id=OsNip_10t0390100-03;Tag=IsoSeq:G14863.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8826.1
Chr10	TAMA	exon	12946496	12946765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0390100-03;Name=OsNip_10t0390100-03;exon_id=OsNip_10t0390100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14863.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8826.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8IMB9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13162915	13163933	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394200-01;Name=OsNip_10t0394200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0394200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13171237	13172542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13172543	13173598	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0394400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0394400-01;protein_id=OsNip_10t0394400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13180917	13181120	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0394400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0394400-01;protein_id=OsNip_10t0394400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13180917	13183059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394400-01;Name=OsNip_10t0394400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0394400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13183199	13183557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394400-01;Name=OsNip_10t0394400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0394400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13171302	13171725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394400-02;Name=OsNip_10t0394400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0394400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	13186553	13187292	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0394700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13186553	13187289	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0394700-01;Parent=gene:OsNip_10g0394700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0394700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13186553	13186839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;Name=OsNip_10t0394700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0394700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13186553	13186839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13186931	13186979	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13186931	13187289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;Name=OsNip_10t0394700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0394700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13186980	13187201	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0394700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;protein_id=OsNip_10t0394700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13187202	13187289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	13186639	13187292	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0394700-02;Parent=gene:OsNip_10g0394700;transcript_id=OsNip_10t0394700-02;Tag=IsoSeq:G14881.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8835.2
Chr10	TAMA	exon	13186639	13187292	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-02;Name=OsNip_10t0394700-02;exon_id=OsNip_10t0394700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14881.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8835.2;prot_id "UniRef90_B9G5K6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	13186639	13187140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0394700-02;Tag=IsoSeq:G14881.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8835.2;prot_id "UniRef90_B9G5K6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	13219950	13226081	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0395000;Name=OsNip_RLCK298;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13219950	13226081	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0395000-01;Parent=gene:OsNip_10g0395000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13219950	13220169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13219950	13220528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;Name=OsNip_10t0395000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0395000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13220170	13220528	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0395000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;protein_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13220693	13220816	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0395000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;protein_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13221209	13221345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;Name=OsNip_10t0395000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0395000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13221209	13221345	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0395000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;protein_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13223275	13223410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;Name=OsNip_10t0395000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0395000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13223275	13223410	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0395000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;protein_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13225650	13226063	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0395000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;protein_id=OsNip_10t0395000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13225650	13226081	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395000-01;Name=OsNip_10t0395000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0395000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13231204	13237841	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0395100-01;Parent=gene:OsNip_10g0395100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0395100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13231204	13231433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13231204	13231575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0395100-01;Name=OsNip_10t0395100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0395100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13285570	13285667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0396100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13289659	13292217	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0396300-01;Parent=gene:OsNip_10g0396300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0396300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13289659	13289894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0396300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13289659	13289969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0396300-01;Name=OsNip_10t0396300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0396300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13289895	13289969	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0396300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0396300-01;protein_id=OsNip_10t0396300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13606027	13606275	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0402200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0402200-01;protein_id=OsNip_10t0402200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13606381	13606431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0402200-01;Name=OsNip_10t0402200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0402200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13606381	13606431	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0402200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0402200-01;protein_id=OsNip_10t0402200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	13606664	13606711	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0402300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13606664	13606711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0402300-00;Name=OsNip_10t0402300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0402300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13833513	13833530	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0405300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;protein_id=OsNip_10t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13833763	13834053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;Name=OsNip_10t0405300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0405300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13833763	13834053	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0405300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;protein_id=OsNip_10t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13835878	13835925	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0405300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;protein_id=OsNip_10t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13835878	13836254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;Name=OsNip_10t0405300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0405300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13835926	13836254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	13833237	13833315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Name=OsNip_10t0405300-02;exon_id=OsNip_10t0405300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	13833763	13834053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Name=OsNip_10t0405300-02;exon_id=OsNip_10t0405300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	13835878	13836281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Name=OsNip_10t0405300-02;exon_id=OsNip_10t0405300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	13836015	13836197	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0405300-02;Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;protein_id=OsNip_10t0405300-02;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	13833237	13833315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	13833763	13834053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	13835878	13836014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	13836201	13836281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405300-02;Tag=IsoSeq:G14902.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8848.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1EN56";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	13842020	13848949	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0405500;Name=PAIR3;biotype=protein_coding;description=Coiled-coil;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13842020	13848949	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0405500-01;Parent=gene:OsNip_10g0405500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0405500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13842020	13842029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405500-01;Name=OsNip_10t0405500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0405500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13842020	13842029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13843104	13843155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13843104	13843185	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405500-01;Name=OsNip_10t0405500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0405500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13843304	13844953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405500-01;Name=OsNip_10t0405500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0405500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13851446	13851557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Name=OsNip_10t0405600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0405600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13851639	13851712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Name=OsNip_10t0405600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0405600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13852222	13852514	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0405600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;protein_id=OsNip_10t0405600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13852222	13852548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Name=OsNip_10t0405600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0405600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13852515	13852548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	13853097	13853377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Name=OsNip_10t0405600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0405600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13853097	13853377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	13848980	13853421	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0405600-02;Parent=gene:OsNip_10g0405600;transcript_id=OsNip_10t0405600-02;Tag=IsoSeq:G14903.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11681.1,Nipponbare.root_G8849.1
Chr10	TAMA	exon	13853097	13853421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-02;Name=OsNip_10t0405600-02;exon_id=OsNip_10t0405600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14903.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11681.1,Nipponbare.root_G8849.1;prot_id "UniRef90_I1IQ47";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	13853173	13853421	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0405600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0405600-02;protein_id=OsNip_10t0405600-02;Tag=IsoSeq:G14903.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11681.1,Nipponbare.root_G8849.1;prot_id "UniRef90_I1IQ47";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	13852222	13852548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0405600-02;Name=OsNip_10t0405600-02;exon_id=OsNip_10t0405600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14903.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11681.1,Nipponbare.root_G8849.1;prot_id "UniRef90_I1IQ47";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	13925334	13925636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0406800-01;Name=OsNip_10t0406800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0406800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	13946248	13951159	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0407450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	13946248	13951159	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0407450-00;Parent=gene:OsNip_10g0407450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0407450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	13946248	13946530	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0407450-00;Parent=transcript:OsNip_10t0407450-00;protein_id=OsNip_10t0407450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14256467	14256787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410600-01;Name=OsNip_10t0410600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0410600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14255800	14256014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410600-02;Name=OsNip_10t0410600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0410600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14258604	14258670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410600-02;Name=OsNip_10t0410600-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0410600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14262561	14262630	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410700-01;Name=OsNip_10t0410700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0410700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14263045	14263100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410700-01;Name=OsNip_10t0410700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0410700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14263449	14263544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410700-01;Name=OsNip_10t0410700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0410700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14263652	14263828	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0410700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0410700-01;protein_id=OsNip_10t0410700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14263652	14263873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410700-01;Name=OsNip_10t0410700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0410700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14270663	14270706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14270663	14270895	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Name=OsNip_10t0410750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0410750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14270707	14270895	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0410750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;protein_id=OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14273476	14273737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Name=OsNip_10t0410750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0410750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14273476	14273737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0410750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;protein_id=OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14273881	14273939	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0410750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;protein_id=OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14273881	14274106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Name=OsNip_10t0410750-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0410750-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14273940	14274106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14274196	14274349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14274411	14274584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Name=OsNip_10t0410750-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0410750-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14274411	14274584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14278753	14283314	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0410900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14278753	14283314	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0410900-01;Parent=gene:OsNip_10g0410900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14278753	14279062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14278753	14279204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410900-01;Name=OsNip_10t0410900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0410900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14279063	14279204	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0410900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0410900-01;protein_id=OsNip_10t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14280300	14280376	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0410900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0410900-01;protein_id=OsNip_10t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14280300	14280513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0410900-01;Name=OsNip_10t0410900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0410900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	14289002	14289859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411100-01;Tag=IsoSeq:G14915.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11692.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4AQV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14319443	14319567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;Name=OsNip_10t0411500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0411500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14321411	14321501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;Name=OsNip_10t0411500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0411500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14322053	14322154	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0411500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;protein_id=OsNip_10t0411500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14322265	14323020	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0411500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;protein_id=OsNip_10t0411500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14322265	14323361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;Name=OsNip_10t0411500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0411500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14323021	14323361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14319926	14321570	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0411600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14319926	14321570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0411600-01;Parent=gene:OsNip_10g0411600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0411600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14319926	14321069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14319926	14321570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411600-01;Name=OsNip_10t0411600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0411600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14321070	14321474	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0411600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0411600-01;protein_id=OsNip_10t0411600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14321475	14321570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14322041	14322867	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0411650;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14322041	14322867	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0411650-00;Parent=gene:OsNip_10g0411650;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0411650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14322041	14322303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411650-00;Name=OsNip_10t0411650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0411650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14322374	14322867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0411650-00;Name=OsNip_10t0411650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0411650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14508690	14508788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0415300-01;Name=OsNip_10t0415300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0415300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14507098	14507161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0415300-02;Name=OsNip_10t0415300-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0415300-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14642514	14642721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0417600-01;Name=OsNip_10t0417600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0417600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14717787	14717947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0418900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14734355	14734508	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0419100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0419100-01;protein_id=OsNip_10t0419100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14736201	14736612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419100-01;Name=OsNip_10t0419100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0419100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14736386	14736612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14739603	14743098	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0419200-01;Parent=gene:OsNip_10g0419200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14739603	14739896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14739603	14740644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;Name=OsNip_10t0419200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0419200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14739897	14740644	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0419200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;protein_id=OsNip_10t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14742169	14742592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;Name=OsNip_10t0419200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0419200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14742169	14742592	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0419200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;protein_id=OsNip_10t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14742688	14742943	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0419200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;protein_id=OsNip_10t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14742688	14743098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0419200-01;Name=OsNip_10t0419200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0419200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14911682	14911829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422075-00;Name=OsNip_10t0422075-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0422075-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14926013	14927464	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422300-00;Name=OsNip_10t0422300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0422300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14927456	14927464	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14928390	14928618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422300-00;Name=OsNip_10t0422300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14928390	14928618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14928739	14928966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14928862	14929838	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0422401-01;Parent=gene:OsNip_10g0422401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0422401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14928862	14928887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;Name=OsNip_10t0422401-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422401-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14928862	14928887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14929450	14929454	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0422401-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;protein_id=OsNip_10t0422401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14929554	14929647	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0422401-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;protein_id=OsNip_10t0422401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14929554	14929838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;Name=OsNip_10t0422401-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14929648	14929838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14944271	14949000	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0422500;biotype=protein_coding;description=Endonuclease/exonuclease/phosphatase;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14944271	14949000	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0422500-01;Parent=gene:OsNip_10g0422500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0422500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14944271	14944608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14944271	14944635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;Name=OsNip_10t0422500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14944609	14944635	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0422500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;protein_id=OsNip_10t0422500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14944787	14944886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;Name=OsNip_10t0422500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0422500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14944787	14944886	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0422500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;protein_id=OsNip_10t0422500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14945248	14945325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;Name=OsNip_10t0422500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0422500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14945248	14945325	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0422500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;protein_id=OsNip_10t0422500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14945512	14945599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422500-01;Name=OsNip_10t0422500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0422500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14956178	14956360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422566-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14958677	14958680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422566-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	14956359	14958683	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0422583;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14956359	14958088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422583-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14958437	14958683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422583-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14960588	14962880	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0422600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14960588	14962880	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0422600-01;Parent=gene:OsNip_10g0422600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0422600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14960588	14961080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	14961713	14962582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422600-01;Name=OsNip_10t0422600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0422600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14961713	14962582	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0422600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422600-01;protein_id=OsNip_10t0422600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14962705	14962796	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0422600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422600-01;protein_id=OsNip_10t0422600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14962705	14962880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422600-01;Name=OsNip_10t0422600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14976089	14976168	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0422700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422700-01;protein_id=OsNip_10t0422700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14976089	14976372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422700-01;Name=OsNip_10t0422700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0422700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14976169	14976372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14979873	14979947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14979948	14980265	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0422800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0422800-01;protein_id=OsNip_10t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14980266	14980665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	14983512	14986232	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0423000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	14983512	14986232	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0423000-01;Parent=gene:OsNip_10g0423000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14983512	14983769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Name=OsNip_10t0423000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0423000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14983512	14983769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14983862	14985406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14983862	14985440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Name=OsNip_10t0423000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0423000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14985407	14985440	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0423000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;protein_id=OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14985800	14985930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Name=OsNip_10t0423000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0423000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14985800	14985930	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0423000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;protein_id=OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	14986027	14986230	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0423000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;protein_id=OsNip_10t0423000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	14986027	14986232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0423000-01;Name=OsNip_10t0423000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0423000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15125000	15125348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0425700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15138433	15138545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0425900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15219084	15220523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0427700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15220656	15222376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0427900-02;Name=OsNip_10t0427900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0427900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15222362	15222376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0427900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15223100	15223120	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0427900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15230192	15230320	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15230192	15230320	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0428200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;protein_id=OsNip_10t0428200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15230450	15232449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15232560	15232599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15232730	15232865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15232959	15233195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15232959	15233195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15233882	15234148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15233882	15234148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15234242	15234593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Name=OsNip_10t0428200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15234242	15234593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15230192	15230320	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Name=OsNip_10t0428200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15230192	15230320	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15230450	15232449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Name=OsNip_10t0428200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15230450	15232449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15232560	15232725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15232726	15232865	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0428200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;protein_id=OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15232959	15233052	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0428200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;protein_id=OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15232959	15233195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Name=OsNip_10t0428200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15233053	15233195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15233882	15233893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Name=OsNip_10t0428200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15233882	15233893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15234530	15234593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0428200-01;Name=OsNip_10t0428200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0428200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15308996	15309102	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0430200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0430200-02;protein_id=OsNip_10t0430200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15340627	15341263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0430800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15362999	15363078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0431000-03;Name=OsNip_10t0431000-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0431000-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15427146	15427433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0432300-01;Name=OsNip_10t0432300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0432300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15428319	15428552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0432400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15436590	15437348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0432650-00;Name=OsNip_10t0432650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0432650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15436590	15437348	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0432650-00;Parent=transcript:OsNip_10t0432650-00;protein_id=OsNip_10t0432650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15437445	15437735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0432725-00;Parent=transcript:OsNip_10t0432725-00;protein_id=OsNip_10t0432725-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	15498122	15499315	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0434999;Name=OsNip_MB45;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15498122	15499315	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0434999-00;Parent=transcript:OsNip_10t0434999-00;protein_id=OsNip_10t0434999-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	15506653	15507311	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0435300;Name=OsNip_MB37;biotype=protein_coding;description=BTB/POZ-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15506653	15506847	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0435300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15506653	15507311	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0435300-00;Name=OsNip_10t0435300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0435300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15506848	15507311	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0435300-00;Parent=transcript:OsNip_10t0435300-00;protein_id=OsNip_10t0435300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	15514723	15519165	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0435400;Name=OsNip_MB44;biotype=protein_coding;description=TRAF-type;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15614217	15616010	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0436900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0436900-01;protein_id=OsNip_10t0436900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15616011	15616103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	15614501	15615974	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0436950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15614501	15615091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;Name=OsNip_10t0436950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0436950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15614501	15615091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15615148	15615281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15615148	15615974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;Name=OsNip_10t0436950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0436950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15615282	15615815	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0436950-00;Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;protein_id=OsNip_10t0436950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15615816	15615974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0436950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	15621355	15624743	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0437000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	15621355	15624642	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0437000-01;Parent=gene:OsNip_10g0437000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15621355	15621578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15621355	15622107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Name=OsNip_10t0437000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0437000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15621579	15622107	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0437000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;protein_id=OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622217	15622292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Name=OsNip_10t0437000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622217	15622292	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0437000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;protein_id=OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622492	15622522	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0437000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;protein_id=OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622492	15622627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Name=OsNip_10t0437000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0437000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15622523	15622627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15623902	15624642	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Name=OsNip_10t0437000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0437000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15623902	15624642	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	15621359	15624665	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0437000-03;Parent=gene:OsNip_10g0437000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15621359	15621578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15621359	15622107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Name=OsNip_10t0437000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15621579	15622107	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0437000-03;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;protein_id=OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622217	15622292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Name=OsNip_10t0437000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622217	15622292	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0437000-03;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;protein_id=OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622504	15622522	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0437000-03;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;protein_id=OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622504	15622627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Name=OsNip_10t0437000-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0437000-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15622523	15622627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15623902	15624665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Name=OsNip_10t0437000-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0437000-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15623902	15624665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	15621359	15624666	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0437000-02;Parent=gene:OsNip_10g0437000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15621359	15621578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15621359	15622107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Name=OsNip_10t0437000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15621579	15622107	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0437000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;protein_id=OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622217	15622292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Name=OsNip_10t0437000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622217	15622292	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0437000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;protein_id=OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15622500	15622627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Name=OsNip_10t0437000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15622500	15622627	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0437000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;protein_id=OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15623902	15624431	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0437000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;protein_id=OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15623902	15624666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Name=OsNip_10t0437000-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0437000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15624432	15624666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	15624601	15624743	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0437000-04;Parent=gene:OsNip_10g0437000;transcript_id=OsNip_10t0437000-04;Tag=IsoSeq:G14961.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8881.1
Chr10	TAMA	exon	15624601	15624743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-04;Name=OsNip_10t0437000-04;exon_id=OsNip_10t0437000-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14961.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8881.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	15624601	15624714	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0437000-04;Parent=transcript:OsNip_10t0437000-04;protein_id=OsNip_10t0437000-04;Tag=IsoSeq:G14961.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8881.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	15624718	15624743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0437000-04;Tag=IsoSeq:G14961.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8881.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	15629402	15635858	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0437100;Name=OsNip_CAT7;biotype=protein_coding;description=Amino;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15730621	15730827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0438500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15755446	15755718	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0439166-00;Parent=transcript:OsNip_10t0439166-00;protein_id=OsNip_10t0439166-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15816689	15816771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0440100-00;Name=OsNip_10t0440100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0440100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15817562	15817788	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0440100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0440100-00;protein_id=OsNip_10t0440100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	15827417	15827725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0440500-00;Name=OsNip_10t0440500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0440500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15827417	15827725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0440500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0440500-00;protein_id=OsNip_10t0440500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	15827844	15827923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0440500-00;Name=OsNip_10t0440500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0440500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	15827844	15827923	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0440500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0440500-00;protein_id=OsNip_10t0440500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	15827043	15828788	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0440500-01;Parent=gene:OsNip_10g0440500;transcript_id=OsNip_10t0440500-01;Tag=IsoSeq:G14971.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6792.1
Chr10	TAMA	exon	15827043	15827328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0440500-01;Name=OsNip_10t0440500-01;exon_id=OsNip_10t0440500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14971.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6792.1;prot_id "UniRef90_A0A452YB17";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16020766	16020857	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0444400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0444400-01;protein_id=OsNip_10t0444400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16020945	16021026	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0444400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0444400-01;protein_id=OsNip_10t0444400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16020945	16021344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444400-01;Name=OsNip_10t0444400-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0444400-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16036383	16036406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16036383	16038107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-02;Name=OsNip_10t0444700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0444700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16036407	16038032	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0444700-02;Parent=transcript:OsNip_10t0444700-02;protein_id=OsNip_10t0444700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16038033	16038107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16036156	16036406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16036156	16038231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-01;Name=OsNip_10t0444700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0444700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16036407	16038032	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0444700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0444700-01;protein_id=OsNip_10t0444700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16038033	16038231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	16036256	16038107	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0444700-03;Parent=gene:OsNip_10g0444700;transcript_id=OsNip_10t0444700-03;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6
Chr10	TAMA	exon	16037954	16038107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;Name=OsNip_10t0444700-03;exon_id=OsNip_10t0444700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	16037954	16038105	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0444700-03;Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;protein_id=OsNip_10t0444700-03;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	16036256	16037575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;Name=OsNip_10t0444700-03;exon_id=OsNip_10t0444700-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	16036396	16037575	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0444700-03;Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;protein_id=OsNip_10t0444700-03;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	16038106	16038107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	16036256	16036393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444700-03;Tag=IsoSeq:G14981.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6796.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16036455	16038061	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0444850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16036455	16038061	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0444850-00;Parent=gene:OsNip_10g0444850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0444850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16036455	16036533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16036455	16036782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;Name=OsNip_10t0444850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0444850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16036534	16036782	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0444850-00;Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;protein_id=OsNip_10t0444850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16037073	16038038	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0444850-00;Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;protein_id=OsNip_10t0444850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16037073	16038061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;Name=OsNip_10t0444850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0444850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16038039	16038061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0444850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16084478	16086689	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0445400;Name=OsNip_HCI1;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16084478	16086689	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0445400-01;Parent=gene:OsNip_10g0445400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0445400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16084478	16084636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16084478	16084850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445400-01;Name=OsNip_10t0445400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0445400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	16085655	16085877	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445400-01;Name=OsNip_10t0445400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0445400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16096849	16097090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16096849	16098550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-01;Name=OsNip_10t0445600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0445600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16097091	16098500	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0445600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0445600-01;protein_id=OsNip_10t0445600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16098501	16098550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	16096886	16096993	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0445600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0445600-02;protein_id=OsNip_10t0445600-02;Tag=IsoSeq:G14984.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6799.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3HNU1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	16098470	16098551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-02;Tag=IsoSeq:G14984.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6799.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3HNU1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	16096994	16098396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-02;Tag=IsoSeq:G14984.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6799.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3HNU1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	16096849	16096883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445600-02;Tag=IsoSeq:G14984.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6799.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3HNU1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16106075	16107485	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0445900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16106220	16106295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16106220	16106350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445900-01;Name=OsNip_10t0445900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0445900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16106296	16106350	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0445900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0445900-01;protein_id=OsNip_10t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16106936	16107138	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0445900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0445900-01;protein_id=OsNip_10t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16106936	16107411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0445900-01;Name=OsNip_10t0445900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0445900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	16182016	16184929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-01;Name=OsNip_10t0447100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0447100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16181656	16181770	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0447100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0447100-02;protein_id=OsNip_10t0447100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16181864	16181916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-02;Name=OsNip_10t0447100-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0447100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16181864	16181916	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0447100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0447100-02;protein_id=OsNip_10t0447100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16182016	16182129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-02;Name=OsNip_10t0447100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0447100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16182016	16182129	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0447100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0447100-02;protein_id=OsNip_10t0447100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	16180832	16184841	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0447100-03;Parent=gene:OsNip_10g0447100;transcript_id=OsNip_10t0447100-03;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2
Chr10	TAMA	exon	16180832	16181082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	16180834	16181082	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0447100-03;Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;protein_id=OsNip_10t0447100-03;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	16181264	16181343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	16181264	16181335	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0447100-03;Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;protein_id=OsNip_10t0447100-03;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	16181656	16181770	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	16181864	16181916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	16182016	16182144	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	16184528	16184841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Name=OsNip_10t0447100-03;exon_id=OsNip_10t0447100-03-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	16180832	16180833	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0447100-03;Tag=IsoSeq:G14988.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8896.4,Nipponbare.panicle_G11752.3,Nipponbare.panicle_G11752.4,Nipponbare.leaf_G6800.1,Nipponbare.leaf_G6800.2;prot_id "UniRef90_A0A0A0KNV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16426820	16426928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0450800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16428860	16429924	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0450900-02;Parent=gene:OsNip_10g0450900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0450900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	16428860	16429924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0450900-02;Name=OsNip_10t0450900-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0450900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	16429132	16429645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0450900-03;Name=OsNip_10t0450900-03;exon_id=OsNip_10t0450900-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14994.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6802.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	16429923	16429924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0450900-03;Tag=IsoSeq:G14994.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6802.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	16429132	16429323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0450900-03;Tag=IsoSeq:G14994.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6802.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	16458009	16460896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451600-01;Name=OsNip_10t0451600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0451600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16476146	16477079	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0451700-01;Parent=gene:OsNip_10g0451700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0451700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16476146	16476356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16476146	16477079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451700-01;Name=OsNip_10t0451700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0451700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16476357	16477049	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0451700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0451700-01;protein_id=OsNip_10t0451700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16477050	16477079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16481078	16482112	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0451900;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16481078	16482112	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0451900-01;Parent=gene:OsNip_10g0451900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0451900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16481078	16481215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16481078	16482112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451900-01;Name=OsNip_10t0451900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0451900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16481216	16481698	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0451900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0451900-01;protein_id=OsNip_10t0451900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16481699	16482112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0451900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16486346	16487160	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0452100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16486346	16487160	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0452100-01;Parent=gene:OsNip_10g0452100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0452100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16486346	16486552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16486346	16487160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452100-01;Name=OsNip_10t0452100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0452100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16486553	16487065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0452100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0452100-01;protein_id=OsNip_10t0452100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16487066	16487160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16494319	16495128	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0452300;Name=CAI1;biotype=protein_coding;description=Eggshell;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16494319	16495128	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0452300-01;Parent=gene:OsNip_10g0452300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16494319	16494534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16494319	16495128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452300-01;Name=OsNip_10t0452300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0452300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16494535	16495092	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0452300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0452300-01;protein_id=OsNip_10t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16495093	16495128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	16500928	16501740	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0452500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16500928	16501740	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0452500-00;Parent=gene:OsNip_10g0452500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0452500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16500928	16501740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452500-00;Name=OsNip_10t0452500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0452500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16507486	16507661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	16509089	16512835	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0452800-01;Parent=gene:OsNip_10g0452800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0452800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16509089	16509600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	16509089	16509720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0452800-01;Name=OsNip_10t0452800-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0452800-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16509601	16509720	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0452800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0452800-01;protein_id=OsNip_10t0452800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16938371	16938461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0460500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	16941359	16941738	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0460500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0460500-01;protein_id=OsNip_10t0460500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17048051	17048228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0462900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17050180	17050355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0462900-01;Name=OsNip_10t0462900-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0462900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	17070925	17072455	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0463200;Name=OsNip_GELP108;biotype=protein_coding;description=Esterase%2C;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17074150	17074258	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0463300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17074259	17074719	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0463300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0463300-01;protein_id=OsNip_10t0463300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17074920	17075079	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0463300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0463300-01;protein_id=OsNip_10t0463300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17074920	17075296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0463300-01;Name=OsNip_10t0463300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0463300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17075080	17075296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0463300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17120644	17121044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0464100-01;Name=OsNip_10t0464100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0464100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17120644	17121044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0464100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	17158123	17162971	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0465000-02;Parent=gene:OsNip_10g0465000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17162140	17162808	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0465000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0465000-02;protein_id=OsNip_10t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17162140	17162971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465000-02;Name=OsNip_10t0465000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0465000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17162809	17162971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	17158157	17163245	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0465000-04;Parent=gene:OsNip_10g0465000;transcript_id=OsNip_10t0465000-04;Tag=IsoSeq:G15038.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11776.1
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Chr10	TAMA	CDS	17163023	17163244	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0465000-04;Parent=transcript:OsNip_10t0465000-04;protein_id=OsNip_10t0465000-04;Tag=IsoSeq:G15038.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11776.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5RU34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17159177	17159824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465000-04;Tag=IsoSeq:G15038.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11776.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5RU34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17158157	17158605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465000-04;Tag=IsoSeq:G15038.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11776.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5RU34";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	17164709	17165494	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0465175-00;Parent=gene:OsNip_10g0465175;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0465175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17164709	17164973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465175-00;Name=OsNip_10t0465175-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0465175-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17164709	17164973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17165102	17165229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465175-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17165102	17165494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465175-00;Name=OsNip_10t0465175-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0465175-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	17184397	17185854	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0465800;Name=OsNip_RPL21.2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17184397	17184720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465800-01;Tag=IsoSeq:G15040.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11778.5,Nipponbare.root_G8934.3,Nipponbare.leaf_G6820.4;prot_id "UniRef90_Q9FDZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17187264	17187623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465900-01;Name=OsNip_10t0465900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0465900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17187405	17187623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17188278	17188428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0465900-01;Name=OsNip_10t0465900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0465900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17249628	17249923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467100-00;Name=OsNip_10t0467100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17250766	17250929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17250930	17251037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;protein_id=OsNip_10t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17252165	17252270	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Name=OsNip_10t0467200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17253893	17254002	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Name=OsNip_10t0467200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0467200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17254267	17254341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Name=OsNip_10t0467200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17254442	17254528	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Name=OsNip_10t0467200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17254986	17255123	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;protein_id=OsNip_10t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17255238	17255582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Name=OsNip_10t0467200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17255310	17255582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17258323	17258531	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;protein_id=OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17259501	17259669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;Name=OsNip_10t0467600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0467600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17259501	17259669	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0467600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;protein_id=OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17259799	17259924	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;Name=OsNip_10t0467600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17259799	17259924	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;protein_id=OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17260778	17260843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;Name=OsNip_10t0467600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17260778	17260843	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;protein_id=OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17260962	17261012	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0467600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;protein_id=OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17260962	17261223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;Name=OsNip_10t0467600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0467600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17261013	17261223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0467600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	17262014	17266550	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0467850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	17262014	17266550	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0467850-00;Parent=gene:OsNip_10g0467850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0467850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	17298120	17299994	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0468301;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17299039	17299422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0468301-00;Name=OsNip_10t0468301-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0468301-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17299523	17299665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0468301-00;Name=OsNip_10t0468301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0468301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17349057	17349868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0469100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17345627	17345627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0469100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17345628	17345911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0469100-03;Name=OsNip_10t0469100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0469100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17377340	17377340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0469900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17377340	17378944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0469900-02;Name=OsNip_10t0469900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0469900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17389132	17390100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Name=OsNip_10t0470100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0470100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17389132	17390100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17391439	17391495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Name=OsNip_10t0470100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0470100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17391439	17391495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17393336	17393430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17393336	17393447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Name=OsNip_10t0470100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0470100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17393431	17393447	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0470100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;protein_id=OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17393525	17393792	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0470100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;protein_id=OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17393525	17393941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Name=OsNip_10t0470100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0470100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17393793	17393941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	17389918	17393968	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0470100-02;Parent=gene:OsNip_10g0470100;transcript_id=OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1
Chr10	TAMA	exon	17393525	17393968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Name=OsNip_10t0470100-02;exon_id=OsNip_10t0470100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	17393818	17393967	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0470100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;protein_id=OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	17393336	17393447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Name=OsNip_10t0470100-02;exon_id=OsNip_10t0470100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	17391440	17391495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Name=OsNip_10t0470100-02;exon_id=OsNip_10t0470100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	17389918	17390101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Name=OsNip_10t0470100-02;exon_id=OsNip_10t0470100-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	17393968	17393968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17393525	17393815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17393336	17393447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17391440	17391495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17389918	17390101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470100-02;Tag=IsoSeq:G15055.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6827.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3GGP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	17415606	17420814	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0470700;Name=OsNip_PTR3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	17415606	17420814	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0470700-01;Parent=gene:OsNip_10g0470700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0470700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17415606	17415736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0470700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17487567	17488780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Name=OsNip_10t0471400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0471400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17487567	17488780	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0471400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;protein_id=OsNip_10t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17488898	17489147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Name=OsNip_10t0471400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0471400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17488898	17489147	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0471400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;protein_id=OsNip_10t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17489749	17490000	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0471400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;protein_id=OsNip_10t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17489749	17490047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Name=OsNip_10t0471400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0471400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17490001	17490047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17490532	17490805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Name=OsNip_10t0471400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0471400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17490532	17490805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	17484872	17490804	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0471400-02;Parent=gene:OsNip_10g0471400;transcript_id=OsNip_10t0471400-02;Tag=IsoSeq:G15061.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11796.1
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17746797	17746974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17746797	17747026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476400-02;Name=OsNip_10t0476400-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0476400-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17762999	17763648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	17766864	17772031	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0476700;Name=OsNip_GELP109;biotype=protein_coding;description=Esterase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	17766864	17772027	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0476700-01;Parent=gene:OsNip_10g0476700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17766864	17766996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17766864	17767070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476700-01;Name=OsNip_10t0476700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0476700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17766997	17767070	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0476700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0476700-01;protein_id=OsNip_10t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17776771	17776920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	17776806	17776920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476900-02;Tag=IsoSeq:G15075.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6835.1,Nipponbare.panicle_G11808.1;prot_id "UniRef90_A0A368SL43";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	17773251	17773739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0476900-02;Tag=IsoSeq:G15075.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6835.1,Nipponbare.panicle_G11808.1;prot_id "UniRef90_A0A368SL43";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17778502	17778656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17778657	17778743	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0477000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;protein_id=OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17779757	17779844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17779757	17779844	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0477000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;protein_id=OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17780645	17780753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17780838	17780936	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0477000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;protein_id=OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17781551	17781593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17782215	17782286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17782574	17782807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	17783212	17783323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;Name=OsNip_10t0477000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0477000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17783212	17783323	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0477000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;protein_id=OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17784786	17784848	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0477000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0477000-01;protein_id=OsNip_10t0477000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17889114	17889120	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0478000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17962853	17963065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0478600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0478600-01;protein_id=OsNip_10t0478600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	17963500	17963733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0478600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0478600-01;protein_id=OsNip_10t0478600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	17963500	17964480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0478600-01;Name=OsNip_10t0478600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0478600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17963734	17964480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0478600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17965942	17966692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0478750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18009232	18009702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0479600-01;Name=OsNip_10t0479600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0479600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18011909	18012117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0479700-01;Name=OsNip_10t0479700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0479700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18011909	18012117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0479700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18015692	18015713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0479700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18085539	18085827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-01;Name=OsNip_10t0480200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18091701	18091850	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-01;Name=OsNip_10t0480200-02-E17;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E17;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18092001	18092147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0480200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0480200-01;protein_id=OsNip_10t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18092148	18092497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18086262	18086386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18086262	18086631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Name=OsNip_10t0480200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18086842	18087001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Name=OsNip_10t0480200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18087300	18087390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Name=OsNip_10t0480200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18087300	18087390	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0480200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;protein_id=OsNip_10t0480200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18091701	18091850	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Name=OsNip_10t0480200-02-E17;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18092001	18092147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0480200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;protein_id=OsNip_10t0480200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18092001	18092494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Name=OsNip_10t0480200-02-E18;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-02-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18092148	18092494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18089867	18089987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Name=OsNip_10t0480200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18090588	18090722	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Name=OsNip_10t0480200-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18090974	18091296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Name=OsNip_10t0480200-03-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18091470	18091575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Name=OsNip_10t0480200-03-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0480200-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18091470	18091575	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0480200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;protein_id=OsNip_10t0480200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18091701	18091895	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0480200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;protein_id=OsNip_10t0480200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18091701	18092415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Name=OsNip_10t0480200-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0480200-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18091896	18092415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18086367	18092143	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0480350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18086367	18092143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0480350-00;Parent=gene:OsNip_10g0480350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18086367	18086626	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18086367	18086626	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18086837	18087007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18086837	18087007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18087182	18087387	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18087182	18087387	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18087479	18087596	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18087479	18087596	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18088093	18088170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18088093	18088170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18088348	18088609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18088348	18088609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18088709	18088780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18088709	18088780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18089278	18089376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18089377	18089388	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0480350-00;Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;protein_id=OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18089472	18089632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18089472	18089632	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0480350-00;Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;protein_id=OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18089775	18089904	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0480350-00;Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;protein_id=OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18089775	18089992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18089905	18089992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18090497	18090707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Name=OsNip_10t0480350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0480350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18090497	18090707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0480350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18150730	18152862	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0481400-01;Parent=gene:OsNip_10g0481400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0481400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18152473	18152604	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0481400-01;Name=OsNip_10t0481400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0481400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18152738	18152862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0481400-01;Name=OsNip_10t0481400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0481400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18150877	18152860	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0481400-02;Name=OsNip_10t0481400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0481400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18271362	18271489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483500-01;Name=OsNip_10t0483500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0483500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18271615	18271875	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483500-01;Name=OsNip_10t0483500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0483500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18271955	18272217	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483500-01;Name=OsNip_10t0483500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0483500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18273843	18274200	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0483500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0483500-01;protein_id=OsNip_10t0483500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18274201	18274523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18281126	18281584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483700-00;Name=OsNip_10t0483700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0483700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	18285393	18285755	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0483800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18285393	18285755	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0483800-00;Parent=gene:OsNip_10g0483800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0483800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18285393	18285755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483800-00;Name=OsNip_10t0483800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0483800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18285393	18285755	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0483800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0483800-00;protein_id=OsNip_10t0483800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18285448	18286402	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0483900;biotype=protein_coding;description=Twin;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18285448	18285564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18285448	18286402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483900-01;Name=OsNip_10t0483900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0483900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18285565	18286173	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0483900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0483900-01;protein_id=OsNip_10t0483900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18286174	18286402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0483900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18297933	18300228	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0484300;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18297933	18300228	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0484300-01;Parent=gene:OsNip_10g0484300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0484300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18297933	18298216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;Name=OsNip_10t0484300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0484300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18297933	18298216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18298375	18298382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18298375	18300228	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;Name=OsNip_10t0484300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0484300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18298383	18300119	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0484300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;protein_id=OsNip_10t0484300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18300120	18300228	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18301439	18304745	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0484400;biotype=protein_coding;description=Ribosomal;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18301439	18304745	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0484400-02;Parent=gene:OsNip_10g0484400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0484400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18301439	18302291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18301439	18302327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;Name=OsNip_10t0484400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0484400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18302292	18302327	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0484400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;protein_id=OsNip_10t0484400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18303420	18304355	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0484400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;protein_id=OsNip_10t0484400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18303420	18304745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;Name=OsNip_10t0484400-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0484400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18304356	18304745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18311854	18314316	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0484700;biotype=protein_coding;description=Pyridoxal;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18311854	18314316	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0484700-01;Parent=gene:OsNip_10g0484700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0484700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18311854	18312096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18311854	18312348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;Name=OsNip_10t0484700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0484700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18312097	18312348	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0484700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;protein_id=OsNip_10t0484700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18312509	18312634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;Name=OsNip_10t0484700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0484700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18312509	18312634	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0484700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;protein_id=OsNip_10t0484700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18312727	18312881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484700-01;Name=OsNip_10t0484700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0484700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18317420	18318393	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0484800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0484800-01;protein_id=OsNip_10t0484800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18317420	18318605	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0484800-01;Name=OsNip_10t0484800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0484800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18321124	18331773	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0485000-01;Parent=gene:OsNip_10g0485000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0485000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18358016	18358152	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485500-01;protein_id=OsNip_10t0485500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18360484	18360612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18360689	18360865	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18360689	18360865	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18360963	18361076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18360963	18361076	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18361567	18361701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18361567	18361701	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18361867	18361934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18361867	18361934	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18362679	18362745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18362840	18362971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18362840	18362971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18363100	18363252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18363755	18363890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18364519	18364624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18364519	18364624	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18364719	18364911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18364719	18364911	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18364984	18365144	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18365408	18365623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18365913	18366178	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18366686	18366960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18367052	18367560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18367052	18367560	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18367653	18367750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18369154	18369362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18369154	18369362	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18369441	18369650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18369441	18369650	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18370078	18370554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E20;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18370078	18370554	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18370643	18370924	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E21;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E21;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18371091	18371417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;protein_id=OsNip_10t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18371602	18371688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E23;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E23;rank=23;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18371770	18371845	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485600-01;Name=OsNip_10t0485600-01-E24;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0485600-01-E24;rank=24;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18375417	18377323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18377855	18378132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0485800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18386865	18386895	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-02;Name=OsNip_10t0486000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0486000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18386865	18386895	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0486000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0486000-02;protein_id=OsNip_10t0486000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18388086	18388105	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0486000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0486000-02;protein_id=OsNip_10t0486000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18388086	18388186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-02;Name=OsNip_10t0486000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0486000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18388432	18389800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18386987	18387005	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-01;Name=OsNip_10t0486000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0486000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18389917	18390195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-03;Name=OsNip_10t0486000-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0486000-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18390004	18390195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18390367	18391287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-03;Name=OsNip_10t0486000-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0486000-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18390367	18391287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0486000-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18434672	18434725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487300-01;Name=OsNip_10t0487300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0487300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18437907	18438275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487300-01;Name=OsNip_10t0487300-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0487300-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18438792	18439054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18442315	18442388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18442315	18442357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18438808	18442146	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0487400-03;Parent=gene:OsNip_10g0487400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0487400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18438808	18439054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18441178	18441201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18441178	18442146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-03;Name=OsNip_10t0487400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0487400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18441202	18442116	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0487400-03;Parent=transcript:OsNip_10t0487400-03;protein_id=OsNip_10t0487400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18442117	18442146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	18474420	18474588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0487900-02;Tag=IsoSeq:G15108.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8971.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SVB7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18475042	18484780	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0488100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18475042	18484780	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0488100-01;Parent=gene:OsNip_10g0488100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0488100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18475042	18475146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18475042	18475325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488100-01;Name=OsNip_10t0488100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0488100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18475430	18475535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488100-01;Name=OsNip_10t0488100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0488100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18475430	18475535	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0488100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0488100-01;protein_id=OsNip_10t0488100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18535295	18535413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;Name=OsNip_10t0488800-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0488800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18538040	18538169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;Name=OsNip_10t0488800-02-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0488800-02-E9;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18538268	18538414	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0488800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;protein_id=OsNip_10t0488800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18538510	18538589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;Name=OsNip_10t0488800-02-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0488800-02-E11;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18538510	18538589	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0488800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;protein_id=OsNip_10t0488800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18538750	18539409	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0488800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;protein_id=OsNip_10t0488800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18538750	18539779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;Name=OsNip_10t0488800-01-E20;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0488800-01-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18539410	18539779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0488800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18549236	18549301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489100-01;Name=OsNip_10t0489100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0489100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18549437	18549505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489100-01;Name=OsNip_10t0489100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0489100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18558482	18559649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489200-01;Name=OsNip_10t0489200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0489200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18559646	18559649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18580507	18580739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18590061	18590580	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0489800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0489800-01;protein_id=OsNip_10t0489800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18590681	18590937	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0489800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0489800-01;protein_id=OsNip_10t0489800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18590681	18590938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489800-01;Name=OsNip_10t0489800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0489800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18590938	18590938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18591175	18595632	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0489900-01;Parent=gene:OsNip_10g0489900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0489900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18591175	18591347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489900-01;Name=OsNip_10t0489900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0489900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18591175	18591347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18592077	18592091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0489900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18621070	18621528	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0490400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0490400-00;protein_id=OsNip_10t0490400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18629290	18629394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0490534-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	18635437	18636123	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0490800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	18637489	18638521	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0490900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18637489	18637602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0490900-00;Name=OsNip_10t0490900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0490900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18637489	18637602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0490900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18638486	18638521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0490900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18640397	18641882	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0491000-01;Parent=gene:OsNip_10g0491000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18640397	18640416	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18640397	18640764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;Name=OsNip_10t0491000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18640417	18640764	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;protein_id=OsNip_10t0491000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18641395	18641736	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;protein_id=OsNip_10t0491000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18641395	18641882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;Name=OsNip_10t0491000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0491000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18641737	18641882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	18640396	18641880	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0491000-02;Parent=gene:OsNip_10g0491000;transcript_id=OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2
Chr10	TAMA	exon	18640396	18640483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;Name=OsNip_10t0491000-02;exon_id=OsNip_10t0491000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	18640398	18640483	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0491000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;protein_id=OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	18640589	18640764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;Name=OsNip_10t0491000-02;exon_id=OsNip_10t0491000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	18640589	18640764	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0491000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;protein_id=OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	18641395	18641880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;Name=OsNip_10t0491000-02;exon_id=OsNip_10t0491000-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	18641395	18641411	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0491000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;protein_id=OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	18640396	18640397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	18641415	18641880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491000-02;Tag=IsoSeq:G15114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6850.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5V6T3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18642323	18642324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18642323	18642445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Name=OsNip_10t0491100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18642445	18642445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18642571	18642742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Name=OsNip_10t0491100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18642571	18642742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18643220	18643325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Name=OsNip_10t0491100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18643220	18643325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18644574	18644861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Name=OsNip_10t0491100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18644574	18644861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18651725	18651945	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0491250;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18651725	18651945	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0491250-00;Parent=gene:OsNip_10g0491250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18651725	18651771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18651725	18651945	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491250-00;Name=OsNip_10t0491250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18651772	18651945	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491250-00;Parent=transcript:OsNip_10t0491250-00;protein_id=OsNip_10t0491250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18656488	18657276	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0491400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18656488	18657276	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0491400-01;Parent=gene:OsNip_10g0491400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18656488	18656548	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18656488	18656612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;Name=OsNip_10t0491400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18656549	18656612	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;protein_id=OsNip_10t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18656808	18656917	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0491400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;protein_id=OsNip_10t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18656808	18657276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;Name=OsNip_10t0491400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0491400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18656918	18657276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18657752	18658090	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0491450;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18657752	18658090	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0491450-00;Parent=gene:OsNip_10g0491450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18657752	18658090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491450-00;Name=OsNip_10t0491450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0491450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18657752	18658090	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0491450-00;Parent=transcript:OsNip_10t0491450-00;protein_id=OsNip_10t0491450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18666474	18667000	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0491801;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18666474	18667000	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0491801-00;Parent=gene:OsNip_10g0491801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18666474	18666505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18666474	18667000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491801-00;Name=OsNip_10t0491801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18666506	18666949	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0491801-00;Parent=transcript:OsNip_10t0491801-00;protein_id=OsNip_10t0491801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18666950	18667000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18667175	18669329	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0491900;biotype=protein_coding;description=D111/G-patch;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18667175	18669329	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0491900-01;Parent=gene:OsNip_10g0491900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18667175	18667269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18667175	18667305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Name=OsNip_10t0491900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0491900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18667270	18667305	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;protein_id=OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18667492	18667545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Name=OsNip_10t0491900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0491900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18667492	18667545	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;protein_id=OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18668490	18668609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Name=OsNip_10t0491900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0491900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18668490	18668609	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;protein_id=OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18669006	18669137	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0491900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;protein_id=OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18669006	18669329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Name=OsNip_10t0491900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0491900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18669138	18669329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0491900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18669611	18677726	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0492000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18670868	18676503	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0492000-01;Parent=gene:OsNip_10g0492000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18670868	18671498	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18670868	18671498	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0492000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;protein_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18671604	18671726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18671604	18671726	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0492000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;protein_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18671834	18671988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18671834	18671988	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0492000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;protein_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18672791	18673004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18672791	18673004	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0492000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;protein_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18674157	18674257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18674157	18674257	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0492000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;protein_id=OsNip_10t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18674342	18674466	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492000-01;Name=OsNip_10t0492000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0492000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18710246	18710310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492900-01;Name=OsNip_10t0492900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0492900-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18710246	18710310	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0492900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492900-01;protein_id=OsNip_10t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18710422	18710534	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0492900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0492900-01;protein_id=OsNip_10t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18710422	18710608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492900-01;Name=OsNip_10t0492900-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0492900-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18710535	18710608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	18707783	18707965	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0492900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0492900-02;protein_id=OsNip_10t0492900-02;Tag=IsoSeq:G15122.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11849.2;prot_id "UniRef90_A0A287FC68";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18740186	18740237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-01;Name=OsNip_10t0493600-03-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18740347	18740487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0493600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-01;protein_id=OsNip_10t0493600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18740576	18740913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-01;Name=OsNip_10t0493600-01-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0493600-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18740660	18740913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18733364	18733364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18733364	18733543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Name=OsNip_10t0493600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0493600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18735569	18735627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Name=OsNip_10t0493600-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18735569	18735627	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0493600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;protein_id=OsNip_10t0493600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18738208	18738264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Name=OsNip_10t0493600-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18738208	18738264	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0493600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;protein_id=OsNip_10t0493600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18738426	18738460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Name=OsNip_10t0493600-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18738798	18738901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;Name=OsNip_10t0493600-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18738798	18738901	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0493600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-02;protein_id=OsNip_10t0493600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18740347	18740487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0493600-03;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-03;protein_id=OsNip_10t0493600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18740576	18740659	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0493600-03;Parent=transcript:OsNip_10t0493600-03;protein_id=OsNip_10t0493600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18740576	18740916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-03;Name=OsNip_10t0493600-03-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0493600-03-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18740660	18740916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18739899	18739900	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0493600-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18787789	18787911	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0494300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494300-01;protein_id=OsNip_10t0494300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18788013	18788141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494300-01;Name=OsNip_10t0494300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0494300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18788013	18788141	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0494300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494300-01;protein_id=OsNip_10t0494300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18789940	18790307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494400-00;Name=OsNip_10t0494400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0494400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18790307	18790307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18794555	18794556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18794557	18794913	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0494500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;protein_id=OsNip_10t0494500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18796357	18796415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;Name=OsNip_10t0494500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0494500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18796357	18796415	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0494500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;protein_id=OsNip_10t0494500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18797223	18798309	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0494500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;protein_id=OsNip_10t0494500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18797223	18798458	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;Name=OsNip_10t0494500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0494500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18798310	18798458	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	18797682	18798466	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0494500-02;Parent=gene:OsNip_10g0494500;transcript_id=OsNip_10t0494500-02;Tag=IsoSeq:G15128.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6861.1
Chr10	TAMA	exon	18797682	18798466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-02;Name=OsNip_10t0494500-02;exon_id=OsNip_10t0494500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15128.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6861.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AX94";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	18798319	18798432	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0494500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0494500-02;protein_id=OsNip_10t0494500-02;Tag=IsoSeq:G15128.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6861.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AX94";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	18797682	18798318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-02;Tag=IsoSeq:G15128.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6861.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AX94";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	18798436	18798466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494500-02;Tag=IsoSeq:G15128.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6861.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AX94";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18798798	18805869	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0494800;Name=OsNip_KTN80a;biotype=protein_coding;description=Katanin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18798798	18805869	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0494800-01;Parent=gene:OsNip_10g0494800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18798798	18798984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18798798	18799063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Name=OsNip_10t0494800-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0494800-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18798985	18799063	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0494800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;protein_id=OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18799171	18799239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Name=OsNip_10t0494800-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0494800-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18799171	18799239	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0494800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;protein_id=OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18799348	18799464	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Name=OsNip_10t0494800-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0494800-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18799348	18799464	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0494800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;protein_id=OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18799534	18799649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Name=OsNip_10t0494800-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0494800-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18799534	18799649	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0494800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;protein_id=OsNip_10t0494800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18799730	18799804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0494800-01;Name=OsNip_10t0494800-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0494800-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18819141	18819320	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0495000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495000-01;protein_id=OsNip_10t0495000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18819141	18819650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495000-01;Name=OsNip_10t0495000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18819321	18819650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	18819620	18819671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495000-02;Name=OsNip_10t0495000-02;exon_id=OsNip_10t0495000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15130.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8980.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	18819620	18819652	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0495000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0495000-02;protein_id=OsNip_10t0495000-02;Tag=IsoSeq:G15130.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8980.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	18819656	18819671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495000-02;Tag=IsoSeq:G15130.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8980.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18817318	18817835	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495050-00;Parent=gene:OsNip_10g0495050;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0495050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18817318	18817835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495050-00;Name=OsNip_10t0495050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18821456	18825084	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0495075;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18821456	18825084	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0495075-00;Parent=gene:OsNip_10g0495075;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18821456	18821599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Name=OsNip_10t0495075-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495075-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18821456	18821599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18821809	18822001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Name=OsNip_10t0495075-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495075-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18821809	18822001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18823519	18824424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18823519	18825084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;Name=OsNip_10t0495075-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495075-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18824425	18825084	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0495075-00;Parent=transcript:OsNip_10t0495075-00;protein_id=OsNip_10t0495075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18823677	18825328	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0495100;Name=PPR454;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18823677	18825328	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495100-01;Parent=gene:OsNip_10g0495100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18823677	18823686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18823677	18825328	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495100-01;Name=OsNip_10t0495100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18823687	18825072	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495100-01;protein_id=OsNip_10t0495100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18825073	18825328	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18823689	18825272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495100-02;Parent=gene:OsNip_10g0495100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18823689	18825072	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0495100-02;protein_id=OsNip_10t0495100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18823689	18825272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495100-02;Name=OsNip_10t0495100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18825073	18825272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18832249	18836049	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0495200;Name=Rf4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18832249	18836049	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495200-01;Parent=gene:OsNip_10g0495200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18832249	18832534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;Name=OsNip_10t0495200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18832249	18832534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18833489	18833609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18833489	18836049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;Name=OsNip_10t0495200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18833610	18835958	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;protein_id=OsNip_10t0495200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18835959	18836049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18833387	18836046	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495200-02;Parent=gene:OsNip_10g0495200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18833387	18833609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18833387	18836046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-02;Name=OsNip_10t0495200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18833610	18835958	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0495200-02;protein_id=OsNip_10t0495200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18835959	18836046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18837746	18843204	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0495300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18837746	18839269	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495300-03;Parent=gene:OsNip_10g0495300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18837746	18837987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18837746	18838563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;Name=OsNip_10t0495300-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18837988	18838563	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-03;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;protein_id=OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18838679	18838782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;Name=OsNip_10t0495300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E7;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18838679	18838782	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0495300-03;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;protein_id=OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18839235	18839268	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-03;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;protein_id=OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18839235	18839269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;Name=OsNip_10t0495300-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0495300-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18839269	18839269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18837749	18843204	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0495300-01;Parent=gene:OsNip_10g0495300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18837749	18837987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18837749	18838563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18837988	18838563	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18838679	18838782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18838679	18838782	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18839235	18839283	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18839235	18839283	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18839561	18839701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18839561	18839701	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18840471	18840539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18840471	18840539	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18840630	18840719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18840630	18840719	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0495300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;protein_id=OsNip_10t0495300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18840883	18841833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0495300-01;Name=OsNip_10t0495300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0495300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18874530	18875014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496000-02;Name=OsNip_10t0496000-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0496000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18890230	18890477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18899005	18899115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18900575	18900661	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-02;Name=OsNip_10t0496900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0496900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18901860	18902391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-02;Name=OsNip_10t0496900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0496900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18903024	18903550	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0496900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0496900-02;protein_id=OsNip_10t0496900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18903024	18904022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-02;Name=OsNip_10t0496900-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0496900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18903551	18904022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18900302	18900373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18900302	18900436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Name=OsNip_10t0496900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0496900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18900575	18900778	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0496900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;protein_id=OsNip_10t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18900575	18902391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Name=OsNip_10t0496900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0496900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18900779	18902391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18903024	18904014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Name=OsNip_10t0496900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0496900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18903024	18904014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0496900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18906524	18915302	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0497000;biotype=protein_coding;description=Armadillo-type;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18906524	18915302	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0497000-01;Parent=gene:OsNip_10g0497000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0497000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18906524	18906873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18906524	18907355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497000-01;Name=OsNip_10t0497000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18906874	18907355	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0497000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497000-01;protein_id=OsNip_10t0497000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18908681	18908780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497000-01;Name=OsNip_10t0497000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0497000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18908681	18908780	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0497000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497000-01;protein_id=OsNip_10t0497000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18917429	18917614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Name=OsNip_10t0497100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0497100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18918225	18918631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Name=OsNip_10t0497100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0497100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18918979	18919080	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Name=OsNip_10t0497100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0497100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18919187	18919414	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0497100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;protein_id=OsNip_10t0497100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18919187	18919492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Name=OsNip_10t0497100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0497100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18919415	18919492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18920153	18920329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Name=OsNip_10t0497100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18920153	18920329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18933270	18933409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;Name=OsNip_10t0497200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0497200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18933270	18933409	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0497200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;protein_id=OsNip_10t0497200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18935885	18936464	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0497200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;protein_id=OsNip_10t0497200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18935885	18937434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;Name=OsNip_10t0497200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18936465	18937434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18937845	18938172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;Name=OsNip_10t0497200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18937845	18938172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	18935690	18942571	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0497300;Name=PPR794;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	18935690	18942571	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0497300-01;Parent=gene:OsNip_10g0497300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18935690	18935795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18935796	18938180	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0497300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;protein_id=OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18938181	18938272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18938681	18938780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Name=OsNip_10t0497300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18938681	18938780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18939135	18939468	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Name=OsNip_10t0497300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18939135	18939468	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18939655	18939859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Name=OsNip_10t0497300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18939655	18939859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18940442	18940570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18955637	18955720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497500-01;Name=OsNip_10t0497500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0497500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18956168	18957024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497500-01;Name=OsNip_10t0497500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0497500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18956228	18957024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18955769	18956297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497550-00;Name=OsNip_10t0497550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18970490	18970990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18971418	18971434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18971418	18972102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18971435	18972102	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0497600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;protein_id=OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18972195	18972299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18973474	18973596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18973474	18973596	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0497600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;protein_id=OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18973713	18973883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18973713	18973883	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0497600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;protein_id=OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	18974057	18974186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	18974439	18974648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;Name=OsNip_10t0497600-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0497600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	18974738	18974860	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0497600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0497600-01;protein_id=OsNip_10t0497600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18977275	18977468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0497750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19006815	19006923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498500-01;Tag=IsoSeq:G15144.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11866.2,Nipponbare.root_G8989.2;prot_id "UniRef90_A3C655";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19007525	19007759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498500-01;Tag=IsoSeq:G15144.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11866.2,Nipponbare.root_G8989.2;prot_id "UniRef90_A3C655";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19009701	19014274	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0498600-01;Parent=gene:OsNip_10g0498600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0498600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19009701	19010152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498600-01;Name=OsNip_10t0498600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0498600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19011072	19011098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19011072	19014274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498600-01;Name=OsNip_10t0498600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0498600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	19025002	19025417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498700-03;Name=OsNip_10t0498700-03;exon_id=OsNip_10t0498700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15146.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11868.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19025206	19025417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498700-03;Tag=IsoSeq:G15146.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11868.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19032408	19032452	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0498800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-01;protein_id=OsNip_10t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19033308	19033328	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0498800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-01;protein_id=OsNip_10t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19033308	19033542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-01;Name=OsNip_10t0498800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0498800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19033329	19033542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	19028127	19033511	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0498800-02;Parent=gene:OsNip_10g0498800;transcript_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1
Chr10	TAMA	exon	19028127	19028582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19028128	19028582	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19028673	19028757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19028673	19028757	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19029427	19029557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19029427	19029557	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19029658	19029760	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19029658	19029760	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19029905	19029919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19029905	19029919	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19030375	19030520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19030375	19030520	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19030643	19030838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19030643	19030838	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19030961	19031035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19030961	19031035	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19031764	19031880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19031764	19031880	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19032408	19032452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19032408	19032452	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19032972	19033070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E11;rank=11;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19032972	19033070	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	19033308	19033511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Name=OsNip_10t0498800-02;exon_id=OsNip_10t0498800-02-E12;rank=12;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	19033308	19033322	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0498800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;protein_id=OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19028127	19028127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19033326	19033511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498800-02;Tag=IsoSeq:G15147.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11869.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19033909	19036321	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0498900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19033909	19036321	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0498900-01;Parent=gene:OsNip_10g0498900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0498900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19033909	19034138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19033909	19034423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Name=OsNip_10t0498900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0498900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19034139	19034423	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0498900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;protein_id=OsNip_10t0498900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19034767	19034880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Name=OsNip_10t0498900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0498900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19034767	19034880	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0498900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;protein_id=OsNip_10t0498900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19034975	19035200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Name=OsNip_10t0498900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0498900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19034975	19035200	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0498900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;protein_id=OsNip_10t0498900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19035345	19035451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Name=OsNip_10t0498900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0498900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19035790	19035945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0498900-01;Name=OsNip_10t0498900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0498900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19045688	19046259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19053658	19056831	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0499400;biotype=protein_coding;description=Cystathionine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19054980	19055828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0499400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0499400-01;protein_id=OsNip_10t0499400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19054980	19056045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499400-01;Name=OsNip_10t0499400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0499400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19055829	19056045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19055003	19055184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499400-02;Tag=IsoSeq:G15150.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8993.8;prot_id "UniRef90_A0A2I0XFG1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19055491	19056831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499400-02;Tag=IsoSeq:G15150.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8993.8;prot_id "UniRef90_A0A2I0XFG1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19056887	19057027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499500-01;Name=OsNip_10t0499500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0499500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19057105	19057140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19057105	19059383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499500-01;Name=OsNip_10t0499500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0499500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19058662	19059383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19062859	19063134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19062860	19063134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19063539	19063585	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0499600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;protein_id=OsNip_10t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19064197	19064251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;Name=OsNip_10t0499600-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0499600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19064197	19064251	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0499600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;protein_id=OsNip_10t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19064326	19064352	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0499600-02;Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;protein_id=OsNip_10t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19064326	19064384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;Name=OsNip_10t0499600-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0499600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19064353	19064384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19067390	19067610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0499800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19079439	19079589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500300-00;Name=OsNip_10t0500300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0500300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19079677	19079743	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0500300-00;Parent=transcript:OsNip_10t0500300-00;protein_id=OsNip_10t0500300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19079851	19080085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500300-00;Name=OsNip_10t0500300-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0500300-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19081036	19081520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500300-00;Name=OsNip_10t0500300-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0500300-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19080875	19082278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500350-01;Name=OsNip_10t0500350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0500350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19082881	19083239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500400-01;Name=OsNip_10t0500400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0500400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19083194	19083239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19084294	19087629	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0500500-01;Parent=gene:OsNip_10g0500500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19084294	19084414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19085097	19085392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;Name=OsNip_10t0500500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0500500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19085097	19085392	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0500500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;protein_id=OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19085761	19085856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;Name=OsNip_10t0500500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0500500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19085761	19085856	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0500500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;protein_id=OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19086488	19086547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;Name=OsNip_10t0500500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0500500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19086488	19086547	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0500500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;protein_id=OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19087092	19087337	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0500500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0500500-01;protein_id=OsNip_10t0500500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19095305	19095662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500600-03;Tag=IsoSeq:G15153.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6869.1,Nipponbare.panicle_G11874.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8JY42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19100198	19100272	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0500700-02;Parent=transcript:OsNip_10t0500700-02;protein_id=OsNip_10t0500700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19100198	19100462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0500700-02;Name=OsNip_10t0500700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0500700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19104518	19105549	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501000-01;protein_id=OsNip_10t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19104518	19105701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501000-01;Name=OsNip_10t0501000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19108036	19108199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19108036	19108399	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501100-00;Name=OsNip_10t0501100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19108200	19108391	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0501100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0501100-00;protein_id=OsNip_10t0501100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19108392	19108399	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19108715	19110695	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0501200;Name=PPR9;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19108715	19110695	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0501200-00;Parent=gene:OsNip_10g0501200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19108715	19109362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501200-00;Name=OsNip_10t0501200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19108715	19109362	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0501200-00;protein_id=OsNip_10t0501200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19109455	19110687	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0501200-00;protein_id=OsNip_10t0501200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19109455	19110695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501200-00;Name=OsNip_10t0501200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19110688	19110695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19112236	19114168	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0501300;Name=PPR10;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19112236	19114168	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0501300-01;Parent=gene:OsNip_10g0501300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19112236	19112300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19112236	19112609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;Name=OsNip_10t0501300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19112301	19112609	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;protein_id=OsNip_10t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19112698	19113930	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;protein_id=OsNip_10t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19112698	19114168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;Name=OsNip_10t0501300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19113931	19114168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19115784	19116642	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0501401;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19115784	19116373	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0501401-02;Parent=gene:OsNip_10g0501401;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0501401-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19115784	19116227	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-02;Name=OsNip_10t0501401-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501401-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19116336	19116373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-02;Name=OsNip_10t0501401-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501401-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19115913	19116642	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0501401-01;Parent=gene:OsNip_10g0501401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19115913	19116129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19115913	19116162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;Name=OsNip_10t0501401-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501401-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19116130	19116162	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0501401-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;protein_id=OsNip_10t0501401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19116486	19116641	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0501401-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;protein_id=OsNip_10t0501401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19116486	19116642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;Name=OsNip_10t0501401-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19116642	19116642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19129876	19133349	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0501500;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19129876	19133349	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0501500-01;Parent=gene:OsNip_10g0501500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19129876	19130003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19129876	19130498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;Name=OsNip_10t0501500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0501500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19130004	19130498	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;protein_id=OsNip_10t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19132639	19133154	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0501500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;protein_id=OsNip_10t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19132639	19133349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;Name=OsNip_10t0501500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19133155	19133349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	19129877	19130907	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0501500-02;Parent=gene:OsNip_10g0501500;transcript_id=OsNip_10t0501500-02;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7
Chr10	TAMA	exon	19129877	19130498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;Name=OsNip_10t0501500-02;exon_id=OsNip_10t0501500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	19129878	19129973	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0501500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;protein_id=OsNip_10t0501500-02;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	19130781	19130907	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;Name=OsNip_10t0501500-02;exon_id=OsNip_10t0501500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19129877	19129877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19129977	19130498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19130781	19130907	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501500-02;Tag=IsoSeq:G15157.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11878.6,Nipponbare.root_G8997.7;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFB4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19142222	19143586	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0501700;Name=PPR11;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19142222	19143586	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0501700-00;Parent=gene:OsNip_10g0501700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19142222	19143586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501700-00;Name=OsNip_10t0501700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0501700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19142222	19143586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0501700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0501700-00;protein_id=OsNip_10t0501700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19146523	19148132	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0501900;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19146523	19148132	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0501900-01;Parent=gene:OsNip_10g0501900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0501900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19146523	19146606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0501900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19161934	19162398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0502400-01;Name=OsNip_10t0502400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0502400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19162172	19162398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0502400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19161925	19162190	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0502450-00;Name=OsNip_10t0502450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0502450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19200397	19200729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503100-01;Name=OsNip_10t0503100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0503100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19200532	19200729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19201583	19206797	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0503200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19201583	19206783	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0503200-01;Parent=gene:OsNip_10g0503200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0503200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19201583	19201895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19220955	19221061	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0503500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0503500-02;protein_id=OsNip_10t0503500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19221163	19221190	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0503500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0503500-02;protein_id=OsNip_10t0503500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19227838	19228173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503550-00;Name=OsNip_10t0503550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0503550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19230267	19233195	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0503600-01;Parent=gene:OsNip_10g0503600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0503600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19230267	19230533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19230678	19230753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19230678	19230753	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0503600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;protein_id=OsNip_10t0503600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19230848	19230973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19231070	19231137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19231070	19231137	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0503600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;protein_id=OsNip_10t0503600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19231264	19231347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19231450	19231498	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19231450	19231498	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0503600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;protein_id=OsNip_10t0503600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19231703	19231750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19232004	19232059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19232160	19232214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0503600-01;Name=OsNip_10t0503600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0503600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19335258	19335533	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0505700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0505700-01;protein_id=OsNip_10t0505700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19335534	19335615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	19335075	19335614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505700-02;Name=OsNip_10t0505700-02;exon_id=OsNip_10t0505700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15175.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11895.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7CIQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19335075	19335104	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505700-02;Tag=IsoSeq:G15175.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11895.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7CIQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19346334	19346395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19346571	19346882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;Name=OsNip_10t0505900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0505900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19346571	19346882	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0505900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;protein_id=OsNip_10t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19346984	19347856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;Name=OsNip_10t0505900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0505900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19346984	19347856	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0505900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;protein_id=OsNip_10t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19347968	19348059	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0505900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;protein_id=OsNip_10t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19347968	19348263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;Name=OsNip_10t0505900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0505900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19348060	19348263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19350042	19351774	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0506000;Name=PPR12;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19350042	19351774	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0506000-00;Parent=gene:OsNip_10g0506000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0506000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19350042	19350160	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19350042	19351774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506000-00;Name=OsNip_10t0506000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0506000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19350161	19351684	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506000-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506000-00;protein_id=OsNip_10t0506000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19351685	19351774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19352994	19354079	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0506100;biotype=protein_coding;description=Heavy;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19352996	19354079	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0506100-01;Parent=gene:OsNip_10g0506100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19352996	19353156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19352996	19353386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;Name=OsNip_10t0506100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0506100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19353157	19353386	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0506100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;protein_id=OsNip_10t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19353830	19354007	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0506100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;protein_id=OsNip_10t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19353830	19354079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;Name=OsNip_10t0506100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0506100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19354008	19354079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	19352994	19354079	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0506100-02;Parent=gene:OsNip_10g0506100;transcript_id=OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1
Chr10	TAMA	exon	19353999	19354079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Name=OsNip_10t0506100-02;exon_id=OsNip_10t0506100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	19353999	19354077	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0506100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;protein_id=OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	19353830	19353911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Name=OsNip_10t0506100-02;exon_id=OsNip_10t0506100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	19353871	19353911	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0506100-02;Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;protein_id=OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	19352994	19353386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Name=OsNip_10t0506100-02;exon_id=OsNip_10t0506100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19354078	19354079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19353830	19353868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19352994	19353386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506100-02;Tag=IsoSeq:G15176.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9007.1,Nipponbare.panicle_G11896.1,Nipponbare.leaf_G6879.1;prot_id "UniRef90_B9R9B5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19356762	19363202	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0506200;Name=OsNip_ValRS3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19356762	19363202	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0506200-00;Parent=gene:OsNip_10g0506200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19356762	19356839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19356762	19356839	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19356951	19357010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19356951	19357010	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19357084	19357253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19357084	19357253	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19357395	19357467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19357395	19357467	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19357627	19357692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19357627	19357692	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19357783	19357866	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19357783	19357866	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19358048	19358125	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;Name=OsNip_10t0506200-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506200-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19358048	19358125	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0506200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0506200-00;protein_id=OsNip_10t0506200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19381322	19382017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506900-01;Name=OsNip_10t0506900-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0506900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19380568	19380659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0506900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19414115	19414196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0507500-00;Name=OsNip_10t0507500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0507500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19414128	19414196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0507500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19415585	19418754	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0507600;biotype=protein_coding;description=PapD-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19415610	19418684	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0507600-01;Parent=gene:OsNip_10g0507600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19415610	19416005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19415610	19416008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0507600-01;Name=OsNip_10t0507600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0507600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	19512837	19512920	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508400-02;Name=OsNip_10t0508400-02;exon_id=OsNip_10t0508400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9010.1,Nipponbare.panicle_G11901.1,Nipponbare.root_G9010.2;prot_id "UniRef90_A0A2G5E2V7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	exon	19513803	19513958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508400-02;Name=OsNip_10t0508400-02;exon_id=OsNip_10t0508400-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9010.1,Nipponbare.panicle_G11901.1,Nipponbare.root_G9010.2;prot_id "UniRef90_A0A2G5E2V7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19532281	19532281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508700-02;Tag=IsoSeq:G15184.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9011.5,Nipponbare.leaf_G6884.4;prot_id "UniRef90_A0A4S4F1Z0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	19531452	19532230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508700-02;Tag=IsoSeq:G15184.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9011.5,Nipponbare.leaf_G6884.4;prot_id "UniRef90_A0A4S4F1Z0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19539636	19539955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19539636	19540530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508900-01;Name=OsNip_10t0508900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0508900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19540445	19540530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0508900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	19543841	19549093	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0509000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19543841	19549093	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0509000-01;Parent=gene:OsNip_10g0509000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0509000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	19543972	19544031	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0509000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0509000-01;protein_id=OsNip_10t0509000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19568394	19568655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0509200-01;Name=OsNip_10t0509200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0509200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19610377	19610598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0510000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19608763	19608824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0510050-00;Name=OsNip_10t0510050-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0510050-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19625691	19626084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0510400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19831923	19832152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0514425-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19832561	19832670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0514425-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19831925	19832723	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0514450-00;Parent=gene:OsNip_10g0514450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0514450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	19837750	19839400	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0514500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19838501	19839400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0514500-00;Name=OsNip_10t0514500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0514500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	19837874	19839387	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0514550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	19894841	19895970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516100-03;Tag=IsoSeq:G15204.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6895.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3HFL7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19895990	19896176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516150-00;Name=OsNip_10t0516150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0516150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	19896421	19896625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516150-00;Name=OsNip_10t0516150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0516150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	19899132	19900795	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0516200-00;Parent=gene:OsNip_10g0516200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0516200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19900393	19900795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516200-00;Name=OsNip_10t0516200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0516200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19900345	19900603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516250-00;Name=OsNip_10t0516250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0516250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	19908394	19913800	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0516300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19908715	19908790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516300-01;Name=OsNip_10t0516300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0516300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	19909886	19909961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516300-01;Name=OsNip_10t0516300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0516300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19911472	19911564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20011499	20011609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20011610	20011855	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0517800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0517800-01;protein_id=OsNip_10t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20011856	20011941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20022553	20023385	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0518000;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20022553	20023383	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0518000-00;Parent=gene:OsNip_10g0518000;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0518000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20022553	20022799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518000-00;Name=OsNip_10t0518000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20023277	20023383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518000-00;Name=OsNip_10t0518000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	20022553	20023385	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0518000-01;Parent=gene:OsNip_10g0518000;transcript_id=OsNip_10t0518000-01;Tag=IsoSeq:G15213.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9026.2
Chr10	TAMA	exon	20022553	20023385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518000-01;Name=OsNip_10t0518000-01;exon_id=OsNip_10t0518000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15213.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9026.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9TF14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	20023297	20023383	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0518000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518000-01;protein_id=OsNip_10t0518000-01;Tag=IsoSeq:G15213.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9026.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9TF14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20023384	20023385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518000-01;Tag=IsoSeq:G15213.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9026.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9TF14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20022553	20023294	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518000-01;Tag=IsoSeq:G15213.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9026.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9TF14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20024964	20028155	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0518100;biotype=protein_coding;description=RabGAP/TBC;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20024964	20028155	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0518100-01;Parent=gene:OsNip_10g0518100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20024964	20025088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20024964	20025243	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Name=OsNip_10t0518100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20025089	20025243	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0518100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;protein_id=OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20025349	20025484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Name=OsNip_10t0518100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0518100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20025349	20025484	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0518100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;protein_id=OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20025739	20025788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Name=OsNip_10t0518100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0518100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20026410	20026463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Name=OsNip_10t0518100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0518100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20026410	20026463	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0518100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;protein_id=OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20026697	20028062	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0518100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;protein_id=OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20026697	20028155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Name=OsNip_10t0518100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0518100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20028063	20028155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20028778	20029168	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0518150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20028778	20029168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518150-00;Name=OsNip_10t0518150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20028803	20031215	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0518200;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20028820	20029345	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0518200-01;Parent=gene:OsNip_10g0518200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20028820	20028918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20028820	20029169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;Name=OsNip_10t0518200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0518200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20028919	20029169	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0518200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;protein_id=OsNip_10t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20029281	20029344	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0518200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;protein_id=OsNip_10t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20029281	20029345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;Name=OsNip_10t0518200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20029345	20029345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	20028803	20031215	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0518200-02;Parent=gene:OsNip_10g0518200;transcript_id=OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7
Chr10	TAMA	exon	20031109	20031215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Name=OsNip_10t0518200-02;exon_id=OsNip_10t0518200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	20031109	20031214	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0518200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;protein_id=OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	exon	20030871	20030987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Name=OsNip_10t0518200-02;exon_id=OsNip_10t0518200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	20030871	20030987	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0518200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;protein_id=OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	exon	20029281	20029347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Name=OsNip_10t0518200-02;exon_id=OsNip_10t0518200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	CDS	20029346	20029347	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0518200-02;Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;protein_id=OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	exon	20028803	20029169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Name=OsNip_10t0518200-02;exon_id=OsNip_10t0518200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20031215	20031215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20029281	20029343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20028803	20029169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518200-02;Tag=IsoSeq:G15215.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11929.5,Nipponbare.root_G9028.7;prot_id "UniRef90_A0A2R6QPS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20031594	20037198	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0518300;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20031594	20037198	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0518300-01;Parent=gene:OsNip_10g0518300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20031594	20031745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20031594	20032011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;Name=OsNip_10t0518300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0518300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20031746	20032011	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0518300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;protein_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20032583	20032705	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;Name=OsNip_10t0518300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0518300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20032583	20032705	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0518300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;protein_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20032815	20032884	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;Name=OsNip_10t0518300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0518300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20032815	20032884	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0518300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;protein_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20033001	20033111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;Name=OsNip_10t0518300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0518300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20033001	20033111	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0518300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;protein_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20035734	20035769	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0518300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0518300-01;protein_id=OsNip_10t0518300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20094588	20094986	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519600-02;Name=OsNip_10t0519600-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0519600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20094629	20094986	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20093773	20093953	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519650-00;Name=OsNip_10t0519650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0519650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20094037	20094215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519650-00;Name=OsNip_10t0519650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0519650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20094343	20094504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519650-00;Name=OsNip_10t0519650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0519650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20095576	20096519	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0519700;biotype=protein_coding;description=Mitochondrial;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20095576	20096519	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0519700-01;Parent=gene:OsNip_10g0519700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0519700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20095576	20095826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20095576	20096519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519700-01;Name=OsNip_10t0519700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0519700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20096415	20096519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20096003	20096501	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0519750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0519750-00;protein_id=OsNip_10t0519750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20096502	20096560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20098367	20100033	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0519800-01;Parent=gene:OsNip_10g0519800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0519800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20098367	20098453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20098367	20100033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519800-01;Name=OsNip_10t0519800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0519800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20098454	20099773	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0519800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0519800-01;protein_id=OsNip_10t0519800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20099774	20100033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0519800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20108921	20110180	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0520100;Name=OsNip_Fbox559;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20108921	20108943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0520100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20108944	20110179	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0520100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0520100-00;protein_id=OsNip_10t0520100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20110180	20110180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0520100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20114954	20116072	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0520400;Name=OsNip__F0771;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20114954	20116072	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0520400-00;Parent=gene:OsNip_10g0520400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0520400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20114954	20114956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0520400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20114954	20116072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0520400-00;Name=OsNip_10t0520400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0520400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20114957	20116072	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0520400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0520400-00;protein_id=OsNip_10t0520400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20135412	20139742	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0520600;biotype=protein_coding;description=UBX;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20135412	20139736	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0520600-02;Parent=gene:OsNip_10g0520600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0520600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20135412	20135811	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0520600-02;Name=OsNip_10t0520600-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0520600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	20151697	20152254	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0520950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20152119	20152254	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0520950-00;Parent=transcript:OsNip_10t0520950-00;protein_id=OsNip_10t0520950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20154610	20159181	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0521000;Name=OsNip_TRE;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20154610	20159181	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0521000-01;Parent=gene:OsNip_10g0521000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0521000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20154610	20154961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521000-01;Name=OsNip_10t0521000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0521000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20183511	20183724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521550-00;Name=OsNip_10t0521550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0521550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20183718	20183724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20184525	20185186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521550-00;Name=OsNip_10t0521550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0521550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20184525	20185186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20185274	20189629	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0521600;Name=XBOS33;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20185274	20189629	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0521600-01;Parent=gene:OsNip_10g0521600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0521600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20186835	20186926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20188052	20188216	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0521600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;protein_id=OsNip_10t0521600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20188607	20188678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;Name=OsNip_10t0521600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0521600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20188607	20188678	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0521600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;protein_id=OsNip_10t0521600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20189246	20189629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;Name=OsNip_10t0521600-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0521600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20189423	20189629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20186050	20186188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0521600-02;Name=OsNip_10t0521600-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0521600-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20214151	20214302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522000-01;Name=OsNip_10t0522000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20214247	20214302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20257330	20257443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522500-03;Tag=IsoSeq:G15232.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6905.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20257694	20257750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522500-03;Tag=IsoSeq:G15232.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6905.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20263310	20263393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Name=OsNip_10t0522601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20263310	20263393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20263496	20263621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Name=OsNip_10t0522601-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522601-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20263496	20263621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20265644	20265678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20265644	20267568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Name=OsNip_10t0522601-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522601-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20265679	20267361	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0522601-01;Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;protein_id=OsNip_10t0522601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20267362	20267568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	20265600	20267624	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0522601-02;Parent=gene:OsNip_10g0522601;transcript_id=OsNip_10t0522601-02;Tag=IsoSeq:G15233.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11942.4,Nipponbare.root_G9039.2
Chr10	TAMA	exon	20265600	20267624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-02;Name=OsNip_10t0522601-02;exon_id=OsNip_10t0522601-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15233.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11942.4,Nipponbare.root_G9039.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9KDJ7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	20267457	20267504	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0522601-02;Parent=transcript:OsNip_10t0522601-02;protein_id=OsNip_10t0522601-02;Tag=IsoSeq:G15233.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11942.4,Nipponbare.root_G9039.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9KDJ7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20265600	20267456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-02;Tag=IsoSeq:G15233.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11942.4,Nipponbare.root_G9039.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9KDJ7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20267508	20267624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522601-02;Tag=IsoSeq:G15233.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11942.4,Nipponbare.root_G9039.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9KDJ7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20271867	20272423	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0522700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20271867	20272423	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0522700-01;Parent=gene:OsNip_10g0522700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20271867	20272169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20271867	20272423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522700-01;Name=OsNip_10t0522700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20272170	20272355	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0522700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0522700-01;protein_id=OsNip_10t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20272356	20272423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20278007	20278573	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0522800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20278007	20278573	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0522800-01;Parent=gene:OsNip_10g0522800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20278007	20278293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20278007	20278573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522800-01;Name=OsNip_10t0522800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20278294	20278485	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0522800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0522800-01;protein_id=OsNip_10t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20278486	20278573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20281431	20285006	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0522900;biotype=protein_coding;description=Isopenicillin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20281431	20285006	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0522900-01;Parent=gene:OsNip_10g0522900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0522900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20281431	20281512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20281431	20281605	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522900-01;Name=OsNip_10t0522900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0522900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20281513	20281605	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0522900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0522900-01;protein_id=OsNip_10t0522900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20281716	20281908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0522900-01;Name=OsNip_10t0522900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0522900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20281716	20281908	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0522900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0522900-01;protein_id=OsNip_10t0522900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20383617	20383733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0524400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0524400-01;protein_id=OsNip_10t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20384151	20386096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0524400-01;Name=OsNip_10t0524400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0524400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20385711	20386096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20489218	20489877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527400-01;Name=OsNip_10t0527400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0527400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20493427	20494200	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0527601-00;Parent=transcript:OsNip_10t0527601-00;protein_id=OsNip_10t0527601-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	20493334	20493753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527601-01;Name=OsNip_10t0527601-01;exon_id=OsNip_10t0527601-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9053.1;prot_id "UniRef90_I7FHT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	20493832	20494344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527601-01;Name=OsNip_10t0527601-01;exon_id=OsNip_10t0527601-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9053.1;prot_id "UniRef90_I7FHT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20493334	20493753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527601-01;Tag=IsoSeq:G15256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9053.1;prot_id "UniRef90_I7FHT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	20493832	20494206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527601-01;Tag=IsoSeq:G15256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9053.1;prot_id "UniRef90_I7FHT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20494315	20494344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527601-01;Tag=IsoSeq:G15256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9053.1;prot_id "UniRef90_I7FHT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20498004	20499096	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0527800;Name=OsNip_GSTU12;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20498004	20499096	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0527800-01;Parent=gene:OsNip_10g0527800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0527800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20498004	20498090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20498004	20498417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;Name=OsNip_10t0527800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0527800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20498091	20498417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0527800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;protein_id=OsNip_10t0527800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20498524	20498898	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0527800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;protein_id=OsNip_10t0527800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20498524	20499096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;Name=OsNip_10t0527800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0527800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20498899	20499096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20537710	20540484	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0527900;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20537710	20540484	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0527900-01;Parent=gene:OsNip_10g0527900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20537710	20538180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20537710	20539037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527900-01;Name=OsNip_10t0527900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0527900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20538181	20539037	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0527900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0527900-01;protein_id=OsNip_10t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20539107	20540484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0527900-01;Name=OsNip_10t0527900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0527900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20539107	20540484	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0527900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0527900-01;protein_id=OsNip_10t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20551209	20552361	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0528100;Name=OsNip_GSTU24;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20551209	20552361	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0528100-01;Parent=gene:OsNip_10g0528100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0528100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20551209	20551284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20551209	20551611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;Name=OsNip_10t0528100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0528100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20551285	20551611	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0528100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;protein_id=OsNip_10t0528100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20551699	20552070	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0528100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;protein_id=OsNip_10t0528100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20551699	20552361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;Name=OsNip_10t0528100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0528100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20552071	20552361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20553611	20554584	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0528150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20553611	20554584	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0528150-01;Parent=gene:OsNip_10g0528150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0528150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20553611	20554124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20553611	20554584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528150-01;Name=OsNip_10t0528150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0528150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20554125	20554550	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0528150-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528150-01;protein_id=OsNip_10t0528150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20554551	20554584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20553664	20554715	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0528200;Name=GST;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20553664	20554715	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0528200-01;Parent=gene:OsNip_10g0528200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20553664	20553707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20553664	20554034	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;Name=OsNip_10t0528200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0528200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20553708	20554034	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0528200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;protein_id=OsNip_10t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20554162	20554542	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0528200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;protein_id=OsNip_10t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20554162	20554715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;Name=OsNip_10t0528200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0528200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20554543	20554715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	20556396	20557613	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0528300;Name=OsNip_GSTU4;biotype=protein_coding;description=Tau;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20556396	20557613	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0528300-01;Parent=gene:OsNip_10g0528300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20556396	20556474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20556475	20556807	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0528300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0528300-01;protein_id=OsNip_10t0528300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20597016	20599106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0529600-01;Name=OsNip_10t0529600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0529600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20629110	20629644	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0530750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0530750-00;protein_id=OsNip_10t0530750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20631706	20631834	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0530750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0530750-00;protein_id=OsNip_10t0530750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20683355	20685553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532100-01;Name=OsNip_10t0532100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0532100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20702195	20703525	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0532300-01;Parent=gene:OsNip_10g0532300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0532300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20702195	20702444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20703376	20703525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532300-01;Name=OsNip_10t0532300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0532300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20715400	20715564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20719171	20720997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-02;Name=OsNip_10t0532800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0532800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20719171	20720997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20722476	20722511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20722476	20722861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-02;Name=OsNip_10t0532800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0532800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20722737	20722861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20720597	20722511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20720597	20722927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0532800-01;Name=OsNip_10t0532800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0532800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20725051	20725107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0533000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20756339	20756513	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0533701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20783296	20783590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0534100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20779640	20779849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0534100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20779640	20779920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0534100-02;Name=OsNip_10t0534100-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0534100-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20837435	20837731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20838541	20838911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535600-01;Name=OsNip_10t0535600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0535600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20838890	20838911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	20838541	20838916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535600-02;Name=OsNip_10t0535600-02;exon_id=OsNip_10t0535600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15287.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9070.1;prot_id "UniRef90_A0A446TP12";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	20837432	20837735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535600-02;Tag=IsoSeq:G15287.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9070.1;prot_id "UniRef90_A0A446TP12";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20843118	20843184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20843118	20843287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;Name=OsNip_10t0535800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0535800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20843185	20843287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0535800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;protein_id=OsNip_10t0535800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20843384	20843405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;Name=OsNip_10t0535800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0535800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20843384	20843405	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0535800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;protein_id=OsNip_10t0535800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20843518	20843574	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0535800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;protein_id=OsNip_10t0535800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20843878	20843959	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0535800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0535800-01;protein_id=OsNip_10t0535800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20870419	20870497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0536100-01;Name=OsNip_10t0536100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0536100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20872224	20872285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0536100-01;Name=OsNip_10t0536100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0536100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20872224	20872285	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0536100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0536100-01;protein_id=OsNip_10t0536100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20872385	20872484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0536100-01;Name=OsNip_10t0536100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0536100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20890567	20890628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0536450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20890567	20890914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0536450-00;Name=OsNip_10t0536450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0536450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20916158	20916160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20917100	20917158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	20929638	20934582	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0537300-01;Parent=gene:OsNip_10g0537300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20929638	20929854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	20931101	20931272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;Name=OsNip_10t0537300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0537300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20931101	20931272	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0537300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;protein_id=OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20931737	20933307	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0537300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;protein_id=OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	20934254	20934548	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0537300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;protein_id=OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	20934254	20934582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;Name=OsNip_10t0537300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0537300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20934549	20934582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0537300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21051784	21052560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21051466	21051653	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0539900-04;Parent=transcript:OsNip_10t0539900-04;protein_id=OsNip_10t0539900-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21051752	21052514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539900-04;Name=OsNip_10t0539900-04-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0539900-04-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21052188	21052514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539900-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21048688	21048807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Name=OsNip_10t0539950-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0539950-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21048688	21048807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21049202	21049733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Name=OsNip_10t0539950-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0539950-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21049202	21049733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21049858	21050092	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21050093	21050250	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0539950-00;Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;protein_id=OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21050348	21050546	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0539950-00;Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;protein_id=OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21050348	21050804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Name=OsNip_10t0539950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0539950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21050547	21050804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21051449	21051698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21051793	21052152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0539950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21055257	21056387	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0540000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21055287	21056361	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0540000-01;Parent=gene:OsNip_10g0540000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0540000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21055287	21055438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21055287	21055612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-01;Name=OsNip_10t0540000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21056244	21056360	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0540000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540000-01;protein_id=OsNip_10t0540000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21056244	21056361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-01;Name=OsNip_10t0540000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21056361	21056361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	21055257	21056387	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-02;Name=OsNip_10t0540000-02;exon_id=OsNip_10t0540000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15305.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11987.1;prot_id "UniRef90_A0A444EMG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	CDS	21056013	21056387	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0540000-02;Parent=transcript:OsNip_10t0540000-02;protein_id=OsNip_10t0540000-02;Tag=IsoSeq:G15305.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11987.1;prot_id "UniRef90_A0A444EMG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21055257	21056010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540000-02;Tag=IsoSeq:G15305.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11987.1;prot_id "UniRef90_A0A444EMG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21055352	21056227	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0540050;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21055352	21056227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540050-00;Name=OsNip_10t0540050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21055352	21056227	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540050-00;Parent=transcript:OsNip_10t0540050-00;protein_id=OsNip_10t0540050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21058117	21061300	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0540100;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21058117	21061300	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0540100-01;Parent=gene:OsNip_10g0540100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21058117	21058510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Name=OsNip_10t0540100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21058117	21058510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21058624	21059103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Name=OsNip_10t0540100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21058624	21059103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21059230	21059234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21059230	21061300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Name=OsNip_10t0540100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21059235	21061280	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0540100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;protein_id=OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21061281	21061300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21059208	21064578	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0540200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21059208	21064578	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0540200-01;Parent=gene:OsNip_10g0540200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21059208	21059216	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21059208	21059486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Name=OsNip_10t0540200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21059217	21059486	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;protein_id=OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21059711	21059875	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;protein_id=OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21059711	21061330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Name=OsNip_10t0540200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21059876	21061330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21061504	21061594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Name=OsNip_10t0540200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21061504	21061594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21064271	21064578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Name=OsNip_10t0540200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21064271	21064578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21065233	21065655	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0540250;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21065233	21065655	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0540250-01;Parent=gene:OsNip_10g0540250;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0540250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21065233	21065655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540250-01;Name=OsNip_10t0540250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21066730	21074892	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0540300;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21066730	21074774	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0540300-01;Parent=gene:OsNip_10g0540300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21066730	21069095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21066730	21069211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21069096	21069211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21071818	21071874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21071818	21071874	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21073305	21073370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21073305	21073370	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21073869	21074100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21073869	21074100	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21074207	21074411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21074207	21074411	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21074509	21074615	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;protein_id=OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21074509	21074774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Name=OsNip_10t0540300-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0540300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21074616	21074774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21068907	21074892	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0540300-02;Parent=gene:OsNip_10g0540300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0540300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21068907	21069095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21068907	21069211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;Name=OsNip_10t0540300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21069096	21069211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540300-02;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;protein_id=OsNip_10t0540300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21071818	21071874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;Name=OsNip_10t0540300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21071818	21071874	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0540300-02;Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;protein_id=OsNip_10t0540300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21073305	21073370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;Name=OsNip_10t0540300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21073869	21074100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540300-02;Name=OsNip_10t0540300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0540300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21091977	21092312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21092599	21092696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21092599	21092710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540800-01;Name=OsNip_10t0540800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0540800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21095286	21095373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540800-01;Name=OsNip_10t0540800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21095886	21096272	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0540800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540800-01;protein_id=OsNip_10t0540800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21108321	21108549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540900-01;Name=OsNip_10t0540900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0540900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21108647	21108753	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0540900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0540900-01;protein_id=OsNip_10t0540900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21108647	21108901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540900-01;Name=OsNip_10t0540900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0540900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21108754	21108901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0540900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	21154175	21155750	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0541700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21154678	21155613	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0541700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0541700-00;protein_id=OsNip_10t0541700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21155614	21155750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21155488	21156975	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0541800;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21156207	21156975	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0541800-01;Parent=gene:OsNip_10g0541800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0541800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21156207	21156975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541800-01;Name=OsNip_10t0541800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0541800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	21155488	21156975	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0541800-02;Parent=gene:OsNip_10g0541800;transcript_id=OsNip_10t0541800-02;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1
Chr10	TAMA	exon	21155938	21156975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541800-02;Name=OsNip_10t0541800-02;exon_id=OsNip_10t0541800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	CDS	21156601	21156975	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0541800-02;Parent=transcript:OsNip_10t0541800-02;protein_id=OsNip_10t0541800-02;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	exon	21155488	21155807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541800-02;Name=OsNip_10t0541800-02;exon_id=OsNip_10t0541800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21155938	21156598	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541800-02;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21155488	21155807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0541800-02;Tag=IsoSeq:G15309.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9084.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21168491	21169227	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0542100;Name=OsNip_MT4;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21168491	21169227	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0542100-01;Parent=gene:OsNip_10g0542100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21168491	21168543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21168491	21168602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;Name=OsNip_10t0542100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0542100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21168544	21168602	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0542100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;protein_id=OsNip_10t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21168689	21168893	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0542100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;protein_id=OsNip_10t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21168689	21169227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;Name=OsNip_10t0542100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0542100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21168894	21169227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21169711	21174539	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0542200;biotype=protein_coding;description=Ubiquilin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21169711	21172191	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0542200-03;Parent=gene:OsNip_10g0542200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21169711	21169972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21169711	21170121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21169973	21170121	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21170196	21170288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21170196	21170288	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21171080	21171108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21171080	21171108	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21171213	21171271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21171213	21171271	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21171344	21171457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21171344	21171457	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21171548	21171837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21171548	21171837	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21171915	21172191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;Name=OsNip_10t0542200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21171915	21172191	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0542200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0542200-03;protein_id=OsNip_10t0542200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21169734	21174539	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0542200-01;Parent=gene:OsNip_10g0542200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0542200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21169734	21169972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180083	21180192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-01;Name=OsNip_10t0542400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180310	21180491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-01;Name=OsNip_10t0542400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21181169	21181282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21179719	21179803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21179719	21179954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Name=OsNip_10t0542400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0542400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180083	21180192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Name=OsNip_10t0542400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21180083	21180192	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0542400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;protein_id=OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180310	21180491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Name=OsNip_10t0542400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21180310	21180491	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0542400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;protein_id=OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180695	21180830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Name=OsNip_10t0542400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0542400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21180695	21180830	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0542400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;protein_id=OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21180920	21181168	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0542400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;protein_id=OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21180920	21181277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Name=OsNip_10t0542400-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0542400-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21181169	21181277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21179877	21181168	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0542550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21179877	21181168	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0542550-00;Parent=gene:OsNip_10g0542550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0542550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21179877	21180185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542550-00;Name=OsNip_10t0542550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21204317	21204782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21205700	21205724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21205725	21206025	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0542900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;protein_id=OsNip_10t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21206115	21206226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;Name=OsNip_10t0542900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0542900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21206115	21206226	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0542900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;protein_id=OsNip_10t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21206978	21207350	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0542900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;protein_id=OsNip_10t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21206978	21207611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;Name=OsNip_10t0542900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0542900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21207351	21207611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	21205700	21207487	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0542900-02;Parent=gene:OsNip_10g0542900;transcript_id=OsNip_10t0542900-02;Tag=IsoSeq:G15314.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6953.3
Chr10	TAMA	exon	21205700	21207487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-02;Name=OsNip_10t0542900-02;exon_id=OsNip_10t0542900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15314.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6953.3;prot_id "UniRef90_M7YX83";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	21206295	21206456	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0542900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0542900-02;protein_id=OsNip_10t0542900-02;Tag=IsoSeq:G15314.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6953.3;prot_id "UniRef90_M7YX83";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	21205700	21206294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-02;Tag=IsoSeq:G15314.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6953.3;prot_id "UniRef90_M7YX83";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21206460	21207487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0542900-02;Tag=IsoSeq:G15314.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6953.3;prot_id "UniRef90_M7YX83";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21208961	21209371	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0543150;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21208961	21209371	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0543150-00;Parent=gene:OsNip_10g0543150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0543150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21208961	21209371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543150-00;Name=OsNip_10t0543150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0543150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21208961	21209371	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0543150-00;Parent=transcript:OsNip_10t0543150-00;protein_id=OsNip_10t0543150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21219598	21221819	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0543400;biotype=protein_coding;description=Chitinase;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21219598	21221819	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0543400-00;Parent=gene:OsNip_10g0543400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0543400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21219598	21219898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543400-00;Name=OsNip_10t0543400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0543400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21219598	21219898	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0543400-00;Parent=transcript:OsNip_10t0543400-00;protein_id=OsNip_10t0543400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21219988	21220099	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543400-00;Name=OsNip_10t0543400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0543400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21221705	21221819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543400-00;Name=OsNip_10t0543400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0543400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21232844	21233093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543800-00;Name=OsNip_10t0543800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0543800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21232997	21233093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21244725	21245032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21244725	21245125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544200-01;Name=OsNip_10t0544200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21245550	21245720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544200-01;Name=OsNip_10t0544200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21246070	21246276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544200-01;Name=OsNip_10t0544200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21253585	21253781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-01;Name=OsNip_10t0544500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0544500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21256130	21256452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-01;Name=OsNip_10t0544500-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21256397	21256452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21254536	21254536	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21254696	21254839	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0544500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;protein_id=OsNip_10t0544500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21254949	21255668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;Name=OsNip_10t0544500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544500-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21254949	21255668	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0544500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;protein_id=OsNip_10t0544500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21256130	21256396	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0544500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;protein_id=OsNip_10t0544500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21256130	21256612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;Name=OsNip_10t0544500-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544500-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21256397	21256612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21271714	21276797	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0544600;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21295722	21295958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-01;Name=OsNip_10t0544900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21295722	21295958	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0544900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0544900-01;protein_id=OsNip_10t0544900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21296892	21297143	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0544900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0544900-01;protein_id=OsNip_10t0544900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21296892	21297479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-01;Name=OsNip_10t0544900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0544900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21297144	21297479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	21293446	21295323	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0544900-02;Parent=gene:OsNip_10g0544900;transcript_id=OsNip_10t0544900-02;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2
Chr10	TAMA	exon	21293446	21293550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Name=OsNip_10t0544900-02;exon_id=OsNip_10t0544900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	21293693	21294106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Name=OsNip_10t0544900-02;exon_id=OsNip_10t0544900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	CDS	21293775	21294038	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0544900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;protein_id=OsNip_10t0544900-02;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	exon	21294636	21295323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Name=OsNip_10t0544900-02;exon_id=OsNip_10t0544900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	21293693	21293774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21294042	21294106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21294636	21295323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544900-02;Tag=IsoSeq:G15321.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9093.2;prot_id "UniRef90_A0A2I6PC74";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21296889	21297143	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0544933;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21296889	21297143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0544933-00;Parent=gene:OsNip_10g0544933;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0544933-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21296889	21297143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0544933-00;Name=OsNip_10t0544933-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0544933-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21298681	21301755	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0544966;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21298681	21301755	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0544966-00;Parent=gene:OsNip_10g0544966;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0544966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21314368	21314595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545300-01;Name=OsNip_10t0545300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0545300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21321636	21322000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545500-00;Name=OsNip_10t0545500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0545500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21322000	21322000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	21320176	21322365	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0545500-01;Parent=gene:OsNip_10g0545500;transcript_id=OsNip_10t0545500-01;Tag=IsoSeq:G15327.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12005.1
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Chr10	TAMA	CDS	21320384	21320473	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0545500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0545500-01;protein_id=OsNip_10t0545500-01;Tag=IsoSeq:G15327.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12005.1;prot_id "UniRef90_C5WMQ4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	CDS	21321636	21322048	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0545500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0545500-01;protein_id=OsNip_10t0545500-01;Tag=IsoSeq:G15327.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12005.1;prot_id "UniRef90_C5WMQ4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	21320176	21320383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545500-01;Tag=IsoSeq:G15327.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12005.1;prot_id "UniRef90_C5WMQ4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21322052	21322365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545500-01;Tag=IsoSeq:G15327.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12005.1;prot_id "UniRef90_C5WMQ4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21323071	21327370	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0545600-00;Parent=gene:OsNip_10g0545600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21323071	21323166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21323071	21323668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;Name=OsNip_10t0545600-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0545600-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21323167	21323668	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0545600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;protein_id=OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21323753	21323934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;Name=OsNip_10t0545600-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0545600-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21323753	21323934	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0545600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;protein_id=OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21324024	21324086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;Name=OsNip_10t0545600-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0545600-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21324024	21324086	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0545600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;protein_id=OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21324542	21324584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;Name=OsNip_10t0545600-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0545600-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21324542	21324584	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0545600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0545600-00;protein_id=OsNip_10t0545600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21331601	21332404	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0545800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0545800-01;protein_id=OsNip_10t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21332405	21332653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21338222	21339608	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0546100;biotype=protein_coding;description=Pollen;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21338222	21339608	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0546100-01;Parent=gene:OsNip_10g0546100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0546100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21338222	21338308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21338222	21338489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546100-01;Name=OsNip_10t0546100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0546100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21338309	21338489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0546100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0546100-01;protein_id=OsNip_10t0546100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21339102	21339427	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0546100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0546100-01;protein_id=OsNip_10t0546100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21360059	21360497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21360059	21360924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546400-01;Name=OsNip_10t0546400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0546400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21360885	21360924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21368383	21373295	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0546600;Name=CYP97C2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21368384	21373100	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0546600-01;Parent=gene:OsNip_10g0546600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21370390	21370587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Name=OsNip_10t0546600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0546600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21370923	21371024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Name=OsNip_10t0546600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0546600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21371135	21371275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Name=OsNip_10t0546600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0546600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21371135	21371275	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0546600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;protein_id=OsNip_10t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21371346	21371453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Name=OsNip_10t0546600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0546600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21372811	21372869	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0546600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;protein_id=OsNip_10t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21373002	21373014	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0546600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;protein_id=OsNip_10t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21373002	21373100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Name=OsNip_10t0546600-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0546600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21373015	21373100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21489490	21489544	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0549100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0549100-01;protein_id=OsNip_10t0549100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21489490	21489552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549100-01;Name=OsNip_10t0549100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0549100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21521187	21521215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21521458	21521589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Name=OsNip_10t0549500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21521458	21521589	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0549500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;protein_id=OsNip_10t0549500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21522369	21522485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Name=OsNip_10t0549500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21522369	21522485	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0549500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;protein_id=OsNip_10t0549500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21523587	21523682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Name=OsNip_10t0549500-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549500-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21524095	21524207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Name=OsNip_10t0549500-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549500-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21524095	21524207	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0549500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;protein_id=OsNip_10t0549500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21524765	21524885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;Name=OsNip_10t0549500-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0549500-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21524765	21524885	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0549500-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549500-00;protein_id=OsNip_10t0549500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21526018	21533893	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0549550;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21526018	21526218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;Name=OsNip_10t0549550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21526018	21526218	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0549550-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;protein_id=OsNip_10t0549550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21526349	21526437	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;Name=OsNip_10t0549550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21526349	21526437	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0549550-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;protein_id=OsNip_10t0549550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21533692	21533893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;Name=OsNip_10t0549550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0549550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21533692	21533893	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0549550-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549550-00;protein_id=OsNip_10t0549550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21529713	21529848	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0549600;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21529713	21529848	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0549600-00;Parent=gene:OsNip_10g0549600;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0549600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21529713	21529848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549600-00;Name=OsNip_10t0549600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0549600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21530321	21530619	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0549650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21530321	21530619	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0549650-00;Parent=gene:OsNip_10g0549650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0549650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21530321	21530619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0549650-00;Name=OsNip_10t0549650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0549650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21530321	21530619	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0549650-00;Parent=transcript:OsNip_10t0549650-00;protein_id=OsNip_10t0549650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21543495	21547308	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0549700;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21561969	21562209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550000-02;Tag=IsoSeq:G15342.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12016.2,Nipponbare.panicle_G12016.1;prot_id "UniRef90_M8ABP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21562336	21563386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550000-02;Tag=IsoSeq:G15342.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12016.2,Nipponbare.panicle_G12016.1;prot_id "UniRef90_M8ABP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21561764	21562891	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550033-00;Name=OsNip_10t0550033-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0550033-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21584815	21585007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21593924	21594176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21594279	21599492	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0550500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21618337	21618873	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0550900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0550900-01;protein_id=OsNip_10t0550900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21619309	21620195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0550900-01;Name=OsNip_10t0550900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0550900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21619309	21620195	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0550900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0550900-01;protein_id=OsNip_10t0550900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21620324	21620372	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0550900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0550900-01;protein_id=OsNip_10t0550900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21636807	21637002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21635944	21637451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21637523	21637934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21652033	21652107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21652033	21652245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Name=OsNip_10t0551600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0551600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21652108	21652245	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0551600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;protein_id=OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21652376	21652462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Name=OsNip_10t0551600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0551600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21652376	21652462	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0551600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;protein_id=OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21652549	21652644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Name=OsNip_10t0551600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0551600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21652549	21652644	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0551600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;protein_id=OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21654674	21654730	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0551600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;protein_id=OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21654674	21654992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Name=OsNip_10t0551600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0551600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21654731	21654992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21655489	21656252	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0551700;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21655489	21656252	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0551700-01;Parent=gene:OsNip_10g0551700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0551700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21655489	21655684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21655489	21656252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551700-01;Name=OsNip_10t0551700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0551700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21655685	21656173	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0551700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551700-01;protein_id=OsNip_10t0551700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21656174	21656252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21658192	21658818	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0551800;Name=RCc2;biotype=protein_coding;description=Root-specific;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21658192	21658818	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0551800-00;Parent=gene:OsNip_10g0551800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0551800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21658192	21658347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21658192	21658818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551800-00;Name=OsNip_10t0551800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0551800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21658348	21658788	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0551800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0551800-00;protein_id=OsNip_10t0551800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21658789	21658818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21662454	21663219	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0551900;Name=OsNip_HyPRP14;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21662454	21663219	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0551900-01;Parent=gene:OsNip_10g0551900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0551900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21662454	21662714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21662454	21663219	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551900-01;Name=OsNip_10t0551900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0551900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21662715	21663143	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0551900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0551900-01;protein_id=OsNip_10t0551900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21663144	21663219	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0551900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21670510	21671244	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0552200;Name=OsNip_HyPRP16;biotype=protein_coding;description=Plant;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21670510	21671244	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0552200-01;Parent=gene:OsNip_10g0552200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0552200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21670510	21670756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0552200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21670510	21671244	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0552200-01;Name=OsNip_10t0552200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0552200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	21786479	21787046	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0554800-02;Tag=IsoSeq:G15361.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9114.1,Nipponbare.panicle_G12028.1;prot_id "UniRef90_K3YDI9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21789187	21789423	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0554900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0554900-02;protein_id=OsNip_10t0554900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21787641	21790244	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0554900-01;Parent=gene:OsNip_10g0554900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0554900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21787641	21788172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0554900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21787641	21788280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0554900-01;Name=OsNip_10t0554900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0554900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21803871	21803930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555200-01;Name=OsNip_10t0555200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0555200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21804011	21804315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555200-01;Name=OsNip_10t0555200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0555200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21804314	21804315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21809273	21809570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21809571	21810650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0555300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0555300-01;protein_id=OsNip_10t0555300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21810651	21810954	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21830158	21831694	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0555600;Name=OsNip_EXPB6;biotype=protein_coding;description=Beta-expansin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21830158	21831694	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0555600-01;Parent=gene:OsNip_10g0555600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21830158	21830477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21830158	21831005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;Name=OsNip_10t0555600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0555600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21831178	21831287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;Name=OsNip_10t0555600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0555600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21831178	21831287	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0555600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;protein_id=OsNip_10t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21831392	21831581	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0555600-01;Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;protein_id=OsNip_10t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21831392	21831694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;Name=OsNip_10t0555600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0555600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21831582	21831694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21830469	21831011	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0555651;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21830469	21831011	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0555651-00;Parent=gene:OsNip_10g0555651;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0555651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21830469	21831011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555651-00;Name=OsNip_10t0555651-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0555651-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21830469	21831011	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0555651-00;Parent=transcript:OsNip_10t0555651-00;protein_id=OsNip_10t0555651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	21835933	21837651	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0555700;Name=OsNip_EXPB2;biotype=protein_coding;description=Beta-expansin;gene_id=OsNip_10g0555700;logic_name=rapdb_genes;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	21835933	21837651	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0555700-02;Parent=gene:OsNip_10g0555700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0555700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21835933	21836339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21835933	21836864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0555700-02;Name=OsNip_10t0555700-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0555700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21836340	21836864	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0555700-02;Parent=transcript:OsNip_10t0555700-02;protein_id=OsNip_10t0555700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21859652	21861259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0556100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21956753	21957095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0557900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21965419	21966288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0558125-00;Name=OsNip_10t0558125-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0558125-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21969310	21969414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0558301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21969415	21969639	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0558301-00;Parent=transcript:OsNip_10t0558301-00;protein_id=OsNip_10t0558301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	21969833	21969838	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0558301-00;Parent=transcript:OsNip_10t0558301-00;protein_id=OsNip_10t0558301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	21969833	21970130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0558301-00;Name=OsNip_10t0558301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0558301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21969839	21970130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0558301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21997256	21997584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0558900-01;Name=OsNip_10t0558900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0558900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	21998413	21998757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559050-00;Name=OsNip_10t0559050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0559050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22012544	22014323	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0559200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22012573	22012946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Name=OsNip_10t0559200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0559200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22012573	22012946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22013097	22013321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22013097	22013422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Name=OsNip_10t0559200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0559200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22013322	22013422	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0559200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;protein_id=OsNip_10t0559200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22013503	22013749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Name=OsNip_10t0559200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0559200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22013503	22013749	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0559200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;protein_id=OsNip_10t0559200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22014023	22014277	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0559200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;protein_id=OsNip_10t0559200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22014023	22014287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0559200-01;Name=OsNip_10t0559200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0559200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22055014	22055096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22056557	22056786	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0560000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560000-01;protein_id=OsNip_10t0560000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22056557	22056950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560000-01;Name=OsNip_10t0560000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0560000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22056787	22056950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22056622	22056950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560000-02;Name=OsNip_10t0560000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0560000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22056787	22056950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22062365	22065838	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0560200-01;Parent=gene:OsNip_10g0560200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22062365	22062624	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22062365	22062819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Name=OsNip_10t0560200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0560200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22063235	22063500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Name=OsNip_10t0560200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0560200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22063235	22063500	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0560200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;protein_id=OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22065347	22065461	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Name=OsNip_10t0560200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0560200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22065347	22065461	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0560200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;protein_id=OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22065594	22065725	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0560200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;protein_id=OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22065594	22065838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Name=OsNip_10t0560200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0560200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22065726	22065838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22069784	22072449	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0560400-01;Parent=gene:OsNip_10g0560400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22069784	22069909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22069784	22070263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;Name=OsNip_10t0560400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0560400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22069910	22070263	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0560400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;protein_id=OsNip_10t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22071672	22072211	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0560400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;protein_id=OsNip_10t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22071672	22072449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;Name=OsNip_10t0560400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0560400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22072212	22072449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22080046	22083302	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0560450;Name=OsNip_ATG3b;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22080046	22083302	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0560450-01;Parent=gene:OsNip_10g0560450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0560450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22080046	22080263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560450-01;Name=OsNip_10t0560450-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0560450-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22080046	22080263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22080425	22080535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560450-01;Name=OsNip_10t0560450-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0560450-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22080425	22080535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22080639	22081212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0560450-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22099546	22100588	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0560700-00;Parent=gene:OsNip_10g0560700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0560700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22150780	22151218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0561600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22198336	22202335	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0562700-01;Parent=gene:OsNip_10g0562700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0562700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22221769	22222252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563000-01;Name=OsNip_10t0563000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0563000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22241785	22242075	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563300-01;Name=OsNip_10t0563300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0563300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22250580	22250643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563500-01;Name=OsNip_10t0563500-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0563500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22250931	22251014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563500-01;Name=OsNip_10t0563500-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0563500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22251287	22251314	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0563500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0563500-01;protein_id=OsNip_10t0563500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22251696	22252171	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0563500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0563500-01;protein_id=OsNip_10t0563500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22247774	22247872	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22248346	22248419	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0563500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0563500-02;protein_id=OsNip_10t0563500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22249048	22249962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563500-02;Name=OsNip_10t0563500-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0563500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22249048	22249962	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0563500-02;Parent=transcript:OsNip_10t0563500-02;protein_id=OsNip_10t0563500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22252786	22253234	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0563550;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22252786	22253234	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0563550-00;Parent=gene:OsNip_10g0563550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0563550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22252786	22253145	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0563550-00;Parent=transcript:OsNip_10t0563550-00;protein_id=OsNip_10t0563550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22252786	22253234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563550-00;Name=OsNip_10t0563550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0563550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22261588	22261873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22261588	22261963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563800-00;Name=OsNip_10t0563800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0563800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22261874	22261963	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0563800-00;Parent=transcript:OsNip_10t0563800-00;protein_id=OsNip_10t0563800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22270050	22270338	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0563900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0563900-01;protein_id=OsNip_10t0563900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22270050	22270503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563900-01;Name=OsNip_10t0563900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0563900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22270339	22270503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0563900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22274545	22278013	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0564000-01;Parent=gene:OsNip_10g0564000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22274545	22274563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22274545	22274869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22274564	22274869	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22275621	22275876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22275621	22275876	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22276424	22276578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22276424	22276578	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22276656	22276928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22276656	22276928	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22277161	22277355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22277161	22277355	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22277446	22277637	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;protein_id=OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22277446	22278013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Name=OsNip_10t0564000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0564000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22277638	22278013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22275605	22277705	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0564050;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22275605	22277705	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0564050-00;Parent=gene:OsNip_10g0564050;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0564050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22275605	22275886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564050-00;Name=OsNip_10t0564050-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564050-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22276439	22276592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564050-00;Name=OsNip_10t0564050-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564050-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22276670	22276905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564050-00;Name=OsNip_10t0564050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22277148	22277377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564050-00;Name=OsNip_10t0564050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22277462	22277705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564050-00;Name=OsNip_10t0564050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0564050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22278681	22281361	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0564100;Name=OsNip_MED31b;biotype=protein_coding;description=SOH1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22278681	22281361	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0564100-01;Parent=gene:OsNip_10g0564100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0564100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22293100	22293473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22294896	22297645	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0564500;Name=SAPK3;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22294896	22297645	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0564500-01;Parent=gene:OsNip_10g0564500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0564500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22294896	22295074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22313460	22313593	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0564900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0564900-01;protein_id=OsNip_10t0564900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22313460	22313829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564900-01;Name=OsNip_10t0564900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0564900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22313594	22313829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	22308959	22309357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564900-02;Name=OsNip_10t0564900-02;exon_id=OsNip_10t0564900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15404.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6983.1;prot_id "UniRef90_A0A022RQK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22312774	22313829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0564900-02;Tag=IsoSeq:G15404.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6983.1;prot_id "UniRef90_A0A022RQK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22316009	22320257	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0565000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22316009	22316105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22319182	22319440	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;Name=OsNip_10t0565000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0565000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22319182	22319440	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0565000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;protein_id=OsNip_10t0565000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22319548	22319721	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0565000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;protein_id=OsNip_10t0565000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22319548	22320257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;Name=OsNip_10t0565000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0565000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22319722	22320257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22320644	22323805	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0565100-00;Parent=gene:OsNip_10g0565100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0565100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22323591	22323650	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0565100-00;Parent=transcript:OsNip_10t0565100-00;protein_id=OsNip_10t0565100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22323591	22323805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565100-00;Name=OsNip_10t0565100-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0565100-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22323651	22323805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22324232	22327654	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0565150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22324232	22327654	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0565150-01;Parent=gene:OsNip_10g0565150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0565150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22324232	22324375	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22324232	22325308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565150-01;Name=OsNip_10t0565150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0565150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22324376	22325308	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0565150-01;Parent=transcript:OsNip_10t0565150-01;protein_id=OsNip_10t0565150-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22408755	22409699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565700-01;Name=OsNip_10t0565700-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0565700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22410023	22410145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0565700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22412125	22412211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566050-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;protein_id=OsNip_10t0566050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22413565	22413741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22413826	22414003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;Name=OsNip_10t0566050-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0566050-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22413826	22414003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22414087	22414195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22414294	22414518	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22424314	22425029	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0566200-00;Parent=gene:OsNip_10g0566200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0566200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22424314	22424397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566200-00;Name=OsNip_10t0566200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22424314	22424397	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566200-00;protein_id=OsNip_10t0566200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22424501	22424760	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566200-00;Name=OsNip_10t0566200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22424827	22424839	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0566200-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566200-00;protein_id=OsNip_10t0566200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22426328	22427740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566300-01;Name=OsNip_10t0566300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	22425678	22425845	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566300-02;Tag=IsoSeq:G15408.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9138.1;prot_id "UniRef90_I1QW23";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22426014	22427667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566300-02;Tag=IsoSeq:G15408.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9138.1;prot_id "UniRef90_I1QW23";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22435311	22436873	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0566400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22435311	22435369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22435311	22436873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566400-01;Name=OsNip_10t0566400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0566400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22436486	22436873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22453084	22456620	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0566700;biotype=protein_coding;description=Chaperonin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22453084	22456620	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0566700-00;Parent=gene:OsNip_10g0566700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22453084	22453205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22453084	22453364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22453206	22453364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;protein_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22453472	22453522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22453472	22453522	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;protein_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22454590	22454655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22454742	22454789	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22454742	22454789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;protein_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22456003	22456032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22456003	22456032	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;protein_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22456230	22456298	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;protein_id=OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22456230	22456620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Name=OsNip_10t0566700-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566700-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22456299	22456620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22457714	22460760	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0566800-01;Parent=gene:OsNip_10g0566800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22457714	22458091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22457714	22458501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Name=OsNip_10t0566800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0566800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22458092	22458501	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0566800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;protein_id=OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22459326	22459488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Name=OsNip_10t0566800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22459326	22459488	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0566800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;protein_id=OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22459596	22459775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Name=OsNip_10t0566800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22459596	22459775	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0566800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;protein_id=OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22460129	22460398	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0566800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;protein_id=OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22460129	22460760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Name=OsNip_10t0566800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0566800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22460399	22460760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22464363	22466552	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0566900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22464363	22466552	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0566900-01;Parent=gene:OsNip_10g0566900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22464363	22464508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22464363	22464640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;Name=OsNip_10t0566900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0566900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22464509	22464640	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;protein_id=OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22465111	22465229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;Name=OsNip_10t0566900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0566900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22465111	22465229	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0566900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;protein_id=OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22465337	22465513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;Name=OsNip_10t0566900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0566900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22465337	22465513	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0566900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;protein_id=OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22465820	22465867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;Name=OsNip_10t0566900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0566900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22465820	22465867	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0566900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0566900-01;protein_id=OsNip_10t0566900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22516924	22517808	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0567900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0567900-01;protein_id=OsNip_10t0567900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22517809	22517963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0567900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22520076	22521575	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0568000-01;Parent=gene:OsNip_10g0568000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0568000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22520076	22520488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22520076	22521575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568000-01;Name=OsNip_10t0568000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22520489	22521574	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0568000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0568000-01;protein_id=OsNip_10t0568000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22521575	22521575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22522025	22524862	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0568100;Name=OsNip_STA248;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22522025	22524862	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0568100-01;Parent=gene:OsNip_10g0568100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22522025	22522587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Name=OsNip_10t0568100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22522025	22522587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22523225	22523329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Name=OsNip_10t0568100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22523225	22523329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22523438	22523566	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Name=OsNip_10t0568100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22523438	22523566	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22523655	22523830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22523655	22524052	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Name=OsNip_10t0568100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0568100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22523831	22524052	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0568100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;protein_id=OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22524510	22524686	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0568100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;protein_id=OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22524510	22524862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Name=OsNip_10t0568100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22524687	22524862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22526937	22533205	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0568200;biotype=protein_coding;description=Chaperonin;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22526937	22532726	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0568200-01;Parent=gene:OsNip_10g0568200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22526937	22527214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Name=OsNip_10t0568200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22526937	22527214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22528215	22528397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Name=OsNip_10t0568200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22528215	22528397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22528702	22529968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Name=OsNip_10t0568200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22528702	22529968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22530089	22530132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22530089	22530240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;Name=OsNip_10t0568200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22530567	22530737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0568200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0568200-01;protein_id=OsNip_10t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22531145	22533250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-01;Name=OsNip_10t0568300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0568300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22534190	22534264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0568300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0568300-01;protein_id=OsNip_10t0568300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22534190	22534379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-01;Name=OsNip_10t0568300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22534265	22534379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22532040	22532183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-02;Tag=IsoSeq:G15415.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12075.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2D0Y1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22531587	22531691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-02;Tag=IsoSeq:G15415.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12075.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2D0Y1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22531145	22531468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568300-02;Tag=IsoSeq:G15415.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12075.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2D0Y1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22544857	22550187	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0568600-00;Parent=gene:OsNip_10g0568600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0568600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22544857	22544857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22544857	22546904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;Name=OsNip_10t0568600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22544858	22546879	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0568600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;protein_id=OsNip_10t0568600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22546880	22546904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22549389	22550187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;Name=OsNip_10t0568600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0568600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22549389	22550187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0568600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	22558864	22558873	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0569000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0569000-01;protein_id=OsNip_10t0569000-01;Tag=IsoSeq:G15417.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12077.1,Nipponbare.leaf_G6989.2,Nipponbare.root_G9144.1;prot_id "UniRef90_A0A2C9VA42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22561548	22561899	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0569000-01;Tag=IsoSeq:G15417.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12077.1,Nipponbare.leaf_G6989.2,Nipponbare.root_G9144.1;prot_id "UniRef90_A0A2C9VA42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22562243	22563068	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0569100;biotype=protein_coding;description=PIG-P;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22562243	22563068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0569100-01;Parent=gene:OsNip_10g0569100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0569100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22575251	22575377	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0569400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0569400-01;protein_id=OsNip_10t0569400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22576067	22576263	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0569400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0569400-01;protein_id=OsNip_10t0569400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22576067	22576531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0569400-01;Name=OsNip_10t0569400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0569400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22576264	22576531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0569400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22601356	22601591	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570001-01;Tag=IsoSeq:G15422.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12081.2;prot_id "UniRef90_Q0IVH8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22607642	22607706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22607642	22607830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;Name=OsNip_10t0570200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0570200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22607707	22607830	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0570200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;protein_id=OsNip_10t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22608356	22608474	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0570200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;protein_id=OsNip_10t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22608356	22608671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;Name=OsNip_10t0570200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0570200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22608475	22608671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22627963	22628853	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0570700;biotype=protein_coding;description=Ribosome-inactivating;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22627963	22628853	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0570700-00;Parent=gene:OsNip_10g0570700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0570700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22627963	22628853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0570700-00;Name=OsNip_10t0570700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0570700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	gene	22629803	22631252	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0570800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22638639	22638702	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0571100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571100-01;protein_id=OsNip_10t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22638639	22640104	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-01;Name=OsNip_10t0571100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0571100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22638703	22640104	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	22638639	22638673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-02;Name=OsNip_10t0571100-02;exon_id=OsNip_10t0571100-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15424.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6994.1,Nipponbare.root_G9147.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A3DE95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	exon	22639707	22640106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-02;Name=OsNip_10t0571100-02;exon_id=OsNip_10t0571100-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G15424.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6994.1,Nipponbare.root_G9147.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A3DE95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	22636108	22636108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-02;Tag=IsoSeq:G15424.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6994.1,Nipponbare.root_G9147.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A3DE95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22639707	22640106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571100-02;Tag=IsoSeq:G15424.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6994.1,Nipponbare.root_G9147.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A3DE95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22640923	22646792	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0571200-01;Parent=gene:OsNip_10g0571200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22640923	22641007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22642435	22642569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Name=OsNip_10t0571200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0571200-02-E2;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22642647	22642757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Name=OsNip_10t0571200-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0571200-02-E3;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22642850	22642938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Name=OsNip_10t0571200-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0571200-02-E4;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22642850	22642938	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;protein_id=OsNip_10t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22643216	22643278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Name=OsNip_10t0571200-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0571200-02-E5;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22643216	22643278	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;protein_id=OsNip_10t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22643440	22643615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;Name=OsNip_10t0571200-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0571200-02-E6;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22643440	22643615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571200-01;protein_id=OsNip_10t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22641215	22641267	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571250-00;Name=OsNip_10t0571250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0571250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22651207	22651340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;Name=OsNip_10t0571300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0571300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22653062	22653175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;Name=OsNip_10t0571300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0571300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22653062	22653175	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;protein_id=OsNip_10t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22653462	22653713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;protein_id=OsNip_10t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22653462	22654233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;Name=OsNip_10t0571300-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0571300-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22653714	22654233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22670628	22671819	.	+	.	ID=gene:OsNip_10g0571600;Name=ONAC121;biotype=protein_coding;description=No;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22684395	22684668	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0572100-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572100-01;protein_id=OsNip_10t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22684395	22684755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572100-01;Name=OsNip_10t0572100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0572100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22684669	22684755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22690792	22690844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22692403	22693316	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0572300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572300-01;protein_id=OsNip_10t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22693405	22693545	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0572300-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572300-01;protein_id=OsNip_10t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22693405	22693588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572300-01;Name=OsNip_10t0572300-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22693546	22693588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	22700964	22701148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572400-02;Tag=IsoSeq:G15428.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12085.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XNN2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22700189	22700552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572400-02;Tag=IsoSeq:G15428.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12085.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XNN2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	22699105	22700101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572400-02;Tag=IsoSeq:G15428.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12085.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XNN2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22702383	22703195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;Name=OsNip_10t0572500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0572500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22702383	22703195	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0572500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;protein_id=OsNip_10t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22703632	22703717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;Name=OsNip_10t0572500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22703632	22703717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0572500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;protein_id=OsNip_10t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22706231	22706305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;Name=OsNip_10t0572500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22706231	22706305	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0572500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;protein_id=OsNip_10t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22706776	22707110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;Name=OsNip_10t0572500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0572500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22706851	22707110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22741639	22743782	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0572900-03;Parent=gene:OsNip_10g0572900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0572900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22741639	22742029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22741639	22742356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-03;Name=OsNip_10t0572900-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572900-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22742458	22742619	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0572900-03;Parent=transcript:OsNip_10t0572900-03;protein_id=OsNip_10t0572900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22743158	22743782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-03;Name=OsNip_10t0572900-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0572900-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22743293	22743782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22741649	22742029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22741649	22742356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-02;Name=OsNip_10t0572900-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22742458	22742619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0572900-02;Name=OsNip_10t0572900-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0572900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22742458	22742619	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0572900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0572900-02;protein_id=OsNip_10t0572900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22760609	22760695	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0573300-00;Parent=transcript:OsNip_10t0573300-00;protein_id=OsNip_10t0573300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22760767	22761111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0573300-00;Name=OsNip_10t0573300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0573300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22766332	22767420	.	+	.	ID=transcript:OsNip_10t0573400-01;Parent=gene:OsNip_10g0573400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0573400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22766332	22766465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0573400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22766332	22767420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0573400-01;Name=OsNip_10t0573400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0573400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22766466	22767104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0573400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0573400-01;protein_id=OsNip_10t0573400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22767105	22767420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0573400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22836686	22840718	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0574800-01;Parent=gene:OsNip_10g0574800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0574800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22859379	22859748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22857142	22859565	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0575100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22857458	22859565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575100-00;Name=OsNip_10t0575100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0575100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22859244	22859565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22861444	22876342	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0575200;Name=OsNip_DjC74;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	22861455	22865778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0575200-03;Parent=gene:OsNip_10g0575200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22861455	22861794	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22862159	22862227	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0575200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;protein_id=OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22862697	22862820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Name=OsNip_10t0575200-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0575200-01-E14;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22863173	22863297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Name=OsNip_10t0575200-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0575200-01-E13;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22863795	22864256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Name=OsNip_10t0575200-02-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0575200-02-E8;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22865041	22865386	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0575200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;protein_id=OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22865472	22865777	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0575200-03;Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;protein_id=OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	22865472	22865778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Name=OsNip_10t0575200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0575200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22865778	22865778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22861455	22862022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0575200-01;Name=OsNip_10t0575200-01-E16;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0575200-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	22861795	22862022	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0575200-01;Parent=transcript:OsNip_10t0575200-01;protein_id=OsNip_10t0575200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22939443	22939475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0576000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	22943682	22945106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0576050-00;Name=OsNip_10t0576050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0576050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	22943712	22945124	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0576100;Name=OsNip_ITPK5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22987608	22987753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	23011418	23011554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577500-02;Name=OsNip_10t0577500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0577500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23011207	23011307	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0577500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0577500-01;protein_id=OsNip_10t0577500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23011605	23011807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23034637	23034740	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0577700-01;Parent=transcript:OsNip_10t0577700-01;protein_id=OsNip_10t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23034637	23034966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577700-01;Name=OsNip_10t0577700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0577700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23034741	23034966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	exon	23034041	23034159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577700-02;Name=OsNip_10t0577700-02;exon_id=OsNip_10t0577700-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G15453.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12109.2,Nipponbare.root_G9165.1,Nipponbare.leaf_G7012.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7QPK5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr10	TAMA	exon	23034303	23034479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577700-02;Name=OsNip_10t0577700-02;exon_id=OsNip_10t0577700-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G15453.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12109.2,Nipponbare.root_G9165.1,Nipponbare.leaf_G7012.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7QPK5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	23037388	23038667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0577800-01;Name=OsNip_10t0577800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0577800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23107518	23107644	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0579400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0579400-01;protein_id=OsNip_10t0579400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23107956	23108362	.	+	2	ID=CDS:OsNip_10t0579400-01;Parent=transcript:OsNip_10t0579400-01;protein_id=OsNip_10t0579400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23107956	23108620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-01;Name=OsNip_10t0579400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0579400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23108363	23108620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	TAMA	CDS	23108208	23108411	.	+	.	ID=CDS:OsNip_10t0579400-02;Parent=transcript:OsNip_10t0579400-02;protein_id=OsNip_10t0579400-02;Tag=IsoSeq:G15462.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12118.2;prot_id "UniRef90_B7F511";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	TAMA	five_prime_UTR	23107349	23107882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-02;Tag=IsoSeq:G15462.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12118.2;prot_id "UniRef90_B7F511";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	23107959	23108207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-02;Tag=IsoSeq:G15462.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12118.2;prot_id "UniRef90_B7F511";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	23108415	23108490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-02;Tag=IsoSeq:G15462.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12118.2;prot_id "UniRef90_B7F511";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	23108997	23109446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579400-02;Tag=IsoSeq:G15462.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12118.2;prot_id "UniRef90_B7F511";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	23112003	23113801	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0579500-01;Parent=gene:OsNip_10g0579500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0579500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23112003	23112227	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23112003	23112317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;Name=OsNip_10t0579500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0579500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23112228	23112317	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0579500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;protein_id=OsNip_10t0579500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23113349	23113433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;Name=OsNip_10t0579500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0579500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23113349	23113433	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0579500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;protein_id=OsNip_10t0579500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23113516	23113625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0579500-01;Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;protein_id=OsNip_10t0579500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23113516	23113801	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0579500-01;Name=OsNip_10t0579500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0579500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	23186505	23186725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580600-00;Name=OsNip_10t0580600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0580600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23186505	23186725	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580600-00;Parent=transcript:OsNip_10t0580600-00;protein_id=OsNip_10t0580600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23190174	23190571	.	+	0	ID=CDS:OsNip_10t0580800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0580800-01;protein_id=OsNip_10t0580800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23191487	23191970	.	+	1	ID=CDS:OsNip_10t0580800-01;Parent=transcript:OsNip_10t0580800-01;protein_id=OsNip_10t0580800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23191487	23192200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580800-01;Name=OsNip_10t0580800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0580800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr10	RAP2018-11-26	exon	23190174	23190550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580750-00;Name=OsNip_10t0580750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_10t0580750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23190174	23190550	.	-	2	ID=CDS:OsNip_10t0580750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0580750-00;protein_id=OsNip_10t0580750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23191466	23191640	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580750-00;Parent=transcript:OsNip_10t0580750-00;protein_id=OsNip_10t0580750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23191466	23191970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580750-00;Name=OsNip_10t0580750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23191641	23191970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	gene	23192471	23194991	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0580900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	23192471	23194991	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0580900-01;Parent=gene:OsNip_10g0580900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23192471	23192621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23192471	23193254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Name=OsNip_10t0580900-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0580900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23192622	23193254	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;protein_id=OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23193585	23193863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Name=OsNip_10t0580900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23193585	23193863	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;protein_id=OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23193968	23194114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-01;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;protein_id=OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23193968	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Name=OsNip_10t0580900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23194115	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23194864	23194991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Name=OsNip_10t0580900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23194864	23194991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	23192525	23194969	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0580900-02;Parent=gene:OsNip_10g0580900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23192525	23192621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23192525	23193254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Name=OsNip_10t0580900-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23192622	23193254	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;protein_id=OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23193585	23193863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Name=OsNip_10t0580900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23193585	23193863	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;protein_id=OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23193968	23194114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0580900-02;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;protein_id=OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23193968	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Name=OsNip_10t0580900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23194115	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23194864	23194969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Name=OsNip_10t0580900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23194864	23194969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	23194450	23194950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0580900-03;Parent=gene:OsNip_10g0580900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_10t0580900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23194450	23194950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-03;Name=OsNip_10t0580900-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_10t0580900-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	TAMA	mRNA	23192522	23194962	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0580900-04;Parent=gene:OsNip_10g0580900;transcript_id=OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4
Chr10	TAMA	exon	23194864	23194962	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Name=OsNip_10t0580900-04;exon_id=OsNip_10t0580900-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	23193968	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Name=OsNip_10t0580900-04;exon_id=OsNip_10t0580900-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	exon	23192522	23193863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Name=OsNip_10t0580900-04;exon_id=OsNip_10t0580900-04-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	CDS	23192809	23193195	.	-	.	ID=CDS:OsNip_10t0580900-04;Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;protein_id=OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	23194864	23194962	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	23193968	23194133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	five_prime_UTR	23193196	23193863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	TAMA	three_prime_UTR	23192522	23192806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0580900-04;Tag=IsoSeq:G15471.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9182.4;prot_id "UniRef90_A0A2C9V3D6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr10	RAP2018-11-26	gene	23195820	23198427	.	-	.	ID=gene:OsNip_10g0581000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	mRNA	23195820	23198427	.	-	.	ID=transcript:OsNip_10t0581000-01;Parent=gene:OsNip_10g0581000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_10t0581000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23195820	23195970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0581000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23195820	23196346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0581000-01;Name=OsNip_10t0581000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_10t0581000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23195971	23196346	.	-	1	ID=CDS:OsNip_10t0581000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0581000-01;protein_id=OsNip_10t0581000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	exon	23196477	23196553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_10t0581000-01;Name=OsNip_10t0581000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_10t0581000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr10	RAP2018-11-26	CDS	23196477	23196553	.	-	0	ID=CDS:OsNip_10t0581000-01;Parent=transcript:OsNip_10t0581000-01;protein_id=OsNip_10t0581000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	148205	149101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0103700-01;Name=OsNip_11t0103700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0103700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	153567	153851	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0103800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0103800-01;protein_id=OsNip_11t0103800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	154578	155480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0103800-01;Name=OsNip_11t0103800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0103800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	154731	155480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0103800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	250848	250866	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	250848	251776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105350-00;Name=OsNip_11t0105350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0105350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	250867	251187	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0105350-00;Parent=transcript:OsNip_11t0105350-00;protein_id=OsNip_11t0105350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	252427	254863	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0105400-01;Parent=gene:OsNip_11g0105400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0105400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	252427	252727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	252427	252853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Name=OsNip_11t0105400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0105400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	253066	253142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Name=OsNip_11t0105400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0105400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	253066	253142	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0105400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;protein_id=OsNip_11t0105400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	253226	253316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Name=OsNip_11t0105400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0105400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	253226	253316	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0105400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;protein_id=OsNip_11t0105400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	253642	253702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Name=OsNip_11t0105400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0105400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	253642	253702	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0105400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;protein_id=OsNip_11t0105400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	253798	253856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105400-01;Name=OsNip_11t0105400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0105400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	263967	264034	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0105800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0105800-01;protein_id=OsNip_11t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	264290	264493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105800-01;Name=OsNip_11t0105800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0105800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	265448	265483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	265685	265893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0105901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	267825	273068	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0106000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	267825	268785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0106000-02;Name=OsNip_11t0106000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0106000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	267825	268785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0106000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	272226	272300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0106000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	354063	354263	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0107500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0107500-01;protein_id=OsNip_11t0107500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	354354	355319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0107500-01;Name=OsNip_11t0107500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0107500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	354408	355319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0107500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	438997	439227	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0109500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0109500-01;protein_id=OsNip_11t0109500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	567643	567690	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0112100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0112100-00;protein_id=OsNip_11t0112100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	568253	568409	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0112100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0112100-00;protein_id=OsNip_11t0112100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	568253	568614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-00;Name=OsNip_11t0112100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0112100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	568410	568614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	566234	566593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-01;Name=OsNip_11t0112100-01;exon_id=OsNip_11t0112100-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15513.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7039.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R3B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	TAMA	exon	568253	568676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-01;Name=OsNip_11t0112100-01;exon_id=OsNip_11t0112100-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15513.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7039.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R3B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	566672	566822	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-01;Tag=IsoSeq:G15513.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7039.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R3B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	567624	567690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-01;Tag=IsoSeq:G15513.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7039.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R3B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	568253	568676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112100-01;Tag=IsoSeq:G15513.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7039.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R3B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	571047	571806	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0112151;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	594354	594666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	618437	618589	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0113300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0113300-01;protein_id=OsNip_11t0113300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	620007	620123	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0113300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0113300-01;protein_id=OsNip_11t0113300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	620007	620379	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0113300-01;Name=OsNip_11t0113300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0113300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	630585	630882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0113700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	630585	632496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0113700-02;Name=OsNip_11t0113700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0113700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	632188	632496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0113700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	685277	685537	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115100-02;Tag=IsoSeq:G15524.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12165.2;prot_id "UniRef90_A0A3B6B6T8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	703567	703928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	703095	703095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	703096	703443	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0115375-00;Parent=transcript:OsNip_11t0115375-00;protein_id=OsNip_11t0115375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	706516	706662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	707886	707967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115800-01;Name=OsNip_11t0115800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0115800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	707886	707967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	708491	708769	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115800-01;Name=OsNip_11t0115800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0115800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	708491	708769	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0115800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	730426	730584	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0116300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0116300-01;protein_id=OsNip_11t0116300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	730682	730771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0116300-01;Name=OsNip_11t0116300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0116300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	730770	730771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0116300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	732634	732755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0116300-01;Name=OsNip_11t0116300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0116300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	732634	732755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0116300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	783485	783485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	783309	783620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117450-00;Name=OsNip_11t0117450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0117450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	787544	789030	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0117500;Name=OsNip_WRKY40;biotype=protein_coding;description=DNA-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	787544	789030	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0117500-01;Parent=gene:OsNip_11g0117500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	787544	787622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	787544	788091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;Name=OsNip_11t0117500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0117500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	787623	788091	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0117500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;protein_id=OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	788229	788333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;Name=OsNip_11t0117500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0117500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	788229	788333	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0117500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;protein_id=OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	788476	788864	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0117500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;protein_id=OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	788476	789030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;Name=OsNip_11t0117500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0117500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	788865	789030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	787544	789030	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0117500-02;Parent=gene:OsNip_11g0117500;transcript_id=OsNip_11t0117500-02;Tag=IsoSeq:G15533.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9221.1
Chr11	TAMA	exon	787544	789030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-02;Name=OsNip_11t0117500-02;exon_id=OsNip_11t0117500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15533.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9221.1;prot_id "UniRef90_Q6IEP1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	788617	788823	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0117500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0117500-02;protein_id=OsNip_11t0117500-02;Tag=IsoSeq:G15533.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9221.1;prot_id "UniRef90_Q6IEP1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	788824	789030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-02;Tag=IsoSeq:G15533.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9221.1;prot_id "UniRef90_Q6IEP1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	787544	788614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0117500-02;Tag=IsoSeq:G15533.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9221.1;prot_id "UniRef90_Q6IEP1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	794803	795540	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0117600;Name=OsNip_WRKY50;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	860701	860980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0119200-01;Name=OsNip_11t0119200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0119200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	860701	860980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0119200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	861725	862328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0119200-02;Tag=IsoSeq:G15539.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9224.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9CPT7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1033365	1033501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123066-01;Name=OsNip_11t0123066-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0123066-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1033657	1035170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1033657	1037017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123066-01;Name=OsNip_11t0123066-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0123066-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1035171	1035473	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0123066-01;Parent=transcript:OsNip_11t0123066-01;protein_id=OsNip_11t0123066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1035474	1037017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123066-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1073511	1073582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123250-01;Name=OsNip_11t0123250-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0123250-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1076273	1076788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123250-01;Name=OsNip_11t0123250-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0123250-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1071355	1076817	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0123400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1071452	1071720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1071452	1071792	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Name=OsNip_11t0123400-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0123400-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1072182	1072304	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0123400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;protein_id=OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1073511	1073582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Name=OsNip_11t0123400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0123400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1073511	1073582	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0123400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;protein_id=OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1074113	1074294	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Name=OsNip_11t0123400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0123400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1074113	1074294	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0123400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;protein_id=OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1074706	1074941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Name=OsNip_11t0123400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0123400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1074706	1074941	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0123400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;protein_id=OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1076273	1076607	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0123400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;protein_id=OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1076273	1076748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Name=OsNip_11t0123400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0123400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1076608	1076748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	1071360	1076817	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0123400-01;Parent=gene:OsNip_11g0123400;transcript_id=OsNip_11t0123400-01;Tag=IsoSeq:G15547.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7058.1
Chr11	TAMA	exon	1076273	1076817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0123400-01;Name=OsNip_11t0123400-01;exon_id=OsNip_11t0123400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15547.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7058.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A2DD59";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1168697	1169203	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1169284	1169340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1169799	1170154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0125700-00;Name=OsNip_11t0125700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0125700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1276347	1276406	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0127700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0127700-01;protein_id=OsNip_11t0127700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1317256	1318705	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0128500-01;Parent=gene:OsNip_11g0128500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0128500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1332999	1333149	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0128800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0128800-01;protein_id=OsNip_11t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1333219	1333329	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0128800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0128800-01;protein_id=OsNip_11t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1333330	1333415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1413405	1413444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1415355	1415618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1458599	1458599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0131900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1466215	1466271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1466361	1466553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1466759	1466902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132000-01;Name=OsNip_11t0132000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1466759	1466902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1467286	1467581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132000-01;Name=OsNip_11t0132000-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132000-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	1468877	1469400	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0132100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1468877	1469400	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0132100-00;Parent=gene:OsNip_11g0132100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0132100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1468877	1468902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1468877	1469400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132100-00;Name=OsNip_11t0132100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0132100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1468903	1469400	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0132100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0132100-00;protein_id=OsNip_11t0132100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1472913	1473988	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0132400;biotype=protein_coding;description=Uncharacterised;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1472913	1473988	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0132400-01;Parent=gene:OsNip_11g0132400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1472913	1473413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1472913	1473493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;Name=OsNip_11t0132400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0132400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1473414	1473493	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0132400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;protein_id=OsNip_11t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1473902	1473986	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0132400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;protein_id=OsNip_11t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1473902	1473988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;Name=OsNip_11t0132400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1473987	1473988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1475884	1477556	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0132501;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1476041	1477556	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0132501-00;Parent=gene:OsNip_11g0132501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1476041	1476222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1476041	1477233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Name=OsNip_11t0132501-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132501-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1476223	1476444	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0132501-00;Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;protein_id=OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1476445	1477233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1477273	1477356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Name=OsNip_11t0132501-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132501-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1477273	1477356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1477367	1477556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Name=OsNip_11t0132501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1477367	1477556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	1475884	1477554	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0132501-01;Parent=gene:OsNip_11g0132501;transcript_id=OsNip_11t0132501-01;Tag=IsoSeq:G15567.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12192.2
Chr11	TAMA	exon	1475884	1477554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-01;Name=OsNip_11t0132501-01;exon_id=OsNip_11t0132501-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15567.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12192.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XYY4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	CDS	1476516	1476665	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0132501-01;Parent=transcript:OsNip_11t0132501-01;protein_id=OsNip_11t0132501-01;Tag=IsoSeq:G15567.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12192.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XYY4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	1476666	1477554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-01;Tag=IsoSeq:G15567.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12192.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XYY4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	1475884	1476513	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132501-01;Tag=IsoSeq:G15567.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12192.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XYY4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1484073	1491751	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0132600;Name=OsNip_WD40-181;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1484073	1491751	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0132600-01;Parent=gene:OsNip_11g0132600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0132600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1484073	1484267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;Name=OsNip_11t0132600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1484073	1484267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1484683	1484701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1484683	1484875	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;Name=OsNip_11t0132600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0132600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1484702	1484875	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0132600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;protein_id=OsNip_11t0132600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1485351	1485405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;Name=OsNip_11t0132600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0132600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1485351	1485405	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0132600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0132600-01;protein_id=OsNip_11t0132600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1712088	1712884	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137100-01;Name=OsNip_11t0137100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0137100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1723822	1723862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Name=OsNip_11t0137300-02-E23;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0137300-02-E23;rank=23;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1724261	1724554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Name=OsNip_11t0137300-02-E22;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0137300-02-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1724261	1724554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1725913	1726082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Name=OsNip_11t0137300-02-E19;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0137300-02-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1725913	1726082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1727365	1727549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1727626	1727912	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Name=OsNip_11t0137300-02-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0137300-02-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1728570	1728629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0137300-02;Name=OsNip_11t0137300-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0137300-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1775407	1777333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0138300-01;Name=OsNip_11t0138300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0138300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1776069	1776920	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0138300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0138300-01;protein_id=OsNip_11t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1776921	1777333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0138300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1777330	1778832	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0138350-01;Parent=gene:OsNip_11g0138350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0138350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1823531	1824250	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1824393	1824499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1824597	1824801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Name=OsNip_11t0139500-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1825173	1825255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Name=OsNip_11t0139500-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1825173	1825255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1825663	1826541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Name=OsNip_11t0139500-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1825663	1826541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1827300	1828276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Name=OsNip_11t0139500-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139500-03-E2;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1827300	1828276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1821374	1821374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1821374	1821483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1821375	1821483	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1822916	1823292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1822916	1823292	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1823375	1823485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1823375	1823485	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1824110	1824250	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1824110	1824250	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1824329	1824499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1824329	1824499	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1824597	1824801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;Name=OsNip_11t0139500-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0139500-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1824597	1824801	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0139500-02;protein_id=OsNip_11t0139500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1830233	1830789	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0139550-00;Parent=transcript:OsNip_11t0139550-00;protein_id=OsNip_11t0139550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1830808	1831729	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0139550-00;Parent=transcript:OsNip_11t0139550-00;protein_id=OsNip_11t0139550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1830808	1831992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139550-00;Name=OsNip_11t0139550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1831730	1831992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1829913	1832347	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0139600-01;Parent=gene:OsNip_11g0139600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0139600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1829913	1830382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1829913	1832347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139600-01;Name=OsNip_11t0139600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1830383	1832134	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0139600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0139600-01;protein_id=OsNip_11t0139600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1832135	1832347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1835867	1837930	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0139700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1835867	1837930	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0139700-01;Parent=gene:OsNip_11g0139700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0139700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1835867	1837730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1835867	1837930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0139700-01;Name=OsNip_11t0139700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0139700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1883422	1883768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0140700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1879355	1879888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0140700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1879355	1880018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0140700-02;Name=OsNip_11t0140700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0140700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1879889	1880018	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0140700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0140700-02;protein_id=OsNip_11t0140700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1880167	1880249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0140700-02;Name=OsNip_11t0140700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0140700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	1936207	1939840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141550-01;Name=OsNip_11t0141550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0141550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1938169	1938558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0141550-01;Parent=transcript:OsNip_11t0141550-01;protein_id=OsNip_11t0141550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1938559	1939840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	1936199	1939835	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0141550-02;Parent=gene:OsNip_11g0141550;transcript_id=OsNip_11t0141550-02;Tag=IsoSeq:G15604.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12218.1
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Chr11	TAMA	CDS	1939641	1939835	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0141550-02;Parent=transcript:OsNip_11t0141550-02;protein_id=OsNip_11t0141550-02;Tag=IsoSeq:G15604.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12218.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2CQE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	exon	1936199	1937539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141550-02;Name=OsNip_11t0141550-02;exon_id=OsNip_11t0141550-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15604.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12218.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2CQE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	1939582	1939638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141550-02;Tag=IsoSeq:G15604.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12218.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2CQE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	1936199	1937539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141550-02;Tag=IsoSeq:G15604.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12218.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2CQE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1942620	1944140	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0141700-00;Parent=gene:OsNip_11g0141700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0141700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1942620	1944140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141700-00;Name=OsNip_11t0141700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0141700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1942620	1944140	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0141700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0141700-00;protein_id=OsNip_11t0141700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1946099	1946770	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0141800-01;Parent=gene:OsNip_11g0141800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0141800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1946099	1946333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1946099	1946770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141800-01;Name=OsNip_11t0141800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0141800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1946334	1946672	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0141800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0141800-01;protein_id=OsNip_11t0141800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1946673	1946770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	1951466	1954444	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0141900;biotype=protein_coding;description=Ankyrin;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	1951562	1954193	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0141900-00;Parent=gene:OsNip_11g0141900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0141900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1951562	1951740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1951562	1952268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141900-00;Name=OsNip_11t0141900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0141900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1951741	1952268	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0141900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0141900-00;protein_id=OsNip_11t0141900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	1953237	1954193	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0141900-00;Name=OsNip_11t0141900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0141900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	1953237	1954193	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0141900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0141900-00;protein_id=OsNip_11t0141900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	1951466	1954444	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0141900-01;Parent=gene:OsNip_11g0141900;transcript_id=OsNip_11t0141900-01;Tag=IsoSeq:G15606.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12220.1
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2016636	2016812	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0143400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0143400-00;protein_id=OsNip_11t0143400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2017557	2018150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0143400-00;Name=OsNip_11t0143400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0143400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2017557	2018150	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0143400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0143400-00;protein_id=OsNip_11t0143400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	2015380	2018131	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0143400-01;Parent=gene:OsNip_11g0143400;transcript_id=OsNip_11t0143400-01;Tag=IsoSeq:G15609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9264.1
Chr11	TAMA	exon	2017557	2018131	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0143400-01;Name=OsNip_11t0143400-01;exon_id=OsNip_11t0143400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9264.1;prot_id "UniRef90_A0A6I9RET1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2074692	2074943	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0145400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0145400-01;protein_id=OsNip_11t0145400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2074944	2077162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0145400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	CDS	2074602	2074685	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0145400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0145400-02;protein_id=OsNip_11t0145400-02;Tag=IsoSeq:G15612.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12223.1,Nipponbare.leaf_G7089.1,Nipponbare.panicle_G12223.2,Nipponbare.root_G9267.1;prot_id "UniRef90_A0A0D2N2G9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	exon	2076944	2077186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0145400-02;Name=OsNip_11t0145400-02;exon_id=OsNip_11t0145400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15612.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12223.1,Nipponbare.leaf_G7089.1,Nipponbare.panicle_G12223.2,Nipponbare.root_G9267.1;prot_id "UniRef90_A0A0D2N2G9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	2076944	2077186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0145400-02;Tag=IsoSeq:G15612.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12223.1,Nipponbare.leaf_G7089.1,Nipponbare.panicle_G12223.2,Nipponbare.root_G9267.1;prot_id "UniRef90_A0A0D2N2G9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2077493	2081514	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0145700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2077493	2077563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0145700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2081432	2081514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0145700-00;Name=OsNip_11t0145700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0145700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2081432	2081514	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0145700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0145700-00;protein_id=OsNip_11t0145700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2087123	2087209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2087123	2087685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-01;Name=OsNip_11t0146000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0146000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2087210	2087683	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0146000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0146000-01;protein_id=OsNip_11t0146000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2087684	2087685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	2081099	2087660	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0146000-02;Parent=gene:OsNip_11g0146000;transcript_id=OsNip_11t0146000-02;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1
Chr11	TAMA	exon	2087237	2087660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;Name=OsNip_11t0146000-02;exon_id=OsNip_11t0146000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	2087237	2087454	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0146000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;protein_id=OsNip_11t0146000-02;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	2081099	2082078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;Name=OsNip_11t0146000-02;exon_id=OsNip_11t0146000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	2081631	2082078	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0146000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;protein_id=OsNip_11t0146000-02;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	2087455	2087660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	2081099	2081628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146000-02;Tag=IsoSeq:G15613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9268.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2087799	2089433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0146100-01;Parent=gene:OsNip_11g0146100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2087799	2089283	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0146100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0146100-01;protein_id=OsNip_11t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2087799	2089433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146100-01;Name=OsNip_11t0146100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0146100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2089284	2089433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2090804	2094536	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0146200;biotype=protein_coding;description=Ankyrin;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2090804	2094497	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0146200-02;Parent=gene:OsNip_11g0146200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0146200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2090804	2091107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146200-02;Name=OsNip_11t0146200-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0146200-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2090804	2091107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2091178	2091321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0146200-02;Name=OsNip_11t0146200-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0146200-01-E11;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	2148783	2151407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0147150-01;Tag=IsoSeq:G15618.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12228.3;prot_id "UniRef90_C7J5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2169255	2170696	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0147500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0147500-02;protein_id=OsNip_11t0147500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2204302	2204508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2204509	2204547	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0147800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;protein_id=OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2204709	2204818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;Name=OsNip_11t0147800-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0147800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2204709	2204818	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0147800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;protein_id=OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2204983	2205103	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0147800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;protein_id=OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2205237	2205477	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0147800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;protein_id=OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2207364	2207566	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0147800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;protein_id=OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2207364	2207780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;Name=OsNip_11t0147800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0147800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2207567	2207780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0147800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2237536	2237746	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0148400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0148400-01;protein_id=OsNip_11t0148400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2237849	2238184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148400-01;Name=OsNip_11t0148400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0148400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2238286	2239079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148400-01;Name=OsNip_11t0148400-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0148400-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2238399	2239079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2239301	2243356	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0148500-02;Parent=gene:OsNip_11g0148500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0148500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2239301	2239564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2239301	2239717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148500-02;Name=OsNip_11t0148500-02-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0148500-02-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2239565	2239717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0148500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0148500-02;protein_id=OsNip_11t0148500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2240013	2240072	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0148500-02;Name=OsNip_11t0148500-02-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0148500-02-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2240013	2240072	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0148500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0148500-02;protein_id=OsNip_11t0148500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2278748	2278973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149300-02;Name=OsNip_11t0149300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0149300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2279082	2279344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2279345	2279440	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0149300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0149300-02;protein_id=OsNip_11t0149300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2279688	2279822	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0149300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0149300-02;protein_id=OsNip_11t0149300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2279688	2281615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149300-02;Name=OsNip_11t0149300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0149300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2291824	2292410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2291329	2292410	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0149400-01;Parent=gene:OsNip_11g0149400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2291329	2291462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2291329	2291595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;Name=OsNip_11t0149400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0149400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2291681	2291775	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;protein_id=OsNip_11t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2291907	2292038	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;protein_id=OsNip_11t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2291907	2292410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;Name=OsNip_11t0149400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0149400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2292039	2292410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2321650	2323268	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0149900-00;Parent=gene:OsNip_11g0149900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0149900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2321650	2321734	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2321650	2323268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149900-00;Name=OsNip_11t0149900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0149900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2321735	2323258	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0149900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0149900-00;protein_id=OsNip_11t0149900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2323259	2323268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0149900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2329968	2333238	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0150100;biotype=protein_coding;description=Phosphoglycerate;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2329968	2333238	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0150100-01;Parent=gene:OsNip_11g0150100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2329968	2330020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2329968	2330446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150100-01;Name=OsNip_11t0150100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0150100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2330021	2330446	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150100-01;protein_id=OsNip_11t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2330546	2330762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150100-01;Name=OsNip_11t0150100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0150100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2330546	2330762	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150100-01;protein_id=OsNip_11t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2336101	2336151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2336498	2336523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Name=OsNip_11t0150200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0150200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2336782	2336844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Name=OsNip_11t0150200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0150200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2337649	2337737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;protein_id=OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2337838	2337940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Name=OsNip_11t0150200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0150200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2337838	2337940	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;protein_id=OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2338753	2338890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Name=OsNip_11t0150200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0150200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2338753	2338890	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;protein_id=OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2339428	2339655	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;protein_id=OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2339428	2341117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Name=OsNip_11t0150200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0150200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2339656	2341117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2343622	2343901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2343622	2344670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150400-02;Name=OsNip_11t0150400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0150400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2343902	2344186	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0150400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0150400-02;protein_id=OsNip_11t0150400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2344187	2344670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2343622	2344673	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0150400-01;Parent=gene:OsNip_11g0150400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0150400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2343622	2343901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2343622	2344124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0150400-01;Name=OsNip_11t0150400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0150400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2343902	2344124	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0150400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150400-01;protein_id=OsNip_11t0150400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2344465	2344583	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0150400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0150400-01;protein_id=OsNip_11t0150400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2451942	2452139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152400-01;Name=OsNip_11t0152400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0152400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2455138	2455673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2452773	2454103	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0152500-01;Parent=gene:OsNip_11g0152500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2452773	2453107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2452773	2453325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;Name=OsNip_11t0152500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0152500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2453108	2453325	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;protein_id=OsNip_11t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2453422	2453462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;Name=OsNip_11t0152500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0152500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2453422	2453462	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;protein_id=OsNip_11t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2453676	2453737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;Name=OsNip_11t0152500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0152500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2453676	2453737	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0152500-01;protein_id=OsNip_11t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2491640	2491745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2490716	2490913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2490716	2491687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153300-02;Name=OsNip_11t0153300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0153300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2490914	2491639	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0153300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0153300-02;protein_id=OsNip_11t0153300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2491640	2491687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2500437	2505233	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0153400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2500437	2505233	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0153400-01;Parent=gene:OsNip_11g0153400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0153400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2500437	2500932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2500933	2501321	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0153400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0153400-01;protein_id=OsNip_11t0153400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2503497	2503616	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153400-01;Name=OsNip_11t0153400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0153400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2503497	2503616	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0153400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0153400-01;protein_id=OsNip_11t0153400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2504087	2504317	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0153400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0153400-01;protein_id=OsNip_11t0153400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2503241	2503371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2503496	2503616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2504087	2504288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2504289	2504312	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0153450-00;Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;protein_id=OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2504382	2504621	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0153450-00;Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;protein_id=OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2504382	2505028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;Name=OsNip_11t0153450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0153450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2504622	2505028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2506894	2508402	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0153500;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2506941	2507007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;Name=OsNip_11t0153500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0153500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2506941	2507007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2507258	2507321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2507258	2508402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;Name=OsNip_11t0153500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0153500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2507322	2508197	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0153500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;protein_id=OsNip_11t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2508198	2508402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	2506894	2508385	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0153500-02;Parent=gene:OsNip_11g0153500;transcript_id=OsNip_11t0153500-02;Tag=IsoSeq:G15644.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7103.1
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Chr11	TAMA	exon	2507250	2508385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0153500-02;Name=OsNip_11t0153500-02;exon_id=OsNip_11t0153500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15644.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7103.1;prot_id "UniRef90_K3Y9J1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2532925	2532996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154000-00;Name=OsNip_11t0154000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2539779	2542990	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0154300-01;Parent=gene:OsNip_11g0154300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0154300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2539779	2540408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Name=OsNip_11t0154300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2540404	2540408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2542560	2542716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Name=OsNip_11t0154300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2542560	2542716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2542815	2542990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Name=OsNip_11t0154300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2542815	2542990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2550551	2552963	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0154500;Name=NAC17;biotype=protein_coding;description=Blast;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2550551	2552963	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0154500-01;Parent=gene:OsNip_11g0154500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0154500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2550551	2550704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2550551	2551211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;Name=OsNip_11t0154500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2550705	2551211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;protein_id=OsNip_11t0154500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2551296	2551673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;protein_id=OsNip_11t0154500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2551296	2552963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;Name=OsNip_11t0154500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2551674	2552963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2550674	2551929	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0154500-02;Parent=gene:OsNip_11g0154500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0154500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2550674	2550704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2550674	2551211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;Name=OsNip_11t0154500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2550705	2551211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;protein_id=OsNip_11t0154500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2551296	2551673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;protein_id=OsNip_11t0154500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2551296	2551929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;Name=OsNip_11t0154500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2551674	2551929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2554039	2554803	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0154700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2554039	2554803	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0154700-00;Parent=gene:OsNip_11g0154700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0154700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2554039	2554230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2554039	2554803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154700-00;Name=OsNip_11t0154700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2554231	2554803	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0154700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0154700-00;protein_id=OsNip_11t0154700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2560816	2563634	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0154900;Name=OsNip_bZIP80;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2560816	2563634	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0154900-01;Parent=gene:OsNip_11g0154900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2560816	2560953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2560816	2561106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2560954	2561106	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2561177	2561389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2561177	2561389	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2561483	2561560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2561483	2561560	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2561670	2561735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2561670	2561735	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2561897	2561959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2561897	2561959	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2562595	2563206	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0154900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;protein_id=OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2562595	2563634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Name=OsNip_11t0154900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0154900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2563207	2563634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0154900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	2565191	2568470	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0155000;biotype=protein_coding;description=Dcp1-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2565403	2566701	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0155000-01;Parent=gene:OsNip_11g0155000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0155000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2565403	2565985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0155000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2565403	2566701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0155000-01;Name=OsNip_11t0155000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0155000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2565986	2566168	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0155000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0155000-01;protein_id=OsNip_11t0155000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2566169	2566701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0155000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	2565191	2568470	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0155000-02;Parent=gene:OsNip_11g0155000;transcript_id=OsNip_11t0155000-02;Tag=IsoSeq:G15648.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12250.1,Nipponbare.root_G9293.2
Chr11	TAMA	exon	2565191	2565465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0155000-02;Name=OsNip_11t0155000-02;exon_id=OsNip_11t0155000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15648.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12250.1,Nipponbare.root_G9293.2;prot_id "UniRef90_A0A660KNV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	2565192	2565465	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0155000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0155000-02;protein_id=OsNip_11t0155000-02;Tag=IsoSeq:G15648.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12250.1,Nipponbare.root_G9293.2;prot_id "UniRef90_A0A660KNV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	exon	2565575	2565615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0155000-02;Name=OsNip_11t0155000-02;exon_id=OsNip_11t0155000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15648.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12250.1,Nipponbare.root_G9293.2;prot_id "UniRef90_A0A660KNV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	2565575	2565615	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0155000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0155000-02;protein_id=OsNip_11t0155000-02;Tag=IsoSeq:G15648.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12250.1,Nipponbare.root_G9293.2;prot_id "UniRef90_A0A660KNV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2632536	2632728	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0156000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0156000-02;protein_id=OsNip_11t0156000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2638599	2639166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0156100-01;Name=OsNip_11t0156100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0156100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	2640635	2646300	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0156200-01;Parent=gene:OsNip_11g0156200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0156200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2640635	2640842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0156200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2640635	2640985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0156200-01;Name=OsNip_11t0156200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0156200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2640843	2640985	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0156200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0156200-01;protein_id=OsNip_11t0156200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2641129	2641178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0156200-01;Name=OsNip_11t0156200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0156200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2734307	2734441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;Name=OsNip_11t0157100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0157100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2734307	2734441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2734676	2735466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	2734676	2736643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;Name=OsNip_11t0157100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0157100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2735467	2736273	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0157100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;protein_id=OsNip_11t0157100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2736274	2736643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	2730121	2736641	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0157100-03;Parent=gene:OsNip_11g0157100;transcript_id=OsNip_11t0157100-03;Tag=IsoSeq:G15653.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12255.3,Nipponbare.root_G9295.1
Chr11	TAMA	exon	2730121	2730322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157100-03;Name=OsNip_11t0157100-03;exon_id=OsNip_11t0157100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15653.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12255.3,Nipponbare.root_G9295.1;prot_id "UniRef90_A0A287DXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	2764271	2764366	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0157400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0157400-01;protein_id=OsNip_11t0157400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2764538	2764949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0157400-01;Name=OsNip_11t0157400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0157400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2817601	2817786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0158400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	2958699	2958811	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0160700-01;Name=OsNip_11t0160700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0160700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3026703	3026740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0161900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3026741	3027364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0161900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0161900-00;protein_id=OsNip_11t0161900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3027365	3027395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0161900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3027714	3031891	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0162000-01;Parent=gene:OsNip_11g0162000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0162000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3027714	3027999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0162000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3110576	3112429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0163800-01;Name=OsNip_11t0163800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0163800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3127493	3128785	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0164100-00;Parent=gene:OsNip_11g0164100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0164100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3127493	3127669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0164100-00;Name=OsNip_11t0164100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0164100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3127493	3127669	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0164100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0164100-00;protein_id=OsNip_11t0164100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3128572	3128682	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0164100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0164100-00;protein_id=OsNip_11t0164100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3128572	3128785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0164100-00;Name=OsNip_11t0164100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0164100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3131935	3136630	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0164200-00;Parent=gene:OsNip_11g0164200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0164200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3184544	3184654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3185015	3185112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3233723	3233920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3234207	3234303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3234207	3234303	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3234655	3234797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3234910	3234949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3234910	3234949	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3235314	3235366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3235314	3235366	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3235490	3235563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3235490	3235563	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3235682	3235764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3235682	3235764	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3235888	3235956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3235888	3235956	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3236057	3236098	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0166800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;protein_id=OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3236057	3236100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Name=OsNip_11t0166800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0166800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3236099	3236100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0166800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	3233921	3234789	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0166866;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3307571	3307681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0168500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3315686	3315687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3315688	3315987	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0168600-01;protein_id=OsNip_11t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3315988	3316207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3332449	3338962	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0169100-01;Parent=gene:OsNip_11g0169100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0169100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3333211	3333354	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0169100-01;Name=OsNip_11t0169100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0169100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3337106	3337174	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0169100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0169100-01;protein_id=OsNip_11t0169100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3338118	3338246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0169100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0169100-01;protein_id=OsNip_11t0169100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3338118	3338962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0169100-01;Name=OsNip_11t0169100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0169100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3338247	3338962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0169100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3342973	3344217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0169200-00;Name=OsNip_11t0169200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0169200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3342973	3344217	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0169200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0169200-00;protein_id=OsNip_11t0169200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3344309	3344506	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0169200-00;Name=OsNip_11t0169200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0169200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3344309	3344506	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0169200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0169200-00;protein_id=OsNip_11t0169200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	3342980	3344492	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0169266;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3342980	3344492	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0169266-00;Parent=gene:OsNip_11g0169266;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0169266-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3432042	3433332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0170400-01;Name=OsNip_11t0170400-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0170400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3465614	3466042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0170900-01;Name=OsNip_11t0170900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0170900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3465614	3466042	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0170900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0170900-01;protein_id=OsNip_11t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3467906	3467944	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0170900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0170900-01;protein_id=OsNip_11t0170900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3467906	3467995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0170900-01;Name=OsNip_11t0170900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0170900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3492862	3493262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0171400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3627548	3630209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173432-00;Name=OsNip_11t0173432-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0173432-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3627548	3630209	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0173432-00;Parent=transcript:OsNip_11t0173432-00;protein_id=OsNip_11t0173432-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3630326	3630642	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0173432-00;Parent=transcript:OsNip_11t0173432-00;protein_id=OsNip_11t0173432-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3641060	3642445	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0173550-01;Parent=transcript:OsNip_11t0173550-01;protein_id=OsNip_11t0173550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3642446	3643539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3643642	3644132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3649441	3653004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173600-01;Name=OsNip_11t0173600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0173600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3653318	3653629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173600-01;Name=OsNip_11t0173600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0173600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	3652355	3652735	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0173750;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	3652355	3652735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173750-00;Name=OsNip_11t0173750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0173750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3652355	3652735	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0173750-00;Parent=transcript:OsNip_11t0173750-00;protein_id=OsNip_11t0173750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3656726	3658094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3658095	3660768	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0173800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0173800-01;protein_id=OsNip_11t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	3660888	3661255	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0173800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0173800-01;protein_id=OsNip_11t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3660888	3661466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173800-01;Name=OsNip_11t0173800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0173800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3661256	3661466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	3664612	3667770	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0173900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	3664612	3667770	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0173900-00;Parent=gene:OsNip_11g0173900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0173900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	3664612	3667288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0173900-00;Name=OsNip_11t0173900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0173900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3816335	3816699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0176300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3834294	3834394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0177200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4043518	4044042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0180800-01;Name=OsNip_11t0180800-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0180800-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4043518	4044042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4045535	4045579	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4047461	4048417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0180800-01;Name=OsNip_11t0180800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0180800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4047461	4048417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4122540	4123510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182100-01;Name=OsNip_11t0182100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0182100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4128533	4130570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0182200-01;Parent=gene:OsNip_11g0182200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0182200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4128533	4128671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4128672	4129586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0182200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0182200-01;protein_id=OsNip_11t0182200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4130134	4130562	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0182200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0182200-01;protein_id=OsNip_11t0182200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4130134	4130570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-01;Name=OsNip_11t0182200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0182200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4128559	4128671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4128559	4129586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;Name=OsNip_11t0182200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0182200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4128672	4129586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0182200-02;Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;protein_id=OsNip_11t0182200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4130134	4130538	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0182200-02;Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;protein_id=OsNip_11t0182200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4130134	4130545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;Name=OsNip_11t0182200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0182200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4130539	4130545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4134329	4140479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0182400-01;Parent=gene:OsNip_11g0182400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0182400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4134329	4134726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4134329	4135093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182400-01;Name=OsNip_11t0182400-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0182400-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4135698	4135782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0182400-01;Name=OsNip_11t0182400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0182400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4295458	4295575	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0184800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0184800-01;protein_id=OsNip_11t0184800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4315043	4315615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0185100-01;Name=OsNip_11t0185100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0185100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4315124	4315465	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0185100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0185100-01;protein_id=OsNip_11t0185100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4385683	4385955	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0186300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0186300-01;protein_id=OsNip_11t0186300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4386084	4386278	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0186300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0186300-01;protein_id=OsNip_11t0186300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4386965	4387385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0186300-01;Name=OsNip_11t0186300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0186300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4387179	4387385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0186300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4387512	4397808	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0186400-00;Parent=gene:OsNip_11g0186400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0186400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4387512	4387834	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0186400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4387512	4387922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0186400-00;Name=OsNip_11t0186400-00-E30;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0186400-00-E30;rank=30;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	4788718	4789379	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195500-02;Tag=IsoSeq:G15740.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12327.4,Nipponbare.root_G9333.2;prot_id "UniRef90_A0A287NWB2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4799955	4800309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-01;Name=OsNip_11t0195600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0195600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4800414	4801052	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0195600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0195600-01;protein_id=OsNip_11t0195600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4800414	4801300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-01;Name=OsNip_11t0195600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0195600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4801053	4801300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	CDS	4799323	4799858	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0195600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;protein_id=OsNip_11t0195600-02;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	4799955	4800312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;Name=OsNip_11t0195600-02;exon_id=OsNip_11t0195600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	4799955	4800312	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0195600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;protein_id=OsNip_11t0195600-02;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	4800417	4801273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;Name=OsNip_11t0195600-02;exon_id=OsNip_11t0195600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	4800417	4801046	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0195600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;protein_id=OsNip_11t0195600-02;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	4799322	4799322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	4801050	4801273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195600-02;Tag=IsoSeq:G15741.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12328.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4799381	4801048	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0195650-00;Parent=gene:OsNip_11g0195650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4799381	4799857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Name=OsNip_11t0195650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4799381	4799857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4799954	4800060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4799954	4800309	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Name=OsNip_11t0195650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0195650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4800061	4800309	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0195650-00;Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;protein_id=OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4800414	4801046	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0195650-00;Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;protein_id=OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4800414	4801048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Name=OsNip_11t0195650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4801047	4801048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	4805210	4806760	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0195700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4805210	4806760	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0195700-01;Parent=gene:OsNip_11g0195700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0195700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4805210	4805620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;Name=OsNip_11t0195700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4805210	4805620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4806257	4806264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4806257	4806760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;Name=OsNip_11t0195700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4806265	4806579	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0195700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;protein_id=OsNip_11t0195700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4806580	4806760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4806222	4806779	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0195750-01;Parent=gene:OsNip_11g0195750;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0195750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4806222	4806779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195750-01;Name=OsNip_11t0195750-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195750-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	4807432	4808617	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0195800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4807432	4808617	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0195800-01;Parent=gene:OsNip_11g0195800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0195800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4807432	4807655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4807432	4808617	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0195800-01;Name=OsNip_11t0195800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0195800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4892372	4892445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4892446	4892862	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0197500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0197500-01;protein_id=OsNip_11t0197500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4892863	4893134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4894638	4899862	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0197600-01;Parent=gene:OsNip_11g0197600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4894638	4895011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	4895764	4895927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;Name=OsNip_11t0197600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0197600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4896002	4896103	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0197600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;protein_id=OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4896457	4896994	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0197600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;protein_id=OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4899440	4899574	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0197600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;protein_id=OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4899440	4899862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;Name=OsNip_11t0197600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0197600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4899575	4899862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4907179	4910693	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0197725-01;Parent=gene:OsNip_11g0197725;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0197725-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4907179	4908322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197725-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4907179	4910693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197725-01;Name=OsNip_11t0197725-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0197725-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4908323	4908658	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0197725-01;Parent=transcript:OsNip_11t0197725-01;protein_id=OsNip_11t0197725-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4908659	4910693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197725-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	4918782	4919895	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0197975;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	4918782	4919895	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0197975-00;Parent=gene:OsNip_11g0197975;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0197975-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4918782	4919401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197975-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	4918782	4919895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197975-00;Name=OsNip_11t0197975-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0197975-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	4919402	4919836	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0197975-00;Parent=transcript:OsNip_11t0197975-00;protein_id=OsNip_11t0197975-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4919837	4919895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0197975-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	4918793	4923725	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0198100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5073803	5075170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Name=OsNip_11t0200950-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0200950-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5073803	5075170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5075424	5075747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5075424	5075788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Name=OsNip_11t0200950-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0200950-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5081413	5081568	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Name=OsNip_11t0200950-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0200950-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5081413	5081568	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0200950-01;Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;protein_id=OsNip_11t0200950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5081792	5082692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Name=OsNip_11t0200950-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0200950-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5082808	5083022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5074034	5083018	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0200950-03;Parent=gene:OsNip_11g0200950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5074034	5074820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5080789	5081052	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0200950-03;Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;protein_id=OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5081124	5081319	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0200950-03;Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;protein_id=OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5081792	5082692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;Name=OsNip_11t0200950-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0200950-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5082665	5082692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5082808	5083018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;Name=OsNip_11t0200950-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0200950-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5082808	5083018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0200950-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5076111	5083020	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0200950-02;Parent=gene:OsNip_11g0200950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0200950-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5148658	5148936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0201966-00;Name=OsNip_11t0201966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0201966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5148658	5148936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0201966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5149121	5149330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0201966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5197023	5197162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0202900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5238445	5239971	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0203400-01;Parent=gene:OsNip_11g0203400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0203400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5238445	5239193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0203400-01;Name=OsNip_11t0203400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0203400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5239269	5239417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0203400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5239269	5239971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0203400-01;Name=OsNip_11t0203400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0203400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5239418	5239597	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0203400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0203400-01;protein_id=OsNip_11t0203400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5239598	5239971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0203400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5258104	5259500	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0204100-02;Parent=gene:OsNip_11g0204100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0204100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5258104	5259163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5258104	5259500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-02;Name=OsNip_11t0204100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0204100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5259164	5259475	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0204100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0204100-02;protein_id=OsNip_11t0204100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5259476	5259500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5258255	5266068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0204100-01;Parent=gene:OsNip_11g0204100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5258255	5258571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5258255	5258672	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;Name=OsNip_11t0204100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0204100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5265349	5265383	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0204100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;protein_id=OsNip_11t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5265503	5265555	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0204100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;protein_id=OsNip_11t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5265503	5266068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;Name=OsNip_11t0204100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0204100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5265556	5266068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	5273137	5275359	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0204500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5322579	5323208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205300-00;Name=OsNip_11t0205300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0205300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5324768	5327659	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0205500-02;Parent=gene:OsNip_11g0205500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0205500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5325037	5325287	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0205500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0205500-02;protein_id=OsNip_11t0205500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5325413	5325662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205500-02;Name=OsNip_11t0205500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0205500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5325413	5325662	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0205500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0205500-02;protein_id=OsNip_11t0205500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5325763	5327613	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0205500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0205500-02;protein_id=OsNip_11t0205500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5325763	5327659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205500-02;Name=OsNip_11t0205500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0205500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5325801	5327613	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0205500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0205500-01;protein_id=OsNip_11t0205500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5325801	5327659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205500-01;Name=OsNip_11t0205500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0205500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5327614	5327659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5336615	5339804	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0205800-01;Parent=gene:OsNip_11g0205800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5336615	5339217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5336615	5339804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0205800-01;Name=OsNip_11t0205800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0205800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5339218	5339442	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0205800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0205800-01;protein_id=OsNip_11t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5378625	5378867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0206700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5378625	5379261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0206700-02;Name=OsNip_11t0206700-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0206700-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5426183	5427714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0207100-01;Name=OsNip_11t0207100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0207100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5566793	5566811	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0208600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0208600-01;protein_id=OsNip_11t0208600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5568047	5568307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0208600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5569289	5571785	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0208651-00;Parent=gene:OsNip_11g0208651;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0208651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5569289	5571308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0208651-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5571309	5571764	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0208651-00;Parent=transcript:OsNip_11t0208651-00;protein_id=OsNip_11t0208651-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5571765	5571785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0208651-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5580098	5582565	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0208700-00;Parent=gene:OsNip_11g0208700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0208700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5580098	5580665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0208700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5580735	5580849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0208700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5617115	5618397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209200-01;Name=OsNip_11t0209200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0209200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5633618	5633873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5646876	5647032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5647140	5647296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5647140	5647301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;Name=OsNip_11t0209600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0209600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5647297	5647301	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0209600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;protein_id=OsNip_11t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5647411	5648416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;Name=OsNip_11t0209600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0209600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5648399	5648416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	5646834	5647032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Name=OsNip_11t0209600-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0209600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5646834	5647032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5647140	5647296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5647140	5647301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Name=OsNip_11t0209600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0209600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5647297	5647301	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0209600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;protein_id=OsNip_11t0209600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5647411	5648371	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0209600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;protein_id=OsNip_11t0209600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5647411	5648372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Name=OsNip_11t0209600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0209600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5648372	5648372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	5653392	5663574	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0209700;Name=OsNip_PI4K1;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5656473	5661850	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0209700-02;Parent=gene:OsNip_11g0209700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0209700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5656473	5656504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0209700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	5996508	5997392	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0215100-01;Parent=gene:OsNip_11g0215100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0215100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5996508	5996588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	5996508	5997392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215100-01;Name=OsNip_11t0215100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0215100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	5996589	5997134	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0215100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0215100-01;protein_id=OsNip_11t0215100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5997135	5997392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6001907	6002424	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0215300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6001907	6002181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215300-00;Name=OsNip_11t0215300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0215300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6001907	6002181	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0215300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0215300-00;protein_id=OsNip_11t0215300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6002277	6002424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215300-00;Name=OsNip_11t0215300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0215300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6002277	6002424	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0215300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0215300-00;protein_id=OsNip_11t0215300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6020972	6024097	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0215400;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6020972	6024097	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0215400-01;Parent=gene:OsNip_11g0215400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6021062	6022218	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0215400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0215400-01;protein_id=OsNip_11t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6023961	6024090	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0215400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0215400-01;protein_id=OsNip_11t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6023961	6024097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215400-01;Name=OsNip_11t0215400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0215400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6024091	6024097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6059390	6065434	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0216000;biotype=protein_coding;description=Pyruvate;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6059390	6065339	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0216000-01;Parent=gene:OsNip_11g0216000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6059390	6059498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6059390	6059567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6059499	6059567	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6060120	6060216	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6060120	6060216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6060315	6060412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6061354	6061509	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6061354	6061509	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6061805	6061882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6062675	6062755	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6063261	6063329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6063261	6063329	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6063416	6063505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6063820	6063964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6063820	6063964	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6064203	6064298	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0216000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;protein_id=OsNip_11t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6064380	6064447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216000-01;Name=OsNip_11t0216000-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216000-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6066387	6066797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216100-01;Name=OsNip_11t0216100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0216100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6068242	6071393	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0216300-02;Parent=gene:OsNip_11g0216300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6068242	6068582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6068242	6068653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;Name=OsNip_11t0216300-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0216300-01-E15;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6068583	6068653	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0216300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;protein_id=OsNip_11t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6068735	6068804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;Name=OsNip_11t0216300-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0216300-01-E14;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6068735	6068804	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0216300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;protein_id=OsNip_11t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6068915	6069062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;Name=OsNip_11t0216300-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0216300-01-E13;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6068915	6069062	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0216300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0216300-02;protein_id=OsNip_11t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6290110	6290209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0220450-00;Name=OsNip_11t0220450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0220450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6299720	6300307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0220500-00;Name=OsNip_11t0220500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0220500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6300361	6300875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0220500-00;Name=OsNip_11t0220500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0220500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6300361	6300875	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0220500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0220500-00;protein_id=OsNip_11t0220500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6358041	6358201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0221300-00;Name=OsNip_11t0221300-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0221300-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6358041	6358201	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0221300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0221300-00;protein_id=OsNip_11t0221300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6511162	6511215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6519995	6521680	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0224600-01;Parent=gene:OsNip_11g0224600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0224600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6519995	6520150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6519995	6521680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224600-01;Name=OsNip_11t0224600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0224600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6520151	6521629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0224600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0224600-01;protein_id=OsNip_11t0224600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6521630	6521680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6530949	6531365	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0224800-00;Parent=transcript:OsNip_11t0224800-00;protein_id=OsNip_11t0224800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6531456	6532307	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0224800-00;Parent=transcript:OsNip_11t0224800-00;protein_id=OsNip_11t0224800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6531456	6532328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224800-00;Name=OsNip_11t0224800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0224800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6532308	6532328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6532575	6536947	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0224900;Name=OsNip_11gRGA3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6532813	6535926	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0224900-00;Parent=gene:OsNip_11g0224900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0224900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6532813	6532860	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6532813	6535926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224900-00;Name=OsNip_11t0224900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0224900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6532861	6535926	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0224900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0224900-00;protein_id=OsNip_11t0224900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	6532575	6535836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0224900-01;Tag=IsoSeq:G15797.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9361.1;prot_id "UniRef90_K3ZQI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6541153	6541347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225000-01;Name=OsNip_11t0225000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0225000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6541321	6541347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6541426	6541618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6541924	6546026	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0225100-01;Parent=gene:OsNip_11g0225100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0225100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6541924	6542300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6541924	6544503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;Name=OsNip_11t0225100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0225100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6542301	6544503	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0225100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;protein_id=OsNip_11t0225100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6544897	6545738	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0225100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;protein_id=OsNip_11t0225100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6544897	6546026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;Name=OsNip_11t0225100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6545739	6546026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6551769	6551992	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0225200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6551769	6551992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0225200-00;Parent=gene:OsNip_11g0225200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0225200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6551769	6551991	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0225200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0225200-00;protein_id=OsNip_11t0225200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6551769	6551992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225200-00;Name=OsNip_11t0225200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6551992	6551992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6554522	6561687	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0225300;Name=OsNip_11gRGA5;biotype=protein_coding;description=Nucleotide;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6554522	6561687	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0225300-01;Parent=gene:OsNip_11g0225300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0225300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6554522	6554527	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6554522	6555357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;Name=OsNip_11t0225300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6554528	6555357	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0225300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;protein_id=OsNip_11t0225300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6556476	6558608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;Name=OsNip_11t0225300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0225300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6556476	6558608	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0225300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;protein_id=OsNip_11t0225300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6561364	6561687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6554554	6555417	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0225300-02;Parent=gene:OsNip_11g0225300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6554554	6554554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6554554	6555417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-02;Name=OsNip_11t0225300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6554555	6555361	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0225300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0225300-02;protein_id=OsNip_11t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6555362	6555417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6554549	6558264	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0225566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6554549	6558264	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0225566-00;Parent=gene:OsNip_11g0225566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6554549	6554659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6554549	6555393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Name=OsNip_11t0225566-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225566-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6554660	6555115	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0225566-00;Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;protein_id=OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6555116	6555393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6556515	6557659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Name=OsNip_11t0225566-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225566-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6556515	6557659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6557714	6558264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Name=OsNip_11t0225566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0225566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6557714	6558264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0225566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6594662	6595795	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0226100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6594662	6595795	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0226100-00;Parent=gene:OsNip_11g0226100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0226100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6594662	6594780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226100-00;Name=OsNip_11t0226100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0226100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6594662	6594780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6594922	6594942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6594922	6595150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226100-00;Name=OsNip_11t0226100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0226100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6594943	6595150	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0226100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0226100-00;protein_id=OsNip_11t0226100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6633737	6635869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226900-01;Name=OsNip_11t0226900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0226900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6638398	6640335	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0226933-01;Parent=transcript:OsNip_11t0226933-01;protein_id=OsNip_11t0226933-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6640336	6640336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226933-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	6638298	6642426	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0226933-02;Parent=gene:OsNip_11g0226933;transcript_id=OsNip_11t0226933-02;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1
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Chr11	TAMA	exon	6638298	6641132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226933-02;Name=OsNip_11t0226933-02;exon_id=OsNip_11t0226933-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1;prot_id "UniRef90_F2DTY2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	CDS	6640761	6640874	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0226933-02;Parent=transcript:OsNip_11t0226933-02;protein_id=OsNip_11t0226933-02;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1;prot_id "UniRef90_F2DTY2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	6642365	6642426	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226933-02;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1;prot_id "UniRef90_F2DTY2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	6640875	6641132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226933-02;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1;prot_id "UniRef90_F2DTY2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	6638298	6640758	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226933-02;Tag=IsoSeq:G15801.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12374.1,Nipponbare.leaf_G7156.1;prot_id "UniRef90_F2DTY2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6646291	6647404	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0226966;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6646291	6647404	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0226966-00;Parent=gene:OsNip_11g0226966;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0226966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6646291	6646432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6646291	6646451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0226966-00;Name=OsNip_11t0226966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0226966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6646433	6646451	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0226966-00;Parent=transcript:OsNip_11t0226966-00;protein_id=OsNip_11t0226966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6650052	6650239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6679058	6681504	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0227250-01;Parent=gene:OsNip_11g0227250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0227250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6679058	6680148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6680149	6680526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0227250-01;Parent=transcript:OsNip_11t0227250-01;protein_id=OsNip_11t0227250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6680527	6681195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6681275	6681504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227250-01;Name=OsNip_11t0227250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0227250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6681275	6681504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6685637	6691859	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0227300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6685665	6687640	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0227300-01;Parent=gene:OsNip_11g0227300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0227300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6685665	6686003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6685665	6686573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227300-01;Name=OsNip_11t0227300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0227300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6686004	6686573	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0227300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0227300-01;protein_id=OsNip_11t0227300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6686769	6687638	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0227300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0227300-01;protein_id=OsNip_11t0227300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6686769	6687640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0227300-01;Name=OsNip_11t0227300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0227300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6881844	6881848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6881849	6884566	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0229400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0229400-01;protein_id=OsNip_11t0229400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6884567	6884768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	6881868	6884810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-02;Name=OsNip_11t0229400-02;exon_id=OsNip_11t0229400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15809.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12378.1;prot_id "UniRef90_I1IMF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	6878761	6878821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-02;Tag=IsoSeq:G15809.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12378.1;prot_id "UniRef90_I1IMF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	6879277	6879344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-02;Tag=IsoSeq:G15809.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12378.1;prot_id "UniRef90_I1IMF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	6881868	6884810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229400-02;Tag=IsoSeq:G15809.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12378.1;prot_id "UniRef90_I1IMF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	6888365	6888425	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229500-01;Name=OsNip_11t0229500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0229500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6888365	6888425	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6893301	6893305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6893306	6896011	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0229500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0229500-01;protein_id=OsNip_11t0229500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6896012	6896307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	6891118	6897208	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0229600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	6891118	6897206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0229600-02;Parent=gene:OsNip_11g0229600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6891118	6893733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6891118	6894035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Name=OsNip_11t0229600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0229600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6893734	6894035	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0229600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;protein_id=OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6894158	6894176	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0229600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;protein_id=OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6894158	6894447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Name=OsNip_11t0229600-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0229600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6894177	6894447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6894537	6894674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6894754	6894818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6894897	6895924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6897015	6897206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Name=OsNip_11t0229600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0229600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6897015	6897206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6894105	6894447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6894537	6894674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;Name=OsNip_11t0229600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0229600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6895850	6895924	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0229600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;protein_id=OsNip_11t0229600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	6897015	6897206	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0229600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;protein_id=OsNip_11t0229600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	6897015	6897208	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;Name=OsNip_11t0229600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0229600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6897207	6897208	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0229600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	7124521	7124770	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0234100-01;Name=OsNip_11t0234100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0234100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7494023	7494326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0240600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7494025	7494326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0240600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7495335	7495335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0240600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	7501175	7503547	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0240800-02;Parent=gene:OsNip_11g0240800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0240800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7501175	7503257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0240800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7603768	7603829	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0242100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;protein_id=OsNip_11t0242100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7603913	7604837	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0242100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;protein_id=OsNip_11t0242100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	7605601	7605891	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;Name=OsNip_11t0242100-02-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0242100-02-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7605601	7605891	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0242100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;protein_id=OsNip_11t0242100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7606359	7606629	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0242100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;protein_id=OsNip_11t0242100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	7606359	7606762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;Name=OsNip_11t0242100-02-E20;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0242100-02-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7606630	7606762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0242100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	7603616	7606460	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0242150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7804503	7804997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0245400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7804998	7806044	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0245400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0245400-01;protein_id=OsNip_11t0245400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7806045	7806059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0245400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	7810223	7810985	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0245466-00;Parent=gene:OsNip_11g0245466;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0245466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7810223	7810784	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0245466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	7810223	7810985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0245466-00;Name=OsNip_11t0245466-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0245466-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7810785	7810985	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0245466-00;Parent=transcript:OsNip_11t0245466-00;protein_id=OsNip_11t0245466-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	7817994	7824068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0245500-01;Parent=gene:OsNip_11g0245500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0245500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7817994	7818238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0245500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	7935476	7935584	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0246950-00;Parent=transcript:OsNip_11t0246950-00;protein_id=OsNip_11t0246950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8099088	8099530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0249900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	8098086	8099486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0249900-03;Tag=IsoSeq:G15847.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12406.4;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZCT5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8100740	8101012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0250000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	8101808	8102012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0250000-01;Name=OsNip_11t0250000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0250000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8104471	8104587	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0250000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0250000-01;protein_id=OsNip_11t0250000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8104686	8105009	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0250000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0250000-01;protein_id=OsNip_11t0250000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8100740	8101012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0250000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	8163352	8169942	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0251400-02;Parent=gene:OsNip_11g0251400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0251400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8163352	8163571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0251400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8163572	8164171	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0251400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0251400-02;protein_id=OsNip_11t0251400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8165066	8165595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0251400-02;Name=OsNip_11t0251400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0251400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8165066	8165595	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0251400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0251400-02;protein_id=OsNip_11t0251400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8165891	8166515	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0251400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0251400-02;protein_id=OsNip_11t0251400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8568422	8570477	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0258500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0258500-00;protein_id=OsNip_11t0258500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8571320	8572176	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0258500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0258500-00;protein_id=OsNip_11t0258500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	8583891	8587507	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0258700;Name=OsNip_bHLH014;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8585948	8586007	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0258700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0258700-00;protein_id=OsNip_11t0258700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8587370	8587507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0258700-00;Name=OsNip_11t0258700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0258700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8587370	8587507	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0258700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0258700-00;protein_id=OsNip_11t0258700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	8597091	8598972	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0258900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	8597091	8598972	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0258900-01;Parent=gene:OsNip_11g0258900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0258900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8597091	8597420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0258900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8597091	8598972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0258900-01;Name=OsNip_11t0258900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0258900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8597421	8597663	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0258900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0258900-01;protein_id=OsNip_11t0258900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8597664	8598972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0258900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	8648863	8650862	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0259700-01;Parent=gene:OsNip_11g0259700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8648863	8648931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8648863	8649006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;Name=OsNip_11t0259700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0259700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8648932	8649006	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0259700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;protein_id=OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8649406	8649828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0259700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;protein_id=OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8649968	8650234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;Name=OsNip_11t0259700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0259700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8649968	8650234	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0259700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;protein_id=OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8650399	8650800	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0259700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0259700-01;protein_id=OsNip_11t0259700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8842487	8842768	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0262200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0262200-00;protein_id=OsNip_11t0262200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	8860655	8862772	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0262500-00;Parent=gene:OsNip_11g0262500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0262500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8860685	8861566	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0262500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0262500-00;protein_id=OsNip_11t0262500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	8976315	8977112	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0264300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0264300-02;protein_id=OsNip_11t0264300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8977113	8977206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0264300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	8977314	8977435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0264300-02;Name=OsNip_11t0264300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0264300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8977314	8977435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0264300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8972034	8972935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0264300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9110513	9112746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0265900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9109503	9109605	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	9109503	9110432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;Name=OsNip_11t0265900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0265900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	9109606	9110432	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0265900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;protein_id=OsNip_11t0265900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	9110513	9112460	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0265900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;protein_id=OsNip_11t0265900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	9110513	9112744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;Name=OsNip_11t0265900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0265900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9112461	9112744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0265900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	9113889	9118446	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0266000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	9187679	9192837	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0267300-01;Parent=gene:OsNip_11g0267300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9187679	9187846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	9187847	9187967	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0267300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0267300-01;protein_id=OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	9189657	9189714	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0267300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0267300-01;protein_id=OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9189877	9190556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9190947	9191923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0267300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9472371	9472564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0271675-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9798418	9798491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	9798418	9799044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0276100-01;Name=OsNip_11t0276100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0276100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9798816	9799044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0276100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	9815907	9820202	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0276300-01;Parent=gene:OsNip_11g0276300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0276300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	9819011	9819087	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0276300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0276300-01;protein_id=OsNip_11t0276300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9820176	9820202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0276300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9896885	9896892	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0278300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	9919810	9924870	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0278900-01;Parent=gene:OsNip_11g0278900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0278900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	9919810	9924870	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0278900-01;Name=OsNip_11t0278900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0278900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9922631	9924870	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0278900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10076555	10077010	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0282600-00;Parent=transcript:OsNip_11t0282600-00;protein_id=OsNip_11t0282600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10076555	10077237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282600-00;Name=OsNip_11t0282600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0282600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10081836	10086180	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0282700-01;Parent=gene:OsNip_11g0282700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0282700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10081836	10081872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10085865	10086151	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0282700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0282700-01;protein_id=OsNip_11t0282700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10085865	10086180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282700-01;Name=OsNip_11t0282700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0282700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10086152	10086180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10096294	10102857	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0282900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10096294	10096418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-02;Name=OsNip_11t0282900-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0282900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10101006	10101060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10101468	10101592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10101750	10102730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10101659	10102857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-01;Name=OsNip_11t0282900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0282900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10102326	10102857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10101468	10101592	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0282800-00;Parent=transcript:OsNip_11t0282800-00;protein_id=OsNip_11t0282800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10101750	10102638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0282800-00;Name=OsNip_11t0282800-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0282800-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10101750	10102638	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0282800-00;Parent=transcript:OsNip_11t0282800-00;protein_id=OsNip_11t0282800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10476976	10477103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0289700-01;Name=OsNip_11t0289700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0289700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10476976	10477103	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0289700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0289700-01;protein_id=OsNip_11t0289700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10477384	10477474	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0289700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0289700-01;protein_id=OsNip_11t0289700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10477384	10477658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0289700-01;Name=OsNip_11t0289700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0289700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10477475	10477658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0289700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10538027	10539355	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0290600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10538027	10539355	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0290600-01;Parent=gene:OsNip_11g0290600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0290600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10538027	10538822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10538027	10538868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;Name=OsNip_11t0290600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0290600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10538823	10538868	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0290600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;protein_id=OsNip_11t0290600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10538999	10539174	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0290600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;protein_id=OsNip_11t0290600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10538999	10539355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;Name=OsNip_11t0290600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0290600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10539175	10539355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0290600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10575509	10582899	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0291000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10575509	10582899	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0291000-00;Parent=gene:OsNip_11g0291000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0291000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10575509	10576933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;Name=OsNip_11t0291000-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0291000-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10575509	10576933	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0291000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;protein_id=OsNip_11t0291000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10580527	10580608	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;Name=OsNip_11t0291000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0291000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10580527	10580608	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0291000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;protein_id=OsNip_11t0291000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10580780	10580949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;Name=OsNip_11t0291000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0291000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10580780	10580949	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0291000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;protein_id=OsNip_11t0291000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10582261	10582899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;Name=OsNip_11t0291000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0291000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10582261	10582899	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0291000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0291000-00;protein_id=OsNip_11t0291000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10575531	10583006	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0291201;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10575531	10576888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Name=OsNip_11t0291201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0291201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10575531	10576888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10580500	10580603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Name=OsNip_11t0291201-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0291201-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10580500	10580603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10580775	10580925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Name=OsNip_11t0291201-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0291201-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10580775	10580925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10582232	10582453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10582232	10583006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Name=OsNip_11t0291201-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0291201-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10582454	10582999	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0291201-00;Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;protein_id=OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10583000	10583006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10609806	10612577	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0291450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10609814	10610083	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0291450-00;Parent=gene:OsNip_11g0291450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0291450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10609814	10610083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-00;Name=OsNip_11t0291450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0291450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	10609806	10612577	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0291450-01;Parent=gene:OsNip_11g0291450;transcript_id=OsNip_11t0291450-01;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1
Chr11	TAMA	exon	10612453	10612577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;Name=OsNip_11t0291450-01;exon_id=OsNip_11t0291450-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	10612175	10612344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;Name=OsNip_11t0291450-01;exon_id=OsNip_11t0291450-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	10612175	10612286	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0291450-01;Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;protein_id=OsNip_11t0291450-01;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	10611547	10611644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;Name=OsNip_11t0291450-01;exon_id=OsNip_11t0291450-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	10611547	10611644	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0291450-01;Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;protein_id=OsNip_11t0291450-01;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	10609806	10611430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;Name=OsNip_11t0291450-01;exon_id=OsNip_11t0291450-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	TAMA	five_prime_UTR	10612453	10612577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0291450-01;Tag=IsoSeq:G15889.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9413.1;prot_id "UniRef90_J3N7L2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10654829	10654920	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0292050-00;Parent=transcript:OsNip_11t0292050-00;protein_id=OsNip_11t0292050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10869642	10870127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10869642	10870364	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296001-01;Name=OsNip_11t0296001-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0296001-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10870128	10870364	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0296001-01;Parent=transcript:OsNip_11t0296001-01;protein_id=OsNip_11t0296001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10887102	10892897	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0296500;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10887102	10892897	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0296500-01;Parent=gene:OsNip_11g0296500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10888547	10889785	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0296500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;protein_id=OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10889786	10889790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10890224	10890516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Name=OsNip_11t0296500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0296500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10890224	10890516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10890738	10890871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Name=OsNip_11t0296500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0296500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10890738	10890871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10891969	10892139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Name=OsNip_11t0296500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0296500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10891969	10892139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10892469	10892897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Name=OsNip_11t0296500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0296500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10892469	10892897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10911131	10915851	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0296800;biotype=protein_coding;description=Chromatin;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10911131	10915851	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0296800-01;Parent=gene:OsNip_11g0296800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0296800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10911131	10911432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296800-01;Name=OsNip_11t0296800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0296800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10911131	10911432	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0296800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0296800-01;protein_id=OsNip_11t0296800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10919759	10919959	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0296900-00;Name=OsNip_11t0296900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0296900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10919759	10919959	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0296900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0296900-00;protein_id=OsNip_11t0296900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10925262	10926515	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0297000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10925275	10925985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;Name=OsNip_11t0297000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0297000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10925275	10925985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10926105	10926156	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10926105	10926515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;Name=OsNip_11t0297000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0297000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10926157	10926417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0297000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;protein_id=OsNip_11t0297000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10926418	10926515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	10925262	10926444	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0297000-02;Parent=gene:OsNip_11g0297000;transcript_id=OsNip_11t0297000-02;Tag=IsoSeq:G15894.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9416.1
Chr11	TAMA	exon	10925262	10926444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-02;Name=OsNip_11t0297000-02;exon_id=OsNip_11t0297000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15894.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9416.1;prot_id "UniRef90_B8BK55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	10925264	10925554	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0297000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0297000-02;protein_id=OsNip_11t0297000-02;Tag=IsoSeq:G15894.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9416.1;prot_id "UniRef90_B8BK55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	10925262	10925263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-02;Tag=IsoSeq:G15894.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9416.1;prot_id "UniRef90_B8BK55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	10925558	10926444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297000-02;Tag=IsoSeq:G15894.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9416.1;prot_id "UniRef90_B8BK55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	10935559	10939478	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0297300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	10935559	10939478	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0297300-01;Parent=gene:OsNip_11g0297300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10935559	10935603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10935559	10936029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;Name=OsNip_11t0297300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0297300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10935604	10936029	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0297300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;protein_id=OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10936947	10937228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;Name=OsNip_11t0297300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0297300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10936947	10937228	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0297300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;protein_id=OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10937369	10937538	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;Name=OsNip_11t0297300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0297300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10937369	10937538	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0297300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;protein_id=OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	10937647	10937744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;Name=OsNip_11t0297300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0297300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	10937647	10937744	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0297300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0297300-01;protein_id=OsNip_11t0297300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	10976991	10978662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0297800-01;Name=OsNip_11t0297800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0297800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11003345	11003733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0298200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11003905	11003973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0298200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	11368349	11368591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0302700-01;Name=OsNip_11t0302700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0302700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	11411524	11411733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;Name=OsNip_11t0303500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0303500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11411524	11411733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11411845	11411886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	11411845	11414063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;Name=OsNip_11t0303500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0303500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	11411887	11414061	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0303500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;protein_id=OsNip_11t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11414062	11414063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	11411522	11416179	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0303500-02;Parent=gene:OsNip_11g0303500;transcript_id=OsNip_11t0303500-02;Tag=IsoSeq:G15904.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12444.1
Chr11	TAMA	exon	11415766	11416179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-02;Name=OsNip_11t0303500-02;exon_id=OsNip_11t0303500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15904.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12444.1;prot_id "UniRef90_I1R2T8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	TAMA	five_prime_UTR	11413755	11414841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-02;Tag=IsoSeq:G15904.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12444.1;prot_id "UniRef90_I1R2T8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	11411522	11411733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0303500-02;Tag=IsoSeq:G15904.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12444.1;prot_id "UniRef90_I1R2T8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	11430729	11432962	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0303600;Name=OMT;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	11430729	11432962	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0303600-01;Parent=gene:OsNip_11g0303600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0303600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11573524	11574414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0306100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	11586431	11586836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0306300-01;Name=OsNip_11t0306300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0306300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11586632	11586836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0306300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	11591738	11596168	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0306400-01;Parent=gene:OsNip_11g0306400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11591738	11591839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0306400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11760956	11760956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0308600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11980473	11980537	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0311300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12034676	12034843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312220-00;Name=OsNip_11t0312220-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0312220-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12037411	12037556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312220-00;Name=OsNip_11t0312220-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0312220-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12037697	12037816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312220-00;Name=OsNip_11t0312220-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0312220-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12037936	12038103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312220-00;Name=OsNip_11t0312220-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0312220-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12078190	12078206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312340-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	12136987	12141801	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0312400;Name=ADK-B;biotype=protein_coding;description=Adenylate;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12136987	12137045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12136987	12137154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312400-01;Name=OsNip_11t0312400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0312400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12141050	12141139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0312400-01;Name=OsNip_11t0312400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0312400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12375894	12375960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0351555-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12377152	12377302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0351555-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	12403900	12404346	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0362633;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	12403900	12404295	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0362633-00;Parent=transcript:OsNip_11t0362633-00;protein_id=OsNip_11t0362633-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12403900	12404346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0362633-00;Name=OsNip_11t0362633-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0362633-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12404296	12404346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0362633-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	12406159	12408062	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0368172;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	12406159	12408062	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0368172-01;Parent=gene:OsNip_11g0368172;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0368172-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12406159	12406422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0368172-01;Name=OsNip_11t0368172-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0368172-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12510081	12510497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0412484-01;Name=OsNip_11t0412484-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0412484-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	12856287	12856655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;Name=OsNip_11t0417400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0417400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	12856287	12856655	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0417400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;protein_id=OsNip_11t0417400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12856751	12856868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;Name=OsNip_11t0417400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0417400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	12856751	12856868	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0417400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;protein_id=OsNip_11t0417400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12860600	12860823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;Name=OsNip_11t0417400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0417400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	12860979	12861371	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0417400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;protein_id=OsNip_11t0417400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12860979	12861914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;Name=OsNip_11t0417400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0417400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12861372	12861914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	12900824	12905493	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0417800;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	12900824	12905493	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0417800-01;Parent=gene:OsNip_11g0417800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0417800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12900824	12901466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417800-01;Name=OsNip_11t0417800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0417800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	12905325	12905493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0417800-01;Name=OsNip_11t0417800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0417800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13088669	13097254	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0420200;Name=OsNip_STA257;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13088669	13097254	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0420200-00;Parent=gene:OsNip_11g0420200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0420200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13088669	13088892	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0420200-00;Name=OsNip_11t0420200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0420200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13088669	13088892	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0420200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0420200-00;protein_id=OsNip_11t0420200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13097128	13097254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0420200-00;Name=OsNip_11t0420200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0420200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13097128	13097254	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0420200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0420200-00;protein_id=OsNip_11t0420200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13200164	13202462	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0421800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13200164	13202462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0421800-01;Parent=gene:OsNip_11g0421800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13200164	13200716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13200164	13200773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Name=OsNip_11t0421800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0421800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13200717	13200773	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0421800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;protein_id=OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13201474	13201740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Name=OsNip_11t0421800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0421800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13201474	13201740	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0421800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;protein_id=OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13202041	13202238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Name=OsNip_11t0421800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0421800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13202041	13202238	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0421800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;protein_id=OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13202384	13202389	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0421800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;protein_id=OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13202384	13202462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Name=OsNip_11t0421800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0421800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13202390	13202462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0421800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13207199	13207707	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0422000-01;Parent=gene:OsNip_11g0422000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0422000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13207199	13207499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13207199	13207707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422000-01;Name=OsNip_11t0422000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0422000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13207500	13207703	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0422000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0422000-01;protein_id=OsNip_11t0422000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13207704	13207707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13215413	13217278	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0422100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13215413	13217278	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0422100-01;Parent=gene:OsNip_11g0422100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13215413	13215413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13215413	13216677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Name=OsNip_11t0422100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0422100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13215414	13215893	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0422100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;protein_id=OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13215894	13216677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13216830	13216922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Name=OsNip_11t0422100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0422100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13216830	13216922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13217140	13217278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Name=OsNip_11t0422100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0422100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13217140	13217278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0422100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13278988	13279927	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0423200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13278988	13279927	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0423200-01;Parent=gene:OsNip_11g0423200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13278988	13279064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13278988	13279927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0423200-01;Name=OsNip_11t0423200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0423200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13279065	13279367	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0423200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0423200-01;protein_id=OsNip_11t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13279368	13279927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13333478	13342107	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0423800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13444322	13444355	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0425100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0425100-01;protein_id=OsNip_11t0425100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13444322	13444373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-01;Name=OsNip_11t0425100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0425100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13444491	13444953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13442846	13445952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13442846	13446692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-02;Name=OsNip_11t0425100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0425100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13445953	13446426	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0425100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0425100-02;protein_id=OsNip_11t0425100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13446427	13446692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	CDS	13442849	13443034	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0425100-03;Parent=transcript:OsNip_11t0425100-03;protein_id=OsNip_11t0425100-03;Tag=IsoSeq:G15924.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12461.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1BJ38";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	TAMA	exon	13444491	13445063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-03;Name=OsNip_11t0425100-03;exon_id=OsNip_11t0425100-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G15924.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12461.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1BJ38";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13443038	13443400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-03;Tag=IsoSeq:G15924.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12461.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1BJ38";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13443499	13444373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-03;Tag=IsoSeq:G15924.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12461.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1BJ38";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13444491	13445063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425100-03;Tag=IsoSeq:G15924.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12461.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1BJ38";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13460527	13466777	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0425300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13460527	13466777	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0425300-02;Parent=gene:OsNip_11g0425300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0425300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13460527	13461161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425300-02;Name=OsNip_11t0425300-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0425300-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13460527	13461161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13461252	13461256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13461252	13461304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0425300-02;Name=OsNip_11t0425300-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0425300-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13560458	13560942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0426400-01;Tag=IsoSeq:G15928.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9431.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0MF31";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	13592733	13596309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0426850-01;Name=OsNip_11t0426850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0426850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13626272	13626632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427401-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13626633	13626839	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0427401-01;Parent=transcript:OsNip_11t0427401-01;protein_id=OsNip_11t0427401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13626840	13631483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	13632428	13637346	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0427500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13632428	13637209	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0427500-02;Parent=gene:OsNip_11g0427500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0427500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13632428	13632715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Name=OsNip_11t0427500-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0427500-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13632428	13632715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13633251	13633830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Name=OsNip_11t0427500-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0427500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13633251	13633830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13633988	13634122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13633988	13634475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0427500-02;Name=OsNip_11t0427500-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0427500-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13709362	13709975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0428500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13709586	13710243	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0429000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13719439	13720479	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0428700-00;Parent=gene:OsNip_11g0428700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0428700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13719439	13719626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0428700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13763875	13764067	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0429433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13763875	13764561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0429433-00;Name=OsNip_11t0429433-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0429433-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	13770580	13785516	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0430000-00;Parent=gene:OsNip_11g0430000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0430000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13970644	13971243	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0432800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0432800-01;protein_id=OsNip_11t0432800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13970644	13971406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432800-01;Name=OsNip_11t0432800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0432800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13971244	13971406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13970644	13971033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432800-02;Tag=IsoSeq:G15938.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9438.1;prot_id "UniRef90_B8BKA4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13970457	13970555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432800-02;Tag=IsoSeq:G15938.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9438.1;prot_id "UniRef90_B8BKA4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	13969264	13970371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432800-02;Tag=IsoSeq:G15938.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9438.1;prot_id "UniRef90_B8BKA4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13971700	13971946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13971700	13972030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0432900-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	13972459	13972504	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0432900-01-E12;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13972459	13972504	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0432900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;protein_id=OsNip_11t0432900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13972631	13972744	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0432900-01-E11;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13972631	13972744	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0432900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;protein_id=OsNip_11t0432900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13973060	13973181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0432900-01-E10;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13973060	13973181	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0432900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;protein_id=OsNip_11t0432900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	13973285	13973356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0432900-01-E9;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	13973285	13973356	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0432900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;protein_id=OsNip_11t0432900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	13974588	13974697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0432900-02;Name=OsNip_11t0432900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0432900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14048550	14048655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	14048550	14048823	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;Name=OsNip_11t0434000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0434000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14048656	14048823	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0434000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;protein_id=OsNip_11t0434000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14049088	14049204	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0434000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;protein_id=OsNip_11t0434000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14049453	14049627	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0434000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;protein_id=OsNip_11t0434000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14052177	14052484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;Name=OsNip_11t0434000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0434000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14052383	14052484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0434000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	14048564	14052450	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0434000-02;Parent=gene:OsNip_11g0434000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0434000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14334341	14334447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0438700-01;Name=OsNip_11t0438700-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0438700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14334818	14334985	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0438700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0438700-01;protein_id=OsNip_11t0438700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	14334818	14335278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0438700-01;Name=OsNip_11t0438700-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0438700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14334986	14335278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0438700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14330653	14330706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0438700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	14330653	14330795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0438700-02;Name=OsNip_11t0438700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0438700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14330707	14330795	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0438700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0438700-02;protein_id=OsNip_11t0438700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14368528	14369253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439100-00;Name=OsNip_11t0439100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0439100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14379808	14381308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14381309	14381644	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0439300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0439300-01;protein_id=OsNip_11t0439300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14381645	14383367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	14379819	14382254	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0439300-02;Parent=gene:OsNip_11g0439300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0439300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14379819	14380935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	14379819	14381032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-02;Name=OsNip_11t0439300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0439300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14381442	14381682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-02;Name=OsNip_11t0439300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0439300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14381645	14381682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14381993	14382254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	14390405	14398122	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0439600-01;Parent=gene:OsNip_11g0439600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0439600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14390405	14390558	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14392157	14392555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0439600-01;Name=OsNip_11t0439600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0439600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	14392157	14392555	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0439600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0439600-01;protein_id=OsNip_11t0439600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	14829571	14829663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0446500-00;Name=OsNip_11t0446500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0446500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14979606	14979767	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0448400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	CDS	14975213	14975645	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0448400-03;Parent=transcript:OsNip_11t0448400-03;protein_id=OsNip_11t0448400-03;Tag=IsoSeq:G15960.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7202.2;prot_id "UniRef90_UPI00187CA9F7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15514985	15515505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0457700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15531495	15532837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458100-01;Name=OsNip_11t0458100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0458100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15532836	15532837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15540911	15541031	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458333-00;Name=OsNip_11t0458333-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0458333-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	15560842	15563274	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0458500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15560842	15560870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15560842	15562397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458500-00;Name=OsNip_11t0458500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0458500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15560871	15562397	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0458500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0458500-00;protein_id=OsNip_11t0458500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15562501	15562608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0458500-00;Name=OsNip_11t0458500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0458500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15562501	15562608	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0458500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0458500-00;protein_id=OsNip_11t0458500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15672653	15673187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15683051	15683248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15694545	15694628	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0460800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0460800-01;protein_id=OsNip_11t0460800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15694545	15694779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460800-01;Name=OsNip_11t0460800-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0460800-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15683494	15683676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460851-00;Name=OsNip_11t0460851-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0460851-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15684532	15684680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460851-00;Name=OsNip_11t0460851-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0460851-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15685135	15685193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460851-00;Name=OsNip_11t0460851-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0460851-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15690086	15690222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460851-00;Name=OsNip_11t0460851-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0460851-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15690740	15690844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460851-00;Name=OsNip_11t0460851-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0460851-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	15700955	15701662	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0460900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	15700955	15701662	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0460900-00;Parent=gene:OsNip_11g0460900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0460900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15700955	15701031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15701196	15701662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0460900-00;Name=OsNip_11t0460900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0460900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15701196	15701662	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0460900-00;Parent=transcript:OsNip_11t0460900-00;protein_id=OsNip_11t0460900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	15706845	15738054	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0461000;Name=OsNip_SCP61;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	15706845	15738054	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0461000-01;Parent=gene:OsNip_11g0461000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15706845	15706873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15706845	15707079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Name=OsNip_11t0461000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0461000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15706874	15707079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;protein_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15713070	15713215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Name=OsNip_11t0461000-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0461000-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15713070	15713215	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;protein_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15713366	15713445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Name=OsNip_11t0461000-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0461000-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15713366	15713445	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;protein_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15713568	15713690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Name=OsNip_11t0461000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0461000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15713568	15713690	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;protein_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15721114	15721216	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;Name=OsNip_11t0461000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0461000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15721114	15721216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0461000-01;protein_id=OsNip_11t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15766058	15766318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462100-01;Name=OsNip_11t0462100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0462100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15766237	15766318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	15764727	15765983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462100-02;Name=OsNip_11t0462100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0462100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15764807	15765983	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0462100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0462100-02;protein_id=OsNip_11t0462100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15766058	15766236	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0462100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0462100-02;protein_id=OsNip_11t0462100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15766058	15766259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462100-02;Name=OsNip_11t0462100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0462100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15766237	15766259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	15786746	15791276	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0462500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	15786746	15791276	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0462500-00;Parent=gene:OsNip_11g0462500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0462500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15786746	15788930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0462500-00;Name=OsNip_11t0462500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0462500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15786746	15788930	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0462500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0462500-00;protein_id=OsNip_11t0462500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15790486	15791270	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0462500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0462500-00;protein_id=OsNip_11t0462500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15904809	15904940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0464600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	15908453	15912480	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0464700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15908453	15909331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0464700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15909332	15909550	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0464700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0464700-01;protein_id=OsNip_11t0464700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15909551	15909614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0464700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15912196	15912480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0464700-01;Name=OsNip_11t0464700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0464700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15912196	15912480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0464700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	15956675	15960376	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0465200-01;Parent=gene:OsNip_11g0465200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0465200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15956675	15956867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0465200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15956675	15957494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0465200-01;Name=OsNip_11t0465200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0465200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	15956868	15957494	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0465200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0465200-01;protein_id=OsNip_11t0465200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	15957986	15958420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0465200-01;Name=OsNip_11t0465200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0465200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16164200	16164242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0470600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	16195482	16196213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0470966-01;Name=OsNip_11t0470966-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0470966-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16195482	16196213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0470966-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16196629	16196829	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0470966-01;Parent=transcript:OsNip_11t0470966-01;protein_id=OsNip_11t0470966-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16196830	16198355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0470966-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	16200965	16201669	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0471100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	16200965	16201669	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0471100-01;Parent=gene:OsNip_11g0471100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0471100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16200965	16201449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0471100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16200965	16201669	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0471100-01;Name=OsNip_11t0471100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0471100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16201450	16201668	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0471100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0471100-01;protein_id=OsNip_11t0471100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16201669	16201669	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0471100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	16205716	16216386	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0471200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16251974	16252198	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0472000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0472000-02;protein_id=OsNip_11t0472000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16324424	16325115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0473350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	16354461	16356407	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0473832;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16743874	16744211	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0479000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0479000-01;protein_id=OsNip_11t0479000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16743874	16744480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479000-01;Name=OsNip_11t0479000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0479000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16744212	16744480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	16751786	16758978	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0479100-00;Parent=gene:OsNip_11g0479100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16751786	16753999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479100-00;Name=OsNip_11t0479100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0479100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16757951	16758976	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0479100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0479100-00;protein_id=OsNip_11t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16757951	16758978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479100-00;Name=OsNip_11t0479100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0479100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	16768640	16772209	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0479232-01;Parent=gene:OsNip_11g0479232;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0479232-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16768640	16768640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16768640	16768973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;Name=OsNip_11t0479232-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0479232-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	16769082	16769231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;Name=OsNip_11t0479232-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0479232-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	16769345	16769525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;Name=OsNip_11t0479232-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0479232-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16769345	16769525	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0479232-01;Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;protein_id=OsNip_11t0479232-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16771790	16771959	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0479232-01;Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;protein_id=OsNip_11t0479232-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16771790	16772209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-01;Name=OsNip_11t0479232-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0479232-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	16771790	16772225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479232-02;Tag=IsoSeq:G15992.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9461.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6QK12";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	16774878	16780258	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0479300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	16774878	16780258	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0479300-01;Parent=gene:OsNip_11g0479300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0479300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16774878	16775038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16774878	16775347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479300-01;Name=OsNip_11t0479300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0479300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	16775039	16775347	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0479300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0479300-01;protein_id=OsNip_11t0479300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	16775481	16775576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0479300-01;Name=OsNip_11t0479300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0479300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17014155	17014234	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0483600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;protein_id=OsNip_11t0483600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17014942	17015043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;Name=OsNip_11t0483600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0483600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17014942	17015043	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0483600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;protein_id=OsNip_11t0483600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17015787	17015827	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0483600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;protein_id=OsNip_11t0483600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17015787	17016159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;Name=OsNip_11t0483600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0483600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17015828	17016159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0483600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	17010706	17016180	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0483600-02;Parent=gene:OsNip_11g0483600;transcript_id=OsNip_11t0483600-02;Tag=IsoSeq:G15998.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7218.1,Nipponbare.panicle_G12518.1,Nipponbare.root_G9466.1
Chr11	TAMA	exon	17010706	17010928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0483600-02;Name=OsNip_11t0483600-02;exon_id=OsNip_11t0483600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G15998.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7218.1,Nipponbare.panicle_G12518.1,Nipponbare.root_G9466.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5H1C6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17060447	17060561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0484400-01;Name=OsNip_11t0484400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0484400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17060860	17061369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0484400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	17065485	17066221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0484500-03;Tag=IsoSeq:G16002.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7220.2;prot_id "UniRef90_A0A067JMY4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17207101	17207270	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0488500-01;Name=OsNip_11t0488500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0488500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17207101	17207270	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0488500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0488500-01;protein_id=OsNip_11t0488500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17212677	17212826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0488600-01;Name=OsNip_11t0488600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0488600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17212777	17212826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0488600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17785138	17785572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0499600-01;Name=OsNip_11t0499600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0499600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17785375	17785572	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0499600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0499600-01;protein_id=OsNip_11t0499600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17790653	17790784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;Name=OsNip_11t0499600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0499600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	17791460	17791624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;Name=OsNip_11t0499600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0499600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17791460	17791624	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0499600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;protein_id=OsNip_11t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17791927	17792217	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0499600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;protein_id=OsNip_11t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17791927	17792540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;Name=OsNip_11t0499600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0499600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17792218	17792540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0499600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	17807490	17807907	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0500050;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	17807490	17807907	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0500050-00;Parent=gene:OsNip_11g0500050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0500050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17807490	17807714	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0500050-00;Parent=transcript:OsNip_11t0500050-00;protein_id=OsNip_11t0500050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17807490	17807907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0500050-00;Name=OsNip_11t0500050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0500050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17810964	17811138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0500100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17811256	17811469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0500100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17811497	17811943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0500100-00;Name=OsNip_11t0500100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0500100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17811497	17811943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0500100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	17829546	17831391	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0501000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	17829546	17831391	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0501000-01;Parent=gene:OsNip_11g0501000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17829546	17829881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17829546	17831165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;Name=OsNip_11t0501000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0501000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17829882	17831165	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0501000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;protein_id=OsNip_11t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17831260	17831274	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0501000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;protein_id=OsNip_11t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17831260	17831391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;Name=OsNip_11t0501000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0501000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17831275	17831391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	17856680	17858107	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0501500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	17856680	17858107	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0501500-01;Parent=gene:OsNip_11g0501500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17856680	17856838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17856680	17858107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0501500-01;Name=OsNip_11t0501500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0501500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17856839	17858107	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0501500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0501500-01;protein_id=OsNip_11t0501500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	17911044	17912013	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0502700;biotype=protein_coding;description=Glycosyl;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	17911046	17912013	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0502700-01;Parent=gene:OsNip_11g0502700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17911046	17911256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	17911046	17912013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-01;Name=OsNip_11t0502700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0502700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	17911257	17911613	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0502700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0502700-01;protein_id=OsNip_11t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17911614	17912013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	17911044	17911990	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0502700-02;Parent=gene:OsNip_11g0502700;transcript_id=OsNip_11t0502700-02;Tag=IsoSeq:G16020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12534.2
Chr11	TAMA	exon	17911044	17911183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-02;Name=OsNip_11t0502700-02;exon_id=OsNip_11t0502700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12534.2;prot_id "UniRef90_A0A444CQ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	CDS	17911046	17911141	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0502700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0502700-02;protein_id=OsNip_11t0502700-02;Tag=IsoSeq:G16020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12534.2;prot_id "UniRef90_A0A444CQ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	exon	17911273	17911990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-02;Name=OsNip_11t0502700-02;exon_id=OsNip_11t0502700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12534.2;prot_id "UniRef90_A0A444CQ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	17911145	17911183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0502700-02;Tag=IsoSeq:G16020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12534.2;prot_id "UniRef90_A0A444CQ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18097775	18098256	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0507350-00;Parent=transcript:OsNip_11t0507350-00;protein_id=OsNip_11t0507350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18106978	18113213	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0507400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18106978	18113191	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0507400-01;Parent=gene:OsNip_11g0507400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18106978	18107350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18106978	18107712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0507400-01;Name=OsNip_11t0507400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0507400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18107809	18107977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0507400-01;Name=OsNip_11t0507400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0507400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18311673	18311954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512600-00;Name=OsNip_11t0512600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0512600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18312163	18312498	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0512600-00;Parent=transcript:OsNip_11t0512600-00;protein_id=OsNip_11t0512600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18313704	18314023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18321542	18322437	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0512800-01;Parent=gene:OsNip_11g0512800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0512800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18321542	18321603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18321542	18321972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;Name=OsNip_11t0512800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0512800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18321604	18321939	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0512800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;protein_id=OsNip_11t0512800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18321940	18321972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18322118	18322437	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;Name=OsNip_11t0512800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0512800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18322118	18322437	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0512800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18337730	18342838	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0513000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18337730	18342838	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0513000-01;Parent=gene:OsNip_11g0513000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18337730	18337963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18337730	18337963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18338058	18338205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18338058	18338337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18338206	18338337	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18338738	18339023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18338738	18339023	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18339106	18339238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18339106	18339238	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18339583	18339794	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18339583	18339794	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18340296	18340657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18340296	18340657	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18340748	18340778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;Name=OsNip_11t0513000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0513000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18340868	18340929	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0513000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0513000-01;protein_id=OsNip_11t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18409994	18414447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0514100-00;Name=OsNip_11t0514100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0514100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18415164	18415374	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0514100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0514100-00;protein_id=OsNip_11t0514100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18416380	18416583	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0514100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0514100-00;protein_id=OsNip_11t0514100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18426136	18428231	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0514400;Name=OsNip_BDG1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18426136	18428231	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0514400-00;Parent=gene:OsNip_11g0514400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0514400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18426136	18426218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0514400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18426559	18426639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0514400-00;Name=OsNip_11t0514400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0514400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18493370	18494393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0515700-00;Name=OsNip_11t0515700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0515700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18504082	18504147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18504961	18505049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18505446	18505591	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18505676	18505800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18505897	18505990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18506077	18506240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18506382	18506543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18506845	18507011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18506845	18507011	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0516000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;protein_id=OsNip_11t0516000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18507133	18507240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18507133	18507240	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0516000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;protein_id=OsNip_11t0516000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18507331	18507423	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0516000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;protein_id=OsNip_11t0516000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18507331	18507701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Name=OsNip_11t0516000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18507424	18507701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18506918	18507468	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0516050;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	18506918	18507234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516050-00;Name=OsNip_11t0516050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0516050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18507303	18507468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516050-00;Name=OsNip_11t0516050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0516050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18509086	18512628	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0516100;biotype=protein_coding;description=Ribosomal;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18509086	18512628	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0516100-01;Parent=gene:OsNip_11g0516100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0516100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18509086	18512052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18509086	18512628	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516100-01;Name=OsNip_11t0516100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0516100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18512053	18512268	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0516100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516100-01;protein_id=OsNip_11t0516100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18512269	18512628	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18520372	18521065	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0516400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18520372	18521065	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0516400-01;Parent=gene:OsNip_11g0516400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0516400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18520372	18520431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;Name=OsNip_11t0516400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18520372	18520431	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0516400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;protein_id=OsNip_11t0516400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18520544	18520670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;Name=OsNip_11t0516400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0516400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18520544	18520670	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0516400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;protein_id=OsNip_11t0516400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18520814	18520869	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0516400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;protein_id=OsNip_11t0516400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18520814	18521065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;Name=OsNip_11t0516400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0516400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18520870	18521065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	18531653	18541501	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0516800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18531653	18541501	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0516800-01;Parent=gene:OsNip_11g0516800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0516800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18531653	18532010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516800-01;Name=OsNip_11t0516800-01-E21;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0516800-01-E21;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18531653	18532010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18532153	18532201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516800-01;Name=OsNip_11t0516800-01-E20;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0516800-01-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18532153	18532201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0516800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18644504	18644572	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0518900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0518900-02;protein_id=OsNip_11t0518900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	18644674	18644775	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0518900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0518900-02;protein_id=OsNip_11t0518900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18644674	18644868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0518900-02;Name=OsNip_11t0518900-02-E16;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0518900-02-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18644776	18644868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0518900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	18655353	18658368	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0519100-00;Parent=gene:OsNip_11g0519100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0519100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	18655353	18655431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0519100-00;Name=OsNip_11t0519100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0519100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19067158	19067600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-01;Name=OsNip_11t0525600-01-E29;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0525600-01-E29;rank=29;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19058466	19058757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;Name=OsNip_11t0525600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0525600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19058987	19059070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;Name=OsNip_11t0525600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0525600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19058987	19059070	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0525600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;protein_id=OsNip_11t0525600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19059632	19059720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;Name=OsNip_11t0525600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0525600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19067158	19067376	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0525600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;protein_id=OsNip_11t0525600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19067158	19067600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-02;Name=OsNip_11t0525600-01-E29;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0525600-01-E29;rank=29;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19059681	19059682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19059681	19059720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;Name=OsNip_11t0525600-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0525600-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19066998	19067066	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0525600-03;Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;protein_id=OsNip_11t0525600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19067158	19067376	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0525600-03;Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;protein_id=OsNip_11t0525600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19067158	19067585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;Name=OsNip_11t0525600-03-E27;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0525600-03-E27;rank=27;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19067377	19067585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0525600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19127892	19128138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	19128154	19130382	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0527100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19128154	19130382	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0527100-01;Parent=gene:OsNip_11g0527100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0527100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19128154	19128391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0527100-01;Name=OsNip_11t0527100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0527100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	19134087	19134782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0527300-02;Tag=IsoSeq:G16052.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12558.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3HMH3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19170793	19171824	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0528200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0528200-01;protein_id=OsNip_11t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19171825	19172631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0528200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	19165863	19172294	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0528200-02;Parent=gene:OsNip_11g0528200;transcript_id=OsNip_11t0528200-02;Tag=IsoSeq:G16053.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12559.1
Chr11	TAMA	exon	19165863	19167295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0528200-02;Name=OsNip_11t0528200-02;exon_id=OsNip_11t0528200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16053.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12559.1;prot_id "UniRef90_A0A0A8Y2D3";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19353108	19353127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19353727	19353859	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0531700-01;protein_id=OsNip_11t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19354968	19355117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0531700-01;Name=OsNip_11t0531700-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0531700-02-E4;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19354968	19355117	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0531700-01;protein_id=OsNip_11t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19523782	19523944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0535600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19525091	19525249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0535600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19533684	19533998	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0536000-01;Parent=gene:OsNip_11g0536000;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0536000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19533684	19533998	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536000-01;Name=OsNip_11t0536000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0536000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19534498	19534662	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0536400-00;Parent=gene:OsNip_11g0536400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0536400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19534498	19534662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536400-00;Name=OsNip_11t0536400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0536400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	19572490	19576497	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0536800;biotype=protein_coding;description=Amidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19572490	19576497	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0536800-01;Parent=gene:OsNip_11g0536800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19572490	19572655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19572490	19572754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19572656	19572754	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19572860	19573093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19572860	19573093	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19573185	19573409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19573185	19573409	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19573495	19573665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19573495	19573665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19573750	19573886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19573750	19573886	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19573971	19574125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;Name=OsNip_11t0536800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0536800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19573971	19574125	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0536800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0536800-01;protein_id=OsNip_11t0536800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19675426	19675619	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0539200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0539200-01;protein_id=OsNip_11t0539200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19677354	19677815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0539200-01;Name=OsNip_11t0539200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0539200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19677754	19677815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0539200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	19694790	19696368	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0539500;biotype=protein_coding;description=Winged;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19694790	19696368	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0539500-00;Parent=gene:OsNip_11g0539500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0539500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19694790	19694802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0539500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19694790	19695108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0539500-00;Name=OsNip_11t0539500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0539500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19694803	19695108	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0539500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0539500-00;protein_id=OsNip_11t0539500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19959433	19959544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19959433	19959544	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19959658	19959773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19959658	19959773	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19959859	19959935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19959859	19959935	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19960091	19960172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19960091	19960172	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19960256	19960393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19960256	19960393	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19962985	19963188	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0543500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;protein_id=OsNip_11t0543500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19962985	19963299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0543500-01;Name=OsNip_11t0543500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0543500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	19988274	19988731	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544000-03;Tag=IsoSeq:G16076.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7245.2;prot_id "UniRef90_W9RSG8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19988741	19988988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19988741	19989105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544100-00;Name=OsNip_11t0544100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19989706	19991058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544100-00;Name=OsNip_11t0544100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19989706	19991058	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0544100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0544100-00;protein_id=OsNip_11t0544100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	19990418	19990726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544150-00;Name=OsNip_11t0544150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	19992104	19996973	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0544200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19992104	19996931	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0544200-02;Parent=gene:OsNip_11g0544200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19992104	19992349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19992350	19992616	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0544200-02;Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;protein_id=OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19992949	19993194	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0544200-02;Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;protein_id=OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19992949	19994914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Name=OsNip_11t0544200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0544200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19993195	19994914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19995020	19995096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Name=OsNip_11t0544200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0544200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19995020	19995096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19996604	19996931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Name=OsNip_11t0544200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0544200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19996604	19996931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19992105	19992321	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0544200-03;Parent=gene:OsNip_11g0544200;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0544200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19992105	19992321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-03;Name=OsNip_11t0544200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0544200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	19994711	19996973	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0544200-01;Parent=gene:OsNip_11g0544200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	19994711	19994914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544200-01;Name=OsNip_11t0544200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0544200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19994711	19994914	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0544200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0544200-01;protein_id=OsNip_11t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	19996604	19996752	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0544200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0544200-01;protein_id=OsNip_11t0544200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20028892	20029518	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544700-01;Name=OsNip_11t0544700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20030056	20034630	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0544800-01;Parent=gene:OsNip_11g0544800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0544800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20030056	20030144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20030056	20030225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544800-01;Name=OsNip_11t0544800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20030145	20030225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0544800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0544800-01;protein_id=OsNip_11t0544800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20030814	20030882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0544800-01;Name=OsNip_11t0544800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0544800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20133086	20133331	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0546000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;protein_id=OsNip_11t0546000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20133576	20133695	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0546000-02;Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;protein_id=OsNip_11t0546000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20133576	20133710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;Name=OsNip_11t0546000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0546000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20133696	20133710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20133813	20134222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;Name=OsNip_11t0546000-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0546000-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20133813	20134222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0546000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	20129021	20134153	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0546000-03;Parent=gene:OsNip_11g0546000;transcript_id=OsNip_11t0546000-03;Tag=IsoSeq:G16087.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9508.2
Chr11	TAMA	exon	20129021	20129094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0546000-03;Name=OsNip_11t0546000-03;exon_id=OsNip_11t0546000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16087.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9508.2;prot_id "UniRef90_D7TFC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	CDS	20129022	20129094	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0546000-03;Parent=transcript:OsNip_11t0546000-03;protein_id=OsNip_11t0546000-03;Tag=IsoSeq:G16087.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9508.2;prot_id "UniRef90_D7TFC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr11	TAMA	five_prime_UTR	20190515	20190694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0547800-01;Tag=IsoSeq:G16093.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7256.3,Nipponbare.leaf_G7256.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3EQM9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	20191421	20191563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0547800-01;Tag=IsoSeq:G16093.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7256.3,Nipponbare.leaf_G7256.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3EQM9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	20270483	20275892	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0549300;Name=OsNip_LysM-RLK8;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20371891	20372451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0549650-00;Name=OsNip_11t0549650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0549650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20371891	20372451	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0549650-00;Parent=transcript:OsNip_11t0549650-00;protein_id=OsNip_11t0549650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20518354	20520099	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0551800-02;Parent=gene:OsNip_11g0551800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0551800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20647384	20647412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555300-00;Name=OsNip_11t0555300-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0555300-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	20651030	20657181	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0555600;Name=OsNip_WAK117;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20651030	20654076	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0555600-01;Parent=gene:OsNip_11g0555600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20651030	20651884	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20651030	20652006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Name=OsNip_11t0555600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0555600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20652299	20653383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Name=OsNip_11t0555600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0555600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20653311	20653383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20653883	20654076	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Name=OsNip_11t0555600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0555600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20653883	20654076	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	20657091	20657181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-02;Name=OsNip_11t0555600-02;exon_id=OsNip_11t0555600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16103.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9517.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5VZU9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	exon	20651085	20653383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-02;Name=OsNip_11t0555600-02;exon_id=OsNip_11t0555600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16103.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9517.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5VZU9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	20651085	20651384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0555600-02;Tag=IsoSeq:G16103.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9517.2;prot_id "UniRef90_A0A1E5VZU9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20667054	20667208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0556132-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20667275	20668186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0556132-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20672585	20674513	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0556400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0556400-00;protein_id=OsNip_11t0556400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20672683	20673101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0556433-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20673102	20673443	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0556433-00;Parent=transcript:OsNip_11t0556433-00;protein_id=OsNip_11t0556433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20673444	20674534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0556433-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20680490	20680495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0556466-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20703017	20703160	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557000-01;protein_id=OsNip_11t0557000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20703017	20703433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557000-01;Name=OsNip_11t0557000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20709538	20714159	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0557300-01;Parent=gene:OsNip_11g0557300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20709538	20709926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20709538	20710565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;Name=OsNip_11t0557300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20709927	20710565	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0557300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;protein_id=OsNip_11t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20713374	20713561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;Name=OsNip_11t0557300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0557300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20713374	20713561	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0557300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;protein_id=OsNip_11t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20713642	20714159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;Name=OsNip_11t0557300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0557300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20714108	20714159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	20711039	20712696	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0557400;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20711039	20712696	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0557400-01;Parent=gene:OsNip_11g0557400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20711039	20711847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20711039	20712696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557400-01;Name=OsNip_11t0557400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20711848	20712696	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0557400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557400-01;protein_id=OsNip_11t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20716456	20718510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557500-00;Name=OsNip_11t0557500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20716456	20718510	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0557500-00;protein_id=OsNip_11t0557500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20720048	20720121	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0557600-00;Parent=gene:OsNip_11g0557600;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0557600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20720048	20720121	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557600-00;Name=OsNip_11t0557600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0557600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	20720724	20723628	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0557700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20720724	20723098	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0557700-01;Parent=gene:OsNip_11g0557700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20720724	20720725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20720726	20720853	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20720963	20721059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20720963	20721059	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20721198	20721339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20721198	20721339	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20721467	20721549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20721467	20721549	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20721970	20722104	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20721970	20722104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20722373	20722477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20722373	20722477	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20722657	20722782	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;protein_id=OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20722657	20723098	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Name=OsNip_11t0557700-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20722783	20723098	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20720771	20723628	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0557700-02;Parent=gene:OsNip_11g0557700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0557700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20720771	20720853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0557700-02;Name=OsNip_11t0557700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0557700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20720771	20720853	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0557700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0557700-02;protein_id=OsNip_11t0557700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20746336	20747515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20746336	20747882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558350-01;Name=OsNip_11t0558350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0558350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	20748838	20751918	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0558400;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20748838	20751918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558400-00;Name=OsNip_11t0558400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0558400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20748838	20751918	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0558400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0558400-00;protein_id=OsNip_11t0558400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20754834	20755207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;Name=OsNip_11t0558500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0558500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20757937	20758260	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0558500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;protein_id=OsNip_11t0558500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20758427	20758591	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;Name=OsNip_11t0558500-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0558500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20758427	20758591	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20758685	20759343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;Name=OsNip_11t0558500-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0558500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20758685	20759343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	20754871	20757463	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0558500-02;Parent=gene:OsNip_11g0558500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20754871	20755400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	20754871	20757463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-02;Name=OsNip_11t0558500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0558500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	20755401	20755742	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0558500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0558500-02;protein_id=OsNip_11t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20755743	20757463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	20754791	20759276	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0558500-03;Parent=gene:OsNip_11g0558500;transcript_id=OsNip_11t0558500-03;Tag=IsoSeq:G16111.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12600.1
Chr11	TAMA	exon	20754791	20755025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0558500-03;Name=OsNip_11t0558500-03;exon_id=OsNip_11t0558500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16111.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12600.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0R9R0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	20902326	20905361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0561100-00;Name=OsNip_11t0561100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0561100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21032505	21037329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21049515	21049536	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0565300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0565300-00;protein_id=OsNip_11t0565300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21050994	21056198	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0565400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21050994	21051753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0565400-01;Name=OsNip_11t0565400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0565400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21050994	21051753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0565400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21179434	21179549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568401-00;Name=OsNip_11t0568401-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0568401-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21185518	21185720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;Name=OsNip_11t0568500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0568500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21185518	21185720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21187021	21187055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21187021	21187738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;Name=OsNip_11t0568500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0568500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21187056	21187499	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;protein_id=OsNip_11t0568500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21187500	21187738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	21187006	21187694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-02;Name=OsNip_11t0568500-02;exon_id=OsNip_11t0568500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7261.2;prot_id "UniRef90_A0A2P5E3G8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	21187006	21187021	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0568500-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568500-02;protein_id=OsNip_11t0568500-02;Tag=IsoSeq:G16114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7261.2;prot_id "UniRef90_A0A2P5E3G8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21187025	21187694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568500-02;Tag=IsoSeq:G16114.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7261.2;prot_id "UniRef90_A0A2P5E3G8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21188307	21197806	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0568600;biotype=protein_coding;description=THUMP;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21188307	21188380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21188307	21188584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0568600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21188381	21188584	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;protein_id=OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21189090	21189521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21189090	21189521	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;protein_id=OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21190083	21190222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21190083	21190222	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;protein_id=OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21190312	21190432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21191141	21191281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21191141	21191281	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;protein_id=OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21197477	21197563	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;protein_id=OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21197477	21197806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Name=OsNip_11t0568600-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21197564	21197806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21188376	21188380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21188376	21188584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;Name=OsNip_11t0568600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21188381	21188584	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;protein_id=OsNip_11t0568600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21189090	21189521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;Name=OsNip_11t0568600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21189090	21189521	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;protein_id=OsNip_11t0568600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21190083	21190222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;Name=OsNip_11t0568600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21190083	21190222	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568600-02;protein_id=OsNip_11t0568600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21205695	21206206	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0568700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568700-02;protein_id=OsNip_11t0568700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21206295	21206571	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0568700-02;Parent=transcript:OsNip_11t0568700-02;protein_id=OsNip_11t0568700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21206295	21207327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568700-02;Name=OsNip_11t0568700-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0568700-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21206572	21207327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21213554	21216313	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0568800;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21213554	21216313	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0568800-00;Parent=gene:OsNip_11g0568800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0568800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21213554	21216313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0568800-00;Name=OsNip_11t0568800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0568800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21289284	21289519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0569800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452334	21452393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-01;Name=OsNip_11t0572100-03-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E18;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21452334	21452393	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0572100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-01;protein_id=OsNip_11t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21452490	21452623	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0572100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-01;protein_id=OsNip_11t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452490	21452902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-01;Name=OsNip_11t0572100-01-E22;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-01-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21452624	21452902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21443125	21443453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21443125	21443456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0572100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21443454	21443456	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;protein_id=OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21443579	21443713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21443579	21443713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;protein_id=OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21444285	21444902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21444285	21444902	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;protein_id=OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21444972	21445039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21444972	21445039	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;protein_id=OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21445340	21445401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E3;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21445340	21445401	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;protein_id=OsNip_11t0572100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21445481	21445632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E4;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21446649	21446856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E8;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21447486	21447655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E10;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21451511	21451757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E17;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452334	21452393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-03-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E18;rank=21;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452490	21452903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-02;Name=OsNip_11t0572100-02-E22;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-02-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21444970	21445039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21445188	21445263	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0572100-03;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;protein_id=OsNip_11t0572100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21445340	21445401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21445481	21445632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21445481	21445632	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0572100-03;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;protein_id=OsNip_11t0572100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21445918	21446081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21446158	21446346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21446649	21446856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21447486	21447655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21448294	21448384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21449039	21449220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21449039	21449220	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572100-03;Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;protein_id=OsNip_11t0572100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21449305	21449344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-03;Name=OsNip_11t0572100-03-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21450851	21450943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-04;Name=OsNip_11t0572100-03-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E16;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21451511	21451757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-04;Name=OsNip_11t0572100-03-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E17;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452334	21452393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-04;Name=OsNip_11t0572100-03-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-03-E18;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21452490	21452910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-04;Name=OsNip_11t0572100-04-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572100-04-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21452624	21452910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21462357	21464486	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0572200;Name=OsNip_EXO70FX8;biotype=protein_coding;description=Exo70;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21462382	21464486	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0572200-01;Parent=gene:OsNip_11g0572200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0572200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21462382	21462940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21462382	21463043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;Name=OsNip_11t0572200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21462941	21463043	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0572200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;protein_id=OsNip_11t0572200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21463108	21464306	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0572200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;protein_id=OsNip_11t0572200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21463108	21464486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;Name=OsNip_11t0572200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0572200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21464307	21464486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	21462357	21464448	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0572200-02;Parent=gene:OsNip_11g0572200;transcript_id=OsNip_11t0572200-02;Tag=IsoSeq:G16122.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9526.3,Nipponbare.root_G9526.4
Chr11	TAMA	exon	21462357	21464448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-02;Name=OsNip_11t0572200-02;exon_id=OsNip_11t0572200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16122.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9526.3,Nipponbare.root_G9526.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9X5I0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	CDS	21463955	21464224	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0572200-02;Parent=transcript:OsNip_11t0572200-02;protein_id=OsNip_11t0572200-02;Tag=IsoSeq:G16122.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9526.3,Nipponbare.root_G9526.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9X5I0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	21464225	21464448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-02;Tag=IsoSeq:G16122.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9526.3,Nipponbare.root_G9526.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9X5I0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21462357	21463952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572200-02;Tag=IsoSeq:G16122.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9526.3,Nipponbare.root_G9526.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9X5I0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21468751	21472160	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0572301;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21468751	21472160	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0572301-01;Parent=gene:OsNip_11g0572301;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0572301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21468751	21469072	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21468751	21471196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;Name=OsNip_11t0572301-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572301-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21469073	21471196	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0572301-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;protein_id=OsNip_11t0572301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21471473	21472105	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0572301-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;protein_id=OsNip_11t0572301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21471473	21472160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;Name=OsNip_11t0572301-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0572301-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21472106	21472160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572301-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21475708	21479641	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0572400-01;Parent=gene:OsNip_11g0572400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21475708	21475758	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21475708	21475894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;Name=OsNip_11t0572400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0572400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21475759	21475894	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;protein_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21475976	21476055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;Name=OsNip_11t0572400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0572400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21475976	21476055	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;protein_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21476629	21476715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;Name=OsNip_11t0572400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0572400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21476629	21476715	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;protein_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21476818	21476895	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;protein_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21476976	21477067	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;protein_id=OsNip_11t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21477161	21477362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0572400-01;Name=OsNip_11t0572400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0572400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	21526589	21527173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573200-02;Name=OsNip_11t0573200-02;exon_id=OsNip_11t0573200-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G16127.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12613.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21527018	21527173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573200-02;Tag=IsoSeq:G16127.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12613.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21530692	21531138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21530692	21531951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573350-00;Name=OsNip_11t0573350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0573350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	21544075	21555553	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0573800;Name=OsNip_DjC75;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21544075	21555553	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0573800-00;Parent=gene:OsNip_11g0573800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0573800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21544075	21544862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21544075	21544958	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21547828	21548311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21548400	21548439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21550363	21550563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21550363	21550563	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0573800-00;Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;protein_id=OsNip_11t0573800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21554264	21554846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21554774	21554846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21555432	21555553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Name=OsNip_11t0573800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0573800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21555432	21555553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21549243	21550702	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0573900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21549243	21550702	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0573900-01;Parent=gene:OsNip_11g0573900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0573900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21549243	21549327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21549243	21550702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573900-01;Name=OsNip_11t0573900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0573900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21549328	21549576	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0573900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0573900-01;protein_id=OsNip_11t0573900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21549577	21550702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0573900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21566303	21567613	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0574200;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21566303	21567613	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0574200-00;Parent=gene:OsNip_11g0574200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0574200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21566303	21566629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0574200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21566303	21567613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0574200-00;Name=OsNip_11t0574200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0574200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21566630	21567613	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0574200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0574200-00;protein_id=OsNip_11t0574200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21568672	21569308	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0574233;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21568672	21569308	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0574233-00;Parent=gene:OsNip_11g0574233;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0574233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21568672	21568918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0574233-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21568672	21569308	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0574233-00;Name=OsNip_11t0574233-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0574233-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21568919	21569308	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0574233-00;Parent=transcript:OsNip_11t0574233-00;protein_id=OsNip_11t0574233-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21690311	21690357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0575900-01;Name=OsNip_11t0575900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0575900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21690311	21690357	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0575900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0575900-01;protein_id=OsNip_11t0575900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21690545	21690938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0575900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21705480	21708029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0576100-00;Name=OsNip_11t0576100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0576100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21705480	21708029	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0576100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0576100-00;protein_id=OsNip_11t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21722905	21727433	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0576400;Name=OsNip__F0247;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21784507	21785176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21820326	21821162	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0578250-00;Parent=gene:OsNip_11g0578250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0578250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21839186	21839316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578500-01;Name=OsNip_11t0578500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0578500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21839186	21839316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	21839916	21843540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578500-01;Name=OsNip_11t0578500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0578500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21839989	21841863	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0578500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0578500-01;protein_id=OsNip_11t0578500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21841864	21843540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21850235	21852086	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0578700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21850235	21852086	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0578700-01;Parent=gene:OsNip_11g0578700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0578700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21850235	21851090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21850235	21852086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578700-01;Name=OsNip_11t0578700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0578700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21851091	21851954	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0578700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0578700-01;protein_id=OsNip_11t0578700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21851955	21852086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0578700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21859265	21862242	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0579000;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21887858	21888684	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0579700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0579700-01;protein_id=OsNip_11t0579700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21887858	21888730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579700-01;Name=OsNip_11t0579700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0579700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21887858	21888527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579700-02;Tag=IsoSeq:G16131.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12616.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J1L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21885479	21885774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579700-02;Tag=IsoSeq:G16131.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12616.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J1L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21883356	21883892	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579700-02;Tag=IsoSeq:G16131.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12616.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J1L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21890420	21890499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21890500	21890662	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;protein_id=OsNip_11t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21890770	21890918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;Name=OsNip_11t0579800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0579800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21890770	21890918	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;protein_id=OsNip_11t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21891404	21891519	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;protein_id=OsNip_11t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21891974	21892136	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0579800-01;protein_id=OsNip_11t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21966465	21968867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21968868	21969203	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0581700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0581700-01;protein_id=OsNip_11t0581700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21966827	21966972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581700-02;Tag=IsoSeq:G16136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12620.2;prot_id "UniRef90_I1H9H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	21968881	21969490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581700-02;Tag=IsoSeq:G16136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12620.2;prot_id "UniRef90_I1H9H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21982349	21986403	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0581900-01;Parent=gene:OsNip_11g0581900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21982349	21982428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21982429	21982738	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;protein_id=OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21982846	21982959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;Name=OsNip_11t0581900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0581900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21982846	21982959	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;protein_id=OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21985648	21985805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;Name=OsNip_11t0581900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0581900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21985648	21985805	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;protein_id=OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21985898	21986092	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;protein_id=OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21985898	21986403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;Name=OsNip_11t0581900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0581900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21986093	21986403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21986828	21990286	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0582000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21986828	21990286	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0582000-00;Parent=gene:OsNip_11g0582000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21986828	21987021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;Name=OsNip_11t0582000-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0582000-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21986828	21987021	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;protein_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21987411	21987539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;Name=OsNip_11t0582000-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0582000-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21987411	21987539	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;protein_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21987683	21987796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;Name=OsNip_11t0582000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0582000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21987683	21987796	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;protein_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21989904	21990065	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;Name=OsNip_11t0582000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0582000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21989904	21990065	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;protein_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21990199	21990286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;Name=OsNip_11t0582000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21990199	21990286	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0582000-00;protein_id=OsNip_11t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	21991920	21994207	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0582100;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	21991920	21994207	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0582100-01;Parent=gene:OsNip_11g0582100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0582100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21991920	21992063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21991920	21992424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;Name=OsNip_11t0582100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0582100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21992064	21992424	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0582100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;protein_id=OsNip_11t0582100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	21993831	21994087	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0582100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;protein_id=OsNip_11t0582100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	21993831	21994207	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;Name=OsNip_11t0582100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0582100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21994088	21994207	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22003368	22010499	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0582300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22003368	22010271	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0582300-02;Parent=gene:OsNip_11g0582300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22003368	22003487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22003368	22003665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22003488	22003665	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22003965	22004031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22003965	22004031	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22004177	22004279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22004177	22004279	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22004936	22005006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22004936	22005006	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22005126	22005189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22005126	22005189	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22005274	22005339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22005274	22005339	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22005451	22005498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22005451	22005498	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22005579	22005641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22005579	22005641	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22005715	22005771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;Name=OsNip_11t0582300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0582300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22005715	22005771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0582300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0582300-02;protein_id=OsNip_11t0582300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22027718	22028163	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22030012	22030300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582801-00;Name=OsNip_11t0582801-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0582801-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22030012	22030300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22030384	22030528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582801-00;Name=OsNip_11t0582801-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0582801-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22031674	22031935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582801-00;Name=OsNip_11t0582801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0582801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22031934	22031935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0582801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22040403	22042021	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0583200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;protein_id=OsNip_11t0583200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22043057	22043522	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0583200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;protein_id=OsNip_11t0583200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22043057	22043600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Name=OsNip_11t0583200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0583200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22043523	22043600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22044148	22044491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Name=OsNip_11t0583200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0583200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22044148	22044491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22044592	22044971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Name=OsNip_11t0583200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0583200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22044592	22044971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22042695	22044861	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0583250;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22042695	22044861	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0583250-01;Parent=gene:OsNip_11g0583250;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0583250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22042695	22044861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0583250-01;Name=OsNip_11t0583250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0583250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22046396	22046842	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0583300;Name=OsNip_Fbox615;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22135198	22135199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22150902	22155445	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0585900-01;Parent=gene:OsNip_11g0585900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22150902	22150903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22150902	22150944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;Name=OsNip_11t0585900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0585900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22150904	22150944	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0585900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;protein_id=OsNip_11t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22151170	22152879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;Name=OsNip_11t0585900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0585900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22151170	22152879	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0585900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;protein_id=OsNip_11t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22153162	22153453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;Name=OsNip_11t0585900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0585900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22154245	22154554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0585900-01;Name=OsNip_11t0585900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0585900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22162839	22163102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586001-00;Name=OsNip_11t0586001-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0586001-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22164268	22164658	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0586001-00;Parent=transcript:OsNip_11t0586001-00;protein_id=OsNip_11t0586001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22167971	22173473	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0586100;Name=OsNip_PP2C76;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22167971	22173473	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0586100-01;Parent=gene:OsNip_11g0586100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0586100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22167971	22167972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22167971	22168170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Name=OsNip_11t0586100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0586100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22168622	22168709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Name=OsNip_11t0586100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0586100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22169385	22169456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Name=OsNip_11t0586100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0586100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22172233	22172287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Name=OsNip_11t0586100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0586100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22172233	22172287	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0586100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;protein_id=OsNip_11t0586100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22172801	22172860	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0586100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;protein_id=OsNip_11t0586100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22172801	22173473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Name=OsNip_11t0586100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0586100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22172861	22173473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22173439	22174799	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0586200;Name=OsNip_CML6;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22173768	22174764	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0586200-00;Parent=gene:OsNip_11g0586200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22173768	22173897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;Name=OsNip_11t0586200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0586200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22173768	22173897	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0586200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;protein_id=OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22173974	22174065	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;Name=OsNip_11t0586200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0586200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22173974	22174065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0586200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;protein_id=OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22174176	22174333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;Name=OsNip_11t0586200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0586200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22174176	22174333	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0586200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;protein_id=OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22174681	22174756	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0586200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;protein_id=OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22174681	22174764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;Name=OsNip_11t0586200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0586200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22174757	22174764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	22173439	22174799	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0586200-01;Parent=gene:OsNip_11g0586200;transcript_id=OsNip_11t0586200-01;Tag=IsoSeq:G16142.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9536.1
Chr11	TAMA	exon	22174681	22174799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0586200-01;Name=OsNip_11t0586200-01;exon_id=OsNip_11t0586200-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16142.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9536.1;prot_id "UniRef90_A0A7L3WX56";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	22174681	22174797	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0586200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0586200-01;protein_id=OsNip_11t0586200-01;Tag=IsoSeq:G16142.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9536.1;prot_id "UniRef90_A0A7L3WX56";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22230843	22231042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22228797	22228850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22228797	22230884	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587100-00;Name=OsNip_11t0587100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0587100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22228851	22230884	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0587100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0587100-00;protein_id=OsNip_11t0587100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22241765	22244524	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0587300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22241918	22244524	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0587300-00;Parent=gene:OsNip_11g0587300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0587300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22241918	22243987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-00;Name=OsNip_11t0587300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0587300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22241918	22243987	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0587300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0587300-00;protein_id=OsNip_11t0587300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22244078	22244524	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-00;Name=OsNip_11t0587300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0587300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22244078	22244524	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0587300-00;Parent=transcript:OsNip_11t0587300-00;protein_id=OsNip_11t0587300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	22241765	22244291	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0587300-01;Parent=gene:OsNip_11g0587300;transcript_id=OsNip_11t0587300-01;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2
Chr11	TAMA	exon	22244078	22244291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;Name=OsNip_11t0587300-01;exon_id=OsNip_11t0587300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	22244078	22244291	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0587300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;protein_id=OsNip_11t0587300-01;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	exon	22242794	22243987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;Name=OsNip_11t0587300-01;exon_id=OsNip_11t0587300-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	CDS	22243614	22243987	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0587300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;protein_id=OsNip_11t0587300-01;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	exon	22241765	22242718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;Name=OsNip_11t0587300-01;exon_id=OsNip_11t0587300-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	22242794	22243611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	22241765	22242718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587300-01;Tag=IsoSeq:G16145.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12628.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WXK2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22267488	22271475	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0587500;biotype=protein_coding;description=RabGAP/TBC;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22267505	22271370	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0587500-01;Parent=gene:OsNip_11g0587500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22267505	22267731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Name=OsNip_11t0587500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0587500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22267505	22267731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22267848	22267931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22268077	22268340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Name=OsNip_11t0587500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0587500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22268077	22268340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22268530	22268627	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22268726	22268748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22268726	22268817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;Name=OsNip_11t0587500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0587500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22268749	22268817	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0587500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0587500-01;protein_id=OsNip_11t0587500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22518901	22519086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592350-00;Name=OsNip_11t0592350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0592350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22524144	22524296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22525661	22525997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22527212	22527352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22527452	22527783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22527452	22527936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Name=OsNip_11t0592375-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0592375-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22527784	22527936	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0592375-00;Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;protein_id=OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22528874	22529580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;Name=OsNip_11t0592375-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0592375-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22528874	22529580	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0592375-00;Parent=transcript:OsNip_11t0592375-00;protein_id=OsNip_11t0592375-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22523670	22529610	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0592400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22565335	22565343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22565069	22565449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592850-00;Name=OsNip_11t0592850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0592850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22566058	22566351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592900-01;Name=OsNip_11t0592900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0592900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22568041	22568508	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0592900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0592900-01;protein_id=OsNip_11t0592900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22568041	22568588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592900-01;Name=OsNip_11t0592900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0592900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22568509	22568588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0592900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22569981	22576763	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0593000;Name=OsNip_NPC4;biotype=protein_coding;description=Phosphoesterase;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22569981	22576763	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0593000-01;Parent=gene:OsNip_11g0593000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22569981	22570198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22570199	22571183	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0593000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0593000-01;protein_id=OsNip_11t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22576060	22576682	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0593000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0593000-01;protein_id=OsNip_11t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22576060	22576763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593000-01;Name=OsNip_11t0593000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0593000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22576683	22576763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22577889	22579413	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0593100-01;Parent=gene:OsNip_11g0593100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0593100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22577889	22577947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22577889	22579413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593100-01;Name=OsNip_11t0593100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0593100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22577948	22579339	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0593100-01;Parent=transcript:OsNip_11t0593100-01;protein_id=OsNip_11t0593100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22579340	22579413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0593100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22604874	22606587	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0593500;Name=OsNip_Fbox618;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22658454	22660151	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0595100-01;Parent=gene:OsNip_11g0595100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22658454	22658663	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22660051	22660151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0595100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22660534	22662341	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0595200-01;Parent=gene:OsNip_11g0595200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0595200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22660534	22660715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0595200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22661026	22661268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0595200-01;Name=OsNip_11t0595200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0595200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22676137	22682472	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596000-00;Name=OsNip_11t0596000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0596000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22698542	22699330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0596200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0596200-00;protein_id=OsNip_11t0596200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	22703963	22704299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596200-01;Tag=IsoSeq:G16167.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9548.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9XSZ0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22699434	22700501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22699434	22700917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-01;Name=OsNip_11t0596250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0596250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22700502	22700789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0596250-01;Parent=transcript:OsNip_11t0596250-01;protein_id=OsNip_11t0596250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22700790	22700917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	CDS	22699398	22699670	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0596250-02;Parent=transcript:OsNip_11t0596250-02;protein_id=OsNip_11t0596250-02;Tag=IsoSeq:G16167.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7280.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0C4I7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	22700017	22700918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-02;Name=OsNip_11t0596250-02;exon_id=OsNip_11t0596250-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16167.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7280.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0C4I7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	22699396	22699397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-02;Tag=IsoSeq:G16167.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7280.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0C4I7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	22699674	22699873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-02;Tag=IsoSeq:G16167.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7280.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0C4I7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	22700017	22700918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0596250-02;Tag=IsoSeq:G16167.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7280.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0C4I7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22763793	22767680	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0597400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22763793	22767680	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0597400-00;Parent=gene:OsNip_11g0597400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0597400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22763793	22767680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0597400-00;Name=OsNip_11t0597400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0597400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22763793	22767680	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0597400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0597400-00;protein_id=OsNip_11t0597400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22768985	22771759	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0597500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22913591	22913800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Name=OsNip_11t0599101-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0599101-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22914510	22914773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Name=OsNip_11t0599101-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0599101-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22914854	22914983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Name=OsNip_11t0599101-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0599101-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22914854	22914983	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0599101-01;Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;protein_id=OsNip_11t0599101-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22915200	22915333	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0599101-01;Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;protein_id=OsNip_11t0599101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22916314	22916394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Name=OsNip_11t0599101-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0599101-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22916314	22916394	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0599101-01;Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;protein_id=OsNip_11t0599101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22916833	22916919	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0599101-01;Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;protein_id=OsNip_11t0599101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	22916833	22917067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Name=OsNip_11t0599101-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0599101-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22916920	22917067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	22916768	22922200	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0599100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	22916768	22922200	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0599100-01;Parent=gene:OsNip_11g0599100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0599100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22916768	22922200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599100-01;Name=OsNip_11t0599100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0599100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22944218	22944537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599400-00;Name=OsNip_11t0599400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0599400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	22948353	22954688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0599466-01;Name=OsNip_11t0599466-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0599466-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	22952930	22953043	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0599500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0599500-00;protein_id=OsNip_11t0599500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23053079	23053200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23053079	23053500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600301-01;Name=OsNip_11t0600301-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0600301-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23060525	23061100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600500-00;Name=OsNip_11t0600500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0600500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23060525	23061100	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0600500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0600500-00;protein_id=OsNip_11t0600500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23063476	23064575	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0600600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23063476	23064575	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0600600-01;Parent=gene:OsNip_11g0600600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0600600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23063476	23064085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23063476	23064575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600600-01;Name=OsNip_11t0600600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0600600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23064086	23064322	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0600600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0600600-01;protein_id=OsNip_11t0600600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23064323	23064575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23081358	23081682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0600900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23132266	23132781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0601600-01;Name=OsNip_11t0601600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0601600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23128793	23129447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0601650-00;Name=OsNip_11t0601650-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0601650-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23175522	23176030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602300-01;Name=OsNip_11t0602300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0602300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23176017	23176030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23176118	23176340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602300-01;Name=OsNip_11t0602300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	23176608	23178790	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0602400;biotype=protein_coding;description=tRNA;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23176608	23178790	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0602400-01;Parent=gene:OsNip_11g0602400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23176608	23176679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602400-01;Name=OsNip_11t0602400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23176608	23176679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23177798	23177848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23177798	23178790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602400-01;Name=OsNip_11t0602400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23178728	23178790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23180328	23182830	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0602500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23181023	23182739	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0602500-00;Parent=gene:OsNip_11g0602500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23181023	23181474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-00;Name=OsNip_11t0602500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0602500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23181023	23181474	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0602500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0602500-00;protein_id=OsNip_11t0602500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23182369	23182546	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0602500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0602500-00;protein_id=OsNip_11t0602500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23182369	23182739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-00;Name=OsNip_11t0602500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0602500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23182547	23182739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	23180328	23182830	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0602500-01;Parent=gene:OsNip_11g0602500;transcript_id=OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1
Chr11	TAMA	exon	23180328	23180433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Name=OsNip_11t0602500-01;exon_id=OsNip_11t0602500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	CDS	23180329	23180433	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0602500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;protein_id=OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	exon	23181093	23181474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Name=OsNip_11t0602500-01;exon_id=OsNip_11t0602500-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	CDS	23181093	23181149	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0602500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;protein_id=OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	exon	23182369	23182830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Name=OsNip_11t0602500-01;exon_id=OsNip_11t0602500-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	23180328	23180328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	23181153	23181474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	23182369	23182830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602500-01;Tag=IsoSeq:G16178.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12653.2,Nipponbare.root_G9555.1;prot_id "UniRef90_A0A4P1RTW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23181093	23182560	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0602550;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23181093	23182560	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0602550-00;Parent=gene:OsNip_11g0602550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23181093	23181396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23181093	23181471	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602550-00;Name=OsNip_11t0602550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0602550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23181397	23181471	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0602550-00;Parent=transcript:OsNip_11t0602550-00;protein_id=OsNip_11t0602550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23182366	23182560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602550-00;Name=OsNip_11t0602550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0602550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23182366	23182560	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0602550-00;Parent=transcript:OsNip_11t0602550-00;protein_id=OsNip_11t0602550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23184448	23187520	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0602600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23184448	23187520	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0602600-01;Parent=gene:OsNip_11g0602600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23184448	23184511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23184448	23184539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;Name=OsNip_11t0602600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23184512	23184539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;protein_id=OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23185852	23186233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;Name=OsNip_11t0602600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0602600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23185852	23186233	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;protein_id=OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23187050	23187227	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;protein_id=OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23187050	23187520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;Name=OsNip_11t0602600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0602600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23187228	23187520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23185852	23187221	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0602701;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23185852	23187221	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0602701-00;Parent=gene:OsNip_11g0602701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23185852	23185916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23185852	23186230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;Name=OsNip_11t0602701-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602701-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23185917	23186201	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0602701-00;Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;protein_id=OsNip_11t0602701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23186202	23186230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23187047	23187221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;Name=OsNip_11t0602701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23187047	23187221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23187999	23193264	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0602750;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23187999	23193264	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0602750-01;Parent=gene:OsNip_11g0602750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23187999	23188355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23187999	23188392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Name=OsNip_11t0602750-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0602750-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23188356	23188392	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0602750-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;protein_id=OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23189799	23190029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Name=OsNip_11t0602750-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0602750-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23189799	23190029	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0602750-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;protein_id=OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23190119	23190120	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0602750-01;Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;protein_id=OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23190119	23190215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Name=OsNip_11t0602750-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602750-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23190121	23190215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23190299	23193264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Name=OsNip_11t0602750-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0602750-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23190299	23193264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0602750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23223865	23224222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0603000-01;Name=OsNip_11t0603000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0603000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23224036	23224222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0603000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23226173	23226629	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0603100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23226173	23226629	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0603100-00;Parent=gene:OsNip_11g0603100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0603100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23226173	23226523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0603100-00;Name=OsNip_11t0603100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0603100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23283945	23284215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23284744	23284798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23291054	23294464	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0604600-01;Parent=gene:OsNip_11g0604600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23291054	23291222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23292202	23292310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604600-01;Name=OsNip_11t0604600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0604600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23292202	23292310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0604600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0604600-01;protein_id=OsNip_11t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23293546	23293669	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0604600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0604600-01;protein_id=OsNip_11t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23293763	23294036	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604600-01;Name=OsNip_11t0604600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0604600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23294120	23294409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0604600-02;Name=OsNip_11t0604600-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0604600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23375538	23377769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23375538	23378661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0605900-01;Name=OsNip_11t0605900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0605900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23377770	23378552	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0605900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0605900-01;protein_id=OsNip_11t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	23378597	23379194	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0606001;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23378597	23378799	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0606001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23378597	23379194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0606001-00;Name=OsNip_11t0606001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0606001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23378905	23379194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0606001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23415625	23418653	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0606800-00;Parent=gene:OsNip_11g0606800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0606800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23421851	23426690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0607000-01;Parent=gene:OsNip_11g0607000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23421851	23422185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23422774	23423799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23425933	23426080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0607000-01;Name=OsNip_11t0607000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0607000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23425933	23426080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0607000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23495358	23496012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608300-01;Name=OsNip_11t0608300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0608300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23495772	23496012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23492074	23495767	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0608500-00;Parent=gene:OsNip_11g0608500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0608500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23492074	23492337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608500-00;Name=OsNip_11t0608500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0608500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23492421	23492627	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608500-00;Name=OsNip_11t0608500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0608500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23494068	23494202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608500-00;Name=OsNip_11t0608500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0608500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23494314	23494534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608500-00;Name=OsNip_11t0608500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0608500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23495326	23495767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0608500-00;Name=OsNip_11t0608500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0608500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23511523	23513127	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0608700;Name=OsNip_RLCK338;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23511523	23513127	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0608700-00;Parent=gene:OsNip_11g0608700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0608700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23574713	23575575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0609760-00;Name=OsNip_11t0609760-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0609760-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23585674	23595238	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0610000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23585674	23595238	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0610000-00;Parent=gene:OsNip_11g0610000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0610000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23635474	23636013	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0611100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0611100-00;protein_id=OsNip_11t0611100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23636014	23636133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0611100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23661546	23664304	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0611600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23663522	23663677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0611600-01;Name=OsNip_11t0611600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0611600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23663557	23663677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0611600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23663942	23664304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0611600-01;Name=OsNip_11t0611600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0611600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23663942	23664304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0611600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23735475	23736432	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0612950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23735475	23736432	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0612950-00;Parent=gene:OsNip_11g0612950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0612950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23735475	23735684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0612950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23735475	23735770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0612950-00;Name=OsNip_11t0612950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0612950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23735685	23735770	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0612950-00;Parent=transcript:OsNip_11t0612950-00;protein_id=OsNip_11t0612950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23736276	23736432	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0612950-00;Name=OsNip_11t0612950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0612950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23736276	23736432	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0612950-00;Parent=transcript:OsNip_11t0612950-00;protein_id=OsNip_11t0612950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23802873	23803362	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0613950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23802873	23803362	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0613950-00;Parent=gene:OsNip_11g0613950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0613950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23802873	23803362	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0613950-00;Name=OsNip_11t0613950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0613950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	23844616	23848520	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0614400;Name=OsNip_pPLAIItheta;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23844616	23848520	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0614400-01;Parent=gene:OsNip_11g0614400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0614400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23844616	23844808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23844616	23844985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614400-01;Name=OsNip_11t0614400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0614400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	23893857	23894222	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0614900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0614900-01;protein_id=OsNip_11t0614900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23893857	23894329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-01;Name=OsNip_11t0614900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0614900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23894223	23894329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	23895453	23896095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-01;Name=OsNip_11t0614900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0614900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23895453	23896095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	23892405	23896059	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0614900-02;Parent=gene:OsNip_11g0614900;transcript_id=OsNip_11t0614900-02;Tag=IsoSeq:G16191.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12663.1,Nipponbare.root_G9562.3
Chr11	TAMA	exon	23892405	23892698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-02;Name=OsNip_11t0614900-02;exon_id=OsNip_11t0614900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16191.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12663.1,Nipponbare.root_G9562.3;prot_id "UniRef90_A0A2R6RMZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	CDS	23892405	23892698	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0614900-02;Parent=transcript:OsNip_11t0614900-02;protein_id=OsNip_11t0614900-02;Tag=IsoSeq:G16191.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12663.1,Nipponbare.root_G9562.3;prot_id "UniRef90_A0A2R6RMZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	exon	23893282	23893339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0614900-02;Name=OsNip_11t0614900-02;exon_id=OsNip_11t0614900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16191.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12663.1,Nipponbare.root_G9562.3;prot_id "UniRef90_A0A2R6RMZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23925810	23926032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0615300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23978805	23979855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0616200-01;Name=OsNip_11t0616200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0616200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	23979343	23979855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0616200-02;Name=OsNip_11t0616200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0616200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	23983327	23987001	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0616300-01;Parent=gene:OsNip_11g0616300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0616300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23983327	23983511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0616300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24043743	24043797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24045125	24045398	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0617800-01;Name=OsNip_11t0617800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0617800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24045249	24045374	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0617800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0617800-01;protein_id=OsNip_11t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24184610	24184783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24184610	24184783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24186197	24186301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24186197	24186301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24187711	24188277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24189104	24189813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24189104	24189813	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0620400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;protein_id=OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24189951	24190138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24189951	24190138	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0620400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;protein_id=OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24190525	24190954	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0620400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;protein_id=OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24190525	24191172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Name=OsNip_11t0620400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24190955	24191172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24184610	24184783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24184610	24184783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24186197	24186301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24186197	24186301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24187433	24187472	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24187433	24187554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24187473	24187554	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0620400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;protein_id=OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24187711	24188277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24187711	24188277	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0620400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;protein_id=OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24189116	24189813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0620400-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24189116	24189813	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0620400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;protein_id=OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24189951	24190138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0620400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24189951	24190138	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0620400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;protein_id=OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24190525	24190954	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0620400-02;Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;protein_id=OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24190525	24191330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Name=OsNip_11t0620400-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0620400-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24190955	24191330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0620400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24213606	24213990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0621000-01;Name=OsNip_11t0621000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0621000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	24214216	24214479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0621000-03;Name=OsNip_11t0621000-03;exon_id=OsNip_11t0621000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9570.3;prot_id "UniRef90_B4FFA0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	TAMA	three_prime_UTR	24214216	24214279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0621000-03;Tag=IsoSeq:G16206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9570.3;prot_id "UniRef90_B4FFA0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	24213606	24213990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0621000-03;Tag=IsoSeq:G16206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9570.3;prot_id "UniRef90_B4FFA0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	24210707	24211624	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0621000-03;Tag=IsoSeq:G16206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9570.3;prot_id "UniRef90_B4FFA0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24218226	24218772	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0621200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24218226	24218772	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0621200-00;Parent=gene:OsNip_11g0621200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0621200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24383517	24384066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0623700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24387280	24390444	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0623800;Name=OsNip_h359-3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24387280	24390444	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0623800-00;Parent=gene:OsNip_11g0623800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0623800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24414689	24414689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0624400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24414690	24415712	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0624400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0624400-01;protein_id=OsNip_11t0624400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24415713	24415797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0624400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24485473	24486679	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0625400;biotype=protein_coding;description=Putative;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24485473	24486679	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0625400-00;Parent=gene:OsNip_11g0625400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0625400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24485473	24485652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;Name=OsNip_11t0625400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0625400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24485473	24485652	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0625400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;protein_id=OsNip_11t0625400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24485802	24485914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;Name=OsNip_11t0625400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0625400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24485802	24485914	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0625400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;protein_id=OsNip_11t0625400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24486222	24486284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;Name=OsNip_11t0625400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0625400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24486222	24486284	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0625400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;protein_id=OsNip_11t0625400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24486388	24486679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;Name=OsNip_11t0625400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0625400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24486388	24486679	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0625400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0625400-00;protein_id=OsNip_11t0625400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24504245	24504966	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0625700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24619216	24619613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0628000-00;Name=OsNip_11t0628000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0628000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24619581	24619613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0628000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24628996	24629376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0628101-00;Name=OsNip_11t0628101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0628101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24638208	24639893	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0629100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24638208	24638493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629100-00;Name=OsNip_11t0629100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0629100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24638208	24638493	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0629100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0629100-00;protein_id=OsNip_11t0629100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24639046	24639872	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0629100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0629100-00;protein_id=OsNip_11t0629100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24639046	24639893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629100-00;Name=OsNip_11t0629100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0629100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24639873	24639893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24638369	24639376	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0629150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24638369	24639376	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0629150-00;Parent=gene:OsNip_11g0629150;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0629150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24638369	24638529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629150-00;Name=OsNip_11t0629150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0629150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24638970	24639376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629150-00;Name=OsNip_11t0629150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0629150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24642531	24646800	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0629200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24642531	24646800	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0629200-01;Parent=gene:OsNip_11g0629200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0629200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24642531	24642695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24642531	24642698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629200-01;Name=OsNip_11t0629200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0629200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24642774	24642848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629200-01;Name=OsNip_11t0629200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0629200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24651999	24652289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24655912	24659328	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0629500-01;Parent=gene:OsNip_11g0629500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0629500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24655912	24656162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24658373	24658505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629500-01;Name=OsNip_11t0629500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0629500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24658615	24658840	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0629500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0629500-01;protein_id=OsNip_11t0629500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24658615	24658851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0629500-01;Name=OsNip_11t0629500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0629500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24810741	24811355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631450-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24812937	24813608	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0631600-00;Parent=transcript:OsNip_11t0631600-00;protein_id=OsNip_11t0631600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24824252	24825165	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0631800;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24824252	24825165	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0631800-01;Parent=gene:OsNip_11g0631800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0631800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24824252	24824820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631800-01;Name=OsNip_11t0631800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0631800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24824927	24825165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631800-01;Name=OsNip_11t0631800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0631800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24825414	24829193	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0631825;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24825414	24829193	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0631825-01;Parent=gene:OsNip_11g0631825;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0631825-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24825414	24827788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631825-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24825414	24829193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631825-01;Name=OsNip_11t0631825-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0631825-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24827789	24828016	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0631825-01;Parent=transcript:OsNip_11t0631825-01;protein_id=OsNip_11t0631825-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24828017	24829193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631825-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24828010	24832958	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0631900;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24828010	24832958	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0631900-01;Parent=gene:OsNip_11g0631900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24828010	24828095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24828010	24828102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;Name=OsNip_11t0631900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0631900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24828096	24828102	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0631900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;protein_id=OsNip_11t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24830322	24830635	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0631900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;protein_id=OsNip_11t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24830322	24832958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;Name=OsNip_11t0631900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0631900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24830636	24832958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24847426	24853969	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0632200-01;Parent=gene:OsNip_11g0632200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24847426	24848254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Name=OsNip_11t0632200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0632200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24847426	24848254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24848329	24848349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24848329	24848705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Name=OsNip_11t0632200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0632200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24848350	24848705	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0632200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;protein_id=OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24853624	24853666	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0632200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;protein_id=OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24853624	24853762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Name=OsNip_11t0632200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0632200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24853667	24853762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24853851	24853969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Name=OsNip_11t0632200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0632200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24853851	24853969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0632200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24911501	24917112	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0633500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24911501	24917044	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0633500-01;Parent=gene:OsNip_11g0633500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24911501	24911615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Name=OsNip_11t0633500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0633500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24911501	24911615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24911928	24913388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24911928	24914965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Name=OsNip_11t0633500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0633500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24913389	24914965	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0633500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;protein_id=OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24915268	24915277	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0633500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;protein_id=OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24915268	24916290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Name=OsNip_11t0633500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0633500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24915278	24916290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24916707	24917044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Name=OsNip_11t0633500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0633500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24916707	24917044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	24911504	24917112	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0633500-02;Parent=gene:OsNip_11g0633500;transcript_id=OsNip_11t0633500-02;Tag=IsoSeq:G16220.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12686.3
Chr11	TAMA	exon	24911504	24914965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633500-02;Name=OsNip_11t0633500-02;exon_id=OsNip_11t0633500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16220.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12686.3;prot_id "UniRef90_M7YLA5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24927833	24928093	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24934412	24935033	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0633800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0633800-01;protein_id=OsNip_11t0633800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24934412	24935140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633800-01;Name=OsNip_11t0633800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0633800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24935034	24935140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0633800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24950810	24952652	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0634200-01;Parent=gene:OsNip_11g0634200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24950810	24950969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24950810	24951539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Name=OsNip_11t0634200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0634200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24950970	24951539	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0634200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;protein_id=OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24951646	24951705	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0634200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;protein_id=OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24951646	24951786	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Name=OsNip_11t0634200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24951706	24951786	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24952497	24952652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Name=OsNip_11t0634200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24952497	24952652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24958875	24960194	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0634350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24958875	24960194	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0634350-01;Parent=gene:OsNip_11g0634350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0634350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24958875	24960194	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634350-01;Name=OsNip_11t0634350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24973683	24975298	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0634500;biotype=protein_coding;description=40S;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24973683	24975298	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0634500-00;Parent=gene:OsNip_11g0634500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24973683	24973758	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24973683	24973820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;Name=OsNip_11t0634500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24973759	24973820	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;protein_id=OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24974664	24974763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;Name=OsNip_11t0634500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0634500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24974664	24974763	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;protein_id=OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24975042	24975050	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;protein_id=OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24975042	24975298	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;Name=OsNip_11t0634500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0634500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24975051	24975298	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	24980227	24984249	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0634700;Name=OsNip_bHLH132;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	24980227	24984249	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0634700-00;Parent=gene:OsNip_11g0634700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24980227	24980441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;Name=OsNip_11t0634700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0634700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24980227	24980441	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0634700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;protein_id=OsNip_11t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24982830	24983277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;Name=OsNip_11t0634700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0634700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24982830	24983277	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0634700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;protein_id=OsNip_11t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24983351	24983539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;Name=OsNip_11t0634700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0634700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	24983351	24983539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0634700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0634700-00;protein_id=OsNip_11t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	24992064	24992204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634902-01;Name=OsNip_11t0634902-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634902-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24992305	24992667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634902-01;Name=OsNip_11t0634902-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634902-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24992774	24992858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634902-01;Name=OsNip_11t0634902-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634902-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24992930	24992976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634902-01;Name=OsNip_11t0634902-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634902-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	24993134	24993465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0634902-01;Name=OsNip_11t0634902-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0634902-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25004867	25009215	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0635000-01;Parent=gene:OsNip_11g0635000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0635000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25004867	25006909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25004867	25007147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;Name=OsNip_11t0635000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0635000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25006910	25007147	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0635000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;protein_id=OsNip_11t0635000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25008167	25008190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;Name=OsNip_11t0635000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0635000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25008167	25008190	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0635000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;protein_id=OsNip_11t0635000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25008674	25008999	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0635000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0635000-01;protein_id=OsNip_11t0635000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25178618	25178774	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0637501-00;Parent=transcript:OsNip_11t0637501-00;protein_id=OsNip_11t0637501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25180179	25180181	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0637501-00;Parent=transcript:OsNip_11t0637501-00;protein_id=OsNip_11t0637501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25180179	25180272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637501-00;Name=OsNip_11t0637501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0637501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25180182	25180272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	25177818	25180272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0637501-01;Parent=gene:OsNip_11g0637501;transcript_id=OsNip_11t0637501-01;Tag=IsoSeq:G16229.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9583.3,Nipponbare.panicle_G12693.3
Chr11	TAMA	exon	25177818	25180272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637501-01;Name=OsNip_11t0637501-01;exon_id=OsNip_11t0637501-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16229.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9583.3,Nipponbare.panicle_G12693.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MHH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	25180134	25180271	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0637501-01;Parent=transcript:OsNip_11t0637501-01;protein_id=OsNip_11t0637501-01;Tag=IsoSeq:G16229.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9583.3,Nipponbare.panicle_G12693.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MHH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	25180272	25180272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637501-01;Tag=IsoSeq:G16229.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9583.3,Nipponbare.panicle_G12693.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MHH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	25177818	25180131	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637501-01;Tag=IsoSeq:G16229.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9583.3,Nipponbare.panicle_G12693.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MHH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25182326	25183324	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0637600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25182326	25183324	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0637600-00;Parent=gene:OsNip_11g0637600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0637600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25182326	25183258	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0637600-00;Parent=transcript:OsNip_11t0637600-00;protein_id=OsNip_11t0637600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25182326	25183324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637600-00;Name=OsNip_11t0637600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0637600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25183259	25183324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0637600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	25247599	25247638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0638900-01;Name=OsNip_11t0638900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0638900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25247599	25247638	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0638900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0638900-01;protein_id=OsNip_11t0638900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	25249045	25249767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0638900-02;Name=OsNip_11t0638900-02;exon_id=OsNip_11t0638900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16233.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12697.1,Nipponbare.root_G9586.2,Nipponbare.root_G9586.1,Nipponbare.leaf_G7309.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1ZBZ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	TAMA	exon	25247599	25247833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0638900-02;Name=OsNip_11t0638900-02;exon_id=OsNip_11t0638900-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G16233.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12697.1,Nipponbare.root_G9586.2,Nipponbare.root_G9586.1,Nipponbare.leaf_G7309.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1ZBZ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	25261729	25261831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639000-00;Name=OsNip_11t0639000-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0639000-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	25261948	25262024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639000-00;Name=OsNip_11t0639000-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639000-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25261948	25262024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25262190	25262271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639000-00;Name=OsNip_11t0639000-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639000-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25262190	25262271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25263336	25264276	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0639100;Name=Pi-kh;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25263336	25264276	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0639100-00;Parent=gene:OsNip_11g0639100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0639100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25263336	25263937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25263336	25264276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639100-00;Name=OsNip_11t0639100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0639100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25263938	25264276	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0639100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0639100-00;protein_id=OsNip_11t0639100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25276091	25278366	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0639300;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25276091	25278366	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0639300-01;Parent=gene:OsNip_11g0639300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25276091	25276113	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25276091	25278366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639300-01;Name=OsNip_11t0639300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25276114	25278294	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0639300-01;protein_id=OsNip_11t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25278295	25278366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25279810	25280531	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0639400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25279810	25280531	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0639400-01;Parent=gene:OsNip_11g0639400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0639400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25279810	25280206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25279810	25280531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639400-01;Name=OsNip_11t0639400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25280207	25280530	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0639400-01;Parent=transcript:OsNip_11t0639400-01;protein_id=OsNip_11t0639400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25280531	25280531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25289129	25293951	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0639600;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25289129	25293951	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0639600-01;Parent=gene:OsNip_11g0639600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25289129	25289527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Name=OsNip_11t0639600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25289129	25289527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25289653	25289718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25289653	25292644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Name=OsNip_11t0639600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25289719	25292526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0639600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;protein_id=OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25292527	25292644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25293475	25293951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Name=OsNip_11t0639600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25293475	25293951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25289291	25293844	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0639600-02;Parent=gene:OsNip_11g0639600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25289291	25289527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Name=OsNip_11t0639600-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25289291	25289527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25289653	25289718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25289653	25292644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Name=OsNip_11t0639600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25289719	25292526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0639600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;protein_id=OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25292527	25292644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25293475	25293844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Name=OsNip_11t0639600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25293475	25293844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25304174	25304459	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0639850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25304174	25304459	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0639850-00;Parent=gene:OsNip_11g0639850;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0639850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25304174	25304459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0639850-00;Name=OsNip_11t0639850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0639850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25316103	25318049	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0640000;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25316103	25318049	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0640000-00;Parent=gene:OsNip_11g0640000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0640000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25316103	25318049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0640000-00;Name=OsNip_11t0640000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0640000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	25316103	25318049	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0640000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0640000-00;protein_id=OsNip_11t0640000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	25321323	25325479	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0640300;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25321323	25325479	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0640300-01;Parent=gene:OsNip_11g0640300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0640300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25321323	25321672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0640300-01;Name=OsNip_11t0640300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0640300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25397658	25397734	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0641200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25398113	25398263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0641200-01;Name=OsNip_11t0641200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0641200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25398113	25398263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0641200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	25398942	25399410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0641200-01;Name=OsNip_11t0641200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0641200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25398942	25399410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0641200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	25501586	25503169	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0643100-01;Parent=gene:OsNip_11g0643100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0643100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26259796	26261416	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0655700-00;Parent=gene:OsNip_11g0655700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0655700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26259796	26259991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0655700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26260141	26260141	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0655700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26260142	26261416	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0655700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0655700-00;protein_id=OsNip_11t0655700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26263729	26267141	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0655800;biotype=protein_coding;description=Lipase%2C;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26263729	26263794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0655800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	26276743	26276885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;Name=OsNip_11t0656100-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0656100-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26276743	26276885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26277014	26277057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;Name=OsNip_11t0656100-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0656100-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26278704	26278797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26279206	26279625	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0656100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;protein_id=OsNip_11t0656100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26279626	26279626	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	26284758	26285124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656201-00;Name=OsNip_11t0656201-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0656201-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26284758	26285124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26285138	26285437	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0656201-00;Parent=transcript:OsNip_11t0656201-00;protein_id=OsNip_11t0656201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26285438	26285439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26285141	26285470	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0656400;Name=OsNip_GRX25;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26285141	26285470	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0656400-00;Parent=gene:OsNip_11g0656400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0656400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26285141	26285470	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0656400-00;Name=OsNip_11t0656400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0656400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26285141	26285470	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0656400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0656400-00;protein_id=OsNip_11t0656400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26286551	26291279	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0656500;biotype=protein_coding;description=Integrase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26286551	26291279	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0656500-01;Parent=gene:OsNip_11g0656500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0656500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	26314438	26314502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0657300-01;Name=OsNip_11t0657300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0657300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26314841	26314904	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0657300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0657300-01;protein_id=OsNip_11t0657300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26314841	26315150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0657300-01;Name=OsNip_11t0657300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0657300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26314905	26315150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0657300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	exon	26313074	26313165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0657300-02;Name=OsNip_11t0657300-02;exon_id=OsNip_11t0657300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16262.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7320.1;prot_id "UniRef90_A0A1S3X4P9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	26313076	26313138	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0657300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0657300-02;protein_id=OsNip_11t0657300-02;Tag=IsoSeq:G16262.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7320.1;prot_id "UniRef90_A0A1S3X4P9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26423702	26423716	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0658800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0658800-01;protein_id=OsNip_11t0658800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26423702	26423933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658800-01;Name=OsNip_11t0658800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26435855	26435897	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0658900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;protein_id=OsNip_11t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26435855	26435957	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Name=OsNip_11t0658900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0658900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26435898	26435957	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26436492	26436610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Name=OsNip_11t0658900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26436492	26436610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26436834	26437001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Name=OsNip_11t0658900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26436834	26437001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26437127	26438037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Name=OsNip_11t0658900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26437127	26438037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26435072	26435641	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0658950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26435072	26435641	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0658950-00;Parent=gene:OsNip_11g0658950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0658950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26435072	26435241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658950-00;Name=OsNip_11t0658950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26435346	26435641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0658950-00;Name=OsNip_11t0658950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0658950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26453228	26453757	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0659200;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26453228	26453757	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0659200-00;Parent=gene:OsNip_11g0659200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0659200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	26453228	26453502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659200-00;Name=OsNip_11t0659200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26460072	26460134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26466115	26466165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26466173	26466194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Name=OsNip_11t0659400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26466173	26466194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26466298	26466370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26466463	26466596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Name=OsNip_11t0659400-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659400-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26466463	26466596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26467443	26468058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Name=OsNip_11t0659400-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659400-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26467443	26468058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26466870	26467284	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0659450-00;Parent=gene:OsNip_11g0659450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0659450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26466870	26467284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659450-00;Name=OsNip_11t0659450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26468486	26473248	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0659500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26468486	26473248	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0659500-01;Parent=gene:OsNip_11g0659500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26468486	26468780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26468486	26469035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26468781	26469035	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26469259	26469327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26469259	26469327	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26469469	26469655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26469469	26469655	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26469793	26469906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26469793	26469906	.	-	1	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26471799	26471932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26471799	26471932	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26472036	26472554	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;protein_id=OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26472036	26472618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26472555	26472618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26473112	26473248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Name=OsNip_11t0659500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26473112	26473248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26475503	26478045	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0659600;Name=OsNip_PME32;biotype=protein_coding;description=Pectinesterase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26475503	26478045	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0659600-01;Parent=gene:OsNip_11g0659600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26475503	26475787	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Name=OsNip_11t0659600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26475503	26475787	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26476258	26476326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26476258	26476731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Name=OsNip_11t0659600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0659600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26476327	26476731	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;protein_id=OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26477457	26477972	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;protein_id=OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26477457	26478045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Name=OsNip_11t0659600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0659600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26477973	26478045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	26479839	26482885	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0659700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26479839	26482885	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0659700-00;Parent=gene:OsNip_11g0659700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0659700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26479839	26480047	.	-	2	ID=CDS:OsNip_11t0659700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0659700-00;protein_id=OsNip_11t0659700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26481432	26481690	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0659700-00;Parent=transcript:OsNip_11t0659700-00;protein_id=OsNip_11t0659700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26875084	26875103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26875368	26875425	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26875368	26876085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666100-01;Name=OsNip_11t0666100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0666100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	26877994	26880084	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0666200;Name=OsNip_RLCK345;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	26878083	26880047	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0666200-00;Parent=gene:OsNip_11g0666200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0666200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	26878083	26879195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666200-00;Name=OsNip_11t0666200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0666200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	26879547	26880047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666200-00;Name=OsNip_11t0666200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0666200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	TAMA	mRNA	26877994	26880084	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0666200-01;Parent=gene:OsNip_11g0666200;transcript_id=OsNip_11t0666200-01;Tag=IsoSeq:G16276.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9611.1
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Chr11	TAMA	five_prime_UTR	26879045	26880084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666200-01;Tag=IsoSeq:G16276.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9611.1;prot_id "UniRef90_A3CHL0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	26877994	26878766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0666200-01;Tag=IsoSeq:G16276.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9611.1;prot_id "UniRef90_A3CHL0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	26946160	26946546	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0667700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0667700-01;protein_id=OsNip_11t0667700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26946547	26946885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0667700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27142195	27145889	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0671650-01;Parent=gene:OsNip_11g0671650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0671650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27142195	27145146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0671650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27142195	27145889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0671650-01;Name=OsNip_11t0671650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0671650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27150145	27150200	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0671950-00;Parent=transcript:OsNip_11t0671950-00;protein_id=OsNip_11t0671950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27150306	27150408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0671950-00;Name=OsNip_11t0671950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0671950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27150306	27150408	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0671950-00;Parent=transcript:OsNip_11t0671950-00;protein_id=OsNip_11t0671950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27152946	27153181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27155346	27157693	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0672300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27155346	27157693	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0672300-01;Parent=gene:OsNip_11g0672300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27155346	27155397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27155398	27155835	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0672300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;protein_id=OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27156109	27156315	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0672300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;protein_id=OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27156109	27156786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;Name=OsNip_11t0672300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0672300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27156316	27156786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27157033	27157693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;Name=OsNip_11t0672300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0672300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27157033	27157693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0672300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27158736	27165378	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0672400;biotype=protein_coding;description=Calponin;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27159075	27165177	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0672400-00;Parent=gene:OsNip_11g0672400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0672400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	gene	27260056	27265613	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0674400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27261093	27264194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-00;Name=OsNip_11t0674400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0674400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27261093	27264194	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0674400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0674400-00;protein_id=OsNip_11t0674400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	27260056	27265613	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0674400-01;Parent=gene:OsNip_11g0674400;transcript_id=OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1
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Chr11	TAMA	exon	27260231	27260390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Name=OsNip_11t0674400-01;exon_id=OsNip_11t0674400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	exon	27261034	27264220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Name=OsNip_11t0674400-01;exon_id=OsNip_11t0674400-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr11	TAMA	exon	27265532	27265613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Name=OsNip_11t0674400-01;exon_id=OsNip_11t0674400-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27260056	27260143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27260231	27260390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27261034	27263529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	27263812	27264220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	27265532	27265613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674400-01;Tag=IsoSeq:G16285.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0BM38";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27272132	27272680	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0676050;Name=OsNip_h359-2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27272132	27272680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676050-00;Name=OsNip_11t0676050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0676050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27272132	27272680	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0676050-00;Parent=transcript:OsNip_11t0676050-00;protein_id=OsNip_11t0676050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27279901	27280797	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0674932;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27279901	27280797	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0674932-00;Parent=gene:OsNip_11g0674932;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0674932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27279901	27279963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27279901	27280042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;Name=OsNip_11t0674932-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0674932-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27279964	27280042	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0674932-00;Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;protein_id=OsNip_11t0674932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27280508	27280686	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0674932-00;Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;protein_id=OsNip_11t0674932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27280508	27280797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;Name=OsNip_11t0674932-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0674932-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27280687	27280797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0674932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27284263	27285315	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0675200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27284263	27285315	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0675200-00;Parent=gene:OsNip_11g0675200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0675200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27284263	27285040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0675200-00;Name=OsNip_11t0675200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0675200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27284263	27285040	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0675200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0675200-00;protein_id=OsNip_11t0675200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27285092	27285315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0675200-00;Name=OsNip_11t0675200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0675200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27285092	27285315	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0675200-00;Parent=transcript:OsNip_11t0675200-00;protein_id=OsNip_11t0675200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27321474	27322040	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0676500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27321474	27322040	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0676500-00;Parent=gene:OsNip_11g0676500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0676500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27321474	27322040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676500-00;Name=OsNip_11t0676500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0676500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27321474	27322040	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0676500-00;Parent=transcript:OsNip_11t0676500-00;protein_id=OsNip_11t0676500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27331081	27339928	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0676650;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27331081	27339928	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0676650-00;Parent=gene:OsNip_11g0676650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0676650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27331081	27331272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676650-00;Name=OsNip_11t0676650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0676650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27331081	27331272	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0676650-00;Parent=transcript:OsNip_11t0676650-00;protein_id=OsNip_11t0676650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27339663	27339713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0676650-00;Parent=transcript:OsNip_11t0676650-00;protein_id=OsNip_11t0676650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27339663	27339928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676650-00;Name=OsNip_11t0676650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0676650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27339714	27339928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27334136	27338080	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0676800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27335214	27337380	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0676800-00;Parent=gene:OsNip_11g0676800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0676800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27335214	27337068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0676800-00;Name=OsNip_11t0676800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0676800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27413485	27413606	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0678301-00;Parent=transcript:OsNip_11t0678301-00;protein_id=OsNip_11t0678301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27415256	27415634	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0678301-00;Parent=transcript:OsNip_11t0678301-00;protein_id=OsNip_11t0678301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27415256	27415869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0678301-00;Name=OsNip_11t0678301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0678301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27415635	27415869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0678301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27428398	27430560	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0678400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27428398	27430560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0678400-00;Name=OsNip_11t0678400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0678400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27428398	27430560	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0678400-00;Parent=transcript:OsNip_11t0678400-00;protein_id=OsNip_11t0678400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27449573	27458955	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0679000;biotype=protein_coding;description=von;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27451209	27452951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-00;Name=OsNip_11t0679000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0679000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27451209	27452951	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0679000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0679000-00;protein_id=OsNip_11t0679000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	27449573	27458955	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0679000-01;Parent=gene:OsNip_11g0679000;transcript_id=OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3
Chr11	TAMA	exon	27458861	27458955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Name=OsNip_11t0679000-01;exon_id=OsNip_11t0679000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	27451275	27452951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Name=OsNip_11t0679000-01;exon_id=OsNip_11t0679000-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	27451275	27451776	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0679000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;protein_id=OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	exon	27449573	27449966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Name=OsNip_11t0679000-01;exon_id=OsNip_11t0679000-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	CDS	27449878	27449966	.	-	.	ID=CDS:OsNip_11t0679000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;protein_id=OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27458861	27458955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27451777	27452951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	27449573	27449875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679000-01;Tag=IsoSeq:G16295.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9620.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XVE7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27486903	27490269	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0679700;Name=OsNip_GPAT3;biotype=protein_coding;description=Glycerol-3-phosphate;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27486903	27490269	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0679700-01;Parent=gene:OsNip_11g0679700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0679700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27486903	27486965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27486903	27487670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;Name=OsNip_11t0679700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0679700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27486966	27487670	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0679700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;protein_id=OsNip_11t0679700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27489086	27490012	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0679700-01;Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;protein_id=OsNip_11t0679700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27489086	27490269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;Name=OsNip_11t0679700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0679700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27490013	27490269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0679700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27595911	27596159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-01;Name=OsNip_11t0682300-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0682300-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27595911	27596159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	27591009	27596209	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0682300-02;Parent=gene:OsNip_11g0682300;transcript_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1
Chr11	TAMA	exon	27591009	27591085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27591011	27591085	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27592126	27592406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27592126	27592406	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27592594	27592698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27592594	27592698	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27593079	27593155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27593079	27593155	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27594187	27594251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27594187	27594251	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27594361	27594402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27594361	27594402	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27594485	27594544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27594485	27594544	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27594683	27595303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27594683	27595303	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27595415	27595550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27595415	27595550	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27595767	27595834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27595767	27595834	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	exon	27595911	27596209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Name=OsNip_11t0682300-02;exon_id=OsNip_11t0682300-02-E11;rank=11;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	CDS	27595911	27596042	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0682300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;protein_id=OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	five_prime_UTR	27591009	27591010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	TAMA	three_prime_UTR	27596046	27596209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682300-02;Tag=IsoSeq:G16297.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12740.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27603341	27604492	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0682501;biotype=protein_coding;description=Disease;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27603341	27604492	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0682501-00;Parent=gene:OsNip_11g0682501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0682501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27603341	27604492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682501-00;Name=OsNip_11t0682501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0682501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27603341	27604492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0682501-00;Parent=transcript:OsNip_11t0682501-00;protein_id=OsNip_11t0682501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27605099	27609143	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0682600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27605099	27609143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0682600-01;Parent=gene:OsNip_11g0682600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0682600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27605099	27605787	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0682600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0682600-01;protein_id=OsNip_11t0682600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27605099	27609143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682600-01;Name=OsNip_11t0682600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0682600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27605788	27609143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0682600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27648703	27655229	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0683500;Name=OsNip_11bglu36;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27648703	27655229	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0683500-02;Parent=gene:OsNip_11g0683500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0683500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27648703	27649441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0683500-02;Name=OsNip_11t0683500-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0683500-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27648703	27649441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0683500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27789087	27789679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0686450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	27888287	27890463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0687800-01;Name=OsNip_11t0687800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0687800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27888933	27890463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0687800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27894560	27895117	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0687900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0687900-01;protein_id=OsNip_11t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27895118	27895838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27900364	27901084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0687900-01;Name=OsNip_11t0687900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0687900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27900364	27901084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27908607	27909044	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0688000-00;Parent=gene:OsNip_11g0688000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27908607	27909044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0688000-00;Name=OsNip_11t0688000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0688000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27908607	27909044	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0688000-00;Parent=transcript:OsNip_11t0688000-00;protein_id=OsNip_11t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27911525	27914393	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0688200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27911525	27914393	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0688200-01;Parent=gene:OsNip_11g0688200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27911525	27912343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27911525	27914393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0688200-01;Name=OsNip_11t0688200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0688200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27912344	27912655	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0688200-01;Parent=transcript:OsNip_11t0688200-01;protein_id=OsNip_11t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27912656	27914393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	27978644	27979861	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0688832;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	27978644	27979861	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0688832-00;Parent=gene:OsNip_11g0688832;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0688832-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27978644	27979861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0688832-00;Name=OsNip_11t0688832-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0688832-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27978644	27979861	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0688832-00;Parent=transcript:OsNip_11t0688832-00;protein_id=OsNip_11t0688832-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27981132	27981659	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0689000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0689000-01;protein_id=OsNip_11t0689000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	27990432	27990515	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0689000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0689000-01;protein_id=OsNip_11t0689000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27990432	27990585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0689000-01;Name=OsNip_11t0689000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0689000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27990516	27990585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0689000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	27990683	27991195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0689000-01;Name=OsNip_11t0689000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0689000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28005496	28005824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0689500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28007573	28008464	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0689500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0689500-01;protein_id=OsNip_11t0689500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28058331	28058335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28058331	28059027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Name=OsNip_11t0690066-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690066-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28058336	28059027	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0690066-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;protein_id=OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28061667	28061929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Name=OsNip_11t0690066-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0690066-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28061667	28061929	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0690066-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;protein_id=OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28062302	28062493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Name=OsNip_11t0690066-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0690066-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28062302	28062493	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0690066-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;protein_id=OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28062607	28063664	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0690066-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;protein_id=OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28062607	28063814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Name=OsNip_11t0690066-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0690066-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28063665	28063814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28058495	28063599	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0690154;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28058495	28063599	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0690154-00;Parent=gene:OsNip_11g0690154;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28058495	28059070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Name=OsNip_11t0690154-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690154-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28058495	28059070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28061721	28062127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Name=OsNip_11t0690154-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690154-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28061721	28062127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28062235	28062508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Name=OsNip_11t0690154-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690154-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28062235	28062508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28062613	28062775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28062613	28063599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Name=OsNip_11t0690154-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690154-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28062776	28063141	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0690154-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;protein_id=OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28063142	28063599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690154-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28075457	28076938	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0690332;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28075457	28076938	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0690332-00;Parent=gene:OsNip_11g0690332;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0690332-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28075457	28076118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690332-00;Name=OsNip_11t0690332-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0690332-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28075457	28076118	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0690332-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690332-00;protein_id=OsNip_11t0690332-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28076662	28076938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690332-00;Name=OsNip_11t0690332-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0690332-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28076662	28076938	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0690332-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690332-00;protein_id=OsNip_11t0690332-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28075487	28079800	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0690466;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28075487	28079800	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0690466-00;Parent=gene:OsNip_11g0690466;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28075487	28076188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Name=OsNip_11t0690466-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690466-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28075487	28076188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28076751	28076928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Name=OsNip_11t0690466-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690466-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28076751	28076928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28078238	28078645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Name=OsNip_11t0690466-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690466-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28078238	28078645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28078802	28078814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28078802	28079800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Name=OsNip_11t0690466-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690466-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28078815	28079240	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0690466-00;Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;protein_id=OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28079241	28079800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690466-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28096484	28098045	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0690866;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28096484	28098045	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0690866-01;Parent=gene:OsNip_11g0690866;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_11t0690866-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28096484	28098045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0690866-01;Name=OsNip_11t0690866-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0690866-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28116306	28121906	.	-	.	ID=gene:OsNip_11g0691050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28116306	28121906	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0691050-00;Parent=gene:OsNip_11g0691050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0691050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28116306	28117001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Name=OsNip_11t0691050-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0691050-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28116306	28117001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28119221	28119750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Name=OsNip_11t0691050-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0691050-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28119221	28119750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28120478	28120705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Name=OsNip_11t0691050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0691050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28120478	28120705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28120909	28120981	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28225249	28226162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0691700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28338480	28338578	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0693800-01;Parent=transcript:OsNip_11t0693800-01;protein_id=OsNip_11t0693800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28485473	28485798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28497684	28497731	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28498280	28498365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Name=OsNip_11t0696600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0696600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28498848	28498976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Name=OsNip_11t0696600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0696600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28498848	28498976	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0696600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;protein_id=OsNip_11t0696600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28499366	28499497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Name=OsNip_11t0696600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0696600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28499366	28499497	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0696600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;protein_id=OsNip_11t0696600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28499606	28499614	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0696600-01;Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;protein_id=OsNip_11t0696600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28499606	28499952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Name=OsNip_11t0696600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0696600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28499615	28499952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	TAMA	mRNA	28496665	28499911	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0696600-02;Parent=gene:OsNip_11g0696600;transcript_id=OsNip_11t0696600-02;Tag=IsoSeq:G16318.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12756.1
Chr11	TAMA	exon	28496665	28498192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-02;Name=OsNip_11t0696600-02;exon_id=OsNip_11t0696600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16318.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12756.1;prot_id "UniRef90_B7ELQ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	CDS	28496666	28497019	.	+	.	ID=CDS:OsNip_11t0696600-02;Parent=transcript:OsNip_11t0696600-02;protein_id=OsNip_11t0696600-02;Tag=IsoSeq:G16318.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12756.1;prot_id "UniRef90_B7ELQ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr11	TAMA	exon	28498280	28498365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0696600-02;Name=OsNip_11t0696600-02;exon_id=OsNip_11t0696600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16318.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12756.1;prot_id "UniRef90_B7ELQ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28723775	28724062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0700900-01;Name=OsNip_11t0700900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0700900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28722783	28723112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0700900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28756663	28757037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0702000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0702000-01;protein_id=OsNip_11t0702000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28777637	28777972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0702700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28781160	28781313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0702900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28781314	28781991	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0702900-01;Parent=transcript:OsNip_11t0702900-01;protein_id=OsNip_11t0702900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28781992	28782126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0702900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28781311	28782194	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0703000-01;Parent=gene:OsNip_11g0703000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28781311	28781343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28781311	28782194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0703000-01;Name=OsNip_11t0703000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0703000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28781344	28781982	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0703000-01;Parent=transcript:OsNip_11t0703000-01;protein_id=OsNip_11t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28781983	28782194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28793791	28794678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0703600-03;Name=OsNip_11t0703600-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0703600-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28811267	28811547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28814668	28815723	.	-	0	ID=CDS:OsNip_11t0704100-00;Parent=transcript:OsNip_11t0704100-00;protein_id=OsNip_11t0704100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28820765	28824145	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0704300;Name=OsNip_ObgM;biotype=protein_coding;description=GTP1/OBG;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28821533	28821641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-01;Name=OsNip_11t0704300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28821533	28821641	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-01;protein_id=OsNip_11t0704300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28821964	28822046	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-01;Name=OsNip_11t0704300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28822588	28822650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-01;Name=OsNip_11t0704300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28822746	28823951	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-01;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-01;protein_id=OsNip_11t0704300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28820814	28820995	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Name=OsNip_11t0704300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28820870	28820995	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;protein_id=OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28821533	28821641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Name=OsNip_11t0704300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28821533	28821641	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;protein_id=OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28821964	28822046	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Name=OsNip_11t0704300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28821964	28822046	.	+	2	ID=CDS:OsNip_11t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;protein_id=OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28822588	28822650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Name=OsNip_11t0704300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28822588	28822650	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;protein_id=OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28822746	28823951	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704300-02;Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;protein_id=OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28822746	28824145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Name=OsNip_11t0704300-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28823952	28824145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	gene	28827746	28828439	.	+	.	ID=gene:OsNip_11g0704500;Name=MT1A;biotype=protein_coding;description=Metallothionein-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28827746	28828439	.	+	.	ID=transcript:OsNip_11t0704500-01;Parent=gene:OsNip_11g0704500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0704500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28827746	28827833	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28827746	28827886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704500-01;Name=OsNip_11t0704500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_11t0704500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28827834	28827886	.	+	0	ID=CDS:OsNip_11t0704500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0704500-01;protein_id=OsNip_11t0704500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	CDS	28828028	28828199	.	+	1	ID=CDS:OsNip_11t0704500-01;Parent=transcript:OsNip_11t0704500-01;protein_id=OsNip_11t0704500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28838945	28839197	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	exon	28839388	28839691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704600-02;Name=OsNip_11t0704600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_11t0704600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28842657	28842688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr11	RAP2018-11-26	mRNA	28846127	28852901	.	-	.	ID=transcript:OsNip_11t0704700-01;Parent=gene:OsNip_11g0704700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_11t0704700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28846127	28846284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr11	RAP2018-11-26	exon	28846127	28846363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_11t0704700-01;Name=OsNip_11t0704700-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_11t0704700-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7571	8440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100200-00;Name=OsNip_12t0100200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0100200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7571	8440	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0100200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0100200-00;protein_id=OsNip_12t0100200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12686	14181	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0100500-01;Parent=gene:OsNip_12g0100500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0100500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12686	12805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12806	13363	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0100500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0100500-01;protein_id=OsNip_12t0100500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	13659	14181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100500-01;Name=OsNip_12t0100500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0100500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14100	14181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25429	25537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25429	27035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100700-00;Name=OsNip_12t0100700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0100700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27032	27035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0100700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	38532	38626	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0101000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-01;protein_id=OsNip_12t0101000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	42351	42494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0101000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-01;protein_id=OsNip_12t0101000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	42587	42868	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0101000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-01;protein_id=OsNip_12t0101000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	42587	43021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0101000-01;Name=OsNip_12t0101000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0101000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	42869	43021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0101000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	37403	38192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;Name=OsNip_12t0101000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0101000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	37403	38192	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0101000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;protein_id=OsNip_12t0101000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	38532	38626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;Name=OsNip_12t0101000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0101000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	38532	38626	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0101000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;protein_id=OsNip_12t0101000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	38723	38820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;Name=OsNip_12t0101000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0101000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	38723	38820	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0101000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0101000-02;protein_id=OsNip_12t0101000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	133256	133489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	133256	133488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0102700-02;Name=OsNip_12t0102700-02;exon_id=OsNip_12t0102700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16354.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12777.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1BR02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	156961	157069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103300-01;Name=OsNip_12t0103300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0103300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	156961	157069	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0103300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0103300-01;protein_id=OsNip_12t0103300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	156440	157069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103300-02;Name=OsNip_12t0103300-02;exon_id=OsNip_12t0103300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16356.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12779.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9NAE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	156440	156774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103300-02;Tag=IsoSeq:G16356.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12779.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9NAE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	167248	167459	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0103500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0103500-00;protein_id=OsNip_12t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	167528	167602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103500-00;Name=OsNip_12t0103500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0103500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	167528	167602	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0103500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0103500-00;protein_id=OsNip_12t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	167819	168419	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103500-00;Name=OsNip_12t0103500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0103500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	167819	168419	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0103500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0103500-00;protein_id=OsNip_12t0103500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	166743	168159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-01;Name=OsNip_12t0103540-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0103540-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	168093	172557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0103540-02;Parent=gene:OsNip_12g0103540;transcript_id=OsNip_12t0103540-02;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1
Chr12	TAMA	exon	172148	172557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Name=OsNip_12t0103540-02;exon_id=OsNip_12t0103540-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	171121	171274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Name=OsNip_12t0103540-02;exon_id=OsNip_12t0103540-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	170016	170282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Name=OsNip_12t0103540-02;exon_id=OsNip_12t0103540-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	exon	168093	169326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Name=OsNip_12t0103540-02;exon_id=OsNip_12t0103540-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	171121	171274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	170016	170282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	169509	169731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	168418	169326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0103540-02;Tag=IsoSeq:G16357.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12780.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0RCK5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	220663	221928	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0104300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0104300-02;protein_id=OsNip_12t0104300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	221929	222856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0104300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	223588	225089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0104300-03;Tag=IsoSeq:G16359.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12781.1,Nipponbare.root_G9656.1;prot_id "UniRef90_A0A287NKV2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	225408	225795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0104300-03;Tag=IsoSeq:G16359.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12781.1,Nipponbare.root_G9656.1;prot_id "UniRef90_A0A287NKV2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	226989	227126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0104400-01;Name=OsNip_12t0104400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0104400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	227853	227945	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0104400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0104400-01;protein_id=OsNip_12t0104400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	242968	243015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0104700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	243016	243467	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0104700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0104700-01;protein_id=OsNip_12t0104700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	243547	243918	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0104700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0104700-01;protein_id=OsNip_12t0104700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	327891	328087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	331023	331097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	331023	331715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106200-01;Name=OsNip_12t0106200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0106200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	346323	347069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	347176	347315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	350015	350057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	350015	350176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Name=OsNip_12t0106550-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0106550-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	350279	350457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Name=OsNip_12t0106550-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0106550-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	350370	350457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	350545	350615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	350772	350797	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0106600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	451788	451899	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0108200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	451980	452360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0108200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	492047	493207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109150-00;Name=OsNip_12t0109150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0109150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	497101	497200	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0109200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0109200-01;protein_id=OsNip_12t0109200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	534123	534213	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0109850-00;Parent=transcript:OsNip_12t0109850-00;protein_id=OsNip_12t0109850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	534398	534607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109850-00;Name=OsNip_12t0109850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0109850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	534398	534607	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0109850-00;Parent=transcript:OsNip_12t0109850-00;protein_id=OsNip_12t0109850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	534984	535127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109850-00;Name=OsNip_12t0109850-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0109850-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	534984	535127	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0109850-00;Parent=transcript:OsNip_12t0109850-00;protein_id=OsNip_12t0109850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	535944	540335	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0109900;Name=OsNip_RBP;biotype=protein_coding;description=Double-stranded;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	535944	540335	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0109900-01;Parent=gene:OsNip_12g0109900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0109900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	535944	536363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	535944	537085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109900-01;Name=OsNip_12t0109900-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0109900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	536364	537085	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0109900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0109900-01;protein_id=OsNip_12t0109900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	537226	537439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0109900-01;Name=OsNip_12t0109900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0109900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	604210	604502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111500-02;Name=OsNip_12t0111500-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0111500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	604399	604502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	607455	608215	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0111600-01;Parent=gene:OsNip_12g0111600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0111600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	607455	607722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	610219	610253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	610254	610500	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0111700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;protein_id=OsNip_12t0111700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	610579	610732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;Name=OsNip_12t0111700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0111700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	610579	610732	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0111700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;protein_id=OsNip_12t0111700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	611374	611421	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0111700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;protein_id=OsNip_12t0111700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	611939	612177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;Name=OsNip_12t0111700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0111700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	612162	612177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	614019	614803	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0111750-00;Parent=gene:OsNip_12g0111750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0111750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	614019	614031	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	614019	614155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;Name=OsNip_12t0111750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0111750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	614032	614155	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0111750-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;protein_id=OsNip_12t0111750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	614581	614768	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0111750-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;protein_id=OsNip_12t0111750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	614581	614803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;Name=OsNip_12t0111750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0111750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	614769	614803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	614314	616031	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0111800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	614314	616031	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0111800-00;Parent=gene:OsNip_12g0111800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	614314	614315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	614314	614525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Name=OsNip_12t0111800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0111800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	614316	614525	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0111800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;protein_id=OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	614611	614802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Name=OsNip_12t0111800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0111800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	614611	614802	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0111800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;protein_id=OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	615067	615232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Name=OsNip_12t0111800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0111800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	615067	615232	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0111800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;protein_id=OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	615460	615845	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0111800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;protein_id=OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	615460	616031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Name=OsNip_12t0111800-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0111800-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	615846	616031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0111800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	647193	648118	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0112600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0112600-01;protein_id=OsNip_12t0112600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	660747	660862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0113001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	660870	661163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0113001-00;Name=OsNip_12t0113001-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0113001-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	737406	737746	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0115100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0115100-00;protein_id=OsNip_12t0115100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	737885	737894	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0115100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0115100-00;protein_id=OsNip_12t0115100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	737885	738254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115100-00;Name=OsNip_12t0115100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0115100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	737895	738254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	767985	768074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115700-01;Name=OsNip_12t0115700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0115700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	768073	768074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	768447	768578	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	768446	768569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115700-02;Name=OsNip_12t0115700-02;exon_id=OsNip_12t0115700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16403.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12816.6,Nipponbare.panicle_G12816.5;prot_id "UniRef90_M0RUU3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	768446	768567	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0115700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0115700-02;protein_id=OsNip_12t0115700-02;Tag=IsoSeq:G16403.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12816.6,Nipponbare.panicle_G12816.5;prot_id "UniRef90_M0RUU3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	767985	768074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0115700-02;Name=OsNip_12t0115700-02;exon_id=OsNip_12t0115700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16403.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12816.6,Nipponbare.panicle_G12816.5;prot_id "UniRef90_M0RUU3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	936900	937155	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0119600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0119600-00;protein_id=OsNip_12t0119600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	937270	937422	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0119600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0119600-00;protein_id=OsNip_12t0119600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	940868	942111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	942923	943648	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0119700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0119700-01;protein_id=OsNip_12t0119700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	943649	943989	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	940114	943991	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0119700-02;Parent=gene:OsNip_12g0119700;transcript_id=OsNip_12t0119700-02;Tag=IsoSeq:G16418.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12825.1
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Chr12	TAMA	CDS	940114	940174	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0119700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0119700-02;protein_id=OsNip_12t0119700-02;Tag=IsoSeq:G16418.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12825.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0Y6I9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	exon	942874	943991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119700-02;Name=OsNip_12t0119700-02;exon_id=OsNip_12t0119700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16418.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12825.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0Y6I9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	942874	942889	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0119700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0119700-02;protein_id=OsNip_12t0119700-02;Tag=IsoSeq:G16418.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12825.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0Y6I9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	942893	943991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119700-02;Tag=IsoSeq:G16418.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12825.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0Y6I9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	944441	945546	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0119800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	944441	945546	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0119800-01;Parent=gene:OsNip_12g0119800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0119800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	944441	944772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	944441	945546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119800-01;Name=OsNip_12t0119800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0119800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	944773	945474	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0119800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0119800-01;protein_id=OsNip_12t0119800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	945475	945546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0119800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	947150	950199	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0120000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	966669	966937	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120200-03;Tag=IsoSeq:G16421.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7376.1,Nipponbare.root_G9686.1,Nipponbare.panicle_G12828.1;prot_id "UniRef90_M8AYW6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	972098	972250	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0120400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;protein_id=OsNip_12t0120400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	972481	972579	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0120400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;protein_id=OsNip_12t0120400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	974617	974727	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0120400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;protein_id=OsNip_12t0120400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	974617	974798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;Name=OsNip_12t0120400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0120400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	974728	974798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	975332	975926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	975104	977096	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0120500-01;Parent=gene:OsNip_12g0120500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0120500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	975104	975294	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	975104	975720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0120500-01;Name=OsNip_12t0120500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0120500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1157989	1158213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124000-01;Name=OsNip_12t0124000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0124000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1158117	1158213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1156690	1158309	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0124000-02;Parent=gene:OsNip_12g0124000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0124000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1156690	1156691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1156690	1157088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124000-02;Name=OsNip_12t0124000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0124000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1156692	1157088	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0124000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0124000-02;protein_id=OsNip_12t0124000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1157320	1157384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124000-02;Name=OsNip_12t0124000-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0124000-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1157320	1157384	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0124000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0124000-02;protein_id=OsNip_12t0124000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1190959	1191508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1200746	1201965	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0125000-01;Parent=gene:OsNip_12g0125000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1201858	1201965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1211834	1211888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1211834	1212679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125200-01;Name=OsNip_12t0125200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0125200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1211889	1212347	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0125200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0125200-01;protein_id=OsNip_12t0125200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1212348	1212679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1212877	1216296	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0125300;biotype=protein_coding;description=Mitotic;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1212877	1216296	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0125300-01;Parent=gene:OsNip_12g0125300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1212877	1213295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1212877	1214587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;Name=OsNip_12t0125300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0125300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1213296	1214587	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0125300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;protein_id=OsNip_12t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1214829	1214977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;Name=OsNip_12t0125300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0125300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1214829	1214977	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0125300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;protein_id=OsNip_12t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1215289	1215446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;Name=OsNip_12t0125300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0125300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1215289	1215446	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0125300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;protein_id=OsNip_12t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1215861	1216005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0125300-01;Name=OsNip_12t0125300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0125300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1323547	1326079	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0127650-00;Parent=gene:OsNip_12g0127650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0127650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1378167	1378700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0128900-00;Name=OsNip_12t0128900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0128900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1378497	1378700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0128900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1387551	1388058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1387551	1388138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;Name=OsNip_12t0129000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0129000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1388059	1388138	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0129000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;protein_id=OsNip_12t0129000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1388533	1388816	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;Name=OsNip_12t0129000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0129000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1388533	1388816	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0129000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;protein_id=OsNip_12t0129000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1390996	1391270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129000-01;Name=OsNip_12t0129000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0129000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1393078	1393653	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0129100-00;Parent=gene:OsNip_12g0129100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0129100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1393078	1393653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129100-00;Name=OsNip_12t0129100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0129100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1393078	1393653	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0129100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0129100-00;protein_id=OsNip_12t0129100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1397309	1399004	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0129300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1397309	1399004	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0129300-01;Parent=gene:OsNip_12g0129300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1397309	1397497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129300-01;Name=OsNip_12t0129300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0129300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1397309	1397497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1398055	1398068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1398055	1398242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129300-01;Name=OsNip_12t0129300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0129300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1398810	1399004	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1400240	1404684	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0129350;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1400240	1404684	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0129350-00;Parent=gene:OsNip_12g0129350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0129350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1400240	1400290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129350-00;Name=OsNip_12t0129350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0129350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1400597	1400666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129350-00;Name=OsNip_12t0129350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0129350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1401321	1401366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0129350-00;Name=OsNip_12t0129350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0129350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1401321	1401366	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0129350-00;Parent=transcript:OsNip_12t0129350-00;protein_id=OsNip_12t0129350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1510315	1510438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0131233-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1563686	1563743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0132400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	1562171	1566518	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0132400-02;Parent=gene:OsNip_12g0132400;transcript_id=OsNip_12t0132400-02;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1
Chr12	TAMA	exon	1566392	1566518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0132400-02;Name=OsNip_12t0132400-02;exon_id=OsNip_12t0132400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1;prot_id "UniRef90_UPI00090090B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	1566392	1566516	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0132400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0132400-02;protein_id=OsNip_12t0132400-02;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1;prot_id "UniRef90_UPI00090090B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	1566221	1566265	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0132400-02;Name=OsNip_12t0132400-02;exon_id=OsNip_12t0132400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1;prot_id "UniRef90_UPI00090090B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	1566221	1566265	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0132400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0132400-02;protein_id=OsNip_12t0132400-02;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1;prot_id "UniRef90_UPI00090090B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	1565902	1566008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0132400-02;Name=OsNip_12t0132400-02;exon_id=OsNip_12t0132400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16453.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12848.2,Nipponbare.root_G9707.1,Nipponbare.panicle_G12848.1,Nipponbare.leaf_G7396.1;prot_id "UniRef90_UPI00090090B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1619876	1620017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0133100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1620255	1620843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0133100-01;Name=OsNip_12t0133100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0133100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1620255	1620843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0133100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1732197	1733659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0135200-01;Name=OsNip_12t0135200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0135200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1732269	1733516	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0135200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0135200-01;protein_id=OsNip_12t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1733517	1733659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1759003	1759085	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0136200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0136200-03;protein_id=OsNip_12t0136200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1759232	1759439	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0136200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0136200-03;protein_id=OsNip_12t0136200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1759232	1759670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136200-03;Name=OsNip_12t0136200-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0136200-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1759440	1759670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1765559	1767686	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0136300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1765559	1767686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0136300-01;Parent=gene:OsNip_12g0136300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0136300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1765559	1766026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1765559	1767686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136300-01;Name=OsNip_12t0136300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0136300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1766027	1767652	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0136300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0136300-01;protein_id=OsNip_12t0136300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1767653	1767686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1772560	1774555	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0136500;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1772560	1774555	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0136500-01;Parent=gene:OsNip_12g0136500;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0136500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1772560	1774555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-01;Name=OsNip_12t0136500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0136500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	1772676	1774513	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0136500-02;Parent=gene:OsNip_12g0136500;transcript_id=OsNip_12t0136500-02;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3
Chr12	TAMA	exon	1773644	1774513	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;Name=OsNip_12t0136500-02;exon_id=OsNip_12t0136500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	exon	1772676	1773526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;Name=OsNip_12t0136500-02;exon_id=OsNip_12t0136500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	1773221	1773397	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0136500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;protein_id=OsNip_12t0136500-02;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	1773644	1774513	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	1773398	1773526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	1772676	1773218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136500-02;Tag=IsoSeq:G16462.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12853.3;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1776606	1777703	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0136600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1776606	1777703	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0136600-01;Parent=gene:OsNip_12g0136600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0136600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1776606	1777162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1776606	1777703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0136600-01;Name=OsNip_12t0136600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0136600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1777163	1777600	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0136600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0136600-01;protein_id=OsNip_12t0136600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1807140	1807513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137200-01;Name=OsNip_12t0137200-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0137200-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1807198	1807513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	1802719	1807481	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0137200-02;Parent=gene:OsNip_12g0137200;transcript_id=OsNip_12t0137200-02;Tag=IsoSeq:G16465.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7402.3
Chr12	TAMA	exon	1802719	1802996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137200-02;Name=OsNip_12t0137200-02;exon_id=OsNip_12t0137200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16465.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7402.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	1802719	1802996	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0137200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0137200-02;protein_id=OsNip_12t0137200-02;Tag=IsoSeq:G16465.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7402.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	1807696	1811160	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0137300-01;Parent=gene:OsNip_12g0137300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0137300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1807696	1808073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137300-01;Name=OsNip_12t0137300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0137300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1807696	1808073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1808561	1808607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137300-01;Name=OsNip_12t0137300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0137300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1808561	1808607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1808782	1809249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0137300-01;Name=OsNip_12t0137300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0137300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1870868	1870891	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0138500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0138500-01;protein_id=OsNip_12t0138500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1872103	1872237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0138500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	1869440	1872337	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0138500-02;Parent=gene:OsNip_12g0138500;transcript_id=OsNip_12t0138500-02;Tag=IsoSeq:G16470.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12859.2
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Chr12	TAMA	CDS	1869441	1869641	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0138500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0138500-02;protein_id=OsNip_12t0138500-02;Tag=IsoSeq:G16470.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12859.2;prot_id "UniRef90_A0A6J1IB08";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1916577	1916647	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0139400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0139400-01;protein_id=OsNip_12t0139400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1917337	1917598	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0139400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0139400-01;protein_id=OsNip_12t0139400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	1917337	1917702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0139400-01;Name=OsNip_12t0139400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0139400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	1940077	1940676	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0140200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0140200-00;protein_id=OsNip_12t0140200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	1942220	1947972	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0140266;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	1942469	1942488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0140266-00;Name=OsNip_12t0140266-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0140266-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1986998	1989200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0141000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	2120377	2120643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143100-02;Name=OsNip_12t0143100-02;exon_id=OsNip_12t0143100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9725.2,Nipponbare.panicle_G12871.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7EJL6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2118085	2118085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143100-02;Tag=IsoSeq:G16483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9725.2,Nipponbare.panicle_G12871.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7EJL6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2118185	2118477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143100-02;Tag=IsoSeq:G16483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9725.2,Nipponbare.panicle_G12871.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7EJL6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2120377	2120643	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143100-02;Tag=IsoSeq:G16483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9725.2,Nipponbare.panicle_G12871.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7EJL6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2121026	2121083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2121026	2122053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;Name=OsNip_12t0143200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0143200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2121084	2122053	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0143200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;protein_id=OsNip_12t0143200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2123796	2124070	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0143200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;protein_id=OsNip_12t0143200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2123796	2124289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;Name=OsNip_12t0143200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0143200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2124071	2124289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0143200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2124542	2126681	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0143300;biotype=protein_coding;description=Excinuclease;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2181040	2181084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144200-01;Tag=IsoSeq:G16487.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7413.2;prot_id "UniRef90_A0A1Z5RJH9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2176990	2180262	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0144401;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2176990	2177207	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2177208	2177267	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0144401-00;Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;protein_id=OsNip_12t0144401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2179093	2179248	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0144401-00;Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;protein_id=OsNip_12t0144401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2179093	2179258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;Name=OsNip_12t0144401-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0144401-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2179249	2179258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2180055	2180262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;Name=OsNip_12t0144401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0144401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2180055	2180262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2193901	2194066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-01;Name=OsNip_12t0144600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0144600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2193901	2194066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2196167	2197129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	2194011	2194292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;Name=OsNip_12t0144600-02;exon_id=OsNip_12t0144600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	CDS	2194013	2194264	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0144600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;protein_id=OsNip_12t0144600-02;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2194011	2194012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2194268	2194292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2194519	2194594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2194698	2196633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144600-02;Tag=IsoSeq:G16488.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12875.8,Nipponbare.panicle_G12875.7;prot_id "UniRef90_A0A1D6H5N1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2199978	2200731	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0144700-01;Parent=gene:OsNip_12g0144700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0144700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2199978	2200336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2199978	2200731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144700-01;Name=OsNip_12t0144700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0144700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2200337	2200561	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0144700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0144700-01;protein_id=OsNip_12t0144700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2200562	2200731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0144700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2215943	2219491	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0145100-01;Parent=gene:OsNip_12g0145100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0145100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2215943	2216180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2215943	2216216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145100-01;Name=OsNip_12t0145100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0145100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2234080	2234757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145400-01;Name=OsNip_12t0145400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0145400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2236066	2236216	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145500-01;Name=OsNip_12t0145500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0145500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2238189	2238311	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0145500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0145500-01;protein_id=OsNip_12t0145500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2238390	2238542	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0145500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0145500-01;protein_id=OsNip_12t0145500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2239218	2239402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2240010	2241632	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0145566-01;Parent=gene:OsNip_12g0145566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0145566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2240010	2240242	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2240010	2241632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145566-01;Name=OsNip_12t0145566-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0145566-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2240243	2240494	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0145566-01;Parent=transcript:OsNip_12t0145566-01;protein_id=OsNip_12t0145566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2240495	2241632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0145566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2242307	2245032	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0145632;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2312638	2313081	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0147200-01;protein_id=OsNip_12t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2313082	2313217	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2316974	2318143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0147300-00;Parent=gene:OsNip_12g0147300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0147300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2316974	2317001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0147300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2316974	2317262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0147300-00;Name=OsNip_12t0147300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0147300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2317002	2317262	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0147300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0147300-00;protein_id=OsNip_12t0147300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2317346	2318143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0147300-00;Name=OsNip_12t0147300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0147300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2317346	2318143	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0147300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0147300-00;protein_id=OsNip_12t0147300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2318854	2321807	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0147500;biotype=protein_coding;description=DNA/RNA;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2318854	2321807	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0147500-01;Parent=gene:OsNip_12g0147500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0147500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2318854	2318960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0147500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2382009	2382170	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0148400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0148400-01;protein_id=OsNip_12t0148400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2382594	2382829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0148400-01;Name=OsNip_12t0148400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0148400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2382792	2382829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0148400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2394848	2395274	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0148600-01;Name=OsNip_12t0148600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0148600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2397102	2397707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0148700-01;Name=OsNip_12t0148700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0148700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2397684	2397707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0148700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2418098	2419084	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0149000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0149000-01;protein_id=OsNip_12t0149000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2419085	2419337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2419992	2420532	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149050-00;Name=OsNip_12t0149050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0149050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2427441	2429883	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0149100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2427464	2427880	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0149100-01;Parent=gene:OsNip_12g0149100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2427464	2427716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2427464	2427880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-01;Name=OsNip_12t0149100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0149100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2427717	2427878	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0149100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0149100-01;protein_id=OsNip_12t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2427879	2427880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	2427441	2429883	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0149100-02;Parent=gene:OsNip_12g0149100;transcript_id=OsNip_12t0149100-02;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2
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Chr12	TAMA	exon	2427441	2428110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-02;Name=OsNip_12t0149100-02;exon_id=OsNip_12t0149100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9UTG4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	2427817	2427873	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0149100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0149100-02;protein_id=OsNip_12t0149100-02;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9UTG4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2429464	2429883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-02;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9UTG4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2427874	2428110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-02;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9UTG4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2427441	2427814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149100-02;Tag=IsoSeq:G16498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12882.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9UTG4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2433326	2434865	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0149300;Name=OsNip_GT3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2433326	2433423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2433326	2434865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149300-01;Name=OsNip_12t0149300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0149300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2433424	2434824	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0149300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0149300-01;protein_id=OsNip_12t0149300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2434825	2434865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2441463	2446063	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0149700-01;Parent=gene:OsNip_12g0149700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2441463	2441611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149700-01;Name=OsNip_12t0149700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0149700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2441463	2441611	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0149700-01;protein_id=OsNip_12t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2444669	2445536	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0149700-01;protein_id=OsNip_12t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2444669	2446063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149700-01;Name=OsNip_12t0149700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0149700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2445537	2446063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0149700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2569330	2569648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0151900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2565213	2566562	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0152000;Name=Rcn3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2565213	2566562	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0152000-00;Parent=gene:OsNip_12g0152000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2565213	2565490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2565797	2565837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;Name=OsNip_12t0152000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0152000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2565797	2565837	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0152000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;protein_id=OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2566088	2566149	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0152000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;protein_id=OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2566255	2566455	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0152000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;protein_id=OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2566255	2566562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;Name=OsNip_12t0152000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2566456	2566562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2571700	2571756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2571700	2572011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Name=OsNip_12t0152100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2571757	2572011	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0152100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;protein_id=OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2572136	2572347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Name=OsNip_12t0152100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0152100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2572136	2572347	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0152100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;protein_id=OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2572911	2573175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Name=OsNip_12t0152100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0152100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2572911	2573175	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0152100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;protein_id=OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2573492	2573791	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0152100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;protein_id=OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2573492	2573888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Name=OsNip_12t0152100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0152100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2573792	2573888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2574325	2575584	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0152200;Name=OsNip_Fbox642;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2574325	2575584	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0152200-00;Parent=gene:OsNip_12g0152200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0152200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2574325	2575584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152200-00;Name=OsNip_12t0152200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0152200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2574325	2575584	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0152200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152200-00;protein_id=OsNip_12t0152200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2588267	2589973	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0152500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2588267	2589973	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0152500-00;Parent=gene:OsNip_12g0152500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2588267	2588598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2588267	2588655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Name=OsNip_12t0152500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2588599	2588655	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0152500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;protein_id=OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2588794	2589002	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Name=OsNip_12t0152500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0152500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2588794	2589002	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0152500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;protein_id=OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2589092	2589305	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0152500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;protein_id=OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2589092	2589357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Name=OsNip_12t0152500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0152500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2589306	2589357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2589591	2589973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Name=OsNip_12t0152500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2589591	2589973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2592552	2594898	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0152600;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2592552	2594898	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0152600-01;Parent=gene:OsNip_12g0152600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2592552	2592638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2592552	2594898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152600-01;Name=OsNip_12t0152600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2592639	2594789	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152600-01;protein_id=OsNip_12t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2594790	2594898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2595556	2600056	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0152700;biotype=protein_coding;description=Amino;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2595556	2599950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0152700-02;Parent=gene:OsNip_12g0152700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0152700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2595556	2595872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2595556	2595935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152700-02;Name=OsNip_12t0152700-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0152700-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2606653	2607141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2605807	2606186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;Name=OsNip_12t0152900-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0152900-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2606724	2606866	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0152900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;protein_id=OsNip_12t0152900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2611817	2611994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;Name=OsNip_12t0152900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2611915	2611994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2612115	2612489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;Name=OsNip_12t0152900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0152900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2612115	2612489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0152900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2622160	2623105	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0153200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2622160	2623105	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0153200-01;Parent=gene:OsNip_12g0153200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2622160	2622452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2622160	2623105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153200-01;Name=OsNip_12t0153200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0153200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2622453	2622842	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0153200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0153200-01;protein_id=OsNip_12t0153200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2622843	2623105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2635628	2636887	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0153400;Name=OsNip_Fbox643;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2635628	2636887	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0153400-00;Parent=gene:OsNip_12g0153400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2635628	2636887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153400-00;Name=OsNip_12t0153400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2635628	2636887	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153400-00;protein_id=OsNip_12t0153400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2637608	2638272	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0153433;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2637608	2638272	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0153433-00;Parent=gene:OsNip_12g0153433;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2637608	2637726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2637608	2638272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153433-00;Name=OsNip_12t0153433-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0153433-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2638144	2638272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2643975	2645314	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0153500;Name=OsNip_alphaCA11;biotype=protein_coding;description=Carbonic;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2643975	2645314	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0153500-01;Parent=gene:OsNip_12g0153500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2643975	2644034	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2643975	2644101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;Name=OsNip_12t0153500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0153500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2644035	2644101	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;protein_id=OsNip_12t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2644187	2644965	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0153500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;protein_id=OsNip_12t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2644187	2645314	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;Name=OsNip_12t0153500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0153500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2644966	2645314	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2647994	2650362	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0153600-00;Parent=gene:OsNip_12g0153600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2647994	2648074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2647994	2648074	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2648402	2648503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2648402	2648503	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2648739	2648861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2648739	2648861	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2649028	2649133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2649028	2649133	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2649591	2649793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2649591	2649793	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2649818	2649878	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2649818	2649878	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2649972	2650063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2649972	2650063	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2650237	2650362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;Name=OsNip_12t0153600-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153600-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2650237	2650362	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153600-00;protein_id=OsNip_12t0153600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2650651	2651769	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0153700;biotype=protein_coding;description=Peptidase;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2650651	2651769	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0153700-00;Parent=gene:OsNip_12g0153700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2650651	2651769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153700-00;Name=OsNip_12t0153700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2650651	2651769	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0153700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153700-00;protein_id=OsNip_12t0153700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2659495	2660490	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0153900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2659495	2660490	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0153900-00;Parent=gene:OsNip_12g0153900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0153900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2659495	2660259	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0153900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0153900-00;protein_id=OsNip_12t0153900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2659495	2660490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153900-00;Name=OsNip_12t0153900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0153900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2660260	2660490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0153900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2661957	2666739	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0154000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2661957	2666739	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0154000-01;Parent=gene:OsNip_12g0154000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2661957	2662412	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2661957	2662422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0154000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2662413	2662422	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2662496	2662583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0154000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2662496	2662583	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2663574	2663590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0154000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2663574	2663590	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2663685	2663893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0154000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2663685	2663893	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2664523	2664684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0154000-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2664523	2664684	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2665022	2665222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0154000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2665022	2665222	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2665307	2665491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0154000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2665307	2665491	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2666058	2666190	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0154000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;protein_id=OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2666058	2666245	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0154000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2666191	2666245	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2666414	2666739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Name=OsNip_12t0154000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0154000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2666414	2666739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2663396	2666737	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0154000-02;Parent=gene:OsNip_12g0154000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2663396	2663572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2686784	2686945	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0154600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0154600-02;protein_id=OsNip_12t0154600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	2687371	2688178	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154600-02;Name=OsNip_12t0154600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0154600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2687692	2688178	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0154600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2708524	2709345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155200-02;Tag=IsoSeq:G16519.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12895.1,Nipponbare.root_G9749.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0MJT1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2724453	2724576	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;protein_id=OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2724649	2725074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Name=OsNip_12t0155300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0155300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2724649	2725074	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;protein_id=OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2725192	2725496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Name=OsNip_12t0155300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0155300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2725192	2725496	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;protein_id=OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2725610	2725773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Name=OsNip_12t0155300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0155300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2725610	2725773	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;protein_id=OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2725849	2725930	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0155300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;protein_id=OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2725849	2725970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Name=OsNip_12t0155300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0155300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2725931	2725970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2726055	2726348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Name=OsNip_12t0155300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0155300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2726055	2726348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2732249	2732695	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0155400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2732249	2732695	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0155400-00;Parent=gene:OsNip_12g0155400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2732249	2732695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155400-00;Name=OsNip_12t0155400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0155400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2732249	2732695	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0155400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0155400-00;protein_id=OsNip_12t0155400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2735598	2735672	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0155600;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2735598	2735672	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0155600-00;Parent=gene:OsNip_12g0155600;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0155600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2735598	2735672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0155600-00;Name=OsNip_12t0155600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0155600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2748031	2752652	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0156000;Name=OsNip_S40-11;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2748031	2752429	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156000-00;Parent=gene:OsNip_12g0156000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2748031	2748657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156000-00;Name=OsNip_12t0156000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2748031	2748657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156000-00;protein_id=OsNip_12t0156000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2752207	2752428	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156000-00;protein_id=OsNip_12t0156000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2752207	2752429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156000-00;Name=OsNip_12t0156000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2752429	2752429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	2751803	2752652	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156000-01;Parent=gene:OsNip_12g0156000;transcript_id=OsNip_12t0156000-01;Tag=IsoSeq:G16520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12896.1
Chr12	TAMA	exon	2751803	2752652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156000-01;Name=OsNip_12t0156000-01;exon_id=OsNip_12t0156000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12896.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SIU1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	2751803	2752150	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0156000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0156000-01;protein_id=OsNip_12t0156000-01;Tag=IsoSeq:G16520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12896.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SIU1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2752154	2752652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156000-01;Tag=IsoSeq:G16520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G12896.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SIU1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2762322	2763599	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0156100;Name=ONAC134;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2762322	2763599	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156100-01;Parent=gene:OsNip_12g0156100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2762322	2762477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2762322	2763599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156100-01;Name=OsNip_12t0156100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2762478	2763401	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0156100-01;protein_id=OsNip_12t0156100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2763402	2763599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2768411	2776846	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0156200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2768411	2776846	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156200-00;Parent=gene:OsNip_12g0156200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2768411	2768465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2768411	2768538	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2768466	2768538	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;protein_id=OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2768570	2768650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2768570	2768650	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0156200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;protein_id=OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2768791	2770493	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0156200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;protein_id=OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2768791	2770937	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2770494	2770937	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2771065	2774947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2771065	2774947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2775340	2775525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2775340	2775525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2775784	2776209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156200-00;Name=OsNip_12t0156200-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156200-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2784339	2784456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2784339	2785620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156500-00;Name=OsNip_12t0156500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2784457	2785620	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0156500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156500-00;protein_id=OsNip_12t0156500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2816100	2822955	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0156866;Name=OsNip_CAT9;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2816100	2822955	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156866-00;Parent=gene:OsNip_12g0156866;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2816100	2816178	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2816100	2816608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Name=OsNip_12t0156866-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156866-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2816179	2816608	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;protein_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2817848	2818070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Name=OsNip_12t0156866-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0156866-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2817848	2818070	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0156866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;protein_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2819279	2819630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Name=OsNip_12t0156866-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0156866-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2819279	2819630	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0156866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;protein_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2820304	2820535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Name=OsNip_12t0156866-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156866-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2820304	2820535	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;protein_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2822312	2822877	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0156866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;protein_id=OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2822312	2822955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Name=OsNip_12t0156866-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0156866-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2822878	2822955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2817839	2822868	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0156883;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2817839	2822868	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0156883-00;Parent=gene:OsNip_12g0156883;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2817839	2817852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2817839	2818041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Name=OsNip_12t0156883-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156883-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2817853	2818041	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0156883-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;protein_id=OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2819282	2819464	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0156883-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;protein_id=OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2819282	2819640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Name=OsNip_12t0156883-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156883-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2819465	2819640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2820312	2820541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Name=OsNip_12t0156883-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156883-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2820312	2820541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2822322	2822868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Name=OsNip_12t0156883-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0156883-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2822322	2822868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156883-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2830044	2831946	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0156900;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2830044	2831946	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0156900-00;Parent=gene:OsNip_12g0156900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0156900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2830044	2831936	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0156900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0156900-00;protein_id=OsNip_12t0156900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2830044	2831946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156900-00;Name=OsNip_12t0156900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0156900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2831937	2831946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0156900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2835307	2837128	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0157000;biotype=protein_coding;description=DNA-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2835307	2837128	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0157000-01;Parent=gene:OsNip_12g0157000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0157000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2835307	2835865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2835307	2835875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157000-01;Name=OsNip_12t0157000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0157000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2851827	2856262	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0157200-01;Parent=gene:OsNip_12g0157200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0157200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2857507	2857830	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0157400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0157400-00;protein_id=OsNip_12t0157400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2869159	2870846	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0157700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2869477	2869866	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0157700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0157700-00;protein_id=OsNip_12t0157700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2869477	2869910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-00;Name=OsNip_12t0157700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0157700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2869867	2869910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2870704	2870846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-00;Name=OsNip_12t0157700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0157700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2870704	2870846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	2869159	2870235	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0157700-01;Parent=gene:OsNip_12g0157700;transcript_id=OsNip_12t0157700-01;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1
Chr12	TAMA	exon	2869159	2869228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;Name=OsNip_12t0157700-01;exon_id=OsNip_12t0157700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	2869489	2870235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;Name=OsNip_12t0157700-01;exon_id=OsNip_12t0157700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	2869905	2870138	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0157700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;protein_id=OsNip_12t0157700-01;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2869159	2869228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2869489	2869904	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2870142	2870235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0157700-01;Tag=IsoSeq:G16524.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12900.1;prot_id "UniRef90_A0A194YIL9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2898694	2900067	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0158300;Name=OsNip_OFP19;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2898694	2900067	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0158300-01;Parent=gene:OsNip_12g0158300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0158300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2898694	2898823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0158300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2898694	2900067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0158300-01;Name=OsNip_12t0158300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0158300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2898824	2899861	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0158300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0158300-01;protein_id=OsNip_12t0158300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2899862	2900067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0158300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2911273	2912589	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0158400;Name=OsNip_OFP20;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2943036	2943225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0158800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0158800-01;protein_id=OsNip_12t0158800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2962924	2963020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2963558	2964074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2964155	2964234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2964312	2964386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2964463	2964873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Name=OsNip_12t0159100-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0159100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2964463	2964873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2971305	2974150	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0159500-01;Parent=gene:OsNip_12g0159500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0159500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2971305	2971658	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0159500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0159500-01;protein_id=OsNip_12t0159500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2971305	2974150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-01;Name=OsNip_12t0159500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0159500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2971659	2974150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2972045	2974159	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0159500-03;Parent=gene:OsNip_12g0159500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0159500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2972045	2973767	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2972045	2974159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-03;Name=OsNip_12t0159500-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0159500-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2973768	2973971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0159500-03;Parent=transcript:OsNip_12t0159500-03;protein_id=OsNip_12t0159500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2973972	2974159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	2971336	2974150	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0159500-04;Parent=gene:OsNip_12g0159500;transcript_id=OsNip_12t0159500-04;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2
Chr12	TAMA	exon	2971336	2971811	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;Name=OsNip_12t0159500-04;exon_id=OsNip_12t0159500-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	2971601	2971762	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0159500-04;Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;protein_id=OsNip_12t0159500-04;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	2973877	2974150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;Name=OsNip_12t0159500-04;exon_id=OsNip_12t0159500-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	2971336	2971600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2971766	2971811	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	2973877	2974150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159500-04;Tag=IsoSeq:G16527.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7433.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HKV6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	2979707	2980850	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0159600;biotype=protein_coding;description=Harpin-induced;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2979707	2980740	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0159600-02;Parent=gene:OsNip_12g0159600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0159600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2979707	2980018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2979707	2980740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-02;Name=OsNip_12t0159600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0159600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2980019	2980657	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0159600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0159600-02;protein_id=OsNip_12t0159600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2980658	2980740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	2979796	2980850	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0159600-01;Parent=gene:OsNip_12g0159600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0159600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2979796	2980018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	2979796	2980850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-01;Name=OsNip_12t0159600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0159600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	2980019	2980657	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0159600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0159600-01;protein_id=OsNip_12t0159600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2980658	2980850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0159600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3118079	3118264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0161900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3179975	3180314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0162900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3206498	3206704	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0163200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;protein_id=OsNip_12t0163200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3206928	3207026	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;Name=OsNip_12t0163200-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0163200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3207143	3207201	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0163200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;protein_id=OsNip_12t0163200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3207279	3207282	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0163200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;protein_id=OsNip_12t0163200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3207279	3207773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;Name=OsNip_12t0163200-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0163200-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3207283	3207773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3203893	3206539	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0163250-01;Parent=gene:OsNip_12g0163250;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0163250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3203893	3204369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163250-01;Name=OsNip_12t0163250-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0163250-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3204972	3205271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163250-01;Name=OsNip_12t0163250-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0163250-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3205817	3206143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163250-01;Name=OsNip_12t0163250-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0163250-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3206498	3206539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0163250-01;Name=OsNip_12t0163250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0163250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3208607	3211741	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0163300;biotype=protein_coding;description=Armadillo-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3282535	3282535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0164300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3282670	3283203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0164300-01;Name=OsNip_12t0164300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0164300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3282670	3283203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0164300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3437905	3437905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0168150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3626049	3626150	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0171200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171200-01;protein_id=OsNip_12t0171200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3626049	3626426	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171200-01;Name=OsNip_12t0171200-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0171200-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3626151	3626426	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	3627680	3629897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171250-01;Name=OsNip_12t0171250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3634846	3635935	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0171500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3634846	3635935	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0171500-01;Parent=gene:OsNip_12g0171500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0171500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3634846	3635060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3634846	3635935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171500-01;Name=OsNip_12t0171500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3635061	3635309	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0171500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171500-01;protein_id=OsNip_12t0171500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3635310	3635935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3636454	3637403	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0171600-01;Parent=gene:OsNip_12g0171600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0171600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3636454	3636503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3636454	3636789	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171600-01;Name=OsNip_12t0171600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3636937	3637199	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0171600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171600-01;protein_id=OsNip_12t0171600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	3641655	3641770	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171700-01;Name=OsNip_12t0171700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3642846	3642878	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3643146	3643421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171700-01;Name=OsNip_12t0171700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3643146	3643421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3644208	3653650	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0171801;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3644208	3653650	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0171801-01;Parent=gene:OsNip_12g0171801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3644208	3644552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3644208	3644830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3644553	3644830	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0171801-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;protein_id=OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3644905	3644968	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0171801-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;protein_id=OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3644905	3645180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3644969	3645180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3645275	3645342	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3645275	3645342	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3646627	3646683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3646627	3646683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3651707	3652106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3651707	3652106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3652728	3652850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3652728	3652850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3653077	3653211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3653541	3653650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Name=OsNip_12t0171801-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0171801-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3653541	3653650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3650086	3650580	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0171900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3650086	3650580	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0171900-01;Parent=gene:OsNip_12g0171900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0171900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3650086	3650220	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3650086	3650580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0171900-01;Name=OsNip_12t0171900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0171900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3650221	3650580	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0171900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0171900-01;protein_id=OsNip_12t0171900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3662338	3662561	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0172150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3662338	3662561	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0172150-00;Parent=gene:OsNip_12g0172150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0172150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3662338	3662561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172150-00;Name=OsNip_12t0172150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0172150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3662338	3662561	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0172150-00;Parent=transcript:OsNip_12t0172150-00;protein_id=OsNip_12t0172150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3668503	3670289	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0172400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3668503	3668519	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3668503	3668610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Name=OsNip_12t0172400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0172400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	3668700	3668859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Name=OsNip_12t0172400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0172400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3668700	3668859	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0172400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;protein_id=OsNip_12t0172400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3669322	3669919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Name=OsNip_12t0172400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0172400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3669322	3669919	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0172400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;protein_id=OsNip_12t0172400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3670193	3670210	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0172400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;protein_id=OsNip_12t0172400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3670193	3670289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Name=OsNip_12t0172400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0172400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3670211	3670289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	3673051	3679299	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0172500;Name=OsNip_WD40-195;biotype=protein_coding;description=WD40;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3673051	3679299	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0172500-01;Parent=gene:OsNip_12g0172500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0172500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3673051	3673290	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3673051	3673722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172500-01;Name=OsNip_12t0172500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0172500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3673291	3673722	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0172500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0172500-01;protein_id=OsNip_12t0172500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3674141	3674233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0172500-01;Name=OsNip_12t0172500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0172500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3674141	3674233	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0172500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0172500-01;protein_id=OsNip_12t0172500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	3725027	3725254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0173400-01;Name=OsNip_12t0173400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0173400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3725027	3725254	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0173400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0173400-01;protein_id=OsNip_12t0173400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3726504	3726753	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0173400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0173400-01;protein_id=OsNip_12t0173400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3726504	3726842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0173400-01;Name=OsNip_12t0173400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0173400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3726754	3726842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0173400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	3723650	3726851	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0173400-02;Parent=gene:OsNip_12g0173400;transcript_id=OsNip_12t0173400-02;Tag=IsoSeq:G16572.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9779.1,Nipponbare.leaf_G7457.1,Nipponbare.panicle_G12940.1
Chr12	TAMA	exon	3726504	3726851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0173400-02;Name=OsNip_12t0173400-02;exon_id=OsNip_12t0173400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16572.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9779.1,Nipponbare.leaf_G7457.1,Nipponbare.panicle_G12940.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0VT20";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	3726504	3726851	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0173400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0173400-02;protein_id=OsNip_12t0173400-02;Tag=IsoSeq:G16572.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9779.1,Nipponbare.leaf_G7457.1,Nipponbare.panicle_G12940.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0VT20";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	CDS	3725168	3725254	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0173400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0173400-02;protein_id=OsNip_12t0173400-02;Tag=IsoSeq:G16572.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9779.1,Nipponbare.leaf_G7457.1,Nipponbare.panicle_G12940.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0VT20";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3868147	3868237	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0176200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;protein_id=OsNip_12t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3868411	3868727	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;Name=OsNip_12t0176200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0176200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3868411	3868727	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0176200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;protein_id=OsNip_12t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	3869379	3869570	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0176200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;protein_id=OsNip_12t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	3869379	3869803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;Name=OsNip_12t0176200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0176200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3869571	3869803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0176200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	3870944	3871559	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0176300-01;Parent=gene:OsNip_12g0176300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0176300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4028039	4028105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0179700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4028106	4029515	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0179700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0179700-02;protein_id=OsNip_12t0179700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4029516	4029525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0179700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	4030195	4031568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0179700-02;Name=OsNip_12t0179700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0179700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4030195	4031568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0179700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	4028050	4031447	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0179700-03;Parent=gene:OsNip_12g0179700;transcript_id=OsNip_12t0179700-03;Tag=IsoSeq:G16590.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12956.4
Chr12	TAMA	exon	4028050	4029525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0179700-03;Name=OsNip_12t0179700-03;exon_id=OsNip_12t0179700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16590.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G12956.4;prot_id "UniRef90_UPI000E7CD593";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4082387	4082615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0180900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0180900-01;protein_id=OsNip_12t0180900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	4082718	4082860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0180900-01;Name=OsNip_12t0180900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0180900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4082718	4082860	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0180900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0180900-01;protein_id=OsNip_12t0180900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4083054	4083356	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0180900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0180900-01;protein_id=OsNip_12t0180900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4145649	4145791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0181600-01;Name=OsNip_12t0181600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0181600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4145896	4146544	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0181600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0181600-01;protein_id=OsNip_12t0181600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	4145896	4146619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0181600-01;Name=OsNip_12t0181600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0181600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4189671	4189988	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	4191349	4193720	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0182600-01;Parent=gene:OsNip_12g0182600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0182600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4193538	4193720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182600-01;Name=OsNip_12t0182600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0182600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	4193988	4198879	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0182700;Name=OsNip_HDAC10;biotype=protein_coding;description=Histone;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4203800	4204024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4204141	4204202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4204225	4204535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182900-00;Name=OsNip_12t0182900-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0182900-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4204469	4204535	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0182900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0182900-00;protein_id=OsNip_12t0182900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4205178	4205408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0182900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4212755	4213112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0183100-03;Name=OsNip_12t0183100-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0183100-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4212923	4213112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0183100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4462463	4462738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-02;Name=OsNip_12t0188700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0188700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4462662	4462738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4461828	4462057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	4462463	4462756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-01;Name=OsNip_12t0188700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0188700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	4461828	4462686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-03;Name=OsNip_12t0188700-03;exon_id=OsNip_12t0188700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16607.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7476.6;prot_id "UniRef90_Q9ZP20";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	4461828	4461852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0188700-03;Tag=IsoSeq:G16607.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7476.6;prot_id "UniRef90_Q9ZP20";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4470921	4470954	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0188900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0188900-01;protein_id=OsNip_12t0188900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4471795	4471928	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0188900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0188900-01;protein_id=OsNip_12t0188900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4472060	4472166	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0188900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0188900-01;protein_id=OsNip_12t0188900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4472682	4472789	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0188900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0188900-01;protein_id=OsNip_12t0188900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4472866	4472936	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0188900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0188900-01;protein_id=OsNip_12t0188900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4710098	4710354	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0192500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4710447	4711325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0192500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	4758078	4758709	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0193100-04;Parent=transcript:OsNip_12t0193100-04;protein_id=OsNip_12t0193100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	4758078	4758720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0193100-04;Name=OsNip_12t0193100-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0193100-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4758710	4758720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0193100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	4760583	4760700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0193100-04;Name=OsNip_12t0193100-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0193100-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4760583	4760700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0193100-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5018234	5018308	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0197100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5014092	5014483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0197150-00;Name=OsNip_12t0197150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0197150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	5020950	5028366	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0197200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5020950	5021381	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0197200-01;Name=OsNip_12t0197200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0197200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5020950	5021381	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0197200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5023056	5023273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0197200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5147861	5147892	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5149084	5149427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5168366	5168612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199200-01;Name=OsNip_12t0199200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0199200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	5172120	5174438	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0199500;Name=OsNip_COMTL1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5172120	5172505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Name=OsNip_12t0199500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0199500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5172120	5172505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0199500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;protein_id=OsNip_12t0199500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5172858	5173101	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0199500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;protein_id=OsNip_12t0199500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5172858	5173171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Name=OsNip_12t0199500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0199500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5173102	5173171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5173522	5173586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Name=OsNip_12t0199500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0199500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5173522	5173586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5174104	5174438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Name=OsNip_12t0199500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0199500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5174104	5174438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	5184081	5186323	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0199800;Name=CYP76M13;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	5184081	5186323	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0199800-01;Parent=gene:OsNip_12g0199800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0199800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5184081	5184492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0199800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5441616	5441805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	5441803	5441804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204200-02;Tag=IsoSeq:G16629.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9808.6;prot_id "UniRef90_Q6ESN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	5440740	5441410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204200-02;Tag=IsoSeq:G16629.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9808.6;prot_id "UniRef90_Q6ESN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	5436000	5436736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204200-02;Tag=IsoSeq:G16629.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9808.6;prot_id "UniRef90_Q6ESN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5455305	5456824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204500-01;Name=OsNip_12t0204500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0204500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5455820	5456707	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0204500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0204500-01;protein_id=OsNip_12t0204500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5469046	5469340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5469046	5471369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0204600-01;Name=OsNip_12t0204600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0204600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5469341	5471263	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0204600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0204600-01;protein_id=OsNip_12t0204600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5573045	5573431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5570626	5570667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;Name=OsNip_12t0206800-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0206800-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5570626	5570667	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0206800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;protein_id=OsNip_12t0206800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5572385	5572449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;Name=OsNip_12t0206800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0206800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5572385	5572449	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0206800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;protein_id=OsNip_12t0206800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5572676	5572754	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0206800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;protein_id=OsNip_12t0206800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5572842	5573023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;Name=OsNip_12t0206800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0206800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5572842	5573023	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0206800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0206800-00;protein_id=OsNip_12t0206800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	5579279	5581544	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0206950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5579279	5580681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206950-00;Name=OsNip_12t0206950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0206950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5581218	5581544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0206950-00;Name=OsNip_12t0206950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0206950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	5584743	5590285	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0207000;Name=OsNip_MADS13;biotype=protein_coding;description=Transcription;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	5584743	5590285	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0207000-01;Parent=gene:OsNip_12g0207000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5584743	5584790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Name=OsNip_12t0207000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0207000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5584743	5584790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5586153	5586168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5586153	5586353	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Name=OsNip_12t0207000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0207000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5586169	5586353	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0207000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;protein_id=OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5587939	5588023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Name=OsNip_12t0207000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0207000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5587939	5588023	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0207000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;protein_id=OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5588663	5588727	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;Name=OsNip_12t0207000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0207000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5588663	5588727	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0207000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0207000-01;protein_id=OsNip_12t0207000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5739380	5739519	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0209700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5772511	5773052	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0210450-00;Parent=transcript:OsNip_12t0210450-00;protein_id=OsNip_12t0210450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5776457	5776462	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0210500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0210500-00;protein_id=OsNip_12t0210500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5776457	5776811	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210500-00;Name=OsNip_12t0210500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0210500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5786606	5786743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5786606	5786966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210601-00;Name=OsNip_12t0210601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0210601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5786966	5786966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210601-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	5801534	5807232	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0210800-01;Parent=gene:OsNip_12g0210800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5801534	5801740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5801534	5801779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;Name=OsNip_12t0210800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0210800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5801741	5801779	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;protein_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5802690	5802787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;Name=OsNip_12t0210800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0210800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5802690	5802787	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;protein_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5802869	5802965	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;protein_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5803452	5803517	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;Name=OsNip_12t0210800-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0210800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5803452	5803517	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;protein_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5804045	5804104	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;Name=OsNip_12t0210800-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0210800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5804045	5804104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0210800-01;protein_id=OsNip_12t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	5866457	5866924	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0211900-01;Parent=gene:OsNip_12g0211900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0211900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5866457	5866708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0211900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5866457	5866924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0211900-01;Name=OsNip_12t0211900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0211900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5866709	5866900	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0211900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0211900-01;protein_id=OsNip_12t0211900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5866901	5866924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0211900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	5892605	5901801	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0212100-00;Parent=gene:OsNip_12g0212100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0212100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5892605	5892621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0212100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5892622	5893023	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0212100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0212100-00;protein_id=OsNip_12t0212100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	5893145	5893204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0212100-00;Name=OsNip_12t0212100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0212100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	5893145	5893204	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0212100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0212100-00;protein_id=OsNip_12t0212100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	5960395	5960734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0214700-01;Name=OsNip_12t0214700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0214700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	6059272	6062946	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0215100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6059272	6062946	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0215100-00;Parent=gene:OsNip_12g0215100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0215100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6059272	6059276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6059272	6060465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215100-00;Name=OsNip_12t0215100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0215100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6059277	6060170	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0215100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0215100-00;protein_id=OsNip_12t0215100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6060171	6060465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6062303	6062946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	6130297	6130518	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0215800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6130297	6130518	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0215800-00;Parent=gene:OsNip_12g0215800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0215800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6130297	6130518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215800-00;Name=OsNip_12t0215800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0215800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6130297	6130518	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0215800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0215800-00;protein_id=OsNip_12t0215800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	6138572	6141905	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0215950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6138572	6141905	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0215950-01;Parent=gene:OsNip_12g0215950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0215950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6138572	6138865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6138572	6141905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215950-01;Name=OsNip_12t0215950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0215950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6138866	6141904	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0215950-01;Parent=transcript:OsNip_12t0215950-01;protein_id=OsNip_12t0215950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6141905	6141905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0215950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	6140537	6142124	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0216000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6140537	6142124	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0216000-01;Parent=gene:OsNip_12g0216000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6140537	6140702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6140537	6142124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216000-01;Name=OsNip_12t0216000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0216000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6141024	6142124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6168271	6169051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216500-01;Name=OsNip_12t0216500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0216500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6168271	6169051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6169201	6169490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216500-01;Name=OsNip_12t0216500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0216500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6169489	6169490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0216500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	6224005	6228243	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0217300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6224005	6225304	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0217300-02;Parent=gene:OsNip_12g0217300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0217300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6224005	6224679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6224005	6225304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-02;Name=OsNip_12t0217300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0217300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6224962	6225304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6224027	6225725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6227704	6227808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6227903	6228243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-01;Name=OsNip_12t0217300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0217300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6227903	6228243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0217300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6625811	6626040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6643580	6643580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6643803	6644023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6647365	6650382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222800-00;Name=OsNip_12t0222800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0222800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6650911	6650962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6650911	6654226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222900-01;Name=OsNip_12t0222900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0222900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6650963	6654040	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0222900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0222900-01;protein_id=OsNip_12t0222900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6654041	6654226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0222900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6652881	6655097	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0223000-01;Parent=gene:OsNip_12g0223000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0223000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6652881	6653850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0223000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6654181	6655097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0223000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6677664	6679751	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0223300-01;Parent=gene:OsNip_12g0223300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0223300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6677664	6677880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0223300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6678135	6678201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0223300-01;Name=OsNip_12t0223300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0223300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6678135	6678201	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0223300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0223300-01;protein_id=OsNip_12t0223300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6679221	6679504	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0223300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0223300-01;protein_id=OsNip_12t0223300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6731713	6731831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0224000-01;Name=OsNip_12t0224000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0224000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	6814863	6815108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225200-02;Tag=IsoSeq:G16663.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7507.2;prot_id "UniRef90_A0A540K6T0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	6815299	6815865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Name=OsNip_12t0225300-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0225300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6815299	6815865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6817011	6817197	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6817011	6817205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Name=OsNip_12t0225300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0225300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6817198	6817205	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0225300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;protein_id=OsNip_12t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	6817901	6820037	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0225300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;protein_id=OsNip_12t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6817901	6820060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Name=OsNip_12t0225300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0225300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6820038	6820060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0225300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6896014	6896092	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0226500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6916214	6916247	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6916473	6916518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6917766	6917835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	6917923	6918279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227050-00;Name=OsNip_12t0227050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0227050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6917923	6918279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	6932587	6937071	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0227400-01;Parent=gene:OsNip_12g0227400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0227400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6932587	6932656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0227400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6966725	6966725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7068884	7069455	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0229600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0229600-00;protein_id=OsNip_12t0229600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7308465	7308674	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0233400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;protein_id=OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7309794	7309851	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0233400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;protein_id=OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7310555	7310643	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0233400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;protein_id=OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7310719	7310788	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0233400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;protein_id=OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7310719	7310798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;Name=OsNip_12t0233400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0233400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7310789	7310798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7311006	7311336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;Name=OsNip_12t0233400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0233400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7311006	7311336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0233400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7409322	7410361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Name=OsNip_12t0235600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0235600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7409322	7410361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7410867	7411007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7411008	7411110	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;protein_id=OsNip_12t0235600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7411215	7411284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Name=OsNip_12t0235600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0235600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7411688	7411885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Name=OsNip_12t0235600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0235600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7411710	7411885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7419688	7427708	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0235650-01;Parent=gene:OsNip_12g0235650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0235650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7419688	7420254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7419688	7421438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;Name=OsNip_12t0235650-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0235650-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7420255	7420917	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0235650-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;protein_id=OsNip_12t0235650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7420918	7421438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7426557	7427708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;Name=OsNip_12t0235650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0235650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7426557	7427708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	7419857	7427467	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0235700;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7419857	7427467	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0235700-00;Parent=gene:OsNip_12g0235700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0235700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7419857	7421438	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0235700-00;protein_id=OsNip_12t0235700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7426557	7427332	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0235700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0235700-00;protein_id=OsNip_12t0235700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7426557	7427467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235700-00;Name=OsNip_12t0235700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0235700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7427333	7427467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	7430623	7434681	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0235800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7430623	7434681	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0235800-01;Parent=gene:OsNip_12g0235800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7430623	7430670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7430835	7430939	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7431513	7431675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0235800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7431513	7431675	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7431775	7431823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0235800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7431775	7431823	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7432182	7432364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0235800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7432182	7432364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7432803	7432877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0235800-02-E2;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7432803	7432877	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7432942	7433127	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7433341	7433429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0235800-02-E4;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7433341	7433429	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7433872	7434424	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0235800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;protein_id=OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7433872	7434681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Name=OsNip_12t0235800-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0235800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7434425	7434681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0235800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7533581	7533660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0236700-02;Name=OsNip_12t0236700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0236700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7534463	7534962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0236700-02;Name=OsNip_12t0236700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0236700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	7536249	7538021	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0236800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7536249	7538021	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0236800-01;Parent=gene:OsNip_12g0236800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0236800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7536249	7536769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0236800-01;Name=OsNip_12t0236800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0236800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7824721	7825017	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0241100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0241100-01;protein_id=OsNip_12t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7824721	7825039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-01;Name=OsNip_12t0241100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0241100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7825018	7825039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	7824721	7825099	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Name=OsNip_12t0241100-02;exon_id=OsNip_12t0241100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	exon	7822922	7823009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Name=OsNip_12t0241100-02;exon_id=OsNip_12t0241100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	7822990	7823009	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0241100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;protein_id=OsNip_12t0241100-02;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	7822066	7822163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Name=OsNip_12t0241100-02;exon_id=OsNip_12t0241100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	7820506	7820611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Name=OsNip_12t0241100-02;exon_id=OsNip_12t0241100-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	7820148	7820381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Name=OsNip_12t0241100-02;exon_id=OsNip_12t0241100-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	7824983	7825099	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	7820506	7820611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	7820148	7820381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0241100-02;Tag=IsoSeq:G16692.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13034.1,Nipponbare.root_G9835.1,Nipponbare.leaf_G7520.2;prot_id "UniRef90_K3ZGD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7874284	7875247	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0242100-01;Parent=gene:OsNip_12g0242100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0242100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7874284	7874439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7874284	7875247	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242100-01;Name=OsNip_12t0242100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0242100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7874440	7875207	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0242100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0242100-01;protein_id=OsNip_12t0242100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7878268	7878888	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0242200-00;Parent=gene:OsNip_12g0242200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0242200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7878672	7878697	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0242200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0242200-00;protein_id=OsNip_12t0242200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7878672	7878888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242200-00;Name=OsNip_12t0242200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0242200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7892375	7892516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7892517	7893506	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0242500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0242500-01;protein_id=OsNip_12t0242500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7893507	7893898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7915608	7918642	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0242700-01;Parent=gene:OsNip_12g0242700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0242700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7915608	7915646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7924501	7924576	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0242900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;protein_id=OsNip_12t0242900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7924669	7924748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;Name=OsNip_12t0242900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0242900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7924669	7924748	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0242900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;protein_id=OsNip_12t0242900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7924837	7924926	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0242900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;protein_id=OsNip_12t0242900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7924837	7924927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;Name=OsNip_12t0242900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0242900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7924927	7924927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7921943	7922092	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242975-00;Name=OsNip_12t0242975-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0242975-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7922227	7922348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0242975-00;Name=OsNip_12t0242975-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0242975-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7989855	7989855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7989855	7990032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244100-04;Name=OsNip_12t0244100-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0244100-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7991535	7991848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244100-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	7989853	7990024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244150-00;Name=OsNip_12t0244150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0244150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7990273	7990426	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0244150-00;Parent=transcript:OsNip_12t0244150-00;protein_id=OsNip_12t0244150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7992997	7993139	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7992997	7993552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;Name=OsNip_12t0244200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0244200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7993140	7993532	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0244200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;protein_id=OsNip_12t0244200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7993533	7993552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7994629	7994722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;Name=OsNip_12t0244200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0244200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7994629	7994722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	7997383	8000365	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0244400;Name=OsNip_LHT2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	7997383	8000365	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0244400-01;Parent=gene:OsNip_12g0244400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7997383	7997473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7997383	7997649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Name=OsNip_12t0244400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0244400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7997474	7997649	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0244400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;protein_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7997733	7998637	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Name=OsNip_12t0244400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0244400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7997733	7998637	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0244400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;protein_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7999515	7999606	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0244400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;protein_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7999733	7999801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Name=OsNip_12t0244400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0244400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7999733	7999801	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0244400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;protein_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	7999931	8000029	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0244400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;protein_id=OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	7999931	8000365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Name=OsNip_12t0244400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0244400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8000030	8000365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8000498	8004474	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0244500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8000498	8004474	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0244500-01;Parent=gene:OsNip_12g0244500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0244500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8000498	8000843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8000498	8001057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0244500-01;Name=OsNip_12t0244500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0244500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	8035048	8036687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245100-01;Name=OsNip_12t0245100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0245100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8036408	8036687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	8053870	8055730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245401-01;Name=OsNip_12t0245401-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0245401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8076291	8076808	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0245700-01;Parent=gene:OsNip_12g0245700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0245700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8076291	8076369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8076291	8076808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245700-01;Name=OsNip_12t0245700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0245700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8076370	8076603	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0245700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0245700-01;protein_id=OsNip_12t0245700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8076604	8076808	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8078681	8081249	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0245800-01;Parent=gene:OsNip_12g0245800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8078681	8078793	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8078681	8078956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Name=OsNip_12t0245800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0245800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8078794	8078955	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0245800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;protein_id=OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8078956	8078956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8079578	8080169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8080985	8081249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Name=OsNip_12t0245800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0245800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8080985	8081249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8161472	8165176	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0246700;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8161472	8165176	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0246700-01;Parent=gene:OsNip_12g0246700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0246700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8161472	8161659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;Name=OsNip_12t0246700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0246700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8161472	8161659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8162056	8162098	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8162056	8164895	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;Name=OsNip_12t0246700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0246700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8162099	8164895	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0246700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;protein_id=OsNip_12t0246700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8164982	8165001	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0246700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0246700-01;protein_id=OsNip_12t0246700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8673218	8674964	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0254601-01;Parent=gene:OsNip_12g0254601;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0254601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8673218	8673512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8673218	8674964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254601-01;Name=OsNip_12t0254601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0254601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8673732	8674964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8684238	8689117	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0254700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8684238	8689117	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0254700-01;Parent=gene:OsNip_12g0254700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8684238	8687694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8684238	8689117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254700-01;Name=OsNip_12t0254700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0254700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8687695	8687979	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0254700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0254700-01;protein_id=OsNip_12t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8687980	8689117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8690833	8699334	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0254825;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8690833	8699141	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0254825-00;Parent=gene:OsNip_12g0254825;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0254825-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8690833	8691210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-00;Name=OsNip_12t0254825-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0254825-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8690833	8691210	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0254825-00;Parent=transcript:OsNip_12t0254825-00;protein_id=OsNip_12t0254825-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8698995	8699141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-00;Name=OsNip_12t0254825-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0254825-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8698995	8699141	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0254825-00;Parent=transcript:OsNip_12t0254825-00;protein_id=OsNip_12t0254825-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	8695277	8699334	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0254825-01;Parent=gene:OsNip_12g0254825;transcript_id=OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1
Chr12	TAMA	exon	8695277	8695499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Name=OsNip_12t0254825-01;exon_id=OsNip_12t0254825-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	8695277	8695499	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0254825-01;Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;protein_id=OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	8695584	8695909	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Name=OsNip_12t0254825-01;exon_id=OsNip_12t0254825-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	8695584	8695591	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0254825-01;Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;protein_id=OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	8698690	8698738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Name=OsNip_12t0254825-01;exon_id=OsNip_12t0254825-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	8698995	8699334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Name=OsNip_12t0254825-01;exon_id=OsNip_12t0254825-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	8695595	8695909	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	8698690	8698738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	8698995	8699334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0254825-01;Tag=IsoSeq:G16702.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13041.1;prot_id "UniRef90_B9FZE1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8710740	8711646	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0255000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8710740	8711646	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0255000-01;Parent=gene:OsNip_12g0255000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0255000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8710740	8710962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8710740	8710996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255000-01;Name=OsNip_12t0255000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8710963	8710996	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0255000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0255000-01;protein_id=OsNip_12t0255000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8711353	8711646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255000-01;Name=OsNip_12t0255000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0255000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8711353	8711646	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0255000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0255000-01;protein_id=OsNip_12t0255000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8726013	8737949	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0255200;biotype=protein_coding;description=Staphylococcal;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8726013	8730968	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0255200-02;Parent=gene:OsNip_12g0255200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8726013	8726359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Name=OsNip_12t0255200-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8726013	8726359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8727474	8727542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Name=OsNip_12t0255200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8727474	8727542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8727648	8727807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Name=OsNip_12t0255200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8727648	8727807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8727888	8727944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Name=OsNip_12t0255200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8727888	8727944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8729063	8729281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8729063	8730968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Name=OsNip_12t0255200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0255200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8729282	8729545	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0255200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;protein_id=OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8729546	8730968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8726067	8737949	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0255200-01;Parent=gene:OsNip_12g0255200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0255200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8726067	8726236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8726067	8726359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0255200-01;Name=OsNip_12t0255200-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0255200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8726237	8726359	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0255200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0255200-01;protein_id=OsNip_12t0255200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	8823315	8825166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0256900-01;Name=OsNip_12t0256900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0256900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8825164	8825166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0256900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8829575	8834630	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0257000;Name=CBP1;biotype=protein_coding;description=Serine;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8829575	8830551	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0257000-03;Parent=gene:OsNip_12g0257000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0257000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8829575	8829903	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8829575	8829987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257000-03;Name=OsNip_12t0257000-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0257000-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8830187	8830232	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0257000-03;Parent=transcript:OsNip_12t0257000-03;protein_id=OsNip_12t0257000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8830433	8830551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257000-03;Name=OsNip_12t0257000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0257000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8829622	8832771	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0257000-02;Parent=gene:OsNip_12g0257000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0257000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8829622	8829903	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	8852645	8853021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257450-01;Name=OsNip_12t0257450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0257450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8860397	8860654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8859415	8859424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8859415	8860654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257500-02;Name=OsNip_12t0257500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0257500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8869547	8869568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8870756	8870910	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0257600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0257600-00;protein_id=OsNip_12t0257600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8871127	8872007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257600-00;Name=OsNip_12t0257600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0257600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8871127	8872007	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0257600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0257600-00;protein_id=OsNip_12t0257600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8883164	8883165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8883164	8884514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257900-02;Name=OsNip_12t0257900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0257900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	8883166	8884506	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0257900-02;Parent=transcript:OsNip_12t0257900-02;protein_id=OsNip_12t0257900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8884507	8884514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0257900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	8906428	8915083	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0258200;Name=OsNip_DjC79;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	8906428	8914969	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0258200-01;Parent=gene:OsNip_12g0258200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0258200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8906428	8906888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0258200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	8906428	8906992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0258200-01;Name=OsNip_12t0258200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0258200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9179771	9181307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0261300-02;Name=OsNip_12t0261300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0261300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9182288	9182918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0261450-01;Name=OsNip_12t0261450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0261450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9196122	9196525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0261575-00;Name=OsNip_12t0261575-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0261575-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9196122	9196525	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0261575-00;Parent=transcript:OsNip_12t0261575-00;protein_id=OsNip_12t0261575-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	9209610	9211645	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0262100;biotype=protein_coding;description=HAT;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	9209610	9211645	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0262100-01;Parent=gene:OsNip_12g0262100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0262100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9209610	9209618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0262100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9209619	9211544	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0262100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0262100-01;protein_id=OsNip_12t0262100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9211545	9211645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0262100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	9246620	9250382	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0262700;biotype=protein_coding;description=Alpha/beta;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	9246620	9250382	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0262700-01;Parent=gene:OsNip_12g0262700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0262700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9362063	9363776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0264500-04;Name=OsNip_12t0264500-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0264500-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9362204	9363776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0264500-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9466783	9468196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0266000-03;Name=OsNip_12t0266000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0266000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9477728	9478760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0266200-01;Name=OsNip_12t0266200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0266200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	9555206	9558162	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0267700-01;Parent=gene:OsNip_12g0267700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9555931	9555997	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0267700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;protein_id=OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9556247	9556306	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0267700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;protein_id=OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9556247	9556387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Name=OsNip_12t0267700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0267700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9556307	9556387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9556541	9556573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Name=OsNip_12t0267700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9556541	9556573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9556659	9556712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Name=OsNip_12t0267700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9556659	9556712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9556811	9556913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9557074	9557202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Name=OsNip_12t0267700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9557864	9558162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Name=OsNip_12t0267700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9557864	9558162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9565766	9566183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9565766	9567140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267800-01;Name=OsNip_12t0267800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9566397	9567140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9565932	9567712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9568079	9568170	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0267900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;protein_id=OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9568525	9568574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;Name=OsNip_12t0267900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0267900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9568525	9568574	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0267900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;protein_id=OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9570009	9570083	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0267900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;protein_id=OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	9570162	9570717	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0267900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;protein_id=OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9570162	9570984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;Name=OsNip_12t0267900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0267900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9570718	9570984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	9573361	9573420	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0267950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	9573361	9573420	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0267950-00;Parent=gene:OsNip_12g0267950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0267950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9573361	9573420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0267950-00;Name=OsNip_12t0267950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0267950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9922385	9922386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0271700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9921771	9922003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0271700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	9921771	9922221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0271700-01;Name=OsNip_12t0271700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0271700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	9983845	9984737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0272800-01;Name=OsNip_12t0272800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0272800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10021504	10021620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273300-01;Name=OsNip_12t0273300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0273300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10021610	10021620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10049911	10050312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;Name=OsNip_12t0273700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0273700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10049911	10050312	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0273700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;protein_id=OsNip_12t0273700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10051224	10051310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;Name=OsNip_12t0273700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0273700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10051224	10051310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0273700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;protein_id=OsNip_12t0273700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10052556	10053017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;Name=OsNip_12t0273700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0273700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10052655	10053017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10053411	10056454	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0273800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10053411	10056454	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0273800-00;Parent=gene:OsNip_12g0273800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0273800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10053411	10053876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;Name=OsNip_12t0273800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0273800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10053411	10053876	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0273800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;protein_id=OsNip_12t0273800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10054614	10055200	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0273800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;protein_id=OsNip_12t0273800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10054614	10055248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;Name=OsNip_12t0273800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0273800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10055201	10055248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10056289	10056454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;Name=OsNip_12t0273800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0273800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10056289	10056454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10058762	10059232	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0273850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10058762	10059232	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0273850-00;Parent=gene:OsNip_12g0273850;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0273850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10058762	10059232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273850-00;Name=OsNip_12t0273850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0273850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10058775	10061686	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0273900;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10058775	10061686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0273900-00;Parent=gene:OsNip_12g0273900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10058775	10059388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10058775	10061686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0273900-00;Name=OsNip_12t0273900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0273900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10059389	10061686	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0273900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0273900-00;protein_id=OsNip_12t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10256687	10256848	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0277000-02;Name=OsNip_12t0277000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0277000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10258835	10259284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0277200-00;Name=OsNip_12t0277200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0277200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10258835	10259284	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0277200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0277200-00;protein_id=OsNip_12t0277200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10281013	10286711	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0277400;Name=OsNip_PUB23;biotype=protein_coding;description=Armadillo-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10281013	10286711	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0277400-01;Parent=gene:OsNip_12g0277400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0277400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10296645	10297096	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0277500-04;Parent=transcript:OsNip_12t0277500-04;protein_id=OsNip_12t0277500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10297367	10297657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0277500-04;Parent=transcript:OsNip_12t0277500-04;protein_id=OsNip_12t0277500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10297367	10297903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0277500-04;Name=OsNip_12t0277500-04-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0277500-04-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10297658	10297903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0277500-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10472891	10473041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279100-01;Name=OsNip_12t0279100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0279100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10474943	10475021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279100-01;Name=OsNip_12t0279100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0279100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10477406	10478397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279100-01;Name=OsNip_12t0279100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0279100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10478235	10478397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10506833	10507122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10506833	10507205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0279600-01;Name=OsNip_12t0279600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0279600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10610855	10611101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0281375-00;Name=OsNip_12t0281375-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0281375-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10612450	10614241	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0281450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10612450	10613648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0281450-00;Name=OsNip_12t0281450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0281450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10612693	10613648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0281450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10613868	10614241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0281450-00;Name=OsNip_12t0281450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0281450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10613868	10614241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0281450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10669458	10670625	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Name=OsNip_12t0282400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0282400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10670428	10670625	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10670694	10670786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10670885	10670989	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10671084	10671542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10671636	10671966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10703640	10705631	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0282766-00;Parent=gene:OsNip_12g0282766;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0282766-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10703640	10703729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282766-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10703730	10704033	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0282766-00;Parent=transcript:OsNip_12t0282766-00;protein_id=OsNip_12t0282766-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10705495	10705532	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0282766-00;Parent=transcript:OsNip_12t0282766-00;protein_id=OsNip_12t0282766-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10705495	10705631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282766-00;Name=OsNip_12t0282766-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0282766-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10705533	10705631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0282766-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10711964	10717815	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0283100;Name=OsNip_NTP13;biotype=protein_coding;description=Nucleotidyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10711964	10717815	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0283100-01;Parent=gene:OsNip_12g0283100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0283100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10711964	10712340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10711964	10712407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;Name=OsNip_12t0283100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0283100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10712341	10712407	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0283100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;protein_id=OsNip_12t0283100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10712550	10713241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;Name=OsNip_12t0283100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0283100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10712550	10713241	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0283100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;protein_id=OsNip_12t0283100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10713601	10713756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;Name=OsNip_12t0283100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0283100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10713601	10713756	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0283100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0283100-01;protein_id=OsNip_12t0283100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10773086	10773487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0284000-03;Name=OsNip_12t0284000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0284000-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10822535	10822950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10823188	10826595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10822540	10823043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Name=OsNip_12t0285100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0285100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10823342	10823383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10823342	10823586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Name=OsNip_12t0285100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0285100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10823384	10823586	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;protein_id=OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10824065	10824325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Name=OsNip_12t0285100-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10824065	10824325	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0285100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;protein_id=OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10830812	10832777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Name=OsNip_12t0285100-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10830812	10832777	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0285100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;protein_id=OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10833093	10833494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;protein_id=OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10833093	10833577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Name=OsNip_12t0285100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0285100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10833495	10833577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10822545	10823043	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-03;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;protein_id=OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10823451	10823586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;Name=OsNip_12t0285100-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10823451	10823586	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0285100-03;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;protein_id=OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10824065	10824325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;Name=OsNip_12t0285100-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10824065	10824325	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0285100-03;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;protein_id=OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10830812	10832777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;Name=OsNip_12t0285100-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10830812	10832777	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0285100-03;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;protein_id=OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10833093	10833494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-03;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;protein_id=OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10833093	10833618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;Name=OsNip_12t0285100-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0285100-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10833495	10833618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10831043	10833579	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0285100-04;Parent=gene:OsNip_12g0285100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0285100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10831043	10831043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10831043	10832777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;Name=OsNip_12t0285100-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0285100-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10831044	10832777	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-04;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;protein_id=OsNip_12t0285100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10833093	10833494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285100-04;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;protein_id=OsNip_12t0285100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10833093	10833579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;Name=OsNip_12t0285100-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0285100-04-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10833495	10833579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	10822541	10833618	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0285100-05;Parent=gene:OsNip_12g0285100;transcript_id=OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1
Chr12	TAMA	exon	10822541	10823586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Name=OsNip_12t0285100-05;exon_id=OsNip_12t0285100-05-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	10822542	10823153	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0285100-05;Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;protein_id=OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	10824065	10824325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Name=OsNip_12t0285100-05;exon_id=OsNip_12t0285100-05-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	10830812	10832777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Name=OsNip_12t0285100-05;exon_id=OsNip_12t0285100-05-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	10833093	10833618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Name=OsNip_12t0285100-05;exon_id=OsNip_12t0285100-05-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	10822541	10822541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	10823157	10823586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	10824065	10824325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	10830812	10832777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	10833093	10833618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285100-05;Tag=IsoSeq:G16747.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13073.2,Nipponbare.leaf_G7546.1;prot_id "UniRef90_A0A446VX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10848222	10856270	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0285500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10862429	10862823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10875071	10875099	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0285700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0285700-00;protein_id=OsNip_12t0285700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10876809	10877400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0285700-00;Name=OsNip_12t0285700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0285700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10876809	10877400	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0285700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0285700-00;protein_id=OsNip_12t0285700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10893286	10894106	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0286200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10893286	10894106	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0286200-01;Parent=gene:OsNip_12g0286200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0286200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10893286	10893494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10893286	10894106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286200-01;Name=OsNip_12t0286200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0286200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10893495	10893977	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286200-01;protein_id=OsNip_12t0286200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10893978	10894106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10904277	10909395	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0286300;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10904277	10909395	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0286300-00;Parent=gene:OsNip_12g0286300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0286300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10904277	10904465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Name=OsNip_12t0286300-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0286300-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10904277	10904465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10905352	10905539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Name=OsNip_12t0286300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0286300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10905352	10905539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10906645	10906730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10906645	10906968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Name=OsNip_12t0286300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0286300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	10909154	10909395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;Name=OsNip_12t0286300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0286300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10909154	10909395	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0286300-00;protein_id=OsNip_12t0286300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10935594	10942446	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0286600;Name=OsNip_POP23;biotype=protein_coding;description=Alpha/beta;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10935594	10942446	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0286600-01;Parent=gene:OsNip_12g0286600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10935594	10935915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10935594	10936425	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Name=OsNip_12t0286600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0286600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10935916	10936425	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;protein_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10939203	10939250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Name=OsNip_12t0286600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0286600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10939203	10939250	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;protein_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10939362	10939598	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Name=OsNip_12t0286600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0286600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10939362	10939598	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;protein_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10939690	10939726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Name=OsNip_12t0286600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0286600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10939690	10939726	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0286600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;protein_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10941997	10942298	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0286600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;protein_id=OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10941997	10942446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Name=OsNip_12t0286600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0286600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10942299	10942446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0286600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10959539	10962329	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0287200;Name=OsNip_MAGO2;biotype=protein_coding;description=Core;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10959539	10962329	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0287200-01;Parent=gene:OsNip_12g0287200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10959539	10959610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10959539	10959850	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;Name=OsNip_12t0287200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0287200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10959611	10959850	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0287200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;protein_id=OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10959985	10960161	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;Name=OsNip_12t0287200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0287200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10959985	10960161	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0287200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;protein_id=OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10962014	10962079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0287200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;protein_id=OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10962014	10962329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;Name=OsNip_12t0287200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0287200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10962080	10962329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	10963340	10974368	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0287300;Name=OsNip_ISC2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	10963340	10971767	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0287300-02;Parent=gene:OsNip_12g0287300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0287300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10963340	10963705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10963340	10963876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287300-02;Name=OsNip_12t0287300-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0287300-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10963706	10963876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0287300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0287300-02;protein_id=OsNip_12t0287300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	10967961	10968119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0287300-02;Name=OsNip_12t0287300-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0287300-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	10967961	10968119	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0287300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0287300-02;protein_id=OsNip_12t0287300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	11140803	11140983	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289666-00;Name=OsNip_12t0289666-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0289666-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11167217	11169327	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0289800-00;Parent=gene:OsNip_12g0289800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0289800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11167217	11169301	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0289800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0289800-00;protein_id=OsNip_12t0289800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11167217	11169327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289800-00;Name=OsNip_12t0289800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0289800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11169302	11169327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	11177011	11178724	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0289833;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11177011	11178724	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0289833-01;Parent=gene:OsNip_12g0289833;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0289833-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11177011	11177423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11177011	11177535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;Name=OsNip_12t0289833-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0289833-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11177424	11177535	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0289833-01;Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;protein_id=OsNip_12t0289833-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11177967	11178107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;Name=OsNip_12t0289833-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0289833-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11177967	11178107	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0289833-01;Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;protein_id=OsNip_12t0289833-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11178201	11178460	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0289833-01;Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;protein_id=OsNip_12t0289833-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11178201	11178724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0289833-01;Name=OsNip_12t0289833-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0289833-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11263219	11263220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11263219	11263636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-02;Name=OsNip_12t0291100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0291100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11263221	11263292	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0291100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0291100-02;protein_id=OsNip_12t0291100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11263293	11263636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11263303	11263583	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0291100-03;Parent=gene:OsNip_12g0291100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0291100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11263303	11263583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-03;Name=OsNip_12t0291100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0291100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	11262587	11263636	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0291100-04;Parent=gene:OsNip_12g0291100;transcript_id=OsNip_12t0291100-04;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12
Chr12	TAMA	exon	11262587	11262792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;Name=OsNip_12t0291100-04;exon_id=OsNip_12t0291100-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	11262775	11262792	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0291100-04;Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;protein_id=OsNip_12t0291100-04;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	11263132	11263636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;Name=OsNip_12t0291100-04;exon_id=OsNip_12t0291100-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	11263132	11263233	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0291100-04;Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;protein_id=OsNip_12t0291100-04;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	11262587	11262774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	11263237	11263636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291100-04;Tag=IsoSeq:G16761.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7552.12;prot_id "UniRef90_P26667";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	11265647	11267889	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0291200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11265647	11267889	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0291200-00;Parent=gene:OsNip_12g0291200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0291200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11265647	11265838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291200-00;Name=OsNip_12t0291200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0291200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11265647	11265838	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0291200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0291200-00;protein_id=OsNip_12t0291200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11267523	11267621	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0291200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0291200-00;protein_id=OsNip_12t0291200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11267523	11267889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291200-00;Name=OsNip_12t0291200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0291200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11267622	11267889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	11265680	11267875	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0291301;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11265680	11267875	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0291301-00;Parent=gene:OsNip_12g0291301;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0291301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11265680	11265934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291301-00;Name=OsNip_12t0291301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0291301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11265680	11265934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11267444	11267594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11267444	11267875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0291301-00;Name=OsNip_12t0291301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0291301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11267595	11267840	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0291301-00;Parent=transcript:OsNip_12t0291301-00;protein_id=OsNip_12t0291301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11351562	11351729	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0292900-03;Parent=transcript:OsNip_12t0292900-03;protein_id=OsNip_12t0292900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	11352170	11352901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0292900-03;Name=OsNip_12t0292900-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0292900-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11353623	11353825	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0292900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11355760	11356037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0292900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11356542	11356825	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0292900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11357939	11359523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11357939	11359810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;Name=OsNip_12t0293000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0293000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11359524	11359772	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0293000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;protein_id=OsNip_12t0293000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11359773	11359810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	11359893	11360175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;Name=OsNip_12t0293000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0293000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11359893	11360175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	11357939	11360914	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0293000-01;Parent=gene:OsNip_12g0293000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0293000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11357939	11359588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0293000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	11906518	11906670	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0299300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0299300-02;protein_id=OsNip_12t0299300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11906671	11907178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0299300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	11904715	11907264	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0299300-03;Parent=gene:OsNip_12g0299300;transcript_id=OsNip_12t0299300-03;Tag=IsoSeq:G16767.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13090.2
Chr12	TAMA	exon	11906338	11907264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0299300-03;Name=OsNip_12t0299300-03;exon_id=OsNip_12t0299300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16767.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13090.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0RG93";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12206539	12206685	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0405200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0405200-01;protein_id=OsNip_12t0405200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12206773	12206982	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0405200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0405200-01;protein_id=OsNip_12t0405200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12207130	12207465	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0405200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0405200-01;protein_id=OsNip_12t0405200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12207130	12207672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0405200-01;Name=OsNip_12t0405200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0405200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12207466	12207672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0405200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	12221399	12223748	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0405300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12221399	12223748	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0405300-01;Parent=gene:OsNip_12g0405300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12221399	12222153	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12221399	12222493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0405300-01;Name=OsNip_12t0405300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0405300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12222154	12222330	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0405300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0405300-01;protein_id=OsNip_12t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12222331	12222493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0405300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12266765	12267316	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0406100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0406100-01;protein_id=OsNip_12t0406100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12266765	12267518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0406100-01;Name=OsNip_12t0406100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0406100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12267317	12267518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0406100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12303478	12304062	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0407000-00;protein_id=OsNip_12t0407000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12305767	12309040	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0407100-01;Parent=gene:OsNip_12g0407100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12305767	12306215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Name=OsNip_12t0407100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12305767	12306215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12306297	12307632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12306297	12307725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Name=OsNip_12t0407100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	12307979	12308059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Name=OsNip_12t0407100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	12308303	12309040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-01;Name=OsNip_12t0407100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	12308857	12309008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-02;Tag=IsoSeq:G16777.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13100.1;prot_id "UniRef90_B8AW35";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	12309063	12309147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407100-02;Tag=IsoSeq:G16777.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13100.1;prot_id "UniRef90_B8AW35";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12312393	12313009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12312393	12313181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407200-01;Name=OsNip_12t0407200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0407200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12313400	12313566	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0407200-01;protein_id=OsNip_12t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12313400	12314511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407200-01;Name=OsNip_12t0407200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	12314031	12315547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407250-01;Name=OsNip_12t0407250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12315611	12315826	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407250-01;Name=OsNip_12t0407250-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407250-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12315850	12318391	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0407300-01;Parent=gene:OsNip_12g0407300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0407300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12315850	12316215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12315850	12318391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407300-01;Name=OsNip_12t0407300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12318343	12318391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	12319463	12319735	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0407350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12319463	12319735	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0407350-00;Parent=gene:OsNip_12g0407350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0407350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12319463	12319735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407350-00;Name=OsNip_12t0407350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	12321682	12326040	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0407500-02;Parent=gene:OsNip_12g0407500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12321682	12321935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12321682	12322496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407500-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12321936	12322496	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12323971	12324040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E12;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	12324259	12324389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E11;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	12325304	12325350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E10;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12325304	12325350	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12325480	12325556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E9;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12325480	12325556	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12325640	12325704	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E8;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12325640	12325704	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12325782	12325868	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12325977	12326039	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;protein_id=OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12325977	12326040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Name=OsNip_12t0407500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0407500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12326040	12326040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12321685	12321935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12321685	12322496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0407500-01;Name=OsNip_12t0407500-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0407500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12321936	12322496	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0407500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0407500-01;protein_id=OsNip_12t0407500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12846349	12846552	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0416500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0416500-01;protein_id=OsNip_12t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12846836	12846852	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0416500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0416500-01;protein_id=OsNip_12t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	12846836	12847678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0416500-01;Name=OsNip_12t0416500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0416500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12846853	12847678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12848035	12848507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12893150	12893423	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0417100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	12911508	12912287	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0417300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	12911754	12912128	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0417300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0417300-00;protein_id=OsNip_12t0417300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13060386	13060488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0419700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	13060584	13060893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0419700-01;Name=OsNip_12t0419700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0419700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13060893	13060893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0419700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	13095003	13096886	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0420000;Name=OsNip_STA280;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13328428	13328675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	13328676	13329542	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0422800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0422800-01;protein_id=OsNip_12t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13329543	13329690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0422800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	13355799	13356143	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0422971-00;Parent=gene:OsNip_12g0422971;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0422971-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13375575	13375661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0423142-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13584996	13586163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0426750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13604156	13604220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0427100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	13675469	13675555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0428200-00;Name=OsNip_12t0428200-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0428200-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	13665623	13665833	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0428200-01;Name=OsNip_12t0428200-01;exon_id=OsNip_12t0428200-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16797.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7570.1,Nipponbare.panicle_G13117.1;prot_id "UniRef90_A0A287JIN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	13664287	13664288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0428200-01;Tag=IsoSeq:G16797.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7570.1,Nipponbare.panicle_G13117.1;prot_id "UniRef90_A0A287JIN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15011427	15011459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0445300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15340376	15340502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0448900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15461853	15461855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15472945	15475350	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0450500-01;Parent=gene:OsNip_12g0450500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15472945	15473272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15473739	15473814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Name=OsNip_12t0450500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0450500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15473739	15473814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15473966	15473975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15473966	15474035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Name=OsNip_12t0450500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0450500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15473976	15474035	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0450500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;protein_id=OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15474125	15474232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;Name=OsNip_12t0450500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0450500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15474324	15474386	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0450500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0450500-01;protein_id=OsNip_12t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15639469	15639627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15640264	15640442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15758649	15760484	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0454600;Name=OsNip_ENODL24;biotype=protein_coding;description=Cupredoxin;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15758649	15760484	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0454600-00;Parent=gene:OsNip_12g0454600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0454600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	15759924	15760484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0454600-00;Name=OsNip_12t0454600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0454600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15760394	15760484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0454600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15759920	15760383	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0454701-00;Parent=gene:OsNip_12g0454701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0454701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15759920	15760381	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0454701-00;Parent=transcript:OsNip_12t0454701-00;protein_id=OsNip_12t0454701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15759920	15760383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0454701-00;Name=OsNip_12t0454701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0454701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15760382	15760383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0454701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15776462	15779912	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0454800;Name=CRL4;biotype=protein_coding;description=Receptor-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15776462	15779912	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0454800-01;Parent=gene:OsNip_12g0454800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0454800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15779536	15779912	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0454800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15788561	15789140	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0455000;Name=OsNip_THI34;biotype=protein_coding;description=Proteinase;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15788561	15789140	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0455000-01;Parent=gene:OsNip_12g0455000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0455000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15788561	15788621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0455000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15788561	15789140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0455000-01;Name=OsNip_12t0455000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0455000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15788622	15788897	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0455000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0455000-01;protein_id=OsNip_12t0455000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15788898	15789140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0455000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15791403	15791929	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0455100-01;Parent=gene:OsNip_12g0455100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0455100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15791403	15791573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0455100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15791841	15791929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0455100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15839919	15840629	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0456000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15839919	15840629	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0456000-00;Parent=gene:OsNip_12g0456000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0456000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15839919	15840629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0456000-00;Name=OsNip_12t0456000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0456000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15839919	15840629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0456000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0456000-00;protein_id=OsNip_12t0456000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15842439	15845828	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0456100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15842439	15845828	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0456100-00;Parent=gene:OsNip_12g0456100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0456100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15842439	15845069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0456100-00;Name=OsNip_12t0456100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0456100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15842439	15845069	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0456100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0456100-00;protein_id=OsNip_12t0456100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	15845166	15845828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0456100-00;Name=OsNip_12t0456100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0456100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	15845166	15845828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0456100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0456100-00;protein_id=OsNip_12t0456100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	15848621	15851558	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0456200;Name=OsNip_DjC80;biotype=protein_coding;description=Heat;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	15848621	15851558	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0456200-01;Parent=gene:OsNip_12g0456200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0456200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15848621	15848996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0456200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16004918	16005479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0458100-01;Name=OsNip_12t0458100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0458100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	16061407	16061407	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0458900-02;Tag=IsoSeq:G16833.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7583.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0B176";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	16068591	16068941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0458900-02;Tag=IsoSeq:G16833.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7583.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0B176";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16081606	16082151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0459100-00;Name=OsNip_12t0459100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0459100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16081606	16082151	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0459100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0459100-00;protein_id=OsNip_12t0459100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16100604	16100682	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0459300-03;Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;protein_id=OsNip_12t0459300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16100790	16100928	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0459300-03;Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;protein_id=OsNip_12t0459300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16100790	16101147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;Name=OsNip_12t0459300-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0459300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16100929	16101147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16101234	16101732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;Name=OsNip_12t0459300-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0459300-03-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16101234	16101732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0459300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16463472	16463951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465000-00;Name=OsNip_12t0465000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0465000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16469122	16469207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16469208	16469271	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0465100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0465100-01;protein_id=OsNip_12t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16469437	16469753	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0465100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0465100-01;protein_id=OsNip_12t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16469437	16469853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465100-01;Name=OsNip_12t0465100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0465100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16469754	16469853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	16500219	16504887	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0465700;Name=DEC;biotype=protein_coding;description=Plant-specific;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	16500219	16504887	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0465700-01;Parent=gene:OsNip_12g0465700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0465700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16500219	16500517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16500219	16501130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;Name=OsNip_12t0465700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0465700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16500518	16501130	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0465700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;protein_id=OsNip_12t0465700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16504213	16504859	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0465700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;protein_id=OsNip_12t0465700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16504213	16504887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;Name=OsNip_12t0465700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0465700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16504860	16504887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	16506143	16507816	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0465800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	16506143	16507816	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0465800-00;Parent=gene:OsNip_12g0465800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0465800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16506143	16506182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465800-00;Name=OsNip_12t0465800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0465800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16507311	16507816	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0465800-00;Name=OsNip_12t0465800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0465800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16582692	16582881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;Name=OsNip_12t0467200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0467200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16582692	16582881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16583199	16583260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16583381	16585353	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;Name=OsNip_12t0467200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0467200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16583742	16584968	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0467200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;protein_id=OsNip_12t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16584969	16585353	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	16589263	16595997	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0467300-01;Parent=gene:OsNip_12g0467300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0467300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16589263	16589757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467300-01;Name=OsNip_12t0467300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0467300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16589263	16589757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16590679	16590709	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16590679	16592741	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467300-01;Name=OsNip_12t0467300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0467300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16594933	16594988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16598434	16598507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16598919	16599501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16618382	16618561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0467700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	16640709	16642633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468000-01;Name=OsNip_12t0468000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0468000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16640818	16642350	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0468000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0468000-01;protein_id=OsNip_12t0468000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16642351	16642633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16641399	16641399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16641399	16642530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468000-02;Name=OsNip_12t0468000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0468000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16641400	16642350	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0468000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0468000-02;protein_id=OsNip_12t0468000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16642351	16642530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	16685515	16692192	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0468300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	16686982	16687801	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0468300-00;Parent=gene:OsNip_12g0468300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0468300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16686982	16687516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0468300-00;Name=OsNip_12t0468300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0468300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16686982	16687516	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0468300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0468300-00;protein_id=OsNip_12t0468300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16964046	16964699	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0472300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0472300-00;protein_id=OsNip_12t0472300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16964886	16965071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0472300-00;Name=OsNip_12t0472300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0472300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	16964886	16965071	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0472300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0472300-00;protein_id=OsNip_12t0472300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	16964627	16965366	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0472366;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	16964627	16965366	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0472366-00;Parent=gene:OsNip_12g0472366;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0472366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16964627	16964870	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0472366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	16964627	16965366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0472366-00;Name=OsNip_12t0472366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0472366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16965222	16965366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0472366-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17070764	17070800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0473900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17071320	17071549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0473900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17302127	17305326	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0476200-01;Parent=gene:OsNip_12g0476200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17302127	17302696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17302127	17303005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Name=OsNip_12t0476200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0476200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17302697	17303005	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0476200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;protein_id=OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17303121	17303240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Name=OsNip_12t0476200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0476200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17303121	17303240	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0476200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;protein_id=OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17304098	17304134	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Name=OsNip_12t0476200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0476200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17304098	17304134	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0476200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;protein_id=OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17305083	17305134	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0476200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;protein_id=OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17305083	17305326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Name=OsNip_12t0476200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0476200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17305135	17305326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0476200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17364617	17367165	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0477050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17364617	17367165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0477050-01;Parent=gene:OsNip_12g0477050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17364617	17365401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17364617	17365518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;Name=OsNip_12t0477050-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0477050-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17365402	17365518	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0477050-01;Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;protein_id=OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17366092	17366236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;Name=OsNip_12t0477050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0477050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17366092	17366236	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0477050-01;Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;protein_id=OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17367011	17367114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0477050-01;Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;protein_id=OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17367011	17367165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;Name=OsNip_12t0477050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0477050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17367115	17367165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17367334	17368383	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0477200;Name=OsNip_CesA10;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17367334	17368383	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0477200-00;Parent=gene:OsNip_12g0477200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0477200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17367334	17368350	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0477200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0477200-00;protein_id=OsNip_12t0477200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17367334	17368383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477200-00;Name=OsNip_12t0477200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0477200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17368351	17368383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17391342	17392627	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0477400-01;Parent=gene:OsNip_12g0477400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0477400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17416289	17418550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477700-01;Name=OsNip_12t0477700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0477700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17418550	17418550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0477700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17463398	17465368	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0478200;Name=OsNip_ABA45;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17463448	17464070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478200-02;Name=OsNip_12t0478200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0478200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17485197	17486364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478400-00;Name=OsNip_12t0478400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0478400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17485211	17486364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17501253	17501969	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0478766-00;Parent=gene:OsNip_12g0478766;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0478766-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17501253	17501969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478766-00;Name=OsNip_12t0478766-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0478766-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17514849	17515832	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0478900;biotype=protein_coding;description=Sterile;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17514849	17515832	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0478900-00;Parent=gene:OsNip_12g0478900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0478900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17514849	17515505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0478900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0478900-00;protein_id=OsNip_12t0478900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17514849	17515832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478900-00;Name=OsNip_12t0478900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0478900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17515506	17515832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0478900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17538320	17539655	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0479100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17538320	17539655	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0479100-00;Parent=gene:OsNip_12g0479100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17538320	17538497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;Name=OsNip_12t0479100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0479100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17538320	17538497	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0479100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;protein_id=OsNip_12t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17538833	17538883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;Name=OsNip_12t0479100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0479100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17538833	17538883	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0479100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;protein_id=OsNip_12t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17538981	17539627	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0479100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;protein_id=OsNip_12t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17538981	17539655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;Name=OsNip_12t0479100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0479100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17539628	17539655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17538826	17539901	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0479150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17538826	17539901	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0479150-00;Parent=gene:OsNip_12g0479150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0479150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17538826	17538891	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17538826	17539264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0479150-00;Name=OsNip_12t0479150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0479150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17625031	17625313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480100-01;Name=OsNip_12t0480100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0480100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	17628169	17632394	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0480200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17628181	17632392	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0480200-01;Parent=gene:OsNip_12g0480200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17628181	17628349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17628181	17629181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Name=OsNip_12t0480200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0480200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17628350	17629181	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0480200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;protein_id=OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17629737	17630165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Name=OsNip_12t0480200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0480200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17630605	17630636	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0480200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;protein_id=OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17630605	17631485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Name=OsNip_12t0480200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0480200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17630637	17631485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17632218	17632392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Name=OsNip_12t0480200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0480200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17632218	17632392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	17628169	17632394	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0480200-02;Parent=gene:OsNip_12g0480200;transcript_id=OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1
Chr12	TAMA	exon	17632218	17632394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Name=OsNip_12t0480200-02;exon_id=OsNip_12t0480200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	17632218	17632392	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0480200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;protein_id=OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	17629737	17631485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Name=OsNip_12t0480200-02;exon_id=OsNip_12t0480200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	17631454	17631485	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0480200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;protein_id=OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	17628169	17629181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Name=OsNip_12t0480200-02;exon_id=OsNip_12t0480200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	17632393	17632394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	17629737	17631451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	17628169	17629181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480200-02;Tag=IsoSeq:G16852.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13150.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUX9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17628428	17629204	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0480250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17628428	17628428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17628428	17629204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480250-00;Name=OsNip_12t0480250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0480250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17628429	17628713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0480250-00;Parent=transcript:OsNip_12t0480250-00;protein_id=OsNip_12t0480250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17628714	17629204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17646581	17651255	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0480300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17646581	17651255	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0480300-01;Parent=gene:OsNip_12g0480300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0480300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17646581	17648546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17646581	17651255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480300-01;Name=OsNip_12t0480300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0480300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17648547	17648843	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0480300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0480300-01;protein_id=OsNip_12t0480300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17648844	17651255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17668569	17670103	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0480800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17668569	17669195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480800-00;Name=OsNip_12t0480800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0480800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17668569	17669195	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0480800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0480800-00;protein_id=OsNip_12t0480800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17669312	17670103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0480800-00;Name=OsNip_12t0480800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0480800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17669312	17670103	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0480800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0480800-00;protein_id=OsNip_12t0480800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	17680782	17682682	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0481000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17680782	17682682	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0481000-00;Parent=gene:OsNip_12g0481000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0481000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17901894	17902809	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0484600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0484600-01;protein_id=OsNip_12t0484600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17902810	17902951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0484600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17900930	17901009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0484600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	17900930	17902995	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0484600-02;Name=OsNip_12t0484600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0484600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	17901010	17902809	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0484600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0484600-02;protein_id=OsNip_12t0484600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	17979197	17983355	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0485600;Name=OsNip_LHT4A;biotype=protein_coding;description=Amino;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	17979213	17983355	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0485600-01;Parent=gene:OsNip_12g0485600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	17979213	17979854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0485600-01;Name=OsNip_12t0485600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0485600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	17979197	17979855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0485600-02;Tag=IsoSeq:G16861.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13156.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0IN82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18004414	18005087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0485800-01;Name=OsNip_12t0485800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0485800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18004902	18005087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0485800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18173246	18173580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487250-01;Name=OsNip_12t0487250-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0487250-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18173246	18173580	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0487250-01;Parent=transcript:OsNip_12t0487250-01;protein_id=OsNip_12t0487250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	18195150	18201573	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0487500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18195150	18195151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18195560	18195581	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0487500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;protein_id=OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18195665	18195667	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0487500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;protein_id=OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18195665	18195712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Name=OsNip_12t0487500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0487500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18195668	18195712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18195797	18195864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Name=OsNip_12t0487500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0487500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18195797	18195864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18196679	18196723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Name=OsNip_12t0487500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0487500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18196679	18196723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18201155	18201565	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Name=OsNip_12t0487500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0487500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18201155	18201565	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	18195155	18201573	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0487500-02;Parent=gene:OsNip_12g0487500;transcript_id=OsNip_12t0487500-02;Tag=IsoSeq:G16863.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9930.1
Chr12	TAMA	exon	18195155	18195477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0487500-02;Name=OsNip_12t0487500-02;exon_id=OsNip_12t0487500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16863.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9930.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0GI62";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	18195156	18195329	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0487500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0487500-02;protein_id=OsNip_12t0487500-02;Tag=IsoSeq:G16863.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9930.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0GI62";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18348680	18349239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0489200-01;Name=OsNip_12t0489200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0489200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	18351588	18353679	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0489300-01;Parent=gene:OsNip_12g0489300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0489300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18351588	18352037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0489300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18351588	18352136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0489300-01;Name=OsNip_12t0489300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0489300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18352038	18352136	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0489300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0489300-01;protein_id=OsNip_12t0489300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18386698	18386754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490050-01;Name=OsNip_12t0490050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0490050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	18387283	18387689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490050-02;Tag=IsoSeq:G16869.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9933.2;prot_id "UniRef90_A0A1Z5R742";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18388482	18388579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18388482	18391056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490100-01;Name=OsNip_12t0490100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0490100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18389936	18391056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	18412383	18413445	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0490566;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	18412383	18413445	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0490566-00;Parent=gene:OsNip_12g0490566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0490566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18412383	18412574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0490566-00;Name=OsNip_12t0490566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0490566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18412817	18412954	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0490566-00;Parent=transcript:OsNip_12t0490566-00;protein_id=OsNip_12t0490566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18413203	18413445	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0490566-00;Parent=transcript:OsNip_12t0490566-00;protein_id=OsNip_12t0490566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	18509843	18528700	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0491800;Name=OsNip_KSL10;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	18509843	18528700	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0491800-01;Parent=gene:OsNip_12g0491800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18509843	18510089	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18509843	18510680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0491800-01;Name=OsNip_12t0491800-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0491800-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18619590	18619752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0493900-01;Name=OsNip_12t0493900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0493900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	18620371	18620629	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0493900-01;Name=OsNip_12t0493900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0493900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18620723	18620830	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0493900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0493900-01;protein_id=OsNip_12t0493900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18620723	18621147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0493900-01;Name=OsNip_12t0493900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0493900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18620831	18621147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0493900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	18721650	18724616	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0495525-00;Parent=gene:OsNip_12g0495525;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0495525-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18721650	18721969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0495525-00;Name=OsNip_12t0495525-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0495525-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18721650	18721969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0495525-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18722971	18723032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0495525-00;Name=OsNip_12t0495525-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0495525-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18722971	18723032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0495525-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18724307	18724352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0495525-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18912359	18912600	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0498300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0498300-01;protein_id=OsNip_12t0498300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	18935753	18935920	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0498700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0498700-01;protein_id=OsNip_12t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	18935753	18936001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0498700-01;Name=OsNip_12t0498700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0498700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18935921	18936001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19060425	19060612	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0500700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0500700-01;protein_id=OsNip_12t0500700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19060425	19060976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500700-01;Name=OsNip_12t0500700-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0500700-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19069857	19072449	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0500800-01;Parent=gene:OsNip_12g0500800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0500800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19069857	19070178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19069857	19070523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;Name=OsNip_12t0500800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0500800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19070179	19070523	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0500800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;protein_id=OsNip_12t0500800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19070610	19071020	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0500800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;protein_id=OsNip_12t0500800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19070610	19072449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;Name=OsNip_12t0500800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0500800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19071021	19072449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	19067860	19072457	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0500800-02;Parent=gene:OsNip_12g0500800;transcript_id=OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2
Chr12	TAMA	exon	19072144	19072457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Name=OsNip_12t0500800-02;exon_id=OsNip_12t0500800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	19072144	19072457	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0500800-02;Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;protein_id=OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	19069580	19069722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Name=OsNip_12t0500800-02;exon_id=OsNip_12t0500800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	19069713	19069722	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0500800-02;Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;protein_id=OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	19069355	19069427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Name=OsNip_12t0500800-02;exon_id=OsNip_12t0500800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	19068724	19069268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Name=OsNip_12t0500800-02;exon_id=OsNip_12t0500800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19069580	19069710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19069355	19069427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19068724	19069268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19068576	19068609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19067860	19068161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0500800-02;Tag=IsoSeq:G16878.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13168.2;prot_id "UniRef90_K4AMY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19079366	19079880	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0501133;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19079366	19079880	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0501133-00;Parent=gene:OsNip_12g0501133;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0501133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19079366	19079739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19079366	19079880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501133-00;Name=OsNip_12t0501133-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0501133-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19079740	19079862	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0501133-00;Parent=transcript:OsNip_12t0501133-00;protein_id=OsNip_12t0501133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19079863	19079880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19089135	19092961	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0501400;biotype=protein_coding;description=Rossmann-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19089135	19092961	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0501400-01;Parent=gene:OsNip_12g0501400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0501400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19089135	19089377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19089135	19089671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501400-01;Name=OsNip_12t0501400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0501400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19089378	19089671	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0501400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0501400-01;protein_id=OsNip_12t0501400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19092106	19092176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0501400-01;Name=OsNip_12t0501400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0501400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19092106	19092176	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0501400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0501400-01;protein_id=OsNip_12t0501400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19133010	19133740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0502200-01;Name=OsNip_12t0502200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0502200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19133502	19133740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0502200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19151501	19152088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0502600-01;Name=OsNip_12t0502600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0502600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19151845	19152045	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0502600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0502600-01;protein_id=OsNip_12t0502600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19152046	19152088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0502600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19158097	19161630	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0502700;Name=OsNip_DjC81;biotype=protein_coding;description=Heat;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19158097	19161630	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0502700-01;Parent=gene:OsNip_12g0502700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19158097	19158198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0502700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19205484	19205622	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0503300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0503300-00;protein_id=OsNip_12t0503300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19205991	19206236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0503300-00;Name=OsNip_12t0503300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0503300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19452186	19452256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507000-01;Name=OsNip_12t0507000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19462695	19462757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Name=OsNip_12t0507200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19462695	19462757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19462860	19462896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19462860	19463022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Name=OsNip_12t0507200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19464165	19464287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Name=OsNip_12t0507200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0507200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19464165	19464287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;protein_id=OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19464518	19464592	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;protein_id=OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19465144	19465245	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;protein_id=OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19465144	19465623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Name=OsNip_12t0507200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0507200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19465246	19465623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19474766	19478135	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0507300;Name=OsNip_WRKY96;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19474766	19478135	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0507300-00;Parent=gene:OsNip_12g0507300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19474766	19474807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;Name=OsNip_12t0507300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0507300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19474766	19474807	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;protein_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19474968	19475039	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;protein_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19475388	19476049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;Name=OsNip_12t0507300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0507300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19475388	19476049	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;protein_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19476124	19476264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;Name=OsNip_12t0507300-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0507300-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19476124	19476264	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0507300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;protein_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19477853	19478135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;Name=OsNip_12t0507300-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0507300-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19477853	19478135	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0507300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507300-00;protein_id=OsNip_12t0507300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19478322	19478591	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0507350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19478322	19478591	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507350-00;Name=OsNip_12t0507350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19481391	19482395	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0507400-00;Parent=gene:OsNip_12g0507400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19481391	19482377	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0507400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507400-00;protein_id=OsNip_12t0507400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19481391	19482395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507400-00;Name=OsNip_12t0507400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19482378	19482395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19488030	19492760	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0507500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19492147	19492760	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0507500-00;Parent=gene:OsNip_12g0507500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19492147	19492689	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0507500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507500-00;protein_id=OsNip_12t0507500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19492147	19492760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-00;Name=OsNip_12t0507500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19492690	19492760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	19488030	19492745	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0507500-01;Parent=gene:OsNip_12g0507500;transcript_id=OsNip_12t0507500-01;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1
Chr12	TAMA	exon	19492333	19492745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;Name=OsNip_12t0507500-01;exon_id=OsNip_12t0507500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	19492333	19492744	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0507500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;protein_id=OsNip_12t0507500-01;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	19488030	19488326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;Name=OsNip_12t0507500-01;exon_id=OsNip_12t0507500-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	19488301	19488326	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0507500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;protein_id=OsNip_12t0507500-01;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	19492745	19492745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	19488030	19488298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507500-01;Tag=IsoSeq:G16892.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7603.1,Nipponbare.panicle_G13180.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6R1X6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19493189	19494900	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0507600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19493189	19494888	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0507600-01;Parent=gene:OsNip_12g0507600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19493189	19493264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Name=OsNip_12t0507600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19493189	19493264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19493397	19493441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Name=OsNip_12t0507600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19493397	19493441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19494436	19494550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19494436	19494888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Name=OsNip_12t0507600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19494551	19494730	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;protein_id=OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19494731	19494888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19494653	19494900	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0507600-02;Parent=gene:OsNip_12g0507600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19494653	19494730	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0507600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0507600-02;protein_id=OsNip_12t0507600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19494653	19494900	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-02;Name=OsNip_12t0507600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0507600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19494731	19494900	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19495194	19495999	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0507700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19495194	19495999	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0507700-00;Parent=gene:OsNip_12g0507700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0507700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19495194	19495419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19495194	19495678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;Name=OsNip_12t0507700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0507700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19495420	19495678	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0507700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;protein_id=OsNip_12t0507700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19495866	19495906	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0507700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;protein_id=OsNip_12t0507700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19495866	19495999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;Name=OsNip_12t0507700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0507700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19495907	19495999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0507700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19513276	19518576	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0508100;biotype=protein_coding;description=Acrosin;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19513276	19518576	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0508100-00;Parent=gene:OsNip_12g0508100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19513276	19513310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19513276	19513667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Name=OsNip_12t0508100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0508100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19513311	19513667	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0508100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;protein_id=OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19515897	19516125	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Name=OsNip_12t0508100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0508100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19515897	19516125	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0508100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;protein_id=OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19517896	19518020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Name=OsNip_12t0508100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0508100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19517896	19518020	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0508100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;protein_id=OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19518098	19518196	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0508100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;protein_id=OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19518098	19518576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Name=OsNip_12t0508100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0508100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19518197	19518576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	19518760	19521002	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0508200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19518760	19521002	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0508200-01;Parent=gene:OsNip_12g0508200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19518760	19518898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19518760	19519306	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;Name=OsNip_12t0508200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0508200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19518899	19519306	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0508200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;protein_id=OsNip_12t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19519453	19519512	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0508200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;protein_id=OsNip_12t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19519453	19519554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;Name=OsNip_12t0508200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0508200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19519513	19519554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19621443	19621490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-01;Name=OsNip_12t0509400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0509400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19615053	19615100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19615524	19616463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19616878	19616930	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19617760	19617884	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19618250	19618477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19628116	19629113	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0509600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0509600-00;protein_id=OsNip_12t0509600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	19630106	19630192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0509600-00;Name=OsNip_12t0509600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0509600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19630106	19630192	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0509600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0509600-00;protein_id=OsNip_12t0509600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19681661	19682064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0510900-01;Name=OsNip_12t0510900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0510900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19701010	19701226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0511300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	19701473	19701618	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0511300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0511300-01;protein_id=OsNip_12t0511300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19808586	19808718	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0512400-02;Name=OsNip_12t0512400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0512400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19809502	19809656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0512400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	19832734	19837063	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0512700-01;Parent=gene:OsNip_12g0512700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0512700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	19834697	19835010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0512700-01;Name=OsNip_12t0512700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0512700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20045832	20045936	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0516000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0516000-00;protein_id=OsNip_12t0516000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20046108	20046254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0516000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20058131	20059545	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0516200-00;Parent=gene:OsNip_12g0516200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0516200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	20102794	20103252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517100-01;Name=OsNip_12t0517100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0517100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20105748	20107176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20105748	20107750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-01;Name=OsNip_12t0517200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0517200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20107177	20107515	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0517200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0517200-01;protein_id=OsNip_12t0517200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20107516	20107750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	20105725	20107750	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0517200-02;Parent=gene:OsNip_12g0517200;transcript_id=OsNip_12t0517200-02;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1
Chr12	TAMA	exon	20105725	20105851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-02;Name=OsNip_12t0517200-02;exon_id=OsNip_12t0517200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1;prot_id "UniRef90_A0A6B7FJK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	20105725	20105851	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0517200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0517200-02;protein_id=OsNip_12t0517200-02;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1;prot_id "UniRef90_A0A6B7FJK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	20107135	20107750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-02;Name=OsNip_12t0517200-02;exon_id=OsNip_12t0517200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1;prot_id "UniRef90_A0A6B7FJK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	20107135	20107220	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0517200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0517200-02;protein_id=OsNip_12t0517200-02;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1;prot_id "UniRef90_A0A6B7FJK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	20107224	20107750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517200-02;Tag=IsoSeq:G16922.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G9960.1;prot_id "UniRef90_A0A6B7FJK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	20128513	20139593	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0517800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20128513	20139593	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0517800-01;Parent=gene:OsNip_12g0517800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20128513	20128634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20128513	20129046	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;Name=OsNip_12t0517800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0517800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20128635	20129046	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0517800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;protein_id=OsNip_12t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20138514	20138566	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0517800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;protein_id=OsNip_12t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20138514	20139593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;Name=OsNip_12t0517800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0517800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20138567	20139593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0517800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	20134692	20137733	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0518000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20134692	20137716	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0518000-02;Parent=gene:OsNip_12g0518000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0518000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20134692	20135729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20134692	20136355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;Name=OsNip_12t0518000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20135730	20135828	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0518000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;protein_id=OsNip_12t0518000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20135829	20136355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20137230	20137716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;Name=OsNip_12t0518000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20137230	20137716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20135712	20137733	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0518000-01;Parent=gene:OsNip_12g0518000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20135712	20135818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20135712	20135822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Name=OsNip_12t0518000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0518000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20135819	20135822	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0518000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;protein_id=OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20135901	20135934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Name=OsNip_12t0518000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0518000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20135901	20135934	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0518000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;protein_id=OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20136011	20136136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Name=OsNip_12t0518000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0518000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20136011	20136136	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0518000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;protein_id=OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20136282	20136348	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0518000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;protein_id=OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20136282	20136355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Name=OsNip_12t0518000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20136349	20136355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20137230	20137733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Name=OsNip_12t0518000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20137230	20137733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	20138135	20141194	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0518200;Name=FCO9;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20138135	20141194	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0518200-01;Parent=gene:OsNip_12g0518200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20138135	20138556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20138135	20138556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20138663	20138814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20138663	20138814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20138926	20139084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20138926	20139084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20139209	20139401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20139209	20139452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20139402	20139452	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0518200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;protein_id=OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20139939	20140055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20139939	20140055	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0518200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;protein_id=OsNip_12t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20140189	20140254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0518200-01;Name=OsNip_12t0518200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0518200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20814317	20814604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0527900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0527900-01;protein_id=OsNip_12t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	20814696	20815952	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0527900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0527900-01;protein_id=OsNip_12t0527900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20814696	20816272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0527900-01;Name=OsNip_12t0527900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0527900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20886258	20886410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0529900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	20890100	20899533	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0530100-01;Parent=gene:OsNip_12g0530100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20890100	20890291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	20890100	20890707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0530100-01;Name=OsNip_12t0530100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0530100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21209481	21210211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533400-00;Name=OsNip_12t0533400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0533400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21210477	21214801	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0533500-01;Parent=gene:OsNip_12g0533500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0533500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21210477	21210703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21210477	21211818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533500-01;Name=OsNip_12t0533500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0533500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21220798	21220803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21221570	21221763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Name=OsNip_12t0533700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0533700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21221952	21222158	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Name=OsNip_12t0533700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0533700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21225231	21225344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Name=OsNip_12t0533700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0533700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21225231	21225344	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0533700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;protein_id=OsNip_12t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21225423	21225473	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0533700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;protein_id=OsNip_12t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21225423	21225582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Name=OsNip_12t0533700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0533700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21225474	21225582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21225806	21229401	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0533800;biotype=protein_coding;description=Mitochondrial;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21225806	21229401	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0533800-01;Parent=gene:OsNip_12g0533800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0533800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21330362	21330529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0536200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21331731	21331820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0536200-01;Name=OsNip_12t0536200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0536200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21331731	21331820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0536200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21429635	21429855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21429635	21430143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;Name=OsNip_12t0538100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0538100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21430374	21430480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;Name=OsNip_12t0538100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0538100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21430374	21430480	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0538100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;protein_id=OsNip_12t0538100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21431391	21431589	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0538100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;protein_id=OsNip_12t0538100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21431391	21431701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;Name=OsNip_12t0538100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0538100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21431590	21431701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21441319	21447715	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0538300-01;Parent=gene:OsNip_12g0538300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0538300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21441319	21441352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21441319	21441520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;Name=OsNip_12t0538300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0538300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21441353	21441520	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0538300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;protein_id=OsNip_12t0538300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21441613	21441765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;Name=OsNip_12t0538300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0538300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21441613	21441765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0538300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;protein_id=OsNip_12t0538300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21445949	21446016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538300-01;Name=OsNip_12t0538300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0538300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21488044	21488239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21488699	21488820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538800-01;Name=OsNip_12t0538800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0538800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21488774	21488820	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0538800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538800-01;protein_id=OsNip_12t0538800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21489438	21489516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0538800-01;Name=OsNip_12t0538800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0538800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21489438	21489516	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0538800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0538800-01;protein_id=OsNip_12t0538800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21564833	21567615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0539700-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21568370	21568475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;Name=OsNip_12t0539751-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0539751-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21568370	21568475	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0539751-00;Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;protein_id=OsNip_12t0539751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21568591	21568687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;Name=OsNip_12t0539751-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0539751-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21568591	21568687	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0539751-00;Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;protein_id=OsNip_12t0539751-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21569358	21569469	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0539751-00;Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;protein_id=OsNip_12t0539751-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21570372	21570449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0539751-00;Name=OsNip_12t0539751-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0539751-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21596724	21596993	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0540200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0540200-01;protein_id=OsNip_12t0540200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	21593916	21596991	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0540200-02;Parent=gene:OsNip_12g0540200;transcript_id=OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1
Chr12	TAMA	exon	21593916	21594489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Name=OsNip_12t0540200-02;exon_id=OsNip_12t0540200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	21593917	21594045	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0540200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;protein_id=OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	exon	21595073	21595153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Name=OsNip_12t0540200-02;exon_id=OsNip_12t0540200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	exon	21596667	21596991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Name=OsNip_12t0540200-02;exon_id=OsNip_12t0540200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	21593916	21593916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21594049	21594489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21595073	21595153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21596667	21596991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540200-02;Tag=IsoSeq:G16963.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13224.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21614879	21617352	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0540700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21614879	21617352	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0540700-01;Parent=gene:OsNip_12g0540700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0540700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21614879	21615017	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540700-01;Name=OsNip_12t0540700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0540700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21614879	21615017	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0540700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0540700-01;protein_id=OsNip_12t0540700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21616322	21616449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0540700-01;Name=OsNip_12t0540700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0540700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21648123	21648213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21648439	21648515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541300-01;Name=OsNip_12t0541300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21648439	21648515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21661582	21663938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-01;Name=OsNip_12t0541500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21663706	21663938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	21661582	21663694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;Name=OsNip_12t0541500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21661642	21663694	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0541500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;protein_id=OsNip_12t0541500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21664570	21665281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;Name=OsNip_12t0541500-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0541500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21665420	21666026	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0541500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;protein_id=OsNip_12t0541500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21665420	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;Name=OsNip_12t0541500-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0541500-04-E2;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21666027	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21662157	21663956	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0541500-03;Parent=gene:OsNip_12g0541500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0541500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21662157	21662157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21662157	21663956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-03;Name=OsNip_12t0541500-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541500-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21662158	21663705	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0541500-03;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-03;protein_id=OsNip_12t0541500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21663706	21663956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21664760	21666265	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0541500-04;Parent=gene:OsNip_12g0541500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0541500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21664760	21664760	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21664760	21665281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;Name=OsNip_12t0541500-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541500-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21664761	21665281	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0541500-04;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;protein_id=OsNip_12t0541500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21665420	21666026	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0541500-04;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;protein_id=OsNip_12t0541500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21665420	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;Name=OsNip_12t0541500-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0541500-04-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21666027	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21665862	21666265	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0541500-05;Parent=gene:OsNip_12g0541500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0541500-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21665862	21666026	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0541500-05;Parent=transcript:OsNip_12t0541500-05;protein_id=OsNip_12t0541500-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21665862	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-05;Name=OsNip_12t0541500-05-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0541500-05-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21666027	21666265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541500-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21666234	21669444	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0541600;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21666234	21666802	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0541600-01;Parent=gene:OsNip_12g0541600;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0541600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21666234	21666802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-01;Name=OsNip_12t0541600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	21666292	21669444	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0541600-02;Parent=gene:OsNip_12g0541600;transcript_id=OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1
Chr12	TAMA	exon	21669188	21669444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Name=OsNip_12t0541600-02;exon_id=OsNip_12t0541600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	21669188	21669444	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0541600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;protein_id=OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	21667727	21667902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Name=OsNip_12t0541600-02;exon_id=OsNip_12t0541600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	21667878	21667902	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0541600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;protein_id=OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	21667517	21667641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Name=OsNip_12t0541600-02;exon_id=OsNip_12t0541600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	21666292	21667183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Name=OsNip_12t0541600-02;exon_id=OsNip_12t0541600-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21667727	21667875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21667517	21667641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21666292	21667183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541600-02;Tag=IsoSeq:G16971.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13232.1;prot_id "UniRef90_M0TQP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21691749	21692645	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0541700;Name=OsNip_RALF-37;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21691749	21692645	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0541700-01;Parent=gene:OsNip_12g0541700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21691749	21691913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21691749	21692645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541700-01;Name=OsNip_12t0541700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0541700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21691914	21692297	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0541700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0541700-01;protein_id=OsNip_12t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21692298	21692645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21700002	21700997	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0542000;Name=OsNip_RALF-38;biotype=protein_coding;description=Rapid;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21700002	21700997	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0542000-01;Parent=gene:OsNip_12g0542000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21700002	21700062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21700002	21700997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542000-01;Name=OsNip_12t0542000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0542000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21700063	21700461	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0542000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0542000-01;protein_id=OsNip_12t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21700462	21700997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21711270	21713942	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0542200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21711496	21713941	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0542200-00;Parent=gene:OsNip_12g0542200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0542200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21711496	21713694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542200-00;Name=OsNip_12t0542200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0542200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21711496	21713694	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0542200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0542200-00;protein_id=OsNip_12t0542200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21713750	21713941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542200-00;Name=OsNip_12t0542200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0542200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21713750	21713941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0542200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0542200-00;protein_id=OsNip_12t0542200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	21711270	21713942	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0542200-01;Parent=gene:OsNip_12g0542200;transcript_id=OsNip_12t0542200-01;Tag=IsoSeq:G16974.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13235.3
Chr12	TAMA	exon	21711270	21713942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542200-01;Name=OsNip_12t0542200-01;exon_id=OsNip_12t0542200-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16974.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13235.3;prot_id "UniRef90_A0A287QPF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	21713942	21713942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542200-01;Tag=IsoSeq:G16974.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13235.3;prot_id "UniRef90_A0A287QPF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	21711270	21713027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542200-01;Tag=IsoSeq:G16974.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13235.3;prot_id "UniRef90_A0A287QPF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21766760	21767380	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0542300-00;Parent=gene:OsNip_12g0542300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0542300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21766760	21767209	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0542300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0542300-00;protein_id=OsNip_12t0542300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21766760	21767380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542300-00;Name=OsNip_12t0542300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0542300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21767210	21767380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21783684	21786014	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0542601;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21783684	21786014	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0542601-01;Parent=gene:OsNip_12g0542601;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0542601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21783684	21785187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21783684	21786014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542601-01;Name=OsNip_12t0542601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0542601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21785188	21785400	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0542601-01;Parent=transcript:OsNip_12t0542601-01;protein_id=OsNip_12t0542601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21785401	21786014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0542601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21834536	21835553	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0543101;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21834536	21835553	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0543101-01;Parent=gene:OsNip_12g0543101;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0543101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21834536	21835553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543101-01;Name=OsNip_12t0543101-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543101-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21869758	21871498	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0543600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21869758	21871498	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0543600-00;Parent=gene:OsNip_12g0543600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0543600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21869758	21869770	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21869758	21870344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;Name=OsNip_12t0543600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21869771	21870344	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0543600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;protein_id=OsNip_12t0543600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21870725	21871413	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0543600-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;protein_id=OsNip_12t0543600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21870725	21871498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;Name=OsNip_12t0543600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0543600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21871414	21871498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21869759	21871355	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0543650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21869759	21871355	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0543650-00;Parent=gene:OsNip_12g0543650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0543650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21869759	21870048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21869759	21870340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;Name=OsNip_12t0543650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0543650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21870049	21870340	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0543650-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;protein_id=OsNip_12t0543650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21870722	21871248	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0543650-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;protein_id=OsNip_12t0543650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21870722	21871355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;Name=OsNip_12t0543650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21871249	21871355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21873069	21877362	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0543701;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21873069	21877362	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0543701-01;Parent=gene:OsNip_12g0543701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0543701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21873069	21875212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21873069	21877362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543701-01;Name=OsNip_12t0543701-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543701-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21875213	21875638	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0543701-01;Parent=transcript:OsNip_12t0543701-01;protein_id=OsNip_12t0543701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21875639	21877362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21879850	21880385	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0543751;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21879850	21880385	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0543751-00;Parent=gene:OsNip_12g0543751;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0543751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21879850	21879976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21879850	21880028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;Name=OsNip_12t0543751-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543751-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21879977	21880028	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0543751-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;protein_id=OsNip_12t0543751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21880161	21880378	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0543751-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;protein_id=OsNip_12t0543751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21880161	21880385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;Name=OsNip_12t0543751-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0543751-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21880379	21880385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21881648	21882778	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0543800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21881648	21882778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0543800-00;Parent=gene:OsNip_12g0543800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21881648	21881809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21881648	21882367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;Name=OsNip_12t0543800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0543800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21881810	21882367	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0543800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;protein_id=OsNip_12t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	21882442	21882636	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0543800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;protein_id=OsNip_12t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21882442	21882778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;Name=OsNip_12t0543800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0543800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21882637	21882778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0543800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21934994	21935136	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0544360;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21934994	21935136	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0544360-00;Parent=gene:OsNip_12g0544360;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0544360-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21934994	21935136	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0544360-00;Name=OsNip_12t0544360-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0544360-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	21964712	21970027	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0544600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	21964712	21970027	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0544600-00;Parent=gene:OsNip_12g0544600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0544600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21964712	21964993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0544600-00;Name=OsNip_12t0544600-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0544600-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21964712	21964993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0544600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	21965108	21965151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0544600-00;Name=OsNip_12t0544600-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0544600-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22048071	22048127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22053809	22054206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22048071	22048127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22050048	22050415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22047720	22048070	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0545900-03;Parent=transcript:OsNip_12t0545900-03;protein_id=OsNip_12t0545900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22048071	22048127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22050602	22051227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-03;Name=OsNip_12t0545900-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0545900-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22050602	22051227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0545900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22089434	22091864	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0546800;Name=EXPA26;biotype=protein_coding;description=Alpha;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22089434	22091864	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0546800-01;Parent=gene:OsNip_12g0546800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0546800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22089434	22089448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0546800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22089434	22090011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0546800-01;Name=OsNip_12t0546800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0546800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22091272	22091581	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0546800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0546800-01;protein_id=OsNip_12t0546800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22101404	22101508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22101404	22101499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22111925	22115516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547401-01;Name=OsNip_12t0547401-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0547401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22126680	22133291	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0547500;Name=OsNip_KCH1;biotype=protein_coding;description=Kinesin-14;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22126680	22133291	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0547500-01;Parent=gene:OsNip_12g0547500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22126680	22126874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22126680	22126971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22126875	22126971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22127667	22127833	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22127667	22127833	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22127930	22128073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22128507	22128764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22128507	22128764	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22128846	22128917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22129010	22129075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22129687	22129768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22130058	22130234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22130058	22130234	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22130337	22130443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22130532	22130707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22130830	22130991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22131074	22131327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22131074	22131327	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22131409	22131572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22131409	22131572	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22131674	22131832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22131674	22131832	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22132300	22132712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22132300	22132712	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22132800	22132935	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0547500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;protein_id=OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22132800	22133291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Name=OsNip_12t0547500-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0547500-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22132936	22133291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22133336	22136891	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0547600;Name=CaMBP;biotype=protein_coding;description=Calmodulin;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22133336	22136891	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0547600-01;Parent=gene:OsNip_12g0547600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0547600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22133336	22133920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0547600-01;Name=OsNip_12t0547600-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0547600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22202703	22203153	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0548700-01;Name=OsNip_12t0548700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0548700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22239581	22240087	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0549700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22239581	22240487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0549700-01;Name=OsNip_12t0549700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0549700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22240487	22240487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0549700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22248392	22254634	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0549800;biotype=protein_coding;description=Armadillo-type;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22248392	22254634	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0549800-00;Parent=gene:OsNip_12g0549800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0549800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22252305	22253871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0549800-00;Name=OsNip_12t0549800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0549800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22252305	22253871	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0549800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0549800-00;protein_id=OsNip_12t0549800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22254002	22254634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0549800-00;Name=OsNip_12t0549800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0549800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22254002	22254634	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0549800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0549800-00;protein_id=OsNip_12t0549800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22283160	22287570	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0550600;Name=qCTR12;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22283176	22284740	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0550600-01;Parent=gene:OsNip_12g0550600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22283176	22283440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Name=OsNip_12t0550600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0550600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22283176	22283440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22283821	22283934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Name=OsNip_12t0550600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0550600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22283821	22283934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22284018	22284045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22284018	22284740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Name=OsNip_12t0550600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0550600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22284046	22284303	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0550600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;protein_id=OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22284304	22284740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0550600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	22283160	22287570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0550600-02;Parent=gene:OsNip_12g0550600;transcript_id=OsNip_12t0550600-02;Tag=IsoSeq:G16985.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7646.1
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22418505	22419086	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0552200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552200-01;protein_id=OsNip_12t0552200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22418505	22419263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552200-01;Name=OsNip_12t0552200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0552200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22419950	22427809	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0552300-01;Parent=gene:OsNip_12g0552300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0552300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22419950	22420538	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;Name=OsNip_12t0552300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22423403	22423577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;Name=OsNip_12t0552300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22423826	22424062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;Name=OsNip_12t0552300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22424149	22424425	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22424426	22427185	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0552300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;protein_id=OsNip_12t0552300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22427186	22427809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22427863	22429178	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0552400;biotype=protein_coding;description=Rossmann-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22427863	22429178	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0552400-01;Parent=gene:OsNip_12g0552400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22427863	22428279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;Name=OsNip_12t0552400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0552400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22428186	22428279	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0552400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;protein_id=OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22428512	22428633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;Name=OsNip_12t0552400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0552400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22428512	22428633	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0552400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;protein_id=OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22428742	22428830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;Name=OsNip_12t0552400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0552400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22428742	22428830	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0552400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;protein_id=OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22428921	22429098	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0552400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;protein_id=OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22428921	22429178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;Name=OsNip_12t0552400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22429099	22429178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22429432	22431793	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0552500;biotype=protein_coding;description=Rossmann-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22429432	22431789	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0552500-01;Parent=gene:OsNip_12g0552500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22429432	22429726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22429432	22429814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Name=OsNip_12t0552500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0552500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22429727	22429814	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0552500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;protein_id=OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22430611	22430732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Name=OsNip_12t0552500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0552500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22430611	22430732	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0552500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;protein_id=OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22431359	22431447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Name=OsNip_12t0552500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0552500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22431359	22431447	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0552500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;protein_id=OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22431538	22431748	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0552500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;protein_id=OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22431538	22431789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Name=OsNip_12t0552500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22431749	22431789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	22430517	22431793	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0552500-02;Parent=gene:OsNip_12g0552500;transcript_id=OsNip_12t0552500-02;Tag=IsoSeq:G16989.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13245.8
Chr12	TAMA	exon	22430517	22431793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-02;Name=OsNip_12t0552500-02;exon_id=OsNip_12t0552500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16989.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13245.8;prot_id "UniRef90_A0A7I8IBP9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	22430726	22431793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552500-02;Tag=IsoSeq:G16989.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13245.8;prot_id "UniRef90_A0A7I8IBP9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22461095	22461947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552700-01;Name=OsNip_12t0552700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0552700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22460503	22460632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552700-02;Tag=IsoSeq:G16990.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13246.2;prot_id "UniRef90_M0T8P3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22460717	22461011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552700-02;Tag=IsoSeq:G16990.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13246.2;prot_id "UniRef90_M0T8P3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22461095	22461720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552700-02;Tag=IsoSeq:G16990.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13246.2;prot_id "UniRef90_M0T8P3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22466362	22469274	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0552800-01;Parent=gene:OsNip_12g0552800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0552800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22466362	22466494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22466362	22466754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552800-01;Name=OsNip_12t0552800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0552800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22466865	22466910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0552800-01;Name=OsNip_12t0552800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0552800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	22487460	22492409	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0553200;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22488914	22488944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22488945	22490601	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0553200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;protein_id=OsNip_12t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22491018	22491820	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0553200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;protein_id=OsNip_12t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22491018	22491844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;Name=OsNip_12t0553200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0553200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22491821	22491844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22492172	22492254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;Name=OsNip_12t0553200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0553200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22492172	22492254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	22487460	22492409	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0553200-02;Parent=gene:OsNip_12g0553200;transcript_id=OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1
Chr12	TAMA	exon	22492172	22492409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Name=OsNip_12t0553200-02;exon_id=OsNip_12t0553200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	22492172	22492408	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0553200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;protein_id=OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	22491018	22491844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Name=OsNip_12t0553200-02;exon_id=OsNip_12t0553200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	22491833	22491844	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0553200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;protein_id=OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	22488650	22490601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Name=OsNip_12t0553200-02;exon_id=OsNip_12t0553200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	22487460	22487803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Name=OsNip_12t0553200-02;exon_id=OsNip_12t0553200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	22492409	22492409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22491018	22491830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22488650	22490601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22487460	22487803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553200-02;Tag=IsoSeq:G16992.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G9994.2,Nipponbare.panicle_G13248.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0I3T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22497610	22502497	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0553600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22497610	22502497	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0553600-01;Parent=gene:OsNip_12g0553600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0553600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22497610	22497947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553600-01;Name=OsNip_12t0553600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0553600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22497610	22497947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22498728	22500682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0553600-01;Name=OsNip_12t0553600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0553600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22512711	22512906	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0554100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0554100-01;protein_id=OsNip_12t0554100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22513150	22513332	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0554100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0554100-01;protein_id=OsNip_12t0554100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22513435	22513645	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0554100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0554100-01;protein_id=OsNip_12t0554100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22518089	22518639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0554300-01;Name=OsNip_12t0554300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0554300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22592950	22593505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555200-01;Name=OsNip_12t0555200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0555200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22597828	22598210	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0555400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555400-01;protein_id=OsNip_12t0555400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22598364	22598577	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0555400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555400-01;protein_id=OsNip_12t0555400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22598364	22598994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555400-01;Name=OsNip_12t0555400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0555400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22598578	22598994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22600046	22601182	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0555500;Name=OsNip_PR10a;biotype=protein_coding;description=Pathogen;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22600049	22601182	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0555500-01;Parent=gene:OsNip_12g0555500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22600049	22600147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22600049	22600322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;Name=OsNip_12t0555500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0555500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22600148	22600322	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0555500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;protein_id=OsNip_12t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22600644	22600945	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0555500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;protein_id=OsNip_12t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22600644	22601182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;Name=OsNip_12t0555500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0555500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22600946	22601182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	22600046	22601182	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0555500-02;Parent=gene:OsNip_12g0555500;transcript_id=OsNip_12t0555500-02;Tag=IsoSeq:G17000.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13255.3
Chr12	TAMA	exon	22600046	22601182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-02;Name=OsNip_12t0555500-02;exon_id=OsNip_12t0555500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17000.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13255.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MNG4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	22600716	22600898	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0555500-02;protein_id=OsNip_12t0555500-02;Tag=IsoSeq:G17000.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13255.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MNG4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	22600046	22600715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-02;Tag=IsoSeq:G17000.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13255.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MNG4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22600902	22601182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555500-02;Tag=IsoSeq:G17000.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13255.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0MNG4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22602934	22607307	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0555600;Name=ND1;biotype=protein_coding;description=Cellulose;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22602934	22607307	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0555600-01;Parent=gene:OsNip_12g0555600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22602934	22603193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22602934	22605861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;Name=OsNip_12t0555600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0555600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22603194	22605861	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0555600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;protein_id=OsNip_12t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22606114	22607093	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0555600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;protein_id=OsNip_12t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22606114	22607307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;Name=OsNip_12t0555600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0555600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22607094	22607307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0555600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22616804	22622177	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0556100;Name=OsNip_Di19-7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22616804	22622177	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0556100-01;Parent=gene:OsNip_12g0556100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22616804	22616999	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22616804	22617060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;Name=OsNip_12t0556100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0556100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22617000	22617060	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0556100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;protein_id=OsNip_12t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22617186	22617334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;Name=OsNip_12t0556100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0556100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22617186	22617334	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0556100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;protein_id=OsNip_12t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22619893	22619970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;Name=OsNip_12t0556100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0556100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22619893	22619970	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0556100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;protein_id=OsNip_12t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22621047	22621312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556100-01;Name=OsNip_12t0556100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0556100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22655907	22656258	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556500-01;Name=OsNip_12t0556500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0556500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22656374	22656698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556600-01;Name=OsNip_12t0556600-01-E24;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0556600-01-E24;rank=24;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22657052	22657145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556600-01;Name=OsNip_12t0556600-01-E22;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0556600-01-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22661309	22661380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556701-00;Name=OsNip_12t0556701-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0556701-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22662309	22662484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556701-00;Name=OsNip_12t0556701-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0556701-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22670886	22672176	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0556900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22670886	22672176	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0556900-00;Parent=gene:OsNip_12g0556900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0556900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22670886	22671923	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0556900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0556900-00;protein_id=OsNip_12t0556900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22670886	22672176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556900-00;Name=OsNip_12t0556900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0556900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22671924	22672176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0556900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22710855	22713327	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0557400-02;Parent=gene:OsNip_12g0557400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22710855	22711058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22710855	22711274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;Name=OsNip_12t0557400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0557400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22711059	22711274	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0557400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;protein_id=OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22712635	22712854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;Name=OsNip_12t0557400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0557400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22712635	22712854	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0557400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;protein_id=OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22713006	22713214	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0557400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;protein_id=OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22713006	22713327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;Name=OsNip_12t0557400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22713215	22713327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22710855	22713349	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0557400-01;Parent=gene:OsNip_12g0557400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22710855	22711058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22710855	22711274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;Name=OsNip_12t0557400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0557400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22712635	22712854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;Name=OsNip_12t0557400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0557400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22712635	22712854	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0557400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;protein_id=OsNip_12t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22713006	22713214	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0557400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;protein_id=OsNip_12t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22713006	22713349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;Name=OsNip_12t0557400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22713215	22713349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22711046	22713258	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0557501;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22711046	22713258	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0557501-00;Parent=gene:OsNip_12g0557501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0557501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22711046	22711274	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Name=OsNip_12t0557501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22711046	22711274	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22712635	22712838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Name=OsNip_12t0557501-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557501-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22712635	22712838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22712994	22713011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22712994	22713258	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;Name=OsNip_12t0557501-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557501-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22713012	22713258	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0557501-00;Parent=transcript:OsNip_12t0557501-00;protein_id=OsNip_12t0557501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22723146	22726841	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0557800;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22723146	22726841	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0557800-01;Parent=gene:OsNip_12g0557800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0557800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22723146	22724446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;Name=OsNip_12t0557800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22723146	22724446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22724587	22724675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22724587	22726150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;Name=OsNip_12t0557800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0557800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22724676	22726150	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0557800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;protein_id=OsNip_12t0557800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22726193	22726766	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0557800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;protein_id=OsNip_12t0557800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22726193	22726841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0557800-01;Name=OsNip_12t0557800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0557800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22848617	22848675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22848997	22850629	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22854591	22860198	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0559200;Name=OsNip_LOX11;biotype=protein_coding;description=Lipoxygenase;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22854591	22858110	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0559200-02;Parent=gene:OsNip_12g0559200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0559200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22854591	22854993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22854591	22855765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;Name=OsNip_12t0559200-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0559200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22854994	22855765	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0559200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;protein_id=OsNip_12t0559200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22855861	22856127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;Name=OsNip_12t0559200-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0559200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22855861	22856127	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0559200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;protein_id=OsNip_12t0559200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22856359	22856660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;Name=OsNip_12t0559200-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0559200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22856359	22856660	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0559200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0559200-02;protein_id=OsNip_12t0559200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	22947753	22948066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560400-02;Tag=IsoSeq:G17009.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7658.1;prot_id "UniRef90_A0A2I4DWP4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22955335	22955539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22956095	22956286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22956392	22956569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22956660	22956802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22957749	22957926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22958571	22958800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	22959089	22959156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22959089	22959156	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0560700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;protein_id=OsNip_12t0560700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	22959266	22959311	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0560700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;protein_id=OsNip_12t0560700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22959266	22959404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Name=OsNip_12t0560700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0560700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22959312	22959404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	22967366	22968659	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0560900;Name=OsNip_OBF1;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	22967366	22968659	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0560900-01;Parent=gene:OsNip_12g0560900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0560900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	22967366	22968022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0560900-01;Name=OsNip_12t0560900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0560900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23052585	23052716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23052585	23053083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562433-00;Name=OsNip_12t0562433-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562433-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23054662	23055920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562455-00;Name=OsNip_12t0562455-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562455-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23061319	23067712	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0562477;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23061319	23067712	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0562477-00;Parent=gene:OsNip_12g0562477;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0562477-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23061319	23061537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Name=OsNip_12t0562477-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562477-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23061672	23061734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Name=OsNip_12t0562477-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562477-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23062485	23062526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0562477-00;Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;protein_id=OsNip_12t0562477-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23062485	23062937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Name=OsNip_12t0562477-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562477-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23062527	23062937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23063049	23063670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23064686	23064844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Name=OsNip_12t0562477-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562477-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23065725	23065846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Name=OsNip_12t0562477-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562477-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23067340	23067455	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562477-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23077033	23077272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23080046	23080108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23080109	23080285	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-02;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-02;protein_id=OsNip_12t0562900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23080286	23082109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23080046	23084534	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0562900-01;Parent=gene:OsNip_12g0562900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23080046	23080108	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23080046	23080275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23080109	23080275	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23082616	23082673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23082616	23082673	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23082802	23082873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23082802	23082873	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23083825	23083944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23083825	23083944	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23084025	23084126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23084025	23084126	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23084212	23084283	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0562900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;protein_id=OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23084212	23084534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Name=OsNip_12t0562900-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0562900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23084284	23084534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0562900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23091540	23094141	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0563000;Name=GPAT;biotype=protein_coding;description=Phospholipid/glycerol;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23091540	23094141	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0563000-00;Parent=gene:OsNip_12g0563000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0563000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23091540	23092394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0563000-00;Name=OsNip_12t0563000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0563000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23091540	23092394	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0563000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0563000-00;protein_id=OsNip_12t0563000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23093224	23094141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0563000-00;Name=OsNip_12t0563000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0563000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23093224	23094141	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0563000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0563000-00;protein_id=OsNip_12t0563000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23159897	23160051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564600-01;Name=OsNip_12t0564600-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0564600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23158543	23159222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564600-02;Name=OsNip_12t0564600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0564600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23161006	23161164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23161677	23161967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564701-00;Name=OsNip_12t0564701-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0564701-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23161677	23161967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23164447	23165549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564750-00;Name=OsNip_12t0564750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0564750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23165524	23165549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23167167	23171951	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0564800;biotype=protein_coding;description=NB-ARC;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23167167	23171951	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0564800-01;Parent=gene:OsNip_12g0564800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23167167	23167271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23167167	23169288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;Name=OsNip_12t0564800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0564800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23167272	23169288	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0564800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;protein_id=OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23169493	23170346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;Name=OsNip_12t0564800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0564800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23169493	23170346	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0564800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;protein_id=OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23171598	23171648	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0564800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;protein_id=OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23171598	23171951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;Name=OsNip_12t0564800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0564800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23171649	23171951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23167291	23170290	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0564866;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23167291	23170290	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0564866-00;Parent=gene:OsNip_12g0564866;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0564866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23167291	23167983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23167291	23169304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564866-00;Name=OsNip_12t0564866-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0564866-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23167984	23168313	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0564866-00;Parent=transcript:OsNip_12t0564866-00;protein_id=OsNip_12t0564866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23168314	23169304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564866-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23169507	23170290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0564866-00;Name=OsNip_12t0564866-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0564866-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	23172526	23172792	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0564932;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23182648	23182959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23187649	23187807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23184681	23185517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565133-00;Name=OsNip_12t0565133-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0565133-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23184681	23185517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565133-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23187791	23188294	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0565133-00;Parent=transcript:OsNip_12t0565133-00;protein_id=OsNip_12t0565133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23188295	23188327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565133-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23192672	23195989	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0565166-00;Parent=gene:OsNip_12g0565166;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0565166-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23192672	23193501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565166-00;Name=OsNip_12t0565166-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0565166-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23193975	23195989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565166-00;Name=OsNip_12t0565166-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0565166-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23195145	23195981	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0565200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23195145	23195981	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0565200-00;Parent=gene:OsNip_12g0565200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0565200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23195145	23195981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565200-00;Name=OsNip_12t0565200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0565200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23195145	23195981	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0565200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0565200-00;protein_id=OsNip_12t0565200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23196491	23200785	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0565300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23196491	23200785	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0565300-01;Parent=gene:OsNip_12g0565300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23196491	23196797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23196491	23197114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Name=OsNip_12t0565300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0565300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23196798	23197114	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0565300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;protein_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23197279	23197426	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Name=OsNip_12t0565300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0565300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23197279	23197426	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0565300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;protein_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23197709	23198919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Name=OsNip_12t0565300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0565300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23197709	23198919	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0565300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;protein_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23198996	23199251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Name=OsNip_12t0565300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0565300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23198996	23199251	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0565300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;protein_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23200430	23200678	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0565300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;protein_id=OsNip_12t0565300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23200430	23200785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0565300-01;Name=OsNip_12t0565300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0565300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23251882	23252201	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0566000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;protein_id=OsNip_12t0566000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23252281	23252545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;Name=OsNip_12t0566000-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0566000-03-E2;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23252281	23252545	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0566000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;protein_id=OsNip_12t0566000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23252689	23252979	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0566000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;protein_id=OsNip_12t0566000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23252689	23253304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;Name=OsNip_12t0566000-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0566000-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23252980	23253304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23258077	23258172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566100-00;Name=OsNip_12t0566100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0566100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23270522	23271682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23270522	23272015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566250-01;Name=OsNip_12t0566250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0566250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23271974	23272015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23271514	23272915	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0566200-01;Parent=gene:OsNip_12g0566200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0566200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23278686	23279087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566300-01;Name=OsNip_12t0566300-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0566300-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23278758	23279087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0566300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23318107	23318392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23318576	23318743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23319517	23319587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23319801	23319858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23321276	23321360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23321448	23321507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23321767	23321840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23321939	23322055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23322995	23323364	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567200-02;Tag=IsoSeq:G17040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10026.1,Nipponbare.panicle_G13291.1,Nipponbare.leaf_G7675.1;prot_id "UniRef90_A0A6P6AMS8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23325673	23325897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23325673	23326375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;Name=OsNip_12t0567300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0567300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23325898	23326375	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0567300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;protein_id=OsNip_12t0567300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23326465	23326594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;Name=OsNip_12t0567300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0567300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23326465	23326594	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0567300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;protein_id=OsNip_12t0567300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23326723	23326843	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0567300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;protein_id=OsNip_12t0567300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23326723	23327055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;Name=OsNip_12t0567300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0567300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23326844	23327055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	23325618	23327055	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0567300-01;Parent=gene:OsNip_12g0567300;transcript_id=OsNip_12t0567300-01;Tag=IsoSeq:G17041.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10027.3
Chr12	TAMA	exon	23326694	23327055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-01;Name=OsNip_12t0567300-01;exon_id=OsNip_12t0567300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17041.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10027.3;prot_id "UniRef90_UPI000E1BCE89";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	23326465	23326594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-01;Name=OsNip_12t0567300-01;exon_id=OsNip_12t0567300-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17041.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10027.3;prot_id "UniRef90_UPI000E1BCE89";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	exon	23325618	23326375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0567300-01;Name=OsNip_12t0567300-01;exon_id=OsNip_12t0567300-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G17041.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10027.3;prot_id "UniRef90_UPI000E1BCE89";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23383088	23385840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568166-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23399429	23399785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568700-00;Name=OsNip_12t0568700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0568700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23404161	23406575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568750-00;Name=OsNip_12t0568750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0568750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23404675	23406587	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0568800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0568800-01;protein_id=OsNip_12t0568800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23406693	23407835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568800-01;Name=OsNip_12t0568800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0568800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23406892	23407835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23406693	23406891	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0568800-02;Parent=transcript:OsNip_12t0568800-02;protein_id=OsNip_12t0568800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23406693	23407853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568800-02;Name=OsNip_12t0568800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0568800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23406892	23407853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23407797	23408779	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0568800-03;Parent=gene:OsNip_12g0568800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0568800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23407797	23408779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568800-03;Name=OsNip_12t0568800-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0568800-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23410052	23410089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0568900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23420072	23420566	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0569200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0569200-01;protein_id=OsNip_12t0569200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23420567	23420841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23427730	23428732	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0569300;biotype=protein_coding;description=Thaumatin%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23427730	23428732	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0569300-01;Parent=gene:OsNip_12g0569300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0569300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23427730	23428732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569300-01;Name=OsNip_12t0569300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0569300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23435458	23435503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23435458	23436485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-01;Name=OsNip_12t0569500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0569500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23435504	23436205	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0569500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0569500-01;protein_id=OsNip_12t0569500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23436206	23436485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	23435458	23435685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-02;Name=OsNip_12t0569500-02;exon_id=OsNip_12t0569500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17052.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7678.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0G7Z2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	23435460	23435597	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0569500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0569500-02;protein_id=OsNip_12t0569500-02;Tag=IsoSeq:G17052.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7678.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0G7Z2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23435601	23435685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-02;Tag=IsoSeq:G17052.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7678.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0G7Z2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23435975	23436536	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569500-02;Tag=IsoSeq:G17052.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G7678.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0G7Z2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23442171	23447194	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0569700-01;Parent=gene:OsNip_12g0569700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0569700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23442171	23444029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23445618	23447194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-01;Name=OsNip_12t0569700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0569700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23445723	23447194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23442175	23442649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-02;Name=OsNip_12t0569700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0569700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23445924	23445935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23445924	23446926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-03;Name=OsNip_12t0569700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0569700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23445936	23446565	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0569700-03;Parent=transcript:OsNip_12t0569700-03;protein_id=OsNip_12t0569700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23446566	23446926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23445617	23446667	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0569800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23445617	23446667	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0569800-00;Parent=gene:OsNip_12g0569800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0569800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23445617	23446049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23445617	23446667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0569800-00;Name=OsNip_12t0569800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0569800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23446050	23446667	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0569800-00;Parent=transcript:OsNip_12t0569800-00;protein_id=OsNip_12t0569800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23498665	23498909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0570600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23501423	23501502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23501980	23502359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0570700-01;Name=OsNip_12t0570700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0570700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23502077	23502359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0570700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23512501	23512585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23512901	23512984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571000-01;Name=OsNip_12t0571000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0571000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23512901	23512984	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0571000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571000-01;protein_id=OsNip_12t0571000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23513121	23513406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571000-01;Name=OsNip_12t0571000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0571000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23513221	23513406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23515075	23516013	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0571100;Name=MTI4C;biotype=protein_coding;description=Metallothionein-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23515075	23516013	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0571100-01;Parent=gene:OsNip_12g0571100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23515075	23515146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23515075	23515202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;Name=OsNip_12t0571100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0571100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23515147	23515202	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0571100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;protein_id=OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23515446	23515529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;Name=OsNip_12t0571100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0571100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23515446	23515529	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0571100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;protein_id=OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23515680	23515776	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0571100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;protein_id=OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23515680	23516013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;Name=OsNip_12t0571100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0571100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23515777	23516013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23516655	23518441	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0571200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23516655	23518441	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0571200-01;Parent=gene:OsNip_12g0571200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23516655	23516733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23516655	23516828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;Name=OsNip_12t0571200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0571200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23516734	23516828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;protein_id=OsNip_12t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23517975	23518161	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;protein_id=OsNip_12t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23517975	23518441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;Name=OsNip_12t0571200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0571200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23518162	23518441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23519969	23521221	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0571300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23519969	23521221	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0571300-01;Parent=gene:OsNip_12g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23519969	23520370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23519969	23521221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571300-01;Name=OsNip_12t0571300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0571300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23520371	23521129	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0571300-01;protein_id=OsNip_12t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23521130	23521221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23555906	23556619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572000-01;Name=OsNip_12t0572000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0572000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23560202	23560551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572000-01;Name=OsNip_12t0572000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0572000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23554927	23555556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572000-02;Tag=IsoSeq:G17060.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13302.1;prot_id "UniRef90_A0A0K1SBG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23584169	23585132	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0572300-01;Parent=gene:OsNip_12g0572300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23584169	23584512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23589647	23593482	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0572400-01;Parent=gene:OsNip_12g0572400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23592382	23592535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572400-01;Name=OsNip_12t0572400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0572400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23593405	23593482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	23634984	23637165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573200-02;Tag=IsoSeq:G17065.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10043.1;prot_id "UniRef90_K3ZHD3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23663142	23663722	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0573600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23663142	23663722	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0573600-01;Parent=gene:OsNip_12g0573600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0573600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23663142	23663249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23663142	23663722	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573600-01;Name=OsNip_12t0573600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0573600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23663250	23663438	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0573600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0573600-01;protein_id=OsNip_12t0573600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23663439	23663722	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	23670086	23673047	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0573800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	23670086	23673047	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0573800-01;Parent=gene:OsNip_12g0573800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0573800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23670086	23670384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573800-01;Name=OsNip_12t0573800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0573800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23670086	23670384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	23670590	23670753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0573800-01;Name=OsNip_12t0573800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0573800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23690844	23691107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0574000-01;Name=OsNip_12t0574000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0574000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23691095	23691107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0574000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23740492	23740564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0575300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23750068	23750655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0575400-01;Name=OsNip_12t0575400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0575400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	23750274	23750582	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0575400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0575400-01;protein_id=OsNip_12t0575400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	23935032	23935656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0578400-01;Name=OsNip_12t0578400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0578400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23935425	23935656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0578400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24053963	24054780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580600-01;Name=OsNip_12t0580600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0580600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24063570	24063775	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580700-01;Name=OsNip_12t0580700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0580700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24070744	24070852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24070744	24071025	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;Name=OsNip_12t0580950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0580950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24070853	24071025	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0580950-00;Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;protein_id=OsNip_12t0580950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24071780	24072407	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0580950-00;Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;protein_id=OsNip_12t0580950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24071780	24072408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;Name=OsNip_12t0580950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0580950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24072408	24072408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0580950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24087199	24089937	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0581300;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24087199	24088344	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0581300-01;Parent=gene:OsNip_12g0581300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24087199	24087866	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24087199	24088344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-01;Name=OsNip_12t0581300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24087867	24088343	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0581300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0581300-01;protein_id=OsNip_12t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24088344	24088344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	24087199	24089937	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0581300-02;Parent=gene:OsNip_12g0581300;transcript_id=OsNip_12t0581300-02;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1
Chr12	TAMA	exon	24089357	24089937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Name=OsNip_12t0581300-02;exon_id=OsNip_12t0581300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	24089458	24089937	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0581300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;protein_id=OsNip_12t0581300-02;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	24088620	24088967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Name=OsNip_12t0581300-02;exon_id=OsNip_12t0581300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	24087199	24088493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Name=OsNip_12t0581300-02;exon_id=OsNip_12t0581300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	24089357	24089455	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	24088620	24088967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	24087199	24088493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581300-02;Tag=IsoSeq:G17089.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13323.1;prot_id "UniRef90_UPI00192A14DF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24088210	24089508	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0581350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24088210	24089508	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0581350-00;Parent=gene:OsNip_12g0581350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0581350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24088210	24088344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24088210	24088476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;Name=OsNip_12t0581350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24088345	24088476	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581350-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;protein_id=OsNip_12t0581350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24088603	24088986	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581350-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;protein_id=OsNip_12t0581350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24088603	24089508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;Name=OsNip_12t0581350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24088987	24089508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24105584	24114720	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0581400;Name=OsNip_SCP66;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24105584	24114720	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0581400-00;Parent=gene:OsNip_12g0581400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24105584	24105609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24105584	24105609	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24108609	24108666	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24108609	24108666	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24108962	24109007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24108962	24109007	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24109146	24109259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24109146	24109259	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24109818	24109939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24109818	24109939	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24110954	24111037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24110954	24111037	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0581400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;protein_id=OsNip_12t0581400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24113199	24113236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581400-00;Name=OsNip_12t0581400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0581400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24140131	24140134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24140131	24140242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;Name=OsNip_12t0581700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24140587	24140694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;Name=OsNip_12t0581700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581700-01-E4;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24140857	24141110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;Name=OsNip_12t0581700-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581700-03-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24140857	24141110	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;protein_id=OsNip_12t0581700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24141193	24141283	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0581700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;protein_id=OsNip_12t0581700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24141193	24141753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-02;Name=OsNip_12t0581700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0581700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24140589	24140589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24140857	24141110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;Name=OsNip_12t0581700-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581700-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24140857	24141110	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581700-03;Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;protein_id=OsNip_12t0581700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24141193	24141283	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0581700-03;Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;protein_id=OsNip_12t0581700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24141193	24141779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;Name=OsNip_12t0581700-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0581700-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24141284	24141779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24142655	24144843	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0581800-01;Parent=gene:OsNip_12g0581800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24142655	24142698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24142655	24143079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;Name=OsNip_12t0581800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24142699	24143079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;protein_id=OsNip_12t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24143158	24143390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;Name=OsNip_12t0581800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0581800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24143494	24143646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;Name=OsNip_12t0581800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0581800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24144367	24144438	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0581800-01;protein_id=OsNip_12t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24145596	24145905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24145906	24146493	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0581900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0581900-01;protein_id=OsNip_12t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24146494	24146549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24145952	24147956	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0581950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24145952	24146260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24145952	24147382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Name=OsNip_12t0581950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24146261	24146593	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0581950-00;Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;protein_id=OsNip_12t0581950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24146594	24147382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24147546	24147621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Name=OsNip_12t0581950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24147546	24147621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24147695	24147956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Name=OsNip_12t0581950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0581950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24147695	24147956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0581950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24154936	24156974	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0582000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24154936	24156974	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0582000-00;Parent=gene:OsNip_12g0582000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24154936	24155617	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582000-00;Name=OsNip_12t0582000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0582000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24154936	24155617	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0582000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0582000-00;protein_id=OsNip_12t0582000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24156031	24156974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582000-00;Name=OsNip_12t0582000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	24176768	24178209	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0582600;biotype=protein_coding;description=TFIIS;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24176768	24178209	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0582600-01;Parent=gene:OsNip_12g0582600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24176768	24177261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24176768	24177522	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;Name=OsNip_12t0582600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24177262	24177522	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;protein_id=OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24177637	24177705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;Name=OsNip_12t0582600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24177637	24177705	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;protein_id=OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24177811	24178065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;protein_id=OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24177811	24178209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;Name=OsNip_12t0582600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0582600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24178066	24178209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24180594	24182306	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0582666;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24180594	24182306	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0582666-00;Parent=gene:OsNip_12g0582666;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0582666-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24180594	24182306	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582666-00;Name=OsNip_12t0582666-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582666-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24180594	24182306	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582666-00;Parent=transcript:OsNip_12t0582666-00;protein_id=OsNip_12t0582666-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24184258	24186538	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0582700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24184258	24186538	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0582700-01;Parent=gene:OsNip_12g0582700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0582700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24184258	24184352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24184258	24184970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582700-01;Name=OsNip_12t0582700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24184353	24184970	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582700-01;protein_id=OsNip_12t0582700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24185555	24186538	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582700-01;Name=OsNip_12t0582700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0582700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24185555	24186538	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0582700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582700-01;protein_id=OsNip_12t0582700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24191443	24197634	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0582800;Name=OsNip_OSCA2.4;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24191443	24197634	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0582800-01;Parent=gene:OsNip_12g0582800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0582800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24191443	24191553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24191443	24191789	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;Name=OsNip_12t0582800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0582800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24191554	24191789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0582800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;protein_id=OsNip_12t0582800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24191897	24192052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;Name=OsNip_12t0582800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0582800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24191897	24192052	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0582800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;protein_id=OsNip_12t0582800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24192761	24192824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;Name=OsNip_12t0582800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0582800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24192761	24192824	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0582800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0582800-01;protein_id=OsNip_12t0582800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24206470	24206629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0583000-01;Name=OsNip_12t0583000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0583000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24213932	24214065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0583300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24238269	24238416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0583700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24489504	24489691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0586600-02;Name=OsNip_12t0586600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0586600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24517341	24517413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24517341	24517413	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0587100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;protein_id=OsNip_12t0587100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24517493	24517614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24518015	24518088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24518176	24518321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24518404	24518512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24518404	24518512	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0587100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;protein_id=OsNip_12t0587100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24518624	24518724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;Name=OsNip_12t0587100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0587100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24518624	24518724	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0587100-00;Parent=transcript:OsNip_12t0587100-00;protein_id=OsNip_12t0587100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24516431	24517201	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0587116;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24516431	24517201	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0587116-00;Parent=gene:OsNip_12g0587116;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0587116-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24516431	24517201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587116-00;Name=OsNip_12t0587116-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0587116-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24526705	24529814	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0587200;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24526715	24529814	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0587200-01;Parent=gene:OsNip_12g0587200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0587200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24526715	24526804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24526715	24529001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;Name=OsNip_12t0587200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0587200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24526805	24528328	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0587200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;protein_id=OsNip_12t0587200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24528329	24529001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24529435	24529814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;Name=OsNip_12t0587200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0587200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24529435	24529814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0587200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	24526705	24529118	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0587200-02;Parent=gene:OsNip_12g0587200;transcript_id=OsNip_12t0587200-02;Tag=IsoSeq:G17104.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7699.1
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24698367	24698435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0590400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24785604	24785855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0591500-00;Name=OsNip_12t0591500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0591500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24785627	24785855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0591500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24786024	24786307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0591500-00;Name=OsNip_12t0591500-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0591500-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24786024	24786307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0591500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24822307	24822365	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0592400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0592400-00;protein_id=OsNip_12t0592400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24822454	24822507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0592400-00;Name=OsNip_12t0592400-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0592400-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	24823278	24824513	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0592500;Name=OsNip_Fbox671;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24823278	24823405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24873457	24873623	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0593000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0593000-02;protein_id=OsNip_12t0593000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24873776	24873997	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0593000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0593000-02;protein_id=OsNip_12t0593000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24873776	24873999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-02;Name=OsNip_12t0593000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0593000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24873998	24873999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24872489	24872733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	24872489	24873331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;Name=OsNip_12t0593000-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0593000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24873776	24874023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;Name=OsNip_12t0593000-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0593000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24874197	24874374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;Name=OsNip_12t0593000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0593000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24876130	24876381	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0593000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;protein_id=OsNip_12t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24877210	24877348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0593000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24884663	24885580	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0593300-00;Parent=transcript:OsNip_12t0593300-00;protein_id=OsNip_12t0593300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	24887190	24887270	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0593650;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24916908	24917305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0594000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	24926341	24928568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0594200-00;Name=OsNip_12t0594200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0594200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	24926341	24928568	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0594200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0594200-00;protein_id=OsNip_12t0594200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24974775	24975143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0594950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	24975808	24980997	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0595000-01;Parent=gene:OsNip_12g0595000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0595000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25046787	25046787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0596600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25046788	25047489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0596600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0596600-01;protein_id=OsNip_12t0596600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25047490	25048556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0596600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	25045618	25046294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0596600-02;Tag=IsoSeq:G17117.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13343.1,Nipponbare.root_G10070.1;prot_id "UniRef90_B9GE28";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	25046590	25047070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0596600-02;Tag=IsoSeq:G17117.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13343.1,Nipponbare.root_G10070.1;prot_id "UniRef90_B9GE28";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25066140	25066250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597051-00;Name=OsNip_12t0597051-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0597051-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25067683	25067753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597051-00;Name=OsNip_12t0597051-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0597051-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25069474	25077583	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0597200;Name=OsNip_M12;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25076498	25077559	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0597200-01;Parent=gene:OsNip_12g0597200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0597200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25076498	25076499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25076498	25077559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597200-01;Name=OsNip_12t0597200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0597200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25076500	25077429	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0597200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0597200-01;protein_id=OsNip_12t0597200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25077430	25077559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	25069474	25077583	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0597200-02;Parent=gene:OsNip_12g0597200;transcript_id=OsNip_12t0597200-02;Tag=IsoSeq:G17120.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13346.1
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25085609	25085965	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0597400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0597400-01;protein_id=OsNip_12t0597400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25085609	25085996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597400-01;Name=OsNip_12t0597400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0597400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25085966	25085996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25102742	25103632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597700-01;Name=OsNip_12t0597700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0597700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25101048	25101733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0597700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25217360	25217735	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0599550-00;Parent=transcript:OsNip_12t0599550-00;protein_id=OsNip_12t0599550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25218400	25218542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599550-00;Name=OsNip_12t0599550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0599550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25226631	25227101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599625-01;Name=OsNip_12t0599625-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0599625-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25233291	25234195	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0599700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25233296	25234195	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0599700-01;Parent=gene:OsNip_12g0599700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25233296	25233484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25233296	25233689	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;Name=OsNip_12t0599700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0599700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25233485	25233689	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0599700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;protein_id=OsNip_12t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25234022	25234062	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0599700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;protein_id=OsNip_12t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25234022	25234195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;Name=OsNip_12t0599700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0599700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25234063	25234195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	25233291	25234097	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0599700-02;Parent=gene:OsNip_12g0599700;transcript_id=OsNip_12t0599700-02;Tag=IsoSeq:G17125.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13351.1
Chr12	TAMA	exon	25233291	25234097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-02;Name=OsNip_12t0599700-02;exon_id=OsNip_12t0599700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17125.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13351.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9VG68";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	25233338	25233430	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0599700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0599700-02;protein_id=OsNip_12t0599700-02;Tag=IsoSeq:G17125.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13351.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9VG68";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	25233431	25234097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-02;Tag=IsoSeq:G17125.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13351.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9VG68";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	25233291	25233335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599700-02;Tag=IsoSeq:G17125.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13351.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9VG68";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25234869	25235824	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0599800;biotype=protein_coding;description=Pectinesterase;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25234869	25235824	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0599800-01;Parent=gene:OsNip_12g0599800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0599800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25234869	25235064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25234869	25235824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599800-01;Name=OsNip_12t0599800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0599800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25235065	25235694	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0599800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0599800-01;protein_id=OsNip_12t0599800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25235695	25235824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0599800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	25234949	25235824	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0599800-02;Parent=gene:OsNip_12g0599800;transcript_id=OsNip_12t0599800-02;Tag=IsoSeq:G17126.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13352.2
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25283486	25283656	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0600701-00;Parent=transcript:OsNip_12t0600701-00;protein_id=OsNip_12t0600701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25306088	25306236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0601200-02;Name=OsNip_12t0601200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0601200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25463211	25463501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0603800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	25484971	25492672	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0604200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25484971	25492672	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0604200-00;Parent=gene:OsNip_12g0604200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0604200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25484971	25485019	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604200-00;Name=OsNip_12t0604200-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0604200-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25484971	25485019	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0604200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0604200-00;protein_id=OsNip_12t0604200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25485224	25485350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604200-00;Name=OsNip_12t0604200-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0604200-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25485224	25485350	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0604200-00;Parent=transcript:OsNip_12t0604200-00;protein_id=OsNip_12t0604200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25516247	25516609	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0604600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604600-01;protein_id=OsNip_12t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25516247	25516929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604600-01;Name=OsNip_12t0604600-01-E22;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0604600-01-E22;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25516610	25516929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25516219	25516852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604650-00;Name=OsNip_12t0604650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0604650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25518232	25522285	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0604700;Name=OsNip_Nek2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25518232	25522285	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0604700-01;Parent=gene:OsNip_12g0604700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25519449	25519904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0604700-02-E3;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25519449	25519904	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520007	25520058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0604700-02-E2;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520157	25520230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0604700-02-E1;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25520157	25520230	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520367	25520416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520505	25520586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25520505	25520586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520664	25520713	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25520804	25520846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25521122	25521167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25521122	25521167	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25521397	25521462	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25521733	25521799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25521733	25521799	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25521927	25522012	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0604700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;protein_id=OsNip_12t0604700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25521927	25522285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0604700-01;Name=OsNip_12t0604700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0604700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25542939	25543165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605200-01;Name=OsNip_12t0605200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0605200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25553547	25554289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605300-01;Name=OsNip_12t0605300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0605300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25580807	25580923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25581021	25581263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25578699	25578791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605800-03;Name=OsNip_12t0605800-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0605800-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25576556	25576679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25580797	25580935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25581033	25581261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605850-00;Name=OsNip_12t0605850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0605850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25581033	25581261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25581356	25581486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25583204	25586395	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0605900-01;Parent=gene:OsNip_12g0605900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25583204	25583365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25583204	25583675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;Name=OsNip_12t0605900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0605900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25583366	25583675	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0605900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;protein_id=OsNip_12t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25584441	25584562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;Name=OsNip_12t0605900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0605900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25584441	25584562	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0605900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;protein_id=OsNip_12t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25584796	25585022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0605900-01;Name=OsNip_12t0605900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0605900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25611229	25611594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0606100-00;Name=OsNip_12t0606100-00-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0606100-00-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25611361	25611594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25622843	25628255	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0606600;Name=OsNip_STA288;biotype=protein_coding;description=DNA-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25622843	25628255	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0606600-01;Parent=gene:OsNip_12g0606600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0606600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25622843	25622893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0606600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25622843	25622965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0606600-01;Name=OsNip_12t0606600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0606600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25622894	25622965	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0606600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0606600-01;protein_id=OsNip_12t0606600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25624187	25624283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0606600-01;Name=OsNip_12t0606600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0606600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25624187	25624283	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0606600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0606600-01;protein_id=OsNip_12t0606600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25644822	25644989	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0607000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0607000-02;protein_id=OsNip_12t0607000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25644822	25645411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607000-02;Name=OsNip_12t0607000-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0607000-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25644990	25645411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	25641796	25642384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607000-03;Name=OsNip_12t0607000-03;exon_id=OsNip_12t0607000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17146.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13370.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6QU02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	25641796	25641990	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0607000-03;Parent=transcript:OsNip_12t0607000-03;protein_id=OsNip_12t0607000-03;Tag=IsoSeq:G17146.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13370.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6QU02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	25641994	25642384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607000-03;Tag=IsoSeq:G17146.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13370.1;prot_id "UniRef90_A0A2R6QU02";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25647428	25652224	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0607100-01;Parent=gene:OsNip_12g0607100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25647428	25647682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25647428	25647682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25648572	25648579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25648572	25648685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25648580	25648685	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0607100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;protein_id=OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25649196	25649257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25649196	25649257	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0607100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;protein_id=OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25649680	25649792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25649680	25649792	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0607100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;protein_id=OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25650057	25650159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25650544	25650771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;Name=OsNip_12t0607100-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0607100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25650544	25650771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0607100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0607100-01;protein_id=OsNip_12t0607100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25679386	25679638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0607800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25699763	25699818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25701883	25701967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25702071	25706990	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0608600;Name=STR22;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25702077	25706990	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0608600-02;Parent=gene:OsNip_12g0608600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0608600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25702077	25702344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25703018	25703081	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0608600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0608600-02;protein_id=OsNip_12t0608600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25703281	25703362	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608600-02;Name=OsNip_12t0608600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0608600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25704107	25704166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608600-02;Name=OsNip_12t0608600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0608600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25704107	25704166	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0608600-02;Parent=transcript:OsNip_12t0608600-02;protein_id=OsNip_12t0608600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	CDS	25702351	25702443	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0608600-03;Parent=transcript:OsNip_12t0608600-03;protein_id=OsNip_12t0608600-03;Tag=IsoSeq:G17148.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13372.1,Nipponbare.leaf_G7716.1,Nipponbare.root_G10085.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	25706979	25706979	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608600-03;Tag=IsoSeq:G17148.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13372.1,Nipponbare.leaf_G7716.1,Nipponbare.root_G10085.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	25702071	25702348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608600-03;Tag=IsoSeq:G17148.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13372.1,Nipponbare.leaf_G7716.1,Nipponbare.root_G10085.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25711932	25712094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608666-00;Name=OsNip_12t0608666-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0608666-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25712030	25712683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608700-00;Name=OsNip_12t0608700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0608700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25712030	25712683	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0608700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0608700-00;protein_id=OsNip_12t0608700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25718546	25720672	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0608900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25718546	25718623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25718546	25720672	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0608900-00;Name=OsNip_12t0608900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0608900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	25722111	25722886	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0609000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25722111	25722886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0609000-00;Parent=gene:OsNip_12g0609000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0609000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25722111	25722372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609000-00;Name=OsNip_12t0609000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0609000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25722813	25722886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609000-00;Name=OsNip_12t0609000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0609000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25722813	25722886	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0609000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0609000-00;protein_id=OsNip_12t0609000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25722806	25723804	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0609025;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25722806	25723804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609025-00;Name=OsNip_12t0609025-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0609025-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25722806	25723804	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0609025-00;Parent=transcript:OsNip_12t0609025-00;protein_id=OsNip_12t0609025-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25725299	25726044	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0609050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25725299	25725300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25725301	25725567	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0609050-01;Parent=transcript:OsNip_12t0609050-01;protein_id=OsNip_12t0609050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25725568	25725586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25725670	25726044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609050-01;Name=OsNip_12t0609050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0609050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25725670	25726044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25726237	25726754	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0609100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25726237	25726754	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0609100-01;Parent=gene:OsNip_12g0609100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0609100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25726237	25726240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25726237	25726754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609100-01;Name=OsNip_12t0609100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0609100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25726241	25726531	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0609100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0609100-01;protein_id=OsNip_12t0609100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25756782	25756977	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609800-02;Name=OsNip_12t0609800-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0609800-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25756782	25756977	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0609800-02;Parent=transcript:OsNip_12t0609800-02;protein_id=OsNip_12t0609800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25757529	25757731	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0609800-02;Parent=transcript:OsNip_12t0609800-02;protein_id=OsNip_12t0609800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25757529	25758117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609800-02;Name=OsNip_12t0609800-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0609800-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25757732	25758117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25758738	25764063	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0609900;Name=OsNip_Fbox676;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25758738	25764063	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0609900-00;Parent=gene:OsNip_12g0609900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0609900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25758738	25759561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609900-00;Name=OsNip_12t0609900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0609900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25758738	25759561	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0609900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0609900-00;protein_id=OsNip_12t0609900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25763625	25764063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0609900-00;Name=OsNip_12t0609900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0609900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25763625	25764063	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0609900-00;Parent=transcript:OsNip_12t0609900-00;protein_id=OsNip_12t0609900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25764900	25765722	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0610100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25764900	25765722	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0610100-01;Parent=gene:OsNip_12g0610100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0610100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25764900	25764951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25764952	25765479	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610100-01;protein_id=OsNip_12t0610100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25765480	25765722	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25768808	25773052	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0610200;Name=OsNip_PIL11;biotype=protein_coding;description=Basic;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25768808	25773052	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0610200-01;Parent=gene:OsNip_12g0610200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25768808	25769146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25768808	25769146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25769828	25769882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25769828	25769944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25769883	25769944	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25770043	25770817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25770043	25770817	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25770993	25771058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25770993	25771058	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25771190	25771255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25771190	25771255	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25771342	25771584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25771342	25771584	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25771821	25771946	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0610200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;protein_id=OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25771821	25771969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25771947	25771969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25772728	25773052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Name=OsNip_12t0610200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0610200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25772728	25773052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25771051	25772690	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0610250;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25771051	25772690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0610250-01;Parent=gene:OsNip_12g0610250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25771051	25771185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25771051	25771601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;Name=OsNip_12t0610250-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0610250-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25771186	25771601	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0610250-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;protein_id=OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25771827	25771953	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;Name=OsNip_12t0610250-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610250-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25771827	25771953	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0610250-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;protein_id=OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25772073	25772147	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0610250-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;protein_id=OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25772073	25772690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;Name=OsNip_12t0610250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0610250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25772148	25772690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25780859	25782415	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0610300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25780954	25781952	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0610300-00;Parent=gene:OsNip_12g0610300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0610300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25780954	25781176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25780954	25781259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610300-00;Name=OsNip_12t0610300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0610300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25804266	25804543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610600-01;Name=OsNip_12t0610600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0610600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25804266	25804543	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0610600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0610600-01;protein_id=OsNip_12t0610600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25805709	25806504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610600-01;Name=OsNip_12t0610600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0610600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25806243	25806504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0610600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	25873348	25880813	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0611700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25873348	25880813	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0611700-01;Parent=gene:OsNip_12g0611700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0611700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25873348	25873567	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25880594	25880811	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0611700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0611700-01;protein_id=OsNip_12t0611700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25880594	25880813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-01;Name=OsNip_12t0611700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0611700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25880812	25880813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	25880594	25880653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-02;Name=OsNip_12t0611700-02;exon_id=OsNip_12t0611700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17159.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10088.3;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	25880594	25880653	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0611700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0611700-02;protein_id=OsNip_12t0611700-02;Tag=IsoSeq:G17159.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10088.3;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	exon	25873351	25873781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-02;Name=OsNip_12t0611700-02;exon_id=OsNip_12t0611700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17159.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10088.3;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	25873650	25873781	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0611700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0611700-02;protein_id=OsNip_12t0611700-02;Tag=IsoSeq:G17159.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10088.3;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	25873351	25873647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611700-02;Tag=IsoSeq:G17159.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10088.3;prot_id "UniRef90_A0A2H3ZUS2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	25883105	25885919	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0611900;biotype=protein_coding;description=Glycosyl;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25883105	25885917	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0611900-01;Parent=gene:OsNip_12g0611900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0611900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25883105	25883523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;Name=OsNip_12t0611900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0611900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25883105	25883523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25884332	25884453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25884332	25885917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;Name=OsNip_12t0611900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0611900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25884454	25885548	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0611900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;protein_id=OsNip_12t0611900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25885549	25885917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	25883394	25885919	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0611900-02;Parent=gene:OsNip_12g0611900;transcript_id=OsNip_12t0611900-02;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1
Chr12	TAMA	exon	25883394	25883518	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-02;Name=OsNip_12t0611900-02;exon_id=OsNip_12t0611900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1;prot_id "UniRef90_A0A2Z7AFH3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	25883394	25883518	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0611900-02;Parent=transcript:OsNip_12t0611900-02;protein_id=OsNip_12t0611900-02;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1;prot_id "UniRef90_A0A2Z7AFH3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	exon	25884332	25885919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-02;Name=OsNip_12t0611900-02;exon_id=OsNip_12t0611900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1;prot_id "UniRef90_A0A2Z7AFH3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	25884332	25884455	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0611900-02;Parent=transcript:OsNip_12t0611900-02;protein_id=OsNip_12t0611900-02;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1;prot_id "UniRef90_A0A2Z7AFH3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	25884459	25885919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0611900-02;Tag=IsoSeq:G17160.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13383.1;prot_id "UniRef90_A0A2Z7AFH3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	25888964	25892988	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0612100-01;Parent=gene:OsNip_12g0612100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0612100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25888964	25889113	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25888964	25889311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25889406	25889657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25890118	25890300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25890389	25890613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	25890389	25890613	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0612100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;protein_id=OsNip_12t0612100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	25890968	25891027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	25891616	25892059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Name=OsNip_12t0612100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0612100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25891689	25892059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25892825	25892988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0612100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26001412	26001637	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0613600-01;Name=OsNip_12t0613600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0613600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26002370	26008343	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0613700-01;Parent=gene:OsNip_12g0613700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0613700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26002370	26002726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0613700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26002370	26002925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0613700-01;Name=OsNip_12t0613700-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0613700-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26088689	26088874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26088329	26090086	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0615150-00;Parent=gene:OsNip_12g0615150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26088329	26088594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Name=OsNip_12t0615150-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0615150-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26088329	26088594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26088716	26088743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26088744	26089028	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0615150-00;Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;protein_id=OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26089029	26089108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26089491	26090086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Name=OsNip_12t0615150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0615150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26089491	26090086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26093271	26097944	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0615200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26093271	26097944	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0615200-01;Parent=gene:OsNip_12g0615200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0615200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26093271	26095925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0615200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26133656	26133878	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616000-01;Name=OsNip_12t0616000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0616000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26133877	26133878	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26184553	26184989	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	26180123	26180399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616600-02;Name=OsNip_12t0616600-02;exon_id=OsNip_12t0616600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7727.2,Nipponbare.leaf_G7727.1,Nipponbare.panicle_G13399.1,Nipponbare.panicle_G13399.2;prot_id "UniRef90_UPI00098E1742";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	exon	26180483	26180641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616600-02;Name=OsNip_12t0616600-02;exon_id=OsNip_12t0616600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7727.2,Nipponbare.leaf_G7727.1,Nipponbare.panicle_G13399.1,Nipponbare.panicle_G13399.2;prot_id "UniRef90_UPI00098E1742";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26183487	26183561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616600-02;Tag=IsoSeq:G17181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7727.2,Nipponbare.leaf_G7727.1,Nipponbare.panicle_G13399.1,Nipponbare.panicle_G13399.2;prot_id "UniRef90_UPI00098E1742";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26184553	26184763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616600-02;Tag=IsoSeq:G17181.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7727.2,Nipponbare.leaf_G7727.1,Nipponbare.panicle_G13399.1,Nipponbare.panicle_G13399.2;prot_id "UniRef90_UPI00098E1742";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26194568	26195061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26194568	26195981	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616800-01;Name=OsNip_12t0616800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0616800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26195866	26195981	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26200242	26203412	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0616900-01;Parent=gene:OsNip_12g0616900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26200242	26200324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26200325	26200489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0616900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;protein_id=OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26200582	26200619	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;Name=OsNip_12t0616900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0616900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26200582	26200619	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0616900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;protein_id=OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26202284	26203256	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0616900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;protein_id=OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26202284	26203412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;Name=OsNip_12t0616900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0616900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26203257	26203412	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	26202536	26203431	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0616900-02;Parent=gene:OsNip_12g0616900;transcript_id=OsNip_12t0616900-02;Tag=IsoSeq:G17183.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G10099.3
Chr12	TAMA	exon	26202536	26203431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-02;Name=OsNip_12t0616900-02;exon_id=OsNip_12t0616900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17183.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G10099.3;prot_id "UniRef90_A0A0C9RPU2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	CDS	26202536	26202658	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0616900-02;Parent=transcript:OsNip_12t0616900-02;protein_id=OsNip_12t0616900-02;Tag=IsoSeq:G17183.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G10099.3;prot_id "UniRef90_A0A0C9RPU2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26202662	26203431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0616900-02;Tag=IsoSeq:G17183.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G10099.3;prot_id "UniRef90_A0A0C9RPU2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26206496	26212061	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0617000-00;Parent=gene:OsNip_12g0617000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0617000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26206496	26206858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617000-00;Name=OsNip_12t0617000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0617000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26206496	26206858	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0617000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0617000-00;protein_id=OsNip_12t0617000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26211135	26212061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617000-00;Name=OsNip_12t0617000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0617000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26211135	26212061	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0617000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0617000-00;protein_id=OsNip_12t0617000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26215882	26221809	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0617100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26215882	26221809	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0617100-01;Parent=gene:OsNip_12g0617100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0617100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26215882	26216126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617100-01;Name=OsNip_12t0617100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0617100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26215882	26216126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26216693	26216806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617100-01;Name=OsNip_12t0617100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0617100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26218432	26218486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617100-01;Name=OsNip_12t0617100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0617100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26270167	26270167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26269318	26270792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617400-01;Name=OsNip_12t0617400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0617400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26300176	26300668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26300176	26300944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0617800-01;Name=OsNip_12t0617800-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0617800-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	26334398	26335901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618300-04;Name=OsNip_12t0618300-04;exon_id=OsNip_12t0618300-04-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G17186.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13404.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26334398	26334770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618300-04;Tag=IsoSeq:G17186.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13404.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26335395	26335885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618333-00;Name=OsNip_12t0618333-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0618333-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26335977	26336072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618333-00;Name=OsNip_12t0618333-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0618333-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26337444	26338006	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0618366-00;Parent=gene:OsNip_12g0618366;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0618366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26337444	26337528	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26337444	26337531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618366-00;Name=OsNip_12t0618366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0618366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26337529	26337531	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0618366-00;Parent=transcript:OsNip_12t0618366-00;protein_id=OsNip_12t0618366-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26351183	26351207	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0618600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26435707	26435714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0620733-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26437390	26437872	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0620733-00;Parent=transcript:OsNip_12t0620733-00;protein_id=OsNip_12t0620733-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26437873	26437992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0620733-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	26455020	26461940	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0621000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26455060	26455236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621000-00;Name=OsNip_12t0621000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26455060	26455236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26455341	26455778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621000-00;Name=OsNip_12t0621000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26455759	26455778	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0621000-00;protein_id=OsNip_12t0621000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26456690	26456825	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621000-00;Name=OsNip_12t0621000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26485609	26485657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-01;Name=OsNip_12t0621100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26485759	26485834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-01;Name=OsNip_12t0621100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26486792	26486917	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-01;protein_id=OsNip_12t0621100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26486792	26487242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-01;Name=OsNip_12t0621100-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26486918	26487242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26477827	26478183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26477827	26478255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Name=OsNip_12t0621100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26478184	26478255	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;protein_id=OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26485091	26485253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Name=OsNip_12t0621100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26485091	26485253	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;protein_id=OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26485609	26485657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Name=OsNip_12t0621100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26485609	26485657	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0621100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;protein_id=OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26485759	26485834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Name=OsNip_12t0621100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26485759	26485834	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0621100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;protein_id=OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26486792	26486917	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;protein_id=OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26486792	26487296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Name=OsNip_12t0621100-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621100-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26486918	26487296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26498568	26504595	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0621300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26498568	26504588	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0621300-02;Parent=gene:OsNip_12g0621300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0621300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26498568	26499349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0621300-02;Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;protein_id=OsNip_12t0621300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26498568	26499788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;Name=OsNip_12t0621300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26499350	26499788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26500918	26500983	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;Name=OsNip_12t0621300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26500918	26500983	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26504177	26504588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-02;Name=OsNip_12t0621300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26502398	26504595	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0621300-01;Parent=gene:OsNip_12g0621300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0621300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26503110	26504103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-01;Name=OsNip_12t0621300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26504177	26504208	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0621300-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621300-01;protein_id=OsNip_12t0621300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26504177	26504595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-01;Name=OsNip_12t0621300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26504209	26504595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26506314	26507238	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0621400-00;Parent=gene:OsNip_12g0621400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0621400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26506314	26506533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26506314	26507238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-00;Name=OsNip_12t0621400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26506534	26507238	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0621400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0621400-00;protein_id=OsNip_12t0621400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	26506284	26507165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0621400-01;Parent=gene:OsNip_12g0621400;transcript_id=OsNip_12t0621400-01;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2
Chr12	TAMA	exon	26506954	26507165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;Name=OsNip_12t0621400-01;exon_id=OsNip_12t0621400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	26506954	26507163	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0621400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;protein_id=OsNip_12t0621400-01;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	exon	26506284	26506790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;Name=OsNip_12t0621400-01;exon_id=OsNip_12t0621400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	26506410	26506790	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0621400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;protein_id=OsNip_12t0621400-01;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	26507164	26507165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26506284	26506407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621400-01;Tag=IsoSeq:G17194.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13412.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26507433	26513551	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0621500;Name=OsNip_STA290;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26507440	26513551	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0621500-01;Parent=gene:OsNip_12g0621500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26507440	26507580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26507440	26507586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26507581	26507586	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26507691	26509067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26507691	26509067	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26509174	26509296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26509174	26509296	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26509440	26509612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26509440	26509612	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26509776	26510016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26509776	26510016	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26510375	26510467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26510375	26510467	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26510536	26510676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26510536	26510676	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26510802	26510894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26510802	26510894	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26511077	26511281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26511077	26511281	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26511437	26511522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26511437	26511522	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26511976	26512064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26511976	26512064	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26512213	26512264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26512213	26512264	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26512342	26512398	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26512342	26512398	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26512490	26512657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26512490	26512657	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26512763	26512843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26512763	26512843	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26512926	26513006	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;protein_id=OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26512926	26513028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26513007	26513028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26513132	26513551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621500-01;Name=OsNip_12t0621500-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621500-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26554609	26554785	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0621900-03;Parent=transcript:OsNip_12t0621900-03;protein_id=OsNip_12t0621900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26555513	26555878	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621900-03;Name=OsNip_12t0621900-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0621900-03-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26555777	26555878	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26551433	26551485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621900-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26551433	26551885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0621900-04;Name=OsNip_12t0621900-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0621900-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26561470	26561569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26561799	26561814	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0622200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0622200-01;protein_id=OsNip_12t0622200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26561799	26562019	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622200-01;Name=OsNip_12t0622200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0622200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	26560930	26561209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622200-02;Tag=IsoSeq:G17198.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7732.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0G0Y8";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26588599	26589334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622850-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26599818	26600085	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0622900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0622900-01;protein_id=OsNip_12t0622900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26603727	26603894	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0622900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0622900-01;protein_id=OsNip_12t0622900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26604424	26604642	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0622900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0622900-01;protein_id=OsNip_12t0622900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26604424	26604728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622900-01;Name=OsNip_12t0622900-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0622900-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26604643	26604728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0622900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26618056	26618737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26618056	26618737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0623400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;protein_id=OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26618839	26618974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26618839	26618974	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0623400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;protein_id=OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26619646	26619661	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0623400-00;Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;protein_id=OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26619646	26619709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26619662	26619709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26619798	26619846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26619798	26619846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26619975	26620045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26619975	26620045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26620125	26620210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26620125	26620210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26620423	26620525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26620423	26620525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26620747	26620854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Name=OsNip_12t0623400-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623400-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26620747	26620854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26621211	26626093	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0623500;Name=OsNip_CAT11;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26621211	26625850	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0623500-02;Parent=gene:OsNip_12g0623500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26621211	26621616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26621211	26621779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26621617	26621779	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0623500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;protein_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26621876	26621951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26621876	26621951	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0623500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;protein_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26622050	26622162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26622050	26622162	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0623500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;protein_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26622255	26622360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26622255	26622360	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0623500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;protein_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26622448	26622682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26622862	26623020	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26623498	26623564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26623652	26623824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;Name=OsNip_12t0623500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0623500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26623652	26623824	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0623500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0623500-02;protein_id=OsNip_12t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26650410	26651050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623900-01;Name=OsNip_12t0623900-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0623900-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26647138	26647235	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26649217	26649384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623950-00;Name=OsNip_12t0623950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0623950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26649384	26649384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0623950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26661286	26661391	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0624000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624000-01;protein_id=OsNip_12t0624000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26661544	26661794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624000-01;Name=OsNip_12t0624000-02-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0624000-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26661544	26661794	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0624000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624000-01;protein_id=OsNip_12t0624000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26672423	26672423	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26673125	26673624	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0624400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624400-01;protein_id=OsNip_12t0624400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26687780	26689054	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0624800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624800-01;protein_id=OsNip_12t0624800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26687780	26689071	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624800-01;Name=OsNip_12t0624800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0624800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26689271	26689332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624800-01;Name=OsNip_12t0624800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0624800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26689271	26689332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26693520	26696511	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0624900;Name=OsNip_GATA25;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26693520	26696511	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0624900-01;Parent=gene:OsNip_12g0624900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26693520	26693621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26693520	26693690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;Name=OsNip_12t0624900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0624900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26693622	26693690	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0624900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;protein_id=OsNip_12t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26695233	26696093	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0624900-01;Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;protein_id=OsNip_12t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26695233	26696511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;Name=OsNip_12t0624900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0624900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26696094	26696511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26698650	26703087	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0625000;Name=rcs1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26698650	26703087	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0625000-01;Parent=gene:OsNip_12g0625000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26698650	26698885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26698650	26698975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26698886	26698975	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26699330	26699410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26699330	26699410	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26699551	26699610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26699551	26699610	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26699819	26699898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26700262	26700313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26700262	26700313	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26700434	26700571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26700434	26700571	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26700650	26700913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26700650	26700913	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26702342	26702399	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26702342	26702399	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26702600	26702709	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26702600	26702709	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26702832	26702879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26702832	26702879	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26703025	26703087	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;Name=OsNip_12t0625000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0625000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26703025	26703087	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0625000-01;protein_id=OsNip_12t0625000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26700639	26702684	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0625102;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26700639	26702684	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0625102-00;Parent=gene:OsNip_12g0625102;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0625102-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26700639	26700963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625102-00;Name=OsNip_12t0625102-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0625102-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26702589	26702684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625102-00;Name=OsNip_12t0625102-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0625102-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	26714545	26718161	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0625200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	26714545	26718145	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0625200-02;Parent=gene:OsNip_12g0625200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0625200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26714545	26714960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26714545	26715925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625200-02;Name=OsNip_12t0625200-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0625200-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26714961	26715925	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0625200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0625200-02;protein_id=OsNip_12t0625200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26716016	26716028	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0625200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0625200-02;protein_id=OsNip_12t0625200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26716016	26716160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0625200-02;Name=OsNip_12t0625200-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0625200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26761368	26761501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0626100-01;Name=OsNip_12t0626100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0626100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26761368	26761501	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0626100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0626100-01;protein_id=OsNip_12t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26762075	26762282	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0626100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0626100-01;protein_id=OsNip_12t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26762075	26762339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0626100-01;Name=OsNip_12t0626100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0626100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26762283	26762339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	26762075	26762345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0626100-02;Name=OsNip_12t0626100-02;exon_id=OsNip_12t0626100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17206.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7736.1,Nipponbare.root_G10108.1,Nipponbare.panicle_G13423.2;prot_id "UniRef90_A0A5B7BP15";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	26762075	26762344	.	-	.	ID=CDS:OsNip_12t0626100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0626100-02;protein_id=OsNip_12t0626100-02;Tag=IsoSeq:G17206.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G7736.1,Nipponbare.root_G10108.1,Nipponbare.panicle_G13423.2;prot_id "UniRef90_A0A5B7BP15";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	26905266	26905922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0628400-01;Name=OsNip_12t0628400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0628400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26905389	26905922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0628400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26905026	26905172	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0628400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0628400-02;protein_id=OsNip_12t0628400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	26905266	26905388	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0628400-02;Parent=transcript:OsNip_12t0628400-02;protein_id=OsNip_12t0628400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	26905266	26905898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0628400-02;Name=OsNip_12t0628400-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0628400-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26905389	26905898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0628400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27024787	27025203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631100-02;Name=OsNip_12t0631100-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0631100-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27024894	27025203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27023667	27025114	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0631150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27023667	27025114	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0631150-00;Parent=gene:OsNip_12g0631150;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0631150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27023667	27024271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631150-00;Name=OsNip_12t0631150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27024439	27025114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631150-00;Name=OsNip_12t0631150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27025315	27029985	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0631200;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27025315	27029985	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0631200-01;Parent=gene:OsNip_12g0631200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27025315	27025656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27025315	27026041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Name=OsNip_12t0631200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0631200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27025657	27026041	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;protein_id=OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27026881	27027629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Name=OsNip_12t0631200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0631200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27026881	27027629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;protein_id=OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27028296	27028694	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;protein_id=OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27028296	27029273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Name=OsNip_12t0631200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27028695	27029273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27029701	27029985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Name=OsNip_12t0631200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27029701	27029985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27025337	27027162	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0631200-02;Parent=gene:OsNip_12g0631200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27025337	27025656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27025337	27026041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;Name=OsNip_12t0631200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0631200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27025657	27026041	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0631200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;protein_id=OsNip_12t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27026881	27027161	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0631200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;protein_id=OsNip_12t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27026881	27027162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;Name=OsNip_12t0631200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27027162	27027162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27046194	27049741	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0631600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27046194	27049741	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0631600-01;Parent=gene:OsNip_12g0631600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0631600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27046194	27046314	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27046194	27047456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;Name=OsNip_12t0631600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27046315	27047456	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0631600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;protein_id=OsNip_12t0631600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27048904	27049021	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0631600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;protein_id=OsNip_12t0631600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27048904	27049036	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;Name=OsNip_12t0631600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0631600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27049022	27049036	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27049182	27049741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631600-01;Name=OsNip_12t0631600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0631600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27056893	27056972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0631800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27060232	27061159	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0632000-01;Parent=gene:OsNip_12g0632000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27060232	27060339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27060232	27060453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;Name=OsNip_12t0632000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0632000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27060340	27060453	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0632000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;protein_id=OsNip_12t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27060567	27060941	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0632000-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;protein_id=OsNip_12t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27060567	27061159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;Name=OsNip_12t0632000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0632000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27060942	27061159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	27060233	27061161	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0632000-02;Parent=gene:OsNip_12g0632000;transcript_id=OsNip_12t0632000-02;Tag=IsoSeq:G17223.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13436.6,Nipponbare.leaf_G7745.6
Chr12	TAMA	exon	27060233	27061161	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-02;Name=OsNip_12t0632000-02;exon_id=OsNip_12t0632000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17223.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13436.6,Nipponbare.leaf_G7745.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	CDS	27060233	27060820	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0632000-02;Parent=transcript:OsNip_12t0632000-02;protein_id=OsNip_12t0632000-02;Tag=IsoSeq:G17223.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13436.6,Nipponbare.leaf_G7745.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27060824	27061161	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632000-02;Tag=IsoSeq:G17223.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13436.6,Nipponbare.leaf_G7745.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27061650	27063765	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0632100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27061650	27062144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27096985	27097074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;Name=OsNip_12t0632700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0632700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27096985	27097074	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0632700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;protein_id=OsNip_12t0632700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27097173	27097487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;Name=OsNip_12t0632700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0632700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27097173	27097487	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0632700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;protein_id=OsNip_12t0632700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27098047	27098262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;Name=OsNip_12t0632700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0632700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27098047	27098262	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0632700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;protein_id=OsNip_12t0632700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27099200	27099271	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0632700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;protein_id=OsNip_12t0632700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27099200	27099336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;Name=OsNip_12t0632700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0632700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27099272	27099336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0632700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	27094799	27099338	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0632700-02;Parent=gene:OsNip_12g0632700;transcript_id=OsNip_12t0632700-02;Tag=IsoSeq:G17225.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10121.4
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27167036	27167373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0633700-00;Name=OsNip_12t0633700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0633700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27168720	27169628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0633800-00;Name=OsNip_12t0633800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0633800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27173605	27173907	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27190985	27192006	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0634400-01;Parent=gene:OsNip_12g0634400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0634400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27190985	27191566	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27190985	27192006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634400-01;Name=OsNip_12t0634400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0634400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27191567	27192004	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0634400-01;Parent=transcript:OsNip_12t0634400-01;protein_id=OsNip_12t0634400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27192005	27192006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27197343	27197872	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0634500;Name=OsNip_bZIP89;biotype=protein_coding;description=bZIP;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27197343	27197872	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0634500-00;Parent=gene:OsNip_12g0634500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27197343	27197849	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0634500-00;Parent=transcript:OsNip_12t0634500-00;protein_id=OsNip_12t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27197343	27197872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634500-00;Name=OsNip_12t0634500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0634500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27197850	27197872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27205497	27206108	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0634600-01;Parent=gene:OsNip_12g0634600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0634600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27205497	27205704	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27205497	27206108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634600-01;Name=OsNip_12t0634600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0634600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27205705	27206064	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0634600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0634600-01;protein_id=OsNip_12t0634600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27206065	27206108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27209219	27209842	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0634700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27209219	27209842	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0634700-00;Parent=gene:OsNip_12g0634700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27209219	27209273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27209274	27209705	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0634700-00;Parent=transcript:OsNip_12t0634700-00;protein_id=OsNip_12t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27209706	27209842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27210339	27213148	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0634800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27210339	27213148	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0634800-01;Parent=gene:OsNip_12g0634800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0634800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27210339	27210631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27210339	27210811	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;Name=OsNip_12t0634800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0634800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27210632	27210811	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0634800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;protein_id=OsNip_12t0634800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27210893	27210967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;Name=OsNip_12t0634800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0634800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27210893	27210967	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0634800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;protein_id=OsNip_12t0634800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27211711	27211822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0634800-01;Name=OsNip_12t0634800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0634800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27263777	27263847	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27265546	27265844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27271101	27271439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636100-01;Name=OsNip_12t0636100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0636100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27272927	27273303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Name=OsNip_12t0636200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27272927	27273303	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;protein_id=OsNip_12t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27273520	27274380	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-01;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;protein_id=OsNip_12t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27273520	27274527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Name=OsNip_12t0636200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27274381	27274527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27275219	27275299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Name=OsNip_12t0636200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27275219	27275299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27276225	27276782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Name=OsNip_12t0636200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27276225	27276782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27271747	27274075	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0636200-03;Parent=gene:OsNip_12g0636200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27271747	27272005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27271747	27272650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Name=OsNip_12t0636200-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636200-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27272006	27272650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;protein_id=OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27272786	27272846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Name=OsNip_12t0636200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E5;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27272786	27272846	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0636200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;protein_id=OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27272927	27273303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Name=OsNip_12t0636200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E4;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27272927	27273303	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;protein_id=OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27273520	27274074	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-03;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;protein_id=OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27273520	27274075	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Name=OsNip_12t0636200-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27274075	27274075	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27272207	27276727	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0636200-02;Parent=gene:OsNip_12g0636200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0636200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27272207	27272650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-02;Name=OsNip_12t0636200-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27272207	27272650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636200-02;Parent=transcript:OsNip_12t0636200-02;protein_id=OsNip_12t0636200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27272786	27272846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636200-02;Name=OsNip_12t0636200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0636200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27288172	27288661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636400-01;Name=OsNip_12t0636400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27293797	27294633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636700-01;Name=OsNip_12t0636700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27294604	27294633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27297883	27297946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;Name=OsNip_12t0636800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27298071	27298173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;Name=OsNip_12t0636800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0636800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27298367	27298470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;Name=OsNip_12t0636800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0636800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27298367	27298470	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0636800-01;Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;protein_id=OsNip_12t0636800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27298575	27298714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;Name=OsNip_12t0636800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27298605	27298714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27300282	27300904	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0636900-01;Parent=gene:OsNip_12g0636900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_12t0636900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27300282	27300904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0636900-01;Name=OsNip_12t0636900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0636900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27301298	27302686	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0637000;Name=OsNip_PAP10b;biotype=protein_coding;description=Purple;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27301298	27302686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0637000-00;Parent=gene:OsNip_12g0637000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0637000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27301298	27302686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0637000-00;Name=OsNip_12t0637000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0637000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27301298	27302686	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0637000-00;Parent=transcript:OsNip_12t0637000-00;protein_id=OsNip_12t0637000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27303890	27307145	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0637100;Name=OsNip_PAP10c;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27303890	27307145	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0637100-02;Parent=gene:OsNip_12g0637100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0637100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27303890	27304299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0637100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27303890	27305195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0637100-02;Name=OsNip_12t0637100-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0637100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27304300	27305195	.	-	2	ID=CDS:OsNip_12t0637100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0637100-02;protein_id=OsNip_12t0637100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27342384	27342473	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0638100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0638100-02;protein_id=OsNip_12t0638100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27342384	27342474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638100-02;Name=OsNip_12t0638100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0638100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27342474	27342474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	27379525	27379638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Name=OsNip_12t0638600-02;exon_id=OsNip_12t0638600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27379525	27379638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27379802	27379887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27379974	27380352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27380551	27381012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27381089	27381409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27382047	27382462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638600-02;Tag=IsoSeq:G17252.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13463.1,Nipponbare.leaf_G7758.2,Nipponbare.root_G10132.1;prot_id "UniRef90_M0S667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27387215	27387273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27437140	27437255	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0639700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0639700-01;protein_id=OsNip_12t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27437703	27438217	.	+	2	ID=CDS:OsNip_12t0639700-01;Parent=transcript:OsNip_12t0639700-01;protein_id=OsNip_12t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27437703	27438506	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-01;Name=OsNip_12t0639700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_12t0639700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27438218	27438506	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	27436268	27438508	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0639700-02;Parent=gene:OsNip_12g0639700;transcript_id=OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1
Chr12	TAMA	exon	27436268	27437060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;Name=OsNip_12t0639700-02;exon_id=OsNip_12t0639700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	CDS	27436645	27436968	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0639700-02;Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;protein_id=OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	five_prime_UTR	27436268	27436644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27436972	27437060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27437140	27437255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27437703	27438508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639700-02;Tag=IsoSeq:G17259.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10139.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5F3C3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27438961	27441793	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0639800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27438961	27441793	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0639800-00;Parent=gene:OsNip_12g0639800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0639800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27438961	27439164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0639800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27443875	27444246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640000-00;Name=OsNip_12t0640000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0640000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	27451260	27453035	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0640200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27451260	27453035	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0640200-00;Parent=gene:OsNip_12g0640200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0640200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27451260	27451286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27451260	27451968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640200-00;Name=OsNip_12t0640200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0640200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27452098	27453035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640200-00;Name=OsNip_12t0640200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0640200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	gene	27461433	27464384	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0640500;Name=OsNip_STA291;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27461437	27464384	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0640500-01;Parent=gene:OsNip_12g0640500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27461437	27461626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27461437	27461712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;Name=OsNip_12t0640500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0640500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27461627	27461712	.	+	0	ID=CDS:OsNip_12t0640500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;protein_id=OsNip_12t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27463666	27464104	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0640500-01;Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;protein_id=OsNip_12t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27463666	27464384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;Name=OsNip_12t0640500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0640500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27464105	27464384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	TAMA	mRNA	27461433	27464231	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0640500-02;Parent=gene:OsNip_12g0640500;transcript_id=OsNip_12t0640500-02;Tag=IsoSeq:G17260.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13469.1
Chr12	TAMA	exon	27461433	27464231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-02;Name=OsNip_12t0640500-02;exon_id=OsNip_12t0640500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17260.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13469.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1JVZ7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	CDS	27463371	27463937	.	+	.	ID=CDS:OsNip_12t0640500-02;Parent=transcript:OsNip_12t0640500-02;protein_id=OsNip_12t0640500-02;Tag=IsoSeq:G17260.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13469.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1JVZ7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	five_prime_UTR	27461433	27463370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-02;Tag=IsoSeq:G17260.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13469.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1JVZ7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27463941	27464231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640500-02;Tag=IsoSeq:G17260.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G13469.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1JVZ7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27461619	27464059	.	-	.	ID=gene:OsNip_12g0640550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27461619	27464059	.	-	.	ID=transcript:OsNip_12t0640550-01;Parent=gene:OsNip_12g0640550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0640550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27461619	27461871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27461619	27461886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640550-01;Name=OsNip_12t0640550-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0640550-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27463156	27463587	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0640550-01;Parent=transcript:OsNip_12t0640550-01;protein_id=OsNip_12t0640550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27463156	27464059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640550-01;Name=OsNip_12t0640550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0640550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27463588	27464059	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	gene	27464745	27471667	.	+	.	ID=gene:OsNip_12g0640600;Name=OsNip_CCD1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	mRNA	27464832	27471667	.	+	.	ID=transcript:OsNip_12t0640600-01;Parent=gene:OsNip_12g0640600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_12t0640600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27464832	27465029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27467162	27467273	.	+	1	ID=CDS:OsNip_12t0640600-01;Parent=transcript:OsNip_12t0640600-01;protein_id=OsNip_12t0640600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27468203	27468302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0640600-01;Name=OsNip_12t0640600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_12t0640600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27496465	27496769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27498589	27498807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27498913	27499044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27500346	27500648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27502795	27502902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27502973	27503023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Name=OsNip_12t0641100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0641100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27502973	27503023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27503124	27503540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	exon	27503124	27503646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;Name=OsNip_12t0641100-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_12t0641100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27503541	27503646	.	-	1	ID=CDS:OsNip_12t0641100-02;Parent=transcript:OsNip_12t0641100-02;protein_id=OsNip_12t0641100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	RAP2018-11-26	CDS	27505480	27505668	.	-	0	ID=CDS:OsNip_12t0641100-01;Parent=transcript:OsNip_12t0641100-01;protein_id=OsNip_12t0641100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr12	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27505669	27507002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr12	TAMA	exon	27508171	27508487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641100-05;Name=OsNip_12t0641100-05;exon_id=OsNip_12t0641100-05-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G17265.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G13474.3;prot_id "UniRef90_UPI00188FE32A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr12	TAMA	three_prime_UTR	27518812	27519054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641500-04;Tag=IsoSeq:G17268.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G10146.1,Nipponbare.panicle_G13477.4,Nipponbare.panicle_G13477.3;prot_id "UniRef90_A0A446YGP0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr12	RAP2018-11-26	exon	27521758	27523074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_12t0641600-01;Name=OsNip_12t0641600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_12t0641600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	392	516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Name=OsNip_02t0100050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0100050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	527	595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Name=OsNip_02t0100050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0100050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	527	595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	610	626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	610	2696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Name=OsNip_02t0100050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0100050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	801	2696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3634	8377	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0100100-01;Parent=gene:OsNip_02g0100100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3634	4049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3864	4049	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4861	4917	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5514	5648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5514	5648	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5728	5808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5728	5808	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5884	5952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5884	5952	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6419	6493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6419	6493	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6619	6705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6619	6705	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6873	6953	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6873	6953	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7045	7163	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7262	7430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7262	7430	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7538	7667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7538	7667	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7753	8255	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;protein_id=OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7753	8377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Name=OsNip_02t0100100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0100100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8256	8377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8609	8609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8609	9927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100150-01;Name=OsNip_02t0100150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0100150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8610	8777	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0100150-01;Parent=transcript:OsNip_02t0100150-01;protein_id=OsNip_02t0100150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8778	9927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0100150-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	120518	121529	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0102200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0102200-01;protein_id=OsNip_02t0102200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	120518	121684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102200-01;Name=OsNip_02t0102200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0102200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	125850	125920	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Name=OsNip_02t0102300-02;exon_id=OsNip_02t0102300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	125030	125128	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	125379	125452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	125850	125920	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	126038	126091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	126816	127152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102300-02;Tag=IsoSeq:G2471.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1502.1,Nipponbare.root_G1502.3,Nipponbare.root_G1502.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XAM5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	126773	127571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	126773	127637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;Name=OsNip_02t0102400-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0102400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	127572	127637	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0102400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;protein_id=OsNip_02t0102400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	127760	127819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;Name=OsNip_02t0102400-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0102400-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	127760	127819	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0102400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;protein_id=OsNip_02t0102400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	127903	128004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;Name=OsNip_02t0102400-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0102400-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	127903	128004	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0102400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;protein_id=OsNip_02t0102400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	128649	128756	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0102400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0102400-01;protein_id=OsNip_02t0102400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	295303	295561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	307030	307823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t010579A-01;Name=OsNip_02t010579A-01-E1;exon_id=OsNip_02t010579A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2492.1;Source=Nipponbare.root_G1517.1,Nipponbare.panicle_G1925.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3EZK4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	307203	307616	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t010579A-01;Parent=transcript:OsNip_02t010579A-01;protein_id=OsNip_02t010579A-01;Tag=IsoSeq:G2492.1;Source=Nipponbare.root_G1517.1,Nipponbare.panicle_G1925.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3EZK4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	307030	307202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t010579A-01;Tag=IsoSeq:G2492.1;Source=Nipponbare.root_G1517.1,Nipponbare.panicle_G1925.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3EZK4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	307620	307823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t010579A-01;Tag=IsoSeq:G2492.1;Source=Nipponbare.root_G1517.1,Nipponbare.panicle_G1925.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3EZK4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	311537	316458	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0105800;Name=OsNip_Fbox059;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	311537	316458	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0105800-01;Parent=gene:OsNip_02g0105800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	311537	311751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	311537	312138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;Name=OsNip_02t0105800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0105800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	311752	312138	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0105800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;protein_id=OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	312220	312372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;Name=OsNip_02t0105800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0105800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	312220	312372	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0105800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;protein_id=OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	312458	313255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;Name=OsNip_02t0105800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0105800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	312458	313255	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0105800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;protein_id=OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	314722	314819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;Name=OsNip_02t0105800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0105800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	314722	314819	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0105800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0105800-01;protein_id=OsNip_02t0105800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	343057	343057	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106100-02;Tag=IsoSeq:G2494.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1927.3,Nipponbare.panicle_G1927.12;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	346590	346889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106100-02;Tag=IsoSeq:G2494.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1927.3,Nipponbare.panicle_G1927.12;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	343383	346491	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0106201-00;Parent=gene:OsNip_02g0106201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0106201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	343383	343560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;Name=OsNip_02t0106201-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0106201-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	343938	344842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;Name=OsNip_02t0106201-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0106201-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	343938	344842	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0106201-00;Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;protein_id=OsNip_02t0106201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	345844	345939	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0106201-00;Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;protein_id=OsNip_02t0106201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	345844	346491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;Name=OsNip_02t0106201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0106201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	345940	346491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	350795	354294	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0106300;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	350795	354294	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0106300-01;Parent=gene:OsNip_02g0106300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0106300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	350795	351133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106300-01;Name=OsNip_02t0106300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0106300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	350795	351133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	351540	351723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106300-01;Name=OsNip_02t0106300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0106300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	351540	351723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	403189	403411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0106800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	460088	460810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	482360	483874	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0108302;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	482360	483874	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0108302-01;Parent=gene:OsNip_02g0108302;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0108302-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	482360	482501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108302-01;Name=OsNip_02t0108302-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0108302-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	482360	482501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108302-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	482593	483874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108302-01;Name=OsNip_02t0108302-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0108302-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	483045	483386	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0108302-01;Parent=transcript:OsNip_02t0108302-01;protein_id=OsNip_02t0108302-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	483387	483874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108302-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	482598	483761	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108400-00;Name=OsNip_02t0108400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0108400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	482598	483761	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0108400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0108400-00;protein_id=OsNip_02t0108400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	482326	483872	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0108400-01;Parent=gene:OsNip_02g0108400;transcript_id=OsNip_02t0108400-01;Tag=IsoSeq:G2500.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1162.1
Chr02	TAMA	exon	482326	482501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0108400-01;Name=OsNip_02t0108400-01;exon_id=OsNip_02t0108400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2500.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1162.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0JVB1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	493876	494003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t010909A-01;Tag=IsoSeq:G2502.1;Source=Nipponbare.panicle_G1933.1;prot_id "UniRef90_A2WZY6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	493568	493762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t010909A-01;Tag=IsoSeq:G2502.1;Source=Nipponbare.panicle_G1933.1;prot_id "UniRef90_A2WZY6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	500135	500148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0109100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	746497	747343	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0113900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0113900-00;protein_id=OsNip_02t0113900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	748077	748174	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0113900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0113900-00;protein_id=OsNip_02t0113900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	745861	748339	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0113900-01;Parent=gene:OsNip_02g0113900;transcript_id=OsNip_02t0113900-01;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1
Chr02	TAMA	exon	745861	747343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0113900-01;Name=OsNip_02t0113900-01;exon_id=OsNip_02t0113900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1;prot_id "UniRef90_A3BBX6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	exon	748077	748339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0113900-01;Name=OsNip_02t0113900-01;exon_id=OsNip_02t0113900-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1;prot_id "UniRef90_A3BBX6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	745861	745861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0113900-01;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1;prot_id "UniRef90_A3BBX6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	746021	747343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0113900-01;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1;prot_id "UniRef90_A3BBX6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	748077	748339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0113900-01;Tag=IsoSeq:G2516.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G1941.1;prot_id "UniRef90_A3BBX6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	788472	788588	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0114700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0114700-01;protein_id=OsNip_02t0114700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	788815	789191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0114700-01;Name=OsNip_02t0114700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0114700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	790441	790570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0114800-01;Tag=IsoSeq:G2523.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1535.2;prot_id "UniRef90_B4FNQ6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	794820	795082	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0114900-00;Parent=gene:OsNip_02g0114900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0114900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	794820	795082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0114900-00;Name=OsNip_02t0114900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0114900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	817456	817457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t011559A-01;Tag=IsoSeq:G2524.1;Source=Nipponbare.leaf_G1172.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	817611	817649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t011559A-01;Tag=IsoSeq:G2524.1;Source=Nipponbare.leaf_G1172.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	818981	824539	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0115600-01;Parent=gene:OsNip_02g0115600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	818981	819021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	818981	819264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-01;Name=OsNip_02t0115600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0115600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	824177	824539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-01;Name=OsNip_02t0115600-01-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0115600-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	824252	824539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	820696	820697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	820696	820761	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0115600-02;Name=OsNip_02t0115600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0115600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	820698	820761	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0115600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0115600-02;protein_id=OsNip_02t0115600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	1103418	1103726	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0121100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0121100-02;protein_id=OsNip_02t0121100-02;Tag=IsoSeq:G2556.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1554.5;prot_id "UniRef90_C0P9G9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1103868	1104288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121100-02;Tag=IsoSeq:G2556.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1554.5;prot_id "UniRef90_C0P9G9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1103076	1103415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121100-02;Tag=IsoSeq:G2556.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1554.5;prot_id "UniRef90_C0P9G9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1106261	1106857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1109334	1109397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;Name=OsNip_02t0121200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0121200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1110956	1111161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;Name=OsNip_02t0121200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0121200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1110956	1111161	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0121200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;protein_id=OsNip_02t0121200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1111650	1111885	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0121200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;protein_id=OsNip_02t0121200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1111650	1111999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;Name=OsNip_02t0121200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0121200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1111886	1111999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1116066	1116159	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1116066	1116952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-01;Name=OsNip_02t0121300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0121300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1116160	1116678	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0121300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0121300-01;protein_id=OsNip_02t0121300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1116679	1116952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	1116067	1116971	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0121300-02;Parent=gene:OsNip_02g0121300;transcript_id=OsNip_02t0121300-02;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7
Chr02	TAMA	exon	1116067	1116438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;Name=OsNip_02t0121300-02;exon_id=OsNip_02t0121300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	1116069	1116143	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0121300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;protein_id=OsNip_02t0121300-02;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	1116540	1116971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;Name=OsNip_02t0121300-02;exon_id=OsNip_02t0121300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1116067	1116068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1116147	1116438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1116540	1116971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121300-02;Tag=IsoSeq:G2558.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1971.7;prot_id "UniRef90_UPI00148AC2A7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1123522	1125432	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0121400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1123885	1125397	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0121400-00;Parent=gene:OsNip_02g0121400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1123885	1123889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1123885	1124192	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;Name=OsNip_02t0121400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0121400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1123890	1124192	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0121400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;protein_id=OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1124599	1124673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;Name=OsNip_02t0121400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0121400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1124599	1124673	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0121400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;protein_id=OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1124841	1124903	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;Name=OsNip_02t0121400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0121400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1124841	1124903	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0121400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;protein_id=OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1125020	1125358	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0121400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;protein_id=OsNip_02t0121400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1125020	1125397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0121400-00;Name=OsNip_02t0121400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0121400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1283278	1283574	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1284472	1284581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1284472	1284581	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1285309	1285639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1285309	1285639	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1285968	1286369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1285968	1286369	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1286626	1286860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1286626	1286860	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1286963	1286988	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0124700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;protein_id=OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1287619	1287792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1287619	1287792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1287859	1288182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Name=OsNip_02t0124700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0124700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1287859	1288182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1288998	1289511	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0124800-01;Parent=gene:OsNip_02g0124800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0124800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1288998	1289441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1288998	1289511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-01;Name=OsNip_02t0124800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0124800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1289442	1289510	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0124800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124800-01;protein_id=OsNip_02t0124800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1289511	1289511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	1289077	1292459	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0124800-02;Parent=gene:OsNip_02g0124800;transcript_id=OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3
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Chr02	TAMA	CDS	1292042	1292458	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0124800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;protein_id=OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1291735	1291894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Name=OsNip_02t0124800-02;exon_id=OsNip_02t0124800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	1291856	1291894	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0124800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;protein_id=OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1291449	1291631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Name=OsNip_02t0124800-02;exon_id=OsNip_02t0124800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1291274	1291357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Name=OsNip_02t0124800-02;exon_id=OsNip_02t0124800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1290073	1290154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Name=OsNip_02t0124800-02;exon_id=OsNip_02t0124800-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1289077	1289875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Name=OsNip_02t0124800-02;exon_id=OsNip_02t0124800-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1292459	1292459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1291735	1291853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1291449	1291631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1291274	1291357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1290073	1290154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1289077	1289875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124800-02;Tag=IsoSeq:G2579.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1985.1,Nipponbare.leaf_G1202.1,Nipponbare.root_G1564.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0WRN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1289896	1291737	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0124866;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1289896	1291737	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0124866-01;Parent=gene:OsNip_02g0124866;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0124866-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1289896	1291162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124866-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1289896	1291737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124866-01;Name=OsNip_02t0124866-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0124866-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1291163	1291516	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0124866-01;Parent=transcript:OsNip_02t0124866-01;protein_id=OsNip_02t0124866-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1291517	1291737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0124866-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1302273	1304317	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0125000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1302273	1304291	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0125000-01;Parent=gene:OsNip_02g0125000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1302273	1302357	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1302273	1302781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Name=OsNip_02t0125000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0125000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1302358	1302781	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0125000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;protein_id=OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1303330	1303469	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0125000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;protein_id=OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1303330	1303483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Name=OsNip_02t0125000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0125000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1303470	1303483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1303794	1304291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Name=OsNip_02t0125000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0125000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1303794	1304291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1303847	1304317	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0125000-02;Parent=gene:OsNip_02g0125000;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0125000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1303847	1304317	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125000-02;Name=OsNip_02t0125000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0125000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1304905	1309799	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0125100;biotype=protein_coding;description=Homoaconitase/3-isopropylmalate;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1304905	1309799	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0125100-01;Parent=gene:OsNip_02g0125100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1304905	1305108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1304905	1305249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;Name=OsNip_02t0125100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0125100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1305109	1305249	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0125100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;protein_id=OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1305677	1305835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;Name=OsNip_02t0125100-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0125100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1305677	1305835	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0125100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;protein_id=OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1305922	1305969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;Name=OsNip_02t0125100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0125100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1305922	1305969	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0125100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;protein_id=OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1306621	1306752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;Name=OsNip_02t0125100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0125100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1306621	1306752	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0125100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125100-01;protein_id=OsNip_02t0125100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1327071	1327187	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0125300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125300-01;protein_id=OsNip_02t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1328060	1328203	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0125300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0125300-01;protein_id=OsNip_02t0125300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1337425	1337685	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0125500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0125500-00;protein_id=OsNip_02t0125500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1336096	1336330	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0125533-00;Name=OsNip_02t0125533-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0125533-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1397698	1398983	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0126600-01;Parent=gene:OsNip_02g0126600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0126600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1397698	1397728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0126600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1397698	1397753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0126600-01;Name=OsNip_02t0126600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0126600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1412368	1412418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127000-02;Name=OsNip_02t0127000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0127000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1412368	1412418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	mRNA	1416601	1417635	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0127100-01;Parent=gene:OsNip_02g0127100;transcript_id=OsNip_02t0127100-01;Tag=IsoSeq:G2593.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1997.4
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1416685	1417060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127100-01;Tag=IsoSeq:G2593.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1997.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0N976";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1417157	1417635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127100-01;Tag=IsoSeq:G2593.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G1997.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0N976";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	mRNA	1419995	1420997	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t012729A-04;Parent=gene:OsNip_02g012729A;transcript_id=OsNip_02t012729A-04;Tag=IsoSeq:G2594.4;Source=Nipponbare.panicle_G1998.4
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Chr02	TAMA	CDS	1420395	1420454	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t012729A-04;Parent=transcript:OsNip_02t012729A-04;protein_id=OsNip_02t012729A-04;Tag=IsoSeq:G2594.4;Source=Nipponbare.panicle_G1998.4;prot_id "UniRef90_I1PXL6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1419995	1420394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t012729A-04;Tag=IsoSeq:G2594.4;Source=Nipponbare.panicle_G1998.4;prot_id "UniRef90_I1PXL6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1420458	1420997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t012729A-04;Tag=IsoSeq:G2594.4;Source=Nipponbare.panicle_G1998.4;prot_id "UniRef90_I1PXL6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	mRNA	1420197	1420732	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t012729A-05;Parent=gene:OsNip_02g012729A;transcript_id=OsNip_02t012729A-05;Tag=IsoSeq:G2594.5;Source=Nipponbare.panicle_G1998.5
Chr02	TAMA	exon	1420197	1420732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t012729A-05;Name=OsNip_02t012729A-05-E1;exon_id=OsNip_02t012729A-05-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2594.5;Source=Nipponbare.panicle_G1998.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	1420197	1420454	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t012729A-05;Parent=transcript:OsNip_02t012729A-05;protein_id=OsNip_02t012729A-05;Tag=IsoSeq:G2594.5;Source=Nipponbare.panicle_G1998.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1420458	1420732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t012729A-05;Tag=IsoSeq:G2594.5;Source=Nipponbare.panicle_G1998.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1423979	1424390	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0127300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1423979	1424390	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0127300-01;Parent=gene:OsNip_02g0127300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1423979	1424233	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0127300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0127300-01;protein_id=OsNip_02t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1423979	1424390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127300-01;Name=OsNip_02t0127300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0127300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1424234	1424390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1427396	1428118	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0127400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1427398	1428069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0127400-01;Parent=gene:OsNip_02g0127400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1427398	1427489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1427398	1428069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127400-01;Name=OsNip_02t0127400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0127400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1427490	1427789	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0127400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0127400-01;protein_id=OsNip_02t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1427790	1428069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	1427396	1428118	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0127400-02;Parent=gene:OsNip_02g0127400;transcript_id=OsNip_02t0127400-02;Tag=IsoSeq:G2596.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2000.3
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Chr02	TAMA	CDS	1427398	1427493	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0127400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0127400-02;protein_id=OsNip_02t0127400-02;Tag=IsoSeq:G2596.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2000.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1438627	1438695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127700-02;Name=OsNip_02t0127700-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0127700-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1439264	1439407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127700-02;Name=OsNip_02t0127700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0127700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1440386	1440559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127700-02;Name=OsNip_02t0127700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0127700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1440386	1440559	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0127700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0127700-02;protein_id=OsNip_02t0127700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1447125	1447126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127900-02;Tag=IsoSeq:G2600.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2004.3,Nipponbare.root_G1573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9RJA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1448777	1449428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0127900-02;Tag=IsoSeq:G2600.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2004.3,Nipponbare.root_G1573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9RJA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1450233	1450766	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0128000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0128000-00;protein_id=OsNip_02t0128000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1453478	1453750	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0128100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0128100-00;protein_id=OsNip_02t0128100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1455788	1456346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128100-00;Name=OsNip_02t0128100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0128100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1456025	1456346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	1474194	1474302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128400-02;Name=OsNip_02t0128400-02;exon_id=OsNip_02t0128400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2603.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1212.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8JBI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1469299	1469715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128500-00;Name=OsNip_02t0128500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0128500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1473845	1474022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1478834	1478893	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0128600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;protein_id=OsNip_02t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1479000	1479065	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0128600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;protein_id=OsNip_02t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1479571	1479765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0128600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;protein_id=OsNip_02t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1479571	1479779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;Name=OsNip_02t0128600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0128600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1479766	1479779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1479881	1480233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;Name=OsNip_02t0128600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0128600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1479881	1480233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0128600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1476515	1479790	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0128501;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1551553	1552808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1551553	1553359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129700-01;Name=OsNip_02t0129700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0129700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1558563	1559143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129800-01;Name=OsNip_02t0129800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0129800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1558740	1559048	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0129800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0129800-01;protein_id=OsNip_02t0129800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1559049	1559143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1560757	1563229	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0129900-01;Parent=gene:OsNip_02g0129900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1560757	1560905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Name=OsNip_02t0129900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0129900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1561007	1561185	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0129900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;protein_id=OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1561281	1561333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Name=OsNip_02t0129900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0129900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1561281	1561333	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0129900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;protein_id=OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1561673	1561787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Name=OsNip_02t0129900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0129900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1562073	1562195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Name=OsNip_02t0129900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0129900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1562073	1562195	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0129900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;protein_id=OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1562558	1562729	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0129900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;protein_id=OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1562815	1563229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Name=OsNip_02t0129900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0129900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1563001	1563229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1563426	1565446	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0130000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1563426	1565446	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0130000-01;Parent=gene:OsNip_02g0130000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1563426	1563804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1563426	1563930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130000-01;Name=OsNip_02t0130000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0130000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1563805	1563930	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0130000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0130000-01;protein_id=OsNip_02t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1565093	1565446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130000-01;Name=OsNip_02t0130000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0130000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1565363	1565446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1566154	1569479	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0130100;biotype=protein_coding;description=SNO;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1566154	1569479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0130100-01;Parent=gene:OsNip_02g0130100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0130100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1566154	1566395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1566154	1566528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;Name=OsNip_02t0130100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0130100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1566396	1566528	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0130100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;protein_id=OsNip_02t0130100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1566619	1566716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;Name=OsNip_02t0130100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0130100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1566619	1566716	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0130100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;protein_id=OsNip_02t0130100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1567495	1567686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;Name=OsNip_02t0130100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0130100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1567495	1567686	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0130100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0130100-01;protein_id=OsNip_02t0130100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1644223	1645161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0131400-00;Name=OsNip_02t0131400-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0131400-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1645328	1645432	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0131400-00;Name=OsNip_02t0131400-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0131400-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1647680	1647884	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0131400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0131400-00;protein_id=OsNip_02t0131400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1648538	1648808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0131400-00;Name=OsNip_02t0131400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0131400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	1648538	1648808	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0131400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0131400-00;protein_id=OsNip_02t0131400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1887949	1888893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0135700-02;Name=OsNip_02t0135700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0135700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1888722	1888893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0135700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	1882717	1882998	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0135700-03;Parent=transcript:OsNip_02t0135700-03;protein_id=OsNip_02t0135700-03;Tag=IsoSeq:G2641.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2036.2;prot_id "UniRef90_A0A453N7X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1949177	1949400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	1947666	1949436	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0136800-03;Parent=gene:OsNip_02g0136800;transcript_id=OsNip_02t0136800-03;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3
Chr02	TAMA	exon	1949177	1949436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;Name=OsNip_02t0136800-03;exon_id=OsNip_02t0136800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	1947666	1949078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;Name=OsNip_02t0136800-03;exon_id=OsNip_02t0136800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	1948074	1948337	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0136800-03;Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;protein_id=OsNip_02t0136800-03;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1949177	1949436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	1948338	1949078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1947666	1948071	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136800-03;Tag=IsoSeq:G2646.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1231.1,Nipponbare.root_G1600.1,Nipponbare.panicle_G2040.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9YM32";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1948600	1949119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0136850-00;Name=OsNip_02t0136850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0136850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1949825	1953397	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0136900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1972335	1972800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	1972335	1972888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137100-02;Tag=IsoSeq:G2647.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1601.7;prot_id "UniRef90_A0A2T7DUD4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	1972939	1974762	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0137200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	1972939	1974198	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0137200-02;Parent=gene:OsNip_02g0137200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0137200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1972939	1973114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	1972939	1973404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137200-02;Name=OsNip_02t0137200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0137200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	1996521	1997302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137500-01;Name=OsNip_02t0137500-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0137500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1996633	1997302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0137500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2036662	2036874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138100-00;Name=OsNip_02t0138100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0138100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2036849	2036874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2036916	2037200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138100-01;Tag=IsoSeq:G2654.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1236.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6RKR2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2037530	2037717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2038169	2038384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138200-01;Name=OsNip_02t0138200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0138200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2038169	2038384	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0138200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0138200-01;protein_id=OsNip_02t0138200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2039096	2039329	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0138200-03;Parent=transcript:OsNip_02t0138200-03;protein_id=OsNip_02t0138200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2039419	2040171	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0138200-03;Parent=transcript:OsNip_02t0138200-03;protein_id=OsNip_02t0138200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2039419	2040424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138200-03;Name=OsNip_02t0138200-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0138200-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2040172	2040424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0138200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2192221	2192310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0140800-00;Name=OsNip_02t0140800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0140800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2192221	2192310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0140800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0140800-00;protein_id=OsNip_02t0140800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2216605	2216709	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0141201-01;Parent=transcript:OsNip_02t0141201-01;protein_id=OsNip_02t0141201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2216710	2219485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0141201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2231145	2239224	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0141300;Name=CAP1;biotype=protein_coding;description=Arabinokinase-Like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2231145	2239224	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0141300-01;Parent=gene:OsNip_02g0141300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0141300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2231145	2231382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0141300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2231145	2231493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0141300-01;Name=OsNip_02t0141300-01-E28;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0141300-01-E28;rank=28;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2231383	2231493	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0141300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0141300-01;protein_id=OsNip_02t0141300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2516879	2517009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-02;Name=OsNip_02t0145500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0145500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2516879	2517009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2517125	2518692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2518693	2518836	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0145500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0145500-02;protein_id=OsNip_02t0145500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2518837	2519232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	2516849	2519234	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0145500-03;Parent=gene:OsNip_02g0145500;transcript_id=OsNip_02t0145500-03;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1
Chr02	TAMA	exon	2516849	2517009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;Name=OsNip_02t0145500-03;exon_id=OsNip_02t0145500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	2516851	2516934	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0145500-03;Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;protein_id=OsNip_02t0145500-03;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	2518997	2519234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;Name=OsNip_02t0145500-03;exon_id=OsNip_02t0145500-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	2516849	2516850	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2516938	2517009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2518997	2519234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145500-03;Tag=IsoSeq:G2673.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1618.3,Nipponbare.panicle_G2062.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0CFJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2520311	2522491	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0145600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2520355	2522491	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0145600-01;Parent=gene:OsNip_02g0145600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0145600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2520355	2520590	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2520355	2521313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145600-01;Name=OsNip_02t0145600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0145600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2520591	2521259	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0145600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0145600-01;protein_id=OsNip_02t0145600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2521260	2521313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2521404	2521595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0145600-01;Name=OsNip_02t0145600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0145600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2550768	2551121	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146400-03;Tag=IsoSeq:G2675.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2064.1,Nipponbare.panicle_G2064.2;prot_id "UniRef90_A0A059ASQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2553837	2553911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2553985	2554211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146500-01;Name=OsNip_02t0146500-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0146500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2553985	2554211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2554363	2554552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2570410	2570588	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0146700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0146700-02;protein_id=OsNip_02t0146700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2570675	2570747	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0146700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0146700-02;protein_id=OsNip_02t0146700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2570675	2571143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146700-02;Name=OsNip_02t0146700-02-E25;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0146700-02-E25;rank=25;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2570748	2571143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2574598	2577069	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0146900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2575663	2577064	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0146900-01;Parent=gene:OsNip_02g0146900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0146900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2575663	2575859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2575663	2577064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-01;Name=OsNip_02t0146900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0146900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2575860	2576972	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0146900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0146900-01;protein_id=OsNip_02t0146900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2576973	2577064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	2574598	2577069	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0146900-02;Parent=gene:OsNip_02g0146900;transcript_id=OsNip_02t0146900-02;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4
Chr02	TAMA	exon	2577036	2577069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;Name=OsNip_02t0146900-02;exon_id=OsNip_02t0146900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	2577036	2577068	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0146900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;protein_id=OsNip_02t0146900-02;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	2574598	2576364	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;Name=OsNip_02t0146900-02;exon_id=OsNip_02t0146900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	2576011	2576364	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0146900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;protein_id=OsNip_02t0146900-02;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	2577069	2577069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2574598	2576008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0146900-02;Tag=IsoSeq:G2679.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1621.4;prot_id "UniRef90_A0A0D9VC58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2577232	2585430	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0147100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2577232	2585430	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0147100-00;Parent=gene:OsNip_02g0147100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0147100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2577232	2577377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2577232	2577422	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147100-00;Name=OsNip_02t0147100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0147100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2577378	2577422	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0147100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0147100-00;protein_id=OsNip_02t0147100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2578019	2578223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147100-00;Name=OsNip_02t0147100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0147100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2599191	2599501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2607029	2607373	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0147500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0147500-00;protein_id=OsNip_02t0147500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2607768	2608614	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0147500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0147500-00;protein_id=OsNip_02t0147500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	2571431	2614087	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0147600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2612044	2614087	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0147600-01;Parent=gene:OsNip_02g0147600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2612044	2612874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2612044	2614087	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0147600-01;Name=OsNip_02t0147600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0147600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2612875	2613990	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0147600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0147600-01;protein_id=OsNip_02t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2676292	2676609	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0148700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0148700-01;protein_id=OsNip_02t0148700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2676610	2676610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0148700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2722136	2725218	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0149500-01;Parent=gene:OsNip_02g0149500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0149500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2722136	2722240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149500-01;Name=OsNip_02t0149500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0149500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2732117	2735185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149650-01;Name=OsNip_02t0149650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0149650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2735958	2736174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2737533	2738038	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0149750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0149750-00;protein_id=OsNip_02t0149750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2744296	2747428	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0149800;Name=OsNip_PP2C10;biotype=protein_coding;description=Stress-responsive;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2744296	2747428	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0149800-01;Parent=gene:OsNip_02g0149800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2744296	2744356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2744296	2744583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;Name=OsNip_02t0149800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0149800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2744357	2744583	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0149800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;protein_id=OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2745336	2745463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;Name=OsNip_02t0149800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0149800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2745336	2745463	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0149800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;protein_id=OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2745555	2745653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;Name=OsNip_02t0149800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0149800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2745555	2745653	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0149800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;protein_id=OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2745744	2745902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;Name=OsNip_02t0149800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0149800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2745744	2745902	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0149800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0149800-01;protein_id=OsNip_02t0149800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2774522	2774685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150200-01;Name=OsNip_02t0150200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0150200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2774546	2774685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2772273	2773531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150200-02;Tag=IsoSeq:G2688.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2077.7;prot_id "UniRef90_A0A1E5UWD4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2773031	2773261	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0150250-00;Parent=transcript:OsNip_02t0150250-00;protein_id=OsNip_02t0150250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2776450	2777557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2777558	2777837	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0150300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0150300-01;protein_id=OsNip_02t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2777917	2778368	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0150300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0150300-01;protein_id=OsNip_02t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2778847	2779281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150300-01;Name=OsNip_02t0150300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0150300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	2795140	2795406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150700-01;Name=OsNip_02t0150700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0150700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	2795195	2795269	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0150700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0150700-02;protein_id=OsNip_02t0150700-02;Tag=IsoSeq:G2690.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1628.2;prot_id "UniRef90_A0A068UDP5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	2795132	2795194	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150700-02;Tag=IsoSeq:G2690.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1628.2;prot_id "UniRef90_A0A068UDP5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	2795273	2795459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150700-02;Tag=IsoSeq:G2690.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1628.2;prot_id "UniRef90_A0A068UDP5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2798816	2803581	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0150800-01;Parent=gene:OsNip_02g0150800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2798816	2799023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2798816	2799295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;Name=OsNip_02t0150800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0150800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2799024	2799295	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0150800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;protein_id=OsNip_02t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2801421	2803020	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0150800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;protein_id=OsNip_02t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2801421	2803581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;Name=OsNip_02t0150800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0150800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2803021	2803581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	2804376	2807635	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0150900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	2804376	2807576	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0150900-03;Parent=gene:OsNip_02g0150900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0150900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2804376	2804694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2804376	2804731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150900-03;Name=OsNip_02t0150900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0150900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2804695	2804731	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0150900-03;Parent=transcript:OsNip_02t0150900-03;protein_id=OsNip_02t0150900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	2805108	2806033	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0150900-03;Parent=transcript:OsNip_02t0150900-03;protein_id=OsNip_02t0150900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	2805108	2806088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0150900-03;Name=OsNip_02t0150900-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0150900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3117056	3117428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t015709A-01;Tag=IsoSeq:G2707.1;Source=Nipponbare.leaf_G1255.1;prot_id "UniRef90_UPI00188E327D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3134572	3134985	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0157400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0157400-01;protein_id=OsNip_02t0157400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	3133149	3135078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157400-02;Tag=IsoSeq:G2708.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1256.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9H1Y4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3132748	3132924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157400-02;Tag=IsoSeq:G2708.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1256.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9H1Y4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3142378	3142467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-01;Name=OsNip_02t0157600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0157600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3142294	3142366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3142294	3142467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Name=OsNip_02t0157600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0157600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3142367	3142467	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0157600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;protein_id=OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3142671	3142747	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0157600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;protein_id=OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3142900	3142970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Name=OsNip_02t0157600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0157600-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3142900	3142970	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0157600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;protein_id=OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3143583	3143636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Name=OsNip_02t0157600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0157600-01-E5;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3143583	3143636	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0157600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;protein_id=OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3143733	3143819	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0157600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;protein_id=OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3143733	3144660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Name=OsNip_02t0157600-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0157600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3143820	3144660	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3144129	3152702	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0157700;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3144129	3144623	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0157700-01;Parent=gene:OsNip_02g0157700;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0157700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3144129	3144623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0157700-01;Name=OsNip_02t0157700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0157700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3164098	3165177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t015809A-03;Tag=IsoSeq:G2711.3;Source=Nipponbare.panicle_G2095.2,Nipponbare.root_G1639.3;prot_id "UniRef90_A3A3B9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3166617	3166765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3166617	3166906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158100-02;Name=OsNip_02t0158100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0158100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3166766	3166906	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0158100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0158100-02;protein_id=OsNip_02t0158100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3166617	3170816	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0158100-01;Parent=gene:OsNip_02g0158100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0158100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3166617	3166765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3182341	3182746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158300-01;Name=OsNip_02t0158300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0158300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3182498	3182746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3179578	3182639	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0158350-00;Parent=gene:OsNip_02g0158350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0158350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3179578	3180275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;Name=OsNip_02t0158350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0158350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3179578	3180275	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0158350-00;Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;protein_id=OsNip_02t0158350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3180928	3180996	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0158350-00;Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;protein_id=OsNip_02t0158350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3180928	3181164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;Name=OsNip_02t0158350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0158350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3180997	3181164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3182345	3182639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;Name=OsNip_02t0158350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0158350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3182345	3182639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3182926	3187016	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0158400;biotype=protein_coding;description=ssDNA-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3182926	3187016	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0158400-01;Parent=gene:OsNip_02g0158400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0158400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3182926	3183314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3182926	3183434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158400-01;Name=OsNip_02t0158400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0158400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3201292	3201435	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0158800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0158800-01;protein_id=OsNip_02t0158800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3202907	3203104	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158800-02;Tag=IsoSeq:G2715.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2098.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3205448	3206332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0158900-01;Name=OsNip_02t0158900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0158900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3207416	3207659	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0159000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0159000-00;protein_id=OsNip_02t0159000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3207935	3208254	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0159000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0159000-00;protein_id=OsNip_02t0159000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3207935	3208323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0159000-00;Name=OsNip_02t0159000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0159000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3208255	3208323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0159000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3212238	3212687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0159100-00;Name=OsNip_02t0159100-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0159100-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3237851	3237982	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0160000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0160000-01;protein_id=OsNip_02t0160000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	mRNA	3237587	3249790	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0160000-02;Parent=gene:OsNip_02g0160000;transcript_id=OsNip_02t0160000-02;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1
Chr02	TAMA	exon	3249604	3249790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	3249604	3249790	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0160000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;protein_id=OsNip_02t0160000-02;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	3248960	3249502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	3249372	3249502	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0160000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;protein_id=OsNip_02t0160000-02;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	exon	3248565	3248682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	3248211	3248413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	3247982	3248089	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	3247386	3247487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0160000-02;Name=OsNip_02t0160000-02;exon_id=OsNip_02t0160000-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G2718.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2101.1;prot_id "UniRef90_A0A453NEC0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3580321	3580631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0166600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3580321	3581706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0166600-01;Name=OsNip_02t0166600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0166600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3580632	3581042	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0166600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0166600-01;protein_id=OsNip_02t0166600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3581043	3581706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0166600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	3581320	3581720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0166600-02;Name=OsNip_02t0166600-02;exon_id=OsNip_02t0166600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2741.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1657.1,Nipponbare.panicle_G2116.1;prot_id "UniRef90_Q6H4W7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	mRNA	3607089	3610224	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0167000-01;Parent=gene:OsNip_02g0167000;transcript_id=OsNip_02t0167000-01;Tag=IsoSeq:G2742.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1658.1
Chr02	TAMA	exon	3607089	3607516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167000-01;Name=OsNip_02t0167000-01;exon_id=OsNip_02t0167000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2742.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1658.1;prot_id "UniRef90_M0TVT5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3619823	3620298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167366-00;Name=OsNip_02t0167366-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0167366-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3621791	3622457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167366-00;Name=OsNip_02t0167366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0167366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3629729	3629918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;Name=OsNip_02t0167500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0167500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3630126	3630202	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0167500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;protein_id=OsNip_02t0167500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3630126	3630467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;Name=OsNip_02t0167500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0167500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3630203	3630467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3631243	3631539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;Name=OsNip_02t0167500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0167500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3631243	3631539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	3623706	3631544	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0167500-02;Parent=gene:OsNip_02g0167500;transcript_id=OsNip_02t0167500-02;Tag=IsoSeq:G2745.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2120.2
Chr02	TAMA	exon	3631243	3631544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-02;Name=OsNip_02t0167500-02;exon_id=OsNip_02t0167500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2745.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2120.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J4Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	3631243	3631543	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0167500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0167500-02;protein_id=OsNip_02t0167500-02;Tag=IsoSeq:G2745.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2120.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J4Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	3630341	3630467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167500-02;Name=OsNip_02t0167500-02;exon_id=OsNip_02t0167500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2745.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2120.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9J4Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3669031	3669323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0167700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3672581	3672989	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0167850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3699418	3699700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168400-02;Tag=IsoSeq:G2749.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1663.1,Nipponbare.panicle_G2124.1,Nipponbare.root_G1663.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9PP26";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3703087	3703369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-02;Name=OsNip_02t0168500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	3703514	3705337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-02;Name=OsNip_02t0168500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3703718	3705043	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0168500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0168500-02;protein_id=OsNip_02t0168500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3705044	3705337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	3705100	3705365	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0168500-03;Parent=gene:OsNip_02g0168500;transcript_id=OsNip_02t0168500-03;Tag=IsoSeq:G2750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1664.1
Chr02	TAMA	exon	3705100	3705365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-03;Name=OsNip_02t0168500-03;exon_id=OsNip_02t0168500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1664.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	3705268	3705339	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0168500-03;Parent=transcript:OsNip_02t0168500-03;protein_id=OsNip_02t0168500-03;Tag=IsoSeq:G2750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1664.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	3705100	3705267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-03;Tag=IsoSeq:G2750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1664.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	3705343	3705365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168500-03;Tag=IsoSeq:G2750.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1664.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3703670	3705482	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0168550;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3703670	3705482	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0168550-00;Parent=gene:OsNip_02g0168550;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0168550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3703670	3705482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168550-00;Name=OsNip_02t0168550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3705886	3709904	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0168600;Name=OsNip_OTU1;biotype=protein_coding;description=Ovarian;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3705886	3709904	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0168600-01;Parent=gene:OsNip_02g0168600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3705886	3706125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3705886	3706169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3706126	3706169	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3706439	3706495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3706439	3706495	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3706737	3706821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3706737	3706821	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3707427	3707475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3707427	3707475	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3707569	3707642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3707569	3707642	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3707778	3707852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3707778	3707852	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3708189	3708243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3708189	3708243	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3708321	3708394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3708321	3708394	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3708610	3708771	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;protein_id=OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3708610	3708808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3708772	3708808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3709752	3709904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Name=OsNip_02t0168600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3709752	3709904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3711186	3713407	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0168700;Name=OsNip_FKBP17-1;biotype=protein_coding;description=Peptidyl-prolyl;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3711186	3713407	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0168700-01;Parent=gene:OsNip_02g0168700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3711186	3711477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3711186	3711603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Name=OsNip_02t0168700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3711478	3711603	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;protein_id=OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3711906	3712022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Name=OsNip_02t0168700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3711906	3712022	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;protein_id=OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3712717	3712839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Name=OsNip_02t0168700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3712717	3712839	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;protein_id=OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3713128	3713403	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0168700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;protein_id=OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3713128	3713407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Name=OsNip_02t0168700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3713404	3713407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	3715361	3718262	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0168800;Name=PBD;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3715361	3718245	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0168800-01;Parent=gene:OsNip_02g0168800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3715361	3715408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3715361	3715578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Name=OsNip_02t0168800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0168800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3715409	3715578	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;protein_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3716306	3716711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Name=OsNip_02t0168800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0168800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3716306	3716711	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;protein_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3716885	3717088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Name=OsNip_02t0168800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3716885	3717088	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;protein_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3717555	3717732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Name=OsNip_02t0168800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0168800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3717555	3717732	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;protein_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3717836	3717954	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0168800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;protein_id=OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	3717836	3718245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Name=OsNip_02t0168800-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0168800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3717955	3718245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	3716056	3718262	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0168800-02;Parent=gene:OsNip_02g0168800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0168800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3716056	3716300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0168800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	3782063	3782175	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0169800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0169800-01;protein_id=OsNip_02t0169800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	3948735	3948813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t017259A-01;Name=OsNip_02t017259A-01-E1;exon_id=OsNip_02t017259A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2769.1;Source=Nipponbare.panicle_G2140.1;prot_id "UniRef90_C5X206";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4014945	4015277	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0173300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0173300-01;protein_id=OsNip_02t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4015278	4015313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	4014845	4015186	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0173401-00;Parent=gene:OsNip_02g0173401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0173401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4014845	4015186	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0173401-00;Parent=transcript:OsNip_02t0173401-00;protein_id=OsNip_02t0173401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	4024691	4028669	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0173500-01;Parent=gene:OsNip_02g0173500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0173500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4024691	4024795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0173500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4024796	4025028	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0173500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0173500-01;protein_id=OsNip_02t0173500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	4044865	4044978	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0173900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0173900-02;protein_id=OsNip_02t0173900-02;Tag=IsoSeq:G2775.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1678.6;prot_id "UniRef90_UPI0012631D8B";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4078499	4078798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0174200-02;Tag=IsoSeq:G2777.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1680.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4080125	4080388	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0174250-00;Parent=transcript:OsNip_02t0174250-00;protein_id=OsNip_02t0174250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4080389	4080739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0174250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4168675	4168831	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0176100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0176100-02;protein_id=OsNip_02t0176100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4390150	4390495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4390496	4390705	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0179200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0179200-01;protein_id=OsNip_02t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	4391584	4391751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179200-01;Name=OsNip_02t0179200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0179200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4391584	4391751	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0179200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0179200-01;protein_id=OsNip_02t0179200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	4412235	4412367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179300-01;Name=OsNip_02t0179300-02-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0179300-02-E11;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	4412469	4412772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179300-01;Name=OsNip_02t0179300-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0179300-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4412469	4412772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4409077	4409078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4409759	4409797	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0179300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0179300-02;protein_id=OsNip_02t0179300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	4423308	4424004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179450-00;Name=OsNip_02t0179450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0179450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4423146	4423333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	4423146	4424225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-01;Name=OsNip_02t0179500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0179500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	4423334	4424023	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0179500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0179500-01;protein_id=OsNip_02t0179500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4424024	4424225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	4421906	4421935	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0179500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;protein_id=OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	CDS	4423366	4424058	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0179500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;protein_id=OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4420053	4420404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4420521	4420610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4421886	4421905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4424062	4424208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0179500-02;Tag=IsoSeq:G2804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2168.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	4499858	4500124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-01;Name=OsNip_02t0180700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0180700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4499924	4500124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	4497121	4497324	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0180700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0180700-02;protein_id=OsNip_02t0180700-02;Tag=IsoSeq:G2811.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1695.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9WMN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4497120	4497120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-02;Tag=IsoSeq:G2811.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1695.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9WMN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4498221	4498576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-02;Tag=IsoSeq:G2811.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1695.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9WMN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4499454	4499613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-02;Tag=IsoSeq:G2811.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1695.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9WMN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4499858	4500125	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180700-02;Tag=IsoSeq:G2811.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1695.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9WMN2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	4500090	4513333	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0180800;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	4500090	4513333	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0180800-01;Parent=gene:OsNip_02g0180800;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0180800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	4500090	4500421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0180800-01;Name=OsNip_02t0180800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0180800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4577936	4578095	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0182200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	4872877	4872957	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-02;Name=OsNip_02t0187800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0187800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4872957	4872957	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	4870168	4872456	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0187800-03;Parent=gene:OsNip_02g0187800;transcript_id=OsNip_02t0187800-03;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1
Chr02	TAMA	exon	4872392	4872456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;Name=OsNip_02t0187800-03;exon_id=OsNip_02t0187800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	4872021	4872248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;Name=OsNip_02t0187800-03;exon_id=OsNip_02t0187800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	4872021	4872126	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0187800-03;Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;protein_id=OsNip_02t0187800-03;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4872392	4872456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	4872127	4872248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	4870168	4870971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0187800-03;Tag=IsoSeq:G2843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2202.1;prot_id "UniRef90_UPI00098DE186";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	4888511	4890272	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0188000;Name=OsNip_UGT84C1;biotype=protein_coding;description=UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	4888511	4890272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0188000-01;Parent=gene:OsNip_02g0188000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0188000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4888511	4888725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0188000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	4888511	4888775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0188000-01;Name=OsNip_02t0188000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0188000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5120501	5120693	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0192100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0192100-01;protein_id=OsNip_02t0192100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5120798	5121357	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0192100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0192100-01;protein_id=OsNip_02t0192100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5120798	5121512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-01;Name=OsNip_02t0192100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5121358	5121512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	5118359	5121925	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0192100-02;Parent=gene:OsNip_02g0192100;transcript_id=OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1
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Chr02	TAMA	exon	5120551	5120693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Name=OsNip_02t0192100-02;exon_id=OsNip_02t0192100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	5120362	5120459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Name=OsNip_02t0192100-02;exon_id=OsNip_02t0192100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	CDS	5118920	5119219	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0192100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;protein_id=OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5120798	5121925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5120551	5120693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5120362	5120459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5119220	5119415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5118359	5118917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192100-02;Tag=IsoSeq:G2864.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1724.1,Nipponbare.panicle_G2220.1,Nipponbare.leaf_G1331.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1AUX6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5118682	5118895	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5118682	5119405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Name=OsNip_02t0192150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5119211	5119405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5120354	5120448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Name=OsNip_02t0192150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5120354	5120448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5120538	5120677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Name=OsNip_02t0192150-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192150-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5120538	5120677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5120778	5121303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Name=OsNip_02t0192150-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192150-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5120778	5121303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5121681	5125735	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0192200-01;Parent=gene:OsNip_02g0192200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5121681	5121950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Name=OsNip_02t0192200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5121681	5121950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5123175	5123187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5123175	5123507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Name=OsNip_02t0192200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0192200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5123188	5123507	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0192200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;protein_id=OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5123578	5125420	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0192200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;protein_id=OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5123578	5125735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Name=OsNip_02t0192200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0192200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5125421	5125735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0192200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5204074	5204613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193425-00;Name=OsNip_02t0193425-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0193425-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5207171	5208022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5208023	5208463	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0193500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0193500-01;protein_id=OsNip_02t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5208464	5208683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	5207147	5208654	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0193500-02;Parent=gene:OsNip_02g0193500;transcript_id=OsNip_02t0193500-02;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2
Chr02	TAMA	exon	5207147	5207417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;Name=OsNip_02t0193500-02;exon_id=OsNip_02t0193500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	5208004	5208654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;Name=OsNip_02t0193500-02;exon_id=OsNip_02t0193500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	5208201	5208338	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0193500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;protein_id=OsNip_02t0193500-02;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5207147	5207417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5208004	5208200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5208342	5208654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193500-02;Tag=IsoSeq:G2868.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2224.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0CH60";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5209234	5212362	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0193600;biotype=protein_coding;description=Mitotic;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5209234	5212362	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0193600-01;Parent=gene:OsNip_02g0193600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0193600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5217698	5218063	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0193732-00;Parent=transcript:OsNip_02t0193732-00;protein_id=OsNip_02t0193732-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5221697	5221796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0193800-01;Name=OsNip_02t0193800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0193800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5280637	5281014	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0194700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0194700-02;protein_id=OsNip_02t0194700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5281456	5281599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0194700-02;Name=OsNip_02t0194700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0194700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	5411302	5411929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196700-01;Name=OsNip_02t0196700-01;exon_id=OsNip_02t0196700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2886.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2239.3;prot_id "UniRef90_A0A1D6QRB7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	exon	5412476	5412783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196700-01;Name=OsNip_02t0196700-01;exon_id=OsNip_02t0196700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2886.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2239.3;prot_id "UniRef90_A0A1D6QRB7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5411406	5411929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196700-01;Tag=IsoSeq:G2886.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2239.3;prot_id "UniRef90_A0A1D6QRB7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5412476	5412783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196700-01;Tag=IsoSeq:G2886.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2239.3;prot_id "UniRef90_A0A1D6QRB7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5413283	5414247	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196700-01;Tag=IsoSeq:G2886.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2239.3;prot_id "UniRef90_A0A1D6QRB7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5411349	5413712	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0196750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5411349	5413712	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0196750-00;Parent=gene:OsNip_02g0196750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0196750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5411349	5411904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0196750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5466878	5467069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197500-02;Tag=IsoSeq:G2890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1741.1,Nipponbare.panicle_G2242.1;prot_id "UniRef90_A0A7N2LZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5466481	5466793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197500-02;Tag=IsoSeq:G2890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1741.1,Nipponbare.panicle_G2242.1;prot_id "UniRef90_A0A7N2LZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5465066	5466005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197500-02;Tag=IsoSeq:G2890.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1741.1,Nipponbare.panicle_G2242.1;prot_id "UniRef90_A0A7N2LZ58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5468648	5469065	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5470066	5470127	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0197600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0197600-01;protein_id=OsNip_02t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5470225	5470353	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0197600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0197600-01;protein_id=OsNip_02t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5470225	5470490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197600-01;Name=OsNip_02t0197600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0197600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5470354	5470490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0197600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5548328	5549534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-01;Name=OsNip_02t0198800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0198800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5548330	5549445	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0198800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0198800-01;protein_id=OsNip_02t0198800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5549446	5549534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	5548057	5549623	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0198800-02;Parent=gene:OsNip_02g0198800;transcript_id=OsNip_02t0198800-02;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3
Chr02	TAMA	exon	5548057	5548209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-02;Name=OsNip_02t0198800-02;exon_id=OsNip_02t0198800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3;prot_id "UniRef90_A0A7N2LJD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	CDS	5548535	5548675	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0198800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0198800-02;protein_id=OsNip_02t0198800-02;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3;prot_id "UniRef90_A0A7N2LJD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5548057	5548209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-02;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3;prot_id "UniRef90_A0A7N2LJD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5548328	5548534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-02;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3;prot_id "UniRef90_A0A7N2LJD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5548679	5549623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198800-02;Tag=IsoSeq:G2899.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2251.3;prot_id "UniRef90_A0A7N2LJD2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5550229	5552064	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0198900;Name=OsNip_RPL7/L12;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5550229	5552064	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0198900-01;Parent=gene:OsNip_02g0198900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0198900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5550229	5550471	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5550229	5551124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198900-01;Name=OsNip_02t0198900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0198900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5550472	5551053	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0198900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0198900-01;protein_id=OsNip_02t0198900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5551054	5551124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0198900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5631540	5632106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0200950-00;Name=OsNip_02t0200950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0200950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5639106	5639314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0201000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5639315	5639685	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0201000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0201000-02;protein_id=OsNip_02t0201000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5753212	5753319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0202800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5753212	5753676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0202800-02;Name=OsNip_02t0202800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0202800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5753320	5753529	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0202800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0202800-02;protein_id=OsNip_02t0202800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	5775899	5776327	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0203300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0203300-01;protein_id=OsNip_02t0203300-01;Tag=IsoSeq:G2919.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2271.1,Nipponbare.root_G1756.1,Nipponbare.leaf_G1357.2;prot_id "UniRef90_A0A0N7KEW3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5775898	5775898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0203300-01;Tag=IsoSeq:G2919.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2271.1,Nipponbare.root_G1756.1,Nipponbare.leaf_G1357.2;prot_id "UniRef90_A0A0N7KEW3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5776331	5777583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0203300-01;Tag=IsoSeq:G2919.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2271.1,Nipponbare.root_G1756.1,Nipponbare.leaf_G1357.2;prot_id "UniRef90_A0A0N7KEW3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5785295	5787370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0203500-01;Name=OsNip_02t0203500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0203500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5785295	5787370	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0203500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0203500-01;protein_id=OsNip_02t0203500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5787723	5788769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0203500-01;Name=OsNip_02t0203500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0203500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5787723	5788769	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0203500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0203500-01;protein_id=OsNip_02t0203500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5824528	5825115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204200-00;Name=OsNip_02t0204200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0204200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5846327	5847294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204500-03;Name=OsNip_02t0204500-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0204500-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5846327	5847294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5863278	5865569	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0204700;Name=OsNip_CYP734A2;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5863278	5863736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;Name=OsNip_02t0204700-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0204700-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5863864	5864281	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0204700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;protein_id=OsNip_02t0204700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5864368	5864618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;Name=OsNip_02t0204700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0204700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5864368	5864618	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0204700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;protein_id=OsNip_02t0204700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5864727	5864950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;Name=OsNip_02t0204700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0204700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5865248	5865569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;Name=OsNip_02t0204700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0204700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5865248	5865569	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0204700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0204700-00;protein_id=OsNip_02t0204700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5907033	5909601	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0205000;biotype=protein_coding;description=Ribosomal;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5907033	5909601	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0205000-01;Parent=gene:OsNip_02g0205000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5907033	5907354	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5907033	5907457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5907355	5907457	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;protein_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5908328	5908461	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5908328	5908461	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;protein_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5908542	5908628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5908542	5908628	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;protein_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5908733	5908924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5908733	5908924	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;protein_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5909036	5909188	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;protein_id=OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5909036	5909215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5909189	5909215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5909492	5909601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Name=OsNip_02t0205000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0205000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5909492	5909601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5910509	5912009	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0205100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5910515	5912009	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0205100-01;Parent=gene:OsNip_02g0205100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0205100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5910515	5911681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5910515	5912009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-01;Name=OsNip_02t0205100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0205100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5911682	5911924	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0205100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0205100-01;protein_id=OsNip_02t0205100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5911925	5912009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	5910509	5912008	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0205100-02;Parent=gene:OsNip_02g0205100;transcript_id=OsNip_02t0205100-02;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1
Chr02	TAMA	exon	5910509	5910640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;Name=OsNip_02t0205100-02;exon_id=OsNip_02t0205100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	5910511	5910640	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0205100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;protein_id=OsNip_02t0205100-02;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	exon	5911749	5912008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;Name=OsNip_02t0205100-02;exon_id=OsNip_02t0205100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	5911749	5911918	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0205100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;protein_id=OsNip_02t0205100-02;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5910509	5910510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5911922	5912008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205100-02;Tag=IsoSeq:G2927.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2276.1,Nipponbare.leaf_G1361.1,Nipponbare.root_G1760.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5912613	5914192	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0205200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5912613	5914192	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0205200-01;Parent=gene:OsNip_02g0205200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0205200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	5932971	5933077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205500-01;Name=OsNip_02t0205500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0205500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5932415	5932832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205500-02;Tag=IsoSeq:G2931.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1764.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5931225	5931659	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0205700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0205700-00;protein_id=OsNip_02t0205700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5931660	5932343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0205700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	gene	5938428	5939388	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g020609A;Tag=IsoSeq:G2932
Chr02	TAMA	mRNA	5938428	5939388	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t020609A-01;Parent=gene:OsNip_02g020609A;transcript_id=OsNip_02t020609A-01;Tag=IsoSeq:G2932.1;Source=Nipponbare.panicle_G2281.1
Chr02	TAMA	exon	5938428	5939388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t020609A-01;Name=OsNip_02t020609A-01-E1;exon_id=OsNip_02t020609A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2932.1;Source=Nipponbare.panicle_G2281.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	5938586	5939386	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t020609A-01;Parent=transcript:OsNip_02t020609A-01;protein_id=OsNip_02t020609A-01;Tag=IsoSeq:G2932.1;Source=Nipponbare.panicle_G2281.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	5939387	5939388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t020609A-01;Tag=IsoSeq:G2932.1;Source=Nipponbare.panicle_G2281.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	5938428	5938583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t020609A-01;Tag=IsoSeq:G2932.1;Source=Nipponbare.panicle_G2281.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5955018	5957276	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0206100;biotype=protein_coding;description=UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5955018	5957276	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0206100-01;Parent=gene:OsNip_02g0206100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0206100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5955018	5955465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;Name=OsNip_02t0206100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0206100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5955018	5955465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5955727	5955762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5955727	5957276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;Name=OsNip_02t0206100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0206100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5955763	5957238	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0206100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;protein_id=OsNip_02t0206100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5957239	5957276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5955466	5957257	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0206100-02;Parent=gene:OsNip_02g0206100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0206100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5955466	5955762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5955466	5957257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-02;Name=OsNip_02t0206100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0206100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5955763	5957238	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0206100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0206100-02;protein_id=OsNip_02t0206100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5957239	5957257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	5965657	5967666	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0206400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	5965657	5967648	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0206400-00;Parent=gene:OsNip_02g0206400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0206400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5965657	5965677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206400-00;Name=OsNip_02t0206400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0206400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	5965657	5965677	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0206400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0206400-00;protein_id=OsNip_02t0206400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	5966890	5967648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206400-00;Name=OsNip_02t0206400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0206400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5996736	5999429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0206833-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6007623	6009551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0207100-01;Name=OsNip_02t0207100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0207100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6017329	6018933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0207400-00;Name=OsNip_02t0207400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0207400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6017329	6018933	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0207400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0207400-00;protein_id=OsNip_02t0207400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	6020675	6021256	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0207500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6205380	6206982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0211100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6206983	6207135	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0211100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0211100-02;protein_id=OsNip_02t0211100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6207760	6207858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0211150-00;Name=OsNip_02t0211150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0211150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6213292	6213687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0211150-00;Name=OsNip_02t0211150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0211150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	6212061	6212890	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0211200-01;Parent=gene:OsNip_02g0211200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0211200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6270427	6270625	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0212500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0212500-01;protein_id=OsNip_02t0212500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6271174	6271229	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0212500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0212500-01;protein_id=OsNip_02t0212500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6271174	6271547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0212500-01;Name=OsNip_02t0212500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0212500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6271230	6271547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0212500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6309982	6310686	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0212975-00;Parent=transcript:OsNip_02t0212975-00;protein_id=OsNip_02t0212975-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	6311651	6313443	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0212900;Name=OsNip_RLCK66;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6311651	6311788	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0212900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0212900-00;protein_id=OsNip_02t0212900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6312270	6312504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0212900-00;Name=OsNip_02t0212900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0212900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6312270	6312504	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0212900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0212900-00;protein_id=OsNip_02t0212900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6312601	6312602	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0212900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0212900-00;protein_id=OsNip_02t0212900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6312601	6312834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0212900-00;Name=OsNip_02t0212900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0212900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6401806	6402186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0214400-01;Name=OsNip_02t0214400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0214400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6452441	6452632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215200-01;Name=OsNip_02t0215200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0215200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6449937	6450145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6450263	6450374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6468567	6469389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6469602	6469934	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0215400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;protein_id=OsNip_02t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6469935	6471430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6472477	6472546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Name=OsNip_02t0215400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0215400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6472477	6472546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6473090	6473301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Name=OsNip_02t0215400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0215400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6473090	6473301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	6468826	6472843	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0215500;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	6468826	6472843	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0215500-01;Parent=gene:OsNip_02g0215500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0215500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6468826	6468948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6468826	6471946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0215500-01;Name=OsNip_02t0215500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0215500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	6577180	6577587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0217600-02;Name=OsNip_02t0217600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0217600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6577436	6577587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0217600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6573100	6573284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0217600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6573100	6573458	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0217600-01;Name=OsNip_02t0217600-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0217600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6573285	6573458	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0217600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0217600-01;protein_id=OsNip_02t0217600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6622802	6622982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0218550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6794716	6795032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0221600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6798568	6799333	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0221800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0221800-00;protein_id=OsNip_02t0221800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6800312	6800414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0221800-00;Name=OsNip_02t0221800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0221800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6800312	6800414	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0221800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0221800-00;protein_id=OsNip_02t0221800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	6925977	6927916	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0223850-01;Parent=gene:OsNip_02g0223850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0223850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6925977	6927155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0223850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6925977	6927916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0223850-01;Name=OsNip_02t0223850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0223850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6927156	6927269	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0223850-01;Parent=transcript:OsNip_02t0223850-01;protein_id=OsNip_02t0223850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6927270	6927916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0223850-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6956599	6956823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0224100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	6956599	6957012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0224100-01;Name=OsNip_02t0224100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0224100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6956824	6957012	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0224100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0224100-01;protein_id=OsNip_02t0224100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	6958361	6959341	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0224100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0224100-01;protein_id=OsNip_02t0224100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7133024	7133382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0227100-01;Name=OsNip_02t0227100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0227100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7133024	7133382	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0227100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0227100-01;protein_id=OsNip_02t0227100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7135476	7135567	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0227200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;protein_id=OsNip_02t0227200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7136872	7136947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;Name=OsNip_02t0227200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0227200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7137282	7137343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;Name=OsNip_02t0227200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0227200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7137282	7137343	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0227200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;protein_id=OsNip_02t0227200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7137846	7137906	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0227200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;protein_id=OsNip_02t0227200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7137846	7137965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;Name=OsNip_02t0227200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0227200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7137907	7137965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0227200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7324460	7324688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0230250-00;Name=OsNip_02t0230250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0230250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7325014	7325155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0230250-00;Name=OsNip_02t0230250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0230250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	7323916	7325174	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0230300;biotype=protein_coding;description=En/Spm-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	7323916	7324292	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0230300-01;Parent=gene:OsNip_02g0230300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0230300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7323916	7324055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0230300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7323916	7324292	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0230300-01;Name=OsNip_02t0230300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0230300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7324056	7324292	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0230300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0230300-01;protein_id=OsNip_02t0230300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	7323953	7325174	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0230300-02;Parent=gene:OsNip_02g0230300;transcript_id=OsNip_02t0230300-02;Tag=IsoSeq:G2995.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2331.3
Chr02	TAMA	exon	7324994	7325174	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0230300-02;Name=OsNip_02t0230300-02;exon_id=OsNip_02t0230300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G2995.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2331.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0JXP9";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7506109	7506180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;Name=OsNip_02t0232500-02-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0232500-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7506109	7506180	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0232500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;protein_id=OsNip_02t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7506588	7506659	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0232500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;protein_id=OsNip_02t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7507115	7507192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;Name=OsNip_02t0232500-02-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0232500-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7508010	7508380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;Name=OsNip_02t0232500-02-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0232500-02-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	7508010	7508380	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0232500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0232500-01;protein_id=OsNip_02t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7575830	7577991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0233566-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	7677319	7677561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235701-00;Name=OsNip_02t0235701-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0235701-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7692007	7692086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7690292	7690814	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235802-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7691253	7691358	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235802-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7691516	7691657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235802-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	7691725	7691985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235802-00;Name=OsNip_02t0235802-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0235802-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7691725	7691985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0235802-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	7706619	7710902	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0236000-01;Parent=gene:OsNip_02g0236000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0236000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7770051	7770159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0236900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8120830	8121651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0244100-01;Name=OsNip_02t0244100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0244100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8121388	8121651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0244100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	8114929	8121645	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0244100-02;Parent=gene:OsNip_02g0244100;transcript_id=OsNip_02t0244100-02;Tag=IsoSeq:G3020.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2351.1
Chr02	TAMA	exon	8114929	8115707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0244100-02;Name=OsNip_02t0244100-02;exon_id=OsNip_02t0244100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3020.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2351.1;prot_id "UniRef90_M0RK83";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8244347	8248444	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0245800-01;Parent=gene:OsNip_02g0245800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8244347	8244484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8244485	8244597	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0245800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;protein_id=OsNip_02t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8244749	8245316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;Name=OsNip_02t0245800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0245800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8244749	8245316	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0245800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;protein_id=OsNip_02t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8245401	8245586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0245800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;protein_id=OsNip_02t0245800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8245992	8246231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;Name=OsNip_02t0245800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0245800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8247490	8247547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0245800-01;Name=OsNip_02t0245800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0245800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8263232	8263292	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0246300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0246300-00;protein_id=OsNip_02t0246300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8265311	8265570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0246300-00;Name=OsNip_02t0246300-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0246300-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8265359	8265570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0246300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	8265311	8265749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0246300-01;Tag=IsoSeq:G3026.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2357.3;prot_id "UniRef90_A0A059C611";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8323988	8324258	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0247100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0247100-00;protein_id=OsNip_02t0247100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8324382	8324946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0247100-00;Name=OsNip_02t0247100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0247100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8324489	8324946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0247100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8492472	8492511	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0250300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0250300-01;protein_id=OsNip_02t0250300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8518211	8518271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0250600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8535236	8535685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0250700-01;Name=OsNip_02t0250700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0250700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8528062	8529234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251200-01;Name=OsNip_02t0251200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0251200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	8536374	8538452	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0251700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8536374	8538452	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0251700-01;Parent=gene:OsNip_02g0251700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8536374	8536544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Name=OsNip_02t0251700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0251700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8536374	8536544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8537373	8537394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8537373	8537821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Name=OsNip_02t0251700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0251700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8537395	8537821	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0251700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;protein_id=OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8538085	8538239	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0251700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;protein_id=OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8538085	8538452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Name=OsNip_02t0251700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0251700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8538240	8538452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0251700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	8539273	8539623	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0251800;Name=OsNip_VQ6;biotype=protein_coding;description=VQ;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8539273	8539623	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0251800-00;Parent=gene:OsNip_02g0251800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0251800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8591759	8591768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0252400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8600080	8600165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0252600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8643576	8643836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253502-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8643576	8644850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253502-00;Name=OsNip_02t0253502-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0253502-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8643837	8644850	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0253502-00;Parent=transcript:OsNip_02t0253502-00;protein_id=OsNip_02t0253502-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	8649792	8650152	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0253601;biotype=protein_coding;description=EF-hand-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8649792	8650152	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0253601-00;Parent=gene:OsNip_02g0253601;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0253601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8649792	8649950	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0253601-00;Parent=transcript:OsNip_02t0253601-00;protein_id=OsNip_02t0253601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8649792	8650152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253601-00;Name=OsNip_02t0253601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0253601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8649951	8650152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	8659226	8660521	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0253700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8659226	8660521	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0253700-01;Parent=gene:OsNip_02g0253700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0253700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8659226	8659346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8659226	8659810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;Name=OsNip_02t0253700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0253700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8659347	8659810	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0253700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;protein_id=OsNip_02t0253700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8659899	8660174	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;Name=OsNip_02t0253700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0253700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8659899	8660174	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0253700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;protein_id=OsNip_02t0253700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8660266	8660419	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0253700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;protein_id=OsNip_02t0253700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8660266	8660521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0253700-01;Name=OsNip_02t0253700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0253700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	8715049	8715049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0254600-02;Tag=IsoSeq:G3042.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2370.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9H7L8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	8714217	8714917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0254600-02;Tag=IsoSeq:G3042.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2370.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9H7L8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	8726682	8730657	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0254700;Name=OsNip_SPMS2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8728852	8728866	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0254700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0254700-01;protein_id=OsNip_02t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8728988	8729017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0254700-01;Name=OsNip_02t0254700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0254700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8728988	8729017	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0254700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0254700-01;protein_id=OsNip_02t0254700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8811034	8811035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0255700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8820642	8820960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0255700-01;Name=OsNip_02t0255700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0255700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8820712	8820960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0255700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8854327	8854535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0256800-00;Name=OsNip_02t0256800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0256800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8857507	8857542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0257001-00;Name=OsNip_02t0257001-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0257001-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	8869192	8871520	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0257200-01;Parent=gene:OsNip_02g0257200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0257200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8869192	8869382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0257200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8869357	8869491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0257250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8939626	8941663	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0258300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0258300-01;protein_id=OsNip_02t0258300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	8943195	8943482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258300-01;Name=OsNip_02t0258300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0258300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8943346	8943482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8973633	8973731	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8973633	8974051	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;Name=OsNip_02t0258800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0258800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	8973732	8974016	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0258800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;protein_id=OsNip_02t0258800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8974017	8974051	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	8977089	8977322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;Name=OsNip_02t0258800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0258800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8977089	8977322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	8973630	8974478	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0258800-02;Parent=gene:OsNip_02g0258800;transcript_id=OsNip_02t0258800-02;Tag=IsoSeq:G3056.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2379.1,Nipponbare.leaf_G1411.1,Nipponbare.root_G1833.2,Nipponbare.panicle_G2379.2
Chr02	TAMA	exon	8973630	8974478	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-02;Name=OsNip_02t0258800-02;exon_id=OsNip_02t0258800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3056.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2379.1,Nipponbare.leaf_G1411.1,Nipponbare.root_G1833.2,Nipponbare.panicle_G2379.2;prot_id "UniRef90_A0A3B6TMR2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	CDS	8974147	8974257	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0258800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0258800-02;protein_id=OsNip_02t0258800-02;Tag=IsoSeq:G3056.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2379.1,Nipponbare.leaf_G1411.1,Nipponbare.root_G1833.2,Nipponbare.panicle_G2379.2;prot_id "UniRef90_A0A3B6TMR2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	8973630	8974146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0258800-02;Tag=IsoSeq:G3056.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2379.1,Nipponbare.leaf_G1411.1,Nipponbare.root_G1833.2,Nipponbare.panicle_G2379.2;prot_id "UniRef90_A0A3B6TMR2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	9116165	9116268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0261100-01;Name=OsNip_02t0261100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0261100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	9117182	9117309	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0261100-01;Name=OsNip_02t0261100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0261100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9241029	9242050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0262600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9257998	9258105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0262800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9262291	9262307	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0262800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9262415	9262614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0262800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	9288823	9290817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0263432-00;Name=OsNip_02t0263432-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0263432-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9288823	9290817	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0263432-00;Parent=transcript:OsNip_02t0263432-00;protein_id=OsNip_02t0263432-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	9391326	9393829	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0264300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	9391326	9391717	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0264300-02;Parent=gene:OsNip_02g0264300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0264300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9391424	9391820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9391424	9392312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;Name=OsNip_02t0264300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0264300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9391821	9392312	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0264300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;protein_id=OsNip_02t0264300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9393302	9393661	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0264300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;protein_id=OsNip_02t0264300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9393302	9393829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;Name=OsNip_02t0264300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0264300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9393662	9393829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	9393288	9393813	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0264501-00;Parent=gene:OsNip_02g0264501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0264501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9393288	9393301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9393288	9393813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264501-00;Name=OsNip_02t0264501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0264501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9393302	9393781	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0264501-00;Parent=transcript:OsNip_02t0264501-00;protein_id=OsNip_02t0264501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9393782	9393813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0264501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9536288	9536363	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0266800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;protein_id=OsNip_02t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9536519	9536678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;Name=OsNip_02t0266800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0266800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	9536976	9537081	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;Name=OsNip_02t0266800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0266800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9536976	9537081	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0266800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;protein_id=OsNip_02t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9538127	9538300	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0266800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;protein_id=OsNip_02t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9538127	9538420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266800-01;Name=OsNip_02t0266800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0266800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9541034	9541035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9541034	9542540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266900-01;Name=OsNip_02t0266900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0266900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9541036	9541287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0266900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0266900-01;protein_id=OsNip_02t0266900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9541288	9542540	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0266900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	9544181	9550655	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0267000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	9544181	9550570	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0267000-01;Parent=gene:OsNip_02g0267000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9544181	9544312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9544181	9544774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9544313	9544774	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9548124	9548192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9548124	9548192	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9548284	9548352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9548284	9548352	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9549238	9549324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9549238	9549324	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9549929	9549996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9549929	9549996	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9550094	9550235	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0267000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;protein_id=OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9550094	9550570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Name=OsNip_02t0267000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0267000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9550236	9550570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	9550368	9550655	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0267000-02;Parent=gene:OsNip_02g0267000;transcript_id=OsNip_02t0267000-02;Tag=IsoSeq:G3071.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1421.1
Chr02	TAMA	exon	9550368	9550655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-02;Name=OsNip_02t0267000-02;exon_id=OsNip_02t0267000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3071.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1421.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	9550369	9550488	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0267000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0267000-02;protein_id=OsNip_02t0267000-02;Tag=IsoSeq:G3071.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1421.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	9550368	9550368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-02;Tag=IsoSeq:G3071.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1421.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	9550492	9550655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267000-02;Tag=IsoSeq:G3071.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1421.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	9551864	9553485	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0267200;Name=OsNip_EXPA13;biotype=protein_coding;description=Alpha-expansin;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	9551864	9553485	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0267200-00;Parent=gene:OsNip_02g0267200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0267200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9551864	9551951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9551864	9552427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;Name=OsNip_02t0267200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0267200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9551952	9552427	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0267200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;protein_id=OsNip_02t0267200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	9552868	9553180	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0267200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;protein_id=OsNip_02t0267200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	9552868	9553485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;Name=OsNip_02t0267200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0267200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9553181	9553485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0267200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	9552146	9553195	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0267350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	9552146	9553195	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0267350-00;Parent=gene:OsNip_02g0267350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0267350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9651685	9651826	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0269400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	9914553	9915197	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0272800-02;Tag=IsoSeq:G3083.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2403.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	10055454	10056434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0274700-01;Name=OsNip_02t0274700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0274700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10056190	10056434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0274700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	10265971	10266551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0278450-00;Name=OsNip_02t0278450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0278450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10266103	10266551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0278450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	10277066	10277178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0278700-01;Name=OsNip_02t0278700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0278700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	10332436	10332617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279600-00;Name=OsNip_02t0279600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0279600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10332569	10332617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10333414	10333765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	10338762	10342350	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0279800-01;Parent=gene:OsNip_02g0279800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0279800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10338762	10338762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	10338762	10339025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279800-01;Name=OsNip_02t0279800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0279800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10338763	10339025	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0279800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0279800-01;protein_id=OsNip_02t0279800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10341818	10341824	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0279800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0279800-01;protein_id=OsNip_02t0279800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	10341818	10342350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0279800-01;Name=OsNip_02t0279800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0279800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10439922	10439990	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0281150-01;Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;protein_id=OsNip_02t0281150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	10440062	10440167	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;Name=OsNip_02t0281150-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0281150-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10440062	10440167	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0281150-01;Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;protein_id=OsNip_02t0281150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10440474	10440539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0281150-01;Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;protein_id=OsNip_02t0281150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	10440474	10440764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;Name=OsNip_02t0281150-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0281150-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10440540	10440764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0281150-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	10437388	10437575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0281150-02;Name=OsNip_02t0281150-02;exon_id=OsNip_02t0281150-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3107.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2421.1,Nipponbare.root_G1858.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0B7Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	10437389	10437575	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0281150-02;Parent=transcript:OsNip_02t0281150-02;protein_id=OsNip_02t0281150-02;Tag=IsoSeq:G3107.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2421.1,Nipponbare.root_G1858.3;prot_id "UniRef90_A0A2I0B7Q9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10787293	10787748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0286891-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10788906	10789508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0286891-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	10897365	10897967	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0288600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0288600-01;protein_id=OsNip_02t0288600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10897968	10897969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0288600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	10897255	10901952	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0288600-02;Parent=gene:OsNip_02g0288600;transcript_id=OsNip_02t0288600-02;Tag=IsoSeq:G3117.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2427.7
Chr02	TAMA	exon	10901524	10901952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0288600-02;Name=OsNip_02t0288600-02;exon_id=OsNip_02t0288600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3117.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2427.7;prot_id "UniRef90_A0A3B6PHW4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	CDS	10898576	10898674	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0288600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0288600-02;protein_id=OsNip_02t0288600-02;Tag=IsoSeq:G3117.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2427.7;prot_id "UniRef90_A0A3B6PHW4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	11162557	11166291	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0293500-01;Parent=gene:OsNip_02g0293500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0293500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11163416	11163571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0293500-01;Name=OsNip_02t0293500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0293500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11165079	11165201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0293500-01;Name=OsNip_02t0293500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0293500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11165079	11165201	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0293500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0293500-01;protein_id=OsNip_02t0293500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11768211	11768547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0303000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11776407	11776925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0303200-01;Name=OsNip_02t0303200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0303200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	11798895	11799847	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0303500;biotype=protein_coding;description=Eggshell;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	11798895	11799847	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0303500-01;Parent=gene:OsNip_02g0303500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11798895	11799155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11799156	11799812	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0303500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0303500-01;protein_id=OsNip_02t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11799813	11799847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0303500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	11866004	11869802	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0304500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	11866004	11869802	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0304500-00;Parent=gene:OsNip_02g0304500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11866004	11866606	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0304500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0304500-00;protein_id=OsNip_02t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11868730	11869053	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0304500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0304500-00;protein_id=OsNip_02t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11869164	11869802	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0304500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0304500-00;protein_id=OsNip_02t0304500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11885617	11885861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0304900-01;Name=OsNip_02t0304900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0304900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11941431	11941766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305600-01;Name=OsNip_02t0305600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0305600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	11944408	11944673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Name=OsNip_02t0305800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0305800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11944408	11944673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11948143	11948150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11948151	11948206	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0305800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;protein_id=OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	11949252	11949324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Name=OsNip_02t0305800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0305800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11949252	11949324	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0305800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;protein_id=OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	11949447	11949502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Name=OsNip_02t0305800-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0305800-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11949447	11949502	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0305800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;protein_id=OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	11949594	11949720	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0305800-00;Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;protein_id=OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	11949594	11949922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Name=OsNip_02t0305800-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0305800-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11949721	11949922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0305800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	11944391	11949946	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0305800-01;Parent=gene:OsNip_02g0305800;transcript_id=OsNip_02t0305800-01;Tag=IsoSeq:G3151.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1450.1
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12057458	12059380	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0307300-01;Name=OsNip_02t0307300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0307300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12088900	12089349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0307800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12086040	12086060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0307800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12086040	12086399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0307800-02;Name=OsNip_02t0307800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0307800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12086061	12086399	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0307800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0307800-02;protein_id=OsNip_02t0307800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	12164165	12164676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t031019A-01;Name=OsNip_02t031019A-01-E1;exon_id=OsNip_02t031019A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3160.1;Source=Nipponbare.panicle_G2461.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	12164165	12164191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t031019A-01;Tag=IsoSeq:G3160.1;Source=Nipponbare.panicle_G2461.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12185506	12187024	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0310200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12185506	12187024	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0310200-01;Parent=gene:OsNip_02g0310200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0310200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12185506	12185819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0310200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12186732	12187024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0310200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12188660	12189220	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0310400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0310400-01;protein_id=OsNip_02t0310400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12320468	12320661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0312550-00;Name=OsNip_02t0312550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0312550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12320468	12320661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0312550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12321698	12321801	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0312550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0312550-00;protein_id=OsNip_02t0312550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12324596	12324765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0312600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12450783	12452032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314400-01;Name=OsNip_02t0314400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0314400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12452356	12452456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314400-01;Name=OsNip_02t0314400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0314400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12464431	12466397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314600-01;Name=OsNip_02t0314600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0314600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12464564	12466108	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0314600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0314600-01;protein_id=OsNip_02t0314600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12466109	12466397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12490271	12493553	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0315200;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12490271	12493553	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0315200-00;Parent=gene:OsNip_02g0315200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0315200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12490271	12490561	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0315200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0315200-00;protein_id=OsNip_02t0315200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12492862	12493479	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0315200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0315200-00;protein_id=OsNip_02t0315200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12492862	12493553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0315200-00;Name=OsNip_02t0315200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0315200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12493480	12493553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0315200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12491942	12493673	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0314925;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12491942	12493673	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0314925-00;Parent=gene:OsNip_02g0314925;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0314925-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12491942	12492281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314925-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12491942	12492360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0314925-00;Name=OsNip_02t0314925-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0314925-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12492282	12492360	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0314925-00;Parent=transcript:OsNip_02t0314925-00;protein_id=OsNip_02t0314925-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12600520	12601431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317300-01;Name=OsNip_02t0317300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0317300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12600792	12601431	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0317300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317300-01;protein_id=OsNip_02t0317300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12603783	12604129	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0317300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317300-01;protein_id=OsNip_02t0317300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12603783	12604151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317300-01;Name=OsNip_02t0317300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0317300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12604130	12604151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12609112	12613259	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0317400;biotype=protein_coding;description=Longin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12609112	12611253	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0317400-02;Parent=gene:OsNip_02g0317400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0317400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12609112	12609225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317400-02;Name=OsNip_02t0317400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0317400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12609112	12609225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12614034	12614259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12618072	12618379	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0317500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317500-01;protein_id=OsNip_02t0317500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12618072	12618437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317500-01;Name=OsNip_02t0317500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0317500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12620372	12620778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317600-00;Name=OsNip_02t0317600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0317600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12623541	12623603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317600-00;Name=OsNip_02t0317600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0317600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12623541	12623603	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0317600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0317600-00;protein_id=OsNip_02t0317600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12624100	12624397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317600-00;Name=OsNip_02t0317600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0317600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	12620374	12625515	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0317700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12620374	12620445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12620374	12620966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-02;Name=OsNip_02t0317700-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0317700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12621224	12622331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-02;Name=OsNip_02t0317700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0317700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12621324	12622331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12620374	12625515	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0317700-01;Parent=gene:OsNip_02g0317700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12620374	12620445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12620374	12620966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Name=OsNip_02t0317700-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0317700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12620446	12620966	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0317700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;protein_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12621224	12621302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Name=OsNip_02t0317700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0317700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12621224	12621302	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0317700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;protein_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12624440	12624505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Name=OsNip_02t0317700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0317700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12624440	12624505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0317700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;protein_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12624956	12625024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Name=OsNip_02t0317700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0317700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12624956	12625024	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0317700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;protein_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12625207	12625215	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0317700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;protein_id=OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12625207	12625515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Name=OsNip_02t0317700-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0317700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12625216	12625515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12630108	12633482	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0317800-01;Parent=gene:OsNip_02g0317800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0317800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12630108	12630305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0317800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12726873	12726941	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0319100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0319100-01;protein_id=OsNip_02t0319100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12727393	12727572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319100-01;Name=OsNip_02t0319100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0319100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12727393	12727572	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0319100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0319100-01;protein_id=OsNip_02t0319100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12728430	12728873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319100-01;Name=OsNip_02t0319100-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0319100-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12728529	12728873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12731586	12735325	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0319300;biotype=protein_coding;description=Glutathione;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12731587	12732144	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0319300-01;Parent=gene:OsNip_02g0319300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12731587	12731908	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12731587	12732144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-01;Name=OsNip_02t0319300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0319300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12731909	12732142	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0319300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0319300-01;protein_id=OsNip_02t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12732143	12732144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	12731586	12735325	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0319300-02;Parent=gene:OsNip_02g0319300;transcript_id=OsNip_02t0319300-02;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1
Chr02	TAMA	exon	12734807	12735325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	12734480	12734692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	12734206	12734382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	12733873	12734097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	12733660	12733788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	12731586	12732142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Name=OsNip_02t0319300-02;exon_id=OsNip_02t0319300-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	12731618	12731776	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0319300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;protein_id=OsNip_02t0319300-02;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	12734480	12734692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0319300-02;Tag=IsoSeq:G3182.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2479.1,Nipponbare.root_G1898.1,Nipponbare.leaf_G1464.1;prot_id "UniRef90_A0A061GEJ2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12755791	12755804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12760355	12760552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;Name=OsNip_02t0320100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0320100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12761027	12761117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;Name=OsNip_02t0320100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0320100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12761470	12761614	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0320100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;protein_id=OsNip_02t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12761741	12761859	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0320100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;protein_id=OsNip_02t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12761741	12762205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;Name=OsNip_02t0320100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0320100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12761860	12762205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12765282	12772010	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0320300-01;Parent=gene:OsNip_02g0320300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0320300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12765282	12765344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12765282	12765567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320300-01;Name=OsNip_02t0320300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0320300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12765345	12765567	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0320300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0320300-01;protein_id=OsNip_02t0320300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12790361	12790746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0320800-01;Name=OsNip_02t0320800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0320800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12813672	12813740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	12850803	12850956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321500-01;Name=OsNip_02t0321500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0321500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12850881	12850956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12851130	12851443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321500-01;Name=OsNip_02t0321500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0321500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12851130	12851443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12852011	12852961	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0321600-01;Parent=gene:OsNip_02g0321600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0321600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12852011	12852121	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12852011	12852508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321600-01;Name=OsNip_02t0321600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0321600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12872124	12872315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	12872070	12872145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321900-03;Tag=IsoSeq:G3186.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1901.4;prot_id "UniRef90_A0A0D3EWJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	12872347	12872351	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0321900-03;Tag=IsoSeq:G3186.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1901.4;prot_id "UniRef90_A0A0D3EWJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12893592	12894722	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0322251-00;Parent=gene:OsNip_02g0322251;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0322251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12893592	12894720	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0322251-00;Parent=transcript:OsNip_02t0322251-00;protein_id=OsNip_02t0322251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12893592	12894722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0322251-00;Name=OsNip_02t0322251-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0322251-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12894721	12894722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0322251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12893632	12894978	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0322400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	12893632	12894978	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0322400-00;Parent=gene:OsNip_02g0322400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0322400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	12893632	12894978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0322400-00;Name=OsNip_02t0322400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0322400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	12893632	12894978	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0322400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0322400-00;protein_id=OsNip_02t0322400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	12903043	12905272	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0322500;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	12970865	12972127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0323600-02;Tag=IsoSeq:G3188.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1466.1;prot_id "UniRef90_Q8GTY5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13007343	13007405	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0324300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0324300-01;protein_id=OsNip_02t0324300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	13097648	13098218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-01;Name=OsNip_02t0325600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0325600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13098032	13098218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13096207	13096352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13096207	13096488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;Name=OsNip_02t0325600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0325600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	13096575	13096894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;Name=OsNip_02t0325600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0325600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13097460	13097536	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0325600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;protein_id=OsNip_02t0325600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13097648	13098031	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0325600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;protein_id=OsNip_02t0325600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13097648	13098218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;Name=OsNip_02t0325600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0325600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13098032	13098218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	13096363	13097514	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0325800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	13096363	13097514	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0325800-00;Parent=gene:OsNip_02g0325800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0325800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13096363	13096479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13096363	13096874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0325800-00;Name=OsNip_02t0325800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0325800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13173784	13173977	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0327000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	13181387	13181467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0327100-02;Tag=IsoSeq:G3198.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1910.1,Nipponbare.panicle_G2491.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0G5U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	13179050	13179324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0327100-02;Tag=IsoSeq:G3198.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1910.1,Nipponbare.panicle_G2491.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0G5U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13200997	13201665	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0327500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0327500-01;protein_id=OsNip_02t0327500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13202870	13203520	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0327500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0327500-01;protein_id=OsNip_02t0327500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13202870	13203751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0327500-01;Name=OsNip_02t0327500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0327500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13203521	13203751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0327500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	13223120	13224084	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0327700-03;Parent=gene:OsNip_02g0327700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0327700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	13294746	13294855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0328525-00;Name=OsNip_02t0328525-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0328525-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	13301504	13301900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0328550-00;Name=OsNip_02t0328550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0328550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	13302040	13302143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0328550-00;Name=OsNip_02t0328550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0328550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13302040	13302143	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0328550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0328550-00;protein_id=OsNip_02t0328550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	13312123	13315987	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0328600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13315495	13315987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0328600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13349865	13350322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0329300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13418171	13418265	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0330400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13418599	13419832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0330400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13495411	13495697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0331200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13495981	13496085	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0331200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0331200-01;protein_id=OsNip_02t0331200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13496486	13497771	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0331200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0331200-01;protein_id=OsNip_02t0331200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13496486	13498068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0331200-01;Name=OsNip_02t0331200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0331200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13606011	13606083	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0332700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13606775	13606776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0332800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	13606775	13607499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0332800-02;Name=OsNip_02t0332800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0332800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	13606777	13607235	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0332800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0332800-02;protein_id=OsNip_02t0332800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13607236	13607499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0332800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	14557678	14557873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-01;Name=OsNip_02t0448600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0448600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	14557678	14557873	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0448600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0448600-01;protein_id=OsNip_02t0448600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	14558537	14559122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-01;Name=OsNip_02t0448600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0448600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14558800	14559122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	14557083	14559096	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0448600-02;Parent=gene:OsNip_02g0448600;transcript_id=OsNip_02t0448600-02;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1
Chr02	TAMA	exon	14557083	14557873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;Name=OsNip_02t0448600-02;exon_id=OsNip_02t0448600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	14557085	14557213	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0448600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;protein_id=OsNip_02t0448600-02;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	14558537	14559096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;Name=OsNip_02t0448600-02;exon_id=OsNip_02t0448600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	14557083	14557084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	14557217	14557873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	14558537	14559096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0448600-02;Tag=IsoSeq:G3238.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2512.2,Nipponbare.root_G1930.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F006";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	14681077	14684806	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0450000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	14681077	14684806	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0450000-01;Parent=gene:OsNip_02g0450000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0450000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14681077	14681980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0450000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	14681077	14684806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0450000-01;Name=OsNip_02t0450000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0450000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	14681981	14684413	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0450000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0450000-01;protein_id=OsNip_02t0450000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14684414	14684806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0450000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	14682426	14684806	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0450000-02;Parent=gene:OsNip_02g0450000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0450000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14682426	14682427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0450000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	14682426	14684806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0450000-02;Name=OsNip_02t0450000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0450000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	14682428	14684413	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0450000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0450000-02;protein_id=OsNip_02t0450000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14974424	14974598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0453100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	14979099	14982717	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0453300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	14979099	14982717	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0453300-02;Parent=gene:OsNip_02g0453300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0453300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15134001	15134819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0455900-00;Name=OsNip_02t0455900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0455900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15141481	15141796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15141481	15143539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-01;Name=OsNip_02t0456000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0456000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15141797	15143482	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0456000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0456000-01;protein_id=OsNip_02t0456000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15143483	15143539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	15138859	15143570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0456000-02;Parent=gene:OsNip_02g0456000;transcript_id=OsNip_02t0456000-02;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3
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Chr02	TAMA	CDS	15142855	15143568	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0456000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0456000-02;protein_id=OsNip_02t0456000-02;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3;prot_id "UniRef90_A0A2P5FHD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	15138859	15139655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-02;Name=OsNip_02t0456000-02;exon_id=OsNip_02t0456000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3;prot_id "UniRef90_A0A2P5FHD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	15143569	15143570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-02;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3;prot_id "UniRef90_A0A2P5FHD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	15141827	15142852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-02;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3;prot_id "UniRef90_A0A2P5FHD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	15138859	15139655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456000-02;Tag=IsoSeq:G3244.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G1933.2,Nipponbare.panicle_G2516.3;prot_id "UniRef90_A0A2P5FHD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15151364	15153319	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0456100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15151364	15153319	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0456100-01;Parent=gene:OsNip_02g0456100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15151364	15151394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15151364	15151734	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Name=OsNip_02t0456100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0456100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15151395	15151734	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0456100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;protein_id=OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15151848	15152101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Name=OsNip_02t0456100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0456100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15151848	15152101	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0456100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;protein_id=OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15152219	15152641	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0456100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;protein_id=OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15152219	15152698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Name=OsNip_02t0456100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0456100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15152642	15152698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15152796	15153319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Name=OsNip_02t0456100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0456100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15152796	15153319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15153796	15172440	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0456500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15153796	15172431	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0456500-01;Parent=gene:OsNip_02g0456500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0456500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15153796	15154037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456500-01;Name=OsNip_02t0456500-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0456500-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15153796	15154037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15154356	15154439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0456500-01;Name=OsNip_02t0456500-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0456500-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15233137	15233445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15233137	15235011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Name=OsNip_02t0457500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0457500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15235473	15235610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Name=OsNip_02t0457500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0457500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15235473	15235610	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0457500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;protein_id=OsNip_02t0457500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15235714	15235989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Name=OsNip_02t0457500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0457500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15238358	15238705	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0457500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;protein_id=OsNip_02t0457500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15238358	15238844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Name=OsNip_02t0457500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0457500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15238706	15238844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15233548	15233614	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15233548	15234999	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;Name=OsNip_02t0457600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0457600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15233615	15233974	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0457600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;protein_id=OsNip_02t0457600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15233975	15234999	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15236398	15236984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;Name=OsNip_02t0457600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0457600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15236398	15236984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0457600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15263803	15283324	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0458100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15263803	15283324	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0458100-01;Parent=gene:OsNip_02g0458100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15263803	15264278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15263803	15264278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15264445	15264692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15264445	15264692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15275761	15275781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15275761	15275845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15275782	15275845	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;protein_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15281556	15281774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15281556	15281774	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;protein_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15281851	15282217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15281851	15282217	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;protein_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15282402	15282657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15282402	15282657	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;protein_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15283053	15283322	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;protein_id=OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15283053	15283324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Name=OsNip_02t0458100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0458100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15283323	15283324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15310546	15324161	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0458900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15310546	15310978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;Name=OsNip_02t0458900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0458900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15310546	15310978	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0458900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;protein_id=OsNip_02t0458900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15323321	15323803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;Name=OsNip_02t0458900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0458900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15323321	15323803	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0458900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;protein_id=OsNip_02t0458900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15323935	15324131	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0458900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;protein_id=OsNip_02t0458900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15323935	15324161	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;Name=OsNip_02t0458900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0458900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15324132	15324161	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15323327	15324125	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0458950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15323327	15324125	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0458950-00;Parent=gene:OsNip_02g0458950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0458950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15323327	15323684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15323327	15323769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458950-00;Name=OsNip_02t0458950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0458950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15323685	15323769	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0458950-00;Parent=transcript:OsNip_02t0458950-00;protein_id=OsNip_02t0458950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15323902	15324125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0458950-00;Name=OsNip_02t0458950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0458950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15323902	15324125	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0458950-00;Parent=transcript:OsNip_02t0458950-00;protein_id=OsNip_02t0458950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15324744	15325572	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0459001;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15324744	15325572	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0459001-00;Parent=gene:OsNip_02g0459001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0459001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15324744	15325118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0459001-00;Name=OsNip_02t0459001-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0459001-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15324744	15325118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0459001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15436611	15437631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461000-01;Name=OsNip_02t0461000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0461000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15436945	15437586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0461000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0461000-01;protein_id=OsNip_02t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15437587	15437631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	15436863	15436958	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0461000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0461000-02;protein_id=OsNip_02t0461000-02;Tag=IsoSeq:G3249.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2521.5;prot_id "UniRef90_UPI001929AA2A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	15437244	15437633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461000-02;Tag=IsoSeq:G3249.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2521.5;prot_id "UniRef90_UPI001929AA2A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	15436959	15437006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461000-02;Tag=IsoSeq:G3249.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2521.5;prot_id "UniRef90_UPI001929AA2A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	15436651	15436860	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461000-02;Tag=IsoSeq:G3249.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2521.5;prot_id "UniRef90_UPI001929AA2A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15441600	15445216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15441600	15445302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;Name=OsNip_02t0461100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0461100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15445217	15445302	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0461100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;protein_id=OsNip_02t0461100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15445431	15445484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;Name=OsNip_02t0461100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0461100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15445431	15445484	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0461100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;protein_id=OsNip_02t0461100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15445753	15445906	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0461100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;protein_id=OsNip_02t0461100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15445753	15446187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;Name=OsNip_02t0461100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0461100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15445907	15446187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0461100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15467385	15467780	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0461700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0461700-00;protein_id=OsNip_02t0461700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15482803	15485901	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0461900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15496218	15498439	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0462200-01;Parent=gene:OsNip_02g0462200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15496218	15497922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-01;Name=OsNip_02t0462200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0462200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15496597	15497907	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0462200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0462200-01;protein_id=OsNip_02t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15497908	15497922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15498335	15498439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-01;Name=OsNip_02t0462200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0462200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15498335	15498439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	15496449	15498392	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0462200-02;Parent=gene:OsNip_02g0462200;transcript_id=OsNip_02t0462200-02;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2
Chr02	TAMA	exon	15498335	15498392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-02;Name=OsNip_02t0462200-02;exon_id=OsNip_02t0462200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FWT3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	CDS	15497061	15497138	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0462200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0462200-02;protein_id=OsNip_02t0462200-02;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FWT3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	15498335	15498392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-02;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FWT3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	15497139	15497917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-02;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FWT3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	15496449	15497058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462200-02;Tag=IsoSeq:G3255.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2526.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FWT3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15502622	15503795	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0462300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15502622	15503795	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0462300-00;Parent=gene:OsNip_02g0462300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0462300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15502622	15503068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462300-00;Name=OsNip_02t0462300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0462300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15502622	15503068	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0462300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0462300-00;protein_id=OsNip_02t0462300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15503550	15503795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462300-00;Name=OsNip_02t0462300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0462300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15503550	15503795	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0462300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0462300-00;protein_id=OsNip_02t0462300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	15505302	15507245	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0462401;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15505302	15507245	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0462401-00;Parent=gene:OsNip_02g0462401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0462401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15505302	15505418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462401-00;Name=OsNip_02t0462401-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0462401-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15527350	15527383	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0462900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0462900-01;protein_id=OsNip_02t0462900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15527350	15527436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462900-01;Name=OsNip_02t0462900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0462900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15527384	15527436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15527533	15527804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462900-01;Name=OsNip_02t0462900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0462900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15527533	15527804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	15524150	15524319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0462900-02;Name=OsNip_02t0462900-02;exon_id=OsNip_02t0462900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3257.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2527.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YP91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	15725827	15726034	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0467200-02;Tag=IsoSeq:G3264.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1944.2,Nipponbare.panicle_G2533.4;prot_id "UniRef90_B9EZW8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15726766	15726836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0467300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15770468	15770496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0468400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15770906	15771056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0468400-01;Name=OsNip_02t0468400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0468400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15772132	15772392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0468400-01;Name=OsNip_02t0468400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0468400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15824898	15825007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0468825-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15833024	15833052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	15836020	15856223	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0469200-01;Parent=gene:OsNip_02g0469200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0469200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15836553	15836624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-01;Name=OsNip_02t0469200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0469200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15838506	15838655	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0469200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0469200-01;protein_id=OsNip_02t0469200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	15840353	15840387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-01;Name=OsNip_02t0469200-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0469200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15855291	15855367	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0469200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0469200-02;protein_id=OsNip_02t0469200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	15855604	15855775	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0469200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0469200-02;protein_id=OsNip_02t0469200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	15855604	15856183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-02;Name=OsNip_02t0469200-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0469200-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15855776	15856183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	15836028	15836225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-03;Name=OsNip_02t0469200-03;exon_id=OsNip_02t0469200-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3270.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2539.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9TC46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	15836030	15836225	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0469200-03;Parent=transcript:OsNip_02t0469200-03;protein_id=OsNip_02t0469200-03;Tag=IsoSeq:G3270.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2539.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9TC46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	15836325	15836457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0469200-03;Name=OsNip_02t0469200-03;exon_id=OsNip_02t0469200-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3270.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2539.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9TC46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	CDS	15836553	15836556	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0469200-03;Parent=transcript:OsNip_02t0469200-03;protein_id=OsNip_02t0469200-03;Tag=IsoSeq:G3270.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2539.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9TC46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16179029	16179118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0474300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	16179230	16179295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0474300-01;Name=OsNip_02t0474300-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0474300-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16179230	16179295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0474300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	16179381	16180335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0474300-01;Name=OsNip_02t0474300-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0474300-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16179381	16180335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0474300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	16348459	16348482	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0477300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0477300-01;protein_id=OsNip_02t0477300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	16348459	16350263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0477300-01;Name=OsNip_02t0477300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0477300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16348483	16350263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0477300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16465980	16466102	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0479300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16617437	16617537	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0481900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	16678288	16680030	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0483500;Name=OsNip_MaT-2;biotype=protein_coding;description=Transferase;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16678288	16678518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0483500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	16678288	16680030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0483500-01;Name=OsNip_02t0483500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0483500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16679986	16680030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0483500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	16834393	16834864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0486400-01;Name=OsNip_02t0486400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0486400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	16918150	16919294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0487300-01;Name=OsNip_02t0487300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0487300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	16981502	16985338	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0488600-01;Parent=gene:OsNip_02g0488600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0488600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16981502	16981768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0488600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	16981769	16982854	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0488600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0488600-01;protein_id=OsNip_02t0488600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17055099	17055225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0489600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17055810	17057077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0489600-01;Name=OsNip_02t0489600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0489600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17056785	17057077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0489600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	17128653	17129517	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t049129A-01;Tag=IsoSeq:G3296.1;Source=Nipponbare.panicle_G2558.1;prot_id "UniRef90_Q2QXU8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	17129692	17130033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t049129A-01;Tag=IsoSeq:G3296.1;Source=Nipponbare.panicle_G2558.1;prot_id "UniRef90_Q2QXU8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	17150510	17152509	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0491300;Name=Mtr1;biotype=protein_coding;description=Secretory;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17150510	17150564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17150565	17152316	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0491300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0491300-01;protein_id=OsNip_02t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17152317	17152509	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	17156517	17160895	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0491400;Name=OsNip_FKBP62c;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17245021	17254879	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0492900-01;Parent=gene:OsNip_02g0492900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17250446	17250568	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Name=OsNip_02t0492900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0492900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17252442	17252581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Name=OsNip_02t0492900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0492900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17252442	17252581	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0492900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;protein_id=OsNip_02t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17254310	17254480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Name=OsNip_02t0492900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0492900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17254649	17254714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Name=OsNip_02t0492900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0492900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17254649	17254714	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0492900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;protein_id=OsNip_02t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17254793	17254814	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0492900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;protein_id=OsNip_02t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17254793	17254879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Name=OsNip_02t0492900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0492900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17254815	17254879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0492900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17258676	17258759	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0493050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0493050-00;protein_id=OsNip_02t0493050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17258845	17259015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0493050-00;Name=OsNip_02t0493050-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0493050-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17258845	17259015	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0493050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0493050-00;protein_id=OsNip_02t0493050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17289993	17290200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0493300-01;Name=OsNip_02t0493300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0493300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17339028	17339029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0494600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17718689	17718835	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0501350-01;Parent=transcript:OsNip_02t0501350-01;protein_id=OsNip_02t0501350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17719472	17719520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-01;Name=OsNip_02t0501350-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0501350-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17719505	17719520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17720299	17720440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-01;Name=OsNip_02t0501350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0501350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17720299	17720440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	17720299	17720453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-02;Name=OsNip_02t0501350-02;exon_id=OsNip_02t0501350-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3310.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1971.1,Nipponbare.panicle_G2571.1;prot_id "UniRef90_I1QSY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	17720453	17720453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-02;Tag=IsoSeq:G3310.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1971.1,Nipponbare.panicle_G2571.1;prot_id "UniRef90_I1QSY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	17720299	17720348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-02;Tag=IsoSeq:G3310.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1971.1,Nipponbare.panicle_G2571.1;prot_id "UniRef90_I1QSY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	17719472	17719520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-02;Tag=IsoSeq:G3310.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1971.1,Nipponbare.panicle_G2571.1;prot_id "UniRef90_I1QSY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	17718578	17718826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0501350-02;Tag=IsoSeq:G3310.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G1971.1,Nipponbare.panicle_G2571.1;prot_id "UniRef90_I1QSY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17782833	17784940	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0502500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0502500-01;protein_id=OsNip_02t0502500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17782833	17785512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0502500-01;Name=OsNip_02t0502500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0502500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17781094	17781369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17781094	17781385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;Name=OsNip_02t0502500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0502500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17781370	17781385	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0502500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;protein_id=OsNip_02t0502500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17782833	17784940	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0502500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;protein_id=OsNip_02t0502500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17782833	17785512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;Name=OsNip_02t0502500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0502500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17784941	17785512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0502500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	17805404	17809023	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0503100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17805404	17808857	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0503100-00;Parent=gene:OsNip_02g0503100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0503100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17805404	17806188	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503100-00;Name=OsNip_02t0503100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0503100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17805404	17806188	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0503100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0503100-00;protein_id=OsNip_02t0503100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17806431	17806716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503100-00;Name=OsNip_02t0503100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0503100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17808192	17808857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503100-00;Name=OsNip_02t0503100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0503100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17818697	17818921	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0503350-01;Parent=transcript:OsNip_02t0503350-01;protein_id=OsNip_02t0503350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17818922	17819130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	17846294	17847820	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0503400;Name=OsNip_RPL35;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17846294	17847820	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0503400-01;Parent=gene:OsNip_02g0503400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17846424	17846559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503400-01;Name=OsNip_02t0503400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0503400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17846645	17846801	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0503400-01;protein_id=OsNip_02t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17847601	17847820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503400-01;Name=OsNip_02t0503400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0503400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17848182	17852559	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0503500-01;Parent=gene:OsNip_02g0503500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0503500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	17852409	17852559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0503500-01;Name=OsNip_02t0503500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0503500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17862192	17866853	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0503700-00;Parent=gene:OsNip_02g0503700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0503700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17882235	17882322	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0504000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;protein_id=OsNip_02t0504000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17882323	17882386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17882692	17883615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;Name=OsNip_02t0504000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0504000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17882692	17883615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17885942	17886285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;Name=OsNip_02t0504000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0504000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17885942	17886285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	17882028	17882386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-02;Tag=IsoSeq:G3314.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2575.5;prot_id "UniRef90_A0A3L6E0X9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	17885942	17886169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-02;Tag=IsoSeq:G3314.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2575.5;prot_id "UniRef90_A0A3L6E0X9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	17886287	17886374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504000-02;Tag=IsoSeq:G3314.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2575.5;prot_id "UniRef90_A0A3L6E0X9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	17886532	17889823	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0504050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	17886532	17889823	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0504050-01;Parent=gene:OsNip_02g0504050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17886532	17888619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17886532	17888713	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Name=OsNip_02t0504050-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0504050-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17888620	17888713	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0504050-01;Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;protein_id=OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	17888877	17888926	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0504050-01;Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;protein_id=OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17888877	17888939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Name=OsNip_02t0504050-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0504050-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17888927	17888939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17889082	17889215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Name=OsNip_02t0504050-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0504050-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17889082	17889215	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	17889292	17889583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0504050-01;Name=OsNip_02t0504050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0504050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18049331	18049707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0506500-03;Name=OsNip_02t0506500-03-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0506500-03-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18049471	18049707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0506500-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18059135	18059700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0506600-01;Name=OsNip_02t0506600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0506600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18059555	18059700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0506600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18091841	18091873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18091874	18091897	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0507100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;protein_id=OsNip_02t0507100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18092034	18092286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;Name=OsNip_02t0507100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0507100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18092034	18092286	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0507100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;protein_id=OsNip_02t0507100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18092474	18092556	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0507100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;protein_id=OsNip_02t0507100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18092474	18092830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;Name=OsNip_02t0507100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0507100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18092557	18092830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	18091905	18092996	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0507100-02;Parent=gene:OsNip_02g0507100;transcript_id=OsNip_02t0507100-02;Tag=IsoSeq:G3324.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2584.1
Chr02	TAMA	exon	18091905	18092996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-02;Name=OsNip_02t0507100-02;exon_id=OsNip_02t0507100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3324.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2584.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0WFT2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	18091906	18092136	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0507100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0507100-02;protein_id=OsNip_02t0507100-02;Tag=IsoSeq:G3324.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2584.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0WFT2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	18091905	18091905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-02;Tag=IsoSeq:G3324.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2584.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0WFT2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	18092140	18092996	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507100-02;Tag=IsoSeq:G3324.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2584.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0WFT2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18110446	18113752	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0507400;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18110446	18113725	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0507400-01;Parent=gene:OsNip_02g0507400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18110446	18110546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18110446	18110748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;Name=OsNip_02t0507400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0507400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18110547	18110748	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0507400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;protein_id=OsNip_02t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18111370	18111473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;Name=OsNip_02t0507400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0507400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18111370	18111473	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0507400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;protein_id=OsNip_02t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18112149	18112262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;Name=OsNip_02t0507400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0507400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18112905	18112988	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507400-01;Name=OsNip_02t0507400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0507400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18121123	18121518	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18137316	18138068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0507900-00;Parent=gene:OsNip_02g0507900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0507900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18137316	18138068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0507900-00;Name=OsNip_02t0507900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0507900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18137316	18138068	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0507900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0507900-00;protein_id=OsNip_02t0507900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18139118	18142753	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0508000;biotype=protein_coding;description=Trimeric;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18139118	18142753	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0508000-01;Parent=gene:OsNip_02g0508000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18139118	18139339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18139118	18139716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;Name=OsNip_02t0508000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0508000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18139340	18139716	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0508000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;protein_id=OsNip_02t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18142263	18142662	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0508000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;protein_id=OsNip_02t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18142263	18142753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;Name=OsNip_02t0508000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0508000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18142663	18142753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18145538	18146073	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0508100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18145538	18146073	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0508100-01;Parent=gene:OsNip_02g0508100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0508100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18145538	18145754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0508100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18241437	18241839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510300-01;Name=OsNip_02t0510300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0510300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18241729	18241839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	18239251	18241829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510300-02;Name=OsNip_02t0510300-02;exon_id=OsNip_02t0510300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3333.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2593.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7QXK3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	18241829	18241829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510300-02;Tag=IsoSeq:G3333.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2593.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7QXK3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	18239251	18241436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510300-02;Tag=IsoSeq:G3333.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2593.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7QXK3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18252570	18256034	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0510600-01;Parent=gene:OsNip_02g0510600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18252570	18252724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18252854	18253058	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0510600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0510600-01;protein_id=OsNip_02t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18254407	18254494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0510600-01;Name=OsNip_02t0510600-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0510600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18254407	18254494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0510600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0510600-01;protein_id=OsNip_02t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18312497	18312578	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;Name=OsNip_02t0511500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0511500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18313139	18313359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;Name=OsNip_02t0511500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0511500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18313139	18313359	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0511500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;protein_id=OsNip_02t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18313604	18313962	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;Name=OsNip_02t0511500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0511500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18313604	18313962	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0511500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;protein_id=OsNip_02t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18314051	18314354	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0511500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;protein_id=OsNip_02t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18314051	18314355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;Name=OsNip_02t0511500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0511500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18314355	18314355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	18312017	18317576	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0511500-02;Parent=gene:OsNip_02g0511500;transcript_id=OsNip_02t0511500-02;Tag=IsoSeq:G3335.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2595.1
Chr02	TAMA	exon	18316804	18317576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-02;Name=OsNip_02t0511500-02;exon_id=OsNip_02t0511500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3335.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2595.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9ID81";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	18316804	18317143	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0511500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0511500-02;protein_id=OsNip_02t0511500-02;Tag=IsoSeq:G3335.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2595.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9ID81";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	18315603	18315768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0511500-02;Name=OsNip_02t0511500-02;exon_id=OsNip_02t0511500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3335.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2595.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9ID81";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18497550	18498101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513700-00;Name=OsNip_02t0513700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0513700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18498100	18498101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18498256	18498553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513700-00;Name=OsNip_02t0513700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0513700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18498256	18498553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18501234	18509632	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0513800;biotype=protein_coding;description=Ovarian;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18501234	18509632	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0513800-01;Parent=gene:OsNip_02g0513800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0513800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18501234	18501493	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18501234	18502339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0513800-01;Name=OsNip_02t0513800-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0513800-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	18595486	18595728	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0515600-02;Tag=IsoSeq:G3345.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1543.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9TZA8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18639596	18639596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0516301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18639596	18639889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0516301-00;Name=OsNip_02t0516301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0516301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18705702	18705867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18705702	18705937	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517300-01;Name=OsNip_02t0517300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18706289	18706455	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517300-01;Name=OsNip_02t0517300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0517300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18709242	18711438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517300-02;Name=OsNip_02t0517300-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0517300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18716835	18716916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517333-02;Name=OsNip_02t0517333-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517333-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18716848	18716916	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517333-02;Parent=transcript:OsNip_02t0517333-02;protein_id=OsNip_02t0517333-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18717021	18717311	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517333-02;Parent=transcript:OsNip_02t0517333-02;protein_id=OsNip_02t0517333-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18717021	18717331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517333-02;Name=OsNip_02t0517333-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517333-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	18714764	18715225	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0517366;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18714764	18715225	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0517366-00;Parent=gene:OsNip_02g0517366;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18714764	18715225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517366-00;Name=OsNip_02t0517366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18769958	18777995	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0517531-01;Parent=gene:OsNip_02g0517531;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517531-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18777210	18777362	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0517531-01;Parent=transcript:OsNip_02t0517531-01;protein_id=OsNip_02t0517531-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18777210	18777995	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-01;Name=OsNip_02t0517531-01-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517531-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18777363	18777995	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18776582	18777819	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0517531-02;Parent=gene:OsNip_02g0517531;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517531-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18776582	18776583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18776582	18776697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;Name=OsNip_02t0517531-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517531-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18776584	18776697	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0517531-02;Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;protein_id=OsNip_02t0517531-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18777210	18777362	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0517531-02;Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;protein_id=OsNip_02t0517531-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18777210	18777819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;Name=OsNip_02t0517531-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517531-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18777363	18777819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517531-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18778609	18781514	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0517564;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18778609	18781514	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0517564-00;Parent=gene:OsNip_02g0517564;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517564-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18778609	18779248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517564-00;Name=OsNip_02t0517564-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0517564-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18778609	18779248	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0517564-00;Parent=transcript:OsNip_02t0517564-00;protein_id=OsNip_02t0517564-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18781198	18781514	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517564-00;Name=OsNip_02t0517564-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517564-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18781198	18781514	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517564-00;Parent=transcript:OsNip_02t0517564-00;protein_id=OsNip_02t0517564-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18805498	18806589	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0517700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18805498	18806589	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0517700-01;Parent=gene:OsNip_02g0517700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18805498	18805916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18805498	18806589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517700-01;Name=OsNip_02t0517700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18805917	18806480	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0517700-01;protein_id=OsNip_02t0517700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18806481	18806589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18811834	18812650	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0517750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18811834	18812650	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0517750-00;Parent=gene:OsNip_02g0517750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18811834	18811896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18811834	18812123	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;Name=OsNip_02t0517750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18811897	18812123	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0517750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;protein_id=OsNip_02t0517750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18812226	18812466	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0517750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;protein_id=OsNip_02t0517750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18812226	18812650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;Name=OsNip_02t0517750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0517750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18812467	18812650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18817869	18821399	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0517900;biotype=protein_coding;description=Aminotransferase-like%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18817869	18821399	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0517900-01;Parent=gene:OsNip_02g0517900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18817869	18818246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18817869	18818246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18818421	18818676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18818421	18818676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18818768	18818869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18818768	18818869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18818945	18819143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18818945	18819143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18819217	18819517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18819217	18819517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18819611	18819839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18819611	18819872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18819840	18819872	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;protein_id=OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18819955	18820011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	18819955	18820011	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0517900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;protein_id=OsNip_02t0517900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	18820101	18820259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0517900-01;Name=OsNip_02t0517900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0517900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18902614	18903187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0519401-00;Name=OsNip_02t0519401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0519401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	18904061	18904523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t051969A-01;Tag=IsoSeq:G3355.1;Source=Nipponbare.root_G1998.1;prot_id "UniRef90_A2YRX0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	18908878	18909479	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0519700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18919669	18921748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0519950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18923492	18924344	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0520000-00;Parent=gene:OsNip_02g0520000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0520000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18923492	18923621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0520000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18924342	18924344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0520000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	18936409	18939517	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0520100-01;Parent=gene:OsNip_02g0520100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0520100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18936409	18936888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0520100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	18976054	18976337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0520750-01;Name=OsNip_02t0520750-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0520750-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19040114	19040395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0522100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19071077	19071135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19071214	19071308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0522800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19224484	19224966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0525900-02;Name=OsNip_02t0525900-02-E18;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0525900-02-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19220801	19220801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0525900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19256918	19260039	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0526500-01;Parent=gene:OsNip_02g0526500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0526500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19256918	19257244	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-01;Name=OsNip_02t0526500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0526500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19259695	19260039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-01;Name=OsNip_02t0526500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0526500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	19258553	19259041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Name=OsNip_02t0526500-02;exon_id=OsNip_02t0526500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	19257537	19257685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Name=OsNip_02t0526500-02;exon_id=OsNip_02t0526500-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	19260036	19260036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	19258553	19259041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	19257537	19257685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	19257385	19257447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	19256924	19257244	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526500-02;Tag=IsoSeq:G3376.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2625.2,Nipponbare.root_G2011.3;prot_id "UniRef90_T1NUL2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19260190	19262199	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0526600-01;Parent=gene:OsNip_02g0526600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19260190	19260217	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19260190	19261516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;Name=OsNip_02t0526600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0526600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19260218	19261378	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0526600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;protein_id=OsNip_02t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19261379	19261516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19261907	19262199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;Name=OsNip_02t0526600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0526600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19261907	19262199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	19268420	19269950	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0526650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19268420	19269950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0526650-01;Parent=gene:OsNip_02g0526650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0526650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19268420	19269185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0526650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19384099	19384219	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0528500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;protein_id=OsNip_02t0528500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19384553	19384616	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0528500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;protein_id=OsNip_02t0528500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19384553	19385078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Name=OsNip_02t0528500-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0528500-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19384617	19385078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19385180	19385259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Name=OsNip_02t0528500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0528500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19385180	19385259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19385352	19385432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Name=OsNip_02t0528500-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0528500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19385352	19385432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19385498	19385890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0528500-02;Name=OsNip_02t0528500-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0528500-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19469330	19469350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0529900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19472233	19486248	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0530100-01;Parent=gene:OsNip_02g0530100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19485858	19486248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0530100-01;Name=OsNip_02t0530100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0530100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19486164	19486248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0530100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19472237	19472449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0530100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19472237	19472760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0530100-02;Name=OsNip_02t0530100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0530100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19621101	19622134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-01;Name=OsNip_02t0532900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0532900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19621101	19622134	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0532900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0532900-01;protein_id=OsNip_02t0532900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19622872	19623210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-01;Name=OsNip_02t0532900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0532900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19621249	19621249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19621249	19622134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-02;Name=OsNip_02t0532900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0532900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19622872	19623214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-02;Name=OsNip_02t0532900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0532900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19622929	19623214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0532900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19623488	19628801	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0533000-00;Parent=gene:OsNip_02g0533000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0533000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19623488	19623787	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19623488	19623928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;Name=OsNip_02t0533000-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0533000-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19623788	19623928	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0533000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;protein_id=OsNip_02t0533000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19624798	19624941	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;Name=OsNip_02t0533000-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0533000-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19624798	19624941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0533000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;protein_id=OsNip_02t0533000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19625169	19625232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;Name=OsNip_02t0533000-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0533000-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19625316	19625402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533000-00;Name=OsNip_02t0533000-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0533000-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19638578	19638854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533300-01;Name=OsNip_02t0533300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0533300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19644999	19645039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19644999	19646061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533700-01;Name=OsNip_02t0533700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0533700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19645040	19645684	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0533700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0533700-01;protein_id=OsNip_02t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19645685	19646061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0533700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	19648496	19649478	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0533800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19648496	19649478	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0533800-01;Parent=gene:OsNip_02g0533800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0533800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19951898	19952577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538550-00;Name=OsNip_02t0538550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0538550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19952925	19953204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538550-00;Name=OsNip_02t0538550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0538550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19952925	19953204	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0538550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0538550-00;protein_id=OsNip_02t0538550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	19952818	19953413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t053869A-01;Name=OsNip_02t053869A-01-E1;exon_id=OsNip_02t053869A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3414.1;Source=Nipponbare.panicle_G2655.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	19952818	19952925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t053869A-01;Tag=IsoSeq:G3414.1;Source=Nipponbare.panicle_G2655.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	19953028	19953413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t053869A-01;Tag=IsoSeq:G3414.1;Source=Nipponbare.panicle_G2655.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	19954579	19955654	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0538700;biotype=protein_coding;description=Harpin-induced;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19954579	19954835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19954579	19955629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-02;Name=OsNip_02t0538700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0538700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19955511	19955629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19954579	19955654	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0538700-01;Parent=gene:OsNip_02g0538700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0538700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19954579	19954835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19954579	19955654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-01;Name=OsNip_02t0538700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0538700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19954836	19955510	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0538700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0538700-01;protein_id=OsNip_02t0538700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19955511	19955654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	19962640	19967923	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0538900;Name=OsNip_bZIP21;biotype=protein_coding;description=Basic-leucine;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19962640	19967923	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0538900-01;Parent=gene:OsNip_02g0538900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19962640	19962935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	19964113	19964239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Name=OsNip_02t0538900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0538900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19964113	19964239	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0538900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;protein_id=OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19964584	19964659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Name=OsNip_02t0538900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0538900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19964584	19964659	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0538900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;protein_id=OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	19966512	19967080	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0538900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;protein_id=OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19966512	19967169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Name=OsNip_02t0538900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0538900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19967081	19967169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	19967684	19967923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Name=OsNip_02t0538900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0538900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19967684	19967923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0538900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	19973187	19977396	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0539100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	19973187	19977396	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0539100-01;Parent=gene:OsNip_02g0539100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0539100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20127465	20127528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541700-01;Name=OsNip_02t0541700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0541700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20127467	20127528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20127664	20127726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20131802	20131829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20131830	20131929	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0541900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0541900-01;protein_id=OsNip_02t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20132061	20132153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541900-01;Name=OsNip_02t0541900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0541900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20132481	20132893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541900-01;Name=OsNip_02t0541900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0541900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20132732	20132893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20152543	20154023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0542600-01;Name=OsNip_02t0542600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0542600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20153497	20153895	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0542600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0542600-01;protein_id=OsNip_02t0542600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20153896	20154023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0542600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20350824	20351039	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0544566-01;Parent=transcript:OsNip_02t0544566-01;protein_id=OsNip_02t0544566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20351040	20352296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0544566-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20390262	20390342	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0545000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0545000-01;protein_id=OsNip_02t0545000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20390942	20391027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0545000-01;Name=OsNip_02t0545000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0545000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20390942	20391027	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0545000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0545000-01;protein_id=OsNip_02t0545000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20391141	20391255	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0545000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0545000-01;protein_id=OsNip_02t0545000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20391141	20391635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0545000-01;Name=OsNip_02t0545000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0545000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20486976	20486976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20486976	20487241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;Name=OsNip_02t0546400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0546400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20486977	20487241	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0546400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;protein_id=OsNip_02t0546400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20489410	20489495	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0546400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;protein_id=OsNip_02t0546400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20489410	20489874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;Name=OsNip_02t0546400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0546400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20489496	20489874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20490867	20491976	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0546600;Name=OsNip_ERF#098;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20490867	20491976	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0546600-01;Parent=gene:OsNip_02g0546600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20490867	20491112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20490867	20491561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;Name=OsNip_02t0546600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0546600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20491113	20491561	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0546600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;protein_id=OsNip_02t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20491680	20491974	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0546600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;protein_id=OsNip_02t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20491680	20491976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;Name=OsNip_02t0546600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0546600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20491975	20491976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20494362	20495719	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0546700;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20494362	20495719	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0546700-01;Parent=gene:OsNip_02g0546700;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0546700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20494362	20495719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0546700-01;Name=OsNip_02t0546700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0546700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20530067	20530486	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0547300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20530067	20530486	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0547300-00;Parent=gene:OsNip_02g0547300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0547300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20530067	20530486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0547300-00;Name=OsNip_02t0547300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0547300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20530067	20530486	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0547300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0547300-00;protein_id=OsNip_02t0547300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	gene	20535250	20538890	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g054809A;Tag=IsoSeq:G3427
Chr02	TAMA	mRNA	20535250	20538890	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t054809A-01;Parent=gene:OsNip_02g054809A;transcript_id=OsNip_02t054809A-01;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1
Chr02	TAMA	exon	20535250	20535689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;Name=OsNip_02t054809A-01-E1;exon_id=OsNip_02t054809A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	20535250	20535689	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t054809A-01;Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;protein_id=OsNip_02t054809A-01;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	20535756	20536238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;Name=OsNip_02t054809A-01-E2;exon_id=OsNip_02t054809A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	20535756	20536041	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t054809A-01;Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;protein_id=OsNip_02t054809A-01;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	20538532	20538890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;Name=OsNip_02t054809A-01-E3;exon_id=OsNip_02t054809A-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	20536045	20536238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	20538532	20538890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t054809A-01;Tag=IsoSeq:G3427.1;Source=Nipponbare.panicle_G2665.1;prot_id "UniRef90_B9R798";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20562601	20565664	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0548100;Name=OsNip_bHLH147;biotype=protein_coding;description=Helix-loop-helix;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20562601	20565664	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0548100-00;Parent=gene:OsNip_02g0548100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0548100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20653295	20653693	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0549700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0549700-02;protein_id=OsNip_02t0549700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20654531	20654762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0549700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20655509	20655672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0549850-00;Name=OsNip_02t0549850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0549850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20665484	20668400	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0549900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20665484	20668400	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0549900-01;Parent=gene:OsNip_02g0549900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0549900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20665484	20667384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0549900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20665484	20668400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0549900-01;Name=OsNip_02t0549900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0549900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20667385	20668400	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0549900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0549900-01;protein_id=OsNip_02t0549900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20676454	20682186	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0550000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20676454	20682186	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0550000-01;Parent=gene:OsNip_02g0550000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20676454	20676670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Name=OsNip_02t0550000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0550000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20676454	20676670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20676795	20676863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20676795	20679004	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Name=OsNip_02t0550000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0550000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20676864	20679004	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0550000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;protein_id=OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20679297	20679477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Name=OsNip_02t0550000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0550000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20679297	20679477	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0550000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;protein_id=OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20679604	20679652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Name=OsNip_02t0550000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0550000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20679604	20679652	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0550000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;protein_id=OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20681807	20681862	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0550000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;protein_id=OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20681807	20682186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Name=OsNip_02t0550000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0550000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20681863	20682186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20676853	20679479	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0550050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20676853	20679479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0550050-00;Parent=gene:OsNip_02g0550050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0550050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20676853	20677251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0550050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20765583	20765951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0551400-01;Name=OsNip_02t0551400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0551400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20817862	20817963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20818410	20818645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20818756	20819219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552100-01;Name=OsNip_02t0552100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0552100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20818756	20819219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20820222	20820554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552100-01;Name=OsNip_02t0552100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0552100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20823483	20824444	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0552150-00;Parent=gene:OsNip_02g0552150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0552150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20823483	20823583	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20823483	20824444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552150-00;Name=OsNip_02t0552150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0552150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20823584	20823829	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0552150-00;Parent=transcript:OsNip_02t0552150-00;protein_id=OsNip_02t0552150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20823830	20824444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20823276	20824650	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0552200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20823499	20824518	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0552200-00;Parent=gene:OsNip_02g0552200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20846850	20847993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0552700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20857044	20858995	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0553000-01;Parent=gene:OsNip_02g0553000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0553000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20858935	20858995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0553000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20868385	20868615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20915289	20915370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0554100-01;Name=OsNip_02t0554100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0554100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	20993495	20994224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555600-02;Name=OsNip_02t0555600-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0555600-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20993867	20994224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20991185	20993676	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0555650-00;Parent=gene:OsNip_02g0555650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20991185	20991297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Name=OsNip_02t0555650-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0555650-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20991185	20991297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20991856	20991999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20991856	20992261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Name=OsNip_02t0555650-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0555650-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20992000	20992261	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0555650-00;Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;protein_id=OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	20992326	20992372	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0555650-00;Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;protein_id=OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20992326	20992634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Name=OsNip_02t0555650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0555650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20992373	20992634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20992831	20992895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Name=OsNip_02t0555650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0555650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20992831	20992895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	20993503	20993676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Name=OsNip_02t0555650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0555650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20993503	20993676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	20994368	20997117	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0555700;Name=OsNip_DjC19;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	20994405	20997117	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0555700-01;Parent=gene:OsNip_02g0555700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0555700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20994405	20994698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0555700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21064137	21068994	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0556900-02;Parent=gene:OsNip_02g0556900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0556900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21087852	21088051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557150-00;Name=OsNip_02t0557150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21098190	21103974	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0557200;Name=OsNip_ARF7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21098190	21103974	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0557200-01;Parent=gene:OsNip_02g0557200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21098190	21098492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21098190	21098541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Name=OsNip_02t0557200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21098493	21098541	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0557200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;protein_id=OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21099316	21099431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Name=OsNip_02t0557200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0557200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21102180	21102655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Name=OsNip_02t0557200-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0557200-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21102736	21102926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Name=OsNip_02t0557200-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0557200-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21102736	21102926	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0557200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;protein_id=OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21103017	21103206	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0557200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;protein_id=OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21103017	21103974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Name=OsNip_02t0557200-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0557200-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21103207	21103974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21102291	21103546	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0557250;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21102291	21102658	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557250-00;Name=OsNip_02t0557250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21102739	21102919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557250-00;Name=OsNip_02t0557250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21103012	21103546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557250-00;Name=OsNip_02t0557250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21104701	21108054	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0557300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21104701	21108054	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0557300-01;Parent=gene:OsNip_02g0557300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21104701	21104849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21104701	21105258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;Name=OsNip_02t0557300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0557300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21104850	21105258	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0557300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;protein_id=OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21106688	21106770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;Name=OsNip_02t0557300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0557300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21106688	21106770	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0557300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;protein_id=OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21106877	21107086	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0557300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;protein_id=OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21106877	21108054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;Name=OsNip_02t0557300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21107087	21108054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21113982	21115838	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0557500;Name=OsNip_C3H16;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21113982	21115838	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0557500-01;Parent=gene:OsNip_02g0557500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21113982	21113983	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21113982	21114043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Name=OsNip_02t0557500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0557500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21113984	21114043	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;protein_id=OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21114229	21114303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Name=OsNip_02t0557500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0557500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21114229	21114303	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;protein_id=OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21114484	21114710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Name=OsNip_02t0557500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0557500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21114484	21114710	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;protein_id=OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21114806	21115679	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;protein_id=OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21114806	21115838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Name=OsNip_02t0557500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0557500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21115680	21115838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21115929	21122132	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0557600;biotype=protein_coding;description=Translation;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21115929	21122111	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0557600-01;Parent=gene:OsNip_02g0557600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21115929	21116348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21115929	21116473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557600-01;Name=OsNip_02t0557600-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0557600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21116349	21116473	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0557600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557600-01;protein_id=OsNip_02t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21116576	21116946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0557600-01;Name=OsNip_02t0557600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0557600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21116576	21116946	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0557600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0557600-01;protein_id=OsNip_02t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21151695	21152550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0558100-03;Name=OsNip_02t0558100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0558100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21156632	21156737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0558100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21161233	21161368	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0558100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21151016	21151083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0558200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21184134	21184694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0558700-00;Name=OsNip_02t0558700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0558700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21225043	21228707	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0559300-01;Parent=gene:OsNip_02g0559300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0559300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21226527	21226754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559300-01;Name=OsNip_02t0559300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0559300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21226846	21227064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559300-01;Name=OsNip_02t0559300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0559300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21231158	21231366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559400-01;Name=OsNip_02t0559400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0559400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21231343	21231366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	21245306	21245531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559500-01;Tag=IsoSeq:G3473.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2704.1;prot_id "UniRef90_UPI0007760688";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	21246080	21246743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559500-01;Tag=IsoSeq:G3473.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2704.1;prot_id "UniRef90_UPI0007760688";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21250083	21251343	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0559800-01;Parent=gene:OsNip_02g0559800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0559800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21250083	21250335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21250083	21251343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559800-01;Name=OsNip_02t0559800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0559800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21250336	21251313	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0559800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0559800-01;protein_id=OsNip_02t0559800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21251314	21251343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0559800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21264269	21264331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0560300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21277161	21277413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21282321	21282383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21282714	21282860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21286187	21287447	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0561400-01;Parent=gene:OsNip_02g0561400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0561400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21286187	21286439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21286187	21287447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561400-01;Name=OsNip_02t0561400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0561400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21286440	21287417	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0561400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0561400-01;protein_id=OsNip_02t0561400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21287418	21287447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21290398	21290659	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0561500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0561500-00;protein_id=OsNip_02t0561500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21291212	21291741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561500-00;Name=OsNip_02t0561500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0561500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21291212	21291741	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0561500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0561500-00;protein_id=OsNip_02t0561500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21295214	21296474	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0561800-01;Parent=gene:OsNip_02g0561800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0561800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21295467	21296444	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0561800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0561800-01;protein_id=OsNip_02t0561800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21296445	21296474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0561800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21327687	21328122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0562400-01;Name=OsNip_02t0562400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0562400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	21325447	21326497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0562400-02;Tag=IsoSeq:G3476.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2707.1;prot_id "UniRef90_V4T4T9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21332690	21332778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0562600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21333460	21333576	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0562600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0562600-01;protein_id=OsNip_02t0562600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21412541	21412612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;Name=OsNip_02t0564000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0564000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21412541	21412612	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;protein_id=OsNip_02t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21412694	21412779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;Name=OsNip_02t0564000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0564000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21412694	21412779	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;protein_id=OsNip_02t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21413300	21413356	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;Name=OsNip_02t0564000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0564000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21413300	21413356	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;protein_id=OsNip_02t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21413492	21413597	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0564000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;protein_id=OsNip_02t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21413492	21413683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;Name=OsNip_02t0564000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0564000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21413598	21413683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	21410855	21413690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0564000-02;Parent=gene:OsNip_02g0564000;transcript_id=OsNip_02t0564000-02;Tag=IsoSeq:G3480.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2710.3,Nipponbare.leaf_G1608.3
Chr02	TAMA	exon	21413492	21413690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564000-02;Name=OsNip_02t0564000-02;exon_id=OsNip_02t0564000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3480.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2710.3,Nipponbare.leaf_G1608.3;prot_id "UniRef90_Q53M09";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21422287	21422355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21437228	21437293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0564700-01;Name=OsNip_02t0564700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0564700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21468284	21469135	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0565300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0565300-00;protein_id=OsNip_02t0565300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21531227	21531252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0566500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21601964	21602376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0567900-01;Name=OsNip_02t0567900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0567900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21602120	21602376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0567900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21608165	21613272	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0568200;Name=CPT1;biotype=protein_coding;description=NPH3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21608165	21613272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0568200-00;Parent=gene:OsNip_02g0568200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0568200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21608165	21608339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0568200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21608165	21608960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0568200-00;Name=OsNip_02t0568200-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0568200-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21608340	21608960	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0568200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0568200-00;protein_id=OsNip_02t0568200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21609031	21609821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0568200-00;Name=OsNip_02t0568200-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0568200-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21609031	21609821	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0568200-00;Parent=transcript:OsNip_02t0568200-00;protein_id=OsNip_02t0568200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21788170	21791222	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0570500-01;Parent=gene:OsNip_02g0570500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0570500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21788171	21789067	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0570500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0570500-01;protein_id=OsNip_02t0570500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	21790393	21791222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0570500-01;Name=OsNip_02t0570500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0570500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21791017	21791222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0570500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	21788183	21790949	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0570600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	21788183	21790949	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0570600-00;Parent=gene:OsNip_02g0570600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0570600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21788183	21788998	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0570600-00;Name=OsNip_02t0570600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0570600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21788183	21788998	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0570600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0570600-00;protein_id=OsNip_02t0570600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	21790362	21790420	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0570600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0570600-00;protein_id=OsNip_02t0570600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	21790362	21790949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0570600-00;Name=OsNip_02t0570600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0570600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21930682	21931006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0572400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21982521	21982664	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0573300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	22062770	22063096	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0574900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0574900-02;protein_id=OsNip_02t0574900-02;Tag=IsoSeq:G3520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2086.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1EEZ5";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	22060821	22062769	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0574900-02;Tag=IsoSeq:G3520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2086.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1EEZ5";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22063100	22063312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0574900-02;Tag=IsoSeq:G3520.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2086.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1EEZ5";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22064966	22065592	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0575000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	22064966	22065592	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0575000-01;Parent=gene:OsNip_02g0575000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22064966	22065228	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22064966	22065592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575000-01;Name=OsNip_02t0575000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0575000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22065229	22065495	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0575000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0575000-01;protein_id=OsNip_02t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22065496	22065592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22068014	22070683	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0575200;biotype=protein_coding;description=DNA/pantothenate;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	22068014	22070683	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0575200-01;Parent=gene:OsNip_02g0575200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0575200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22068014	22068298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22068014	22068553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575200-01;Name=OsNip_02t0575200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0575200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22103417	22103524	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575800-01;Name=OsNip_02t0575800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0575800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22104217	22105007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575800-01;Name=OsNip_02t0575800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0575800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22104873	22105007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0575800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22110140	22117656	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0575900;Name=OsNip_EXO70FX6;biotype=protein_coding;description=Exo70;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22229412	22230707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0578201-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22247121	22247550	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0578800-02;Tag=IsoSeq:G3530.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2748.3;prot_id "UniRef90_A0A1R3HCB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22258833	22258888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0579000-02;Name=OsNip_02t0579000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0579000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22258833	22258888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0579000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22259067	22259075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0579000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22351663	22352068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580600-02;Tag=IsoSeq:G3536.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2753.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9PCI7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22355510	22355683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580700-01;Name=OsNip_02t0580700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0580700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22361114	22361508	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0580700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0580700-01;protein_id=OsNip_02t0580700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22361614	22361640	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0580700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0580700-01;protein_id=OsNip_02t0580700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22361614	22362054	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580700-01;Name=OsNip_02t0580700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0580700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22361641	22362054	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22372989	22373507	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0580966-00;Parent=transcript:OsNip_02t0580966-00;protein_id=OsNip_02t0580966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22373608	22373829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580966-00;Name=OsNip_02t0580966-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0580966-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22373655	22373829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	22370190	22371329	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0580966-01;Parent=gene:OsNip_02g0580966;transcript_id=OsNip_02t0580966-01;Tag=IsoSeq:G3541.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2757.1
Chr02	TAMA	exon	22370190	22371329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580966-01;Name=OsNip_02t0580966-01;exon_id=OsNip_02t0580966-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3541.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2757.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8LI44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	22370190	22370393	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0580966-01;Parent=transcript:OsNip_02t0580966-01;protein_id=OsNip_02t0580966-01;Tag=IsoSeq:G3541.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2757.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8LI44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22370397	22371329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0580966-01;Tag=IsoSeq:G3541.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2757.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8LI44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22381101	22389666	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0580983;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22411997	22412305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581300-01;Name=OsNip_02t0581300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0581300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22409973	22410127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581300-02;Tag=IsoSeq:G3543.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2101.5;prot_id "UniRef90_A0A0D2SBS9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22409732	22409887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581300-02;Tag=IsoSeq:G3543.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2101.5;prot_id "UniRef90_A0A0D2SBS9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22407815	22409546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581300-02;Tag=IsoSeq:G3543.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2101.5;prot_id "UniRef90_A0A0D2SBS9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	22415292	22426149	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0581400-01;Parent=gene:OsNip_02g0581400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22415292	22415316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22415292	22415709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;Name=OsNip_02t0581400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0581400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22415317	22415709	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0581400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;protein_id=OsNip_02t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22416035	22416231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;Name=OsNip_02t0581400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0581400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22416035	22416231	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0581400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;protein_id=OsNip_02t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22416314	22416431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;Name=OsNip_02t0581400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0581400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22416314	22416431	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0581400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0581400-01;protein_id=OsNip_02t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22439260	22439349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0582100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22440715	22440885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0582100-00;Name=OsNip_02t0582100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0582100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22440715	22440885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0582100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22436069	22436534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0582100-01;Tag=IsoSeq:G3545.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2103.1,Nipponbare.panicle_G2761.1;prot_id "UniRef90_A0A1D6E8V1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22529385	22529524	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0584200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0584200-01;protein_id=OsNip_02t0584200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22531242	22531323	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0584200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0584200-01;protein_id=OsNip_02t0584200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22531242	22531379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0584200-01;Name=OsNip_02t0584200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0584200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22535987	22536085	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0584300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0584300-01;protein_id=OsNip_02t0584300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22558964	22559501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0585100-01;Tag=IsoSeq:G3552.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2109.5;prot_id "UniRef90_Q0E010";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22562006	22562257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0585200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22562258	22562653	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0585200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0585200-01;protein_id=OsNip_02t0585200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22562798	22562803	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0585200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0585200-01;protein_id=OsNip_02t0585200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22562798	22562946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0585200-01;Name=OsNip_02t0585200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0585200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22562804	22562946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0585200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	22561901	22562951	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0585200-02;Parent=gene:OsNip_02g0585200;transcript_id=OsNip_02t0585200-02;Tag=IsoSeq:G3553.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2110.2
Chr02	TAMA	exon	22561901	22562951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0585200-02;Name=OsNip_02t0585200-02;exon_id=OsNip_02t0585200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3553.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2110.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7F892";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22605633	22605737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0586500-02;Name=OsNip_02t0586500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0586500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22602419	22602682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0586500-01;Name=OsNip_02t0586500-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0586500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22602419	22602682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0586500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22602766	22605216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0586500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22602766	22605517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0586500-01;Name=OsNip_02t0586500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0586500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22605217	22605517	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0586500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0586500-01;protein_id=OsNip_02t0586500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22645199	22645593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0587600-00;Name=OsNip_02t0587600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0587600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22688391	22688848	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588500-01;Name=OsNip_02t0588500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0588500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22687303	22687570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22688391	22688684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588500-02;Name=OsNip_02t0588500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0588500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	22693751	22693971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588600-02;Tag=IsoSeq:G3561.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1645.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9VHP6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22696563	22697570	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0588700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	22696563	22697570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0588700-01;Parent=gene:OsNip_02g0588700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0588700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22696563	22696839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	22696563	22697570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588700-01;Name=OsNip_02t0588700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0588700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	22696840	22697196	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0588700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0588700-01;protein_id=OsNip_02t0588700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22697197	22697570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0588700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	22707618	22707812	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0588775;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	22965932	22966075	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0593100-00;Name=OsNip_02t0593100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0593100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23102367	23102815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595300-00;Name=OsNip_02t0595300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0595300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23105718	23106537	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0595400-01;Parent=gene:OsNip_02g0595400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0595400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23105718	23106537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595400-01;Name=OsNip_02t0595400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0595400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23107885	23107963	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0595500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;protein_id=OsNip_02t0595500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23108306	23108545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;Name=OsNip_02t0595500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0595500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23108306	23108545	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0595500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;protein_id=OsNip_02t0595500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23109739	23110281	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0595500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;protein_id=OsNip_02t0595500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23109739	23110311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;Name=OsNip_02t0595500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0595500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23110282	23110311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	23107009	23107593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-02;Name=OsNip_02t0595500-02;exon_id=OsNip_02t0595500-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G3587.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1657.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7JDJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	23110352	23110352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-02;Tag=IsoSeq:G3587.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1657.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7JDJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23108306	23108533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-02;Tag=IsoSeq:G3587.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1657.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7JDJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23107885	23107963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-02;Tag=IsoSeq:G3587.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1657.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7JDJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23107009	23107593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595500-02;Tag=IsoSeq:G3587.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1657.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7JDJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23111937	23112039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23111937	23113830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0595700-01;Name=OsNip_02t0595700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0595700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23112040	23113443	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0595700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0595700-01;protein_id=OsNip_02t0595700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23126927	23127224	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0596000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23126927	23127308	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0596000-01;Name=OsNip_02t0596000-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0596000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23241660	23242066	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0597900-01;Parent=gene:OsNip_02g0597900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0597900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23241660	23241879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0597900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23241880	23242065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0597900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0597900-01;protein_id=OsNip_02t0597900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23242066	23242066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0597900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	23241743	23244633	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0597900-02;Parent=gene:OsNip_02g0597900;transcript_id=OsNip_02t0597900-02;Tag=IsoSeq:G3600.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2796.2
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Chr02	TAMA	CDS	23242917	23242919	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0597900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0597900-02;protein_id=OsNip_02t0597900-02;Tag=IsoSeq:G3600.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2796.2;prot_id "UniRef90_A0A4V6T4P9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	23241743	23242137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0597900-02;Name=OsNip_02t0597900-02;exon_id=OsNip_02t0597900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3600.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2796.2;prot_id "UniRef90_A0A4V6T4P9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23242850	23242914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0597900-02;Tag=IsoSeq:G3600.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2796.2;prot_id "UniRef90_A0A4V6T4P9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23416611	23416778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0599400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23535117	23535219	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601500-02;Tag=IsoSeq:G3613.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2808.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23544805	23545238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601700-01;Name=OsNip_02t0601700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0601700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23544805	23545238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23547431	23549077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601700-01;Name=OsNip_02t0601700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0601700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23548832	23549077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23545845	23548377	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0601750-00;Parent=gene:OsNip_02g0601750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0601750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23545845	23546542	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0601750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0601750-00;protein_id=OsNip_02t0601750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23545845	23546563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601750-00;Name=OsNip_02t0601750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0601750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23546543	23546563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23554203	23554234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0601800-05;Tag=IsoSeq:G3615.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1667.1,Nipponbare.root_G2145.8;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23559972	23561665	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0602000-01;Parent=gene:OsNip_02g0602000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23559972	23560045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23559972	23560755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602000-01;Name=OsNip_02t0602000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23560046	23560755	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0602000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0602000-01;protein_id=OsNip_02t0602000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23561208	23561665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602000-01;Name=OsNip_02t0602000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0602000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	23562279	23565935	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0602100;Name=OsNip_MSRPK1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23562279	23563089	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0602100-01;Parent=gene:OsNip_02g0602100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23562279	23562711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23562279	23563089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-01;Name=OsNip_02t0602100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23562712	23563089	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0602100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-01;protein_id=OsNip_02t0602100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23562283	23565935	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0602100-02;Parent=gene:OsNip_02g0602100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23562283	23562711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23562283	23564126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23562712	23564126	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0602100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;protein_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23564220	23564348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23564220	23564348	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0602100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;protein_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23564442	23564577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23564442	23564577	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0602100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;protein_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23564658	23564746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23564843	23564954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23565034	23565140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23565034	23565140	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0602100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;protein_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23565237	23565330	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0602100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;protein_id=OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23565237	23565935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Name=OsNip_02t0602100-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0602100-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23565331	23565935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	23562830	23564338	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0602201;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23562830	23564338	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0602201-00;Parent=gene:OsNip_02g0602201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23562830	23563205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23562830	23564119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;Name=OsNip_02t0602201-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602201-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23563206	23563601	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0602201-00;Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;protein_id=OsNip_02t0602201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23563602	23564119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23564213	23564338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;Name=OsNip_02t0602201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23564213	23564338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	23572965	23575487	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0602300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23572965	23575418	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0602300-01;Parent=gene:OsNip_02g0602300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23572965	23573694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23573816	23573943	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0602300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;protein_id=OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23574040	23574321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;Name=OsNip_02t0602300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0602300-02-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23574040	23574321	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0602300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;protein_id=OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23575125	23575219	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0602300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;protein_id=OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23575125	23575418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;Name=OsNip_02t0602300-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0602300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23575220	23575418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23573015	23575487	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0602300-02;Parent=gene:OsNip_02g0602300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0602300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23573015	23573049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-02;Name=OsNip_02t0602300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0602300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23573015	23573049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23573665	23573694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0602300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23612056	23612557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0603100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23677350	23677855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23678217	23678333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;Name=OsNip_02t0604300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0604300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23680924	23681031	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;Name=OsNip_02t0604300-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0604300-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23681363	23681439	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;protein_id=OsNip_02t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23681634	23681682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;Name=OsNip_02t0604300-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0604300-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23681634	23681682	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;protein_id=OsNip_02t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23681767	23681817	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;protein_id=OsNip_02t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23681767	23681831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0604300-01;Name=OsNip_02t0604300-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0604300-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	23724341	23724513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Name=OsNip_02t0605400-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0605400-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23724341	23724513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23724630	23724707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Name=OsNip_02t0605400-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0605400-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23724630	23724707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23724839	23724985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Name=OsNip_02t0605400-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0605400-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23724839	23724985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23725080	23725135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Name=OsNip_02t0605400-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0605400-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23725080	23725135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	23720407	23726364	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0605400-01;Parent=gene:OsNip_02g0605400;transcript_id=OsNip_02t0605400-01;Tag=IsoSeq:G3625.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2152.1
Chr02	TAMA	exon	23720407	23720733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-01;Name=OsNip_02t0605400-01;exon_id=OsNip_02t0605400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3625.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2152.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1Z6W3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	23720408	23720733	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0605400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0605400-01;protein_id=OsNip_02t0605400-01;Tag=IsoSeq:G3625.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2152.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1Z6W3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	23720812	23720868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605400-01;Name=OsNip_02t0605400-01;exon_id=OsNip_02t0605400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3625.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2152.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1Z6W3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23743658	23744060	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0605900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0605900-01;protein_id=OsNip_02t0605900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23743658	23744109	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605900-01;Name=OsNip_02t0605900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0605900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	23743067	23743146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0605900-02;Tag=IsoSeq:G3627.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1672.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23748484	23748951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	23749148	23753239	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0606100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	23749148	23750278	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0606100-00;Parent=gene:OsNip_02g0606100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23749148	23749414	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23749148	23749517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;Name=OsNip_02t0606100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0606100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23749415	23749517	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0606100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;protein_id=OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23749612	23749637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;Name=OsNip_02t0606100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0606100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23749612	23749637	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0606100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;protein_id=OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23749986	23750104	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;Name=OsNip_02t0606100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0606100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23749986	23750104	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0606100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;protein_id=OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	23750179	23750278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;Name=OsNip_02t0606100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0606100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	23750179	23750278	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0606100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0606100-00;protein_id=OsNip_02t0606100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	23749148	23753239	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0606100-01;Parent=gene:OsNip_02g0606100;transcript_id=OsNip_02t0606100-01;Tag=IsoSeq:G3629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2818.1,Nipponbare.root_G2155.1
Chr02	TAMA	exon	23753039	23753239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0606100-01;Name=OsNip_02t0606100-01;exon_id=OsNip_02t0606100-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2818.1,Nipponbare.root_G2155.1;prot_id "UniRef90_A0A0K9QI70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	23753039	23753238	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0606100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0606100-01;protein_id=OsNip_02t0606100-01;Tag=IsoSeq:G3629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2818.1,Nipponbare.root_G2155.1;prot_id "UniRef90_A0A0K9QI70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24061192	24062693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611400-01;Name=OsNip_02t0611400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0611400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24062251	24062693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24063225	24066510	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0611450-00;Parent=gene:OsNip_02g0611450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24063225	24063673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24063225	24064393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Name=OsNip_02t0611450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0611450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24063674	24063856	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0611450-00;Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;protein_id=OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24063857	24064393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24066126	24066424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24066432	24066510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Name=OsNip_02t0611450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0611450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24066432	24066510	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24068339	24074731	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0611500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24068339	24074731	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0611500-01;Parent=gene:OsNip_02g0611500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24068339	24068950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24068339	24069973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611500-01;Name=OsNip_02t0611500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0611500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24068951	24069973	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0611500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0611500-01;protein_id=OsNip_02t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	24084383	24084460	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0611800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0611800-02;protein_id=OsNip_02t0611800-02;Tag=IsoSeq:G3652.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2168.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	24084306	24084382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611800-02;Tag=IsoSeq:G3652.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2168.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	24084464	24084763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0611800-02;Tag=IsoSeq:G3652.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2168.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24090864	24094269	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0612000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24090864	24094103	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0612000-01;Parent=gene:OsNip_02g0612000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0612000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24090864	24090871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0612000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24093701	24093943	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0612000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0612000-01;protein_id=OsNip_02t0612000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	24182262	24182423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;Name=OsNip_02t0613400-02;exon_id=OsNip_02t0613400-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	exon	24181233	24182168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;Name=OsNip_02t0613400-02;exon_id=OsNip_02t0613400-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	24181233	24182168	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0613400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;protein_id=OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	CDS	24180929	24181144	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0613400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;protein_id=OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	CDS	24179736	24179996	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0613400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;protein_id=OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	exon	24178402	24179069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;Name=OsNip_02t0613400-02;exon_id=OsNip_02t0613400-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	24178725	24179069	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0613400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;protein_id=OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	24188013	24188014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	24178402	24178722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613400-02;Tag=IsoSeq:G3658.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2842.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24196224	24201250	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0613600-01;Parent=gene:OsNip_02g0613600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0613600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24196224	24196342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613600-01;Name=OsNip_02t0613600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0613600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24196224	24196342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24198478	24198563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0613600-01;Name=OsNip_02t0613600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0613600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24198478	24198563	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0613600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0613600-01;protein_id=OsNip_02t0613600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24240092	24240309	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0614200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24240092	24240525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0614200-01;Name=OsNip_02t0614200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0614200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24240310	24240525	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0614200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0614200-01;protein_id=OsNip_02t0614200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24242210	24242428	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0614200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0614200-01;protein_id=OsNip_02t0614200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24242210	24242558	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0614200-01;Name=OsNip_02t0614200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0614200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24242211	24242651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0614250-00;Name=OsNip_02t0614250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0614250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24242211	24242651	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0614250-00;Parent=transcript:OsNip_02t0614250-00;protein_id=OsNip_02t0614250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24351053	24353651	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0615800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0615800-01;protein_id=OsNip_02t0615800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24354149	24354469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0615800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24352187	24353651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0615800-02;Name=OsNip_02t0615800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0615800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24352187	24353651	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0615800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0615800-02;protein_id=OsNip_02t0615800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24353742	24354486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0615800-02;Name=OsNip_02t0615800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0615800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24354149	24354486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0615800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	24351324	24354488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0615800-03;Tag=IsoSeq:G3667.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2851.6;prot_id "UniRef90_A0A0D9YUY8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24372812	24372844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24372845	24373830	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0616100-04;Parent=transcript:OsNip_02t0616100-04;protein_id=OsNip_02t0616100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24374046	24374283	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0616100-04;Parent=transcript:OsNip_02t0616100-04;protein_id=OsNip_02t0616100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24374046	24374397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-04;Name=OsNip_02t0616100-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0616100-04-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24374284	24374397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24373069	24373069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-06;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24373069	24374397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-06;Name=OsNip_02t0616100-06-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0616100-06-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24373070	24374161	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0616100-06;Parent=transcript:OsNip_02t0616100-06;protein_id=OsNip_02t0616100-06;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24374162	24374397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-06;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24373397	24374439	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0616100-07;Parent=gene:OsNip_02g0616100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0616100-07;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24373397	24374161	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0616100-07;Parent=transcript:OsNip_02t0616100-07;protein_id=OsNip_02t0616100-07;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24373397	24374439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-07;Name=OsNip_02t0616100-07-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0616100-07-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24374162	24374439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0616100-07;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24380848	24382673	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0616199-00;Parent=gene:OsNip_02g0616199;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0616199-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24527753	24527823	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0617600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24528693	24528816	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0617600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24568013	24568207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24569489	24569919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24569920	24570079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0618200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0618200-01;protein_id=OsNip_02t0618200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24570211	24570372	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618200-01;Name=OsNip_02t0618200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0618200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24570211	24570372	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0618200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0618200-01;protein_id=OsNip_02t0618200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24580911	24581448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618525-00;Name=OsNip_02t0618525-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0618525-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24595175	24595238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24596243	24596740	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0618700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0618700-01;protein_id=OsNip_02t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24596243	24596966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0618700-01;Name=OsNip_02t0618700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0618700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24650695	24650999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0619600-01;Name=OsNip_02t0619600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0619600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24650932	24650999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0619600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24647331	24651211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0619801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24647331	24652347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0619801-01;Name=OsNip_02t0619801-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0619801-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24651539	24652347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0619801-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24665979	24666143	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0620000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0620000-00;protein_id=OsNip_02t0620000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24666250	24666819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620000-00;Name=OsNip_02t0620000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0620000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24666250	24666819	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0620000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0620000-00;protein_id=OsNip_02t0620000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24671617	24671782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24676801	24677324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620400-01;Name=OsNip_02t0620400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0620400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24683709	24685205	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0620500-00;Parent=gene:OsNip_02g0620500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0620500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24683709	24685205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620500-00;Name=OsNip_02t0620500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0620500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24683709	24685205	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0620500-00;Parent=transcript:OsNip_02t0620500-00;protein_id=OsNip_02t0620500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24683711	24685162	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0620533;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24683711	24685162	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0620533-00;Parent=gene:OsNip_02g0620533;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0620533-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24683711	24684416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620533-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24683711	24685162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620533-00;Name=OsNip_02t0620533-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0620533-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24684417	24685160	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0620533-00;Parent=transcript:OsNip_02t0620533-00;protein_id=OsNip_02t0620533-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24685161	24685162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620533-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24690869	24692425	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0620566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24690869	24692425	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0620566-00;Parent=gene:OsNip_02g0620566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0620566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24690869	24691536	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0620566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24691537	24692424	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0620566-00;Parent=transcript:OsNip_02t0620566-00;protein_id=OsNip_02t0620566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24718047	24718559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0621300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24718047	24718721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0621300-01;Name=OsNip_02t0621300-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0621300-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24718812	24718982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0621300-01;Name=OsNip_02t0621300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0621300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24718812	24718982	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0621300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0621300-01;protein_id=OsNip_02t0621300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24771122	24771248	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Name=OsNip_02t0622100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0622100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24771122	24771248	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0622100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;protein_id=OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24771321	24771382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Name=OsNip_02t0622100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0622100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24771321	24771382	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0622100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;protein_id=OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24771470	24771530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Name=OsNip_02t0622100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0622100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24771470	24771530	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0622100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;protein_id=OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24771621	24771754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Name=OsNip_02t0622100-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0622100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24771621	24771754	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0622100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;protein_id=OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24771962	24772255	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0622100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;protein_id=OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24771962	24772750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Name=OsNip_02t0622100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0622100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24772256	24772750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	24773713	24774843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622200-02;Name=OsNip_02t0622200-02;exon_id=OsNip_02t0622200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3692.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2868.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CDE79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	24774812	24774843	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0622200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0622200-02;protein_id=OsNip_02t0622200-02;Tag=IsoSeq:G3692.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2868.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CDE79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	24773713	24774809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622200-02;Tag=IsoSeq:G3692.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2868.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CDE79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	24786092	24786542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0622500-01;Name=OsNip_02t0622500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0622500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24819819	24820066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24830558	24831992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0623400-00;Parent=gene:OsNip_02g0623400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24830558	24830695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24830696	24831325	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0623400-00;Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;protein_id=OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24831326	24831332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24831606	24831690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Name=OsNip_02t0623400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0623400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24831606	24831690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24831774	24831992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Name=OsNip_02t0623400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0623400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24831774	24831992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	gene	24838703	24838982	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g062349A;Tag=IsoSeq:G3696
Chr02	TAMA	mRNA	24838703	24838982	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t062349A-01;Parent=gene:OsNip_02g062349A;transcript_id=OsNip_02t062349A-01;Tag=IsoSeq:G3696.1;Source=Nipponbare.leaf_G1709.1
Chr02	TAMA	exon	24838703	24838982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t062349A-01;Name=OsNip_02t062349A-01-E1;exon_id=OsNip_02t062349A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3696.1;Source=Nipponbare.leaf_G1709.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	24838704	24838823	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t062349A-01;Parent=transcript:OsNip_02t062349A-01;protein_id=OsNip_02t062349A-01;Tag=IsoSeq:G3696.1;Source=Nipponbare.leaf_G1709.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	24838703	24838703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t062349A-01;Tag=IsoSeq:G3696.1;Source=Nipponbare.leaf_G1709.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	24838827	24838982	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t062349A-01;Tag=IsoSeq:G3696.1;Source=Nipponbare.leaf_G1709.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24848195	24860106	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0623500;biotype=protein_coding;description=Lysyl-tRNA;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24848195	24859531	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0623500-02;Parent=gene:OsNip_02g0623500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24848195	24848428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623500-02;Name=OsNip_02t0623500-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0623500-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24848195	24848428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0623500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24973450	24973759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24973450	24974875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-02;Name=OsNip_02t0626100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0626100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24973760	24974875	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0626100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0626100-02;protein_id=OsNip_02t0626100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24973450	24973759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24973450	24975500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-01;Name=OsNip_02t0626100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0626100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	24976838	24977202	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0626100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0626100-01;protein_id=OsNip_02t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24976838	24977287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-01;Name=OsNip_02t0626100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0626100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24977203	24977287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24976369	24976837	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0626200;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24976369	24976837	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0626200-01;Parent=gene:OsNip_02g0626200;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0626200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24976369	24976837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626200-01;Name=OsNip_02t0626200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0626200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	24985256	24989388	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0626400;Name=OsNip_PAL;biotype=protein_coding;description=Phenylalanine;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	24985256	24986844	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0626400-03;Parent=gene:OsNip_02g0626400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0626400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24985256	24985581	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	24985256	24986844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0626400-03;Name=OsNip_02t0626400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0626400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25054342	25054965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0627750-00;Name=OsNip_02t0627750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0627750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25112192	25112997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0628100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25112192	25113435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0628100-03;Name=OsNip_02t0628100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0628100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25112998	25113435	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0628100-03;Parent=transcript:OsNip_02t0628100-03;protein_id=OsNip_02t0628100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25112870	25113452	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0628100-01;Parent=gene:OsNip_02g0628100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0628100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25112870	25112997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0628100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25112998	25113450	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0628100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0628100-01;protein_id=OsNip_02t0628100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25113451	25113452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0628100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	25110807	25113453	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0628100-04;Parent=gene:OsNip_02g0628100;transcript_id=OsNip_02t0628100-04;Tag=IsoSeq:G3707.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2200.1,Nipponbare.panicle_G2881.1
Chr02	TAMA	exon	25113342	25113453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0628100-04;Name=OsNip_02t0628100-04;exon_id=OsNip_02t0628100-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3707.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2200.1,Nipponbare.panicle_G2881.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0VLX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	25113342	25113452	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0628100-04;Parent=transcript:OsNip_02t0628100-04;protein_id=OsNip_02t0628100-04;Tag=IsoSeq:G3707.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2200.1,Nipponbare.panicle_G2881.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0VLX8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25155024	25155468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629101-00;Name=OsNip_02t0629101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0629101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25155078	25155431	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0629101-00;Parent=transcript:OsNip_02t0629101-00;protein_id=OsNip_02t0629101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25155432	25155468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629101-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25162876	25162946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25162947	25163137	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0629200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0629200-01;protein_id=OsNip_02t0629200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25166192	25166222	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0629200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0629200-01;protein_id=OsNip_02t0629200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25166192	25166544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-01;Name=OsNip_02t0629200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0629200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25162880	25163265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;Name=OsNip_02t0629200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0629200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25162947	25163265	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0629200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;protein_id=OsNip_02t0629200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25163372	25163667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;Name=OsNip_02t0629200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0629200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25165409	25165549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;Name=OsNip_02t0629200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0629200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25165409	25165549	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0629200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;protein_id=OsNip_02t0629200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25166112	25166222	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0629200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;protein_id=OsNip_02t0629200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25166112	25166502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;Name=OsNip_02t0629200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0629200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25166223	25166502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25162880	25163265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-03;Tag=IsoSeq:G3711.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1716.7;prot_id "UniRef90_C9WSP8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25163372	25163474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-03;Tag=IsoSeq:G3711.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1716.7;prot_id "UniRef90_C9WSP8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25163526	25163667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-03;Tag=IsoSeq:G3711.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1716.7;prot_id "UniRef90_C9WSP8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25165409	25165548	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-03;Tag=IsoSeq:G3711.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1716.7;prot_id "UniRef90_C9WSP8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25166255	25166544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629200-03;Tag=IsoSeq:G3711.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1716.7;prot_id "UniRef90_C9WSP8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25162998	25166195	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0629266;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25162998	25166195	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0629266-00;Parent=gene:OsNip_02g0629266;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0629266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25162998	25163261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;Name=OsNip_02t0629266-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0629266-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25162998	25163261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25163369	25163666	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;Name=OsNip_02t0629266-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0629266-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25163369	25163666	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0629266-00;Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;protein_id=OsNip_02t0629266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25165408	25165453	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0629266-00;Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;protein_id=OsNip_02t0629266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25165408	25165545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;Name=OsNip_02t0629266-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0629266-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25165454	25165545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0629266-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25213808	25213934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0630650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25235673	25236419	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631000-01;Name=OsNip_02t0631000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0631000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25239748	25240131	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631100-01;Name=OsNip_02t0631100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0631100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25239880	25240131	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0631100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631100-01;protein_id=OsNip_02t0631100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25240912	25241280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631100-01;Name=OsNip_02t0631100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0631100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25241020	25241280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25242589	25243119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25242589	25243155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25250039	25250135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25250407	25250495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25250407	25250495	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;protein_id=OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25251205	25251319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25251205	25251319	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;protein_id=OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25251715	25251783	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25251715	25251783	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;protein_id=OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25252916	25253018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25252916	25253018	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;protein_id=OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25253411	25253712	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0631200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;protein_id=OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25253411	25253995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25253713	25253995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25255692	25256486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Name=OsNip_02t0631200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0631200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25255692	25256486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25251009	25255916	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0631200-02;Parent=gene:OsNip_02g0631200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25251009	25251172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25251009	25251319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0631200-02;Name=OsNip_02t0631200-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0631200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25350062	25350577	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0632800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0632800-01;protein_id=OsNip_02t0632800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25351599	25351744	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25348530	25349149	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25348530	25349163	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;Name=OsNip_02t0632850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0632850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25349150	25349163	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0632850-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;protein_id=OsNip_02t0632850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25350020	25350221	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0632850-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;protein_id=OsNip_02t0632850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25350020	25350269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;Name=OsNip_02t0632850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0632850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25350222	25350269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	gene	25354039	25355773	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g063289A;Tag=IsoSeq:G3721
Chr02	TAMA	mRNA	25354039	25355773	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t063289A-01;Parent=gene:OsNip_02g063289A;transcript_id=OsNip_02t063289A-01;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1
Chr02	TAMA	exon	25354039	25354291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t063289A-01;Name=OsNip_02t063289A-01-E1;exon_id=OsNip_02t063289A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9YVC5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	25354039	25354291	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t063289A-01;Parent=transcript:OsNip_02t063289A-01;protein_id=OsNip_02t063289A-01;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9YVC5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	25355267	25355773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t063289A-01;Name=OsNip_02t063289A-01-E2;exon_id=OsNip_02t063289A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9YVC5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	25355267	25355292	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t063289A-01;Parent=transcript:OsNip_02t063289A-01;protein_id=OsNip_02t063289A-01;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9YVC5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25355296	25355773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t063289A-01;Tag=IsoSeq:G3721.1;Source=Nipponbare.panicle_G2892.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9YVC5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25356937	25360011	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0632900;Name=OsNip_WAK15;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25356937	25360011	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0632900-00;Parent=gene:OsNip_02g0632900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25356937	25357992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Name=OsNip_02t0632900-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0632900-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25356937	25357992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25358081	25358233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Name=OsNip_02t0632900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0632900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25358081	25358233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25358482	25358826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25358482	25358999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Name=OsNip_02t0632900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0632900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25358827	25358999	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0632900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;protein_id=OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25359093	25360011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;Name=OsNip_02t0632900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0632900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25359093	25360011	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0632900-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632900-00;protein_id=OsNip_02t0632900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25361261	25365392	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0632950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25361261	25365392	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0632950-00;Parent=gene:OsNip_02g0632950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0632950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25361261	25361431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25361261	25361488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;Name=OsNip_02t0632950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0632950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25361432	25361488	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0632950-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;protein_id=OsNip_02t0632950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25364548	25364946	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0632950-00;Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;protein_id=OsNip_02t0632950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25364548	25365392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;Name=OsNip_02t0632950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0632950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25364947	25365392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0632950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25361374	25365608	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0633000;biotype=protein_coding;description=Lipase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25361374	25365608	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0633000-00;Parent=gene:OsNip_02g0633000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0633000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25361374	25361544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25361374	25361555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633000-00;Name=OsNip_02t0633000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0633000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25361545	25361555	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0633000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0633000-00;protein_id=OsNip_02t0633000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25364606	25365608	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633000-00;Name=OsNip_02t0633000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0633000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25364606	25365608	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0633000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0633000-00;protein_id=OsNip_02t0633000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25374692	25377893	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0633066;Name=OsNip_WAK16;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25374692	25377893	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0633066-00;Parent=gene:OsNip_02g0633066;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0633066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25374692	25375938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;Name=OsNip_02t0633066-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0633066-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25374692	25375938	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0633066-00;Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;protein_id=OsNip_02t0633066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25376027	25376179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;Name=OsNip_02t0633066-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0633066-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25376027	25376179	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0633066-00;Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;protein_id=OsNip_02t0633066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25376344	25376799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;Name=OsNip_02t0633066-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0633066-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25376344	25376799	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0633066-00;Parent=transcript:OsNip_02t0633066-00;protein_id=OsNip_02t0633066-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25454258	25454378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0634900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25469078	25469526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635200-01;Name=OsNip_02t0635200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0635200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25471563	25471958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635300-00;Name=OsNip_02t0635300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0635300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25480704	25480964	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0635400-00;Parent=gene:OsNip_02g0635400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0635400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25480704	25480964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635400-00;Name=OsNip_02t0635400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0635400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25488084	25488154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25488084	25490696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;Name=OsNip_02t0635600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0635600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25488155	25490696	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0635600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;protein_id=OsNip_02t0635600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25490811	25490906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;Name=OsNip_02t0635600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0635600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25490811	25490906	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0635600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;protein_id=OsNip_02t0635600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25491071	25491432	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0635600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;protein_id=OsNip_02t0635600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25491071	25491732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;Name=OsNip_02t0635600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0635600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25491433	25491732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25491958	25493981	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0635700;biotype=protein_coding;description=E2F-associated;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25491958	25493981	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0635700-01;Parent=gene:OsNip_02g0635700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25491958	25492018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25491958	25492100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;Name=OsNip_02t0635700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0635700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25492019	25492100	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0635700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;protein_id=OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25492286	25492451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;Name=OsNip_02t0635700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0635700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25492286	25492451	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0635700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;protein_id=OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25493543	25493801	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0635700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;protein_id=OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25493543	25493981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;Name=OsNip_02t0635700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0635700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25493802	25493981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25497325	25498429	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0635800;Name=OsNip_TCP7;biotype=protein_coding;description=Transcription;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25497325	25498429	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0635800-01;Parent=gene:OsNip_02g0635800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0635800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25497325	25497408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0635800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25512859	25512947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25514509	25514861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25514509	25515465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-01;Name=OsNip_02t0636400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0636400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25514862	25515464	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0636400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0636400-01;protein_id=OsNip_02t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25515465	25515465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	25514688	25517331	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0636400-02;Parent=gene:OsNip_02g0636400;transcript_id=OsNip_02t0636400-02;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3
Chr02	TAMA	exon	25516892	25517331	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-02;Name=OsNip_02t0636400-02;exon_id=OsNip_02t0636400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3;prot_id "UniRef90_A0A7I8K254";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	25516892	25517331	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0636400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0636400-02;protein_id=OsNip_02t0636400-02;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3;prot_id "UniRef90_A0A7I8K254";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	25514688	25515766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-02;Name=OsNip_02t0636400-02;exon_id=OsNip_02t0636400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3;prot_id "UniRef90_A0A7I8K254";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	25515763	25515766	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0636400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0636400-02;protein_id=OsNip_02t0636400-02;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3;prot_id "UniRef90_A0A7I8K254";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25514688	25515760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636400-02;Tag=IsoSeq:G3735.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2216.3;prot_id "UniRef90_A0A7I8K254";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25523466	25524380	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0636600;biotype=protein_coding;description=GRAM;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25523466	25524380	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0636600-00;Parent=gene:OsNip_02g0636600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0636600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25523466	25523917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;Name=OsNip_02t0636600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0636600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25523466	25523917	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0636600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;protein_id=OsNip_02t0636600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25524035	25524103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;Name=OsNip_02t0636600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0636600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25524035	25524103	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0636600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;protein_id=OsNip_02t0636600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25524212	25524380	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;Name=OsNip_02t0636600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0636600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25524212	25524380	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0636600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0636600-00;protein_id=OsNip_02t0636600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25527702	25529056	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0636700;biotype=protein_coding;description=GRAM;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25527702	25529056	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0636700-01;Parent=gene:OsNip_02g0636700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25527702	25528051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25527702	25528506	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;Name=OsNip_02t0636700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0636700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25528052	25528506	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0636700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;protein_id=OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25528611	25528706	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;Name=OsNip_02t0636700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0636700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25528611	25528706	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0636700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;protein_id=OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25528801	25528948	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0636700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;protein_id=OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25528801	25529056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;Name=OsNip_02t0636700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0636700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25528949	25529056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0636700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25539579	25540404	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0637000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25539579	25540404	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0637000-01;Parent=gene:OsNip_02g0637000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0637000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25539579	25539580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0637000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25539579	25540404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0637000-01;Name=OsNip_02t0637000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0637000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25539581	25540060	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0637000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0637000-01;protein_id=OsNip_02t0637000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25540061	25540404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0637000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	gene	25540289	25543037	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g063719A;Tag=IsoSeq:G3739
Chr02	TAMA	mRNA	25540289	25543037	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t063719A-01;Parent=gene:OsNip_02g063719A;transcript_id=OsNip_02t063719A-01;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1
Chr02	TAMA	exon	25542643	25543037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;Name=OsNip_02t063719A-01-E1;exon_id=OsNip_02t063719A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	25542953	25543036	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t063719A-01;Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;protein_id=OsNip_02t063719A-01;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	25540289	25540550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;Name=OsNip_02t063719A-01-E2;exon_id=OsNip_02t063719A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25543037	25543037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25542643	25542950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25540289	25540550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t063719A-01;Tag=IsoSeq:G3739.1;Source=Nipponbare.panicle_G2908.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NI82";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25550305	25550944	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0637200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25550305	25550944	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0637200-01;Parent=gene:OsNip_02g0637200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0637200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25550305	25550572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0637200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25640927	25640975	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0639100-00;Parent=transcript:OsNip_02t0639100-00;protein_id=OsNip_02t0639100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25640927	25640990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639100-00;Name=OsNip_02t0639100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0639100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25640976	25640990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25646627	25646716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25646627	25648251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-01;Name=OsNip_02t0639300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0639300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25646717	25647118	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639300-01;protein_id=OsNip_02t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25647119	25648251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	25646625	25648202	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0639300-02;Parent=gene:OsNip_02g0639300;transcript_id=OsNip_02t0639300-02;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2
Chr02	TAMA	exon	25646625	25647084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;Name=OsNip_02t0639300-02;exon_id=OsNip_02t0639300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	25646835	25647084	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0639300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;protein_id=OsNip_02t0639300-02;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	25647206	25648202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;Name=OsNip_02t0639300-02;exon_id=OsNip_02t0639300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	25647206	25647228	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0639300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;protein_id=OsNip_02t0639300-02;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	25646625	25646834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	25647232	25648202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639300-02;Tag=IsoSeq:G3747.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2223.2;prot_id "UniRef90_B8A2S5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25652554	25659494	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0639500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25652554	25659494	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0639500-01;Parent=gene:OsNip_02g0639500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25652554	25652707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;Name=OsNip_02t0639500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0639500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25652554	25652707	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0639500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;protein_id=OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25653997	25654303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;Name=OsNip_02t0639500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0639500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25653997	25654303	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0639500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;protein_id=OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25655015	25655144	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0639500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;protein_id=OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25658790	25658984	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0639500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;protein_id=OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25658790	25659494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;Name=OsNip_02t0639500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0639500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25658985	25659494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25655001	25658982	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0639550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25655001	25658982	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0639550-00;Parent=gene:OsNip_02g0639550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0639550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25655001	25655162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639550-00;Name=OsNip_02t0639550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0639550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25655001	25655162	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0639550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0639550-00;protein_id=OsNip_02t0639550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25658814	25658929	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0639550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0639550-00;protein_id=OsNip_02t0639550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25658814	25658982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639550-00;Name=OsNip_02t0639550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0639550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25658930	25658982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25660296	25664328	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0639600-01;Parent=gene:OsNip_02g0639600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25660296	25660595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25660596	25660760	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0639600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0639600-01;protein_id=OsNip_02t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25663265	25664328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639600-01;Name=OsNip_02t0639600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0639600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25664087	25664328	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25665014	25671633	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0639700;biotype=protein_coding;description=Region;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25665014	25671633	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0639700-01;Parent=gene:OsNip_02g0639700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25665014	25665257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639700-01;Name=OsNip_02t0639700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0639700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25665014	25665257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25666280	25666322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0639700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25693917	25694076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0640200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25694675	25694768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0640200-01;Name=OsNip_02t0640200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0640200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25724040	25726064	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0640500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0640500-01;protein_id=OsNip_02t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25726065	25726080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0640500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25736401	25736487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0640800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25772936	25773091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641800-02;Name=OsNip_02t0641800-02-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0641800-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25773015	25773091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25773831	25774435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25776689	25778145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641850-01;Name=OsNip_02t0641850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0641850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25778113	25780795	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0641900;Name=myb7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25778113	25780795	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0641900-01;Parent=gene:OsNip_02g0641900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0641900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25778113	25778231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25778232	25778364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0641900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;protein_id=OsNip_02t0641900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25778873	25779002	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;Name=OsNip_02t0641900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0641900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25778873	25779002	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0641900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;protein_id=OsNip_02t0641900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25779780	25780795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;Name=OsNip_02t0641900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0641900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25780420	25780795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0641900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25779761	25780436	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0642050-00;Parent=gene:OsNip_02g0642050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0642050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25779761	25779923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25779761	25780436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642050-00;Name=OsNip_02t0642050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0642050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25779924	25780283	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0642050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0642050-00;protein_id=OsNip_02t0642050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25780284	25780436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	25789355	25791213	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0642200;Name=OsNip_REM1.4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25789355	25791213	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0642200-01;Parent=gene:OsNip_02g0642200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0642200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25789355	25789499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25789355	25789700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;Name=OsNip_02t0642200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0642200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25790136	25790217	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0642200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;protein_id=OsNip_02t0642200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25790398	25790485	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;Name=OsNip_02t0642200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0642200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	25790398	25790485	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0642200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;protein_id=OsNip_02t0642200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	25790569	25790640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0642200-01;Name=OsNip_02t0642200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0642200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	25858610	25859028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0643500-01;Name=OsNip_02t0643500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0643500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25890445	25900918	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0644000-01;Parent=gene:OsNip_02g0644000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0644000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25890445	25890632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0644000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	25946487	25954551	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0644700-01;Parent=gene:OsNip_02g0644700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0644700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26143957	26144729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0649300-01;Name=OsNip_02t0649300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0649300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	26248643	26251980	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0651300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26248643	26251980	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0651300-01;Parent=gene:OsNip_02g0651300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0651300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26248643	26248898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0651300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26248643	26248976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0651300-01;Name=OsNip_02t0651300-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0651300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	26271681	26272652	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0651900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26271681	26272652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0651900-01;Name=OsNip_02t0651900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0651900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26272388	26272652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0651900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26275400	26277684	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0652000-01;Parent=gene:OsNip_02g0652000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0652000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26275400	26275670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0652000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26275671	26275932	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0652000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0652000-01;protein_id=OsNip_02t0652000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26277224	26277600	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0652000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0652000-01;protein_id=OsNip_02t0652000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26277224	26277684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0652000-01;Name=OsNip_02t0652000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0652000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26277601	26277684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0652000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26352881	26353360	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0653400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0653400-01;protein_id=OsNip_02t0653400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26352881	26353445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0653400-01;Name=OsNip_02t0653400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0653400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26353361	26353445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0653400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26365830	26370471	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0653800;Name=OsNip_Rab1C3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26365902	26365992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0653800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26365902	26366006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0653800-01;Name=OsNip_02t0653800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0653800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26368413	26368460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0653800-01;Name=OsNip_02t0653800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0653800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26396308	26396486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26396501	26403263	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0654400;biotype=protein_coding;description=Transcription;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26396501	26403263	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0654400-01;Parent=gene:OsNip_02g0654400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26396501	26396825	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26397098	26397347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654400-01;Name=OsNip_02t0654400-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0654400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26397098	26397347	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0654400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0654400-01;protein_id=OsNip_02t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26398320	26398375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654400-01;Name=OsNip_02t0654400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0654400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26409779	26410829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654600-01;Tag=IsoSeq:G3795.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2249.2;prot_id "UniRef90_UPI000B425D83";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26422187	26423485	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0654700;Name=ERF91;biotype=protein_coding;description=AP2/ERF;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26422187	26423485	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0654700-01;Parent=gene:OsNip_02g0654700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0654700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26422187	26422513	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0654700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26469236	26469277	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	26465757	26469248	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0655300-04;Parent=gene:OsNip_02g0655300;transcript_id=OsNip_02t0655300-04;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3
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Chr02	TAMA	CDS	26469215	26469248	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0655300-04;Parent=transcript:OsNip_02t0655300-04;protein_id=OsNip_02t0655300-04;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3;prot_id "UniRef90_A0A6A6LGC2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	CDS	26468947	26469017	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0655300-04;Parent=transcript:OsNip_02t0655300-04;protein_id=OsNip_02t0655300-04;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3;prot_id "UniRef90_A0A6A6LGC2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	26465757	26466023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655300-04;Name=OsNip_02t0655300-04;exon_id=OsNip_02t0655300-04-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3;prot_id "UniRef90_A0A6A6LGC2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26468455	26468944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655300-04;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3;prot_id "UniRef90_A0A6A6LGC2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26465757	26466023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655300-04;Tag=IsoSeq:G3798.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2952.3;prot_id "UniRef90_A0A6A6LGC2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26466817	26467222	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0655401;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26466817	26467222	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0655401-00;Parent=gene:OsNip_02g0655401;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0655401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26466817	26467222	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655401-00;Name=OsNip_02t0655401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0655401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26471633	26473622	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0655500;Name=OsNip_STA68;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26471633	26473622	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0655500-01;Parent=gene:OsNip_02g0655500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0655500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26471633	26471692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26471633	26471810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655500-01;Name=OsNip_02t0655500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0655500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26471693	26471810	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0655500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0655500-01;protein_id=OsNip_02t0655500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26472461	26472748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655500-01;Name=OsNip_02t0655500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0655500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26472461	26472748	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0655500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0655500-01;protein_id=OsNip_02t0655500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26494493	26495490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0655800-03;Tag=IsoSeq:G3801.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2253.1,Nipponbare.panicle_G2954.1;prot_id "UniRef90_M8BLU4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26501183	26501351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0656100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26501183	26502437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0656100-01;Name=OsNip_02t0656100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0656100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26502285	26502437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0656100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26501186	26502284	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0656100-02;Parent=gene:OsNip_02g0656100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0656100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26501186	26501351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0656100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	26571916	26571916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657600-01;Tag=IsoSeq:G3807.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2257.1,Nipponbare.panicle_G2958.1,Nipponbare.panicle_G2958.2,Nipponbare.root_G2257.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9NHV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26572064	26573250	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657600-01;Tag=IsoSeq:G3807.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2257.1,Nipponbare.panicle_G2958.1,Nipponbare.panicle_G2958.2,Nipponbare.root_G2257.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9NHV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	26573963	26574200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657700-01;Name=OsNip_02t0657700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0657700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26574418	26574511	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0657700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0657700-01;protein_id=OsNip_02t0657700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26576167	26576573	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0657700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0657700-01;protein_id=OsNip_02t0657700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26576167	26576645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657700-01;Name=OsNip_02t0657700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0657700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26576574	26576645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26579595	26579821	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0657775-00;Parent=gene:OsNip_02g0657775;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0657775-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26579595	26579658	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657775-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26579595	26579821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0657775-00;Name=OsNip_02t0657775-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0657775-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26579659	26579763	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0657775-00;Parent=transcript:OsNip_02t0657775-00;protein_id=OsNip_02t0657775-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	26620307	26620519	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Name=OsNip_02t0658300-02;exon_id=OsNip_02t0658300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	26620309	26620519	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0658300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;protein_id=OsNip_02t0658300-02;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	26620630	26620756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Name=OsNip_02t0658300-02;exon_id=OsNip_02t0658300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	exon	26621920	26622211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Name=OsNip_02t0658300-02;exon_id=OsNip_02t0658300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	26620307	26620308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26620704	26620756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	26621920	26622211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658300-02;Tag=IsoSeq:G3811.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1756.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26625056	26627870	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0658400;Name=OsNip_REM0.1;biotype=protein_coding;description=Remorin%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26625056	26627870	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0658400-01;Parent=gene:OsNip_02g0658400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0658400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26625056	26625435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	26649847	26650194	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0658850-00;Parent=transcript:OsNip_02t0658850-00;protein_id=OsNip_02t0658850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26663354	26663474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0658900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26699095	26701207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26841960	26842296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0662900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26842426	26842637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0662900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26843614	26843961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0662900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26854625	26854948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	26853143	26854630	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0663200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	26853143	26854630	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0663200-00;Parent=gene:OsNip_02g0663200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0663200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26853143	26853371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663200-00;Name=OsNip_02t0663200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0663200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26853143	26853371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26853444	26853445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	26853444	26854630	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663200-00;Name=OsNip_02t0663200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0663200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26853869	26854630	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0663200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27014876	27015209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0665200-02;Tag=IsoSeq:G3830.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2976.1,Nipponbare.root_G2271.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27015398	27015706	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0665250-01;Parent=transcript:OsNip_02t0665250-01;protein_id=OsNip_02t0665250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27015707	27015749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0665250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27018440	27021331	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0665300-01;Parent=gene:OsNip_02g0665300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0665300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27018440	27018597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0665300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27018440	27021331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0665300-01;Name=OsNip_02t0665300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0665300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27018527	27018597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0665300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27018598	27020973	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0665300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0665300-02;protein_id=OsNip_02t0665300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27035723	27036001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0666000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27044341	27044451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0666200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27120685	27121179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0668100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27124395	27124417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0668100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27188029	27188490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0669700-02;Tag=IsoSeq:G3848.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G2991.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3F8P8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27228831	27229723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670500-01;Name=OsNip_02t0670500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27228956	27229315	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0670500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0670500-01;protein_id=OsNip_02t0670500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27229316	27229723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	27228833	27229601	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0670500-02;Parent=gene:OsNip_02g0670500;transcript_id=OsNip_02t0670500-02;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3
Chr02	TAMA	exon	27228833	27228980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670500-02;Name=OsNip_02t0670500-02;exon_id=OsNip_02t0670500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3;prot_id "UniRef90_K3XSQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	27228833	27228980	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0670500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0670500-02;protein_id=OsNip_02t0670500-02;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3;prot_id "UniRef90_K3XSQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	27229096	27229601	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670500-02;Name=OsNip_02t0670500-02;exon_id=OsNip_02t0670500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3;prot_id "UniRef90_K3XSQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	27229096	27229148	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0670500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0670500-02;protein_id=OsNip_02t0670500-02;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3;prot_id "UniRef90_K3XSQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27229152	27229601	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670500-02;Tag=IsoSeq:G3852.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G2994.3;prot_id "UniRef90_K3XSQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27237052	27241155	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0670700;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27237052	27241155	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0670700-01;Parent=gene:OsNip_02g0670700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27237052	27237428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27237052	27237428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27237519	27237675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27237519	27237675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27237823	27237887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27237823	27237887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27238082	27238138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27238082	27238138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27238403	27238537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27238403	27238537	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27238623	27238656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27238623	27241155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Name=OsNip_02t0670700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27238657	27240720	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0670700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;protein_id=OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27240721	27241155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27244843	27246916	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0670900;Name=OsNip_ANT3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27244843	27246897	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0670900-02;Parent=gene:OsNip_02g0670900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0670900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27244843	27244873	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27244843	27246897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-02;Name=OsNip_02t0670900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27244874	27246337	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0670900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0670900-02;protein_id=OsNip_02t0670900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27246338	27246897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27245220	27246916	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0670900-05;Parent=gene:OsNip_02g0670900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0670900-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27245220	27245221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27245220	27246916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-05;Name=OsNip_02t0670900-05-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0670900-05-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27245222	27246337	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0670900-05;Parent=transcript:OsNip_02t0670900-05;protein_id=OsNip_02t0670900-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27246338	27246916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0670900-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27248839	27250065	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0671100;Name=MAIF1;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27248839	27250065	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0671100-01;Parent=gene:OsNip_02g0671100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0671100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27248839	27248867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27248839	27250065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671100-01;Name=OsNip_02t0671100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0671100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27248868	27250001	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0671100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0671100-01;protein_id=OsNip_02t0671100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27250002	27250065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27262061	27263495	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0671200;Name=OsNip__F0676;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27262061	27263495	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0671200-01;Parent=gene:OsNip_02g0671200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0671200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27262061	27262062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27262061	27263495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671200-01;Name=OsNip_02t0671200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0671200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27262063	27263175	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0671200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0671200-01;protein_id=OsNip_02t0671200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27263176	27263495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27266202	27269207	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0671300;Name=OsNip_bHLH076;biotype=protein_coding;description=Basic;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27266202	27269207	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0671300-01;Parent=gene:OsNip_02g0671300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0671300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27266202	27266287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27266202	27266464	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671300-01;Name=OsNip_02t0671300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0671300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27266288	27266464	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0671300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0671300-01;protein_id=OsNip_02t0671300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27266589	27266633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671300-01;Name=OsNip_02t0671300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0671300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27299855	27300008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	27298397	27298765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671800-02;Name=OsNip_02t0671800-02;exon_id=OsNip_02t0671800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3856.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2289.1;prot_id "UniRef90_Q8W0X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	27300045	27300045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671800-02;Tag=IsoSeq:G3856.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2289.1;prot_id "UniRef90_Q8W0X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27298397	27298765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671800-02;Tag=IsoSeq:G3856.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2289.1;prot_id "UniRef90_Q8W0X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27306666	27309617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27306666	27310941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0671950-01;Name=OsNip_02t0671950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0671950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27316157	27316240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672100-01;Name=OsNip_02t0672100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0672100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27316157	27316240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27316825	27317050	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0672100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0672100-01;protein_id=OsNip_02t0672100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27318385	27318784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672100-01;Name=OsNip_02t0672100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0672100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27371474	27371727	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672700-02;Tag=IsoSeq:G3861.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2294.1;prot_id "UniRef90_D5AAK0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27374262	27374482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;Name=OsNip_02t0672800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0672800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27374566	27374793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;Name=OsNip_02t0672800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0672800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27375738	27375775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;Name=OsNip_02t0672800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0672800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27375738	27375775	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0672800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;protein_id=OsNip_02t0672800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27376123	27376200	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0672800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;protein_id=OsNip_02t0672800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27376123	27376761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;Name=OsNip_02t0672800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0672800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27376201	27376761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0672800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27386926	27388940	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0673000-01;Parent=gene:OsNip_02g0673000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0673000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27386926	27387279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0673000-01;Name=OsNip_02t0673000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0673000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27386926	27387279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0673000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27387800	27387802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0673000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27387800	27388940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0673000-01;Name=OsNip_02t0673000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0673000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27387803	27388483	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0673000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0673000-01;protein_id=OsNip_02t0673000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	27549673	27549791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-01;Name=OsNip_02t0675800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0675800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27549673	27549791	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0675800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0675800-01;protein_id=OsNip_02t0675800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27550802	27551231	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0675800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0675800-01;protein_id=OsNip_02t0675800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27550802	27551592	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-01;Name=OsNip_02t0675800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0675800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27551232	27551592	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	27548414	27551552	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0675800-02;Parent=gene:OsNip_02g0675800;transcript_id=OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1
Chr02	TAMA	exon	27548414	27549337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Name=OsNip_02t0675800-02;exon_id=OsNip_02t0675800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	27548415	27548792	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0675800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;protein_id=OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	27549673	27549791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Name=OsNip_02t0675800-02;exon_id=OsNip_02t0675800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	27548414	27548414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27549673	27549791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27550534	27550652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27550802	27551552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0675800-02;Tag=IsoSeq:G3871.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3008.1;prot_id "UniRef90_C5YE44";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27559285	27567041	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0676000;biotype=protein_coding;description=Membrane;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27559285	27566940	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0676000-01;Parent=gene:OsNip_02g0676000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0676000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27559285	27559400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0676000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27652935	27654206	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0677300-02;Parent=gene:OsNip_02g0677300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0677300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27652935	27652979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0677300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27652935	27654206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0677300-02;Name=OsNip_02t0677300-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0677300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27652980	27653654	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0677300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0677300-02;protein_id=OsNip_02t0677300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27653655	27654206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0677300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27658924	27660116	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0677600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27658946	27660116	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0677600-01;Parent=gene:OsNip_02g0677600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0677600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27802235	27802444	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0681000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0681000-01;protein_id=OsNip_02t0681000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27803399	27803476	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0681000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0681000-01;protein_id=OsNip_02t0681000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27803399	27803714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0681000-01;Name=OsNip_02t0681000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0681000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27803477	27803714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0681000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	27798154	27803719	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0681000-02;Parent=gene:OsNip_02g0681000;transcript_id=OsNip_02t0681000-02;Tag=IsoSeq:G3882.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3015.1
Chr02	TAMA	exon	27798154	27798282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0681000-02;Name=OsNip_02t0681000-02;exon_id=OsNip_02t0681000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3882.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3015.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5VVA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	27798156	27798282	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0681000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0681000-02;protein_id=OsNip_02t0681000-02;Tag=IsoSeq:G3882.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3015.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5VVA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27988376	27988849	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0684300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0684300-01;protein_id=OsNip_02t0684300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27988376	27988901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684300-01;Name=OsNip_02t0684300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0684300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	27988376	27989371	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684300-02;Name=OsNip_02t0684300-02;exon_id=OsNip_02t0684300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G3893.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3023.2;prot_id "UniRef90_A0A2G5F857";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27986583	27986877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684300-02;Tag=IsoSeq:G3893.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3023.2;prot_id "UniRef90_A0A2G5F857";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	27988376	27989371	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684300-02;Tag=IsoSeq:G3893.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3023.2;prot_id "UniRef90_A0A2G5F857";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	27989526	27990398	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0684400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27989526	27990398	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0684400-01;Parent=gene:OsNip_02g0684400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0684400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27989526	27989711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27989526	27990027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;Name=OsNip_02t0684400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0684400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27989712	27990027	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0684400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;protein_id=OsNip_02t0684400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	27990137	27990348	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0684400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;protein_id=OsNip_02t0684400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	27990137	27990398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;Name=OsNip_02t0684400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0684400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27990349	27990398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0684400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	27994105	27994677	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0684500-00;Parent=gene:OsNip_02g0684500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0684500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28041117	28041515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0685200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28117979	28118084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686450-00;Name=OsNip_02t0686450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0686450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28118218	28118374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686450-00;Name=OsNip_02t0686450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0686450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28122848	28123818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686500-01;Name=OsNip_02t0686500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0686500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28123012	28123818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28123691	28123940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28123691	28124165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;Name=OsNip_02t0686600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0686600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28124594	28124665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;Name=OsNip_02t0686600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0686600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28124594	28124665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0686600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;protein_id=OsNip_02t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28124759	28124878	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;Name=OsNip_02t0686600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0686600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28126955	28127101	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0686600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;protein_id=OsNip_02t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28127817	28128078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686600-01;Name=OsNip_02t0686600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0686600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28132758	28133637	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0686700-01;Parent=gene:OsNip_02g0686700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0686700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28133295	28133383	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0686700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0686700-01;protein_id=OsNip_02t0686700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28133295	28133637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686700-01;Name=OsNip_02t0686700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0686700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28133384	28133637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28136347	28137459	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0686800-01;Parent=gene:OsNip_02g0686800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0686800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28137025	28137459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0686800-01;Name=OsNip_02t0686800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0686800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	28212261	28216552	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0688000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28212261	28216552	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0688000-00;Parent=gene:OsNip_02g0688000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28212261	28212337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28212261	28212673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Name=OsNip_02t0688000-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0688000-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28212338	28212667	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0688000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;protein_id=OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28212668	28212673	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28213064	28213251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Name=OsNip_02t0688000-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0688000-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28213064	28213251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28213336	28213526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Name=OsNip_02t0688000-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0688000-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28213336	28213526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0688000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28279816	28279963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28291064	28291093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28291640	28291677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	28291699	28291700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689700-03;Tag=IsoSeq:G3911.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3040.1;prot_id "UniRef90_F6I1H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28290928	28291672	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689700-03;Tag=IsoSeq:G3911.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3040.1;prot_id "UniRef90_F6I1H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28294322	28299880	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0689800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28294322	28299880	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0689800-01;Parent=gene:OsNip_02g0689800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0689800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28294322	28294696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28294322	28295108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Name=OsNip_02t0689800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0689800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28295266	28295732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Name=OsNip_02t0689800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0689800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28298055	28298122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Name=OsNip_02t0689800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0689800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28298200	28298264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Name=OsNip_02t0689800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0689800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28298429	28299880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689800-01;Name=OsNip_02t0689800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0689800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28312696	28312985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28315706	28315880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;Name=OsNip_02t0689900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0689900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28315706	28315880	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0689900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;protein_id=OsNip_02t0689900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28316079	28316081	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0689900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;protein_id=OsNip_02t0689900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28316079	28316195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;Name=OsNip_02t0689900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0689900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28316082	28316195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0689900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28318735	28319280	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0690000-01;Parent=gene:OsNip_02g0690000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0690000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28318735	28318916	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28318735	28319280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690000-01;Name=OsNip_02t0690000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28319280	28319280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28335171	28335315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690200-02;Tag=IsoSeq:G3913.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3042.2;prot_id "UniRef90_C5YEY7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28335762	28335908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28337629	28337754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28338054	28339303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28339426	28339494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28339803	28339892	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28342758	28342809	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28342906	28342981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28343785	28344078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690300-01;Name=OsNip_02t0690300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28345982	28350171	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0690500;Name=OsNip_PP2C26;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28346403	28347689	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0690500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;protein_id=OsNip_02t0690500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28348017	28348130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;Name=OsNip_02t0690500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0690500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28348017	28348130	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0690500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;protein_id=OsNip_02t0690500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28349488	28349612	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0690500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;protein_id=OsNip_02t0690500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28349488	28350171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;Name=OsNip_02t0690500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0690500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28349613	28350171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28346390	28349984	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0690550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28346390	28349984	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0690550-00;Parent=gene:OsNip_02g0690550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28346390	28346841	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0690550-00;Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;protein_id=OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28346390	28347687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Name=OsNip_02t0690550-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690550-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28346842	28347687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28348015	28348117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Name=OsNip_02t0690550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28348015	28348117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28348351	28348631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Name=OsNip_02t0690550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28348351	28348631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28349487	28349984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Name=OsNip_02t0690550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28349487	28349984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28352052	28353541	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0690600;Name=OsNip_PUB36;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28352052	28353541	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0690600-01;Parent=gene:OsNip_02g0690600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0690600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28352052	28352086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28352052	28353541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690600-01;Name=OsNip_02t0690600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28352087	28353364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0690600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0690600-01;protein_id=OsNip_02t0690600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28353365	28353541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28355603	28360508	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0690700;biotype=protein_coding;description=Clathrin;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28355603	28360508	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0690700-01;Parent=gene:OsNip_02g0690700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0690700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28355603	28355804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28355603	28355887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690700-01;Name=OsNip_02t0690700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0690700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28355805	28355887	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0690700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0690700-01;protein_id=OsNip_02t0690700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28356633	28356810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690700-01;Name=OsNip_02t0690700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0690700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28366551	28366903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0690800-01;Name=OsNip_02t0690800-02-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0690800-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28420214	28420373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0691900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28420480	28420576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0691900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28423111	28423988	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0691900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28421416	28423535	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0692000-01;Parent=gene:OsNip_02g0692000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0692000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28421416	28421904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0692000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28421416	28423535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0692000-01;Name=OsNip_02t0692000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0692000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28421905	28423074	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0692000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0692000-01;protein_id=OsNip_02t0692000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28423075	28423535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0692000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28435079	28436672	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0692700-01;Parent=gene:OsNip_02g0692700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0692700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28435079	28435532	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0692700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28435079	28435832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0692700-01;Name=OsNip_02t0692700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0692700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28435533	28435832	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0692700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0692700-01;protein_id=OsNip_02t0692700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28541106	28541162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28542270	28542426	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	28546070	28546144	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28546070	28546144	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0694700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;protein_id=OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28546237	28546771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28546237	28546771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0694700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;protein_id=OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28546850	28547231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28546850	28547231	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0694700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;protein_id=OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28547333	28547420	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0694700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;protein_id=OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28547333	28547574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28547421	28547574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28547664	28547829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28547664	28547829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28548098	28548337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Name=OsNip_02t0694700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0694700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28548098	28548337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28548351	28551798	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0694800-01;Parent=gene:OsNip_02g0694800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28548351	28548678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28548351	28548768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28548679	28548768	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28548987	28549068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28548987	28549068	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28549237	28549283	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28549237	28549283	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28549376	28549457	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28549531	28549641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28549531	28549641	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28549726	28549797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28549726	28549797	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;protein_id=OsNip_02t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28549912	28550156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0694800-01;Name=OsNip_02t0694800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0694800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28583384	28583636	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0695800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0695800-01;protein_id=OsNip_02t0695800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28583724	28584178	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0695800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0695800-01;protein_id=OsNip_02t0695800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28583724	28584180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0695800-01;Name=OsNip_02t0695800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0695800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28673761	28674279	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0697300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;protein_id=OsNip_02t0697300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28675085	28675330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;Name=OsNip_02t0697300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0697300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28675085	28675330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0697300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;protein_id=OsNip_02t0697300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28676155	28676568	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0697300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;protein_id=OsNip_02t0697300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28676155	28676757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;Name=OsNip_02t0697300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0697300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28676569	28676757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0697300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	28673002	28673380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0697300-02;Name=OsNip_02t0697300-02;exon_id=OsNip_02t0697300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3933.9;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2342.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0GBN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	28673004	28673372	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0697300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0697300-02;protein_id=OsNip_02t0697300-02;Tag=IsoSeq:G3933.9;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2342.8;prot_id "UniRef90_A0A0E0GBN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28681761	28683248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0697500-03;Tag=IsoSeq:G3934.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3060.2;prot_id "UniRef90_UPI00192A03A6";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28703757	28704291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0698000-04;Tag=IsoSeq:G3938.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1808.4;prot_id "UniRef90_A0A7C9E783";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28704731	28705040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0698100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28752734	28752795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0699000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28751920	28752721	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0699150-00;Parent=gene:OsNip_02g0699150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0699150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28751920	28752166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0699150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28751920	28752721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0699150-00;Name=OsNip_02t0699150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0699150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28752167	28752721	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0699150-00;Parent=transcript:OsNip_02t0699150-00;protein_id=OsNip_02t0699150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28755172	28758583	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0699300;Name=OsNip_ARFB1d;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28773019	28773519	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0699600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0699600-01;protein_id=OsNip_02t0699600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28773520	28773523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0699600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28773078	28773747	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0699600-02;Tag=IsoSeq:G3948.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3070.1;prot_id "UniRef90_A0A5A7RA40";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28823534	28823534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0700600-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28943682	28943683	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0702500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28965325	28965942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0702700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28967587	28971989	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0702800-01;Parent=gene:OsNip_02g0702800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0702800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28970995	28971131	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0702800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0702800-01;protein_id=OsNip_02t0702800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28971292	28971385	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0702800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0702800-01;protein_id=OsNip_02t0702800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28971598	28971767	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0702800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0702800-01;protein_id=OsNip_02t0702800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28971598	28971989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0702800-01;Name=OsNip_02t0702800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0702800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28997279	28997385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703600-02;Tag=IsoSeq:G3964.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2364.1;prot_id "UniRef90_A0A1D6HHH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	28997541	28998454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703600-02;Tag=IsoSeq:G3964.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2364.1;prot_id "UniRef90_A0A1D6HHH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	28995728	28998274	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0703700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	28995728	28998274	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0703700-00;Parent=gene:OsNip_02g0703700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0703700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28995728	28996358	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703700-00;Name=OsNip_02t0703700-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0703700-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28995728	28996358	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28996463	28996538	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	28996463	28996848	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0703700-00;Name=OsNip_02t0703700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0703700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	28996539	28996848	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0703700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0703700-00;protein_id=OsNip_02t0703700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29113806	29114646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29113445	29113547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29116296	29116372	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;Name=OsNip_02t0705400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0705400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29116296	29116372	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0705400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;protein_id=OsNip_02t0705400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29116871	29116896	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0705400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;protein_id=OsNip_02t0705400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29116871	29117170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;Name=OsNip_02t0705400-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0705400-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29116897	29117170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29117082	29119291	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0705500;Name=OsNip_bHLH079;biotype=protein_coding;description=Helix-loop-helix;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29117082	29119217	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0705500-02;Parent=gene:OsNip_02g0705500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0705500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29117082	29117211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29117082	29117249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;Name=OsNip_02t0705500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0705500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29117212	29117249	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0705500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;protein_id=OsNip_02t0705500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29117662	29117740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;Name=OsNip_02t0705500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0705500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29117662	29117740	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0705500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;protein_id=OsNip_02t0705500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29117837	29118130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;Name=OsNip_02t0705500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0705500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29117837	29118130	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0705500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0705500-02;protein_id=OsNip_02t0705500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29203890	29203913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29206676	29208686	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0706600;Name=OsNip_ZHD7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29206676	29208686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0706600-00;Parent=gene:OsNip_02g0706600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29206676	29206848	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29206676	29208196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;Name=OsNip_02t0706600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0706600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29206849	29208132	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0706600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;protein_id=OsNip_02t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29208133	29208196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29208401	29208686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;Name=OsNip_02t0706600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0706600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29208401	29208686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	29206693	29208337	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0706600-01;Parent=gene:OsNip_02g0706600;transcript_id=OsNip_02t0706600-01;Tag=IsoSeq:G3978.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3093.2
Chr02	TAMA	exon	29206693	29208337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0706600-01;Name=OsNip_02t0706600-01;exon_id=OsNip_02t0706600-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G3978.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3093.2;prot_id "UniRef90_A0A6J1KBH2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29238051	29239272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707200-01;Tag=IsoSeq:G3982.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3095.1;prot_id "UniRef90_UPI0012633AD1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29258565	29259232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-03;Name=OsNip_02t0707900-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0707900-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29259343	29259401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29259529	29260280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-03;Name=OsNip_02t0707900-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0707900-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29260085	29260410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-02;Name=OsNip_02t0707900-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0707900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29265244	29265446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-02;Name=OsNip_02t0707900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0707900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29265428	29265446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0707900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29330530	29330660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0709300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29352839	29353189	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0709400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0709400-02;protein_id=OsNip_02t0709400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29353491	29353549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0709400-02;Name=OsNip_02t0709400-02-E25;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0709400-02-E25;rank=25;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29353491	29353549	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0709400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0709400-02;protein_id=OsNip_02t0709400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29351204	29357890	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0709400-03;Parent=gene:OsNip_02g0709400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0709400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29351204	29351204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0709400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29450411	29450983	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0710800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0710800-01;protein_id=OsNip_02t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29451100	29451192	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0710800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0710800-01;protein_id=OsNip_02t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29451100	29451429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0710800-01;Name=OsNip_02t0710800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0710800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29451193	29451429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29460060	29461117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0711000-01;Name=OsNip_02t0711000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0711000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29460361	29460687	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0711000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0711000-01;protein_id=OsNip_02t0711000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29460688	29461117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0711000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29481179	29482160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0711900-01;Tag=IsoSeq:G4001.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3111.2,Nipponbare.root_G2389.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5F3B7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29548372	29548824	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0713250-00;Parent=transcript:OsNip_02t0713250-00;protein_id=OsNip_02t0713250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29551070	29551994	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0713400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0713400-01;protein_id=OsNip_02t0713400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29553794	29553864	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0713400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0713400-01;protein_id=OsNip_02t0713400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29553794	29554247	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0713400-01;Name=OsNip_02t0713400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0713400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29553865	29554247	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0713400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29555642	29557498	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0713500;Name=OsNip_Fbox108;biotype=protein_coding;description=F-box;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29555642	29557498	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0713500-00;Parent=gene:OsNip_02g0713500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0713500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29555642	29556043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0713500-00;Name=OsNip_02t0713500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0713500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29596852	29596969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-01;Name=OsNip_02t0714000-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0714000-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29597046	29597138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29597887	29598898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-01;Name=OsNip_02t0714000-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0714000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29597887	29598898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29594783	29598766	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0714000-02;Parent=gene:OsNip_02g0714000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0714000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29594783	29594813	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29594783	29595059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714000-02;Name=OsNip_02t0714000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0714000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29618530	29618666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29619221	29619282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714500-01;Name=OsNip_02t0714500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0714500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29626009	29626420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714600-01;Name=OsNip_02t0714600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0714600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29627278	29627377	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0714600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0714600-02;protein_id=OsNip_02t0714600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29627455	29627588	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0714600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0714600-02;protein_id=OsNip_02t0714600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29627455	29627755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714600-02;Name=OsNip_02t0714600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0714600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29627589	29627755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29635986	29639344	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0714700-01;Parent=gene:OsNip_02g0714700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0714700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29635986	29636413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714700-01;Name=OsNip_02t0714700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0714700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29636730	29636874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29659401	29659686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0714801-00;Name=OsNip_02t0714801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0714801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29659401	29659686	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0714801-00;Parent=transcript:OsNip_02t0714801-00;protein_id=OsNip_02t0714801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29667743	29669572	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0715000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29669192	29669572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715000-01;Name=OsNip_02t0715000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0715000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29670746	29670765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29671374	29671716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Name=OsNip_02t0715200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0715200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29671374	29671716	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0715200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;protein_id=OsNip_02t0715200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29671982	29672253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Name=OsNip_02t0715200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0715200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29672789	29672985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Name=OsNip_02t0715200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0715200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29673381	29673815	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0715200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;protein_id=OsNip_02t0715200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29673381	29675020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Name=OsNip_02t0715200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0715200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29673816	29675020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29672121	29672742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29672121	29675896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-02;Name=OsNip_02t0715200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0715200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29672743	29673012	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0715200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0715200-02;protein_id=OsNip_02t0715200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29673013	29675896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29670757	29673885	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0715225;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29670757	29673885	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0715225-00;Parent=gene:OsNip_02g0715225;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29670757	29670944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Name=OsNip_02t0715225-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0715225-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29670757	29670944	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0715225-00;Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;protein_id=OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29671363	29671452	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0715225-00;Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;protein_id=OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29671363	29671712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Name=OsNip_02t0715225-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0715225-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29671453	29671712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29671980	29672268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Name=OsNip_02t0715225-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0715225-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29671980	29672268	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29672805	29672990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Name=OsNip_02t0715225-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0715225-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29672805	29672990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29673379	29673885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Name=OsNip_02t0715225-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0715225-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29673379	29673885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0715225-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29675632	29676023	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0715250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29675632	29676023	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0715250-00;Parent=gene:OsNip_02g0715250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0715250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29725309	29726240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0716500-05;Tag=IsoSeq:G4017.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3123.1,Nipponbare.panicle_G3123.3;prot_id "UniRef90_A0A0P0X5H8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29736312	29737363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;Name=OsNip_02t0716800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0716800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29736514	29737363	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;protein_id=OsNip_02t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29737888	29738447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;Name=OsNip_02t0716800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0716800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29737888	29738447	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;protein_id=OsNip_02t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29738565	29738782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;Name=OsNip_02t0716800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0716800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29738565	29738782	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0716800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0716800-01;protein_id=OsNip_02t0716800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29758172	29758526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717300-01;Name=OsNip_02t0717300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0717300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	29756292	29756360	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0717300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0717300-02;protein_id=OsNip_02t0717300-02;Tag=IsoSeq:G4021.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1844.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NK52";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	29756023	29756024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717300-02;Tag=IsoSeq:G4021.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1844.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NK52";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29756364	29756648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717300-02;Tag=IsoSeq:G4021.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1844.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NK52";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29758172	29758595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717300-02;Tag=IsoSeq:G4021.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1844.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NK52";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29763622	29774996	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0717400;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29763622	29774996	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0717400-01;Parent=gene:OsNip_02g0717400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0717400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29763622	29763888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29763622	29764371	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717400-01;Name=OsNip_02t0717400-01-E29;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0717400-01-E29;rank=29;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29763889	29764371	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0717400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0717400-01;protein_id=OsNip_02t0717400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29764826	29764894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717400-01;Name=OsNip_02t0717400-01-E28;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0717400-01-E28;rank=28;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29794965	29797238	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0717800-01;Parent=gene:OsNip_02g0717800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0717800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29794965	29795503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29794965	29797238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-01;Name=OsNip_02t0717800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0717800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29795504	29795869	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0717800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0717800-01;protein_id=OsNip_02t0717800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29795870	29797238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	29795562	29797238	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0717800-02;Parent=gene:OsNip_02g0717800;transcript_id=OsNip_02t0717800-02;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5
Chr02	TAMA	exon	29797065	29797238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-02;Name=OsNip_02t0717800-02;exon_id=OsNip_02t0717800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5;prot_id "UniRef90_A0A0B0P435";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	29797065	29797238	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0717800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0717800-02;protein_id=OsNip_02t0717800-02;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5;prot_id "UniRef90_A0A0B0P435";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	exon	29795562	29795985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-02;Name=OsNip_02t0717800-02;exon_id=OsNip_02t0717800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5;prot_id "UniRef90_A0A0B0P435";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	29795893	29795985	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0717800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0717800-02;protein_id=OsNip_02t0717800-02;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5;prot_id "UniRef90_A0A0B0P435";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29795562	29795890	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717800-02;Tag=IsoSeq:G4025.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2410.4,Nipponbare.leaf_G1847.5;prot_id "UniRef90_A0A0B0P435";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29799480	29800579	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0717900;biotype=protein_coding;description=MSF1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29799480	29800579	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0717900-01;Parent=gene:OsNip_02g0717900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0717900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29799480	29799782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29799480	29800579	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0717900-01;Name=OsNip_02t0717900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0717900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29799783	29800373	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0717900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0717900-01;protein_id=OsNip_02t0717900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29825034	29825129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0718900-03;Tag=IsoSeq:G4030.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3135.5,Nipponbare.leaf_G1851.5;prot_id "UniRef90_C4J7A3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	29824200	29824438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0718950-00;Name=OsNip_02t0718950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0718950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	29827548	29830453	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0719000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29827548	29830453	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0719000-01;Parent=gene:OsNip_02g0719000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0719000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29827548	29827576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0719000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29827548	29828218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0719000-01;Name=OsNip_02t0719000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0719000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29827577	29828218	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0719000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0719000-01;protein_id=OsNip_02t0719000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29850864	29851295	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0719600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0719600-01;protein_id=OsNip_02t0719600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29851777	29852145	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0719600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0719600-01;protein_id=OsNip_02t0719600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	29889553	29890655	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0720450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29890242	29890655	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0720450-00;Parent=transcript:OsNip_02t0720450-00;protein_id=OsNip_02t0720450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29890269	29890787	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0720500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0720500-01;protein_id=OsNip_02t0720500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	CDS	29889112	29889416	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0720500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0720500-02;protein_id=OsNip_02t0720500-02;Tag=IsoSeq:G4039.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3143.1,Nipponbare.root_G2416.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PWU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	TAMA	CDS	29889526	29889748	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0720500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0720500-02;protein_id=OsNip_02t0720500-02;Tag=IsoSeq:G4039.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3143.1,Nipponbare.root_G2416.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PWU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	29889752	29891033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720500-02;Tag=IsoSeq:G4039.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3143.1,Nipponbare.root_G2416.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PWU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	29892488	29894313	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0720600-01;Parent=gene:OsNip_02g0720600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0720600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29892488	29892786	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29892488	29894048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;Name=OsNip_02t0720600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0720600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29892787	29894048	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0720600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;protein_id=OsNip_02t0720600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	29894140	29894269	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0720600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;protein_id=OsNip_02t0720600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	29894140	29894313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;Name=OsNip_02t0720600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0720600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29894270	29894313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	29892462	29894292	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0720600-02;Parent=gene:OsNip_02g0720600;transcript_id=OsNip_02t0720600-02;Tag=IsoSeq:G4040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2417.1
Chr02	TAMA	exon	29894140	29894292	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0720600-02;Name=OsNip_02t0720600-02;exon_id=OsNip_02t0720600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4040.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2417.1;prot_id "UniRef90_A0A4U6WQS1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30222955	30223053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726400-02;Name=OsNip_02t0726400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0726400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	30226674	30230625	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0726500;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30226674	30230625	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0726500-01;Parent=gene:OsNip_02g0726500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30226674	30226961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30228803	30229092	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Name=OsNip_02t0726500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0726500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30229199	30229403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Name=OsNip_02t0726500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0726500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30229199	30229403	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0726500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;protein_id=OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30229520	30229677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Name=OsNip_02t0726500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0726500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30229520	30229677	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0726500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;protein_id=OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30229859	30230102	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0726500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;protein_id=OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30229859	30230625	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Name=OsNip_02t0726500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0726500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30230103	30230625	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30231963	30232918	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0726600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30232315	30232896	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0726600-01;Parent=gene:OsNip_02g0726600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0726600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30232315	30232725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0726600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726600-01;protein_id=OsNip_02t0726600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30232315	30232896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-01;Name=OsNip_02t0726600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0726600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30232726	30232896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	30231963	30232918	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0726600-02;Parent=gene:OsNip_02g0726600;transcript_id=OsNip_02t0726600-02;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6
Chr02	TAMA	exon	30231963	30232080	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;Name=OsNip_02t0726600-02;exon_id=OsNip_02t0726600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	30231965	30232080	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0726600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;protein_id=OsNip_02t0726600-02;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	30232411	30232918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;Name=OsNip_02t0726600-02;exon_id=OsNip_02t0726600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	30232411	30232636	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0726600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;protein_id=OsNip_02t0726600-02;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	30231963	30231964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30232640	30232918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726600-02;Tag=IsoSeq:G4070.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1865.6;prot_id "UniRef90_A0A2H3Z7S0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30232944	30235725	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0726700;Name=OsNip_bHLH034;biotype=protein_coding;description=Helix-loop-helix;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30233286	30235221	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0726700-01;Parent=gene:OsNip_02g0726700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30233286	30233561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30233286	30233722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726700-01;Name=OsNip_02t0726700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0726700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30233562	30233722	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0726700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726700-01;protein_id=OsNip_02t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30233810	30233987	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0726700-01;Name=OsNip_02t0726700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0726700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30233810	30233987	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0726700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0726700-01;protein_id=OsNip_02t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30276458	30279263	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0727500-01;Parent=gene:OsNip_02g0727500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0727500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30276458	30276636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0727500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30278347	30278499	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0727500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0727500-01;protein_id=OsNip_02t0727500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30279120	30279261	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0727500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0727500-01;protein_id=OsNip_02t0727500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30279120	30279263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0727500-01;Name=OsNip_02t0727500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0727500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30279262	30279263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0727500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	30279120	30279249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0727500-02;Name=OsNip_02t0727500-02;exon_id=OsNip_02t0727500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2433.1,Nipponbare.root_G2433.2,Nipponbare.panicle_G3176.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0VP65";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	exon	30278347	30278499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0727500-02;Name=OsNip_02t0727500-02;exon_id=OsNip_02t0727500-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G4074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2433.1,Nipponbare.root_G2433.2,Nipponbare.panicle_G3176.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0VP65";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30313078	30313280	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0728401-01;Parent=transcript:OsNip_02t0728401-01;protein_id=OsNip_02t0728401-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30313078	30313421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0728401-01;Name=OsNip_02t0728401-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0728401-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30352710	30356478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729300-01;Name=OsNip_02t0729300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0729300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30354867	30356276	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0729300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0729300-01;protein_id=OsNip_02t0729300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30356277	30356478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30357071	30359162	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0729350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30357071	30359162	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0729350-00;Parent=gene:OsNip_02g0729350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0729350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30357071	30357709	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0729350-00;Parent=transcript:OsNip_02t0729350-00;protein_id=OsNip_02t0729350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30358416	30358514	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0729350-00;Parent=transcript:OsNip_02t0729350-00;protein_id=OsNip_02t0729350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30358416	30359162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729350-00;Name=OsNip_02t0729350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0729350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30358515	30359162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30361908	30363528	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0729400;Name=OsNip_Str11;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30361908	30363528	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0729400-01;Parent=gene:OsNip_02g0729400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0729400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30383201	30383486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30382312	30382551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729700-03;Tag=IsoSeq:G4084.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1872.3;prot_id "UniRef90_Q6YWR4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30382664	30383444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0729700-03;Tag=IsoSeq:G4084.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1872.3;prot_id "UniRef90_Q6YWR4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30433013	30433087	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0730500-01;Name=OsNip_02t0730500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0730500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30433013	30433087	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0730500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0730500-01;protein_id=OsNip_02t0730500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30433540	30433600	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0730500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0730500-01;protein_id=OsNip_02t0730500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30433705	30433931	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0730500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0730500-01;protein_id=OsNip_02t0730500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30433705	30434086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0730500-01;Name=OsNip_02t0730500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0730500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30449574	30451465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731050-01;Name=OsNip_02t0731050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30456666	30462759	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0731200;Name=OsNip_MADS57;biotype=protein_coding;description=MADS-box;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30456666	30456999	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30456666	30457181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30457000	30457181	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30458344	30458419	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30458344	30458419	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30461176	30461237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30461176	30461237	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30461673	30461772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30461673	30461772	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30461861	30461902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30461861	30461902	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30462002	30462085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30462002	30462085	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30462169	30462332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30462169	30462332	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30462420	30462435	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0731200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;protein_id=OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30462420	30462759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Name=OsNip_02t0731200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0731200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30462436	30462759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30459392	30464135	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0731300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30459392	30464135	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0731300-01;Parent=gene:OsNip_02g0731300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0731300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30459392	30459712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-01;Name=OsNip_02t0731300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30459803	30461254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-01;Name=OsNip_02t0731300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30464064	30464135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-01;Name=OsNip_02t0731300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	30459403	30464135	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0731300-02;Parent=gene:OsNip_02g0731300;transcript_id=OsNip_02t0731300-02;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3
Chr02	TAMA	exon	30464064	30464135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;Name=OsNip_02t0731300-02;exon_id=OsNip_02t0731300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	30464064	30464133	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0731300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;protein_id=OsNip_02t0731300-02;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	exon	30459403	30461254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;Name=OsNip_02t0731300-02;exon_id=OsNip_02t0731300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	CDS	30461067	30461254	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0731300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;protein_id=OsNip_02t0731300-02;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	30464134	30464135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30459403	30461064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731300-02;Tag=IsoSeq:G4091.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2442.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30467578	30468413	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0731400;Name=OsNip_UCL5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30467578	30468413	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0731400-01;Parent=gene:OsNip_02g0731400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0731400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30467578	30467663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30467578	30467868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;Name=OsNip_02t0731400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30467664	30467868	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0731400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;protein_id=OsNip_02t0731400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30467983	30468182	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0731400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;protein_id=OsNip_02t0731400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30467983	30468413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;Name=OsNip_02t0731400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0731400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30468183	30468413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30468783	30470102	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0731500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30468783	30470102	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0731500-01;Parent=gene:OsNip_02g0731500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0731500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30468783	30469301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731500-01;Name=OsNip_02t0731500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0731500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30468783	30469301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30469409	30469490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30472993	30473074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0731600-02;Tag=IsoSeq:G4092.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1876.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30518224	30518508	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0732200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0732200-01;protein_id=OsNip_02t0732200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30526422	30526667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0732300-01;Name=OsNip_02t0732300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0732300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30526422	30526666	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0732300-02;Tag=IsoSeq:G4095.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2444.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6RCV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30524662	30525269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0732350-00;Name=OsNip_02t0732350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0732350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30528645	30530536	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0732400-01;Parent=gene:OsNip_02g0732400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0732400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30528645	30529065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0732400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30567468	30567986	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0733200-02;Tag=IsoSeq:G4101.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2449.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0NKL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30569067	30569173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0733200-02;Tag=IsoSeq:G4101.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2449.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0NKL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	30569811	30570012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0733200-02;Tag=IsoSeq:G4101.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2449.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0NKL1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30658896	30659079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0734900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30669217	30672861	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0735100-01;Parent=gene:OsNip_02g0735100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0735100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30669292	30670236	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0735100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0735100-01;protein_id=OsNip_02t0735100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30670327	30670478	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735100-01;Name=OsNip_02t0735100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0735100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30670327	30670478	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0735100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0735100-01;protein_id=OsNip_02t0735100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30672334	30672861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735100-01;Name=OsNip_02t0735100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0735100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30672584	30672861	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30670391	30671745	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0735150-01;Parent=gene:OsNip_02g0735150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0735150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30670391	30671333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30670391	30671745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735150-01;Name=OsNip_02t0735150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0735150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30671334	30671558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0735150-01;Parent=transcript:OsNip_02t0735150-01;protein_id=OsNip_02t0735150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30671559	30671745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	30674780	30678659	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0735200;Name=OsNip_GS1;biotype=protein_coding;description=Glutamine;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30674780	30678475	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0735200-02;Parent=gene:OsNip_02g0735200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0735200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30674780	30675207	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30674780	30675360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0735200-02;Name=OsNip_02t0735200-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0735200-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30675208	30675360	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0735200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0735200-02;protein_id=OsNip_02t0735200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30763838	30764396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0736800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30781833	30781923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0737300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30781833	30782237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0737300-00;Name=OsNip_02t0737300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0737300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30781924	30782154	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0737300-00;Parent=transcript:OsNip_02t0737300-00;protein_id=OsNip_02t0737300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30782155	30782237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0737300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	30784648	30785350	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0737401-01;Parent=gene:OsNip_02g0737401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0737401-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30828795	30829053	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0738400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0738400-01;protein_id=OsNip_02t0738400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30841335	30841589	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0738750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0738750-00;protein_id=OsNip_02t0738750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	30841692	30842445	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0738750-00;Parent=transcript:OsNip_02t0738750-00;protein_id=OsNip_02t0738750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30841692	30842595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0738750-00;Name=OsNip_02t0738750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0738750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30842446	30842595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0738750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	mRNA	30858907	30860742	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t073889A-01;Parent=gene:OsNip_02g073889A;transcript_id=OsNip_02t073889A-01;Tag=IsoSeq:G4119.1;Source=Nipponbare.panicle_G3212.1
Chr02	TAMA	exon	30858907	30860742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t073889A-01;Name=OsNip_02t073889A-01-E1;exon_id=OsNip_02t073889A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4119.1;Source=Nipponbare.panicle_G3212.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E7C3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	30859536	30859796	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t073889A-01;Parent=transcript:OsNip_02t073889A-01;protein_id=OsNip_02t073889A-01;Tag=IsoSeq:G4119.1;Source=Nipponbare.panicle_G3212.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E7C3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	30858907	30859535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t073889A-01;Tag=IsoSeq:G4119.1;Source=Nipponbare.panicle_G3212.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E7C3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	30989383	30989940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0741000-00;Name=OsNip_02t0741000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0741000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30994447	30994682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0741100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	30994447	30994852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0741100-02;Name=OsNip_02t0741100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0741100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31076513	31077624	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0742051-01;Parent=gene:OsNip_02g0742051;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0742051-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31096456	31096528	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0742351-00;Parent=transcript:OsNip_02t0742351-00;protein_id=OsNip_02t0742351-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31096191	31101212	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0742500;Name=OsNip_Degp3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31184865	31185332	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0743600-00;protein_id=OsNip_02t0743600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31185333	31185459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31184822	31185744	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0743600-01;Parent=gene:OsNip_02g0743600;transcript_id=OsNip_02t0743600-01;Tag=IsoSeq:G4145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3232.2
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Chr02	TAMA	exon	31185333	31185744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743600-01;Name=OsNip_02t0743600-01;exon_id=OsNip_02t0743600-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3232.2;prot_id "UniRef90_A0A2K1RA60";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	31185333	31185334	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0743600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0743600-01;protein_id=OsNip_02t0743600-01;Tag=IsoSeq:G4145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3232.2;prot_id "UniRef90_A0A2K1RA60";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31184822	31185001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743600-01;Tag=IsoSeq:G4145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3232.2;prot_id "UniRef90_A0A2K1RA60";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31185338	31185744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743600-01;Tag=IsoSeq:G4145.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3232.2;prot_id "UniRef90_A0A2K1RA60";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31191758	31191841	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-01;protein_id=OsNip_02t0743700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31192133	31192510	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-01;protein_id=OsNip_02t0743700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31192133	31193392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-01;Name=OsNip_02t0743700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0743700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31192511	31193392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31190820	31193393	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0743700-02;Parent=gene:OsNip_02g0743700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31190820	31191025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31190820	31191137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Name=OsNip_02t0743700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0743700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31191314	31191492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Name=OsNip_02t0743700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0743700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31191314	31191492	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0743700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;protein_id=OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31191758	31191841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Name=OsNip_02t0743700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0743700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31192133	31192297	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Name=OsNip_02t0743700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0743700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31192133	31192297	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;protein_id=OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31193025	31193147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;protein_id=OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31193025	31193393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Name=OsNip_02t0743700-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0743700-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31193148	31193393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31190967	31195239	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0743700-03;Parent=gene:OsNip_02g0743700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0743700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31190967	31191025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31190967	31191137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0743700-03;Name=OsNip_02t0743700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0743700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31191026	31191137	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0743700-03;Parent=transcript:OsNip_02t0743700-03;protein_id=OsNip_02t0743700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31255025	31255135	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0745000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0745000-01;protein_id=OsNip_02t0745000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31255454	31255480	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0745000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0745000-01;protein_id=OsNip_02t0745000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31255454	31255481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745000-01;Name=OsNip_02t0745000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0745000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31255481	31255481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31252804	31256005	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0745000-02;Parent=gene:OsNip_02g0745000;transcript_id=OsNip_02t0745000-02;Tag=IsoSeq:G4154.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2474.2
Chr02	TAMA	exon	31255610	31256005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745000-02;Name=OsNip_02t0745000-02;exon_id=OsNip_02t0745000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4154.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2474.2;prot_id "UniRef90_A1L4Y1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	exon	31255454	31255516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745000-02;Name=OsNip_02t0745000-02;exon_id=OsNip_02t0745000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4154.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2474.2;prot_id "UniRef90_A1L4Y1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31298338	31299077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-01;Name=OsNip_02t0745600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0745600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31298645	31299077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	31290658	31290784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;Name=OsNip_02t0745600-02;exon_id=OsNip_02t0745600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	31298338	31298901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;Name=OsNip_02t0745600-02;exon_id=OsNip_02t0745600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	31298517	31298663	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0745600-02;Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;protein_id=OsNip_02t0745600-02;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31290658	31290784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31298338	31298516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31298667	31298901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745600-02;Tag=IsoSeq:G4157.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3242.1,Nipponbare.root_G2477.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9VKZ8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31299633	31301828	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0745700;biotype=protein_coding;description=Fatty;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31299633	31299886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31299633	31300117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;Name=OsNip_02t0745700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0745700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31299887	31300117	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0745700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;protein_id=OsNip_02t0745700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31300929	31301495	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0745700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;protein_id=OsNip_02t0745700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31300929	31301828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;Name=OsNip_02t0745700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0745700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31301496	31301828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0745700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31411205	31411213	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;Name=OsNip_02t0747600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0747600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31411205	31411213	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0747600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;protein_id=OsNip_02t0747600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31412824	31412906	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0747600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;protein_id=OsNip_02t0747600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31413059	31413534	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0747600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;protein_id=OsNip_02t0747600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31413059	31413535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;Name=OsNip_02t0747600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0747600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31413535	31413535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0747600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31410070	31414230	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0747600-02;Parent=gene:OsNip_02g0747600;transcript_id=OsNip_02t0747600-02;Tag=IsoSeq:G4161.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3246.1
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31497036	31498714	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0749450-01;Parent=gene:OsNip_02g0749450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0749450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31497036	31497445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0749450-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31529358	31529405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750300-00;Name=OsNip_02t0750300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0750300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31530873	31530874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31530875	31531513	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0750400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0750400-01;protein_id=OsNip_02t0750400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31531514	31531853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31529620	31531859	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0750400-02;Parent=gene:OsNip_02g0750400;transcript_id=OsNip_02t0750400-02;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1
Chr02	TAMA	exon	31529620	31530015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;Name=OsNip_02t0750400-02;exon_id=OsNip_02t0750400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	31530344	31531859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;Name=OsNip_02t0750400-02;exon_id=OsNip_02t0750400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	31531362	31531484	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0750400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;protein_id=OsNip_02t0750400-02;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31529620	31530015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31530344	31531361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31531488	31531859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750400-02;Tag=IsoSeq:G4173.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1907.1;prot_id "UniRef90_A0A7C9EIC3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31532128	31534872	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0750500;biotype=protein_coding;description=Methyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31532128	31534872	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0750500-01;Parent=gene:OsNip_02g0750500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0750500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31532128	31532442	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31532128	31532527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0750500-01;Name=OsNip_02t0750500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0750500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31571420	31571963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0751100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31575903	31577560	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0751300-01;Parent=gene:OsNip_02g0751300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0751300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31575903	31575926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0751300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31650048	31650388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0752800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31663080	31665818	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0753000-01;Parent=gene:OsNip_02g0753000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0753000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31665536	31665616	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753000-01;protein_id=OsNip_02t0753000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31665536	31665818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753000-01;Name=OsNip_02t0753000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0753000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31664161	31664246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753100-00;Name=OsNip_02t0753100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31664375	31664470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753100-00;Name=OsNip_02t0753100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31673161	31675228	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0753200-01;Parent=gene:OsNip_02g0753200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31673161	31673167	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31673161	31673549	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;Name=OsNip_02t0753200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31673168	31673549	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;protein_id=OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31674567	31674717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;Name=OsNip_02t0753200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0753200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31674567	31674717	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0753200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;protein_id=OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31674832	31675048	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0753200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;protein_id=OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31674832	31675228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;Name=OsNip_02t0753200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0753200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31675049	31675228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31676474	31677436	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0753300;biotype=protein_coding;description=Lipoxygenase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31676474	31677436	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0753300-01;Parent=gene:OsNip_02g0753300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0753300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31676474	31676542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31676474	31676644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;Name=OsNip_02t0753300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31676543	31676644	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;protein_id=OsNip_02t0753300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31676711	31677190	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;protein_id=OsNip_02t0753300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31676711	31677436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;Name=OsNip_02t0753300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0753300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31677191	31677436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31676474	31677394	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0753300-02;Parent=gene:OsNip_02g0753300;transcript_id=OsNip_02t0753300-02;Tag=IsoSeq:G4184.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2493.1
Chr02	TAMA	exon	31676474	31677394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-02;Name=OsNip_02t0753300-02;exon_id=OsNip_02t0753300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4184.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2493.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9ZLL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	31676475	31676711	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0753300-02;Parent=transcript:OsNip_02t0753300-02;protein_id=OsNip_02t0753300-02;Tag=IsoSeq:G4184.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2493.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9ZLL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31676474	31676474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-02;Tag=IsoSeq:G4184.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2493.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9ZLL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31676715	31677394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753300-02;Tag=IsoSeq:G4184.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2493.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9ZLL9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31683482	31684818	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0753400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31683482	31684818	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0753400-01;Parent=gene:OsNip_02g0753400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0753400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31683482	31683545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31683482	31684818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753400-01;Name=OsNip_02t0753400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31683546	31684484	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753400-01;protein_id=OsNip_02t0753400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31684485	31684818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31686188	31689398	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0753500;Name=OsNip_STA78;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31686188	31689398	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0753500-01;Parent=gene:OsNip_02g0753500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0753500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31686188	31686544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753500-01;Name=OsNip_02t0753500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0753500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31686188	31686544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0753500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31706706	31706842	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0753900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0753900-01;protein_id=OsNip_02t0753900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31757912	31758296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0754800-02;Tag=IsoSeq:G4195.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2500.2,Nipponbare.panicle_G3275.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31759113	31761547	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0754900;Name=OsNip_APRL3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31759161	31760356	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0754900-01;Parent=gene:OsNip_02g0754900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0754900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31759161	31759281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0754900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31759161	31759727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0754900-01;Name=OsNip_02t0754900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0754900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31759282	31759727	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0754900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0754900-01;protein_id=OsNip_02t0754900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31910500	31910588	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0757700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0757700-02;protein_id=OsNip_02t0757700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	31910727	31911384	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0757700-02;Parent=transcript:OsNip_02t0757700-02;protein_id=OsNip_02t0757700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	31910727	31911652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-02;Name=OsNip_02t0757700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0757700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31911385	31911652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	31909151	31911652	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0757700-03;Parent=gene:OsNip_02g0757700;transcript_id=OsNip_02t0757700-03;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3
Chr02	TAMA	exon	31909151	31909892	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-03;Name=OsNip_02t0757700-03;exon_id=OsNip_02t0757700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1F836";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	CDS	31911026	31911127	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0757700-03;Parent=transcript:OsNip_02t0757700-03;protein_id=OsNip_02t0757700-03;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1F836";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31909151	31909892	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-03;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1F836";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	31910727	31911025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-03;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1F836";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	31911131	31911652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757700-03;Tag=IsoSeq:G4205.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3280.3;prot_id "UniRef90_A0A6G1F836";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	31910611	31911501	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0757800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	31910611	31911501	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0757800-01;Parent=gene:OsNip_02g0757800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0757800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31910611	31910681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0757800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	31988046	31988885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0759700-02;Name=OsNip_02t0759700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0759700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31988808	31989420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0759700-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32051545	32051582	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0761100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;protein_id=OsNip_02t0761100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32051669	32051749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;Name=OsNip_02t0761100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0761100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32051669	32051749	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0761100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;protein_id=OsNip_02t0761100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32051860	32051871	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0761100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;protein_id=OsNip_02t0761100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32051860	32051946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;Name=OsNip_02t0761100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0761100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32051872	32051946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32052027	32052300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;Name=OsNip_02t0761100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32052027	32052300	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32047967	32048176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Name=OsNip_02t0761150-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761150-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32047967	32048176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32049874	32050063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32049874	32050393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Name=OsNip_02t0761150-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761150-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32050064	32050279	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0761150-00;Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;protein_id=OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32050280	32050393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32050567	32050640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Name=OsNip_02t0761150-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761150-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32050567	32050640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32050756	32050808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32050998	32051122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32051406	32051468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Name=OsNip_02t0761150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32051406	32051468	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32051633	32051752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Name=OsNip_02t0761150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0761150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32051633	32051752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0761150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32052568	32055886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0761200-01;Parent=gene:OsNip_02g0761200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0761200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32179355	32187390	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0763900-01;Parent=gene:OsNip_02g0763900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0763900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32179355	32179456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0763900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32179355	32179556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0763900-01;Name=OsNip_02t0763900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0763900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32255478	32255819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0765925-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	32261594	32267607	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0766000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32261594	32262014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Name=OsNip_02t0766000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0766000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32261594	32262014	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32262494	32262585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32262494	32262607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Name=OsNip_02t0766000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0766000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32262586	32262607	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0766000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;protein_id=OsNip_02t0766000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32266965	32267374	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0766000-02;Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;protein_id=OsNip_02t0766000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32266965	32267534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Name=OsNip_02t0766000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0766000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32267375	32267534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0766000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32287685	32287766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;Name=OsNip_02t0767000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0767000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32288914	32289271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;Name=OsNip_02t0767000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0767000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32290252	32291028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;Name=OsNip_02t0767000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0767000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32290252	32291028	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0767000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;protein_id=OsNip_02t0767000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32291119	32291224	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0767000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;protein_id=OsNip_02t0767000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32291119	32291225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;Name=OsNip_02t0767000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0767000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32291225	32291225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	32287214	32292128	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0767000-02;Parent=gene:OsNip_02g0767000;transcript_id=OsNip_02t0767000-02;Tag=IsoSeq:G4238.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3307.2
Chr02	TAMA	exon	32291883	32292128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0767000-02;Name=OsNip_02t0767000-02;exon_id=OsNip_02t0767000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4238.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3307.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3X335";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32394937	32395420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0768800-01;Name=OsNip_02t0768800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0768800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	32418493	32419361	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0769100;Name=OsNip_SAUR12;biotype=protein_coding;description=Auxin;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32418493	32418642	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0769100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32418643	32419029	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0769100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0769100-01;protein_id=OsNip_02t0769100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32419030	32419361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0769100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	32426368	32429398	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0769200;Name=LYP5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32426373	32429398	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0769200-01;Parent=gene:OsNip_02g0769200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0769200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32501058	32501145	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0770700-01;Parent=transcript:OsNip_02t0770700-01;protein_id=OsNip_02t0770700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32561654	32562547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0771600-02;Name=OsNip_02t0771600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0771600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32562276	32562547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0771600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32598100	32598202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772300-01;Name=OsNip_02t0772300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0772300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32598432	32598511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772300-01;Name=OsNip_02t0772300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0772300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32613827	32614048	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0772600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0772600-00;protein_id=OsNip_02t0772600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32611794	32611982	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0772650-00;Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;protein_id=OsNip_02t0772650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32611983	32612052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32612473	32612802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;Name=OsNip_02t0772650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0772650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32612473	32612802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32613037	32613415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;Name=OsNip_02t0772650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0772650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32613037	32613415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0772650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32617768	32620885	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0772700-01;Parent=gene:OsNip_02g0772700;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0772700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32672463	32673918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0773732-01;Name=OsNip_02t0773732-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0773732-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32685791	32686004	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774100-00;Name=OsNip_02t0774100-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0774100-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	32685220	32685285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774100-01;Tag=IsoSeq:G4271.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1954.1,Nipponbare.leaf_G1954.2;prot_id "UniRef90_A0A151TU66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	32685639	32685656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774100-01;Tag=IsoSeq:G4271.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1954.1,Nipponbare.leaf_G1954.2;prot_id "UniRef90_A0A151TU66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	32685808	32686047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774100-01;Tag=IsoSeq:G4271.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G1954.1,Nipponbare.leaf_G1954.2;prot_id "UniRef90_A0A151TU66";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32700433	32700708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32701450	32701573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32703241	32704456	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0774800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0774800-01;protein_id=OsNip_02t0774800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32704541	32704557	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0774800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0774800-01;protein_id=OsNip_02t0774800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32704541	32704653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0774800-01;Name=OsNip_02t0774800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0774800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32721642	32721834	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32721930	32722078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32722079	32722121	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0775050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;protein_id=OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32722276	32722424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Name=OsNip_02t0775050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0775050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32722276	32722424	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0775050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;protein_id=OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32722678	32722795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Name=OsNip_02t0775050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0775050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32722723	32722795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32722939	32723211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Name=OsNip_02t0775050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0775050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32722939	32723211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32722267	32722417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0775100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0775100-01;protein_id=OsNip_02t0775100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32722672	32722805	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0775100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0775100-01;protein_id=OsNip_02t0775100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32722943	32723122	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0775100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0775100-01;protein_id=OsNip_02t0775100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32722943	32723342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775100-01;Name=OsNip_02t0775100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0775100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32723123	32723342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	32723403	32727558	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0775200;Name=OsNip_RFC3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32723403	32727558	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0775200-01;Parent=gene:OsNip_02g0775200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0775200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32723403	32723688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0775200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32832494	32832742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0776700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32840368	32840859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0776900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32840983	32841945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0776900-01;Name=OsNip_02t0776900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0776900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32840983	32841945	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0776900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0776900-01;protein_id=OsNip_02t0776900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	32842042	32842456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0776900-01;Name=OsNip_02t0776900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0776900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32954112	32954120	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0778400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0778400-01;protein_id=OsNip_02t0778400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	32985428	32987749	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0779200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0779200-02;protein_id=OsNip_02t0779200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32985194	32987845	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0779200-01;Parent=gene:OsNip_02g0779200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0779200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32985194	32985427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0779200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	32985194	32987845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0779200-01;Name=OsNip_02t0779200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0779200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32987777	32987845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0779200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	32991479	32992210	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0779300-01;Parent=gene:OsNip_02g0779300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0779300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33047984	33048003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0780200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33073135	33073521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0780600-01;Name=OsNip_02t0780600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0780600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33074138	33074216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0780600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0780600-01;protein_id=OsNip_02t0780600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33140029	33141318	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0781966-00;Name=OsNip_02t0781966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0781966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33147859	33148390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0782100-01;Name=OsNip_02t0782100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0782100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33147859	33148390	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0782100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0782100-01;protein_id=OsNip_02t0782100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33681017	33681521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792600-02;Name=OsNip_02t0792600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0792600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33688668	33690441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-01;Name=OsNip_02t0792800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0792800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33688703	33690322	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0792800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0792800-01;protein_id=OsNip_02t0792800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33690323	33690441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33688697	33688702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	33688697	33690465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-02;Name=OsNip_02t0792800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0792800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33688703	33690322	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0792800-02;Parent=transcript:OsNip_02t0792800-02;protein_id=OsNip_02t0792800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33690323	33690465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	33688668	33690460	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0792800-03;Parent=gene:OsNip_02g0792800;transcript_id=OsNip_02t0792800-03;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2
Chr02	TAMA	exon	33688668	33688708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;Name=OsNip_02t0792800-03;exon_id=OsNip_02t0792800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	33688670	33688708	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0792800-03;Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;protein_id=OsNip_02t0792800-03;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	exon	33688932	33690460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;Name=OsNip_02t0792800-03;exon_id=OsNip_02t0792800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	33688932	33689099	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0792800-03;Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;protein_id=OsNip_02t0792800-03;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	33688668	33688669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	33689103	33690460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792800-03;Tag=IsoSeq:G4338.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G1976.2;prot_id "UniRef90_F2D3N2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	33690791	33694134	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0792900;biotype=protein_coding;description=TMS;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	33690791	33694134	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0792900-01;Parent=gene:OsNip_02g0792900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0792900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33690791	33691094	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0792900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33733124	33733524	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0793850-00;Name=OsNip_02t0793850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0793850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	33946014	33946388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0797500-01;Name=OsNip_02t0797500-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0797500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33946146	33946388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0797500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33972687	33972910	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	33971506	33973066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798100-01;Name=OsNip_02t0798100-01;exon_id=OsNip_02t0798100-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4360.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2614.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YVR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	CDS	33971506	33972030	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0798100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0798100-01;protein_id=OsNip_02t0798100-01;Tag=IsoSeq:G4360.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2614.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YVR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	33971268	33971269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798100-01;Tag=IsoSeq:G4360.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2614.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YVR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	33972034	33973066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798100-01;Tag=IsoSeq:G4360.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2614.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YVR3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	33976614	33978362	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0798200;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33976614	33976947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	33976614	33977106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;Name=OsNip_02t0798200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0798200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33976948	33977106	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0798200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;protein_id=OsNip_02t0798200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	33977225	33977355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;Name=OsNip_02t0798200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0798200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33977225	33977355	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0798200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;protein_id=OsNip_02t0798200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33977632	33977974	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0798200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;protein_id=OsNip_02t0798200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	33977632	33978362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;Name=OsNip_02t0798200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0798200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33977975	33978362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	33982930	33983620	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0798400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	33982930	33983620	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0798400-01;Parent=gene:OsNip_02g0798400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0798400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33982930	33983188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	33982930	33983620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798400-01;Name=OsNip_02t0798400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0798400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	33983189	33983578	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0798400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0798400-01;protein_id=OsNip_02t0798400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33983579	33983620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0798400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	33987027	33987712	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0798501;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	34075075	34075500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800000-01;Name=OsNip_02t0800000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0800000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34075838	34076123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34076917	34077014	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0800100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;protein_id=OsNip_02t0800100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34077783	34077883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;Name=OsNip_02t0800100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0800100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34077783	34077883	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0800100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;protein_id=OsNip_02t0800100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34077966	34078091	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0800100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;protein_id=OsNip_02t0800100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34077966	34078156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;Name=OsNip_02t0800100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0800100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34078092	34078156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	34081775	34082447	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0800300-01;Parent=gene:OsNip_02g0800300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0800300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34081775	34081816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34081775	34082447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800300-01;Name=OsNip_02t0800300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0800300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34081817	34082200	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0800300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800300-01;protein_id=OsNip_02t0800300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34082201	34082447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	34084356	34085028	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0800400-01;Parent=gene:OsNip_02g0800400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0800400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34084356	34084397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34084356	34085028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800400-01;Name=OsNip_02t0800400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0800400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34084398	34084781	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0800400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800400-01;protein_id=OsNip_02t0800400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34084782	34085028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	34087936	34089381	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0800433;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	34087936	34089381	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0800433-00;Parent=gene:OsNip_02g0800433;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0800433-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	34089783	34090091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801200-03;Tag=IsoSeq:G4372.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3414.3;prot_id "UniRef90_B7EE20";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34101931	34103019	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34104066	34104158	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34104066	34104189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0800600-01;Name=OsNip_02t0800600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0800600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34104438	34104568	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0800600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0800600-01;protein_id=OsNip_02t0800600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34182107	34182791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34182166	34182791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34182166	34183143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Name=OsNip_02t0801900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0801900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34182792	34183143	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0801900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;protein_id=OsNip_02t0801900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34183352	34183374	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0801900-02;Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;protein_id=OsNip_02t0801900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34183352	34183404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Name=OsNip_02t0801900-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0801900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34183375	34183404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34183503	34183610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Name=OsNip_02t0801900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0801900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34183503	34183610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0801900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	34305275	34305396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0804500-01;Name=OsNip_02t0804500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0804500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34306179	34306247	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0804500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0804500-01;protein_id=OsNip_02t0804500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34307278	34307568	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0804500-01;Parent=transcript:OsNip_02t0804500-01;protein_id=OsNip_02t0804500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34307278	34307611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0804500-01;Name=OsNip_02t0804500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0804500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34307569	34307611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0804500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	34307278	34307686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0804500-02;Name=OsNip_02t0804500-02;exon_id=OsNip_02t0804500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4387.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3427.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9LEN5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34372417	34372650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0805800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	34372439	34378347	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0805800-01;Parent=gene:OsNip_02g0805800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0805800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34372439	34372650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0805800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34372439	34373097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0805800-01;Name=OsNip_02t0805800-01-E17;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0805800-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34372651	34373097	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0805800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0805800-01;protein_id=OsNip_02t0805800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34373222	34373423	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0805800-01;Name=OsNip_02t0805800-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0805800-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34801146	34801473	.	+	1	ID=CDS:OsNip_02t0812600-00;Parent=transcript:OsNip_02t0812600-00;protein_id=OsNip_02t0812600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	34802001	34814925	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0812700;Name=OsNip_Fbox117;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34831127	34831171	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0813183-00;Parent=transcript:OsNip_02t0813183-00;protein_id=OsNip_02t0813183-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	34831127	34831267	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0813183-00;Name=OsNip_02t0813183-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0813183-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34831172	34831267	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0813183-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	34929054	34929362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0815400-02;Tag=IsoSeq:G4434.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2022.4;prot_id "UniRef90_A0A5J9UVY2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34942520	34942604	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0815800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0815800-01;protein_id=OsNip_02t0815800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	34988501	34988602	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0816300-03;Parent=transcript:OsNip_02t0816300-03;protein_id=OsNip_02t0816300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	34989345	34989864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0816300-03;Name=OsNip_02t0816300-03-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0816300-03-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34989495	34989864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0816300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35004495	35004794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0816500-02;Tag=IsoSeq:G4440.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3469.2;prot_id "UniRef90_A0A2P2JE45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35040070	35040463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0816900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35072229	35072576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0817500-01;Name=OsNip_02t0817500-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0817500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35072343	35072576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0817500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35068020	35068082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0817500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35068020	35068646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0817500-02;Name=OsNip_02t0817500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0817500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35070632	35070775	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0817500-02;Name=OsNip_02t0817500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0817500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35070632	35070775	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0817500-02;Parent=transcript:OsNip_02t0817500-02;protein_id=OsNip_02t0817500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35130674	35130798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0818900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35131514	35131877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0818900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35134539	35134662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0819000-00;Name=OsNip_02t0819000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0819000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35134539	35134662	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0819000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0819000-00;protein_id=OsNip_02t0819000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35134751	35135088	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0819000-00;Parent=transcript:OsNip_02t0819000-00;protein_id=OsNip_02t0819000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35134751	35135089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0819000-00;Name=OsNip_02t0819000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0819000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35164532	35165363	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0819300-01;Name=OsNip_02t0819300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0819300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35237653	35237958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0820700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35234156	35234402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0820700-02;Name=OsNip_02t0820700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0820700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35234156	35234402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0820700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35234543	35234579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0820700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35254134	35255188	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0820900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35255363	35256043	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0821100;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35255363	35256043	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0821100-01;Parent=gene:OsNip_02g0821100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0821100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35255363	35256043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821100-01;Name=OsNip_02t0821100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0821100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35256169	35258188	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0821200;biotype=protein_coding;description=Ribosomal;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35256169	35257359	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0821200-01;Parent=gene:OsNip_02g0821200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0821200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35256169	35256556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35256169	35256685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;Name=OsNip_02t0821200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0821200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35256557	35256685	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0821200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;protein_id=OsNip_02t0821200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35257208	35257357	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0821200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;protein_id=OsNip_02t0821200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35257208	35257359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;Name=OsNip_02t0821200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0821200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35257358	35257359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	35256338	35258188	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0821200-02;Parent=gene:OsNip_02g0821200;transcript_id=OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5
Chr02	TAMA	exon	35258115	35258188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Name=OsNip_02t0821200-02;exon_id=OsNip_02t0821200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	35258115	35258187	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0821200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;protein_id=OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	35257476	35257633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Name=OsNip_02t0821200-02;exon_id=OsNip_02t0821200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	CDS	35257590	35257633	.	-	.	ID=CDS:OsNip_02t0821200-02;Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;protein_id=OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	35257208	35257374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Name=OsNip_02t0821200-02;exon_id=OsNip_02t0821200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	exon	35256338	35256685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Name=OsNip_02t0821200-02;exon_id=OsNip_02t0821200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	35258188	35258188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35257476	35257587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35257208	35257374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35256338	35256685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821200-02;Tag=IsoSeq:G4465.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2678.3,Nipponbare.leaf_G2040.2,Nipponbare.panicle_G3490.5;prot_id "UniRef90_UPI00188E3D9A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35261577	35261775	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0821301;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35261577	35261775	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0821301-00;Parent=gene:OsNip_02g0821301;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0821301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35261577	35261775	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821301-00;Name=OsNip_02t0821301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0821301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35263294	35265393	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0821400;Name=OsNip_RLCK90;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35263294	35265393	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0821400-01;Parent=gene:OsNip_02g0821400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35263294	35263432	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35263294	35264142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;Name=OsNip_02t0821400-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0821400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35263433	35264142	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0821400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;protein_id=OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35264218	35264619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;Name=OsNip_02t0821400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0821400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35264218	35264619	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0821400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;protein_id=OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35265015	35265321	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0821400-01;Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;protein_id=OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35265015	35265393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;Name=OsNip_02t0821400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0821400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35265322	35265393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35263359	35265370	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0821400-02;Parent=gene:OsNip_02g0821400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0821400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35263359	35263432	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35263359	35264142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-02;Name=OsNip_02t0821400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0821400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35263433	35264142	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0821400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0821400-02;protein_id=OsNip_02t0821400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35264218	35264619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821400-02;Name=OsNip_02t0821400-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0821400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35264218	35264619	.	-	2	ID=CDS:OsNip_02t0821400-02;Parent=transcript:OsNip_02t0821400-02;protein_id=OsNip_02t0821400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	35273699	35273717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821800-03;Name=OsNip_02t0821800-03;exon_id=OsNip_02t0821800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4467.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2041.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7MSN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	35273699	35273717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821800-03;Tag=IsoSeq:G4467.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2041.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7MSN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	35274245	35274313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821800-03;Tag=IsoSeq:G4467.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2041.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7MSN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	five_prime_UTR	35274424	35274544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821800-03;Tag=IsoSeq:G4467.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2041.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7MSN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35274641	35274717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0821800-03;Tag=IsoSeq:G4467.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2041.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7MSN6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35272733	35274717	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0821850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35281400	35281411	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0822050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0822050-00;protein_id=OsNip_02t0822050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35286788	35287415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0822100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35303332	35303952	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0822450-00;Parent=transcript:OsNip_02t0822450-00;protein_id=OsNip_02t0822450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35346915	35347359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823000-01;Name=OsNip_02t0823000-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0823000-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35341783	35341991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;Name=OsNip_02t0823050-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0823050-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35341783	35341991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35342857	35343001	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35343091	35343235	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;Name=OsNip_02t0823050-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0823050-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35343136	35343235	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0823050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;protein_id=OsNip_02t0823050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35343821	35343910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;Name=OsNip_02t0823050-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0823050-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35343821	35343910	.	-	1	ID=CDS:OsNip_02t0823050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;protein_id=OsNip_02t0823050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35344046	35344158	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0823050-00;Parent=transcript:OsNip_02t0823050-00;protein_id=OsNip_02t0823050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35374088	35374180	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0823600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0823600-01;protein_id=OsNip_02t0823600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35376562	35376734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35378189	35378825	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823700-00;Name=OsNip_02t0823700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0823700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35379378	35379454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35379455	35379805	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0823800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;protein_id=OsNip_02t0823800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35380444	35383245	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0823800-01;Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;protein_id=OsNip_02t0823800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35383590	35383922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;Name=OsNip_02t0823800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0823800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35383850	35383922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35384010	35384205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0823800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35438371	35439053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825166-00;Name=OsNip_02t0825166-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0825166-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35439274	35439476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825166-00;Name=OsNip_02t0825166-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0825166-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35440900	35442608	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0825301;Name=OsNip_Fbox122;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35440926	35441462	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0825301-00;Parent=transcript:OsNip_02t0825301-00;protein_id=OsNip_02t0825301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35441550	35442608	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0825301-00;Parent=transcript:OsNip_02t0825301-00;protein_id=OsNip_02t0825301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35440926	35441297	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35440926	35442493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825367-00;Name=OsNip_02t0825367-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0825367-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35441298	35441561	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0825367-00;Parent=transcript:OsNip_02t0825367-00;protein_id=OsNip_02t0825367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35441562	35442493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825367-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35447743	35449938	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0825500;Name=OsNip_Fbox123;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35447743	35449938	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0825500-01;Parent=gene:OsNip_02g0825500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0825500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35447743	35448050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0825500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35535173	35535988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0826700-00;Name=OsNip_02t0826700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0826700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35536101	35536130	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0826700-00;Parent=transcript:OsNip_02t0826700-00;protein_id=OsNip_02t0826700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35545506	35548242	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0827100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35547153	35547153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35547154	35547202	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0827100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;protein_id=OsNip_02t0827100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35547395	35547494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;Name=OsNip_02t0827100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0827100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35547469	35547494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35547870	35548242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;Name=OsNip_02t0827100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0827100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35547870	35548242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	35545506	35545875	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827100-02;Name=OsNip_02t0827100-02;exon_id=OsNip_02t0827100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4495.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2059.1,Nipponbare.panicle_G3517.2,Nipponbare.root_G2704.2;prot_id "UniRef90_UPI00053C4478";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	CDS	35545506	35545875	.	+	.	ID=CDS:OsNip_02t0827100-02;Parent=transcript:OsNip_02t0827100-02;protein_id=OsNip_02t0827100-02;Tag=IsoSeq:G4495.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2059.1,Nipponbare.panicle_G3517.2,Nipponbare.root_G2704.2;prot_id "UniRef90_UPI00053C4478";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35566674	35567513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827500-01;Name=OsNip_02t0827500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0827500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35567391	35567513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35566396	35566590	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827500-02;Tag=IsoSeq:G4498.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2707.2,Nipponbare.panicle_G3519.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5VFC7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35566674	35567515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827500-02;Tag=IsoSeq:G4498.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2707.2,Nipponbare.panicle_G3519.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5VFC7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35567756	35568005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0827600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35588337	35589241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828200-01;Name=OsNip_02t0828200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_02t0828200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35589052	35589241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	35588337	35589220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828200-02;Name=OsNip_02t0828200-02;exon_id=OsNip_02t0828200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4500.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3521.2;prot_id "UniRef90_A0A5P1E1Z5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35586007	35586966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828200-02;Tag=IsoSeq:G4500.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3521.2;prot_id "UniRef90_A0A5P1E1Z5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr02	TAMA	three_prime_UTR	35588337	35589220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828200-02;Tag=IsoSeq:G4500.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3521.2;prot_id "UniRef90_A0A5P1E1Z5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35585712	35586890	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0828300-01;Parent=gene:OsNip_02g0828300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0828300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35600213	35600678	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828533-01;Name=OsNip_02t0828533-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0828533-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35608987	35610667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828566-01;Name=OsNip_02t0828566-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0828566-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35610599	35610667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35609003	35609743	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0828600;Name=OsNip_TCP11;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35609003	35609055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35609003	35609743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828600-01;Name=OsNip_02t0828600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0828600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35609056	35609190	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0828600-01;Parent=transcript:OsNip_02t0828600-01;protein_id=OsNip_02t0828600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35609191	35609743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35621745	35622236	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0828800-01;Parent=gene:OsNip_02g0828800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0828800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35621745	35621984	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35621745	35622236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828800-01;Name=OsNip_02t0828800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0828800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	gene	35624137	35630750	.	+	.	ID=gene:OsNip_02g0828900;Name=JMJ720;biotype=protein_coding;description=Transcription;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35624137	35630678	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0828900-01;Parent=gene:OsNip_02g0828900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0828900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35624137	35624193	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35624137	35624430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828900-01;Name=OsNip_02t0828900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0828900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35624194	35624430	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0828900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0828900-01;protein_id=OsNip_02t0828900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35625975	35626079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0828900-01;Parent=transcript:OsNip_02t0828900-01;protein_id=OsNip_02t0828900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35626180	35626310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828900-01;Name=OsNip_02t0828900-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0828900-02-E2;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35630390	35630750	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0828900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35633824	35634501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35633824	35635184	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;Name=OsNip_02t0829000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0829000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35634502	35634735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0829000-01;Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;protein_id=OsNip_02t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35634736	35635184	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35636381	35636782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;Name=OsNip_02t0829000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0829000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35636381	35636782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35639878	35642562	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0829100;Name=OsNip_RPA32;biotype=protein_coding;description=Replication;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35639878	35642562	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0829100-01;Parent=gene:OsNip_02g0829100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0829100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35639878	35640105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0829100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35705713	35706380	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0830700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35741027	35742196	.	+	0	ID=CDS:OsNip_02t0831100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0831100-01;protein_id=OsNip_02t0831100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35742197	35742581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0831100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35787235	35787492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0832200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0832200-01;protein_id=OsNip_02t0832200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35787596	35787712	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0832200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0832200-01;protein_id=OsNip_02t0832200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35787596	35787721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0832200-01;Name=OsNip_02t0832200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0832200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35787713	35787721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0832200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35825448	35831318	.	+	.	ID=transcript:OsNip_02t0833100-01;Parent=gene:OsNip_02g0833100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35826315	35826367	.	+	2	ID=CDS:OsNip_02t0833100-01;Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;protein_id=OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35826315	35826582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Name=OsNip_02t0833100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_02t0833100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35826368	35826582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35826696	35826817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Name=OsNip_02t0833100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35828973	35829268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35829340	35829435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Name=OsNip_02t0833100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35829340	35829435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35829506	35829627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Name=OsNip_02t0833100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35829506	35829627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35830393	35830447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35830971	35831318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Name=OsNip_02t0833100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35830971	35831318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35832090	35836364	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0833200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35832090	35836364	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0833200-01;Parent=gene:OsNip_02g0833200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35832090	35832381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Name=OsNip_02t0833200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35832090	35832381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35832470	35832937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Name=OsNip_02t0833200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35832470	35832937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35833129	35833243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Name=OsNip_02t0833200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35833129	35833243	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35834506	35834620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Name=OsNip_02t0833200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35834506	35834620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35834733	35835211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35834733	35836364	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Name=OsNip_02t0833200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35835212	35835445	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0833200-01;Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;protein_id=OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35835446	35836364	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35836805	35838365	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0833300;biotype=protein_coding;description=Ubiquitin-conjugating;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35836805	35838365	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0833300-01;Parent=gene:OsNip_02g0833300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0833300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35836805	35837049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35836805	35838365	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833300-01;Name=OsNip_02t0833300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0833300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	CDS	35837050	35838258	.	-	0	ID=CDS:OsNip_02t0833300-01;Parent=transcript:OsNip_02t0833300-01;protein_id=OsNip_02t0833300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35838259	35838365	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	TAMA	mRNA	35836807	35838365	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0833300-02;Parent=gene:OsNip_02g0833300;transcript_id=OsNip_02t0833300-02;Tag=IsoSeq:G4532.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3548.3
Chr02	TAMA	exon	35838195	35838365	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833300-02;Name=OsNip_02t0833300-02;exon_id=OsNip_02t0833300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4532.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3548.3;prot_id "UniRef90_A0A2C9W5C3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr02	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35845031	35845041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35847940	35850475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833500-02;Name=OsNip_02t0833500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_02t0833500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35848648	35850475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr02	TAMA	exon	35847620	35850622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833500-03;Name=OsNip_02t0833500-03;exon_id=OsNip_02t0833500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4534.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3550.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	TAMA	five_prime_UTR	35847620	35847932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_02t0833500-03;Tag=IsoSeq:G4534.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3550.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr02	RAP2018-11-26	exon	35884408	35884500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834025-00;Name=OsNip_02t0834025-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0834025-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35884587	35884636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834025-00;Name=OsNip_02t0834025-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0834025-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35885154	35885265	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834025-00;Name=OsNip_02t0834025-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0834025-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35888179	35888743	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0834050;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35888179	35888743	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0834050-00;Parent=gene:OsNip_02g0834050;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_02t0834050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35888179	35888743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834050-00;Name=OsNip_02t0834050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0834050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	gene	35889064	35889853	.	-	.	ID=gene:OsNip_02g0834100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	mRNA	35889064	35889853	.	-	.	ID=transcript:OsNip_02t0834100-01;Parent=gene:OsNip_02g0834100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_02t0834100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35889064	35889597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr02	RAP2018-11-26	exon	35889064	35889853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_02t0834100-01;Name=OsNip_02t0834100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_02t0834100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	514342	514395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0108800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	514492	514759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0108800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	511484	514759	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0108800-02;Parent=gene:OsNip_03g0108800;transcript_id=OsNip_03t0108800-02;Tag=IsoSeq:G4595.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2762.1
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	727078	728004	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0112900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0112900-00;protein_id=OsNip_03t0112900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	729771	729846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0112950-01;Name=OsNip_03t0112950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0112950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	732488	734247	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0113000;Name=OsNip_RLCK95;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	732488	733012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0113000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	732488	733665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0113000-02;Name=OsNip_03t0113000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0113000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	733013	733665	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0113000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0113000-02;protein_id=OsNip_03t0113000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	793686	793780	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0114100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0114100-01;protein_id=OsNip_03t0114100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	794137	794489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114100-01;Name=OsNip_03t0114100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0114100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	794170	794489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	793551	794490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114100-02;Name=OsNip_03t0114100-02;exon_id=OsNip_03t0114100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4622.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3618.1;prot_id "UniRef90_A0A444FDU8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	793551	793551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114100-02;Tag=IsoSeq:G4622.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3618.1;prot_id "UniRef90_A0A444FDU8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	794167	794490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114100-02;Tag=IsoSeq:G4622.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3618.1;prot_id "UniRef90_A0A444FDU8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	795385	798116	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0114200;biotype=protein_coding;description=Nucleic;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	795385	798116	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0114200-01;Parent=gene:OsNip_03g0114200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0114200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	795385	795612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	795385	795799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114200-01;Name=OsNip_03t0114200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0114200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	797863	798116	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0114200-01;Name=OsNip_03t0114200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0114200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1175883	1175883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1173801	1175732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1173801	1176175	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121200-02;Name=OsNip_03t0121200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0121200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1195077	1195709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121700-02;Tag=IsoSeq:G4660.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2131.1;prot_id "UniRef90_M0ZIP7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1196662	1196826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121800-01;Name=OsNip_03t0121800-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0121800-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1199954	1200115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0121800-01;Name=OsNip_03t0121800-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0121800-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1232247	1232551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1232247	1232760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122200-01;Name=OsNip_03t0122200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0122200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1234206	1234438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122200-01;Name=OsNip_03t0122200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0122200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1234438	1234438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	1235460	1244932	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0122300;Name=FLS;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1235460	1235684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1235460	1235945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Name=OsNip_03t0122300-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0122300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1236971	1237295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Name=OsNip_03t0122300-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0122300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1236971	1237295	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0122300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;protein_id=OsNip_03t0122300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1244344	1244591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Name=OsNip_03t0122300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0122300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1244344	1244591	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0122300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;protein_id=OsNip_03t0122300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1244708	1244902	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0122300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;protein_id=OsNip_03t0122300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1244708	1244932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Name=OsNip_03t0122300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0122300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1244903	1244932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1242351	1244930	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0122300-02;Parent=gene:OsNip_03g0122300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1242351	1242678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1242351	1242751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;Name=OsNip_03t0122300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0122300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1242679	1242751	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0122300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;protein_id=OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1244344	1244591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;Name=OsNip_03t0122300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0122300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1244344	1244591	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0122300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;protein_id=OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1244708	1244902	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0122300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;protein_id=OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1244708	1244930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;Name=OsNip_03t0122300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0122300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1244903	1244930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	1242355	1244930	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0122300-03;Parent=gene:OsNip_03g0122300;transcript_id=OsNip_03t0122300-03;Tag=IsoSeq:G4662.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2800.5
Chr03	TAMA	exon	1242355	1244930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-03;Name=OsNip_03t0122300-03;exon_id=OsNip_03t0122300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4662.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2800.5;prot_id "UniRef90_A0A5J9VAK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	1244602	1244928	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0122300-03;Parent=transcript:OsNip_03t0122300-03;protein_id=OsNip_03t0122300-03;Tag=IsoSeq:G4662.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2800.5;prot_id "UniRef90_A0A5J9VAK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	1244929	1244930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0122300-03;Tag=IsoSeq:G4662.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2800.5;prot_id "UniRef90_A0A5J9VAK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1434977	1435315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125000-01;Name=OsNip_03t0125000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0125000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1451663	1451951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125400-01;Name=OsNip_03t0125400-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0125400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1463825	1463941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0125700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0125700-01;protein_id=OsNip_03t0125700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1464029	1464090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125700-01;Name=OsNip_03t0125700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0125700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1464029	1464090	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0125700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0125700-01;protein_id=OsNip_03t0125700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1484399	1484943	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0125900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0125900-01;protein_id=OsNip_03t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1485644	1485797	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0125900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0125900-01;protein_id=OsNip_03t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1485644	1485927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125900-01;Name=OsNip_03t0125900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0125900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1485798	1485927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1484367	1484398	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1484367	1486097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125900-02;Name=OsNip_03t0125900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0125900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1484948	1486097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0125900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	1486030	1490594	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0126000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1486030	1490594	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0126000-01;Parent=gene:OsNip_03g0126000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0126000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1631520	1631721	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0128800-03;Parent=transcript:OsNip_03t0128800-03;protein_id=OsNip_03t0128800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	1630256	1631748	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0128800-04;Parent=gene:OsNip_03g0128800;transcript_id=OsNip_03t0128800-04;Tag=IsoSeq:G4701.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2149.3
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1630532	1630738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0128800-04;Tag=IsoSeq:G4701.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2149.3;prot_id "UniRef90_A0A2G5EME7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1630256	1630407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0128800-04;Tag=IsoSeq:G4701.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2149.3;prot_id "UniRef90_A0A2G5EME7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	1635847	1638066	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0128866;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1635847	1638066	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0128866-00;Parent=gene:OsNip_03g0128866;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0128866-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1720072	1720807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130500-02;Name=OsNip_03t0130500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0130500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1720542	1720805	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0130500-02;Parent=transcript:OsNip_03t0130500-02;protein_id=OsNip_03t0130500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1720806	1720807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1720158	1727907	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0130500-01;Parent=gene:OsNip_03g0130500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0130500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1720158	1720541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1720158	1720985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130500-01;Name=OsNip_03t0130500-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0130500-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	1721068	1721179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130500-01;Name=OsNip_03t0130500-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0130500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1769843	1770199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1774391	1775646	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0130950-00;Parent=gene:OsNip_03g0130950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0130950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1774391	1774548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0130950-00;Name=OsNip_03t0130950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0130950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1815546	1815941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0131825-00;Parent=transcript:OsNip_03t0131825-00;protein_id=OsNip_03t0131825-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1815942	1816000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131825-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1816354	1816503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131825-00;Name=OsNip_03t0131825-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0131825-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1816354	1816503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131825-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1817533	1818855	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0131900-01;Parent=gene:OsNip_03g0131900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0131900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1817533	1817671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1817533	1818855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131900-01;Name=OsNip_03t0131900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0131900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1818839	1818855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0131900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1817620	1818990	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0131950-00;Parent=gene:OsNip_03g0131950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0131950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1825606	1825719	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0132000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132000-01;protein_id=OsNip_03t0132000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1825606	1825976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-01;Name=OsNip_03t0132000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0132000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1825720	1825976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	1822239	1825968	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0132000-02;Parent=gene:OsNip_03g0132000;transcript_id=OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2
Chr03	TAMA	exon	1822239	1825102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Name=OsNip_03t0132000-02;exon_id=OsNip_03t0132000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	1824587	1824784	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;protein_id=OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	exon	1825210	1825466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Name=OsNip_03t0132000-02;exon_id=OsNip_03t0132000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	1822239	1824586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1824788	1825102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1825210	1825466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1825606	1825968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132000-02;Tag=IsoSeq:G4723.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2839.2;prot_id "UniRef90_A0A0J8BHP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	1831332	1833081	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0132200;Name=OsNip_EXPLA1;biotype=protein_coding;description=Expansin-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1831332	1831389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1831332	1831555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Name=OsNip_03t0132200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0132200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1831390	1831555	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0132200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;protein_id=OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1831665	1831777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Name=OsNip_03t0132200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0132200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1831665	1831777	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0132200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;protein_id=OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1831885	1832063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Name=OsNip_03t0132200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0132200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1831885	1832063	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0132200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;protein_id=OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1832343	1832475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Name=OsNip_03t0132200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0132200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1832343	1832475	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0132200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;protein_id=OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	1832565	1832813	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0132200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;protein_id=OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1832565	1833035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Name=OsNip_03t0132200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0132200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1832814	1833035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	1831340	1833081	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0132200-02;Parent=gene:OsNip_03g0132200;transcript_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2
Chr03	TAMA	exon	1831340	1831555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Name=OsNip_03t0132200-02;exon_id=OsNip_03t0132200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	1831342	1831555	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;protein_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	1831665	1831766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Name=OsNip_03t0132200-02;exon_id=OsNip_03t0132200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	1831665	1831766	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;protein_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	1831876	1832063	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Name=OsNip_03t0132200-02;exon_id=OsNip_03t0132200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	1831876	1832063	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;protein_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	1832338	1832475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Name=OsNip_03t0132200-02;exon_id=OsNip_03t0132200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	1832338	1832475	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;protein_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	1832565	1833081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Name=OsNip_03t0132200-02;exon_id=OsNip_03t0132200-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	1832565	1832807	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0132200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;protein_id=OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	1831340	1831341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	1832811	1833081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132200-02;Tag=IsoSeq:G4724.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3702.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	1831422	1832828	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0132250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	1831422	1832828	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0132250-00;Parent=gene:OsNip_03g0132250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0132250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1831422	1831446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1831422	1831758	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0132250-00;Name=OsNip_03t0132250-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0132250-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1956859	1957200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0135400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	1956859	1958622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0135400-01;Name=OsNip_03t0135400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0135400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2265247	2266928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0141000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	2264928	2265240	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0141000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0141000-02;protein_id=OsNip_03t0141000-02;Tag=IsoSeq:G4771.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2867.2,Nipponbare.panicle_G3733.1,Nipponbare.leaf_G2185.1,Nipponbare.root_G2867.3;prot_id "UniRef90_Q9FDZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	TAMA	CDS	2266302	2266303	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0141000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0141000-02;protein_id=OsNip_03t0141000-02;Tag=IsoSeq:G4771.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2867.2,Nipponbare.panicle_G3733.1,Nipponbare.leaf_G2185.1,Nipponbare.root_G2867.3;prot_id "UniRef90_Q9FDZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	2264927	2264927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0141000-02;Tag=IsoSeq:G4771.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G2867.2,Nipponbare.panicle_G3733.1,Nipponbare.leaf_G2185.1,Nipponbare.root_G2867.3;prot_id "UniRef90_Q9FDZ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2409889	2413431	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0143600-01;Parent=gene:OsNip_03g0143600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0143600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2412519	2412687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143600-01;Name=OsNip_03t0143600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0143600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2412770	2412902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143600-01;Name=OsNip_03t0143600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0143600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2413124	2413431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2415606	2415748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;Name=OsNip_03t0143700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0143700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2415993	2416069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2418341	2418494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;Name=OsNip_03t0143700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0143700-02-E2;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2418341	2418494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0143700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;protein_id=OsNip_03t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2418680	2419338	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0143700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;protein_id=OsNip_03t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2418680	2419559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;Name=OsNip_03t0143700-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0143700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2419339	2419559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2417244	2419564	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0143700-02;Parent=gene:OsNip_03g0143700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0143700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2417244	2417244	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2417244	2418243	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-02;Name=OsNip_03t0143700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0143700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2417245	2418243	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0143700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0143700-02;protein_id=OsNip_03t0143700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2418341	2418494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0143700-02;Name=OsNip_03t0143700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0143700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2498099	2499016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2506095	2506940	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0145150-00;Parent=transcript:OsNip_03t0145150-00;protein_id=OsNip_03t0145150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2506064	2507170	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0145200-01;Parent=gene:OsNip_03g0145200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2506064	2506129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2506130	2506216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0145200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0145200-01;protein_id=OsNip_03t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2506317	2506889	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0145200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0145200-01;protein_id=OsNip_03t0145200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2506317	2507170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145200-01;Name=OsNip_03t0145200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0145200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2534050	2534463	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145751-00;Name=OsNip_03t0145751-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0145751-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2534050	2534463	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0145751-00;Parent=transcript:OsNip_03t0145751-00;protein_id=OsNip_03t0145751-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2542773	2542925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145775-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2542773	2543266	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145775-01;Name=OsNip_03t0145775-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0145775-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2542926	2543264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0145775-01;Parent=transcript:OsNip_03t0145775-01;protein_id=OsNip_03t0145775-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2543265	2543266	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145775-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2543670	2546338	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0145800;biotype=protein_coding;description=Ankyrin;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2543680	2544274	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0145800-02;Parent=gene:OsNip_03g0145800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0145800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2543680	2543924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2543680	2544110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0145800-02;Name=OsNip_03t0145800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0145800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2543925	2544110	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0145800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0145800-02;protein_id=OsNip_03t0145800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2544204	2544272	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0145800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0145800-02;protein_id=OsNip_03t0145800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2564426	2564558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0146100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-01;protein_id=OsNip_03t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2564426	2564646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-01;Name=OsNip_03t0146100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0146100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2562858	2563051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2562858	2563135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;Name=OsNip_03t0146100-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0146100-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2563052	2563135	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0146100-03;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;protein_id=OsNip_03t0146100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2563298	2563671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;Name=OsNip_03t0146100-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0146100-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2563298	2563671	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0146100-03;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;protein_id=OsNip_03t0146100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2564426	2564558	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0146100-03;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;protein_id=OsNip_03t0146100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2564426	2564643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;Name=OsNip_03t0146100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0146100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2564559	2564643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2562867	2563417	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0146100-05;Parent=gene:OsNip_03g0146100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0146100-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2562867	2563051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2562867	2563417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-05;Name=OsNip_03t0146100-05-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0146100-05-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2563052	2563417	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0146100-05;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-05;protein_id=OsNip_03t0146100-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	2562859	2564645	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0146100-06;Parent=gene:OsNip_03g0146100;transcript_id=OsNip_03t0146100-06;Tag=IsoSeq:G4793.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2880.6
Chr03	TAMA	exon	2564495	2564645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-06;Name=OsNip_03t0146100-06;exon_id=OsNip_03t0146100-06-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4793.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2880.6;prot_id "UniRef90_Q53U42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	CDS	2564495	2564644	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0146100-06;Parent=transcript:OsNip_03t0146100-06;protein_id=OsNip_03t0146100-06;Tag=IsoSeq:G4793.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2880.6;prot_id "UniRef90_Q53U42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	exon	2562859	2563623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-06;Name=OsNip_03t0146100-06;exon_id=OsNip_03t0146100-06-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4793.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2880.6;prot_id "UniRef90_Q53U42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	2564645	2564645	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146100-06;Tag=IsoSeq:G4793.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2880.6;prot_id "UniRef90_Q53U42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2581186	2581617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0146500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2727281	2727559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149100-01;Name=OsNip_03t0149100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0149100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	2748010	2748637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149300-02;Tag=IsoSeq:G4804.9;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2885.8;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2757617	2760567	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0149400;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2757617	2760567	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0149400-01;Parent=gene:OsNip_03g0149400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2757617	2757735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2757617	2758067	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;Name=OsNip_03t0149400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0149400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2757736	2758067	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;protein_id=OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2758242	2759219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;Name=OsNip_03t0149400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0149400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2758242	2759219	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;protein_id=OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2760259	2760445	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;protein_id=OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2760259	2760567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;Name=OsNip_03t0149400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0149400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2760446	2760567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2771187	2772433	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0149700;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2771187	2772433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0149700-00;Parent=gene:OsNip_03g0149700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2771187	2771395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149700-00;Name=OsNip_03t0149700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0149700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2771187	2771395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2771402	2771429	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2771402	2772433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0149700-00;Name=OsNip_03t0149700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0149700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2771430	2772365	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0149700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0149700-00;protein_id=OsNip_03t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	2813423	2814177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0150700-01;Tag=IsoSeq:G4807.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3757.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9UD58";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2815502	2815735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0150800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2815502	2817322	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0150800-01;Name=OsNip_03t0150800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0150800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2823077	2828037	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0151100-01;Parent=gene:OsNip_03g0151100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0151100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2823077	2823388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Name=OsNip_03t0151100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0151100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2823469	2823560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2824990	2825098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2825214	2825269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2825214	2825465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Name=OsNip_03t0151100-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0151100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2825270	2825465	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0151100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;protein_id=OsNip_03t0151100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2825610	2825822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Name=OsNip_03t0151100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0151100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2825901	2825994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151100-01;Name=OsNip_03t0151100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0151100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2823275	2825432	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151201-01;Name=OsNip_03t0151201-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0151201-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2833133	2837268	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0151300-01;Parent=gene:OsNip_03g0151300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2833133	2833279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2833133	2834246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;Name=OsNip_03t0151300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0151300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2833280	2834246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0151300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;protein_id=OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2834333	2834395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;Name=OsNip_03t0151300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0151300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2834333	2834395	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0151300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;protein_id=OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2834488	2834519	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0151300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;protein_id=OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2834488	2834555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;Name=OsNip_03t0151300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0151300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2834520	2834555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0151300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2874811	2875186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152200-00;Name=OsNip_03t0152200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0152200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2878853	2879068	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0152300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152300-01;protein_id=OsNip_03t0152300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2879172	2880416	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0152300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152300-01;protein_id=OsNip_03t0152300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2879172	2880830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152300-01;Name=OsNip_03t0152300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0152300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2883005	2883236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2883237	2883353	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2883743	2883845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Name=OsNip_03t0152400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0152400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2883743	2883845	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2883984	2884051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Name=OsNip_03t0152400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0152400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2883984	2884051	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2884783	2884925	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Name=OsNip_03t0152400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0152400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2884783	2884925	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2885263	2885455	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Name=OsNip_03t0152400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0152400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2885263	2885455	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2886830	2887864	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;protein_id=OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2886830	2887887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Name=OsNip_03t0152400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0152400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2887865	2887887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2886826	2887072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2886826	2887778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152500-00;Name=OsNip_03t0152500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0152500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2887073	2887778	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0152500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0152500-00;protein_id=OsNip_03t0152500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2897477	2900285	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0152600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2897477	2900285	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0152600-01;Parent=gene:OsNip_03g0152600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2897477	2897681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2897477	2897852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;Name=OsNip_03t0152600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0152600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2897682	2897852	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;protein_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2898284	2898385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;Name=OsNip_03t0152600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0152600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2898284	2898385	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;protein_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2898458	2898574	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;protein_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2899628	2899728	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;protein_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2900001	2900229	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0152600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;protein_id=OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2900001	2900285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;Name=OsNip_03t0152600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0152600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2900230	2900285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2901555	2906614	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0152700;biotype=protein_coding;description=Pseudouridine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2987483	2987864	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0154700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0154700-01;protein_id=OsNip_03t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	2988740	2989232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154700-01;Name=OsNip_03t0154700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0154700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2988918	2989232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2987483	2988911	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0154750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2987483	2988911	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0154750-00;Parent=gene:OsNip_03g0154750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0154750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2987483	2987547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2987483	2987861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;Name=OsNip_03t0154750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0154750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	2987548	2987832	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0154750-00;Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;protein_id=OsNip_03t0154750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2987833	2987861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2988737	2988911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;Name=OsNip_03t0154750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0154750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2988737	2988911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0154750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	2994392	2995344	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0155000;biotype=protein_coding;description=Monooxygenase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	2994392	2995344	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0155000-00;Parent=gene:OsNip_03g0155000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0155000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	2994392	2994563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0155000-00;Name=OsNip_03t0155000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0155000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2994392	2994563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0155000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2994657	2994798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0155000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	3027175	3027483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0156200-00;Name=OsNip_03t0156200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0156200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	3036423	3036531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0156366-00;Name=OsNip_03t0156366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0156366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3042769	3042840	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0156500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0156500-01;protein_id=OsNip_03t0156500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3044579	3044902	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0156500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0156500-01;protein_id=OsNip_03t0156500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3044579	3045332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0156500-01;Name=OsNip_03t0156500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0156500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3108710	3108817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0157800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3109200	3109735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0157800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3103895	3104354	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0157800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3103895	3104702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0157800-02;Name=OsNip_03t0157800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0157800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3112071	3112384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0157900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	3114416	3115461	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0158000-01;Parent=gene:OsNip_03g0158000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0158000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3114416	3114731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0158000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3114416	3115461	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0158000-01;Name=OsNip_03t0158000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0158000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	3115986	3120267	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0158200-01;Parent=gene:OsNip_03g0158200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0158200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3115986	3116090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0158200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3116467	3116760	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0158200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0158200-01;protein_id=OsNip_03t0158200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3119658	3119743	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0158200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0158200-01;protein_id=OsNip_03t0158200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3119820	3119885	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0158200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0158200-01;protein_id=OsNip_03t0158200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3119820	3120267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0158200-01;Name=OsNip_03t0158200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0158200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	3207709	3208276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0160100-01;Name=OsNip_03t0160100-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0160100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	3343295	3343388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0161900-03;Tag=IsoSeq:G4852.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3789.1,Nipponbare.leaf_G2221.1;prot_id "UniRef90_C5X1F4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	3343565	3344547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0161900-03;Tag=IsoSeq:G4852.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3789.1,Nipponbare.leaf_G2221.1;prot_id "UniRef90_C5X1F4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3347543	3347802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0161950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3347543	3347886	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0161950-00;Name=OsNip_03t0161950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0161950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3347803	3347886	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0161950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0161950-00;protein_id=OsNip_03t0161950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3348155	3348175	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0161950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0161950-00;protein_id=OsNip_03t0161950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3348155	3348242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0161950-00;Name=OsNip_03t0161950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0161950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3739055	3739171	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0169600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169600-01;protein_id=OsNip_03t0169600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	3739843	3741336	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0169700;Name=OsNip_Dof12os;biotype=protein_coding;description=Antisense;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	3739843	3741336	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0169700-01;Parent=gene:OsNip_03g0169700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0169700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	3739843	3741336	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169700-01;Name=OsNip_03t0169700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0169700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3744980	3745064	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0169800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;protein_id=OsNip_03t0169800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3745451	3745489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;Name=OsNip_03t0169800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0169800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3745451	3745489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0169800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;protein_id=OsNip_03t0169800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3745704	3746060	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0169800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;protein_id=OsNip_03t0169800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3745704	3746086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;Name=OsNip_03t0169800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0169800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3746061	3746086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	3747934	3750570	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0169900;biotype=protein_coding;description=Pathogenic;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	3747934	3750271	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0169900-01;Parent=gene:OsNip_03g0169900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0169900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3747934	3748177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3747934	3748225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;Name=OsNip_03t0169900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0169900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3748178	3748225	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0169900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;protein_id=OsNip_03t0169900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	3749968	3750270	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0169900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;protein_id=OsNip_03t0169900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3749968	3750271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;Name=OsNip_03t0169900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0169900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3750271	3750271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	3747934	3750570	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0169900-02;Parent=gene:OsNip_03g0169900;transcript_id=OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2
Chr03	TAMA	exon	3750392	3750570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Name=OsNip_03t0169900-02;exon_id=OsNip_03t0169900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	3750477	3750569	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0169900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;protein_id=OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	3749968	3750270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Name=OsNip_03t0169900-02;exon_id=OsNip_03t0169900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	3747934	3748225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Name=OsNip_03t0169900-02;exon_id=OsNip_03t0169900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	3750570	3750570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	3750392	3750474	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	3749968	3750270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	3747934	3748225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0169900-02;Tag=IsoSeq:G4881.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3812.1,Nipponbare.leaf_G2235.3,Nipponbare.leaf_G2235.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6TLH5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	3751182	3753905	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0170000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	3751182	3753905	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0170000-01;Parent=gene:OsNip_03g0170000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0170000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3751182	3753615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0170000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3997274	3997757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0174600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3990819	3990858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0174600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	3990819	3990874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0174600-02;Name=OsNip_03t0174600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0174600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4120842	4120973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0178066-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4121241	4121375	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0178066-01;Parent=transcript:OsNip_03t0178066-01;protein_id=OsNip_03t0178066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4121707	4121793	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0178066-01;Parent=transcript:OsNip_03t0178066-01;protein_id=OsNip_03t0178066-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4137520	4137587	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0178500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0178500-01;protein_id=OsNip_03t0178500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4138388	4138483	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0178500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0178500-01;protein_id=OsNip_03t0178500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	4141969	4142715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0178500-01;Name=OsNip_03t0178500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0178500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4141936	4142524	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0178550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4141936	4143332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0178550-01;Name=OsNip_03t0178550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0178550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4142525	4142785	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0178550-01;Parent=transcript:OsNip_03t0178550-01;protein_id=OsNip_03t0178550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4142786	4143332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0178550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	4144020	4144383	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0178600;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	4178324	4179030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0179400-02;Tag=IsoSeq:G4916.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G2953.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	4181381	4182557	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0179700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	4181381	4182557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0179700-00;Parent=gene:OsNip_03g0179700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0179700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4181381	4181661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0179700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4181381	4181793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0179700-00;Name=OsNip_03t0179700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0179700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4181662	4181793	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0179700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0179700-00;protein_id=OsNip_03t0179700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4181907	4182149	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0179700-00;Name=OsNip_03t0179700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0179700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4181907	4182149	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0179700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0179700-00;protein_id=OsNip_03t0179700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4272872	4273365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0181600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4274264	4274366	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0181600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0181600-01;protein_id=OsNip_03t0181600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4274448	4275642	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0181600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0181600-01;protein_id=OsNip_03t0181600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4291454	4291799	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0181800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	4417900	4418010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184100-02;Tag=IsoSeq:G4938.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2261.3;prot_id "UniRef90_Q338P4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	4418671	4419105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184100-02;Tag=IsoSeq:G4938.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2261.3;prot_id "UniRef90_Q338P4";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	4420240	4420995	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0184201-00;Parent=gene:OsNip_03g0184201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0184201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4420240	4420240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4420240	4420572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184201-00;Name=OsNip_03t0184201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0184201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4439392	4439493	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0184500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0184500-01;protein_id=OsNip_03t0184500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4439619	4439765	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0184500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0184500-01;protein_id=OsNip_03t0184500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4439619	4439874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184500-01;Name=OsNip_03t0184500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0184500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4439766	4439874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	4441960	4443828	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0184550-01;Parent=gene:OsNip_03g0184550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0184550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4441960	4442043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0184550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4500429	4500480	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0186100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0186100-01;protein_id=OsNip_03t0186100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	4500559	4500824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0186100-01;Name=OsNip_03t0186100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0186100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	4517564	4518519	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0186500-04;Tag=IsoSeq:G4949.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3871.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7Q4R7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4653462	4653899	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0188900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0188900-02;protein_id=OsNip_03t0188900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4653978	4654433	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0188900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0188900-02;protein_id=OsNip_03t0188900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4653978	4654743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0188900-02;Name=OsNip_03t0188900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0188900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4654434	4654743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0188900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	4660862	4661923	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0189100;biotype=protein_coding;description=Uncharacterised;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	4660862	4661923	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0189100-01;Parent=gene:OsNip_03g0189100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0189100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4660862	4661029	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0189100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4703410	4703556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0190400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4766183	4766335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0191400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4955331	4955601	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0195475-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4955771	4955856	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0195475-00;Parent=transcript:OsNip_03t0195475-00;protein_id=OsNip_03t0195475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	4956094	4956317	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0195475-00;Name=OsNip_03t0195475-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0195475-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	4956094	4956317	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0195475-00;Parent=transcript:OsNip_03t0195475-00;protein_id=OsNip_03t0195475-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5083486	5083486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0196900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	5170211	5170358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198400-02;Tag=IsoSeq:G5007.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3018.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5170479	5170716	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198400-02;Tag=IsoSeq:G5007.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3018.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5167339	5170273	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0198433-00;Parent=gene:OsNip_03g0198433;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0198433-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5167339	5167523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5167611	5167680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5167768	5167928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5168286	5168391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5168885	5169079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5169343	5169436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5169516	5169702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5169804	5169996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5170079	5170273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198433-00;Name=OsNip_03t0198433-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198433-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5175138	5179203	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0198500-01;Parent=gene:OsNip_03g0198500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0198500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5175138	5175384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198500-01;Name=OsNip_03t0198500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5175138	5175384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5176579	5176582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5176579	5176796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0198500-01;Name=OsNip_03t0198500-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0198500-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5335508	5335603	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0201901-00;Parent=transcript:OsNip_03t0201901-00;protein_id=OsNip_03t0201901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	5335910	5335910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0201901-01;Tag=IsoSeq:G5020.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3026.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5334789	5335679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0201901-01;Tag=IsoSeq:G5020.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3026.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	5341103	5347082	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0202001;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5341103	5347082	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0202001-01;Parent=gene:OsNip_03g0202001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0202001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5341103	5341388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0202001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5342167	5342213	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0202001-01;Parent=transcript:OsNip_03t0202001-01;protein_id=OsNip_03t0202001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5438603	5438789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203750-00;Name=OsNip_03t0203750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0203750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5443359	5443445	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0203800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0203800-01;protein_id=OsNip_03t0203800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5443590	5443916	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0203800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0203800-01;protein_id=OsNip_03t0203800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5443590	5444188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203800-01;Name=OsNip_03t0203800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0203800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5443917	5444188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5442944	5443226	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203800-02;Tag=IsoSeq:G5029.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3932.2;prot_id "UniRef90_B4FQ15";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5442732	5442858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203800-02;Tag=IsoSeq:G5029.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3932.2;prot_id "UniRef90_B4FQ15";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5442179	5442620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0203800-02;Tag=IsoSeq:G5029.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3932.2;prot_id "UniRef90_B4FQ15";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5458099	5458225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5458099	5459673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0204100-01;Name=OsNip_03t0204100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0204100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5458226	5459673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0204100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0204100-01;protein_id=OsNip_03t0204100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5481817	5482123	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0204900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0204900-01;protein_id=OsNip_03t0204900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5483405	5483640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5483641	5485007	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5485943	5486370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Name=OsNip_03t0205000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0205000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5485943	5486370	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5487521	5487615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Name=OsNip_03t0205000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0205000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5487521	5487615	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5487726	5487787	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Name=OsNip_03t0205000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0205000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5487726	5487787	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5487902	5488061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Name=OsNip_03t0205000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0205000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5487902	5488061	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5488751	5489147	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0205000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;protein_id=OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5488751	5489241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Name=OsNip_03t0205000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0205000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5489148	5489241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0205000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	5483405	5489259	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0205000-02;Parent=gene:OsNip_03g0205000;transcript_id=OsNip_03t0205000-02;Tag=IsoSeq:G5033.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3936.1,Nipponbare.leaf_G2302.1
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5594126	5594359	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0206900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0206900-01;protein_id=OsNip_03t0206900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5595252	5595994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0206900-01;Name=OsNip_03t0206900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0206900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5595837	5595994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0206900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	5609827	5612733	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0207200;biotype=protein_coding;description=Syntaxin;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5609827	5612733	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0207200-01;Parent=gene:OsNip_03g0207200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0207200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5609827	5610398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0207200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5649180	5649278	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0207900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0207900-01;protein_id=OsNip_03t0207900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5649877	5650212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0207900-01;Name=OsNip_03t0207900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0207900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5771946	5772251	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0210500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0210500-01;protein_id=OsNip_03t0210500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5772252	5772406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0210500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5779088	5779384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0210700-02;Tag=IsoSeq:G5056.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3955.2,Nipponbare.leaf_G2316.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5779625	5780223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0210800-01;Name=OsNip_03t0210800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0210800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5781693	5782279	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0210800-01;protein_id=OsNip_03t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5783134	5784936	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0210800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0210800-01;protein_id=OsNip_03t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5783134	5784938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0210800-01;Name=OsNip_03t0210800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0210800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5784937	5784938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0210800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	5807852	5807852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211400-02;Tag=IsoSeq:G5059.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3958.1;prot_id "UniRef90_A0A6I9SAX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5808908	5808945	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211400-02;Tag=IsoSeq:G5059.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3958.1;prot_id "UniRef90_A0A6I9SAX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5810011	5812644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211400-02;Tag=IsoSeq:G5059.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G3958.1;prot_id "UniRef90_A0A6I9SAX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	5814835	5814883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211500-01;Name=OsNip_03t0211500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0211500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5814835	5814883	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0211500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0211500-01;protein_id=OsNip_03t0211500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5814958	5815285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211500-01;Name=OsNip_03t0211500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0211500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	5828181	5828189	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t021179A-01;Tag=IsoSeq:G5063.1;Source=Nipponbare.panicle_G3961.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5836635	5836787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5840714	5844806	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0211900-02;Parent=gene:OsNip_03g0211900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5840714	5841381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Name=OsNip_03t0211900-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0211900-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5840714	5841381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5841482	5841553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5841639	5841710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5841981	5842124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5842214	5842285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5842533	5843185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5842533	5843261	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Name=OsNip_03t0211900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0211900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5843186	5843261	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0211900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;protein_id=OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5843968	5844115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Name=OsNip_03t0211900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0211900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5843968	5844115	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0211900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;protein_id=OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5844626	5844737	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0211900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;protein_id=OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5844626	5844806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Name=OsNip_03t0211900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0211900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5844738	5844806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0211900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5856983	5857069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0212200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5857155	5857465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0212200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	5853922	5854102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0212200-02;Name=OsNip_03t0212200-02;exon_id=OsNip_03t0212200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5065.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2320.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4LZY4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	TAMA	exon	5854945	5855014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0212200-02;Name=OsNip_03t0212200-02;exon_id=OsNip_03t0212200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5065.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2320.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4LZY4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5876647	5876777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0212950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5876994	5877016	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0212950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0212950-00;protein_id=OsNip_03t0212950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5877121	5877274	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0212950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0212950-00;protein_id=OsNip_03t0212950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5982256	5982376	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0214100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0214100-01;protein_id=OsNip_03t0214100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	5982587	5982781	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0214100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0214100-01;protein_id=OsNip_03t0214100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	5982587	5983020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0214100-01;Name=OsNip_03t0214100-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0214100-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	5983462	5988738	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0214200-02;Parent=gene:OsNip_03g0214200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0214200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5983462	5983834	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0214200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6115553	6116995	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0216300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0216300-02;protein_id=OsNip_03t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6116996	6117635	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6118183	6118730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216300-02;Name=OsNip_03t0216300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0216300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6118183	6118730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	6118856	6120196	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0216400;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6118856	6120196	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0216400-01;Parent=gene:OsNip_03g0216400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0216400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6118856	6118991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6118856	6120196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216400-01;Name=OsNip_03t0216400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0216400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6118992	6120170	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0216400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0216400-01;protein_id=OsNip_03t0216400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6120171	6120196	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6140387	6140448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6142636	6142781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216700-01;Name=OsNip_03t0216700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0216700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6142636	6142781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	6141194	6142781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216700-02;Name=OsNip_03t0216700-02;exon_id=OsNip_03t0216700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5088.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3063.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	6142389	6142781	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0216700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0216700-02;protein_id=OsNip_03t0216700-02;Tag=IsoSeq:G5088.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3063.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6141194	6142386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216700-02;Tag=IsoSeq:G5088.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3063.6;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	6147473	6152948	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0216766;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6147473	6152948	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0216766-01;Parent=gene:OsNip_03g0216766;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0216766-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6147473	6152316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216766-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6147473	6152948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216766-01;Name=OsNip_03t0216766-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0216766-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6152317	6152616	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0216766-01;Parent=transcript:OsNip_03t0216766-01;protein_id=OsNip_03t0216766-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6152617	6152948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216766-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6152114	6155182	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0216800-01;Parent=gene:OsNip_03g0216800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0216800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6152114	6152172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6152173	6152418	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0216800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0216800-01;protein_id=OsNip_03t0216800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6152538	6152675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216800-01;Name=OsNip_03t0216800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0216800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6152538	6152675	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0216800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0216800-01;protein_id=OsNip_03t0216800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6163195	6163542	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0216900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0216900-01;protein_id=OsNip_03t0216900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6163195	6163869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-01;Name=OsNip_03t0216900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0216900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6163543	6163869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	6159743	6160080	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0216900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;protein_id=OsNip_03t0216900-02;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	6160207	6160503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;Name=OsNip_03t0216900-02;exon_id=OsNip_03t0216900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	exon	6163195	6163869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;Name=OsNip_03t0216900-02;exon_id=OsNip_03t0216900-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6160207	6160503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6162269	6162496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6163195	6163869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0216900-02;Tag=IsoSeq:G5089.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3064.1,Nipponbare.panicle_G3983.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3YPH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6163963	6164560	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0217000-01;Parent=gene:OsNip_03g0217000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0217000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6163963	6164064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6163963	6164560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217000-01;Name=OsNip_03t0217000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0217000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6164065	6164496	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0217000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217000-01;protein_id=OsNip_03t0217000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6164497	6164560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	6167007	6173985	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0217200;Name=OsNip_Fbox133;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6167007	6173938	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0217200-01;Parent=gene:OsNip_03g0217200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6167007	6167195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6167007	6167265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;Name=OsNip_03t0217200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0217200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6167196	6167265	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0217200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;protein_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6167932	6168035	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0217200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;protein_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6172275	6173114	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0217200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;protein_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6173188	6173340	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0217200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;protein_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6173428	6173796	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0217200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;protein_id=OsNip_03t0217200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6173428	6173938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0217200-01;Name=OsNip_03t0217200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0217200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6295480	6295537	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0219900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6296122	6296273	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0219900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0219900-01;protein_id=OsNip_03t0219900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6297260	6297481	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0219900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0219900-01;protein_id=OsNip_03t0219900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6297260	6297596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0219900-01;Name=OsNip_03t0219900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0219900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6297482	6297596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0219900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	6297269	6297619	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0219900-02;Parent=gene:OsNip_03g0219900;transcript_id=OsNip_03t0219900-02;Tag=IsoSeq:G5100.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3992.2
Chr03	TAMA	exon	6297269	6297619	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0219900-02;Name=OsNip_03t0219900-02;exon_id=OsNip_03t0219900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5100.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3992.2;prot_id "UniRef90_B9HJ33";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	6297382	6297429	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0219900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0219900-02;protein_id=OsNip_03t0219900-02;Tag=IsoSeq:G5100.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G3992.2;prot_id "UniRef90_B9HJ33";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6425367	6425498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0222800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6457915	6458213	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0223400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6457915	6458369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0223400-01;Name=OsNip_03t0223400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0223400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6458214	6458369	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0223400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0223400-01;protein_id=OsNip_03t0223400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	6466218	6466493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0223550-00;Name=OsNip_03t0223550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0223550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6516496	6517818	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0224200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0224200-02;protein_id=OsNip_03t0224200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6518260	6518415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6515666	6515740	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0224200-03;Parent=transcript:OsNip_03t0224200-03;protein_id=OsNip_03t0224200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	6519054	6523430	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0224300;Name=OsNip_TPS4;biotype=protein_coding;description=HAD-superfamily;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6519054	6519404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6519054	6519719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;Name=OsNip_03t0224300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0224300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6519405	6519719	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0224300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;protein_id=OsNip_03t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6519812	6520085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;Name=OsNip_03t0224300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0224300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6519812	6520085	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0224300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;protein_id=OsNip_03t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6520450	6522131	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0224300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;protein_id=OsNip_03t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	6520450	6522132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;Name=OsNip_03t0224300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0224300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6522132	6522132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	6519153	6523430	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0224300-02;Parent=gene:OsNip_03g0224300;transcript_id=OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4
Chr03	TAMA	exon	6523164	6523430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Name=OsNip_03t0224300-02;exon_id=OsNip_03t0224300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	6523209	6523430	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0224300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;protein_id=OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	6520450	6522938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Name=OsNip_03t0224300-02;exon_id=OsNip_03t0224300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	6519812	6520085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Name=OsNip_03t0224300-02;exon_id=OsNip_03t0224300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	6519153	6519719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Name=OsNip_03t0224300-02;exon_id=OsNip_03t0224300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6523164	6523206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6520450	6522938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6519812	6520085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6519153	6519719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224300-02;Tag=IsoSeq:G5114.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3078.1,Nipponbare.panicle_G4004.4;prot_id "UniRef90_A0A5J5AN84";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	6537573	6541381	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0224700;Name=HSFA9;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6537573	6541381	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0224700-01;Parent=gene:OsNip_03g0224700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0224700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6537573	6537736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0224700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6636808	6636985	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0226400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0226400-01;protein_id=OsNip_03t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6651685	6653694	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0226600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0226600-01;protein_id=OsNip_03t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6653695	6653918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6826736	6827113	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229100-01;Tag=IsoSeq:G5133.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3089.1;prot_id "UniRef90_A0A287PEB5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	6856744	6856745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229500-01;Tag=IsoSeq:G5134.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4020.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8JUT0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	6853794	6855911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229500-01;Tag=IsoSeq:G5134.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4020.1;prot_id "UniRef90_A0A4S8JUT0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	6859922	6862489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229551-01;Name=OsNip_03t0229551-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0229551-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	6861618	6861917	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0229551-01;Parent=transcript:OsNip_03t0229551-01;protein_id=OsNip_03t0229551-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6863023	6871173	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0229575-01;Parent=gene:OsNip_03g0229575;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0229575-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6863023	6863759	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229575-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6864030	6865225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0229575-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	6948035	6950951	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0231600-01;Parent=gene:OsNip_03g0231600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0231600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	7025418	7025852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0232500-01;Name=OsNip_03t0232500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0232500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7029174	7029740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0232600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	7029174	7031611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0232600-01;Name=OsNip_03t0232600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0232600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	7029741	7031120	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0232600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0232600-01;protein_id=OsNip_03t0232600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7031121	7031611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0232600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	7043271	7046128	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0232800-01;Parent=gene:OsNip_03g0232800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0232800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7043271	7043703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0232800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7231158	7231777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0237100-02;Tag=IsoSeq:G5161.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3111.4;prot_id "UniRef90_A0A287IJX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	7235667	7235667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t023724A-01;Tag=IsoSeq:G5162.1;Source=Nipponbare.panicle_G4040.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7235046	7235400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t023724A-01;Tag=IsoSeq:G5162.1;Source=Nipponbare.panicle_G4040.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	7237162	7241445	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0237250-01;Parent=gene:OsNip_03g0237250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0237250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7237162	7237315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0237250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	7237162	7237985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0237250-01;Name=OsNip_03t0237250-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0237250-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	7237316	7237985	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0237250-01;Parent=transcript:OsNip_03t0237250-01;protein_id=OsNip_03t0237250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	7240453	7240921	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0237250-01;Parent=transcript:OsNip_03t0237250-01;protein_id=OsNip_03t0237250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	7707960	7708025	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0246100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0246100-01;protein_id=OsNip_03t0246100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7916038	7916074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	7917764	7918248	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0250000-03;Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;protein_id=OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	CDS	7915998	7916031	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0250000-03;Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;protein_id=OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	7915402	7915620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Name=OsNip_03t0250000-03;exon_id=OsNip_03t0250000-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	exon	7914619	7915088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Name=OsNip_03t0250000-03;exon_id=OsNip_03t0250000-03-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7915735	7915995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7915402	7915620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7915171	7915299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	7914619	7915088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250000-03;Tag=IsoSeq:G5213.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2386.2,Nipponbare.root_G3145.1,Nipponbare.panicle_G4083.2;prot_id "UniRef90_A0A2T7C8S3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	7929012	7933985	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0250200-01;Parent=gene:OsNip_03g0250200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0250200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	7929012	7929607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250200-01;Name=OsNip_03t0250200-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0250200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7929012	7929607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7929669	7931729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	7929669	7932230	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0250200-01;Name=OsNip_03t0250200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0250200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	7931730	7932230	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0250200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0250200-01;protein_id=OsNip_03t0250200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8167277	8167443	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0254700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0254700-02;protein_id=OsNip_03t0254700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8167519	8167707	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0254700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0254700-02;protein_id=OsNip_03t0254700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	8219433	8219601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255500-03;Tag=IsoSeq:G5235.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4100.2;prot_id "UniRef90_A0A1B1UZZ3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	8218898	8219329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255500-03;Tag=IsoSeq:G5235.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4100.2;prot_id "UniRef90_A0A1B1UZZ3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8241532	8241711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8241532	8242113	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255900-01;Name=OsNip_03t0255900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0255900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8241712	8242008	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0255900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0255900-01;protein_id=OsNip_03t0255900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8242009	8242113	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	8241573	8242000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0255900-02;Tag=IsoSeq:G5236.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3157.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7CEW3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	8437361	8437649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;Name=OsNip_03t0260100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0260100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	8440206	8440447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;Name=OsNip_03t0260100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0260100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8440206	8440447	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0260100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;protein_id=OsNip_03t0260100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8441576	8441846	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0260100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;protein_id=OsNip_03t0260100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8441576	8441906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;Name=OsNip_03t0260100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0260100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8441847	8441906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	8437371	8441908	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0260100-02;Parent=gene:OsNip_03g0260100;transcript_id=OsNip_03t0260100-02;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1
Chr03	TAMA	exon	8441576	8441908	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-02;Name=OsNip_03t0260100-02;exon_id=OsNip_03t0260100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1;prot_id "UniRef90_A0A3S3MVL7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	8441576	8441907	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0260100-02;Parent=transcript:OsNip_03t0260100-02;protein_id=OsNip_03t0260100-02;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1;prot_id "UniRef90_A0A3S3MVL7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	8440206	8440447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-02;Name=OsNip_03t0260100-02;exon_id=OsNip_03t0260100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1;prot_id "UniRef90_A0A3S3MVL7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	8440441	8440447	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0260100-02;Parent=transcript:OsNip_03t0260100-02;protein_id=OsNip_03t0260100-02;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1;prot_id "UniRef90_A0A3S3MVL7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	8437729	8439249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0260100-02;Name=OsNip_03t0260100-02;exon_id=OsNip_03t0260100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5248.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3166.2,Nipponbare.panicle_G4110.1;prot_id "UniRef90_A0A3S3MVL7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	8670753	8671096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0263700-02;Tag=IsoSeq:G5260.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4120.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FGJ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8676353	8676510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0263800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8679164	8679339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0263900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8679164	8682334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0263900-01;Name=OsNip_03t0263900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0263900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8679340	8681886	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0263900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0263900-01;protein_id=OsNip_03t0263900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8681887	8682334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0263900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	8679830	8680692	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0263950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	8789242	8790378	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0265900-01;Parent=gene:OsNip_03g0265900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0265900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	8789645	8789785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0265900-01;Name=OsNip_03t0265900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0265900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8837183	8838046	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8838551	8841204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	8837821	8838527	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0267200-01;Parent=gene:OsNip_03g0267200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8837821	8838030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8837821	8838527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267200-01;Name=OsNip_03t0267200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0267200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	8838031	8838510	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0267200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0267200-01;protein_id=OsNip_03t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8838511	8838527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	8841305	8843028	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0267300;Name=OsNip_CFR;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	8841311	8843013	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0267300-02;Parent=gene:OsNip_03g0267300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0267300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8841311	8841502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267300-02;Name=OsNip_03t0267300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0267300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	8853502	8853978	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0267550-00;Parent=gene:OsNip_03g0267550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0267550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	8853502	8853978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267550-00;Name=OsNip_03t0267550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0267550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8870459	8870801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0267850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	8889180	8889515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0268050-00;Name=OsNip_03t0268050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0268050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	9076047	9076347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0271400-02;Tag=IsoSeq:G5305.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4158.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9079675	9079992	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0271500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0271500-01;protein_id=OsNip_03t0271500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9080101	9080235	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0271500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0271500-01;protein_id=OsNip_03t0271500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9080101	9080249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0271500-01;Name=OsNip_03t0271500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0271500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	9143252	9143528	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0272400-01;Name=OsNip_03t0272400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0272400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9329468	9329501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0275950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9332756	9333176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0275950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9333267	9334857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0275950-00;Name=OsNip_03t0275950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0275950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9333267	9334857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0275950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	gene	9347325	9347776	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g027629A;Tag=IsoSeq:G5318
Chr03	TAMA	mRNA	9347325	9347776	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t027629A-01;Parent=gene:OsNip_03g027629A;transcript_id=OsNip_03t027629A-01;Tag=IsoSeq:G5318.1;Source=Nipponbare.panicle_G4170.1
Chr03	TAMA	exon	9347325	9347776	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t027629A-01;Name=OsNip_03t027629A-01-E1;exon_id=OsNip_03t027629A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5318.1;Source=Nipponbare.panicle_G4170.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0APA3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	9347576	9347776	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t027629A-01;Parent=transcript:OsNip_03t027629A-01;protein_id=OsNip_03t027629A-01;Tag=IsoSeq:G5318.1;Source=Nipponbare.panicle_G4170.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0APA3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	9347325	9347573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t027629A-01;Tag=IsoSeq:G5318.1;Source=Nipponbare.panicle_G4170.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0APA3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	9359575	9359994	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0276300;Name=OsNip_Dof14;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	9359575	9359994	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0276300-00;Parent=gene:OsNip_03g0276300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0276300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9359575	9359993	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0276300-00;Parent=transcript:OsNip_03t0276300-00;protein_id=OsNip_03t0276300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9359575	9359994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0276300-00;Name=OsNip_03t0276300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0276300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9359994	9359994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0276300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	9370160	9373089	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0276500;Name=OsNip_Hsp71.1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	9370160	9373067	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0276500-01;Parent=gene:OsNip_03g0276500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9370160	9370272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9370160	9370486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0276500-01;Name=OsNip_03t0276500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0276500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9370273	9370486	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0276500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0276500-01;protein_id=OsNip_03t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9371144	9372882	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0276500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0276500-01;protein_id=OsNip_03t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	9447926	9448340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278200-03;Tag=IsoSeq:G5327.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3222.2,Nipponbare.panicle_G4177.1,Nipponbare.root_G3222.1;prot_id "UniRef90_M1BWT8";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	9448566	9448701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278200-03;Tag=IsoSeq:G5327.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3222.2,Nipponbare.panicle_G4177.1,Nipponbare.root_G3222.1;prot_id "UniRef90_M1BWT8";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	9446247	9447865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278250-00;Name=OsNip_03t0278250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0278250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9447956	9448032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9447956	9448379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278250-00;Name=OsNip_03t0278250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0278250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9448321	9448379	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	9449358	9452530	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0278300-04;Parent=gene:OsNip_03g0278300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0278300-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9449358	9450853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278300-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9449358	9451058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278300-04;Name=OsNip_03t0278300-04-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0278300-04-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9450854	9451058	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0278300-04;Parent=transcript:OsNip_03t0278300-04;protein_id=OsNip_03t0278300-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9451528	9451706	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0278300-04;Name=OsNip_03t0278300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0278300-02-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9617509	9617591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0281201-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9617592	9618548	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0281201-01;Parent=transcript:OsNip_03t0281201-01;protein_id=OsNip_03t0281201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9618549	9618641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0281201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	9619836	9628261	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0281300;biotype=protein_coding;description=phosphotransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	9619836	9628261	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0281300-01;Parent=gene:OsNip_03g0281300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0281300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9619836	9619989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0281300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9620574	9620644	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0281300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0281300-01;protein_id=OsNip_03t0281300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9758744	9758890	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0284000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0284000-00;protein_id=OsNip_03t0284000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9759025	9759147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0284000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0284000-00;protein_id=OsNip_03t0284000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	9756837	9759330	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0284000-01;Parent=gene:OsNip_03g0284000;transcript_id=OsNip_03t0284000-01;Tag=IsoSeq:G5353.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2465.1
Chr03	TAMA	exon	9756837	9757209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0284000-01;Name=OsNip_03t0284000-01;exon_id=OsNip_03t0284000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5353.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2465.1;prot_id "UniRef90_UPI0009E4783F";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9799297	9799617	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0284900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9847723	9847913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0285800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9847723	9848086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0285800-02;Name=OsNip_03t0285800-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0285800-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9847914	9848086	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0285800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0285800-02;protein_id=OsNip_03t0285800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9874207	9874310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0286300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0286300-01;protein_id=OsNip_03t0286300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9874480	9874708	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0286300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0286300-01;protein_id=OsNip_03t0286300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9876165	9876576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0286300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9949113	9949629	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0287800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0287800-00;protein_id=OsNip_03t0287800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	9950396	9950899	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0287800-01;Tag=IsoSeq:G5371.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3248.2;prot_id "UniRef90_A0A1D5V010";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9989751	9989846	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0288600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0288600-01;protein_id=OsNip_03t0288600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9989955	9990113	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0288600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0288600-01;protein_id=OsNip_03t0288600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9989955	9990388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0288600-01;Name=OsNip_03t0288600-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0288600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9990114	9990388	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0288600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9987338	9987338	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0288600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	9987338	9987606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0288600-02;Name=OsNip_03t0288600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0288600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	9987339	9987606	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0288600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0288600-02;protein_id=OsNip_03t0288600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10028841	10029033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0289400-00;Name=OsNip_03t0289400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0289400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10028841	10029033	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0289400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0289400-00;protein_id=OsNip_03t0289400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10043208	10044161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0289800-01;Name=OsNip_03t0289800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0289800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	10048015	10048230	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t029029A-01;Parent=transcript:OsNip_03t029029A-01;protein_id=OsNip_03t029029A-01;Tag=IsoSeq:G5382.1;Source=Nipponbare.panicle_G4221.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	10048014	10048014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t029029A-01;Tag=IsoSeq:G5382.1;Source=Nipponbare.panicle_G4221.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	10048234	10048327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t029029A-01;Tag=IsoSeq:G5382.1;Source=Nipponbare.panicle_G4221.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	10080334	10083450	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0290300;Name=OsNip_FAD7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10080334	10082679	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0290300-01;Parent=gene:OsNip_03g0290300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0290300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10080334	10080501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0290300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10080502	10080690	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0290300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0290300-01;protein_id=OsNip_03t0290300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10081791	10081871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0290300-01;Name=OsNip_03t0290300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0290300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10081973	10082158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0290300-01;Name=OsNip_03t0290300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0290300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10385107	10385460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0296700-01;Name=OsNip_03t0296700-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0296700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10385962	10387602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0296700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10386135	10386806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0296700-02;Name=OsNip_03t0296700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0296700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10419048	10419737	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0297600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0297600-01;protein_id=OsNip_03t0297600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10419738	10419833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0297600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	10419184	10419973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t029769A-01;Tag=IsoSeq:G5414.1;Source=Nipponbare.leaf_G2497.1;prot_id "UniRef90_J3LB18";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10502015	10502048	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10502015	10502200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;Name=OsNip_03t0299200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0299200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10502049	10502200	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0299200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;protein_id=OsNip_03t0299200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10502304	10503153	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0299200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;protein_id=OsNip_03t0299200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10502304	10503291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;Name=OsNip_03t0299200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0299200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10503154	10503291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	10502015	10503312	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0299200-02;Parent=gene:OsNip_03g0299200;transcript_id=OsNip_03t0299200-02;Tag=IsoSeq:G5421.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3285.3
Chr03	TAMA	exon	10502015	10503312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-02;Name=OsNip_03t0299200-02;exon_id=OsNip_03t0299200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5421.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3285.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	10502017	10503147	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0299200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0299200-02;protein_id=OsNip_03t0299200-02;Tag=IsoSeq:G5421.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3285.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	10502015	10502016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-02;Tag=IsoSeq:G5421.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3285.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	10503151	10503312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299200-02;Tag=IsoSeq:G5421.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3285.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	10502301	10503064	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0299400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10502301	10503064	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0299400-00;Parent=gene:OsNip_03g0299400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0299400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10502301	10502714	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0299400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0299400-00;protein_id=OsNip_03t0299400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10502301	10502909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299400-00;Name=OsNip_03t0299400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0299400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	10517166	10517664	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299600-02;Tag=IsoSeq:G5422.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3286.7;prot_id "UniRef90_A0A287P438";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10519860	10520192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	10525760	10531373	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0299800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10525760	10527995	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0299800-02;Parent=gene:OsNip_03g0299800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0299800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10525760	10526229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10525760	10527995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-02;Name=OsNip_03t0299800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0299800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10527994	10527995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10526047	10526229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10526047	10528041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-03;Name=OsNip_03t0299800-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0299800-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10526230	10528041	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0299800-03;Parent=transcript:OsNip_03t0299800-03;protein_id=OsNip_03t0299800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10531003	10531296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-03;Name=OsNip_03t0299800-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0299800-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10531024	10531296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10526047	10526229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10531024	10531373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0299800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10615272	10615583	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0301500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0301500-00;protein_id=OsNip_03t0301500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	10615819	10619334	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0301550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10615819	10619334	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0301550-01;Parent=gene:OsNip_03g0301550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0301550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10615819	10617138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0301550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10615819	10619334	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0301550-01;Name=OsNip_03t0301550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0301550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10672648	10672736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302700-02;Name=OsNip_03t0302700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0302700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10677857	10678234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302850-00;Name=OsNip_03t0302850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0302850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10677857	10678234	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0302850-00;Parent=transcript:OsNip_03t0302850-00;protein_id=OsNip_03t0302850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10684315	10684490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10684635	10684755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10684635	10684891	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Name=OsNip_03t0302900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0302900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10684756	10684891	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0302900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;protein_id=OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10684980	10685038	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0302900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;protein_id=OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10685140	10686915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Name=OsNip_03t0302900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0302900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10685140	10686915	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0302900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;protein_id=OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10687696	10687840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Name=OsNip_03t0302900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0302900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10687696	10687840	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0302900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;protein_id=OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10687931	10688649	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0302900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;protein_id=OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10687931	10688768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Name=OsNip_03t0302900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0302900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10688650	10688768	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	10688522	10688839	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0302900-02;Parent=gene:OsNip_03g0302900;transcript_id=OsNip_03t0302900-02;Tag=IsoSeq:G5444.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3302.1
Chr03	TAMA	exon	10688522	10688839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-02;Name=OsNip_03t0302900-02;exon_id=OsNip_03t0302900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5444.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3302.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	10688524	10688643	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0302900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0302900-02;protein_id=OsNip_03t0302900-02;Tag=IsoSeq:G5444.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3302.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	10688522	10688523	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-02;Tag=IsoSeq:G5444.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3302.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	10688647	10688839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0302900-02;Tag=IsoSeq:G5444.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3302.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	10692333	10693906	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0303100;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10692333	10693906	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0303100-01;Parent=gene:OsNip_03g0303100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0303100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10692333	10692407	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0303100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10692333	10693906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0303100-01;Name=OsNip_03t0303100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0303100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	10804094	10804361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0304800-01;Name=OsNip_03t0304800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0304800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10832122	10832340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0305200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	10839459	10840785	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0305400-01;Parent=gene:OsNip_03g0305400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0305400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10839459	10839835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0305400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	10840055	10840206	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0305400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0305400-01;protein_id=OsNip_03t0305400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	10840295	10840401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0305400-01;Name=OsNip_03t0305400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0305400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	11372818	11372819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t031689A-03;Tag=IsoSeq:G5491.3;Source=Nipponbare.panicle_G4307.3,Nipponbare.root_G3332.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	11375503	11376925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t031689A-03;Tag=IsoSeq:G5491.3;Source=Nipponbare.panicle_G4307.3,Nipponbare.root_G3332.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11395982	11396070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0316900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11522811	11522886	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0319300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0319300-01;protein_id=OsNip_03t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11523717	11524090	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0319300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0319300-01;protein_id=OsNip_03t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11523717	11524356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0319300-01;Name=OsNip_03t0319300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0319300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11524091	11524356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0319300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	11522678	11524442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0319300-02;Name=OsNip_03t0319300-02;exon_id=OsNip_03t0319300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5499.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3337.6;prot_id "UniRef90_P17928";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	11522678	11522679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0319300-02;Tag=IsoSeq:G5499.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3337.6;prot_id "UniRef90_P17928";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	11523028	11524442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0319300-02;Tag=IsoSeq:G5499.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3337.6;prot_id "UniRef90_P17928";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	11526273	11531969	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0319400;Name=CK1;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	11526273	11530306	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0319400-01;Parent=gene:OsNip_03g0319400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0319400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	11661413	11663363	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0322000-01;Tag=IsoSeq:G5512.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4324.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6RA95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	11679555	11679711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0322600-01;Name=OsNip_03t0322600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0322600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	11679897	11680129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0322600-01;Name=OsNip_03t0322600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0322600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	11753155	11753399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0323900-01;Name=OsNip_03t0323900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0323900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	11753066	11753824	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0323950-00;Parent=gene:OsNip_03g0323950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0323950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11753066	11753824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0323950-00;Name=OsNip_03t0323950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0323950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	11769398	11769651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-01;Name=OsNip_03t0324200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0324200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11769398	11769651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11771176	11771257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11771176	11773492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-01;Name=OsNip_03t0324200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0324200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11773193	11773492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	11769669	11772658	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0324200-02;Parent=gene:OsNip_03g0324200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0324200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11769669	11771257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11771258	11772658	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0324200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0324200-02;protein_id=OsNip_03t0324200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	11774230	11778954	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0324300;Name=EIL1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	11774230	11778272	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0324300-02;Parent=gene:OsNip_03g0324300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0324300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11774230	11774476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11776083	11778008	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0324300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0324300-02;protein_id=OsNip_03t0324300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11778009	11778272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	11774347	11778954	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0324300-03;Parent=gene:OsNip_03g0324300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11774347	11774476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Name=OsNip_03t0324300-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0324300-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11774347	11774476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11776001	11776082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11776001	11777501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Name=OsNip_03t0324300-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0324300-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11776083	11777501	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0324300-03;Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;protein_id=OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11777841	11778008	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0324300-03;Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;protein_id=OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	11777841	11778954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Name=OsNip_03t0324300-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0324300-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11778009	11778954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11816467	11816704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	11817027	11818149	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324900-01;Name=OsNip_03t0324900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0324900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	11817075	11818037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0324900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0324900-01;protein_id=OsNip_03t0324900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11818038	11818149	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0324900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	11819962	11822946	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0325000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12357266	12358120	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0334250-00;Parent=transcript:OsNip_03t0334250-00;protein_id=OsNip_03t0334250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12358121	12358145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	12359258	12360010	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0334300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12359258	12360010	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0334300-00;Parent=gene:OsNip_03g0334300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0334300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12359258	12360010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334300-00;Name=OsNip_03t0334300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0334300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12359258	12360010	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0334300-00;Parent=transcript:OsNip_03t0334300-00;protein_id=OsNip_03t0334300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	gene	12361722	12362489	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g033469A;Tag=IsoSeq:G5558
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Chr03	TAMA	exon	12361722	12362489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469A-01;Name=OsNip_03t033469A-01-E1;exon_id=OsNip_03t033469A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5558.1;Source=Nipponbare.leaf_G2564.1,Nipponbare.panicle_G4363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	12361933	12362166	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t033469A-01;Parent=transcript:OsNip_03t033469A-01;protein_id=OsNip_03t033469A-01;Tag=IsoSeq:G5558.1;Source=Nipponbare.leaf_G2564.1,Nipponbare.panicle_G4363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	12362167	12362489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469A-01;Tag=IsoSeq:G5558.1;Source=Nipponbare.leaf_G2564.1,Nipponbare.panicle_G4363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	12361722	12361930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469A-01;Tag=IsoSeq:G5558.1;Source=Nipponbare.leaf_G2564.1,Nipponbare.panicle_G4363.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	gene	12366082	12367495	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g033469B;Tag=IsoSeq:G5559
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Chr03	TAMA	exon	12366082	12367476	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-01;Name=OsNip_03t033469B-01-E1;exon_id=OsNip_03t033469B-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5559.1;Source=Nipponbare.leaf_G2565.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	12367495	12367495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-02;Tag=IsoSeq:G5559.2;Source=Nipponbare.leaf_G2565.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	mRNA	12366331	12367469	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t033469B-03;Parent=gene:OsNip_03g033469B;transcript_id=OsNip_03t033469B-03;Tag=IsoSeq:G5559.3;Source=Nipponbare.leaf_G2565.3
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Chr03	TAMA	CDS	12367279	12367467	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t033469B-03;Parent=transcript:OsNip_03t033469B-03;protein_id=OsNip_03t033469B-03;Tag=IsoSeq:G5559.3;Source=Nipponbare.leaf_G2565.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	12367468	12367469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-03;Tag=IsoSeq:G5559.3;Source=Nipponbare.leaf_G2565.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	12366331	12367276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-03;Tag=IsoSeq:G5559.3;Source=Nipponbare.leaf_G2565.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	mRNA	12366361	12367482	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t033469B-04;Parent=gene:OsNip_03g033469B;transcript_id=OsNip_03t033469B-04;Tag=IsoSeq:G5559.4;Source=Nipponbare.leaf_G2565.4
Chr03	TAMA	exon	12366361	12367482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-04;Name=OsNip_03t033469B-04-E1;exon_id=OsNip_03t033469B-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5559.4;Source=Nipponbare.leaf_G2565.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	12367279	12367482	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t033469B-04;Parent=transcript:OsNip_03t033469B-04;protein_id=OsNip_03t033469B-04;Tag=IsoSeq:G5559.4;Source=Nipponbare.leaf_G2565.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	12366361	12367276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t033469B-04;Tag=IsoSeq:G5559.4;Source=Nipponbare.leaf_G2565.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	12373338	12380292	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0334700;Name=osALA1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12375718	12380262	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0334700-01;Parent=gene:OsNip_03g0334700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0334700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12375718	12375718	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12375718	12376082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;Name=OsNip_03t0334700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0334700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12375719	12376082	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0334700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;protein_id=OsNip_03t0334700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12376355	12376685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;Name=OsNip_03t0334700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0334700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12376355	12376685	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0334700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;protein_id=OsNip_03t0334700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12376824	12377679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;Name=OsNip_03t0334700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0334700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12376824	12377679	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0334700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0334700-01;protein_id=OsNip_03t0334700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12528485	12528893	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0337500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0337500-00;protein_id=OsNip_03t0337500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12632577	12633932	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0339900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0339900-01;protein_id=OsNip_03t0339900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12633933	12634277	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12634996	12635182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-01;Name=OsNip_03t0339900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0339900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12634996	12635182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	12631452	12635177	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0339900-02;Parent=gene:OsNip_03g0339900;transcript_id=OsNip_03t0339900-02;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2
Chr03	TAMA	exon	12634996	12635177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Name=OsNip_03t0339900-02;exon_id=OsNip_03t0339900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	CDS	12634996	12635175	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0339900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;protein_id=OsNip_03t0339900-02;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	exon	12632618	12634277	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Name=OsNip_03t0339900-02;exon_id=OsNip_03t0339900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	exon	12631452	12631662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Name=OsNip_03t0339900-02;exon_id=OsNip_03t0339900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	12635176	12635177	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	12632618	12634275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	12631452	12631662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0339900-02;Tag=IsoSeq:G5580.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2573.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DCX4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	12643069	12646793	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0340001;biotype=protein_coding;description=Uroporphyrinogen;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12643071	12646793	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0340001-01;Parent=gene:OsNip_03g0340001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0340001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12643071	12644076	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0340001-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12643071	12644130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0340001-01;Name=OsNip_03t0340001-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0340001-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	12645460	12645648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0340001-01;Name=OsNip_03t0340001-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0340001-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12668813	12669664	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0340300-01;Parent=gene:OsNip_03g0340300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0340300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12715987	12718369	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0341100-01;Parent=gene:OsNip_03g0341100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0341100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12739354	12739431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0341600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12786599	12786708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0343225-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12809319	12809726	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0343800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0343800-00;protein_id=OsNip_03t0343800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12809727	12809783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0343800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	12812218	12812882	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0343900;Name=PsbX;biotype=protein_coding;description=Photosystem;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12812218	12812882	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0343900-01;Parent=gene:OsNip_03g0343900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0343900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	12812218	12812882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0343900-01;Name=OsNip_03t0343900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0343900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12812678	12812882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0343900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	12814604	12819290	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0344100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	12814604	12819271	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0344100-01;Parent=gene:OsNip_03g0344100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12814604	12814728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;Name=OsNip_03t0344100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0344100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12814604	12814728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12815492	12815557	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;protein_id=OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12815673	12815747	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;protein_id=OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	12817235	12817291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;Name=OsNip_03t0344100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0344100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12817235	12817291	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;protein_id=OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	12817375	12817460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;Name=OsNip_03t0344100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0344100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	12817375	12817460	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0344100-01;protein_id=OsNip_03t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	12823607	12824251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0344300-02;Name=OsNip_03t0344300-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0344300-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	12907100	12907324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0345700-02;Tag=IsoSeq:G5601.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4395.3,Nipponbare.root_G3397.2,Nipponbare.root_G3397.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9JQL5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	13127083	13127217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0350100-02;Name=OsNip_03t0350100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0350100-01-E9;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	13167198	13167327	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0351400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0351400-01;protein_id=OsNip_03t0351400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	13167427	13167538	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0351400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0351400-01;protein_id=OsNip_03t0351400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	13167427	13167540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0351400-01;Name=OsNip_03t0351400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0351400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13167539	13167540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0351400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	13164556	13169185	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0351400-02;Parent=gene:OsNip_03g0351400;transcript_id=OsNip_03t0351400-02;Tag=IsoSeq:G5616.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3404.1,Nipponbare.panicle_G4406.1
Chr03	TAMA	exon	13168621	13169185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0351400-02;Name=OsNip_03t0351400-02;exon_id=OsNip_03t0351400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5616.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3404.1,Nipponbare.panicle_G4406.1;prot_id "UniRef90_A0A200QX79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	CDS	13168826	13169185	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0351400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0351400-02;protein_id=OsNip_03t0351400-02;Tag=IsoSeq:G5616.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3404.1,Nipponbare.panicle_G4406.1;prot_id "UniRef90_A0A200QX79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	13283541	13283879	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0353400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0353400-02;protein_id=OsNip_03t0353400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13283880	13284511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0353400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	13283226	13284502	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0353400-03;Parent=gene:OsNip_03g0353400;transcript_id=OsNip_03t0353400-03;Tag=IsoSeq:G5625.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2596.2,Nipponbare.root_G3410.4,Nipponbare.panicle_G4415.2,Nipponbare.root_G3410.8
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13574903	13575805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0355300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	13575806	13577233	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0355300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0355300-01;protein_id=OsNip_03t0355300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13586816	13587101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0355600-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	13586816	13587398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0355600-04;Name=OsNip_03t0355600-04-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0355600-04-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13586838	13587101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0355600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	13860387	13860530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0358000-00;Name=OsNip_03t0358000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0358000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	13860387	13860530	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0358000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0358000-00;protein_id=OsNip_03t0358000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	13841131	13860864	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0358000-01;Parent=gene:OsNip_03g0358000;transcript_id=OsNip_03t0358000-01;Tag=IsoSeq:G5641.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3419.1,Nipponbare.panicle_G4430.1
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14233970	14234038	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0364700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;protein_id=OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14234117	14234203	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0364700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;protein_id=OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14234117	14234394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	14234498	14234619	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14234498	14234619	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14234778	14234805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14234778	14234805	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14234891	14235225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14234891	14235225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14235318	14235417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14235318	14235417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14235598	14236034	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Name=OsNip_03t0364700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0364700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14235598	14236034	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	14233413	14236035	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0364700-02;Parent=gene:OsNip_03g0364700;transcript_id=OsNip_03t0364700-02;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1
Chr03	TAMA	exon	14233413	14233877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;Name=OsNip_03t0364700-02;exon_id=OsNip_03t0364700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	14233413	14233877	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0364700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;protein_id=OsNip_03t0364700-02;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	14233970	14234038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;Name=OsNip_03t0364700-02;exon_id=OsNip_03t0364700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	14233970	14234038	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0364700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;protein_id=OsNip_03t0364700-02;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	14234117	14234199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;Name=OsNip_03t0364700-02;exon_id=OsNip_03t0364700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	14234117	14234199	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0364700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0364700-02;protein_id=OsNip_03t0364700-02;Tag=IsoSeq:G5661.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4450.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14262233	14262284	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0365200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0365200-01;protein_id=OsNip_03t0365200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	14262375	14264654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0365200-01;Name=OsNip_03t0365200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0365200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14264182	14264702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0365250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14264182	14265684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0365250-01;Name=OsNip_03t0365250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0365250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14298449	14298670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0366000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14431771	14431997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0367900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	14545985	14547346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0370500-03;Name=OsNip_03t0370500-03;exon_id=OsNip_03t0370500-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5678.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3442.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	14545985	14546624	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0370500-03;Parent=transcript:OsNip_03t0370500-03;protein_id=OsNip_03t0370500-03;Tag=IsoSeq:G5678.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3442.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	14545733	14545733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0370500-03;Tag=IsoSeq:G5678.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3442.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	14546628	14547346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0370500-03;Tag=IsoSeq:G5678.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3442.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	14548912	14549608	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0370600-00;Parent=gene:OsNip_03g0370600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0370600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14555233	14555611	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0370900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0370900-01;protein_id=OsNip_03t0370900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14555798	14556229	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0370900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0370900-01;protein_id=OsNip_03t0370900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14555798	14556433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0370900-01;Name=OsNip_03t0370900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0370900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14556230	14556433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0370900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14578942	14579140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0371600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	14598168	14599574	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0371800-00;Parent=gene:OsNip_03g0371800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0371800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14683357	14683611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0372950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14683903	14683904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0372950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14690359	14690552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14690359	14691910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373100-01;Name=OsNip_03t0373100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0373100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14691834	14691910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	14698096	14698884	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0373300;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	14698096	14698884	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0373300-01;Parent=gene:OsNip_03g0373300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0373300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14698096	14698453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14698096	14698884	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373300-01;Name=OsNip_03t0373300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0373300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14698454	14698813	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0373300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0373300-01;protein_id=OsNip_03t0373300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14698814	14698884	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	14701314	14705044	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0373500-01;Parent=gene:OsNip_03g0373500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14701314	14701314	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14701315	14701610	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0373500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;protein_id=OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14702886	14702907	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0373500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;protein_id=OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14702886	14702979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;Name=OsNip_03t0373500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0373500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14702908	14702979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	14704407	14705044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;Name=OsNip_03t0373500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0373500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14704407	14705044	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0373500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	14784760	14785731	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0374901-00;Name=OsNip_03t0374901-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0374901-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	14784720	14785712	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0374900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0374900-00;protein_id=OsNip_03t0374900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15224279	15224371	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0383900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	15383276	15384276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0386500-01;Name=OsNip_03t0386500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0386500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	15381798	15382198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;Name=OsNip_03t0386500-02;exon_id=OsNip_03t0386500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	exon	15382325	15382465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;Name=OsNip_03t0386500-02;exon_id=OsNip_03t0386500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	CDS	15382659	15382730	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0386500-02;Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;protein_id=OsNip_03t0386500-02;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	CDS	15383056	15383163	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0386500-02;Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;protein_id=OsNip_03t0386500-02;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	15381798	15381799	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	15383167	15384237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0386500-02;Tag=IsoSeq:G5708.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3459.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	15389893	15404527	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0386600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15491716	15491826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0388366-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	15499421	15499571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0388432-00;Name=OsNip_03t0388432-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0388432-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	15498674	15507731	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0388500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	15505524	15507726	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0388500-01;Parent=gene:OsNip_03g0388500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0388500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	15505524	15506089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0388500-01;Name=OsNip_03t0388500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0388500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	15505526	15506089	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0388500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0388500-01;protein_id=OsNip_03t0388500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	15506638	15506967	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0388500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0388500-01;protein_id=OsNip_03t0388500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	15506638	15507726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0388500-01;Name=OsNip_03t0388500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0388500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15506968	15507726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0388500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	15498674	15507731	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0388500-02;Parent=gene:OsNip_03g0388500;transcript_id=OsNip_03t0388500-02;Tag=IsoSeq:G5714.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3464.1
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16246825	16247262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16250380	16250620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16250621	16250846	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0400700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0400700-01;protein_id=OsNip_03t0400700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	16251446	16251580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-01;Name=OsNip_03t0400700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0400700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16251484	16251580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	16250372	16251585	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0400700-02;Parent=gene:OsNip_03g0400700;transcript_id=OsNip_03t0400700-02;Tag=IsoSeq:G5751.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4522.1
Chr03	TAMA	exon	16250372	16251585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-02;Name=OsNip_03t0400700-02;exon_id=OsNip_03t0400700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5751.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4522.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7F7X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	16251351	16251584	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0400700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0400700-02;protein_id=OsNip_03t0400700-02;Tag=IsoSeq:G5751.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4522.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7F7X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	16251585	16251585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-02;Tag=IsoSeq:G5751.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4522.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7F7X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	16250372	16251348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400700-02;Tag=IsoSeq:G5751.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4522.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7F7X9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	16259903	16261152	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0400901;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	16259903	16261152	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0400901-00;Parent=gene:OsNip_03g0400901;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0400901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16259903	16259907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	16259903	16261152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400901-00;Name=OsNip_03t0400901-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0400901-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16259908	16261152	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0400901-00;Parent=transcript:OsNip_03t0400901-00;protein_id=OsNip_03t0400901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	16262868	16265236	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0400800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	16262868	16265236	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0400800-00;Parent=gene:OsNip_03g0400800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0400800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	16262868	16265077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400800-00;Name=OsNip_03t0400800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0400800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16262868	16265077	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0400800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0400800-00;protein_id=OsNip_03t0400800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	16265185	16265236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0400800-00;Name=OsNip_03t0400800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0400800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16451701	16451763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0403400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	16457621	16459112	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0403501;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16458062	16459112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0403501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	16457908	16459449	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0403600-01;Parent=gene:OsNip_03g0403600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0403600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16457908	16457909	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0403600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	16457908	16459449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0403600-01;Name=OsNip_03t0403600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0403600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	16577189	16577257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0405000-01;Name=OsNip_03t0405000-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0405000-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16577189	16577257	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0405000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0405000-01;protein_id=OsNip_03t0405000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16577351	16577493	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0405000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0405000-01;protein_id=OsNip_03t0405000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	16577351	16577673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0405000-01;Name=OsNip_03t0405000-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0405000-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16577494	16577673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0405000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	16572094	16572308	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0405000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0405000-02;protein_id=OsNip_03t0405000-02;Tag=IsoSeq:G5760.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4529.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9MDX4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16654335	16654454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0406200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16655193	16655278	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0406200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0406200-01;protein_id=OsNip_03t0406200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16656878	16657039	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0406200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0406200-01;protein_id=OsNip_03t0406200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	16657923	16657924	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0406200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0406200-01;protein_id=OsNip_03t0406200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	16836779	16838029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0409100-04;Tag=IsoSeq:G5771.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3497.2;prot_id "UniRef90_Q10ND5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	17252230	17253187	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0415750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17252854	17253072	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0415750-01;Parent=transcript:OsNip_03t0415750-01;protein_id=OsNip_03t0415750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17253073	17253187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0415750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	gene	17258619	17259320	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g041619A;Tag=IsoSeq:G5790
Chr03	TAMA	mRNA	17258619	17259320	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t041619A-01;Parent=gene:OsNip_03g041619A;transcript_id=OsNip_03t041619A-01;Tag=IsoSeq:G5790.1;Source=Nipponbare.panicle_G4552.1
Chr03	TAMA	exon	17258619	17259320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t041619A-01;Name=OsNip_03t041619A-01-E1;exon_id=OsNip_03t041619A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5790.1;Source=Nipponbare.panicle_G4552.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	17258621	17258782	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t041619A-01;Parent=transcript:OsNip_03t041619A-01;protein_id=OsNip_03t041619A-01;Tag=IsoSeq:G5790.1;Source=Nipponbare.panicle_G4552.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	17258619	17258620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t041619A-01;Tag=IsoSeq:G5790.1;Source=Nipponbare.panicle_G4552.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	17258786	17259320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t041619A-01;Tag=IsoSeq:G5790.1;Source=Nipponbare.panicle_G4552.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9V4J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	17260407	17262436	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0416200;Name=BC1;biotype=protein_coding;description=BRITTLE;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	17260407	17262436	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0416200-01;Parent=gene:OsNip_03g0416200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17260407	17260500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17260407	17260561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;Name=OsNip_03t0416200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0416200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17260501	17260561	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0416200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;protein_id=OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17260656	17261714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;Name=OsNip_03t0416200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0416200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17260656	17261714	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0416200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;protein_id=OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17261821	17262107	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0416200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;protein_id=OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17261821	17262436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;Name=OsNip_03t0416200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0416200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17262108	17262436	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	17260437	17262351	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0416200-02;Parent=gene:OsNip_03g0416200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0416200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17260437	17260500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17287288	17287294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	17288084	17292842	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0416500-01;Parent=gene:OsNip_03g0416500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17288084	17288360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17449756	17450254	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0419100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0419100-01;protein_id=OsNip_03t0419100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17452046	17452470	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0419100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0419100-01;protein_id=OsNip_03t0419100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17452046	17452606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0419100-01;Name=OsNip_03t0419100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0419100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17452471	17452606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0419100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17449480	17449755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0419100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17616562	17616738	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0423200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0423200-01;protein_id=OsNip_03t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17616739	17616740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	17616236	17616738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;Name=OsNip_03t0423200-02;exon_id=OsNip_03t0423200-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	17616641	17616738	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0423200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;protein_id=OsNip_03t0423200-02;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	17619047	17619248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	17617262	17617411	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	17617151	17617173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	17616236	17616638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423200-02;Tag=IsoSeq:G5804.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3516.1,Nipponbare.panicle_G4563.1,Nipponbare.leaf_G2667.1;prot_id "UniRef90_A0A0B0PIX5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17623509	17623736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17623509	17624847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;Name=OsNip_03t0423300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0423300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17623737	17624847	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0423300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;protein_id=OsNip_03t0423300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17624929	17625074	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0423300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;protein_id=OsNip_03t0423300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17624929	17625094	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;Name=OsNip_03t0423300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0423300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17625075	17625094	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	17623511	17625093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-02;Name=OsNip_03t0423300-02;exon_id=OsNip_03t0423300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5805.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4564.5;prot_id "UniRef90_A0A0D3GXA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	17624903	17625091	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0423300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0423300-02;protein_id=OsNip_03t0423300-02;Tag=IsoSeq:G5805.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4564.5;prot_id "UniRef90_A0A0D3GXA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	17625092	17625093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-02;Tag=IsoSeq:G5805.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4564.5;prot_id "UniRef90_A0A0D3GXA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	17623511	17624900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423300-02;Tag=IsoSeq:G5805.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4564.5;prot_id "UniRef90_A0A0D3GXA1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	17669044	17674040	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0423800;Name=OsNip_Med8_1;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	17669057	17674040	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0423800-01;Parent=gene:OsNip_03g0423800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0423800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17669057	17669227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17669057	17669451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;Name=OsNip_03t0423800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0423800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17669228	17669451	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0423800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;protein_id=OsNip_03t0423800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17669575	17669699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;Name=OsNip_03t0423800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0423800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	17669575	17669699	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0423800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;protein_id=OsNip_03t0423800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	17670477	17670601	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0423800-01;Name=OsNip_03t0423800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0423800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	17985619	17998387	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0429800-01;Parent=gene:OsNip_03g0429800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0429800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18598318	18598590	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0439800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	18647500	18647607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0441000-01;Name=OsNip_03t0441000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0441000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18647536	18647607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0441000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	18768610	18769745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0442800-01;Name=OsNip_03t0442800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0442800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	18769837	18770180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0442800-01;Name=OsNip_03t0442800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0442800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	18769870	18770178	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0442800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0442800-01;protein_id=OsNip_03t0442800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	18890447	18890595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0444900-00;Name=OsNip_03t0444900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0444900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	18890447	18890595	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0444900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0444900-00;protein_id=OsNip_03t0444900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	18882351	18893244	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0444900-01;Parent=gene:OsNip_03g0444900;transcript_id=OsNip_03t0444900-01;Tag=IsoSeq:G5849.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4601.1
Chr03	TAMA	exon	18882351	18882791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0444900-01;Name=OsNip_03t0444900-01;exon_id=OsNip_03t0444900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5849.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4601.1;prot_id "UniRef90_A0A317YEP5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	exon	18892708	18893244	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0444900-01;Name=OsNip_03t0444900-01;exon_id=OsNip_03t0444900-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G5849.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4601.1;prot_id "UniRef90_A0A317YEP5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	18892708	18893244	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0444900-01;Tag=IsoSeq:G5849.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4601.1;prot_id "UniRef90_A0A317YEP5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	18935194	18936295	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0445700-01;Parent=gene:OsNip_03g0445700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0445700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18935194	18935475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0445700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	18935194	18935906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0445700-01;Name=OsNip_03t0445700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0445700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	19362668	19363800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t045229A-01;Tag=IsoSeq:G5853.1;Source=Nipponbare.panicle_G4603.1;prot_id "UniRef90_B9F989";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19413119	19413279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19413119	19413529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;Name=OsNip_03t0452300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0452300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19413280	19413529	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0452300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;protein_id=OsNip_03t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19416308	19417038	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0452300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;protein_id=OsNip_03t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19416308	19417098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;Name=OsNip_03t0452300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0452300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19417039	19417098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	19413235	19413532	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0452801-00;Name=OsNip_03t0452801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0452801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	19423584	19428439	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0453301;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	19423584	19428439	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0453301-01;Parent=gene:OsNip_03g0453301;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0453301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19423584	19427754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0453301-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19423584	19428439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0453301-01;Name=OsNip_03t0453301-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0453301-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	19531322	19531652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0454300-02;Name=OsNip_03t0454300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0454300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	19528082	19528546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0454300-03;Name=OsNip_03t0454300-03;exon_id=OsNip_03t0454300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5857.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4606.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NX48";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19746654	19746906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0557900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	19865379	19867221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t055839A-01;Name=OsNip_03t055839A-01-E1;exon_id=OsNip_03t055839A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5858.1;Source=Nipponbare.panicle_G4607.1;prot_id "UniRef90_Q8H8R2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	19867031	19867219	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t055839A-01;Parent=transcript:OsNip_03t055839A-01;protein_id=OsNip_03t055839A-01;Tag=IsoSeq:G5858.1;Source=Nipponbare.panicle_G4607.1;prot_id "UniRef90_Q8H8R2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	19867220	19867221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t055839A-01;Tag=IsoSeq:G5858.1;Source=Nipponbare.panicle_G4607.1;prot_id "UniRef90_Q8H8R2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	19865379	19867028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t055839A-01;Tag=IsoSeq:G5858.1;Source=Nipponbare.panicle_G4607.1;prot_id "UniRef90_Q8H8R2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	19864740	19865260	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t055839A-01;Tag=IsoSeq:G5858.1;Source=Nipponbare.panicle_G4607.1;prot_id "UniRef90_Q8H8R2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	19903997	19908557	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0558400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	19903997	19908557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0558400-01;Parent=gene:OsNip_03g0558400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0558400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19903997	19904142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19903997	19907961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;Name=OsNip_03t0558400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0558400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19904143	19904361	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0558400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;protein_id=OsNip_03t0558400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19904362	19907961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19908172	19908557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;Name=OsNip_03t0558400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0558400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19908172	19908557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	19904294	19905198	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0558600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	19904294	19905198	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0558600-01;Parent=gene:OsNip_03g0558600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0558600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19904294	19904438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19904294	19904810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;Name=OsNip_03t0558600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0558600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19904439	19904810	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0558600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;protein_id=OsNip_03t0558600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19904900	19905007	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0558600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;protein_id=OsNip_03t0558600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19904900	19905198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;Name=OsNip_03t0558600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0558600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19905008	19905198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	19925378	19926319	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0558700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	19925378	19926319	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0558700-01;Parent=gene:OsNip_03g0558700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0558700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19925378	19925616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	19925378	19926319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558700-01;Name=OsNip_03t0558700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0558700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	19925617	19926318	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0558700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0558700-01;protein_id=OsNip_03t0558700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19926319	19926319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0558700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	20018763	20019702	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0559700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20018827	20019659	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0559700-00;Parent=gene:OsNip_03g0559700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0559700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20018827	20018921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20018827	20019659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-00;Name=OsNip_03t0559700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20018922	20019656	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0559700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0559700-00;protein_id=OsNip_03t0559700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20019657	20019659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	20018763	20019702	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0559700-01;Parent=gene:OsNip_03g0559700;transcript_id=OsNip_03t0559700-01;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2
Chr03	TAMA	exon	20019654	20019702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-01;Name=OsNip_03t0559700-01;exon_id=OsNip_03t0559700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1C6C1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	20019654	20019702	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0559700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0559700-01;protein_id=OsNip_03t0559700-01;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1C6C1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	exon	20018763	20019302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-01;Name=OsNip_03t0559700-01;exon_id=OsNip_03t0559700-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1C6C1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	20018980	20019302	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0559700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0559700-01;protein_id=OsNip_03t0559700-01;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1C6C1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	20018763	20018977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559700-01;Tag=IsoSeq:G5859.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4608.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1C6C1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	20030272	20033711	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0559900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20030272	20033667	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0559900-02;Parent=gene:OsNip_03g0559900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20030272	20030518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Name=OsNip_03t0559900-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559900-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20030272	20030518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20030612	20030668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Name=OsNip_03t0559900-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559900-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20030612	20030668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20031289	20031611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Name=OsNip_03t0559900-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20031289	20031611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20031693	20031785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Name=OsNip_03t0559900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559900-01-E6;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20031693	20031785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20031861	20032000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20031861	20032547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Name=OsNip_03t0559900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0559900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20032001	20032417	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0559900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;protein_id=OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20032418	20032547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0559900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	20194578	20194964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0562200-02;Name=OsNip_03t0562200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0562200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20243868	20243969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20244628	20244628	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20244629	20244868	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0563200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0563200-01;protein_id=OsNip_03t0563200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20244869	20245176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	20248238	20250000	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0563300;Name=ELL;biotype=protein_coding;description=Magnesium-chelatase;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20248326	20250000	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0563300-01;Parent=gene:OsNip_03g0563300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20248326	20248499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20248326	20249555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;Name=OsNip_03t0563300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0563300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20248500	20249555	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0563300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;protein_id=OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20249637	20249716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;Name=OsNip_03t0563300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0563300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20249637	20249716	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0563300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;protein_id=OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20249830	20249941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0563300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;protein_id=OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20249830	20250000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;Name=OsNip_03t0563300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0563300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20249942	20250000	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	20248238	20248483	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0563300-02;Parent=gene:OsNip_03g0563300;transcript_id=OsNip_03t0563300-02;Tag=IsoSeq:G5861.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2695.2
Chr03	TAMA	exon	20248238	20248483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-02;Name=OsNip_03t0563300-02;exon_id=OsNip_03t0563300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5861.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2695.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	20248388	20248483	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0563300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0563300-02;protein_id=OsNip_03t0563300-02;Tag=IsoSeq:G5861.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2695.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	20248238	20248385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0563300-02;Tag=IsoSeq:G5861.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2695.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	20257176	20259092	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0563400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20257176	20259092	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0563400-00;Parent=gene:OsNip_03g0563400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0563400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20420795	20421148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0565600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	20563284	20564968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568550-00;Name=OsNip_03t0568550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0568550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20563670	20564968	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20563364	20564866	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0568600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0568600-01;protein_id=OsNip_03t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20569313	20572604	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0568800-01;Parent=gene:OsNip_03g0568800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0568800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20569313	20569592	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20569313	20570484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568800-01;Name=OsNip_03t0568800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0568800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20569593	20570484	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0568800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0568800-01;protein_id=OsNip_03t0568800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20570569	20571048	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568800-01;Name=OsNip_03t0568800-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0568800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20577014	20577682	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0568900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0568900-01;protein_id=OsNip_03t0568900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20579105	20579350	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0568900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0568900-01;protein_id=OsNip_03t0568900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20579105	20579351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568900-01;Name=OsNip_03t0568900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0568900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20579351	20579351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0568900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20584426	20586557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0569000-01;Parent=gene:OsNip_03g0569000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0569000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20584426	20584689	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;Name=OsNip_03t0569000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0569000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20584426	20584689	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20584773	20584797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20584773	20584854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;Name=OsNip_03t0569000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0569000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20584798	20584854	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0569000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;protein_id=OsNip_03t0569000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20584960	20586555	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0569000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0569000-01;protein_id=OsNip_03t0569000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20845123	20845136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20846613	20846882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0572300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20924071	20924180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0573750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20945028	20948107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	20948200	20948502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574300-01;Name=OsNip_03t0574300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0574300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20961329	20961520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20961788	20961804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20962044	20962088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20961329	20961520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20961329	20961804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-01;Name=OsNip_03t0574600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0574600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20961521	20961787	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0574600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0574600-01;protein_id=OsNip_03t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20961788	20961804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20962044	20962190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	20978620	20985759	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0574900-01;Parent=gene:OsNip_03g0574900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0574900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20978620	20978894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20978620	20979149	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574900-01;Name=OsNip_03t0574900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0574900-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	20978895	20979149	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0574900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0574900-01;protein_id=OsNip_03t0574900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	20979332	20980137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0574900-01;Name=OsNip_03t0574900-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0574900-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21037490	21037936	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0575700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0575700-01;protein_id=OsNip_03t0575700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21037937	21038297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0575700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21053709	21055527	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0575950-00;Parent=gene:OsNip_03g0575950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0575950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21053709	21053909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0575950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21225817	21225859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0579000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21224305	21224565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0579000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21272072	21272275	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0579900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0579900-01;protein_id=OsNip_03t0579900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21272072	21272411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0579900-01;Name=OsNip_03t0579900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0579900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21272276	21272411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0579900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	21269175	21271927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0579900-02;Tag=IsoSeq:G5896.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4642.1;prot_id "UniRef90_M0RL68";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21375190	21375263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581650-00;Name=OsNip_03t0581650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0581650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21378149	21378183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21378149	21378277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;Name=OsNip_03t0581800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0581800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21378184	21378277	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0581800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;protein_id=OsNip_03t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21378587	21378657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;Name=OsNip_03t0581800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0581800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21380382	21380471	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0581800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;protein_id=OsNip_03t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21381861	21381881	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0581800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;protein_id=OsNip_03t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21381861	21382083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;Name=OsNip_03t0581800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0581800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21381882	21382083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	21378167	21378264	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0581800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0581800-02;protein_id=OsNip_03t0581800-02;Tag=IsoSeq:G5900.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4643.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	21381871	21382160	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-02;Name=OsNip_03t0581800-02;exon_id=OsNip_03t0581800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5900.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4643.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	21381871	21381988	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0581800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0581800-02;protein_id=OsNip_03t0581800-02;Tag=IsoSeq:G5900.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4643.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	21381992	21382160	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0581800-02;Tag=IsoSeq:G5900.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4643.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	21392897	21394893	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0582000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21392897	21394721	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0582000-01;Parent=gene:OsNip_03g0582000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0582000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21392897	21393616	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21392897	21394016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;Name=OsNip_03t0582000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0582000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21393617	21394016	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0582000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;protein_id=OsNip_03t0582000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21394103	21394614	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0582000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;protein_id=OsNip_03t0582000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21394103	21394721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;Name=OsNip_03t0582000-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0582000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21394615	21394721	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21393006	21394893	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0582000-02;Parent=gene:OsNip_03g0582000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0582000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21393006	21393052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21393006	21393079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;Name=OsNip_03t0582000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0582000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21393053	21393079	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0582000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;protein_id=OsNip_03t0582000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21393599	21394016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;Name=OsNip_03t0582000-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0582000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21393599	21394016	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0582000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;protein_id=OsNip_03t0582000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21394103	21394614	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0582000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0582000-02;protein_id=OsNip_03t0582000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21460948	21461127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0583000-00;Name=OsNip_03t0583000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0583000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	21636667	21637235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0586500-02;Tag=IsoSeq:G5907.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2728.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21639749	21639782	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0586600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0586600-01;protein_id=OsNip_03t0586600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21641088	21641223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0586600-01;Name=OsNip_03t0586600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0586600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21647446	21647810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0586700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21647446	21647943	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0586700-01;Name=OsNip_03t0586700-01-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0586700-01-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21648845	21648967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0586700-01;Name=OsNip_03t0586700-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0586700-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21685498	21685569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0587100-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21685570	21685872	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0587100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0587100-04;protein_id=OsNip_03t0587100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21685932	21686058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0587100-04;Name=OsNip_03t0587100-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0587100-04-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21685932	21686058	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0587100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0587100-04;protein_id=OsNip_03t0587100-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21686318	21686504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0587100-04;Name=OsNip_03t0587100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0587100-02-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21782331	21783161	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0589100-00;Parent=transcript:OsNip_03t0589100-00;protein_id=OsNip_03t0589100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	21784848	21791170	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0589300;biotype=protein_coding;description=Ovarian;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21784848	21791170	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0589300-01;Parent=gene:OsNip_03g0589300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0589300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21784848	21785060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0589300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	21784848	21785068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0589300-01;Name=OsNip_03t0589300-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0589300-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21785898	21785971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0589300-01;Name=OsNip_03t0589300-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0589300-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21786055	21786129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0589300-01;Name=OsNip_03t0589300-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0589300-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21910439	21913786	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0591300-01;Parent=gene:OsNip_03g0591300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0591300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	21947113	21947114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592100-01;Tag=IsoSeq:G5916.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4656.1;prot_id "UniRef90_B9FUF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	21947547	21947769	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592100-01;Tag=IsoSeq:G5916.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4656.1;prot_id "UniRef90_B9FUF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	21947965	21948191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592100-01;Tag=IsoSeq:G5916.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4656.1;prot_id "UniRef90_B9FUF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21952058	21952518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0591600-00;Name=OsNip_03t0591600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0591600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21952058	21952518	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0591600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0591600-00;protein_id=OsNip_03t0591600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	21954147	21957702	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0591700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21954147	21957702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0591700-01;Name=OsNip_03t0591700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0591700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21954455	21954619	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0591700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0591700-01;protein_id=OsNip_03t0591700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21954620	21957702	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0591700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	21960011	21963975	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0591801;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	21960011	21963975	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0591801-00;Parent=gene:OsNip_03g0591801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0591801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	21960366	21960550	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0591801-00;Parent=transcript:OsNip_03t0591801-00;protein_id=OsNip_03t0591801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	21963352	21963975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0591801-00;Name=OsNip_03t0591801-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0591801-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21963902	21963975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0591801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22000043	22000092	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22000043	22000232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;Name=OsNip_03t0592500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0592500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22000093	22000232	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0592500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;protein_id=OsNip_03t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22000322	22000973	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0592500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;protein_id=OsNip_03t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22000322	22001236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;Name=OsNip_03t0592500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0592500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22000974	22001236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	22000565	22001240	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0592500-02;Parent=gene:OsNip_03g0592500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0592500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22000565	22000565	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22000565	22001240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-02;Name=OsNip_03t0592500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0592500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22000566	22000973	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0592500-02;Parent=transcript:OsNip_03t0592500-02;protein_id=OsNip_03t0592500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22000974	22001240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	22000038	22001239	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0592500-03;Parent=gene:OsNip_03g0592500;transcript_id=OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10
Chr03	TAMA	exon	22000038	22000232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Name=OsNip_03t0592500-03;exon_id=OsNip_03t0592500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	22000040	22000232	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0592500-03;Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;protein_id=OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	22000322	22000715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Name=OsNip_03t0592500-03;exon_id=OsNip_03t0592500-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	22000322	22000377	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0592500-03;Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;protein_id=OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	22000777	22001239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Name=OsNip_03t0592500-03;exon_id=OsNip_03t0592500-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	22000038	22000039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	22000381	22000715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	22000777	22001239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0592500-03;Tag=IsoSeq:G5917.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2734.10;prot_id "UniRef90_A0A4P8F9B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	22100401	22100952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0594600-00;Name=OsNip_03t0594600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0594600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22100401	22100952	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0594600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0594600-00;protein_id=OsNip_03t0594600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	gene	22107447	22107869	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g059469A;Tag=IsoSeq:G5919
Chr03	TAMA	mRNA	22107447	22107869	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t059469A-01;Parent=gene:OsNip_03g059469A;transcript_id=OsNip_03t059469A-01;Tag=IsoSeq:G5919.1;Source=Nipponbare.root_G3578.1,Nipponbare.leaf_G2735.1
Chr03	TAMA	exon	22107447	22107869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t059469A-01;Name=OsNip_03t059469A-01-E1;exon_id=OsNip_03t059469A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5919.1;Source=Nipponbare.root_G3578.1,Nipponbare.leaf_G2735.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	22107636	22107869	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t059469A-01;Parent=transcript:OsNip_03t059469A-01;protein_id=OsNip_03t059469A-01;Tag=IsoSeq:G5919.1;Source=Nipponbare.root_G3578.1,Nipponbare.leaf_G2735.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	22107447	22107633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t059469A-01;Tag=IsoSeq:G5919.1;Source=Nipponbare.root_G3578.1,Nipponbare.leaf_G2735.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	22110421	22116489	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0594700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	22110421	22116473	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0594700-01;Parent=gene:OsNip_03g0594700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0594700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22110421	22110798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22110421	22110951	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;Name=OsNip_03t0594700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0594700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22110799	22110951	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0594700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;protein_id=OsNip_03t0594700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22111047	22111145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;Name=OsNip_03t0594700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0594700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22111047	22111145	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0594700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;protein_id=OsNip_03t0594700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22112313	22112626	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0594700-01;Name=OsNip_03t0594700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0594700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22451553	22451808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0601100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22548594	22549246	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0602600-01;protein_id=OsNip_03t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22550362	22550833	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0602600-01;protein_id=OsNip_03t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22551467	22551729	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0602600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0602600-01;protein_id=OsNip_03t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	22551467	22552000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0602600-01;Name=OsNip_03t0602600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0602600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22551730	22552000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0602600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22757986	22759817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0606466-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	22799861	22803963	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0606600-00;Parent=gene:OsNip_03g0606600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0606600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	22801850	22801986	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0606600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0606600-00;protein_id=OsNip_03t0606600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	22803529	22803963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0606600-00;Name=OsNip_03t0606600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0606600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22803777	22803963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0606600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	22995037	22996307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0609800-02;Name=OsNip_03t0609800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0609800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23036531	23037247	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0610400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0610400-01;protein_id=OsNip_03t0610400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23037248	23037381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23048126	23050530	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0610650-01;Parent=gene:OsNip_03g0610650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0610650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23048126	23048221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23067482	23067988	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0610800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0610800-01;protein_id=OsNip_03t0610800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23070325	23070417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610900-01;Name=OsNip_03t0610900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0610900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23070568	23070621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610900-01;Name=OsNip_03t0610900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0610900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23070723	23071076	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0610900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0610900-01;protein_id=OsNip_03t0610900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23070723	23071156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610900-01;Name=OsNip_03t0610900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0610900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23071077	23071156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0610900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	mRNA	23076783	23077941	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0611100-02;Parent=gene:OsNip_03g0611100;transcript_id=OsNip_03t0611100-02;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2
Chr03	TAMA	exon	23076783	23077041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;Name=OsNip_03t0611100-02;exon_id=OsNip_03t0611100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	23076994	23077041	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0611100-02;Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;protein_id=OsNip_03t0611100-02;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	23077661	23077941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;Name=OsNip_03t0611100-02;exon_id=OsNip_03t0611100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	23077661	23077702	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0611100-02;Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;protein_id=OsNip_03t0611100-02;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	23076783	23076993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	23077706	23077941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611100-02;Tag=IsoSeq:G5962.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4692.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	23086275	23090306	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0611200;biotype=protein_coding;description=Aldo/keto;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23086275	23090241	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0611200-01;Parent=gene:OsNip_03g0611200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23086275	23086457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Name=OsNip_03t0611200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0611200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23086275	23086457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23086702	23086712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23086702	23086916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Name=OsNip_03t0611200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0611200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23086713	23086916	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0611200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;protein_id=OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23087010	23087105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Name=OsNip_03t0611200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0611200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23087010	23087105	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0611200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;protein_id=OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23087208	23087291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Name=OsNip_03t0611200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0611200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23087208	23087291	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0611200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;protein_id=OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23087692	23087852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;Name=OsNip_03t0611200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0611200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23087692	23087852	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0611200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0611200-01;protein_id=OsNip_03t0611200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	23432802	23433405	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t061789A-01;Tag=IsoSeq:G5968.1;Source=Nipponbare.root_G3606.1;prot_id "UniRef90_M0SFV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	23450222	23451182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0618300-02;Tag=IsoSeq:G5970.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4698.5;prot_id "UniRef90_A0A446R5X7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23451226	23451562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0618366-00;Name=OsNip_03t0618366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0618366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23465079	23465964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0618800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23465965	23466453	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0618800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0618800-01;protein_id=OsNip_03t0618800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23466454	23466595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0618800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	23465925	23466826	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0618900;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23465925	23466826	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0618900-01;Parent=gene:OsNip_03g0618900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0618900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23465925	23466826	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0618900-01;Name=OsNip_03t0618900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0618900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	23474911	23475779	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0619151;Name=OsNip_Dof13;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23474911	23475779	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0619151-00;Parent=gene:OsNip_03g0619151;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0619151-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23474911	23474996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0619151-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23474911	23475779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0619151-00;Name=OsNip_03t0619151-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0619151-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23474997	23475779	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0619151-00;Parent=transcript:OsNip_03t0619151-00;protein_id=OsNip_03t0619151-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	23512612	23513573	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0619875;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23513502	23513573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0619875-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	23523560	23528315	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0620400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23523560	23525397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;Name=OsNip_03t0620400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23525817	23526261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;Name=OsNip_03t0620400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23526398	23527604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;Name=OsNip_03t0620400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23526921	23527604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0620400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;protein_id=OsNip_03t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23527915	23528175	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0620400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;protein_id=OsNip_03t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23527915	23528315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;Name=OsNip_03t0620400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0620400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23528176	23528315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23535165	23535287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0620500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;protein_id=OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23535701	23535913	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0620500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;protein_id=OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23535701	23536138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Name=OsNip_03t0620500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0620500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23535914	23536138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23536274	23536497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Name=OsNip_03t0620500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23536274	23536497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23536979	23537396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Name=OsNip_03t0620500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23536979	23537396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23537478	23537695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Name=OsNip_03t0620500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23537478	23537695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23538338	23538865	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Name=OsNip_03t0620500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23538338	23538865	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	23545428	23547647	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0620800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23545428	23547015	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0620800-02;Parent=gene:OsNip_03g0620800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0620800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23545428	23545614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23545428	23547015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620800-02;Name=OsNip_03t0620800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0620800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23545615	23547015	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0620800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0620800-02;protein_id=OsNip_03t0620800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	23545490	23547647	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0620800-01;Parent=gene:OsNip_03g0620800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0620800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23545490	23545614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23545490	23547455	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620800-01;Name=OsNip_03t0620800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0620800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23545615	23547455	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0620800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0620800-01;protein_id=OsNip_03t0620800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23547551	23547647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0620800-01;Name=OsNip_03t0620800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0620800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23562442	23562967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0621400-01;Name=OsNip_03t0621400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0621400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	23572411	23572574	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0621600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0621600-00;protein_id=OsNip_03t0621600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23576549	23576752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0621650-00;Name=OsNip_03t0621650-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0621650-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23576558	23576752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0621650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23576979	23577245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0621650-00;Name=OsNip_03t0621650-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0621650-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23614512	23614743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0622300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23615636	23616246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0622300-02;Name=OsNip_03t0622300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0622300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	23838648	23839587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0626100-01;Name=OsNip_03t0626100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0626100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23911418	23911503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0627300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	23911669	23911794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0627300-01;Name=OsNip_03t0627300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0627300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23912749	23913207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0627300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	23907648	23913159	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0627300-02;Parent=gene:OsNip_03g0627300;transcript_id=OsNip_03t0627300-02;Tag=IsoSeq:G5984.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3616.2
Chr03	TAMA	exon	23907648	23907903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0627300-02;Name=OsNip_03t0627300-02;exon_id=OsNip_03t0627300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G5984.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3616.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9PVJ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	23907650	23907903	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0627300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0627300-02;protein_id=OsNip_03t0627300-02;Tag=IsoSeq:G5984.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3616.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9PVJ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	exon	23908049	23908172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0627300-02;Name=OsNip_03t0627300-02;exon_id=OsNip_03t0627300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G5984.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3616.2;prot_id "UniRef90_A0A0K9PVJ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	24217219	24217370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0633900-01;Name=OsNip_03t0633900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0633900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24218201	24218339	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0633900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0633900-01;protein_id=OsNip_03t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	24219046	24219439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0633900-01;Name=OsNip_03t0633900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0633900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24219399	24219439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0633900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24220064	24222271	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0634000-01;Parent=gene:OsNip_03g0634000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0634000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24220064	24220256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0634000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24220064	24220397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0634000-01;Name=OsNip_03t0634000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0634000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24220257	24220397	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0634000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0634000-01;protein_id=OsNip_03t0634000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24221825	24222196	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0634000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0634000-01;protein_id=OsNip_03t0634000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24692974	24693300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0641200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	24704351	24704420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0641300-02;Tag=IsoSeq:G6011.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3633.1,Nipponbare.root_G3633.2,Nipponbare.panicle_G4729.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5DDZ3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24729376	24729627	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0641700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0641700-02;protein_id=OsNip_03t0641700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24729717	24729771	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0641700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0641700-02;protein_id=OsNip_03t0641700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24729866	24729888	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0641700-02;Parent=transcript:OsNip_03t0641700-02;protein_id=OsNip_03t0641700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24905091	24905249	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0645100-03;Parent=transcript:OsNip_03t0645100-03;protein_id=OsNip_03t0645100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24905250	24905484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	24902506	24905460	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0645100-04;Parent=gene:OsNip_03g0645100;transcript_id=OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2
Chr03	TAMA	exon	24902506	24902642	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Name=OsNip_03t0645100-04;exon_id=OsNip_03t0645100-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	24902508	24902642	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0645100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;protein_id=OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	24902733	24902821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Name=OsNip_03t0645100-04;exon_id=OsNip_03t0645100-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	24902733	24902821	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0645100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;protein_id=OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	24902946	24902992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Name=OsNip_03t0645100-04;exon_id=OsNip_03t0645100-04-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	24902946	24902992	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0645100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;protein_id=OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	24904277	24905460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Name=OsNip_03t0645100-04;exon_id=OsNip_03t0645100-04-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	24904277	24904311	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0645100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;protein_id=OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	24902506	24902507	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	24904315	24905460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645100-04;Tag=IsoSeq:G6020.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3637.2;prot_id "UniRef90_I1M8Z1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	24905586	24909080	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0645200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24905586	24907886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0645200-01;Parent=gene:OsNip_03g0645200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24905586	24906122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24905586	24906185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Name=OsNip_03t0645200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0645200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907295	24907349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Name=OsNip_03t0645200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0645200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24907295	24907349	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0645200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;protein_id=OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907466	24907562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Name=OsNip_03t0645200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0645200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24907466	24907562	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0645200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;protein_id=OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24907647	24907884	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0645200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;protein_id=OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907647	24907886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Name=OsNip_03t0645200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24907885	24907886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	24905947	24909080	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0645200-02;Parent=gene:OsNip_03g0645200;transcript_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1
Chr03	TAMA	exon	24908911	24909080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Name=OsNip_03t0645200-02;exon_id=OsNip_03t0645200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	24908911	24909078	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0645200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;protein_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	24907647	24908391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Name=OsNip_03t0645200-02;exon_id=OsNip_03t0645200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	24907647	24908391	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0645200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;protein_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	24907466	24907562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Name=OsNip_03t0645200-02;exon_id=OsNip_03t0645200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	24907466	24907562	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0645200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;protein_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	24907295	24907349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Name=OsNip_03t0645200-02;exon_id=OsNip_03t0645200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	24907295	24907349	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0645200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;protein_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	24905947	24906185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Name=OsNip_03t0645200-02;exon_id=OsNip_03t0645200-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	24906129	24906185	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0645200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;protein_id=OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	24909079	24909080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	24905947	24906126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645200-02;Tag=IsoSeq:G6021.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3638.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	24905964	24910950	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0645250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24905964	24910950	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0645250-00;Parent=gene:OsNip_03g0645250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24905964	24906174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24905964	24906174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907286	24907337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24907286	24907337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907459	24907566	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24907459	24907566	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24907651	24908401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24907651	24908401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24908922	24909276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24908922	24909276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24909366	24909543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24909366	24909543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24910562	24910687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24910562	24910950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;Name=OsNip_03t0645250-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645250-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24910688	24910950	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0645250-00;Parent=transcript:OsNip_03t0645250-00;protein_id=OsNip_03t0645250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	24959201	24961260	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0645900;Name=OsNip_NCED1;biotype=protein_coding;description=Carotenoid;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24959201	24961260	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0645900-00;Parent=gene:OsNip_03g0645900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0645900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24959201	24959370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24959201	24961260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645900-00;Name=OsNip_03t0645900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24959371	24961197	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0645900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0645900-00;protein_id=OsNip_03t0645900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24961198	24961260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	24959718	24961198	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0645966;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24959718	24961198	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0645966-00;Parent=gene:OsNip_03g0645966;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0645966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24959718	24960108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24959718	24960720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;Name=OsNip_03t0645966-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0645966-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24960109	24960720	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0645966-00;Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;protein_id=OsNip_03t0645966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	24960862	24961197	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0645966-00;Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;protein_id=OsNip_03t0645966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	24960862	24961198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;Name=OsNip_03t0645966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0645966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24961198	24961198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0645966-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	24996395	24998425	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0646032;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	24996395	24998425	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0646032-01;Parent=gene:OsNip_03g0646032;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0646032-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25003873	25003988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25005351	25005650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0646350-00;Parent=transcript:OsNip_03t0646350-00;protein_id=OsNip_03t0646350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25006454	25007505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646350-00;Name=OsNip_03t0646350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0646350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25006559	25007505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	25009415	25010369	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0646400-01;Parent=gene:OsNip_03g0646400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0646400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25009415	25009569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25009570	25009746	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0646400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0646400-01;protein_id=OsNip_03t0646400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25010032	25010355	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0646400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0646400-01;protein_id=OsNip_03t0646400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25010032	25010369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646400-01;Name=OsNip_03t0646400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0646400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25010356	25010369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0646400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	25008547	25010365	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0646400-02;Parent=gene:OsNip_03g0646400;transcript_id=OsNip_03t0646400-02;Tag=IsoSeq:G6025.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4737.1
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25129823	25129906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648450-00;Name=OsNip_03t0648450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0648450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25129823	25129906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25129988	25130169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648450-00;Name=OsNip_03t0648450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0648450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25130258	25130866	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648450-00;Name=OsNip_03t0648450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0648450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	25131035	25131791	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0648500-01;Parent=gene:OsNip_03g0648500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0648500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25131035	25131170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25135397	25135517	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	25139612	25140600	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0648800;Name=OsNip_GRL7;biotype=protein_coding;description=Thioredoxin;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25139612	25139619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25139612	25140600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648800-00;Name=OsNip_03t0648800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0648800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25139620	25140594	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0648800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0648800-00;protein_id=OsNip_03t0648800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25140595	25140600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	25142513	25146392	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0648900;biotype=protein_coding;description=HAD-superfamily;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	25142513	25146173	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0648900-01;Parent=gene:OsNip_03g0648900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25142513	25142521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25142513	25142788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0648900-01;Name=OsNip_03t0648900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0648900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25142522	25142788	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0648900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0648900-01;protein_id=OsNip_03t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25142870	25142933	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0648900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0648900-01;protein_id=OsNip_03t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25143595	25143718	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0648900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0648900-01;protein_id=OsNip_03t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25206537	25206647	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0650000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0650000-02;protein_id=OsNip_03t0650000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25206537	25206948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650000-02;Name=OsNip_03t0650000-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0650000-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25254195	25254279	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25267395	25267488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650800-00;Name=OsNip_03t0650800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0650800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25267395	25267488	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0650800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0650800-00;protein_id=OsNip_03t0650800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	25267550	25267893	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0650850;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	25267550	25267893	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0650850-01;Parent=gene:OsNip_03g0650850;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0650850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25267550	25267893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650850-01;Name=OsNip_03t0650850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0650850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	25268199	25273015	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0650900;Name=OsNip_NLA2;biotype=protein_coding;description=Ortholog;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	25268199	25272892	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0650900-01;Parent=gene:OsNip_03g0650900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0650900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25268199	25268604	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25268199	25268710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;Name=OsNip_03t0650900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0650900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25268605	25268710	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0650900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;protein_id=OsNip_03t0650900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25268806	25268864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;Name=OsNip_03t0650900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0650900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25268806	25268864	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0650900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;protein_id=OsNip_03t0650900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25269135	25269272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;Name=OsNip_03t0650900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0650900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25269135	25269272	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0650900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0650900-01;protein_id=OsNip_03t0650900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25638653	25639033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0657000-01;Name=OsNip_03t0657000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0657000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	25810432	25810839	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0659400-03;Parent=transcript:OsNip_03t0659400-03;protein_id=OsNip_03t0659400-03;Tag=IsoSeq:G6063.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2792.1,Nipponbare.root_G3658.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	25810275	25810429	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0659400-03;Tag=IsoSeq:G6063.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2792.1,Nipponbare.root_G3658.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	25805372	25810848	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0659450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	25805372	25806174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;Name=OsNip_03t0659450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0659450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25805372	25806174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25806911	25807026	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0659450-00;Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;protein_id=OsNip_03t0659450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25807494	25807701	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0659450-00;Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;protein_id=OsNip_03t0659450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25807494	25807885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;Name=OsNip_03t0659450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0659450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25807702	25807885	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0659450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25943115	25943263	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0661250-00;Parent=transcript:OsNip_03t0661250-00;protein_id=OsNip_03t0661250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	25945350	25945620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0661250-00;Name=OsNip_03t0661250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0661250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	25945350	25945620	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0661250-00;Parent=transcript:OsNip_03t0661250-00;protein_id=OsNip_03t0661250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	26268250	26268366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0667201-00;Name=OsNip_03t0667201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0667201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26268250	26268366	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0667201-00;Parent=transcript:OsNip_03t0667201-00;protein_id=OsNip_03t0667201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26276302	26277674	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0667300;Name=OsNip_IRT2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26276422	26277614	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0667300-00;Parent=gene:OsNip_03g0667300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0667300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26276422	26276877	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0667300-00;Name=OsNip_03t0667300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0667300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26276422	26276877	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0667300-00;Parent=transcript:OsNip_03t0667300-00;protein_id=OsNip_03t0667300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26276958	26277614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0667300-00;Name=OsNip_03t0667300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0667300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26276958	26277614	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0667300-00;Parent=transcript:OsNip_03t0667300-00;protein_id=OsNip_03t0667300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	26276302	26277674	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0667300-01;Parent=gene:OsNip_03g0667300;transcript_id=OsNip_03t0667300-01;Tag=IsoSeq:G6087.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3676.4
Chr03	TAMA	exon	26276302	26277674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0667300-01;Name=OsNip_03t0667300-01;exon_id=OsNip_03t0667300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6087.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3676.4;prot_id "UniRef90_M7ZMN9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	26277007	26277483	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0667300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0667300-01;protein_id=OsNip_03t0667300-01;Tag=IsoSeq:G6087.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3676.4;prot_id "UniRef90_M7ZMN9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	26277484	26277674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0667300-01;Tag=IsoSeq:G6087.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3676.4;prot_id "UniRef90_M7ZMN9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	26363672	26364425	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0668500-02;Tag=IsoSeq:G6095.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4787.1;prot_id "UniRef90_A0A453H1Y6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26421588	26421795	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0669600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0669600-02;protein_id=OsNip_03t0669600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26421588	26422220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0669600-02;Name=OsNip_03t0669600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0669600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26421796	26422220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0669600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26425197	26442532	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0669900-00;Parent=gene:OsNip_03g0669900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0669900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26425197	26425875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0669900-00;Name=OsNip_03t0669900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0669900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26425197	26425875	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0669900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0669900-00;protein_id=OsNip_03t0669900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26441709	26442532	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0669900-00;Name=OsNip_03t0669900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0669900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26441709	26442532	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0669900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0669900-00;protein_id=OsNip_03t0669900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26427507	26427590	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0669700;Name=OsNip_Fbox165;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26427507	26427590	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0669700-00;Parent=gene:OsNip_03g0669700;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0669700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26427507	26427590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0669700-00;Name=OsNip_03t0669700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0669700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26433380	26438222	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0669800;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	26460849	26461127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0670700-04;Name=OsNip_03t0670700-04-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0670700-04-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26460891	26461127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0670700-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26460060	26460154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0670700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26656802	26657843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0674300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26752033	26752699	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0676400-01;Parent=gene:OsNip_03g0676400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0676400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26752033	26752183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0676400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26752033	26752699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0676400-01;Name=OsNip_03t0676400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0676400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26752616	26752699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0676400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	26755878	26756258	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0676866-00;Name=OsNip_03t0676866-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0676866-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26784463	26788834	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0677101;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26784463	26788834	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0677101-00;Parent=gene:OsNip_03g0677101;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0677101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26784463	26784637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0677101-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	26788554	26788834	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0677101-00;Name=OsNip_03t0677101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0677101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26788554	26788834	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0677101-00;Parent=transcript:OsNip_03t0677101-00;protein_id=OsNip_03t0677101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26797276	26797921	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0677475;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26797276	26797921	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0677475-00;Parent=gene:OsNip_03g0677475;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0677475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26797276	26797657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0677475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26797276	26797921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0677475-00;Name=OsNip_03t0677475-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0677475-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26797658	26797834	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0677475-00;Parent=transcript:OsNip_03t0677475-00;protein_id=OsNip_03t0677475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26797835	26797921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0677475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26831934	26832408	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0678100;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26831934	26832408	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0678100-00;Parent=gene:OsNip_03g0678100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0678100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26831934	26832408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678100-00;Name=OsNip_03t0678100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0678100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26863031	26864940	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0678400;Name=OsNip_RDCP4;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26863036	26863916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26863036	26864940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-01;Name=OsNip_03t0678400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0678400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26863917	26864618	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0678400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0678400-01;protein_id=OsNip_03t0678400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26864619	26864940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	26863031	26864940	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0678400-02;Parent=gene:OsNip_03g0678400;transcript_id=OsNip_03t0678400-02;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3
Chr03	TAMA	exon	26863031	26863155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;Name=OsNip_03t0678400-02;exon_id=OsNip_03t0678400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	26863890	26864940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;Name=OsNip_03t0678400-02;exon_id=OsNip_03t0678400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	26864146	26864556	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0678400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;protein_id=OsNip_03t0678400-02;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	26863031	26863155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	26863890	26864145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	26864560	26864940	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678400-02;Tag=IsoSeq:G6116.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4804.2,Nipponbare.root_G3690.3;prot_id "UniRef90_M0S7L6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	26878159	26879403	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0678800;biotype=protein_coding;description=Glycosyl;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	26878159	26879403	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0678800-00;Parent=gene:OsNip_03g0678800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0678800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26878159	26879241	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0678800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0678800-00;protein_id=OsNip_03t0678800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26878159	26879403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678800-00;Name=OsNip_03t0678800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0678800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26879242	26879403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0678800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	26994556	26994726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0680200-00;Name=OsNip_03t0680200-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0680200-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26994810	26994889	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0680200-00;Parent=transcript:OsNip_03t0680200-00;protein_id=OsNip_03t0680200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	26995167	26995230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0680200-00;Name=OsNip_03t0680200-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0680200-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	26995167	26995230	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0680200-00;Parent=transcript:OsNip_03t0680200-00;protein_id=OsNip_03t0680200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	26988310	26995494	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0680200-01;Parent=gene:OsNip_03g0680200;transcript_id=OsNip_03t0680200-01;Tag=IsoSeq:G6121.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4808.1
Chr03	TAMA	exon	26988310	26988496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0680200-01;Name=OsNip_03t0680200-01;exon_id=OsNip_03t0680200-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6121.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4808.1;prot_id "UniRef90_T1LX70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	26988312	26988496	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0680200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0680200-01;protein_id=OsNip_03t0680200-01;Tag=IsoSeq:G6121.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4808.1;prot_id "UniRef90_T1LX70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	CDS	26989392	26989419	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0680200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0680200-01;protein_id=OsNip_03t0680200-01;Tag=IsoSeq:G6121.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4808.1;prot_id "UniRef90_T1LX70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	27046895	27047020	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0680600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0680600-00;protein_id=OsNip_03t0680600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27316632	27322394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685200-01;Name=OsNip_03t0685200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0685200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	27334076	27334648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t068529A-01;Tag=IsoSeq:G6138.1;Source=Nipponbare.panicle_G4820.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9IQM8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27334203	27334313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	27334203	27334703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685300-01;Name=OsNip_03t0685300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0685300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27337073	27337228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685300-01;Name=OsNip_03t0685300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0685300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27337581	27337889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685300-01;Name=OsNip_03t0685300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0685300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27363048	27364266	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0685800-01;Name=OsNip_03t0685800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0685800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27431846	27432572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687200-01;Name=OsNip_03t0687200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0687200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27431846	27432572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	27434655	27434707	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0687200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0687200-01;protein_id=OsNip_03t0687200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27435724	27436591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687200-01;Name=OsNip_03t0687200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0687200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27436301	27436591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27441058	27441804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687400-00;Name=OsNip_03t0687400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0687400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	27441058	27441804	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0687400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0687400-00;protein_id=OsNip_03t0687400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	27444695	27445609	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0687700;Name=OsNip_EnS-52;biotype=protein_coding;description=Ribosome-inactivating;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	27444695	27445609	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0687700-01;Parent=gene:OsNip_03g0687700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0687700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27444695	27444838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0687700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27537252	27537829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0689688-00;Name=OsNip_03t0689688-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0689688-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27537260	27537829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0689688-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	27536734	27537824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t068983A-01;Name=OsNip_03t068983A-01-E1;exon_id=OsNip_03t068983A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6154.1;Source=Nipponbare.root_G3710.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3G4L2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27709064	27709360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0692400-02;Name=OsNip_03t0692400-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0692400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	27984270	27985282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0697833-01;Tag=IsoSeq:G6173.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4852.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6GTS9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	27985375	27985627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0697833-01;Tag=IsoSeq:G6173.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4852.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6GTS9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	27986413	27986784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0697833-01;Tag=IsoSeq:G6173.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4852.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6GTS9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	27983787	27984027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0698066-00;Name=OsNip_03t0698066-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0698066-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	27984095	27985263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0698066-00;Name=OsNip_03t0698066-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0698066-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	28009314	28012201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0698800-02;Tag=IsoSeq:G6176.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G2842.1,Nipponbare.panicle_G4855.2,Nipponbare.root_G3722.1,Nipponbare.panicle_G4855.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9VPT4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28024427	28024490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699100-01;Name=OsNip_03t0699100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0699100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28042133	28042378	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699400-01;Name=OsNip_03t0699400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0699400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28046240	28046533	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0699600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0699600-01;protein_id=OsNip_03t0699600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28047345	28047719	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0699600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0699600-01;protein_id=OsNip_03t0699600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28047345	28048027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699600-01;Name=OsNip_03t0699600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0699600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28047720	28048027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28052646	28053580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699700-01;Name=OsNip_03t0699700-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0699700-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28052636	28053417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699750-00;Name=OsNip_03t0699750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0699750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28054566	28060996	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0699800;Name=OsNip_THI36;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28054566	28055167	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0699800-01;Parent=gene:OsNip_03g0699800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0699800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28054566	28054833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28054566	28055167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-01;Name=OsNip_03t0699800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0699800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28054834	28055148	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0699800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0699800-01;protein_id=OsNip_03t0699800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28055149	28055167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	28060919	28060996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;Name=OsNip_03t0699800-02;exon_id=OsNip_03t0699800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	28060919	28060995	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0699800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;protein_id=OsNip_03t0699800-02;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	28054638	28055141	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;Name=OsNip_03t0699800-02;exon_id=OsNip_03t0699800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	28055129	28055141	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0699800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;protein_id=OsNip_03t0699800-02;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	28060996	28060996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	28054638	28055126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699800-02;Tag=IsoSeq:G6183.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G4861.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0MM46";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28058425	28058695	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0699950;Name=OsNip_STA110;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28058425	28058695	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0699950-00;Parent=gene:OsNip_03g0699950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0699950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28058425	28058640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699950-00;Name=OsNip_03t0699950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0699950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28058425	28058640	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0699950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0699950-00;protein_id=OsNip_03t0699950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28058666	28058695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0699950-00;Name=OsNip_03t0699950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0699950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28058666	28058695	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0699950-00;Parent=transcript:OsNip_03t0699950-00;protein_id=OsNip_03t0699950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28063603	28064495	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0700100;Name=OsNip_THI38;biotype=protein_coding;description=Somatomedin;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28063603	28064495	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0700100-01;Parent=gene:OsNip_03g0700100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0700100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28063603	28064023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28063603	28064495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700100-01;Name=OsNip_03t0700100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0700100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28064024	28064317	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0700100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0700100-01;protein_id=OsNip_03t0700100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28064318	28064495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28068975	28069515	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0700200;Name=OsNip_THI39;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28068975	28069515	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0700200-01;Parent=gene:OsNip_03g0700200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0700200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28068975	28069135	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28068975	28069515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700200-01;Name=OsNip_03t0700200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0700200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28069136	28069429	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0700200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0700200-01;protein_id=OsNip_03t0700200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28112258	28112394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28112395	28112760	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0700750-00;Parent=transcript:OsNip_03t0700750-00;protein_id=OsNip_03t0700750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28112761	28113049	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28118060	28118146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700800-02;Name=OsNip_03t0700800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0700800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28118060	28118146	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0700800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0700800-02;protein_id=OsNip_03t0700800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28118317	28118430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0700800-02;Name=OsNip_03t0700800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0700800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28157826	28158032	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0701400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;protein_id=OsNip_03t0701400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28157826	28158203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Name=OsNip_03t0701400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0701400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28158033	28158203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28158356	28158572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Name=OsNip_03t0701400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0701400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28158356	28158572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28160505	28161762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Name=OsNip_03t0701400-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0701400-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28160505	28161762	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	28158306	28158776	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0701400-03;Parent=gene:OsNip_03g0701400;transcript_id=OsNip_03t0701400-03;Tag=IsoSeq:G6188.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3731.2
Chr03	TAMA	exon	28158306	28158776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-03;Name=OsNip_03t0701400-03;exon_id=OsNip_03t0701400-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6188.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3731.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9JHI2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	28158307	28158438	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0701400-03;Parent=transcript:OsNip_03t0701400-03;protein_id=OsNip_03t0701400-03;Tag=IsoSeq:G6188.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3731.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9JHI2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	28158306	28158306	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-03;Tag=IsoSeq:G6188.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3731.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9JHI2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	28158442	28158776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701400-03;Tag=IsoSeq:G6188.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3731.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9JHI2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28160303	28161346	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0701500-01;Parent=gene:OsNip_03g0701500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0701500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28160303	28160449	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28160303	28161346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701500-01;Name=OsNip_03t0701500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0701500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28160450	28161289	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0701500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701500-01;protein_id=OsNip_03t0701500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28161290	28161346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28163601	28163949	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0701550;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28163601	28163949	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0701550-01;Parent=gene:OsNip_03g0701550;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0701550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28163601	28163949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701550-01;Name=OsNip_03t0701550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0701550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	28164813	28167428	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0701600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28164813	28167428	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0701600-01;Parent=gene:OsNip_03g0701600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28164813	28165045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28164813	28165127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28165046	28165127	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28165408	28165516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28165408	28165516	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28166015	28166042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28166015	28166042	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28166122	28166312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28166122	28166312	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28166454	28166568	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28166454	28166568	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28166991	28167242	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0701600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;protein_id=OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28166991	28167428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Name=OsNip_03t0701600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0701600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28167243	28167428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0701600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28232740	28232834	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0702700-03;Parent=transcript:OsNip_03t0702700-03;protein_id=OsNip_03t0702700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28233374	28233929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0702700-03;Name=OsNip_03t0702700-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0702700-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28233551	28233929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0702700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28240368	28245227	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0703000-01;Parent=gene:OsNip_03g0703000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28241266	28241297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0703000-01;Name=OsNip_03t0703000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0703000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28241390	28241607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0703000-01;Name=OsNip_03t0703000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0703000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28241390	28241607	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0703000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0703000-01;protein_id=OsNip_03t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28241747	28241862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0703000-01;Name=OsNip_03t0703000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0703000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28241747	28241862	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0703000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0703000-01;protein_id=OsNip_03t0703000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	28275693	28275694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0703400-02;Tag=IsoSeq:G6200.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3739.3;prot_id "UniRef90_A0A199W332";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	28273870	28275531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0703400-02;Tag=IsoSeq:G6200.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3739.3;prot_id "UniRef90_A0A199W332";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28456043	28456395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0706900-01;Name=OsNip_03t0706900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0706900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	28566190	28566234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0708500-01;Tag=IsoSeq:G6214.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2863.3;prot_id "UniRef90_D7SJ95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28568347	28568686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0708600-02;Name=OsNip_03t0708600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0708600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28631737	28631794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28632225	28632396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710000-02;Name=OsNip_03t0710000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0710000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28632225	28632396	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0710000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0710000-02;protein_id=OsNip_03t0710000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28632487	28633089	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0710000-02;Parent=transcript:OsNip_03t0710000-02;protein_id=OsNip_03t0710000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28632487	28633255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710000-02;Name=OsNip_03t0710000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0710000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28667237	28667353	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0710800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0710800-01;protein_id=OsNip_03t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28667466	28667522	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0710800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0710800-01;protein_id=OsNip_03t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28667466	28667703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710800-01;Name=OsNip_03t0710800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0710800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28667523	28667703	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	28664133	28664228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0710800-02;Name=OsNip_03t0710800-02;exon_id=OsNip_03t0710800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6223.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4894.7;prot_id "UniRef90_A0A5J5AH57";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	CDS	28664133	28664228	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0710800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0710800-02;protein_id=OsNip_03t0710800-02;Tag=IsoSeq:G6223.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4894.7;prot_id "UniRef90_A0A5J5AH57";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28795423	28797588	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0712400-02;Parent=gene:OsNip_03g0712400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0712400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28795423	28796262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28795423	28797588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-02;Name=OsNip_03t0712400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0712400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28796263	28796940	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0712400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0712400-02;protein_id=OsNip_03t0712400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28796941	28797588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	28797570	28798180	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0712400-01;Parent=gene:OsNip_03g0712400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0712400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28797570	28797635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	28797570	28798180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-01;Name=OsNip_03t0712400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0712400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	28797636	28798178	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0712400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0712400-01;protein_id=OsNip_03t0712400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28798179	28798180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	28796407	28799143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0712400-03;Parent=gene:OsNip_03g0712400;transcript_id=OsNip_03t0712400-03;Tag=IsoSeq:G6236.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3762.2
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28819775	28820086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0712700-01;Name=OsNip_03t0712700-01-E18;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0712700-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	28861933	28862894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0713500-00;Name=OsNip_03t0713500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0713500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	28861902	28862720	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0713550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29074149	29074542	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0718100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0718100-01;protein_id=OsNip_03t0718100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29074792	29075405	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0718100-01;Name=OsNip_03t0718100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0718100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29114654	29114905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0719000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29114906	29115262	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0719000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0719000-01;protein_id=OsNip_03t0719000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	29200753	29202691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720300-03;Tag=IsoSeq:G6265.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3783.3;prot_id "UniRef90_A0A078FR24";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29210364	29212204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720400-01;Name=OsNip_03t0720400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0720400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29212637	29212745	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0720500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0720500-00;protein_id=OsNip_03t0720500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29213095	29213252	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0720500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0720500-00;protein_id=OsNip_03t0720500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29214752	29214849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29215148	29215241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29215767	29215913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29236187	29238382	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0720800;Name=OsNip_MYB52;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29236187	29238382	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0720800-01;Parent=gene:OsNip_03g0720800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0720800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29236187	29236603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29236187	29236718	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;Name=OsNip_03t0720800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0720800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29236604	29236718	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0720800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;protein_id=OsNip_03t0720800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29237265	29237714	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;Name=OsNip_03t0720800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0720800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29237265	29237714	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0720800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;protein_id=OsNip_03t0720800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29237860	29238032	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0720800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0720800-01;protein_id=OsNip_03t0720800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29329004	29336560	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0722800-01;Parent=gene:OsNip_03g0722800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0722800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29329004	29329275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0722800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29329276	29329566	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0722800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0722800-01;protein_id=OsNip_03t0722800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29331329	29331484	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0722800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0722800-01;protein_id=OsNip_03t0722800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29331580	29332479	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0722800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0722800-01;protein_id=OsNip_03t0722800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	29382464	29382673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t072339A-01;Tag=IsoSeq:G6276.1;Source=Nipponbare.panicle_G4939.1;prot_id "UniRef90_T1MAH7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29397649	29401365	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0723600-01;Parent=gene:OsNip_03g0723600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0723600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29397649	29397766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0723600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29397767	29398924	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0723600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0723600-01;protein_id=OsNip_03t0723600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29400808	29401365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0723600-01;Name=OsNip_03t0723600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0723600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29401087	29401365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0723600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29397708	29397766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0723600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29397767	29398924	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0723600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0723600-02;protein_id=OsNip_03t0723600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29400808	29401086	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0723600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0723600-02;protein_id=OsNip_03t0723600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29400808	29401258	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0723600-02;Name=OsNip_03t0723600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0723600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29427504	29427526	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0724300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0724300-01;protein_id=OsNip_03t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29427954	29428082	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0724300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0724300-01;protein_id=OsNip_03t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29428751	29430450	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0724300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0724300-01;protein_id=OsNip_03t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29428751	29430915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724300-01;Name=OsNip_03t0724300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0724300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29430451	29430915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29426851	29427358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724400-00;Name=OsNip_03t0724400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0724400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29427943	29428078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724400-00;Name=OsNip_03t0724400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0724400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29428744	29429169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724400-00;Name=OsNip_03t0724400-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0724400-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29448215	29450245	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0724500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29448215	29450245	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0724500-01;Parent=gene:OsNip_03g0724500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0724500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29448215	29448421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29448215	29448520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724500-01;Name=OsNip_03t0724500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0724500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29448422	29448520	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0724500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0724500-01;protein_id=OsNip_03t0724500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29448623	29448818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0724500-01;Name=OsNip_03t0724500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0724500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29490220	29490529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0725400-02;Name=OsNip_03t0725400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0725400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29486077	29486788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0725400-03;Name=OsNip_03t0725400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0725400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29489234	29489817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0725400-03;Name=OsNip_03t0725400-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0725400-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29489543	29489817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0725400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29487579	29490095	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0725601;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29487579	29490095	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0725601-01;Parent=gene:OsNip_03g0725601;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0725601-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29487579	29490095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0725601-01;Name=OsNip_03t0725601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0725601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29516640	29519083	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0725800;Name=OsNip_bHLH018;biotype=protein_coding;description=Helix-loop-helix;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	29528082	29528183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726100-03;Tag=IsoSeq:G6286.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3796.6,Nipponbare.panicle_G4947.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	29528736	29528984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726100-03;Tag=IsoSeq:G6286.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3796.6,Nipponbare.panicle_G4947.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29527406	29527975	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0726150-00;Parent=gene:OsNip_03g0726150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0726150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29527406	29527508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726150-00;Name=OsNip_03t0726150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0726150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29548695	29549026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726300-01;Name=OsNip_03t0726300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0726300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29549904	29550120	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726300-01;Name=OsNip_03t0726300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0726300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29549904	29550120	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29584758	29584833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0726700-01;Name=OsNip_03t0726700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0726700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29584758	29584833	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0726700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0726700-01;protein_id=OsNip_03t0726700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29585928	29591307	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0726800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	29660662	29661656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0727600-02;Tag=IsoSeq:G6293.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3799.1;prot_id "UniRef90_A0A166AWX9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29745719	29746091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728600-01;Name=OsNip_03t0728600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0728600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29745719	29746091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29746875	29746961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29747494	29747802	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0728600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0728600-01;protein_id=OsNip_03t0728600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29747803	29747861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29766132	29774166	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0728800;Name=OsNip_RH16;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29766132	29774052	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0728800-01;Parent=gene:OsNip_03g0728800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0728800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29766132	29766170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29767021	29767185	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0728800-01;Name=OsNip_03t0728800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0728800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29767021	29767185	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0728800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0728800-01;protein_id=OsNip_03t0728800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	29874616	29875190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0730600-00;Name=OsNip_03t0730600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0730600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	29880945	29887239	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0730700;Name=OsNip_SCP21;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	29880945	29887239	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0730700-00;Parent=gene:OsNip_03g0730700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0730700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29880945	29881114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0730700-00;Name=OsNip_03t0730700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0730700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29880945	29881114	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0730700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0730700-00;protein_id=OsNip_03t0730700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	29883160	29883305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0730700-00;Name=OsNip_03t0730700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0730700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	29883160	29883305	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0730700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0730700-00;protein_id=OsNip_03t0730700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30300382	30300729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0738400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30301026	30301027	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0738400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30301026	30301147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0738400-03;Name=OsNip_03t0738400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0738400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30301028	30301147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0738400-03;Parent=transcript:OsNip_03t0738400-03;protein_id=OsNip_03t0738400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30342908	30343128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0739500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30385440	30385526	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0740600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0740600-02;protein_id=OsNip_03t0740600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30385440	30385901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0740600-02;Name=OsNip_03t0740600-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0740600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30385527	30385901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0740600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	30384564	30385528	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0740650-00;Parent=gene:OsNip_03g0740650;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0740650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	30431853	30432446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741525-00;Name=OsNip_03t0741525-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0741525-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30432192	30432446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741525-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30436490	30437512	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0741600-00;Parent=transcript:OsNip_03t0741600-00;protein_id=OsNip_03t0741600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30436490	30437525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-00;Name=OsNip_03t0741600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0741600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30437513	30437525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30437607	30437889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-00;Name=OsNip_03t0741600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0741600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30437607	30437889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	30436619	30437715	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0741600-01;Parent=gene:OsNip_03g0741600;transcript_id=OsNip_03t0741600-01;Tag=IsoSeq:G6349.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4995.1,Nipponbare.leaf_G2919.1
Chr03	TAMA	exon	30436619	30437715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-01;Name=OsNip_03t0741600-01;exon_id=OsNip_03t0741600-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6349.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4995.1,Nipponbare.leaf_G2919.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q0HXQ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	30436621	30436911	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0741600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0741600-01;protein_id=OsNip_03t0741600-01;Tag=IsoSeq:G6349.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4995.1,Nipponbare.leaf_G2919.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q0HXQ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	30436619	30436620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-01;Tag=IsoSeq:G6349.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4995.1,Nipponbare.leaf_G2919.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q0HXQ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	30436915	30437715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0741600-01;Tag=IsoSeq:G6349.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G4995.1,Nipponbare.leaf_G2919.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q0HXQ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30515976	30516272	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0743400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0743400-01;protein_id=OsNip_03t0743400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30516273	30516672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	30513965	30514330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;Name=OsNip_03t0743400-02;exon_id=OsNip_03t0743400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	CDS	30513966	30514330	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0743400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;protein_id=OsNip_03t0743400-02;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	exon	30515976	30516485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;Name=OsNip_03t0743400-02;exon_id=OsNip_03t0743400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	CDS	30515976	30516000	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0743400-02;Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;protein_id=OsNip_03t0743400-02;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	30513965	30513965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	30516004	30516485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743400-02;Tag=IsoSeq:G6354.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2921.2,Nipponbare.panicle_G4999.3,Nipponbare.root_G3835.3;prot_id "UniRef90_A0A251TRT7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	30517480	30519662	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0743500;Name=OsNip_CML4;biotype=protein_coding;description=Calcium-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	30517480	30519627	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0743500-01;Parent=gene:OsNip_03g0743500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0743500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30517480	30518751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30517480	30519627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743500-01;Name=OsNip_03t0743500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0743500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30518752	30518964	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0743500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0743500-01;protein_id=OsNip_03t0743500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30518965	30519627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0743500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	30701249	30704661	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0746800-01;Parent=gene:OsNip_03g0746800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0746800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30990536	30990620	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0751600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0751600-01;protein_id=OsNip_03t0751600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30990739	30991361	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0751600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0751600-01;protein_id=OsNip_03t0751600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30990739	30991596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-01;Name=OsNip_03t0751600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0751600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30991362	30991596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	30989987	30991567	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0751600-02;Parent=gene:OsNip_03g0751600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0751600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30989987	30990086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;Name=OsNip_03t0751600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0751600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30989987	30990086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30990536	30990620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;Name=OsNip_03t0751600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0751600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30990536	30990620	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0751600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;protein_id=OsNip_03t0751600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	30990739	30991361	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0751600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;protein_id=OsNip_03t0751600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	30990739	30991567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;Name=OsNip_03t0751600-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0751600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30991362	30991567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	30991277	30991621	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0751600-03;Parent=gene:OsNip_03g0751600;transcript_id=OsNip_03t0751600-03;Tag=IsoSeq:G6392.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5033.5
Chr03	TAMA	exon	30991277	30991621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0751600-03;Name=OsNip_03t0751600-03;exon_id=OsNip_03t0751600-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6392.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5033.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31085814	31086050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0753750-00;Name=OsNip_03t0753750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0753750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31097103	31097167	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0754200-02;Name=OsNip_03t0754200-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0754200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31097103	31097167	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0754200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0754200-02;protein_id=OsNip_03t0754200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31097258	31097369	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0754200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0754200-02;protein_id=OsNip_03t0754200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31097258	31097477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0754200-02;Name=OsNip_03t0754200-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0754200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31296539	31297066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757200-01;Name=OsNip_03t0757200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0757200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31302603	31303076	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757550-01;Name=OsNip_03t0757550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0757550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	31302708	31305227	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0757600;biotype=protein_coding;description=UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31303320	31304305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757600-01;Name=OsNip_03t0757600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0757600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31304195	31304305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31303306	31303339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31303306	31305227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757600-02;Name=OsNip_03t0757600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0757600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31303340	31304194	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0757600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0757600-02;protein_id=OsNip_03t0757600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31304195	31305227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0757600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31512595	31512724	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0762000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0762000-01;protein_id=OsNip_03t0762000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31514091	31514398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762000-01;Name=OsNip_03t0762000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0762000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31514342	31514398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	31517358	31518881	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0762100-01;Parent=gene:OsNip_03g0762100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31517358	31517558	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31517559	31518158	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0762100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;protein_id=OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31518250	31518342	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0762100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;protein_id=OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31518250	31518373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;Name=OsNip_03t0762100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0762100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31518343	31518373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31518812	31518881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31532831	31533256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762450-00;Name=OsNip_03t0762450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0762450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31537855	31538060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-01;Name=OsNip_03t0762500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0762500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31537855	31538060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31538136	31538350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31538136	31538761	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-01;Name=OsNip_03t0762500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0762500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31538351	31538761	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0762500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0762500-01;protein_id=OsNip_03t0762500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	31537854	31538693	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0762500-02;Parent=gene:OsNip_03g0762500;transcript_id=OsNip_03t0762500-02;Tag=IsoSeq:G6440.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3890.1
Chr03	TAMA	exon	31537854	31538693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-02;Name=OsNip_03t0762500-02;exon_id=OsNip_03t0762500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6440.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3890.1;prot_id "UniRef90_Q8W5H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	CDS	31537856	31537921	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0762500-02;Parent=transcript:OsNip_03t0762500-02;protein_id=OsNip_03t0762500-02;Tag=IsoSeq:G6440.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3890.1;prot_id "UniRef90_Q8W5H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	31537854	31537855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-02;Tag=IsoSeq:G6440.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3890.1;prot_id "UniRef90_Q8W5H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31537925	31538693	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0762500-02;Tag=IsoSeq:G6440.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G3890.1;prot_id "UniRef90_Q8W5H6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	31542955	31544614	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0762700;biotype=protein_coding;description=Transcriptional;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31677294	31677409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0765050-00;Name=OsNip_03t0765050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0765050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31680943	31681608	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0765100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0765100-01;protein_id=OsNip_03t0765100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31681609	31681754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0765100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31785951	31787273	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0767600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0767600-01;protein_id=OsNip_03t0767600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31787358	31787900	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0767600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0767600-01;protein_id=OsNip_03t0767600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31787358	31788078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-01;Name=OsNip_03t0767600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0767600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31787901	31788078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	31785622	31785691	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0767600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0767600-02;protein_id=OsNip_03t0767600-02;Tag=IsoSeq:G6461.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3900.1,Nipponbare.panicle_G5092.2;prot_id "UniRef90_M1AMG6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	exon	31787358	31788117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-02;Name=OsNip_03t0767600-02;exon_id=OsNip_03t0767600-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G6461.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3900.1,Nipponbare.panicle_G5092.2;prot_id "UniRef90_M1AMG6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	31785181	31785181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-02;Tag=IsoSeq:G6461.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3900.1,Nipponbare.panicle_G5092.2;prot_id "UniRef90_M1AMG6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31786034	31787273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-02;Tag=IsoSeq:G6461.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3900.1,Nipponbare.panicle_G5092.2;prot_id "UniRef90_M1AMG6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31787358	31788117	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767600-02;Tag=IsoSeq:G6461.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G3900.1,Nipponbare.panicle_G5092.2;prot_id "UniRef90_M1AMG6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	31786091	31787567	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0767650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	31786091	31787567	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0767650-00;Parent=gene:OsNip_03g0767650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0767650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31803759	31804146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767900-01;Name=OsNip_03t0767900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0767900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31803954	31804146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0767900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	31811577	31811799	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-01;Name=OsNip_03t076844A-01-E1;exon_id=OsNip_03t076844A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6464.1;Source=Nipponbare.leaf_G2973.1;prot_id "UniRef90_A0A5N6P9A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31812942	31814869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-01;Tag=IsoSeq:G6464.1;Source=Nipponbare.leaf_G2973.1;prot_id "UniRef90_A0A5N6P9A0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	mRNA	31811577	31814869	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t076844A-02;Parent=gene:OsNip_03g076844A;transcript_id=OsNip_03t076844A-02;Tag=IsoSeq:G6464.2;Source=Nipponbare.panicle_G5095.1,Nipponbare.leaf_G2973.2,Nipponbare.root_G3902.1
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	31811577	31811578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-02;Tag=IsoSeq:G6464.2;Source=Nipponbare.panicle_G5095.1,Nipponbare.leaf_G2973.2,Nipponbare.root_G3902.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31811909	31814869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-02;Tag=IsoSeq:G6464.2;Source=Nipponbare.panicle_G5095.1,Nipponbare.leaf_G2973.2,Nipponbare.root_G3902.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	exon	31811648	31813310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-03;Name=OsNip_03t076844A-03-E1;exon_id=OsNip_03t076844A-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6464.3;Source=Nipponbare.leaf_G2973.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	31811648	31811905	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t076844A-03;Parent=transcript:OsNip_03t076844A-03;protein_id=OsNip_03t076844A-03;Tag=IsoSeq:G6464.3;Source=Nipponbare.leaf_G2973.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31813377	31814869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-03;Tag=IsoSeq:G6464.3;Source=Nipponbare.leaf_G2973.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31813638	31814554	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t076844A-24;Tag=IsoSeq:G6464.24;Source=Nipponbare.leaf_G2973.23;prot_id "UniRef90_A0A6D2JPQ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31817608	31817993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0768450-00;Name=OsNip_03t0768450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0768450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	31818345	31818606	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889A-01;Name=OsNip_03t076889A-01-E1;exon_id=OsNip_03t076889A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6465.1;Source=Nipponbare.leaf_G2974.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0VBA6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	31819285	31819329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889B-02;Tag=IsoSeq:G6466.2;Source=Nipponbare.leaf_G2975.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	mRNA	31819672	31821149	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t076889C-01;Parent=gene:OsNip_03g076889C;transcript_id=OsNip_03t076889C-01;Tag=IsoSeq:G6467.1;Source=Nipponbare.leaf_G2976.1
Chr03	TAMA	exon	31819672	31821149	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889C-01;Name=OsNip_03t076889C-01-E1;exon_id=OsNip_03t076889C-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6467.1;Source=Nipponbare.leaf_G2976.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	31821149	31821149	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889C-01;Tag=IsoSeq:G6467.1;Source=Nipponbare.leaf_G2976.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31819672	31820111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889C-01;Tag=IsoSeq:G6467.1;Source=Nipponbare.leaf_G2976.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	mRNA	31820117	31820962	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t076889C-02;Parent=gene:OsNip_03g076889C;transcript_id=OsNip_03t076889C-02;Tag=IsoSeq:G6467.2;Source=Nipponbare.leaf_G2976.3,Nipponbare.leaf_G2976.2
Chr03	TAMA	exon	31820117	31820962	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889C-02;Name=OsNip_03t076889C-02-E1;exon_id=OsNip_03t076889C-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6467.2;Source=Nipponbare.leaf_G2976.3,Nipponbare.leaf_G2976.2;prot_id "UniRef90_A0A0A8YIN7";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	31820117	31820740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t076889C-02;Tag=IsoSeq:G6467.2;Source=Nipponbare.leaf_G2976.3,Nipponbare.leaf_G2976.2;prot_id "UniRef90_A0A0A8YIN7";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31824161	31824164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0768900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31824161	31824936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0768900-00;Name=OsNip_03t0768900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0768900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31824165	31824695	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0768900-00;Parent=transcript:OsNip_03t0768900-00;protein_id=OsNip_03t0768900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31824696	31824936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0768900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	31825518	31829665	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0769000-00;Parent=gene:OsNip_03g0769000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0769000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31825518	31825699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0769000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31826389	31826526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0769000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0769000-00;protein_id=OsNip_03t0769000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31826817	31826876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0769000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0769000-00;protein_id=OsNip_03t0769000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31827164	31827570	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0769000-00;Name=OsNip_03t0769000-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0769000-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	31828317	31828439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0769000-00;Name=OsNip_03t0769000-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0769000-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31924061	31924111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0770700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31922684	31922947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0770750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	31922684	31923247	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0770750-00;Name=OsNip_03t0770750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0770750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	31922948	31923184	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0770750-00;Parent=transcript:OsNip_03t0770750-00;protein_id=OsNip_03t0770750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31923185	31923247	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0770750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	31924821	31925500	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0770775;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32019224	32019527	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772800-02;Name=OsNip_03t0772800-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0772800-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32019574	32019904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32019574	32020691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;Name=OsNip_03t0772900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0772900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32019905	32020627	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0772900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;protein_id=OsNip_03t0772900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32020628	32020691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32020971	32021171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;Name=OsNip_03t0772900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0772900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32020971	32021171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	32019617	32021229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-02;Name=OsNip_03t0772900-02;exon_id=OsNip_03t0772900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6480.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5106.2;prot_id "UniRef90_K4ADR2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	32020111	32020395	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0772900-02;Parent=transcript:OsNip_03t0772900-02;protein_id=OsNip_03t0772900-02;Tag=IsoSeq:G6480.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5106.2;prot_id "UniRef90_K4ADR2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	32020396	32021229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-02;Tag=IsoSeq:G6480.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5106.2;prot_id "UniRef90_K4ADR2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	32019617	32020108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0772900-02;Tag=IsoSeq:G6480.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5106.2;prot_id "UniRef90_K4ADR2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32028145	32029878	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0773000-01;Parent=gene:OsNip_03g0773000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0773000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32028145	32028429	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32028145	32029878	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773000-01;Name=OsNip_03t0773000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0773000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32028430	32029764	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0773000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0773000-01;protein_id=OsNip_03t0773000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32029765	32029878	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32028367	32029918	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0773050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32028367	32029918	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0773050-00;Parent=gene:OsNip_03g0773050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0773050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32029330	32029830	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0773050-00;Parent=transcript:OsNip_03t0773050-00;protein_id=OsNip_03t0773050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32029831	32029918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773050-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32034998	32040880	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0773100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32035018	32040880	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0773100-01;Parent=gene:OsNip_03g0773100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0773100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32035018	32035501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773100-01;Name=OsNip_03t0773100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0773100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32035018	32035501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32035594	32035731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0773100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32274107	32274174	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	CDS	32273362	32273457	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0778100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0778100-04;protein_id=OsNip_03t0778100-04;Tag=IsoSeq:G6502.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2991.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	CDS	32273217	32273249	.	-	.	ID=CDS:OsNip_03t0778100-04;Parent=transcript:OsNip_03t0778100-04;protein_id=OsNip_03t0778100-04;Tag=IsoSeq:G6502.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2991.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	32273082	32273214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778100-04;Tag=IsoSeq:G6502.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2991.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32307046	32308070	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0778400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32307046	32308070	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0778400-00;Parent=gene:OsNip_03g0778400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32307046	32307112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32307046	32307870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;Name=OsNip_03t0778400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0778400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32307113	32307733	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0778400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;protein_id=OsNip_03t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32307734	32307870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32307889	32308070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;Name=OsNip_03t0778400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0778400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32307889	32308070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0778400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32325402	32327052	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0779000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32378049	32378168	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0780800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0780800-02;protein_id=OsNip_03t0780800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32378049	32378380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0780800-02;Name=OsNip_03t0780800-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0780800-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32403269	32403449	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0781700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0781700-01;protein_id=OsNip_03t0781700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32403269	32403463	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0781700-01;Name=OsNip_03t0781700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0781700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32403450	32403463	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0781700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32404619	32404752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0781700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	32404619	32404752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0781700-02;Name=OsNip_03t0781700-02;exon_id=OsNip_03t0781700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6512.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G2998.1;prot_id "UniRef90_A0A6J1C5Q7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32434915	32435052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0782500-01;Name=OsNip_03t0782500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0782500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32587769	32588169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0785100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	32710464	32710662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787300-02;Tag=IsoSeq:G6540.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5160.4,Nipponbare.root_G3945.2,Nipponbare.panicle_G5160.1;prot_id "UniRef90_W1NE70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	32710792	32711340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787300-02;Tag=IsoSeq:G6540.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5160.4,Nipponbare.root_G3945.2,Nipponbare.panicle_G5160.1;prot_id "UniRef90_W1NE70";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32710472	32710661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787350-00;Name=OsNip_03t0787350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0787350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32711121	32711121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32711829	32712223	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0787400-01;Parent=gene:OsNip_03g0787400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_03t0787400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32711829	32712223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787400-01;Name=OsNip_03t0787400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0787400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32715361	32716250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787600-02;Name=OsNip_03t0787600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0787600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32716016	32716250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32715378	32715652	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32716016	32716307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32715699	32716283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0787500-00;Name=OsNip_03t0787500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0787500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32715699	32716283	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0787500-00;Parent=transcript:OsNip_03t0787500-00;protein_id=OsNip_03t0787500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32732162	32733002	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0788000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32732162	32733002	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0788000-00;Parent=gene:OsNip_03g0788000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0788000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32732162	32732556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0788000-00;Name=OsNip_03t0788000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0788000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32732162	32732556	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0788000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0788000-00;protein_id=OsNip_03t0788000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32732714	32733002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0788000-00;Name=OsNip_03t0788000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0788000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32732714	32733002	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0788000-00;Parent=transcript:OsNip_03t0788000-00;protein_id=OsNip_03t0788000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32736206	32737397	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0788100-01;Parent=gene:OsNip_03g0788100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0788100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32736206	32736310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0788100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32736206	32737397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0788100-01;Name=OsNip_03t0788100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0788100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32736311	32736937	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0788100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0788100-01;protein_id=OsNip_03t0788100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32811620	32811892	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789433-01;Name=OsNip_03t0789433-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789433-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	32811900	32811900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789433-02;Tag=IsoSeq:G6548.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3021.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W428";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	32810956	32811669	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789433-02;Tag=IsoSeq:G6548.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3021.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W428";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32820606	32821137	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789500-01;Name=OsNip_03t0789500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32821229	32821387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789500-01;Name=OsNip_03t0789500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0789500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32821382	32821387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32822526	32822978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32826350	32827244	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32826350	32828545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789600-01;Name=OsNip_03t0789600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32827245	32827343	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0789600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0789600-01;protein_id=OsNip_03t0789600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32827344	32828545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	32829161	32832483	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0789800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32829161	32832483	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0789800-01;Parent=gene:OsNip_03g0789800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32829161	32829807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32829161	32830712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Name=OsNip_03t0789800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32829808	32830008	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0789800-01;Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;protein_id=OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32830009	32830712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32830832	32830942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Name=OsNip_03t0789800-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-02-E3;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32830832	32830942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32831721	32832483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Name=OsNip_03t0789800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32831721	32832483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	32829837	32832470	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0789800-02;Parent=gene:OsNip_03g0789800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32829837	32829980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Name=OsNip_03t0789800-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0789800-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32829837	32829980	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0789800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;protein_id=OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	32830617	32830647	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0789800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;protein_id=OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32830617	32830712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Name=OsNip_03t0789800-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	32830832	32830942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Name=OsNip_03t0789800-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32830832	32830942	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	32831721	32831784	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Name=OsNip_03t0789800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0789800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32831721	32831784	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32832133	32832470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0789800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33065377	33070873	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0795000-01;Parent=gene:OsNip_03g0795000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0795000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33065377	33065860	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0795000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33066937	33067029	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0795000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0795000-01;protein_id=OsNip_03t0795000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33145989	33146079	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0796501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	gene	33169846	33172084	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0796600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33169846	33172084	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0796600-01;Parent=gene:OsNip_03g0796600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0796600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33169846	33170099	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0796600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	33317807	33318933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799250-00;Name=OsNip_03t0799250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0799250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	33320937	33321607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799300-01;Name=OsNip_03t0799300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0799300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33321328	33321607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	33324182	33324520	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0799400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33324182	33324520	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0799400-00;Parent=gene:OsNip_03g0799400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0799400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33324182	33324520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799400-00;Name=OsNip_03t0799400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0799400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33326961	33327125	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33328277	33333234	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0799600-01;Parent=gene:OsNip_03g0799600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33328277	33328401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33328402	33328477	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0799600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;protein_id=OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	33332429	33332564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;Name=OsNip_03t0799600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0799600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33332429	33332564	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0799600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;protein_id=OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33332850	33332876	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0799600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;protein_id=OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33332850	33333234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;Name=OsNip_03t0799600-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0799600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33332877	33333234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33328312	33333226	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0799600-02;Parent=gene:OsNip_03g0799600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0799600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33328312	33328401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33328312	33328477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0799600-02;Name=OsNip_03t0799600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0799600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33366995	33367110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0800050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	33471997	33472293	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802200-01;Name=OsNip_03t0802200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0802200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33474343	33474623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33474343	33474741	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Name=OsNip_03t0802300-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0802300-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33474624	33474741	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33474825	33475471	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Name=OsNip_03t0802300-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0802300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33474825	33475471	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33476364	33476475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Name=OsNip_03t0802300-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0802300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33476364	33476475	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33476727	33477511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Name=OsNip_03t0802300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0802300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33476727	33477511	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33478211	33478281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;Name=OsNip_03t0802300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0802300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33478211	33478281	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33479737	33480049	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0802300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0802300-02;protein_id=OsNip_03t0802300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	33519431	33520097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0803300-01;Name=OsNip_03t0803300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0803300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33690503	33690944	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33691167	33691217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33691337	33691419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33691337	33691470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;Name=OsNip_03t0806400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0806400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33691420	33691470	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0806400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;protein_id=OsNip_03t0806400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33692045	33692248	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0806400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0806400-01;protein_id=OsNip_03t0806400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33805847	33806193	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0808600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33973854	33974145	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0811400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0811400-00;protein_id=OsNip_03t0811400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	33974679	33975193	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0811400-00;Parent=transcript:OsNip_03t0811400-00;protein_id=OsNip_03t0811400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	33974679	33975525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0811400-00;Name=OsNip_03t0811400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0811400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33975194	33975525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0811400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	33988216	33991906	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0811500;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	33988216	33991906	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0811500-01;Parent=gene:OsNip_03g0811500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0811500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33988216	33988556	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0811500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34089399	34089787	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0813700-00;Parent=transcript:OsNip_03t0813700-00;protein_id=OsNip_03t0813700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34144737	34144865	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0814800-00;Parent=transcript:OsNip_03t0814800-00;protein_id=OsNip_03t0814800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34166782	34167521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815100-01;Name=OsNip_03t0815100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0815100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34167259	34167521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	34166100	34167543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815100-02;Name=OsNip_03t0815100-02;exon_id=OsNip_03t0815100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6670.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4028.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	34166101	34166679	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0815100-02;Parent=transcript:OsNip_03t0815100-02;protein_id=OsNip_03t0815100-02;Tag=IsoSeq:G6670.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4028.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	34166100	34166100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815100-02;Tag=IsoSeq:G6670.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4028.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	34166683	34167543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815100-02;Tag=IsoSeq:G6670.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4028.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	34167824	34173328	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0815200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	34167824	34173328	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0815200-01;Parent=gene:OsNip_03g0815200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0815200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34167824	34168139	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34167824	34168223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;Name=OsNip_03t0815200-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0815200-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34168140	34168223	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0815200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;protein_id=OsNip_03t0815200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34168555	34168889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;Name=OsNip_03t0815200-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0815200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34168555	34168889	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0815200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;protein_id=OsNip_03t0815200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34169343	34169520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0815200-01;Name=OsNip_03t0815200-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0815200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34260279	34262693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0816950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34266510	34266566	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0817000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0817000-01;protein_id=OsNip_03t0817000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34314649	34314729	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0817800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0817800-02;protein_id=OsNip_03t0817800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34382411	34382483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0819201-00;Name=OsNip_03t0819201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0819201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	34382759	34384359	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0819300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	34382759	34384359	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0819300-01;Parent=gene:OsNip_03g0819300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0819300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34382759	34382869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0819300-01;Name=OsNip_03t0819300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0819300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34382759	34382869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0819300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34398169	34398301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0819700-01;Name=OsNip_03t0819700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0819700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34400124	34400184	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0819700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0819700-01;protein_id=OsNip_03t0819700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34418600	34418780	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0820100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0820100-01;protein_id=OsNip_03t0820100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34418864	34419139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0820100-01;Name=OsNip_03t0820100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0820100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34418948	34419139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0820100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	34412904	34413052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0820100-02;Name=OsNip_03t0820100-02;exon_id=OsNip_03t0820100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6696.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5285.2;prot_id "UniRef90_UPI00053C71E0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34464738	34465037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0821250-00;Parent=transcript:OsNip_03t0821250-00;protein_id=OsNip_03t0821250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34465038	34465038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0821250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34471668	34471874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0821275-00;Name=OsNip_03t0821275-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0821275-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	34474697	34477056	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0821300-02;Parent=gene:OsNip_03g0821300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0821300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34474697	34474990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0821300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34474697	34475106	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0821300-02;Name=OsNip_03t0821300-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0821300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34474991	34475106	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0821300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0821300-02;protein_id=OsNip_03t0821300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34475244	34475508	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0821300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0821300-02;protein_id=OsNip_03t0821300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34476578	34476691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0821300-02;Name=OsNip_03t0821300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0821300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34540409	34540503	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0822800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0822800-02;protein_id=OsNip_03t0822800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34540660	34540869	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0822800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0822800-02;protein_id=OsNip_03t0822800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34540660	34541316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0822800-02;Name=OsNip_03t0822800-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0822800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34540870	34541316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0822800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	34539540	34541208	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0822800-03;Parent=gene:OsNip_03g0822800;transcript_id=OsNip_03t0822800-03;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1
Chr03	TAMA	exon	34539540	34539896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0822800-03;Name=OsNip_03t0822800-03;exon_id=OsNip_03t0822800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5G2H8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	34539542	34539896	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0822800-03;Parent=transcript:OsNip_03t0822800-03;protein_id=OsNip_03t0822800-03;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5G2H8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	34539978	34540149	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0822800-03;Name=OsNip_03t0822800-03;exon_id=OsNip_03t0822800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5G2H8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	CDS	34539978	34540060	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0822800-03;Parent=transcript:OsNip_03t0822800-03;protein_id=OsNip_03t0822800-03;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5G2H8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr03	TAMA	exon	34540409	34540503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0822800-03;Name=OsNip_03t0822800-03;exon_id=OsNip_03t0822800-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G6711.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3113.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5G2H8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34674294	34674491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0825500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34674979	34676276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0825600-02;Name=OsNip_03t0825600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0825600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34676020	34676276	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0825600-02;Parent=transcript:OsNip_03t0825600-02;protein_id=OsNip_03t0825600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34676871	34676918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0825600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	34675249	34676923	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0825600-01;Parent=gene:OsNip_03g0825600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0825600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34675249	34675388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0825600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	34675249	34676923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0825600-01;Name=OsNip_03t0825600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0825600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	34675389	34676870	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0825600-01;Parent=transcript:OsNip_03t0825600-01;protein_id=OsNip_03t0825600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	34707088	34707667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0826200-02;Tag=IsoSeq:G6732.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3123.1,Nipponbare.panicle_G5314.2;prot_id "UniRef90_Q8GRK6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	34710464	34710653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0826300-00;Name=OsNip_03t0826300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0826300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	34792025	34793842	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0828300-01;Parent=gene:OsNip_03g0828300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0828300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34883520	34883810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0830500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35051589	35052011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0834000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35103405	35103525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0835400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	35123591	35124074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0835950-00;Name=OsNip_03t0835950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0835950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	35127638	35127701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0836000-01;Name=OsNip_03t0836000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0836000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35127698	35127701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0836000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35255869	35258649	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0839000-01;Parent=gene:OsNip_03g0839000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0839000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35255869	35256090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0839000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35256091	35256203	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0839000-01;Parent=transcript:OsNip_03t0839000-01;protein_id=OsNip_03t0839000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35440538	35440649	.	+	1	ID=CDS:OsNip_03t0843200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843200-01;protein_id=OsNip_03t0843200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35440650	35440969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	35436869	35440968	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0843200-02;Parent=gene:OsNip_03g0843200;transcript_id=OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1
Chr03	TAMA	exon	35436869	35437055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Name=OsNip_03t0843200-02;exon_id=OsNip_03t0843200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	35436870	35437055	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0843200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;protein_id=OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	35437481	35437552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Name=OsNip_03t0843200-02;exon_id=OsNip_03t0843200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	35437481	35437552	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0843200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;protein_id=OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	exon	35437784	35437908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Name=OsNip_03t0843200-02;exon_id=OsNip_03t0843200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	exon	35440538	35440968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Name=OsNip_03t0843200-02;exon_id=OsNip_03t0843200-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	CDS	35440538	35440643	.	+	.	ID=CDS:OsNip_03t0843200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;protein_id=OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	five_prime_UTR	35436869	35436869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	35440647	35440968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843200-02;Tag=IsoSeq:G6805.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4115.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	35441296	35443615	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0843300;Name=OsNip_LEA7;biotype=protein_coding;description=Late;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35441296	35443574	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0843300-02;Parent=gene:OsNip_03g0843300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35441296	35441622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35441296	35441628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Name=OsNip_03t0843300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0843300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35441623	35441628	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;protein_id=OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35442320	35443264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843300-02;Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;protein_id=OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35442320	35443273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Name=OsNip_03t0843300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35443265	35443273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35443528	35443574	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Name=OsNip_03t0843300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35443528	35443574	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35441296	35443615	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0843300-01;Parent=gene:OsNip_03g0843300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35441296	35441622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35441296	35441628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Name=OsNip_03t0843300-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0843300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35441623	35441628	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;protein_id=OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35442320	35443264	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843300-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;protein_id=OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35442320	35443273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Name=OsNip_03t0843300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35443265	35443273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35443528	35443615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Name=OsNip_03t0843300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35443528	35443615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	35444425	35446363	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0843400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35444425	35446363	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0843400-01;Parent=gene:OsNip_03g0843400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0843400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35444425	35444466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35444425	35444880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;Name=OsNip_03t0843400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35444467	35444880	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0843400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;protein_id=OsNip_03t0843400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35445772	35446017	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0843400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;protein_id=OsNip_03t0843400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35445772	35446363	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;Name=OsNip_03t0843400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0843400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35446018	35446363	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	35446442	35452470	.	-	.	ID=gene:OsNip_03g0843500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35446442	35452470	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0843500-01;Parent=gene:OsNip_03g0843500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35446442	35446707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843500-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35446442	35446707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35446881	35447105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0843500-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35446881	35447105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35447181	35448052	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35447181	35448191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0843500-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35448053	35448191	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0843500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;protein_id=OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35448292	35448350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-02-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0843500-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35448292	35448350	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;protein_id=OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35449187	35449249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-02-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0843500-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35449187	35449249	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0843500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;protein_id=OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35449451	35449512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;Name=OsNip_03t0843500-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0843500-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35449451	35449512	.	-	2	ID=CDS:OsNip_03t0843500-01;Parent=transcript:OsNip_03t0843500-01;protein_id=OsNip_03t0843500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	TAMA	exon	35581972	35582424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t084639A-01;Name=OsNip_03t084639A-01-E1;exon_id=OsNip_03t084639A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6820.1;Source=Nipponbare.panicle_G5385.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr03	TAMA	three_prime_UTR	35582284	35582424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t084639A-01;Tag=IsoSeq:G6820.1;Source=Nipponbare.panicle_G5385.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	35589787	35596069	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0846400;biotype=protein_coding;description=Peptidase%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35589787	35596069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0846400-01;Parent=gene:OsNip_03g0846400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0846400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35589787	35589933	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0846400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35591762	35591863	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0846400-01;Parent=transcript:OsNip_03t0846400-01;protein_id=OsNip_03t0846400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	35666520	35666969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0848250-00;Name=OsNip_03t0848250-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0848250-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35666529	35666969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0848250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35829543	35829635	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0851100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;protein_id=OsNip_03t0851100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35829729	35829804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;Name=OsNip_03t0851100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0851100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35829729	35829804	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0851100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;protein_id=OsNip_03t0851100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35829930	35830120	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0851100-01;Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;protein_id=OsNip_03t0851100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35829930	35830202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;Name=OsNip_03t0851100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0851100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35830121	35830202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0851100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35910890	35911039	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0852900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;protein_id=OsNip_03t0852900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35911142	35911187	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0852900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;protein_id=OsNip_03t0852900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35911293	35911390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;Name=OsNip_03t0852900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0852900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35911293	35911390	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0852900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;protein_id=OsNip_03t0852900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35911510	35911680	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0852900-01;Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;protein_id=OsNip_03t0852900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35911510	35911694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;Name=OsNip_03t0852900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0852900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35911681	35911694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0852900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	35959766	35960595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853600-01;Name=OsNip_03t0853600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0853600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35960543	35960595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35965090	35965304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35965090	35968218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;Name=OsNip_03t0853700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0853700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35965305	35968172	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0853700-01;Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;protein_id=OsNip_03t0853700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35968173	35968218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35968318	35968402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;Name=OsNip_03t0853700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0853700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35968318	35968402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	TAMA	mRNA	35965127	35968271	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0853700-02;Parent=gene:OsNip_03g0853700;transcript_id=OsNip_03t0853700-02;Tag=IsoSeq:G6858.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5417.1
Chr03	TAMA	exon	35965127	35968271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-02;Name=OsNip_03t0853700-02;exon_id=OsNip_03t0853700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6858.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5417.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YLK2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr03	TAMA	five_prime_UTR	35967992	35968271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-02;Tag=IsoSeq:G6858.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5417.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YLK2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	TAMA	three_prime_UTR	35965127	35967629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853700-02;Tag=IsoSeq:G6858.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5417.1;prot_id "UniRef90_A0A1D1YLK2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr03	RAP2018-11-26	gene	35968541	35970513	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0853800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	35968541	35970470	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0853800-02;Parent=gene:OsNip_03g0853800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0853800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35968541	35968573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	35968541	35968679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0853800-02;Name=OsNip_03t0853800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0853800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35968574	35968679	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0853800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0853800-02;protein_id=OsNip_03t0853800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	35969460	35970136	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0853800-02;Parent=transcript:OsNip_03t0853800-02;protein_id=OsNip_03t0853800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36175331	36175370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36176423	36177622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36177845	36177906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Name=OsNip_03t0857200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0857200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36177845	36177906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36178397	36179073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Name=OsNip_03t0857200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0857200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36179318	36179350	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	CDS	36179351	36179611	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0857200-01;Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;protein_id=OsNip_03t0857200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36179612	36180182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	36177367	36180173	.	-	.	ID=transcript:OsNip_03t0857200-02;Parent=gene:OsNip_03g0857200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36177367	36177564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36177367	36177622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Name=OsNip_03t0857200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_03t0857200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	36177565	36177622	.	-	1	ID=CDS:OsNip_03t0857200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;protein_id=OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	36178397	36178485	.	-	0	ID=CDS:OsNip_03t0857200-02;Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;protein_id=OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36178397	36179073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Name=OsNip_03t0857200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0857200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36178486	36179073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36179318	36180173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Name=OsNip_03t0857200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0857200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36179318	36180173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	36177802	36177961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857301-00;Name=OsNip_03t0857301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_03t0857301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	36177802	36177961	.	+	0	ID=CDS:OsNip_03t0857301-00;Parent=transcript:OsNip_03t0857301-00;protein_id=OsNip_03t0857301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	exon	36178408	36178475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0857301-00;Name=OsNip_03t0857301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0857301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	CDS	36178408	36178475	.	+	2	ID=CDS:OsNip_03t0857301-00;Parent=transcript:OsNip_03t0857301-00;protein_id=OsNip_03t0857301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	36232503	36232916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0858400-01;Name=OsNip_03t0858400-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_03t0858400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	exon	36232653	36232911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0858400-02;Name=OsNip_03t0858400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_03t0858400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36353713	36354603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0861200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	36355129	36355194	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_03t0861200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	gene	36360645	36361743	.	+	.	ID=gene:OsNip_03g0861300;Name=OsNip_PIP2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr03	RAP2018-11-26	mRNA	36360645	36361743	.	+	.	ID=transcript:OsNip_03t0861300-01;Parent=gene:OsNip_03g0861300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_03t0861300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr03	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36386914	36387086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_03t0861900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	182523	182679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0102600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	354081	354314	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0105300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0105300-02;protein_id=OsNip_04t0105300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	354315	355463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0105300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	355225	355315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0105300-03;Tag=IsoSeq:G6923.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4196.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB533";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	370795	372419	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0105700-01;Parent=gene:OsNip_04g0105700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0105700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	370795	371042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0105700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	410669	412516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0106500-00;Name=OsNip_04t0106500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0106500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	619860	620008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0110600-02;Tag=IsoSeq:G6939.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4207.1,Nipponbare.leaf_G3216.1,Nipponbare.panicle_G5483.1;prot_id "UniRef90_A0A068U071";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	618741	618818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0110600-02;Tag=IsoSeq:G6939.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4207.1,Nipponbare.leaf_G3216.1,Nipponbare.panicle_G5483.1;prot_id "UniRef90_A0A068U071";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	617516	617989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0110600-02;Tag=IsoSeq:G6939.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4207.1,Nipponbare.leaf_G3216.1,Nipponbare.panicle_G5483.1;prot_id "UniRef90_A0A068U071";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	626696	627055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0110700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	627181	627394	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0110700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0110700-01;protein_id=OsNip_04t0110700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	639804	643247	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0111100-00;Parent=gene:OsNip_04g0111100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0111100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	837068	837306	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-01;Name=OsNip_04t0113800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0113800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	837072	837306	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	835500	837342	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0113800-02;Parent=gene:OsNip_04g0113800;transcript_id=OsNip_04t0113800-02;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2
Chr04	TAMA	exon	835500	835812	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;Name=OsNip_04t0113800-02;exon_id=OsNip_04t0113800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	835501	835812	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0113800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;protein_id=OsNip_04t0113800-02;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	exon	837065	837342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;Name=OsNip_04t0113800-02;exon_id=OsNip_04t0113800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	837065	837091	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0113800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;protein_id=OsNip_04t0113800-02;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	835500	835500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	837095	837342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0113800-02;Tag=IsoSeq:G6944.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3219.1,Nipponbare.root_G4208.1,Nipponbare.panicle_G5488.2,Nipponbare.panicle_G5488.1,Nipponbare.root_G4208.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3FHN8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	868089	868779	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0114300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	868089	868779	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0114300-00;Parent=gene:OsNip_04g0114300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0114300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	868089	868182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0114300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	868089	868779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0114300-00;Name=OsNip_04t0114300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0114300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	868183	868779	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0114300-00;Parent=transcript:OsNip_04t0114300-00;protein_id=OsNip_04t0114300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	885541	886249	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0114801;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	885541	886249	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0114801-00;Parent=gene:OsNip_04g0114801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0114801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	885541	885754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0114801-00;Name=OsNip_04t0114801-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0114801-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	885541	885754	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0114801-00;Parent=transcript:OsNip_04t0114801-00;protein_id=OsNip_04t0114801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	885972	886249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0114801-00;Name=OsNip_04t0114801-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0114801-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	885972	886249	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0114801-00;Parent=transcript:OsNip_04t0114801-00;protein_id=OsNip_04t0114801-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	944632	945366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0115800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1051881	1052153	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0117600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0117600-01;protein_id=OsNip_04t0117600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1098382	1098638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0118400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1096578	1096578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0118400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	1096578	1098615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0118400-02;Name=OsNip_04t0118400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0118400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1148894	1149270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	1149795	1149876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;Name=OsNip_04t0119500-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0119500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1149795	1149876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0119500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;protein_id=OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1150491	1150574	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0119500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;protein_id=OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1150666	1150848	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0119500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;protein_id=OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	1151180	1151354	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;Name=OsNip_04t0119500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0119500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1151180	1151354	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0119500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;protein_id=OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1151456	1151694	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0119500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;protein_id=OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	1151456	1151980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;Name=OsNip_04t0119500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0119500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1151695	1151980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	1148896	1151736	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0119500-03;Parent=gene:OsNip_04g0119500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0119500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1148896	1149270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0119500-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	1321044	1321287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0121800-01;Name=OsNip_04t0121800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0121800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1321127	1321287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0121800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	1325165	1327664	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0121900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	1325252	1327635	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0121900-01;Parent=gene:OsNip_04g0121900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0121900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1325252	1327205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0121900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	1369057	1370924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0122750-01;Name=OsNip_04t0122750-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0122750-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1754439	1754506	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0127800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1759155	1759240	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0127800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0127800-01;protein_id=OsNip_04t0127800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	1759337	1759735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0127800-01;Name=OsNip_04t0127800-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0127800-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1759557	1759735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0127800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1844672	1844935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	1844672	1846498	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129350-01;Name=OsNip_04t0129350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0129350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1844936	1845166	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0129350-01;Parent=transcript:OsNip_04t0129350-01;protein_id=OsNip_04t0129350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1845167	1846498	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	1848749	1851612	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0129400;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	1848749	1849281	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0129400-01;Parent=gene:OsNip_04g0129400;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0129400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	1848749	1849281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129400-01;Name=OsNip_04t0129400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0129400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	1848749	1851612	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0129400-02;Parent=gene:OsNip_04g0129400;transcript_id=OsNip_04t0129400-02;Tag=IsoSeq:G6970.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5504.1
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Chr04	TAMA	exon	1851113	1851191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129400-02;Name=OsNip_04t0129400-02;exon_id=OsNip_04t0129400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G6970.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5504.1;prot_id "UniRef90_A0A6P9ES60";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	1848749	1850366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129400-02;Name=OsNip_04t0129400-02;exon_id=OsNip_04t0129400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G6970.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5504.1;prot_id "UniRef90_A0A6P9ES60";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	1851113	1851191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129400-02;Tag=IsoSeq:G6970.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5504.1;prot_id "UniRef90_A0A6P9ES60";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	1864145	1864330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0129500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0129500-01;protein_id=OsNip_04t0129500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1864771	1865237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	1869708	1869962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129600-02;Tag=IsoSeq:G6972.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4224.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W766";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	1874562	1876811	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0129900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	1874562	1876811	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0129900-01;Parent=gene:OsNip_04g0129900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1874562	1874620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0129900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2371878	2372018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0136000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2372072	2372469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0136000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	2533768	2535289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0137883-00;Name=OsNip_04t0137883-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0137883-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2539347	2540743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0138432-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	2539347	2540950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0138432-01;Name=OsNip_04t0138432-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0138432-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	2540744	2540887	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0138432-01;Parent=transcript:OsNip_04t0138432-01;protein_id=OsNip_04t0138432-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2540888	2540950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0138432-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	2649112	2649831	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0138800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	2649112	2649831	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0138800-00;Parent=gene:OsNip_04g0138800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0138800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	2649112	2649831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0138800-00;Name=OsNip_04t0138800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0138800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	2667561	2669859	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0139100-00;Parent=gene:OsNip_04g0139100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0139100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	2667561	2669846	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0139100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0139100-00;protein_id=OsNip_04t0139100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	2667561	2669859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0139100-00;Name=OsNip_04t0139100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0139100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2669847	2669859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0139100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	2690138	2695153	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0139201-01;Parent=gene:OsNip_04g0139201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0139201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2690138	2691524	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0139201-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	2690138	2695153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0139201-01;Name=OsNip_04t0139201-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0139201-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	2891358	2891435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0142400-01;Name=OsNip_04t0142400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0142400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2891361	2891435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0142400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	2890536	2890728	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0142400-02;Tag=IsoSeq:G6984.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4234.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9W238";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	2889775	2890254	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0142400-02;Tag=IsoSeq:G6984.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4234.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9W238";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	gene	2910436	2913609	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g014284A;Tag=IsoSeq:G6985
Chr04	TAMA	mRNA	2910436	2913609	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t014284A-01;Parent=gene:OsNip_04g014284A;transcript_id=OsNip_04t014284A-01;Tag=IsoSeq:G6985.1;Source=Nipponbare.root_G4235.1
Chr04	TAMA	exon	2910436	2913609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t014284A-01;Name=OsNip_04t014284A-01-E1;exon_id=OsNip_04t014284A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6985.1;Source=Nipponbare.root_G4235.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0ICW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	2912884	2913609	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t014284A-01;Parent=transcript:OsNip_04t014284A-01;protein_id=OsNip_04t014284A-01;Tag=IsoSeq:G6985.1;Source=Nipponbare.root_G4235.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0ICW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	2910436	2912881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t014284A-01;Tag=IsoSeq:G6985.1;Source=Nipponbare.root_G4235.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0ICW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	2911041	2913410	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0142850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3241614	3242145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0146300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3298363	3298367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3299332	3299480	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3310275	3310510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3310741	3310905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	3311731	3311795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;Name=OsNip_04t0147600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0147600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3311731	3311795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	3312066	3312547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;Name=OsNip_04t0147600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0147600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	3312066	3312547	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0147600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0147600-01;protein_id=OsNip_04t0147600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	3410818	3412396	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0149400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	3411651	3412393	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0149400-01;Parent=gene:OsNip_04g0149400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	3411651	3411738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0149400-01;Name=OsNip_04t0149400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0149400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	3411651	3411738	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0149400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0149400-01;protein_id=OsNip_04t0149400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	4443034	4443184	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0165450-00;Name=OsNip_04t0165450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0165450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	4453265	4453430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0165600-01;Name=OsNip_04t0165600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0165600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4453265	4453430	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0165600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0165600-01;protein_id=OsNip_04t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4454873	4454980	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0165600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0165600-01;protein_id=OsNip_04t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4454873	4455350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0165600-01;Name=OsNip_04t0165600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0165600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4457411	4457656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0165700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4457411	4457755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0165700-01;Name=OsNip_04t0165700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0165700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4457847	4457927	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0165700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0165700-01;protein_id=OsNip_04t0165700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4545744	4545771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	4557167	4558430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t016770A-01;Name=OsNip_04t016770A-01-E1;exon_id=OsNip_04t016770A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G6999.1;Source=Nipponbare.panicle_G5523.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3K9J8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	4557167	4557168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t016770A-01;Tag=IsoSeq:G6999.1;Source=Nipponbare.panicle_G5523.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3K9J8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	4557772	4558430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t016770A-01;Tag=IsoSeq:G6999.1;Source=Nipponbare.panicle_G5523.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3K9J8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	4599353	4604670	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0167701-01;Parent=gene:OsNip_04g0167701;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0167701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4599353	4601165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167701-01;Name=OsNip_04t0167701-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0167701-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4603316	4604670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167701-01;Name=OsNip_04t0167701-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0167701-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	4638237	4640929	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0167800-01;Parent=gene:OsNip_04g0167800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0167800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4638237	4638359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4638237	4638584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;Name=OsNip_04t0167800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0167800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4638360	4638584	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0167800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;protein_id=OsNip_04t0167800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4640097	4640885	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0167800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;protein_id=OsNip_04t0167800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4640097	4640929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;Name=OsNip_04t0167800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0167800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4640886	4640929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0167800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	4874385	4878321	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0171800-01;Parent=gene:OsNip_04g0171800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0171800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4874385	4875699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4874385	4876713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;Name=OsNip_04t0171800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0171800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4875700	4876713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0171800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;protein_id=OsNip_04t0171800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	4877340	4877978	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0171800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;protein_id=OsNip_04t0171800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4877340	4878321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;Name=OsNip_04t0171800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0171800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4877979	4878321	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	4874375	4878331	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0171800-02;Parent=gene:OsNip_04g0171800;transcript_id=OsNip_04t0171800-02;Tag=IsoSeq:G7004.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5528.4
Chr04	TAMA	exon	4874375	4878331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-02;Name=OsNip_04t0171800-02;exon_id=OsNip_04t0171800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7004.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5528.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	4875700	4876824	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0171800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0171800-02;protein_id=OsNip_04t0171800-02;Tag=IsoSeq:G7004.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5528.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	4874375	4875699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-02;Tag=IsoSeq:G7004.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5528.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	4876828	4878331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0171800-02;Tag=IsoSeq:G7004.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5528.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	4915137	4916720	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0172100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	4915137	4916720	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0172100-01;Parent=gene:OsNip_04g0172100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4915137	4916013	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4915137	4916720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0172100-01;Name=OsNip_04t0172100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0172100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4916143	4916720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	4921974	4921975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t017239A-01;Tag=IsoSeq:G7005.1;Source=Nipponbare.panicle_G5529.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	4921389	4921416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t017239A-01;Tag=IsoSeq:G7005.1;Source=Nipponbare.panicle_G5529.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4925468	4925539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0172400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4965529	4965623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4965529	4965778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173300-01;Name=OsNip_04t0173300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0173300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4969979	4974802	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	4969979	4975272	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173300-03;Name=OsNip_04t0173300-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0173300-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	5005112	5006206	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0173800-01;Parent=gene:OsNip_04g0173800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5005112	5005452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	5005112	5006206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173800-01;Name=OsNip_04t0173800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0173800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5005453	5006136	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0173800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0173800-01;protein_id=OsNip_04t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5006137	5006206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0173800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5041230	5041910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0174100-00;Name=OsNip_04t0174100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0174100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	5058331	5061257	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0174200-01;Parent=gene:OsNip_04g0174200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0174200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5058611	5059855	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0174200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5060449	5060539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0174200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5152089	5152757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0175500-00;Name=OsNip_04t0175500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0175500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5166736	5166803	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0175600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0175600-01;protein_id=OsNip_04t0175600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5166960	5167404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0175600-01;Name=OsNip_04t0175600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0175600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5167260	5167404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0175600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5185988	5186485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0175900-01;Name=OsNip_04t0175900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0175900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5186285	5186485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0175900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	5189974	5194492	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0176200-00;Parent=gene:OsNip_04g0176200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0176200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5189974	5190273	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0176200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0176200-00;protein_id=OsNip_04t0176200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5190424	5190488	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0176200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0176200-00;protein_id=OsNip_04t0176200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	5194150	5194492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0176200-00;Name=OsNip_04t0176200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0176200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5194150	5194492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0176200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0176200-00;protein_id=OsNip_04t0176200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	5210111	5216557	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0176300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5210111	5210244	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0176300-00;Name=OsNip_04t0176300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0176300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5210111	5210244	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0176300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	5592612	5596585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0182250-01;Name=OsNip_04t0182250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0182250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5594155	5594403	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0182250-01;Parent=transcript:OsNip_04t0182250-01;protein_id=OsNip_04t0182250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5868179	5868179	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0186800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	5865174	5867983	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0187001-00;Parent=gene:OsNip_04g0187001;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0187001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	5865174	5865427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0187001-00;Name=OsNip_04t0187001-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0187001-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5865529	5865790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0187001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	5989708	5989977	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0188500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0188500-01;protein_id=OsNip_04t0188500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5989978	5990234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0188500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	6011986	6012256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t018939B-01;Tag=IsoSeq:G7031.1;Source=Nipponbare.root_G4261.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T7I2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	8455297	8455412	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0226400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;protein_id=OsNip_04t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	8456482	8456630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Name=OsNip_04t0226400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0226400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8456512	8456630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8457141	8460691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	8460853	8461041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Name=OsNip_04t0226400-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0226400-02-E8;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8460853	8461041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	8461138	8461439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Name=OsNip_04t0226400-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0226400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8461138	8461439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	8453829	8461494	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0226400-02;Parent=gene:OsNip_04g0226400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0226400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	8474486	8474587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;Name=OsNip_04t0226600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0226600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8474486	8474587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8474722	8474843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	8474722	8476142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;Name=OsNip_04t0226600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0226600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	8474844	8476031	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0226600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;protein_id=OsNip_04t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8476032	8476142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	8474722	8476048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-02;Name=OsNip_04t0226600-02;exon_id=OsNip_04t0226600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7062.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5573.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	8474850	8476046	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0226600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0226600-02;protein_id=OsNip_04t0226600-02;Tag=IsoSeq:G7062.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5573.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	8476047	8476048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-02;Tag=IsoSeq:G7062.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5573.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	8474722	8474847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0226600-02;Tag=IsoSeq:G7062.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5573.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	8585216	8585626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228000-01;Name=OsNip_04t0228000-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0228000-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	8587855	8587977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228100-01;Name=OsNip_04t0228100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0228100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8589342	8589448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8589860	8589905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8590051	8591016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8591111	8591458	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	8591569	8591630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Name=OsNip_04t0228300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0228300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8591569	8591630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8591706	8591783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0228300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8767202	8767366	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0231266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	8767202	8767534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0231266-00;Name=OsNip_04t0231266-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0231266-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	8767367	8767534	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0231266-00;Parent=transcript:OsNip_04t0231266-00;protein_id=OsNip_04t0231266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	8811012	8815165	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0231800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	8811012	8815165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0231800-01;Parent=gene:OsNip_04g0231800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0231800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9347671	9347712	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0244500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	9571289	9572114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0247700-00;Name=OsNip_04t0247700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0247700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9661934	9662137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0249500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	9662307	9662330	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0249500-00;Name=OsNip_04t0249500-00-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0249500-00-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	9663369	9663589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0249500-00;Name=OsNip_04t0249500-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0249500-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	10094318	10094339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t025552A-01;Tag=IsoSeq:G7109.1;Source=Nipponbare.panicle_G5602.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	10104695	10104870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t025552A-01;Tag=IsoSeq:G7109.1;Source=Nipponbare.panicle_G5602.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11084856	11085362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0268300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11131281	11131484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0268700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	11180119	11183765	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0269100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	11180119	11183765	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0269100-00;Parent=gene:OsNip_04g0269100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0269100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11180119	11180417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269100-00;Name=OsNip_04t0269100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0269100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11180119	11180417	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0269100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0269100-00;protein_id=OsNip_04t0269100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11180945	11181152	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269100-00;Name=OsNip_04t0269100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0269100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11252807	11253012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269700-01;Name=OsNip_04t0269700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0269700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11252844	11253012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11253292	11254736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269700-01;Name=OsNip_04t0269700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0269700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11253292	11254736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	11255676	11258882	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0269800-01;Parent=gene:OsNip_04g0269800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0269800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11255676	11256102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0269800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11274115	11274165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0270100-02;Name=OsNip_04t0270100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0270100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11274115	11274165	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0270100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0270100-02;protein_id=OsNip_04t0270100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11274512	11274598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0270100-02;Name=OsNip_04t0270100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0270100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11274512	11274598	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0270100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0270100-02;protein_id=OsNip_04t0270100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11463433	11464047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0273350-01;Name=OsNip_04t0273350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0273350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	11472037	11473585	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0273600-00;Parent=gene:OsNip_04g0273600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0273600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11472037	11473185	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0273600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0273600-00;protein_id=OsNip_04t0273600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11472037	11473585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0273600-00;Name=OsNip_04t0273600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0273600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11483033	11483110	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0273900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0273900-00;protein_id=OsNip_04t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11483228	11483353	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0273900-00;Name=OsNip_04t0273900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0273900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11483228	11483353	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0273900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0273900-00;protein_id=OsNip_04t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11483531	11483719	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0273900-00;Name=OsNip_04t0273900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0273900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11483531	11483719	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0273900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0273900-00;protein_id=OsNip_04t0273900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11498702	11499541	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0274100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0274100-00;protein_id=OsNip_04t0274100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11498702	11499639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0274100-00;Name=OsNip_04t0274100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0274100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11499542	11499639	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0274100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11684138	11684694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0276600-01;Name=OsNip_04t0276600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0276600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11721670	11721804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0277400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11745894	11747090	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278000-01;Name=OsNip_04t0278000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0278000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11747201	11747620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278101-00;Name=OsNip_04t0278101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0278101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11747855	11748419	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0278100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0278100-00;protein_id=OsNip_04t0278100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11750172	11750502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278100-00;Name=OsNip_04t0278100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0278100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11750261	11750502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	11764702	11797975	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0278200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11764702	11765213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278200-01;Name=OsNip_04t0278200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0278200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11764702	11765213	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11765402	11765473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	11765402	11765485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0278200-01;Name=OsNip_04t0278200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0278200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	11765474	11765485	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0278200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0278200-01;protein_id=OsNip_04t0278200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11886974	11887112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0280200-01;Name=OsNip_04t0280200-01-E25;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0280200-01-E25;rank=25;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	11936040	11936662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0280700-01;Name=OsNip_04t0280700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0280700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12035120	12035715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	12047968	12048694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282200-01;Name=OsNip_04t0282200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0282200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12048048	12048694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12062977	12063386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12062977	12063828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282400-01;Name=OsNip_04t0282400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0282400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12063387	12063743	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0282400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0282400-01;protein_id=OsNip_04t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12063744	12063828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0282400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12385421	12385880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0286500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12385881	12387134	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0286500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0286500-01;protein_id=OsNip_04t0286500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12387135	12387320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0286500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12425564	12425646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0287400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	12627398	12628669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-01;Name=OsNip_04t0290400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12627739	12627999	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0290400-01;protein_id=OsNip_04t0290400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12628000	12628669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	12627394	12628386	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0290400-02;Parent=gene:OsNip_04g0290400;transcript_id=OsNip_04t0290400-02;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1
Chr04	TAMA	exon	12627394	12627665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-02;Name=OsNip_04t0290400-02;exon_id=OsNip_04t0290400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0P2B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	exon	12627741	12628386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-02;Name=OsNip_04t0290400-02;exon_id=OsNip_04t0290400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0P2B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	12627741	12627821	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0290400-02;Parent=transcript:OsNip_04t0290400-02;protein_id=OsNip_04t0290400-02;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0P2B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	12627394	12627395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-02;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0P2B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	12627825	12628386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290400-02;Tag=IsoSeq:G7139.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5625.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0P2B3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	12628440	12630654	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0290450-01;Parent=gene:OsNip_04g0290450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0290450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12628440	12630280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12628440	12630654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290450-01;Name=OsNip_04t0290450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12630281	12630526	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0290450-01;Parent=transcript:OsNip_04t0290450-01;protein_id=OsNip_04t0290450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12630527	12630654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	12645868	12651707	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0290800;Name=OsNip_RUS1;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	12645868	12651648	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0290800-00;Parent=gene:OsNip_04g0290800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12645868	12645948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12645868	12646644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Name=OsNip_04t0290800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12645949	12646644	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12646750	12647025	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Name=OsNip_04t0290800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0290800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12646750	12647025	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12647754	12647810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Name=OsNip_04t0290800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0290800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12649060	12649258	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12650362	12650468	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12650681	12650854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Name=OsNip_04t0290800-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0290800-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12650681	12650854	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12650939	12651211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0290800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;protein_id=OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12650939	12651293	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Name=OsNip_04t0290800-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0290800-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12651212	12651293	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12651349	12651648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	12651265	12651707	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0290800-01;Parent=gene:OsNip_04g0290800;transcript_id=OsNip_04t0290800-01;Tag=IsoSeq:G7140.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4304.1
Chr04	TAMA	exon	12651265	12651707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-01;Name=OsNip_04t0290800-01;exon_id=OsNip_04t0290800-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7140.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4304.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	12651480	12651614	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0290800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0290800-01;protein_id=OsNip_04t0290800-01;Tag=IsoSeq:G7140.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4304.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	12651265	12651479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-01;Tag=IsoSeq:G7140.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4304.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	12651618	12651707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290800-01;Tag=IsoSeq:G7140.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4304.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	12646034	12649199	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0290750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	12646034	12649199	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0290750-00;Parent=gene:OsNip_04g0290750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12646034	12646298	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0290750-00;Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;protein_id=OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12646034	12646642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Name=OsNip_04t0290750-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290750-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12646299	12646642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12646748	12647032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Name=OsNip_04t0290750-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290750-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12646748	12647032	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12647762	12647805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Name=OsNip_04t0290750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12647762	12647805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	12649053	12649199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Name=OsNip_04t0290750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0290750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12649053	12649199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0290750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	12661871	12668589	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0291000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	12957074	12957248	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0295100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0295100-00;protein_id=OsNip_04t0295100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	12955613	12955913	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295100-01;Tag=IsoSeq:G7143.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4306.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0H0U9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13026796	13026948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-00;Name=OsNip_04t0295901-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0295901-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13026872	13026948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	13026955	13027633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-00;Name=OsNip_04t0295901-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0295901-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13026955	13027633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13027650	13029118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	13026503	13027182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-01;Name=OsNip_04t0295901-01;exon_id=OsNip_04t0295901-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7145.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5628.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W888";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	13026503	13026503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-01;Tag=IsoSeq:G7145.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5628.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W888";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	13026645	13027182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0295901-01;Tag=IsoSeq:G7145.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5628.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0W888";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	13056659	13057081	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0296034-00;Parent=gene:OsNip_04g0296034;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0296034-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	13056659	13057081	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0296034-00;Name=OsNip_04t0296034-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0296034-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	13155049	13155441	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0297800-02;Tag=IsoSeq:G7147.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3316.2;prot_id "UniRef90_Q01MJ1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13193351	13195231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0298501-00;Name=OsNip_04t0298501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0298501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13193351	13195231	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0298501-00;Parent=transcript:OsNip_04t0298501-00;protein_id=OsNip_04t0298501-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13203419	13203470	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0298600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0298600-00;protein_id=OsNip_04t0298600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13311590	13311971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0300100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	13610010	13610358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0303900-02;Tag=IsoSeq:G7152.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5634.2;prot_id "UniRef90_UPI0009E4EA4A";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13610848	13611136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;Name=OsNip_04t0303950-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0303950-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13611566	13613535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;Name=OsNip_04t0303950-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0303950-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13611566	13613535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13615044	13615154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;Name=OsNip_04t0303950-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0303950-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13615044	13615154	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0303950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;protein_id=OsNip_04t0303950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13615924	13616050	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0303950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0303950-01;protein_id=OsNip_04t0303950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13820520	13820521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13821684	13822178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13822854	13822960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Name=OsNip_04t0306800-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0306800-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13822854	13822960	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0306800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;protein_id=OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	13825029	13825137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Name=OsNip_04t0306800-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0306800-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13825226	13825950	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0306800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;protein_id=OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	13827214	13827298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Name=OsNip_04t0306800-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0306800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13827214	13827298	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0306800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;protein_id=OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13827383	13827568	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0306800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;protein_id=OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	13827383	13827569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Name=OsNip_04t0306800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0306800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13827569	13827569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0306800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	13926309	13928367	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0308000-01;Parent=gene:OsNip_04g0308000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0308000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13926927	13927007	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0308000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0308000-01;protein_id=OsNip_04t0308000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	13928112	13928126	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0308000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0308000-01;protein_id=OsNip_04t0308000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	13928112	13928367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0308000-01;Name=OsNip_04t0308000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0308000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13928127	13928367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0308000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	13926309	13928366	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0308000-04;Parent=gene:OsNip_04g0308000;transcript_id=OsNip_04t0308000-04;Tag=IsoSeq:G7158.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5639.1
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14558934	14559183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0317800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14675326	14675711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0319600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	14716344	14716700	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0320100-02;Name=OsNip_04t0320100-02-E18;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0320100-02-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	14969826	14971280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0324000-01;Name=OsNip_04t0324000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0324000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	14969920	14971443	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0324100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0324100-01;protein_id=OsNip_04t0324100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14971444	14971484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0324100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	14988695	14988997	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0324400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0324400-00;protein_id=OsNip_04t0324400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	15006079	15010473	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0324550;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	15006079	15010473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0324550-01;Name=OsNip_04t0324550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0324550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	15007851	15008150	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0324550-01;Parent=transcript:OsNip_04t0324550-01;protein_id=OsNip_04t0324550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15008151	15010473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0324550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	15025499	15026024	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0324750;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	15025499	15026024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0324750-00;Name=OsNip_04t0324750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0324750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	15067485	15069035	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0325300-01;Parent=gene:OsNip_04g0325300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0325300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15067485	15067485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	15067485	15068615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;Name=OsNip_04t0325300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0325300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	15067486	15068598	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0325300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;protein_id=OsNip_04t0325300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15068599	15068615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	15068730	15069035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;Name=OsNip_04t0325300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0325300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15068730	15069035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0325300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	15098152	15107087	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0326000-00;Parent=gene:OsNip_04g0326000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0326000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	15098152	15098256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0326000-00;Name=OsNip_04t0326000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0326000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	15098152	15098256	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0326000-00;Parent=transcript:OsNip_04t0326000-00;protein_id=OsNip_04t0326000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	15098591	15098794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0326000-00;Name=OsNip_04t0326000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0326000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	15098881	15098952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0326000-00;Name=OsNip_04t0326000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0326000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15845377	15845448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0337000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	15845558	15848609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0337000-01;Name=OsNip_04t0337000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0337000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	15848927	15849032	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0337000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0337000-01;protein_id=OsNip_04t0337000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	16542057	16542602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0347600-01;Name=OsNip_04t0347600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0347600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	16706824	16707387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0350300-00;Name=OsNip_04t0350300-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0350300-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17044448	17046749	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0356800-00;Parent=gene:OsNip_04g0356800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0356800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17044448	17044718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17044448	17045159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;Name=OsNip_04t0356800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0356800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17044719	17045009	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0356800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;protein_id=OsNip_04t0356800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17045010	17045159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17045322	17046749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;Name=OsNip_04t0356800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0356800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17045322	17046749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0356800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17056567	17056848	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0357000-00;Parent=transcript:OsNip_04t0357000-00;protein_id=OsNip_04t0357000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17056567	17056898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0357000-00;Name=OsNip_04t0357000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0357000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17056849	17056898	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0357000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	17061923	17071581	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0357200;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17061923	17071581	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0357200-01;Parent=gene:OsNip_04g0357200;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0357200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17061923	17062155	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0357200-01;Name=OsNip_04t0357200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0357200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17063344	17063514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0357200-01;Name=OsNip_04t0357200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0357200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	17201224	17203486	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0359700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	17202659	17203486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359700-00;Name=OsNip_04t0359700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0359700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17202657	17203116	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0360400-00;Parent=gene:OsNip_04g0360400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0360400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17202657	17203114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0360400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0360400-00;protein_id=OsNip_04t0360400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17202657	17203116	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360400-00;Name=OsNip_04t0360400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0360400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17203115	17203116	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17207053	17208964	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0359900-00;Parent=gene:OsNip_04g0359900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0359900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17207053	17207319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17207053	17207648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;Name=OsNip_04t0359900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0359900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17207320	17207538	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0359900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;protein_id=OsNip_04t0359900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17207539	17207648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17207851	17208964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;Name=OsNip_04t0359900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0359900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17207851	17208964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	17208711	17208890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0359900-01;Tag=IsoSeq:G7217.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3341.1;prot_id "UniRef90_Q7FA33";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	17258661	17263088	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0360500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17258661	17263088	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0360500-01;Parent=gene:OsNip_04g0360500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0360500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17258661	17259758	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;Name=OsNip_04t0360500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0360500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17258661	17259758	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17260264	17262172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17260264	17263088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;Name=OsNip_04t0360500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0360500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17262173	17263087	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0360500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;protein_id=OsNip_04t0360500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17263088	17263088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	17258899	17263021	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0360650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17258899	17263021	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0360650-00;Parent=gene:OsNip_04g0360650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0360650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17258899	17259711	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0360650-00;Parent=transcript:OsNip_04t0360650-00;protein_id=OsNip_04t0360650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17258899	17259729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360650-00;Name=OsNip_04t0360650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0360650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17259712	17259729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17260242	17260531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0360650-00;Name=OsNip_04t0360650-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0360650-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	17491635	17492026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0363700-02;Tag=IsoSeq:G7219.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3342.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KPE8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	17906102	17907396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0368800-01;Tag=IsoSeq:G7222.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5681.1;prot_id "UniRef90_A0A287JW81";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	17913242	17914650	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0369000;Name=OsNip_RLCK144;biotype=protein_coding;description=PapD-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	17913242	17914650	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0369000-01;Parent=gene:OsNip_04g0369000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0369000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17913242	17913436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0369000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	17913242	17914650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0369000-01;Name=OsNip_04t0369000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0369000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	17913437	17913850	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0369000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0369000-01;protein_id=OsNip_04t0369000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17913851	17914650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0369000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18136259	18136512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372100-00;Name=OsNip_04t0372100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0372100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18169980	18170121	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0372700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0372700-01;protein_id=OsNip_04t0372700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18170821	18170981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372700-01;Name=OsNip_04t0372700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0372700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18171653	18171807	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372775-00;Name=OsNip_04t0372775-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0372775-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	18172160	18177058	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0372800;biotype=protein_coding;description=Nucleotide-binding%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18172160	18177058	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0372800-01;Parent=gene:OsNip_04g0372800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0372800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18172160	18172514	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18172160	18172765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372800-01;Name=OsNip_04t0372800-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0372800-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18172515	18172765	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0372800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0372800-01;protein_id=OsNip_04t0372800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18173231	18173297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0372800-01;Name=OsNip_04t0372800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0372800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18468382	18468526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0378066-00;Name=OsNip_04t0378066-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0378066-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18468382	18468526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0378066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18469562	18469614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0378066-00;Name=OsNip_04t0378066-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0378066-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18469562	18469614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0378066-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	18478743	18480229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0378400-02;Tag=IsoSeq:G7239.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5693.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z9F2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18591516	18591644	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18593909	18594311	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0380000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;protein_id=OsNip_04t0380000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18594783	18594864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;Name=OsNip_04t0380000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0380000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18594786	18594864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18595367	18595952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;Name=OsNip_04t0380000-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0380000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18595367	18595952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	18603362	18603633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380300-03;Tag=IsoSeq:G7246.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4354.1;prot_id "UniRef90_A0A200R4A5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	18602677	18603104	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0380300-03;Tag=IsoSeq:G7246.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4354.1;prot_id "UniRef90_A0A200R4A5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18694087	18694225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0381400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18695867	18695867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0381500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18695867	18696438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0381500-01;Name=OsNip_04t0381500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0381500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18695868	18696275	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0381500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0381500-01;protein_id=OsNip_04t0381500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18742798	18743199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	18740826	18742760	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0382250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18740826	18741101	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18741460	18741651	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0382250-00;Parent=transcript:OsNip_04t0382250-00;protein_id=OsNip_04t0382250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18741460	18742760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382250-00;Name=OsNip_04t0382250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0382250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18741652	18742760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18746928	18752050	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0382300-01;Parent=gene:OsNip_04g0382300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18746928	18747140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18746928	18747438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Name=OsNip_04t0382300-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0382300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18747141	18747438	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0382300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;protein_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18747615	18747778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Name=OsNip_04t0382300-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0382300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18747615	18747778	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0382300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;protein_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18748642	18748848	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0382300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;protein_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18749433	18749605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Name=OsNip_04t0382300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0382300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18749433	18749605	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0382300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;protein_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18751691	18751850	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0382300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;protein_id=OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18751691	18752050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Name=OsNip_04t0382300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0382300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18751851	18752050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18746934	18749519	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0382300-03;Parent=gene:OsNip_04g0382300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0382300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18746934	18747140	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18774541	18774699	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0382700-02;Parent=transcript:OsNip_04t0382700-02;protein_id=OsNip_04t0382700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18775464	18775820	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0382700-02;Parent=transcript:OsNip_04t0382700-02;protein_id=OsNip_04t0382700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18775464	18776122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382700-02;Name=OsNip_04t0382700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0382700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18775821	18776122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0382700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18827449	18827529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	18846357	18846806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t038419A-02;Tag=IsoSeq:G7256.2;Source=Nipponbare.panicle_G5703.1,Nipponbare.root_G4361.2;prot_id "UniRef90_A0A6G1F4X4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18847035	18850569	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0384200-01;Parent=gene:OsNip_04g0384200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0384200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18849139	18849266	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0384200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;protein_id=OsNip_04t0384200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18849797	18849869	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0384200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;protein_id=OsNip_04t0384200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18849797	18849915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;Name=OsNip_04t0384200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0384200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18849870	18849915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18850333	18850569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;Name=OsNip_04t0384200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0384200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18850333	18850569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	18869479	18870143	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0384650;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18869479	18870143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0384650-01;Parent=gene:OsNip_04g0384650;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0384650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18869479	18870143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0384650-01;Name=OsNip_04t0384650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0384650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18976091	18976701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386300-01;Name=OsNip_04t0386300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0386300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	18976024	18976609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386300-02;Tag=IsoSeq:G7261.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5707.2;prot_id "UniRef90_I1P669";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	18984714	18987800	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0386500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	18984714	18987786	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0386500-01;Parent=gene:OsNip_04g0386500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0386500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18984714	18984715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18984714	18984888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Name=OsNip_04t0386500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0386500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18984953	18985038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Name=OsNip_04t0386500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0386500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18985645	18985748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Name=OsNip_04t0386500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0386500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18986414	18986527	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Name=OsNip_04t0386500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0386500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	18986414	18986527	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0386500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;protein_id=OsNip_04t0386500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	18986953	18987036	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386500-01;Name=OsNip_04t0386500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0386500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	18998460	18998714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0386900-01;Name=OsNip_04t0386900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0386900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	19020605	19037718	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0387300-01;Parent=gene:OsNip_04g0387300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19020605	19020807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Name=OsNip_04t0387300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0387300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	19035985	19036109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Name=OsNip_04t0387300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0387300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19036003	19036109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19036191	19036290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19036890	19036925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Name=OsNip_04t0387300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0387300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19036890	19036925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19037090	19037164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Name=OsNip_04t0387300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0387300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19037090	19037164	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19037263	19037718	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Name=OsNip_04t0387300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0387300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19037263	19037718	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	19042718	19043129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t038759A-01;Name=OsNip_04t038759A-01-E1;exon_id=OsNip_04t038759A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7266.1;Source=Nipponbare.root_G4365.1;prot_id "UniRef90_A0A446L2E5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	19042718	19043129	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t038759A-01;Parent=transcript:OsNip_04t038759A-01;protein_id=OsNip_04t038759A-01;Tag=IsoSeq:G7266.1;Source=Nipponbare.root_G4365.1;prot_id "UniRef90_A0A446L2E5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	CDS	19056142	19056220	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t038759A-01;Parent=transcript:OsNip_04t038759A-01;protein_id=OsNip_04t038759A-01;Tag=IsoSeq:G7266.1;Source=Nipponbare.root_G4365.1;prot_id "UniRef90_A0A446L2E5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19191986	19192319	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	19230646	19231904	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390600-02;Name=OsNip_04t0390600-02;exon_id=OsNip_04t0390600-02-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G7276.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5721.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	19230646	19231577	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0390600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0390600-02;protein_id=OsNip_04t0390600-02;Tag=IsoSeq:G7276.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5721.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	19231581	19231904	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390600-02;Tag=IsoSeq:G7276.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5721.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	19233125	19235143	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0390700-01;Parent=gene:OsNip_04g0390700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19233125	19233229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19233125	19233662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;Name=OsNip_04t0390700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0390700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	19233230	19233662	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0390700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;protein_id=OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19233779	19233864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;Name=OsNip_04t0390700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0390700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	19233779	19233864	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0390700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;protein_id=OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	19234476	19234640	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0390700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;protein_id=OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	19234743	19235143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;Name=OsNip_04t0390700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0390700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19235034	19235143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	19236654	19236866	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0390800-01;Name=OsNip_04t0390800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0390800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	19376535	19376814	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0394100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0394100-00;protein_id=OsNip_04t0394100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19376535	19376820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0394100-00;Name=OsNip_04t0394100-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0394100-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19376815	19376820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0394100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19566018	19566088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19566314	19566316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19566527	19566769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396550-01;Name=OsNip_04t0396550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0396550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19566527	19566769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19591901	19591953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19591901	19592215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0396800-01;Name=OsNip_04t0396800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0396800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	19591954	19592215	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0396800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0396800-01;protein_id=OsNip_04t0396800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	19600460	19600818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0397000-01;Name=OsNip_04t0397000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0397000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19600544	19600818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0397000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	19601466	19601625	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0397100-02;Parent=gene:OsNip_04g0397100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0397100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19601466	19601625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0397100-02;Name=OsNip_04t0397100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0397100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	19601504	19603306	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0397100-01;Parent=gene:OsNip_04g0397100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0397100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19601504	19601813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0397100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	19601504	19602992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0397100-01;Name=OsNip_04t0397100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0397100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	19695374	19709946	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0398800-01;Parent=gene:OsNip_04g0398800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0398800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20014743	20015303	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0403400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0403400-01;protein_id=OsNip_04t0403400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20014743	20015529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403400-01;Name=OsNip_04t0403400-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0403400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20015304	20015529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20012986	20015300	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0403450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20013903	20014025	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403450-00;Name=OsNip_04t0403450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0403450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20014135	20014348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403450-00;Name=OsNip_04t0403450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0403450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	20012986	20015300	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0403450-01;Parent=gene:OsNip_04g0403450;transcript_id=OsNip_04t0403450-01;Tag=IsoSeq:G7311.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5755.1
Chr04	TAMA	exon	20012986	20015300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403450-01;Name=OsNip_04t0403450-01;exon_id=OsNip_04t0403450-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7311.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5755.1;prot_id "UniRef90_B8BCC1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	20014480	20014647	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0403450-01;Parent=transcript:OsNip_04t0403450-01;protein_id=OsNip_04t0403450-01;Tag=IsoSeq:G7311.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5755.1;prot_id "UniRef90_B8BCC1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	20014648	20015300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403450-01;Tag=IsoSeq:G7311.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5755.1;prot_id "UniRef90_B8BCC1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20012986	20014477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403450-01;Tag=IsoSeq:G7311.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5755.1;prot_id "UniRef90_B8BCC1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20015782	20019593	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0403500;biotype=protein_coding;description=NAD(P)-binding;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20015782	20019552	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0403500-01;Parent=gene:OsNip_04g0403500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0403500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20015782	20015926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20015782	20016075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0403500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20016176	20016264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20016364	20016454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20017583	20017729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20018848	20018973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20019051	20019552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Name=OsNip_04t0403500-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0403500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20019332	20019552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20015834	20019593	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0403500-02;Parent=gene:OsNip_04g0403500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0403500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20015834	20015926	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20015834	20016075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;Name=OsNip_04t0403500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20015927	20016075	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0403500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;protein_id=OsNip_04t0403500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20018848	20018973	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0403500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;protein_id=OsNip_04t0403500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20019051	20019331	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0403500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;protein_id=OsNip_04t0403500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20019051	20019593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0403500-02;Name=OsNip_04t0403500-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0403500-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20224646	20225093	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0408700-02;Tag=IsoSeq:G7328.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3387.1;prot_id "UniRef90_A0A199W7C4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20230799	20230813	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0408900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0408900-01;protein_id=OsNip_04t0408900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20257358	20257523	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0409900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0409900-01;protein_id=OsNip_04t0409900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20257600	20257811	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0409900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0409900-01;protein_id=OsNip_04t0409900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20258828	20259157	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0409900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0409900-01;protein_id=OsNip_04t0409900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20258828	20259273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0409900-01;Name=OsNip_04t0409900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0409900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20278175	20278258	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0410300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0410300-01;protein_id=OsNip_04t0410300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20278980	20279226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410300-01;Name=OsNip_04t0410300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0410300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20280360	20280444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20280445	20280727	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0410400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0410400-01;protein_id=OsNip_04t0410400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20280864	20281648	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0410400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0410400-01;protein_id=OsNip_04t0410400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20280864	20281976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410400-01;Name=OsNip_04t0410400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0410400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20281649	20281976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20282714	20286792	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0410700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20282714	20286792	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0410700-00;Parent=gene:OsNip_04g0410700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0410700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20282714	20282929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;Name=OsNip_04t0410700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0410700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20282714	20282929	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0410700-00;Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;protein_id=OsNip_04t0410700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20284308	20284739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;Name=OsNip_04t0410700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0410700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20284308	20284739	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0410700-00;Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;protein_id=OsNip_04t0410700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20286504	20286792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;Name=OsNip_04t0410700-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0410700-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20286504	20286792	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0410700-00;Parent=transcript:OsNip_04t0410700-00;protein_id=OsNip_04t0410700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20283513	20285410	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0410600;Name=OsNip_PAP21a;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20283513	20285410	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0410600-01;Parent=gene:OsNip_04g0410600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0410600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20283513	20283739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20283513	20283974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410600-01;Name=OsNip_04t0410600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0410600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20283740	20283974	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0410600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0410600-01;protein_id=OsNip_04t0410600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20284062	20284150	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0410600-01;Name=OsNip_04t0410600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0410600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20320789	20320850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0411400-01;Name=OsNip_04t0411400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0411400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20321030	20321385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0411400-01;Name=OsNip_04t0411400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0411400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20321231	20321385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0411400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20405177	20405746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0412900-01;Name=OsNip_04t0412900-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0412900-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20462071	20462139	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0414100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414100-01;protein_id=OsNip_04t0414100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20462269	20462437	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0414100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414100-01;protein_id=OsNip_04t0414100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20462533	20462783	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0414100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414100-01;protein_id=OsNip_04t0414100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20462533	20462938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414100-01;Name=OsNip_04t0414100-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0414100-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20462784	20462938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	20485797	20487086	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0414500;Name=OsNip_Fbox208;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20485797	20486108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20486348	20486682	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0414500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414500-01;protein_id=OsNip_04t0414500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20487037	20487044	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0414500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414500-01;protein_id=OsNip_04t0414500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20487037	20487086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-01;Name=OsNip_04t0414500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0414500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20487045	20487086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	20485874	20487082	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0414500-02;Parent=gene:OsNip_04g0414500;transcript_id=OsNip_04t0414500-02;Tag=IsoSeq:G7348.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4417.2
Chr04	TAMA	exon	20485874	20487082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-02;Name=OsNip_04t0414500-02;exon_id=OsNip_04t0414500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7348.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4417.2;prot_id "UniRef90_A0A287IFN1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	20485991	20486074	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0414500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0414500-02;protein_id=OsNip_04t0414500-02;Tag=IsoSeq:G7348.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4417.2;prot_id "UniRef90_A0A287IFN1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	20486075	20487082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-02;Tag=IsoSeq:G7348.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4417.2;prot_id "UniRef90_A0A287IFN1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20485874	20485988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414500-02;Tag=IsoSeq:G7348.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4417.2;prot_id "UniRef90_A0A287IFN1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20496054	20497028	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0414700;biotype=protein_coding;description=Photosystem;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20496054	20497009	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0414700-01;Parent=gene:OsNip_04g0414700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0414700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20496054	20496122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20496054	20496189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;Name=OsNip_04t0414700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0414700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20496277	20496361	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;Name=OsNip_04t0414700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0414700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20496277	20496361	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0414700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;protein_id=OsNip_04t0414700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20496470	20496649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;Name=OsNip_04t0414700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0414700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20496766	20496862	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0414700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0414700-01;protein_id=OsNip_04t0414700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20496766	20497028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414700-02;Tag=IsoSeq:G7349.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5786.3,Nipponbare.leaf_G3397.1;prot_id "UniRef90_I3SE13";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20499421	20501058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414800-00;Name=OsNip_04t0414800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0414800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20506819	20508788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0414900-01;Name=OsNip_04t0414900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0414900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20569897	20571009	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0416500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0416500-01;protein_id=OsNip_04t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20569897	20571227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416500-01;Name=OsNip_04t0416500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0416500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20571010	20571227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20579386	20580531	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0416700-01;Parent=gene:OsNip_04g0416700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20579386	20579460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Name=OsNip_04t0416700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0416700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20579386	20579460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20579468	20579654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20579468	20580107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Name=OsNip_04t0416700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0416700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20579655	20580107	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0416700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;protein_id=OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	20580195	20580404	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0416700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;protein_id=OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20580195	20580531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Name=OsNip_04t0416700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0416700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20580405	20580531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	20579402	20580520	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0416700-02;Parent=gene:OsNip_04g0416700;transcript_id=OsNip_04t0416700-02;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2
Chr04	TAMA	exon	20580195	20580520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;Name=OsNip_04t0416700-02;exon_id=OsNip_04t0416700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	20580439	20580519	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0416700-02;Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;protein_id=OsNip_04t0416700-02;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	20579402	20580107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;Name=OsNip_04t0416700-02;exon_id=OsNip_04t0416700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	20580520	20580520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20580195	20580436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20579402	20580107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0416700-02;Tag=IsoSeq:G7355.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3401.1,Nipponbare.root_G4419.2,Nipponbare.panicle_G5792.2;prot_id "UniRef90_B4FDU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20587017	20591159	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0416900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20590633	20591148	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0416900-01;Parent=gene:OsNip_04g0416900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0416900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20625819	20626020	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0417600-01;Tag=IsoSeq:G7357.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4420.2;prot_id "UniRef90_C0PLR5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	20640443	20645375	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0417800-01;Parent=gene:OsNip_04g0417800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0417800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20640443	20640710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0417800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20640443	20641216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0417800-01;Name=OsNip_04t0417800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0417800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20661591	20661752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0418100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	20679986	20680659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t041829A-01;Tag=IsoSeq:G7361.1;Source=Nipponbare.leaf_G3403.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20679809	20679905	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t041829A-01;Tag=IsoSeq:G7361.1;Source=Nipponbare.leaf_G3403.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	exon	20679964	20680659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t041829A-02;Name=OsNip_04t041829A-02-E1;exon_id=OsNip_04t041829A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7361.2;Source=Nipponbare.leaf_G3403.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	20680115	20680177	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t041829A-02;Parent=transcript:OsNip_04t041829A-02;protein_id=OsNip_04t041829A-02;Tag=IsoSeq:G7361.2;Source=Nipponbare.leaf_G3403.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	20680178	20680659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t041829A-02;Tag=IsoSeq:G7361.2;Source=Nipponbare.leaf_G3403.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	20679964	20680112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t041829A-02;Tag=IsoSeq:G7361.2;Source=Nipponbare.leaf_G3403.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XAS6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	20688214	20692233	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0418300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	20688214	20688503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0418300-00;Name=OsNip_04t0418300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0418300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20873475	20873605	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0422000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	20873475	20873897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0422000-03;Name=OsNip_04t0422000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0422000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20941052	20941797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0423600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20942299	20942351	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0423600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21215722	21215985	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0428500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21227408	21230736	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0428900-01;Parent=gene:OsNip_04g0428900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0428900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21230574	21230657	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0428900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0428900-01;protein_id=OsNip_04t0428900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21230574	21230736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0428900-01;Name=OsNip_04t0428900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0428900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21232622	21235366	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0428950-00;Parent=gene:OsNip_04g0428950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0428950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21317340	21317421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21317560	21317687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429850-00;Name=OsNip_04t0429850-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0429850-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21317560	21317687	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21317769	21318045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429850-00;Name=OsNip_04t0429850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0429850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21317769	21318045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21319691	21320116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21319691	21320542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0429900-01;Name=OsNip_04t0429900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0429900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21361288	21361513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21363398	21363467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21363971	21364299	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0430800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0430800-01;protein_id=OsNip_04t0430800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21365189	21365478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-01;Name=OsNip_04t0430800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0430800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21365388	21365478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21363616	21363970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21363616	21364299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;Name=OsNip_04t0430800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0430800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21363971	21364299	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0430800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;protein_id=OsNip_04t0430800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21365189	21365342	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0430800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;protein_id=OsNip_04t0430800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21365189	21365344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;Name=OsNip_04t0430800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0430800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21365343	21365344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0430800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	21373278	21373278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431000-02;Tag=IsoSeq:G7392.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5819.1,Nipponbare.leaf_G3414.1,Nipponbare.root_G4439.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XBX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	21376322	21376370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431000-02;Tag=IsoSeq:G7392.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5819.1,Nipponbare.leaf_G3414.1,Nipponbare.root_G4439.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XBX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	21376770	21377151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431000-02;Tag=IsoSeq:G7392.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5819.1,Nipponbare.leaf_G3414.1,Nipponbare.root_G4439.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XBX0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21377338	21377546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21377338	21377712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431100-02;Name=OsNip_04t0431100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0431100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21377547	21377711	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0431100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0431100-02;protein_id=OsNip_04t0431100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21377712	21377712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21377338	21379536	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0431100-01;Parent=gene:OsNip_04g0431100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0431100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21377338	21377546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21377338	21377750	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0431100-01;Name=OsNip_04t0431100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0431100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21424187	21424206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0432100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	21428227	21430913	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0432200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21641511	21643147	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435200-01;Parent=gene:OsNip_04g0435200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0435200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21641511	21641515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21641511	21643147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435200-01;Name=OsNip_04t0435200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21641516	21642349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0435200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0435200-01;protein_id=OsNip_04t0435200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21642350	21643147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21643960	21658120	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0435300-01;Parent=gene:OsNip_04g0435300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21643960	21644157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Name=OsNip_04t0435300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21643960	21644157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21654782	21655052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21655601	21655709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Name=OsNip_04t0435300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21655601	21655709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21656312	21656380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21656312	21656395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Name=OsNip_04t0435300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21656381	21656395	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0435300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;protein_id=OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21657859	21658065	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0435300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;protein_id=OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21657859	21658120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Name=OsNip_04t0435300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0435300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21658066	21658120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21650405	21650715	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435325;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21650405	21650715	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435325-00;Parent=gene:OsNip_04g0435325;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0435325-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21650405	21650463	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435325-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21650405	21650715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435325-00;Name=OsNip_04t0435325-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0435325-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21650464	21650715	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0435325-00;Parent=transcript:OsNip_04t0435325-00;protein_id=OsNip_04t0435325-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21652387	21652820	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21652387	21652820	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435350-00;Parent=gene:OsNip_04g0435350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0435350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21652387	21652820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435350-00;Name=OsNip_04t0435350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21654339	21654767	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435402;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21654339	21654767	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435402-00;Parent=gene:OsNip_04g0435402;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0435402-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21654339	21654767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435402-00;Name=OsNip_04t0435402-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435402-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21656698	21658847	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21656698	21658847	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435450-00;Parent=gene:OsNip_04g0435450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0435450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21656698	21657024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435450-00;Name=OsNip_04t0435450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21658733	21658847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435450-00;Name=OsNip_04t0435450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21661225	21661772	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435475;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21661225	21661772	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435475-00;Parent=gene:OsNip_04g0435475;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0435475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21661225	21661445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21661225	21661772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435475-00;Name=OsNip_04t0435475-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0435475-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21661446	21661772	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0435475-00;Parent=transcript:OsNip_04t0435475-00;protein_id=OsNip_04t0435475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21662080	21664360	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0435500;Name=OsNip_TCHQD1;biotype=protein_coding;description=Glutathione;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21662080	21664310	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0435500-01;Parent=gene:OsNip_04g0435500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0435500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21662080	21662435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21662080	21663024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;Name=OsNip_04t0435500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0435500-02-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21662436	21663024	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0435500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;protein_id=OsNip_04t0435500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21663133	21663341	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0435500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;protein_id=OsNip_04t0435500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21663133	21663343	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;Name=OsNip_04t0435500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21664135	21664310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0435500-01;Name=OsNip_04t0435500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0435500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21692755	21693624	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436000-00;Name=OsNip_04t0436000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0436000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21695578	21698610	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0436100-01;Parent=gene:OsNip_04g0436100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0436100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21695578	21695880	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21695881	21696024	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0436100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;protein_id=OsNip_04t0436100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21698063	21698206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;Name=OsNip_04t0436100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0436100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21698063	21698206	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0436100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;protein_id=OsNip_04t0436100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21698316	21698610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;Name=OsNip_04t0436100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0436100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21698490	21698610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21699925	21702996	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0436300;Name=PDIL1;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21699925	21702992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0436300-01;Parent=gene:OsNip_04g0436300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0436300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21699925	21700199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436300-01;Name=OsNip_04t0436300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0436300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21699925	21700199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21700300	21700553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436300-01;Name=OsNip_04t0436300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0436300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21700300	21700553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21700655	21701654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0436300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21758000	21758576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0437600-01;Name=OsNip_04t0437600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0437600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21758661	21759431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0437700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21766009	21768900	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0437900;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21766009	21768900	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0437900-01;Parent=gene:OsNip_04g0437900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0437900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21766009	21768900	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0437900-01;Name=OsNip_04t0437900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0437900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	gene	21769718	21770677	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g043810A;Tag=IsoSeq:G7414
Chr04	TAMA	mRNA	21769718	21770677	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t043810A-01;Parent=gene:OsNip_04g043810A;transcript_id=OsNip_04t043810A-01;Tag=IsoSeq:G7414.1;Source=Nipponbare.root_G4452.1
Chr04	TAMA	exon	21769718	21770677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t043810A-01;Name=OsNip_04t043810A-01-E1;exon_id=OsNip_04t043810A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7414.1;Source=Nipponbare.root_G4452.1;prot_id "UniRef90_Q7XRA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	21770306	21770677	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t043810A-01;Parent=transcript:OsNip_04t043810A-01;protein_id=OsNip_04t043810A-01;Tag=IsoSeq:G7414.1;Source=Nipponbare.root_G4452.1;prot_id "UniRef90_Q7XRA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	21769718	21770303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t043810A-01;Tag=IsoSeq:G7414.1;Source=Nipponbare.root_G4452.1;prot_id "UniRef90_Q7XRA9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	21784727	21786221	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0438101;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	21784727	21786221	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0438101-00;Parent=gene:OsNip_04g0438101;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21784727	21784961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Name=OsNip_04t0438101-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0438101-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21784727	21784961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21785445	21785585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21785445	21785894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Name=OsNip_04t0438101-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0438101-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21785586	21785894	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0438101-00;Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;protein_id=OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	21785901	21786101	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0438101-00;Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;protein_id=OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	21785901	21786221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Name=OsNip_04t0438101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0438101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21786102	21786221	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0438101-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	21864307	21864550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0439400-02;Tag=IsoSeq:G7421.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3429.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21881686	21881780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0439600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	21969542	21969820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0441600-00;Name=OsNip_04t0441600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0441600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21969569	21969820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0441600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22023036	22023206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0442200-01;Name=OsNip_04t0442200-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0442200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22092913	22093176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22095067	22095318	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22095319	22096349	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0443700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0443700-01;protein_id=OsNip_04t0443700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22097227	22097461	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0443700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0443700-01;protein_id=OsNip_04t0443700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22097227	22097462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443700-01;Name=OsNip_04t0443700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0443700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	22100238	22101910	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0443750;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22100238	22101910	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0443750-00;Parent=gene:OsNip_04g0443750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0443750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22100238	22100419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;Name=OsNip_04t0443750-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0443750-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22100238	22100419	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0443750-00;Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;protein_id=OsNip_04t0443750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22101390	22101670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;Name=OsNip_04t0443750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0443750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22101390	22101670	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0443750-00;Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;protein_id=OsNip_04t0443750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22101804	22101910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;Name=OsNip_04t0443750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0443750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22101804	22101910	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0443750-00;Parent=transcript:OsNip_04t0443750-00;protein_id=OsNip_04t0443750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22103142	22108833	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0443801;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22110891	22111168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t044389A-01;Tag=IsoSeq:G7437.1;Source=Nipponbare.root_G4466.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NGV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22109734	22110419	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t044389A-01;Tag=IsoSeq:G7437.1;Source=Nipponbare.root_G4466.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NGV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22109404	22109632	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t044389A-01;Tag=IsoSeq:G7437.1;Source=Nipponbare.root_G4466.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0NGV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22118247	22122536	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0443900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22189484	22189516	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0444900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0444900-01;protein_id=OsNip_04t0444900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22216936	22221343	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0445700-01;Parent=gene:OsNip_04g0445700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0445700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22314079	22316433	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0447400-01;Parent=gene:OsNip_04g0447400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0447400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22323860	22326881	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0447700-01;Parent=gene:OsNip_04g0447700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0447700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22346027	22346461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448200-02;Name=OsNip_04t0448200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0448200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	22343273	22343359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448200-03;Name=OsNip_04t0448200-03;exon_id=OsNip_04t0448200-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G7461.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4481.1,Nipponbare.panicle_G5869.1;prot_id "UniRef90_J3LDZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22344320	22345261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448200-03;Tag=IsoSeq:G7461.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4481.1,Nipponbare.panicle_G5869.1;prot_id "UniRef90_J3LDZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22346027	22346461	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448200-03;Tag=IsoSeq:G7461.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4481.1,Nipponbare.panicle_G5869.1;prot_id "UniRef90_J3LDZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22341408	22341618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448250-00;Name=OsNip_04t0448250-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0448250-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22342471	22343168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448250-00;Name=OsNip_04t0448250-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0448250-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22343268	22343357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448250-00;Name=OsNip_04t0448250-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0448250-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22344318	22345271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448250-00;Name=OsNip_04t0448250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0448250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22346036	22346394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448250-00;Name=OsNip_04t0448250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0448250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22348134	22348157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22353813	22355207	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0448500-00;Parent=transcript:OsNip_04t0448500-00;protein_id=OsNip_04t0448500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22353818	22355210	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0448550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22353818	22355210	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0448550-00;Parent=gene:OsNip_04g0448550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0448550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22353818	22354697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0448550-00;Name=OsNip_04t0448550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0448550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22385360	22387707	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0449200-01;Parent=gene:OsNip_04g0449200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0449200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22385643	22387153	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0449200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0449200-01;protein_id=OsNip_04t0449200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22387436	22387707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449200-01;Name=OsNip_04t0449200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0449200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22387674	22387707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22385657	22385753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22385754	22386974	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0449300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0449300-01;protein_id=OsNip_04t0449300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22386975	22387285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22389359	22394035	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0449400;Name=OsNip_PP2C40;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22389359	22392243	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0449400-01;Parent=gene:OsNip_04g0449400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0449400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22389359	22389945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22389359	22389980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449400-01;Name=OsNip_04t0449400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0449400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22389946	22389980	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0449400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0449400-01;protein_id=OsNip_04t0449400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22390062	22390264	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449400-01;Name=OsNip_04t0449400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0449400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22418680	22418835	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0449900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0449900-01;protein_id=OsNip_04t0449900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22418680	22419109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449900-01;Name=OsNip_04t0449900-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0449900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22418836	22419109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22418854	22419092	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0449900-02;Parent=gene:OsNip_04g0449900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0449900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22418854	22419092	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449900-02;Name=OsNip_04t0449900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0449900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	22414497	22419105	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0449900-03;Parent=gene:OsNip_04g0449900;transcript_id=OsNip_04t0449900-03;Tag=IsoSeq:G7468.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5875.2,Nipponbare.panicle_G5875.1
Chr04	TAMA	exon	22414497	22414964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0449900-03;Name=OsNip_04t0449900-03;exon_id=OsNip_04t0449900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7468.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5875.2,Nipponbare.panicle_G5875.1;prot_id "UniRef90_A0A453NXP9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	22414499	22414964	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0449900-03;Parent=transcript:OsNip_04t0449900-03;protein_id=OsNip_04t0449900-03;Tag=IsoSeq:G7468.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5875.2,Nipponbare.panicle_G5875.1;prot_id "UniRef90_A0A453NXP9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22434662	22434743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	22433756	22434743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450200-02;Name=OsNip_04t0450200-02;exon_id=OsNip_04t0450200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7471.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4489.1,Nipponbare.panicle_G5877.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FZD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	22433756	22433778	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0450200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0450200-02;protein_id=OsNip_04t0450200-02;Tag=IsoSeq:G7471.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4489.1,Nipponbare.panicle_G5877.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FZD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22432179	22432179	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450200-02;Tag=IsoSeq:G7471.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4489.1,Nipponbare.panicle_G5877.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FZD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22433782	22434743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450200-02;Tag=IsoSeq:G7471.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4489.1,Nipponbare.panicle_G5877.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FZD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22435568	22435999	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0450250-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450250-00;protein_id=OsNip_04t0450250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22435568	22436126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450250-00;Name=OsNip_04t0450250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0450250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	22442143	22443686	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0450400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22442143	22443686	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0450400-01;Parent=gene:OsNip_04g0450400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0450400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22442143	22442299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22442143	22443686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450400-01;Name=OsNip_04t0450400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0450400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22445324	22445368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22448084	22450533	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0450600-00;Parent=gene:OsNip_04g0450600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22448084	22448172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22448084	22448354	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;Name=OsNip_04t0450600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0450600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22448173	22448354	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0450600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;protein_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22448509	22448580	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0450600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;protein_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22448685	22448752	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0450600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;protein_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22448855	22449048	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;Name=OsNip_04t0450600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0450600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22448855	22449048	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0450600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;protein_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22450183	22450257	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0450600-00;Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;protein_id=OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22450183	22450533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;Name=OsNip_04t0450600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0450600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22450258	22450533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22452038	22452591	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0450701;Name=OsNip_AGP4;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22452038	22452591	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0450701-00;Parent=gene:OsNip_04g0450701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0450701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22452038	22452209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0450701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22466929	22468369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0451000-02;Name=OsNip_04t0451000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0451000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22633063	22633275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453400-02;Name=OsNip_04t0453400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0453400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22628584	22628584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22628585	22628782	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0453450-00;Parent=transcript:OsNip_04t0453450-00;protein_id=OsNip_04t0453450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22628883	22629842	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0453450-00;Parent=transcript:OsNip_04t0453450-00;protein_id=OsNip_04t0453450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22628883	22629867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453450-00;Name=OsNip_04t0453450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0453450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22629843	22629867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22642685	22648129	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0453500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22645052	22648129	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0453500-01;Parent=gene:OsNip_04g0453500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22645052	22645887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22645052	22648129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-01;Name=OsNip_04t0453500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0453500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22645888	22646169	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0453500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0453500-01;protein_id=OsNip_04t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22646170	22648129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	22642685	22648123	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0453500-02;Parent=gene:OsNip_04g0453500;transcript_id=OsNip_04t0453500-02;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1
Chr04	TAMA	exon	22648018	22648123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-02;Name=OsNip_04t0453500-02;exon_id=OsNip_04t0453500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1;prot_id "UniRef90_Q5Z5Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	22648018	22648123	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0453500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0453500-02;protein_id=OsNip_04t0453500-02;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1;prot_id "UniRef90_Q5Z5Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	exon	22644453	22645082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-02;Name=OsNip_04t0453500-02;exon_id=OsNip_04t0453500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1;prot_id "UniRef90_Q5Z5Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	exon	22643262	22644360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-02;Name=OsNip_04t0453500-02;exon_id=OsNip_04t0453500-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1;prot_id "UniRef90_Q5Z5Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	exon	22642685	22643172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0453500-02;Name=OsNip_04t0453500-02;exon_id=OsNip_04t0453500-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G7487.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5887.1;prot_id "UniRef90_Q5Z5Q4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22811993	22812160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0455900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	22811851	22812138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0455900-03;Name=OsNip_04t0455900-03;exon_id=OsNip_04t0455900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7493.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3457.2;prot_id "UniRef90_A0A022Q7L1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22830222	22830392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0456700-02;Tag=IsoSeq:G7497.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3458.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22831216	22831217	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t045689A-01;Tag=IsoSeq:G7498.1;Source=Nipponbare.leaf_G3459.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22831530	22831709	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t045689A-01;Tag=IsoSeq:G7498.1;Source=Nipponbare.leaf_G3459.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22834019	22834806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0456900-00;Name=OsNip_04t0456900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0456900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22834019	22834806	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0456900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0456900-00;protein_id=OsNip_04t0456900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22835681	22835912	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0456900-00;Name=OsNip_04t0456900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0456900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22835681	22835912	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0456900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0456900-00;protein_id=OsNip_04t0456900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22835913	22837165	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0457000;Name=CP24;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22835913	22837163	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0457000-01;Parent=gene:OsNip_04g0457000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0457000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22835913	22836232	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22835913	22836782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;Name=OsNip_04t0457000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0457000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22836233	22836782	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0457000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;protein_id=OsNip_04t0457000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22836893	22837101	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0457000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;protein_id=OsNip_04t0457000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22836893	22837163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;Name=OsNip_04t0457000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0457000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22837102	22837163	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	22835913	22837165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0457000-02;Parent=gene:OsNip_04g0457000;transcript_id=OsNip_04t0457000-02;Tag=IsoSeq:G7499.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3460.1,Nipponbare.panicle_G5896.1
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Chr04	TAMA	CDS	22836777	22837163	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0457000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0457000-02;protein_id=OsNip_04t0457000-02;Tag=IsoSeq:G7499.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3460.1,Nipponbare.panicle_G5896.1;prot_id "UniRef90_A0A2P5CS71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22837164	22837165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-02;Tag=IsoSeq:G7499.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3460.1,Nipponbare.panicle_G5896.1;prot_id "UniRef90_A0A2P5CS71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22835913	22836774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457000-02;Tag=IsoSeq:G7499.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3460.1,Nipponbare.panicle_G5896.1;prot_id "UniRef90_A0A2P5CS71";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22836195	22837571	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0457100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22836195	22837571	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0457100-01;Parent=gene:OsNip_04g0457100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0457100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22836195	22836551	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22836195	22837571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457100-01;Name=OsNip_04t0457100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0457100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22836552	22836917	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0457100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457100-01;protein_id=OsNip_04t0457100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22836918	22837571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22837855	22840529	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0457200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22837855	22840529	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0457200-01;Parent=gene:OsNip_04g0457200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0457200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22837855	22838078	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22838755	22838914	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0457200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457200-01;protein_id=OsNip_04t0457200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22839962	22840529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457200-01;Name=OsNip_04t0457200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0457200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22840431	22840529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22848936	22851578	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0457300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22848936	22851573	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0457300-01;Parent=gene:OsNip_04g0457300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22848936	22849045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22849558	22849591	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0457300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;protein_id=OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22849768	22849884	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0457300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;protein_id=OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22850236	22850619	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0457300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;protein_id=OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22850236	22850674	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;Name=OsNip_04t0457300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0457300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22850620	22850674	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22850927	22851078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0457300-01;Name=OsNip_04t0457300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0457300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	22888012	22892741	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0458200;Name=IIP4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22892511	22892741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22891020	22892741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-02;Name=OsNip_04t0458200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0458200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22892511	22892741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	22888012	22892741	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0458200-03;Parent=gene:OsNip_04g0458200;transcript_id=OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1
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Chr04	TAMA	exon	22889948	22889950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Name=OsNip_04t0458200-03;exon_id=OsNip_04t0458200-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	22890297	22892741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Name=OsNip_04t0458200-03;exon_id=OsNip_04t0458200-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	22891387	22891986	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0458200-03;Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;protein_id=OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22888012	22888030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22889948	22889950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	22890297	22891386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22891990	22892741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458200-03;Tag=IsoSeq:G7505.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5901.2,Nipponbare.leaf_G3463.1,Nipponbare.root_G4511.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9J150";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22890333	22892786	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0458250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22890333	22892786	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0458250-00;Parent=gene:OsNip_04g0458250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0458250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22890333	22891732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	22890333	22892786	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458250-00;Name=OsNip_04t0458250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0458250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	22891733	22892659	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0458250-00;Parent=transcript:OsNip_04t0458250-00;protein_id=OsNip_04t0458250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22892660	22892786	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	22893849	22898645	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0458300;Name=GalM4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22905429	22905619	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0458600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	22914764	22915501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0459000-02;Tag=IsoSeq:G7510.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5906.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9QUK0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22929310	22929460	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0459200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	22937162	22939007	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0459500-01;Parent=gene:OsNip_04g0459500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0459500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	22942007	22942295	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0459600-01;Name=OsNip_04t0459600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0459600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23040615	23041378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23047733	23047774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23047851	23047934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Name=OsNip_04t0461300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23047851	23047934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23048012	23048166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Name=OsNip_04t0461300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23048012	23048166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23048254	23048445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Name=OsNip_04t0461300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23048254	23048445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23045683	23056619	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0461400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23045683	23048831	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0461400-02;Parent=gene:OsNip_04g0461400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0461400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23045683	23046633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23045683	23048831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461400-02;Name=OsNip_04t0461400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23046886	23048831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23079926	23081438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461800-01;Name=OsNip_04t0461800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23081350	23081438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23083335	23084975	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23083335	23085438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461900-01;Name=OsNip_04t0461900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0461900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23084976	23085221	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0461900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0461900-01;protein_id=OsNip_04t0461900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23085222	23085438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0461900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23093153	23094065	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0462200-01;Parent=gene:OsNip_04g0462200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23093153	23093223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23093224	23093584	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0462200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0462200-01;protein_id=OsNip_04t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23093732	23093973	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0462200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0462200-01;protein_id=OsNip_04t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23093732	23094065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0462200-01;Name=OsNip_04t0462200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0462200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23093974	23094065	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0462200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23125252	23125292	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23125293	23125535	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0463100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463100-01;protein_id=OsNip_04t0463100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23125536	23125572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23125686	23126013	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463100-01;Name=OsNip_04t0463100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23133503	23133933	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23134256	23134720	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463400-01;Name=OsNip_04t0463400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0463400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23134986	23135100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463400-01;Name=OsNip_04t0463400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0463400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23134986	23135100	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0463400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463400-01;protein_id=OsNip_04t0463400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23136746	23137105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463400-01;Name=OsNip_04t0463400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23137003	23137105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23140707	23140777	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0463500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463500-01;protein_id=OsNip_04t0463500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23142346	23142524	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0463500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463500-01;protein_id=OsNip_04t0463500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23142620	23142737	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0463500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463500-01;protein_id=OsNip_04t0463500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23142620	23142817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463500-01;Name=OsNip_04t0463500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23145069	23145382	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23145069	23145454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463600-01;Name=OsNip_04t0463600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23145383	23145454	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0463600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0463600-01;protein_id=OsNip_04t0463600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23151498	23151738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463700-01;Name=OsNip_04t0463700-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23154054	23154335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23155349	23155390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463800-01;Name=OsNip_04t0463800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23155349	23155390	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23155522	23158544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0463800-01;Name=OsNip_04t0463800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0463800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23159815	23160093	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0463900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0463900-00;protein_id=OsNip_04t0463900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23165556	23166329	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0464100;biotype=protein_coding;description=Heavy;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23165556	23165800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23165556	23166329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-01;Name=OsNip_04t0464100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0464100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23165801	23166157	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0464100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0464100-01;protein_id=OsNip_04t0464100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23166158	23166329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	23165559	23166302	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0464100-02;Parent=gene:OsNip_04g0464100;transcript_id=OsNip_04t0464100-02;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2
Chr04	TAMA	exon	23165559	23165699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;Name=OsNip_04t0464100-02;exon_id=OsNip_04t0464100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	23165560	23165679	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0464100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;protein_id=OsNip_04t0464100-02;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	23165807	23166302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;Name=OsNip_04t0464100-02;exon_id=OsNip_04t0464100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	23165559	23165559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23165683	23165699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23165807	23166302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464100-02;Tag=IsoSeq:G7536.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4527.2;prot_id "UniRef90_UPI00188FB706";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23171516	23176332	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0464200;Name=BAD1;biotype=protein_coding;description=Betaine;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23171516	23176332	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0464200-01;Parent=gene:OsNip_04g0464200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0464200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23171516	23171792	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23171516	23171883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464200-01;Name=OsNip_04t0464200-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0464200-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	mRNA	23178407	23182899	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0464400-01;Parent=gene:OsNip_04g0464400;transcript_id=OsNip_04t0464400-01;Tag=IsoSeq:G7538.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5929.1
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Chr04	TAMA	exon	23182632	23182740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464400-01;Name=OsNip_04t0464400-01;exon_id=OsNip_04t0464400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7538.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5929.1;prot_id "UniRef90_A0A5B7BX42";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23217466	23218156	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23226754	23226909	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-01;Name=OsNip_04t0464966-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0464966-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23226754	23226909	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0464966-01;Parent=transcript:OsNip_04t0464966-01;protein_id=OsNip_04t0464966-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23227204	23228235	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0464966-01;Parent=transcript:OsNip_04t0464966-01;protein_id=OsNip_04t0464966-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23227204	23228272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-01;Name=OsNip_04t0464966-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0464966-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23228236	23228272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	23226181	23228260	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-02;Name=OsNip_04t0464966-02;exon_id=OsNip_04t0464966-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7541.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4530.2;prot_id "UniRef90_UPI00071CA20D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	23228259	23228260	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-02;Tag=IsoSeq:G7541.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4530.2;prot_id "UniRef90_UPI00071CA20D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23226181	23228064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0464966-02;Tag=IsoSeq:G7541.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4530.2;prot_id "UniRef90_UPI00071CA20D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23230618	23230754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-01;Name=OsNip_04t0465000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0465000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23233495	23233557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-01;Name=OsNip_04t0465000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0465000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23233495	23233557	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0465000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0465000-01;protein_id=OsNip_04t0465000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23234490	23234546	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0465000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0465000-01;protein_id=OsNip_04t0465000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23234547	23234936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23229134	23229196	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0465000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;protein_id=OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23230618	23230754	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0465000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;protein_id=OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23231705	23231789	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0465000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;protein_id=OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23231705	23232447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Name=OsNip_04t0465000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0465000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23231790	23232447	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23232948	23233028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Name=OsNip_04t0465000-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0465000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23232948	23233028	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23233495	23233557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Name=OsNip_04t0465000-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0465000-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23233495	23233557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23234490	23234915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Name=OsNip_04t0465000-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0465000-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23234490	23234915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23235808	23237158	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0465100;Name=prx55;biotype=protein_coding;description=Haem;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23235808	23237158	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0465100-01;Parent=gene:OsNip_04g0465100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23235808	23236080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23235808	23237158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0465100-01;Name=OsNip_04t0465100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0465100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23236081	23237088	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0465100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0465100-01;protein_id=OsNip_04t0465100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23497279	23497584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t047029A-01;Tag=IsoSeq:G7563.1;Source=Nipponbare.panicle_G5947.1;prot_id "UniRef90_I1IYQ1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23527447	23527678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0470901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23544095	23546859	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0471300-01;Parent=gene:OsNip_04g0471300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0471300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23560195	23560611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0471400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23553939	23554164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0471400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23553939	23556606	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0471400-03;Name=OsNip_04t0471400-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0471400-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23554165	23556606	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0471400-03;Parent=transcript:OsNip_04t0471400-03;protein_id=OsNip_04t0471400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23557254	23558027	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0471400-03;Parent=transcript:OsNip_04t0471400-03;protein_id=OsNip_04t0471400-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23557254	23558029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0471400-03;Name=OsNip_04t0471400-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0471400-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	23632350	23635084	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0472700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23789421	23790269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475400-00;Name=OsNip_04t0475400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0475400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23789421	23790269	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0475400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0475400-00;protein_id=OsNip_04t0475400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23790790	23792950	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0475500;Name=OsNip_V4;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23790794	23792871	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0475500-01;Parent=gene:OsNip_04g0475500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0475500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23790794	23791155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23790794	23791614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;Name=OsNip_04t0475500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0475500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23791156	23791614	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0475500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;protein_id=OsNip_04t0475500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23792569	23792796	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0475500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;protein_id=OsNip_04t0475500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23792569	23792871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;Name=OsNip_04t0475500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0475500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23792797	23792871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	23790790	23792950	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0475500-02;Parent=gene:OsNip_04g0475500;transcript_id=OsNip_04t0475500-02;Tag=IsoSeq:G7582.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4546.1
Chr04	TAMA	exon	23790790	23792950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-02;Name=OsNip_04t0475500-02;exon_id=OsNip_04t0475500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7582.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4546.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C225B";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	23792514	23792948	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0475500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0475500-02;protein_id=OsNip_04t0475500-02;Tag=IsoSeq:G7582.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4546.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C225B";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	23792949	23792950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475500-02;Tag=IsoSeq:G7582.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4546.1;prot_id "UniRef90_UPI00053C225B";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23795593	23795889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23795593	23796132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;Name=OsNip_04t0475600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0475600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23796352	23796670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;Name=OsNip_04t0475600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0475600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23796352	23796670	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0475600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;protein_id=OsNip_04t0475600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23796770	23797110	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0475600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;protein_id=OsNip_04t0475600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23796770	23797531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;Name=OsNip_04t0475600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0475600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23797111	23797531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	CDS	23796770	23797144	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0475600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0475600-02;protein_id=OsNip_04t0475600-02;Tag=IsoSeq:G7583.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4547.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	exon	23795605	23796670	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-02;Name=OsNip_04t0475600-02;exon_id=OsNip_04t0475600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7583.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4547.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	23796260	23796670	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0475600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0475600-02;protein_id=OsNip_04t0475600-02;Tag=IsoSeq:G7583.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4547.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	23797145	23797145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-02;Tag=IsoSeq:G7583.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4547.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23795605	23796257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475600-02;Tag=IsoSeq:G7583.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4547.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23818561	23819413	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0475900;Name=RMS;biotype=protein_coding;description=Acyl-carrier;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23818561	23819413	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0475900-01;Parent=gene:OsNip_04g0475900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0475900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23818561	23818776	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23818561	23819413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475900-01;Name=OsNip_04t0475900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0475900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23818777	23819313	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0475900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0475900-01;protein_id=OsNip_04t0475900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23819314	23819413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0475900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23826525	23829341	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0476000;Name=OsNip__F0756;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23826525	23829341	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0476000-01;Parent=gene:OsNip_04g0476000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23826525	23826611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23826525	23827266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Name=OsNip_04t0476000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0476000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23826612	23827266	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0476000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;protein_id=OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23827582	23827715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Name=OsNip_04t0476000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0476000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23827582	23827715	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0476000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;protein_id=OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23828216	23828398	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Name=OsNip_04t0476000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23828216	23828398	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0476000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;protein_id=OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23828813	23828986	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0476000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;protein_id=OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23828813	23829341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Name=OsNip_04t0476000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23828987	23829341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	23829769	23836554	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0476100;Name=OsNip_DAO4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23829769	23832604	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0476100-02;Parent=gene:OsNip_04g0476100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23829769	23830050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23829769	23830170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23830051	23830170	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23830320	23830401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23830320	23830401	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23830488	23830756	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23831052	23831192	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23831052	23831192	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23831419	23831604	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23831419	23831604	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23831854	23832090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23831854	23832090	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23832173	23832388	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23832173	23832388	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23832484	23832603	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;protein_id=OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23832484	23832604	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Name=OsNip_04t0476100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0476100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23832604	23832604	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	23829786	23831927	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0476100-03;Parent=gene:OsNip_04g0476100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0476100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23829786	23830050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	23829786	23830170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476100-03;Name=OsNip_04t0476100-03-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0476100-03-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23849353	23849664	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23850897	23850923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23850924	23853335	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0476500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476500-01;protein_id=OsNip_04t0476500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23862188	23863738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476650-01;Name=OsNip_04t0476650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0476650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	23866298	23867132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476700-01;Name=OsNip_04t0476700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0476700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23866947	23867132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23864752	23864917	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476700-02;Tag=IsoSeq:G7587.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5966.3;prot_id "UniRef90_A0A426Z5W1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	23866298	23867217	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0476700-02;Tag=IsoSeq:G7587.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5966.3;prot_id "UniRef90_A0A426Z5W1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23868000	23868713	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0476800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0476800-01;protein_id=OsNip_04t0476800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23955831	23955894	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0479000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0479000-02;protein_id=OsNip_04t0479000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	23956407	23956513	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0479000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0479000-02;protein_id=OsNip_04t0479000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23959528	23959974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0479000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24159668	24159731	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0483200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0483200-02;protein_id=OsNip_04t0483200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	24160835	24161070	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0483200-03;Parent=gene:OsNip_04g0483200;transcript_id=OsNip_04t0483200-03;Tag=IsoSeq:G7613.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4564.2,Nipponbare.panicle_G5986.2
Chr04	TAMA	exon	24160835	24161070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483200-03;Name=OsNip_04t0483200-03;exon_id=OsNip_04t0483200-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7613.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4564.2,Nipponbare.panicle_G5986.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	24160884	24161015	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0483200-03;Parent=transcript:OsNip_04t0483200-03;protein_id=OsNip_04t0483200-03;Tag=IsoSeq:G7613.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4564.2,Nipponbare.panicle_G5986.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	24160835	24160883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483200-03;Tag=IsoSeq:G7613.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4564.2,Nipponbare.panicle_G5986.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24161019	24161070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483200-03;Tag=IsoSeq:G7613.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4564.2,Nipponbare.panicle_G5986.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24161435	24165181	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0483400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24161435	24165181	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0483400-01;Parent=gene:OsNip_04g0483400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24161435	24161627	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24161435	24161763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;Name=OsNip_04t0483400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0483400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24161628	24161763	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0483400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;protein_id=OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24162317	24162374	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;Name=OsNip_04t0483400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0483400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24162317	24162374	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0483400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;protein_id=OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24162905	24165179	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0483400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;protein_id=OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24162905	24165181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;Name=OsNip_04t0483400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0483400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24165180	24165181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24168477	24170948	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0483450;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24168477	24170948	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0483450-00;Parent=gene:OsNip_04g0483450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0483450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24168477	24168859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483450-00;Name=OsNip_04t0483450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0483450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24168477	24168859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24168866	24169146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0483450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24236148	24236212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0484850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24236303	24236490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0484850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24237179	24240711	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0484900-01;Parent=gene:OsNip_04g0484900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0484900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24237179	24237288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0484900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24265362	24265754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24265435	24265754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24265885	24266032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24265885	24266032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24266166	24266261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24266166	24266261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24266787	24266857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24266787	24266857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24266986	24267101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24266986	24267101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24267216	24267261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24267216	24267261	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24267374	24267726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Name=OsNip_04t0485300-03-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485300-03-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24267374	24267726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24267372	24267728	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0485300-04;Parent=gene:OsNip_04g0485300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0485300-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24267372	24267373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485300-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24267885	24268999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485400-03;Tag=IsoSeq:G7621.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G5994.1,Nipponbare.root_G4572.1,Nipponbare.panicle_G5994.2;prot_id "UniRef90_A0A6J1DIY7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	24275960	24276035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485700-02;Tag=IsoSeq:G7622.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5995.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DFE1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24277423	24278397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485700-02;Tag=IsoSeq:G7622.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G5995.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DFE1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24279601	24279853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Name=OsNip_04t0485800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24279601	24279853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24279950	24280218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24279950	24280698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Name=OsNip_04t0485800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0485800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24280219	24280698	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0485800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;protein_id=OsNip_04t0485800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24281486	24283053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Name=OsNip_04t0485800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24282368	24283053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24279601	24279853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-01;Name=OsNip_04t0485800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0485800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24279601	24279853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24279950	24280218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24279950	24280698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0485800-01;Name=OsNip_04t0485800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0485800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24319015	24319209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486800-01;Name=OsNip_04t0486800-01-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0486800-01-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24324633	24324725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0486900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0486900-01;protein_id=OsNip_04t0486900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24325206	24325557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486900-01;Name=OsNip_04t0486900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0486900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24325275	24325557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24325769	24328250	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0486950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24325769	24328250	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0486950-01;Parent=gene:OsNip_04g0486950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24325769	24326036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24325769	24326708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Name=OsNip_04t0486950-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0486950-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24326037	24326708	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0486950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;protein_id=OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24326798	24327128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Name=OsNip_04t0486950-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0486950-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24326798	24327128	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0486950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;protein_id=OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24327392	24327717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Name=OsNip_04t0486950-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0486950-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24327392	24327717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0486950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;protein_id=OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24327802	24328176	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0486950-01;Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;protein_id=OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24327802	24328250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Name=OsNip_04t0486950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0486950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24328177	24328250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0486950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24331929	24334820	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0487000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24331929	24334820	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0487000-01;Parent=gene:OsNip_04g0487000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24331929	24333902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Name=OsNip_04t0487000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24331929	24333902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24334036	24334121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Name=OsNip_04t0487000-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24334036	24334121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24334251	24334287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Name=OsNip_04t0487000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24334251	24334287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24334384	24334385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24334384	24334820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Name=OsNip_04t0487000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24334386	24334643	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0487000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;protein_id=OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24334644	24334820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24333380	24334783	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0487000-02;Parent=gene:OsNip_04g0487000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0487000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24333380	24333902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487000-02;Name=OsNip_04t0487000-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24354760	24354939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-01;Name=OsNip_04t0487300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0487300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24355076	24355355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-01;Name=OsNip_04t0487300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0487300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24355274	24355355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	24352450	24355421	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0487300-02;Parent=gene:OsNip_04g0487300;transcript_id=OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1
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Chr04	TAMA	CDS	24355076	24355421	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0487300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;protein_id=OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	24354760	24354939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;Name=OsNip_04t0487300-02;exon_id=OsNip_04t0487300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	24354760	24354939	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0487300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;protein_id=OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	24354543	24354656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;Name=OsNip_04t0487300-02;exon_id=OsNip_04t0487300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	24354637	24354656	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0487300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;protein_id=OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	24352450	24352907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;Name=OsNip_04t0487300-02;exon_id=OsNip_04t0487300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24354543	24354634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24352450	24352907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487300-02;Tag=IsoSeq:G7629.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3514.1;prot_id "UniRef90_UPI0010A4FF76";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24356759	24357616	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0487400;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24356759	24357616	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0487400-00;Parent=gene:OsNip_04g0487400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0487400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24356759	24357616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487400-00;Name=OsNip_04t0487400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0487400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24356759	24357616	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0487400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0487400-00;protein_id=OsNip_04t0487400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24359394	24360538	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0487550;Name=OsNip_C3H29;biotype=protein_coding;description=Putative;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24359394	24360538	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0487550-00;Parent=gene:OsNip_04g0487550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0487550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24359394	24359603	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0487550-00;Name=OsNip_04t0487550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0487550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24391459	24395755	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0488400-01;Parent=gene:OsNip_04g0488400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24391459	24391628	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24391459	24391858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Name=OsNip_04t0488400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0488400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24391629	24391858	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0488400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;protein_id=OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24392343	24392383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Name=OsNip_04t0488400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0488400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24392343	24392383	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0488400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;protein_id=OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24392500	24392561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Name=OsNip_04t0488400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0488400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24392500	24392561	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0488400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;protein_id=OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24393283	24393474	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0488400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;protein_id=OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24393283	24395755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Name=OsNip_04t0488400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0488400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24393475	24395755	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24398522	24402508	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0488500;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24417418	24417809	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0488800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24431489	24440479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0489100-01;Parent=gene:OsNip_04g0489100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0489100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24431489	24432141	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0489100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24431489	24432223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0489100-01;Name=OsNip_04t0489100-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0489100-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24433029	24433451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0489100-01;Name=OsNip_04t0489100-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0489100-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24433029	24433451	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0489100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0489100-01;protein_id=OsNip_04t0489100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24503562	24505397	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490300-02;Tag=IsoSeq:G7638.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6006.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9FNI9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24505544	24505791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24505948	24506016	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0490400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;protein_id=OsNip_04t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24506686	24506707	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;Name=OsNip_04t0490400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0490400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24507662	24507805	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0490400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;protein_id=OsNip_04t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24508050	24508239	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0490400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;protein_id=OsNip_04t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24508050	24508396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;Name=OsNip_04t0490400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0490400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24508240	24508396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24512482	24515493	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0490500;Name=OsNip_RLCK152;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24535586	24536254	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490900-00;Name=OsNip_04t0490900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0490900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24535586	24536254	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0490900-00;Parent=transcript:OsNip_04t0490900-00;protein_id=OsNip_04t0490900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	24534386	24536320	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0490900-01;Parent=gene:OsNip_04g0490900;transcript_id=OsNip_04t0490900-01;Tag=IsoSeq:G7644.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6011.1
Chr04	TAMA	exon	24534386	24534888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490900-01;Name=OsNip_04t0490900-01;exon_id=OsNip_04t0490900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7644.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6011.1;prot_id "UniRef90_J3LZ51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	24534387	24534419	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0490900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0490900-01;protein_id=OsNip_04t0490900-01;Tag=IsoSeq:G7644.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6011.1;prot_id "UniRef90_J3LZ51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24535586	24536320	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0490900-01;Tag=IsoSeq:G7644.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6011.1;prot_id "UniRef90_J3LZ51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24611350	24611753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492400-01;Name=OsNip_04t0492400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0492400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24611350	24611753	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24612931	24612945	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24624551	24624552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24624551	24624617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492600-01;Name=OsNip_04t0492600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0492600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24624739	24624835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492600-01;Name=OsNip_04t0492600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0492600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24646535	24647448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0492900-03;Name=OsNip_04t0492900-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0492900-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24670951	24670952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0493300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	CDS	24672834	24672971	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t049339A-01;Parent=transcript:OsNip_04t049339A-01;protein_id=OsNip_04t049339A-01;Tag=IsoSeq:G7656.1;Source=Nipponbare.panicle_G6021.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PAY5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	24672972	24673198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t049339A-01;Tag=IsoSeq:G7656.1;Source=Nipponbare.panicle_G6021.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PAY5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	24672611	24672831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t049339A-01;Tag=IsoSeq:G7656.1;Source=Nipponbare.panicle_G6021.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PAY5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	24687708	24689297	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0493400;Name=Cht4(t)*(Chi4);biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	24687753	24689297	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0493400-01;Parent=gene:OsNip_04g0493400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0493400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24687753	24688066	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0493400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24687753	24688473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0493400-01;Name=OsNip_04t0493400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0493400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	24752570	24753003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0495075-00;Name=OsNip_04t0495075-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0495075-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24932587	24932631	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0498800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0498800-01;protein_id=OsNip_04t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	24998197	24999099	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0500700-02;Parent=transcript:OsNip_04t0500700-02;protein_id=OsNip_04t0500700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	24998197	24999530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0500700-02;Name=OsNip_04t0500700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0500700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24999100	24999530	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0500700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25058704	25058963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0501800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25068801	25069001	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0502200-01;Name=OsNip_04t0502200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0502200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25068801	25069001	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0502200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0502200-01;protein_id=OsNip_04t0502200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25074788	25075188	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0502200-01;Name=OsNip_04t0502200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0502200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	25072038	25072912	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0502200-02;Name=OsNip_04t0502200-02;exon_id=OsNip_04t0502200-02-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G7692.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6049.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	TAMA	exon	25073609	25074568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0502200-02;Name=OsNip_04t0502200-02;exon_id=OsNip_04t0502200-02-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G7692.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6049.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	25073609	25074568	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0502200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0502200-02;protein_id=OsNip_04t0502200-02;Tag=IsoSeq:G7692.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6049.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25133355	25133694	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0503550-00;Name=OsNip_04t0503550-00-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0503550-00-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	25349812	25350154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507500-03;Tag=IsoSeq:G7713.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6063.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25368373	25369120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507700-01;Name=OsNip_04t0507700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0507700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25371098	25371350	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507700-01;Name=OsNip_04t0507700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0507700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25371484	25371719	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0507700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0507700-01;protein_id=OsNip_04t0507700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25371484	25372042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507700-01;Name=OsNip_04t0507700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0507700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25373469	25373530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25373621	25373754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Name=OsNip_04t0507800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0507800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25373873	25373976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Name=OsNip_04t0507800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0507800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25374067	25374157	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Name=OsNip_04t0507800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0507800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25374235	25374299	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0507800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;protein_id=OsNip_04t0507800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25374300	25374316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25374415	25374576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25374757	25375084	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0507900-02;Parent=transcript:OsNip_04t0507900-02;protein_id=OsNip_04t0507900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25375722	25376437	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0507900-02;Parent=transcript:OsNip_04t0507900-02;protein_id=OsNip_04t0507900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25375722	25376710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507900-02;Name=OsNip_04t0507900-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0507900-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25376438	25376710	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0507900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25389381	25390024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508150-01;Name=OsNip_04t0508150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0508150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	25389649	25395401	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0508200-01;Parent=gene:OsNip_04g0508200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25389649	25389697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25390056	25390099	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0508200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0508200-01;protein_id=OsNip_04t0508200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25399529	25399815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508300-01;Name=OsNip_04t0508300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0508300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	25400153	25401557	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0508400;biotype=protein_coding;description=No;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25401159	25401434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508400-00;Name=OsNip_04t0508400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0508400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	mRNA	25400153	25401557	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0508400-01;Parent=gene:OsNip_04g0508400;transcript_id=OsNip_04t0508400-01;Tag=IsoSeq:G7719.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4633.2
Chr04	TAMA	exon	25400153	25401557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508400-01;Name=OsNip_04t0508400-01;exon_id=OsNip_04t0508400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7719.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4633.2;prot_id "UniRef90_B9FG26";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	25401146	25401557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508400-01;Tag=IsoSeq:G7719.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4633.2;prot_id "UniRef90_B9FG26";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	25405125	25407689	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0508500;Name=R2R3-MYB;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25405125	25405428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25418474	25418713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	25421987	25422322	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0508751;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	25421987	25422322	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0508751-00;Parent=gene:OsNip_04g0508751;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0508751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25421987	25422322	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0508751-00;Name=OsNip_04t0508751-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0508751-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25421987	25422322	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0508751-00;Parent=transcript:OsNip_04t0508751-00;protein_id=OsNip_04t0508751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	25424202	25429268	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0508800;Name=OsNip_RFP;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25470223	25470355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509200-01;Name=OsNip_04t0509200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0509200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25471200	25471394	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0509200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0509200-01;protein_id=OsNip_04t0509200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25471200	25471511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509200-01;Name=OsNip_04t0509200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0509200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25471395	25471511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	25471200	25471560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509200-02;Name=OsNip_04t0509200-02;exon_id=OsNip_04t0509200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7723.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6071.1,Nipponbare.root_G4635.1;prot_id "UniRef90_A0A6J0KT14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	exon	25470223	25470355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509200-02;Name=OsNip_04t0509200-02;exon_id=OsNip_04t0509200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7723.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6071.1,Nipponbare.root_G4635.1;prot_id "UniRef90_A0A6J0KT14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	25470223	25470355	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0509200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0509200-02;protein_id=OsNip_04t0509200-02;Tag=IsoSeq:G7723.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6071.1,Nipponbare.root_G4635.1;prot_id "UniRef90_A0A6J0KT14";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25516136	25516137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0509800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25577118	25579436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0511600-02;Name=OsNip_04t0511600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0511600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	25638398	25638740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0513000-02;Tag=IsoSeq:G7738.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3552.1,Nipponbare.panicle_G6084.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1E4F3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25646120	25646496	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0513301-00;Parent=transcript:OsNip_04t0513301-00;protein_id=OsNip_04t0513301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25753053	25753154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515300-02;Name=OsNip_04t0515300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0515300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25753238	25753329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515300-02;Name=OsNip_04t0515300-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0515300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25751906	25752010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25753042	25753118	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	25756039	25756273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515400-00;Name=OsNip_04t0515400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0515400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25756270	25756273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	25773347	25776183	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0515900-01;Parent=gene:OsNip_04g0515900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25773347	25773516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25773347	25773685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;Name=OsNip_04t0515900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0515900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25773517	25773685	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0515900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;protein_id=OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25775129	25775394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;Name=OsNip_04t0515900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0515900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25775129	25775394	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0515900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;protein_id=OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25775502	25775903	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0515900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;protein_id=OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25775502	25776183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;Name=OsNip_04t0515900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0515900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25775904	25776183	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0515900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	25790019	25791505	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0516200;Name=OsNip_G1L4;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	25790019	25791505	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0516200-01;Parent=gene:OsNip_04g0516200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25790019	25790251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25790019	25790881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Name=OsNip_04t0516200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0516200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	25790252	25790860	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0516200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;protein_id=OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25790861	25790881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25791238	25791313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Name=OsNip_04t0516200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0516200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25791238	25791313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	25791459	25791505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Name=OsNip_04t0516200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0516200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25791459	25791505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0516200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26015627	26016035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519700-02;Tag=IsoSeq:G7752.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4655.1,Nipponbare.panicle_G6094.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5EM17";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26024007	26024291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26024010	26024597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519912-00;Name=OsNip_04t0519912-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0519912-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26031906	26032145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519912-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26033463	26033766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519912-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26027651	26033771	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0519925-00;Parent=gene:OsNip_04g0519925;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0519925-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26027651	26027821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0519925-00;Name=OsNip_04t0519925-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0519925-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26029978	26030055	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0519925-00;Parent=transcript:OsNip_04t0519925-00;protein_id=OsNip_04t0519925-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26092138	26093766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0520900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	26094891	26095181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0520900-03;Name=OsNip_04t0520900-03;exon_id=OsNip_04t0520900-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7756.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6098.1;prot_id "UniRef90_A0A0S3R3R7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	26090682	26090839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0520900-03;Tag=IsoSeq:G7756.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6098.1;prot_id "UniRef90_A0A0S3R3R7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26090972	26092165	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0520900-03;Tag=IsoSeq:G7756.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6098.1;prot_id "UniRef90_A0A0S3R3R7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26094891	26095181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0520900-03;Tag=IsoSeq:G7756.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6098.1;prot_id "UniRef90_A0A0S3R3R7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26099189	26099314	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521001-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26099189	26099946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521001-00;Name=OsNip_04t0521001-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0521001-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26113427	26113913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521700-01;Name=OsNip_04t0521700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0521700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26113427	26113913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26114769	26114800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26115362	26115487	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0521800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0521800-02;protein_id=OsNip_04t0521800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26115856	26116170	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0521800-02;Name=OsNip_04t0521800-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0521800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26115856	26116170	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0521800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0521800-02;protein_id=OsNip_04t0521800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26235989	26236777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26236705	26240648	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0524500-01;Parent=gene:OsNip_04g0524500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0524500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26236705	26236902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26236705	26238015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;Name=OsNip_04t0524500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0524500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26236903	26238015	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0524500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;protein_id=OsNip_04t0524500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26238087	26238276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;Name=OsNip_04t0524500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0524500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26238087	26238276	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0524500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;protein_id=OsNip_04t0524500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26238383	26238517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;Name=OsNip_04t0524500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0524500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26238629	26238726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524500-01;Name=OsNip_04t0524500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0524500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26250879	26252252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524600-01;Name=OsNip_04t0524600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0524600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26251983	26252252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	26247778	26247779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0524600-02;Tag=IsoSeq:G7768.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4666.1,Nipponbare.panicle_G6104.1;prot_id "UniRef90_A0A1S6YFS3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26312424	26312496	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526101-00;Name=OsNip_04t0526101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26314027	26318498	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0526200-01;Parent=gene:OsNip_04g0526200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26314027	26314288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26315104	26316701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26316831	26316897	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Name=OsNip_04t0526200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26317060	26317201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Name=OsNip_04t0526200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26317060	26317201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26317539	26317636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26317539	26317652	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Name=OsNip_04t0526200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26317637	26317652	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0526200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;protein_id=OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26317743	26317864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Name=OsNip_04t0526200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0526200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26317743	26317864	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0526200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;protein_id=OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26317935	26318156	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0526200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;protein_id=OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26317935	26318498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Name=OsNip_04t0526200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0526200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26318157	26318498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26320449	26321489	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0526300;biotype=protein_coding;description=Sulfotransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26320449	26321489	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0526300-00;Parent=gene:OsNip_04g0526300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0526300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26320449	26321489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526300-00;Name=OsNip_04t0526300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0526300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26320449	26321489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0526300-00;Parent=transcript:OsNip_04t0526300-00;protein_id=OsNip_04t0526300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26323989	26324804	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0526600;Name=RASI;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26323989	26324804	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0526600-01;Parent=gene:OsNip_04g0526600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26323989	26324145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26323989	26324804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526600-01;Name=OsNip_04t0526600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26324146	26324748	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0526600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526600-01;protein_id=OsNip_04t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26324749	26324804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26342449	26343778	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0526800;biotype=protein_coding;description=GRAM;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26342449	26343778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0526800-01;Parent=gene:OsNip_04g0526800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26342449	26342726	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26342449	26343178	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;Name=OsNip_04t0526800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0526800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26342727	26343178	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0526800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;protein_id=OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26343299	26343367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;Name=OsNip_04t0526800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0526800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26343299	26343367	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0526800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;protein_id=OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26343475	26343655	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0526800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;protein_id=OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26343475	26343778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;Name=OsNip_04t0526800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0526800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26343656	26343778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0526800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26347311	26348499	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0527000;biotype=protein_coding;description=GRAM;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26347311	26348499	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0527000-01;Parent=gene:OsNip_04g0527000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26347311	26347616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26347311	26348068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;Name=OsNip_04t0527000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0527000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26347617	26348068	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0527000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;protein_id=OsNip_04t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26348187	26348382	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0527000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;protein_id=OsNip_04t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26348187	26348499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;Name=OsNip_04t0527000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0527000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26348383	26348499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	26347322	26348499	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0527000-02;Parent=gene:OsNip_04g0527000;transcript_id=OsNip_04t0527000-02;Tag=IsoSeq:G7776.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4670.3
Chr04	TAMA	exon	26347322	26348499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-02;Name=OsNip_04t0527000-02;exon_id=OsNip_04t0527000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7776.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4670.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6QIG1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	26348141	26348497	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0527000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0527000-02;protein_id=OsNip_04t0527000-02;Tag=IsoSeq:G7776.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4670.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6QIG1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	26348498	26348499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-02;Tag=IsoSeq:G7776.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4670.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6QIG1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26347322	26348138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527000-02;Tag=IsoSeq:G7776.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4670.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6QIG1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26360323	26361225	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0527300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26360323	26361225	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0527300-01;Parent=gene:OsNip_04g0527300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0527300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26360323	26361225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527300-01;Name=OsNip_04t0527300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0527300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26364147	26368378	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0527400;biotype=protein_coding;description=BRO1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26364147	26367897	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0527400-02;Parent=gene:OsNip_04g0527400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0527400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26364147	26364844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;Name=OsNip_04t0527400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0527400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26364147	26364844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26365080	26365124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26365080	26365377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;Name=OsNip_04t0527400-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0527400-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26365125	26365377	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0527400-02;Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;protein_id=OsNip_04t0527400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26365476	26365547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0527400-02;Name=OsNip_04t0527400-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0527400-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26493618	26494581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529500-03;Name=OsNip_04t0529500-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0529500-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26502737	26503177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529600-01;Name=OsNip_04t0529600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0529600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26503076	26503177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26504423	26504481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26504423	26506105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529700-01;Name=OsNip_04t0529700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0529700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26504482	26505876	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0529700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0529700-01;protein_id=OsNip_04t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26505877	26506105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26506073	26508797	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0529800;biotype=protein_coding;description=Sugar/inositol;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26506073	26508797	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0529800-01;Parent=gene:OsNip_04g0529800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0529800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26506073	26506600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26506073	26508003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;Name=OsNip_04t0529800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0529800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26506601	26508003	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0529800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;protein_id=OsNip_04t0529800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26508480	26508648	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0529800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;protein_id=OsNip_04t0529800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26508480	26508797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;Name=OsNip_04t0529800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0529800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26508649	26508797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26506261	26506600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26506261	26507840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-02;Name=OsNip_04t0529800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0529800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26506601	26507839	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0529800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0529800-02;protein_id=OsNip_04t0529800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26507840	26507840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0529800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26511352	26515329	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0530000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26511352	26515329	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0530000-01;Parent=gene:OsNip_04g0530000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0530000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26511352	26511553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26512156	26512207	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0530000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;protein_id=OsNip_04t0530000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26513697	26513747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;Name=OsNip_04t0530000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0530000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26513697	26513747	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0530000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;protein_id=OsNip_04t0530000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26514606	26514740	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0530000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;protein_id=OsNip_04t0530000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26514606	26514806	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0530000-01;Name=OsNip_04t0530000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0530000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26528506	26528717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0530400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26530841	26530972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0530400-01;Name=OsNip_04t0530400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0530400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26560942	26561256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531100-02;Tag=IsoSeq:G7798.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6126.3,Nipponbare.panicle_G6126.2,Nipponbare.root_G4684.1;prot_id "UniRef90_A0A7J6FF82";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26566506	26566611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-01;Name=OsNip_04t0531300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0531300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26569983	26570069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-01;Name=OsNip_04t0531300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0531300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26570035	26570069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26570756	26571227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26565601	26565668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26569983	26570034	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0531300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;protein_id=OsNip_04t0531300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26569983	26570069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Name=OsNip_04t0531300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0531300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26570035	26570069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26570756	26570939	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Name=OsNip_04t0531300-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531300-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26570756	26570939	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26571401	26571685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Name=OsNip_04t0531300-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531300-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26571401	26571685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26572735	26575287	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0531400;Name=SIT2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26572754	26575020	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0531400-01;Parent=gene:OsNip_04g0531400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0531400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26572754	26572927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26572754	26574555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;Name=OsNip_04t0531400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0531400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26572928	26574555	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0531400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;protein_id=OsNip_04t0531400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26574667	26574949	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0531400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;protein_id=OsNip_04t0531400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26574667	26575020	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;Name=OsNip_04t0531400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26574950	26575020	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	26572735	26575287	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0531400-02;Parent=gene:OsNip_04g0531400;transcript_id=OsNip_04t0531400-02;Tag=IsoSeq:G7800.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4686.1,Nipponbare.leaf_G3575.1,Nipponbare.root_G4686.2,Nipponbare.panicle_G6127.1
Chr04	TAMA	exon	26572735	26575287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-02;Name=OsNip_04t0531400-02;exon_id=OsNip_04t0531400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7800.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4686.1,Nipponbare.leaf_G3575.1,Nipponbare.root_G4686.2,Nipponbare.panicle_G6127.1;prot_id "UniRef90_A0A287IXA1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	CDS	26574151	26574309	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0531400-02;Parent=transcript:OsNip_04t0531400-02;protein_id=OsNip_04t0531400-02;Tag=IsoSeq:G7800.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4686.1,Nipponbare.leaf_G3575.1,Nipponbare.root_G4686.2,Nipponbare.panicle_G6127.1;prot_id "UniRef90_A0A287IXA1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	26574310	26575287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-02;Tag=IsoSeq:G7800.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4686.1,Nipponbare.leaf_G3575.1,Nipponbare.root_G4686.2,Nipponbare.panicle_G6127.1;prot_id "UniRef90_A0A287IXA1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	26572735	26574148	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531400-02;Tag=IsoSeq:G7800.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4686.1,Nipponbare.leaf_G3575.1,Nipponbare.root_G4686.2,Nipponbare.panicle_G6127.1;prot_id "UniRef90_A0A287IXA1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26576255	26578707	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0531500;biotype=protein_coding;description=Concanavalin;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26576255	26578707	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0531500-01;Parent=gene:OsNip_04g0531500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26576255	26576297	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26576255	26578707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531500-01;Name=OsNip_04t0531500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26576298	26578508	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0531500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0531500-01;protein_id=OsNip_04t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26578509	26578707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26576334	26578699	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0531600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26576334	26578699	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0531600-01;Parent=gene:OsNip_04g0531600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26576334	26576560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26576334	26578699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531600-01;Name=OsNip_04t0531600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26576561	26576974	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0531600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0531600-01;protein_id=OsNip_04t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26576975	26578699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	26580248	26582931	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0531700;biotype=protein_coding;description=Short-chain;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26580262	26582931	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0531700-01;Parent=gene:OsNip_04g0531700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26580262	26580457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26580262	26581394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Name=OsNip_04t0531700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26580458	26580787	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;protein_id=OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26580788	26581394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26581759	26581953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Name=OsNip_04t0531700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26581759	26581953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	26582395	26582931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Name=OsNip_04t0531700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0531700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26582395	26582931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	26580248	26582928	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0531700-02;Parent=gene:OsNip_04g0531700;transcript_id=OsNip_04t0531700-02;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1
Chr04	TAMA	exon	26580248	26580376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-02;Name=OsNip_04t0531700-02;exon_id=OsNip_04t0531700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1;prot_id "UniRef90_M0W893";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	exon	26580487	26580745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-02;Name=OsNip_04t0531700-02;exon_id=OsNip_04t0531700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1;prot_id "UniRef90_M0W893";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	exon	26581329	26581394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-02;Name=OsNip_04t0531700-02;exon_id=OsNip_04t0531700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1;prot_id "UniRef90_M0W893";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	exon	26581759	26581953	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0531700-02;Name=OsNip_04t0531700-02;exon_id=OsNip_04t0531700-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1;prot_id "UniRef90_M0W893";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	CDS	26581820	26581945	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0531700-02;Parent=transcript:OsNip_04t0531700-02;protein_id=OsNip_04t0531700-02;Tag=IsoSeq:G7802.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6129.2,Nipponbare.leaf_G3577.1,Nipponbare.root_G4688.1;prot_id "UniRef90_M0W893";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26678450	26678662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0533602-00;Name=OsNip_04t0533602-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0533602-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26678450	26678662	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0533602-00;Parent=transcript:OsNip_04t0533602-00;protein_id=OsNip_04t0533602-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	26918121	26918294	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0538100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0538100-01;protein_id=OsNip_04t0538100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	26958848	26960262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0538700-01;Name=OsNip_04t0538700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0538700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26962438	26968050	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0538800-01;Parent=gene:OsNip_04g0538800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0538800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26976417	26976420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0538900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	26977442	26978662	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0539000-01;Parent=gene:OsNip_04g0539000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0539000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26977442	26977481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0539000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27013503	27013535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0539701-00;Name=OsNip_04t0539701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0539701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27015657	27019587	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0539800-01;Parent=gene:OsNip_04g0539800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0539800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27015657	27015824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0539800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27034509	27034736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0540401-00;Name=OsNip_04t0540401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0540401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27137227	27137856	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0542000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;protein_id=OsNip_04t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27137857	27137954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27143051	27143772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;Name=OsNip_04t0542000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0542000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27143051	27143772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27143884	27144180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;Name=OsNip_04t0542000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0542000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27143884	27144180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	27137141	27138778	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0542000-02;Parent=gene:OsNip_04g0542000;transcript_id=OsNip_04t0542000-02;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3
Chr04	TAMA	exon	27137141	27138084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;Name=OsNip_04t0542000-02;exon_id=OsNip_04t0542000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	27138312	27138778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;Name=OsNip_04t0542000-02;exon_id=OsNip_04t0542000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	27138509	27138619	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0542000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;protein_id=OsNip_04t0542000-02;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	27137141	27138084	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	27138312	27138508	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	27138623	27138778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542000-02;Tag=IsoSeq:G7844.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6162.3;prot_id "UniRef90_A0A5B7B8A0";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	27149973	27152079	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0542100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27149973	27152079	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0542100-01;Parent=gene:OsNip_04g0542100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27149973	27149974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27149973	27152079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0542100-01;Name=OsNip_04t0542100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0542100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27149975	27150577	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0542100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0542100-01;protein_id=OsNip_04t0542100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27222923	27223073	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0543700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0543700-01;protein_id=OsNip_04t0543700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27256445	27256508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0544400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27258527	27258940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0544400-00;Name=OsNip_04t0544400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0544400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	27256193	27257129	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0544400-01;Tag=IsoSeq:G7854.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3603.2;prot_id "UniRef90_A0A1U7YZK1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27261210	27261331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0544700-00;Name=OsNip_04t0544700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0544700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27462955	27463454	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548450-00;Name=OsNip_04t0548450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0548450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27467112	27467245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548450-00;Name=OsNip_04t0548450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0548450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27466424	27467214	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0548500-01;Parent=gene:OsNip_04g0548500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0548500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27466424	27466676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27466841	27467214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548500-01;Name=OsNip_04t0548500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0548500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27478192	27479717	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0548700-01;Parent=gene:OsNip_04g0548700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0548700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27478192	27478384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27478192	27478730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0548700-01;Name=OsNip_04t0548700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0548700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27551423	27560074	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0550400-01;Parent=gene:OsNip_04g0550400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0550400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27551423	27551838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0550400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27646851	27647183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552066-00;Name=OsNip_04t0552066-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0552066-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27655668	27655706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27655668	27655893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;Name=OsNip_04t0552200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0552200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27655994	27656106	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0552200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;protein_id=OsNip_04t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27656183	27656376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;Name=OsNip_04t0552200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0552200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27656183	27656376	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0552200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;protein_id=OsNip_04t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27656476	27656809	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0552200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;protein_id=OsNip_04t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27656476	27657079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;Name=OsNip_04t0552200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0552200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27656810	27657079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0552200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	27656472	27656826	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0552250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27701946	27702046	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0553300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0553300-01;protein_id=OsNip_04t0553300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27702445	27702650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0553300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0553300-01;protein_id=OsNip_04t0553300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27702445	27702667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0553300-01;Name=OsNip_04t0553300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0553300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	27783927	27784171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0555300-03;Tag=IsoSeq:G7888.14;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6194.13;prot_id "UniRef90_A0A3S3QKQ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27798127	27798763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0555500-01;Name=OsNip_04t0555500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0555500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27837201	27838008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27853304	27853508	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27853304	27854961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556600-01;Name=OsNip_04t0556600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0556600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27854901	27854961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27853509	27853650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27853509	27854879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556550-00;Name=OsNip_04t0556550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0556550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27853651	27854061	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0556550-00;Parent=transcript:OsNip_04t0556550-00;protein_id=OsNip_04t0556550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27854062	27854879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	27864116	27866585	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0556900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27864116	27866585	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0556900-01;Parent=gene:OsNip_04g0556900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0556900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27864116	27864481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27864116	27864882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;Name=OsNip_04t0556900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0556900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27865628	27865682	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0556900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;protein_id=OsNip_04t0556900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27866334	27866543	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0556900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;protein_id=OsNip_04t0556900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27866334	27866585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;Name=OsNip_04t0556900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0556900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27866544	27866585	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0556900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	27868073	27870370	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0557000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	27868084	27870370	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0557000-01;Parent=gene:OsNip_04g0557000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0557000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27868084	27868201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557000-01;Name=OsNip_04t0557000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0557000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27868084	27868201	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27868993	27869040	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27868993	27870370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557000-01;Name=OsNip_04t0557000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0557000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27869041	27870093	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0557000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0557000-01;protein_id=OsNip_04t0557000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27900983	27901048	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557400-00;Name=OsNip_04t0557400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0557400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27915598	27916115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27916193	27916849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Name=OsNip_04t0557500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0557500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27916193	27916849	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27931237	27931293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Name=OsNip_04t0557500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0557500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	27931656	27931753	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Name=OsNip_04t0557500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0557500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27931656	27931753	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;protein_id=OsNip_04t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27939183	27939319	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0557500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;protein_id=OsNip_04t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	27939183	27939357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Name=OsNip_04t0557500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0557500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27939320	27939357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27949384	27949701	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0557800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	27949864	27950274	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0557800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0557800-00;protein_id=OsNip_04t0557800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28073346	28073579	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0560400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0560400-01;protein_id=OsNip_04t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28074048	28074593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0560400-01;Name=OsNip_04t0560400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0560400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28074593	28074593	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28075550	28075655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0560500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28117990	28118316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0561700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28129819	28129939	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0561950-00;Name=OsNip_04t0561950-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0561950-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28137735	28137874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0562100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28137875	28138369	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0562100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0562100-01;protein_id=OsNip_04t0562100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28138467	28138598	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0562100-01;Name=OsNip_04t0562100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0562100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28138467	28138598	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0562100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0562100-01;protein_id=OsNip_04t0562100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	28175060	28175275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t056299A-01;Tag=IsoSeq:G7919.1;Source=Nipponbare.panicle_G6218.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28184950	28185097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0563000-01;Name=OsNip_04t0563000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0563000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28195316	28195490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0563100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28293711	28293768	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0564600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0564600-02;protein_id=OsNip_04t0564600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28296439	28296642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0564700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28296439	28296747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0564700-02;Name=OsNip_04t0564700-02-E17;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0564700-02-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28501934	28502492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0567200-01;Name=OsNip_04t0567200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0567200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28566811	28567732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0568400-01;Name=OsNip_04t0568400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0568400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28567404	28567732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0568400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28645462	28646013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0569500-00;Name=OsNip_04t0569500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0569500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28722495	28723019	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-02;Name=OsNip_04t0570800-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0570800-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28723566	28723854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28725710	28725920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-02;Name=OsNip_04t0570800-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0570800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28726675	28727491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-02;Name=OsNip_04t0570800-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0570800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28724161	28724416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-01;Name=OsNip_04t0570800-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0570800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28724194	28724416	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0570800-01;Parent=transcript:OsNip_04t0570800-01;protein_id=OsNip_04t0570800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28724626	28724703	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0570800-01;Name=OsNip_04t0570800-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0570800-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28746297	28746421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571200-01;Name=OsNip_04t0571200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28746297	28746421	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0571200-01;protein_id=OsNip_04t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28746706	28746814	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0571200-01;protein_id=OsNip_04t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28747409	28747841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571200-01;Name=OsNip_04t0571200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28747454	28747841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28751117	28751547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28751117	28751916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;Name=OsNip_04t0571300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0571300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28751548	28751916	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;protein_id=OsNip_04t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28752415	28752654	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;protein_id=OsNip_04t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28752415	28753070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;Name=OsNip_04t0571300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28752655	28753070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28751117	28754394	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0571300-01;Parent=gene:OsNip_04g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28751117	28751547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28751117	28751916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;Name=OsNip_04t0571300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0571300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28752415	28752533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;Name=OsNip_04t0571300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28752415	28752533	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;protein_id=OsNip_04t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28753600	28754026	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;protein_id=OsNip_04t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28753600	28754394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;Name=OsNip_04t0571300-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0571300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28754027	28754394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28751148	28754395	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0571300-03;Parent=gene:OsNip_04g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28751148	28751547	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28751148	28751916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;Name=OsNip_04t0571300-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0571300-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28751548	28751916	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;protein_id=OsNip_04t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28752415	28752533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;Name=OsNip_04t0571300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28752415	28752533	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;protein_id=OsNip_04t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28753600	28754026	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_04t0571300-03;protein_id=OsNip_04t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28774369	28774623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28774947	28776387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571700-01;Name=OsNip_04t0571700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0571700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28790584	28791208	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-01;Name=OsNip_04t0571800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0571800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28788578	28788882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28788578	28789068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;Name=OsNip_04t0571800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0571800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28788883	28789068	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0571800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;protein_id=OsNip_04t0571800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28789952	28790049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;Name=OsNip_04t0571800-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0571800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28790584	28790908	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0571800-02;Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;protein_id=OsNip_04t0571800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28790584	28791105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;Name=OsNip_04t0571800-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0571800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28790909	28791105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0571800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28809427	28809535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28809427	28809738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;Name=OsNip_04t0572100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0572100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28809536	28809738	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0572100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;protein_id=OsNip_04t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28810965	28810986	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0572100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;protein_id=OsNip_04t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28810965	28812531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;Name=OsNip_04t0572100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0572100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28810987	28812531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28813791	28814782	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0572200;Name=OsNip_ERF#023;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28813791	28814782	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0572200-00;Parent=gene:OsNip_04g0572200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0572200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28813791	28814782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572200-00;Name=OsNip_04t0572200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0572200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28813898	28814518	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0572200-00;Parent=transcript:OsNip_04t0572200-00;protein_id=OsNip_04t0572200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28814519	28814782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28820861	28821520	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0572400;Name=OsNip_DREB1E;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28820861	28821520	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0572400-00;Parent=gene:OsNip_04g0572400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0572400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28820861	28821520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572400-00;Name=OsNip_04t0572400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0572400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28820861	28821520	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0572400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0572400-00;protein_id=OsNip_04t0572400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28827172	28829781	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0572500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28827172	28829781	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0572500-00;Parent=gene:OsNip_04g0572500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0572500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28828026	28828248	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0572500-00;Parent=transcript:OsNip_04t0572500-00;protein_id=OsNip_04t0572500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28829288	28829781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572500-00;Name=OsNip_04t0572500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0572500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28829288	28829781	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0572500-00;Parent=transcript:OsNip_04t0572500-00;protein_id=OsNip_04t0572500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28841171	28846886	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0572600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28841171	28846886	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0572600-01;Parent=gene:OsNip_04g0572600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0572600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28852532	28852782	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28854121	28854690	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0572800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28854121	28854690	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0572800-00;Parent=gene:OsNip_04g0572800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0572800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28854531	28854690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0572800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28862600	28868988	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0573000-01;Parent=gene:OsNip_04g0573000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28862600	28863045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;Name=OsNip_04t0573000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0573000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28862600	28863045	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28865279	28865399	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0573000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;protein_id=OsNip_04t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28865560	28865871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;Name=OsNip_04t0573000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0573000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28865560	28865871	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0573000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;protein_id=OsNip_04t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28866175	28866629	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573000-01;Name=OsNip_04t0573000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0573000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28874207	28874776	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573300-00;Name=OsNip_04t0573300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0573300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28878474	28878849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-01;Name=OsNip_04t0573200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0573200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28876277	28876411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-02;Name=OsNip_04t0573200-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0573200-03-E2;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28876277	28876411	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-03;Name=OsNip_04t0573200-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0573200-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28876277	28876411	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0573200-03;Parent=transcript:OsNip_04t0573200-03;protein_id=OsNip_04t0573200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28878474	28881577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-03;Name=OsNip_04t0573200-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0573200-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28878774	28879450	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28879451	28879885	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0573200-05;Parent=transcript:OsNip_04t0573200-05;protein_id=OsNip_04t0573200-05;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28879886	28882313	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0573200-05;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28901149	28902573	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0574100-03;Parent=transcript:OsNip_04t0574100-03;protein_id=OsNip_04t0574100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28902574	28902745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	gene	28903014	28904553	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g057419A;Tag=IsoSeq:G7955
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Chr04	TAMA	exon	28903014	28904553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419A-01;Name=OsNip_04t057419A-01-E1;exon_id=OsNip_04t057419A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7955.1;Source=Nipponbare.leaf_G3630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3F4R7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	28904552	28904553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419A-01;Tag=IsoSeq:G7955.1;Source=Nipponbare.leaf_G3630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3F4R7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	28903014	28904339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419A-01;Tag=IsoSeq:G7955.1;Source=Nipponbare.leaf_G3630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3F4R7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	exon	28903558	28904358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419B-01;Name=OsNip_04t057419B-01-E1;exon_id=OsNip_04t057419B-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7956.1;Source=Nipponbare.panicle_G6244.1,Nipponbare.leaf_G3631.1;prot_id "UniRef90_B8AH47";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	28903558	28904187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419B-01;Tag=IsoSeq:G7956.1;Source=Nipponbare.panicle_G6244.1,Nipponbare.leaf_G3631.1;prot_id "UniRef90_B8AH47";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	28904281	28904358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t057419B-01;Tag=IsoSeq:G7956.1;Source=Nipponbare.panicle_G6244.1,Nipponbare.leaf_G3631.1;prot_id "UniRef90_B8AH47";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28910272	28911853	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0574200;Name=OsNip_FLA1;biotype=protein_coding;description=FAS1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28910272	28911853	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0574200-01;Parent=gene:OsNip_04g0574200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0574200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28910272	28911853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574200-01;Name=OsNip_04t0574200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0574200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28922841	28923696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574500-01;Name=OsNip_04t0574500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0574500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28923179	28923696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28926377	28926840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574600-01;Name=OsNip_04t0574600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0574600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	28928722	28929133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574600-01;Name=OsNip_04t0574600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0574600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28928992	28929133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28929773	28932030	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0574700-01;Parent=gene:OsNip_04g0574700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28929773	28929923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28929773	28930469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;Name=OsNip_04t0574700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0574700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28929924	28930469	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0574700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;protein_id=OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28930564	28931369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;Name=OsNip_04t0574700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0574700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28930564	28931369	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0574700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;protein_id=OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28931445	28931829	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0574700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;protein_id=OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28931445	28932030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;Name=OsNip_04t0574700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0574700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28931830	28932030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28932065	28934270	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0574800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28932065	28934270	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0574800-00;Parent=gene:OsNip_04g0574800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0574800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28932065	28932992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;Name=OsNip_04t0574800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0574800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28932065	28932992	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0574800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;protein_id=OsNip_04t0574800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28933582	28933662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;Name=OsNip_04t0574800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0574800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28933582	28933662	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0574800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;protein_id=OsNip_04t0574800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28934227	28934270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;Name=OsNip_04t0574800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0574800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	28934227	28934270	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0574800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0574800-00;protein_id=OsNip_04t0574800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	28973239	28974207	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0575801;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	28973239	28974207	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0575801-01;Parent=gene:OsNip_04g0575801;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0575801-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	28973239	28974207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0575801-01;Name=OsNip_04t0575801-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0575801-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	29032490	29033262	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0576300;Name=OsNip_STA131;biotype=protein_coding;description=tRNA;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29032490	29033262	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0576300-01;Parent=gene:OsNip_04g0576300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0576300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29032490	29032662	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29032490	29033262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576300-01;Name=OsNip_04t0576300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0576300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	29032832	29033430	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0576400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29067612	29067837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576700-01;Name=OsNip_04t0576700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0576700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29068512	29068704	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0576700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0576700-01;protein_id=OsNip_04t0576700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29068789	29068949	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0576700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0576700-01;protein_id=OsNip_04t0576700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29068789	29069212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576700-01;Name=OsNip_04t0576700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0576700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29068950	29069212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	29065911	29066192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576700-02;Name=OsNip_04t0576700-02;exon_id=OsNip_04t0576700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G7960.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4792.4,Nipponbare.panicle_G6247.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6SUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	exon	29066273	29066365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0576700-02;Name=OsNip_04t0576700-02;exon_id=OsNip_04t0576700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G7960.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4792.4,Nipponbare.panicle_G6247.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6SUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29247497	29249631	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0579700-01;Parent=gene:OsNip_04g0579700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0579700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29313551	29313690	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0580700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0580700-01;protein_id=OsNip_04t0580700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29313778	29313874	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0580700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0580700-01;protein_id=OsNip_04t0580700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29313778	29314056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0580700-01;Name=OsNip_04t0580700-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0580700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	29350793	29351531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t058129A-01;Tag=IsoSeq:G7978.1;Source=Nipponbare.panicle_G6260.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DHL9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29350946	29351303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29354013	29354190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0581300-01;Name=OsNip_04t0581300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0581300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29366459	29367029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29367030	29367911	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0581400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0581400-01;protein_id=OsNip_04t0581400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	29366710	29367909	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0581451;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29366710	29366922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0581451-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29499839	29500111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0583800-01;Name=OsNip_04t0583800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0583800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29500248	29500598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0583800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29500955	29503774	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0583900-01;Parent=gene:OsNip_04g0583900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29503208	29503336	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0583900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0583900-01;protein_id=OsNip_04t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29503531	29503545	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0583900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0583900-01;protein_id=OsNip_04t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29503531	29503774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0583900-01;Name=OsNip_04t0583900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0583900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29517945	29518095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0584300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29518194	29518385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0584300-01;Name=OsNip_04t0584300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0584300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29518194	29518385	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0584300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29539527	29539662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0584800-01;Name=OsNip_04t0584800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0584800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29544590	29544700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0584900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29552142	29552409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29552410	29552465	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0585000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0585000-01;protein_id=OsNip_04t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29552739	29552997	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0585000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0585000-01;protein_id=OsNip_04t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29552739	29553107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585000-01;Name=OsNip_04t0585000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0585000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29552998	29553107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	CDS	29552175	29552321	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0585000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0585000-02;protein_id=OsNip_04t0585000-02;Tag=IsoSeq:G7988.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6268.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8K2H7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	29552322	29553103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585000-02;Tag=IsoSeq:G7988.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6268.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8K2H7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	29552132	29552172	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585000-02;Tag=IsoSeq:G7988.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6268.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8K2H7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29552395	29552984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585050-00;Name=OsNip_04t0585050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0585050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29556896	29563246	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0585100-01;Parent=gene:OsNip_04g0585100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0585100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29556896	29557047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29556896	29557893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585100-01;Name=OsNip_04t0585100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0585100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29557048	29557893	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0585100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0585100-01;protein_id=OsNip_04t0585100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29558212	29558403	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0585100-01;Name=OsNip_04t0585100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0585100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29558212	29558403	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0585100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0585100-01;protein_id=OsNip_04t0585100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29642082	29642380	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0586700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29651702	29651732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0586850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29658700	29658810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587300-01;Name=OsNip_04t0587300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0587300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29658735	29658810	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0587300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0587300-01;protein_id=OsNip_04t0587300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29659203	29660257	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0587300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0587300-01;protein_id=OsNip_04t0587300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29659203	29660577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587300-01;Name=OsNip_04t0587300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0587300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29660258	29660577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	29660983	29662459	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0587400;Name=OsNip_PUP6;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29660983	29662459	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0587400-01;Parent=gene:OsNip_04g0587400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29660983	29661009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29660983	29661097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;Name=OsNip_04t0587400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0587400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29661010	29661097	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0587400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;protein_id=OsNip_04t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	29661215	29662353	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0587400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;protein_id=OsNip_04t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29661215	29662459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;Name=OsNip_04t0587400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0587400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29662354	29662459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	29661126	29662438	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0587400-02;Parent=gene:OsNip_04g0587400;transcript_id=OsNip_04t0587400-02;Tag=IsoSeq:G8001.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3651.2,Nipponbare.panicle_G6279.1
Chr04	TAMA	exon	29661126	29662438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-02;Name=OsNip_04t0587400-02;exon_id=OsNip_04t0587400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8001.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3651.2,Nipponbare.panicle_G6279.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5EKP7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	29661272	29661592	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0587400-02;Parent=transcript:OsNip_04t0587400-02;protein_id=OsNip_04t0587400-02;Tag=IsoSeq:G8001.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3651.2,Nipponbare.panicle_G6279.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5EKP7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	29661126	29661271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-02;Tag=IsoSeq:G8001.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3651.2,Nipponbare.panicle_G6279.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5EKP7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	29661596	29662438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587400-02;Tag=IsoSeq:G8001.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3651.2,Nipponbare.panicle_G6279.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5EKP7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	29666137	29670469	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0587451;Name=OsNip_PUP13;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	29666137	29670469	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0587451-00;Parent=gene:OsNip_04g0587451;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0587451-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29666137	29666749	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587451-00;Name=OsNip_04t0587451-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0587451-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	29670246	29670469	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0587451-00;Name=OsNip_04t0587451-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0587451-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	29669835	29672579	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0587500;Name=OsNip_PUP13;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	29805484	29805995	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0589600-02;Tag=IsoSeq:G8009.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4816.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29803142	29803226	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0589650-00;Name=OsNip_04t0589650-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0589650-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29859989	29860316	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0590400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	29857542	29858504	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0590400-02;Tag=IsoSeq:G8012.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4818.3,Nipponbare.panicle_G6286.1;prot_id "UniRef90_A0A200R547";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	29858784	29860120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0590400-02;Tag=IsoSeq:G8012.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4818.3,Nipponbare.panicle_G6286.1;prot_id "UniRef90_A0A200R547";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	29863417	29863603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0590451-00;Name=OsNip_04t0590451-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0590451-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29977671	29977828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0592600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30020644	30021073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0593800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30242350	30242436	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0599400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0599400-01;protein_id=OsNip_04t0599400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30242829	30242870	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0599400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0599400-01;protein_id=OsNip_04t0599400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	30249437	30253906	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0599675;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30249437	30249528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30250815	30251352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30251468	30252102	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30252433	30252608	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30252722	30253036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30253557	30253906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599675-00;Name=OsNip_04t0599675-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0599675-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	30264259	30267376	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0599700;biotype=protein_coding;description=Cobalamin;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30264259	30267376	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0599700-01;Parent=gene:OsNip_04g0599700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30264259	30264299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0599700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30388420	30388431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30388949	30389110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;Name=OsNip_04t0602200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0602200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30389554	30389688	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0602200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;protein_id=OsNip_04t0602200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30389826	30390044	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0602200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;protein_id=OsNip_04t0602200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30389826	30390045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;Name=OsNip_04t0602200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0602200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30390045	30390045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	30388420	30390721	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0602200-02;Parent=gene:OsNip_04g0602200;transcript_id=OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2
Chr04	TAMA	exon	30390217	30390721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	30390217	30390719	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0602200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;protein_id=OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	30389826	30390074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	30390050	30390074	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0602200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;protein_id=OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	30389554	30389688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	30389268	30389450	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	30388949	30389110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	30388420	30388836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Name=OsNip_04t0602200-02;exon_id=OsNip_04t0602200-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	30390720	30390721	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	30389826	30390047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	30389554	30389688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	30389268	30389450	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602200-02;Tag=IsoSeq:G8043.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4836.6,Nipponbare.leaf_G3671.2,Nipponbare.panicle_G6312.2;prot_id "UniRef90_M0T373";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30413771	30415745	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0602700-00;Parent=gene:OsNip_04g0602700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0602700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30415061	30415147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602700-00;Name=OsNip_04t0602700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0602700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30415061	30415147	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0602700-00;Parent=transcript:OsNip_04t0602700-00;protein_id=OsNip_04t0602700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30415266	30415745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602700-00;Name=OsNip_04t0602700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0602700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30415689	30415745	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0602700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30416463	30418313	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0602800-02;Parent=gene:OsNip_04g0602800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0602800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30704254	30705079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30705080	30705160	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0607200-03;Parent=transcript:OsNip_04t0607200-03;protein_id=OsNip_04t0607200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30705161	30707047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	CDS	30703857	30704235	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0607200-04;Parent=transcript:OsNip_04t0607200-04;protein_id=OsNip_04t0607200-04;Tag=IsoSeq:G8068.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3681.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DI17";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	30704983	30705755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607200-04;Tag=IsoSeq:G8068.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3681.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DI17";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	30711791	30712483	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0607250;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30711791	30712483	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0607250-00;Parent=gene:OsNip_04g0607250;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0607250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30711791	30712483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607250-00;Name=OsNip_04t0607250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30716170	30716186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30716170	30718175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-01;Name=OsNip_04t0607400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30716187	30717158	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0607400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0607400-01;protein_id=OsNip_04t0607400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30717159	30718175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30716195	30722227	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0607400-04;Parent=gene:OsNip_04g0607400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30716195	30716195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30716195	30717273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Name=OsNip_04t0607400-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607400-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30716196	30717158	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0607400-04;Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;protein_id=OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30717159	30717273	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30720366	30720403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Name=OsNip_04t0607400-04-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607400-04-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30720366	30720403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30721588	30722227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Name=OsNip_04t0607400-04-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607400-04-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30721588	30722227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607400-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	30723898	30724911	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0607450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30723898	30724911	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0607450-01;Parent=gene:OsNip_04g0607450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0607450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30723898	30724911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607450-01;Name=OsNip_04t0607450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	30724493	30727084	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0607500;Name=HKT4;biotype=protein_coding;description=Ion;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30724493	30727084	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0607500-02;Parent=gene:OsNip_04g0607500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0607500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30724493	30724997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30724493	30725310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;Name=OsNip_04t0607500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0607500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30724998	30725310	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0607500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;protein_id=OsNip_04t0607500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30725709	30726967	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0607500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;protein_id=OsNip_04t0607500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30725709	30727084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;Name=OsNip_04t0607500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30726968	30727084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	30724691	30726976	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0607500-01;Parent=gene:OsNip_04g0607500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30724691	30724691	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30724691	30724866	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;Name=OsNip_04t0607500-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0607500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30724692	30724866	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0607500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;protein_id=OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30725086	30725310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;Name=OsNip_04t0607500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0607500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30725086	30725310	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0607500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;protein_id=OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	30725709	30726967	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0607500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;protein_id=OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30725709	30726976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;Name=OsNip_04t0607500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0607500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30726968	30726976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0607500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	30730362	30735354	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0607566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	30846035	30846347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609100-02;Tag=IsoSeq:G8075.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6333.2;prot_id "UniRef90_A0A0D3HIR6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30852341	30852677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609200-01;Name=OsNip_04t0609200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0609200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30852341	30852677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	30852825	30853027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609200-01;Name=OsNip_04t0609200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0609200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30852825	30853027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30853116	30853641	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0609200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30957085	30957612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0610700-01;Name=OsNip_04t0610700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0610700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30998324	30999600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611200-01;Name=OsNip_04t0611200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0611200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	30995900	30997072	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611233-00;Name=OsNip_04t0611233-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0611233-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31001451	31001903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611300-01;Name=OsNip_04t0611300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0611300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31001600	31001903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31001449	31001587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611266-00;Name=OsNip_04t0611266-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0611266-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31001515	31001587	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611266-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31003855	31007535	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0611400-01;Parent=gene:OsNip_04g0611400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0611400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31003855	31003901	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31011805	31011846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611500-01;Name=OsNip_04t0611500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0611500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31011846	31011846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	31007597	31013810	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0611500-02;Parent=gene:OsNip_04g0611500;transcript_id=OsNip_04t0611500-02;Tag=IsoSeq:G8090.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6347.3
Chr04	TAMA	exon	31013677	31013810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611500-02;Name=OsNip_04t0611500-02;exon_id=OsNip_04t0611500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8090.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6347.3;prot_id "UniRef90_M0RL95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	CDS	31013677	31013808	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0611500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0611500-02;protein_id=OsNip_04t0611500-02;Tag=IsoSeq:G8090.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6347.3;prot_id "UniRef90_M0RL95";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31030174	31030419	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0611800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0611800-00;protein_id=OsNip_04t0611800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31030692	31031027	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0611800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0611800-00;protein_id=OsNip_04t0611800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31030692	31031039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611800-00;Name=OsNip_04t0611800-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0611800-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31031028	31031039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0611800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	31062464	31062559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0612500-03;Tag=IsoSeq:G8093.9;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3689.7,Nipponbare.panicle_G6349.8;prot_id "UniRef90_UPI00188EAE1A";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31066567	31066702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0612600-02;Name=OsNip_04t0612600-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0612600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31066567	31066702	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0612600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0612600-02;protein_id=OsNip_04t0612600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31079617	31080220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0613100-00;Name=OsNip_04t0613100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0613100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31189295	31193896	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0614650-00;Parent=transcript:OsNip_04t0614650-00;protein_id=OsNip_04t0614650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	31187344	31191251	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0614650-01;Parent=gene:OsNip_04g0614650;transcript_id=OsNip_04t0614650-01;Tag=IsoSeq:G8109.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6363.2
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Chr04	RAP2018-11-26	gene	31270141	31270896	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0616282;Name=OsNip_RLCK159;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31270141	31270896	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0616282-00;Parent=gene:OsNip_04g0616282;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0616282-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	31414880	31414891	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618500-02;Tag=IsoSeq:G8122.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4877.3,Nipponbare.panicle_G6374.2,Nipponbare.leaf_G3702.2;prot_id "UniRef90_A0A2P6Q6S2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31421880	31425084	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0618700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0618700-01;protein_id=OsNip_04t0618700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31421880	31425092	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618700-01;Name=OsNip_04t0618700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0618700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31424345	31425278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	31429753	31429754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t061894A-01;Tag=IsoSeq:G8125.1;Source=Nipponbare.leaf_G3703.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	31429968	31430234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t061894A-01;Tag=IsoSeq:G8125.1;Source=Nipponbare.leaf_G3703.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	31434880	31435978	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0618950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31434880	31435978	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0618950-00;Parent=gene:OsNip_04g0618950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0618950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31434880	31434935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31434880	31435978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618950-00;Name=OsNip_04t0618950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0618950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31434936	31435955	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0618950-00;Parent=transcript:OsNip_04t0618950-00;protein_id=OsNip_04t0618950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31435956	31435978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0618950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	31439595	31443484	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0619000;Name=ONAC083;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31439595	31443397	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0619000-01;Parent=gene:OsNip_04g0619000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0619000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31439595	31440344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0619000-01;Name=OsNip_04t0619000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0619000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31439595	31440344	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0619000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31442086	31443138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0619000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31474399	31474423	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0619500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	31588757	31589367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164A-01;Name=OsNip_04t062164A-01-E1;exon_id=OsNip_04t062164A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8137.1;Source=Nipponbare.leaf_G3707.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	31588952	31589365	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t062164A-01;Parent=transcript:OsNip_04t062164A-01;protein_id=OsNip_04t062164A-01;Tag=IsoSeq:G8137.1;Source=Nipponbare.leaf_G3707.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	31589366	31589367	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164A-01;Tag=IsoSeq:G8137.1;Source=Nipponbare.leaf_G3707.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	31588757	31588949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164A-01;Tag=IsoSeq:G8137.1;Source=Nipponbare.leaf_G3707.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	gene	31588862	31589787	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g062164B;Tag=IsoSeq:G8138
Chr04	TAMA	mRNA	31588862	31589787	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t062164B-01;Parent=gene:OsNip_04g062164B;transcript_id=OsNip_04t062164B-01;Tag=IsoSeq:G8138.1;Source=Nipponbare.panicle_G6386.1
Chr04	TAMA	exon	31588862	31589787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164B-01;Name=OsNip_04t062164B-01-E1;exon_id=OsNip_04t062164B-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8138.1;Source=Nipponbare.panicle_G6386.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	31588864	31589148	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t062164B-01;Parent=transcript:OsNip_04t062164B-01;protein_id=OsNip_04t062164B-01;Tag=IsoSeq:G8138.1;Source=Nipponbare.panicle_G6386.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	31588862	31588863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164B-01;Tag=IsoSeq:G8138.1;Source=Nipponbare.panicle_G6386.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	31589152	31589787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t062164B-01;Tag=IsoSeq:G8138.1;Source=Nipponbare.panicle_G6386.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	31597884	31602430	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0621650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31597884	31602430	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0621650-01;Parent=gene:OsNip_04g0621650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0621650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31597884	31600060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0621650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31597884	31602430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0621650-01;Name=OsNip_04t0621650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0621650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31600061	31600459	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0621650-01;Parent=transcript:OsNip_04t0621650-01;protein_id=OsNip_04t0621650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31600460	31602430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0621650-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31718924	31719152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0624000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31780061	31780211	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0625100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;protein_id=OsNip_04t0625100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31780369	31780431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;Name=OsNip_04t0625100-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0625100-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31780369	31780431	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0625100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;protein_id=OsNip_04t0625100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	31780670	31780783	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0625100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;protein_id=OsNip_04t0625100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	31780670	31780978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;Name=OsNip_04t0625100-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0625100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31780784	31780978	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0625100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31836193	31836454	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0626000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31937356	31939121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0627400-01;Name=OsNip_04t0627400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0627400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31938780	31939121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0627400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	31959627	31961695	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0628000-01;Parent=gene:OsNip_04g0628000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0628000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31964896	31965035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31962543	31962609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-02;Name=OsNip_04t0628100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0628100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	31962543	31962609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	31963750	31965069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-02;Name=OsNip_04t0628100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0628100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31964896	31965069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	31962543	31965091	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0628100-03;Parent=gene:OsNip_04g0628100;transcript_id=OsNip_04t0628100-03;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4
Chr04	TAMA	exon	31962543	31962609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-03;Name=OsNip_04t0628100-03;exon_id=OsNip_04t0628100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4;prot_id "UniRef90_A0A6P5F875";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	31962700	31962796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-03;Name=OsNip_04t0628100-03;exon_id=OsNip_04t0628100-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4;prot_id "UniRef90_A0A6P5F875";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	exon	31963750	31965091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-03;Name=OsNip_04t0628100-03;exon_id=OsNip_04t0628100-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4;prot_id "UniRef90_A0A6P5F875";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	31962543	31962609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-03;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4;prot_id "UniRef90_A0A6P5F875";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	31962700	31962796	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0628100-03;Tag=IsoSeq:G8165.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6412.6,Nipponbare.root_G4899.4;prot_id "UniRef90_A0A6P5F875";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32024094	32024501	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0629600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32025146	32025236	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0629600-02;Parent=transcript:OsNip_04t0629600-02;protein_id=OsNip_04t0629600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32173571	32173715	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0631800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32175276	32175377	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0631800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0631800-00;protein_id=OsNip_04t0631800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32176082	32177352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0631800-00;Name=OsNip_04t0631800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0631800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32177352	32177352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0631800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32185456	32185638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32185724	32185825	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32185905	32187311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632300-01;Name=OsNip_04t0632300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0632300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32186660	32187133	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0632300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0632300-01;protein_id=OsNip_04t0632300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32187134	32187311	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32185847	32187369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632350-01;Name=OsNip_04t0632350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0632350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	32188994	32197539	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0632400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32188994	32189391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632400-01;Name=OsNip_04t0632400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0632400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32188994	32189391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32191763	32192760	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0632400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32302355	32302446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32302189	32302553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635201-00;Name=OsNip_04t0635201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0635201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	32323642	32323989	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0635350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	32323642	32323989	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0635350-00;Parent=gene:OsNip_04g0635350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0635350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32323642	32323989	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635350-00;Name=OsNip_04t0635350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0635350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	32331495	32331996	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0635400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	32331495	32331990	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0635400-00;Parent=gene:OsNip_04g0635400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0635400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32331495	32331647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32331495	32331990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635400-00;Name=OsNip_04t0635400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0635400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32331648	32331974	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0635400-00;Parent=transcript:OsNip_04t0635400-00;protein_id=OsNip_04t0635400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32331975	32331990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	32331496	32331996	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0635400-01;Parent=gene:OsNip_04g0635400;transcript_id=OsNip_04t0635400-01;Tag=IsoSeq:G8188.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6429.3
Chr04	TAMA	exon	32331937	32331996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635400-01;Name=OsNip_04t0635400-01;exon_id=OsNip_04t0635400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8188.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6429.3;prot_id "none";degrade_flag "missing";match_flag "no_orf"
Chr04	TAMA	exon	32331496	32331797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635400-01;Name=OsNip_04t0635400-01;exon_id=OsNip_04t0635400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8188.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6429.3;prot_id "none";degrade_flag "missing";match_flag "no_orf"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	32331657	32332138	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0635450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32331657	32332138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635450-00;Name=OsNip_04t0635450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0635450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32338699	32338925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0635700-01;Name=OsNip_04t0635700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0635700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32476847	32477199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639000-01;Name=OsNip_04t0639000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0639000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32481508	32482342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639200-01;Name=OsNip_04t0639200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0639200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32481778	32482342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	32481008	32482348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639200-02;Name=OsNip_04t0639200-02;exon_id=OsNip_04t0639200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8205.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6442.3,Nipponbare.leaf_G3732.4;prot_id "UniRef90_A0A2R6S365";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	32481010	32481360	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0639200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0639200-02;protein_id=OsNip_04t0639200-02;Tag=IsoSeq:G8205.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6442.3,Nipponbare.leaf_G3732.4;prot_id "UniRef90_A0A2R6S365";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	32481008	32481009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639200-02;Tag=IsoSeq:G8205.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6442.3,Nipponbare.leaf_G3732.4;prot_id "UniRef90_A0A2R6S365";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	32481364	32482348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639200-02;Tag=IsoSeq:G8205.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6442.3,Nipponbare.leaf_G3732.4;prot_id "UniRef90_A0A2R6S365";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	32483088	32485551	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0639300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32483088	32483164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32483165	32483284	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;protein_id=OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32483386	32483451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Name=OsNip_04t0639300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0639300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32483386	32483451	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;protein_id=OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32483559	32483649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Name=OsNip_04t0639300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0639300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32483832	32483961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Name=OsNip_04t0639300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0639300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32483832	32483961	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;protein_id=OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32484035	32484123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Name=OsNip_04t0639300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0639300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32484035	32484123	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;protein_id=OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32484391	32484416	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0639300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;protein_id=OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32484391	32484417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Name=OsNip_04t0639300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0639300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32484417	32484417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	32485323	32485551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;Name=OsNip_04t0639300-02;exon_id=OsNip_04t0639300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	32485323	32485549	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0639300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;protein_id=OsNip_04t0639300-02;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	CDS	32485214	32485226	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0639300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;protein_id=OsNip_04t0639300-02;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	32484891	32484965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;Name=OsNip_04t0639300-02;exon_id=OsNip_04t0639300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	32484630	32484698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;Name=OsNip_04t0639300-02;exon_id=OsNip_04t0639300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	exon	32483088	32483284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0639300-02;Name=OsNip_04t0639300-02;exon_id=OsNip_04t0639300-02-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G8206.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3733.2,Nipponbare.panicle_G6443.2;prot_id "UniRef90_A0A443NIS1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32633728	32633954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0641300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32632433	32632887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0641350-00;Name=OsNip_04t0641350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0641350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32632433	32632887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0641350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32634024	32634383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0641400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32634135	32634383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0641400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	32791897	32792697	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0644300-01;Parent=gene:OsNip_04g0644300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0644300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32791898	32791993	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0644300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;protein_id=OsNip_04t0644300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32792074	32792110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;Name=OsNip_04t0644300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0644300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32792074	32792110	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0644300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;protein_id=OsNip_04t0644300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32792208	32792602	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0644300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;protein_id=OsNip_04t0644300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32792208	32792697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;Name=OsNip_04t0644300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0644300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32792603	32792697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0644300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	32788646	32792800	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0644300-02;Parent=gene:OsNip_04g0644300;transcript_id=OsNip_04t0644300-02;Tag=IsoSeq:G8226.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6459.2,Nipponbare.root_G4934.1,Nipponbare.leaf_G3740.2,Nipponbare.leaf_G3740.1,Nipponbare.panicle_G6459.1
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	32801074	32801535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0644600-01;Name=OsNip_04t0644600-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0644600-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32801074	32801535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0644600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32852142	32852271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32852142	32853025	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645200-01;Name=OsNip_04t0645200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0645200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	32855657	32855687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32855657	32856649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645500-01;Name=OsNip_04t0645500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0645500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32855688	32856434	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0645500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0645500-01;protein_id=OsNip_04t0645500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32856435	32856649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	32856597	32860277	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0645600-01;Parent=gene:OsNip_04g0645600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0645600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	32856597	32856865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32856866	32856928	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0645600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0645600-01;protein_id=OsNip_04t0645600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	32857162	32857297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0645600-01;Name=OsNip_04t0645600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0645600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	32857162	32857297	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0645600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0645600-01;protein_id=OsNip_04t0645600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33030613	33031827	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-01;Name=OsNip_04t0648900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0648900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33031010	33031711	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0648900-01;Parent=transcript:OsNip_04t0648900-01;protein_id=OsNip_04t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33031712	33031827	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33030624	33031795	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0648900-02;Parent=gene:OsNip_04g0648900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0648900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33030624	33031009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33030624	33031795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-02;Name=OsNip_04t0648900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0648900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33031010	33031711	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0648900-02;Parent=transcript:OsNip_04t0648900-02;protein_id=OsNip_04t0648900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33031712	33031795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	33030613	33031843	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0648900-03;Parent=gene:OsNip_04g0648900;transcript_id=OsNip_04t0648900-03;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1
Chr04	TAMA	exon	33031775	33031843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-03;Name=OsNip_04t0648900-03;exon_id=OsNip_04t0648900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	33031775	33031842	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0648900-03;Parent=transcript:OsNip_04t0648900-03;protein_id=OsNip_04t0648900-03;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	exon	33030613	33030765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-03;Name=OsNip_04t0648900-03;exon_id=OsNip_04t0648900-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	33030651	33030765	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0648900-03;Parent=transcript:OsNip_04t0648900-03;protein_id=OsNip_04t0648900-03;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	33031843	33031843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0648900-03;Tag=IsoSeq:G8244.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G4947.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33074317	33075371	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0649100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	33071859	33072355	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0649100-04;Name=OsNip_04t0649100-04;exon_id=OsNip_04t0649100-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8245.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6473.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6G6Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	CDS	33071860	33072355	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0649100-04;Parent=transcript:OsNip_04t0649100-04;protein_id=OsNip_04t0649100-04;Tag=IsoSeq:G8245.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6473.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6G6Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr04	TAMA	exon	33072660	33072685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0649100-04;Name=OsNip_04t0649100-04;exon_id=OsNip_04t0649100-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8245.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6473.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6G6Q8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33161549	33162987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0650700-03;Name=OsNip_04t0650700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0650700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33162171	33162987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0650700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33254151	33254322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0652700-01;Name=OsNip_04t0652700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0652700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33255235	33255327	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0652700-01;Name=OsNip_04t0652700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0652700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33255235	33255327	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0652700-01;Parent=transcript:OsNip_04t0652700-01;protein_id=OsNip_04t0652700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33334267	33334365	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653500-00;Name=OsNip_04t0653500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0653500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33341978	33346528	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0653600-01;Parent=gene:OsNip_04g0653600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0653600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33341978	33342087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33341978	33342145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653600-01;Name=OsNip_04t0653600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0653600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33346061	33346396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653600-02;Name=OsNip_04t0653600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0653600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33347881	33348507	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0653700-01;Parent=gene:OsNip_04g0653700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0653700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33347881	33347952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33347881	33348507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653700-01;Name=OsNip_04t0653700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0653700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33348307	33348507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0653700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33374335	33374435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33374335	33374727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;Name=OsNip_04t0654400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0654400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33374436	33374727	.	-	1	ID=CDS:OsNip_04t0654400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;protein_id=OsNip_04t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33374806	33375098	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0654400-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;protein_id=OsNip_04t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33374806	33375212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;Name=OsNip_04t0654400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0654400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33375099	33375212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33377245	33378457	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0654500-01;Parent=gene:OsNip_04g0654500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0654500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33377245	33377337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33377245	33378457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654500-01;Name=OsNip_04t0654500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0654500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33377338	33377688	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0654500-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654500-01;protein_id=OsNip_04t0654500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33377689	33378457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33383015	33383211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654550-00;Name=OsNip_04t0654550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0654550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33383015	33383211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33383770	33383987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654550-00;Name=OsNip_04t0654550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0654550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33383787	33383987	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33386622	33391644	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0654600-01;Parent=gene:OsNip_04g0654600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33386622	33386949	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33386622	33387133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;Name=OsNip_04t0654600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0654600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33386950	33387133	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0654600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;protein_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33387202	33387617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;Name=OsNip_04t0654600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0654600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33387202	33387617	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0654600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;protein_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33387700	33387779	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0654600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;protein_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33387870	33388005	.	+	1	ID=CDS:OsNip_04t0654600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;protein_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33388144	33388296	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0654600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0654600-01;protein_id=OsNip_04t0654600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33399564	33402242	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0654800-00;Name=OsNip_04t0654800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0654800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33399564	33402242	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0654800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0654800-00;protein_id=OsNip_04t0654800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33407358	33409844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655000-00;Name=OsNip_04t0655000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0655000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33409806	33409844	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	33415316	33415634	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0655100;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33415316	33415634	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0655100-01;Parent=gene:OsNip_04g0655100;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_04t0655100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33415316	33415634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655100-01;Name=OsNip_04t0655100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0655100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	33418637	33421199	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0655300;Name=OsNip_RLCK168;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33418637	33421199	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0655300-01;Parent=gene:OsNip_04g0655300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33418637	33419752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33418637	33421199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-01;Name=OsNip_04t0655300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0655300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33419753	33420988	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0655300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0655300-01;protein_id=OsNip_04t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33420989	33421199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	33418672	33421140	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0655300-02;Parent=gene:OsNip_04g0655300;transcript_id=OsNip_04t0655300-02;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3
Chr04	TAMA	exon	33418672	33418818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;Name=OsNip_04t0655300-02;exon_id=OsNip_04t0655300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	33419718	33421140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;Name=OsNip_04t0655300-02;exon_id=OsNip_04t0655300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	33421006	33421125	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0655300-02;Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;protein_id=OsNip_04t0655300-02;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	33418672	33418818	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	33419718	33421005	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	33421129	33421140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655300-02;Tag=IsoSeq:G8271.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G3764.3;prot_id "UniRef90_A0A6I9QS05";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	33421535	33422584	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0655400;Name=OsNip_RLCK169;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33421535	33422584	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0655400-01;Parent=gene:OsNip_04g0655400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0655400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33421535	33421918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33421535	33422584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0655400-01;Name=OsNip_04t0655400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0655400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33517990	33518085	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0657100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0657100-01;protein_id=OsNip_04t0657100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33518450	33518501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0657100-01;Name=OsNip_04t0657100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0657100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33561951	33562211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0658000-02;Name=OsNip_04t0658000-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0658000-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33562190	33562211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0658000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33563292	33563672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0658000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33565812	33566481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0658100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33565812	33568359	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0658100-01;Name=OsNip_04t0658100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0658100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33566482	33567768	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0658100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0658100-01;protein_id=OsNip_04t0658100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33649018	33649308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0659400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33648127	33648694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0659450-00;Name=OsNip_04t0659450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0659450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	33649692	33653854	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0659500;Name=OsNip_PP2C45;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	33649693	33653823	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0659500-02;Parent=gene:OsNip_04g0659500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0659500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33649693	33649997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0659500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33649693	33650147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0659500-02;Name=OsNip_04t0659500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0659500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	33650243	33650317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0659500-02;Name=OsNip_04t0659500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0659500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33650243	33650317	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0659500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0659500-02;protein_id=OsNip_04t0659500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33651056	33651147	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0659500-02;Parent=transcript:OsNip_04t0659500-02;protein_id=OsNip_04t0659500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33763609	33763715	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0661600-03;Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;protein_id=OsNip_04t0661600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33763918	33763974	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;Name=OsNip_04t0661600-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0661600-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33763918	33763974	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0661600-03;Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;protein_id=OsNip_04t0661600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	33764062	33764271	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0661600-03;Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;protein_id=OsNip_04t0661600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	33764062	33764473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;Name=OsNip_04t0661600-03-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0661600-03-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	33764272	33764473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	33760415	33764472	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0661600-04;Parent=gene:OsNip_04g0661600;transcript_id=OsNip_04t0661600-04;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1
Chr04	TAMA	exon	33760415	33760599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-04;Name=OsNip_04t0661600-04;exon_id=OsNip_04t0661600-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1;prot_id "UniRef90_B9RQ35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	33760416	33760599	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0661600-04;Parent=transcript:OsNip_04t0661600-04;protein_id=OsNip_04t0661600-04;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1;prot_id "UniRef90_B9RQ35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	33760681	33760807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-04;Name=OsNip_04t0661600-04;exon_id=OsNip_04t0661600-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1;prot_id "UniRef90_B9RQ35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	33760681	33760807	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0661600-04;Parent=transcript:OsNip_04t0661600-04;protein_id=OsNip_04t0661600-04;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1;prot_id "UniRef90_B9RQ35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	33760879	33761009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0661600-04;Name=OsNip_04t0661600-04;exon_id=OsNip_04t0661600-04-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8299.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G4985.1;prot_id "UniRef90_B9RQ35";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	33809451	33809954	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0662600-01;Tag=IsoSeq:G8304.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6519.2;prot_id "UniRef90_A0A2R6R5S9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34093984	34094484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0667900-02;Name=OsNip_04t0667900-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0667900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34094257	34094484	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0667900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34095473	34096058	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0668000-01;Parent=gene:OsNip_04g0668000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0668000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34095473	34095737	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34095473	34096058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668000-01;Name=OsNip_04t0668000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0668000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34095738	34096058	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0668000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0668000-01;protein_id=OsNip_04t0668000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34099320	34103201	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0668200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34099320	34103201	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0668200-01;Parent=gene:OsNip_04g0668200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0668200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34099320	34100122	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34099320	34103201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668200-01;Name=OsNip_04t0668200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0668200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34100123	34100419	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0668200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0668200-01;protein_id=OsNip_04t0668200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34100420	34103201	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34104471	34104969	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0668300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34122909	34123422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34123933	34123980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0668900-01;Name=OsNip_04t0668900-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0668900-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34168155	34168224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;Name=OsNip_04t0670000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34168340	34168494	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0670000-01;Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;protein_id=OsNip_04t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34168340	34168515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;Name=OsNip_04t0670000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0670000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34168495	34168515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34169113	34169404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;Name=OsNip_04t0670000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0670000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34169113	34169404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34171600	34173289	.	+	.	ID=gene:OsNip_04g0670100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34171600	34173070	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0670100-00;Parent=gene:OsNip_04g0670100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34171600	34171617	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34171600	34173070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-00;Name=OsNip_04t0670100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0670100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34171618	34173027	.	+	0	ID=CDS:OsNip_04t0670100-00;Parent=transcript:OsNip_04t0670100-00;protein_id=OsNip_04t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34173028	34173070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	34171600	34173289	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0670100-01;Parent=gene:OsNip_04g0670100;transcript_id=OsNip_04t0670100-01;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1
Chr04	TAMA	exon	34171600	34171817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;Name=OsNip_04t0670100-01;exon_id=OsNip_04t0670100-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	34171601	34171817	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0670100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;protein_id=OsNip_04t0670100-01;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	exon	34171889	34173289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;Name=OsNip_04t0670100-01;exon_id=OsNip_04t0670100-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	CDS	34171889	34173021	.	+	.	ID=CDS:OsNip_04t0670100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;protein_id=OsNip_04t0670100-01;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	34171600	34171600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	34173025	34173289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670100-01;Tag=IsoSeq:G8344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5009.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34171761	34173033	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0670150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34171761	34173033	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0670150-00;Parent=gene:OsNip_04g0670150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0670150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34171761	34172164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670150-00;Name=OsNip_04t0670150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34171761	34172164	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670150-00;Parent=transcript:OsNip_04t0670150-00;protein_id=OsNip_04t0670150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34172279	34172827	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670150-00;Parent=transcript:OsNip_04t0670150-00;protein_id=OsNip_04t0670150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34172279	34173033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670150-00;Name=OsNip_04t0670150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0670150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34172828	34173033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34173356	34176732	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0670200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34173356	34176706	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0670200-02;Parent=gene:OsNip_04g0670200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34173356	34173616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34173356	34173682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Name=OsNip_04t0670200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34173617	34173682	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;protein_id=OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34173993	34174460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Name=OsNip_04t0670200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34173993	34174460	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;protein_id=OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34174537	34174677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Name=OsNip_04t0670200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34174537	34174677	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;protein_id=OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34174774	34175012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Name=OsNip_04t0670200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34176142	34176706	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;Name=OsNip_04t0670200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34176142	34176706	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0670200-02;protein_id=OsNip_04t0670200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34173356	34176732	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0670200-01;Parent=gene:OsNip_04g0670200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0670200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34173356	34173616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34173356	34173682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;Name=OsNip_04t0670200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34174774	34175012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;Name=OsNip_04t0670200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34176142	34176628	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0670200-01;Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;protein_id=OsNip_04t0670200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34176142	34176732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;Name=OsNip_04t0670200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0670200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34176629	34176732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34201068	34205682	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0670400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34201068	34205659	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0670400-02;Parent=gene:OsNip_04g0670400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0670400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34201068	34202359	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34201068	34202426	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0670400-02;Name=OsNip_04t0670400-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0670400-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	34407715	34408387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t067409A-01;Tag=IsoSeq:G8361.1;Source=Nipponbare.root_G5018.1;prot_id "UniRef90_Q6ZCF1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34414832	34415641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0674200-01;Name=OsNip_04t0674200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0674200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34416120	34416275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0674300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34418942	34420114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0674300-01;Name=OsNip_04t0674300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0674300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34418942	34420114	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0674300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0674300-01;protein_id=OsNip_04t0674300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34438196	34438707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0674500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34680569	34681308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-01;Name=OsNip_04t0679100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0679100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34680971	34681308	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	34677496	34680472	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-02;Name=OsNip_04t0679100-02;exon_id=OsNip_04t0679100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8385.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6581.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7LFN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	exon	34680569	34681235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-02;Name=OsNip_04t0679100-02;exon_id=OsNip_04t0679100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8385.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6581.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7LFN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	34678034	34680472	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-02;Tag=IsoSeq:G8385.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6581.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7LFN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	34680569	34681235	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679100-02;Tag=IsoSeq:G8385.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6581.1;prot_id "UniRef90_A0A7J7LFN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34680567	34680852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679150-00;Name=OsNip_04t0679150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0679150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34681372	34685068	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0679200;Name=OsNip_RLCK172;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34681372	34685033	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0679200-02;Parent=gene:OsNip_04g0679200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0679200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34681372	34681619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34682379	34682526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679200-02;Name=OsNip_04t0679200-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0679200-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34682614	34682851	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0679200-02;Parent=transcript:OsNip_04t0679200-02;protein_id=OsNip_04t0679200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34683565	34683699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0679200-02;Name=OsNip_04t0679200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0679200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34753927	34754385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0680700-01;Name=OsNip_04t0680700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0680700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34753927	34754385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0680700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34755297	34756030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0680700-01;Name=OsNip_04t0680700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0680700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34755297	34756030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0680700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34792378	34792586	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0681625-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34830964	34831192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0682300-02;Name=OsNip_04t0682300-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0682300-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34843161	34843336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0682500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34852968	34854671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0682600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34852968	34854888	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0682600-01;Name=OsNip_04t0682600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0682600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34854672	34854887	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0682600-01;Parent=transcript:OsNip_04t0682600-01;protein_id=OsNip_04t0682600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34905817	34905890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683600-01;Name=OsNip_04t0683600-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0683600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34905826	34905890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34906000	34906157	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34906284	34906505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34906733	34907296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	34920963	34921144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683875-00;Name=OsNip_04t0683875-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0683875-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34921628	34921694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683875-00;Name=OsNip_04t0683875-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0683875-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34921804	34921973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683875-00;Name=OsNip_04t0683875-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0683875-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	gene	34922245	34926223	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0683900;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	34922245	34925107	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0683900-02;Parent=gene:OsNip_04g0683900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0683900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34922245	34922489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34922245	34922747	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683900-02;Name=OsNip_04t0683900-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0683900-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34922490	34922747	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0683900-02;Parent=transcript:OsNip_04t0683900-02;protein_id=OsNip_04t0683900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34923135	34923284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0683900-02;Name=OsNip_04t0683900-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0683900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34923135	34923284	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0683900-02;Parent=transcript:OsNip_04t0683900-02;protein_id=OsNip_04t0683900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	34975865	34976010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0684800-03;Name=OsNip_04t0684800-03;exon_id=OsNip_04t0684800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8408.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5047.3,Nipponbare.leaf_G3833.1,Nipponbare.panicle_G6602.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9LDX4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr04	TAMA	exon	34977281	34977733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0684800-03;Name=OsNip_04t0684800-03;exon_id=OsNip_04t0684800-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G8408.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5047.3,Nipponbare.leaf_G3833.1,Nipponbare.panicle_G6602.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9LDX4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr04	TAMA	five_prime_UTR	34976179	34976304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0684800-03;Tag=IsoSeq:G8408.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5047.3,Nipponbare.leaf_G3833.1,Nipponbare.panicle_G6602.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9LDX4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr04	TAMA	three_prime_UTR	34977620	34977733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0684800-03;Tag=IsoSeq:G8408.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5047.3,Nipponbare.leaf_G3833.1,Nipponbare.panicle_G6602.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9LDX4";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	34980601	34980711	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0684900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	34992137	34992338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0685100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34992339	34992464	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0685100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0685100-01;protein_id=OsNip_04t0685100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	34992577	34992690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0685100-01;Name=OsNip_04t0685100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0685100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	34992577	34992690	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0685100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0685100-01;protein_id=OsNip_04t0685100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35178683	35179771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0687900-01;Name=OsNip_04t0687900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_04t0687900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35179494	35179771	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35187443	35187692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35188406	35188590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-02;Name=OsNip_04t0688100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0688100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35188406	35188590	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0688100-02;Parent=transcript:OsNip_04t0688100-02;protein_id=OsNip_04t0688100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35188745	35189040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-02;Name=OsNip_04t0688100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0688100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35187454	35187692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35187454	35188310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;Name=OsNip_04t0688100-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0688100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35188406	35188590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;Name=OsNip_04t0688100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0688100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35188406	35188590	.	-	2	ID=CDS:OsNip_04t0688100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;protein_id=OsNip_04t0688100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35188745	35188982	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0688100-01;Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;protein_id=OsNip_04t0688100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35188745	35189187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;Name=OsNip_04t0688100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0688100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35188983	35189187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	35187598	35189040	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0688100-03;Parent=gene:OsNip_04g0688100;transcript_id=OsNip_04t0688100-03;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3
Chr04	TAMA	exon	35188746	35189040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Name=OsNip_04t0688100-03;exon_id=OsNip_04t0688100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	CDS	35188870	35189040	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0688100-03;Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;protein_id=OsNip_04t0688100-03;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	35188406	35188591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Name=OsNip_04t0688100-03;exon_id=OsNip_04t0688100-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	exon	35187598	35188310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Name=OsNip_04t0688100-03;exon_id=OsNip_04t0688100-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	35188746	35188867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	35188406	35188591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	35187598	35188310	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688100-03;Tag=IsoSeq:G8428.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6619.3,Nipponbare.root_G5061.3;prot_id "UniRef90_A0A446MYH6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr04	RAP2018-11-26	gene	35192194	35193779	.	-	.	ID=gene:OsNip_04g0688200;Name=prx60;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	35192194	35193779	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0688200-01;Parent=gene:OsNip_04g0688200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35192194	35192456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35192194	35193044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0688200-01;Name=OsNip_04t0688200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0688200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35246443	35246736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689000-01;Name=OsNip_04t0689000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0689000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	35246672	35246736	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	TAMA	mRNA	35245425	35246734	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0689000-02;Parent=gene:OsNip_04g0689000;transcript_id=OsNip_04t0689000-02;Tag=IsoSeq:G8431.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5064.2
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Chr04	TAMA	CDS	35245538	35245699	.	-	.	ID=CDS:OsNip_04t0689000-02;Parent=transcript:OsNip_04t0689000-02;protein_id=OsNip_04t0689000-02;Tag=IsoSeq:G8431.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5064.2;prot_id "UniRef90_M0WUX2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	35246444	35246734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689000-02;Tag=IsoSeq:G8431.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5064.2;prot_id "UniRef90_M0WUX2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	five_prime_UTR	35245700	35246369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689000-02;Tag=IsoSeq:G8431.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5064.2;prot_id "UniRef90_M0WUX2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr04	TAMA	three_prime_UTR	35245425	35245535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689000-02;Tag=IsoSeq:G8431.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5064.2;prot_id "UniRef90_M0WUX2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	35267299	35270253	.	-	.	ID=transcript:OsNip_04t0689300-01;Parent=gene:OsNip_04g0689300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0689300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35267299	35267373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35267299	35267712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;Name=OsNip_04t0689300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0689300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35267374	35267712	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0689300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;protein_id=OsNip_04t0689300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35267787	35267873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;Name=OsNip_04t0689300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_04t0689300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35267787	35267873	.	-	0	ID=CDS:OsNip_04t0689300-01;Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;protein_id=OsNip_04t0689300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35267939	35268162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_04t0689300-01;Name=OsNip_04t0689300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_04t0689300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	mRNA	35283206	35286176	.	+	.	ID=transcript:OsNip_04t0689800-00;Parent=gene:OsNip_04g0689800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_04t0689800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	CDS	35284665	35284885	.	+	2	ID=CDS:OsNip_04t0689800-00;Parent=transcript:OsNip_04t0689800-00;protein_id=OsNip_04t0689800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	exon	35320015	35320077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0690400-01;Name=OsNip_04t0690400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0690400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35320015	35320077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0690400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35323280	35323984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0690400-01;Name=OsNip_04t0690400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0690400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35323280	35323984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0690400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35380254	35380322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0691500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35380399	35380458	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0691500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	exon	35380559	35381225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0691500-02;Name=OsNip_04t0691500-02-E28;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_04t0691500-02-E28;rank=28;Tag=RAP2018-11-26
Chr04	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	35380559	35381225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0691500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr04	TAMA	exon	35369138	35369389	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_04t0691500-03;Name=OsNip_04t0691500-03;exon_id=OsNip_04t0691500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8439.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6627.1,Nipponbare.root_G5070.2;prot_id "UniRef90_UPI000C1CE6EB";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	10947	11430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100008-00;Name=OsNip_05t0100008-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100008-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	13858	14071	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0100016-00;Parent=transcript:OsNip_05t0100016-00;protein_id=OsNip_05t0100016-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	13858	14076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100016-00;Name=OsNip_05t0100016-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0100016-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14072	14076	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100016-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33595	33692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	33837	33950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Name=OsNip_05t0100100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	33837	33950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	34676	35119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Name=OsNip_05t0100100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	34703	35119	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;protein_id=OsNip_05t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	35223	35510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Name=OsNip_05t0100100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0100100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	35223	35510	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0100100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;protein_id=OsNip_05t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	36270	36483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Name=OsNip_05t0100100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	36270	36483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	36366	38029	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0100300;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	37224	37440	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0100300-01;Parent=gene:OsNip_05g0100300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_05t0100300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	37224	37440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-01;Name=OsNip_05t0100300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	36366	38029	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0100300-02;Parent=gene:OsNip_05g0100300;transcript_id=OsNip_05t0100300-02;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2
Chr05	TAMA	exon	37360	38029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;Name=OsNip_05t0100300-02;exon_id=OsNip_05t0100300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	37737	38027	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0100300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;protein_id=OsNip_05t0100300-02;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	exon	36366	36600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;Name=OsNip_05t0100300-02;exon_id=OsNip_05t0100300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	38028	38029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	37360	37734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	36366	36600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100300-02;Tag=IsoSeq:G8457.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5081.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	38788	39027	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0100366;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	38788	39027	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0100366-00;Parent=gene:OsNip_05g0100366;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_05t0100366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	38788	39027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0100366-00;Name=OsNip_05t0100366-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0100366-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	44725	47165	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0100500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	44725	47165	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0100500-01;Parent=gene:OsNip_05g0100500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0100500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	201441	201616	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0103600-01;Name=OsNip_05t0103600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0103600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	258770	259018	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0104750-00;Parent=transcript:OsNip_05t0104750-00;protein_id=OsNip_05t0104750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	260126	262272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0104800-01;Parent=gene:OsNip_05g0104800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0104800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	260126	260283	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0104800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	260654	260775	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0104800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0104800-01;protein_id=OsNip_05t0104800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	261172	261401	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0104800-01;Name=OsNip_05t0104800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0104800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	261172	261401	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0104800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0104800-01;protein_id=OsNip_05t0104800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	261803	261882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0104800-01;Name=OsNip_05t0104800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0104800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	317219	317274	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0105900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	317219	317444	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0105900-01;Name=OsNip_05t0105900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0105900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	317538	317626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0105900-01;Name=OsNip_05t0105900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0105900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	327273	328143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0106100-02;Tag=IsoSeq:G8492.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5104.1;prot_id "UniRef90_A9NUI8";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	326148	327003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0106100-02;Tag=IsoSeq:G8492.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5104.1;prot_id "UniRef90_A9NUI8";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	340705	340779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0106200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	492497	492623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0108950-00;Name=OsNip_05t0108950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0108950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	493621	493624	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0108950-00;Parent=transcript:OsNip_05t0108950-00;protein_id=OsNip_05t0108950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	493744	494056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0108950-00;Name=OsNip_05t0108950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0108950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	494751	498039	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0109100-00;Parent=gene:OsNip_05g0109100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0109100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	494751	494799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0109100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	494751	495056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0109100-00;Name=OsNip_05t0109100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0109100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	565153	565266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0110500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	606142	606217	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0111300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0111300-02;protein_id=OsNip_05t0111300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	606423	606742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0111300-02;Name=OsNip_05t0111300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0111300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	606447	606742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0111300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	605869	606764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0111300-03;Name=OsNip_05t0111300-03;exon_id=OsNip_05t0111300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8519.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6693.5;prot_id "UniRef90_A0A0E0H8I9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	701583	701641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	701583	701870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113000-01;Name=OsNip_05t0113000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0113000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	701642	701870	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0113000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0113000-01;protein_id=OsNip_05t0113000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	715762	715894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	716295	718096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	716295	718362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;Name=OsNip_05t0113400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0113400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	718097	718362	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0113400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;protein_id=OsNip_05t0113400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	718465	718615	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0113400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;protein_id=OsNip_05t0113400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	718465	718798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;Name=OsNip_05t0113400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0113400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	718616	718798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	716295	718798	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0113400-02;Parent=gene:OsNip_05g0113400;transcript_id=OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1
Chr05	TAMA	exon	716295	716399	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Name=OsNip_05t0113400-02;exon_id=OsNip_05t0113400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	716297	716399	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0113400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;protein_id=OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	718097	718362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Name=OsNip_05t0113400-02;exon_id=OsNip_05t0113400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	718097	718125	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0113400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;protein_id=OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	718465	718798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Name=OsNip_05t0113400-02;exon_id=OsNip_05t0113400-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	716295	716296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	718129	718362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	718465	718798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113400-02;Tag=IsoSeq:G8525.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3889.1,Nipponbare.root_G5125.1,Nipponbare.panicle_G6699.1;prot_id "UniRef90_F6GV37";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	719134	721868	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0113500-03;Parent=gene:OsNip_05g0113500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	719134	719397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	719134	719566	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;Name=OsNip_05t0113500-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0113500-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	719398	719566	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0113500-03;Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;protein_id=OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	719655	719926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;Name=OsNip_05t0113500-05-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0113500-05-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	719655	719926	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0113500-03;Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;protein_id=OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	720889	721230	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0113500-03;Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;protein_id=OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	720889	721868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;Name=OsNip_05t0113500-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0113500-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	721231	721868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0113500-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	846932	847237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0115500-00;Name=OsNip_05t0115500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0115500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	846932	847237	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0115500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0115500-00;protein_id=OsNip_05t0115500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	849168	850376	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0115600-01;Parent=gene:OsNip_05g0115600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	849168	849220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	849221	849877	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0115600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0115600-01;protein_id=OsNip_05t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	850115	850376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0115600-01;Name=OsNip_05t0115600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0115600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	850190	850376	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	849241	849897	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0115650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	903532	904759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0116850-00;Name=OsNip_05t0116850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0116850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	904207	904759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0116850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	909637	910252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t011699A-01;Name=OsNip_05t011699A-01-E1;exon_id=OsNip_05t011699A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8537.1;Source=Nipponbare.panicle_G6709.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DL62";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	909637	909947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t011699A-01;Tag=IsoSeq:G8537.1;Source=Nipponbare.panicle_G6709.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DL62";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	910143	910252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t011699A-01;Tag=IsoSeq:G8537.1;Source=Nipponbare.panicle_G6709.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DL62";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	912965	913746	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0117000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	912965	913013	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0117000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	912965	913746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0117000-00;Name=OsNip_05t0117000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0117000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	913014	913364	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0117000-00;Parent=transcript:OsNip_05t0117000-00;protein_id=OsNip_05t0117000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	913365	913746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0117000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	919538	920499	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0117300;Name=OsNip_CLE502;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	919592	920499	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0117300-00;Parent=gene:OsNip_05g0117300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0117300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	919592	920116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0117300-00;Name=OsNip_05t0117300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0117300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	919592	920116	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0117300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0117300-00;protein_id=OsNip_05t0117300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	920437	920499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0117300-00;Name=OsNip_05t0117300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0117300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	920437	920499	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0117300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0117300-00;protein_id=OsNip_05t0117300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	919538	920367	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0117300-01;Parent=gene:OsNip_05g0117300;transcript_id=OsNip_05t0117300-01;Tag=IsoSeq:G8538.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6710.1
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1011398	1012312	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0119600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0119600-01;protein_id=OsNip_05t0119600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1012629	1012854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1014025	1014355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1014025	1014658	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-01;Name=OsNip_05t0119700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0119700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1014356	1014658	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0119700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0119700-01;protein_id=OsNip_05t0119700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	1014102	1017649	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0119700-02;Parent=gene:OsNip_05g0119700;transcript_id=OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2
Chr05	TAMA	exon	1017584	1017649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;Name=OsNip_05t0119700-02;exon_id=OsNip_05t0119700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	1017584	1017647	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0119700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;protein_id=OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	1016867	1017185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;Name=OsNip_05t0119700-02;exon_id=OsNip_05t0119700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	1016867	1017185	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0119700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;protein_id=OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	1014102	1016677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;Name=OsNip_05t0119700-02;exon_id=OsNip_05t0119700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	1016560	1016677	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0119700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;protein_id=OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	1017648	1017649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	1014102	1016557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0119700-02;Tag=IsoSeq:G8548.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6719.2;prot_id "UniRef90_UPI001929A2D6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1200288	1200391	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0121900-00;Parent=transcript:OsNip_05t0121900-00;protein_id=OsNip_05t0121900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1200496	1201038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0121900-00;Name=OsNip_05t0121900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0121900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1200496	1201038	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0121900-00;Parent=transcript:OsNip_05t0121900-00;protein_id=OsNip_05t0121900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	1199319	1201050	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0121900-01;Parent=gene:OsNip_05g0121900;transcript_id=OsNip_05t0121900-01;Tag=IsoSeq:G8558.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5146.2
Chr05	TAMA	exon	1200496	1201050	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0121900-01;Name=OsNip_05t0121900-01;exon_id=OsNip_05t0121900-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8558.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5146.2;prot_id "UniRef90_A0A022RLC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1300670	1301996	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0123400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0123400-01;protein_id=OsNip_05t0123400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1302075	1302106	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0123400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0123400-01;protein_id=OsNip_05t0123400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1302075	1302199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0123400-01;Name=OsNip_05t0123400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0123400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1302107	1302199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0123400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	1300476	1301686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0123400-02;Tag=IsoSeq:G8564.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5152.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7F9H4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1535979	1536374	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0127233-00;Parent=transcript:OsNip_05t0127233-00;protein_id=OsNip_05t0127233-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	1548659	1550049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-01;Name=OsNip_05t0127300-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0127300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1549830	1550049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1547454	1548630	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0127300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0127300-02;protein_id=OsNip_05t0127300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1549152	1549819	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0127300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0127300-02;protein_id=OsNip_05t0127300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1549152	1550016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-02;Name=OsNip_05t0127300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0127300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1549820	1550016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	1548275	1550016	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0127300-03;Parent=gene:OsNip_05g0127300;transcript_id=OsNip_05t0127300-03;Tag=IsoSeq:G8577.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5160.2
Chr05	TAMA	exon	1548275	1550016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-03;Name=OsNip_05t0127300-03;exon_id=OsNip_05t0127300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8577.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5160.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z8V8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	1548353	1548418	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0127300-03;Parent=transcript:OsNip_05t0127300-03;protein_id=OsNip_05t0127300-03;Tag=IsoSeq:G8577.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5160.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z8V8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	1548275	1548352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-03;Tag=IsoSeq:G8577.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5160.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z8V8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	1548422	1550016	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127300-03;Tag=IsoSeq:G8577.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5160.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z8V8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	1553459	1557224	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0127400;Name=OsNip_DjB5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	1553459	1557206	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0127400-01;Parent=gene:OsNip_05g0127400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1553459	1553622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1553459	1553704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Name=OsNip_05t0127400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0127400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1553623	1553704	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0127400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;protein_id=OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1553721	1553766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Name=OsNip_05t0127400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0127400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1553721	1553766	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0127400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;protein_id=OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1553934	1554207	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0127400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;protein_id=OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1553934	1554238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Name=OsNip_05t0127400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0127400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1554208	1554238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1556612	1557206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Name=OsNip_05t0127400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0127400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1556612	1557206	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0127400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	1553527	1557224	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0127400-02;Parent=gene:OsNip_05g0127400;transcript_id=OsNip_05t0127400-02;Tag=IsoSeq:G8578.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G3907.1
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1705441	1705977	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0129100-00;Parent=transcript:OsNip_05t0129100-00;protein_id=OsNip_05t0129100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1706338	1706779	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0129100-00;Parent=transcript:OsNip_05t0129100-00;protein_id=OsNip_05t0129100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	1704913	1705435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;Name=OsNip_05t0129100-01;exon_id=OsNip_05t0129100-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	1704913	1705435	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0129100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;protein_id=OsNip_05t0129100-01;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	1705546	1705977	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;Name=OsNip_05t0129100-01;exon_id=OsNip_05t0129100-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	1705546	1705898	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0129100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;protein_id=OsNip_05t0129100-01;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	1706338	1707061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;Name=OsNip_05t0129100-01;exon_id=OsNip_05t0129100-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	1705902	1705977	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	1706338	1707061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129100-01;Tag=IsoSeq:G8584.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6748.1,Nipponbare.root_G5164.1,Nipponbare.leaf_G3912.1;prot_id "UniRef90_A0A4S4EG45";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	1707173	1707799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;Name=OsNip_05t0129200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0129200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1707173	1707799	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0129200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;protein_id=OsNip_05t0129200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1707924	1708070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;Name=OsNip_05t0129200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0129200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1707924	1708070	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0129200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;protein_id=OsNip_05t0129200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1708170	1708256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;Name=OsNip_05t0129200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0129200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1708170	1708256	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0129200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;protein_id=OsNip_05t0129200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1708397	1709074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0129200-00;Name=OsNip_05t0129200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0129200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	1866886	1873316	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0132100-02;Parent=gene:OsNip_05g0132100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0132100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1866886	1867168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0132100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	1866886	1867231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0132100-02;Name=OsNip_05t0132100-02-E20;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0132100-02-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	1867341	1867460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0132100-02;Name=OsNip_05t0132100-02-E19;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0132100-02-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	1867341	1867460	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0132100-02;Parent=transcript:OsNip_05t0132100-02;protein_id=OsNip_05t0132100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2054798	2054860	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0135100-00;Parent=transcript:OsNip_05t0135100-00;protein_id=OsNip_05t0135100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2056648	2057590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135100-00;Name=OsNip_05t0135100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0135100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2056648	2057590	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0135100-00;Parent=transcript:OsNip_05t0135100-00;protein_id=OsNip_05t0135100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	2053517	2054148	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0135150;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2053517	2054148	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135150-00;Name=OsNip_05t0135150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0135150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2061827	2061853	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2061827	2062150	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;Name=OsNip_05t0135200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0135200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2061854	2062150	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0135200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;protein_id=OsNip_05t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2062260	2063018	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0135200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;protein_id=OsNip_05t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2062260	2063241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;Name=OsNip_05t0135200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0135200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2063019	2063241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0135200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	2061995	2062783	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0135300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2061995	2062783	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0135300-00;Parent=gene:OsNip_05g0135300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0135300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2143794	2143971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0136800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2143794	2144660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0136800-01;Name=OsNip_05t0136800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0136800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2144416	2144660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0136800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2252861	2252877	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0139200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2259039	2259688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0139300-00;Name=OsNip_05t0139300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0139300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2259039	2259688	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0139300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0139300-00;protein_id=OsNip_05t0139300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2311217	2321098	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0140000-01;Parent=gene:OsNip_05g0140000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0140000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2311217	2311465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Name=OsNip_05t0140000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0140000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2311217	2311465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2311544	2312182	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2311544	2312598	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Name=OsNip_05t0140000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0140000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2316648	2316741	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Name=OsNip_05t0140000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0140000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2316673	2316741	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2320955	2321098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Name=OsNip_05t0140000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0140000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2320955	2321098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	2311396	2315442	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0140100;Name=OsNip_MYB2P-1;biotype=protein_coding;description=R2R3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2311396	2315429	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0140100-01;Parent=gene:OsNip_05g0140100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0140100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2311396	2311510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140100-01;Name=OsNip_05t0140100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0140100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2311396	2311510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2311594	2313402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2326313	2331324	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0140334-00;Parent=gene:OsNip_05g0140334;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0140334-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2331231	2331324	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140334-00;Name=OsNip_05t0140334-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0140334-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2333058	2333203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140500-01;Name=OsNip_05t0140500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0140500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2333058	2333203	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0140500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0140500-01;protein_id=OsNip_05t0140500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2334716	2335074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0140600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2550170	2550769	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0144300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0144300-01;protein_id=OsNip_05t0144300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2551393	2551594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0144300-01;Name=OsNip_05t0144300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0144300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2557011	2557075	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0144300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0144300-01;protein_id=OsNip_05t0144300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2557583	2557718	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0144300-01;Name=OsNip_05t0144300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0144300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2585097	2585207	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0144800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0144800-01;protein_id=OsNip_05t0144800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2714257	2714257	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2714257	2714335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;Name=OsNip_05t0147200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0147200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2714258	2714335	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;protein_id=OsNip_05t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2714486	2714571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;Name=OsNip_05t0147200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0147200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2714486	2714571	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;protein_id=OsNip_05t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2714648	2714730	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;Name=OsNip_05t0147200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0147200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2714648	2714730	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0147200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0147200-01;protein_id=OsNip_05t0147200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	2796433	2796433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0148900-02;Tag=IsoSeq:G8646.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5204.1;prot_id "UniRef90_A0A287EUU4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2796448	2797487	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0148950-00;Parent=gene:OsNip_05g0148950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0148950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2806170	2807237	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0149100-01;Parent=gene:OsNip_05g0149100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2806170	2807237	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149100-01;Name=OsNip_05t0149100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0149100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2807169	2807237	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2810650	2811774	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0149200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0149200-01;protein_id=OsNip_05t0149200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2811775	2812294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	2810594	2818318	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0149200-02;Parent=gene:OsNip_05g0149200;transcript_id=OsNip_05t0149200-02;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4
Chr05	TAMA	exon	2810594	2811439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Name=OsNip_05t0149200-02;exon_id=OsNip_05t0149200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	2810594	2811226	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0149200-02;Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;protein_id=OsNip_05t0149200-02;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	2815089	2815172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Name=OsNip_05t0149200-02;exon_id=OsNip_05t0149200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	2815640	2818318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Name=OsNip_05t0149200-02;exon_id=OsNip_05t0149200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	2811230	2811439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	2815089	2815172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	2815640	2818318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149200-02;Tag=IsoSeq:G8649.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6801.4;prot_id "UniRef90_A0A1D6FUK5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	2815646	2817965	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0149251;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2815646	2817965	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0149251-00;Parent=gene:OsNip_05g0149251;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0149251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2815646	2816265	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	2815646	2817965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149251-00;Name=OsNip_05t0149251-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0149251-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	2816266	2817735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0149251-00;Parent=transcript:OsNip_05t0149251-00;protein_id=OsNip_05t0149251-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2817736	2817965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149251-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	2833116	2833764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149500-02;Tag=IsoSeq:G8652.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6803.1;prot_id "UniRef90_UPI000F7C69A8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	2834206	2840842	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0149600-02;Parent=gene:OsNip_05g0149600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0149600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2834206	2834613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0149600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	2898458	2898971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0150500-01;Name=OsNip_05t0150500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0150500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3245448	3245998	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	3247483	3247629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155400-01;Name=OsNip_05t0155400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0155400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	3245999	3246383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155450-00;Name=OsNip_05t0155450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0155450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	3251082	3251768	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0155500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	3251082	3251768	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0155500-01;Parent=gene:OsNip_05g0155500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0155500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3251082	3251335	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3251082	3251768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155500-01;Name=OsNip_05t0155500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0155500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3251336	3251566	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0155500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0155500-01;protein_id=OsNip_05t0155500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3251567	3251768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	3252035	3252404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3252035	3252404	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0155601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;protein_id=OsNip_05t0155601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3252503	3252630	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3252503	3252630	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0155601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;protein_id=OsNip_05t0155601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3252708	3252836	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3252708	3252836	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0155601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;protein_id=OsNip_05t0155601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3253934	3254012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	3254112	3254275	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3254364	3254549	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0155601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;protein_id=OsNip_05t0155601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3254654	3254785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	3254654	3254785	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0155601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;protein_id=OsNip_05t0155601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3254880	3254971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0155601-00;Name=OsNip_05t0155601-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0155601-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3529967	3530238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	3526724	3527049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;Name=OsNip_05t0160000-02;exon_id=OsNip_05t0160000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	3526725	3527049	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0160000-02;Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;protein_id=OsNip_05t0160000-02;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	3528716	3530367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;Name=OsNip_05t0160000-02;exon_id=OsNip_05t0160000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	3528716	3528741	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0160000-02;Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;protein_id=OsNip_05t0160000-02;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	3526724	3526724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	3528745	3530367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160000-02;Tag=IsoSeq:G8698.8;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G6842.5;prot_id "UniRef90_A0A0A0K7C2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	3531471	3534877	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0160100;biotype=protein_coding;description=CT11-RanBPM;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	3531471	3534877	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0160100-01;Parent=gene:OsNip_05g0160100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0160100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3531471	3531548	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3531471	3531842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0160100-01;Name=OsNip_05t0160100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0160100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3640228	3640497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0161800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	3723581	3723773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0163400-02;Name=OsNip_05t0163400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0163400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3723863	3723992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0163400-02;Name=OsNip_05t0163400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0163400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3725221	3725381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0163400-02;Name=OsNip_05t0163400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0163400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	3722113	3725420	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0163400-04;Parent=gene:OsNip_05g0163400;transcript_id=OsNip_05t0163400-04;Tag=IsoSeq:G8714.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6855.4,Nipponbare.root_G5246.2
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Chr05	TAMA	CDS	3723863	3723996	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0163400-04;Parent=transcript:OsNip_05t0163400-04;protein_id=OsNip_05t0163400-04;Tag=IsoSeq:G8714.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6855.4,Nipponbare.root_G5246.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	TAMA	exon	3722113	3723229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0163400-04;Name=OsNip_05t0163400-04;exon_id=OsNip_05t0163400-04-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G8714.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6855.4,Nipponbare.root_G5246.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	3722113	3723229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0163400-04;Tag=IsoSeq:G8714.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6855.4,Nipponbare.root_G5246.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	gene	3725745	3726042	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g016349A;Tag=IsoSeq:G8715
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	3981395	3982992	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0166900-00;Parent=gene:OsNip_05g0166900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0166900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3981395	3982119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0166900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	3981395	3982992	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0166900-00;Name=OsNip_05t0166900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0166900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4176428	4176804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0169600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	4175911	4176376	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0169701-00;Parent=gene:OsNip_05g0169701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0169701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4175911	4176339	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0169701-00;Parent=transcript:OsNip_05t0169701-00;protein_id=OsNip_05t0169701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	4175911	4176376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0169701-00;Name=OsNip_05t0169701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0169701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4307346	4309297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4309405	4309494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	4312572	4314358	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0172100-01;Parent=gene:OsNip_05g0172100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4312572	4313112	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	4312572	4314358	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172100-01;Name=OsNip_05t0172100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0172100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4313113	4314282	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0172100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0172100-01;protein_id=OsNip_05t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4314283	4314358	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	4317909	4323215	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0172300-01;Parent=gene:OsNip_05g0172300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0172300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4317909	4318218	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0172300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4318219	4318906	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0172300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0172300-01;protein_id=OsNip_05t0172300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4319266	4319489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0172300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0172300-01;protein_id=OsNip_05t0172300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4320399	4321356	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0172300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0172300-01;protein_id=OsNip_05t0172300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	4876146	4876298	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t018099B-01;Tag=IsoSeq:G8767.1;Source=Nipponbare.root_G5274.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0KZ78";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4877623	4877804	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0181000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4887961	4888152	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0181250-01;Parent=transcript:OsNip_05t0181250-01;protein_id=OsNip_05t0181250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4889989	4890246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0181250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	4887330	4890200	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0181250-02;Parent=gene:OsNip_05g0181250;transcript_id=OsNip_05t0181250-02;Tag=IsoSeq:G8769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5276.1
Chr05	TAMA	exon	4889989	4890200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0181250-02;Name=OsNip_05t0181250-02;exon_id=OsNip_05t0181250-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5276.1;prot_id "UniRef90_A0A287KD56";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	4889989	4890198	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0181250-02;Parent=transcript:OsNip_05t0181250-02;protein_id=OsNip_05t0181250-02;Tag=IsoSeq:G8769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5276.1;prot_id "UniRef90_A0A287KD56";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	4888648	4888790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0181250-02;Name=OsNip_05t0181250-02;exon_id=OsNip_05t0181250-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8769.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5276.1;prot_id "UniRef90_A0A287KD56";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	4940083	4940887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0182150-00;Name=OsNip_05t0182150-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0182150-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4940802	4940887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0182150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	4947693	4951874	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0182201-01;Parent=gene:OsNip_05g0182201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0182201-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	4975672	4975722	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0182700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0182700-01;protein_id=OsNip_05t0182700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4976150	4976514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0182700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4976749	4977011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0182800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	5441429	5441834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5441504	5441834	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	5442389	5442449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5442389	5442449	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5442806	5442916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5442806	5442916	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5443007	5443480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5443007	5443480	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5443560	5443594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5443560	5443594	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5444147	5444673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;Name=OsNip_05t0188600-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0188600-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5444147	5444673	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0188600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0188600-02;protein_id=OsNip_05t0188600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	5437108	5444934	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0188600-03;Parent=gene:OsNip_05g0188600;transcript_id=OsNip_05t0188600-03;Tag=IsoSeq:G8790.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6914.1
Chr05	TAMA	exon	5437108	5437377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0188600-03;Name=OsNip_05t0188600-03;exon_id=OsNip_05t0188600-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8790.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6914.1;prot_id "UniRef90_A0A1D6F7W8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	TAMA	CDS	5619535	5619560	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t019149A-01;Parent=transcript:OsNip_05t019149A-01;protein_id=OsNip_05t019149A-01;Tag=IsoSeq:G8794.1;Source=Nipponbare.panicle_G6917.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	5619564	5619683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t019149A-01;Tag=IsoSeq:G8794.1;Source=Nipponbare.panicle_G6917.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	5625713	5632906	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0191500-02;Parent=gene:OsNip_05g0191500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0191500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5625713	5626097	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5625713	5626155	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;Name=OsNip_05t0191500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0191500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5626098	5626155	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0191500-02;Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;protein_id=OsNip_05t0191500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5632397	5632872	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0191500-02;Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;protein_id=OsNip_05t0191500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5632397	5632906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;Name=OsNip_05t0191500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0191500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5632873	5632906	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	5628754	5632906	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0191500-01;Parent=gene:OsNip_05g0191500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0191500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5628754	5629240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5628754	5629319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0191500-01;Name=OsNip_05t0191500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0191500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5678183	5678671	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0192500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0192500-00;protein_id=OsNip_05t0192500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	5698773	5699231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t019359A-01;Tag=IsoSeq:G8796.1;Source=Nipponbare.leaf_G4007.1;prot_id "UniRef90_A0A453JYF7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5971951	5972018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0196800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	5971951	5972438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0196800-00;Name=OsNip_05t0196800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0196800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	5973358	5973431	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0196800-00;Parent=transcript:OsNip_05t0196800-00;protein_id=OsNip_05t0196800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	6136300	6136663	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0198700-02;Tag=IsoSeq:G8812.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6930.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0HAT3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6157753	6157853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0198950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6157753	6158446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0198950-00;Name=OsNip_05t0198950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0198950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	6191144	6191579	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0199500-01;Name=OsNip_05t0199500-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0199500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6192469	6192611	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0199500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0199500-01;protein_id=OsNip_05t0199500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6650281	6650438	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0207350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0207350-00;protein_id=OsNip_05t0207350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6651337	6651577	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0207350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0207350-00;protein_id=OsNip_05t0207350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6651337	6651625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207350-00;Name=OsNip_05t0207350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0207350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6651578	6651625	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6652760	6656383	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0207400-02;Parent=gene:OsNip_05g0207400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0207400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6652760	6652955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6652956	6653178	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0207400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0207400-02;protein_id=OsNip_05t0207400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6655924	6656207	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0207400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0207400-02;protein_id=OsNip_05t0207400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6655924	6656383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207400-02;Name=OsNip_05t0207400-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0207400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6656208	6656383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	6657481	6661493	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0207500;Name=GSK2;biotype=protein_coding;description=GSK3/SHAGGY-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6657481	6661493	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0207500-01;Parent=gene:OsNip_05g0207500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0207500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6657481	6658018	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0207500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6726768	6727246	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0208550-00;Parent=transcript:OsNip_05t0208550-00;protein_id=OsNip_05t0208550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6727247	6727270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6722943	6723479	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0208500-03;Parent=transcript:OsNip_05t0208500-03;protein_id=OsNip_05t0208500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6723480	6723481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6722266	6723481	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0208500-01;Parent=gene:OsNip_05g0208500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0208500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6722266	6722544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6722266	6722908	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-01;Name=OsNip_05t0208500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0208500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6722545	6722908	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0208500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0208500-01;protein_id=OsNip_05t0208500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6723291	6723481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-01;Name=OsNip_05t0208500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0208500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6723291	6723481	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0208500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0208500-01;protein_id=OsNip_05t0208500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	6721738	6723481	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0208500-04;Parent=gene:OsNip_05g0208500;transcript_id=OsNip_05t0208500-04;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2
Chr05	TAMA	exon	6723447	6723481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-04;Name=OsNip_05t0208500-04;exon_id=OsNip_05t0208500-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2;prot_id "UniRef90_Q0DK03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	6723447	6723481	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0208500-04;Parent=transcript:OsNip_05t0208500-04;protein_id=OsNip_05t0208500-04;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2;prot_id "UniRef90_Q0DK03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	exon	6721738	6723274	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-04;Name=OsNip_05t0208500-04;exon_id=OsNip_05t0208500-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2;prot_id "UniRef90_Q0DK03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	6722923	6723274	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0208500-04;Parent=transcript:OsNip_05t0208500-04;protein_id=OsNip_05t0208500-04;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2;prot_id "UniRef90_Q0DK03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	6721738	6722920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208500-04;Tag=IsoSeq:G8834.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5305.2;prot_id "UniRef90_Q0DK03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	6729957	6733304	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0208600;biotype=protein_coding;description=Myb/SANT-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6729957	6733304	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0208600-00;Parent=gene:OsNip_05g0208600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6729957	6730221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Name=OsNip_05t0208600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0208600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6729957	6730221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6731994	6731994	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6731994	6732342	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Name=OsNip_05t0208600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0208600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6731995	6732342	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0208600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;protein_id=OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6732438	6733055	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0208600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;protein_id=OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6732438	6733304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Name=OsNip_05t0208600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0208600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6733056	6733304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0208600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	6750835	6751956	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0209000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6750835	6751956	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0209000-01;Parent=gene:OsNip_05g0209000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0209000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6750835	6751285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6750835	6751956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209000-01;Name=OsNip_05t0209000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0209000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	6756098	6756320	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209100-01;Name=OsNip_05t0209100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0209100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6773865	6774100	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6773865	6774240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;Name=OsNip_05t0209500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0209500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6774101	6774240	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0209500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;protein_id=OsNip_05t0209500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6774363	6774486	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0209500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;protein_id=OsNip_05t0209500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6774363	6774671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;Name=OsNip_05t0209500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0209500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6774487	6774671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	6787676	6791412	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0209600-01;Parent=gene:OsNip_05g0209600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6787676	6787752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	6788070	6788276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209600-01;Name=OsNip_05t0209600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0209600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6788070	6788276	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0209600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0209600-01;protein_id=OsNip_05t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6788461	6788609	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0209600-01;Name=OsNip_05t0209600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0209600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6788461	6788609	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0209600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0209600-01;protein_id=OsNip_05t0209600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	6882720	6883895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0211100-03;Tag=IsoSeq:G8841.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4024.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4CAY9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	6939486	6939746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212200-01;Name=OsNip_05t0212200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0212200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	6962890	6962922	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0212400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0212400-01;protein_id=OsNip_05t0212400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6962890	6963876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-01;Name=OsNip_05t0212400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0212400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6962923	6963876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	6964016	6964188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-01;Name=OsNip_05t0212400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0212400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6964016	6964188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	6957488	6964159	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0212400-02;Parent=gene:OsNip_05g0212400;transcript_id=OsNip_05t0212400-02;Tag=IsoSeq:G8844.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4026.1
Chr05	TAMA	exon	6964016	6964159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-02;Name=OsNip_05t0212400-02;exon_id=OsNip_05t0212400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8844.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4026.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0HB39";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	6964016	6964157	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0212400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0212400-02;protein_id=OsNip_05t0212400-02;Tag=IsoSeq:G8844.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4026.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0HB39";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	6963807	6963866	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0212400-02;Name=OsNip_05t0212400-02;exon_id=OsNip_05t0212400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8844.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4026.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0HB39";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	6963856	6963866	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0212400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0212400-02;protein_id=OsNip_05t0212400-02;Tag=IsoSeq:G8844.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4026.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0HB39";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	7264195	7264731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0217950-00;Name=OsNip_05t0217950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0217950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	7264188	7264755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218001-00;Name=OsNip_05t0218001-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0218001-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7264454	7264755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7271691	7271832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7271691	7272578	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218100-01;Name=OsNip_05t0218100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0218100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7271833	7272531	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0218100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218100-01;protein_id=OsNip_05t0218100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7272532	7272578	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	7279432	7284634	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0218400-01;Parent=gene:OsNip_05g0218400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7279432	7279623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7280132	7280293	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7280731	7280878	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7281211	7281287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Name=OsNip_05t0218400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0218400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7281211	7281287	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7281642	7281712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Name=OsNip_05t0218400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0218400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7281642	7281712	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7281816	7281902	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Name=OsNip_05t0218400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0218400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7281816	7281902	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7282587	7283126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Name=OsNip_05t0218400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0218400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7282587	7283126	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7283841	7284462	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0218400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;protein_id=OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7283841	7284634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Name=OsNip_05t0218400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0218400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7284463	7284634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0218400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7458400	7460457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0221400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7460683	7461042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0221400-01;Name=OsNip_05t0221400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0221400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7460683	7461042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0221400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	7455579	7460886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0221400-02;Parent=gene:OsNip_05g0221400;transcript_id=OsNip_05t0221400-02;Tag=IsoSeq:G8864.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6967.1,Nipponbare.root_G5318.3,Nipponbare.leaf_G4035.2
Chr05	TAMA	exon	7460683	7460886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0221400-02;Name=OsNip_05t0221400-02;exon_id=OsNip_05t0221400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8864.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6967.1,Nipponbare.root_G5318.3,Nipponbare.leaf_G4035.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0N625";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	7460765	7460884	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0221400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0221400-02;protein_id=OsNip_05t0221400-02;Tag=IsoSeq:G8864.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6967.1,Nipponbare.root_G5318.3,Nipponbare.leaf_G4035.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0N625";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	7460287	7460457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0221400-02;Name=OsNip_05t0221400-02;exon_id=OsNip_05t0221400-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8864.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6967.1,Nipponbare.root_G5318.3,Nipponbare.leaf_G4035.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0N625";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7776310	7776465	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0228000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0228000-01;protein_id=OsNip_05t0228000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7965875	7965999	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0230900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0230900-01;protein_id=OsNip_05t0230900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	7966300	7966430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0230900-01;Name=OsNip_05t0230900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0230900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	7966300	7966430	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0230900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0230900-01;protein_id=OsNip_05t0230900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	7960430	7966778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0230900-02;Parent=gene:OsNip_05g0230900;transcript_id=OsNip_05t0230900-02;Tag=IsoSeq:G8880.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6983.1,Nipponbare.panicle_G6983.2,Nipponbare.leaf_G4045.1,Nipponbare.root_G5327.1
Chr05	TAMA	exon	7966634	7966778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0230900-02;Name=OsNip_05t0230900-02;exon_id=OsNip_05t0230900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8880.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6983.1,Nipponbare.panicle_G6983.2,Nipponbare.leaf_G4045.1,Nipponbare.root_G5327.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZLC3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	7966634	7966776	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0230900-02;Parent=transcript:OsNip_05t0230900-02;protein_id=OsNip_05t0230900-02;Tag=IsoSeq:G8880.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G6983.1,Nipponbare.panicle_G6983.2,Nipponbare.leaf_G4045.1,Nipponbare.root_G5327.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7ZLC3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8038751	8039104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0232500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0232500-01;protein_id=OsNip_05t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8038751	8039392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232500-01;Name=OsNip_05t0232500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0232500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8039105	8039392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8038258	8039010	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0232566;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	8038258	8038471	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232566-00;Name=OsNip_05t0232566-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232566-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8038705	8039010	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232566-00;Name=OsNip_05t0232566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8044658	8045102	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0232632;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	8046789	8047587	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0232700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8046789	8047587	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0232700-01;Parent=gene:OsNip_05g0232700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8046789	8046911	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8046789	8047587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232700-01;Name=OsNip_05t0232700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8046912	8047325	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0232700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0232700-01;protein_id=OsNip_05t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8047326	8047587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8053522	8056940	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0232800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8053522	8056940	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0232800-00;Parent=gene:OsNip_05g0232800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8053522	8053966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Name=OsNip_05t0232800-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232800-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8053522	8053966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8053994	8054209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Name=OsNip_05t0232800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8053994	8054209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8054327	8055048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8054327	8056355	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Name=OsNip_05t0232800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0232800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8055049	8056355	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0232800-00;Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;protein_id=OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8056636	8056651	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0232800-00;Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;protein_id=OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8056636	8056940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Name=OsNip_05t0232800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0232800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8056652	8056940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0232800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8080835	8082069	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0233000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8080835	8082069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0233000-01;Parent=gene:OsNip_05g0233000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0233000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8080835	8081833	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0233000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0233000-01;protein_id=OsNip_05t0233000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8080835	8082069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0233000-01;Name=OsNip_05t0233000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0233000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8081834	8082069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0233000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	gene	8086749	8088837	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g023436A;Tag=IsoSeq:G8885
Chr05	TAMA	mRNA	8086749	8088837	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t023436A-01;Parent=gene:OsNip_05g023436A;transcript_id=OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1
Chr05	TAMA	exon	8086749	8087280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;Name=OsNip_05t023436A-01-E1;exon_id=OsNip_05t023436A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	8087265	8087280	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t023436A-01;Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;protein_id=OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	8087867	8087971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;Name=OsNip_05t023436A-01-E2;exon_id=OsNip_05t023436A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	8087867	8087971	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t023436A-01;Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;protein_id=OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	8088146	8088837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;Name=OsNip_05t023436A-01-E3;exon_id=OsNip_05t023436A-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	8088146	8088276	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t023436A-01;Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;protein_id=OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	8086749	8087264	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	8088280	8088837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436A-01;Tag=IsoSeq:G8885.1;Source=Nipponbare.root_G5331.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0IXG2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	gene	8107390	8108278	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g023436B;Tag=IsoSeq:G8886
Chr05	TAMA	mRNA	8107390	8108278	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t023436B-01;Parent=gene:OsNip_05g023436B;transcript_id=OsNip_05t023436B-01;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1
Chr05	TAMA	exon	8108105	8108278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;Name=OsNip_05t023436B-01-E1;exon_id=OsNip_05t023436B-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	exon	8107390	8108017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;Name=OsNip_05t023436B-01-E2;exon_id=OsNip_05t023436B-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	8107623	8107742	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t023436B-01;Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;protein_id=OsNip_05t023436B-01;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	8108105	8108278	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	8107743	8108017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	8107390	8107620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t023436B-01;Tag=IsoSeq:G8886.1;Source=Nipponbare.panicle_G6988.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8154422	8174151	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0234366;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8371897	8372082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0237200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8372083	8372370	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0237200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0237200-01;protein_id=OsNip_05t0237200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	8445124	8445684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0238200-01;Name=OsNip_05t0238200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0238200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8445484	8445684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0238200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8450507	8450966	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0238400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8450507	8451797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0238400-01;Name=OsNip_05t0238400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0238400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8450967	8451668	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0238400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0238400-01;protein_id=OsNip_05t0238400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8451669	8451797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0238400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8475636	8477846	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0239100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8475636	8477846	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0239100-01;Parent=gene:OsNip_05g0239100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0239100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8475636	8476868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0239100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8475636	8477103	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0239100-01;Name=OsNip_05t0239100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0239100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8476869	8477103	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0239100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0239100-01;protein_id=OsNip_05t0239100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8477570	8477604	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0239100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0239100-01;protein_id=OsNip_05t0239100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8477570	8477846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0239100-01;Name=OsNip_05t0239100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0239100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8491887	8492925	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0239400-00;Parent=transcript:OsNip_05t0239400-00;protein_id=OsNip_05t0239400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8529004	8529132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8529287	8529531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8530007	8530126	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0240200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;protein_id=OsNip_05t0240200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8534072	8534892	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0240200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;protein_id=OsNip_05t0240200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8534072	8535211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;Name=OsNip_05t0240200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0240200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8534893	8535211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8526487	8526738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8526487	8526907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0240200-03;Name=OsNip_05t0240200-03-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0240200-03-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	8578966	8579317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t024099A-02;Tag=IsoSeq:G8892.2;Source=Nipponbare.root_G5333.1,Nipponbare.leaf_G4050.1,Nipponbare.panicle_G6994.2;prot_id "UniRef90_Q8S6T7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8584562	8589468	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0241000-01;Parent=gene:OsNip_05g0241000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8584562	8584862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8584562	8585069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241000-01;Name=OsNip_05t0241000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0241000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8584863	8585069	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0241000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241000-01;protein_id=OsNip_05t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8585796	8585960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241000-01;Name=OsNip_05t0241000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0241000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8585796	8585960	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0241000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241000-01;protein_id=OsNip_05t0241000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	8608559	8608658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Name=OsNip_05t0241200-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0241200-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8608559	8608658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8608828	8608928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Name=OsNip_05t0241200-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0241200-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8608828	8608928	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8609458	8609764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Name=OsNip_05t0241200-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0241200-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8609458	8609764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8613323	8614217	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0241300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8613323	8614217	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0241300-01;Parent=gene:OsNip_05g0241300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0241300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8613323	8613534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8613323	8613560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;Name=OsNip_05t0241300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0241300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8613535	8613560	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0241300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;protein_id=OsNip_05t0241300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8613936	8614170	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0241300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;protein_id=OsNip_05t0241300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8613936	8614217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;Name=OsNip_05t0241300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0241300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8614171	8614217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	8616503	8618486	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0241400;biotype=protein_coding;description=Profilin/allergen;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	8616503	8618486	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0241400-01;Parent=gene:OsNip_05g0241400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0241400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8616503	8616712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8616503	8616804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;Name=OsNip_05t0241400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0241400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8616713	8616804	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0241400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;protein_id=OsNip_05t0241400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8616938	8617048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;Name=OsNip_05t0241400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0241400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	8616938	8617048	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0241400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;protein_id=OsNip_05t0241400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	8617164	8617273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0241400-01;Name=OsNip_05t0241400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0241400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	9232572	9233375	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0252100-01;protein_id=OsNip_05t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	9233597	9234259	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0252100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0252100-01;protein_id=OsNip_05t0252100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	9233597	9234349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0252100-01;Name=OsNip_05t0252100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0252100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	10672412	10675647	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0267800-01;Parent=gene:OsNip_05g0267800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0267800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10869071	10869233	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0270000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	10883466	10886687	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0270200-01;Parent=gene:OsNip_05g0270200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0270200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10883466	10883815	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0270200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	10883466	10884100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0270200-01;Name=OsNip_05t0270200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0270200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11029617	11029918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	11029412	11029845	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0272300;biotype=protein_coding;description=NmrA-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11029412	11029599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272300-00;Name=OsNip_05t0272300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0272300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11029412	11029599	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0272300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0272300-00;protein_id=OsNip_05t0272300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11029746	11029845	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272300-00;Name=OsNip_05t0272300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0272300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11029746	11029845	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0272300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0272300-00;protein_id=OsNip_05t0272300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11036281	11036334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272632-00;Name=OsNip_05t0272632-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0272632-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	11042441	11043648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t027279A-01;Name=OsNip_05t027279A-01-E1;exon_id=OsNip_05t027279A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8922.1;Source=Nipponbare.root_G5351.1;prot_id "UniRef90_A0A6N2LNY9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	11043305	11043646	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t027279A-01;Parent=transcript:OsNip_05t027279A-01;protein_id=OsNip_05t027279A-01;Tag=IsoSeq:G8922.1;Source=Nipponbare.root_G5351.1;prot_id "UniRef90_A0A6N2LNY9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	11043647	11043648	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t027279A-01;Tag=IsoSeq:G8922.1;Source=Nipponbare.root_G5351.1;prot_id "UniRef90_A0A6N2LNY9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	11042441	11043302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t027279A-01;Tag=IsoSeq:G8922.1;Source=Nipponbare.root_G5351.1;prot_id "UniRef90_A0A6N2LNY9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11042638	11042725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11043086	11043708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;Name=OsNip_05t0272800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0272800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11043086	11043708	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;protein_id=OsNip_05t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11044664	11045179	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;protein_id=OsNip_05t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11045448	11045618	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;protein_id=OsNip_05t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11045448	11045689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;Name=OsNip_05t0272800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0272800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11045619	11045689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	11042679	11045691	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0272800-02;Parent=gene:OsNip_05g0272800;transcript_id=OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2
Chr05	TAMA	exon	11042679	11042975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Name=OsNip_05t0272800-02;exon_id=OsNip_05t0272800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	11042681	11042975	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0272800-02;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;protein_id=OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	exon	11043065	11043708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Name=OsNip_05t0272800-02;exon_id=OsNip_05t0272800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	11043065	11043708	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0272800-02;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;protein_id=OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	exon	11044664	11045179	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Name=OsNip_05t0272800-02;exon_id=OsNip_05t0272800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	11044664	11045179	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0272800-02;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;protein_id=OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	exon	11045448	11045691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Name=OsNip_05t0272800-02;exon_id=OsNip_05t0272800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	11045448	11045612	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0272800-02;Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;protein_id=OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	11042679	11042680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	11045616	11045691	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0272800-02;Tag=IsoSeq:G8923.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7015.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11261810	11264629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0275100-00;Parent=transcript:OsNip_05t0275100-00;protein_id=OsNip_05t0275100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11314367	11314511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0275600-01;Name=OsNip_05t0275600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0275600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	11393115	11394895	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0276500-01;Parent=gene:OsNip_05g0276500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11393115	11393381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11393382	11393691	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0276500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;protein_id=OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11394273	11394594	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;Name=OsNip_05t0276500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0276500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11394273	11394594	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0276500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;protein_id=OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11394694	11394829	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0276500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;protein_id=OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11394694	11394895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;Name=OsNip_05t0276500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0276500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11394830	11394895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	11393416	11394546	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0276750-00;Parent=gene:OsNip_05g0276750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0276750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11393416	11393417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11393416	11393695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0276750-00;Name=OsNip_05t0276750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0276750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11393418	11393695	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0276750-00;Parent=transcript:OsNip_05t0276750-00;protein_id=OsNip_05t0276750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11436932	11437027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0277300-02;Name=OsNip_05t0277300-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0277300-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	11609465	11609506	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0278500-02;Tag=IsoSeq:G8934.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5359.4;prot_id "UniRef90_A0A6G1EU38";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11614939	11615071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0278550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	11641032	11643809	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0278950-00;Parent=gene:OsNip_05g0278950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0278950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11641032	11641114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0278950-00;Name=OsNip_05t0278950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0278950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11643482	11643809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0278950-00;Name=OsNip_05t0278950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0278950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	11643482	11643809	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0278950-00;Parent=transcript:OsNip_05t0278950-00;protein_id=OsNip_05t0278950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	11647853	11656591	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0279300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	11647853	11656591	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0279300-01;Parent=gene:OsNip_05g0279300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0279300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11647853	11648169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0279300-01;Name=OsNip_05t0279300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0279300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11647853	11648169	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0279300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	11654172	11654234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0279300-01;Name=OsNip_05t0279300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0279300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11654172	11654234	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0279300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	11654666	11655028	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0279300-01;Name=OsNip_05t0279300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0279300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12070130	12070563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0283200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12297635	12297781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0285900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	12978190	12978268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t029459B-01;Tag=IsoSeq:G8953.1;Source=Nipponbare.leaf_G4072.1;prot_id "UniRef90_P0C158";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	12978344	12978467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t029459B-01;Tag=IsoSeq:G8953.1;Source=Nipponbare.leaf_G4072.1;prot_id "UniRef90_P0C158";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	12989844	12990641	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0294600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0294600-02;protein_id=OsNip_05t0294600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12990642	12990642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0294600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	12989754	12992479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0294600-01;Parent=gene:OsNip_05g0294600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0294600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12989754	12989843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	12989754	12991164	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;Name=OsNip_05t0294600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0294600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	12989844	12991164	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0294600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;protein_id=OsNip_05t0294600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	12991466	12992418	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0294600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;protein_id=OsNip_05t0294600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	12991466	12992479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;Name=OsNip_05t0294600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0294600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12992419	12992479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0294600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	13006264	13010216	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0294800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13046295	13046685	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295100-02;Name=OsNip_05t0295100-02-E23;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0295100-02-E23;rank=23;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13057124	13057457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;Name=OsNip_05t0295200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0295200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13057124	13057457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13057654	13057778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13059289	13059540	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;Name=OsNip_05t0295200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0295200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	13059289	13059540	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0295200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;protein_id=OsNip_05t0295200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	13059621	13059682	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;Name=OsNip_05t0295200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0295200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	13059621	13059682	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0295200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;protein_id=OsNip_05t0295200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	13060124	13060127	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0295200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0295200-01;protein_id=OsNip_05t0295200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	13272794	13272794	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t029759A-01;Tag=IsoSeq:G8962.1;Source=Nipponbare.panicle_G7041.1;prot_id "UniRef90_B8AIB5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	13273068	13274427	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t029759A-01;Tag=IsoSeq:G8962.1;Source=Nipponbare.panicle_G7041.1;prot_id "UniRef90_B8AIB5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13275328	13275792	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0297800-01;Name=OsNip_05t0297800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0297800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13275328	13275792	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0297800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13276825	13278767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0297800-01;Name=OsNip_05t0297800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0297800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13278597	13278767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0297800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	13280293	13280716	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0297850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	13280293	13280716	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0297850-01;Parent=gene:OsNip_05g0297850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0297850-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13423126	13424003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0299700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	13424002	13424002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0299700-02;Tag=IsoSeq:G8970.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4080.1;prot_id "UniRef90_M0RVN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	13421650	13422094	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0299700-02;Tag=IsoSeq:G8970.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4080.1;prot_id "UniRef90_M0RVN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13626448	13627054	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0303000-01;Name=OsNip_05t0303000-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0303000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13626856	13627054	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0303000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	13626448	13627167	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0303000-02;Name=OsNip_05t0303000-02;exon_id=OsNip_05t0303000-02-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G8977.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4085.1,Nipponbare.panicle_G7055.4,Nipponbare.panicle_G7055.3;prot_id "UniRef90_C5YU58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	13621790	13621791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0303000-02;Tag=IsoSeq:G8977.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4085.1,Nipponbare.panicle_G7055.4,Nipponbare.panicle_G7055.3;prot_id "UniRef90_C5YU58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	13622272	13622396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0303000-02;Tag=IsoSeq:G8977.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4085.1,Nipponbare.panicle_G7055.4,Nipponbare.panicle_G7055.3;prot_id "UniRef90_C5YU58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	13711188	13711590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0304200-01;Name=OsNip_05t0304200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0304200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13711473	13711590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0304200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	13711704	13711853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0304200-01;Name=OsNip_05t0304200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0304200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13711704	13711853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0304200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	13709159	13709376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0304200-02;Tag=IsoSeq:G8978.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7056.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9ZX61";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14196983	14197095	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0311037-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	14245044	14246369	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0311500-01;Parent=gene:OsNip_05g0311500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0311500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14245044	14245121	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0311500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14419792	14419798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0313700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	14694481	14694654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0317200-01;Name=OsNip_05t0317200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0317200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	14824145	14824572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0319200-00;Name=OsNip_05t0319200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0319200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14824478	14824572	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0319200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	14854444	14855118	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0319900-00;Name=OsNip_05t0319900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0319900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	14854444	14855118	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0319900-00;Parent=transcript:OsNip_05t0319900-00;protein_id=OsNip_05t0319900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	14866515	14869847	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0320100;Name=OsNip_Fbox255;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	14868598	14869847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320100-01;Name=OsNip_05t0320100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0320100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	14880436	14881877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-01;Name=OsNip_05t0320300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0320300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14880436	14881877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	14881468	14881908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Name=OsNip_05t0320300-02;exon_id=OsNip_05t0320300-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	14879462	14879462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	14879739	14879795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	14879925	14880262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	14880436	14880699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	14881468	14881908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320300-02;Tag=IsoSeq:G9010.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5393.1;prot_id "UniRef90_B8AWL8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	14893395	14894078	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0320500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	14893395	14894078	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0320500-00;Parent=gene:OsNip_05g0320500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0320500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14893395	14893395	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	14893395	14893800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320500-00;Name=OsNip_05t0320500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0320500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	14893396	14893800	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0320500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0320500-00;protein_id=OsNip_05t0320500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	14893920	14894078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0320500-00;Name=OsNip_05t0320500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0320500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	14893920	14894078	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0320500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0320500-00;protein_id=OsNip_05t0320500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	gene	14897369	14898104	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g032069A;Tag=IsoSeq:G9011
Chr05	TAMA	mRNA	14897369	14897976	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t032069A-01;Parent=gene:OsNip_05g032069A;transcript_id=OsNip_05t032069A-01;Tag=IsoSeq:G9011.1;Source=Nipponbare.panicle_G7085.1
Chr05	TAMA	exon	14897369	14897520	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t032069A-01;Name=OsNip_05t032069A-01-E1;exon_id=OsNip_05t032069A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9011.1;Source=Nipponbare.panicle_G7085.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9UZZ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr05	TAMA	CDS	14897369	14897485	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t032069A-01;Parent=transcript:OsNip_05t032069A-01;protein_id=OsNip_05t032069A-01;Tag=IsoSeq:G9011.1;Source=Nipponbare.panicle_G7085.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9UZZ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr05	TAMA	exon	14897676	14897976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t032069A-01;Name=OsNip_05t032069A-01-E2;exon_id=OsNip_05t032069A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9011.1;Source=Nipponbare.panicle_G7085.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9UZZ5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15130056	15130193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0326600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15130537	15130940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0326600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	15131191	15131491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0326600-01;Name=OsNip_05t0326600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0326600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	15131268	15131489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0326600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0326600-01;protein_id=OsNip_05t0326600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15131490	15131491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0326600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	15132717	15134330	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0326625;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	15382743	15382902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0329400-00;Name=OsNip_05t0329400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0329400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16164474	16164769	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0343800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16178796	16179086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0344200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	16566541	16566756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0350700-01;Name=OsNip_05t0350700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0350700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16622355	16622727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0351500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	16625449	16625788	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0351500-01;Name=OsNip_05t0351500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0351500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16686998	16687047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	16687048	16687740	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0353300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0353300-00;protein_id=OsNip_05t0353300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	16689899	16690672	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0353300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0353300-00;protein_id=OsNip_05t0353300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	16689899	16690968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353300-00;Name=OsNip_05t0353300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0353300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16690673	16690968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	16686913	16687122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353300-01;Name=OsNip_05t0353300-01;exon_id=OsNip_05t0353300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9053.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4127.1;prot_id "UniRef90_A0A2N9J5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	CDS	16703898	16704230	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0353500-02;Parent=transcript:OsNip_05t0353500-02;protein_id=OsNip_05t0353500-02;Tag=IsoSeq:G9055.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7122.2;prot_id "UniRef90_A0A287P6B6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	16702956	16703088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353500-02;Tag=IsoSeq:G9055.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7122.2;prot_id "UniRef90_A0A287P6B6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	16717739	16718768	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0353600-00;Name=OsNip_05t0353600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0353600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	16717761	16718768	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0353600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0353600-00;protein_id=OsNip_05t0353600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	16735951	16736215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0354075-00;Name=OsNip_05t0354075-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0354075-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16735951	16736215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0354075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16739196	16739259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0354075-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	16739196	16739610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0354075-00;Name=OsNip_05t0354075-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0354075-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	16739260	16739526	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0354075-00;Parent=transcript:OsNip_05t0354075-00;protein_id=OsNip_05t0354075-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17343645	17343877	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0363200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17344380	17344454	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0363200-01;Name=OsNip_05t0363200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0363200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17508948	17509432	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0365200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0365200-01;protein_id=OsNip_05t0365200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17510023	17510373	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0365200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0365200-01;protein_id=OsNip_05t0365200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17510023	17510595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0365200-01;Name=OsNip_05t0365200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0365200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17510374	17510595	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0365200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17507847	17510527	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0365250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17587885	17588053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0366300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17622926	17622995	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0366900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0366900-01;protein_id=OsNip_05t0366900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17623099	17623499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0366900-01;Name=OsNip_05t0366900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0366900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17623431	17623499	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0366900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	17671354	17671535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368000-01;Tag=IsoSeq:G9098.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7155.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5WEY4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17693871	17693948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368300-01;Name=OsNip_05t0368300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0368300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17694205	17694385	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368300-01;Name=OsNip_05t0368300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0368300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17695080	17695783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368300-01;Name=OsNip_05t0368300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0368300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17695512	17695783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17693870	17695489	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0368350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17693870	17695489	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0368350-00;Parent=gene:OsNip_05g0368350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17693870	17693948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Name=OsNip_05t0368350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0368350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17693870	17693948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17694205	17694483	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17694205	17694571	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Name=OsNip_05t0368350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0368350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17694484	17694571	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0368350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;protein_id=OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17695078	17695346	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0368350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;protein_id=OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17695078	17695489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Name=OsNip_05t0368350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0368350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17695347	17695489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17696091	17696562	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0368400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17696091	17696562	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0368400-00;Parent=gene:OsNip_05g0368400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0368400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17696091	17696091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17696091	17696562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368400-00;Name=OsNip_05t0368400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0368400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17696092	17696226	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0368400-00;Parent=transcript:OsNip_05t0368400-00;protein_id=OsNip_05t0368400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17696227	17696562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17697119	17697191	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0368501;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17697119	17697191	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0368501-00;Parent=gene:OsNip_05g0368501;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_05t0368501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17697119	17697191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368501-00;Name=OsNip_05t0368501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0368501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17714478	17715988	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0368600;biotype=protein_coding;description=Heavy;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17714478	17715988	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0368600-01;Parent=gene:OsNip_05g0368600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17714478	17714523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17714478	17715443	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;Name=OsNip_05t0368600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0368600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17714524	17715443	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0368600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;protein_id=OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17715647	17715722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;Name=OsNip_05t0368600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0368600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17715647	17715722	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0368600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;protein_id=OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17715898	17715924	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0368600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;protein_id=OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17715898	17715988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;Name=OsNip_05t0368600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0368600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17715925	17715988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0368600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17714524	17715716	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0368633;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17778219	17778528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369800-00;Name=OsNip_05t0369800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0369800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17779880	17781705	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0369900-01;Parent=gene:OsNip_05g0369900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0369900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17779880	17779915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17779916	17781033	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0369900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0369900-01;protein_id=OsNip_05t0369900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17781233	17781236	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0369900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0369900-01;protein_id=OsNip_05t0369900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17781233	17781705	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369900-01;Name=OsNip_05t0369900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0369900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17781237	17781705	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	17779885	17781713	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0369900-02;Parent=gene:OsNip_05g0369900;transcript_id=OsNip_05t0369900-02;Tag=IsoSeq:G9103.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7158.1
Chr05	TAMA	exon	17779885	17781713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369900-02;Name=OsNip_05t0369900-02;exon_id=OsNip_05t0369900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9103.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7158.1;prot_id "UniRef90_B8B9M5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	17779885	17779956	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0369900-02;Parent=transcript:OsNip_05t0369900-02;protein_id=OsNip_05t0369900-02;Tag=IsoSeq:G9103.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7158.1;prot_id "UniRef90_B8B9M5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	17779960	17781713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0369900-02;Tag=IsoSeq:G9103.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7158.1;prot_id "UniRef90_B8B9M5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	17783522	17785974	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0370000;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	17783522	17785974	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0370000-01;Parent=gene:OsNip_05g0370000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0370000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17783522	17783638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0370000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17783522	17785974	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0370000-01;Name=OsNip_05t0370000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0370000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17783639	17785633	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0370000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0370000-01;protein_id=OsNip_05t0370000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17812706	17812916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0370600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17813257	17813374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0370600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17813564	17815888	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0370600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0370600-01;protein_id=OsNip_05t0370600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17815889	17816392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0370600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17852931	17853588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0371133-00;Name=OsNip_05t0371133-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0371133-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	17880817	17881187	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0371500-02;Tag=IsoSeq:G9109.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7163.1,Nipponbare.leaf_G4147.1,Nipponbare.root_G5448.2;prot_id "UniRef90_A0A6P5GQP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	17887455	17887526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0371600-01;Name=OsNip_05t0371600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0371600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	17887455	17887526	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0371600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0371600-01;protein_id=OsNip_05t0371600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17995659	17996840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0373400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	17995659	17997113	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0373400-02;Name=OsNip_05t0373400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0373400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18741109	18741959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387200-01;Name=OsNip_05t0387200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0387200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18741511	18741959	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18740096	18740470	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0387200-02;Parent=transcript:OsNip_05t0387200-02;protein_id=OsNip_05t0387200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18741109	18741856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387200-02;Name=OsNip_05t0387200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0387200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18741511	18741856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	18742852	18743489	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0387300-01;Parent=gene:OsNip_05g0387300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18742852	18743171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18742852	18743489	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387300-01;Name=OsNip_05t0387300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0387300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18743172	18743489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0387300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0387300-01;protein_id=OsNip_05t0387300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18757319	18757510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18757511	18759550	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0387700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0387700-01;protein_id=OsNip_05t0387700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18759551	18760229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18757360	18757510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18757360	18759604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387700-02;Name=OsNip_05t0387700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0387700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18759551	18759604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0387700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	18763585	18768243	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0387750-01;Parent=gene:OsNip_05g0387750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0387750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18796477	18797085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0388600-01;Name=OsNip_05t0388600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0388600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18801353	18801478	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0388600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0388600-01;protein_id=OsNip_05t0388600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18801571	18801607	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0388600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0388600-01;protein_id=OsNip_05t0388600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18801571	18801851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0388600-01;Name=OsNip_05t0388600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0388600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18801608	18801851	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0388600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18886405	18887896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390000-01;Name=OsNip_05t0390000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0390000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18892000	18892114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18919657	18919984	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390300-00;Name=OsNip_05t0390300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0390300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18920036	18920528	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390300-00;Name=OsNip_05t0390300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0390300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	18919094	18919463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390300-01;Tag=IsoSeq:G9152.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7198.2;prot_id "UniRef90_A0A2K2D9X7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	18919761	18920500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390300-01;Tag=IsoSeq:G9152.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7198.2;prot_id "UniRef90_A0A2K2D9X7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	18928206	18933263	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0390500-01;Parent=gene:OsNip_05g0390500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18928206	18928255	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18928206	18928485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Name=OsNip_05t0390500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0390500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	18929744	18929817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Name=OsNip_05t0390500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0390500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18929744	18929817	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0390500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;protein_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18930217	18930347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Name=OsNip_05t0390500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0390500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18930217	18930347	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0390500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;protein_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18930592	18930772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Name=OsNip_05t0390500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0390500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18931828	18932016	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0390500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;protein_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18932167	18932205	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0390500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;protein_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	18932561	18933037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0390500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;protein_id=OsNip_05t0390500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	18932561	18933263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0390500-01;Name=OsNip_05t0390500-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0390500-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19182378	19183276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394200-01;Name=OsNip_05t0394200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0394200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19178761	19179475	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0394301-00;Parent=transcript:OsNip_05t0394301-00;protein_id=OsNip_05t0394301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19178761	19179705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394301-00;Name=OsNip_05t0394301-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0394301-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19179476	19179705	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19181113	19181214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394301-00;Name=OsNip_05t0394301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0394301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19181113	19181214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19217268	19217391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19218362	19218408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394900-01;Name=OsNip_05t0394900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0394900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19218362	19218408	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0394900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0394900-01;protein_id=OsNip_05t0394900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19218503	19218682	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0394900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0394900-01;protein_id=OsNip_05t0394900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19218503	19218684	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0394900-01;Name=OsNip_05t0394900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0394900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19525642	19525710	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0401500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0401500-01;protein_id=OsNip_05t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19684184	19684490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0404200-02;Name=OsNip_05t0404200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0404200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19684349	19684490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0404200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	CDS	19681771	19681806	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0404200-03;Parent=transcript:OsNip_05t0404200-03;protein_id=OsNip_05t0404200-03;Tag=IsoSeq:G9199.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4185.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3WYS3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19737505	19737605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0405000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19815231	19815512	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0406700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0406700-01;protein_id=OsNip_05t0406700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19815231	19815972	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406700-01;Name=OsNip_05t0406700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0406700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19828480	19829197	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19829198	19830382	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0406800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0406800-01;protein_id=OsNip_05t0406800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19830383	19830827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19829080	19829197	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19829080	19830856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-02;Name=OsNip_05t0406800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0406800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19829198	19830382	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0406800-02;Parent=transcript:OsNip_05t0406800-02;protein_id=OsNip_05t0406800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19830383	19830856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	19828480	19830742	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0406800-03;Parent=gene:OsNip_05g0406800;transcript_id=OsNip_05t0406800-03;Tag=IsoSeq:G9210.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5511.3
Chr05	TAMA	exon	19828480	19829060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-03;Name=OsNip_05t0406800-03;exon_id=OsNip_05t0406800-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9210.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5511.3;prot_id "UniRef90_A0A5A7NWV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	TAMA	exon	19829164	19830742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-03;Name=OsNip_05t0406800-03;exon_id=OsNip_05t0406800-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9210.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5511.3;prot_id "UniRef90_A0A5A7NWV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	19828681	19829060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-03;Tag=IsoSeq:G9210.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5511.3;prot_id "UniRef90_A0A5A7NWV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	19829164	19830742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0406800-03;Tag=IsoSeq:G9210.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5511.3;prot_id "UniRef90_A0A5A7NWV3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	19837789	19838677	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0407100;biotype=protein_coding;description=Four;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	19837789	19838522	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0407100-01;Parent=gene:OsNip_05g0407100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19837789	19837921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19837789	19837927	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;Name=OsNip_05t0407100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0407100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19837922	19837927	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0407100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;protein_id=OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19838141	19838301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;Name=OsNip_05t0407100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19838141	19838301	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0407100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;protein_id=OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19838355	19838406	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0407100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;protein_id=OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19838355	19838522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;Name=OsNip_05t0407100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0407100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19838407	19838522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	19837800	19838677	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0407100-02;Parent=gene:OsNip_05g0407100;transcript_id=OsNip_05t0407100-02;Tag=IsoSeq:G9211.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5512.6
Chr05	TAMA	exon	19837800	19838677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-02;Name=OsNip_05t0407100-02;exon_id=OsNip_05t0407100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9211.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5512.6;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	CDS	19838074	19838400	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0407100-02;Parent=transcript:OsNip_05t0407100-02;protein_id=OsNip_05t0407100-02;Tag=IsoSeq:G9211.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5512.6;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	19837800	19838073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-02;Tag=IsoSeq:G9211.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5512.6;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	19838404	19838677	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407100-02;Tag=IsoSeq:G9211.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5512.6;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	19838548	19846592	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0407200;Name=OsNip_WD40-119;biotype=protein_coding;description=WD;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	19838548	19846592	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0407200-01;Parent=gene:OsNip_05g0407200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19838548	19838834	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19838548	19839002	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19838835	19839002	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0407200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;protein_id=OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19840576	19840636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19840576	19840636	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0407200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;protein_id=OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19840748	19840903	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19840748	19840903	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0407200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;protein_id=OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19840985	19841157	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	19840985	19841157	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0407200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;protein_id=OsNip_05t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19842444	19842521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19842644	19842820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407200-01;Name=OsNip_05t0407200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19869589	19871283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407500-01;Name=OsNip_05t0407500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0407500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19869420	19869856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0407550-01;Name=OsNip_05t0407550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0407550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	19931869	19932333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0408200-01;Name=OsNip_05t0408200-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0408200-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19934675	19934840	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0408300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	19934675	19935006	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0408300-01;Name=OsNip_05t0408300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0408300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20192522	20193783	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0412800-01;Parent=gene:OsNip_05g0412800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0412800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20193320	20193783	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0412800-01;Name=OsNip_05t0412800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0412800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20193659	20193783	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0412800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20196728	20198228	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0412900-01;Parent=gene:OsNip_05g0412900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0412900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20196728	20197085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0412900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20196728	20198228	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0412900-01;Name=OsNip_05t0412900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0412900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20210370	20210656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;Name=OsNip_05t0413400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0413400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20211736	20211827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;Name=OsNip_05t0413400-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0413400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20211736	20211827	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0413400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;protein_id=OsNip_05t0413400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20213144	20213394	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0413400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;protein_id=OsNip_05t0413400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20213144	20213455	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;Name=OsNip_05t0413400-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0413400-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20213395	20213455	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	20211736	20213397	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0413575;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20211736	20213397	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0413575-00;Parent=gene:OsNip_05g0413575;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0413575-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20211736	20211824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413575-00;Name=OsNip_05t0413575-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0413575-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20211736	20211824	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0413575-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	20305317	20305637	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0415200-02;Tag=IsoSeq:G9232.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5525.1;prot_id "UniRef90_UPI00188E9008";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20314680	20321520	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0415600-01;Parent=gene:OsNip_05g0415600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0415600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20314680	20315503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0415600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20315695	20316173	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0415600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0415600-01;protein_id=OsNip_05t0415600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20316887	20320190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0415600-01;Name=OsNip_05t0415600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0415600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20316939	20320190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0415600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20320305	20320475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0415600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20438344	20438579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0417200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20439456	20439537	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0417200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0417200-01;protein_id=OsNip_05t0417200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20439637	20439748	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0417200-01;Name=OsNip_05t0417200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0417200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20439637	20439748	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0417200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0417200-01;protein_id=OsNip_05t0417200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20439848	20440193	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0417200-01;Name=OsNip_05t0417200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0417200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20489771	20489828	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0418100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0418100-01;protein_id=OsNip_05t0418100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20489952	20490068	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0418100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0418100-01;protein_id=OsNip_05t0418100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20489952	20490119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0418100-01;Name=OsNip_05t0418100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0418100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20542374	20542637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0419050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20844456	20844556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20845207	20845559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20845763	20846492	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0425650-00;Parent=gene:OsNip_05g0425650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0425650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20845763	20845817	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20845763	20846492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425650-00;Name=OsNip_05t0425650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0425650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20845818	20846492	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0425650-00;Parent=transcript:OsNip_05t0425650-00;protein_id=OsNip_05t0425650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	20847174	20851077	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0425700;Name=OsNip_Fbox258;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	20847174	20851077	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0425700-01;Parent=gene:OsNip_05g0425700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20847174	20847513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Name=OsNip_05t0425700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20847174	20847513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20848501	20848760	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0425700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;protein_id=OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20849504	20849852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Name=OsNip_05t0425700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20849927	20850068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Name=OsNip_05t0425700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20849927	20850068	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0425700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;protein_id=OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20850361	20850740	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0425700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;protein_id=OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20850361	20851077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Name=OsNip_05t0425700-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20850741	20851077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	20847243	20847513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Name=OsNip_05t0425700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0425700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20847243	20847513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20848470	20848500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20848470	20848760	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Name=OsNip_05t0425700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20848501	20848760	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0425700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;protein_id=OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20849504	20849852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Name=OsNip_05t0425700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20849504	20849852	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0425700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;protein_id=OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	20849927	20850068	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;Name=OsNip_05t0425700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0425700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20849927	20850068	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0425700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;protein_id=OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	20850361	20850740	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0425700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0425700-02;protein_id=OsNip_05t0425700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	21078527	21079287	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429500-03;Tag=IsoSeq:G9276.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7294.5;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21081086	21081512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21081086	21083522	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429700-02;Name=OsNip_05t0429700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0429700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21083928	21084058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21081512	21082811	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429751-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	21082812	21083753	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0429751-00;Parent=transcript:OsNip_05t0429751-00;protein_id=OsNip_05t0429751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21083754	21083754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0429751-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	21091737	21093414	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0429802;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21129630	21129643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0430400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	21135258	21138615	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0430700-01;Parent=gene:OsNip_05g0430700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0430700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21135258	21135873	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0430700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	21191468	21191633	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0431700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0431700-01;protein_id=OsNip_05t0431700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21191468	21191740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0431700-01;Name=OsNip_05t0431700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0431700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21191634	21191740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0431700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	21191572	21191738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0431700-02;Name=OsNip_05t0431700-02;exon_id=OsNip_05t0431700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9283.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7298.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9UFZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21613940	21614014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0441500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21614420	21614955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0441500-02;Name=OsNip_05t0441500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0441500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21614420	21614955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0441500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	21613659	21614014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0441500-03;Name=OsNip_05t0441500-03;exon_id=OsNip_05t0441500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9312.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4230.2;prot_id "UniRef90_I1QMU8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	21614640	21614971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0441500-03;Tag=IsoSeq:G9312.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4230.2;prot_id "UniRef90_I1QMU8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21762531	21762740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0444750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	21790822	21792552	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0445000;Name=OsNip_Rab7B2;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21790822	21791031	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21791722	21792552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21792550	21793270	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	21791974	21792867	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0445100-02;Parent=gene:OsNip_05g0445100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0445100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21791974	21792087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21791974	21792867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445100-02;Name=OsNip_05t0445100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0445100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	21843346	21856444	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0445900;Name=ROS1c;biotype=protein_coding;description=5-methylcytosine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21843346	21843769	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21843346	21843897	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E20;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E20;rank=20;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	21844734	21844772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E19;rank=19;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	21844734	21844772	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0445900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;protein_id=OsNip_05t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21844853	21844967	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E18;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E18;rank=18;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	21845072	21845137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	21846209	21846348	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0445900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;protein_id=OsNip_05t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21846428	21846491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	21846428	21846491	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0445900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;protein_id=OsNip_05t0445900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	21846569	21846605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	21846753	21847190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0445900-01;Name=OsNip_05t0445900-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0445900-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21888402	21889053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0446500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	22035486	22035553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t044909A-01;Tag=IsoSeq:G9332.1;Source=Nipponbare.panicle_G7330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	22035003	22035394	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t044909A-01;Tag=IsoSeq:G9332.1;Source=Nipponbare.panicle_G7330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	22034830	22034886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t044909A-01;Tag=IsoSeq:G9332.1;Source=Nipponbare.panicle_G7330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	22033970	22034255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t044909A-01;Tag=IsoSeq:G9332.1;Source=Nipponbare.panicle_G7330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	22038866	22047589	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0449100-01;Parent=gene:OsNip_05g0449100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0449100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22038866	22039526	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0449100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22038866	22039875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0449100-01;Name=OsNip_05t0449100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0449100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22039527	22039811	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0449100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0449100-01;protein_id=OsNip_05t0449100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22039812	22039875	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0449100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22045975	22046048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0449100-01;Name=OsNip_05t0449100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0449100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22071728	22071961	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0449600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0449600-02;protein_id=OsNip_05t0449600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22071962	22072900	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0449600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22388488	22388535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0455700-02;Name=OsNip_05t0455700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0455700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22409907	22410288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0456300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22409907	22410372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0456300-02;Name=OsNip_05t0456300-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0456300-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22452403	22452631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0457200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22493470	22493603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0458100-01;Name=OsNip_05t0458100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0458100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22493911	22494019	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0458100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0458100-01;protein_id=OsNip_05t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22493911	22494054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0458100-01;Name=OsNip_05t0458100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0458100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22494020	22494054	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0458100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22619722	22620207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460200-01;Name=OsNip_05t0460200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0460200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22616186	22616285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460350-00;Name=OsNip_05t0460350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22618391	22618501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460350-00;Name=OsNip_05t0460350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22618573	22618663	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460350-00;Name=OsNip_05t0460350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22619190	22619269	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460350-00;Name=OsNip_05t0460350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22619717	22620088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460350-00;Name=OsNip_05t0460350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	22625295	22625615	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0460475;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	22625295	22625615	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0460475-00;Parent=gene:OsNip_05g0460475;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0460475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22625295	22625615	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460475-00;Name=OsNip_05t0460475-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0460475-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22625295	22625615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0460475-00;Parent=transcript:OsNip_05t0460475-00;protein_id=OsNip_05t0460475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	22625667	22629028	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0460600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	22625667	22629028	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0460600-01;Parent=gene:OsNip_05g0460600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0460600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22625667	22625782	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22632157	22632211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460700-01;Name=OsNip_05t0460700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0460700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22632157	22632211	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0460700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0460700-01;protein_id=OsNip_05t0460700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22632351	22632406	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0460700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0460700-01;protein_id=OsNip_05t0460700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22632351	22632486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460700-01;Name=OsNip_05t0460700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0460700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22632407	22632486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	22632351	22632490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0460700-02;Name=OsNip_05t0460700-02;exon_id=OsNip_05t0460700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9369.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9MFB3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	22632351	22632488	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0460700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0460700-02;protein_id=OsNip_05t0460700-02;Tag=IsoSeq:G9369.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9MFB3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22841169	22841234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0465250-00;Name=OsNip_05t0465250-00-E17;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0465250-00-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22841793	22841908	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0465250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22853860	22854259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0465400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22853860	22854533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0465400-01;Name=OsNip_05t0465400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0465400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22854260	22854533	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0465400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0465400-01;protein_id=OsNip_05t0465400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22881485	22881578	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0466200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0466200-01;protein_id=OsNip_05t0466200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22881485	22881780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466200-01;Name=OsNip_05t0466200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0466200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22903115	22903786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466600-01;Name=OsNip_05t0466600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0466600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22903205	22903516	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0466600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0466600-01;protein_id=OsNip_05t0466600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	22904353	22906048	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0466700;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	22904354	22904819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466700-01;Name=OsNip_05t0466700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0466700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	22904353	22906048	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0466700-02;Parent=gene:OsNip_05g0466700;transcript_id=OsNip_05t0466700-02;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1
Chr05	TAMA	exon	22905839	22906048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466700-02;Name=OsNip_05t0466700-02;exon_id=OsNip_05t0466700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1;prot_id "UniRef90_K3XMJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	22905839	22906048	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0466700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0466700-02;protein_id=OsNip_05t0466700-02;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1;prot_id "UniRef90_K3XMJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	22904353	22905162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466700-02;Name=OsNip_05t0466700-02;exon_id=OsNip_05t0466700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1;prot_id "UniRef90_K3XMJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	22905091	22905162	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0466700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0466700-02;protein_id=OsNip_05t0466700-02;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1;prot_id "UniRef90_K3XMJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	22904353	22905088	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466700-02;Tag=IsoSeq:G9390.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4259.1,Nipponbare.root_G5618.1,Nipponbare.panicle_G7378.1;prot_id "UniRef90_K3XMJ0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	22907941	22910650	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0466800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	22907941	22910650	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0466800-01;Parent=gene:OsNip_05g0466800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0466800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22907941	22908138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22907941	22908471	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;Name=OsNip_05t0466800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0466800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22908139	22908471	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0466800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;protein_id=OsNip_05t0466800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22909002	22909126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;Name=OsNip_05t0466800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0466800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	22909002	22909126	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0466800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;protein_id=OsNip_05t0466800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	22909215	22909339	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0466800-01;Name=OsNip_05t0466800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0466800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23013820	23014346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0468800-01;Name=OsNip_05t0468800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0468800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23021219	23021600	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0468900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23050622	23053139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469450-01;Name=OsNip_05t0469450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23058815	23058936	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23059564	23059727	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Name=OsNip_05t0469600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0469600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23059564	23059727	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0469600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;protein_id=OsNip_05t0469600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23059821	23060471	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Name=OsNip_05t0469600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0469600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23060571	23060688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Name=OsNip_05t0469600-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0469600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23060781	23060969	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Name=OsNip_05t0469600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0469600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23061094	23061264	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0469600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;protein_id=OsNip_05t0469600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23061094	23061529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Name=OsNip_05t0469600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0469600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23061265	23061529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23058961	23061262	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0469701;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23058961	23061262	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0469701-00;Parent=gene:OsNip_05g0469701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23058961	23059643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23058961	23059710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Name=OsNip_05t0469701-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0469701-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23059644	23059710	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0469701-00;Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;protein_id=OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23059807	23060030	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0469701-00;Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;protein_id=OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23059807	23060465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Name=OsNip_05t0469701-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469701-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23060031	23060465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23060569	23060681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Name=OsNip_05t0469701-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469701-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23060569	23060681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23060772	23060978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Name=OsNip_05t0469701-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469701-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23060772	23060978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23061103	23061262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Name=OsNip_05t0469701-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469701-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23061103	23061262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469701-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23065514	23068193	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0469800;biotype=protein_coding;description=Pyruvate;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23065514	23068193	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0469800-00;Parent=gene:OsNip_05g0469800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0469800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23065514	23065606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23067448	23067651	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469812-00;Name=OsNip_05t0469812-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0469812-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23079101	23080522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0469900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23082505	23082660	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0470000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0470000-01;protein_id=OsNip_05t0470000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23082737	23083707	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0470000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0470000-01;protein_id=OsNip_05t0470000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23082737	23083749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470000-01;Name=OsNip_05t0470000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0470000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23083708	23083749	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23093610	23095496	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0470600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23093610	23095496	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0470600-01;Parent=gene:OsNip_05g0470600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0470600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23093610	23095111	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23093610	23095496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470600-01;Name=OsNip_05t0470600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0470600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23095112	23095324	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0470600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0470600-01;protein_id=OsNip_05t0470600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23095325	23095496	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23096797	23097000	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23096797	23097521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-01;Name=OsNip_05t0470650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0470650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23097001	23097198	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0470650-01;Parent=transcript:OsNip_05t0470650-01;protein_id=OsNip_05t0470650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23097199	23097521	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	23096726	23097561	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0470650-02;Parent=gene:OsNip_05g0470650;transcript_id=OsNip_05t0470650-02;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1
Chr05	TAMA	exon	23096726	23097153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;Name=OsNip_05t0470650-02;exon_id=OsNip_05t0470650-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	23096728	23096877	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0470650-02;Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;protein_id=OsNip_05t0470650-02;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	exon	23097269	23097561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;Name=OsNip_05t0470650-02;exon_id=OsNip_05t0470650-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	23096726	23096727	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23096881	23097153	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23097269	23097561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0470650-02;Tag=IsoSeq:G9401.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7386.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0E5K9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23101746	23104091	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0470700;Name=OsNip_RFP;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23101746	23104091	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0470700-01;Parent=gene:OsNip_05g0470700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0470700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23216585	23217183	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0472850-00;Parent=transcript:OsNip_05t0472850-00;protein_id=OsNip_05t0472850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23216585	23217185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0472850-00;Name=OsNip_05t0472850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0472850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23217184	23217185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0472850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23239204	23240669	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0473000;Name=OsNip_PYL/RCAR6;biotype=protein_coding;description=Streptomyces;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23239204	23240669	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0473000-01;Parent=gene:OsNip_05g0473000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0473000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23239204	23239961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23239204	23240669	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-01;Name=OsNip_05t0473000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0473000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23239962	23240615	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0473000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0473000-01;protein_id=OsNip_05t0473000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23240616	23240669	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	23239673	23240668	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0473000-02;Parent=gene:OsNip_05g0473000;transcript_id=OsNip_05t0473000-02;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5
Chr05	TAMA	exon	23240450	23240668	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-02;Name=OsNip_05t0473000-02;exon_id=OsNip_05t0473000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5;prot_id "UniRef90_B4FIS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	23240639	23240668	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0473000-02;Parent=transcript:OsNip_05t0473000-02;protein_id=OsNip_05t0473000-02;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5;prot_id "UniRef90_B4FIS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	exon	23239673	23239996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-02;Name=OsNip_05t0473000-02;exon_id=OsNip_05t0473000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5;prot_id "UniRef90_B4FIS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23240450	23240636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-02;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5;prot_id "UniRef90_B4FIS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23239673	23239996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473000-02;Tag=IsoSeq:G9411.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5633.5;prot_id "UniRef90_B4FIS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23239643	23240672	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0473101;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23239643	23240672	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0473101-01;Parent=gene:OsNip_05g0473101;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0473101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23239643	23240346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23239643	23240672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473101-01;Name=OsNip_05t0473101-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0473101-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23240347	23240672	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0473101-01;Parent=transcript:OsNip_05t0473101-01;protein_id=OsNip_05t0473101-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23247706	23250054	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0473300;Name=OsNip_ERF#043;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23247706	23250054	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0473300-01;Parent=gene:OsNip_05g0473300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0473300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23247706	23247947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0473300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23274276	23274362	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0473900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0473900-01;protein_id=OsNip_05t0473900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23291722	23291871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23292351	23292914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23293209	23293338	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23293716	23294246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23294782	23294889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23295057	23295602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23296103	23296225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23296103	23296225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23296640	23297225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23296640	23297225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23297376	23297534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23297376	23297672	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23297535	23297672	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;protein_id=OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23298188	23298238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23298313	23298386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23298502	23298589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23298502	23298589	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0474600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;protein_id=OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23298687	23298893	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23298970	23299041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23299180	23299239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23299180	23299239	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;protein_id=OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23299340	23299516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23299340	23299516	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;protein_id=OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23300121	23300210	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;protein_id=OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23300121	23300467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Name=OsNip_05t0474600-01-E16;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23300211	23300467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23293934	23293934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23293934	23294246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;Name=OsNip_05t0474600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0474600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23293935	23294246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;protein_id=OsNip_05t0474600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23294782	23294889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;Name=OsNip_05t0474600-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23294782	23294889	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;protein_id=OsNip_05t0474600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23295057	23295602	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;Name=OsNip_05t0474600-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0474600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23295057	23295602	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0474600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0474600-02;protein_id=OsNip_05t0474600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23319098	23319239	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23319790	23319965	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0474900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23416463	23419334	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0476100-01;Parent=gene:OsNip_05g0476100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0476100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23416574	23416774	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0476100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0476100-01;protein_id=OsNip_05t0476100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23417628	23419127	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0476100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0476100-01;protein_id=OsNip_05t0476100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23417628	23419334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476100-01;Name=OsNip_05t0476100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0476100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23419128	23419334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23419626	23424595	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0476200;Name=OsNip_MCM3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23463142	23463303	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23463304	23465337	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0476700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0476700-01;protein_id=OsNip_05t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23465338	23465536	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	23463229	23465533	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0476700-02;Parent=gene:OsNip_05g0476700;transcript_id=OsNip_05t0476700-02;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1
Chr05	TAMA	exon	23463229	23463299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;Name=OsNip_05t0476700-02;exon_id=OsNip_05t0476700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	23464485	23465533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;Name=OsNip_05t0476700-02;exon_id=OsNip_05t0476700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	23465190	23465357	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0476700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;protein_id=OsNip_05t0476700-02;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	23463229	23463299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	23464485	23465189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23465361	23465533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0476700-02;Tag=IsoSeq:G9423.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4271.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9EF77";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	23477021	23478552	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0477100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23477021	23478552	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0477100-01;Parent=gene:OsNip_05g0477100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23477021	23477642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23477021	23478552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0477100-01;Name=OsNip_05t0477100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0477100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23477643	23478371	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0477100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0477100-01;protein_id=OsNip_05t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23478372	23478552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23503760	23504191	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0477800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0477800-01;protein_id=OsNip_05t0477800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23504192	23504193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0477800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23508215	23508215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0477900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23524138	23524332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0478250-00;Name=OsNip_05t0478250-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0478250-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23524138	23524332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0478250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23524396	23524982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0478250-00;Name=OsNip_05t0478250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0478250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23525794	23527493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0478300-01;Name=OsNip_05t0478300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0478300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23527256	23527493	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0478300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	23579211	23579938	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0479475;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	23579212	23579928	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0479475-00;Parent=gene:OsNip_05g0479475;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0479475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23579212	23579577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0479475-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23579212	23579928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0479475-00;Name=OsNip_05t0479475-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0479475-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	23579578	23579928	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0479475-00;Parent=transcript:OsNip_05t0479475-00;protein_id=OsNip_05t0479475-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23645371	23645464	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-02;Name=OsNip_05t0481000-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0481000-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23645371	23645464	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23646342	23646681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-02;Name=OsNip_05t0481000-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0481000-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23646342	23646681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23642774	23642950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	23642774	23643089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481000-03;Name=OsNip_05t0481000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0481000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	23668642	23669296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t048149A-01;Tag=IsoSeq:G9436.1;Source=Nipponbare.leaf_G4279.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0B304";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23672800	23673171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	23673627	23673770	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0481500-01;Name=OsNip_05t0481500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0481500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24002606	24002607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0488100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24057380	24060567	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0489600-03;Parent=gene:OsNip_05g0489600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0489600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24057380	24057698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0489600-03;Name=OsNip_05t0489600-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0489600-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24091367	24091692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0490300-01;Name=OsNip_05t0490300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0490300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24105722	24105754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24106101	24106552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0490400-01;Name=OsNip_05t0490400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0490400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24106101	24106552	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0490400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24107393	24110143	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0490500-01;Parent=gene:OsNip_05g0490500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0490500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24175560	24175890	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0491900-01;Tag=IsoSeq:G9474.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7451.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24190339	24191689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492300-00;Name=OsNip_05t0492300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0492300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	24194658	24202634	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0492500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24194658	24202634	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0492500-01;Parent=gene:OsNip_05g0492500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24196810	24196993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24197108	24197512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24197108	24197542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Name=OsNip_05t0492500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0492500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24197513	24197542	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0492500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;protein_id=OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24198445	24198789	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0492500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;protein_id=OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24198445	24200655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Name=OsNip_05t0492500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0492500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24198790	24200655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24202465	24202634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0492500-01;Name=OsNip_05t0492500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0492500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24291732	24292848	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0494600-01;Parent=gene:OsNip_05g0494600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0494600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24291732	24291871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0494600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24375009	24375102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0496000-01;Name=OsNip_05t0496000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0496000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24375009	24375102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0496000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24376195	24376196	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0496000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24376195	24376825	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0496000-01;Name=OsNip_05t0496000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0496000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24484957	24485650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0497700-01;Name=OsNip_05t0497700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0497700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24537185	24537191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498366-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24537805	24537894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24538712	24538816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Name=OsNip_05t0498400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539141	24539352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Name=OsNip_05t0498400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539432	24539485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Name=OsNip_05t0498400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24539432	24539485	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;protein_id=OsNip_05t0498400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539589	24539858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Name=OsNip_05t0498400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24539634	24539858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24537945	24539858	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0498400-02;Parent=gene:OsNip_05g0498400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24537945	24538779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24537945	24538816	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Name=OsNip_05t0498400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24538780	24538816	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;protein_id=OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539141	24539352	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Name=OsNip_05t0498400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E3;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24539141	24539352	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0498400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;protein_id=OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539432	24539485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Name=OsNip_05t0498400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24539432	24539485	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;protein_id=OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24539589	24539633	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;protein_id=OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24539589	24539858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Name=OsNip_05t0498400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498400-01-E5;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24539634	24539858	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	24537811	24539860	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0498400-03;Parent=gene:OsNip_05g0498400;transcript_id=OsNip_05t0498400-03;Tag=IsoSeq:G9498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5684.2
Chr05	TAMA	exon	24537811	24539860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-03;Name=OsNip_05t0498400-03;exon_id=OsNip_05t0498400-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5684.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HGF1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	24537811	24539511	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-03;Tag=IsoSeq:G9498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5684.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HGF1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24539719	24539860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498400-03;Tag=IsoSeq:G9498.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5684.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0HGF1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24540877	24541181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24541629	24541630	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24551224	24551533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498633-00;Name=OsNip_05t0498633-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498633-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	24552444	24555160	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0498700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24552461	24555115	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0498700-01;Parent=gene:OsNip_05g0498700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24552461	24552817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24552461	24552859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24552981	24553091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24552981	24553091	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0498700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;protein_id=OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24553175	24553258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24553175	24553258	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0498700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;protein_id=OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24553937	24554037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24553937	24554037	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0498700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;protein_id=OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24554172	24554778	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0498700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;protein_id=OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24554172	24554914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24554779	24554914	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24555011	24555115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Name=OsNip_05t0498700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24555011	24555115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	24555011	24555160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	24554172	24554799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	24554172	24554411	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0498700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;protein_id=OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	24553937	24554037	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	24553937	24554037	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0498700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;protein_id=OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	24553175	24553258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	24553175	24553258	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0498700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;protein_id=OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	24552981	24553091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	exon	24552444	24552859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Name=OsNip_05t0498700-02;exon_id=OsNip_05t0498700-02-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	24555011	24555160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	24554412	24554799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24552981	24553091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24552444	24552859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498700-02;Tag=IsoSeq:G9500.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7468.1,Nipponbare.root_G5686.3,Nipponbare.root_G5686.1;prot_id "UniRef90_UPI000B8CB8D2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	24560496	24564922	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0498800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24560496	24560670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Name=OsNip_05t0498800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24560496	24560670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24561848	24561944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Name=OsNip_05t0498800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24561848	24561944	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24562496	24563009	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Name=OsNip_05t0498800-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0498800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24562503	24563009	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;protein_id=OsNip_05t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24563089	24563184	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0498800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;protein_id=OsNip_05t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24563089	24563882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Name=OsNip_05t0498800-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0498800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24563185	24563882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24560503	24564922	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0498800-02;Parent=gene:OsNip_05g0498800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0498800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24587739	24587924	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0499400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0499400-01;protein_id=OsNip_05t0499400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24588008	24588173	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0499400-01;Name=OsNip_05t0499400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0499400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24665957	24666335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24669675	24673123	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0501300-01;Parent=gene:OsNip_05g0501300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24669882	24670382	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0501300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;protein_id=OsNip_05t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24670943	24671036	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;Name=OsNip_05t0501300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0501300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24670943	24671036	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0501300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;protein_id=OsNip_05t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24673008	24673030	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0501300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;protein_id=OsNip_05t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24673008	24673123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;Name=OsNip_05t0501300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0501300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24673031	24673123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24681854	24682004	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501400-02;Tag=IsoSeq:G9514.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7479.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	24682128	24682556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501400-02;Tag=IsoSeq:G9514.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7479.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24680522	24680665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0501500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0501500-00;protein_id=OsNip_05t0501500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24680785	24680889	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0501500-00;Parent=transcript:OsNip_05t0501500-00;protein_id=OsNip_05t0501500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24680785	24680935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0501500-00;Name=OsNip_05t0501500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0501500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24715439	24715527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0502101-00;Name=OsNip_05t0502101-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0502101-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24715959	24716516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0502101-00;Name=OsNip_05t0502101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0502101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24723804	24723871	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0502150-00;Parent=gene:OsNip_05g0502150;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_05t0502150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24723804	24723871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0502150-00;Name=OsNip_05t0502150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0502150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24913012	24913502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505383-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24913012	24914004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505383-01;Name=OsNip_05t0505383-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0505383-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24913503	24914003	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0505383-01;Parent=transcript:OsNip_05t0505383-01;protein_id=OsNip_05t0505383-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24914004	24914004	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505383-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	24961645	24964469	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0505692-01;Parent=gene:OsNip_05g0505692;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0505692-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24961645	24964117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505692-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24964349	24964469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505692-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	24987033	24989544	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0505900;Name=OsNip_CLE507;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	24988857	24989291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-02;Name=OsNip_05t0505900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0505900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24989144	24989291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24987550	24988067	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24987550	24988110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;Name=OsNip_05t0505900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0505900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24988068	24988110	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0505900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;protein_id=OsNip_05t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	24988857	24989143	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0505900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;protein_id=OsNip_05t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	24988857	24989544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;Name=OsNip_05t0505900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0505900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24989144	24989544	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25063904	25064011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0507400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	25153902	25157647	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0508300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25184696	25185037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0508700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0508700-01;protein_id=OsNip_05t0508700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25181434	25181439	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0508700-03;Parent=transcript:OsNip_05t0508700-03;protein_id=OsNip_05t0508700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25183648	25184053	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0508700-03;Parent=transcript:OsNip_05t0508700-03;protein_id=OsNip_05t0508700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25184985	25186706	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508700-03;Name=OsNip_05t0508700-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0508700-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25177260	25177476	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25177260	25177476	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25179067	25179185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25179067	25179185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25179945	25180027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25180105	25180179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25180105	25180179	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25180263	25180403	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25180831	25180973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25180881	25180973	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0508750-00;Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;protein_id=OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25181076	25181327	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0508750-00;Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;protein_id=OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25181076	25181437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25181328	25181437	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25181653	25181751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25181653	25181751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25182046	25182229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25182046	25182229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25183655	25183858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0508750-00;Name=OsNip_05t0508750-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0508750-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25196457	25196765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0509050-00;Name=OsNip_05t0509050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0509050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25199743	25199958	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0509101-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25214532	25214585	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0509200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25214532	25214687	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0509200-01;Name=OsNip_05t0509200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0509200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25258654	25258730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0509700-01;Name=OsNip_05t0509700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0509700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25283187	25284425	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0510400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0510400-01;protein_id=OsNip_05t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25284426	25284457	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25286139	25286665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0510400-01;Name=OsNip_05t0510400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0510400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25286139	25286665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	25291060	25293013	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0510600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25291060	25293013	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0510600-01;Parent=gene:OsNip_05g0510600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25291060	25291253	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0510600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	five_prime_UTR	25382346	25382347	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512200-02;Tag=IsoSeq:G9549.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	25385209	25385531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512200-02;Tag=IsoSeq:G9549.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4330.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25387145	25387923	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0512301-00;Parent=gene:OsNip_05g0512301;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0512301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25387145	25387475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25387145	25387923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512301-00;Name=OsNip_05t0512301-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0512301-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25387476	25387838	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0512301-00;Parent=transcript:OsNip_05t0512301-00;protein_id=OsNip_05t0512301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25387839	25387923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25390732	25392479	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0512400-01;Parent=gene:OsNip_05g0512400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0512400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25390732	25391114	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25390732	25391528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512400-01;Name=OsNip_05t0512400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0512400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25392432	25392479	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25392886	25396045	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0512500-01;Parent=gene:OsNip_05g0512500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0512500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25395680	25395752	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512500-01;Name=OsNip_05t0512500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0512500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25395680	25395752	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0512500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0512500-01;protein_id=OsNip_05t0512500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25395869	25395958	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0512500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0512500-01;protein_id=OsNip_05t0512500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25395869	25396045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0512500-01;Name=OsNip_05t0512500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0512500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25456387	25456462	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0513350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25456564	25456876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0513350-00;Name=OsNip_05t0513350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0513350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25456678	25456876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0513350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	25458603	25462078	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0513400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25458603	25461049	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0513400-01;Parent=gene:OsNip_05g0513400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25458603	25458843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25458603	25458997	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0513400-01;Name=OsNip_05t0513400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0513400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25458844	25458997	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0513400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0513400-01;protein_id=OsNip_05t0513400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25516048	25516204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0514701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25560496	25561582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515400-02;Name=OsNip_05t0515400-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0515400-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	25564515	25566228	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0515500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25564517	25566222	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0515500-01;Parent=gene:OsNip_05g0515500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0515500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25564517	25564529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25564517	25565333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;Name=OsNip_05t0515500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0515500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25564530	25565333	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0515500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;protein_id=OsNip_05t0515500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25565686	25565985	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0515500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;protein_id=OsNip_05t0515500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25565686	25566222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;Name=OsNip_05t0515500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0515500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25565986	25566222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	25564515	25566228	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0515500-02;Parent=gene:OsNip_05g0515500;transcript_id=OsNip_05t0515500-02;Tag=IsoSeq:G9561.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7517.6
Chr05	TAMA	exon	25564515	25566228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-02;Name=OsNip_05t0515500-02;exon_id=OsNip_05t0515500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9561.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7517.6;prot_id "UniRef90_A0A452ZJP0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	25564516	25564644	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0515500-02;Parent=transcript:OsNip_05t0515500-02;protein_id=OsNip_05t0515500-02;Tag=IsoSeq:G9561.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7517.6;prot_id "UniRef90_A0A452ZJP0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	25564515	25564515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-02;Tag=IsoSeq:G9561.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7517.6;prot_id "UniRef90_A0A452ZJP0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	25564648	25566228	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515500-02;Tag=IsoSeq:G9561.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7517.6;prot_id "UniRef90_A0A452ZJP0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	25569090	25570887	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0515600;Name=ZRP4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25569090	25569257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0515600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25608292	25610823	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0516300-01;Parent=gene:OsNip_05g0516300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25608292	25608340	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25608341	25608820	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0516300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0516300-01;protein_id=OsNip_05t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	25609505	25609507	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0516300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0516300-01;protein_id=OsNip_05t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	25609505	25609573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516300-01;Name=OsNip_05t0516300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0516300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25609508	25609573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25629221	25629343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516900-01;Name=OsNip_05t0516900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0516900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25629221	25629343	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25631047	25631456	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0516900-01;Name=OsNip_05t0516900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0516900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25810632	25810946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0519800-01;Name=OsNip_05t0519800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0519800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25811211	25817129	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0519900-02;Parent=gene:OsNip_05g0519900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0519900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25811211	25811536	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0519900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	25928115	25928223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0521300-04;Name=OsNip_05t0521300-04-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0521300-04-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25955370	25955720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0521700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	25962545	25964535	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0521900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25962545	25964535	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0521900-00;Parent=gene:OsNip_05g0521900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0521900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	25962558	25963784	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0521950-00;Parent=gene:OsNip_05g0521950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0521950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25962558	25962559	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0521950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25963214	25963784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0521950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26017170	26017742	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0522250-00;Name=OsNip_05t0522250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0522250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	26017332	26022265	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0522500;Name=OsNip_HXK5;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26017332	26022265	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0522500-01;Parent=gene:OsNip_05g0522500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0522500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	26028190	26029166	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0522700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26028190	26029166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0522700-01;Name=OsNip_05t0522700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0522700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26028392	26029090	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0522700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0522700-01;protein_id=OsNip_05t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26029091	26029166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0522700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26049874	26050503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523200-01;Name=OsNip_05t0523200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0523200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	26052916	26055714	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0523300;Name=OsNip_IAA18;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26052916	26055714	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0523300-01;Parent=gene:OsNip_05g0523300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26052916	26053141	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26052916	26053165	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26053395	26053458	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26053851	26053998	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26053851	26053998	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0523300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;protein_id=OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26054113	26054375	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26054113	26054375	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0523300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;protein_id=OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26054954	26055098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26054954	26055098	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0523300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;protein_id=OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26055189	26055528	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0523300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;protein_id=OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26055189	26055714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Name=OsNip_05t0523300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0523300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26055529	26055714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0523300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	26094860	26095836	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0524100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26094863	26095836	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0524100-01;Parent=gene:OsNip_05g0524100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26094863	26094863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26094863	26095836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0524100-01;Name=OsNip_05t0524100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0524100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26094864	26095586	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0524100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0524100-01;protein_id=OsNip_05t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26095587	26095836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	26094860	26095836	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0524100-02;Parent=gene:OsNip_05g0524100;transcript_id=OsNip_05t0524100-02;Tag=IsoSeq:G9596.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5739.6
Chr05	TAMA	exon	26094860	26095238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0524100-02;Name=OsNip_05t0524100-02;exon_id=OsNip_05t0524100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9596.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5739.6;prot_id "UniRef90_A0A3L6R0L3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	26094860	26094967	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0524100-02;Parent=transcript:OsNip_05t0524100-02;protein_id=OsNip_05t0524100-02;Tag=IsoSeq:G9596.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5739.6;prot_id "UniRef90_A0A3L6R0L3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	26095334	26095836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0524100-02;Name=OsNip_05t0524100-02;exon_id=OsNip_05t0524100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9596.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5739.6;prot_id "UniRef90_A0A3L6R0L3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	26132912	26139476	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0524900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26180148	26180422	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0526400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26180148	26180589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0526400-01;Name=OsNip_05t0526400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0526400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26180423	26180589	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0526400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0526400-01;protein_id=OsNip_05t0526400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26180666	26180735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0526400-01;Name=OsNip_05t0526400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0526400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26180666	26180735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0526400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0526400-01;protein_id=OsNip_05t0526400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26217303	26218198	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0527600-00;Name=OsNip_05t0527600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0527600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26288268	26288430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0529200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26305529	26305695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0529600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26351402	26351467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0530600-00;Name=OsNip_05t0530600-00-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0530600-00-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	26356728	26358548	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0530701;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26356728	26357074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0530701-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26383893	26384301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0531500-01;Name=OsNip_05t0531500-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0531500-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26384121	26384301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26383248	26383249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0531500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26383248	26383433	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0531500-02;Name=OsNip_05t0531500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0531500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26419416	26419417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0532600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26563756	26564073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0534900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26564170	26566558	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0534900-01;Name=OsNip_05t0534900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0534900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26564170	26566558	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0534900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26570425	26573958	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0535100-01;Parent=gene:OsNip_05g0535100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0535100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26570425	26570915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0535100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26570425	26572023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0535100-01;Name=OsNip_05t0535100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0535100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26593568	26593653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0535500-01;Name=OsNip_05t0535500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0535500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26597947	26601563	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0535600-00;Parent=gene:OsNip_05g0535600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0535600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26597947	26598871	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0535600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0535600-00;protein_id=OsNip_05t0535600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26599181	26599285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0535600-00;Name=OsNip_05t0535600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0535600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26599181	26599285	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0535600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0535600-00;protein_id=OsNip_05t0535600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26599546	26599616	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0535600-00;Parent=transcript:OsNip_05t0535600-00;protein_id=OsNip_05t0535600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26599546	26599633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0535600-00;Name=OsNip_05t0535600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0535600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26792022	26792132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0539300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26821419	26822297	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0539900-01;Name=OsNip_05t0539900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0539900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	26820775	26821333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0539900-02;Name=OsNip_05t0539900-02;exon_id=OsNip_05t0539900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9642.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4367.2,Nipponbare.panicle_G7580.2;prot_id "UniRef90_A0A061GKG0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	three_prime_UTR	26869996	26870139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541200-02;Tag=IsoSeq:G9651.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7588.1,Nipponbare.root_G5776.1;prot_id "UniRef90_A0A452ZQ04";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	26870242	26870582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541200-02;Tag=IsoSeq:G9651.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7588.1,Nipponbare.root_G5776.1;prot_id "UniRef90_A0A452ZQ04";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26902013	26905007	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0541900-01;Parent=gene:OsNip_05g0541900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26902013	26903936	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26902013	26904190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Name=OsNip_05t0541900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0541900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26903937	26904190	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0541900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;protein_id=OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26904294	26904441	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0541900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;protein_id=OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26904294	26904451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Name=OsNip_05t0541900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0541900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26904442	26904451	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26904943	26905007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Name=OsNip_05t0541900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0541900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26904943	26905007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	26902130	26905053	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0541900-02;Parent=gene:OsNip_05g0541900;transcript_id=OsNip_05t0541900-02;Tag=IsoSeq:G9654.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7591.2,Nipponbare.leaf_G4372.2,Nipponbare.root_G5778.2
Chr05	TAMA	exon	26904943	26905053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0541900-02;Name=OsNip_05t0541900-02;exon_id=OsNip_05t0541900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9654.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7591.2,Nipponbare.leaf_G4372.2,Nipponbare.root_G5778.2;prot_id "UniRef90_A0A4S8JUN5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	26904943	26905053	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0541900-02;Parent=transcript:OsNip_05t0541900-02;protein_id=OsNip_05t0541900-02;Tag=IsoSeq:G9654.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7591.2,Nipponbare.leaf_G4372.2,Nipponbare.root_G5778.2;prot_id "UniRef90_A0A4S8JUN5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	26949159	26949737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-01;Name=OsNip_05t0543000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0543000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26949582	26949737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	26948391	26948733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-02;Name=OsNip_05t0543000-02;exon_id=OsNip_05t0543000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9662.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7599.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0L585";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	TAMA	exon	26949136	26949831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-02;Name=OsNip_05t0543000-02;exon_id=OsNip_05t0543000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9662.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7599.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0L585";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	26948391	26948392	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-02;Tag=IsoSeq:G9662.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7599.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0L585";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	26948522	26948733	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-02;Tag=IsoSeq:G9662.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7599.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0L585";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	26949136	26949831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543000-02;Tag=IsoSeq:G9662.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7599.4;prot_id "UniRef90_A0A0E0L585";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	26952587	26955912	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0543100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	26952587	26955912	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0543100-01;Parent=gene:OsNip_05g0543100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0543100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26952587	26952971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26952587	26953070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;Name=OsNip_05t0543100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0543100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26952972	26953070	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0543100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;protein_id=OsNip_05t0543100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26953163	26953285	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;Name=OsNip_05t0543100-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0543100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	26953163	26953285	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0543100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;protein_id=OsNip_05t0543100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	26953376	26953517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0543100-01;Name=OsNip_05t0543100-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0543100-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27223488	27223664	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0548700-00;Parent=transcript:OsNip_05t0548700-00;protein_id=OsNip_05t0548700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	27224856	27227291	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0548800;biotype=protein_coding;description=Acid;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27224856	27224917	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27224918	27224977	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0548800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;protein_id=OsNip_05t0548800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27225378	27225473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;Name=OsNip_05t0548800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0548800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27225378	27225473	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0548800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;protein_id=OsNip_05t0548800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27225565	27225636	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0548800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;protein_id=OsNip_05t0548800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27225565	27226126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;Name=OsNip_05t0548800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0548800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27225637	27226126	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0548800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	27224856	27227291	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0548800-02;Parent=gene:OsNip_05g0548800;transcript_id=OsNip_05t0548800-02;Tag=IsoSeq:G9684.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7616.1
Chr05	TAMA	exon	27226982	27227291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0548800-02;Name=OsNip_05t0548800-02;exon_id=OsNip_05t0548800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9684.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7616.1;prot_id "UniRef90_A0A2C9UQQ4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27382079	27382166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0551000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27521232	27521570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0553300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	27524786	27526242	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0553400-01;Parent=gene:OsNip_05g0553400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0553400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27545551	27546073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-03;Name=OsNip_05t0554000-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0554000-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27545635	27546073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27543221	27543765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;Name=OsNip_05t0554000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27543221	27543765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0554000-02;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;protein_id=OsNip_05t0554000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27543876	27543966	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0554000-02;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;protein_id=OsNip_05t0554000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27543876	27544111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;Name=OsNip_05t0554000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0554000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27543967	27544111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27544202	27545922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27542128	27542229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27542128	27542514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27542230	27542514	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0554000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;protein_id=OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27543221	27543765	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27543221	27543765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0554000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;protein_id=OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27543876	27543962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27543876	27543962	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0554000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;protein_id=OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27544055	27544111	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27544055	27544111	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0554000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;protein_id=OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27544202	27544454	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0554000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;protein_id=OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27544202	27544973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27544455	27544973	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27545233	27545438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27545233	27545438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27545551	27545922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Name=OsNip_05t0554000-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0554000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27545551	27545922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	27542128	27545922	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0554000-04;Parent=gene:OsNip_05g0554000;transcript_id=OsNip_05t0554000-04;Tag=IsoSeq:G9704.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5817.4
Chr05	TAMA	exon	27542128	27542514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0554000-04;Name=OsNip_05t0554000-04;exon_id=OsNip_05t0554000-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9704.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5817.4;prot_id "UniRef90_A0A368R9E7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27603088	27604285	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0555100-01;Parent=transcript:OsNip_05t0555100-01;protein_id=OsNip_05t0555100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27603088	27605407	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555100-01;Name=OsNip_05t0555100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0555100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27604286	27605407	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27635861	27636394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555600-02;Name=OsNip_05t0555600-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0555600-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27638094	27638177	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27638094	27638894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555700-01;Name=OsNip_05t0555700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0555700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27638178	27638615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0555700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0555700-01;protein_id=OsNip_05t0555700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27638616	27638894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	27640763	27641333	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0555800;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	27640763	27641333	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0555800-00;Parent=gene:OsNip_05g0555800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0555800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27640763	27640830	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555800-00;Name=OsNip_05t0555800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0555800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27640943	27641171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555800-00;Name=OsNip_05t0555800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0555800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27640943	27641171	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0555800-00;Parent=transcript:OsNip_05t0555800-00;protein_id=OsNip_05t0555800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27641292	27641333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555800-00;Name=OsNip_05t0555800-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0555800-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27641292	27641333	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0555800-00;Parent=transcript:OsNip_05t0555800-00;protein_id=OsNip_05t0555800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	27642436	27642713	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0555900;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	27642436	27642713	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0555900-01;Parent=gene:OsNip_05g0555900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_05t0555900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27642436	27642713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0555900-01;Name=OsNip_05t0555900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0555900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	27643114	27647653	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0556000;biotype=protein_coding;description=Oxoglutarate/iron-dependent;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	27643114	27647653	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0556000-01;Parent=gene:OsNip_05g0556000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27643114	27643404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27643114	27643611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Name=OsNip_05t0556000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0556000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27643405	27643611	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0556000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;protein_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27643696	27643773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Name=OsNip_05t0556000-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0556000-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27643696	27643773	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0556000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;protein_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27643872	27643921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Name=OsNip_05t0556000-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0556000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27643872	27643921	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0556000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;protein_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27644038	27644091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Name=OsNip_05t0556000-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0556000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27644038	27644091	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0556000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;protein_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	27644289	27644341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;Name=OsNip_05t0556000-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0556000-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27644289	27644341	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0556000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556000-01;protein_id=OsNip_05t0556000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27652091	27652151	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27652409	27652498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27652727	27652833	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0556201-00;Name=OsNip_05t0556201-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0556201-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27652831	27652833	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0556201-00;Parent=transcript:OsNip_05t0556201-00;protein_id=OsNip_05t0556201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27679362	27679418	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0556600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0556600-01;protein_id=OsNip_05t0556600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	27733895	27738318	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0557600-01;Parent=gene:OsNip_05g0557600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27733895	27734250	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27736493	27736627	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0557600-01;Name=OsNip_05t0557600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0557600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27737944	27738061	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0557600-01;Name=OsNip_05t0557600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0557600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27737944	27738061	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0557600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0557600-01;protein_id=OsNip_05t0557600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27912799	27912922	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0560900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27912018	27912018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0561000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27912019	27912782	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0561000-00;Parent=transcript:OsNip_05t0561000-00;protein_id=OsNip_05t0561000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	27935368	27936000	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0561400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	27935448	27935675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0561400-00;Name=OsNip_05t0561400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0561400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	27935448	27935675	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0561400-00;Parent=transcript:OsNip_05t0561400-00;protein_id=OsNip_05t0561400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	27935368	27936000	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0561400-01;Parent=gene:OsNip_05g0561400;transcript_id=OsNip_05t0561400-01;Tag=IsoSeq:G9740.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5841.6
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28038294	28039159	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0563400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0563400-01;protein_id=OsNip_05t0563400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28039232	28039297	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0563400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0563400-01;protein_id=OsNip_05t0563400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28067828	28067888	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0563900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0563900-01;protein_id=OsNip_05t0563900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28068232	28068389	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0563900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0563900-01;protein_id=OsNip_05t0563900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28068232	28068569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563900-01;Name=OsNip_05t0563900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0563900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28068390	28068569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28067824	28068569	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0563900-02;Parent=gene:OsNip_05g0563900;transcript_id=OsNip_05t0563900-02;Tag=IsoSeq:G9752.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5851.1,Nipponbare.panicle_G7672.1,Nipponbare.leaf_G4421.1
Chr05	TAMA	exon	28067824	28068569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563900-02;Name=OsNip_05t0563900-02;exon_id=OsNip_05t0563900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9752.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5851.1,Nipponbare.panicle_G7672.1,Nipponbare.leaf_G4421.1;prot_id "UniRef90_A0A287GLZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	28067825	28067989	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0563900-02;Parent=transcript:OsNip_05t0563900-02;protein_id=OsNip_05t0563900-02;Tag=IsoSeq:G9752.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5851.1,Nipponbare.panicle_G7672.1,Nipponbare.leaf_G4421.1;prot_id "UniRef90_A0A287GLZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28067824	28067824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563900-02;Tag=IsoSeq:G9752.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5851.1,Nipponbare.panicle_G7672.1,Nipponbare.leaf_G4421.1;prot_id "UniRef90_A0A287GLZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28067993	28068569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563900-02;Tag=IsoSeq:G9752.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5851.1,Nipponbare.panicle_G7672.1,Nipponbare.leaf_G4421.1;prot_id "UniRef90_A0A287GLZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28068329	28069297	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0563950;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28068329	28069297	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0563950-01;Parent=gene:OsNip_05g0563950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0563950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28068329	28068360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28068329	28069297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563950-01;Name=OsNip_05t0563950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0563950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28068361	28068699	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0563950-01;Parent=transcript:OsNip_05t0563950-01;protein_id=OsNip_05t0563950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28068700	28069297	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0563950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28073023	28076506	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0564000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28073023	28076506	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0564000-00;Parent=gene:OsNip_05g0564000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0564000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28073023	28073851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564000-00;Name=OsNip_05t0564000-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564000-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28073023	28073851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28074974	28074988	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28074974	28075183	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564000-00;Name=OsNip_05t0564000-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0564000-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28075583	28075692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564000-00;Name=OsNip_05t0564000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0564000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28081663	28082860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-01;Name=OsNip_05t0564200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28081694	28082608	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0564200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0564200-01;protein_id=OsNip_05t0564200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28082609	28082860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	28080217	28080267	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;Name=OsNip_05t0564200-02;exon_id=OsNip_05t0564200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	TAMA	CDS	28080376	28080431	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0564200-02;Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;protein_id=OsNip_05t0564200-02;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	exon	28080996	28082860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;Name=OsNip_05t0564200-02;exon_id=OsNip_05t0564200-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	CDS	28080996	28081016	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0564200-02;Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;protein_id=OsNip_05t0564200-02;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28080217	28080218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28081020	28082860	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564200-02;Tag=IsoSeq:G9753.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7673.5,Nipponbare.panicle_G7673.3;prot_id "UniRef90_A0A0A9PAB6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28085122	28085232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Name=OsNip_05t0564300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28085122	28085232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28089302	28089368	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28090314	28090654	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Name=OsNip_05t0564300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0564300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28091304	28091399	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0564300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;protein_id=OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28091478	28091633	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Name=OsNip_05t0564300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0564300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28091478	28091633	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0564300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;protein_id=OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28091901	28092047	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0564300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;protein_id=OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28091901	28092378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Name=OsNip_05t0564300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0564300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28092048	28092378	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28089312	28092327	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0564350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28089312	28092327	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0564350-00;Parent=gene:OsNip_05g0564350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28089312	28090119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Name=OsNip_05t0564350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28089312	28090119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28090300	28090740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Name=OsNip_05t0564350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28090300	28090740	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28091272	28091391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Name=OsNip_05t0564350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0564350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28091272	28091391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28091476	28091555	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28091476	28091631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;Name=OsNip_05t0564350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0564350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28091556	28091631	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0564350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;protein_id=OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28091899	28092074	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0564350-00;Parent=transcript:OsNip_05t0564350-00;protein_id=OsNip_05t0564350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28129780	28129842	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0565400-01;Name=OsNip_05t0565400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0565400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28130663	28130728	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0565400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0565400-01;protein_id=OsNip_05t0565400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28130933	28131181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0565400-01;Name=OsNip_05t0565400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0565400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28131113	28131181	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0565400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28128525	28131159	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0565400-02;Parent=gene:OsNip_05g0565400;transcript_id=OsNip_05t0565400-02;Tag=IsoSeq:G9759.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4427.4
Chr05	TAMA	exon	28130933	28131159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0565400-02;Name=OsNip_05t0565400-02;exon_id=OsNip_05t0565400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9759.5;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4427.4;prot_id "UniRef90_A0A0K9QYU0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28191695	28191822	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0566400-01;Name=OsNip_05t0566400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0566400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28193840	28194022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0566400-01;Name=OsNip_05t0566400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0566400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28193897	28194022	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0566400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	CDS	28193840	28194025	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0566400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0566400-02;protein_id=OsNip_05t0566400-02;Tag=IsoSeq:G9762.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4430.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28206970	28206970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0566600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28237042	28237289	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0567100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28231903	28232593	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0567100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28299507	28300046	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0568300-00;Parent=transcript:OsNip_05t0568300-00;protein_id=OsNip_05t0568300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28307089	28307129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0568600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28343998	28344132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0569400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	gene	28377522	28379212	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0570200;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28377706	28378941	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0570200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0570200-01;protein_id=OsNip_05t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28378942	28379212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0570200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28388746	28390246	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0570350;Name=OsNip__F0697;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28388746	28390246	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0570350-01;Parent=gene:OsNip_05g0570350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0570350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28388746	28388920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0570350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28388746	28390246	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0570350-01;Name=OsNip_05t0570350-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0570350-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28388921	28390246	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0570350-01;Parent=transcript:OsNip_05t0570350-01;protein_id=OsNip_05t0570350-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28392188	28397563	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0570375;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28392188	28397563	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0570375-00;Parent=gene:OsNip_05g0570375;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0570375-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28472464	28472920	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0571200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0571200-01;protein_id=OsNip_05t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28472464	28473050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571200-01;Name=OsNip_05t0571200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0571200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28472921	28473050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	28472478	28473056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571200-02;Name=OsNip_05t0571200-02;exon_id=OsNip_05t0571200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9781.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7695.1,Nipponbare.root_G5870.1;prot_id "UniRef90_K3Z8H3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	28472479	28472835	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0571200-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571200-02;protein_id=OsNip_05t0571200-02;Tag=IsoSeq:G9781.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7695.1,Nipponbare.root_G5870.1;prot_id "UniRef90_K3Z8H3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28472478	28472478	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571200-02;Tag=IsoSeq:G9781.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7695.1,Nipponbare.root_G5870.1;prot_id "UniRef90_K3Z8H3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28472839	28473056	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571200-02;Tag=IsoSeq:G9781.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7695.1,Nipponbare.root_G5870.1;prot_id "UniRef90_K3Z8H3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28473568	28476469	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571300-02;Parent=gene:OsNip_05g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28473568	28473773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28473568	28474069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;Name=OsNip_05t0571300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0571300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28473774	28474069	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0571300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;protein_id=OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28474161	28474428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;Name=OsNip_05t0571300-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0571300-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28474161	28474428	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;protein_id=OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28474765	28476195	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;protein_id=OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28474765	28476469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;Name=OsNip_05t0571300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0571300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28476196	28476469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28473720	28476156	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571300-03;Parent=gene:OsNip_05g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28473720	28473773	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28473720	28474069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;Name=OsNip_05t0571300-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0571300-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28473774	28474069	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;protein_id=OsNip_05t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28474161	28474428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;Name=OsNip_05t0571300-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0571300-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28474161	28474428	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;protein_id=OsNip_05t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28474765	28476156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;Name=OsNip_05t0571300-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0571300-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28474765	28476156	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571300-03;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-03;protein_id=OsNip_05t0571300-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28476388	28477137	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571300-01;Parent=gene:OsNip_05g0571300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28476388	28476677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28476388	28477137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-01;Name=OsNip_05t0571300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0571300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28476678	28476767	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0571300-01;protein_id=OsNip_05t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28476768	28477137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28478301	28482910	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0571400;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28478301	28481216	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571400-02;Parent=gene:OsNip_05g0571400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28478301	28478795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Name=OsNip_05t0571400-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0571400-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28478301	28478795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28478906	28479329	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28478906	28479756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Name=OsNip_05t0571400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0571400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28479330	28479756	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0571400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;protein_id=OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28479810	28480423	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571400-02;Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;protein_id=OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28479810	28481216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Name=OsNip_05t0571400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0571400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28480424	28481216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28480951	28482901	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571400-01;Parent=gene:OsNip_05g0571400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0571400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28480951	28481096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28480951	28481281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;Name=OsNip_05t0571400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0571400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28481097	28481281	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0571400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;protein_id=OsNip_05t0571400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28482556	28482880	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0571400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;protein_id=OsNip_05t0571400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28482556	28482901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;Name=OsNip_05t0571400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0571400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28482881	28482901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28480958	28482910	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0571400-03;Parent=gene:OsNip_05g0571400;transcript_id=OsNip_05t0571400-03;Tag=IsoSeq:G9782.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4442.2
Chr05	TAMA	exon	28482556	28482910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0571400-03;Name=OsNip_05t0571400-03;exon_id=OsNip_05t0571400-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9782.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4442.2;prot_id "UniRef90_M8AVK8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28550478	28550620	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0573200-00;Name=OsNip_05t0573200-00-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0573200-00-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28550799	28550924	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0573200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0573200-00;protein_id=OsNip_05t0573200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28551026	28551291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0573200-00;Name=OsNip_05t0573200-00-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0573200-00-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28551111	28551291	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0573200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28592519	28592602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0573900-01;Name=OsNip_05t0573900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0573900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28592519	28592602	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0573900-01;Parent=transcript:OsNip_05t0573900-01;protein_id=OsNip_05t0573900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28597575	28597575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28597576	28598178	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0574000-00;Parent=transcript:OsNip_05t0574000-00;protein_id=OsNip_05t0574000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28598253	28598885	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0574000-00;Parent=transcript:OsNip_05t0574000-00;protein_id=OsNip_05t0574000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28598253	28598915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-00;Name=OsNip_05t0574000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0574000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28598886	28598915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28597540	28599077	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0574000-01;Parent=gene:OsNip_05g0574000;transcript_id=OsNip_05t0574000-01;Tag=IsoSeq:G9789.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7702.2
Chr05	TAMA	exon	28597540	28599077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-01;Name=OsNip_05t0574000-01;exon_id=OsNip_05t0574000-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9789.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7702.2;prot_id "UniRef90_A0A444C7X5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	28597631	28598176	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0574000-01;Parent=transcript:OsNip_05t0574000-01;protein_id=OsNip_05t0574000-01;Tag=IsoSeq:G9789.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7702.2;prot_id "UniRef90_A0A444C7X5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28597540	28597630	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-01;Tag=IsoSeq:G9789.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7702.2;prot_id "UniRef90_A0A444C7X5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28598180	28599077	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574000-01;Tag=IsoSeq:G9789.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G7702.2;prot_id "UniRef90_A0A444C7X5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28597581	28598820	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0573950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28625224	28627191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-01;Name=OsNip_05t0574600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0574600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28625435	28626997	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0574600-01;Parent=transcript:OsNip_05t0574600-01;protein_id=OsNip_05t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28626998	28627191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28627287	28627550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-01;Name=OsNip_05t0574600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0574600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28627287	28627550	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	TAMA	exon	28625222	28627090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-02;Name=OsNip_05t0574600-02;exon_id=OsNip_05t0574600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9794.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5879.1;prot_id "UniRef90_V4UMZ1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	CDS	28626907	28627002	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0574600-02;Parent=transcript:OsNip_05t0574600-02;protein_id=OsNip_05t0574600-02;Tag=IsoSeq:G9794.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5879.1;prot_id "UniRef90_V4UMZ1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28627003	28627090	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-02;Tag=IsoSeq:G9794.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5879.1;prot_id "UniRef90_V4UMZ1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28625222	28626904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574600-02;Tag=IsoSeq:G9794.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5879.1;prot_id "UniRef90_V4UMZ1";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28628763	28632268	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0574700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28628860	28632192	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0574700-01;Parent=gene:OsNip_05g0574700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28628860	28629104	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574700-01;Name=OsNip_05t0574700-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0574700-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28628860	28629104	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28629180	28629738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28629180	28629828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0574700-01;Name=OsNip_05t0574700-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0574700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28663289	28663515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0575400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28664227	28664333	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0575400-01;Name=OsNip_05t0575400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0575400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28708126	28708523	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0576500-02;Parent=transcript:OsNip_05t0576500-02;protein_id=OsNip_05t0576500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28708126	28708589	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576500-02;Name=OsNip_05t0576500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0576500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28716494	28717202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28716494	28717779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576700-01;Name=OsNip_05t0576700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0576700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28717725	28717779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28721012	28726493	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0576800-01;Parent=gene:OsNip_05g0576800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0576800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28721012	28721070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28721071	28721343	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0576800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0576800-01;protein_id=OsNip_05t0576800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28722259	28722658	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0576800-01;Name=OsNip_05t0576800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0576800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28722259	28722658	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0576800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0576800-01;protein_id=OsNip_05t0576800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28762150	28762271	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-01;Name=OsNip_05t0577700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0577700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28762150	28762271	.	-	2	ID=CDS:OsNip_05t0577700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0577700-01;protein_id=OsNip_05t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28763213	28763519	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0577700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0577700-01;protein_id=OsNip_05t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28763213	28763686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-01;Name=OsNip_05t0577700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0577700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28763520	28763686	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28760173	28760484	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0577700-02;Parent=gene:OsNip_05g0577700;transcript_id=OsNip_05t0577700-02;Tag=IsoSeq:G9800.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5881.2
Chr05	TAMA	exon	28760173	28760484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-02;Name=OsNip_05t0577700-02;exon_id=OsNip_05t0577700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9800.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5881.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0L641";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	28760372	28760482	.	-	.	ID=CDS:OsNip_05t0577700-02;Parent=transcript:OsNip_05t0577700-02;protein_id=OsNip_05t0577700-02;Tag=IsoSeq:G9800.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5881.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0L641";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	28760483	28760484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-02;Tag=IsoSeq:G9800.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5881.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0L641";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	three_prime_UTR	28760173	28760369	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0577700-02;Tag=IsoSeq:G9800.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5881.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0L641";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	RAP2018-11-26	gene	28767438	28774079	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0577800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28840466	28840715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579500-01;Name=OsNip_05t0579500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0579500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28845800	28846124	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579600-01;Name=OsNip_05t0579600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0579600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28848050	28850435	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0579700-00;Parent=gene:OsNip_05g0579700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0579700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28848050	28848490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28848050	28848515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579700-00;Name=OsNip_05t0579700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0579700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28848491	28848515	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0579700-00;Parent=transcript:OsNip_05t0579700-00;protein_id=OsNip_05t0579700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28850032	28850435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579700-00;Name=OsNip_05t0579700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0579700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28850343	28850435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	28854843	28857818	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0579800-01;Parent=gene:OsNip_05g0579800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28854843	28854855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28854843	28855061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0579800-01;Name=OsNip_05t0579800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0579800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28854856	28855061	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_05t0579800-01;protein_id=OsNip_05t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28919968	28920005	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;Name=OsNip_05t0581200-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0581200-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28920087	28920193	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;Name=OsNip_05t0581200-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0581200-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28920087	28920193	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0581200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;protein_id=OsNip_05t0581200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28920281	28920402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;Name=OsNip_05t0581200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0581200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28920281	28920402	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0581200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;protein_id=OsNip_05t0581200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28921002	28921043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;Name=OsNip_05t0581200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0581200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28921002	28921043	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0581200-00;Parent=transcript:OsNip_05t0581200-00;protein_id=OsNip_05t0581200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	28919773	28921445	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0581200-01;Parent=gene:OsNip_05g0581200;transcript_id=OsNip_05t0581200-01;Tag=IsoSeq:G9813.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5889.1
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28952584	28952754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0581900-01;Name=OsNip_05t0581900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0581900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	28960225	28960643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0582100-02;Name=OsNip_05t0582100-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0582100-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28960225	28960643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0582100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	28960740	28960898	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0582100-02;Name=OsNip_05t0582100-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0582100-01-E15;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	28987106	28987389	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0582300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0582300-01;protein_id=OsNip_05t0582300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29035520	29035777	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0583400-01;Parent=transcript:OsNip_05t0583400-01;protein_id=OsNip_05t0583400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29035778	29036227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0583400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29038722	29038839	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0583500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0583500-01;protein_id=OsNip_05t0583500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29039618	29040023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0583500-01;Name=OsNip_05t0583500-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_05t0583500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29039618	29040023	.	+	2	ID=CDS:OsNip_05t0583500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0583500-01;protein_id=OsNip_05t0583500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29040122	29040299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0583500-01;Name=OsNip_05t0583500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0583500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29040122	29040299	.	+	1	ID=CDS:OsNip_05t0583500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0583500-01;protein_id=OsNip_05t0583500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29069512	29069761	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0584200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0584200-01;protein_id=OsNip_05t0584200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29069874	29070079	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0584200-01;Parent=transcript:OsNip_05t0584200-01;protein_id=OsNip_05t0584200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29069874	29070559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0584200-01;Name=OsNip_05t0584200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0584200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29070080	29070559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0584200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29069325	29069511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0584200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29143726	29144458	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0585500-01;Parent=transcript:OsNip_05t0585500-01;protein_id=OsNip_05t0585500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29143726	29144459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585500-01;Name=OsNip_05t0585500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0585500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29144459	29144459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	29143724	29144285	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585601-00;Name=OsNip_05t0585601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0585601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29143724	29144285	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0585601-00;Parent=transcript:OsNip_05t0585601-00;protein_id=OsNip_05t0585601-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	29150232	29152272	.	-	.	ID=gene:OsNip_05g0585700;biotype=protein_coding;description=Helix-turn-helix%2C;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	29150232	29152272	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0585700-01;Parent=gene:OsNip_05g0585700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0585700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29150232	29150381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29150232	29150475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;Name=OsNip_05t0585700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_05t0585700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29150382	29150475	.	-	1	ID=CDS:OsNip_05t0585700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;protein_id=OsNip_05t0585700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29150591	29150778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;Name=OsNip_05t0585700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0585700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29150591	29150778	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0585700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;protein_id=OsNip_05t0585700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29152066	29152227	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0585700-01;Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;protein_id=OsNip_05t0585700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29152066	29152272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0585700-01;Name=OsNip_05t0585700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0585700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	29271392	29274798	.	-	.	ID=transcript:OsNip_05t0587400-01;Parent=gene:OsNip_05g0587400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29271392	29271699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0587400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29519649	29520052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	29517590	29517694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Name=OsNip_05t0592450-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0592450-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29517590	29517694	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29518127	29518488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Name=OsNip_05t0592450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0592450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29518127	29518488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29518694	29518964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Name=OsNip_05t0592450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0592450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29518694	29518964	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29519045	29519170	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29519045	29519656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Name=OsNip_05t0592450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0592450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29519171	29519440	.	-	0	ID=CDS:OsNip_05t0592450-00;Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;protein_id=OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29519441	29519656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	gene	29520232	29527462	.	+	.	ID=gene:OsNip_05g0592500;biotype=protein_coding;description=SIT4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	mRNA	29520232	29527462	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0592500-01;Parent=gene:OsNip_05g0592500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_05t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29520232	29520453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29520232	29520492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0592500-01;Name=OsNip_05t0592500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0592500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29658392	29658931	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0595300-01;Parent=transcript:OsNip_05t0595300-01;protein_id=OsNip_05t0595300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29658932	29659085	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	29656683	29656887	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;Name=OsNip_05t0595300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_05t0595300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr05	RAP2018-11-26	exon	29658392	29658925	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;Name=OsNip_05t0595300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0595300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29658392	29658925	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0595300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;protein_id=OsNip_05t0595300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29659408	29659572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;Name=OsNip_05t0595300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0595300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29659408	29659572	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0595300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;protein_id=OsNip_05t0595300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	CDS	29659761	29659856	.	+	0	ID=CDS:OsNip_05t0595300-02;Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;protein_id=OsNip_05t0595300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	exon	29659761	29660315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;Name=OsNip_05t0595300-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_05t0595300-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29659857	29660315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr05	TAMA	mRNA	29656681	29657859	.	+	.	ID=transcript:OsNip_05t0595300-03;Parent=gene:OsNip_05g0595300;transcript_id=OsNip_05t0595300-03;Tag=IsoSeq:G9872.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7769.1
Chr05	TAMA	exon	29656681	29657859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-03;Name=OsNip_05t0595300-03;exon_id=OsNip_05t0595300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9872.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7769.1;prot_id "UniRef90_Q5TKF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	CDS	29656683	29656874	.	+	.	ID=CDS:OsNip_05t0595300-03;Parent=transcript:OsNip_05t0595300-03;protein_id=OsNip_05t0595300-03;Tag=IsoSeq:G9872.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7769.1;prot_id "UniRef90_Q5TKF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr05	TAMA	five_prime_UTR	29656681	29656682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_05t0595300-03;Tag=IsoSeq:G9872.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7769.1;prot_id "UniRef90_Q5TKF5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	183073	183195	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0102600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102600-01;protein_id=OsNip_06t0102600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	183664	183792	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0102600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102600-01;protein_id=OsNip_06t0102600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	185697	185803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	185804	186025	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0102700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;protein_id=OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	186121	186237	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0102700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;protein_id=OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	186324	186737	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;Name=OsNip_06t0102700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0102700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	186324	186737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0102700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;protein_id=OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	186827	187888	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0102700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;protein_id=OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	186827	188136	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;Name=OsNip_06t0102700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0102700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	187889	188136	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0102700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	185753	188136	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0102700-02;Parent=gene:OsNip_06g0102700;transcript_id=OsNip_06t0102700-02;Tag=IsoSeq:G9888.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7783.2
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	216334	216509	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0103300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;protein_id=OsNip_06t0103300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	216631	216798	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0103300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;protein_id=OsNip_06t0103300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	217225	217304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;Name=OsNip_06t0103300-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0103300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	217225	217304	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0103300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;protein_id=OsNip_06t0103300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	217404	217444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;Name=OsNip_06t0103300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0103300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	217404	217444	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0103300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0103300-02;protein_id=OsNip_06t0103300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	215144	218016	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0103300-01;Parent=gene:OsNip_06g0103300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0103300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	215144	215400	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0103300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	215144	215613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0103300-01;Name=OsNip_06t0103300-02-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0103300-02-E8;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	215707	215790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0103300-01;Name=OsNip_06t0103300-02-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0103300-02-E7;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	456199	456351	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0107100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0107100-01;protein_id=OsNip_06t0107100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	454886	454921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0107100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	455264	455493	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0107100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0107100-02;protein_id=OsNip_06t0107100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	455951	456061	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0107100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0107100-02;protein_id=OsNip_06t0107100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	543057	543099	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0109200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	564534	564681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0109600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	627219	628759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0111200-01;Name=OsNip_06t0111200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0111200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	628421	628759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0111200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	628470	628752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0111200-02;Tag=IsoSeq:G9921.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7807.2;prot_id "UniRef90_A3B7Q2";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr06	TAMA	mRNA	811044	816535	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0114000-05;Parent=gene:OsNip_06g0114000;transcript_id=OsNip_06t0114000-05;Tag=IsoSeq:G9935.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7818.2,Nipponbare.root_G5965.1,Nipponbare.root_G5965.2,Nipponbare.leaf_G4521.3,Nipponbare.leaf_G4521.1
Chr06	TAMA	exon	816448	816535	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0114000-05;Name=OsNip_06t0114000-05;exon_id=OsNip_06t0114000-05-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9935.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7818.2,Nipponbare.root_G5965.1,Nipponbare.root_G5965.2,Nipponbare.leaf_G4521.3,Nipponbare.leaf_G4521.1;prot_id "UniRef90_D7SLM9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	TAMA	exon	815234	815458	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0114000-05;Name=OsNip_06t0114000-05;exon_id=OsNip_06t0114000-05-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G9935.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7818.2,Nipponbare.root_G5965.1,Nipponbare.root_G5965.2,Nipponbare.leaf_G4521.3,Nipponbare.leaf_G4521.1;prot_id "UniRef90_D7SLM9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	TAMA	exon	813831	814073	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0114000-05;Name=OsNip_06t0114000-05;exon_id=OsNip_06t0114000-05-E6;rank=6;Tag=IsoSeq:G9935.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7818.2,Nipponbare.root_G5965.1,Nipponbare.root_G5965.2,Nipponbare.leaf_G4521.3,Nipponbare.leaf_G4521.1;prot_id "UniRef90_D7SLM9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	871774	871779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	876948	877211	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	878295	878501	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0115800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0115800-02;protein_id=OsNip_06t0115800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	878646	880442	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	CDS	880386	880449	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0115800-03;Parent=transcript:OsNip_06t0115800-03;protein_id=OsNip_06t0115800-03;Tag=IsoSeq:G9949.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5973.2,Nipponbare.panicle_G7828.5;prot_id "UniRef90_A0A5P1EZQ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	exon	878295	878621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-03;Name=OsNip_06t0115800-03;exon_id=OsNip_06t0115800-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G9949.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5973.2,Nipponbare.panicle_G7828.5;prot_id "UniRef90_A0A5P1EZQ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	877016	877856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-03;Name=OsNip_06t0115800-03;exon_id=OsNip_06t0115800-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G9949.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5973.2,Nipponbare.panicle_G7828.5;prot_id "UniRef90_A0A5P1EZQ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	878295	878621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-03;Tag=IsoSeq:G9949.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5973.2,Nipponbare.panicle_G7828.5;prot_id "UniRef90_A0A5P1EZQ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	877016	877856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0115800-03;Tag=IsoSeq:G9949.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G5973.2,Nipponbare.panicle_G7828.5;prot_id "UniRef90_A0A5P1EZQ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	885834	885835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0116100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	885834	885998	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0116100-01;Name=OsNip_06t0116100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0116100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	886973	887145	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0116100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0116100-01;protein_id=OsNip_06t0116100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	1009739	1010018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118600-02;Tag=IsoSeq:G9956.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5978.1;prot_id "UniRef90_I1QJG5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	1010244	1011305	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118600-02;Tag=IsoSeq:G9956.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5978.1;prot_id "UniRef90_I1QJG5";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1011587	1011899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1011587	1012931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-02;Name=OsNip_06t0118700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0118700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1013626	1013912	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-02;Name=OsNip_06t0118700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0118700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1013626	1013912	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0118700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0118700-02;protein_id=OsNip_06t0118700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1011625	1011899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1011625	1012931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;Name=OsNip_06t0118700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0118700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1011900	1012931	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0118700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;protein_id=OsNip_06t0118700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1013626	1013912	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0118700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;protein_id=OsNip_06t0118700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1014440	1014605	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0118700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;protein_id=OsNip_06t0118700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1014440	1014688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;Name=OsNip_06t0118700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0118700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1014606	1014688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1025098	1025823	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0118800-00;Parent=gene:OsNip_06g0118800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1025098	1025823	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118800-00;Name=OsNip_06t0118800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0118800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1025098	1025823	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0118800-00;Parent=transcript:OsNip_06t0118800-00;protein_id=OsNip_06t0118800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	1028678	1029546	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0118900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1028678	1029546	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0118900-00;Parent=gene:OsNip_06g0118900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0118900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1028678	1028763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1028678	1029546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118900-00;Name=OsNip_06t0118900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0118900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1028764	1029429	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0118900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0118900-00;protein_id=OsNip_06t0118900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1029430	1029546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	1039777	1040060	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0118950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1039777	1040060	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0118950-00;Parent=gene:OsNip_06g0118950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0118950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1039777	1040060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0118950-00;Name=OsNip_06t0118950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0118950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1486443	1486490	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0128200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0128200-02;protein_id=OsNip_06t0128200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	1525882	1525882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0128700-02;Tag=IsoSeq:G9982.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5993.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	1525985	1526081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0128700-02;Tag=IsoSeq:G9982.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G5993.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1526538	1527491	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0128800-01;Parent=gene:OsNip_06g0128800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1526538	1526943	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1526538	1527491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0128800-01;Name=OsNip_06t0128800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0128800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1526944	1527489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0128800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0128800-01;protein_id=OsNip_06t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1527490	1527491	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0128800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1531371	1531684	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1539031	1542210	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0129100-01;Parent=gene:OsNip_06g0129100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0129100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1539031	1539122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1539996	1540075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Name=OsNip_06t0129100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0129100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1539996	1540075	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0129100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;protein_id=OsNip_06t0129100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1540197	1540356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Name=OsNip_06t0129100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0129100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1541079	1541166	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Name=OsNip_06t0129100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0129100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1541255	1541301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Name=OsNip_06t0129100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0129100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1541255	1541301	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0129100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;protein_id=OsNip_06t0129100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1541622	1542210	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129100-01;Name=OsNip_06t0129100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0129100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1544045	1544258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1544045	1545618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-01;Name=OsNip_06t0129200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0129200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1545561	1545618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1545945	1546192	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-01;Name=OsNip_06t0129200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0129200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1545945	1546192	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1544078	1545392	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0129200-02;Parent=gene:OsNip_06g0129200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0129200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1544078	1544258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1544078	1545392	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129200-02;Name=OsNip_06t0129200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0129200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1544259	1545392	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0129200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0129200-02;protein_id=OsNip_06t0129200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	1547059	1550637	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0129300;Name=OsNip_ISI1;biotype=protein_coding;description=Armadillo-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1547059	1550637	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0129300-01;Parent=gene:OsNip_06g0129300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1547059	1547434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1547059	1547651	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;Name=OsNip_06t0129300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0129300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1547435	1547651	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0129300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;protein_id=OsNip_06t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1548127	1548200	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;Name=OsNip_06t0129300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0129300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1548127	1548200	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0129300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;protein_id=OsNip_06t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1548485	1548583	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0129300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;protein_id=OsNip_06t0129300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1549216	1549421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129300-01;Name=OsNip_06t0129300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0129300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1560486	1560896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0129400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1565577	1565874	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0129600-00;Parent=transcript:OsNip_06t0129600-00;protein_id=OsNip_06t0129600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1565978	1566203	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0129600-00;Parent=transcript:OsNip_06t0129600-00;protein_id=OsNip_06t0129600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1608277	1608348	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0130100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0130100-02;protein_id=OsNip_06t0130100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1611598	1612409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130100-03;Name=OsNip_06t0130100-03-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0130100-03-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1613670	1620183	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0130200-01;Parent=gene:OsNip_06g0130200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1613670	1613950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Name=OsNip_06t0130200-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0130200-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1613670	1613950	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1614127	1614212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Name=OsNip_06t0130200-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0130200-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1614127	1614212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1614310	1614318	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1614310	1614357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Name=OsNip_06t0130200-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0130200-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1614319	1614357	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0130200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;protein_id=OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1614446	1614520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Name=OsNip_06t0130200-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0130200-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1614446	1614520	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0130200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;protein_id=OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1614602	1614664	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;Name=OsNip_06t0130200-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0130200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1614602	1614664	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0130200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0130200-01;protein_id=OsNip_06t0130200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1639090	1639134	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1640620	1640852	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1642665	1643799	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0130800-01;Parent=gene:OsNip_06g0130800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1642665	1642921	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1642665	1643389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;Name=OsNip_06t0130800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0130800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1642922	1643389	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0130800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;protein_id=OsNip_06t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1643479	1643733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0130800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;protein_id=OsNip_06t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	1643479	1643799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;Name=OsNip_06t0130800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0130800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1643734	1643799	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	1642663	1643796	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0130800-02;Parent=gene:OsNip_06g0130800;transcript_id=OsNip_06t0130800-02;Tag=IsoSeq:G9995.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4550.7,Nipponbare.panicle_G7863.9
Chr06	TAMA	exon	1642663	1643796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0130800-02;Name=OsNip_06t0130800-02;exon_id=OsNip_06t0130800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G9995.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4550.7,Nipponbare.panicle_G7863.9;prot_id "UniRef90_A0A6G1CPF2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	1643763	1643795	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0130800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0130800-02;protein_id=OsNip_06t0130800-02;Tag=IsoSeq:G9995.9;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4550.7,Nipponbare.panicle_G7863.9;prot_id "UniRef90_A0A6G1CPF2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	1712173	1712234	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0131900-00;Name=OsNip_06t0131900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0131900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1811787	1812083	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0133800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0133800-01;protein_id=OsNip_06t0133800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	1808989	1810092	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0133800-02;Parent=gene:OsNip_06g0133800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0133800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	1809211	1810092	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0133800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0133800-02;protein_id=OsNip_06t0133800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1973536	1973995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0137100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	2036651	2037778	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0138400-00;Name=OsNip_06t0138400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0138400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2072356	2072508	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0139200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0139200-01;protein_id=OsNip_06t0139200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2072509	2072928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0139200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	2071099	2072976	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0139200-03;Parent=gene:OsNip_06g0139200;transcript_id=OsNip_06t0139200-03;Tag=IsoSeq:G10035.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4576.1
Chr06	TAMA	exon	2072827	2072976	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0139200-03;Name=OsNip_06t0139200-03;exon_id=OsNip_06t0139200-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10035.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4576.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PT93";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	2072827	2072975	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0139200-03;Parent=transcript:OsNip_06t0139200-03;protein_id=OsNip_06t0139200-03;Tag=IsoSeq:G10035.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4576.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PT93";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2243154	2243175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0142625-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	2289189	2289497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0143650-00;Name=OsNip_06t0143650-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0143650-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2298207	2298254	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0143700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0143700-01;protein_id=OsNip_06t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2298349	2298736	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0143700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0143700-01;protein_id=OsNip_06t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2298349	2298802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0143700-01;Name=OsNip_06t0143700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0143700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2298737	2298802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0143700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2413785	2416692	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0146100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0146100-01;protein_id=OsNip_06t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2417647	2417903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0146100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2421572	2421688	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0146200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0146200-02;protein_id=OsNip_06t0146200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2421689	2422483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0146200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	2427926	2433570	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0146250;Name=OsNip_WRKY73;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	2428013	2428129	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0146250-00;Name=OsNip_06t0146250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0146250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2428013	2428129	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0146250-00;Parent=transcript:OsNip_06t0146250-00;protein_id=OsNip_06t0146250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2554941	2555023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149166-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	2554746	2554991	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0149200-00;Parent=gene:OsNip_06g0149200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0149200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2554746	2554991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149200-00;Name=OsNip_06t0149200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0149200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2554746	2554991	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0149200-00;Parent=transcript:OsNip_06t0149200-00;protein_id=OsNip_06t0149200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	2555635	2557663	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0149300-01;Parent=gene:OsNip_06g0149300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0149300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2555635	2555911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2574249	2574332	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0149700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;protein_id=OsNip_06t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	2575137	2575262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Name=OsNip_06t0149700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0149700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2575530	2575688	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0149700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;protein_id=OsNip_06t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2575865	2576058	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Name=OsNip_06t0149700-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0149700-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2575865	2576058	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0149700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;protein_id=OsNip_06t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	2576259	2576429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Name=OsNip_06t0149700-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0149700-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2576385	2576429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2576546	2576676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Name=OsNip_06t0149700-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0149700-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2576546	2576676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	2576584	2576715	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0149700-01;Parent=gene:OsNip_06g0149700;transcript_id=OsNip_06t0149700-01;Tag=IsoSeq:G10082.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6050.1
Chr06	TAMA	exon	2576584	2576715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149700-01;Name=OsNip_06t0149700-01;exon_id=OsNip_06t0149700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10082.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6050.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	2576586	2576633	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0149700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0149700-01;protein_id=OsNip_06t0149700-01;Tag=IsoSeq:G10082.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6050.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2581516	2581720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	2582610	2583296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t015009A-01;Name=OsNip_06t015009A-01-E1;exon_id=OsNip_06t015009A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10084.1;Source=Nipponbare.panicle_G7926.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6DGR6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	TAMA	exon	2583422	2583766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t015009A-01;Name=OsNip_06t015009A-01-E2;exon_id=OsNip_06t015009A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10084.1;Source=Nipponbare.panicle_G7926.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6DGR6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	2582610	2582611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t015009A-01;Tag=IsoSeq:G10084.1;Source=Nipponbare.panicle_G7926.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6DGR6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	2583056	2583296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t015009A-01;Tag=IsoSeq:G10084.1;Source=Nipponbare.panicle_G7926.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6DGR6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	2583422	2583766	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t015009A-01;Tag=IsoSeq:G10084.1;Source=Nipponbare.panicle_G7926.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6DGR6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	2584171	2586156	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0150100-01;Parent=gene:OsNip_06g0150100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2584171	2584303	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2584304	2584660	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;protein_id=OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2585277	2585438	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;protein_id=OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2585768	2586106	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;protein_id=OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2585768	2586156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;Name=OsNip_06t0150100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0150100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2586107	2586156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	2587930	2588896	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0150300-01;Parent=gene:OsNip_06g0150300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2587930	2588119	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2587930	2588896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150300-01;Name=OsNip_06t0150300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0150300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2588120	2588782	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0150300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0150300-01;protein_id=OsNip_06t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2588783	2588896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0150300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	2749762	2751168	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t015359A-01;Tag=IsoSeq:G10100.1;Source=Nipponbare.root_G6062.1;prot_id "UniRef90_A0A2P6Q6W6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2768822	2768869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0153600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2768822	2768899	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0153600-02;Name=OsNip_06t0153600-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0153600-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2768870	2768899	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0153600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0153600-02;protein_id=OsNip_06t0153600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	2769158	2769247	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0153600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0153600-02;protein_id=OsNip_06t0153600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	2769325	2769381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0153600-02;Name=OsNip_06t0153600-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0153600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3056277	3056874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0160100-01;Tag=IsoSeq:G10124.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7957.2;prot_id "UniRef90_A0A287PMP9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3058733	3059016	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0160200-01;Name=OsNip_06t0160200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0160200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3060007	3063606	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0160400-01;Parent=gene:OsNip_06g0160400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0160400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3060007	3060237	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0160400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3060007	3060368	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0160400-01;Name=OsNip_06t0160400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0160400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3060701	3060803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0160400-01;Name=OsNip_06t0160400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0160400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3195927	3196424	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;protein_id=OsNip_06t0163300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3197290	3197475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;Name=OsNip_06t0163300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3197290	3197475	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;protein_id=OsNip_06t0163300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3198280	3198564	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;protein_id=OsNip_06t0163300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3198280	3198736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;Name=OsNip_06t0163300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3198565	3198736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3196766	3197360	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0163350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3196766	3197360	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0163350-00;Parent=gene:OsNip_06g0163350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0163350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3196766	3197360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163350-00;Name=OsNip_06t0163350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0163350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3199376	3203918	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0163400;Name=PDIL1;biotype=protein_coding;description=Thioredoxin;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3199376	3203918	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0163400-01;Parent=gene:OsNip_06g0163400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3199376	3199482	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3199376	3199970	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3199483	3199970	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3200070	3200199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3200070	3200199	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3200340	3200505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3200340	3200505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3200773	3200891	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3200773	3200891	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3201064	3201144	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3201064	3201144	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3201244	3201330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3201244	3201330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3201652	3201723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3201652	3201723	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3201799	3201867	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3201799	3201867	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3202357	3202434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3202357	3202434	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3202548	3202688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3202548	3202688	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3203341	3203394	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3203341	3203394	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3203473	3203589	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0163400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;protein_id=OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3203473	3203918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Name=OsNip_06t0163400-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163400-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3203590	3203918	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3204057	3204326	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0163450;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3204057	3204326	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0163450-00;Parent=gene:OsNip_06g0163450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0163450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3204057	3204326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163450-00;Name=OsNip_06t0163450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0163450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3204057	3204326	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0163450-00;Parent=transcript:OsNip_06t0163450-00;protein_id=OsNip_06t0163450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	gene	3204654	3207329	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g016349A;Tag=IsoSeq:G10134
Chr06	TAMA	mRNA	3204654	3207329	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t016349A-01;Parent=gene:OsNip_06g016349A;transcript_id=OsNip_06t016349A-01;Tag=IsoSeq:G10134.1;Source=Nipponbare.leaf_G4617.1
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3235204	3237307	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163701-02;Tag=IsoSeq:G10135.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6083.1;prot_id "UniRef90_UPI000BE5F510";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3234516	3234863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163701-02;Tag=IsoSeq:G10135.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6083.1;prot_id "UniRef90_UPI000BE5F510";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3241818	3246312	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0163900-01;Parent=gene:OsNip_06g0163900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0163900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3241818	3242045	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Name=OsNip_06t0163900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0163900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3242179	3244184	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Name=OsNip_06t0163900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0163900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3242179	3244184	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3245434	3245702	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3245434	3246312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Name=OsNip_06t0163900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0163900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3245703	3246263	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0163900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;protein_id=OsNip_06t0163900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3246264	3246312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0163900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3250548	3261364	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0164000-01;Parent=gene:OsNip_06g0164000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0164000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3250548	3250841	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0164000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3302231	3302252	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0165300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0165300-00;protein_id=OsNip_06t0165300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3302367	3303145	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0165300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0165300-00;protein_id=OsNip_06t0165300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	gene	3304617	3305223	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g016549A;Tag=IsoSeq:G10139
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Chr06	TAMA	exon	3304617	3304763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t016549A-01;Name=OsNip_06t016549A-01-E1;exon_id=OsNip_06t016549A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10139.1;Source=Nipponbare.panicle_G7968.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	TAMA	exon	3304863	3305223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t016549A-01;Name=OsNip_06t016549A-01-E2;exon_id=OsNip_06t016549A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10139.1;Source=Nipponbare.panicle_G7968.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	3304863	3304898	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t016549A-01;Parent=transcript:OsNip_06t016549A-01;protein_id=OsNip_06t016549A-01;Tag=IsoSeq:G10139.1;Source=Nipponbare.panicle_G7968.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3304902	3305223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t016549A-01;Tag=IsoSeq:G10139.1;Source=Nipponbare.panicle_G7968.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3305304	3307872	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0165500;Name=OsNip_RLCK198;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3305304	3307872	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0165500-00;Parent=gene:OsNip_06g0165500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0165500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3305304	3305424	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3305304	3307872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165500-00;Name=OsNip_06t0165500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0165500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3305425	3307872	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0165500-00;Parent=transcript:OsNip_06t0165500-00;protein_id=OsNip_06t0165500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3310919	3311822	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0165600;Name=OsNip_DREB1D;biotype=protein_coding;description=CRT/DRE;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3310919	3311822	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0165600-01;Parent=gene:OsNip_06g0165600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3310919	3310942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3310919	3311822	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165600-01;Name=OsNip_06t0165600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0165600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3310943	3311704	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0165600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0165600-01;protein_id=OsNip_06t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3311705	3311822	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3314114	3315452	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0165800;Name=ROMT-16;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	3314114	3315452	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0165800-01;Parent=gene:OsNip_06g0165800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0165800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	3314828	3315446	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165800-02;Name=OsNip_06t0165800-02;exon_id=OsNip_06t0165800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10140.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7969.2,Nipponbare.panicle_G7969.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	3314114	3314114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0165800-02;Tag=IsoSeq:G10140.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G7969.2,Nipponbare.panicle_G7969.4;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3319112	3319619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;Name=OsNip_06t0166000-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3319419	3319619	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0166000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;protein_id=OsNip_06t0166000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3320909	3321007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;Name=OsNip_06t0166000-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3320909	3321007	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0166000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;protein_id=OsNip_06t0166000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3321555	3321690	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;Name=OsNip_06t0166000-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3321555	3321690	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0166000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;protein_id=OsNip_06t0166000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3321844	3321990	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0166000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;protein_id=OsNip_06t0166000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3322076	3322209	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0166000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;protein_id=OsNip_06t0166000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3322076	3322249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-01;Name=OsNip_06t0166000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3319140	3320767	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3319140	3321007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;Name=OsNip_06t0166000-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0166000-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3321555	3321681	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0166000-02;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;protein_id=OsNip_06t0166000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3321844	3321990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;Name=OsNip_06t0166000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3321844	3321990	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0166000-02;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;protein_id=OsNip_06t0166000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3322076	3322209	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0166000-02;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;protein_id=OsNip_06t0166000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	3322076	3322249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;Name=OsNip_06t0166000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0166000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3322210	3322249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	3319143	3322249	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0166000-03;Parent=gene:OsNip_06g0166000;transcript_id=OsNip_06t0166000-03;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1
Chr06	TAMA	exon	3322076	3322249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;Name=OsNip_06t0166000-03;exon_id=OsNip_06t0166000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	3322076	3322247	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0166000-03;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;protein_id=OsNip_06t0166000-03;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	3321555	3321990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;Name=OsNip_06t0166000-03;exon_id=OsNip_06t0166000-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	3321983	3321990	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0166000-03;Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;protein_id=OsNip_06t0166000-03;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	3320909	3321007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;Name=OsNip_06t0166000-03;exon_id=OsNip_06t0166000-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	3319143	3319619	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;Name=OsNip_06t0166000-03;exon_id=OsNip_06t0166000-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	3322248	3322249	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0166000-03;Tag=IsoSeq:G10141.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6088.3,Nipponbare.panicle_G7970.1;prot_id "UniRef90_M0T3P1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3682377	3682653	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0173000-00;Parent=transcript:OsNip_06t0173000-00;protein_id=OsNip_06t0173000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3683833	3683894	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0173000-00;Parent=transcript:OsNip_06t0173000-00;protein_id=OsNip_06t0173000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3692764	3692859	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0173450-00;Parent=transcript:OsNip_06t0173450-00;protein_id=OsNip_06t0173450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3693190	3693281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0173450-00;Name=OsNip_06t0173450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0173450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3693250	3693281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0173450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	3696151	3696531	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t017379A-01;Tag=IsoSeq:G10161.1;Source=Nipponbare.panicle_G7987.1;prot_id "UniRef90_K3ZZY7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3774776	3774939	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0174400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0174400-01;protein_id=OsNip_06t0174400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3775303	3775493	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0174400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0174400-01;protein_id=OsNip_06t0174400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3873658	3874008	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0177225-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	3877366	3877465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0177250-00;Name=OsNip_06t0177250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0177250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	3877366	3877465	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0177250-00;Parent=transcript:OsNip_06t0177250-00;protein_id=OsNip_06t0177250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	3878788	3882766	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0177300;biotype=protein_coding;description=Glycosyl;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	mRNA	3995026	3996462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t018066A-02;Parent=gene:OsNip_06g018066A;transcript_id=OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1
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Chr06	TAMA	CDS	3995977	3996460	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t018066A-02;Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;protein_id=OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	CDS	3995882	3995886	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t018066A-02;Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;protein_id=OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	3995026	3995663	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;Name=OsNip_06t018066A-02-E3;exon_id=OsNip_06t018066A-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	3996461	3996462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3995771	3995879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	3995026	3995663	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-02;Tag=IsoSeq:G10182.2;Source=Nipponbare.root_G6114.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9US81";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	mRNA	3995130	3996448	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t018066A-03;Parent=gene:OsNip_06g018066A;transcript_id=OsNip_06t018066A-03;Tag=IsoSeq:G10182.3;Source=Nipponbare.panicle_G8004.2
Chr06	TAMA	exon	3995977	3996448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-03;Name=OsNip_06t018066A-03-E1;exon_id=OsNip_06t018066A-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10182.3;Source=Nipponbare.panicle_G8004.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0A5V2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	3996316	3996447	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t018066A-03;Parent=transcript:OsNip_06t018066A-03;protein_id=OsNip_06t018066A-03;Tag=IsoSeq:G10182.3;Source=Nipponbare.panicle_G8004.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0A5V2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	3995771	3995886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-03;Name=OsNip_06t018066A-03-E2;exon_id=OsNip_06t018066A-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10182.3;Source=Nipponbare.panicle_G8004.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0A5V2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	3995626	3995663	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t018066A-03;Name=OsNip_06t018066A-03-E3;exon_id=OsNip_06t018066A-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10182.3;Source=Nipponbare.panicle_G8004.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0A5V2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4091389	4091478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0182450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4091389	4091960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0182450-00;Name=OsNip_06t0182450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0182450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4091479	4091742	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0182450-00;Parent=transcript:OsNip_06t0182450-00;protein_id=OsNip_06t0182450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4091743	4091960	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0182450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4099315	4099373	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0182500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0182500-02;protein_id=OsNip_06t0182500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4100309	4100863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0182500-02;Name=OsNip_06t0182500-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0182500-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4100629	4100863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0182500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4165519	4165602	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0183700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0183700-01;protein_id=OsNip_06t0183700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4166691	4166971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0183700-01;Name=OsNip_06t0183700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0183700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4166943	4166971	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0183700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4258205	4258450	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0184733-01;Parent=transcript:OsNip_06t0184733-01;protein_id=OsNip_06t0184733-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4323420	4323587	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0185900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0185900-01;protein_id=OsNip_06t0185900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4324823	4325071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0185900-01;Name=OsNip_06t0185900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0185900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4324853	4325071	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0185900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	4322764	4323592	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0185933-00;Parent=gene:OsNip_06g0185933;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0185933-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4372200	4372519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-02;Name=OsNip_06t0186600-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0186600-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4373335	4373441	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0186600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0186600-02;protein_id=OsNip_06t0186600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4373522	4373695	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0186600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0186600-02;protein_id=OsNip_06t0186600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4373522	4373696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-02;Name=OsNip_06t0186600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0186600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4373696	4373696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4371000	4371887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Name=OsNip_06t0186600-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0186600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4371000	4371887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4372200	4372519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Name=OsNip_06t0186600-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0186600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4372200	4372519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4373335	4373441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Name=OsNip_06t0186600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0186600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4373335	4373441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4373522	4373695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Name=OsNip_06t0186600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0186600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4373522	4373695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4374139	4375953	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4375954	4376214	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0186600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;protein_id=OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4376215	4376383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	4371000	4376453	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0186600-03;Parent=gene:OsNip_06g0186600;transcript_id=OsNip_06t0186600-03;Tag=IsoSeq:G10199.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8020.1
Chr06	TAMA	exon	4376014	4376453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0186600-03;Name=OsNip_06t0186600-03;exon_id=OsNip_06t0186600-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10199.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8020.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4A7U7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	CDS	4376014	4376452	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0186600-03;Parent=transcript:OsNip_06t0186600-03;protein_id=OsNip_06t0186600-03;Tag=IsoSeq:G10199.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8020.1;prot_id "UniRef90_A0A6P4A7U7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4470635	4470901	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0188550-01;Name=OsNip_06t0188550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0188550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4572544	4572847	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190525-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4572930	4573127	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190525-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4577367	4577413	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4577367	4577790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;Name=OsNip_06t0190550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0190550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4577414	4577629	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0190550-00;Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;protein_id=OsNip_06t0190550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4577630	4577790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	4583174	4583642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;Name=OsNip_06t0190550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0190550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4583174	4583642	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0190550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	4587987	4591068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0190700-00;Parent=gene:OsNip_06g0190700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0190700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	4844553	4854690	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0195600-01;Parent=gene:OsNip_06g0195600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0195600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	4931758	4931948	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0196700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0196700-02;protein_id=OsNip_06t0196700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	4932033	4932612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0196700-02;Name=OsNip_06t0196700-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0196700-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4932178	4932612	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0196700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4926019	4926491	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0196700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	mRNA	5002345	5004808	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0198500-01;Parent=gene:OsNip_06g0198500;transcript_id=OsNip_06t0198500-01;Tag=IsoSeq:G10231.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6146.2
Chr06	TAMA	exon	5002345	5004808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198500-01;Name=OsNip_06t0198500-01;exon_id=OsNip_06t0198500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10231.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6146.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XIJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	5002345	5004602	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198500-01;Tag=IsoSeq:G10231.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6146.2;prot_id "UniRef90_A0A2H3XIJ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5005547	5005714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5005547	5008055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-01;Name=OsNip_06t0198600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0198600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5005715	5006071	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0198600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0198600-01;protein_id=OsNip_06t0198600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5006072	5008055	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	5005556	5008057	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0198600-02;Parent=gene:OsNip_06g0198600;transcript_id=OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3
Chr06	TAMA	exon	5007883	5008057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;Name=OsNip_06t0198600-02;exon_id=OsNip_06t0198600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	5007883	5008056	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0198600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;protein_id=OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	CDS	5006223	5006225	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0198600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;protein_id=OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	5008057	5008057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	5006104	5006220	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	5005556	5006038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198600-02;Tag=IsoSeq:G10232.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6147.3;prot_id "UniRef90_A0A1D1Y178";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5008201	5008284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0198700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5008285	5008365	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0198700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0198700-01;protein_id=OsNip_06t0198700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	5211868	5212328	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0203200-02;Name=OsNip_06t0203200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0203200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	5208882	5209361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0203200-01;Name=OsNip_06t0203200-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0203200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5209451	5209800	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0203200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0203200-01;protein_id=OsNip_06t0203200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	5211868	5212330	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0203200-01;Name=OsNip_06t0203200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0203200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5212327	5212330	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0203200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5213485	5217872	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0203400-00;Parent=gene:OsNip_06g0203400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0203400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5213485	5213488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0203400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	5660169	5661263	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0210900-01;Name=OsNip_06t0210900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0210900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5707729	5707866	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0211700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0211700-00;protein_id=OsNip_06t0211700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5712154	5714608	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0212100-01;Parent=gene:OsNip_06g0212100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0212100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5712154	5712312	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0212100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5835610	5835683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5835610	5836879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214800-02;Name=OsNip_06t0214800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0214800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5835684	5836673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0214800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0214800-02;protein_id=OsNip_06t0214800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5836674	5836879	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	5837375	5838622	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0214850;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5837535	5838622	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0214850-00;Parent=gene:OsNip_06g0214850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0214850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5837535	5837563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5837535	5838622	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-00;Name=OsNip_06t0214850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0214850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5837564	5838622	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214850-00;Parent=transcript:OsNip_06t0214850-00;protein_id=OsNip_06t0214850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	5837375	5838577	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0214850-01;Parent=gene:OsNip_06g0214850;transcript_id=OsNip_06t0214850-01;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2
Chr06	TAMA	exon	5838019	5838577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;Name=OsNip_06t0214850-01;exon_id=OsNip_06t0214850-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	5838019	5838576	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0214850-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;protein_id=OsNip_06t0214850-01;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	exon	5837375	5837790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;Name=OsNip_06t0214850-01;exon_id=OsNip_06t0214850-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	5837521	5837790	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0214850-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;protein_id=OsNip_06t0214850-01;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	5838577	5838577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	5837375	5837518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214850-01;Tag=IsoSeq:G10274.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6177.1,Nipponbare.panicle_G8084.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	5840158	5844481	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0214900;biotype=protein_coding;description=FAD-dependent;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5840158	5844481	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0214900-01;Parent=gene:OsNip_06g0214900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5840158	5840298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5840158	5840438	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5840299	5840438	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5840520	5840623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5840520	5840623	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5840767	5840843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5840767	5840843	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5840923	5841315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5840923	5841315	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5841450	5841665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5841450	5841665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5842009	5842102	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5842009	5842102	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5842640	5842820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5842640	5842820	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5842928	5842994	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5842928	5842994	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5843182	5843277	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5843738	5843928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5843738	5843928	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	5844336	5844423	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0214900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;protein_id=OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	5844336	5844481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Name=OsNip_06t0214900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0214900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5844424	5844481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0214900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	5847981	5849574	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0215000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5847981	5849574	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0215000-01;Parent=gene:OsNip_06g0215000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0215000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	5894938	5895107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0215900-03;Tag=IsoSeq:G10280.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6182.1;prot_id "UniRef90_B4F872";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	5905511	5905836	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0215950-00;Name=OsNip_06t0215950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0215950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5905286	5906018	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0216000-01;Parent=gene:OsNip_06g0216000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5905286	5905503	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0216000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	5908095	5909128	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0216100-00;Parent=gene:OsNip_06g0216100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0216100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6041725	6041797	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0218150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6041869	6041931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0218150-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	6253190	6253707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0221200-01;Name=OsNip_06t0221200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0221200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6253707	6253956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0221300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6253707	6254494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0221300-01;Name=OsNip_06t0221300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0221300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6253957	6254472	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0221300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0221300-01;protein_id=OsNip_06t0221300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6254473	6254494	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0221300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	6255722	6256138	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t022209A-01;Tag=IsoSeq:G10303.1;Source=Nipponbare.panicle_G8100.1;prot_id "UniRef90_A0A287LH11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	6256234	6256868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t022209A-01;Tag=IsoSeq:G10303.1;Source=Nipponbare.panicle_G8100.1;prot_id "UniRef90_A0A287LH11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6279737	6281730	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0222100-00;Parent=gene:OsNip_06g0222100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0222100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6279737	6279853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0222100-00;Name=OsNip_06t0222100-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0222100-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	6279967	6280040	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0222100-00;Name=OsNip_06t0222100-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0222100-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6280159	6280228	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0222100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0222100-00;protein_id=OsNip_06t0222100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6472173	6473641	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0224900-02;Parent=gene:OsNip_06g0224900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0224900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6472363	6472462	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0224900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6473600	6473672	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0224900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6701407	6701973	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0229000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0229000-01;protein_id=OsNip_06t0229000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	6702956	6704431	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0229066;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6702956	6704431	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0229066-00;Parent=gene:OsNip_06g0229066;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0229066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6702956	6704431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229066-00;Name=OsNip_06t0229066-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0229066-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	6736941	6737686	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-00;Name=OsNip_06t0229400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0229400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6736941	6737686	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0229400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0229400-00;protein_id=OsNip_06t0229400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	6735979	6737823	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0229400-01;Parent=gene:OsNip_06g0229400;transcript_id=OsNip_06t0229400-01;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1
Chr06	TAMA	exon	6735979	6736471	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-01;Name=OsNip_06t0229400-01;exon_id=OsNip_06t0229400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1;prot_id "UniRef90_A0A072UW91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	exon	6736977	6737823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-01;Name=OsNip_06t0229400-01;exon_id=OsNip_06t0229400-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1;prot_id "UniRef90_A0A072UW91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	6735979	6735980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-01;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1;prot_id "UniRef90_A0A072UW91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	6736005	6736471	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-01;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1;prot_id "UniRef90_A0A072UW91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	6736977	6737823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229400-01;Tag=IsoSeq:G10325.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6210.1;prot_id "UniRef90_A0A072UW91";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	6748398	6753335	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0229800;Name=ALK;biotype=protein_coding;description=Soluble;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6748398	6753302	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0229800-01;Parent=gene:OsNip_06g0229800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0229800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6748398	6748560	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6748398	6748890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229800-01;Name=OsNip_06t0229800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0229800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6748561	6748890	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0229800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0229800-01;protein_id=OsNip_06t0229800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6749020	6749688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0229800-01;Name=OsNip_06t0229800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0229800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6895777	6895869	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6898009	6898157	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0232700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0232700-01;protein_id=OsNip_06t0232700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6898242	6898611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0232700-01;Name=OsNip_06t0232700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0232700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	6916550	6916621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233000-02;Tag=IsoSeq:G10335.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G4696.1,Nipponbare.root_G6214.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WUS8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	6916092	6916229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233101-00;Name=OsNip_06t0233101-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0233101-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6916092	6916229	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0233101-00;Parent=transcript:OsNip_06t0233101-00;protein_id=OsNip_06t0233101-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	6923330	6924997	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0233200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6923330	6924997	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0233200-01;Parent=gene:OsNip_06g0233200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0233200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6923330	6923418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6923330	6924997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233200-01;Name=OsNip_06t0233200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0233200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6923419	6924729	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0233200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0233200-01;protein_id=OsNip_06t0233200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6924730	6924997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	6928598	6932490	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0233400;biotype=protein_coding;description=Defective;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	6928598	6932468	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0233400-02;Parent=gene:OsNip_06g0233400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0233400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6928598	6928854	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	6928855	6928965	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0233400-02;Parent=transcript:OsNip_06t0233400-02;protein_id=OsNip_06t0233400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	6929234	6929293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0233400-02;Name=OsNip_06t0233400-02-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0233400-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	6981673	6981756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0234150-00;Name=OsNip_06t0234150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0234150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7055964	7056204	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7057524	7060029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7060112	7060233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7060112	7060563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235500-01;Name=OsNip_06t0235500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7060234	7060482	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0235500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0235500-01;protein_id=OsNip_06t0235500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7060483	7060563	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	7058578	7058578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t023579A-01;Tag=IsoSeq:G10343.1;Source=Nipponbare.leaf_G4698.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	7058738	7058820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t023579A-01;Tag=IsoSeq:G10343.1;Source=Nipponbare.leaf_G4698.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	7067117	7069533	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0235800-00;Parent=gene:OsNip_06g0235800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0235800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7067117	7069522	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0235800-00;Parent=transcript:OsNip_06t0235800-00;protein_id=OsNip_06t0235800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7067117	7069533	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235800-00;Name=OsNip_06t0235800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7078036	7078176	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0235850-01;Parent=transcript:OsNip_06t0235850-01;protein_id=OsNip_06t0235850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7078177	7078336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7078429	7079552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235850-01;Name=OsNip_06t0235850-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235850-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7078429	7079552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	7080825	7082583	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0235900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	7080825	7082583	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0235900-00;Parent=gene:OsNip_06g0235900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7080825	7080946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7080825	7080946	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7081043	7081110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7081043	7081110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7081654	7081666	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7081654	7081698	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7081667	7081698	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0235900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;protein_id=OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7081965	7082043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7081965	7082043	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0235900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;protein_id=OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7082129	7082298	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7082129	7082298	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0235900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;protein_id=OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7082399	7082501	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0235900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;protein_id=OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7082399	7082583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Name=OsNip_06t0235900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0235900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7082502	7082583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0235900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	7086628	7088509	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0236266;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	7086668	7088509	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0236266-01;Parent=gene:OsNip_06g0236266;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0236266-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7086668	7086677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0236266-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7086668	7088509	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0236266-01;Name=OsNip_06t0236266-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0236266-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7086678	7087082	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0236266-01;Parent=transcript:OsNip_06t0236266-01;protein_id=OsNip_06t0236266-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7087083	7088509	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0236266-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	7086628	7088498	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0236266-02;Parent=gene:OsNip_06g0236266;transcript_id=OsNip_06t0236266-02;Tag=IsoSeq:G10344.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6219.1
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	7119798	7120401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0236900-02;Tag=IsoSeq:G10346.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8133.1;prot_id "UniRef90_M5XFK9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7260409	7260410	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0239700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7263397	7263483	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0239700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0239700-01;protein_id=OsNip_06t0239700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	7263604	7263955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0239700-01;Name=OsNip_06t0239700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0239700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7722728	7722990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0248600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7722728	7723354	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0248600-01;Name=OsNip_06t0248600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0248600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7722991	7723272	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0248600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0248600-01;protein_id=OsNip_06t0248600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7723273	7723354	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0248600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	7729987	7730569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t024934A-01;Name=OsNip_06t024934A-01-E1;exon_id=OsNip_06t024934A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10371.1;Source=Nipponbare.root_G6233.1;prot_id "UniRef90_A0A1W0VSC7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	7730568	7730569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t024934A-01;Tag=IsoSeq:G10371.1;Source=Nipponbare.root_G6233.1;prot_id "UniRef90_A0A1W0VSC7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	7729987	7730460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t024934A-01;Tag=IsoSeq:G10371.1;Source=Nipponbare.root_G6233.1;prot_id "UniRef90_A0A1W0VSC7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	7763207	7763803	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0249350;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	7763207	7763803	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0249350-00;Parent=gene:OsNip_06g0249350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0249350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7763207	7763527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0249350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	7763207	7763803	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0249350-00;Name=OsNip_06t0249350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0249350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7853485	7853568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0251900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	7853753	7854050	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0251900-00;Parent=transcript:OsNip_06t0251900-00;protein_id=OsNip_06t0251900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7920702	7920938	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0252300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8129122	8129334	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0256000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8410031	8410450	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0260500-00;Parent=transcript:OsNip_06t0260500-00;protein_id=OsNip_06t0260500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	8408828	8410333	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0260500-01;Tag=IsoSeq:G10398.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8173.3;prot_id "UniRef90_A0A3B5Y5Z8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	8408350	8408744	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0260500-01;Tag=IsoSeq:G10398.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8173.3;prot_id "UniRef90_A0A3B5Y5Z8";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8726504	8726623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0264366-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8825622	8826017	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0266000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0266000-01;protein_id=OsNip_06t0266000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8826018	8826627	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	8826710	8827101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266000-01;Name=OsNip_06t0266000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0266000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8826710	8827101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	8831700	8832327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t026613A-01;Name=OsNip_06t026613A-01-E1;exon_id=OsNip_06t026613A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10406.1;Source=Nipponbare.panicle_G8180.1;prot_id "UniRef90_Q947Y5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	exon	8827021	8827478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t026613A-01;Name=OsNip_06t026613A-01-E2;exon_id=OsNip_06t026613A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10406.1;Source=Nipponbare.panicle_G8180.1;prot_id "UniRef90_Q947Y5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	8832327	8832327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t026613A-01;Tag=IsoSeq:G10406.1;Source=Nipponbare.panicle_G8180.1;prot_id "UniRef90_Q947Y5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	8827021	8827478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t026613A-01;Tag=IsoSeq:G10406.1;Source=Nipponbare.panicle_G8180.1;prot_id "UniRef90_Q947Y5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	8835090	8835400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266133-00;Name=OsNip_06t0266133-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0266133-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	8834922	8835325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266266-00;Name=OsNip_06t0266266-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0266266-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8835410	8835481	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0266266-00;Parent=transcript:OsNip_06t0266266-00;protein_id=OsNip_06t0266266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	8835575	8835800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266266-00;Name=OsNip_06t0266266-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0266266-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8835575	8835800	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0266266-00;Parent=transcript:OsNip_06t0266266-00;protein_id=OsNip_06t0266266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	8836439	8837989	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0266400;Name=OsNip_UCL17;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	8837240	8837989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266400-01;Tag=IsoSeq:G10407.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6253.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	8836439	8836940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266400-01;Tag=IsoSeq:G10407.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6253.4;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	8848154	8848833	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0266800-02;Parent=gene:OsNip_06g0266800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0266800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	8848154	8848633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266800-02;Name=OsNip_06t0266800-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0266800-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8848373	8848633	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0266800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0266800-02;protein_id=OsNip_06t0266800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	8848738	8848833	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266800-02;Name=OsNip_06t0266800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0266800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8848297	8848372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	8848297	8848729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266800-01;Name=OsNip_06t0266800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0266800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8848373	8848627	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0266800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0266800-01;protein_id=OsNip_06t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8848628	8848729	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0266800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	8868033	8869886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0267200-01;Parent=gene:OsNip_06g0267200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	8868033	8869026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0267200-01;Name=OsNip_06t0267200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0267200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8868033	8869026	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8869371	8869406	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	8869371	8869446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0267200-01;Name=OsNip_06t0267200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0267200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	8869407	8869446	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0267200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0267200-01;protein_id=OsNip_06t0267200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	9832187	9832495	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0281300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0281300-01;protein_id=OsNip_06t0281300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	9835173	9835225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0281350-00;Name=OsNip_06t0281350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0281350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	10279629	10280577	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0286146-00;Parent=gene:OsNip_06g0286146;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0286146-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	10279629	10280046	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0286146-00;Parent=transcript:OsNip_06t0286146-00;protein_id=OsNip_06t0286146-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	10280136	10280548	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0286146-00;Parent=transcript:OsNip_06t0286146-00;protein_id=OsNip_06t0286146-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	10280136	10280577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0286146-00;Name=OsNip_06t0286146-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0286146-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	10374580	10374913	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0286375-01;Tag=IsoSeq:G10443.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4734.3,Nipponbare.leaf_G4734.1;prot_id "UniRef90_M0RYF8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10445137	10445243	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0287700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10554842	10555041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	10559837	10563820	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0289300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	10562431	10562446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289300-00;Name=OsNip_06t0289300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0289300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	10562431	10562446	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0289300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0289300-00;protein_id=OsNip_06t0289300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	10563356	10563819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289300-00;Name=OsNip_06t0289300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0289300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	10563356	10563819	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0289300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0289300-00;protein_id=OsNip_06t0289300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	10559837	10563820	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0289300-01;Parent=gene:OsNip_06g0289300;transcript_id=OsNip_06t0289300-01;Tag=IsoSeq:G10447.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4736.2
Chr06	TAMA	exon	10563356	10563820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289300-01;Name=OsNip_06t0289300-01;exon_id=OsNip_06t0289300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10447.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4736.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z0U3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	10563356	10563429	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289300-01;Tag=IsoSeq:G10447.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4736.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z0U3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	10559837	10559991	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289300-01;Tag=IsoSeq:G10447.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4736.2;prot_id "UniRef90_A0A0D9Z0U3";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	10588158	10589935	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0289900;Name=UGT;biotype=protein_coding;description=UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	10588158	10589935	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0289900-01;Parent=gene:OsNip_06g0289900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0289900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10588158	10588431	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	10588158	10589935	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0289900-01;Name=OsNip_06t0289900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0289900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	10588432	10589877	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0289900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0289900-01;protein_id=OsNip_06t0289900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11058542	11058832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0298000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11227570	11227695	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0300800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0300800-02;protein_id=OsNip_06t0300800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11227903	11228211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0300800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0300800-02;protein_id=OsNip_06t0300800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	11227903	11228544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0300800-02;Name=OsNip_06t0300800-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0300800-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11228212	11228544	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0300800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	11237438	11242796	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0301000-01;Parent=gene:OsNip_06g0301000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0301000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11237438	11237820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0301000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	11237438	11237910	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0301000-01;Name=OsNip_06t0301000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0301000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11237821	11237910	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0301000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0301000-01;protein_id=OsNip_06t0301000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	11464208	11464787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;Name=OsNip_06t0303800-02;exon_id=OsNip_06t0303800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	11464269	11464427	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0303800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;protein_id=OsNip_06t0303800-02;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	11461593	11461736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	11461884	11461946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	11464208	11464268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	11464431	11464787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0303800-02;Tag=IsoSeq:G10465.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6289.3,Nipponbare.panicle_G8219.1,Nipponbare.leaf_G4742.2;prot_id "UniRef90_A0A077S8K2";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	11476337	11482796	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0304300-01;Parent=gene:OsNip_06g0304300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0304300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11476337	11477446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0304300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	11476337	11477629	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0304300-01;Name=OsNip_06t0304300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0304300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11555727	11556881	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0306201-00;Parent=transcript:OsNip_06t0306201-00;protein_id=OsNip_06t0306201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11559602	11560765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0306300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0306300-01;protein_id=OsNip_06t0306300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11560766	11560896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0306300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	11559570	11560929	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0306300-02;Parent=gene:OsNip_06g0306300;transcript_id=OsNip_06t0306300-02;Tag=IsoSeq:G10468.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6292.3,Nipponbare.panicle_G8221.2
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Chr06	TAMA	exon	11559992	11560929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0306300-02;Name=OsNip_06t0306300-02;exon_id=OsNip_06t0306300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10468.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6292.3,Nipponbare.panicle_G8221.2;prot_id "UniRef90_I1GQL7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	11559570	11559894	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0306300-02;Tag=IsoSeq:G10468.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6292.3,Nipponbare.panicle_G8221.2;prot_id "UniRef90_I1GQL7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	11559992	11560553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0306300-02;Tag=IsoSeq:G10468.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6292.3,Nipponbare.panicle_G8221.2;prot_id "UniRef90_I1GQL7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	11560686	11560929	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0306300-02;Tag=IsoSeq:G10468.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6292.3,Nipponbare.panicle_G8221.2;prot_id "UniRef90_I1GQL7";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	11605456	11605683	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t030749A-02;Tag=IsoSeq:G10470.2;Source=Nipponbare.panicle_G8223.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	11740471	11740920	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0309200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0309200-01;protein_id=OsNip_06t0309200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11882479	11882977	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0311700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	11887860	11890159	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0311800-00;Parent=gene:OsNip_06g0311800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0311800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12273798	12273925	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0317100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0317100-00;protein_id=OsNip_06t0317100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	12274139	12274281	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317100-00;Name=OsNip_06t0317100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0317100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	12279981	12281390	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0317200-01;Parent=gene:OsNip_06g0317200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0317200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12279981	12280014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12279981	12280114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-01;Name=OsNip_06t0317200-03-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0317200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12281112	12281196	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0317200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0317200-01;protein_id=OsNip_06t0317200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12281112	12281390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-01;Name=OsNip_06t0317200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0317200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12281197	12281390	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12279981	12280014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	12280850	12281083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;Name=OsNip_06t0317200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0317200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12280850	12281083	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0317200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;protein_id=OsNip_06t0317200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12281120	12281196	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0317200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;protein_id=OsNip_06t0317200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12281120	12281401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;Name=OsNip_06t0317200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0317200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12281197	12281401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	12279981	12281401	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0317200-03;Parent=gene:OsNip_06g0317200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0317200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12279981	12280014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12279981	12280114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0317200-03;Name=OsNip_06t0317200-03-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0317200-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12325397	12325463	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0318300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0318300-01;protein_id=OsNip_06t0318300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	12453962	12454049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0320500-02;Tag=IsoSeq:G10495.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4758.8;prot_id "UniRef90_A0A2P2JR40";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12605152	12605582	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0323100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0323100-01;protein_id=OsNip_06t0323100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	12605892	12606640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0323100-01;Name=OsNip_06t0323100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0323100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12606531	12606640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0323100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	12604819	12604937	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0323100-02;Name=OsNip_06t0323100-02;exon_id=OsNip_06t0323100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10497.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8246.3;prot_id "UniRef90_I1PQN6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	12681316	12681614	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0324601-00;Name=OsNip_06t0324601-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0324601-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	12751760	12753434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0325950-00;Name=OsNip_06t0325950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0325950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	12758542	12763661	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0326000;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	12758542	12763661	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0326000-01;Parent=gene:OsNip_06g0326000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12758542	12758927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12758542	12759137	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Name=OsNip_06t0326000-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0326000-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12758928	12759137	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0326000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;protein_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12759438	12759599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Name=OsNip_06t0326000-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0326000-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12759438	12759599	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0326000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;protein_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12760512	12760643	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Name=OsNip_06t0326000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0326000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12760512	12760643	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0326000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;protein_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12761807	12761859	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Name=OsNip_06t0326000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0326000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12761807	12761859	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0326000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;protein_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12763011	12763590	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0326000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;protein_id=OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12763011	12763661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Name=OsNip_06t0326000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0326000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12763591	12763661	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	gene	12781780	12782979	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g032639A;Tag=IsoSeq:G10501
Chr06	TAMA	mRNA	12781780	12782979	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t032639A-01;Parent=gene:OsNip_06g032639A;transcript_id=OsNip_06t032639A-01;Tag=IsoSeq:G10501.1;Source=Nipponbare.root_G6312.1
Chr06	TAMA	exon	12781780	12782979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t032639A-01;Name=OsNip_06t032639A-01-E1;exon_id=OsNip_06t032639A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10501.1;Source=Nipponbare.root_G6312.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9WPV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	12781780	12782451	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t032639A-01;Parent=transcript:OsNip_06t032639A-01;protein_id=OsNip_06t032639A-01;Tag=IsoSeq:G10501.1;Source=Nipponbare.root_G6312.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9WPV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	12782455	12782979	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t032639A-01;Tag=IsoSeq:G10501.1;Source=Nipponbare.root_G6312.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9WPV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	12794372	12800188	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0326400;Name=OsNip_PFPA2;biotype=protein_coding;description=Phosphofructokinase;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	12794383	12800188	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0326400-01;Parent=gene:OsNip_06g0326400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12794383	12794474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12794383	12794579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326400-01;Name=OsNip_06t0326400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0326400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12794475	12794579	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0326400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326400-01;protein_id=OsNip_06t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	12795311	12795483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0326400-01;Name=OsNip_06t0326400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0326400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	12795311	12795483	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0326400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0326400-01;protein_id=OsNip_06t0326400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	12859932	12860007	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0327400-01;Tag=IsoSeq:G10507.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6317.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0WWH2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13165905	13166017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Name=OsNip_06t0332450-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0332450-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13166946	13167251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Name=OsNip_06t0332450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0332450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13166946	13167251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13168758	13168952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Name=OsNip_06t0332450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0332450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13168758	13168952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13169090	13169470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Name=OsNip_06t0332450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0332450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13169090	13169470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	13172164	13175101	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0332500-01;Parent=gene:OsNip_06g0332500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0332500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13172164	13172591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0332500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13387378	13387490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0335975-00;Name=OsNip_06t0335975-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0335975-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13387969	13388699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336001-01;Name=OsNip_06t0336001-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0336001-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13389882	13390271	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0335900-02;Parent=transcript:OsNip_06t0335900-02;protein_id=OsNip_06t0335900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	13399295	13399653	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0336150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	13399295	13399653	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0336150-01;Parent=gene:OsNip_06g0336150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0336150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13399295	13399395	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13399295	13399653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336150-01;Name=OsNip_06t0336150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0336150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13399396	13399653	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0336150-01;Parent=transcript:OsNip_06t0336150-01;protein_id=OsNip_06t0336150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	13407319	13408715	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0336200;Name=OsNip_TIP2;biotype=protein_coding;description=Delta-tonoplast;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13407319	13407409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407319	13407539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;Name=OsNip_06t0336200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0336200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407410	13407539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0336200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;protein_id=OsNip_06t0336200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407621	13407868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;Name=OsNip_06t0336200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0336200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407621	13407868	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0336200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;protein_id=OsNip_06t0336200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407971	13408339	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0336200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;protein_id=OsNip_06t0336200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407971	13408715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;Name=OsNip_06t0336200-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0336200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13408340	13408715	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13407322	13407409	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407322	13407539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Name=OsNip_06t0336200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0336200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407410	13407539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0336200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;protein_id=OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407621	13407650	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Name=OsNip_06t0336200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0336200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407621	13407650	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0336200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;protein_id=OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407772	13407868	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Name=OsNip_06t0336200-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0336200-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407772	13407868	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0336200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;protein_id=OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13407971	13408022	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0336200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;protein_id=OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13407971	13408697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Name=OsNip_06t0336200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0336200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13408023	13408697	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0336200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	13412111	13412717	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0336350;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	13412111	13412717	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0336350-00;Parent=gene:OsNip_06g0336350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0336350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13604329	13604407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13604518	13604612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-03;Name=OsNip_06t0340600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0340600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13604518	13604612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13604761	13604886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-03;Name=OsNip_06t0340600-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0340600-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13604761	13604886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	13601984	13604837	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0340600-04;Parent=gene:OsNip_06g0340600;transcript_id=OsNip_06t0340600-04;Tag=IsoSeq:G10526.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6329.1
Chr06	TAMA	exon	13604714	13604837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-04;Name=OsNip_06t0340600-04;exon_id=OsNip_06t0340600-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10526.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6329.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AFT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	13604518	13604612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-04;Name=OsNip_06t0340600-04;exon_id=OsNip_06t0340600-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10526.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6329.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AFT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	13604329	13604407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0340600-04;Name=OsNip_06t0340600-04;exon_id=OsNip_06t0340600-04-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10526.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6329.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0AFT3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13873300	13873538	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0345732-00;Name=OsNip_06t0345732-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0345732-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13873546	13873657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0345732-00;Name=OsNip_06t0345732-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0345732-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	13886690	13888716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0346100-01;Name=OsNip_06t0346100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0346100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13888709	13888716	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0346100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0346100-01;protein_id=OsNip_06t0346100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13888805	13888913	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0346100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0346100-01;protein_id=OsNip_06t0346100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13888805	13888915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0346100-01;Name=OsNip_06t0346100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0346100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13888914	13888915	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0346100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	13888929	13889644	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0346201-00;Parent=gene:OsNip_06g0346201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0346201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	13888929	13888981	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0346201-00;Name=OsNip_06t0346201-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0346201-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	13888929	13888981	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0346201-00;Parent=transcript:OsNip_06t0346201-00;protein_id=OsNip_06t0346201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14170858	14170918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0349800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	gene	14221117	14227611	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0350700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	14221117	14227611	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0350700-01;Parent=gene:OsNip_06g0350700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0350700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14389975	14390175	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0352900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14419584	14421327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0353400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	14422605	14422829	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0353400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0353400-01;protein_id=OsNip_06t0353400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	14428455	14428791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0353400-01;Name=OsNip_06t0353400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0353400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14428731	14428791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0353400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	14428123	14428766	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0353400-02;Parent=gene:OsNip_06g0353400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0353400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14428123	14428403	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0353400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	14428123	14428766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0353400-02;Name=OsNip_06t0353400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0353400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	14428404	14428730	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0353400-02;Parent=transcript:OsNip_06t0353400-02;protein_id=OsNip_06t0353400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14584596	14585039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0355500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	14585214	14586002	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0355500-01;Name=OsNip_06t0355500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0355500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	14586119	14586196	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0355500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0355500-01;protein_id=OsNip_06t0355500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	14586810	14587047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0355500-01;Name=OsNip_06t0355500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0355500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	14586810	14587047	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0355500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0355500-01;protein_id=OsNip_06t0355500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15612807	15613211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	15622082	15624876	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0470500-00;Parent=gene:OsNip_06g0470500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0470500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15622593	15622735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	15648705	15648915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;Name=OsNip_06t0470800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0470800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15648705	15648915	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15649624	15649704	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15653515	15653600	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0470800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;protein_id=OsNip_06t0470800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15656218	15656335	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0470800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;protein_id=OsNip_06t0470800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15656218	15659325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;Name=OsNip_06t0470800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0470800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15656336	15659325	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0470800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	15665967	15668824	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0471100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	15665967	15668824	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0471100-00;Parent=gene:OsNip_06g0471100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0471100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15665967	15666035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;Name=OsNip_06t0471100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0471100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15665967	15666035	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0471100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;protein_id=OsNip_06t0471100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15667659	15667724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;Name=OsNip_06t0471100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0471100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15667659	15667724	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0471100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;protein_id=OsNip_06t0471100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15668366	15668824	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;Name=OsNip_06t0471100-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0471100-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15668366	15668824	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0471100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0471100-00;protein_id=OsNip_06t0471100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	15718546	15721230	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0472000;Name=OsNip_MSRB1;biotype=protein_coding;description=Methionine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15756825	15756919	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0472600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0472600-01;protein_id=OsNip_06t0472600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15757001	15757052	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0472600-01;protein_id=OsNip_06t0472600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15757001	15759210	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472600-01;Name=OsNip_06t0472600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0472600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	15763073	15763100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-01;Name=OsNip_06t0472700-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0472700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15763322	15763349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-01;protein_id=OsNip_06t0472700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15765272	15765622	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-01;protein_id=OsNip_06t0472700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15765272	15765624	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-01;Name=OsNip_06t0472700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0472700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15765623	15765624	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15761155	15761347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15761155	15762381	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;Name=OsNip_06t0472700-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0472700-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15761348	15762381	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0472700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;protein_id=OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15763073	15763100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;Name=OsNip_06t0472700-02-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0472700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15763073	15763100	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;protein_id=OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15763180	15763238	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;Name=OsNip_06t0472700-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0472700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15763180	15763238	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0472700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;protein_id=OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15763322	15763349	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;Name=OsNip_06t0472700-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0472700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15763322	15763349	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;protein_id=OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15765272	15765556	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0472700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0472700-02;protein_id=OsNip_06t0472700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	15872448	15872695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474200-01;Name=OsNip_06t0474200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0474200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15877891	15877968	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15877891	15879564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474300-01;Name=OsNip_06t0474300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0474300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15891370	15891638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15891370	15892016	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474500-02;Name=OsNip_06t0474500-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0474500-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15891639	15892016	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0474500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0474500-02;protein_id=OsNip_06t0474500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	15892338	15892484	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0474500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0474500-02;protein_id=OsNip_06t0474500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	15892570	15892623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474500-02;Name=OsNip_06t0474500-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0474500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	15918538	15918793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474800-02;Name=OsNip_06t0474800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0474800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15918601	15918793	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0474800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16264256	16264679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0480000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16693771	16694037	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0487380-01;Parent=transcript:OsNip_06t0487380-01;protein_id=OsNip_06t0487380-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16694038	16694662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487380-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	gene	16700640	16703284	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g048761A;Tag=IsoSeq:G10582
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Chr06	TAMA	exon	16702850	16703284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Name=OsNip_06t048761A-01-E1;exon_id=OsNip_06t048761A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	exon	16701594	16701681	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Name=OsNip_06t048761A-01-E2;exon_id=OsNip_06t048761A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	16700640	16700931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Name=OsNip_06t048761A-01-E3;exon_id=OsNip_06t048761A-01-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	16703283	16703284	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	16701594	16701680	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	16700640	16700931	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t048761A-01;Tag=IsoSeq:G10582.1;Source=Nipponbare.leaf_G4800.1,Nipponbare.root_G6358.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9R9U5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16705088	16705202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487620-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16705088	16705640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487620-01;Name=OsNip_06t0487620-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487620-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16705203	16705466	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0487620-01;Parent=transcript:OsNip_06t0487620-01;protein_id=OsNip_06t0487620-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16705467	16705640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487620-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	16719026	16719110	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0487660;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	16719026	16719110	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0487660-00;Parent=gene:OsNip_06g0487660;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0487660-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16719026	16719110	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487660-00;Name=OsNip_06t0487660-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487660-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	16719409	16719801	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0487700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	16719409	16719801	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487700-00;Name=OsNip_06t0487700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0487700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16719409	16719801	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0487700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0487700-00;protein_id=OsNip_06t0487700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	16732927	16745662	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0487900;Name=OTS1;biotype=protein_coding;description=SUMO;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	16732927	16745608	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0487900-02;Parent=gene:OsNip_06g0487900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16732927	16733693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16732927	16733693	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16733814	16733924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16733814	16733924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16736212	16736326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16736212	16736326	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16736650	16736772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16736650	16736772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16736965	16737058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16736965	16737058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16738119	16738160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16738119	16738160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16739314	16739409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16739314	16739409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16739496	16739525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16739496	16739525	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16740421	16742677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16740421	16742774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;Name=OsNip_06t0487900-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0487900-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16742678	16742774	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0487900-02;Parent=transcript:OsNip_06t0487900-02;protein_id=OsNip_06t0487900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	16888451	16888452	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490200-04;Tag=IsoSeq:G10586.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6361.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	16887832	16888286	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490200-04;Tag=IsoSeq:G10586.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6361.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	16887359	16887730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490200-04;Tag=IsoSeq:G10586.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6361.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16896515	16896721	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0490400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0490400-00;protein_id=OsNip_06t0490400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16896894	16897661	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0490400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0490400-00;protein_id=OsNip_06t0490400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16896894	16897774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490400-00;Name=OsNip_06t0490400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0490400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16897662	16897774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	16910985	16916624	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0490700-01;Parent=gene:OsNip_06g0490700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0490700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16910985	16911336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0490700-01;Name=OsNip_06t0490700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0490700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16966043	16966188	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16966271	16966316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16966271	16966760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491300-01;Name=OsNip_06t0491300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16966599	16966760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	16968153	16970345	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0491566-01;Parent=gene:OsNip_06g0491566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0491566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16968153	16968609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16968153	16969435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;Name=OsNip_06t0491566-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491566-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16968610	16968903	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0491566-01;Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;protein_id=OsNip_06t0491566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16968904	16969435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16969910	16970345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;Name=OsNip_06t0491566-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491566-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16969910	16970345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491566-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	16991828	16995260	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0491800;biotype=protein_coding;description=HAT;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	16991828	16994085	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0491800-01;Parent=gene:OsNip_06g0491800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16991828	16992100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Name=OsNip_06t0491800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16991828	16992100	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16992180	16992258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Name=OsNip_06t0491800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16992180	16992258	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16992348	16992467	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	16992348	16994085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Name=OsNip_06t0491800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0491800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	16992468	16993097	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0491800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;protein_id=OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16993098	16994085	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	16991866	16995260	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0491800-02;Parent=gene:OsNip_06g0491800;transcript_id=OsNip_06t0491800-02;Tag=IsoSeq:G10588.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8304.2
Chr06	TAMA	exon	16994848	16995260	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0491800-02;Name=OsNip_06t0491800-02;exon_id=OsNip_06t0491800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10588.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8304.2;prot_id "UniRef90_UPI000CE27415";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	16994848	16995259	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0491800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0491800-02;protein_id=OsNip_06t0491800-02;Tag=IsoSeq:G10588.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8304.2;prot_id "UniRef90_UPI000CE27415";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17067166	17067308	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0493100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0493100-01;protein_id=OsNip_06t0493100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17068465	17068570	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0493100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0493100-01;protein_id=OsNip_06t0493100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17068465	17068612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-01;Name=OsNip_06t0493100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0493100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17068571	17068612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	17068465	17068610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-02;Name=OsNip_06t0493100-02;exon_id=OsNip_06t0493100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10589.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6364.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WX93";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17068465	17068610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-02;Tag=IsoSeq:G10589.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6364.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WX93";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17067008	17067199	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-02;Tag=IsoSeq:G10589.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6364.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WX93";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17066928	17066933	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493100-02;Tag=IsoSeq:G10589.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6364.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WX93";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	17130109	17134973	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0493600;Name=Pho1;biotype=protein_coding;description=Phosphate;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17130109	17134973	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0493600-01;Parent=gene:OsNip_06g0493600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0493600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17130109	17130187	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17130109	17130430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0493600-01;Name=OsNip_06t0493600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0493600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17130188	17130430	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0493600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0493600-01;protein_id=OsNip_06t0493600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17156157	17156239	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17163647	17163731	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17179245	17179245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t049439A-01;Tag=IsoSeq:G10592.1;Source=Nipponbare.panicle_G8307.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17179618	17179829	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t049439A-01;Tag=IsoSeq:G10592.1;Source=Nipponbare.panicle_G8307.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	17197792	17198030	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494400-01;Name=OsNip_06t0494400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0494400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17200154	17200240	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0494400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0494400-01;protein_id=OsNip_06t0494400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	17200336	17200567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494400-01;Name=OsNip_06t0494400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0494400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17200396	17200567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17236186	17239130	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0494701-01;Parent=gene:OsNip_06g0494701;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0494701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17236186	17237289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17236186	17239130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494701-01;Name=OsNip_06t0494701-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0494701-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17237290	17237517	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0494701-01;Parent=transcript:OsNip_06t0494701-01;protein_id=OsNip_06t0494701-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17237518	17239130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0494701-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	17437848	17438253	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0497500-00;Name=OsNip_06t0497500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0497500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17539962	17542480	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0498800-01;Parent=gene:OsNip_06g0498800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17539962	17540125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0498800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	17812091	17813834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0502900-03;Name=OsNip_06t0502900-03;exon_id=OsNip_06t0502900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10607.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8320.1;prot_id "UniRef90_B9T6J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	CDS	17812091	17812813	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0502900-03;Parent=transcript:OsNip_06t0502900-03;protein_id=OsNip_06t0502900-03;Tag=IsoSeq:G10607.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8320.1;prot_id "UniRef90_B9T6J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17812817	17813834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0502900-03;Tag=IsoSeq:G10607.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8320.1;prot_id "UniRef90_B9T6J9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17822397	17824603	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0503100-01;Parent=gene:OsNip_06g0503100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17822397	17822704	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17822397	17824098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;Name=OsNip_06t0503100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0503100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17822705	17824098	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0503100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;protein_id=OsNip_06t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17824513	17824579	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0503100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;protein_id=OsNip_06t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17824513	17824603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;Name=OsNip_06t0503100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0503100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17824580	17824603	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	17822454	17824697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-02;Name=OsNip_06t0503100-02;exon_id=OsNip_06t0503100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10608.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8321.4;prot_id "UniRef90_Q2QP43";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	17824489	17824695	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0503100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0503100-02;protein_id=OsNip_06t0503100-02;Tag=IsoSeq:G10608.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8321.4;prot_id "UniRef90_Q2QP43";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17824696	17824697	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-02;Tag=IsoSeq:G10608.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8321.4;prot_id "UniRef90_Q2QP43";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17822454	17824486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503100-02;Tag=IsoSeq:G10608.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8321.4;prot_id "UniRef90_Q2QP43";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	17822720	17824424	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0503250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17822720	17824424	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0503250-00;Parent=gene:OsNip_06g0503250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0503250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17822720	17823428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17822720	17824424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503250-00;Name=OsNip_06t0503250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0503250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17823429	17824424	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0503250-00;Parent=transcript:OsNip_06t0503250-00;protein_id=OsNip_06t0503250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	17836925	17840780	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0503400;biotype=protein_coding;description=Reticulon;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17836976	17840764	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0503400-01;Parent=gene:OsNip_06g0503400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17837032	17837269	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;protein_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17839647	17839827	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;protein_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17839909	17840050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;Name=OsNip_06t0503400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0503400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17839909	17840050	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;protein_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17840146	17840215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;Name=OsNip_06t0503400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0503400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17840146	17840215	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;protein_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17840306	17840472	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0503400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;protein_id=OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17840306	17840764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;Name=OsNip_06t0503400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0503400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17840473	17840764	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	17836925	17840780	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0503400-02;Parent=gene:OsNip_06g0503400;transcript_id=OsNip_06t0503400-02;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1
Chr06	TAMA	exon	17836925	17839827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-02;Name=OsNip_06t0503400-02;exon_id=OsNip_06t0503400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PYD1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	17838361	17838591	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0503400-02;Parent=transcript:OsNip_06t0503400-02;protein_id=OsNip_06t0503400-02;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PYD1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17836925	17838360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-02;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PYD1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17840146	17840215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-02;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PYD1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17840306	17840780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503400-02;Tag=IsoSeq:G10609.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8322.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PYD1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	17847225	17848089	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0503850;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17847225	17848089	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0503850-00;Parent=gene:OsNip_06g0503850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0503850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17847225	17847482	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0503850-00;Parent=transcript:OsNip_06t0503850-00;protein_id=OsNip_06t0503850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17847225	17848089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503850-00;Name=OsNip_06t0503850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0503850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17847483	17848089	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0503850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	17847303	17848113	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0503800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17847303	17848113	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0503800-00;Parent=gene:OsNip_06g0503800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0503800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	17986629	17986882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505700-01;Name=OsNip_06t0505700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0505700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17986736	17986882	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	17984207	17984207	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505700-02;Tag=IsoSeq:G10613.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8325.2;prot_id "UniRef90_K3XSM8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17984268	17984579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505700-02;Tag=IsoSeq:G10613.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8325.2;prot_id "UniRef90_K3XSM8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	17986629	17986914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505700-02;Tag=IsoSeq:G10613.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8325.2;prot_id "UniRef90_K3XSM8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17993105	17993167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17993105	17993851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505900-01;Name=OsNip_06t0505900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0505900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17993618	17993851	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0505900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	17993237	17995212	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0506000-01;Parent=gene:OsNip_06g0506000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0506000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17993237	17993332	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	17993237	17993626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506000-01;Name=OsNip_06t0506000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0506000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	17993333	17993626	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0506000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0506000-01;protein_id=OsNip_06t0506000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	17994669	17995212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506000-01;Name=OsNip_06t0506000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0506000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17995167	17995212	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17997701	17997761	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18000063	18000277	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18000376	18000534	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18002577	18002646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	18002647	18003000	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0506150-01;Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;protein_id=OsNip_06t0506150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18003001	18006345	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	18006452	18006577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Name=OsNip_06t0506150-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0506150-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18006452	18006577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	18007843	18008223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Name=OsNip_06t0506150-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0506150-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18007843	18008223	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506150-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	18002712	18009339	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0506200;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	18002712	18009339	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0506200-01;Parent=gene:OsNip_06g0506200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0506200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	18002712	18002977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506200-01;Name=OsNip_06t0506200-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0506200-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18002712	18002977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18004205	18005117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	18004205	18005291	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0506200-01;Name=OsNip_06t0506200-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0506200-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	18005118	18005291	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0506200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0506200-01;protein_id=OsNip_06t0506200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	18146221	18146262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0508700-01;Name=OsNip_06t0508700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0508700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18146257	18146262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0508700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	18524688	18525069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0513050-01;Name=OsNip_06t0513050-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0513050-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18524688	18525069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0513050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18525183	18525236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0513050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	18525183	18525251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0513050-01;Name=OsNip_06t0513050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0513050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	18747525	18749180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-01;Name=OsNip_06t0514700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0514700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18747638	18749180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18749271	18749348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18749892	18750238	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	18747293	18747443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;Name=OsNip_06t0514700-02;exon_id=OsNip_06t0514700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	18747294	18747443	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0514700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;protein_id=OsNip_06t0514700-02;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	18747525	18747628	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;Name=OsNip_06t0514700-02;exon_id=OsNip_06t0514700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	18747525	18747539	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0514700-02;Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;protein_id=OsNip_06t0514700-02;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	18749058	18749180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;Name=OsNip_06t0514700-02;exon_id=OsNip_06t0514700-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	18749271	18749348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;Name=OsNip_06t0514700-02;exon_id=OsNip_06t0514700-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	18749892	18750266	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0514700-02;Name=OsNip_06t0514700-02;exon_id=OsNip_06t0514700-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G10622.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8330.3;prot_id "UniRef90_B8B4E4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	19063808	19065989	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0520300-00;Parent=gene:OsNip_06g0520300;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0520300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	19063808	19064348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0520300-00;Name=OsNip_06t0520300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0520300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	19065156	19065989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0520300-00;Name=OsNip_06t0520300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0520300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	19101558	19107176	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0520600-01;Parent=gene:OsNip_06g0520600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19101558	19101720	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	19101558	19102098	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0520600-01;Name=OsNip_06t0520600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0520600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	19734734	19734971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530200-01;Name=OsNip_06t0530200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0530200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	19732945	19733102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530200-02;Name=OsNip_06t0530200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0530200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19737618	19737618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	19737618	19737656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;Name=OsNip_06t0530300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0530300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	19737981	19738047	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;Name=OsNip_06t0530300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0530300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	19737981	19738047	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0530300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;protein_id=OsNip_06t0530300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	19739877	19740287	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0530300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;protein_id=OsNip_06t0530300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	19739877	19740526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;Name=OsNip_06t0530300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0530300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19740288	19740526	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	19736548	19736783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0530300-02;Name=OsNip_06t0530300-02;exon_id=OsNip_06t0530300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10642.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8344.2;prot_id "UniRef90_A0A3S3MH18";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19833803	19834130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0531500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	19869609	19869942	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0532101-00;Name=OsNip_06t0532101-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0532101-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	CDS	20224371	20224414	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0538900-02;Parent=transcript:OsNip_06t0538900-02;protein_id=OsNip_06t0538900-02;Tag=IsoSeq:G10654.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6405.1,Nipponbare.panicle_G8352.1;prot_id "UniRef90_A0A4Y7IJW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	20224692	20224692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0538900-02;Tag=IsoSeq:G10654.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6405.1,Nipponbare.panicle_G8352.1;prot_id "UniRef90_A0A4Y7IJW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	20223905	20224368	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0538900-02;Tag=IsoSeq:G10654.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6405.1,Nipponbare.panicle_G8352.1;prot_id "UniRef90_A0A4Y7IJW2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	20230756	20232066	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0539066;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20230756	20231742	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0539066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20230756	20232066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0539066-01;Name=OsNip_06t0539066-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0539066-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20231743	20232036	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0539066-01;Parent=transcript:OsNip_06t0539066-01;protein_id=OsNip_06t0539066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20232037	20232066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0539066-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	20231417	20231674	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0539100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	20231417	20231674	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0539100-00;Parent=gene:OsNip_06g0539100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0539100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20231417	20231674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0539100-00;Name=OsNip_06t0539100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0539100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20231417	20231674	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0539100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0539100-00;protein_id=OsNip_06t0539100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	20241554	20245065	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0539250;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	20241554	20245065	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0539250-01;Parent=gene:OsNip_06g0539250;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0539250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	20282472	20287273	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0540200-00;Parent=gene:OsNip_06g0540200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0540200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	20286801	20287273	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0540200-00;Name=OsNip_06t0540200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0540200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20286801	20287273	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0540200-00;Parent=transcript:OsNip_06t0540200-00;protein_id=OsNip_06t0540200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	20323335	20325370	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0541132;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	20323335	20323533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20323335	20323533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	20323637	20323843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20323692	20323843	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0541132-00;Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;protein_id=OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20324009	20324063	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0541132-00;Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;protein_id=OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20324009	20324192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20324064	20324192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20324985	20325198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20324985	20325198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20325211	20325230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20325211	20325230	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20325267	20325370	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0541132-00;Name=OsNip_06t0541132-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0541132-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20621210	20621456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20621210	20622203	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;Name=OsNip_06t0545800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0545800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20621457	20622203	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0545800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;protein_id=OsNip_06t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20622308	20622799	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0545800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;protein_id=OsNip_06t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20622308	20622856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;Name=OsNip_06t0545800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0545800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20622800	20622856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0545800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	gene	20996397	20998850	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0553100;Name=HSfC2b;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	20998086	20998850	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0553100-01;Parent=gene:OsNip_06g0553100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0553100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20998086	20998173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	20998086	20998850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-01;Name=OsNip_06t0553100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0553100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	20998174	20998722	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0553100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0553100-01;protein_id=OsNip_06t0553100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20998723	20998850	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	20996397	20998762	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0553100-02;Parent=gene:OsNip_06g0553100;transcript_id=OsNip_06t0553100-02;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1
Chr06	TAMA	exon	20998513	20998762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;Name=OsNip_06t0553100-02;exon_id=OsNip_06t0553100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	20996397	20997384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;Name=OsNip_06t0553100-02;exon_id=OsNip_06t0553100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	20996589	20996828	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0553100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;protein_id=OsNip_06t0553100-02;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	20998513	20998762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	20996829	20997384	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	20996397	20996586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553100-02;Tag=IsoSeq:G10677.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8366.1;prot_id "UniRef90_A0A6V7P8G2";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	gene	21000223	21000523	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g055319A;Tag=IsoSeq:G10678
Chr06	TAMA	mRNA	21000223	21000523	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t055319A-01;Parent=gene:OsNip_06g055319A;transcript_id=OsNip_06t055319A-01;Tag=IsoSeq:G10678.1;Source=Nipponbare.panicle_G8367.1
Chr06	TAMA	exon	21000223	21000523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t055319A-01;Name=OsNip_06t055319A-01-E1;exon_id=OsNip_06t055319A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10678.1;Source=Nipponbare.panicle_G8367.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	21000335	21000523	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t055319A-01;Parent=transcript:OsNip_06t055319A-01;protein_id=OsNip_06t055319A-01;Tag=IsoSeq:G10678.1;Source=Nipponbare.panicle_G8367.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	21000223	21000332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t055319A-01;Tag=IsoSeq:G10678.1;Source=Nipponbare.panicle_G8367.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	21006766	21008156	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0553200;Name=PFL;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	21006766	21008156	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0553200-01;Parent=gene:OsNip_06g0553200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21006766	21007117	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21006766	21007454	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0553200-01;Name=OsNip_06t0553200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0553200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	21166864	21167131	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555400-01;Name=OsNip_06t0555400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0555400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21167583	21167940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	21168374	21168433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;Name=OsNip_06t0555500-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0555500-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21168374	21168433	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;protein_id=OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21168758	21168861	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;protein_id=OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21169207	21169921	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;protein_id=OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21170400	21170539	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;Name=OsNip_06t0555500-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0555500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21170400	21170539	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;protein_id=OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21171162	21171492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0555500-02;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;protein_id=OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21171162	21171514	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;Name=OsNip_06t0555500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0555500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21171493	21171514	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21167671	21167940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21167671	21168116	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-01;Name=OsNip_06t0555500-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0555500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	21168374	21168433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-01;Name=OsNip_06t0555500-02-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0555500-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21168374	21168433	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0555500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0555500-01;protein_id=OsNip_06t0555500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21168571	21168679	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0555500-01;Name=OsNip_06t0555500-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0555500-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21397232	21397698	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0560000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0560000-01;protein_id=OsNip_06t0560000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21556463	21557086	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0562200-01;Parent=transcript:OsNip_06t0562200-01;protein_id=OsNip_06t0562200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21557087	21557283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0562200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	21563900	21567923	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0562300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	21564071	21566577	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0562300-00;Parent=gene:OsNip_06g0562300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0562300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21564071	21564223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0562300-00;Name=OsNip_06t0562300-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0562300-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21564071	21564223	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0562300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0562300-00;protein_id=OsNip_06t0562300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21564350	21564410	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0562300-00;Name=OsNip_06t0562300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0562300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21697800	21698005	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0564400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0564400-00;protein_id=OsNip_06t0564400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21698604	21698806	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0564400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0564400-00;protein_id=OsNip_06t0564400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	21699451	21699561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0564400-00;Name=OsNip_06t0564400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0564400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21699451	21699561	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0564400-00;Parent=transcript:OsNip_06t0564400-00;protein_id=OsNip_06t0564400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	21700599	21703282	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0564500;biotype=protein_coding;description=Cysteine;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	21700599	21703282	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0564500-01;Parent=gene:OsNip_06g0564500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0564500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21877828	21877882	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0566700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0566700-00;protein_id=OsNip_06t0566700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	21876918	21877041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0566700-01;Tag=IsoSeq:G10704.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8389.3;prot_id "UniRef90_Q0DCC8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	21877144	21877393	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0566700-01;Tag=IsoSeq:G10704.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8389.3;prot_id "UniRef90_Q0DCC8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	21877828	21878023	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0566700-01;Tag=IsoSeq:G10704.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8389.3;prot_id "UniRef90_Q0DCC8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	21879182	21879427	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0566850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	21879182	21879427	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0566850-00;Name=OsNip_06t0566850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0566850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21879182	21879427	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0566850-00;Parent=transcript:OsNip_06t0566850-00;protein_id=OsNip_06t0566850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	21882930	21885294	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0567000;biotype=protein_coding;description=Uncharacterised;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	21882930	21885294	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0567000-01;Parent=gene:OsNip_06g0567000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0567000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21882930	21883011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21882930	21883014	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;Name=OsNip_06t0567000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0567000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21883012	21883014	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0567000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;protein_id=OsNip_06t0567000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21883126	21883226	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;Name=OsNip_06t0567000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0567000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	21883126	21883226	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0567000-01;Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;protein_id=OsNip_06t0567000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	21884784	21884862	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0567000-01;Name=OsNip_06t0567000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0567000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21954935	21955132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0567900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22197414	22197742	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22197414	22198051	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;Name=OsNip_06t0572400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0572400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22197743	22198051	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;protein_id=OsNip_06t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22199432	22199941	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0572400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;protein_id=OsNip_06t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22199432	22200008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;Name=OsNip_06t0572400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0572400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22199942	22200008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0572400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22488680	22491650	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0578100-00;Parent=gene:OsNip_06g0578100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0578100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22488680	22490224	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0578100-00;Parent=transcript:OsNip_06t0578100-00;protein_id=OsNip_06t0578100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	22491175	22491650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0578100-00;Name=OsNip_06t0578100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0578100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22491631	22491650	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0578100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22594115	22598173	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0579600-01;Parent=gene:OsNip_06g0579600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0579600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22595049	22598173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0579600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22598231	22598990	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0579800-01;Parent=gene:OsNip_06g0579800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22598231	22598670	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22598671	22598874	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0579800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0579800-01;protein_id=OsNip_06t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22598875	22598990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0579800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	22613928	22617394	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0580100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22613998	22617392	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0580100-01;Parent=gene:OsNip_06g0580100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0580100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22613998	22614119	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0580100-01;Name=OsNip_06t0580100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0580100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	22704104	22704499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0581300-01;Name=OsNip_06t0581300-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0581300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22704219	22704499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0581300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	22740880	22740971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t058239A-01;Tag=IsoSeq:G10727.1;Source=Nipponbare.panicle_G8409.1;prot_id "UniRef90_Q5VPA4";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	22780293	22781032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0582600-01;Name=OsNip_06t0582600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0582600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22780898	22781032	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0582600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	22794359	22800197	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0583400;Name=HDAC1;biotype=protein_coding;description=Class-I;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22794359	22800196	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0583400-01;Parent=gene:OsNip_06g0583400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0583400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22794359	22794835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22794359	22794943	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583400-01;Name=OsNip_06t0583400-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0583400-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22794836	22794943	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0583400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0583400-01;protein_id=OsNip_06t0583400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22795071	22795151	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583400-01;Name=OsNip_06t0583400-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0583400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	22807569	22808015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058359A-01;Name=OsNip_06t058359A-01-E2;exon_id=OsNip_06t058359A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10731.1;Source=Nipponbare.panicle_G8412.1,Nipponbare.root_G6448.1;prot_id "UniRef90_A0A7H4LQ63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	22809929	22809930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058359A-01;Tag=IsoSeq:G10731.1;Source=Nipponbare.panicle_G8412.1,Nipponbare.root_G6448.1;prot_id "UniRef90_A0A7H4LQ63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	22807569	22808015	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058359A-01;Tag=IsoSeq:G10731.1;Source=Nipponbare.panicle_G8412.1,Nipponbare.root_G6448.1;prot_id "UniRef90_A0A7H4LQ63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22811046	22811126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22811046	22812756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583600-00;Name=OsNip_06t0583600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0583600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22811127	22812756	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0583600-00;Parent=transcript:OsNip_06t0583600-00;protein_id=OsNip_06t0583600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22812902	22813269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583600-00;Name=OsNip_06t0583600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0583600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22812902	22813269	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0583600-00;Parent=transcript:OsNip_06t0583600-00;protein_id=OsNip_06t0583600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	22821117	22823386	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0583900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22821117	22823386	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0583900-01;Parent=gene:OsNip_06g0583900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22821117	22821311	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22821117	22821529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583900-01;Name=OsNip_06t0583900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0583900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22821312	22821529	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0583900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0583900-01;protein_id=OsNip_06t0583900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22821612	22822379	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0583900-01;Name=OsNip_06t0583900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0583900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	22846347	22847044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0584400-01;Name=OsNip_06t0584400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0584400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	22856543	22856764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058589A-01;Tag=IsoSeq:G10735.1;Source=Nipponbare.panicle_G8416.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0LD04";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	22856104	22856357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058589A-01;Tag=IsoSeq:G10735.1;Source=Nipponbare.panicle_G8416.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0LD04";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	22856543	22856763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058589A-02;Tag=IsoSeq:G10735.2;Source=Nipponbare.root_G6450.1,Nipponbare.panicle_G8416.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0LD04";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	22856152	22856357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058589A-02;Tag=IsoSeq:G10735.2;Source=Nipponbare.root_G6450.1,Nipponbare.panicle_G8416.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0LD04";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	22860927	22867521	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0585900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	22860927	22867521	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0585900-01;Parent=gene:OsNip_06g0585900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22860927	22861245	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22860927	22861299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;Name=OsNip_06t0585900-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0585900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22861246	22861299	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0585900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;protein_id=OsNip_06t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	22862210	22862240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;Name=OsNip_06t0585900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0585900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22862210	22862240	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0585900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;protein_id=OsNip_06t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	22867300	22867454	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0585900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0585900-01;protein_id=OsNip_06t0585900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23008479	23008846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0587200-00;Name=OsNip_06t0587200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0587200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23008829	23008846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0587200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	23014685	23014892	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058729A-01;Tag=IsoSeq:G10738.1;Source=Nipponbare.leaf_G4866.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PZM0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	23013194	23013717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t058729A-01;Tag=IsoSeq:G10738.1;Source=Nipponbare.leaf_G4866.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0PZM0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	23017969	23021462	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0587300-01;Parent=gene:OsNip_06g0587300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0587300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23017969	23020069	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0587300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23087775	23087795	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0588450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23097172	23097578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0588800-00;Name=OsNip_06t0588800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0588800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23097525	23097578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0588800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23136424	23136671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0589700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23233117	23233439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0591400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23234119	23234772	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0591450-00;Name=OsNip_06t0591450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0591450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23234119	23234772	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0591450-00;Parent=transcript:OsNip_06t0591450-00;protein_id=OsNip_06t0591450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	23240367	23240597	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0591551;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	23240367	23240597	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0591551-00;Parent=gene:OsNip_06g0591551;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0591551-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23240367	23240597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0591551-00;Name=OsNip_06t0591551-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0591551-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23240367	23240597	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0591551-00;Parent=transcript:OsNip_06t0591551-00;protein_id=OsNip_06t0591551-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	23350577	23350815	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594100-03;Tag=IsoSeq:G10752.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8430.1,Nipponbare.root_G6456.1,Nipponbare.leaf_G4873.2,Nipponbare.leaf_G4873.1,Nipponbare.panicle_G8430.2;prot_id "UniRef90_M0TFU6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23357768	23358210	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23358853	23359176	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23367126	23367495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23367126	23368775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594300-01;Name=OsNip_06t0594300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0594300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23368681	23368775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	gene	23379156	23381421	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0594600;Name=OsNip_AT10;biotype=protein_coding;description=BAHD;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	23379156	23381421	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0594600-01;Parent=gene:OsNip_06g0594600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0594600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23393217	23393611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0594940-00;Name=OsNip_06t0594940-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0594940-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23407102	23407305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595180-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23433554	23433662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595433-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	23432872	23435035	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0595566-00;Parent=gene:OsNip_06g0595566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0595566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23432872	23433771	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Name=OsNip_06t0595566-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0595566-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23433937	23434220	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Name=OsNip_06t0595566-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0595566-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	23434302	23434382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Name=OsNip_06t0595566-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0595566-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23434302	23434382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23434481	23434586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23434481	23434811	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Name=OsNip_06t0595566-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0595566-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23434940	23435035	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23433726	23433834	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0595700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0595700-00;protein_id=OsNip_06t0595700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23433914	23434221	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0595700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0595700-00;protein_id=OsNip_06t0595700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23434474	23435090	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0595700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0595700-00;protein_id=OsNip_06t0595700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	23438800	23440545	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0595800;Name=OsNip_AT8;biotype=protein_coding;description=Transferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	23438800	23440545	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0595800-01;Parent=gene:OsNip_06g0595800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0595800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23438800	23438874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23438800	23439330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595800-01;Name=OsNip_06t0595800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0595800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23438875	23439330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0595800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0595800-01;protein_id=OsNip_06t0595800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23439440	23439494	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0595800-01;Name=OsNip_06t0595800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0595800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23691144	23691323	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0600301-00;Parent=transcript:OsNip_06t0600301-00;protein_id=OsNip_06t0600301-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23691468	23691545	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0600301-00;Parent=transcript:OsNip_06t0600301-00;protein_id=OsNip_06t0600301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23691668	23691740	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0600301-00;Name=OsNip_06t0600301-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0600301-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23691668	23691740	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0600301-00;Parent=transcript:OsNip_06t0600301-00;protein_id=OsNip_06t0600301-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	23689236	23691973	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0600301-01;Parent=gene:OsNip_06g0600301;transcript_id=OsNip_06t0600301-01;Tag=IsoSeq:G10772.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8444.1,Nipponbare.leaf_G4889.1
Chr06	TAMA	exon	23689236	23689345	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0600301-01;Name=OsNip_06t0600301-01;exon_id=OsNip_06t0600301-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10772.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8444.1,Nipponbare.leaf_G4889.1;prot_id "UniRef90_A9PA03";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23949929	23950097	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0604600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0604600-01;protein_id=OsNip_06t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	23950213	23950439	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0604600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0604600-01;protein_id=OsNip_06t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	23950213	23950657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0604600-01;Name=OsNip_06t0604600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0604600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23950440	23950657	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0604600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24005166	24012308	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0605600-01;Parent=gene:OsNip_06g0605600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0605600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24005166	24005459	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24005166	24005779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;Name=OsNip_06t0605600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0605600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24005460	24005779	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0605600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;protein_id=OsNip_06t0605600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24005846	24006584	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;Name=OsNip_06t0605600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0605600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24005846	24006584	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0605600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;protein_id=OsNip_06t0605600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24009317	24009800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;Name=OsNip_06t0605600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0605600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24009317	24009800	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0605600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0605600-01;protein_id=OsNip_06t0605600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24352469	24353951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0610800-01;Name=OsNip_06t0610800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0610800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24353788	24353951	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0610800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24359242	24363675	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0611000-01;Parent=gene:OsNip_06g0611000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24360470	24360543	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24360714	24360923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24361974	24362107	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24362190	24362561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24362643	24363029	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24363120	24363370	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611050-00;Name=OsNip_06t0611050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	24364001	24364844	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0611100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24364001	24364844	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0611100-01;Parent=gene:OsNip_06g0611100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24364001	24364227	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24364228	24364323	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0611100-01;protein_id=OsNip_06t0611100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24364451	24364774	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611100-01;Parent=transcript:OsNip_06t0611100-01;protein_id=OsNip_06t0611100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24364451	24364844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611100-01;Name=OsNip_06t0611100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24364775	24364844	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	24365251	24366236	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0611150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24365251	24366236	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0611150-00;Parent=gene:OsNip_06g0611150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24365251	24365546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24365251	24365561	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611150-00;Name=OsNip_06t0611150-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611150-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24365547	24365561	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611150-00;Parent=transcript:OsNip_06t0611150-00;protein_id=OsNip_06t0611150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24365620	24365796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611150-00;Name=OsNip_06t0611150-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611150-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24366123	24366236	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611150-00;Name=OsNip_06t0611150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24380883	24381425	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611400-01;Name=OsNip_06t0611400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24381767	24382168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611400-01;Name=OsNip_06t0611400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24382004	24382168	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	24382631	24383041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t061149A-01;Name=OsNip_06t061149A-01-E1;exon_id=OsNip_06t061149A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10815.1;Source=Nipponbare.panicle_G8482.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	24382942	24383040	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t061149A-01;Parent=transcript:OsNip_06t061149A-01;protein_id=OsNip_06t061149A-01;Tag=IsoSeq:G10815.1;Source=Nipponbare.panicle_G8482.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	24383041	24383041	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t061149A-01;Tag=IsoSeq:G10815.1;Source=Nipponbare.panicle_G8482.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	24382631	24382939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t061149A-01;Tag=IsoSeq:G10815.1;Source=Nipponbare.panicle_G8482.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24384025	24386064	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0611500-01;Parent=gene:OsNip_06g0611500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24384025	24384073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24384025	24384604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611500-01;Name=OsNip_06t0611500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24384074	24384604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0611500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0611500-01;protein_id=OsNip_06t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24385143	24386064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611500-01;Name=OsNip_06t0611500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24385890	24386064	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24384206	24385835	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0611550-00;Parent=gene:OsNip_06g0611550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24384206	24384592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611550-00;Name=OsNip_06t0611550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24384206	24384592	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611550-00;Parent=transcript:OsNip_06t0611550-00;protein_id=OsNip_06t0611550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24385116	24385835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611550-00;Name=OsNip_06t0611550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0611550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24385119	24385835	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24388239	24389073	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0611600-00;Parent=gene:OsNip_06g0611600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	24388239	24389073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611600-00;Name=OsNip_06t0611600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24388872	24389073	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	24390137	24393848	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0611700-00;Parent=gene:OsNip_06g0611700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0611700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24390137	24390281	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;Name=OsNip_06t0611700-00-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0611700-00-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24390137	24390281	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0611700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;protein_id=OsNip_06t0611700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24390473	24390516	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;Name=OsNip_06t0611700-00-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0611700-00-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24390473	24390516	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;protein_id=OsNip_06t0611700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	24390606	24390774	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;Name=OsNip_06t0611700-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0611700-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	24390878	24391065	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0611700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0611700-00;protein_id=OsNip_06t0611700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24707334	24707541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0616900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25013594	25014038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622300-02;Name=OsNip_06t0622300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0622300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25014194	25014203	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25018961	25019288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622300-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25014892	25014931	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622300-04;Name=OsNip_06t0622300-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0622300-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25014893	25014931	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0622300-04;Parent=transcript:OsNip_06t0622300-04;protein_id=OsNip_06t0622300-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25016086	25016138	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0622300-04;Parent=transcript:OsNip_06t0622300-04;protein_id=OsNip_06t0622300-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25016267	25016312	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0622300-04;Parent=transcript:OsNip_06t0622300-04;protein_id=OsNip_06t0622300-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25043509	25043935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622700-02;Name=OsNip_06t0622700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0622700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25043646	25043935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25041945	25041975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25041945	25042415	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0622700-01;Name=OsNip_06t0622700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0622700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25041976	25042415	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0622700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0622700-01;protein_id=OsNip_06t0622700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25154307	25155583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624850-00;Name=OsNip_06t0624850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0624850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158696	25158788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158933	25158946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25158933	25159195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-01;Name=OsNip_06t0624900-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0624900-03-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25159295	25159510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-01;Name=OsNip_06t0624900-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0624900-03-E3;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25163448	25164529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-01;Name=OsNip_06t0624900-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0624900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25158679	25158788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-02;Name=OsNip_06t0624900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0624900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158679	25158788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158933	25158946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25163448	25164128	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-02;Name=OsNip_06t0624900-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0624900-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25163745	25164128	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158689	25158788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25158933	25158946	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25158933	25159195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Name=OsNip_06t0624900-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0624900-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25158947	25159195	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0624900-03;Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;protein_id=OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25159295	25159510	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Name=OsNip_06t0624900-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0624900-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25159295	25159510	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0624900-03;Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;protein_id=OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25163448	25163744	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0624900-03;Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;protein_id=OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25163448	25164141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Name=OsNip_06t0624900-03-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0624900-03-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25163745	25164141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	25158679	25164616	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0624900-04;Parent=gene:OsNip_06g0624900;transcript_id=OsNip_06t0624900-04;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5
Chr06	TAMA	exon	25158679	25158743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-04;Name=OsNip_06t0624900-04;exon_id=OsNip_06t0624900-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	exon	25164060	25164616	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-04;Name=OsNip_06t0624900-04;exon_id=OsNip_06t0624900-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr06	TAMA	five_prime_UTR	25158679	25158743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-04;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	25164060	25164186	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-04;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	25164286	25164616	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624900-04;Tag=IsoSeq:G10842.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4918.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	25158967	25163735	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0624950;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	25158967	25163735	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0624950-00;Parent=gene:OsNip_06g0624950;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0624950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25158967	25159226	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0624950-00;Name=OsNip_06t0624950-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0624950-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25207631	25207810	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-02;Name=OsNip_06t0625400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0625400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	25208524	25208722	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25208233	25208280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	exon	25207631	25207819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E7;rank=7;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25207238	25207534	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25206647	25206748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25206113	25206247	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E10;rank=10;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25205532	25205756	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E11;rank=11;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	25205195	25205398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0625400-03;Name=OsNip_06t0625400-03;exon_id=OsNip_06t0625400-03-E12;rank=12;Tag=IsoSeq:G10843.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6500.1,Nipponbare.panicle_G8507.2,Nipponbare.panicle_G8507.3,Nipponbare.panicle_G8507.1,Nipponbare.leaf_G4919.2,Nipponbare.leaf_G4919.1;prot_id "UniRef90_D7UDI7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25501532	25501725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0630300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25524538	25525259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0630850-01;Name=OsNip_06t0630850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0630850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25524608	25525027	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0630850-01;Parent=transcript:OsNip_06t0630850-01;protein_id=OsNip_06t0630850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25525028	25525259	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0630850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	25539375	25546479	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0631300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25544480	25544480	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0631300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25629187	25629312	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0632400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	25718152	25721418	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0634300-02;Parent=gene:OsNip_06g0634300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0634300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25718152	25718352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0634300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25718152	25718601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0634300-02;Name=OsNip_06t0634300-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0634300-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25787465	25787648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0635700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	25826703	25828445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t063609A-01;Name=OsNip_06t063609A-01-E1;exon_id=OsNip_06t063609A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10862.1;Source=Nipponbare.panicle_G8525.1;prot_id "UniRef90_UPI0008FD7DFC";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	25827882	25828088	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t063609A-01;Parent=transcript:OsNip_06t063609A-01;protein_id=OsNip_06t063609A-01;Tag=IsoSeq:G10862.1;Source=Nipponbare.panicle_G8525.1;prot_id "UniRef90_UPI0008FD7DFC";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	25828092	25828445	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t063609A-01;Tag=IsoSeq:G10862.1;Source=Nipponbare.panicle_G8525.1;prot_id "UniRef90_UPI0008FD7DFC";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	25832821	25836854	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0636100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25906430	25906430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0637800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25934788	25934923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	gene	25946132	25949678	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0638500;biotype=protein_coding;description=Tyrosine;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25946419	25947161	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638500-00;Name=OsNip_06t0638500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0638500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25946419	25947161	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0638500-00;Parent=transcript:OsNip_06t0638500-00;protein_id=OsNip_06t0638500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25947541	25949428	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0638500-00;Parent=transcript:OsNip_06t0638500-00;protein_id=OsNip_06t0638500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25947541	25949605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638500-00;Name=OsNip_06t0638500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0638500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25949429	25949605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	25946132	25949678	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638500-01;Name=OsNip_06t0638500-01;exon_id=OsNip_06t0638500-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10870.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8532.2;prot_id "UniRef90_A0A1U7YXM1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	25948899	25949678	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0638500-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638500-01;protein_id=OsNip_06t0638500-01;Tag=IsoSeq:G10870.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8532.2;prot_id "UniRef90_A0A1U7YXM1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	25946132	25948896	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638500-01;Tag=IsoSeq:G10870.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8532.2;prot_id "UniRef90_A0A1U7YXM1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	25959471	25963252	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0638700;Name=OsNip_CYL2;biotype=protein_coding;description=Putative;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	25959471	25963252	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0638700-01;Parent=gene:OsNip_06g0638700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25959471	25959659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25959471	25959785	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25959660	25959785	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25960748	25960818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25960748	25960818	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25960946	25961043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25960946	25961043	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25961142	25961214	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25961142	25961214	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25961486	25961530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25961486	25961530	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	25962819	25963224	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0638700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;protein_id=OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	25962819	25963252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Name=OsNip_06t0638700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0638700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25963225	25963252	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0638700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	25963878	25967433	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0638900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	25963878	25967328	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0638900-01;Parent=gene:OsNip_06g0638900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0638900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	25992919	25993219	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0639300-01;Name=OsNip_06t0639300-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0639300-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	26007058	26010413	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0639600-01;Parent=gene:OsNip_06g0639600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0639600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26105546	26105547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0641800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	26163645	26163789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0642650-01;Name=OsNip_06t0642650-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0642650-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	26186629	26186811	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0642900-01;Parent=transcript:OsNip_06t0642900-01;protein_id=OsNip_06t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	26186629	26187011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0642900-01;Name=OsNip_06t0642900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0642900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26186812	26187011	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0642900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	26258063	26258263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0643900-02;Name=OsNip_06t0643900-02;exon_id=OsNip_06t0643900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G10887.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6524.1,Nipponbare.leaf_G4935.2,Nipponbare.root_G6524.3,Nipponbare.panicle_G8548.1,Nipponbare.panicle_G8548.3;prot_id "UniRef90_A0A0E0E494";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26273324	26273483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0644200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26275998	26275999	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0644200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	26955106	26955285	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0656700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0656700-01;protein_id=OsNip_06t0656700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	26955106	26955645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656700-01;Name=OsNip_06t0656700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0656700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26955286	26955645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	26956110	26956171	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0656725-00;Parent=gene:OsNip_06g0656725;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0656725-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	26956110	26956171	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656725-00;Name=OsNip_06t0656725-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0656725-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	26957522	26958621	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0656800;Name=OsNip_FLA25;biotype=protein_coding;description=FAS1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	26957522	26958621	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0656800-01;Parent=gene:OsNip_06g0656800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26957522	26957734	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	26957522	26957970	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;Name=OsNip_06t0656800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0656800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	26957735	26957970	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0656800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;protein_id=OsNip_06t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	26958031	26958604	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0656800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;protein_id=OsNip_06t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	26958031	26958621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;Name=OsNip_06t0656800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0656800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26958605	26958621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	26957541	26958620	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0656800-02;Parent=gene:OsNip_06g0656800;transcript_id=OsNip_06t0656800-02;Tag=IsoSeq:G10930.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8580.2
Chr06	TAMA	exon	26957541	26958620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-02;Name=OsNip_06t0656800-02;exon_id=OsNip_06t0656800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10930.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8580.2;prot_id "UniRef90_A0A699JDH8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	26958487	26958618	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0656800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0656800-02;protein_id=OsNip_06t0656800-02;Tag=IsoSeq:G10930.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8580.2;prot_id "UniRef90_A0A699JDH8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	26958619	26958620	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-02;Tag=IsoSeq:G10930.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8580.2;prot_id "UniRef90_A0A699JDH8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	26957541	26958484	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0656800-02;Tag=IsoSeq:G10930.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8580.2;prot_id "UniRef90_A0A699JDH8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	27025485	27029339	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0657500;Name=OsNip_PLT2;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27058338	27059571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0658350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27063980	27067191	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0658400-01;Parent=gene:OsNip_06g0658400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0658400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27063980	27064206	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0658400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	27084866	27085871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t065889A-01;Name=OsNip_06t065889A-01-E1;exon_id=OsNip_06t065889A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10931.1;Source=Nipponbare.leaf_G4960.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0WCY6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	27153718	27153945	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659500-01;Name=OsNip_06t0659500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0659500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	27151482	27151736	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659500-02;Name=OsNip_06t0659500-02;exon_id=OsNip_06t0659500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G10935.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8584.1;prot_id "UniRef90_A0A2G9GBK4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	27153718	27154007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659500-02;Tag=IsoSeq:G10935.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8584.1;prot_id "UniRef90_A0A2G9GBK4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27154687	27156204	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0659600-01;Parent=gene:OsNip_06g0659600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27154687	27155072	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	27154687	27156204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659600-01;Name=OsNip_06t0659600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0659600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	27155073	27156158	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0659600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0659600-01;protein_id=OsNip_06t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27156159	27156204	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	27162266	27162609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659750-00;Name=OsNip_06t0659750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0659750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	27162645	27163147	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0659800;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27162645	27163147	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0659800-00;Parent=gene:OsNip_06g0659800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0659800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	27162645	27163130	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0659800-00;Parent=transcript:OsNip_06t0659800-00;protein_id=OsNip_06t0659800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	27162645	27163147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659800-00;Name=OsNip_06t0659800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0659800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27163131	27163147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0659800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	27200330	27200399	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0660000;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27200330	27200399	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0660000-00;Parent=gene:OsNip_06g0660000;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_06t0660000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	27200330	27200399	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0660000-00;Name=OsNip_06t0660000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0660000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	27200808	27204611	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0660200;Name=OsNip_PIN2;biotype=protein_coding;description=Auxin;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27601270	27605299	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0666600-01;Parent=gene:OsNip_06g0666600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0666600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	27605064	27605299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0666600-01;Name=OsNip_06t0666600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0666600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	27644256	27646536	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0667300-01;Name=OsNip_06t0667300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0667300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27652731	27656723	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0667400-01;Parent=gene:OsNip_06g0667400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0667400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	27656346	27656489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0667400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0667400-01;protein_id=OsNip_06t0667400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27656490	27656723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0667400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27653646	27656345	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0667400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	27653646	27656696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0667400-02;Name=OsNip_06t0667400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0667400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	27656346	27656489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0667400-02;Parent=transcript:OsNip_06t0667400-02;protein_id=OsNip_06t0667400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27656490	27656696	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0667400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	27656878	27658818	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0667500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	27782932	27791010	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0670400-00;Parent=gene:OsNip_06g0670400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0670400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28137535	28138094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0677300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28139204	28139265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0677400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28189634	28189634	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0678100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28190270	28190855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0678100-00;Name=OsNip_06t0678100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0678100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	gene	28270171	28272930	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0679400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28270171	28272930	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0679400-01;Parent=gene:OsNip_06g0679400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0679400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28270171	28270475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28270171	28270741	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;Name=OsNip_06t0679400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0679400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28270476	28270741	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0679400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;protein_id=OsNip_06t0679400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28271490	28272240	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;Name=OsNip_06t0679400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0679400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28271490	28272240	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0679400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;protein_id=OsNip_06t0679400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28272327	28272653	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0679400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;protein_id=OsNip_06t0679400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28272327	28272930	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0679400-01;Name=OsNip_06t0679400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0679400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28285082	28285338	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0679700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28355294	28356313	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0680800-00;Name=OsNip_06t0680800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0680800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28425227	28425443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0681600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	28425303	28425424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0681600-03;Tag=IsoSeq:G11011.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G4987.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	28426960	28430241	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0681700;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28426960	28430241	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0681700-01;Parent=gene:OsNip_06g0681700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0681700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28455676	28456729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682666-01;Name=OsNip_06t0682666-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682666-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28455939	28456640	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0682666-01;Parent=transcript:OsNip_06t0682666-01;protein_id=OsNip_06t0682666-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28456641	28456729	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682666-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28453267	28454046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682700-00;Name=OsNip_06t0682700-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0682700-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28455676	28456249	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0682700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0682700-00;protein_id=OsNip_06t0682700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28456380	28456743	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682700-00;Name=OsNip_06t0682700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0682700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28456380	28456743	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0682700-00;Parent=transcript:OsNip_06t0682700-00;protein_id=OsNip_06t0682700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28457970	28458415	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28458971	28459167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28458971	28459167	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28459329	28459527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28459329	28459527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28459639	28459711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28459639	28459711	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28459843	28459940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28459843	28459940	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28460451	28460507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28460451	28460507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28460605	28460731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28460605	28460731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28461358	28461391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Name=OsNip_06t0682800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0682800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28461358	28461391	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28461493	28463098	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0682800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28469173	28470097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683000-02;Name=OsNip_06t0683000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0683000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28469820	28470097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28468217	28470075	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0683000-03;Parent=gene:OsNip_06g0683000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0683000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28468217	28468218	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683000-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28468217	28468240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683000-03;Name=OsNip_06t0683000-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0683000-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28468392	28469081	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683000-03;Name=OsNip_06t0683000-03-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0683000-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28496872	28497221	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28495505	28496831	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683925-00;Name=OsNip_06t0683925-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0683925-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28498729	28500528	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0683950-01;Parent=transcript:OsNip_06t0683950-01;protein_id=OsNip_06t0683950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28500529	28500582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0683950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	28504185	28508822	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0684000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28504190	28508808	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0684000-02;Parent=gene:OsNip_06g0684000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0684000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28504190	28504597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0684000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28508568	28508588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0684000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28508722	28508808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0684000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28589842	28589911	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0685700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0685700-01;protein_id=OsNip_06t0685700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28589842	28590205	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0685700-01;Name=OsNip_06t0685700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0685700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28617473	28617568	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28617569	28617946	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0686400-02;Parent=transcript:OsNip_06t0686400-02;protein_id=OsNip_06t0686400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28617947	28618958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28620001	28620310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686400-02;Name=OsNip_06t0686400-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0686400-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28620001	28620310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	28618932	28618958	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686400-03;Name=OsNip_06t0686400-03;exon_id=OsNip_06t0686400-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11029.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8653.4,Nipponbare.root_G6607.1,Nipponbare.leaf_G4995.1;prot_id "UniRef90_A0A1D6GTY0";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28621128	28621263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686550-00;Name=OsNip_06t0686550-00-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0686550-00-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28621351	28621434	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28642548	28643209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686900-01;Name=OsNip_06t0686900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0686900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28642959	28643209	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0686900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28643856	28647795	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0687000-00;Parent=gene:OsNip_06g0687000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0687000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28643856	28644139	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0687000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28643856	28645765	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0687000-00;Name=OsNip_06t0687000-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0687000-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28644140	28645765	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0687000-00;Parent=transcript:OsNip_06t0687000-00;protein_id=OsNip_06t0687000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28867535	28870804	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0692100-01;Parent=gene:OsNip_06g0692100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0692100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28867535	28867659	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0692100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28870804	28870804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0692100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28874838	28878068	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0692300-00;Parent=gene:OsNip_06g0692300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0692300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	28874838	28878068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0692300-00;Name=OsNip_06t0692300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0692300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28874838	28878068	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0692300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0692300-00;protein_id=OsNip_06t0692300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	28888959	28892150	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0692500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	28888959	28892150	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0692500-00;Parent=gene:OsNip_06g0692500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0692500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28978323	28978409	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0694100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0694100-02;protein_id=OsNip_06t0694100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28978543	28978680	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0694100-02;Parent=transcript:OsNip_06t0694100-02;protein_id=OsNip_06t0694100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28979431	28980053	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	28995903	28997357	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694600-00;Name=OsNip_06t0694600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0694600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	28995903	28997357	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0694600-00;Parent=transcript:OsNip_06t0694600-00;protein_id=OsNip_06t0694600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	29002202	29003541	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0694800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29002279	29002404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29002279	29002633	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;Name=OsNip_06t0694800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0694800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29002405	29002633	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;protein_id=OsNip_06t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29003110	29003450	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0694800-01;Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;protein_id=OsNip_06t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29003110	29003541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;Name=OsNip_06t0694800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0694800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29003451	29003541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	29002202	29003541	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0694800-02;Parent=gene:OsNip_06g0694800;transcript_id=OsNip_06t0694800-02;Tag=IsoSeq:G11053.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5007.6
Chr06	TAMA	exon	29003253	29003541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0694800-02;Name=OsNip_06t0694800-02;exon_id=OsNip_06t0694800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11053.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5007.6;prot_id "UniRef90_A0A0D9WTM0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29070300	29071754	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0695700-02;Tag=IsoSeq:G11057.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8671.1;prot_id "UniRef90_A0A6G1FFM1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29072361	29072649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29072650	29072901	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0695800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;protein_id=OsNip_06t0695800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29072999	29073186	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;Name=OsNip_06t0695800-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0695800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29072999	29073186	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0695800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;protein_id=OsNip_06t0695800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29075133	29075477	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;Name=OsNip_06t0695800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0695800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29075133	29075477	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0695800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;protein_id=OsNip_06t0695800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29075574	29075664	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0695800-02;Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;protein_id=OsNip_06t0695800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29075574	29075775	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0695800-02;Name=OsNip_06t0695800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0695800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29342410	29342600	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0698711-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	29411178	29411443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699600-02;Name=OsNip_06t0699600-02;exon_id=OsNip_06t0699600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G11074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5015.1,Nipponbare.panicle_G8685.2,Nipponbare.root_G6637.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3HIT2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	29407713	29407986	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699600-02;Tag=IsoSeq:G11074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5015.1,Nipponbare.panicle_G8685.2,Nipponbare.root_G6637.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3HIT2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29408248	29409847	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699600-02;Tag=IsoSeq:G11074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5015.1,Nipponbare.panicle_G8685.2,Nipponbare.root_G6637.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3HIT2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29410865	29411035	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699600-02;Tag=IsoSeq:G11074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5015.1,Nipponbare.panicle_G8685.2,Nipponbare.root_G6637.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3HIT2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29411178	29411443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699600-02;Tag=IsoSeq:G11074.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5015.1,Nipponbare.panicle_G8685.2,Nipponbare.root_G6637.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3HIT2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	29417421	29418950	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0699700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29417421	29418950	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0699700-01;Parent=gene:OsNip_06g0699700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0699700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29417421	29417421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29417421	29417884	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;Name=OsNip_06t0699700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0699700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29417422	29417884	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0699700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;protein_id=OsNip_06t0699700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29417982	29418517	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0699700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;protein_id=OsNip_06t0699700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29417982	29418950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;Name=OsNip_06t0699700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0699700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29418518	29418950	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	29419754	29422725	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0699800;biotype=protein_coding;description=ENTH/VHS;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29419754	29422725	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0699800-00;Parent=gene:OsNip_06g0699800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0699800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29419754	29420024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0699800-00;Name=OsNip_06t0699800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0699800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29661235	29661310	.	+	1	ID=CDS:OsNip_06t0702600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;protein_id=OsNip_06t0702600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29661414	29661543	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;Name=OsNip_06t0702600-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0702600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29661414	29661543	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0702600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;protein_id=OsNip_06t0702600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29661852	29662795	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;Name=OsNip_06t0702600-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0702600-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29661852	29662795	.	+	2	ID=CDS:OsNip_06t0702600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;protein_id=OsNip_06t0702600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29663306	29663725	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;Name=OsNip_06t0702600-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0702600-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29663306	29663725	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0702600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;protein_id=OsNip_06t0702600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29664240	29664430	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0702600-01;Name=OsNip_06t0702600-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0702600-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29760165	29760234	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0704600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;protein_id=OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29760336	29760419	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0704600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;protein_id=OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29760756	29760829	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0704600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;protein_id=OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29760915	29761026	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0704600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;protein_id=OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29761121	29761411	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0704600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;protein_id=OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29761121	29761418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;Name=OsNip_06t0704600-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0704600-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29761412	29761418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29761666	29761724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;Name=OsNip_06t0704600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0704600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29761666	29761724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0704600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29815954	29816743	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705600-00;Name=OsNip_06t0705600-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0705600-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29816623	29817158	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705600-01;Tag=IsoSeq:G11106.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8712.2;prot_id "UniRef90_J3LAF1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29824636	29824733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;Name=OsNip_06t0705901-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0705901-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29824636	29824733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29824844	29825130	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29825213	29825973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29825213	29826498	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;Name=OsNip_06t0705901-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0705901-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29825974	29826498	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0705901-00;Parent=transcript:OsNip_06t0705901-00;protein_id=OsNip_06t0705901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	gene	29828537	29831137	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g0706100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29828537	29831137	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0706100-00;Parent=gene:OsNip_06g0706100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0706100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29897280	29899109	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0707350-00;Parent=gene:OsNip_06g0707350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0707350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29906831	29907393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0707400-02;Name=OsNip_06t0707400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0707400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29966996	29967478	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708200-02;Name=OsNip_06t0708200-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0708200-01-E9;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29966996	29967478	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	exon	29961079	29961296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708200-03;Name=OsNip_06t0708200-03;exon_id=OsNip_06t0708200-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11113.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6660.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6RZ25";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	TAMA	exon	29961388	29961499	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708200-03;Name=OsNip_06t0708200-03;exon_id=OsNip_06t0708200-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11113.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6660.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6RZ25";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29975921	29976322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708500-02;Name=OsNip_06t0708500-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0708500-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	29976876	29977647	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-01;Name=OsNip_06t0708600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0708600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29976984	29977328	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0708600-01;Parent=transcript:OsNip_06t0708600-01;protein_id=OsNip_06t0708600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29977329	29977647	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	29976873	29977662	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0708600-02;Parent=gene:OsNip_06g0708600;transcript_id=OsNip_06t0708600-02;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3
Chr06	TAMA	exon	29976873	29976905	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;Name=OsNip_06t0708600-02;exon_id=OsNip_06t0708600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	29976875	29976905	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0708600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;protein_id=OsNip_06t0708600-02;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	exon	29977264	29977662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;Name=OsNip_06t0708600-02;exon_id=OsNip_06t0708600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	CDS	29977264	29977322	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0708600-02;Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;protein_id=OsNip_06t0708600-02;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	29976873	29976874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	29977326	29977662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708600-02;Tag=IsoSeq:G11117.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8721.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29978814	29980612	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0708700-03;Parent=gene:OsNip_06g0708700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0708700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29978814	29980212	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29978814	29980612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-03;Name=OsNip_06t0708700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0708700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29980213	29980548	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0708700-03;Parent=transcript:OsNip_06t0708700-03;protein_id=OsNip_06t0708700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29980549	29980612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	29978862	29981991	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0708700-01;Parent=gene:OsNip_06g0708700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29978862	29979780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29978862	29979955	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Name=OsNip_06t0708700-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0708700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29979781	29979955	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0708700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;protein_id=OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29980361	29980512	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Name=OsNip_06t0708700-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0708700-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29980361	29980512	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0708700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;protein_id=OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29980635	29980790	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Name=OsNip_06t0708700-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0708700-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29980635	29980790	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0708700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;protein_id=OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29980911	29981217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Name=OsNip_06t0708700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0708700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	29980911	29981217	.	-	1	ID=CDS:OsNip_06t0708700-01;Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;protein_id=OsNip_06t0708700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	29981312	29981428	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0708700-01;Name=OsNip_06t0708700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0708700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30062161	30062859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0710800-01;Name=OsNip_06t0710800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_06t0710800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30062280	30062859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0710800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30222656	30222774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0713300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30225297	30225744	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0713400-01;Name=OsNip_06t0713400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0713400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30225852	30226013	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0713400-01;Parent=transcript:OsNip_06t0713400-01;protein_id=OsNip_06t0713400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	30370627	30370679	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0715400-02;Tag=IsoSeq:G11156.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6687.3;prot_id "UniRef90_A0A2P6RLX3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30371037	30371156	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0715500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30422200	30422542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716200-01;Name=OsNip_06t0716200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0716200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30422357	30422542	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	30420333	30421077	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0716401-00;Parent=gene:OsNip_06g0716401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0716401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30420333	30421076	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0716401-00;Parent=transcript:OsNip_06t0716401-00;protein_id=OsNip_06t0716401-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30420333	30421077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716401-00;Name=OsNip_06t0716401-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0716401-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30421077	30421077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	30422607	30437970	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0716467-00;Parent=gene:OsNip_06g0716467;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0716467-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30422607	30422948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;Name=OsNip_06t0716467-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0716467-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30422607	30422948	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0716467-00;Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;protein_id=OsNip_06t0716467-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30423374	30423523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;Name=OsNip_06t0716467-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0716467-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30423374	30423523	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0716467-00;Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;protein_id=OsNip_06t0716467-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30434950	30435549	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0716467-00;Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;protein_id=OsNip_06t0716467-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30434950	30435802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;Name=OsNip_06t0716467-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0716467-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30435550	30435802	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0716467-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30479289	30479318	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0717300-00;Name=OsNip_06t0717300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0717300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30479289	30479318	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0717300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0717300-00;protein_id=OsNip_06t0717300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30480254	30480541	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0717300-00;Parent=transcript:OsNip_06t0717300-00;protein_id=OsNip_06t0717300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	30479345	30480798	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0717300-01;Parent=gene:OsNip_06g0717300;transcript_id=OsNip_06t0717300-01;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1
Chr06	TAMA	exon	30479345	30479482	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0717300-01;Name=OsNip_06t0717300-01;exon_id=OsNip_06t0717300-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1;prot_id "UniRef90_B6T1U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	30479347	30479482	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0717300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0717300-01;protein_id=OsNip_06t0717300-01;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1;prot_id "UniRef90_B6T1U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	TAMA	CDS	30480254	30480294	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0717300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0717300-01;protein_id=OsNip_06t0717300-01;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1;prot_id "UniRef90_B6T1U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	30479345	30479346	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0717300-01;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1;prot_id "UniRef90_B6T1U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	three_prime_UTR	30480298	30480798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0717300-01;Tag=IsoSeq:G11167.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6696.1,Nipponbare.leaf_G5061.1,Nipponbare.panicle_G8767.1;prot_id "UniRef90_B6T1U1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	30480738	30485250	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0717400;biotype=protein_coding;description=Pseudouridine;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	30480738	30485250	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0717400-01;Parent=gene:OsNip_06g0717400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0717400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30480738	30481377	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0717400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30591798	30592786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0720000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30589192	30589671	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0720000-01;Name=OsNip_06t0720000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0720000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	30602447	30602790	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0720400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	TAMA	three_prime_UTR	30602400	30602667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0720400-02;Tag=IsoSeq:G11173.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8773.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0DQ11";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr06	RAP2018-11-26	gene	30604118	30610503	.	-	.	ID=gene:OsNip_06g0720500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30767730	30768122	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724100-01;Name=OsNip_06t0724100-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0724100-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30773443	30773601	.	-	2	ID=CDS:OsNip_06t0724300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0724300-01;protein_id=OsNip_06t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30773693	30773711	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0724300-01;Parent=transcript:OsNip_06t0724300-01;protein_id=OsNip_06t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30773693	30773813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724300-01;Name=OsNip_06t0724300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0724300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30773712	30773813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	30770746	30773818	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0724300-02;Parent=gene:OsNip_06g0724300;transcript_id=OsNip_06t0724300-02;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2
Chr06	TAMA	exon	30773693	30773818	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;Name=OsNip_06t0724300-02;exon_id=OsNip_06t0724300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	CDS	30773693	30773817	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0724300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;protein_id=OsNip_06t0724300-02;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	30773443	30773601	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;Name=OsNip_06t0724300-02;exon_id=OsNip_06t0724300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	CDS	30773443	30773601	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0724300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;protein_id=OsNip_06t0724300-02;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	exon	30772919	30772990	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;Name=OsNip_06t0724300-02;exon_id=OsNip_06t0724300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr06	TAMA	CDS	30772987	30772990	.	-	.	ID=CDS:OsNip_06t0724300-02;Parent=transcript:OsNip_06t0724300-02;protein_id=OsNip_06t0724300-02;Tag=IsoSeq:G11178.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G8776.2,Nipponbare.root_G6702.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0AKD5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30855251	30855269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0725500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30855270	30856121	.	+	0	ID=CDS:OsNip_06t0725500-00;Parent=transcript:OsNip_06t0725500-00;protein_id=OsNip_06t0725500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	30855372	30859440	.	-	.	ID=transcript:OsNip_06t0725550-00;Parent=gene:OsNip_06g0725550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0725550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30855372	30855863	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0725550-00;Name=OsNip_06t0725550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_06t0725550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30855372	30855863	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0725550-00;Parent=transcript:OsNip_06t0725550-00;protein_id=OsNip_06t0725550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	CDS	30859064	30859369	.	-	0	ID=CDS:OsNip_06t0725550-00;Parent=transcript:OsNip_06t0725550-00;protein_id=OsNip_06t0725550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	30859064	30859440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0725550-00;Name=OsNip_06t0725550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0725550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30859370	30859440	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0725550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	gene	30858842	30859564	.	+	.	ID=gene:OsNip_06g072569A;Tag=IsoSeq:G11188
Chr06	TAMA	mRNA	30858842	30859564	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t072569A-01;Parent=gene:OsNip_06g072569A;transcript_id=OsNip_06t072569A-01;Tag=IsoSeq:G11188.1;Source=Nipponbare.panicle_G8784.1
Chr06	TAMA	exon	30858842	30859564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t072569A-01;Name=OsNip_06t072569A-01-E1;exon_id=OsNip_06t072569A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11188.1;Source=Nipponbare.panicle_G8784.1;prot_id "UniRef90_A2YH51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	CDS	30858844	30859269	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t072569A-01;Parent=transcript:OsNip_06t072569A-01;protein_id=OsNip_06t072569A-01;Tag=IsoSeq:G11188.1;Source=Nipponbare.panicle_G8784.1;prot_id "UniRef90_A2YH51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr06	TAMA	five_prime_UTR	30858842	30858843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t072569A-01;Tag=IsoSeq:G11188.1;Source=Nipponbare.panicle_G8784.1;prot_id "UniRef90_A2YH51";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30913212	30913463	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0726600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	30917940	30917986	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0726800-01;Name=OsNip_06t0726800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0726800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30917974	30917986	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0726800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30918712	30918862	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0726800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	30936553	30936612	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_06t0727000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	mRNA	30944198	30948067	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0727200-01;Parent=gene:OsNip_06g0727200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_06t0727200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	31119379	31119467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Name=OsNip_06t0730200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0730200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31119570	31119810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	31120027	31120105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Name=OsNip_06t0730200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0730200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31120027	31120105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	exon	31120221	31120365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Name=OsNip_06t0730200-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_06t0730200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	31120221	31120365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr06	TAMA	mRNA	31118735	31121868	.	+	.	ID=transcript:OsNip_06t0730200-02;Parent=gene:OsNip_06g0730200;transcript_id=OsNip_06t0730200-02;Tag=IsoSeq:G11210.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6721.5
Chr06	TAMA	exon	31118735	31119055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-02;Name=OsNip_06t0730200-02;exon_id=OsNip_06t0730200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11210.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6721.5;prot_id "UniRef90_J3MHV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	31118772	31119055	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0730200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0730200-02;protein_id=OsNip_06t0730200-02;Tag=IsoSeq:G11210.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6721.5;prot_id "UniRef90_J3MHV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	exon	31119145	31119224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730200-02;Name=OsNip_06t0730200-02;exon_id=OsNip_06t0730200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11210.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6721.5;prot_id "UniRef90_J3MHV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr06	TAMA	CDS	31119145	31119148	.	+	.	ID=CDS:OsNip_06t0730200-02;Parent=transcript:OsNip_06t0730200-02;protein_id=OsNip_06t0730200-02;Tag=IsoSeq:G11210.6;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6721.5;prot_id "UniRef90_J3MHV8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr06	RAP2018-11-26	exon	31135528	31135752	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_06t0730500-01;Name=OsNip_06t0730500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_06t0730500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	236595	237104	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0104100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0104100-01;protein_id=OsNip_07t0104100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	237105	237329	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	235903	236252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-02;Name=OsNip_07t0104100-02;exon_id=OsNip_07t0104100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11244.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6740.2;prot_id "UniRef90_C5Z1J0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	exon	236328	237448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-02;Name=OsNip_07t0104100-02;exon_id=OsNip_07t0104100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11244.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6740.2;prot_id "UniRef90_C5Z1J0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	235903	236252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-02;Tag=IsoSeq:G11244.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6740.2;prot_id "UniRef90_C5Z1J0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	236328	237126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-02;Tag=IsoSeq:G11244.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6740.2;prot_id "UniRef90_C5Z1J0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	237277	237448	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104100-02;Tag=IsoSeq:G11244.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G6740.2;prot_id "UniRef90_C5Z1J0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	240466	240945	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0104233;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	240466	240552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0104233-00;Name=OsNip_07t0104233-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0104233-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	306082	306083	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0105600-02;Tag=IsoSeq:G11250.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5093.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	306441	306442	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0105600-02;Tag=IsoSeq:G11250.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5093.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	306444	306981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0105600-02;Tag=IsoSeq:G11250.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5093.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	307038	311943	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0105700-01;Parent=gene:OsNip_07g0105700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0105700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	307038	307383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0105700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	307038	307551	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0105700-01;Name=OsNip_07t0105700-01-E16;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0105700-01-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	404954	405708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0107366-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	gene	412701	413625	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g010758A;Tag=IsoSeq:G11260
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Chr07	RAP2018-11-26	gene	689982	690619	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0112300;biotype=protein_coding;description=3'-5';Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	gene	697413	698927	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0112600;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	697413	697518	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	697413	698927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112600-01;Name=OsNip_07t0112600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0112600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	697684	698927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	697742	698662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t011269A-01;Name=OsNip_07t011269A-01-E1;exon_id=OsNip_07t011269A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11285.1;Source=Nipponbare.root_G6766.1;prot_id "UniRef90_A2XS32";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	697742	698286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t011269A-01;Tag=IsoSeq:G11285.1;Source=Nipponbare.root_G6766.1;prot_id "UniRef90_A2XS32";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	698644	698662	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t011269A-01;Tag=IsoSeq:G11285.1;Source=Nipponbare.root_G6766.1;prot_id "UniRef90_A2XS32";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	699881	700826	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0112700;Name=OsNip_ENODL19;biotype=protein_coding;description=Cupredoxin;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	699881	700826	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0112700-01;Parent=gene:OsNip_07g0112700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0112700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	699881	700092	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	699881	700460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;Name=OsNip_07t0112700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0112700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	700093	700460	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0112700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;protein_id=OsNip_07t0112700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	700549	700717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0112700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;protein_id=OsNip_07t0112700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	700549	700826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;Name=OsNip_07t0112700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0112700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	700718	700826	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	703009	705502	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0112800-01;Parent=gene:OsNip_07g0112800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	703009	703061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112800-01;Name=OsNip_07t0112800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0112800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	703009	703061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	703192	703222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	703223	703348	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0112800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0112800-01;protein_id=OsNip_07t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1012774	1012774	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0118900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	1012774	1012948	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0118900-02;Name=OsNip_07t0118900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0118900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	1202595	1202945	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0123400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0123400-01;protein_id=OsNip_07t0123400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	1432684	1433404	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0127500-01;Parent=gene:OsNip_07g0127500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0127500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	1432754	1433272	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0127500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0127500-01;protein_id=OsNip_07t0127500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1433273	1433404	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0127500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	1669513	1671074	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0131725-00;Parent=gene:OsNip_07g0131725;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0131725-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1671045	1671074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0131725-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1755897	1756075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0133100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	1863312	1863404	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0134800-04;Parent=transcript:OsNip_07t0134800-04;protein_id=OsNip_07t0134800-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	1863497	1863565	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0134800-04;Parent=transcript:OsNip_07t0134800-04;protein_id=OsNip_07t0134800-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	1863497	1863567	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0134800-04;Name=OsNip_07t0134800-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0134800-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1860739	1860926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0134800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	2455405	2455636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0147500-01;Name=OsNip_07t0147500-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0147500-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	2455481	2455636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0147500-02;Tag=IsoSeq:G11360.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8914.2;prot_id "UniRef90_A0A446WR59";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	exon	2546467	2547413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0148900-02;Name=OsNip_07t0148900-02;exon_id=OsNip_07t0148900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11366.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8919.5;prot_id "UniRef90_A0A1Q3C883";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	2546467	2546467	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0148900-02;Tag=IsoSeq:G11366.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8919.5;prot_id "UniRef90_A0A1Q3C883";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	2546663	2547413	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0148900-02;Tag=IsoSeq:G11366.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8919.5;prot_id "UniRef90_A0A1Q3C883";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	2569102	2570516	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149250-01;Name=OsNip_07t0149250-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0149250-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	2569534	2569654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149300-00;Name=OsNip_07t0149300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0149300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	2569794	2569858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149300-00;Name=OsNip_07t0149300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0149300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2569794	2569858	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0149300-00;Parent=transcript:OsNip_07t0149300-00;protein_id=OsNip_07t0149300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2570458	2570553	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149300-00;Name=OsNip_07t0149300-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0149300-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2570458	2570553	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0149300-00;Parent=transcript:OsNip_07t0149300-00;protein_id=OsNip_07t0149300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	2595756	2599060	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0149900;biotype=protein_coding;description=X8;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	2595756	2599060	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0149900-01;Parent=gene:OsNip_07g0149900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2595756	2595924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2595756	2596024	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Name=OsNip_07t0149900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0149900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2595925	2596024	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0149900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;protein_id=OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2596116	2596146	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Name=OsNip_07t0149900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0149900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2596116	2596146	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0149900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;protein_id=OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2596247	2596589	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0149900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;protein_id=OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2596247	2596591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Name=OsNip_07t0149900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0149900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2596590	2596591	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2598742	2599060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Name=OsNip_07t0149900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0149900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2598742	2599060	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0149900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	2601216	2606217	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0150100;Name=OsNip_OSCA3.1;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	2601216	2606217	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0150100-01;Parent=gene:OsNip_07g0150100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2601216	2601582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2601216	2601963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Name=OsNip_07t0150100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0150100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2601583	2601963	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;protein_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2602193	2602448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Name=OsNip_07t0150100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0150100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2602193	2602448	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;protein_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2602556	2603400	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;protein_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2603529	2603804	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;protein_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2604626	2604789	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Name=OsNip_07t0150100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0150100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2604626	2604789	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0150100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;protein_id=OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	2605772	2606217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Name=OsNip_07t0150100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0150100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2606046	2606217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	2613935	2616323	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0150200-01;Parent=gene:OsNip_07g0150200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2613935	2613990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;Name=OsNip_07t0150200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0150200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2613935	2613990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2614084	2614126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2614961	2615246	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;protein_id=OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2615891	2615956	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;protein_id=OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2616047	2616106	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0150200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;protein_id=OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2616047	2616323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;Name=OsNip_07t0150200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0150200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2616107	2616323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0150200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	2634435	2640489	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0150500;biotype=protein_coding;description=Zinc;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	2634435	2640489	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0150500-01;Parent=gene:OsNip_07g0150500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0150500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	2800871	2801059	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0152900-04;Parent=transcript:OsNip_07t0152900-04;protein_id=OsNip_07t0152900-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	2800871	2801322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0152900-04;Name=OsNip_07t0152900-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0152900-01-E12;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2801060	2801322	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0152900-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	2797948	2798781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0152900-05;Name=OsNip_07t0152900-05;exon_id=OsNip_07t0152900-05-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11375.7;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5150.3;prot_id "UniRef90_A0A397ZDM0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3957966	3959527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0175300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	3957966	3960638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0175300-01;Name=OsNip_07t0175300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0175300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	3959528	3960145	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0175300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0175300-01;protein_id=OsNip_07t0175300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3960146	3960638	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0175300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	3959532	3960639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0175300-02;Name=OsNip_07t0175300-02;exon_id=OsNip_07t0175300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11451.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G8990.1;prot_id "UniRef90_A0A287MXN7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4089316	4091202	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0177300-02;Tag=IsoSeq:G11459.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G6864.2;prot_id "UniRef90_A0A287MJH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4122889	4123109	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0178100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0178100-01;protein_id=OsNip_07t0178100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4122889	4123587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0178100-01;Name=OsNip_07t0178100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0178100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4306546	4307513	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0181500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4483933	4484756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0184800-01;Name=OsNip_07t0184800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0184800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4484527	4484756	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0184800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4490192	4490320	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0184900-04;Parent=transcript:OsNip_07t0184900-04;protein_id=OsNip_07t0184900-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4721767	4721946	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0188233-01;Parent=transcript:OsNip_07t0188233-01;protein_id=OsNip_07t0188233-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4721947	4722675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188233-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	4721907	4724596	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0188233-02;Parent=gene:OsNip_07g0188233;transcript_id=OsNip_07t0188233-02;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2
Chr07	TAMA	exon	4721907	4721938	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188233-02;Name=OsNip_07t0188233-02;exon_id=OsNip_07t0188233-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0JNZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	CDS	4721909	4721938	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0188233-02;Parent=transcript:OsNip_07t0188233-02;protein_id=OsNip_07t0188233-02;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0JNZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	exon	4722048	4722106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188233-02;Name=OsNip_07t0188233-02;exon_id=OsNip_07t0188233-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0JNZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4724255	4724295	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188233-02;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0JNZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4724365	4724596	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188233-02;Tag=IsoSeq:G11499.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5214.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0JNZ8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4725288	4725583	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188249-00;Name=OsNip_07t0188249-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0188249-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	4725715	4726845	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0188266-00;Parent=gene:OsNip_07g0188266;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0188266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4725715	4726224	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188266-00;Name=OsNip_07t0188266-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0188266-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4732496	4733459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-01;Name=OsNip_07t0188700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0188700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4729469	4729705	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4729469	4730269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;Name=OsNip_07t0188700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0188700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4731444	4731667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;Name=OsNip_07t0188700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0188700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4731444	4731667	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0188700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;protein_id=OsNip_07t0188700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4731809	4732274	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0188700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;protein_id=OsNip_07t0188700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4731809	4732383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;Name=OsNip_07t0188700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0188700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4732275	4732383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4729587	4729705	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4729587	4730269	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;Name=OsNip_07t0188700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0188700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4729706	4730269	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0188700-03;Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;protein_id=OsNip_07t0188700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4731444	4731571	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;Name=OsNip_07t0188700-03-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0188700-03-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4731444	4731571	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0188700-03;Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;protein_id=OsNip_07t0188700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4732873	4733179	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0188700-03;Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;protein_id=OsNip_07t0188700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4732873	4733531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;Name=OsNip_07t0188700-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0188700-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4733180	4733531	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	4731806	4733152	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0188750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	4731806	4733152	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0188750-00;Parent=gene:OsNip_07g0188750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0188750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4731806	4732139	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0188750-00;Name=OsNip_07t0188750-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0188750-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4863214	4863331	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0190400-00;Parent=transcript:OsNip_07t0190400-00;protein_id=OsNip_07t0190400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4863509	4864110	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0190400-00;Parent=transcript:OsNip_07t0190400-00;protein_id=OsNip_07t0190400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	4868011	4877912	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0190600;biotype=protein_coding;description=Domain;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4980431	4981651	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-01;Name=OsNip_07t0192300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0192300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4980619	4981651	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	4980431	4980609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Name=OsNip_07t0192300-02;exon_id=OsNip_07t0192300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	exon	4978008	4978404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Name=OsNip_07t0192300-02;exon_id=OsNip_07t0192300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	4981649	4981649	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4981433	4981472	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4980431	4980609	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4978008	4978404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192300-02;Tag=IsoSeq:G11512.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5221.1,Nipponbare.panicle_G9043.2,Nipponbare.root_G6892.1;prot_id "UniRef90_C5XP90";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	4986843	4987429	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192400-01;Name=OsNip_07t0192400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0192400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	4998776	5000689	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t019254A-01;Name=OsNip_07t019254A-01-E1;exon_id=OsNip_07t019254A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11513.1;Source=Nipponbare.root_G6893.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3IDJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	4998776	4998777	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t019254A-01;Tag=IsoSeq:G11513.1;Source=Nipponbare.root_G6893.1;prot_id "UniRef90_A0A0Q3IDJ6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	exon	4998779	5000463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t019254A-02;Name=OsNip_07t019254A-02-E1;exon_id=OsNip_07t019254A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11513.2;Source=Nipponbare.root_G6893.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	4998779	4998780	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t019254A-02;Tag=IsoSeq:G11513.2;Source=Nipponbare.root_G6893.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	4998838	5000463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t019254A-02;Tag=IsoSeq:G11513.2;Source=Nipponbare.root_G6893.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	4999115	5000023	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0192550-00;Parent=gene:OsNip_07g0192550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0192550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4999115	4999444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192550-00;Name=OsNip_07t0192550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0192550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4999115	4999444	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0192550-00;Parent=transcript:OsNip_07t0192550-00;protein_id=OsNip_07t0192550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	4999739	5000023	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192550-00;Name=OsNip_07t0192550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0192550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	4999739	5000023	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0192550-00;Parent=transcript:OsNip_07t0192550-00;protein_id=OsNip_07t0192550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5003872	5003916	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5003872	5005726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0192700-01;Name=OsNip_07t0192700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0192700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5434983	5435137	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0200500-00;Parent=transcript:OsNip_07t0200500-00;protein_id=OsNip_07t0200500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5435824	5436147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0200500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5555810	5556046	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0203300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;protein_id=OsNip_07t0203300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5556119	5556202	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;Name=OsNip_07t0203300-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0203300-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5556119	5556202	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0203300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;protein_id=OsNip_07t0203300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5556639	5556746	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0203300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;protein_id=OsNip_07t0203300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5556639	5557133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;Name=OsNip_07t0203300-01-E12;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0203300-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5556747	5557133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0203300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	5565331	5566233	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0203500-01;Parent=gene:OsNip_07g0203500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0203500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5565331	5565487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0203500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5622358	5622452	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0204500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0204500-01;protein_id=OsNip_07t0204500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5623469	5623623	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0204500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0204500-01;protein_id=OsNip_07t0204500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5623469	5623660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0204500-01;Name=OsNip_07t0204500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0204500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5623624	5623660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0204500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	5667329	5667669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205200-02;Name=OsNip_07t0205200-02-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205200-02-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5667329	5667669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	5662263	5662353	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205350-00;Name=OsNip_07t0205350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5662729	5662865	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205350-00;Name=OsNip_07t0205350-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205350-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	5664853	5665021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205350-00;Name=OsNip_07t0205350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	5682013	5682428	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205500-01;Name=OsNip_07t0205500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5683023	5683109	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0205500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0205500-01;protein_id=OsNip_07t0205500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	5684583	5685265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205500-01;Name=OsNip_07t0205500-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0205500-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5684961	5685265	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	5682196	5685233	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0205600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	5682196	5685233	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0205600-00;Parent=gene:OsNip_07g0205600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5682196	5682443	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Name=OsNip_07t0205600-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205600-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5682196	5682443	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5683172	5683502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Name=OsNip_07t0205600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5683172	5683502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5683610	5683780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Name=OsNip_07t0205600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0205600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5683610	5683780	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5684120	5684292	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5684120	5684305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Name=OsNip_07t0205600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0205600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5684293	5684305	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0205600-00;Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;protein_id=OsNip_07t0205600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	5684581	5684977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0205600-00;Name=OsNip_07t0205600-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0205600-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	5751587	5751684	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0206700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0206700-02;protein_id=OsNip_07t0206700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5893620	5893832	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0209201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	6233571	6233811	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0213400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0213400-01;protein_id=OsNip_07t0213400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	6233911	6234546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0213400-01;Name=OsNip_07t0213400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0213400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6234272	6234546	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0213400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	6232598	6232741	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0213400-02;Name=OsNip_07t0213400-02;exon_id=OsNip_07t0213400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11568.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5241.2;prot_id "UniRef90_A0A5J9U0Q3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7739116	7739308	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0239200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	7742969	7746758	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0239400-01;Parent=gene:OsNip_07g0239400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0239400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	7904750	7904992	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0241600-00;Parent=transcript:OsNip_07t0241600-00;protein_id=OsNip_07t0241600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	7905050	7905518	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0241700-00;Parent=transcript:OsNip_07t0241700-00;protein_id=OsNip_07t0241700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	7908519	7909408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0241700-00;Name=OsNip_07t0241700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0241700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	7908519	7909408	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0241700-00;Parent=transcript:OsNip_07t0241700-00;protein_id=OsNip_07t0241700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8192199	8192577	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	8191725	8192576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247000-03;Name=OsNip_07t0247000-03;exon_id=OsNip_07t0247000-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11625.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9136.5;prot_id "UniRef90_B4FCV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	CDS	8191725	8192192	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0247000-03;Parent=transcript:OsNip_07t0247000-03;protein_id=OsNip_07t0247000-03;Tag=IsoSeq:G11625.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9136.5;prot_id "UniRef90_B4FCV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	8191069	8191069	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247000-03;Tag=IsoSeq:G11625.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9136.5;prot_id "UniRef90_B4FCV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	8192196	8192576	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247000-03;Tag=IsoSeq:G11625.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9136.5;prot_id "UniRef90_B4FCV9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8194024	8199881	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0247100-01;Parent=gene:OsNip_07g0247100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8194024	8194037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8194024	8194317	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8194038	8194317	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8194960	8195135	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8194960	8195135	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8195210	8195330	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8195210	8195330	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8196477	8196601	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8196477	8196601	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8198123	8198251	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8198123	8198251	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8198335	8198505	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8198335	8198505	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8199512	8199583	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0247100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;protein_id=OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8199512	8199881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Name=OsNip_07t0247100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0247100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8199584	8199881	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8202694	8202766	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0247201-00;Parent=gene:OsNip_07g0247201;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_07t0247201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8202694	8202766	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0247201-00;Name=OsNip_07t0247201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0247201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	8227001	8232024	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0248100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8227001	8232024	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0248100-01;Parent=gene:OsNip_07g0248100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0248100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8227001	8230621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8227001	8232024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248100-01;Name=OsNip_07t0248100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0248100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8230622	8231344	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0248100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0248100-01;protein_id=OsNip_07t0248100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8231345	8232024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8238762	8239871	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0248150-00;Parent=gene:OsNip_07g0248150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0248150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8238762	8239871	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248150-00;Name=OsNip_07t0248150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0248150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8238762	8239871	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0248150-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248150-00;protein_id=OsNip_07t0248150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	8240430	8241373	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0248275;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8240430	8241373	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0248275-00;Parent=gene:OsNip_07g0248275;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0248275-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8240430	8240604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248275-00;Name=OsNip_07t0248275-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0248275-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8240430	8240604	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0248275-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248275-00;protein_id=OsNip_07t0248275-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8241125	8241243	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0248275-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248275-00;protein_id=OsNip_07t0248275-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8241125	8241373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248275-00;Name=OsNip_07t0248275-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0248275-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8241244	8241373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248275-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	8240431	8241373	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0248350;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8240431	8241373	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0248350-00;Parent=gene:OsNip_07g0248350;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8240431	8240548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8240431	8240665	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;Name=OsNip_07t0248350-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0248350-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8240549	8240665	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0248350-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;protein_id=OsNip_07t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8241176	8241352	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0248350-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;protein_id=OsNip_07t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8241176	8241373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;Name=OsNip_07t0248350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0248350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8241353	8241373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	8248489	8258077	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0248550-00;Parent=gene:OsNip_07g0248550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0248550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8248489	8248856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	8248489	8249352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0248550-00;Name=OsNip_07t0248550-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0248550-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8248857	8249352	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0248550-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248550-00;protein_id=OsNip_07t0248550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	8249953	8249975	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0248550-00;Parent=transcript:OsNip_07t0248550-00;protein_id=OsNip_07t0248550-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	10176990	10177055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0273900-02;Tag=IsoSeq:G11664.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9161.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5F2P0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	10180484	10180727	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0274100-02;Name=OsNip_07t0274100-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0274100-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11171285	11171444	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0289050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11176426	11176471	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0289050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	13311708	13311887	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418150-01;Name=OsNip_07t0418150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0418150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	13313597	13316522	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0418200-01;Parent=gene:OsNip_07g0418200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0418200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13313597	13313598	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13313597	13313723	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;Name=OsNip_07t0418200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0418200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13313599	13313723	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0418200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;protein_id=OsNip_07t0418200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13314572	13315211	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;Name=OsNip_07t0418200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0418200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13314572	13315211	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0418200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;protein_id=OsNip_07t0418200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	13316186	13316522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;Name=OsNip_07t0418200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0418200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13316303	13316522	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0418200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	13323931	13326242	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0418500;Name=OsNip_CYP709C9;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	13323931	13326229	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0418500-01;Parent=gene:OsNip_07g0418500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0418500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	13382831	13383316	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419000-00;Name=OsNip_07t0419000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0419000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	gene	13383377	13383987	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0419100;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13383725	13383987	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0419100-00;Parent=transcript:OsNip_07t0419100-00;protein_id=OsNip_07t0419100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	13384934	13386043	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0419200;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13385892	13386043	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	13388826	13392088	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0419300-01;Parent=gene:OsNip_07g0419300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0419300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13388826	13388859	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13388860	13388929	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0419300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419300-01;protein_id=OsNip_07t0419300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13391142	13391902	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0419300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419300-01;protein_id=OsNip_07t0419300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13391142	13392088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419300-01;Name=OsNip_07t0419300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0419300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13391903	13392088	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	13391139	13391894	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419400-00;Name=OsNip_07t0419400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0419400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	13399139	13411985	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0419500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	13399139	13411985	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0419500-01;Parent=gene:OsNip_07g0419500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13399139	13399262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13399139	13399311	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;Name=OsNip_07t0419500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0419500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13399263	13399311	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0419500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;protein_id=OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13400407	13400573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;Name=OsNip_07t0419500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0419500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13400407	13400573	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0419500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;protein_id=OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13402210	13402452	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;Name=OsNip_07t0419500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0419500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13402210	13402452	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0419500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;protein_id=OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13405035	13405146	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;Name=OsNip_07t0419500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0419500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13405035	13405146	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0419500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0419500-01;protein_id=OsNip_07t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	13444023	13444250	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0420000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0420000-01;protein_id=OsNip_07t0420000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13597296	13597446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0421932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13597533	13598042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0421932-00;Name=OsNip_07t0421932-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0421932-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13597533	13598042	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0421932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	13598656	13598805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0421932-00;Name=OsNip_07t0421932-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0421932-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13598656	13598805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0421932-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	13602730	13604607	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0422000;Name=FLL2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14676410	14676707	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0437500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	15056537	15056654	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0443700-00;Parent=transcript:OsNip_07t0443700-00;protein_id=OsNip_07t0443700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15056655	15057070	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0443700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16003234	16003262	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0458800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16036836	16036840	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0459500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16306868	16307038	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0463400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0463400-01;protein_id=OsNip_07t0463400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16306868	16307421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0463400-01;Name=OsNip_07t0463400-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0463400-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16307039	16307421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0463400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	16302997	16303572	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0463400-02;Name=OsNip_07t0463400-02;exon_id=OsNip_07t0463400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11789.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5339.1,Nipponbare.panicle_G9250.2,Nipponbare.root_G7027.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8K5E0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16512607	16512675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0466200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	16512998	16513147	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0466200-01;Name=OsNip_07t0466200-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0466200-02-E2;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16513113	16513147	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0466200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0466200-01;protein_id=OsNip_07t0466200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16513242	16513374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0466200-01;Name=OsNip_07t0466200-02-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0466200-02-E3;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16513242	16513374	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0466200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0466200-01;protein_id=OsNip_07t0466200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16733252	16733293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0468900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16734528	16735144	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0468900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16735712	16735712	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0468900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16815629	16816507	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0470400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16816799	16816839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0470400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16857578	16857633	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0470700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0470700-01;protein_id=OsNip_07t0470700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16858236	16858310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0470700-01;Name=OsNip_07t0470700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0470700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16858236	16858310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0470700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0470700-01;protein_id=OsNip_07t0470700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16883793	16886934	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0471050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16883793	16887883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0471050-01;Name=OsNip_07t0471050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0471050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16887307	16887883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0471050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	16886901	16890362	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0471100;Name=OsNip_SET26;biotype=protein_coding;description=SET;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	16886901	16890362	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0471100-01;Parent=gene:OsNip_07g0471100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0471100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16957446	16957697	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0472300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;protein_id=OsNip_07t0472300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16957782	16957904	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0472300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;protein_id=OsNip_07t0472300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16958003	16959572	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0472300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;protein_id=OsNip_07t0472300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16958003	16959615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;Name=OsNip_07t0472300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0472300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16959573	16959615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16960376	16960436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;Name=OsNip_07t0472300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0472300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16960376	16960436	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	16965300	16969961	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0472400;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	16966933	16969895	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0472400-01;Parent=gene:OsNip_07g0472400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0472400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16966933	16966933	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16966933	16967275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;Name=OsNip_07t0472400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0472400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16966934	16967275	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0472400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;protein_id=OsNip_07t0472400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	16968245	16968292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;Name=OsNip_07t0472400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0472400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16968245	16968292	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0472400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;protein_id=OsNip_07t0472400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	16968374	16969615	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0472400-01;Parent=transcript:OsNip_07t0472400-01;protein_id=OsNip_07t0472400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17186673	17186786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0475700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	17186787	17187149	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0475700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0475700-01;protein_id=OsNip_07t0475700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17187150	17187640	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0475700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	17195348	17196977	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0475800-01;Parent=gene:OsNip_07g0475800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0475800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17195348	17195597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0475800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	17195348	17196478	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0475800-01;Name=OsNip_07t0475800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0475800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	17851928	17852159	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0485600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0485600-01;protein_id=OsNip_07t0485600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	17851928	17852160	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0485600-01;Name=OsNip_07t0485600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0485600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	17867052	17867971	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0485950-01;Name=OsNip_07t0485950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0485950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	17870561	17880263	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0486000;Name=OsNip_MSH4;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	17887563	17887798	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0486100-01;Name=OsNip_07t0486100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0486100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17991463	17991963	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0487198-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	17987936	17988235	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0487300-00;Parent=transcript:OsNip_07t0487300-00;protein_id=OsNip_07t0487300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	17988503	17988653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0487300-00;Name=OsNip_07t0487300-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0487300-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	17988503	17988653	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0487300-00;Parent=transcript:OsNip_07t0487300-00;protein_id=OsNip_07t0487300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	18536473	18536502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0495300-00;Name=OsNip_07t0495300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0495300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18603409	18603414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0496401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	18812310	18813757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0499900-01;Name=OsNip_07t0499900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0499900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18813711	18813757	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0499900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	18840251	18842537	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0500300-01;Parent=gene:OsNip_07g0500300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0500300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18840251	18840310	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0500300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	18841880	18842537	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0500300-01;Name=OsNip_07t0500300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0500300-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	CDS	18840253	18840448	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0500300-02;Parent=transcript:OsNip_07t0500300-02;protein_id=OsNip_07t0500300-02;Tag=IsoSeq:G11869.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9315.2;prot_id "UniRef90_F2E5L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	18841880	18842423	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0500300-02;Tag=IsoSeq:G11869.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9315.2;prot_id "UniRef90_F2E5L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18853498	18853503	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0500951-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	18873790	18875926	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0501100;Name=CHS;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	18873790	18875926	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0501100-01;Parent=gene:OsNip_07g0501100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0501100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	18875539	18875926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0501100-01;Name=OsNip_07t0501100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0501100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18875762	18875926	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0501100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	19593344	19594582	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0511900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0511900-01;protein_id=OsNip_07t0511900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19594583	19595214	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0511900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	19593032	19593362	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0511900-02;Tag=IsoSeq:G11902.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9343.2;prot_id "UniRef90_A0A426Z909";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	19593630	19595181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0511900-02;Tag=IsoSeq:G11902.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9343.2;prot_id "UniRef90_A0A426Z909";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	19598507	19598675	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0512000-01;Name=OsNip_07t0512000-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0512000-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19614348	19614656	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0512100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19672733	19672837	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0513200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	19682653	19683439	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0513200-01;Name=OsNip_07t0513200-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0513200-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	19682151	19682232	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t051339A-01;Tag=IsoSeq:G11907.1;Source=Nipponbare.leaf_G5399.1;prot_id "UniRef90_Q8LNP8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	19924380	19924599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0516900-03;Name=OsNip_07t0516900-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0516900-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19924383	19924599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0516900-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20053523	20054019	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0519300-01;Name=OsNip_07t0519300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0519300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	20109262	20109699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0520600-03;Tag=IsoSeq:G11923.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7106.1;prot_id "UniRef90_A0A7I8L8M8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20114596	20115182	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0520800-01;Name=OsNip_07t0520800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0520800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	20347149	20347226	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0524100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0524100-01;protein_id=OsNip_07t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	20347314	20347391	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0524100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0524100-01;protein_id=OsNip_07t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	20347314	20347644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0524100-01;Name=OsNip_07t0524100-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0524100-01-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20347392	20347644	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0524100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	20341009	20341280	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0524100-02;Name=OsNip_07t0524100-02;exon_id=OsNip_07t0524100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11934.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9366.1;prot_id "UniRef90_A0A6N2MEI5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20418158	20418589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0525400-01;Name=OsNip_07t0525400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0525400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20617855	20617963	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0527750-00;Name=OsNip_07t0527750-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0527750-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20625092	20625171	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0527900-00;Name=OsNip_07t0527900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0527900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	20640488	20647709	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0528200-00;Parent=gene:OsNip_07g0528200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0528200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20640488	20640592	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0528200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20641467	20641781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0528200-00;Name=OsNip_07t0528200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0528200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	CDS	20724581	20724847	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0529600-03;Parent=transcript:OsNip_07t0529600-03;protein_id=OsNip_07t0529600-03;Tag=IsoSeq:G11942.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5414.8;prot_id "UniRef90_A0A5B7B709";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	exon	20725723	20726052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0529600-03;Name=OsNip_07t0529600-03;exon_id=OsNip_07t0529600-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G11942.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5414.8;prot_id "UniRef90_A0A5B7B709";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	20724851	20725018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0529600-03;Tag=IsoSeq:G11942.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5414.8;prot_id "UniRef90_A0A5B7B709";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	20725723	20726052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0529600-03;Tag=IsoSeq:G11942.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5414.8;prot_id "UniRef90_A0A5B7B709";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	20729432	20731215	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0529700-01;Parent=gene:OsNip_07g0529700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	20729526	20729736	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0529700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0529700-01;protein_id=OsNip_07t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	20729815	20729933	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0529700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0529700-01;protein_id=OsNip_07t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	20729815	20731215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0529700-01;Name=OsNip_07t0529700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0529700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20729934	20731215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0529700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20771100	20771529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0530700-02;Name=OsNip_07t0530700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0530700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	20804833	20805360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0531400-02;Name=OsNip_07t0531400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0531400-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20807382	20807495	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0531500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	20808096	20812480	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0531600;biotype=protein_coding;description=Phospholipid/glycerol;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	21049086	21050483	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0535800-02;Tag=IsoSeq:G11963.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7130.3;prot_id "UniRef90_A0A3L6T619";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	21086087	21086730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0536800-00;Name=OsNip_07t0536800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0536800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	21104462	21105276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0536966-00;Name=OsNip_07t0536966-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0536966-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21105276	21105276	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0536966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	21104509	21109991	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0537000-01;Parent=gene:OsNip_07g0537000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0537000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21109136	21109286	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0537000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0537000-01;protein_id=OsNip_07t0537000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21109389	21109673	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0537000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0537000-01;protein_id=OsNip_07t0537000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21109389	21109726	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0537000-01;Name=OsNip_07t0537000-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0537000-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	21244761	21245039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539400-01;Tag=IsoSeq:G11969.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7136.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	21265863	21269388	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0539700-01;Parent=gene:OsNip_07g0539700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0539700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21265863	21266041	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21265863	21266490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539700-01;Name=OsNip_07t0539700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0539700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	21280695	21280949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539900-02;Name=OsNip_07t0539900-02;exon_id=OsNip_07t0539900-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G11970.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9388.1,Nipponbare.root_G7137.1,Nipponbare.leaf_G5423.1;prot_id "UniRef90_J3MLP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	exon	21280321	21280549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539900-02;Name=OsNip_07t0539900-02;exon_id=OsNip_07t0539900-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G11970.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9388.1,Nipponbare.root_G7137.1,Nipponbare.leaf_G5423.1;prot_id "UniRef90_J3MLP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	21282634	21282635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539900-02;Tag=IsoSeq:G11970.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9388.1,Nipponbare.root_G7137.1,Nipponbare.leaf_G5423.1;prot_id "UniRef90_J3MLP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	21281048	21282325	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539900-02;Tag=IsoSeq:G11970.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9388.1,Nipponbare.root_G7137.1,Nipponbare.leaf_G5423.1;prot_id "UniRef90_J3MLP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	21280695	21280949	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539900-02;Tag=IsoSeq:G11970.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9388.1,Nipponbare.root_G7137.1,Nipponbare.leaf_G5423.1;prot_id "UniRef90_J3MLP2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21291968	21292479	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21291968	21292934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539950-01;Name=OsNip_07t0539950-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0539950-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21292723	21292934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0539950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	21293128	21294251	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0540000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	21293128	21294251	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0540000-00;Parent=gene:OsNip_07g0540000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21293128	21294192	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0540000-00;Parent=transcript:OsNip_07t0540000-00;protein_id=OsNip_07t0540000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21293128	21294251	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540000-00;Name=OsNip_07t0540000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0540000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	21295200	21299576	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0540100-01;Parent=gene:OsNip_07g0540100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21295200	21295461	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	21295915	21296065	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Name=OsNip_07t0540100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0540100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	21296496	21296706	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Name=OsNip_07t0540100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0540100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21296496	21296706	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0540100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;protein_id=OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21296793	21296923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Name=OsNip_07t0540100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0540100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21296793	21296923	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0540100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;protein_id=OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21297018	21297158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Name=OsNip_07t0540100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0540100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21297018	21297158	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0540100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;protein_id=OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	21298625	21299492	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0540100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;protein_id=OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	21298625	21299576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Name=OsNip_07t0540100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0540100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21299493	21299576	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	21295200	21299573	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0540100-02;Parent=gene:OsNip_07g0540100;transcript_id=OsNip_07t0540100-02;Tag=IsoSeq:G11971.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9389.2
Chr07	TAMA	exon	21298625	21299573	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0540100-02;Name=OsNip_07t0540100-02;exon_id=OsNip_07t0540100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G11971.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9389.2;prot_id "UniRef90_I1GTS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	CDS	21298625	21299571	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0540100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0540100-02;protein_id=OsNip_07t0540100-02;Tag=IsoSeq:G11971.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9389.2;prot_id "UniRef90_I1GTS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21576235	21576582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0544900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	22257818	22258542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0557700-00;Name=OsNip_07t0557700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0557700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	22317917	22317918	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0558400-02;Tag=IsoSeq:G12018.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5451.12;prot_id "UniRef90_A0A1S2YLW7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	22316392	22316996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0558400-02;Tag=IsoSeq:G12018.9;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5451.12;prot_id "UniRef90_A0A1S2YLW7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22319353	22319446	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0558500-02;Parent=transcript:OsNip_07t0558500-02;protein_id=OsNip_07t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22319740	22319858	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0558500-02;Parent=transcript:OsNip_07t0558500-02;protein_id=OsNip_07t0558500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	22346421	22347030	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-00;Name=OsNip_07t0559400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0559400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22346671	22347030	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0559400-00;Parent=transcript:OsNip_07t0559400-00;protein_id=OsNip_07t0559400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22347642	22348103	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0559400-00;Parent=transcript:OsNip_07t0559400-00;protein_id=OsNip_07t0559400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	22347642	22348417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-00;Name=OsNip_07t0559400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0559400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22348104	22348417	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	22346353	22346961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-01;Name=OsNip_07t0559400-01;exon_id=OsNip_07t0559400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12021.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7172.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F8Y4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	22346457	22346961	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-01;Tag=IsoSeq:G12021.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7172.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F8Y4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	22346353	22346397	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0559400-01;Tag=IsoSeq:G12021.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7172.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1F8Y4";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	22347903	22349716	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0559550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22487780	22488451	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0562700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0562700-02;protein_id=OsNip_07t0562700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	22487780	22488588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562700-02;Name=OsNip_07t0562700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0562700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22488452	22488588	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	22487438	22487594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562700-03;Tag=IsoSeq:G12025.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5456.8;prot_id "UniRef90_P27523";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	22487876	22488299	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562700-03;Tag=IsoSeq:G12025.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5456.8;prot_id "UniRef90_P27523";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	22488531	22488698	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562700-03;Tag=IsoSeq:G12025.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5456.8;prot_id "UniRef90_P27523";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	22488827	22497724	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0562800-01;Parent=gene:OsNip_07g0562800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0562800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22488827	22489270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	22488827	22489735	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562800-01;Name=OsNip_07t0562800-01-E24;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0562800-01-E24;rank=24;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22489271	22489735	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0562800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0562800-01;protein_id=OsNip_07t0562800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	22490807	22490928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0562800-01;Name=OsNip_07t0562800-02-E19;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0562800-02-E19;rank=22;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22490807	22490928	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0562800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0562800-01;protein_id=OsNip_07t0562800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	22889331	22889937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0569100-02;Tag=IsoSeq:G12062.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7198.5;prot_id "UniRef90_A0A199UX79";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	22890002	22890811	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0569166-01;Parent=transcript:OsNip_07t0569166-01;protein_id=OsNip_07t0569166-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23112259	23112539	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0572500-01;Parent=transcript:OsNip_07t0572500-01;protein_id=OsNip_07t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23112691	23113903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0572500-01;Name=OsNip_07t0572500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0572500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23112722	23113903	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0572500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	23115846	23119820	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0572600-01;Parent=gene:OsNip_07g0572600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0572600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23115846	23115896	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0572600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23155123	23156611	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23156612	23156971	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0573000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0573000-01;protein_id=OsNip_07t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23156972	23157341	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0573000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	23160354	23164554	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0573100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	23160404	23164551	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0573100-01;Parent=gene:OsNip_07g0573100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0573100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23161455	23161604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0573100-01;Name=OsNip_07t0573100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0573100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23248080	23248647	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0574900-01;Name=OsNip_07t0574900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0574900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23309128	23309676	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576000-03;Name=OsNip_07t0576000-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0576000-01-E11;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	23314373	23319116	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0576100;Name=OsNip_GH3-10;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	23314373	23319116	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0576100-00;Parent=gene:OsNip_07g0576100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23314373	23314481	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23314482	23314933	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0576100-00;Parent=transcript:OsNip_07t0576100-00;protein_id=OsNip_07t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23318111	23318597	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0576100-00;Parent=transcript:OsNip_07t0576100-00;protein_id=OsNip_07t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	23318111	23319116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576100-00;Name=OsNip_07t0576100-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0576100-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23318598	23319116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	23314534	23319116	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0576300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	23314534	23319116	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0576300-00;Parent=gene:OsNip_07g0576300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0576300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23314534	23314870	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0576300-00;Parent=transcript:OsNip_07t0576300-00;protein_id=OsNip_07t0576300-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	23314534	23314924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576300-00;Name=OsNip_07t0576300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0576300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23314871	23314924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0576300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	23398207	23398993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0578300-02;Name=OsNip_07t0578300-02;exon_id=OsNip_07t0578300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12095.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9485.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7EXS5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr07	TAMA	exon	23399720	23400653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0578300-02;Name=OsNip_07t0578300-02;exon_id=OsNip_07t0578300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12095.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9485.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7EXS5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	23398597	23398993	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0578300-02;Tag=IsoSeq:G12095.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9485.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7EXS5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	23399720	23400653	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0578300-02;Tag=IsoSeq:G12095.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9485.1;prot_id "UniRef90_A0A2T7EXS5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	23400939	23401971	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0578333-01;Parent=gene:OsNip_07g0578333;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0578333-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23401005	23401198	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0578333-01;Parent=transcript:OsNip_07t0578333-01;protein_id=OsNip_07t0578333-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23401473	23401503	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0578333-01;Parent=transcript:OsNip_07t0578333-01;protein_id=OsNip_07t0578333-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23540868	23540988	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0581366-00;Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;protein_id=OsNip_07t0581366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	23541134	23541536	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;Name=OsNip_07t0581366-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0581366-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23541134	23541536	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0581366-00;Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;protein_id=OsNip_07t0581366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	23541636	23541976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;Name=OsNip_07t0581366-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0581366-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23541636	23541976	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0581366-00;Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;protein_id=OsNip_07t0581366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23542200	23543239	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0581366-00;Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;protein_id=OsNip_07t0581366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	23542200	23543383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;Name=OsNip_07t0581366-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0581366-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23543240	23543383	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0581366-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	23540704	23543435	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0581366-01;Parent=gene:OsNip_07g0581366;transcript_id=OsNip_07t0581366-01;Tag=IsoSeq:G12104.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9494.2
Chr07	TAMA	exon	23540704	23541022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0581366-01;Name=OsNip_07t0581366-01;exon_id=OsNip_07t0581366-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12104.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9494.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DJP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	CDS	23540705	23541022	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0581366-01;Parent=transcript:OsNip_07t0581366-01;protein_id=OsNip_07t0581366-01;Tag=IsoSeq:G12104.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9494.2;prot_id "UniRef90_A0A0A9DJP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23583333	23583907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0582450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23584701	23584796	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0582500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23706154	23706523	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0584550-00;Name=OsNip_07t0584550-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0584550-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23721772	23721912	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0584900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	23746485	23746610	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0585000-01;Name=OsNip_07t0585000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0585000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	23747129	23748466	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0585000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0585000-01;protein_id=OsNip_07t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23748467	23748665	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0585000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	23747747	23747834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0585000-02;Name=OsNip_07t0585000-02;exon_id=OsNip_07t0585000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12116.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7233.3;prot_id "UniRef90_A2YN39";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	23747753	23747834	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0585000-02;Parent=transcript:OsNip_07t0585000-02;protein_id=OsNip_07t0585000-02;Tag=IsoSeq:G12116.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7233.3;prot_id "UniRef90_A2YN39";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	24032921	24033240	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0589532-00;Name=OsNip_07t0589532-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0589532-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24035824	24035858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0589600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24055001	24055763	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0590000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24055001	24055763	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0590000-01;Parent=gene:OsNip_07g0590000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0590000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	24055001	24055763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590000-01;Name=OsNip_07t0590000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0590000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24055538	24055763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24055052	24055110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24055720	24055945	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24066085	24067613	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0590500;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24066085	24067613	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0590500-00;Parent=gene:OsNip_07g0590500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0590500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24066085	24066229	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590500-00;Name=OsNip_07t0590500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0590500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24066085	24066229	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0590500-00;Parent=transcript:OsNip_07t0590500-00;protein_id=OsNip_07t0590500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24067168	24067613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590500-00;Name=OsNip_07t0590500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0590500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24067168	24067613	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0590500-00;Parent=transcript:OsNip_07t0590500-00;protein_id=OsNip_07t0590500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24071176	24073668	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0590600;biotype=protein_coding;description=Tetratricopeptide-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24071176	24073668	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0590600-00;Parent=gene:OsNip_07g0590600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0590600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24071176	24071180	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24071176	24073668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590600-00;Name=OsNip_07t0590600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0590600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24071181	24073535	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0590600-00;Parent=transcript:OsNip_07t0590600-00;protein_id=OsNip_07t0590600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24073536	24073668	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24078215	24079597	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0590700;Name=OsNip_AGP13;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24078257	24079597	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0590700-01;Parent=gene:OsNip_07g0590700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0590700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24078257	24078595	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24078257	24078676	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-01;Name=OsNip_07t0590700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0590700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24078596	24078676	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0590700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0590700-01;protein_id=OsNip_07t0590700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24079379	24079597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-01;Name=OsNip_07t0590700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0590700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24079379	24079597	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0590700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0590700-01;protein_id=OsNip_07t0590700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	24078215	24078812	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0590700-02;Parent=gene:OsNip_07g0590700;transcript_id=OsNip_07t0590700-02;Tag=IsoSeq:G12136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7248.2
Chr07	TAMA	exon	24078215	24078812	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-02;Name=OsNip_07t0590700-02;exon_id=OsNip_07t0590700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7248.2;prot_id "UniRef90_Q67U14";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	24078344	24078550	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0590700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0590700-02;protein_id=OsNip_07t0590700-02;Tag=IsoSeq:G12136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7248.2;prot_id "UniRef90_Q67U14";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	24078551	24078812	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-02;Tag=IsoSeq:G12136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7248.2;prot_id "UniRef90_Q67U14";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	24078215	24078341	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0590700-02;Tag=IsoSeq:G12136.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7248.2;prot_id "UniRef90_Q67U14";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24087353	24089505	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0591100;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24087353	24089505	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0591100-01;Parent=gene:OsNip_07g0591100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24087353	24087742	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24087353	24088396	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;Name=OsNip_07t0591100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0591100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24087743	24088396	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0591100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;protein_id=OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24088494	24088853	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;Name=OsNip_07t0591100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0591100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24088494	24088853	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0591100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;protein_id=OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24088947	24089489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0591100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;protein_id=OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24088947	24089505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;Name=OsNip_07t0591100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0591100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24089490	24089505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0591100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24087891	24088589	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0591202;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24087891	24088589	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0591202-00;Parent=gene:OsNip_07g0591202;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0591202-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24126351	24126438	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0592000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0592000-01;protein_id=OsNip_07t0592000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24126540	24126760	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0592000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0592000-01;protein_id=OsNip_07t0592000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24126761	24127487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0592000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24128367	24129622	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0592100-01;Parent=gene:OsNip_07g0592100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0592100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24128367	24128434	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24128367	24128466	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;Name=OsNip_07t0592100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0592100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24128435	24128466	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0592100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;protein_id=OsNip_07t0592100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24128681	24129554	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0592100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;protein_id=OsNip_07t0592100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24128681	24129622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;Name=OsNip_07t0592100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0592100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24129555	24129622	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0592100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24129716	24137321	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0592200;Name=OsNip_AP65;biotype=protein_coding;description=Aspartic;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24251055	24251465	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0595900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	24661104	24662533	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0603200-02;Tag=IsoSeq:G12171.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5528.1;prot_id "UniRef90_A0A2I0VLK7";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24744764	24744957	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0604100-00;Parent=transcript:OsNip_07t0604100-00;protein_id=OsNip_07t0604100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24752892	24752971	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;protein_id=OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24753607	24754063	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;protein_id=OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24754221	24754374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;Name=OsNip_07t0604300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0604300-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24754221	24754374	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;protein_id=OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24754458	24754735	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;Name=OsNip_07t0604300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0604300-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24754458	24754735	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;protein_id=OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24754805	24755097	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0604300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;protein_id=OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24754805	24755315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;Name=OsNip_07t0604300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0604300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24755098	24755315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24752889	24755200	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0604350;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24752889	24755200	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0604350-00;Parent=gene:OsNip_07g0604350;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_07t0604350-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24752889	24752981	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604350-00;Name=OsNip_07t0604350-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0604350-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24753620	24754063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0604350-00;Name=OsNip_07t0604350-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0604350-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24931872	24932857	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0606800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0606800-01;protein_id=OsNip_07t0606800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24932872	24932989	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0606800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0606800-01;protein_id=OsNip_07t0606800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24932872	24933033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606800-01;Name=OsNip_07t0606800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0606800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24932990	24933033	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	24931854	24933091	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0606800-02;Parent=gene:OsNip_07g0606800;transcript_id=OsNip_07t0606800-02;Tag=IsoSeq:G12186.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7278.2
Chr07	TAMA	exon	24931854	24933091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606800-02;Name=OsNip_07t0606800-02;exon_id=OsNip_07t0606800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12186.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7278.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0X2P4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	CDS	24931856	24932983	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0606800-02;Parent=transcript:OsNip_07t0606800-02;protein_id=OsNip_07t0606800-02;Tag=IsoSeq:G12186.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7278.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0X2P4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	24931854	24931855	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606800-02;Tag=IsoSeq:G12186.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7278.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0X2P4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	24932987	24933091	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606800-02;Tag=IsoSeq:G12186.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7278.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0X2P4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	24934360	24937067	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0606900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	24934360	24937062	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0606900-01;Parent=gene:OsNip_07g0606900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24934360	24934653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24934360	24935486	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;Name=OsNip_07t0606900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0606900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24934654	24935486	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0606900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;protein_id=OsNip_07t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	24936863	24937061	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0606900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;protein_id=OsNip_07t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	24936863	24937062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;Name=OsNip_07t0606900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0606900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24937062	24937062	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	24934389	24937067	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0606900-02;Parent=gene:OsNip_07g0606900;transcript_id=OsNip_07t0606900-02;Tag=IsoSeq:G12187.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7279.5,Nipponbare.panicle_G9559.3
Chr07	TAMA	exon	24936863	24937067	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0606900-02;Name=OsNip_07t0606900-02;exon_id=OsNip_07t0606900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12187.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7279.5,Nipponbare.panicle_G9559.3;prot_id "UniRef90_UPI0003EAE29F";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	24975250	24975326	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0607700-02;Tag=IsoSeq:G12190.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7281.1,Nipponbare.panicle_G9562.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADF3ED";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	24975503	24976582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0607700-02;Tag=IsoSeq:G12190.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7281.1,Nipponbare.panicle_G9562.1;prot_id "UniRef90_UPI0018ADF3ED";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	24992199	24992835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0607800-02;Name=OsNip_07t0607800-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0607800-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	CDS	24990998	24990998	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0607800-03;Parent=transcript:OsNip_07t0607800-03;protein_id=OsNip_07t0607800-03;Tag=IsoSeq:G12191.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5535.4;prot_id "UniRef90_UPI0007F0376D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	TAMA	exon	24992199	24992562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0607800-03;Name=OsNip_07t0607800-03;exon_id=OsNip_07t0607800-03-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G12191.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5535.4;prot_id "UniRef90_UPI0007F0376D";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25260329	25260955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0613600-01;Name=OsNip_07t0613600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0613600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25260354	25260578	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0613600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0613600-01;protein_id=OsNip_07t0613600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25260579	25260955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0613600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	25273385	25273944	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0613800;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	25273385	25273944	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0613800-00;Parent=gene:OsNip_07g0613800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0613800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	25287879	25288556	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614000-03;Tag=IsoSeq:G12206.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5546.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25289670	25290039	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614000-03;Tag=IsoSeq:G12206.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5546.5;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25289257	25290038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25327001	25327489	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0614700-02;Parent=transcript:OsNip_07t0614700-02;protein_id=OsNip_07t0614700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25327576	25327907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614700-02;Name=OsNip_07t0614700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0614700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25327792	25327907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	25326762	25327995	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0614700-01;Parent=gene:OsNip_07g0614700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0614700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25326762	25327386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25326762	25327995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614700-01;Name=OsNip_07t0614700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0614700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25327387	25327791	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0614700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0614700-01;protein_id=OsNip_07t0614700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25327792	25327995	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0614700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	25326734	25328016	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0614700-03;Parent=gene:OsNip_07g0614700;transcript_id=OsNip_07t0614700-03;Tag=IsoSeq:G12211.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9582.1
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25364138	25364560	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0615500-01;Name=OsNip_07t0615500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0615500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25363599	25363980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0615500-02;Tag=IsoSeq:G12214.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9585.1;prot_id "UniRef90_I1QC60";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25480516	25480761	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0617600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0617600-01;protein_id=OsNip_07t0617600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25480762	25481302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	25480066	25480889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t061769A-01;Name=OsNip_07t061769A-01-E1;exon_id=OsNip_07t061769A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12226.1;Source=Nipponbare.root_G7298.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25480066	25480383	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t061769A-01;Tag=IsoSeq:G12226.1;Source=Nipponbare.root_G7298.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	25488479	25489870	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0617700;Name=OsNip_Fbox397;biotype=protein_coding;description=Cyclin-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	25488479	25489870	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0617700-01;Parent=gene:OsNip_07g0617700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0617700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25488479	25488512	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25488479	25489870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617700-01;Name=OsNip_07t0617700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0617700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25488513	25489733	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0617700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0617700-01;protein_id=OsNip_07t0617700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25489734	25489870	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	25492989	25497548	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0617800;Name=OsNip_AlaAT3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	25492989	25495303	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0617800-01;Parent=gene:OsNip_07g0617800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25492989	25493213	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25493214	25493330	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0617800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0617800-01;protein_id=OsNip_07t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25493448	25493651	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0617800-01;Name=OsNip_07t0617800-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0617800-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25493448	25493651	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0617800-01;Parent=transcript:OsNip_07t0617800-01;protein_id=OsNip_07t0617800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25572038	25572101	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619200-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25572038	25572696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619200-04;Name=OsNip_07t0619200-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0619200-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25572102	25572377	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0619200-04;Parent=transcript:OsNip_07t0619200-04;protein_id=OsNip_07t0619200-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25572378	25572696	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619200-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	25601681	25601682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619600-02;Tag=IsoSeq:G12237.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5562.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25602964	25603323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619600-02;Tag=IsoSeq:G12237.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5562.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25603771	25603800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619600-02;Tag=IsoSeq:G12237.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5562.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	25611925	25616422	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0619700;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	25611983	25616341	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0619700-01;Parent=gene:OsNip_07g0619700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25611983	25612956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Name=OsNip_07t0619700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0619700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25611983	25612956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25613569	25613677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Name=OsNip_07t0619700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0619700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25613569	25613677	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25614158	25614256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Name=OsNip_07t0619700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0619700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25614158	25614256	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25614377	25614473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Name=OsNip_07t0619700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0619700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25614377	25614473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25614553	25614634	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0619700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25679362	25679803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0621300-02;Name=OsNip_07t0621300-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0621300-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25679362	25679803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0621300-03;Tag=IsoSeq:G12246.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7310.1,Nipponbare.panicle_G9609.1,Nipponbare.leaf_G5565.2;prot_id "UniRef90_A0A3B6JM58";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25776199	25776456	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;Name=OsNip_07t0623100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0623100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	25776552	25776908	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;Name=OsNip_07t0623100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0623100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25776552	25776908	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0623100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;protein_id=OsNip_07t0623100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	25777504	25777872	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0623100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;protein_id=OsNip_07t0623100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	25777504	25777874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;Name=OsNip_07t0623100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0623100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25777873	25777874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	25776199	25783529	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0623100-02;Parent=gene:OsNip_07g0623100;transcript_id=OsNip_07t0623100-02;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2
Chr07	TAMA	exon	25783332	25783529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;Name=OsNip_07t0623100-02;exon_id=OsNip_07t0623100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	CDS	25783332	25783529	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0623100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;protein_id=OsNip_07t0623100-02;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	exon	25782737	25782856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;Name=OsNip_07t0623100-02;exon_id=OsNip_07t0623100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	CDS	25782737	25782856	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0623100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;protein_id=OsNip_07t0623100-02;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	exon	25781976	25782091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;Name=OsNip_07t0623100-02;exon_id=OsNip_07t0623100-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	CDS	25782062	25782091	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0623100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0623100-02;protein_id=OsNip_07t0623100-02;Tag=IsoSeq:G12254.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7317.1,Nipponbare.leaf_G5570.1,Nipponbare.panicle_G9617.2;prot_id "UniRef90_M0T5T8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25840775	25840808	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0624100-01;Tag=IsoSeq:G12258.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7320.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	25839986	25840241	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0624100-01;Tag=IsoSeq:G12258.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7320.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25935727	25936474	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0626200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	25931609	25931921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0626200-03;Name=OsNip_07t0626200-03;exon_id=OsNip_07t0626200-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12264.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9626.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6HVG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr07	TAMA	CDS	25931610	25931921	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0626200-03;Parent=transcript:OsNip_07t0626200-03;protein_id=OsNip_07t0626200-03;Tag=IsoSeq:G12264.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9626.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6HVG9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26006881	26007621	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627400-01;Name=OsNip_07t0627400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0627400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26009099	26009223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26009099	26009867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627500-00;Name=OsNip_07t0627500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0627500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26009224	26009499	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0627500-00;Parent=transcript:OsNip_07t0627500-00;protein_id=OsNip_07t0627500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26009500	26009867	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26013462	26013708	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0627600-00;Parent=gene:OsNip_07g0627600;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_07t0627600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26013462	26013708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627600-00;Name=OsNip_07t0627600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0627600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	26014914	26017793	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0627700;Name=OsNip_GL1-9;biotype=protein_coding;description=Fatty;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26014914	26017793	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0627700-01;Parent=gene:OsNip_07g0627700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0627700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26014914	26015361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0627700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26173595	26174381	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631200-01;Name=OsNip_07t0631200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0631200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26189635	26189708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631300-01;Name=OsNip_07t0631300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0631300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26189635	26189708	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0631300-01;Parent=transcript:OsNip_07t0631300-01;protein_id=OsNip_07t0631300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26211749	26211812	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26211813	26212142	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0631900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0631900-01;protein_id=OsNip_07t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26213131	26213430	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0631900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0631900-01;protein_id=OsNip_07t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26213586	26213842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-01;Name=OsNip_07t0631900-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0631900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26213649	26213842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26213652	26213842	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0631900-02;Parent=gene:OsNip_07g0631900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_07t0631900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26213652	26213842	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-02;Name=OsNip_07t0631900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0631900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	26211749	26213849	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0631900-03;Parent=gene:OsNip_07g0631900;transcript_id=OsNip_07t0631900-03;Tag=IsoSeq:G12288.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5586.4
Chr07	TAMA	exon	26211749	26213849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-03;Name=OsNip_07t0631900-03;exon_id=OsNip_07t0631900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12288.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5586.4;prot_id "UniRef90_UPI001493DADF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	26211749	26212063	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0631900-03;Parent=transcript:OsNip_07t0631900-03;protein_id=OsNip_07t0631900-03;Tag=IsoSeq:G12288.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5586.4;prot_id "UniRef90_UPI001493DADF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	26212067	26213849	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631900-03;Tag=IsoSeq:G12288.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5586.4;prot_id "UniRef90_UPI001493DADF";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	26211825	26212748	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0631950;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26211825	26212748	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0631950-00;Parent=gene:OsNip_07g0631950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0631950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26211825	26211932	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26211825	26212152	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;Name=OsNip_07t0631950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0631950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26211933	26212152	.	-	1	ID=CDS:OsNip_07t0631950-00;Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;protein_id=OsNip_07t0631950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26212667	26212746	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0631950-00;Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;protein_id=OsNip_07t0631950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26212667	26212748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;Name=OsNip_07t0631950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0631950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26212747	26212748	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0631950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	26215095	26216358	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0632000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26215095	26216256	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0632000-01;Parent=gene:OsNip_07g0632000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26215095	26215141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26215095	26216256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-01;Name=OsNip_07t0632000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0632000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26215142	26216092	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632000-01;protein_id=OsNip_07t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26216093	26216256	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	26215096	26216358	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0632000-02;Parent=gene:OsNip_07g0632000;transcript_id=OsNip_07t0632000-02;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5
Chr07	TAMA	exon	26215096	26216096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;Name=OsNip_07t0632000-02;exon_id=OsNip_07t0632000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	CDS	26215098	26215256	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0632000-02;Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;protein_id=OsNip_07t0632000-02;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	exon	26216198	26216358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;Name=OsNip_07t0632000-02;exon_id=OsNip_07t0632000-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	26215096	26215097	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	26215260	26216096	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	26216198	26216358	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632000-02;Tag=IsoSeq:G12289.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9645.5;prot_id "UniRef90_I1IJ55";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	26230671	26240841	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0632600;biotype=protein_coding;description=Heat;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	26230671	26240841	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0632600-01;Parent=gene:OsNip_07g0632600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26230671	26230952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26230671	26230952	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26232023	26232112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26232023	26232227	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26232113	26232227	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26232334	26232403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26232334	26232403	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26233007	26233049	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26233007	26233049	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26233468	26233545	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26233468	26233545	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26233683	26233767	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26233683	26233767	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26233853	26233935	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26233853	26233935	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26234069	26234126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26234069	26234126	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26235349	26235406	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26235349	26235406	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26235585	26235681	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26236165	26236200	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E12;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E12;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26236416	26236552	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26237413	26237482	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;Name=OsNip_07t0632600-01-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0632600-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26237413	26237482	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0632600-01;Parent=transcript:OsNip_07t0632600-01;protein_id=OsNip_07t0632600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26413818	26414449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636100-01;Name=OsNip_07t0636100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0636100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26413934	26414449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	26412872	26413059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636100-02;Tag=IsoSeq:G12309.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7354.1,Nipponbare.panicle_G9663.1;prot_id "UniRef90_M8A3J5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	26413282	26414449	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636100-02;Tag=IsoSeq:G12309.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7354.1,Nipponbare.panicle_G9663.1;prot_id "UniRef90_M8A3J5";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26419001	26419055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636200-01;Name=OsNip_07t0636200-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0636200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26419312	26419367	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0636200-01;Name=OsNip_07t0636200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0636200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26420777	26420843	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0636200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0636200-01;protein_id=OsNip_07t0636200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	26644873	26645331	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0640200-01;Name=OsNip_07t0640200-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0640200-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26646515	26646837	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0640300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26781112	26781121	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0642950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26822106	26822420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0644400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	gene	26844638	26850135	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0644550;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	26883845	26883917	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0645000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0645000-01;protein_id=OsNip_07t0645000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	26883845	26883927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0645000-01;Name=OsNip_07t0645000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0645000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26883918	26883927	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0645000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27105556	27105857	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0648566-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	27637020	27637669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-01;Name=OsNip_07t0656800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0656800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27637217	27637669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	27637765	27637846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-01;Name=OsNip_07t0656800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0656800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27637765	27637846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27638091	27638590	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	27635598	27635967	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-02;Name=OsNip_07t0656800-02;exon_id=OsNip_07t0656800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12371.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7397.1;prot_id "UniRef90_UPI001246CA83";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	CDS	27635600	27635967	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0656800-02;Parent=transcript:OsNip_07t0656800-02;protein_id=OsNip_07t0656800-02;Tag=IsoSeq:G12371.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7397.1;prot_id "UniRef90_UPI001246CA83";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr07	TAMA	exon	27637020	27637133	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0656800-02;Name=OsNip_07t0656800-02;exon_id=OsNip_07t0656800-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12371.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7397.1;prot_id "UniRef90_UPI001246CA83";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	27685725	27685846	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0657500-02;Name=OsNip_07t0657500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0657500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	27685725	27685846	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0657500-02;Parent=transcript:OsNip_07t0657500-02;protein_id=OsNip_07t0657500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	27686022	27686190	.	+	1	ID=CDS:OsNip_07t0657500-02;Parent=transcript:OsNip_07t0657500-02;protein_id=OsNip_07t0657500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	27755764	27757305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0658700-01;Name=OsNip_07t0658700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0658700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27757008	27757305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0658700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	27776219	27776497	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0659100-01;Parent=gene:OsNip_07g0659100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0659100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27776219	27776430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0659100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	27776219	27776497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0659100-01;Name=OsNip_07t0659100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0659100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	27776431	27776496	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0659100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0659100-01;protein_id=OsNip_07t0659100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27776497	27776497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0659100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	27776237	27777977	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0659100-02;Parent=gene:OsNip_07g0659100;transcript_id=OsNip_07t0659100-02;Tag=IsoSeq:G12383.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5627.1
Chr07	TAMA	exon	27777873	27777977	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0659100-02;Name=OsNip_07t0659100-02;exon_id=OsNip_07t0659100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12383.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5627.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7GPE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	27777873	27777976	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0659100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0659100-02;protein_id=OsNip_07t0659100-02;Tag=IsoSeq:G12383.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5627.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7GPE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	exon	27777637	27777724	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0659100-02;Name=OsNip_07t0659100-02;exon_id=OsNip_07t0659100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12383.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5627.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7GPE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	27777670	27777724	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0659100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0659100-02;protein_id=OsNip_07t0659100-02;Tag=IsoSeq:G12383.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5627.1;prot_id "UniRef90_A0A3Q7GPE2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	27823641	27823763	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0660000-00;Parent=transcript:OsNip_07t0660000-00;protein_id=OsNip_07t0660000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	27823826	27824511	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0660100;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27823831	27824012	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	27823831	27824495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-01;Name=OsNip_07t0660100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0660100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	27824013	27824150	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0660100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0660100-01;protein_id=OsNip_07t0660100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27824151	27824495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	TAMA	mRNA	27823826	27824511	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0660100-02;Parent=gene:OsNip_07g0660100;transcript_id=OsNip_07t0660100-02;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1
Chr07	TAMA	exon	27824380	27824511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;Name=OsNip_07t0660100-02;exon_id=OsNip_07t0660100-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	CDS	27824424	27824510	.	-	.	ID=CDS:OsNip_07t0660100-02;Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;protein_id=OsNip_07t0660100-02;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	exon	27823826	27824180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;Name=OsNip_07t0660100-02;exon_id=OsNip_07t0660100-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	27824511	27824511	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	27824380	27824421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	27823826	27824180	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660100-02;Tag=IsoSeq:G12387.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5630.1;prot_id "UniRef90_A0A0D9X2H0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	27825945	27840086	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0660200;Name=CHR705;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	27825945	27829618	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0660200-02;Parent=gene:OsNip_07g0660200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0660200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27825945	27826393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	27825945	27826881	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0660200-02;Name=OsNip_07t0660200-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0660200-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	27887673	27887982	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0661201-00;Name=OsNip_07t0661201-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0661201-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	27883553	27888239	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0661300;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	27884566	27888239	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0661300-01;Parent=gene:OsNip_07g0661300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0661300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27884566	27884567	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0661300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	28075072	28075287	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0665000-01;Tag=IsoSeq:G12413.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5644.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9VKN9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28074646	28074895	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0665100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28075600	28077583	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0665200-01;Parent=gene:OsNip_07g0665200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0665200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28143063	28143487	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0666400-00;Name=OsNip_07t0666400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0666400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28143063	28143487	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0666400-00;Parent=transcript:OsNip_07t0666400-00;protein_id=OsNip_07t0666400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28146499	28149613	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0666600;biotype=protein_coding;description=KIP1-like;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28146499	28146813	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0666600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28208243	28208443	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0667900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28208947	28209063	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0667900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28335377	28335402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28335377	28337565	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670000-02;Name=OsNip_07t0670000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0670000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28335403	28337565	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0670000-02;Parent=transcript:OsNip_07t0670000-02;protein_id=OsNip_07t0670000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28335381	28337597	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0670000-01;Parent=gene:OsNip_07g0670000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28335381	28335402	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28335381	28337597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670000-01;Name=OsNip_07t0670000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0670000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28335403	28337583	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0670000-01;Parent=transcript:OsNip_07t0670000-01;protein_id=OsNip_07t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28337584	28337597	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28337741	28339272	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0670100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28337741	28339272	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0670100-00;Parent=gene:OsNip_07g0670100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28337741	28337786	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0670100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28424282	28424757	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0672500-01;Name=OsNip_07t0672500-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0672500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28423644	28423803	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0672500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28423644	28423947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0672500-02;Name=OsNip_07t0672500-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0672500-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28470198	28470302	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0673500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28470369	28470777	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0673500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28470862	28470952	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0673500-02;Name=OsNip_07t0673500-02-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_07t0673500-02-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	exon	28539715	28540102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0674700-02;Name=OsNip_07t0674700-02;exon_id=OsNip_07t0674700-02-E5;rank=5;Tag=IsoSeq:G12454.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7446.1;prot_id "UniRef90_A0A453APY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr07	TAMA	three_prime_UTR	28538153	28538335	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0674700-02;Tag=IsoSeq:G12454.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7446.1;prot_id "UniRef90_A0A453APY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	28539715	28540102	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0674700-02;Tag=IsoSeq:G12454.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7446.1;prot_id "UniRef90_A0A453APY0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28537719	28539955	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0674750;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28559086	28562956	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0675100-01;Parent=gene:OsNip_07g0675100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0675100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28559310	28560004	.	-	2	ID=CDS:OsNip_07t0675100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0675100-01;protein_id=OsNip_07t0675100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28561843	28562887	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0675100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0675100-01;protein_id=OsNip_07t0675100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28561843	28562956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675100-01;Name=OsNip_07t0675100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0675100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28562888	28562956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28559646	28559991	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675133-00;Name=OsNip_07t0675133-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0675133-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28559646	28559991	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0675133-00;Parent=transcript:OsNip_07t0675133-00;protein_id=OsNip_07t0675133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28561827	28562451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675133-00;Name=OsNip_07t0675133-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0675133-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28561827	28562451	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0675133-00;Parent=transcript:OsNip_07t0675133-00;protein_id=OsNip_07t0675133-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28565620	28566979	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0675166;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28565620	28566979	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0675166-01;Parent=gene:OsNip_07g0675166;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_07t0675166-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28565620	28566979	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675166-01;Name=OsNip_07t0675166-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0675166-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28566115	28567042	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0675200;Name=OsNip_EnS-114;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28566115	28567042	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0675200-01;Parent=gene:OsNip_07g0675200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0675200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28566115	28566162	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28566115	28567042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675200-01;Name=OsNip_07t0675200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0675200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28566163	28567002	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0675200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0675200-01;protein_id=OsNip_07t0675200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28567003	28567042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28584875	28593368	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0675400;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28584875	28593347	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0675400-01;Parent=gene:OsNip_07g0675400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0675400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28584875	28585147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675400-01;Name=OsNip_07t0675400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0675400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28584875	28585147	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0675400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28661009	28661566	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0676900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0676900-01;protein_id=OsNip_07t0676900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28661009	28661792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0676900-01;Name=OsNip_07t0676900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0676900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	mRNA	28660188	28661792	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0676900-02;Parent=gene:OsNip_07g0676900;transcript_id=OsNip_07t0676900-02;Tag=IsoSeq:G12460.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7452.6,Nipponbare.panicle_G9774.2
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Chr07	TAMA	CDS	28661670	28661744	.	+	.	ID=CDS:OsNip_07t0676900-02;Parent=transcript:OsNip_07t0676900-02;protein_id=OsNip_07t0676900-02;Tag=IsoSeq:G12460.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7452.6,Nipponbare.panicle_G9774.2;prot_id "UniRef90_Q94EL6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	28660188	28660930	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0676900-02;Tag=IsoSeq:G12460.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7452.6,Nipponbare.panicle_G9774.2;prot_id "UniRef90_Q94EL6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	five_prime_UTR	28661009	28661669	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0676900-02;Tag=IsoSeq:G12460.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7452.6,Nipponbare.panicle_G9774.2;prot_id "UniRef90_Q94EL6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	28661748	28661792	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0676900-02;Tag=IsoSeq:G12460.8;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7452.6,Nipponbare.panicle_G9774.2;prot_id "UniRef90_Q94EL6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28669498	28671384	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0677100-01;Parent=gene:OsNip_07g0677100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0677100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28669498	28669781	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;Name=OsNip_07t0677100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0677100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28670229	28670420	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;Name=OsNip_07t0677100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0677100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28670229	28670420	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0677100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;protein_id=OsNip_07t0677100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28670523	28670688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;Name=OsNip_07t0677100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0677100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28670523	28670688	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0677100-01;Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;protein_id=OsNip_07t0677100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28670773	28671384	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677100-01;Name=OsNip_07t0677100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0677100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28673754	28673821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28674134	28674310	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0677200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0677200-01;protein_id=OsNip_07t0677200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28674397	28674562	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0677200-01;Parent=transcript:OsNip_07t0677200-01;protein_id=OsNip_07t0677200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	28674677	28675336	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-01;Name=OsNip_07t0677200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0677200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28674497	28674498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28674497	28674562	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;Name=OsNip_07t0677200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0677200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28674499	28674562	.	+	0	ID=CDS:OsNip_07t0677200-02;Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;protein_id=OsNip_07t0677200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	28674677	28675071	.	+	2	ID=CDS:OsNip_07t0677200-02;Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;protein_id=OsNip_07t0677200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28674677	28675351	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;Name=OsNip_07t0677200-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_07t0677200-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28675072	28675351	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	28678458	28680010	.	+	.	ID=gene:OsNip_07g0677300;Name=POXgX9;biotype=protein_coding;description=Peroxidase;gene_id=OsNip_07g0677300;logic_name=rapdb_genes;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	28678458	28680010	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0677300-01;Parent=gene:OsNip_07g0677300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0677300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28678458	28678476	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	28678458	28678686	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0677300-01;Name=OsNip_07t0677300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0677300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	29025685	29025829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684500-01;Name=OsNip_07t0684500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0684500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	29029810	29030143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;Name=OsNip_07t0684700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0684700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29029810	29030143	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29030241	29030282	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29030241	29030624	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;Name=OsNip_07t0684700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0684700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	29030283	29030624	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0684700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;protein_id=OsNip_07t0684700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29030748	29031020	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;Name=OsNip_07t0684700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0684700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	29030748	29031020	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0684700-01;Parent=transcript:OsNip_07t0684700-01;protein_id=OsNip_07t0684700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	gene	29040452	29042297	.	-	.	ID=gene:OsNip_07g0684800;Name=ONAC015;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	29040452	29042127	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0684800-02;Parent=gene:OsNip_07g0684800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0684800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29040452	29041003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29040452	29041429	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0684800-02;Name=OsNip_07t0684800-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0684800-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	29041004	29041429	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0684800-02;Parent=transcript:OsNip_07t0684800-02;protein_id=OsNip_07t0684800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29171078	29171124	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29171078	29172225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0686600-01;Name=OsNip_07t0686600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0686600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29171782	29172225	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0686600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	exon	29216607	29217245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687700-01;Name=OsNip_07t0687700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0687700-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29216757	29217245	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	TAMA	five_prime_UTR	29216610	29217172	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687700-02;Tag=IsoSeq:G12506.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7482.3;prot_id "UniRef90_A0A6A3BLJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr07	TAMA	three_prime_UTR	29217275	29217402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687700-02;Tag=IsoSeq:G12506.4;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7482.3;prot_id "UniRef90_A0A6A3BLJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	29220339	29221843	.	-	.	ID=transcript:OsNip_07t0687900-01;Parent=gene:OsNip_07g0687900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	29220339	29220655	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29220339	29220868	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687900-01;Name=OsNip_07t0687900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_07t0687900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	29220656	29220868	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0687900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0687900-01;protein_id=OsNip_07t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	CDS	29220967	29221740	.	-	0	ID=CDS:OsNip_07t0687900-01;Parent=transcript:OsNip_07t0687900-01;protein_id=OsNip_07t0687900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29220967	29221843	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0687900-01;Name=OsNip_07t0687900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0687900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	mRNA	29225285	29227664	.	+	.	ID=transcript:OsNip_07t0688000-01;Parent=gene:OsNip_07g0688000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_07t0688000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr07	RAP2018-11-26	exon	29225285	29225673	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_07t0688000-01;Name=OsNip_07t0688000-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_07t0688000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr07	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	29357023	29357315	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_07t0690300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	231737	232315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0104300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	231120	232366	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0104300-03;Tag=IsoSeq:G12563.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9859.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9DHP4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	352146	352546	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0107100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	358944	359064	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0107300-00;Parent=transcript:OsNip_08t0107300-00;protein_id=OsNip_08t0107300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	359291	359465	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0107300-00;Parent=transcript:OsNip_08t0107300-00;protein_id=OsNip_08t0107300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	580366	586456	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0111200-01;Parent=gene:OsNip_08g0111200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0111200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	580366	580465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0111200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	681178	681199	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0112700-02;Tag=IsoSeq:G12599.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5722.1,Nipponbare.root_G7542.3,Nipponbare.panicle_G9890.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6PPB2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	681309	681713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0112700-02;Tag=IsoSeq:G12599.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5722.1,Nipponbare.root_G7542.3,Nipponbare.panicle_G9890.2;prot_id "UniRef90_A0A3L6PPB2";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	682645	684136	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0112800-01;Parent=gene:OsNip_08g0112800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	682645	682956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	682645	682973	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0112800-01;Name=OsNip_08t0112800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0112800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	682957	682973	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0112800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0112800-01;protein_id=OsNip_08t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	683449	683592	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0112800-01;Name=OsNip_08t0112800-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0112800-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	683449	683592	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0112800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0112800-01;protein_id=OsNip_08t0112800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	905376	905649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0116500-03;Name=OsNip_08t0116500-03;exon_id=OsNip_08t0116500-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7550.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	905376	905377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0116500-03;Tag=IsoSeq:G12612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7550.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	905492	905649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0116500-03;Tag=IsoSeq:G12612.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7550.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	906858	908370	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0116566;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	906858	908370	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0116566-00;Parent=gene:OsNip_08g0116566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0116566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	906858	906874	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0116566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	906858	907536	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0116566-00;Name=OsNip_08t0116566-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0116566-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	906875	907536	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0116566-00;Parent=transcript:OsNip_08t0116566-00;protein_id=OsNip_08t0116566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	956380	956637	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0117200-01;Tag=IsoSeq:G12616.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9905.1,Nipponbare.leaf_G5731.1,Nipponbare.root_G7552.1;prot_id "UniRef90_A0A2P2K896";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	962587	964531	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0117300-01;Parent=gene:OsNip_08g0117300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0117300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	962587	962972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0117300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	963711	963897	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0117300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0117300-01;protein_id=OsNip_08t0117300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	1205886	1209749	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0122000;Name=OsNip_PP2A-B'theta;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1205886	1209749	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0122000-01;Parent=gene:OsNip_08g0122000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0122000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1205891	1206465	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1206466	1206810	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0122000-02;Parent=transcript:OsNip_08t0122000-02;protein_id=OsNip_08t0122000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1208038	1209243	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0122000-02;Parent=transcript:OsNip_08t0122000-02;protein_id=OsNip_08t0122000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1209244	1209300	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1209390	1209490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1215576	1216317	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0122201-00;Parent=gene:OsNip_08g0122201;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0122201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1215576	1215744	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122201-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1216035	1216086	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1216103	1216317	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122201-00;Name=OsNip_08t0122201-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0122201-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1216103	1216317	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122201-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1230097	1230772	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0122400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1230097	1230772	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0122400-01;Parent=gene:OsNip_08g0122400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0122400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1230097	1230340	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1230097	1230772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0122400-01;Name=OsNip_08t0122400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0122400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1230341	1230730	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0122400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0122400-01;protein_id=OsNip_08t0122400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1479294	1479396	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1484373	1484914	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	1501915	1502115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;Name=OsNip_08t0125700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0125700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1501915	1502115	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0125700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;protein_id=OsNip_08t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1502183	1502209	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0125700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;protein_id=OsNip_08t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1502183	1502311	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;Name=OsNip_08t0125700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0125700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1502210	1502311	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1503035	1503143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1503897	1506337	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0125800-01;Parent=gene:OsNip_08g0125800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1503897	1504044	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1503897	1504804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;Name=OsNip_08t0125800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0125800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1504045	1504804	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0125800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;protein_id=OsNip_08t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1504891	1506317	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0125800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;protein_id=OsNip_08t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1504891	1506337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;Name=OsNip_08t0125800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0125800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1506318	1506337	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1503964	1506282	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0125850;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1503964	1506282	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0125850-00;Parent=gene:OsNip_08g0125850;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1503964	1504806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125850-00;Name=OsNip_08t0125850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0125850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1503964	1504806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1504883	1505103	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1505533	1506282	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0125850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1510719	1512998	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0126000;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1510719	1512998	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0126000-00;Parent=gene:OsNip_08g0126000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0126000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1510719	1512992	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0126000-00;Parent=transcript:OsNip_08t0126000-00;protein_id=OsNip_08t0126000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1510719	1512998	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126000-00;Name=OsNip_08t0126000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0126000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1512993	1512998	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1515445	1517559	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0126100-00;Parent=gene:OsNip_08g0126100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0126100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1515445	1517559	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126100-00;Name=OsNip_08t0126100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0126100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1515445	1517559	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0126100-00;Parent=transcript:OsNip_08t0126100-00;protein_id=OsNip_08t0126100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1525385	1529192	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0126300;Name=OsNip_GapC3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1525411	1529192	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0126300-01;Parent=gene:OsNip_08g0126300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1525411	1525485	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1525411	1525489	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;Name=OsNip_08t0126300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0126300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1525486	1525489	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0126300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;protein_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1525623	1525646	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;Name=OsNip_08t0126300-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0126300-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1525623	1525646	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0126300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;protein_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1525762	1525862	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;Name=OsNip_08t0126300-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0126300-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1525762	1525862	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0126300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;protein_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1526150	1526265	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0126300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;protein_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1526358	1526457	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0126300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0126300-01;protein_id=OsNip_08t0126300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	1566363	1566431	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127100-02;Name=OsNip_08t0127100-02-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0127100-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1566363	1566431	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0127100-02;Parent=transcript:OsNip_08t0127100-02;protein_id=OsNip_08t0127100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1566563	1566661	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0127100-02;Parent=transcript:OsNip_08t0127100-02;protein_id=OsNip_08t0127100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1566563	1566957	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127100-02;Name=OsNip_08t0127100-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0127100-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1566662	1566957	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1567554	1574475	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0127300;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1567554	1568166	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0127300-01;Parent=gene:OsNip_08g0127300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1567554	1568039	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1567554	1568166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-01;Name=OsNip_08t0127300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0127300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1568040	1568165	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0127300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0127300-01;protein_id=OsNip_08t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	1568166	1568166	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	1567587	1574475	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0127300-02;Parent=gene:OsNip_08g0127300;transcript_id=OsNip_08t0127300-02;Tag=IsoSeq:G12640.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9925.1,Nipponbare.root_G7568.2
Chr08	TAMA	exon	1572573	1574475	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-02;Name=OsNip_08t0127300-02;exon_id=OsNip_08t0127300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12640.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9925.1,Nipponbare.root_G7568.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9RXT4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	1574058	1574474	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0127300-02;Parent=transcript:OsNip_08t0127300-02;protein_id=OsNip_08t0127300-02;Tag=IsoSeq:G12640.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9925.1,Nipponbare.root_G7568.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9RXT4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	exon	1572449	1572497	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-02;Name=OsNip_08t0127300-02;exon_id=OsNip_08t0127300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12640.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9925.1,Nipponbare.root_G7568.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9RXT4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	exon	1572217	1572372	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127300-02;Name=OsNip_08t0127300-02;exon_id=OsNip_08t0127300-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G12640.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G9925.1,Nipponbare.root_G7568.2;prot_id "UniRef90_A0A6I9RXT4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1597239	1599498	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0127900-01;Parent=gene:OsNip_08g0127900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0127900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1599338	1599498	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1598160	1599259	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0127950-00;Parent=gene:OsNip_08g0127950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0127950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1598160	1598421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1598160	1598482	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0127950-00;Name=OsNip_08t0127950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0127950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1598422	1598482	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0127950-00;Parent=transcript:OsNip_08t0127950-00;protein_id=OsNip_08t0127950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1598861	1599252	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0127950-00;Parent=transcript:OsNip_08t0127950-00;protein_id=OsNip_08t0127950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1679311	1679475	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0129900-00;Parent=transcript:OsNip_08t0129900-00;protein_id=OsNip_08t0129900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1751935	1752468	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0131000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1752707	1755525	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0131100-01;Parent=gene:OsNip_08g0131100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0131100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1753126	1754040	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0131100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0131100-01;protein_id=OsNip_08t0131100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1755336	1755525	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0131100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1754670	1755296	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0131150;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1754670	1755296	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0131150-00;Parent=gene:OsNip_08g0131150;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0131150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	1754670	1754699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0131150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	1754670	1755296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0131150-00;Name=OsNip_08t0131150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0131150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	1754700	1755296	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0131150-00;Parent=transcript:OsNip_08t0131150-00;protein_id=OsNip_08t0131150-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	1755976	1757069	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0131200;Name=OsNip_LTP1.7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	1755976	1757069	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0131200-01;Parent=gene:OsNip_08g0131200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0131200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2054222	2054420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0136300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	2513233	2514517	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0144400-02;Name=OsNip_08t0144400-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0144400-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	2572994	2573098	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0145501-01;Parent=transcript:OsNip_08t0145501-01;protein_id=OsNip_08t0145501-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2573099	2573290	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0145501-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2759756	2759883	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t014826A-02;Tag=IsoSeq:G12694.2;Source=Nipponbare.panicle_G9969.2;prot_id "UniRef90_A0A0P0XSX7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	2758766	2759599	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t014826A-03;Tag=IsoSeq:G12694.3;Source=Nipponbare.panicle_G9969.3;prot_id "UniRef90_A0A0P0X3B9";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2759756	2760587	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t014826A-03;Tag=IsoSeq:G12694.3;Source=Nipponbare.panicle_G9969.3;prot_id "UniRef90_A0A0P0X3B9";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	2760819	2765216	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0148267-00;Parent=gene:OsNip_08g0148267;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0148267-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	2934783	2934784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151000-01;Tag=IsoSeq:G12699.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9974.2,Nipponbare.leaf_G5768.2,Nipponbare.root_G7602.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5HNV5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2938179	2938271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151000-01;Tag=IsoSeq:G12699.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9974.2,Nipponbare.leaf_G5768.2,Nipponbare.root_G7602.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5HNV5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2938341	2938463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151000-01;Tag=IsoSeq:G12699.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9974.2,Nipponbare.leaf_G5768.2,Nipponbare.root_G7602.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5HNV5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2939052	2939106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151000-01;Tag=IsoSeq:G12699.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9974.2,Nipponbare.leaf_G5768.2,Nipponbare.root_G7602.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5HNV5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	2939716	2940110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151000-01;Tag=IsoSeq:G12699.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9974.2,Nipponbare.leaf_G5768.2,Nipponbare.root_G7602.1;prot_id "UniRef90_A0A6P5HNV5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	2948553	2951372	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0151300;Name=CEF1;biotype=protein_coding;description=R2R3-MYB;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	2948553	2951314	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0151300-02;Parent=gene:OsNip_08g0151300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0151300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2948553	2948983	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0151300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3009693	3009969	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	3010811	3010980	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;Name=OsNip_08t0152500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0152500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	3010811	3010980	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;protein_id=OsNip_08t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	3011936	3012048	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;protein_id=OsNip_08t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	3012192	3012270	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0152500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;protein_id=OsNip_08t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	3012192	3012527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;Name=OsNip_08t0152500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0152500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	3012271	3012527	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	3009693	3012528	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0152500-02;Parent=gene:OsNip_08g0152500;transcript_id=OsNip_08t0152500-02;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1
Chr08	TAMA	exon	3012192	3012528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-02;Name=OsNip_08t0152500-02;exon_id=OsNip_08t0152500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1;prot_id "UniRef90_M0TDC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	TAMA	exon	3009693	3012048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-02;Name=OsNip_08t0152500-02;exon_id=OsNip_08t0152500-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1;prot_id "UniRef90_M0TDC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	3012527	3012528	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-02;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1;prot_id "UniRef90_M0TDC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	3012192	3012308	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-02;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1;prot_id "UniRef90_M0TDC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	3009693	3012048	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0152500-02;Tag=IsoSeq:G12703.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9978.1;prot_id "UniRef90_M0TDC6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	3013807	3016330	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0152600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	3013807	3016330	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0152600-01;Parent=gene:OsNip_08g0152600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0152600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3285096	3285348	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0156700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	3295568	3295889	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0156800-01;Name=OsNip_08t0156800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0156800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3301039	3301473	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0156900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	3337804	3338882	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0157500-03;Tag=IsoSeq:G12724.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G9998.3,Nipponbare.leaf_G5780.3;prot_id "UniRef90_A0A0C5ATR6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	3514899	3515342	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0159900-01;Name=OsNip_08t0159900-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0159900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	3515496	3518732	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0159900-01;Name=OsNip_08t0159900-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0159900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	3842271	3842346	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0165800-00;Parent=transcript:OsNip_08t0165800-00;protein_id=OsNip_08t0165800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	4065431	4065561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0169600-01;Name=OsNip_08t0169600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0169600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	4254521	4255342	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0172566-00;Parent=transcript:OsNip_08t0172566-00;protein_id=OsNip_08t0172566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	4254521	4255346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0172566-00;Name=OsNip_08t0172566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0172566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4255343	4255346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0172566-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	4268283	4268909	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0172800-01;Parent=gene:OsNip_08g0172800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0172800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4268283	4268408	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0172800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	4268283	4268909	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0172800-01;Name=OsNip_08t0172800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0172800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	4268409	4268690	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0172800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0172800-01;protein_id=OsNip_08t0172800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4268691	4268909	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0172800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	4290418	4291283	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0173300;Name=OsNip_PROPEP3;biotype=protein_coding;description=Small;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	4290418	4291283	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0173300-01;Parent=gene:OsNip_08g0173300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4290418	4290535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	4290418	4291283	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0173300-01;Name=OsNip_08t0173300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0173300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	4290536	4291084	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0173300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0173300-01;protein_id=OsNip_08t0173300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	4326090	4326315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0174300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4329769	4329843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0174300-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	4597056	4597381	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0178650-00;Parent=gene:OsNip_08g0178650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0178650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	4599751	4604714	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0178700-01;Parent=gene:OsNip_08g0178700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0178700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4599751	4600008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0178700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	4968157	4969131	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0184600-01;Name=OsNip_08t0184600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0184600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5147424	5147948	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0188000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	5401162	5404366	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0192400-00;Parent=gene:OsNip_08g0192400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0192400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5418272	5418401	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0192800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	5418272	5419613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0192800-01;Name=OsNip_08t0192800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0192800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	5418402	5419613	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0192800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0192800-01;protein_id=OsNip_08t0192800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	5519881	5520342	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t019450A-01;Tag=IsoSeq:G12818.1;Source=Nipponbare.root_G7669.1;prot_id "UniRef90_Q2R8Y7";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	exon	5523072	5523382	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t019450A-02;Name=OsNip_08t019450A-02-E1;exon_id=OsNip_08t019450A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12818.2;Source=Nipponbare.leaf_G5825.1;prot_id "UniRef90_Q2R8Y7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5584231	5584505	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0196200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	5939682	5939791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0202200-01;Name=OsNip_08t0202200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0202200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	5951646	5951717	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0202300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	5953748	5953819	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0202300-02;Parent=transcript:OsNip_08t0202300-02;protein_id=OsNip_08t0202300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	5953908	5954019	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0202300-02;Parent=transcript:OsNip_08t0202300-02;protein_id=OsNip_08t0202300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5954020	5954145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0202300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5954285	5954356	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0202300-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	6004271	6004772	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0203325-00;Name=OsNip_08t0203325-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0203325-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6006975	6007052	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0203350-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	6015745	6023225	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0203400-01;Parent=gene:OsNip_08g0203400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0203400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	6142162	6143084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-01;Name=OsNip_08t0205200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0205200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6142367	6143083	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0205200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0205200-01;protein_id=OsNip_08t0205200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6143084	6143084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	6142177	6144418	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0205200-02;Parent=gene:OsNip_08g0205200;transcript_id=OsNip_08t0205200-02;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3
Chr08	TAMA	exon	6143767	6144418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;Name=OsNip_08t0205200-02;exon_id=OsNip_08t0205200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	6143767	6144417	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0205200-02;Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;protein_id=OsNip_08t0205200-02;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	exon	6142177	6143091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;Name=OsNip_08t0205200-02;exon_id=OsNip_08t0205200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	6143077	6143091	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0205200-02;Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;protein_id=OsNip_08t0205200-02;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	6144418	6144418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	6142177	6143074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205200-02;Tag=IsoSeq:G12840.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7679.3;prot_id "UniRef90_A0A4S8IUP8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	6155162	6157777	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0205300;Name=OsNip_SET28;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6168352	6168582	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6168352	6169288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-01;Name=OsNip_08t0205800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0205800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6168583	6168915	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0205800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0205800-01;protein_id=OsNip_08t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6168916	6169288	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	6168355	6168502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-02;Name=OsNip_08t0205800-02;exon_id=OsNip_08t0205800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12842.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5831.1,Nipponbare.panicle_G10085.1,Nipponbare.root_G7681.2;prot_id "UniRef90_J3MR74";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	exon	6168996	6169301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-02;Name=OsNip_08t0205800-02;exon_id=OsNip_08t0205800-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G12842.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5831.1,Nipponbare.panicle_G10085.1,Nipponbare.root_G7681.2;prot_id "UniRef90_J3MR74";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	6168355	6168502	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-02;Tag=IsoSeq:G12842.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5831.1,Nipponbare.panicle_G10085.1,Nipponbare.root_G7681.2;prot_id "UniRef90_J3MR74";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	6168996	6169075	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-02;Tag=IsoSeq:G12842.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5831.1,Nipponbare.panicle_G10085.1,Nipponbare.root_G7681.2;prot_id "UniRef90_J3MR74";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	6169184	6169301	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0205800-02;Tag=IsoSeq:G12842.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5831.1,Nipponbare.panicle_G10085.1,Nipponbare.root_G7681.2;prot_id "UniRef90_J3MR74";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	6170105	6175794	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0205900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	6170105	6175794	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0205900-01;Parent=gene:OsNip_08g0205900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0205900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6359059	6359189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0209000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6359204	6359451	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0209000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6432276	6433911	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0210300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6432276	6434158	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0210300-01;Name=OsNip_08t0210300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0210300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	6553984	6585906	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0211750;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	6553984	6585906	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0211750-01;Parent=gene:OsNip_08g0211750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6553984	6554192	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6553984	6554246	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;Name=OsNip_08t0211750-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0211750-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6554193	6554246	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0211750-01;Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;protein_id=OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6555766	6555828	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;Name=OsNip_08t0211750-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0211750-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6555766	6555828	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0211750-01;Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;protein_id=OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6585601	6585714	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0211750-01;Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;protein_id=OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6585601	6585906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;Name=OsNip_08t0211750-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0211750-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6585715	6585906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0211750-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	6585028	6586115	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0213200-00;Parent=gene:OsNip_08g0213200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6585028	6585058	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6585059	6585477	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0213200-00;Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;protein_id=OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	6585618	6585729	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0213200-00;Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;protein_id=OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6585618	6585738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;Name=OsNip_08t0213200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0213200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6585730	6585738	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	6586045	6586115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;Name=OsNip_08t0213200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0213200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	6586045	6586115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0213200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	6598294	6603374	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0213400-01;Parent=gene:OsNip_08g0213400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0213400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	7341433	7341718	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0220600-03;Parent=transcript:OsNip_08t0220600-03;protein_id=OsNip_08t0220600-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	7341433	7343203	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0220600-03;Name=OsNip_08t0220600-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0220600-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	7341719	7343203	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0220600-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	7347935	7348105	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0220600-04;Name=OsNip_08t0220600-04;exon_id=OsNip_08t0220600-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12859.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10099.2;prot_id "UniRef90_A0A3S3MSQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	7347935	7348104	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0220600-04;Parent=transcript:OsNip_08t0220600-04;protein_id=OsNip_08t0220600-04;Tag=IsoSeq:G12859.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10099.2;prot_id "UniRef90_A0A3S3MSQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	7568558	7569057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;Name=OsNip_08t0224300-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0224300-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7568558	7569057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7569350	7569421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	7569350	7569490	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;Name=OsNip_08t0224300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0224300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	7569422	7569490	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0224300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;protein_id=OsNip_08t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	7569935	7570070	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;Name=OsNip_08t0224300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0224300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	7569935	7570070	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0224300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0224300-01;protein_id=OsNip_08t0224300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7691858	7692043	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0225900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8307815	8308011	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8308653	8308841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8308956	8309580	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8310971	8310984	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0236900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;protein_id=OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8311226	8311538	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0236900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;protein_id=OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8311226	8311773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;Name=OsNip_08t0236900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0236900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8311539	8311773	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0236900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	8328017	8329241	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0237000;Name=OsNip_XTH17;biotype=protein_coding;description=Xyloglucan;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	8328017	8329241	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0237000-01;Parent=gene:OsNip_08g0237000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0237000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8328017	8328059	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8328017	8328541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;Name=OsNip_08t0237000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8328060	8328541	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0237000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;protein_id=OsNip_08t0237000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8328640	8329030	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0237000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;protein_id=OsNip_08t0237000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8328640	8329241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;Name=OsNip_08t0237000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0237000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8329031	8329241	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	8328017	8329220	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0237000-02;Parent=gene:OsNip_08g0237000;transcript_id=OsNip_08t0237000-02;Tag=IsoSeq:G12883.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7700.3
Chr08	TAMA	exon	8328017	8329220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-02;Name=OsNip_08t0237000-02;exon_id=OsNip_08t0237000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12883.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7700.3;prot_id "UniRef90_B4FV67";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	8328017	8328439	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0237000-02;Parent=transcript:OsNip_08t0237000-02;protein_id=OsNip_08t0237000-02;Tag=IsoSeq:G12883.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7700.3;prot_id "UniRef90_B4FV67";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	8328443	8329220	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237000-02;Tag=IsoSeq:G12883.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7700.3;prot_id "UniRef90_B4FV67";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	8335699	8339610	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0237100;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	8335699	8339610	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0237100-01;Parent=gene:OsNip_08g0237100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8335699	8336027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8335699	8336027	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8336661	8336716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8336661	8336716	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8336827	8336929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8336827	8336929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8338128	8338233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8338128	8338233	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8338400	8338470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8338400	8338470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8338614	8338733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8338614	8338733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8339046	8339153	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8339046	8339610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Name=OsNip_08t0237100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0237100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8339154	8339387	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0237100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;protein_id=OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8339388	8339610	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	8342253	8346555	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0237200;Name=OsNip_MPG4;biotype=protein_coding;description=Mannose-1-phosphate;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	8342253	8346555	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0237200-01;Parent=gene:OsNip_08g0237200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0237200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8342253	8342407	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0237200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8419539	8419628	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8419720	8419820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238600-01;Name=OsNip_08t0238600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8419720	8419820	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8420237	8420579	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	8415405	8417869	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0238700-01;Parent=gene:OsNip_08g0238700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8415405	8415779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8415405	8415779	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8416252	8416327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8416252	8416327	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	8416479	8416488	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8416479	8416548	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8416489	8416548	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0238700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;protein_id=OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	8416646	8416745	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0238700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;protein_id=OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	8416837	8416989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8416893	8416989	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8417315	8417389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8417315	8417389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8417500	8417869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Name=OsNip_08t0238700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0238700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	8417500	8417869	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0238700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	8489401	8490191	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0240500-01;Tag=IsoSeq:G12888.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7704.3;prot_id "UniRef90_A0A5J9TX41";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	8494099	8495316	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0240566;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	8494099	8495316	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0240566-00;Parent=gene:OsNip_08g0240566;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0240566-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	8494099	8494470	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0240566-00;Name=OsNip_08t0240566-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0240566-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9439937	9440500	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255020-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9440932	9441162	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255020-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	9440105	9440500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255140-00;Name=OsNip_08t0255140-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0255140-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9440105	9440500	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255140-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9440934	9441435	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255140-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	9477453	9482623	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0255500-00;Parent=gene:OsNip_08g0255500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9477453	9477763	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9478191	9478319	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9478449	9480270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9480280	9480304	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	9480305	9480463	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0255500-00;Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;protein_id=OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9480574	9480613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	9480574	9480613	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0255500-00;Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;protein_id=OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9480744	9480879	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	9480744	9480879	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0255500-00;Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;protein_id=OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	9480973	9481066	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0255500-00;Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;protein_id=OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9480973	9481209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9481067	9481209	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9481896	9482159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9481896	9482159	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9482253	9482418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9482253	9482418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	9482438	9482623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Name=OsNip_08t0255500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0255500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	9482438	9482623	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0255500-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	gene	9489124	9491764	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g025599A;Tag=IsoSeq:G12919
Chr08	TAMA	mRNA	9489124	9491764	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t025599A-01;Parent=gene:OsNip_08g025599A;transcript_id=OsNip_08t025599A-01;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1
Chr08	TAMA	exon	9491599	9491764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;Name=OsNip_08t025599A-01-E1;exon_id=OsNip_08t025599A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	9491599	9491763	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t025599A-01;Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;protein_id=OsNip_08t025599A-01;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	exon	9489124	9489409	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;Name=OsNip_08t025599A-01-E2;exon_id=OsNip_08t025599A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	9489296	9489409	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t025599A-01;Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;protein_id=OsNip_08t025599A-01;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	9491764	9491764	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	9489124	9489293	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t025599A-01;Tag=IsoSeq:G12919.1;Source=Nipponbare.leaf_G5868.1,Nipponbare.panicle_G10143.1;prot_id "UniRef90_UPI00077551B2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	9507285	9508548	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0256000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	9507285	9508548	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0256000-01;Parent=gene:OsNip_08g0256000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0256000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	9780047	9780687	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0260400-00;Parent=transcript:OsNip_08t0260400-00;protein_id=OsNip_08t0260400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	9781612	9782015	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0260400-00;Name=OsNip_08t0260400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0260400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	10218508	10218657	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0267800-01;Name=OsNip_08t0267800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0267800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10220424	10220568	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0267800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	10292683	10292821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269600-01;Name=OsNip_08t0269600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0269600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10292683	10292821	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0269600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0269600-01;protein_id=OsNip_08t0269600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	10292052	10292864	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0269600-02;Parent=gene:OsNip_08g0269600;transcript_id=OsNip_08t0269600-02;Tag=IsoSeq:G12932.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10153.1
Chr08	TAMA	exon	10292683	10292864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269600-02;Name=OsNip_08t0269600-02;exon_id=OsNip_08t0269600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12932.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10153.1;prot_id "UniRef90_B8B916";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	10292757	10292864	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0269600-02;Parent=transcript:OsNip_08t0269600-02;protein_id=OsNip_08t0269600-02;Tag=IsoSeq:G12932.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10153.1;prot_id "UniRef90_B8B916";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	10292683	10292754	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269600-02;Tag=IsoSeq:G12932.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10153.1;prot_id "UniRef90_B8B916";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	10292052	10292529	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269600-02;Tag=IsoSeq:G12932.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10153.1;prot_id "UniRef90_B8B916";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	10294239	10295050	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0269700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	10294239	10295050	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0269700-01;Parent=gene:OsNip_08g0269700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10294239	10294455	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	10294239	10294730	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0269700-01;Name=OsNip_08t0269700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0269700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10294456	10294730	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0269700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0269700-01;protein_id=OsNip_08t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10294880	10295015	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0269700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0269700-01;protein_id=OsNip_08t0269700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	10453730	10456174	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0272200;biotype=protein_coding;description=Pentatricopeptide;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10453730	10454373	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0272200-00;Parent=transcript:OsNip_08t0272200-00;protein_id=OsNip_08t0272200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	10455127	10456174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0272200-00;Name=OsNip_08t0272200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0272200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10456157	10456174	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0272200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10473631	10474020	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0272800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0272800-01;protein_id=OsNip_08t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10474021	10474373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0272800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	10491641	10494280	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0273000;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	10491641	10494280	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0273000-01;Parent=gene:OsNip_08g0273000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0273000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10491641	10492907	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0273000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	10491641	10494280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0273000-01;Name=OsNip_08t0273000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0273000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	10492908	10493144	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0273000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0273000-01;protein_id=OsNip_08t0273000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10493145	10494280	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0273000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	gene	10508125	10509221	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g027359A;Tag=IsoSeq:G12939
Chr08	TAMA	mRNA	10508125	10509221	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t027359A-01;Parent=gene:OsNip_08g027359A;transcript_id=OsNip_08t027359A-01;Tag=IsoSeq:G12939.1;Source=Nipponbare.panicle_G10159.1
Chr08	TAMA	exon	10508125	10508387	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t027359A-01;Name=OsNip_08t027359A-01-E1;exon_id=OsNip_08t027359A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12939.1;Source=Nipponbare.panicle_G10159.1;prot_id "UniRef90_UPI000C1CF2BD";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10591039	10591072	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0275600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10932591	10932864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0280200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	10932623	10933745	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0280200-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	11074545	11074631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0282200-01;Name=OsNip_08t0282200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0282200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11075446	11075564	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0282200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	11076743	11078779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0282200-01;Name=OsNip_08t0282200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0282200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	11078272	11078643	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0282200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0282200-01;protein_id=OsNip_08t0282200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	11453068	11453068	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0288200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11548007	11548414	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0290000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11549736	11549937	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0290000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11550178	11550667	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0290000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	11551804	11551985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0290000-01;Name=OsNip_08t0290000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0290000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11551804	11551985	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0290000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	11894411	11894446	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0295300-02;Name=OsNip_08t0295300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0295300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	11897094	11897611	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0295300-03;Name=OsNip_08t0295300-03;exon_id=OsNip_08t0295300-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G12963.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7742.1,Nipponbare.panicle_G10178.1;prot_id "UniRef90_M8BWT2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	13472944	13473077	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0315001-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	14157919	14158334	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0323400-02;Tag=IsoSeq:G12999.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5909.2;prot_id "UniRef90_A0A1D6L8H6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14360542	14360812	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0326600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	14358602	14358852	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0326600-02;Name=OsNip_08t0326600-02;exon_id=OsNip_08t0326600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G13004.8;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G5912.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14977891	14977932	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0334900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	15341941	15342242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0340700-02;Tag=IsoSeq:G13027.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5916.1;prot_id "UniRef90_B8BM20";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15354219	15354386	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0340900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15356847	15356884	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0340900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	15361705	15361739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t034169A-01;Tag=IsoSeq:G13028.1;Source=Nipponbare.root_G7788.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	15391572	15398468	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0341700-01;Parent=gene:OsNip_08g0341700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0341700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	15391572	15391838	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0341700-01;Name=OsNip_08t0341700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0341700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	15393787	15394105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0341700-01;Name=OsNip_08t0341700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0341700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	15397807	15397881	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0341700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0341700-01;protein_id=OsNip_08t0341700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	15397983	15398003	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0341700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0341700-01;protein_id=OsNip_08t0341700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	15558033	15558167	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0344100-01;Name=OsNip_08t0344100-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0344100-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	15558033	15558167	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0344100-01;protein_id=OsNip_08t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	15558714	15558737	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0344100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0344100-01;protein_id=OsNip_08t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	15558714	15559145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0344100-01;Name=OsNip_08t0344100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0344100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15558738	15559145	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0344100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	15554256	15557398	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0344200;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15719018	15719197	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0346600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	15734057	15734381	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t034679A-01;Tag=IsoSeq:G13044.1;Source=Nipponbare.root_G7798.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	16237710	16238205	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0355500-03;Name=OsNip_08t0355500-03-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0355500-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	16239731	16240185	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0355500-03;Name=OsNip_08t0355500-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0355500-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16512952	16513189	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0359050-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	16513780	16517887	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0359100-01;Parent=gene:OsNip_08g0359100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0359100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	16965034	16965337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0366050-00;Name=OsNip_08t0366050-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0366050-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	16994337	16994635	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t036729A-01;Tag=IsoSeq:G13072.1;Source=Nipponbare.panicle_G10260.1;prot_id "UniRef90_M7ZJJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	17061538	17061806	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0367300-00;Name=OsNip_08t0367300-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0367300-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	17351722	17351892	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0371608-00;Parent=transcript:OsNip_08t0371608-00;protein_id=OsNip_08t0371608-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17646157	17646632	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0376200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18160631	18160976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0384900-01;Name=OsNip_08t0384900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0384900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18160726	18160976	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0384900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	18156725	18156919	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0384900-02;Name=OsNip_08t0384900-02;exon_id=OsNip_08t0384900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13102.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10284.1,Nipponbare.root_G7822.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9K039";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18308562	18308728	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0387400-01;Name=OsNip_08t0387400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0387400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18449766	18450279	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389601-01;Name=OsNip_08t0389601-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0389601-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18454435	18454473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18452699	18452856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18452699	18452856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18453023	18453050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18453023	18453236	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18453051	18453236	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0389700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;protein_id=OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18454135	18454294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18455715	18455779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18455715	18455779	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0389700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;protein_id=OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18455938	18455965	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18455938	18455965	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0389700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;protein_id=OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18456206	18456292	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E8;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18457632	18458055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Name=OsNip_08t0389700-02-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18457718	18458055	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18452711	18452856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Name=OsNip_08t0389700-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0389700-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18452711	18452856	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18453023	18453050	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18454135	18454294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Name=OsNip_08t0389700-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0389700-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18454135	18454294	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0389700-03;Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;protein_id=OsNip_08t0389700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18454382	18454434	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0389700-03;Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;protein_id=OsNip_08t0389700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18454382	18454473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Name=OsNip_08t0389700-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0389700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18454435	18454473	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0389700-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	gene	18465899	18467299	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g038999A;Tag=IsoSeq:G13113
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18547691	18547920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0391700-00;Name=OsNip_08t0391700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0391700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18547691	18547920	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0391700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0391700-00;protein_id=OsNip_08t0391700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	18542196	18543929	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0391700-01;Parent=gene:OsNip_08g0391700;transcript_id=OsNip_08t0391700-01;Tag=IsoSeq:G13118.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10296.1
Chr08	TAMA	exon	18542196	18543929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0391700-01;Name=OsNip_08t0391700-01;exon_id=OsNip_08t0391700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13118.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10296.1;prot_id "UniRef90_K3XYG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	18543726	18543929	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0391700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0391700-01;protein_id=OsNip_08t0391700-01;Tag=IsoSeq:G13118.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10296.1;prot_id "UniRef90_K3XYG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	18542196	18543723	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0391700-01;Tag=IsoSeq:G13118.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10296.1;prot_id "UniRef90_K3XYG3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	18542554	18543631	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0391800;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18542554	18542943	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0391800-00;Parent=transcript:OsNip_08t0391800-00;protein_id=OsNip_08t0391800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18542554	18543631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0391800-00;Name=OsNip_08t0391800-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0391800-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18542944	18543631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0391800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	18568971	18570352	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0392100-00;Parent=gene:OsNip_08g0392100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0392100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18676305	18676416	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0393600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0393600-01;protein_id=OsNip_08t0393600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18676577	18677613	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0393600-01;Name=OsNip_08t0393600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0393600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18677704	18677800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0393600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18678169	18678475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0393600-01;Name=OsNip_08t0393600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0393600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18678169	18678475	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0393600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	18680131	18681463	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0393700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	18680131	18681463	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0393700-01;Parent=gene:OsNip_08g0393700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0393700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18680131	18680699	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0393700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18767337	18767500	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0395500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0395500-01;protein_id=OsNip_08t0395500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18767586	18768060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0395500-01;Name=OsNip_08t0395500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0395500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18767709	18768060	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0395500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	18770027	18771421	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0395700-01;Parent=gene:OsNip_08g0395700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0395700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18770027	18770515	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0395700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	18770027	18771421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0395700-01;Name=OsNip_08t0395700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0395700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	18770516	18770650	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0395700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0395700-01;protein_id=OsNip_08t0395700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18770651	18771421	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0395700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	18770340	18771447	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0395700-02;Parent=gene:OsNip_08g0395700;transcript_id=OsNip_08t0395700-02;Tag=IsoSeq:G13123.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7831.1,Nipponbare.panicle_G10301.1
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	18959003	18959667	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0397900-02;Name=OsNip_08t0397900-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0397900-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18960126	18960448	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0398000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19031198	19031323	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0398700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0398700-02;protein_id=OsNip_08t0398700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19031324	19031552	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0398700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19139675	19139732	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19141068	19141699	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401100-01;Name=OsNip_08t0401100-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0401100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19142778	19142924	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401200-00;Name=OsNip_08t0401200-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0401200-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19143373	19143445	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401200-00;Name=OsNip_08t0401200-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0401200-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	19157206	19161819	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0401500-01;Parent=gene:OsNip_08g0401500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19157206	19157414	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19157206	19157469	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;Name=OsNip_08t0401500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0401500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19159091	19159404	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0401500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;protein_id=OsNip_08t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19160692	19161046	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;Name=OsNip_08t0401500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0401500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19160692	19161046	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0401500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;protein_id=OsNip_08t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19161602	19161671	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0401500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;protein_id=OsNip_08t0401500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19161602	19161819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0401500-01;Name=OsNip_08t0401500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0401500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19463943	19464249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0407200-01;Name=OsNip_08t0407200-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0407200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19463943	19464249	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19466377	19466438	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0407200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	19647162	19648087	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0410350;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	19647725	19649962	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0410500;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19648504	19649231	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410500-01;Name=OsNip_08t0410500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0410500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19648504	19649231	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0410500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0410500-01;protein_id=OsNip_08t0410500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19649318	19649962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410500-01;Name=OsNip_08t0410500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0410500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19649748	19649962	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	gene	19656081	19657361	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g041089A;Tag=IsoSeq:G13149
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Chr08	TAMA	exon	19656081	19657361	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t041089A-01;Name=OsNip_08t041089A-01-E1;exon_id=OsNip_08t041089A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13149.1;Source=Nipponbare.root_G7848.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0J5H4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	19656948	19657361	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t041089A-01;Parent=transcript:OsNip_08t041089A-01;protein_id=OsNip_08t041089A-01;Tag=IsoSeq:G13149.1;Source=Nipponbare.root_G7848.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0J5H4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	19656081	19656945	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t041089A-01;Tag=IsoSeq:G13149.1;Source=Nipponbare.root_G7848.1;prot_id "UniRef90_A0A0E0J5H4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	19657493	19661886	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0410900;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	19657493	19661886	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0410900-01;Parent=gene:OsNip_08g0410900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19657493	19657800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19657493	19657800	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19658015	19658154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19658015	19658154	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19658871	19658929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19658871	19658929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19660240	19660956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19660240	19660956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19661214	19661301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19661214	19661301	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19661573	19661607	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19661573	19661886	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;Name=OsNip_08t0410900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0410900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19661608	19661886	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0410900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0410900-01;protein_id=OsNip_08t0410900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19657861	19659120	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19659121	19659306	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0410950-00;Parent=transcript:OsNip_08t0410950-00;protein_id=OsNip_08t0410950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19659307	19659417	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0410950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	19661984	19662980	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0411000-00;Name=OsNip_08t0411000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0411000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19661984	19662980	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0411000-00;Parent=transcript:OsNip_08t0411000-00;protein_id=OsNip_08t0411000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	19663053	19663477	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0411000-00;Name=OsNip_08t0411000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0411000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19663053	19663477	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0411000-00;Parent=transcript:OsNip_08t0411000-00;protein_id=OsNip_08t0411000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	19672758	19676628	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0411200;biotype=protein_coding;description=Methyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	19900150	19900285	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0416100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0416100-01;protein_id=OsNip_08t0416100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20172202	20172573	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0421500-01;Name=OsNip_08t0421500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0421500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	20181762	20182590	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0421600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	20181762	20182590	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0421600-00;Parent=gene:OsNip_08g0421600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0421600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20181762	20181954	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0421600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	20181762	20182590	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0421600-00;Name=OsNip_08t0421600-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0421600-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20385738	20385975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0424500-02;Name=OsNip_08t0424500-01-E15;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0424500-01-E15;rank=12;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20388591	20388993	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0424600-01;Name=OsNip_08t0424600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0424600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	20402026	20405973	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0425000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20403303	20403443	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0425000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0425000-01;protein_id=OsNip_08t0425000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20405133	20405332	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0425000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0425000-01;protein_id=OsNip_08t0425000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20405499	20405712	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0425000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0425000-01;protein_id=OsNip_08t0425000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20671668	20672384	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0428900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0428900-01;protein_id=OsNip_08t0428900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20672940	20673557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0428900-01;Name=OsNip_08t0428900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0428900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20673209	20673557	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0428900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20698420	20699009	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0429200-01;Name=OsNip_08t0429200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0429200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	20698684	20703190	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0429200-02;Parent=gene:OsNip_08g0429200;transcript_id=OsNip_08t0429200-02;Tag=IsoSeq:G13193.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10355.3
Chr08	TAMA	exon	20702485	20703190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0429200-02;Name=OsNip_08t0429200-02;exon_id=OsNip_08t0429200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13193.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10355.3;prot_id "UniRef90_A0A3L6E338";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	exon	20698684	20699056	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0429200-02;Name=OsNip_08t0429200-02;exon_id=OsNip_08t0429200-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13193.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10355.3;prot_id "UniRef90_A0A3L6E338";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	20702485	20703057	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0429200-02;Tag=IsoSeq:G13193.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10355.3;prot_id "UniRef90_A0A3L6E338";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	20804129	20805096	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0430300-01;Name=OsNip_08t0430300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0430300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20812503	20812912	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0430500-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	20812503	20812972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0430500-03;Name=OsNip_08t0430500-03-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0430500-03-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20852495	20852941	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0431100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20851336	20851337	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0431100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	20851336	20851574	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0431100-03;Name=OsNip_08t0431100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0431100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20851338	20851574	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0431100-03;Parent=transcript:OsNip_08t0431100-03;protein_id=OsNip_08t0431100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	20851661	20851871	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0431100-03;Name=OsNip_08t0431100-01-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0431100-01-E5;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	20851661	20851871	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0431100-03;Parent=transcript:OsNip_08t0431100-03;protein_id=OsNip_08t0431100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21056008	21056008	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	21054788	21056136	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434300-02;Name=OsNip_08t0434300-02;exon_id=OsNip_08t0434300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13210.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5992.5;prot_id "UniRef90_A0A059A667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	21056024	21056136	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0434300-02;Parent=transcript:OsNip_08t0434300-02;protein_id=OsNip_08t0434300-02;Tag=IsoSeq:G13210.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5992.5;prot_id "UniRef90_A0A059A667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	21054788	21056021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434300-02;Tag=IsoSeq:G13210.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G5992.5;prot_id "UniRef90_A0A059A667";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21083276	21083374	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21083924	21084029	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0434632-01;Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;protein_id=OsNip_08t0434632-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21084311	21084921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21085019	21085422	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;Name=OsNip_08t0434632-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0434632-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21085019	21085422	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21085509	21086649	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434632-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	21089942	21092044	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0434700;biotype=protein_coding;description=Homeodomain-like;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	21089942	21092044	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0434700-01;Parent=gene:OsNip_08g0434700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0434700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21089942	21090492	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0434700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21403209	21403435	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0440000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	21565505	21565555	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442400-01;Name=OsNip_08t0442400-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0442400-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21565647	21565723	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0442400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0442400-01;protein_id=OsNip_08t0442400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21567447	21568141	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0442400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0442400-01;protein_id=OsNip_08t0442400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21567447	21568488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442400-01;Name=OsNip_08t0442400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0442400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21568142	21568488	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	21577709	21579139	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0442600;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21577709	21578278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21577709	21579139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442600-01;Name=OsNip_08t0442600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0442600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21578279	21578494	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0442600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0442600-01;protein_id=OsNip_08t0442600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21578495	21579139	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	21578028	21583612	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0442700;Name=COE1;biotype=protein_coding;description=Leucine-rich;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	21578028	21583519	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0442700-02;Parent=gene:OsNip_08g0442700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0442700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21578028	21578672	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21578028	21579053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;Name=OsNip_08t0442700-02-E9;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0442700-02-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21578673	21579053	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0442700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;protein_id=OsNip_08t0442700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21579605	21579996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;Name=OsNip_08t0442700-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0442700-01-E10;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21579605	21579996	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0442700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;protein_id=OsNip_08t0442700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	21581950	21582086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;Name=OsNip_08t0442700-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0442700-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	21581950	21582086	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0442700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0442700-02;protein_id=OsNip_08t0442700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	22113532	22113890	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0452100-01;Tag=IsoSeq:G13256.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10404.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	22112815	22113817	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0452200;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	22112815	22113817	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0452200-01;Parent=gene:OsNip_08g0452200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0452200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22112815	22112919	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0452200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22112815	22113817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0452200-01;Name=OsNip_08t0452200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0452200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22113601	22113817	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0452200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	22190131	22190132	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453200-03;Tag=IsoSeq:G13257.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10405.1,Nipponbare.root_G7907.1,Nipponbare.leaf_G6008.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0XGH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	22190304	22190581	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453200-03;Tag=IsoSeq:G13257.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10405.1,Nipponbare.root_G7907.1,Nipponbare.leaf_G6008.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0XGH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	22191043	22191160	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453200-03;Tag=IsoSeq:G13257.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10405.1,Nipponbare.root_G7907.1,Nipponbare.leaf_G6008.1;prot_id "UniRef90_A0A0P0XGH0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	22223904	22224021	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0453766-01;Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;protein_id=OsNip_08t0453766-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	22224159	22224276	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;Name=OsNip_08t0453766-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0453766-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22225757	22225783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22226060	22226141	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22227224	22227416	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;Name=OsNip_08t0453766-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0453766-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22227224	22227416	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453766-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	22220068	22227461	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0453800;Name=CDKC;biotype=protein_coding;description=Serine/threonine;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	22220068	22227461	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0453800-00;Parent=gene:OsNip_08g0453800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0453800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22220068	22220306	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0453800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	22334997	22335553	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0455600-01;Name=OsNip_08t0455600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0455600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22450098	22450402	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0457600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22446853	22446902	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0457600-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22446853	22447607	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0457600-02;Name=OsNip_08t0457600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0457600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	22532195	22532404	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0459300-02;Name=OsNip_08t0459300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0459300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	22617837	22618099	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0460600-02;Tag=IsoSeq:G13272.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10414.5;prot_id "UniRef90_A0A287XYJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	22616860	22617173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0460600-02;Tag=IsoSeq:G13272.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10414.5;prot_id "UniRef90_A0A287XYJ6";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22617036	22617037	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0460650-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22617036	22617604	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0460650-01;Name=OsNip_08t0460650-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0460650-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22829894	22830022	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0464950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22830116	22830195	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0464950-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22830763	22831125	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0464950-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	22829455	22831213	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0465000;Name=OsNip_hox27;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	22829455	22831213	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0465000-00;Parent=gene:OsNip_08g0465000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0465000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22829455	22829631	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0465000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22829455	22829829	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0465000-00;Name=OsNip_08t0465000-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0465000-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	22829632	22829829	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0465000-00;Parent=transcript:OsNip_08t0465000-00;protein_id=OsNip_08t0465000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	22830935	22831006	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0465000-00;Parent=transcript:OsNip_08t0465000-00;protein_id=OsNip_08t0465000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	22830935	22831213	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0465000-00;Name=OsNip_08t0465000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0465000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	23076527	23076763	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0469400-00;Name=OsNip_08t0469400-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0469400-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23076944	23077193	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0469400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	23077629	23079429	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0469500-01;Parent=gene:OsNip_08g0469500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0469500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	23353863	23355003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0474000-02;Name=OsNip_08t0474000-02;exon_id=OsNip_08t0474000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13299.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7933.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6MTZ9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	CDS	23354106	23354606	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0474000-02;Parent=transcript:OsNip_08t0474000-02;protein_id=OsNip_08t0474000-02;Tag=IsoSeq:G13299.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7933.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6MTZ9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	23353863	23354105	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0474000-02;Tag=IsoSeq:G13299.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7933.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6MTZ9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	23354610	23355003	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0474000-02;Tag=IsoSeq:G13299.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G7933.3;prot_id "UniRef90_A0A3B6MTZ9";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	23376142	23376787	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0474100;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23376142	23376142	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0474100-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	23376142	23376787	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0474100-00;Name=OsNip_08t0474100-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0474100-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	23381803	23383437	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0474400-00;Parent=gene:OsNip_08g0474400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0474400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	23384707	23385710	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0474500;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	23450412	23451554	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0476050-01;Name=OsNip_08t0476050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0476050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	23451018	23451317	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0476050-01;Parent=transcript:OsNip_08t0476050-01;protein_id=OsNip_08t0476050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	23572867	23573388	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0477900-00;Parent=transcript:OsNip_08t0477900-00;protein_id=OsNip_08t0477900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	23575567	23576307	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0478000;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	23763739	23763739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0481000-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	23843555	23843689	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0482100-02;Parent=transcript:OsNip_08t0482100-02;protein_id=OsNip_08t0482100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	23843555	23843724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-02;Name=OsNip_08t0482100-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0482100-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23843690	23843724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	23843908	23844486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-02;Name=OsNip_08t0482100-02-E15;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0482100-02-E15;rank=15;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23843908	23844486	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	23834180	23844253	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0482100-03;Parent=gene:OsNip_08g0482100;transcript_id=OsNip_08t0482100-03;Tag=IsoSeq:G13324.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10450.2
Chr08	TAMA	exon	23834180	23834487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-03;Name=OsNip_08t0482100-03;exon_id=OsNip_08t0482100-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13324.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10450.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3III8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	CDS	23834182	23834487	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0482100-03;Parent=transcript:OsNip_08t0482100-03;protein_id=OsNip_08t0482100-03;Tag=IsoSeq:G13324.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10450.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3III8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr08	TAMA	exon	23835077	23835575	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0482100-03;Name=OsNip_08t0482100-03;exon_id=OsNip_08t0482100-03-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13324.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10450.2;prot_id "UniRef90_A0A1R3III8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	23984412	23984695	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0485300-00;Name=OsNip_08t0485300-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0485300-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	23990662	23990807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0485400-02;Name=OsNip_08t0485400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0485400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	23990921	23991140	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0485400-02;Parent=transcript:OsNip_08t0485400-02;protein_id=OsNip_08t0485400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	23995179	23995211	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0485400-02;Parent=transcript:OsNip_08t0485400-02;protein_id=OsNip_08t0485400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	23995179	23996294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0485400-02;Name=OsNip_08t0485400-02-E6;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0485400-02-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	23995212	23996294	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0485400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	23988183	23989680	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0485400-03;Name=OsNip_08t0485400-03;exon_id=OsNip_08t0485400-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13334.3;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G7956.1;prot_id "UniRef90_A0A2G5C650";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24038778	24039260	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0486100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24267889	24268077	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0491100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0491100-01;protein_id=OsNip_08t0491100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	24274040	24274304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491200-01;Name=OsNip_08t0491200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0491200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24274040	24274304	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	24276247	24277403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491200-01;Name=OsNip_08t0491200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0491200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24277127	24277403	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	24282860	24284377	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0491400-01;Parent=gene:OsNip_08g0491400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24282860	24282960	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	24282860	24284377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491400-01;Name=OsNip_08t0491400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0491400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24282961	24284271	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0491400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0491400-01;protein_id=OsNip_08t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24284272	24284377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	24292185	24294714	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0491700;Name=OsNip_C3H57;biotype=protein_coding;description=Putative;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24292185	24292649	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0491700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0491700-00;protein_id=OsNip_08t0491700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	24292718	24293692	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0491700-00;Name=OsNip_08t0491700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0491700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24292718	24293692	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0491700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0491700-00;protein_id=OsNip_08t0491700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24294002	24294263	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0491700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0491700-00;protein_id=OsNip_08t0491700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24294689	24294714	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0491700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0491700-00;protein_id=OsNip_08t0491700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	24311145	24314816	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0492000;Name=OsNip_OPT9;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	24311145	24314816	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0492000-01;Parent=gene:OsNip_08g0492000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0492000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24318620	24318687	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0492100-01;Parent=transcript:OsNip_08t0492100-01;protein_id=OsNip_08t0492100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	24318620	24318746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0492100-01;Name=OsNip_08t0492100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0492100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	24318688	24318746	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0492100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	24475955	24476217	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0495866-00;Name=OsNip_08t0495866-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0495866-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	24534752	24534888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0496800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	24533263	24533391	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0496800-02;Name=OsNip_08t0496800-02;exon_id=OsNip_08t0496800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13362.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10483.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6JEU9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	24716340	24718126	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0500600-01;Name=OsNip_08t0500600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0500600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24989241	24989429	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0505200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0505200-01;protein_id=OsNip_08t0505200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24989532	24989645	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0505200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0505200-01;protein_id=OsNip_08t0505200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	24989759	24990100	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0505200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0505200-01;protein_id=OsNip_08t0505200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25134053	25134365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0507702-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25155158	25155176	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0508000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25216460	25216695	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0508800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25216460	25218138	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0508800-01;Name=OsNip_08t0508800-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0508800-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25216696	25218138	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0508800-01;Parent=transcript:OsNip_08t0508800-01;protein_id=OsNip_08t0508800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25218429	25218761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0508800-01;Name=OsNip_08t0508800-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0508800-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25254359	25254599	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0509200-02;Name=OsNip_08t0509200-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0509200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25260150	25260582	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0509400-01;Name=OsNip_08t0509400-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0509400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25260417	25260582	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0509400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0509400-01;protein_id=OsNip_08t0509400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25262815	25262923	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0509400-01;Name=OsNip_08t0509400-01-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0509400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25262815	25262923	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0509400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0509400-01;protein_id=OsNip_08t0509400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25316401	25316453	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510300-01;Name=OsNip_08t0510300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0510300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25317310	25318570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510300-01;Name=OsNip_08t0510300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0510300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25318125	25318570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	25319041	25320717	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0510400-01;Parent=gene:OsNip_08g0510400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25319041	25319133	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25319041	25319412	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;Name=OsNip_08t0510400-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0510400-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25319134	25319412	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0510400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;protein_id=OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25319496	25319725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;Name=OsNip_08t0510400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0510400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25319496	25319725	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0510400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;protein_id=OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25320323	25320668	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0510400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;protein_id=OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25320323	25320717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;Name=OsNip_08t0510400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0510400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25320669	25320717	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	25321532	25325539	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0510500;biotype=protein_coding;description=ENT;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	25321532	25325533	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0510500-01;Parent=gene:OsNip_08g0510500;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0510500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25321532	25321810	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25326385	25327392	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0510700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0510700-01;protein_id=OsNip_08t0510700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25328035	25328605	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-01;Name=OsNip_08t0510700-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0510700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25328035	25328605	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0510700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0510700-01;protein_id=OsNip_08t0510700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25328786	25329360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-01;Name=OsNip_08t0510700-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0510700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25329190	25329360	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25328622	25328781	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25328622	25329352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-02;Name=OsNip_08t0510700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0510700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25328782	25329189	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0510700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0510700-02;protein_id=OsNip_08t0510700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	25329190	25329352	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	25329256	25329408	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0510700-03;Name=OsNip_08t0510700-03;exon_id=OsNip_08t0510700-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13412.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8005.1;prot_id "UniRef90_A0A1E5UVQ3";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25440241	25440348	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25440484	25440675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0513000-01;Name=OsNip_08t0513000-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0513000-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25440484	25440675	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0513000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25467761	25468115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0513600-01;Name=OsNip_08t0513600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0513600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25467834	25468115	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0513600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	25482063	25487437	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0513700;Name=OsNip_SPL15;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25651468	25651641	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25650157	25650530	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517150-01;Name=OsNip_08t0517150-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0517150-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	25652085	25663725	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0517200;Name=FCO2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	25652085	25658556	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0517200-02;Parent=gene:OsNip_08g0517200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0517200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25652085	25652674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517200-02;Name=OsNip_08t0517200-02-E17;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0517200-02-E17;rank=17;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25652085	25652674	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	25652793	25652847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517200-02;Name=OsNip_08t0517200-02-E16;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0517200-02-E16;rank=16;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25652793	25652847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25653040	25653270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0517200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25731417	25731809	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0518350-00;Parent=transcript:OsNip_08t0518350-00;protein_id=OsNip_08t0518350-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	25738339	25743155	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0518400-00;Parent=gene:OsNip_08g0518400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0518400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	25739951	25739961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0518400-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	25770188	25771549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0519100-01;Name=OsNip_08t0519100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0519100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	25893751	25894008	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0520900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0520900-01;protein_id=OsNip_08t0520900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26044517	26045316	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0523850-00;Parent=transcript:OsNip_08t0523850-00;protein_id=OsNip_08t0523850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	26069146	26069827	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524100-01;Name=OsNip_08t0524100-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0524100-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26072254	26072433	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26072254	26072733	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;Name=OsNip_08t0524200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0524200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26072434	26072733	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0524200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;protein_id=OsNip_08t0524200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26072845	26073099	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;Name=OsNip_08t0524200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0524200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26072845	26073099	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0524200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;protein_id=OsNip_08t0524200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26073958	26074575	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0524200-01;Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;protein_id=OsNip_08t0524200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26073958	26074640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;Name=OsNip_08t0524200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0524200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26074576	26074640	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	26086547	26087515	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0524400;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26086563	26087515	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0524400-00;Parent=gene:OsNip_08g0524400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0524400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26086563	26086631	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26086563	26087515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524400-00;Name=OsNip_08t0524400-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0524400-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26086632	26087423	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0524400-00;Parent=transcript:OsNip_08t0524400-00;protein_id=OsNip_08t0524400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26087424	26087515	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524400-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	26086547	26087508	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0524400-01;Parent=gene:OsNip_08g0524400;transcript_id=OsNip_08t0524400-01;Tag=IsoSeq:G13468.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8036.8
Chr08	TAMA	exon	26086547	26086947	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0524400-01;Name=OsNip_08t0524400-01;exon_id=OsNip_08t0524400-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13468.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8036.8;prot_id "UniRef90_A0A1D6KQ78";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	26134848	26135497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0525500-01;Name=OsNip_08t0525500-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0525500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26135421	26135497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0525500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26135421	26135497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0525500-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26136761	26137324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0525500-02;Name=OsNip_08t0525500-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0525500-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26136761	26137324	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0525500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26422252	26422519	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	26422641	26422760	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;Name=OsNip_08t0530500-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0530500-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26422641	26422760	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0530500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;protein_id=OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26422981	26423067	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0530500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;protein_id=OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26423515	26423685	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;Name=OsNip_08t0530500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0530500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26423515	26423685	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0530500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;protein_id=OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26423777	26423980	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0530500-01;Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;protein_id=OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26423777	26423999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;Name=OsNip_08t0530500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0530500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26423981	26423999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	26430721	26433053	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0530600;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26430721	26433033	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0530600-01;Parent=gene:OsNip_08g0530600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0530600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26430721	26430997	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26430721	26433033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-01;Name=OsNip_08t0530600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0530600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26430998	26431156	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0530600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0530600-01;protein_id=OsNip_08t0530600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26431157	26433033	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	26430840	26433053	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0530600-02;Parent=gene:OsNip_08g0530600;transcript_id=OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1
Chr08	TAMA	exon	26432554	26433053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Name=OsNip_08t0530600-02;exon_id=OsNip_08t0530600-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	CDS	26432572	26433051	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0530600-02;Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;protein_id=OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	exon	26431651	26431819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Name=OsNip_08t0530600-02;exon_id=OsNip_08t0530600-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	exon	26430840	26431195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Name=OsNip_08t0530600-02;exon_id=OsNip_08t0530600-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	26433052	26433053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	26432554	26432569	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	26431651	26431819	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	26430840	26431195	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530600-02;Tag=IsoSeq:G13489.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6103.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	26434718	26445150	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0530801;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26434718	26445150	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0530801-00;Parent=gene:OsNip_08g0530801;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0530801-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26434718	26434883	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0530801-00;Name=OsNip_08t0530801-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0530801-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	26466152	26467785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-02;Name=OsNip_08t0531300-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0531300-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	26465482	26465535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;Name=OsNip_08t0531300-03;exon_id=OsNip_08t0531300-03-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	TAMA	exon	26467139	26467237	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;Name=OsNip_08t0531300-03;exon_id=OsNip_08t0531300-03-E8;rank=8;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	CDS	26467139	26467237	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0531300-03;Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;protein_id=OsNip_08t0531300-03;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	exon	26467519	26467784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;Name=OsNip_08t0531300-03;exon_id=OsNip_08t0531300-03-E9;rank=9;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	CDS	26467519	26467590	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0531300-03;Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;protein_id=OsNip_08t0531300-03;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	26464486	26464487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	26467594	26467784	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531300-03;Tag=IsoSeq:G13492.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6105.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26501167	26506198	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0531600-01;Parent=gene:OsNip_08g0531600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26501167	26501222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26501167	26501713	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;Name=OsNip_08t0531600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0531600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26501223	26501713	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0531600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;protein_id=OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26504616	26504746	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;Name=OsNip_08t0531600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0531600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26504616	26504746	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0531600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;protein_id=OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26505189	26505934	.	+	2	ID=CDS:OsNip_08t0531600-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;protein_id=OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26505189	26506198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;Name=OsNip_08t0531600-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0531600-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26505935	26506198	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	26507926	26512348	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0531700;Name=OsNip_MADS7;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26507926	26512261	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0531700-01;Parent=gene:OsNip_08g0531700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26507926	26507990	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26507926	26508175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;Name=OsNip_08t0531700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0531700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26507991	26508175	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;protein_id=OsNip_08t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26509100	26509178	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;Name=OsNip_08t0531700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0531700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26509100	26509178	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;protein_id=OsNip_08t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	26509403	26509471	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0531700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0531700-01;protein_id=OsNip_08t0531700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26549474	26549956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0532600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	26546988	26549806	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0532700;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26546988	26549806	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0532700-01;Parent=gene:OsNip_08g0532700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0532700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26546988	26547253	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0532700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26605305	26605539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0533600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26790799	26791061	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	26785711	26785854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-03;Name=OsNip_08t0536100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0536100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26785711	26785854	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26786040	26786271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-03;Name=OsNip_08t0536100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0536100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26786040	26786271	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26786824	26787131	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	26820090	26820116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0536400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26855818	26855880	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0537001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26856295	26856594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0537001-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	26852059	26857339	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0537002-01;Parent=gene:OsNip_08g0537002;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0537002-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	26852059	26853978	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0537002-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	26852059	26857339	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0537002-01;Name=OsNip_08t0537002-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0537002-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27047535	27047765	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0540300-01;protein_id=OsNip_08t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27048860	27048981	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540300-01;Name=OsNip_08t0540300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0540300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27048860	27048981	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0540300-01;Parent=transcript:OsNip_08t0540300-01;protein_id=OsNip_08t0540300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27057395	27057547	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;Name=OsNip_08t0540400-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0540400-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27058328	27058453	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;Name=OsNip_08t0540400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0540400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27058328	27058453	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0540400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;protein_id=OsNip_08t0540400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27058574	27059212	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0540400-01;Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;protein_id=OsNip_08t0540400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27058574	27059334	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;Name=OsNip_08t0540400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0540400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27059213	27059334	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	27058574	27059332	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0540400-02;Name=OsNip_08t0540400-02;exon_id=OsNip_08t0540400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13530.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10620.2,Nipponbare.root_G8072.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	CDS	27058574	27059332	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0540400-02;Parent=transcript:OsNip_08t0540400-02;protein_id=OsNip_08t0540400-02;Tag=IsoSeq:G13530.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10620.2,Nipponbare.root_G8072.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	TAMA	CDS	27058330	27058453	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0540400-02;Parent=transcript:OsNip_08t0540400-02;protein_id=OsNip_08t0540400-02;Tag=IsoSeq:G13530.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10620.2,Nipponbare.root_G8072.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27120439	27121216	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0541900-00;Parent=gene:OsNip_08g0541900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0541900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27120439	27121080	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27120439	27121216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541900-00;Name=OsNip_08t0541900-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0541900-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27121081	27121155	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0541900-00;Parent=transcript:OsNip_08t0541900-00;protein_id=OsNip_08t0541900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27121156	27121216	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27121508	27122420	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0541950;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27121508	27122420	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0541950-00;Parent=gene:OsNip_08g0541950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0541950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27121508	27121671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541950-00;Name=OsNip_08t0541950-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0541950-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27121508	27121671	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27121755	27122191	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0541950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27163603	27163690	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27184601	27185259	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0543051-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	gene	27270665	27277289	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0544250;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27372003	27372545	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546500-00;Name=OsNip_08t0546500-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0546500-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	27374565	27374875	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546533-02;Name=OsNip_08t0546533-02;exon_id=OsNip_08t0546533-02-E3;rank=3;Tag=IsoSeq:G13554.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8086.1;prot_id "UniRef90_C7J6A6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	27372876	27372876	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546533-02;Tag=IsoSeq:G13554.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8086.1;prot_id "UniRef90_C7J6A6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27373138	27373597	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546533-02;Tag=IsoSeq:G13554.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8086.1;prot_id "UniRef90_C7J6A6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27374273	27374360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546533-02;Tag=IsoSeq:G13554.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8086.1;prot_id "UniRef90_C7J6A6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27374565	27374875	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546533-02;Tag=IsoSeq:G13554.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8086.1;prot_id "UniRef90_C7J6A6";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27374934	27375636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546600-01;Name=OsNip_08t0546600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0546600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27376052	27378939	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0546700-01;Parent=gene:OsNip_08g0546700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0546700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27376052	27376441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;Name=OsNip_08t0546700-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0546700-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27376330	27376441	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0546700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;protein_id=OsNip_08t0546700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27376646	27376893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;Name=OsNip_08t0546700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0546700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27376646	27376893	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0546700-01;Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;protein_id=OsNip_08t0546700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27376976	27377142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;Name=OsNip_08t0546700-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0546700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27378582	27378939	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546700-01;Name=OsNip_08t0546700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0546700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27382872	27383113	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27384067	27384470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546800-01;Name=OsNip_08t0546800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0546800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27384388	27384470	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27393171	27396125	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0546900;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27393304	27396084	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0546900-01;Parent=gene:OsNip_08g0546900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0546900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27393304	27393521	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27393304	27396084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-01;Name=OsNip_08t0546900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0546900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27393522	27394310	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0546900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0546900-01;protein_id=OsNip_08t0546900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27394311	27396084	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	27393171	27396125	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0546900-02;Parent=gene:OsNip_08g0546900;transcript_id=OsNip_08t0546900-02;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1
Chr08	TAMA	exon	27395873	27396125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;Name=OsNip_08t0546900-02;exon_id=OsNip_08t0546900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	exon	27393171	27394288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;Name=OsNip_08t0546900-02;exon_id=OsNip_08t0546900-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	CDS	27393479	27393598	.	-	.	ID=CDS:OsNip_08t0546900-02;Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;protein_id=OsNip_08t0546900-02;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	27395873	27396125	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	27393599	27394288	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27393171	27393476	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0546900-02;Tag=IsoSeq:G13557.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8088.1;prot_id "UniRef90_J3MV04";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27397948	27401077	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0547000;biotype=protein_coding;description=RNA;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	27519465	27519799	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0548700-02;Name=OsNip_08t0548700-02;exon_id=OsNip_08t0548700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13567.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10649.3;prot_id "UniRef90_A0A446YEK9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr08	TAMA	CDS	27520368	27520593	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0548700-02;Parent=transcript:OsNip_08t0548700-02;protein_id=OsNip_08t0548700-02;Tag=IsoSeq:G13567.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10649.3;prot_id "UniRef90_A0A446YEK9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27521047	27521535	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0548700-02;Tag=IsoSeq:G13567.5;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10649.3;prot_id "UniRef90_A0A446YEK9";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27533329	27533459	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27533460	27533632	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0548900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;protein_id=OsNip_08t0548900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27533704	27534118	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0548900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;protein_id=OsNip_08t0548900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27536404	27536565	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0548900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;protein_id=OsNip_08t0548900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27536404	27536724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;Name=OsNip_08t0548900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0548900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27536566	27536724	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0548900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27547971	27549173	.	-	.	ID=gene:OsNip_08g0549000;Name=OsNip_GL1A;biotype=protein_coding;description=R2R3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27547971	27549173	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0549000-01;Parent=gene:OsNip_08g0549000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0549000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27547971	27548322	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27547971	27548791	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;Name=OsNip_08t0549000-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0549000-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27548323	27548791	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0549000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;protein_id=OsNip_08t0549000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27548868	27549130	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0549000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;protein_id=OsNip_08t0549000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27548868	27549173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;Name=OsNip_08t0549000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0549000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27549131	27549173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	27548083	27549173	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0549000-02;Parent=gene:OsNip_08g0549000;transcript_id=OsNip_08t0549000-02;Tag=IsoSeq:G13569.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10651.5,Nipponbare.root_G8096.6,Nipponbare.panicle_G10651.6,Nipponbare.leaf_G6145.1
Chr08	TAMA	exon	27548083	27549173	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549000-02;Name=OsNip_08t0549000-02;exon_id=OsNip_08t0549000-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13569.6;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10651.5,Nipponbare.root_G8096.6,Nipponbare.panicle_G10651.6,Nipponbare.leaf_G6145.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27583175	27583521	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0549900-00;Parent=transcript:OsNip_08t0549900-00;protein_id=OsNip_08t0549900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27583528	27583558	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0549900-00;Parent=transcript:OsNip_08t0549900-00;protein_id=OsNip_08t0549900-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27583528	27583821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549900-00;Name=OsNip_08t0549900-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_08t0549900-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27583559	27583821	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549900-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27585872	27586502	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0549950-00;Parent=gene:OsNip_08g0549950;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0549950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27585872	27586128	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27585872	27586502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549950-00;Name=OsNip_08t0549950-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0549950-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27586129	27586500	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0549950-00;Parent=transcript:OsNip_08t0549950-00;protein_id=OsNip_08t0549950-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27586501	27586502	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0549950-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27706583	27707229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554000-01;Name=OsNip_08t0554000-01-E13;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0554000-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27706625	27707229	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	exon	27706825	27707252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554000-03;Name=OsNip_08t0554000-03;exon_id=OsNip_08t0554000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13578.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8102.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	CDS	27707186	27707236	.	+	.	ID=CDS:OsNip_08t0554000-03;Parent=transcript:OsNip_08t0554000-03;protein_id=OsNip_08t0554000-03;Tag=IsoSeq:G13578.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8102.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	five_prime_UTR	27706825	27707185	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554000-03;Tag=IsoSeq:G13578.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8102.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27707240	27707252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554000-03;Tag=IsoSeq:G13578.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8102.2;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27708166	27712609	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0554050;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27708166	27712609	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0554050-01;Parent=gene:OsNip_08g0554050;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0554050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27708166	27708296	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27708166	27708482	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554050-01;Name=OsNip_08t0554050-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0554050-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27708297	27708482	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0554050-01;Parent=transcript:OsNip_08t0554050-01;protein_id=OsNip_08t0554050-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27708568	27708636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554050-01;Name=OsNip_08t0554050-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0554050-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27708568	27708636	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0554050-01;Parent=transcript:OsNip_08t0554050-01;protein_id=OsNip_08t0554050-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27764121	27764274	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0554900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0554900-01;protein_id=OsNip_08t0554900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27764400	27765557	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0554900-01;Parent=transcript:OsNip_08t0554900-01;protein_id=OsNip_08t0554900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27764400	27765767	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554900-01;Name=OsNip_08t0554900-01-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0554900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27765558	27765767	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27764691	27765798	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0554900-02;Parent=gene:OsNip_08g0554900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0554900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27764691	27765557	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0554900-02;Parent=transcript:OsNip_08t0554900-02;protein_id=OsNip_08t0554900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27764691	27765798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554900-02;Name=OsNip_08t0554900-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0554900-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27765558	27765798	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	TAMA	mRNA	27761932	27765778	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0554900-03;Parent=gene:OsNip_08g0554900;transcript_id=OsNip_08t0554900-03;Tag=IsoSeq:G13581.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10661.1
Chr08	TAMA	exon	27761932	27762130	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0554900-03;Name=OsNip_08t0554900-03;exon_id=OsNip_08t0554900-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13581.1;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10661.1;prot_id "UniRef90_A0A7C8YEF4";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27813718	27813788	.	+	1	ID=CDS:OsNip_08t0555800-00;Parent=transcript:OsNip_08t0555800-00;protein_id=OsNip_08t0555800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27814173	27814418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0555800-00;Name=OsNip_08t0555800-00-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0555800-00-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27814358	27814418	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0555800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27818486	27818962	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0555700-00;Parent=gene:OsNip_08g0555700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0555700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27818486	27818962	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0555700-00;Name=OsNip_08t0555700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0555700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27818486	27818962	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0555700-00;Parent=transcript:OsNip_08t0555700-00;protein_id=OsNip_08t0555700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	gene	27818497	27818907	.	+	.	ID=gene:OsNip_08g0555650;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	27818497	27818907	.	+	.	ID=transcript:OsNip_08t0555650-00;Parent=gene:OsNip_08g0555650;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27818497	27818638	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	27818497	27818907	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0555650-00;Name=OsNip_08t0555650-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0555650-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	27818639	27818905	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0555650-00;Parent=transcript:OsNip_08t0555650-00;protein_id=OsNip_08t0555650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	27842429	27842561	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	three_prime_UTR	27884312	27885464	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t055739A-01;Tag=IsoSeq:G13593.1;Source=Nipponbare.root_G8115.1;prot_id "UniRef90_A0A368RAY1";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	27916589	27916861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0557850-00;Name=OsNip_08t0557850-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0557850-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	27916589	27916861	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0557850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28144400	28144453	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0562100-02;Parent=transcript:OsNip_08t0562100-02;protein_id=OsNip_08t0562100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28144557	28144610	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0562100-02;Parent=transcript:OsNip_08t0562100-02;protein_id=OsNip_08t0562100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28144557	28144877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562100-02;Name=OsNip_08t0562100-02-E14;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0562100-02-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28144611	28144877	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	28144876	28149227	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0562200-02;Parent=gene:OsNip_08g0562200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0562200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28144876	28145447	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28144876	28145839	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;Name=OsNip_08t0562200-02-E5;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_08t0562200-02-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28145448	28145839	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0562200-02;Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;protein_id=OsNip_08t0562200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28146170	28146296	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;Name=OsNip_08t0562200-02-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0562200-02-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28146170	28146296	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0562200-02;Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;protein_id=OsNip_08t0562200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28146392	28147156	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;Name=OsNip_08t0562200-03-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0562200-03-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28146392	28147156	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0562200-02;Parent=transcript:OsNip_08t0562200-02;protein_id=OsNip_08t0562200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	exon	28346988	28348010	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0565900-01;Name=OsNip_08t0565900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0565900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	TAMA	five_prime_UTR	28347131	28347731	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t056599A-01;Tag=IsoSeq:G13638.1;Source=Nipponbare.panicle_G10713.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	28348007	28351751	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0566000-01;Parent=gene:OsNip_08g0566000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	28348007	28348373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28349169	28349438	.	-	2	ID=CDS:OsNip_08t0566000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;protein_id=OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28350082	28350369	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0566000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;protein_id=OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28351075	28351183	.	-	1	ID=CDS:OsNip_08t0566000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;protein_id=OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28351270	28351595	.	-	0	ID=CDS:OsNip_08t0566000-01;Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;protein_id=OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28351270	28351751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;Name=OsNip_08t0566000-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_08t0566000-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	28351596	28351751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_08t0566000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	mRNA	28355371	28360778	.	-	.	ID=transcript:OsNip_08t0566100-01;Parent=gene:OsNip_08g0566100;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_08t0566100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr08	RAP2018-11-26	CDS	28375508	28375585	.	+	0	ID=CDS:OsNip_08t0566400-02;Parent=transcript:OsNip_08t0566400-02;protein_id=OsNip_08t0566400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr08	RAP2018-11-26	exon	28375508	28375814	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_08t0566400-02;Name=OsNip_08t0566400-02-E7;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_08t0566400-02-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	1172800	1173039	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0114700-00;Parent=transcript:OsNip_09t0114700-00;protein_id=OsNip_09t0114700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	1172803	1172972	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0114700-01;Name=OsNip_09t0114700-01;exon_id=OsNip_09t0114700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13671.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10743.1,Nipponbare.panicle_G10743.2;prot_id "UniRef90_K3ZWZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	CDS	1172803	1172972	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t0114700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0114700-01;protein_id=OsNip_09t0114700-01;Tag=IsoSeq:G13671.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10743.1,Nipponbare.panicle_G10743.2;prot_id "UniRef90_K3ZWZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	CDS	1172412	1172534	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t0114700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0114700-01;protein_id=OsNip_09t0114700-01;Tag=IsoSeq:G13671.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10743.1,Nipponbare.panicle_G10743.2;prot_id "UniRef90_K3ZWZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	exon	1168883	1169145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0114700-01;Name=OsNip_09t0114700-01;exon_id=OsNip_09t0114700-01-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G13671.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10743.1,Nipponbare.panicle_G10743.2;prot_id "UniRef90_K3ZWZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	1168883	1169145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0114700-01;Tag=IsoSeq:G13671.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10743.1,Nipponbare.panicle_G10743.2;prot_id "UniRef90_K3ZWZ7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	1637403	1638966	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0121000-01;Name=OsNip_09t0121000-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0121000-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	2293466	2294284	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0129500-02;Tag=IsoSeq:G13692.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8186.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6CE57";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	2294609	2294659	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0129500-02;Tag=IsoSeq:G13692.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8186.1;prot_id "UniRef90_A0A3B6CE57";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2306101	2306565	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0129800-00;Parent=transcript:OsNip_09t0129800-00;protein_id=OsNip_09t0129800-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	2320603	2322832	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0130300;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	2320603	2322832	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0130300-01;Parent=gene:OsNip_09g0130300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0130300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2359080	2359363	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0130800-02;Parent=transcript:OsNip_09t0130800-02;protein_id=OsNip_09t0130800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2359606	2360621	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0130800-02;Name=OsNip_09t0130800-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0130800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2354904	2355190	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0130800-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2354904	2355439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0130800-04;Name=OsNip_09t0130800-04-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0130800-04-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2357084	2357518	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0130800-04;Parent=transcript:OsNip_09t0130800-04;protein_id=OsNip_09t0130800-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2357084	2357520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0130800-04;Name=OsNip_09t0130800-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0130800-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2357519	2357520	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0130800-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	2385751	2386788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131200-01;Name=OsNip_09t0131200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0131200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2386500	2386788	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	2385636	2387109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131200-02;Name=OsNip_09t0131200-02;exon_id=OsNip_09t0131200-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13696.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8188.3,Nipponbare.leaf_G6221.1;prot_id "UniRef90_A0A5K1CAN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	CDS	2385637	2386119	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0131200-02;Parent=transcript:OsNip_09t0131200-02;protein_id=OsNip_09t0131200-02;Tag=IsoSeq:G13696.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8188.3,Nipponbare.leaf_G6221.1;prot_id "UniRef90_A0A5K1CAN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	2385636	2385636	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131200-02;Tag=IsoSeq:G13696.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8188.3,Nipponbare.leaf_G6221.1;prot_id "UniRef90_A0A5K1CAN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	2386123	2387109	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131200-02;Tag=IsoSeq:G13696.6;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8188.3,Nipponbare.leaf_G6221.1;prot_id "UniRef90_A0A5K1CAN1";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	2396780	2405236	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0131400;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	2396780	2400181	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0131400-02;Parent=gene:OsNip_09g0131400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0131400-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2396780	2397017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131400-02;Name=OsNip_09t0131400-01-E11;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0131400-01-E11;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2396780	2397017	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0131400-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2707213	2707346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0135800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	2705199	2707231	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0135800-02;Parent=gene:OsNip_09g0135800;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0135800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2705199	2705460	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0135800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2705199	2707231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0135800-02;Name=OsNip_09t0135800-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0135800-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2705461	2707212	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0135800-02;Parent=transcript:OsNip_09t0135800-02;protein_id=OsNip_09t0135800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2707213	2707231	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0135800-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	2703201	2707270	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0135800-03;Parent=gene:OsNip_09g0135800;transcript_id=OsNip_09t0135800-03;Tag=IsoSeq:G13707.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10771.1
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	2706824	2707302	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0135850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	2914721	2915347	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;Name=OsNip_09t0237600-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0237600-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2915752	2915876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0237600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;protein_id=OsNip_09t0237600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2916134	2916319	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0237600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;protein_id=OsNip_09t0237600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	2917730	2917872	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;Name=OsNip_09t0237600-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0237600-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	2917730	2917872	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0237600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;protein_id=OsNip_09t0237600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	2919739	2920132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;Name=OsNip_09t0237600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0237600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	2919989	2920132	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	2923320	2924830	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0237900;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	2923320	2924792	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0237900-01;Parent=gene:OsNip_09g0237900;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_09t0237900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2923320	2923708	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237900-01;Name=OsNip_09t0237900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0237900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2924069	2924189	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237900-01;Name=OsNip_09t0237900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0237900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2924263	2924398	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237900-01;Name=OsNip_09t0237900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0237900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	2924516	2924792	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237900-01;Name=OsNip_09t0237900-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0237900-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	2923346	2924830	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0237900-02;Parent=gene:OsNip_09g0237900;transcript_id=OsNip_09t0237900-02;Tag=IsoSeq:G13709.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10773.2
Chr09	TAMA	exon	2924516	2924830	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0237900-02;Name=OsNip_09t0237900-02;exon_id=OsNip_09t0237900-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G13709.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10773.2;prot_id "UniRef90_A0A0E0QNA7";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	3101605	3106242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0240850-01;Name=OsNip_09t0240850-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0240850-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	3105019	3105495	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0240850-01;Parent=transcript:OsNip_09t0240850-01;protein_id=OsNip_09t0240850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	3105496	3106242	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0240850-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	3118920	3124226	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0240975;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	4175710	4175710	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0255200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	4175711	4176073	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0255200-00;Parent=transcript:OsNip_09t0255200-00;protein_id=OsNip_09t0255200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	4568500	4568807	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t026189A-01;Tag=IsoSeq:G13745.1;Source=Nipponbare.root_G8215.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3H4B8";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	4704888	4705085	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0263474-00;Parent=transcript:OsNip_09t0263474-00;protein_id=OsNip_09t0263474-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	4706284	4706346	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0263474-00;Name=OsNip_09t0263474-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0263474-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	4706284	4706346	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0263474-00;Parent=transcript:OsNip_09t0263474-00;protein_id=OsNip_09t0263474-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	4706347	4706457	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0263474-01;Tag=IsoSeq:G13749.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6251.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	4706146	4706272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0263474-01;Tag=IsoSeq:G13749.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6251.1;prot_id "none";degrade_flag "full_length";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5105172	5105175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0267600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	5106500	5106823	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0267600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	5104804	5104897	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0267701-00;Parent=transcript:OsNip_09t0267701-00;protein_id=OsNip_09t0267701-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6019728	6019906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0281600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6019985	6020349	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0281600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	6019865	6019906	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0281600-02;Name=OsNip_09t0281600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0281600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6676524	6676626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0290900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	6678535	6678975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0290900-01;Name=OsNip_09t0290900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0290900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	6678535	6678975	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0290900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	7277255	7277580	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0298500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	7277581	7278939	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0298500-01;Parent=transcript:OsNip_09t0298500-01;protein_id=OsNip_09t0298500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	7753842	7755377	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0304500-01;Name=OsNip_09t0304500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0304500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	9654129	9654296	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0327300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0327300-01;protein_id=OsNip_09t0327300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	9654818	9654956	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0327300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	10763252	10763421	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0344800-01;Name=OsNip_09t0344800-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0344800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10767771	10768106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0344800-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	10845836	10846633	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0346500-04;Parent=transcript:OsNip_09t0346500-04;protein_id=OsNip_09t0346500-04;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10846634	10847012	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346500-04;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	10846559	10846819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346500-05;Name=OsNip_09t0346500-05;exon_id=OsNip_09t0346500-05-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G13870.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6311.8;prot_id "UniRef90_M0ZEV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	10845779	10845779	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346500-05;Tag=IsoSeq:G13870.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6311.8;prot_id "UniRef90_M0ZEV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	10845870	10846360	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346500-05;Tag=IsoSeq:G13870.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6311.8;prot_id "UniRef90_M0ZEV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	10846559	10846819	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346500-05;Tag=IsoSeq:G13870.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6311.8;prot_id "UniRef90_M0ZEV7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	10849769	10852856	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0346600-01;Parent=gene:OsNip_09g0346600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0346600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10849769	10849847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	10849769	10850003	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Name=OsNip_09t0346600-01-E9;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0346600-01-E9;rank=9;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	10850110	10850263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Name=OsNip_09t0346600-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0346600-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	10850110	10850263	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0346600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;protein_id=OsNip_09t0346600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	10850673	10850739	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Name=OsNip_09t0346600-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0346600-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	10851321	10851439	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Name=OsNip_09t0346600-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0346600-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	10852577	10852856	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346600-01;Name=OsNip_09t0346600-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0346600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	10856539	10862749	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0346700-01;Parent=gene:OsNip_09g0346700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0346700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	10856539	10857021	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0346700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11710251	11710472	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0359900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	11907629	11908107	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0363500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	12387077	12387955	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0371700-01;Name=OsNip_09t0371700-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0371700-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	12390189	12390369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0371800-00;Name=OsNip_09t0371800-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0371800-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12390318	12390369	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0371800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12391160	12391323	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0371800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12391883	12392144	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0371800-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	12397884	12399092	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0372100-02;Name=OsNip_09t0372100-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0372100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	12407427	12413260	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0372400-01;Parent=gene:OsNip_09g0372400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12407427	12407490	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	12411258	12411557	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0372400-01;Name=OsNip_09t0372400-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0372400-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12411258	12411557	.	+	2	ID=CDS:OsNip_09t0372400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0372400-01;protein_id=OsNip_09t0372400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12431007	12431262	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0372800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	12646004	12647562	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0376800-01;Name=OsNip_09t0376800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0376800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12649802	12650074	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0376800-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	12644320	12650081	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0376800-02;Parent=gene:OsNip_09g0376800;transcript_id=OsNip_09t0376800-02;Tag=IsoSeq:G13928.3;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G10933.1,Nipponbare.root_G8301.4
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12834354	12834503	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0380400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0380400-01;protein_id=OsNip_09t0380400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12834504	12834961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	CDS	12833962	12834117	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0380400-02;Parent=transcript:OsNip_09t0380400-02;protein_id=OsNip_09t0380400-02;Tag=IsoSeq:G13934.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10939.3;prot_id "UniRef90_I1QNJ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	12833961	12833961	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380400-02;Tag=IsoSeq:G13934.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10939.3;prot_id "UniRef90_I1QNJ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	12834121	12834839	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380400-02;Tag=IsoSeq:G13934.4;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G10939.3;prot_id "UniRef90_I1QNJ9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12835752	12836664	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12835752	12837275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380450-01;Name=OsNip_09t0380450-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0380450-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12836665	12836793	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0380450-01;Parent=transcript:OsNip_09t0380450-01;protein_id=OsNip_09t0380450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12836794	12837275	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380450-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	12837886	12838615	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0380501;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	12837886	12838615	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0380501-00;Parent=gene:OsNip_09g0380501;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0380501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12837886	12837947	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;Name=OsNip_09t0380501-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0380501-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12837886	12837947	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0380501-00;Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;protein_id=OsNip_09t0380501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12838109	12838213	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;Name=OsNip_09t0380501-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0380501-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12838109	12838213	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0380501-00;Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;protein_id=OsNip_09t0380501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12838411	12838615	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;Name=OsNip_09t0380501-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0380501-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12838411	12838615	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0380501-00;Parent=transcript:OsNip_09t0380501-00;protein_id=OsNip_09t0380501-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	12847732	12848959	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0380600;biotype=protein_coding;description=Protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12897566	12898006	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0381300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	12897572	12899549	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0381400-01;Parent=gene:OsNip_09g0381400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0381400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	12897572	12898299	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12897572	12898889	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;Name=OsNip_09t0381400-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0381400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12898300	12898889	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0381400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;protein_id=OsNip_09t0381400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	12898988	12899486	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0381400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;protein_id=OsNip_09t0381400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	12898988	12899549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;Name=OsNip_09t0381400-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0381400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	12899487	12899549	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0381400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	13155767	13155832	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0385700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	13158329	13159646	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0385900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	14813062	14813119	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0414600-02;Parent=transcript:OsNip_09t0414600-02;protein_id=OsNip_09t0414600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	14813352	14813725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-02;Name=OsNip_09t0414600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0414600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14813624	14813725	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	14813684	14815904	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	14813684	14816389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-01;Name=OsNip_09t0414600-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0414600-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	14815905	14816108	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0414600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0414600-01;protein_id=OsNip_09t0414600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	14816109	14816389	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	14812452	14813660	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0414600-03;Parent=gene:OsNip_09g0414600;transcript_id=OsNip_09t0414600-03;Tag=IsoSeq:G14013.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6378.2
Chr09	TAMA	exon	14812452	14813660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-03;Name=OsNip_09t0414600-03;exon_id=OsNip_09t0414600-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14013.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6378.2;prot_id "UniRef90_I1I7G0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	CDS	14813068	14813241	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t0414600-03;Parent=transcript:OsNip_09t0414600-03;protein_id=OsNip_09t0414600-03;Tag=IsoSeq:G14013.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6378.2;prot_id "UniRef90_I1I7G0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	14813242	14813660	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0414600-03;Tag=IsoSeq:G14013.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6378.2;prot_id "UniRef90_I1I7G0";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	15071339	15072062	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0419100-04;Name=OsNip_09t0419100-04-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0419100-04-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	15077763	15078115	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0419200-01;Name=OsNip_09t0419200-01-E4;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0419200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	15092619	15092888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0419500-01;Name=OsNip_09t0419500-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0419500-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15092704	15092888	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0419500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15090674	15090899	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0419500-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	15136455	15136538	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0420300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0420300-01;protein_id=OsNip_09t0420300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	15136633	15136690	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0420300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0420300-01;protein_id=OsNip_09t0420300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	15138689	15139321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0420300-01;Name=OsNip_09t0420300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0420300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	15139224	15139321	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0420300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	15153787	15157002	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0420600-01;Parent=gene:OsNip_09g0420600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0420600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	15279318	15279501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t042249A-01;Tag=IsoSeq:G14033.1;Source=Nipponbare.panicle_G11017.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	TAMA	exon	15279348	15279692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t042249A-02;Name=OsNip_09t042249A-02-E1;exon_id=OsNip_09t042249A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14033.2;Source=Nipponbare.panicle_G11017.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	CDS	15279504	15279692	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t042249A-02;Parent=transcript:OsNip_09t042249A-02;protein_id=OsNip_09t042249A-02;Tag=IsoSeq:G14033.2;Source=Nipponbare.panicle_G11017.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	15279348	15279501	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t042249A-02;Tag=IsoSeq:G14033.2;Source=Nipponbare.panicle_G11017.2;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	15281789	15282024	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0422500-01;Name=OsNip_09t0422500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0422500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	15345430	15346721	.	+	2	ID=CDS:OsNip_09t0423500-01;Parent=transcript:OsNip_09t0423500-01;protein_id=OsNip_09t0423500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	15345430	15346841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0423500-01;Name=OsNip_09t0423500-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0423500-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15346722	15346841	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0423500-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	15344619	15344834	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0423500-02;Name=OsNip_09t0423500-02;exon_id=OsNip_09t0423500-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14037.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11020.2;prot_id "UniRef90_A0A453KWI5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	15345430	15345468	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0423500-02;Tag=IsoSeq:G14037.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11020.2;prot_id "UniRef90_A0A453KWI5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	15345673	15347066	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0423500-02;Tag=IsoSeq:G14037.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11020.2;prot_id "UniRef90_A0A453KWI5";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	15345412	15346743	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0423550;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	15507714	15507771	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0427100-01;Parent=transcript:OsNip_09t0427100-01;protein_id=OsNip_09t0427100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	15507714	15508094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0427100-01;Name=OsNip_09t0427100-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0427100-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	15507772	15508094	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0427100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	15505395	15506163	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0427125;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	15599729	15600169	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0429100-01;Tag=IsoSeq:G14054.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11034.1;prot_id "UniRef90_A0A0D3H746";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	15599149	15606593	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0429200;Name=OsNip_GLR2.2;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	15599149	15606593	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0429200-00;Parent=gene:OsNip_09g0429200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0429200-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16443208	16443245	.	+	2	ID=CDS:OsNip_09t0442300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0442300-01;protein_id=OsNip_09t0442300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	16443208	16443578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0442300-01;Name=OsNip_09t0442300-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0442300-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16443246	16443578	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0442300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	16439143	16439424	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0442300-02;Name=OsNip_09t0442300-02;exon_id=OsNip_09t0442300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14088.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6410.5;prot_id "UniRef90_A0A287KUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	exon	16439535	16439656	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0442300-02;Name=OsNip_09t0442300-02;exon_id=OsNip_09t0442300-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14088.7;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6410.5;prot_id "UniRef90_A0A287KUI3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	16556668	16556821	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0444550-00;Name=OsNip_09t0444550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0444550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16675107	16675233	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0447000-00;Parent=transcript:OsNip_09t0447000-00;protein_id=OsNip_09t0447000-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16675337	16675416	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0447000-00;Parent=transcript:OsNip_09t0447000-00;protein_id=OsNip_09t0447000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16675524	16675586	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0447000-00;Parent=transcript:OsNip_09t0447000-00;protein_id=OsNip_09t0447000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	16675524	16675588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0447000-00;Name=OsNip_09t0447000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0447000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	16675587	16675588	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0447000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	16711022	16713794	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0447300;Name=CYP76L1;biotype=protein_coding;description=Cytochrome;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	16711022	16713794	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0447300-01;Parent=gene:OsNip_09g0447300;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0447300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16711022	16711270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0447300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16782535	16782666	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0448900-01;Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;protein_id=OsNip_09t0448900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	16782970	16783074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Name=OsNip_09t0448900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0448900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16783058	16783074	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16783165	16783363	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	16783586	16783645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Name=OsNip_09t0448900-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0448900-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16783586	16783645	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	16783771	16783835	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0448900-01;Name=OsNip_09t0448900-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0448900-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	16884993	16885289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t045099A-02;Tag=IsoSeq:G14109.2;Source=Nipponbare.panicle_G11074.2,Nipponbare.panicle_G11074.3;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16965029	16965143	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0452300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0452300-01;protein_id=OsNip_09t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	16965293	16965490	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0452300-01;Parent=transcript:OsNip_09t0452300-01;protein_id=OsNip_09t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	16965293	16965800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0452300-01;Name=OsNip_09t0452300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0452300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	16965491	16965800	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0452300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	16963299	16965805	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0452300-02;Parent=gene:OsNip_09g0452300;transcript_id=OsNip_09t0452300-02;Tag=IsoSeq:G14115.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11079.1
Chr09	TAMA	exon	16963299	16963874	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0452300-02;Name=OsNip_09t0452300-02;exon_id=OsNip_09t0452300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14115.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11079.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	CDS	16963300	16963818	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0452300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0452300-02;protein_id=OsNip_09t0452300-02;Tag=IsoSeq:G14115.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11079.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	17184097	17184215	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456100-02;Name=OsNip_09t0456100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0456100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17184098	17184215	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0456100-02;Parent=transcript:OsNip_09t0456100-02;protein_id=OsNip_09t0456100-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17184297	17185082	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456100-02;Name=OsNip_09t0456100-02-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0456100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	17227972	17228923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456800-01;Name=OsNip_09t0456800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0456800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17228614	17228923	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	17221486	17221487	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456800-02;Tag=IsoSeq:G14134.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11095.1;prot_id "UniRef90_UPI0009E5F760";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	17221746	17222414	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456800-02;Tag=IsoSeq:G14134.4;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11095.1;prot_id "UniRef90_UPI0009E5F760";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17221622	17222086	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	17227961	17228613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456850-00;Name=OsNip_09t0456850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0456850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17228479	17228613	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	17234726	17244776	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0456900-01;Parent=gene:OsNip_09g0456900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0456900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17234726	17235047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456900-01;Name=OsNip_09t0456900-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0456900-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17234726	17235047	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17235151	17235225	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0456900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17405932	17405935	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0460250-01;Parent=transcript:OsNip_09t0460250-01;protein_id=OsNip_09t0460250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17406705	17407033	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0460250-01;Parent=transcript:OsNip_09t0460250-01;protein_id=OsNip_09t0460250-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17406705	17407270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0460250-01;Name=OsNip_09t0460250-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0460250-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17407034	17407270	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0460250-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	17427436	17428563	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t046149A-01;Name=OsNip_09t046149A-01-E1;exon_id=OsNip_09t046149A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14146.1;Source=Nipponbare.root_G8429.1,Nipponbare.panicle_G11103.1;prot_id "UniRef90_A0A2S3H083";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	CDS	17428279	17428575	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t046149A-02;Parent=transcript:OsNip_09t046149A-02;protein_id=OsNip_09t046149A-02;Tag=IsoSeq:G14146.2;Source=Nipponbare.root_G8429.2;prot_id "UniRef90_A0A2S3H083";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	17427438	17428278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t046149A-02;Tag=IsoSeq:G14146.2;Source=Nipponbare.root_G8429.2;prot_id "UniRef90_A0A2S3H083";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	17428579	17428701	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t046149A-02;Tag=IsoSeq:G14146.2;Source=Nipponbare.root_G8429.2;prot_id "UniRef90_A0A2S3H083";degrade_flag "full_length";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	17448346	17448430	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0461500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17448346	17449590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0461500-01;Name=OsNip_09t0461500-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0461500-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17448431	17449477	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0461500-01;Parent=transcript:OsNip_09t0461500-01;protein_id=OsNip_09t0461500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17449478	17449590	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0461500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	17447935	17449584	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0461500-02;Parent=gene:OsNip_09g0461500;transcript_id=OsNip_09t0461500-02;Tag=IsoSeq:G14147.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11104.1
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	17747278	17747278	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0467200-02;Tag=IsoSeq:G14167.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6440.8;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	17748584	17748688	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0467200-02;Tag=IsoSeq:G14167.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6440.8;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	17749385	17751263	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0467300-01;Name=OsNip_09t0467300-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0467300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	gene	17755755	17771403	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0467400;Name=OsNip_PUP3;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	17755755	17771403	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0467400-03;Parent=gene:OsNip_09g0467400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0467400-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	17790516	17790999	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0468300-01;Tag=IsoSeq:G14170.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8447.2;prot_id "UniRef90_A0A6V7P6L9";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17843411	17843519	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0469300-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17843411	17843682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0469300-01;Name=OsNip_09t0469300-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0469300-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17978321	17978756	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0471550-01;Parent=transcript:OsNip_09t0471550-01;protein_id=OsNip_09t0471550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	17978965	17979390	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0471550-01;Parent=transcript:OsNip_09t0471550-01;protein_id=OsNip_09t0471550-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	17978965	17979418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0471550-01;Name=OsNip_09t0471550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0471550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	17979391	17979418	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0471550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	18243261	18243373	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0476100-02;Name=OsNip_09t0476100-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0476100-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	18242949	18245317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0476100-01;Name=OsNip_09t0476100-01-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0476100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18247317	18247709	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0476401-00;Parent=gene:OsNip_09g0476401;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0476401-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18269127	18269252	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18269253	18269498	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0477100-01;Parent=transcript:OsNip_09t0477100-01;protein_id=OsNip_09t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18269499	18269791	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0477100-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	gene	18272631	18273222	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g047754A;Tag=IsoSeq:G14195
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Chr09	TAMA	exon	18272631	18273154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754A-01;Name=OsNip_09t047754A-01-E1;exon_id=OsNip_09t047754A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14195.1;Source=Nipponbare.panicle_G11141.1;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	CDS	18272631	18272702	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t047754A-01;Parent=transcript:OsNip_09t047754A-01;protein_id=OsNip_09t047754A-01;Tag=IsoSeq:G14195.1;Source=Nipponbare.panicle_G11141.1;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	18272706	18273154	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754A-01;Tag=IsoSeq:G14195.1;Source=Nipponbare.panicle_G11141.1;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	mRNA	18272631	18273222	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t047754A-02;Parent=gene:OsNip_09g047754A;transcript_id=OsNip_09t047754A-02;Tag=IsoSeq:G14195.2;Source=Nipponbare.panicle_G11141.2
Chr09	TAMA	exon	18272631	18273222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754A-02;Name=OsNip_09t047754A-02-E1;exon_id=OsNip_09t047754A-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14195.2;Source=Nipponbare.panicle_G11141.2;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	CDS	18272631	18272702	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t047754A-02;Parent=transcript:OsNip_09t047754A-02;protein_id=OsNip_09t047754A-02;Tag=IsoSeq:G14195.2;Source=Nipponbare.panicle_G11141.2;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	18272706	18273222	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754A-02;Tag=IsoSeq:G14195.2;Source=Nipponbare.panicle_G11141.2;prot_id "UniRef90_Q651Y3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	gene	18275086	18275785	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g047754B;Tag=IsoSeq:G14196
Chr09	TAMA	mRNA	18275086	18275785	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t047754B-01;Parent=gene:OsNip_09g047754B;transcript_id=OsNip_09t047754B-01;Tag=IsoSeq:G14196.1;Source=Nipponbare.panicle_G11142.1
Chr09	TAMA	exon	18275086	18275785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754B-01;Name=OsNip_09t047754B-01-E1;exon_id=OsNip_09t047754B-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14196.1;Source=Nipponbare.panicle_G11142.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	CDS	18275088	18275405	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t047754B-01;Parent=transcript:OsNip_09t047754B-01;protein_id=OsNip_09t047754B-01;Tag=IsoSeq:G14196.1;Source=Nipponbare.panicle_G11142.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	18275086	18275087	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754B-01;Tag=IsoSeq:G14196.1;Source=Nipponbare.panicle_G11142.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	18275409	18275785	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t047754B-01;Tag=IsoSeq:G14196.1;Source=Nipponbare.panicle_G11142.1;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18278585	18280223	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0477550;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18278585	18280223	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0477550-00;Parent=gene:OsNip_09g0477550;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0477550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18278585	18278828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0477550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18278585	18280223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0477550-00;Name=OsNip_09t0477550-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0477550-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18278829	18279419	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0477550-00;Parent=transcript:OsNip_09t0477550-00;protein_id=OsNip_09t0477550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18279420	18280223	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0477550-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18281423	18286861	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0477700;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	18365260	18366617	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0479133-00;Name=OsNip_09t0479133-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0479133-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18381040	18381079	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0479300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	18382521	18382719	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0479300-01;Name=OsNip_09t0479300-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0479300-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18452296	18452708	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0480700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	CDS	18451619	18451732	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0480700-02;Parent=transcript:OsNip_09t0480700-02;protein_id=OsNip_09t0480700-02;Tag=IsoSeq:G14206.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11149.2,Nipponbare.root_G8466.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1FQP7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	18451618	18451618	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0480700-02;Tag=IsoSeq:G14206.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11149.2,Nipponbare.root_G8466.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1FQP7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	18451736	18452584	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0480700-02;Tag=IsoSeq:G14206.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11149.2,Nipponbare.root_G8466.1;prot_id "UniRef90_A0A5P1FQP7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18456846	18457443	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0480900;Name=OsNip_BURP15;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18456846	18457443	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0480900-01;Parent=gene:OsNip_09g0480900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0480900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18456846	18457052	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0480900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18457053	18457292	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0480900-01;Parent=transcript:OsNip_09t0480900-01;protein_id=OsNip_09t0480900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18457293	18457443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0480900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18457886	18458443	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0481000-00;Parent=gene:OsNip_09g0481000;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0481000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18457886	18458443	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0481000-00;Name=OsNip_09t0481000-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0481000-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18457886	18458443	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0481000-00;Parent=transcript:OsNip_09t0481000-00;protein_id=OsNip_09t0481000-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18464265	18469040	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0481100;Name=OsNip_SNDP10;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	gene	18657575	18659177	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0482900;biotype=protein_coding;description=UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18657575	18659177	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0482900-01;Parent=gene:OsNip_09g0482900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0482900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18657659	18659092	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0482900-01;Parent=transcript:OsNip_09t0482900-01;protein_id=OsNip_09t0482900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18674794	18674794	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0483600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18676501	18676601	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0483700-00;Parent=transcript:OsNip_09t0483700-00;protein_id=OsNip_09t0483700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18851989	18852216	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0488700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0488700-01;protein_id=OsNip_09t0488700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	18852316	18853114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0488700-01;Name=OsNip_09t0488700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0488700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18852766	18853114	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0488700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18851606	18852581	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0488750;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18851606	18852581	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0488750-00;Parent=gene:OsNip_09g0488750;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0488750-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18851606	18851809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0488750-00;Name=OsNip_09t0488750-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0488750-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18851606	18851809	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0488750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18944434	18944714	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491596-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18944434	18945272	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491596-01;Name=OsNip_09t0491596-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0491596-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18950233	18950248	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491612-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18950233	18951277	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491612-01;Name=OsNip_09t0491612-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0491612-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18950249	18951277	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0491612-01;Parent=transcript:OsNip_09t0491612-01;protein_id=OsNip_09t0491612-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18952759	18952831	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0491628;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18952759	18952831	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0491628-00;Parent=gene:OsNip_09g0491628;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_09t0491628-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18952759	18952831	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491628-00;Name=OsNip_09t0491628-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0491628-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	18953659	18954646	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0491644;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18953659	18954646	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0491644-01;Parent=gene:OsNip_09g0491644;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0491644-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	18953659	18953885	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491644-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18953659	18954646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491644-01;Name=OsNip_09t0491644-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0491644-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	18953886	18954644	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0491644-01;Parent=transcript:OsNip_09t0491644-01;protein_id=OsNip_09t0491644-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	18954645	18954646	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491644-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	18955552	18956578	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0491652-00;Parent=gene:OsNip_09g0491652;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0491652-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	18955552	18955934	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0491652-00;Name=OsNip_09t0491652-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0491652-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19385713	19385943	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0500966-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	19433960	19437709	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0502200-01;Parent=gene:OsNip_09g0502200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0502200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	19468899	19469007	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0503100-01;Name=OsNip_09t0503100-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0503100-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	19568274	19568315	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0505700-03;Tag=IsoSeq:G14296.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6493.1,Nipponbare.root_G8520.1,Nipponbare.panicle_G11223.1,Nipponbare.panicle_G11223.2,Nipponbare.panicle_G11223.3;prot_id "UniRef90_UPI000C1D3EF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	19568459	19568843	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0505700-03;Tag=IsoSeq:G14296.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6493.1,Nipponbare.root_G8520.1,Nipponbare.panicle_G11223.1,Nipponbare.panicle_G11223.2,Nipponbare.panicle_G11223.3;prot_id "UniRef90_UPI000C1D3EF3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	19570448	19570539	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0505800-01;Name=OsNip_09t0505800-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0505800-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	19591971	19592123	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t050644A-01;Tag=IsoSeq:G14299.1;Source=Nipponbare.panicle_G11226.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2DM80";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	19592208	19592637	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t050644A-01;Tag=IsoSeq:G14299.1;Source=Nipponbare.panicle_G11226.1;prot_id "UniRef90_A0A2K2DM80";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	19596349	19597750	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0506450-00;Parent=gene:OsNip_09g0506450;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0506450-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19630562	19630655	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0506900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	mRNA	19642782	19643964	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0507100-01;Parent=gene:OsNip_09g0507100;transcript_id=OsNip_09t0507100-01;Tag=IsoSeq:G14300.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11227.1
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	19642782	19642783	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507100-01;Tag=IsoSeq:G14300.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11227.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XYQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	19642976	19643964	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507100-01;Tag=IsoSeq:G14300.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11227.1;prot_id "UniRef90_A0A2H3XYQ2";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19653389	19653497	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	19653389	19653682	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507200-01;Name=OsNip_09t0507200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0507200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	19657660	19657759	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507200-01;Name=OsNip_09t0507200-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0507200-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	19657660	19657759	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0507200-01;Parent=transcript:OsNip_09t0507200-01;protein_id=OsNip_09t0507200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	19657831	19657872	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507200-01;Name=OsNip_09t0507200-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0507200-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19678522	19678751	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19680139	19680145	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0507600-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	19697500	19698027	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0508250-00;Parent=transcript:OsNip_09t0508250-00;protein_id=OsNip_09t0508250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19698028	19698416	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0508250-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	19698582	19698761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0508250-00;Name=OsNip_09t0508250-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0508250-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19698582	19698761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0508250-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	19698582	19698761	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0508250-01;Name=OsNip_09t0508250-01;exon_id=OsNip_09t0508250-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14307.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11234.5;prot_id "UniRef90_A0A2I0AI73";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	19881250	19881733	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0511500-01;Parent=transcript:OsNip_09t0511500-01;protein_id=OsNip_09t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	19881250	19882134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0511500-01;Name=OsNip_09t0511500-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0511500-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19881734	19882134	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0511500-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	19882650	19888124	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0511600;Name=OsNip_9bglu31;biotype=protein_coding;description=Glycoside;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	19882650	19882893	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0511600-02;Name=OsNip_09t0511600-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0511600-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	19965263	19965344	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0513100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19995089	19995175	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0513600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	19995297	19995864	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0513600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	20214374	20215110	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518000-01;Tag=IsoSeq:G14352.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11272.1;prot_id "UniRef90_Q0J0B6";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	20215186	20215529	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518000-01;Tag=IsoSeq:G14352.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11272.1;prot_id "UniRef90_Q0J0B6";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	20222992	20223992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518200-01;Name=OsNip_09t0518200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0518200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20223730	20223992	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518200-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20222211	20223692	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0518266-00;Parent=gene:OsNip_09g0518266;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0518266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20222211	20222441	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518266-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20222442	20222882	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0518266-00;Parent=transcript:OsNip_09t0518266-00;protein_id=OsNip_09t0518266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20222967	20223653	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0518266-00;Parent=transcript:OsNip_09t0518266-00;protein_id=OsNip_09t0518266-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20222967	20223692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518266-00;Name=OsNip_09t0518266-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0518266-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20223654	20223692	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518266-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	20239318	20240514	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518500-04;Tag=IsoSeq:G14354.5;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.root_G8551.2,Nipponbare.panicle_G11274.5,Nipponbare.leaf_G6516.2;prot_id "UniRef90_A0A2I0VNB6";degrade_flag "full_length";match_flag "full_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20241489	20243398	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0518600-00;Parent=gene:OsNip_09g0518600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0518600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20241489	20242127	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518600-00;Name=OsNip_09t0518600-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0518600-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20241489	20242127	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0518600-00;Parent=transcript:OsNip_09t0518600-00;protein_id=OsNip_09t0518600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20242381	20242495	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518600-00;Name=OsNip_09t0518600-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0518600-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20242381	20242495	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0518600-00;Parent=transcript:OsNip_09t0518600-00;protein_id=OsNip_09t0518600-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20242575	20242653	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0518600-00;Name=OsNip_09t0518600-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0518600-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20269547	20269717	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0519100-00;Parent=transcript:OsNip_09t0519100-00;protein_id=OsNip_09t0519100-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	20269590	20269762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0519100-01;Tag=IsoSeq:G14359.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11278.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6T722";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	20268361	20269194	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0519100-01;Tag=IsoSeq:G14359.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11278.1;prot_id "UniRef90_A0A3L6T722";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	20272906	20273688	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0519150-00;Name=OsNip_09t0519150-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0519150-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	20273778	20274376	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0519200;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20273778	20274376	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0519200-02;Parent=gene:OsNip_09g0519200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0519200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20273778	20274177	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0519200-02;Parent=transcript:OsNip_09t0519200-02;protein_id=OsNip_09t0519200-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20273778	20274376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0519200-02;Name=OsNip_09t0519200-02-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0519200-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20274178	20274376	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0519200-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20293695	20294066	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0519601-00;Parent=gene:OsNip_09g0519601;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0519601-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20334779	20334847	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0520550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	20335235	20336386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0520550-01;Name=OsNip_09t0520550-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0520550-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20335532	20336386	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0520550-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20337186	20340505	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0520600-01;Parent=gene:OsNip_09g0520600;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20337186	20337586	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0520600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20639128	20639475	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0527650-00;Parent=transcript:OsNip_09t0527650-00;protein_id=OsNip_09t0527650-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20641465	20641920	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0527700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20642303	20642317	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0527700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20642303	20642393	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0527700-01;Name=OsNip_09t0527700-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0527700-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20692305	20692403	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0528500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20692488	20693123	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0528500-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	20692496	20693116	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0528700-00;Name=OsNip_09t0528700-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0528700-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20692496	20693116	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0528700-00;Parent=transcript:OsNip_09t0528700-00;protein_id=OsNip_09t0528700-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	20691299	20693573	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0528700-01;Parent=gene:OsNip_09g0528700;transcript_id=OsNip_09t0528700-01;Tag=IsoSeq:G14388.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6531.2
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	20775317	20775928	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530350-00;Name=OsNip_09t0530350-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0530350-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20786528	20786755	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530600-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20787543	20787570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20787938	20788110	.	+	2	ID=CDS:OsNip_09t0530700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0530700-01;protein_id=OsNip_09t0530700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20789001	20789099	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0530700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0530700-01;protein_id=OsNip_09t0530700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20789001	20790463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530700-01;Name=OsNip_09t0530700-01-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0530700-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	20789100	20790463	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	20787549	20790245	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0530700-02;Parent=gene:OsNip_09g0530700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0530700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	20787549	20787570	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530700-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	20787549	20787751	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0530700-02;Name=OsNip_09t0530700-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0530700-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	20787571	20787751	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0530700-02;Parent=transcript:OsNip_09t0530700-02;protein_id=OsNip_09t0530700-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21255014	21255108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-01;Name=OsNip_09t0539800-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0539800-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21255107	21255108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	21256737	21256864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;Name=OsNip_09t0539800-02;exon_id=OsNip_09t0539800-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	CDS	21256737	21256863	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t0539800-02;Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;protein_id=OsNip_09t0539800-02;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr09	TAMA	exon	21254336	21254654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;Name=OsNip_09t0539800-02;exon_id=OsNip_09t0539800-02-E4;rank=4;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	21256864	21256864	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21255014	21255108	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21254336	21254654	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539800-02;Tag=IsoSeq:G14435.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11343.1,Nipponbare.root_G8603.1;prot_id "UniRef90_A0A5J9T011";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	21260360	21261099	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0539901;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21260360	21260639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;Name=OsNip_09t0539901-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0539901-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21260360	21260639	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21260778	21260828	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21260778	21261082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;Name=OsNip_09t0539901-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0539901-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21260829	21261080	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0539901-00;Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;protein_id=OsNip_09t0539901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21261081	21261082	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0539901-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	21260364	21261099	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0539901-01;Parent=gene:OsNip_09g0539901;transcript_id=OsNip_09t0539901-01;Tag=IsoSeq:G14436.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.leaf_G6560.1
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21310135	21310594	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;Name=OsNip_09t0541000-02-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0541000-02-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21310166	21310594	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0541000-02;Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;protein_id=OsNip_09t0541000-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21310694	21310915	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0541000-02;Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;protein_id=OsNip_09t0541000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21311017	21311139	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0541000-02;Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;protein_id=OsNip_09t0541000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21311017	21311400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;Name=OsNip_09t0541000-02-E3;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0541000-02-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21311140	21311400	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	21310139	21311541	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0541000-03;Parent=gene:OsNip_09g0541000;transcript_id=OsNip_09t0541000-03;Tag=IsoSeq:G14438.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6562.7
Chr09	TAMA	exon	21310139	21311541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-03;Name=OsNip_09t0541000-03;exon_id=OsNip_09t0541000-03-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14438.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6562.7;prot_id "UniRef90_A0A2C9VW63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	CDS	21310141	21310275	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0541000-03;Parent=transcript:OsNip_09t0541000-03;protein_id=OsNip_09t0541000-03;Tag=IsoSeq:G14438.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6562.7;prot_id "UniRef90_A0A2C9VW63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	21310139	21310140	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-03;Tag=IsoSeq:G14438.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6562.7;prot_id "UniRef90_A0A2C9VW63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21310279	21311541	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0541000-03;Tag=IsoSeq:G14438.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6562.7;prot_id "UniRef90_A0A2C9VW63";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	21310165	21310918	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0541050;biotype=protein_coding;description=Hypothetical;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21377298	21378542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0542700-00;Name=OsNip_09t0542700-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0542700-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21378420	21378542	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0542700-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	21375638	21378575	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0542700-01;Name=OsNip_09t0542700-01;exon_id=OsNip_09t0542700-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14446.3;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11353.3;prot_id "UniRef90_I1ISD9";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21386831	21387018	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0542900-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21386828	21387021	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0542900-02;Tag=IsoSeq:G14448.7;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8610.7;prot_id "none";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "no_hit"
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21391774	21392078	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21393535	21393569	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-01;Name=OsNip_09t0543100-01-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0543100-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21393535	21393648	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-02;Name=OsNip_09t0543100-02-E2;constitutive=0;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0543100-02-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21397340	21397921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-02;Name=OsNip_09t0543100-02-E10;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0543100-02-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21397634	21397921	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21397472	21397633	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0543100-03;Parent=transcript:OsNip_09t0543100-03;protein_id=OsNip_09t0543100-03;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21397472	21397922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-03;Name=OsNip_09t0543100-03-E1;constitutive=0;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0543100-03-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21397634	21397922	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-03;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	21392009	21393038	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-04;Name=OsNip_09t0543100-04;exon_id=OsNip_09t0543100-04-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14449.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11354.1,Nipponbare.root_G8611.2;prot_id "UniRef90_A0A7J7CZS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	CDS	21392009	21393038	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0543100-04;Parent=transcript:OsNip_09t0543100-04;protein_id=OsNip_09t0543100-04;Tag=IsoSeq:G14449.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11354.1,Nipponbare.root_G8611.2;prot_id "UniRef90_A0A7J7CZS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	exon	21393535	21393651	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0543100-04;Name=OsNip_09t0543100-04;exon_id=OsNip_09t0543100-04-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14449.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11354.1,Nipponbare.root_G8611.2;prot_id "UniRef90_A0A7J7CZS0";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "90_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	21669399	21669593	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0548066-00;Parent=transcript:OsNip_09t0548066-00;protein_id=OsNip_09t0548066-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	21671670	21673656	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0548083;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	21671670	21673656	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0548083-00;Parent=gene:OsNip_09g0548083;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_09t0548083-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21671670	21671778	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548083-00;Name=OsNip_09t0548083-00-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0548083-00-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21671895	21672064	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548083-00;Name=OsNip_09t0548083-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0548083-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	21672364	21672536	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548083-00;Name=OsNip_09t0548083-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0548083-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21685970	21686042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548300-01;Name=OsNip_09t0548300-01-E14;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0548300-01-E14;rank=14;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21685992	21686042	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21687201	21687492	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548300-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	exon	21681285	21681739	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0548300-02;Name=OsNip_09t0548300-02;exon_id=OsNip_09t0548300-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14460.1;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11363.1;prot_id "UniRef90_A0A1U7YUG5";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	21746526	21746804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0549700-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	21746803	21746804	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0549700-02;Tag=IsoSeq:G14465.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8622.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FLX3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21746139	21746305	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0549700-02;Tag=IsoSeq:G14465.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8622.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FLX3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	21745335	21745700	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0549700-02;Tag=IsoSeq:G14465.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.root_G8622.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9FLX3";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "full_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	21751750	21752289	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0550000-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	21753101	21753255	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0550000-01;Name=OsNip_09t0550000-01-E8;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0550000-01-E8;rank=8;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	22106361	22106373	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0556300-02;Tag=IsoSeq:G14483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11381.2,Nipponbare.root_G8636.2,Nipponbare.root_G8636.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XGM1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	22106896	22107106	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0556300-02;Tag=IsoSeq:G14483.2;TagType=genic;Source=Nipponbare.panicle_G11381.2,Nipponbare.root_G8636.2,Nipponbare.root_G8636.3;prot_id "UniRef90_A0A0D9XGM1";degrade_flag "full_length";match_flag "bad_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	22107352	22113927	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0556400;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22107352	22111209	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0556400-01;Parent=gene:OsNip_09g0556400;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22107352	22107762	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22107352	22107876	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;Name=OsNip_09t0556400-01-E11;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0556400-01-E11;rank=11;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22107763	22107876	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0556400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;protein_id=OsNip_09t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22107967	22108053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;Name=OsNip_09t0556400-01-E10;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0556400-01-E10;rank=10;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22107967	22108053	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0556400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;protein_id=OsNip_09t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22108258	22108310	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0556400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0556400-01;protein_id=OsNip_09t0556400-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	22195907	22196143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-01;Name=OsNip_09t0558300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	22196326	22197181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-01;Name=OsNip_09t0558300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E7;rank=7;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	22194414	22194626	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Name=OsNip_09t0558300-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E3;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22194414	22194626	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0558300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;protein_id=OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22194964	22195268	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Name=OsNip_09t0558300-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E4;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22194964	22195268	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0558300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;protein_id=OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22195478	22195589	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Name=OsNip_09t0558300-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E5;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22195478	22195589	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0558300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;protein_id=OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22195907	22196143	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Name=OsNip_09t0558300-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E6;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22195907	22196143	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0558300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;protein_id=OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22196326	22197033	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0558300-02;Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;protein_id=OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22196326	22197181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Name=OsNip_09t0558300-01-E7;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0558300-01-E7;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22197034	22197181	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558300-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	22193479	22196846	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0558450;biotype=nontranslating_CDS;description=Non-protein;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22193479	22196846	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0558450-00;Parent=gene:OsNip_09g0558450;biotype=nontranslating_CDS;transcript_id=OsNip_09t0558450-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22193479	22193805	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558450-00;Name=OsNip_09t0558450-00-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0558450-00-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22194402	22194636	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558450-00;Name=OsNip_09t0558450-00-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0558450-00-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22194982	22195323	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558450-00;Name=OsNip_09t0558450-00-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0558450-00-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22195839	22196142	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558450-00;Name=OsNip_09t0558450-00-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0558450-00-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22196325	22196846	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0558450-00;Name=OsNip_09t0558450-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0558450-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	gene	22197350	22200929	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g055859A;Tag=IsoSeq:G14493
Chr09	TAMA	mRNA	22197350	22200929	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t055859A-01;Parent=gene:OsNip_09g055859A;transcript_id=OsNip_09t055859A-01;Tag=IsoSeq:G14493.1;Source=Nipponbare.panicle_G11390.1
Chr09	TAMA	exon	22199452	22200929	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t055859A-01;Name=OsNip_09t055859A-01-E1;exon_id=OsNip_09t055859A-01-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14493.1;Source=Nipponbare.panicle_G11390.1;prot_id "UniRef90_B7EZD8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	CDS	22200802	22200927	.	-	.	ID=CDS:OsNip_09t055859A-01;Parent=transcript:OsNip_09t055859A-01;protein_id=OsNip_09t055859A-01;Tag=IsoSeq:G14493.1;Source=Nipponbare.panicle_G11390.1;prot_id "UniRef90_B7EZD8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	exon	22198803	22198912	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t055859A-01;Name=OsNip_09t055859A-01-E2;exon_id=OsNip_09t055859A-01-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14493.1;Source=Nipponbare.panicle_G11390.1;prot_id "UniRef90_B7EZD8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22242058	22242595	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0559800-01;Parent=transcript:OsNip_09t0559800-01;protein_id=OsNip_09t0559800-01;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	exon	22266629	22266838	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-01;Name=OsNip_09t0560400-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0560400-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22266629	22266838	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0560400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0560400-01;protein_id=OsNip_09t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22268596	22268835	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0560400-01;Parent=transcript:OsNip_09t0560400-01;protein_id=OsNip_09t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22268596	22268858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-01;Name=OsNip_09t0560400-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0560400-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22268836	22268858	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	22265642	22268857	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0560400-02;Parent=gene:OsNip_09g0560400;transcript_id=OsNip_09t0560400-02;Tag=IsoSeq:G14501.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11398.2
Chr09	TAMA	exon	22265642	22268857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-02;Name=OsNip_09t0560400-02;exon_id=OsNip_09t0560400-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14501.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11398.2;prot_id "UniRef90_M7Z4W8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	TAMA	five_prime_UTR	22268856	22268857	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-02;Tag=IsoSeq:G14501.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11398.2;prot_id "UniRef90_M7Z4W8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	22265642	22268577	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560400-02;Tag=IsoSeq:G14501.2;TagType=novel_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11398.2;prot_id "UniRef90_M7Z4W8";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22284529	22286183	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0560850-00;Parent=transcript:OsNip_09t0560850-00;protein_id=OsNip_09t0560850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22286450	22286540	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0560850-00;Parent=transcript:OsNip_09t0560850-00;protein_id=OsNip_09t0560850-00;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22286450	22286541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560850-00;Name=OsNip_09t0560850-00-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0560850-00-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22286541	22286541	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560850-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22287174	22291746	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0560900-02;Parent=gene:OsNip_09g0560900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0560900-02;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22287174	22287564	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0560900-02;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22356996	22356996	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0562750-00;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22540259	22540333	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0565600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0565600-01;protein_id=OsNip_09t0565600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22540413	22540566	.	+	1	ID=CDS:OsNip_09t0565600-01;Parent=transcript:OsNip_09t0565600-01;protein_id=OsNip_09t0565600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22540413	22540738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565600-01;Name=OsNip_09t0565600-01-E13;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0565600-01-E13;rank=13;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22540567	22540738	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565600-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	gene	22542184	22545112	.	+	.	ID=gene:OsNip_09g0565700;Name=EIP3;biotype=protein_coding;description=Prephenate;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22542195	22543863	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0565700-01;Parent=gene:OsNip_09g0565700;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0565700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22542195	22542365	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22542195	22543863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-01;Name=OsNip_09t0565700-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0565700-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22542366	22543571	.	+	0	ID=CDS:OsNip_09t0565700-01;Parent=transcript:OsNip_09t0565700-01;protein_id=OsNip_09t0565700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22543572	22543863	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	TAMA	mRNA	22542184	22545112	.	+	.	ID=transcript:OsNip_09t0565700-02;Parent=gene:OsNip_09g0565700;transcript_id=OsNip_09t0565700-02;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1
Chr09	TAMA	exon	22542184	22543606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-02;Name=OsNip_09t0565700-02;exon_id=OsNip_09t0565700-02-E1;rank=1;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1;prot_id "UniRef90_K3Y7J7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	CDS	22542184	22542492	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0565700-02;Parent=transcript:OsNip_09t0565700-02;protein_id=OsNip_09t0565700-02;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1;prot_id "UniRef90_K3Y7J7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	exon	22544696	22545112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-02;Name=OsNip_09t0565700-02;exon_id=OsNip_09t0565700-02-E2;rank=2;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1;prot_id "UniRef90_K3Y7J7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	22542496	22543606	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-02;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1;prot_id "UniRef90_K3Y7J7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	22544696	22545112	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565700-02;Tag=IsoSeq:G14523.1;TagType=genic;Source=Nipponbare.leaf_G6600.1;prot_id "UniRef90_K3Y7J7";degrade_flag "5prime_degrade";match_flag "50_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	22548039	22552725	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0565900;biotype=protein_coding;description=Conserved;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22548039	22552725	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0565900-01;Parent=gene:OsNip_09g0565900;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22548039	22549038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Name=OsNip_09t0565900-01-E6;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0565900-01-E6;rank=6;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22548039	22549038	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22549117	22549257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Name=OsNip_09t0565900-01-E5;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0565900-01-E5;rank=5;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22549117	22549257	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22549774	22549956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Name=OsNip_09t0565900-01-E4;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0565900-01-E4;rank=4;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22549774	22549956	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22550046	22551053	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22550046	22551194	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Name=OsNip_09t0565900-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=0;exon_id=OsNip_09t0565900-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22551054	22551194	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0565900-01;Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;protein_id=OsNip_09t0565900-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22551332	22551420	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0565900-01;Name=OsNip_09t0565900-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=0;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0565900-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
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Chr09	TAMA	CDS	22689244	22689431	.	+	.	ID=CDS:OsNip_09t0568100-01;Parent=transcript:OsNip_09t0568100-01;protein_id=OsNip_09t0568100-01;Tag=IsoSeq:G14536.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11424.2,Nipponbare.leaf_G6606.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SZB3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	22688072	22688286	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568100-01;Tag=IsoSeq:G14536.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11424.2,Nipponbare.leaf_G6606.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SZB3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	five_prime_UTR	22688939	22689057	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568100-01;Tag=IsoSeq:G14536.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11424.2,Nipponbare.leaf_G6606.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SZB3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	TAMA	three_prime_UTR	22689435	22689623	.	+	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568100-01;Tag=IsoSeq:G14536.2;TagType=novel_not_in_catalog;Source=Nipponbare.panicle_G11424.2,Nipponbare.leaf_G6606.1;prot_id "UniRef90_A0A0A9SZB3";degrade_flag "full_length";match_flag "90_match"
Chr09	RAP2018-11-26	gene	22690177	22691820	.	-	.	ID=gene:OsNip_09g0568200;Name=OsNip_HAP3L;biotype=protein_coding;description=Similar;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	mRNA	22690177	22691820	.	-	.	ID=transcript:OsNip_09t0568200-01;Parent=gene:OsNip_09g0568200;biotype=protein_coding;transcript_id=OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	three_prime_UTR	22690177	22690481	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22690177	22690618	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;Name=OsNip_09t0568200-01-E3;constitutive=1;ensembl_end_phase=-1;ensembl_phase=1;exon_id=OsNip_09t0568200-01-E3;rank=3;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22690482	22690618	.	-	2	ID=CDS:OsNip_09t0568200-01;Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;protein_id=OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22690973	22691091	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;Name=OsNip_09t0568200-01-E2;constitutive=1;ensembl_end_phase=1;ensembl_phase=2;exon_id=OsNip_09t0568200-01-E2;rank=2;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22690973	22691091	.	-	1	ID=CDS:OsNip_09t0568200-01;Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;protein_id=OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	CDS	22691587	22691753	.	-	0	ID=CDS:OsNip_09t0568200-01;Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;protein_id=OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	exon	22691587	22691820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;Name=OsNip_09t0568200-01-E1;constitutive=1;ensembl_end_phase=2;ensembl_phase=-1;exon_id=OsNip_09t0568200-01-E1;rank=1;Tag=RAP2018-11-26
Chr09	RAP2018-11-26	five_prime_UTR	22691754	22691820	.	-	.	Parent=transcript:OsNip_09t0568200-01;Tag=RAP2018-11-26
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